Chr	Start	End	Ref	Alt	Func.refGene	Gene.refGene	GeneDetail.refGene	ExonicFunc.refGene	AAChange.refGene	snp138	cosmic68	1000g2014oct_all	SIFT_score	SIFT_pred	Polyphen2_HDIV_score	Polyphen2_HDIV_pred	Polyphen2_HVAR_score	Polyphen2_HVAR_pred	LRT_score	LRT_pred	MutationTaster_score	MutationTaster_pred	MutationAssessor_score	MutationAssessor_pred	FATHMM_score	FATHMM_pred	RadialSVM_score	RadialSVM_pred	LR_score	LR_pred	VEST3_score	CADD_raw	CADD_phred	GERP++_RS	phyloP46way_placental	phyloP100way_vertebrate	SiPhy_29way_logOdds	RUN	GROUP	CELL_LINE	VARIANT_TYPE	CALLER_FLAGS	CALLER_COUNT	VARSCAN_JUDGEMENT	VARSCAN_PVAL	TORRENT_JUDGEMENT	TORRENT_QUAL	SNIPER_SCORE	MUTECT_SCORE	MUTECT_CONCERNS	MUTECT_JUDGEMENT	TOTAL_READS	NORMAL_READS	VARIANT_READS	BLOOD_DETECTED
chr10	100024611	100024611	T	T	intronic	LOXL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	100143684	100143684	G	T	intronic	PYROXD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.529346	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	91	83	8	0
chr10	100144628	100144628	T	T	intronic	PYROXD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	100146895	100146895	T	C	intronic	PYROXD2	NaN	NaN	NaN	rs2296438	NaN	0.521166	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	230	173	57	32
chr10	100147060	100147060	A	G	exonic	PYROXD2	NaN	synonymous SNV	PYROXD2:NM_032709:exon14:c.T1452C:p.F484F	rs4345897	NaN	0.521166	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	87	NaN	NA	NA	250	201	49	35
chr10	100148086	100148086	A	T	intronic	PYROXD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.480055	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	156	149	7	0
chr10	100148308	100148308	T	G	intronic	PYROXD2	NaN	NaN	NaN	rs2147895	NaN	0.514577	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	17.8789	46	NaN	NA	NA	123	102	21	5
chr10	100150530	100150530	G	T	intronic	PYROXD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr10	100150533	100150533	T	A	intronic	PYROXD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr10	100150535	100150535	A	T	intronic	PYROXD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	100150538	100150538	T	C	intronic	PYROXD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	100152177	100152177	C	C	intronic	PYROXD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	113	93	0	0
chr10	100152769	100152769	C	G	exonic	PYROXD2	NaN	nonsynonymous SNV	PYROXD2:NM_032709:exon9:c.G857C:p.G286A	rs139584064	NaN	0.000399361	0	D	1.0	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	3.545	H	-0.5	T	0.524	D	0.653	D	0.94	4.841	27.5	5.58	2.638	7.336	17.363	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.08730158730158755	NA	0	0	NaN	NA	NA	13	10	3	0
chr10	100177367	100177367	T	C	exonic	HPS1	NaN	nonsynonymous SNV	HPS1:NM_000195:exon20:c.A2057G:p.Q686R	rs372189642	NaN	NaN	0.36	T	0.546	P	0.234	B	0.003	N	1.000	D	0.29	N	0.92	T	-1.104	T	0.055	T	0.084	0.722	7.842	3.08	0.889	5.934	7.623	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	150	34	116	1
chr10	100179851	100179851	T	C	exonic	HPS1	NaN	nonsynonymous SNV	HPS1:NM_000195:exon18:c.A1808G:p.Q603R	rs2296436	NaN	0.123403	1	T	0.0	B	0.004	B	0.001	N	0.000	P	-0.6	N	1.03	T	-1.006	T	0.000	T	0.032	0.025	4.144	3.43	0.498	1.305	6.295	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.872668	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	44	30	14	9
chr10	100183194	100183194	T	T	intronic	HPS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr10	100185239	100185239	T	T	intronic	HPS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr10	100185250	100185250	C	T	intronic	HPS1	NaN	NaN	NaN	rs41317034	NaN	0.124601	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	71	NaN	NA	NA	101	87	14	12
chr10	100185798	100185798	A	A	intronic	HPS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	100189252	100189252	G	G	UTR3	HPS1	NM_182639:c.*40C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	73	56	0	0
chr10	100189504	100189504	C	A	intronic	HPS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.750506	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	60	55	5	0
chr10	100189663	100189663	A	G	intronic	HPS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr10	100191088	100191088	C	G	ncRNA_exonic	MIR4685	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr10	100219159	100219159	T	T	UTR3	HPSE2	NM_021828:c.*172A>A,NM_001166246:c.*374A>A,NM_001166245:c.*172A>A,NM_001166244:c.*172A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr10	100219519	100219519	G	A	intronic	HPSE2	NaN	NaN	NaN	rs11189618	NaN	0.530551	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	74.06949	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	136	100	36	48
chr10	100221635	100221635	A	A	intronic	HPSE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	100453559	100453559	T	C	intronic	HPSE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr10	100453754	100453754	T	A	intronic	HPSE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.703329	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	144	134	10	0
chr10	100453755	100453755	C	T	intronic	HPSE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.80601	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	138	128	10	0
chr10	101117232	101117232	T	C	intronic	CNNM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr10	101151143	101151143	T	T	intronic	CNNM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	57	51	0	0
chr10	101157338	101157338	G	C	exonic	GOT1	NaN	nonsynonymous SNV	GOT1:NM_002079:exon9:c.C1208G:p.T403S	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.0	B	0.001	B	0.005	N	0.980	N	0.05	N	2.08	T	-1.021	T	0.026	T	0.152	1.904	12.33	2.96	0.732	1.702	9.783	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.245656	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	319	309	10	0
chr10	101294936	101294936	C	T	exonic	NKX2-3	NaN	synonymous SNV	NKX2-3:NM_145285:exon2:c.C553T:p.L185L	rs113459553	NaN	0.033147	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	66	49	17	4
chr10	101419832	101419832	A	A	intronic	ENTPD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr10	101448614	101448614	A	A	intronic	ENTPD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	101451078	101451078	T	T	intronic	ENTPD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	101458787	101458787	A	A	intronic	ENTPD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr10	101464172	101464172	A	T	intronic	ENTPD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03958220163043989	NA	0	0	NaN	NA	NA	97	69	28	0
chr10	101542578	101542578	C	T	UTR5	ABCC2	NM_000392:c.-24C>T	NaN	NaN	rs717620	ID=COSN163734;OCCURENCE=1(breast)	0.134984	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.531416	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	94	68	26	25
chr10	101563681	101563681	T	T	intronic	ABCC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	11	7	0	0
chr10	101564037	101564037	A	G	intronic	ABCC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	15	6	9	0
chr10	101571255	101571255	G	A	intronic	ABCC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.75888	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	136	127	9	0
chr10	101571258	101571258	C	G	intronic	ABCC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.094218	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	137	128	9	0
chr10	101579040	101579040	A	A	intronic	ABCC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	101591685	101591685	C	T	intronic	ABCC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.947858	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	389	382	7	0
chr10	101604207	101604207	C	T	exonic	ABCC2	NaN	synonymous SNV	ABCC2:NM_000392:exon28:c.C3972T:p.I1324I	rs3740066	ID=COSM147024;OCCURENCE=1(stomach)	0.288139	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.415194	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	95	73	22	35
chr10	101639796	101639796	G	A	exonic	DNMBP	NaN	synonymous SNV	DNMBP:NM_015221:exon16:c.C4320T:p.S1440S	rs2255901	ID=COSM1179742;OCCURENCE=1(prostate)	0.464457	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	80	NaN	NA	NA	163	141	23	43
chr10	101646434	101646434	A	C	intronic	DNMBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	86	NaN	NA	NA	27	7	19	0
chr10	101654696	101654696	T	C	intronic	DNMBP	NaN	NaN	NaN	rs3758394	NaN	0.45607	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.431128	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	42	17	44
chr10	101656170	101656170	G	A	intronic	DNMBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.209895	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	49	44	5	0
chr10	101715361	101715361	G	T	exonic	DNMBP	NaN	nonsynonymous SNV	DNMBP:NM_015221:exon4:c.C1870A:p.H624N	NaN	NaN	NaN	0.22	T	0.361	B	0.109	B	0.022	N	1.000	D	1.67	L	2.7	T	-1.127	T	0.042	T	0.109	0.676	7.616	5.51	2.873	2.585	19.222	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.082166	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	166	153	13	0
chr10	101715561	101715561	A	G	exonic	DNMBP	NaN	nonsynonymous SNV	DNMBP:NM_015221:exon4:c.T1670C:p.I557T	NaN	NaN	NaN	0.51	T	0.094	B	0.026	B	0.098	N	0.984	N	1.7	L	2.68	T	-1.032	T	0.030	T	0.211	2.528	14.41	4.72	2.317	1.953	7.790	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.967231	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	200	195	5	0
chr10	101775410	101775410	A	G	intergenic	DNMBP,CPN1	dist=5734;dist=26655	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	37	4	33	0
chr10	101824850	101824850	T	T	intronic	CPN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	101825160	101825160	C	G	intronic	CPN1	NaN	NaN	NaN	rs3829161	NaN	0.381789	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	825.038	0	NaN	NA	NA	63	0	63	39
chr10	101835899	101835899	A	G	intronic	CPN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr10	101841153	101841153	A	G	intronic	CPN1	NaN	NaN	NaN	rs10883439	NaN	0.892971	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	119.300919	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	0	46	58
chr10	101841419	101841419	G	A	UTR5	CPN1	NM_001308:c.-37C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.048164	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	107	102	5	0
chr10	101914761	101914761	A	A	intronic	ERLIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	101937971	101937971	G	A	intronic	ERLIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.932665	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	95	87	8	0
chr10	101950569	101950569	T	T	intronic	CHUK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	102003437	102003437	T	T	intronic	CWF19L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr10	102005491	102005491	T	C	intronic	CWF19L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	6	0	5	0
chr10	102027406	102027406	GC	CG,G,GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	510.853	0	NaN	NA	NA	54	0	3	0
chr10	102048760	102048760	G	T	exonic	PKD2L1	NaN	nonsynonymous SNV	PKD2L1:NM_001253837:exon15:c.C2163A:p.D721E,PKD2L1:NM_016112:exon15:c.C2304A:p.D768E	NaN	NaN	NaN	0.98	T	0.004	B	0.006	B	0.810	N	1.000	N	0.55	N	0.42	T	-1.015	T	0.073	T	0.046	1.539	11.10	-1.42	-0.232	0.144	0.869	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	8.903144080602795E-6	NA	0	0	NaN	NA	NA	199	134	65	0
chr10	102048761	102048761	T	C	exonic	PKD2L1	NaN	nonsynonymous SNV	PKD2L1:NM_001253837:exon15:c.A2162G:p.D721G,PKD2L1:NM_016112:exon15:c.A2303G:p.D768G	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.002	B	0.003	B	0.810	N	1.000	N	0.55	N	0.32	T	-1.015	T	0.099	T	0.166	3.506	17.92	0.194	0.046	-0.579	3.717	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	2.022254807283618E-8	NA	0	0	NaN	NA	NA	289	225	64	0
chr10	102048762	102048762	C	G	exonic	PKD2L1	NaN	nonsynonymous SNV	PKD2L1:NM_001253837:exon15:c.G2161C:p.D721H,PKD2L1:NM_016112:exon15:c.G2302C:p.D768H	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.327	B	0.125	B	0.810	N	1.000	N	0.55	N	0.29	T	-0.986	T	0.113	T	0.125	3.509	17.93	2.31	0.693	0.325	7.006	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	1.3630098149951055E-9	NA	0	0	NaN	NA	NA	282	219	63	0
chr10	102049711	102049711	T	T	intronic	PKD2L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	102054272	102054272	C	A	intronic	PKD2L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	16	15.668308	nearby_gap_events	REJECT	30	20	10	0
chr10	102056970	102056970	A	G	intronic	PKD2L1	NaN	NaN	NaN	rs2278841	NaN	0.415335	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	25.1297	0	NaN	NA	NA	64	43	21	10
chr10	102089563	102089563	A	G	intronic	PKD2L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	102089565	102089565	A	G	intronic	PKD2L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	102089571	102089571	T	C	intronic	PKD2L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	102089572	102089572	T	A	intronic	PKD2L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	102089574	102089574	G	C	intronic	PKD2L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	102089577	102089577	A	C	intronic	PKD2L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr10	102238684	102238684	T	A	intronic	WNT8B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	13	6	7	0
chr10	102241998	102241998	G	C	intronic	WNT8B	NaN	NaN	NaN	rs17113137	NaN	0.187899	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.237643	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	9	23	27
chr10	102242536	102242536	G	C	exonic	WNT8B	NaN	nonsynonymous SNV	WNT8B:NM_003393:exon6:c.G1019C:p.R340P	NaN	NaN	NaN	0.23	T	0.001	B	0.002	B	0.497	N	0.787	N	0.805	L	-0.86	T	-0.847	T	0.217	T	0.226	1.570	11.20	3.5	0.620	1.405	6.617	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	80	78	2	0
chr10	102242650	102242650	A	A	UTR3	WNT8B	NM_003393:c.*77A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	102249345	102249345	T	A	intronic	SEC31B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	102249484	102249484	G	G	exonic	SEC31B	NaN	synonymous SNV	SEC31B:NM_015490:exon22:c.C3000C:p.P1000P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	21	20	0	0
chr10	102250105	102250105	T	C	intronic	SEC31B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr10	102250106	102250106	T	G	intronic	SEC31B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr10	102255213	102255213	T	G	exonic	SEC31B	NaN	nonsynonymous SNV	SEC31B:NM_015490:exon19:c.A2401C:p.I801L	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.011	B	0.009	B	0.053	N	0.937	N	0.69	N	0.77	T	-1.038	T	0.081	T	0.114	1.120	9.567	4.0	1.406	2.201	9.008	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.030376	nearby_gap_events	REJECT	9	5	4	0
chr10	102255214	102255214	C	T	exonic	SEC31B	NaN	synonymous SNV	SEC31B:NM_015490:exon19:c.G2400A:p.R800R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.418134	nearby_gap_events	REJECT	7	3	4	0
chr10	102257811	102257811	G	T	exonic	SEC31B	NaN	nonsynonymous SNV	SEC31B:NM_015490:exon15:c.C1838A:p.A613D	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.896	P	0.802	P	0.051	N	1.000	D	2.03	M	0.61	T	-0.868	T	0.205	T	0.387	3.122	16.43	3.63	0.669	2.096	9.819	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	64	NaN	NA	NA	44	40	4	2
chr10	102258439	102258439	C	T	intronic	SEC31B	NaN	NaN	NaN	rs9420792	NaN	0.19369	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	123.865127	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	56	11	45	31
chr10	102265183	102265183	G	A	exonic	SEC31B	NaN	nonsynonymous SNV	SEC31B:NM_015490:exon10:c.C1114T:p.P372S	rs2295772	NaN	0.185104	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.000	P	-1.24	N	0.74	T	-1.024	T	0.000	T	0.118	0.161	4.865	3.47	0.123	2.770	1.708	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	97.4445	0	NaN	NA	NA	70	21	49	28
chr10	102265815	102265815	A	G	exonic	SEC31B	NaN	synonymous SNV	SEC31B:NM_015490:exon9:c.T1026C:p.H342H	rs2295773	NaN	0.185104	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	228.789026	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	120	36	84	31
chr10	102269284	102269284	A	G	intronic	SEC31B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	102279773	102279773	T	T	upstream	SEC31B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	16	13	0	0
chr10	102289078	102289078	C	A	intronic	NDUFB8	NaN	NaN	NaN	rs1800662	NaN	0.180911	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	102289317	102289317	A	C	intronic	NDUFB8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr10	102295678	102295678	G	C	UTR5	HIF1AN	NM_017902:c.-38G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.06	T	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.648	T	0.248	T	.	1.608	11.33	3.88	1.394	1.899	8.799	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	102307735	102307735	T	C	intronic	HIF1AN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	102506070	102506070	G	C	intronic	PAX2	NaN	NaN	NaN	rs4472867	NaN	0.846645	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	161.364	0	41.72707	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	45
chr10	102509793	102509793	G	A	intronic	PAX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.38944	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	25	21	4	0
chr10	102541174	102541174	A	A	intronic	PAX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	102673063	102673063	G	T	UTR3	FAM178A	NM_001243770:c.*4G>T	NaN	NaN	rs3802725	NaN	0.254393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	65.96061	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	11	28	45
chr10	102688951	102688951	A	C	intronic	FAM178A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.541289	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	33	28	5	0
chr10	102697284	102697284	T	C	intronic	FAM178A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	102703866	102703866	A	G	exonic	FAM178A	NaN	nonsynonymous SNV	FAM178A:NM_001136123:exon12:c.A2738G:p.N913S,FAM178A:NM_018121:exon12:c.A2738G:p.N913S	NaN	NaN	NaN	0.24	T	0.999	D	0.941	D	0.000	D	1.000	D	1.555	L	1.3	T	-0.938	T	0.157	T	0.216	3.056	16.20	5.37	2.035	4.954	11.769	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.172852	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	50	37	13	0
chr10	102705077	102705077	T	T	intronic	FAM178A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr10	102732263	102732263	T	T	upstream	SEMA4G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr10	102738431	102738431	A	T	UTR3	MRPL43	NM_176792:c.*579T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	62	NaN	NA	NA	42	21	21	0
chr10	102738432	102738432	G	T	UTR3	MRPL43	NM_176792:c.*578C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.322009	clustered_read_position	REJECT	21	18	3	0
chr10	102744214	102744214	T	C	UTR3	SEMA4G	NM_017893:c.*326T>C	NaN	NaN	rs2295716	NaN	0.36242	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	129	92	37	14
chr10	102748601	102748601	G	T	exonic	C10orf2	NaN	nonsynonymous SNV	C10orf2:NM_001163812:exon1:c.G634T:p.G212W,C10orf2:NM_021830:exon1:c.G634T:p.G212W	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.988	D	0.614	P	0.110	N	1.000	N	1.67	L	-3.26	D	0.168	D	0.767	D	0.34	1.599	11.30	1.26	0.276	2.377	7.849	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.292762	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	398	383	15	0
chr10	102770082	102770082	T	G	exonic	PDZD7	NaN	nonsynonymous SNV	PDZD7:NM_001195263:exon15:c.A2564C:p.N855T	rs807023	NaN	0.772963	0.56	T	.	.	.	.	.	.	1.000	P	-0.345	N	.	.	-1.030	T	0.000	T	0.013	0.430	6.333	1.35	0.232	0.097	5.225	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	70	NaN	NA	NA	135	105	30	57
chr10	102771573	102771573	G	A	intronic	PDZD7	NaN	NaN	NaN	rs807020	NaN	0.376797	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.345567	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	44	13	23
chr10	102771702	102771702	T	T	exonic	PDZD7	NaN	synonymous SNV	PDZD7:NM_001195263:exon13:c.A1913A:p.E638E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr10	102780355	102780355	G	G	intronic	PDZD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	20	16	0	0
chr10	102783126	102783126	T	T	intronic	PDZD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	102783678	102783678	T	C	intronic	PDZD7	NaN	NaN	NaN	rs6584410	ID=COSM147031;OCCURENCE=1(stomach)	0.596046	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	136.141019	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	0	50	52
chr10	102789748	102789748	TA	T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.6699	0	NaN	NA	NA	7	4	2	3
chr10	102792295	102792295	G	A	intronic	SFXN3	NaN	NaN	NaN	rs807014	NaN	0.955671	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.08295	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	46
chr10	102794644	102794644	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	5	0	2,3	0
chr10	102794645	102794645	G	T	intronic	SFXN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	102796138	102796138	T	T	intronic	SFXN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr10	102831964	102831964	G	G	intergenic	KAZALD1,TLX1NB	dist=6613;dist=17114	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	102855640	102855640	G	A	intronic	TLX1NB	NaN	NaN	NaN	rs12258159	NaN	0.346845	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	102896780	102896780	A	A	UTR3	TLX1	NM_001195517:c.*352A>A,NM_005521:c.*110A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	106	88	0	0
chr10	102896800	102896800	CG	C,CA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	623.056	0	NaN	NA	NA	98	16	50	2
chr10	102896804	102896804	G	A	UTR3	TLX1	NM_001195517:c.*376G>A,NM_005521:c.*134G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	95	41	54	0
chr10	102981407	102981407	T	C	intergenic	LINC01514,LBX1	dist=27503;dist=5326	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	102981408	102981408	C	A	intergenic	LINC01514,LBX1	dist=27504;dist=5325	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	102994128	102994128	G	T	ncRNA_intronic	LBX1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	103043575	103043575	C	G	intergenic	LOC101927419,BTRC	dist=20268;dist=70215	NaN	NaN	rs76844723	NaN	0.0495208	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	103285900	103285900	C	T	exonic	BTRC	NaN	synonymous SNV	BTRC:NM_001256856:exon5:c.C609T:p.I203I,BTRC:NM_003939:exon5:c.C579T:p.I193I,BTRC:NM_033637:exon6:c.C687T:p.I229I	rs17767748	NaN	0.0455272	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.679289	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	37	23	8
chr10	103295277	103295277	A	A	intronic	BTRC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	103339366	103339366	G	C	exonic	POLL	NaN	synonymous SNV	POLL:NM_001174084:exon9:c.C1572G:p.G524G,POLL:NM_001174085:exon9:c.C1296G:p.G432G,POLL:NM_013274:exon9:c.C1572G:p.G524G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.121607	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	65	56	9	0
chr10	103340056	103340056	G	A	exonic	POLL	NaN	nonsynonymous SNV	POLL:NM_001174084:exon8:c.C1312T:p.R438W,POLL:NM_001174085:exon8:c.C1036T:p.R346W,POLL:NM_013274:exon8:c.C1312T:p.R438W	rs3730477	NaN	0.0998403	0.02	D	1.0	D	0.834	P	0.007	N	0.000	P	2.36	M	0.93	T	-1.096	T	0.000	T	0.299	2.267	13.54	1.68	0.050	1.670	4.830	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	74.442318	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	17	30	15
chr10	103340144	103340144	A	G	exonic	POLL	NaN	synonymous SNV	POLL:NM_001174084:exon8:c.T1224C:p.S408S,POLL:NM_001174085:exon8:c.T948C:p.S316S,POLL:NM_013274:exon8:c.T1224C:p.S408S	rs3730476	NaN	0.163139	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	117.341036	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	44	0	44	24
chr10	103344589	103344589	T	G	exonic	POLL	NaN	nonsynonymous SNV	POLL:NM_001174084:exon5:c.A661C:p.T221P,POLL:NM_013274:exon5:c.A661C:p.T221P	rs3730463	NaN	0.0583067	0.13	T	0.229	B	0.029	B	0.551	N	1.000	P	1.1	L	2.7	T	-1.107	T	0.002	T	0.312	2.004	12.66	3.61	0.153	0.578	11.171	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	190	156	34	7
chr10	103541921	103541921	A	G	intronic	NPM3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.228443	nearby_gap_events	REJECT	60	55	5	0
chr10	103541948	103541948	C	T	intronic	NPM3	NaN	NaN	NaN	rs3816354	NaN	0.26258	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	288.022	0	97.492484	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	51	11	40	16
chr10	103542492	103542492	A	T	intronic	NPM3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	73	NaN	NA	NA	43	10	33	0
chr10	103560186	103560186	A	C	intronic	MGEA5	NaN	NaN	NaN	rs2305194	NaN	0.275559	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSm	3	Somatic	2.7379276618969656E-9	Somatic	195.944	92	NaN	NA	NA	44	13	31	14
chr10	103560195	103560195	T	G	intronic	MGEA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	51	31	20	0
chr10	103573222	103573222	C	T	intronic	MGEA5	NaN	NaN	NaN	rs11191118	NaN	0.249002	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	120	NaN	NA	NA	78	70	8	37
chr10	103588548	103588548	A	G	ncRNA_exonic	KCNIP2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	24	5	19	0
chr10	103649311	103649311	A	T	intronic	C10orf76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.987184	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	132	120	12	2
chr10	103717508	103717508	A	G	intronic	C10orf76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.088941	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	46	36	10	0
chr10	103717509	103717509	G	A	intronic	C10orf76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.048993831529981866	NA	0	0	16.550977	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	53	39	14	0
chr10	103811385	103811385	C	C	intronic	C10orf76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	103826166	103826166	G	T	exonic	HPS6	NaN	nonsynonymous SNV	HPS6:NM_024747:exon1:c.G935T:p.W312L	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.001	B	0.006	B	0.229	N	1.000	N	0	N	-0.96	T	-0.968	T	0.181	T	0.176	-0.883	0.475	-0.943	-0.057	0.402	6.982	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	90	78	12	0
chr10	103869133	103869133	G	A	intronic	LDB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.045108	nearby_gap_events	REJECT	55	50	5	0
chr10	103869451	103869451	A	A	intronic	LDB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	103869713	103869713	G	A	exonic	LDB1	NaN	stopgain	LDB1:NM_001113407:exon7:c.C613T:p.R205X,LDB1:NM_003893:exon7:c.C505T:p.R169X	NaN	ID=COSM321367;OCCURENCE=1(lung)	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	7.093	38	3.38	0.567	3.676	14.164	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.634878	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	128	122	6	0
chr10	103870222	103870222	T	T	intronic	LDB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	103879704	103879704	G	C	intronic	LDB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2631578947368443	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr10	103897578	103897578	T	T	intronic	PPRC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr10	103904690	103904690	C	C	intronic	PPRC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	52	40	0	0
chr10	103904843	103904843	G	T	exonic	PPRC1	NaN	synonymous SNV	PPRC1:NM_001288728:exon8:c.G3315T:p.V1105V,PPRC1:NM_015062:exon8:c.G3675T:p.V1225V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1428571428571436	NA	0	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr10	103986474	103986474	A	A	intronic	ELOVL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	103990242	103990242	C	G	UTR3	PITX3	NM_005029:c.*29G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.952322	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	56	49	7	0
chr10	103991381	103991381	G	A	exonic	PITX3	NaN	synonymous SNV	PITX3:NM_005029:exon3:c.C285T:p.I95I	rs2281983	NaN	0.664137	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.751189	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	30
chr10	104117895	104117895	T	C	exonic	GBF1	NaN	nonsynonymous SNV	GBF1:NM_001199378:exon9:c.T739C:p.S247P,GBF1:NM_001199379:exon9:c.T739C:p.S247P,GBF1:NM_004193:exon9:c.T739C:p.S247P	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.378	B	0.204	B	0.004	N	0.997	D	1.39	L	2.91	T	-1.022	T	0.024	T	0.079	2.327	13.74	4.15	1.079	1.847	6.255	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.406265	clustered_read_position	REJECT	44	40	4	0
chr10	104119928	104119928	T	T	intronic	GBF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	21	20	0	0
chr10	104121452	104121452	G	G	intronic	GBF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	26	22	0	0
chr10	104123179	104123179	A	A	intronic	GBF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	104141970	104141970	G	C	exonic	GBF1	NaN	synonymous SNV	GBF1:NM_001199378:exon40:c.G5448C:p.V1816V,GBF1:NM_001199379:exon40:c.G5445C:p.V1815V,GBF1:NM_004193:exon40:c.G5457C:p.V1819V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.21052631578947564	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr10	104142182	104142182	A	A	UTR3	GBF1	NM_001199378:c.*89A>A,NM_004193:c.*89A>A,NM_001199379:c.*89A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	104155618	104155618	C	T	UTR5	NFKB2	NM_001261403:c.-99C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	25	16	9	0
chr10	104158092	104158092	A	G	intronic	NFKB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.86423	0	NaN	NA	NA	50	43	7	0
chr10	104163556	104163556	T	T	intronic	PSD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	104165224	104165224	G	A	exonic	PSD	NaN	synonymous SNV	PSD:NM_002779:exon12:c.C2205T:p.I735I,PSD:NM_001270965:exon13:c.C2205T:p.I735I,PSD:NM_001270966:exon13:c.C1068T:p.I356I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.118845	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	80	76	4	0
chr10	104172343	104172343	A	A	intronic	PSD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr10	104173566	104173566	A	G	exonic	PSD	NaN	nonsynonymous SNV	PSD:NM_002779:exon5:c.T1513C:p.S505P,PSD:NM_001270965:exon6:c.T1513C:p.S505P,PSD:NM_001270966:exon6:c.T376C:p.S126P	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.734	P	0.185	B	0.386	N	0.850	N	0.695	N	2.08	T	-1.088	T	0.037	T	0.563	3.072	16.26	4.65	1.749	4.414	14.132	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.324998	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	174	158	16	0
chr10	104174512	104174512	C	A	intronic	PSD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2833480695549716	NA	0	0	NaN	NA	NA	23	18	5	0
chr10	104183670	104183670	ATGGGGA	ATGGGAG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	115.958	0	NaN	NA	NA	15	1	8	0
chr10	104229785	104229785	C	T	exonic	TMEM180	NaN	synonymous SNV	TMEM180:NM_024789:exon4:c.C204T:p.P68P	rs41306870	NaN	0.410144	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	79.853742	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	1	28	41
chr10	104231020	104231020	T	G	intronic	TMEM180	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	16	7	9	0
chr10	104243733	104243733	T	T	intronic	ACTR1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	104244149	104244149	A	C	intronic	ACTR1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr10	104250278	104250278	A	G	intronic	ACTR1A	NaN	NaN	NaN	rs17709610	NaN	0.207668	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	1377.06	0	435.300852	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	142	1	141	22
chr10	104262351	104262351	A	G	intronic	ACTR1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.375697	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	291	283	8	0
chr10	104387019	104387019	T	C	intronic	SUFU	NaN	NaN	NaN	rs12414407	NaN	0.719649	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	73.882395	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	0	33	47
chr10	104416806	104416806	G	T	exonic	TRIM8	NaN	nonsynonymous SNV	TRIM8:NM_030912:exon6:c.G1351T:p.A451S	NaN	NaN	NaN	1	T	0.001	B	0.002	B	0.002	N	0.842	N	-0.805	N	-0.98	T	-0.959	T	0.105	T	0.141	-0.076	3.629	3.43	1.269	3.032	7.241	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.53127	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr10	104416808	104416808	CG	TC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.53129	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr10	104416830	104416830	C	T	exonic	TRIM8	NaN	stopgain	TRIM8:NM_030912:exon6:c.C1375T:p.Q459X	NaN	NaN	NaN	0.01	D	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	5.119	32	5.43	2.558	7.417	19.231	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.5313	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr10	104492707	104492707	G	C	intronic	SFXN2	NaN	NaN	NaN	rs2778037	NaN	0.747204	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	39.924189	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	8	16	52
chr10	104495937	104495937	A	G	intronic	SFXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	104497596	104497596	C	G	UTR3	SFXN2	NM_178858:c.*77C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	104536184	104536184	T	C	intronic	WBP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	8.73427	0	7.854118		KEEP	25	21	4	0
chr10	104572818	104572818	A	T	exonic	WBP1L	NaN	nonsynonymous SNV	WBP1L:NM_001083913:exon4:c.A822T:p.E274D,WBP1L:NM_017787:exon4:c.A759T:p.E253D	NaN	NaN	NaN	0	D	0.989	D	0.845	P	0.000	D	1.000	D	2.135	M	0.18	T	-0.452	T	0.325	T	0.529	4.235	22.0	4.23	0.891	1.714	7.293	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.584483	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	62	58	4	0
chr10	104572819	104572819	G	C	exonic	WBP1L	NaN	nonsynonymous SNV	WBP1L:NM_001083913:exon4:c.G823C:p.V275L,WBP1L:NM_017787:exon4:c.G760C:p.V254L	NaN	NaN	NaN	0.24	T	0.902	P	0.439	B	0.000	N	1.000	D	0.975	L	1.15	T	-1.095	T	0.099	T	0.825	3.539	18.06	6.07	2.890	5.721	14.764	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.481076	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	62	58	4	0
chr10	104572820	104572820	T	G	exonic	WBP1L	NaN	nonsynonymous SNV	WBP1L:NM_001083913:exon4:c.T824G:p.V275G,WBP1L:NM_017787:exon4:c.T761G:p.V254G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.948	D	0.000	D	1.000	D	1.78	L	0.87	T	-0.564	T	0.268	T	0.958	4.725	26.3	6.07	2.330	8.000	16.639	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.779588	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	62	58	4	0
chr10	104687231	104687231	A	A	UTR3	CNNM2	NM_199077:c.*92A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	104861235	104861235	A	G	intronic	NT5C2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	8	2	5	0
chr10	105006495	105006495	A	T	UTR3	RPEL1	NM_001143909:c.*55A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr10	105038124	105038124	G	C	intronic	INA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	100	90	10	0
chr10	105046759	105046759	T	T	intronic	INA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	105127708	105127708	G	A	upstream	TAF5	NaN	NaN	NaN	rs10883858	NaN	0.428714	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.77779	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	25
chr10	105141431	105141431	T	T	intronic	TAF5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr10	105147478	105147478	A	T	intronic	TAF5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr10	105163050	105163050	A	A	intronic	PDCD11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	105192058	105192058	A	A	intronic	PDCD11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr10	105209085	105209085	C	A	intronic	CALHM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.008	B	0.01	B	.	.	1.000	N	.	.	1.65	T	-1.013	T	0.036	T	0.118	1.845	12.13	-4.55	-1.055	0.005	0.548	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	105209356	105209356	CAG	C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	96.4791	0	NaN	NA	NA	18	4	13	0
chr10	105209413	105209413	C	T	exonic	CALHM2	NaN	nonsynonymous SNV	CALHM2:NM_015916:exon3:c.G286A:p.A96T	rs2232659	NaN	0.00898562	0.39	T	0.545	P	0.048	B	0.006	N	0.525	D	0.695	N	2.31	T	-1.038	T	0.013	T	0.092	1.810	12.01	5.55	2.590	2.811	14.738	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	63.4903	0	27.525251	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	5	10	3
chr10	105215016	105215016	A	G	UTR3	CALHM1	NM_001001412:c.*3T>C	NaN	NaN	rs2986016	NaN	0.880192	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	235.528	0	76.081048	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	0	25	50
chr10	105218359	105218359	T	C	exonic	CALHM1	NaN	synonymous SNV	CALHM1:NM_001001412:exon1:c.A150G:p.A50A	rs2986018	NaN	0.884784	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.273952	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	0	15	53
chr10	105232970	105232970	C	T	exonic	CALHM3	NaN	synonymous SNV	CALHM3:NM_001129742:exon3:c.G1035A:p.X345X	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.12173913043478274	NA	0	0	NaN	NA	NA	16	12	4	0
chr10	105238611	105238611	G	T	exonic	CALHM3	NaN	nonsynonymous SNV	CALHM3:NM_001129742:exon1:c.C179A:p.P60Q	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.34	M	2.17	T	-0.879	T	0.161	T	0.839	3.887	19.76	5.65	2.667	9.326	19.726	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.559823	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	285	276	9	0
chr10	105248586	105248586	T	C	ncRNA_intronic	NEURL1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	105308830	105308830	C	G	intronic	NEURL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr10	105331448	105331448	A	G	exonic	NEURL1	NaN	nonsynonymous SNV	NEURL1:NM_004210:exon3:c.A518G:p.D173G	NaN	NaN	NaN	0.03	D	1.0	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	2.135	M	1.54	T	-0.766	T	0.194	T	0.879	4.673	25.8	5.79	2.203	9.339	15.307	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.971979	nearby_gap_events	REJECT	46	40	6	0
chr10	105344756	105344756	T	C	exonic	NEURL1	NaN	synonymous SNV	NEURL1:NM_004210:exon4:c.T1113C:p.P371P	rs2236209	NaN	0.529153	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.086123	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	16
chr10	105349349	105349349	T	G	exonic	NEURL1	NaN	nonsynonymous SNV	NEURL1:NM_004210:exon5:c.T1418G:p.L473R	NaN	NaN	NaN	0.28	T	0.993	D	0.844	P	0.000	D	1.000	D	1.67	L	.	.	-0.703	T	0.253	T	0.914	3.136	16.48	5.2	1.980	3.453	9.577	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.507997	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	72	64	8	0
chr10	105349350	105349350	G	T	exonic	NEURL1	NaN	synonymous SNV	NEURL1:NM_004210:exon5:c.G1419T:p.L473L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.11068111455108365	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	8	6	0
chr10	105361816	105361816	T	G	exonic	SH3PXD2A	NaN	synonymous SNV	SH3PXD2A:NM_014631:exon14:c.A3075C:p.I1025I	rs4918031	NaN	0.879992	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.012	T	0.000	T	.	-0.492	1.739	2.38	0.247	0.097	4.904	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.79015	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	50
chr10	105363296	105363296	A	G	exonic	SH3PXD2A	NaN	nonsynonymous SNV	SH3PXD2A:NM_014631:exon14:c.T1595C:p.I532T	NaN	NaN	NaN	0.4	T	0.425	B	0.189	B	0.000	D	1.000	N	1.39	L	0.28	T	-0.847	T	0.191	T	0.371	1.084	9.423	5.47	2.072	5.949	15.549	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	24	14	8	0
chr10	105371242	105371242	T	T	intronic	SH3PXD2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	105373014	105373014	A	C	intronic	SH3PXD2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr10	105385885	105385885	T	C	intronic	SH3PXD2A	NaN	NaN	NaN	rs12415413	NaN	0.937101	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	105386775	105386775	T	T	intronic	SH3PXD2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	105410523	105410523	A	A	intronic	SH3PXD2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	105420862	105420862	G	A	exonic	SH3PXD2A	NaN	synonymous SNV	SH3PXD2A:NM_014631:exon8:c.C483T:p.A161A	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.831	T	0.203	T	.	1.507	10.99	4.41	2.504	2.963	7.294	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr10	105420863	105420863	G	A	exonic	SH3PXD2A	NaN	nonsynonymous SNV	SH3PXD2A:NM_014631:exon8:c.C482T:p.A161V	NaN	NaN	NaN	0.15	T	0.012	B	0.015	B	0.145	N	1.000	D	0	N	0.63	T	-1.028	T	0.127	T	0.216	2.816	15.38	0.465	0.178	0.146	11.954	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr10	105420867	105420867	C	T	exonic	SH3PXD2A	NaN	nonsynonymous SNV	SH3PXD2A:NM_014631:exon8:c.G478A:p.D160N	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.996	D	0.849	P	0.000	D	1.000	D	0.55	N	0.48	T	-0.898	T	0.184	T	0.123	5.482	35	5.37	2.504	7.818	19.103	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr10	105460230	105460230	T	G	intronic	SH3PXD2A	NaN	NaN	NaN	rs10786763	NaN	0.206869	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr10	105474235	105474235	T	G	intronic	SH3PXD2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	105606287	105606287	C	T	intronic	SH3PXD2A	NaN	NaN	NaN	rs4918060	NaN	0.865016	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	105614878	105614878	AGGGGC	AGGGC,AGGGGCG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	357.909	0	NaN	NA	NA	45	0	7	16
chr10	105614884	105614884	A	G	intronic	SH3PXD2A	NaN	NaN	NaN	rs4918064	NaN	0.996406	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	280.87	0	NaN	NA	NA	31	1	30	55
chr10	105670365	105670365	T	C	exonic	OBFC1	NaN	nonsynonymous SNV	OBFC1:NM_024928:exon3:c.A149G:p.N50S	rs146909879	NaN	NaN	0.36	T	0.999	D	0.918	D	0.000	D	0.993	D	2.14	M	0.93	T	-0.812	T	0.198	T	0.122	2.741	15.13	5.47	2.197	2.575	9.376	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.977871		KEEP	76	70	6	0
chr10	105677166	105677166	T	T	intronic	OBFC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	10569119	10569119	T	C	intergenic	LOC101928322,SFTA1P	dist=64807;dist=257283	NaN	NaN	rs9651534	NaN	0.898163	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	105752503	105752503	C	T	intronic	SLK	NaN	NaN	NaN	rs2476953	NaN	0.228435	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	64.825056	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	12	24	20
chr10	105778063	105778063	T	A	intronic	SLK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.396429	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	296	261	35	0
chr10	105780221	105780221	G	T	intronic	SLK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.928984	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	213	190	23	0
chr10	105793576	105793576	T	C	intronic	COL17A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.752272	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	65	59	6	0
chr10	105797332	105797332	T	T	intronic	COL17A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	105806375	105806375	T	G	intronic	COL17A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	105806387	105806387	T	A	intronic	COL17A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	105811851	105811851	T	T	intronic	COL17A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr10	105814826	105814826	C	A	intronic	COL17A1	NaN	NaN	NaN	rs805691	NaN	0.552915	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	265.676747	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	92	1	91	54
chr10	105815456	105815456	T	G	intronic	COL17A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	105815457	105815457	C	A	intronic	COL17A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	105815458	105815458	A	G	intronic	COL17A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	105821136	105821136	A	T	intronic	COL17A1	NaN	NaN	NaN	rs805704	NaN	0.83726	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	189.597	0	58.536476	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	0	19	54
chr10	105821294	105821294	A	G	intronic	COL17A1	NaN	NaN	NaN	rs805705	NaN	0.838059	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	57.581197	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	0	20	55
chr10	105824333	105824333	G	A	exonic	COL17A1	NaN	nonsynonymous SNV	COL17A1:NM_000494:exon10:c.C629T:p.T210M	rs805708	NaN	0.564896	0.12	T	1.0	D	0.947	D	0.006	N	0.340	P	1.995	M	0.46	T	-0.910	T	0.000	T	0.489	3.586	18.27	5.57	2.627	6.834	19.139	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	246.705866	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	82	0	82	44
chr10	105837379	105837379	A	A	intronic	COL17A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	105838227	105838227	T	T	intronic	COL17A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr10	105881881	105881881	G	C	UTR5	SFR1	NM_145247:c.-868G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.472158	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	97	92	5	0
chr10	105891289	105891289	A	T	intronic	CFAP43	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.025259392519454756	NA	0	0	17.225439	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	75	62	13	0
chr10	105893192	105893192	G	A	intronic	CFAP43	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	105902989	105902989	T	T	intronic	CFAP43	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr10	105921657	105921657	T	T	intronic	CFAP43	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	105921988	105921988	G	G	intronic	CFAP43	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	105922003	105922003	T	A	intronic	CFAP43	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr10	105928629	105928629	A	G	intronic	CFAP43	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr10	105947398	105947398	A	C	intronic	CFAP43	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.90575	0	NaN	NA	NA	14	12	2	3
chr10	105951998	105951998	T	C	exonic	CFAP43	NaN	nonsynonymous SNV	CFAP43:NM_025145:exon12:c.A1505G:p.N502S	NaN	NaN	NaN	0.84	T	0.004	B	0.007	B	0.112	N	1.000	N	1.59	L	1.62	T	-0.982	T	0.057	T	0.033	-0.360	2.303	2.25	0.136	2.090	10.961	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.570797	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	56	52	4	0
chr10	106019279	106019279	T	T	intronic	GSTO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	106139769	106139769	T	C	intronic	CFAP58	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr10	106139770	106139770	T	G	intronic	CFAP58	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr10	106139771	106139771	G	A	intronic	CFAP58	NaN	NaN	NaN	rs375550908	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	106207403	106207403	T	T	intronic	CFAP58	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	106602537	106602537	C	T	intronic	SORCS3	NaN	NaN	NaN	rs41317264	NaN	0.127596	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	45	19	26	12
chr10	106907360	106907360	T	T	intronic	SORCS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr10	106970825	106970825	T	T	intronic	SORCS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	106974179	106974179	T	T	intronic	SORCS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	106974283	106974283	C	C	exonic	SORCS3	NaN	synonymous SNV	SORCS3:NM_014978:exon18:c.C2459C:p.A820A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	64	NaN	NA	NA	108	89	0	0
chr10	10812378	10812378	G	T	intergenic	LOC101928322,SFTA1P	dist=308066;dist=14024	NaN	NaN	rs10905821	NaN	0.192093	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr10	10812385	10812385	A	A	intergenic	LOC101928322,SFTA1P	dist=308073;dist=14017	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr10	108337078	108337078	A	G	UTR3	SORCS1	NM_052918:c.*100T>C,NM_001206572:c.*228T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2569169960474291	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr10	108337298	108337298	G	A	exonic	SORCS1	NaN	synonymous SNV	SORCS1:NM_052918:exon26:c.C3387T:p.P1129P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.598176	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	41	32	9	0
chr10	108338930	108338930	C	T	exonic	SORCS1	NaN	nonsynonymous SNV	SORCS1:NM_001013031:exon26:c.G3451A:p.E1151K,SORCS1:NM_001206569:exon26:c.G3451A:p.E1151K,SORCS1:NM_001206572:exon26:c.G3451A:p.E1151K	NaN	NaN	NaN	.	.	0.235	B	0.142	B	0.002	N	1.000	D	1.355	L	2.29	T	-1.112	T	0.063	T	0.416	3.862	19.62	4.99	1.493	5.781	16.477	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.659517	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	154	143	11	0
chr10	108338931	108338931	A	C	exonic	SORCS1	NaN	synonymous SNV	SORCS1:NM_001013031:exon26:c.T3450G:p.S1150S,SORCS1:NM_001206569:exon26:c.T3450G:p.S1150S,SORCS1:NM_001206572:exon26:c.T3450G:p.S1150S	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.902	T	0.194	T	.	0.788	8.156	3.59	0.505	1.049	6.946	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.960868	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	156	145	11	0
chr10	108377844	108377844	T	T	intronic	SORCS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr10	108389249	108389249	T	C	intronic	SORCS1	NaN	NaN	NaN	rs1322004	NaN	0.965455	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	156.749562	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	0	53	58
chr10	108434773	108434773	T	T	intronic	SORCS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	108439103	108439103	A	C	intronic	SORCS1	NaN	NaN	NaN	rs821929	NaN	0.775359	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.193564	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	48
chr10	108447975	108447975	C	T	exonic	SORCS1	NaN	nonsynonymous SNV	SORCS1:NM_001013031:exon10:c.G1535A:p.R512K,SORCS1:NM_001206569:exon10:c.G1535A:p.R512K,SORCS1:NM_001206570:exon10:c.G1535A:p.R512K,SORCS1:NM_001206571:exon10:c.G1535A:p.R512K,SORCS1:NM_001206572:exon10:c.G1535A:p.R512K,SORCS1:NM_052918:exon10:c.G1535A:p.R512K	NaN	NaN	NaN	.	.	0.002	B	0.011	B	0.000	D	0.637	N	0.605	N	1.56	T	-1.064	T	0.053	T	0.101	2.843	15.47	6.17	2.941	1.363	15.946	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.04983108569180235	NA	0	0	NaN	NA	NA	55	44	11	2
chr10	108458957	108458957	T	T	intronic	SORCS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	108466230	108466230	T	T	intronic	SORCS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr10	108489874	108489874	T	C	splicing	SORCS1	NM_052918:exon7:c.960-2A>G,NM_001206570:exon7:c.960-2A>G,NM_001206572:exon7:c.960-2A>G,NM_001013031:exon7:c.960-2A>G,NM_001206571:exon7:c.960-2A>G,NM_001206569:exon7:c.960-2A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.350	17.28	5.89	2.254	4.328	12.708	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	75	42	20	0
chr10	108923704	108923704	A	G	intronic	SORCS1	NaN	NaN	NaN	rs2993097	NaN	0.253994	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.058132	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	14	6	25
chr10	1094928	1094928	C	A	exonic	IDI1	NaN	nonsynonymous SNV	IDI1:NM_004508:exon1:c.G16T:p.A6S	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.003	B	0.001	B	0.721	U	1.000	N	.	.	.	.	-1.034	T	0.061	T	0.176	1.536	11.09	-3.56	-1.296	-0.465	2.359	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	42.2257	19	NaN	NA	NA	9	3	6	6
chr10	111633106	111633106	T	G	intronic	XPNPEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.597736	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	138	129	9	0
chr10	111637422	111637422	T	C	intronic	XPNPEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr10	111637423	111637423	T	A	intronic	XPNPEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr10	111642023	111642023	T	T	intronic	XPNPEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr10	111642409	111642409	G	A	intronic	XPNPEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.462425	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	185	178	7	0
chr10	111642412	111642412	G	T	intronic	XPNPEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.494104	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	179	172	7	0
chr10	111651421	111651421	T	G	intronic	XPNPEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	111651422	111651422	C	A	intronic	XPNPEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	111651479	111651479	C	A	splicing	XPNPEP1	NM_001167604:exon6:c.415+1G>T,NM_020383:exon6:c.415+1G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.338	22.8	5.49	2.566	7.289	17.573	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.102727	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	22	16	6	0
chr10	111967849	111967849	G	T	intronic	MXI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.06249999999999998	NA	0	0	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr10	111967933	111967933	C	T	intronic	MXI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	31	21	10	1
chr10	112333446	112333446	A	G	intronic	SMC3	NaN	NaN	NaN	rs140102981	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	48	42	6	1
chr10	112343841	112343841	A	G	intronic	SMC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.248703	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	530	512	18	0
chr10	112350715	112350715	C	T	intronic	SMC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.83587	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	80	76	4	0
chr10	112356331	112356331	G	A	intronic	SMC3	NaN	NaN	NaN	rs7075340	NaN	0.957268	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	111.773149	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	0	42	57
chr10	112359605	112359605	A	A	intronic	SMC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	112360936	112360936	A	G	intronic	SMC3	NaN	NaN	NaN	rs11195213	NaN	0.148962	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	14	11	3	15
chr10	112361870	112361870	A	G	exonic	SMC3	NaN	synonymous SNV	SMC3:NM_005445:exon25:c.A3039G:p.S1013S	rs2419565	NaN	0.986821	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	560.907902	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	180	0	180	58
chr10	112541776	112541776	A	A	intronic	RBM20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	112542996	112542996	G	C	intronic	RBM20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	112542997	112542997	T	G	intronic	RBM20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	112542998	112542998	G	A	intronic	RBM20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	112544298	112544298	G	A	intronic	RBM20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	15	2	13	0
chr10	112544300	112544300	A	G	intronic	RBM20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	15	2	13	0
chr10	112572458	112572458	G	C	exonic	RBM20	NaN	nonsynonymous SNV	RBM20:NM_001134363:exon9:c.G2303C:p.W768S	rs1417635	NaN	0.991014	0.85	T	0.0	B	0.0	B	0.686	N	1.000	P	-1.24	N	-0.4	T	-0.995	T	0.000	T	0.034	-2.468	0.003	-2.2	-1.521	0.613	9.457	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	185.961613	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	1	65	57
chr10	112572631	112572631	AAT	AGT,GTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	19.7989	0	NaN	NA	NA	13	7	2	0
chr10	112589750	112589750	A	C	intronic	RBM20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr10	1125936	1125936	C	T	intronic	WDR37	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.515485	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	233	223	10	0
chr10	112595719	112595719	G	C	exonic	RBM20	NaN	nonsynonymous SNV	RBM20:NM_001134363:exon14:c.G3667C:p.E1223Q	rs942077	NaN	0.697085	0.03	D	0.834	P	0.322	B	.	.	0.027	P	1.245	L	-2.99	D	-0.917	T	0.000	T	0.087	2.837	15.45	5.17	2.410	3.961	17.448	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	74.977	0	NaN	NA	NA	200	0	200	14
chr10	112642619	112642619	T	T	intronic	PDCD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr10	112760138	112760138	A	T	intronic	SHOC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.47903	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	23	18	5	0
chr10	11291022	11291022	T	T	intronic	CELF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	49	39	0	0
chr10	11299735	11299735	A	T	exonic	CELF2	NaN	synonymous SNV	CELF2:NM_001025076:exon5:c.A345T:p.V115V,CELF2:NM_001025077:exon5:c.A417T:p.V139V,CELF2:NM_001083591:exon5:c.A345T:p.V115V,CELF2:NM_006561:exon5:c.A438T:p.V146V	rs2277212	ID=COSM1345795,COSM1345794;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.78115	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	121	24	97	47
chr10	11308513	11308513	C	T	intronic	CELF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	26	18	8	0
chr10	11370820	11370820	T	A	ncRNA_intronic	CELF2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr10	113890536	113890536	G	G	intergenic	ADRA2A,GPAM	dist=1049874;dist=19086	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr10	113914318	113914318	T	T	intronic	GPAM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	12	8	0	0
chr10	113960684	113960684	A	T	intergenic	GPAM,TECTB	dist=17147;dist=82730	NaN	NaN	rs7071332	NaN	0.373203	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	114045979	114045979	G	A	intronic	TECTB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.505933	possible_contamination	REJECT	75	70	5	0
chr10	114046073	114046073	T	C	intronic	TECTB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.1909392789373829	NA	0	0	12.090908	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	155	138	17	0
chr10	114046074	114046074	C	T	intronic	TECTB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.543129	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	153	137	16	0
chr10	114171354	114171354	A	A	intronic	ACSL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	6	0	0
chr10	114181873	114181873	T	C	intronic	ACSL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	114186170	114186170	A	A	intronic	ACSL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr10	114186624	114186624	G	A	intronic	ACSL5	NaN	NaN	NaN	rs2256368	NaN	0.963858	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	173.972098	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	0	57	56
chr10	114193061	114193061	A	G	intronic	ZDHHC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.286591	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	47	41	6	0
chr10	1142208	1142208	T	C	intronic	WDR37	NaN	NaN	NaN	rs10794716	NaN	0.98762	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	0.455	6.472	-1.13	-0.518	0.022	0.942	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	161.875902	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	0	53	58
chr10	114297930	114297930	A	A	intronic	VTI1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	114799932	114799932	A	C	intronic	TCF7L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	115335584	115335584	T	T	intronic	HABP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	115336820	115336820	T	C	intronic	HABP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr10	115340486	115340486	G	T	intronic	HABP2	NaN	NaN	NaN	rs375238541	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	39.414942	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	161	134	27	0
chr10	115342950	115342950	C	T	intronic	HABP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	115342957	115342957	T	C	intronic	HABP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	6	3	0
chr10	115370254	115370254	A	G	exonic	NRAP	NaN	synonymous SNV	NRAP:NM_006175:exon30:c.T3462C:p.I1154I,NRAP:NM_001261463:exon31:c.T3567C:p.I1189I,NRAP:NM_198060:exon31:c.T3567C:p.I1189I	rs12243176	NaN	0.469449	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	57.142662	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	17	24	42
chr10	115370274	115370274	T	C	exonic	NRAP	NaN	nonsynonymous SNV	NRAP:NM_006175:exon30:c.A3442G:p.I1148V,NRAP:NM_001261463:exon31:c.A3547G:p.I1183V,NRAP:NM_198060:exon31:c.A3547G:p.I1183V	rs10749138	ID=COSM1180648;OCCURENCE=1(upper_aerodigestive_tract)	0.462859	1	T	0.0	B	0.001	B	0.012	N	0.000	P	0.44	N	2.66	T	-0.924	T	0.000	T	0.043	0.715	7.807	0.626	-0.123	0.173	9.731	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	63.827301	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	17	26	42
chr10	115375441	115375441	T	T	intronic	NRAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr10	115381553	115381553	T	T	intronic	NRAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	115423094	115423094	G	C	intronic	NRAP	NaN	NaN	NaN	rs12770981	ID=COSN163764;OCCURENCE=1(breast)	0.302716	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.189168	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	3	13	33
chr10	115423180	115423180	C	T	exonic	NRAP	NaN	nonsynonymous SNV	NRAP:NM_001261463:exon2:c.G98A:p.C33Y,NRAP:NM_006175:exon2:c.G98A:p.C33Y,NRAP:NM_198060:exon2:c.G98A:p.C33Y	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	4.125	H	-5.74	D	0.999	D	0.989	D	0.972	4.676	25.8	5.77	2.737	7.238	19.982	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.699009	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	15	13	2	0
chr10	115423524	115423524	T	C	intronic	NRAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	6	4	0
chr10	115423706	115423706	T	T	UTR5	NRAP	NM_006175:c.-65A>A,NM_198060:c.-65A>A,NM_001261463:c.-65A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	115486226	115486226	A	A	intronic	CASP7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	115526377	115526377	T	T	exonic	PLEKHS1	NaN	synonymous SNV	PLEKHS1:NM_182601:exon3:c.T106T:p.W36W,PLEKHS1:NM_024889:exon4:c.T124T:p.W42W	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	21	21	0	0
chr10	115528738	115528738	A	A	intronic	PLEKHS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	115534820	115534820	A	G	intronic	PLEKHS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.625437	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	399	393	6	0
chr10	115601420	115601420	A	G	intronic	DCLRE1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr10	115605394	115605394	T	C	intronic	DCLRE1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr10	115608655	115608655	C	A	intronic	DCLRE1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	12	6	4	0
chr10	115707321	115707321	G	G	intergenic	NHLRC2,ADRB1	dist=35056;dist=96485	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	11574168	11574168	G	G	intronic	USP6NL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	135	87	0	0
chr10	115895809	115895809	T	C	intronic	CCDC186	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	19	12	7	0
chr10	115904071	115904071	T	G	intronic	CCDC186	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	115904075	115904075	G	C	intronic	CCDC186	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	115904076	115904076	T	C	intronic	CCDC186	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	11	0	9	0
chr10	115904445	115904445	A	A	intronic	CCDC186	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr10	115962953	115962953	A	A	intronic	TDRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	19	17	0	0
chr10	115966154	115966154	A	C	intronic	TDRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.375954	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	170	152	18	0
chr10	116013367	116013367	CT	C,CC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	67.7782	0	NaN	NA	NA	180	135	30	22
chr10	116044587	116044587	C	T	intronic	VWA2	NaN	NaN	NaN	rs10787521	NaN	0.416534	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	127	107	20	37
chr10	116048928	116048928	C	G	exonic	VWA2	NaN	nonsynonymous SNV	VWA2:NM_001272046:exon12:c.C1802G:p.A601G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.958	D	0.002	N	0.807	N	2.42	M	-1.17	T	-0.038	T	0.572	D	0.419	4.167	21.6	4.52	2.547	0.890	9.317	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	17	15	2	0
chr10	116058970	116058970	T	T	intronic	AFAP1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	116091555	116091555	T	C	intronic	AFAP1L2	NaN	NaN	NaN	rs10787524	NaN	0.736621	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.193698	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	2	7	51
chr10	116100537	116100537	A	A	intronic	AFAP1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	116205029	116205029	A	A	intronic	ABLIM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	116205030	116205030	A	A	intronic	ABLIM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	116205036	116205036	A	A	intronic	ABLIM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	116205038	116205038	T	T	intronic	ABLIM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	116245101	116245101	A	G	exonic	ABLIM1	NaN	synonymous SNV	ABLIM1:NM_006720:exon4:c.T132C:p.Y44Y,ABLIM1:NM_001003408:exon9:c.T900C:p.Y300Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.4466	0	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr10	116251686	116251686	T	A	intronic	ABLIM1	NaN	NaN	NaN	rs12784116	NaN	0.198882	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	431.68472	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	145	1	144	37
chr10	116590515	116590515	G	A	intronic	FAM160B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.021547	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	54	51	3	0
chr10	116605871	116605871	A	G	intronic	FAM160B1	NaN	NaN	NaN	rs147535557	NaN	0.00339457	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.726262	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	150	139	11	0
chr10	116887543	116887543	G	T	intronic	ATRNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.528377	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	163	153	10	0
chr10	117041050	117041050	A	G	intronic	ATRNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	13	7	6	0
chr10	117041053	117041053	T	A	intronic	ATRNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	12	6	5	0
chr10	117041057	117041057	A	T	intronic	ATRNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr10	117041058	117041058	A	G	intronic	ATRNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr10	117045911	117045911	A	G	intronic	ATRNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.040584	nearby_gap_events	REJECT	153	146	7	0
chr10	117059529	117059529	T	G	intronic	ATRNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	5	3	0
chr10	117278861	117278861	A	G	intronic	ATRNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr10	117309098	117309098	G	A	intronic	ATRNL1	NaN	NaN	NaN	rs1336108	NaN	0.596246	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	574.481449	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	202	1	201	53
chr10	1175110	1175110	T	C	intronic	WDR37	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	37	23	14	0
chr10	11789511	11789511	C	G	intronic	ECHDC3	NaN	NaN	NaN	rs4750092	NaN	0.913538	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2060.19	0	NaN	NA	NA	199	0	199	54
chr10	11797675	11797675	G	A	intronic	ECHDC3	NaN	NaN	NaN	rs3750695	NaN	0.231629	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	57	44	13	23
chr10	118031619	118031619	G	A	UTR5	GFRA1	NM_001145453:c.-78C>T,NM_005264:c.-78C>T,NM_145793:c.-78C>T	NaN	NaN	rs2577360	NaN	0.4998	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.777576	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	47
chr10	11805354	11805354	A	G	exonic	ECHDC3	NaN	synonymous SNV	ECHDC3:NM_024693:exon5:c.A723G:p.A241A	rs12258196	NaN	0.515176	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.471271	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	6	15	48
chr10	11805357	11805357	G	A	exonic	ECHDC3	NaN	synonymous SNV	ECHDC3:NM_024693:exon5:c.G726A:p.S242S	rs10906011	NaN	0.515775	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	60.350534	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	6	22	48
chr10	11805455	11805455	T	C	exonic	ECHDC3	NaN	nonsynonymous SNV	ECHDC3:NM_024693:exon5:c.T824C:p.V275A	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.465	P	0.753	P	0.000	D	1.000	D	0.85	L	-0.23	T	-0.604	T	0.323	T	0.469	4.756	26.6	5.73	2.184	7.607	15.184	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.505335	nearby_gap_events	REJECT	131	123	8	0
chr10	118101538	118101538	T	T	intronic	CCDC172	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr10	118137939	118137939	A	T	exonic	CCDC172	NaN	stopgain	CCDC172:NM_198515:exon8:c.A658T:p.K220X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.447	17.67	5.56	2.240	5.154	13.541	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.910524	nearby_gap_events	REJECT	85	79	6	0
chr10	118231213	118231213	G	C	intronic	PNLIPRP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	118231219	118231219	C	A	intronic	PNLIPRP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	118231220	118231220	A	G	intronic	PNLIPRP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	118231221	118231221	T	C	intronic	PNLIPRP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr10	118231406	118231406	A	C	intronic	PNLIPRP3	NaN	NaN	NaN	rs10749217	NaN	0.750599	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	139.490806	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	0	45	55
chr10	118354437	118354437	A	A	intronic	PNLIPRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	118359496	118359496	G	A	intronic	PNLIPRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr10	118363642	118363642	T	C	exonic	PNLIPRP1	NaN	synonymous SNV	PNLIPRP1:NM_001303135:exon11:c.T1164C:p.S388S,PNLIPRP1:NM_006229:exon11:c.T1164C:p.S388S	rs3010501	NaN	0.70627	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	84.668226	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	16	32	50
chr10	118364967	118364967	G	C	exonic	PNLIPRP1	NaN	nonsynonymous SNV	PNLIPRP1:NM_001303135:exon12:c.G1242C:p.E414D,PNLIPRP1:NM_006229:exon12:c.G1242C:p.E414D	rs2305204	NaN	0.125399	0.54	T	0.0	B	0.001	B	0.032	N	0.000	P	1.29	L	-0.12	T	-0.961	T	0.000	T	0.243	1.556	11.16	4.63	1.331	0.781	7.095	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	48.326371	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	10	20	5
chr10	118380483	118380483	G	A	UTR5	PNLIPRP2	NM_005396:c.-5G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.626021	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	37	34	3	0
chr10	118380627	118380627	A	G	intronic	PNLIPRP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	118387282	118387282	A	G	exonic	PNLIPRP2	NaN	unknown	UNKNOWN	rs11544712	ID=COSM427116,COSM427117;OCCURENCE=1(breast)	0.36222	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.267742	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	3
chr10	118389617	118389617	A	G	intronic	PNLIPRP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr10	118389618	118389618	A	C	intronic	PNLIPRP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr10	118389621	118389621	A	G	intronic	PNLIPRP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr10	118404672	118404672	A	A	downstream	PNLIPRP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr10	118423547	118423547	G	C	UTR3	C10orf82	NM_144661:c.*134C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.07	T	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-0.978	T	0.091	T	.	0.142	4.761	-1.11	-0.239	0.133	4.747	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr10	118438990	118438990	C	G	intronic	HSPA12A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.035672	clustered_read_position	REJECT	84	78	6	0
chr10	118452044	118452044	G	T	intronic	HSPA12A	NaN	NaN	NaN	rs2240711	NaN	0.513978	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	64.3482	0	60.060087	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	89	63	26	37
chr10	118466664	118466664	G	A	intronic	HSPA12A	NaN	NaN	NaN	rs79355850	NaN	0.340056	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.34285714285714414	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr10	118615304	118615304	A	C	intronic	ENO4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr10	118633548	118633548	A	G	intronic	ENO4	NaN	NaN	NaN	rs1637574	NaN	0.999002	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	831.447	0	NaN	NA	NA	78	1	77	17
chr10	118661561	118661561	A	T	intronic	KIAA1598	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr10	118661565	118661565	G	T	intronic	KIAA1598	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr10	118897635	118897635	A	G	UTR5	VAX1	NM_199131:c.-68T>C,NM_001112704:c.-68T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr10	119014948	119014948	C	A	intronic	SLC18A2	NaN	NaN	NaN	rs363343	NaN	0.637979	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	90.512551	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	0	31	57
chr10	119026566	119026566	T	C	intronic	SLC18A2	NaN	NaN	NaN	rs363227	NaN	0.723642	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	164.401316	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	55	0	55	57
chr10	119029586	119029586	G	G	exonic	SLC18A2	NaN	synonymous SNV	SLC18A2:NM_003054:exon14:c.G1191G:p.M397M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	98	63	0	0
chr10	119029744	119029744	G	A	intronic	SLC18A2	NaN	NaN	NaN	rs363272	NaN	0.722843	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	222.237574	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	75	0	75	57
chr10	119044545	119044545	G	A	exonic	PDZD8	NaN	synonymous SNV	PDZD8:NM_173791:exon5:c.C1699T:p.L567L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.73003	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	49	42	7	0
chr10	1193728	1193728	A	A	intergenic	WDR37,LINC00200	dist=15491;dist=11980	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	119578959	119578959	A	G	intergenic	EMX2,RAB11FIP2	dist=269902;dist=185468	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	119590717	119590717	G	G	intergenic	EMX2,RAB11FIP2	dist=281660;dist=173710	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	11978499	11978499	T	G	intronic	UPF2	NaN	NaN	NaN	rs7921794	NaN	0.708267	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	53.2362	0	35.477286	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	62	43	19	31
chr10	119805740	119805740	A	A	UTR5	RAB11FIP2	NM_014904:c.-66T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	13	9	0	0
chr10	12005964	12005964	A	C	intronic	UPF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	12005965	12005965	A	G	intronic	UPF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	120095165	120095165	A	G	intronic	FAM204A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.431943	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	145	135	10	0
chr10	12021069	12021069	T	C	exonic	UPF2	NaN	nonsynonymous SNV	UPF2:NM_015542:exon9:c.A1940G:p.D647G,UPF2:NM_080599:exon9:c.A1940G:p.D647G	NaN	NaN	NaN	0.27	T	1.0	D	0.989	D	0.000	D	1.000	D	2.255	M	1.9	T	-0.931	T	0.167	T	0.919	4.477	24.0	6.08	2.330	7.698	16.643	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	201	178	23	0
chr10	12021312	12021312	G	A	intronic	UPF2	NaN	NaN	NaN	rs3740023	NaN	0.333267	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	0.1238390092879262	Somatic	192.457	60	57.562874	clustered_read_position	REJECT	30	7	23	32
chr10	120353899	120353899	C	A	exonic	PRLHR	NaN	synonymous SNV	PRLHR:NM_004248:exon2:c.G858T:p.V286V	rs116062593	NaN	0.0141773	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	41.94963	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	12	18	3
chr10	120353910	120353910	T	C	exonic	PRLHR	NaN	nonsynonymous SNV	PRLHR:NM_004248:exon2:c.A847G:p.I283V	rs1613448	NaN	0.978035	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-1.63	N	1.08	T	-0.945	T	0.000	T	0.114	-0.568	1.439	4.38	1.065	3.866	12.564	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.623025	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	0	30	58
chr10	12039805	12039805	G	A	intronic	UPF2	NaN	NaN	NaN	rs144296206	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	133	NaN	NA	NA	183	19	162	2
chr10	120446156	120446156	G	T	intronic	CACUL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.603592	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	154	140	14	0
chr10	120450921	120450921	A	G	intronic	CACUL1	NaN	NaN	NaN	rs182158739	NaN	0.0071885	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	18.9079	0	NaN	NA	NA	39	30	9	2
chr10	120460761	120460761	A	G	intronic	CACUL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.732727	nearby_gap_events	REJECT	76	68	8	0
chr10	120514147	120514147	G	A	exonic	CACUL1	NaN	nonsynonymous SNV	CACUL1:NM_153810:exon1:c.C128T:p.S43L	rs373912454	NaN	NaN	0.81	T	0.001	B	0.0	B	0.093	N	0.994	N	0.55	N	.	.	-1.026	T	0.052	T	0.115	0.938	8.825	2.69	1.103	3.666	7.889	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.09072580645161439	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr10	120568545	120568545	C	T	intergenic	CACUL1,NANOS1	dist=53787;dist=220683	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	12071397	12071397	G	A	exonic	UPF2	NaN	synonymous SNV	UPF2:NM_015542:exon3:c.C492T:p.L164L,UPF2:NM_080599:exon3:c.C492T:p.L164L	rs11257490	NaN	0.261781	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.290571	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	25	12	20
chr10	12077220	12077220	T	T	exonic	UPF2	NaN	synonymous SNV	UPF2:NM_015542:exon2:c.A203A:p.E68E,UPF2:NM_080599:exon2:c.A203A:p.E68E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr10	120790328	120790328	G	A	UTR3	NANOS1	NM_199461:c.*136G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	120802356	120802356	T	C	intronic	EIF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	37	25	12	0
chr10	120802358	120802358	A	A	intronic	EIF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	120810681	120810681	T	T	intronic	EIF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	120817450	120817450	A	G	intronic	EIF3A	NaN	NaN	NaN	rs10886375	NaN	0.8127	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	312.814726	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	117	0	117	58
chr10	120832359	120832359	C	G	intronic	EIF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr10	120832360	120832360	A	C	intronic	EIF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr10	120832361	120832361	A	T	intronic	EIF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr10	120832362	120832362	T	G	intronic	EIF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr10	120832363	120832363	T	G	intronic	EIF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr10	120832364	120832364	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	13	5	5,3	0
chr10	120832896	120832896	T	T	intronic	EIF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	120883099	120883099	A	A	ncRNA_intronic	FAM45B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	120900589	120900589	A	C	UTR3	SFXN4	NM_213649:c.*165T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	13	2	11	0
chr10	120916072	120916072	G	C	intronic	SFXN4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	120917616	120917616	G	A	intronic	SFXN4	NaN	NaN	NaN	rs2275112	NaN	0.266973	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.46514	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	2	7	36
chr10	120919179	120919179	G	A	intronic	SFXN4	NaN	NaN	NaN	rs3740558	NaN	0.508187	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.883849	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	54	44	10	43
chr10	120933324	120933324	G	A	exonic	PRDX3	NaN	synonymous SNV	PRDX3:NM_001302272:exon4:c.C372T:p.D124D,PRDX3:NM_006793:exon4:c.C372T:p.D124D	rs3758609	NaN	0.953275	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	197.807	0	56.794892	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	0	21	42
chr10	120938324	120938324	C	G	UTR5	PRDX3	NM_001302272:c.-22G>C,NM_006793:c.-22G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	121042878	121042878	G	C	intronic	GRK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	121042879	121042879	A	T	intronic	GRK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	121042880	121042880	A	C	intronic	GRK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	121042881	121042881	A	T	intronic	GRK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	121085997	121085997	C	C	intronic	GRK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	121182612	121182612	T	T	intronic	GRK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	121191186	121191186	C	A	intronic	GRK5	NaN	NaN	NaN	rs7099478	NaN	0.533147	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	51.034222	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	107	82	25	49
chr10	121196134	121196134	T	C	intronic	GRK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	97	26	70	0
chr10	121212406	121212406	G	G	intronic	GRK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr10	121285466	121285466	T	C	intronic	RGS10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	121285467	121285467	T	A	intronic	RGS10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	121285468	121285468	T	C	intronic	RGS10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	121285470	121285470	G	A	intronic	RGS10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	121285473	121285473	A	T	intronic	RGS10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	121285474	121285474	A	C	intronic	RGS10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	121285477	121285477	T	G	intronic	RGS10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	121336101	121336101	T	T	intronic	TIAL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	121336288	121336288	A	T	intronic	TIAL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	50	19	31	0
chr10	121336564	121336564	T	T	intronic	TIAL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	121337056	121337056	C	A	intronic	TIAL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.332476	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	135	129	6	0
chr10	12135967	12135967	C	T	intronic	DHTKD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	121429633	121429633	T	C	exonic	BAG3	NaN	nonsynonymous SNV	BAG3:NM_004281:exon2:c.T451C:p.C151R	rs2234962	NaN	0.0964457	0.52	T	0.664	P	0.317	B	0.254	N	0.000	P	0.695	N	-1.02	T	-1.099	T	0.000	T	0.289	3.301	17.09	0.064	-0.242	0.566	5.413	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.829219	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	6	27	26
chr10	121431948	121431948	A	C	exonic	BAG3	NaN	nonsynonymous SNV	BAG3:NM_004281:exon3:c.A689C:p.K230T	NaN	NaN	NaN	0.26	T	1.0	D	0.989	D	0.001	D	0.997	D	2.125	M	-1.26	T	0.207	D	0.651	D	0.672	4.361	23.0	6.17	2.371	4.514	16.822	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.518826	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	176	160	16	0
chr10	121436065	121436065	T	C	exonic	BAG3	NaN	synonymous SNV	BAG3:NM_004281:exon4:c.T999C:p.P333P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.130055	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	40	37	3	0
chr10	121541109	121541109	T	A	intronic	INPP5F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	121565093	121565093	A	A	intronic	INPP5F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	121595220	121595220	A	G	intronic	MCMBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	149	139	10	0
chr10	12159647	12159647	A	G	intronic	DHTKD1	NaN	NaN	NaN	rs2399771	NaN	0.958466	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	93.679616	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	0	35	54
chr10	121598016	121598016	A	T	intronic	MCMBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	121619451	121619451	A	G	intronic	MCMBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	10	0	10	0
chr10	121657923	121657923	T	G	intronic	SEC23IP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	121689267	121689267	A	T	exonic	SEC23IP	NaN	nonsynonymous SNV	SEC23IP:NM_007190:exon14:c.A2462T:p.Y821F	NaN	NaN	NaN	1	T	0.84	P	0.669	P	0.000	D	1.000	D	-0.9	N	2.46	T	-1.007	T	0.024	T	0.733	1.669	11.54	5.48	2.082	9.014	15.555	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.039788	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	15	11	4	0
chr10	121689478	121689478	A	A	intronic	SEC23IP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	12191933	12191933	C	T	exonic	SEC61A2	NaN	synonymous SNV	SEC61A2:NM_001142628:exon5:c.C369T:p.A123A,SEC61A2:NM_001142627:exon6:c.C435T:p.A145A,SEC61A2:NM_018144:exon6:c.C435T:p.A145A	rs10466280	NaN	0.424321	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-0.931	T	0.000	T	.	0.235	5.271	-3.7	-1.051	-0.009	6.678	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	65.536032	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	8	25	38
chr10	12199864	12199864	A	T	intronic	SEC61A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	11	5	5	0
chr10	12199865	12199865	A	T	intronic	SEC61A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	11	5	5	0
chr10	12199867	12199867	G	C	intronic	SEC61A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr10	12209853	12209853	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	1	2,3	0
chr10	122216840	122216840	T	T	exonic	PPAPDC1A	NaN	synonymous SNV	PPAPDC1A:NM_001030059:exon1:c.T23T:p.I8I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	73	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	122280643	122280643	G	G	intronic	PPAPDC1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	122304199	122304199	G	T	intronic	PPAPDC1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	11	6	3	0
chr10	122344920	122344920	T	T	ncRNA_intronic	MIR5694	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	122344935	122344935	T	T	ncRNA_intronic	MIR5694	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	12238311	12238311	A	G	exonic	CDC123	NaN	nonsynonymous SNV	CDC123:NM_006023:exon1:c.A67G:p.I23V	NaN	NaN	NaN	0.2	T	0.01	B	0.02	B	0.000	D	1.000	D	1.485	L	.	.	-0.848	T	0.190	T	0.359	2.120	13.05	4.58	2.053	6.632	13.366	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.857127	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	147	142	5	0
chr10	12252217	12252217	G	G	intronic	CDC123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	25	21	0	0
chr10	12257681	12257681	T	G	intronic	CDC123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.481167	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	68	59	9	0
chr10	122618344	122618344	A	A	ncRNA_intronic	MIR5694	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	122661656	122661656	T	T	ncRNA_intronic	MIR5694	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	122665488	122665488	T	C	exonic	WDR11	NaN	nonsynonymous SNV	WDR11:NM_018117:exon27:c.T3392C:p.L1131P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.998	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	2.125	M	-2.97	D	0.900	D	0.855	D	0.985	3.961	20.3	5.63	2.128	7.618	15.842	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.368577	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	36	33	3	0
chr10	122666210	122666210	T	T	ncRNA_intronic	MIR5694	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr10	122666437	122666437	A	A	ncRNA_intronic	MIR5694	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr10	12284392	12284392	G	G	intronic	CDC123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	1230968	1230968	C	T	exonic	ADARB2	NaN	nonsynonymous SNV	ADARB2:NM_018702:exon9:c.G1876A:p.A626T	rs2271275	ID=COSM1560925;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.543131	0.22	T	0.623	P	0.376	B	0.000	D	0.000	P	1.68	L	-3.3	D	-0.926	T	0.000	T	0.383	2.281	13.59	4.81	2.220	1.502	17.899	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	127.561	0	41.431868	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	33
chr10	123246773	123246773	T	A	intronic	FGFR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	123247669	123247669	AC	A,AA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	619.612	0	NaN	NA	NA	174	72	88	2
chr10	123247670	123247670	C	A	intronic	FGFR2	NaN	NaN	NaN	rs4647915	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.509428	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	85	76	9	0
chr10	123298158	123298158	T	C	exonic	FGFR2	NaN	synonymous SNV	FGFR2:NM_001144916:exon3:c.A351G:p.V117V,FGFR2:NM_001144918:exon4:c.A351G:p.V117V,FGFR2:NM_023029:exon4:c.A429G:p.V143V,FGFR2:NM_001144913:exon5:c.A696G:p.V232V,FGFR2:NM_001144914:exon5:c.A696G:p.V232V,FGFR2:NM_001144915:exon5:c.A429G:p.V143V,FGFR2:NM_001144919:exon5:c.A429G:p.V143V,FGFR2:NM_000141:exon6:c.A696G:p.V232V,FGFR2:NM_001144917:exon6:c.A696G:p.V232V,FGFR2:NM_022970:exon6:c.A696G:p.V232V	rs1047100	NaN	0.795327	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	117.853756	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	19	47	55
chr10	123596254	123596254	T	C	exonic	ATE1	NaN	synonymous SNV	ATE1:NM_001288735:exon8:c.A948G:p.S316S,ATE1:NM_001288734:exon9:c.A891G:p.S297S,ATE1:NM_001001976:exon10:c.A1236G:p.S412S,ATE1:NM_001288736:exon10:c.A1215G:p.S405S,ATE1:NM_007041:exon10:c.A1236G:p.S412S	rs4237536	NaN	0.889177	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.024	T	0.000	T	.	0.868	8.518	-6.52	-1.150	-1.608	2.518	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	208.98741	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	71	0	71	58
chr10	123724661	123724661	T	T	intronic	NSMCE4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	123727347	123727347	A	C	intronic	NSMCE4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.069836	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	45	33	12	0
chr10	123727351	123727351	A	A	intronic	NSMCE4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	123733511	123733511	C	G	intronic	NSMCE4A	NaN	NaN	NaN	rs10887034	NaN	0.105631	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	97.333623	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	19	38	14
chr10	123774155	123774155	C	C	intronic	TACC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	123842065	123842065	A	G	intronic	TACC2	NaN	NaN	NaN	rs2459103	NaN	0.970048	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	54.748982	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	52
chr10	123846095	123846095	G	A	exonic	TACC2	NaN	synonymous SNV	TACC2:NM_001291876:exon4:c.G4080A:p.E1360E,TACC2:NM_001291877:exon4:c.G4080A:p.E1360E,TACC2:NM_206862:exon4:c.G4080A:p.E1360E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.836492	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	186	171	15	0
chr10	123848136	123848136	C	C	exonic	TACC2	NaN	synonymous SNV	TACC2:NM_001291877:exon5:c.C5603C:p.A1868A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	40	33	0	0
chr10	123933236	123933236	A	T	intronic	TACC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	123970380	123970380	C	A	exonic	TACC2	NaN	nonsynonymous SNV	TACC2:NM_001291878:exon3:c.C674A:p.T225N,TACC2:NM_006997:exon3:c.C674A:p.T225N,TACC2:NM_206860:exon3:c.C674A:p.T225N,TACC2:NM_206861:exon6:c.C878A:p.T293N,TACC2:NM_001291876:exon8:c.C6305A:p.T2102N,TACC2:NM_001291877:exon8:c.C6452A:p.T2151N,TACC2:NM_206862:exon9:c.C6440A:p.T2147N	NaN	NaN	NaN	0.43	T	0.999	D	0.972	D	0.002	N	1.000	N	1.95	M	3.95	T	-1.034	T	0.060	T	0.11	3.207	16.74	4.62	1.300	1.827	10.527	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	43	19	24	0
chr10	124008358	124008358	A	G	intronic	TACC2	NaN	NaN	NaN	rs146111568	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	124045798	124045798	A	A	intronic	BTBD16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	124050486	124050486	T	C	intronic	BTBD16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr10	124094540	124094540	A	T	intronic	BTBD16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr10	124152749	124152749	T	C	exonic	PLEKHA1	NaN	synonymous SNV	PLEKHA1:NM_001001974:exon2:c.T33C:p.C11C,PLEKHA1:NM_021622:exon2:c.T33C:p.C11C,PLEKHA1:NM_001195608:exon3:c.T33C:p.C11C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.168478	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	140	134	6	0
chr10	124186593	124186593	A	C	intronic	PLEKHA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	12	0	12	0
chr10	124244482	124244482	G	T	intronic	HTRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	124266426	124266426	G	T	intronic	HTRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.615676	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	77	62	15	0
chr10	124329801	124329801	G	A	intronic	DMBT1	NaN	NaN	NaN	rs3740223	NaN	0.705072	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	167.698803	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	0	53	53
chr10	124331986	124331986	T	G	intronic	DMBT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	124340406	124340406	GC	CC,G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	872.118	0	NaN	NA	NA	130	3	29	3
chr10	124351668	124351668	T	T	intronic	DMBT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	124390020	124390020	A	A	intronic	DMBT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	124396847	124396847	A	A	intronic	DMBT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	124399467	124399467	C	T	intronic	DMBT1	NaN	NaN	NaN	rs2261655	NaN	0.647963	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	134.218957	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	44	0	44	39
chr10	124457076	124457076	T	A	downstream	C10orf120	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	124457320	124457320	T	C	exonic	C10orf120	NaN	nonsynonymous SNV	C10orf120:NM_001010912:exon3:c.A937G:p.K313E	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.705	P	0.359	B	0.966	N	1.000	N	1.04	L	1.22	T	-1.001	T	0.071	T	0.357	1.947	12.47	-0.973	-0.265	0.292	6.599	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.375191	possible_contamination	REJECT	59	55	4	0
chr10	1245893	1245893	A	C	intronic	ADARB2	NaN	NaN	NaN	rs1983028	NaN	0.542931	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.36	0	NaN	NA	NA	15	11	3	24
chr10	124593447	124593447	T	C	exonic	CUZD1	NaN	synonymous SNV	CUZD1:NM_022034:exon8:c.A1392G:p.R464R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.228125		KEEP	98	93	5	0
chr10	124610117	124610117	A	A	ncRNA_intronic	FAM24B-CUZD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr10	124672266	124672266	T	C	intronic	FAM24A	NaN	NaN	NaN	rs201365301	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	10	4	5	0
chr10	124675208	124675208	T	C	intergenic	FAM24A,C10orf88	dist=2581;dist=15211	NaN	NaN	rs10902842	NaN	0.45008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	124675253	124675253	A	G	intergenic	FAM24A,C10orf88	dist=2626;dist=15166	NaN	NaN	rs10902843	NaN	0.498802	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	124697550	124697550	A	G	exonic	C10orf88	NaN	synonymous SNV	C10orf88:NM_024942:exon5:c.T774C:p.P258P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.673062	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	322	315	7	0
chr10	124742895	124742895	G	C	exonic	PSTK	NaN	nonsynonymous SNV	PSTK:NM_153336:exon3:c.G616C:p.G206R	rs3736582	ID=COSM147077;OCCURENCE=1(stomach)	0.581669	0.47	T	0.003	B	0.009	B	0.175	N	0.486	P	1.935	M	1.59	T	-0.991	T	0.000	T	0.682	1.164	9.739	1.81	0.339	1.664	4.515	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.856129	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	5	8	44
chr10	124896065	124896065	C	G	intronic	HMX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	124917218	124917218	T	G	intronic	BUB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.866606	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	154	120	34	9
chr10	124917238	124917238	T	C	intronic	BUB3	NaN	NaN	NaN	rs2304550	NaN	0.240615	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	65	NaN	NA	NA	134	111	23	9
chr10	124917427	124917427	A	G	intronic	BUB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	0	2	0
chr10	125115973	125115973	C	A	intergenic	BUB3,GPR26	dist=191087;dist=309898	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	125425970	125425970	T	T	exonic	GPR26	NaN	synonymous SNV	GPR26:NM_153442:exon1:c.T47T:p.M16M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	125426412	125426412	A	G	exonic	GPR26	NaN	synonymous SNV	GPR26:NM_153442:exon1:c.A489G:p.P163P	rs12263344	ID=COSM1346532;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.551917	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.545934	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	3	6	44
chr10	125426666	125426666	G	A	intronic	GPR26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.31027	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	184	170	14	0
chr10	125438114	125438114	A	A	intronic	GPR26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	125514322	125514322	T	A	intronic	CPXM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr10	125514323	125514323	C	A	intronic	CPXM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr10	125514324	125514324	T	G	intronic	CPXM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr10	125528048	125528048	G	A	exonic	CPXM2	NaN	synonymous SNV	CPXM2:NM_198148:exon9:c.C1293T:p.Y431Y	rs1219725	NaN	0.378794	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	56.802223	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	98	70	28	37
chr10	125557668	125557668	A	A	intronic	CPXM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	18	16	0	0
chr10	125622070	125622070	T	T	intronic	CPXM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr10	125779434	125779434	G	T	UTR3	CHST15	NM_014863:c.*1164C>A,NM_001270765:c.*1164C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	125779439	125779439	C	T	UTR3	CHST15	NM_014863:c.*1159G>A,NM_001270765:c.*1159G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	125779441	125779441	G	C	UTR3	CHST15	NM_014863:c.*1157C>G,NM_001270765:c.*1157C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	126097565	126097565	A	A	intronic	OAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	15	12	0	0
chr10	126136682	126136682	G	C	exonic	NKX1-2	NaN	synonymous SNV	NKX1-2:NM_001146340:exon2:c.C249G:p.P83P	rs3916136	NaN	0.103435	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	45.5459	15	16.307223	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	1	6	9
chr10	126139901	126139901	C	C	intergenic	NKX1-2,LHPP	dist=1351;dist=10440	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	126198328	126198328	A	C	intronic	LHPP	NaN	NaN	NaN	rs1869658	NaN	0.23103	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	32	15	17	0
chr10	126301663	126301663	T	T	intronic	LHPP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	126306118	126306118	G	A	intergenic	LHPP,FAM53B	dist=3408;dist=1745	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr10	1263076	1263076	C	T	intronic	ADARB2	NaN	NaN	NaN	rs3750677	NaN	0.348043	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.168192	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	35	11	31
chr10	1263166	1263166	T	C	intronic	ADARB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.731324	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	89	84	5	0
chr10	126335586	126335586	T	C	intronic	FAM53B	NaN	NaN	NaN	rs10901796	NaN	0.347444	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	18	1	17	0
chr10	126370766	126370766	A	G	exonic	FAM53B	NaN	nonsynonymous SNV	FAM53B:NM_014661:exon4:c.T316C:p.S106P	NaN	NaN	NaN	0.14	T	0.998	D	0.934	D	0.000	D	0.910	D	0.84	L	0.91	T	-0.884	T	0.136	T	0.553	3.347	17.27	4.98	2.217	1.728	9.620	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.663807	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	185	172	13	0
chr10	126454157	126454157	G	C	exonic	METTL10	NaN	synonymous SNV	METTL10:NM_001304467:exon5:c.C186G:p.L62L,METTL10:NM_001304468:exon5:c.C186G:p.L62L,METTL10:NM_212554:exon5:c.C420G:p.L140L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.172054	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	101	96	5	0
chr10	126490512	126490512	G	T	intronic	FAM175B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	126490514	126490514	C	G	intronic	FAM175B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	126508084	126508084	A	A	intronic	FAM175B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	126660781	126660781	A	T	intronic	ZRANB1	NaN	NaN	NaN	rs3802700	NaN	0.772963	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	110.666917	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	0	39	57
chr10	126673660	126673660	A	A	UTR3	ZRANB1	NM_017580:c.*99A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	126683217	126683217	C	T	exonic	CTBP2	NaN	nonsynonymous SNV	CTBP2:NM_022802:exon5:c.G2221A:p.A741T,CTBP2:NM_001083914:exon7:c.G601A:p.A201T,CTBP2:NM_001290214:exon7:c.G601A:p.A201T,CTBP2:NM_001290215:exon7:c.G601A:p.A201T,CTBP2:NM_001329:exon7:c.G601A:p.A201T	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.299	B	0.338	B	0.000	D	1.000	D	2.89	M	-1.58	D	0.340	D	0.664	D	0.849	4.502	24.2	5.57	2.619	3.817	19.547	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.650575	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	505	495	10	0
chr10	126683263	126683263	A	A	intronic	CTBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	126683264	126683264	C	C	intronic	CTBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	126686540	126686540	A	G	exonic	CTBP2	NaN	synonymous SNV	CTBP2:NM_022802:exon4:c.T2178C:p.I726I,CTBP2:NM_001083914:exon6:c.T558C:p.I186I,CTBP2:NM_001290214:exon6:c.T558C:p.I186I,CTBP2:NM_001290215:exon6:c.T558C:p.I186I,CTBP2:NM_001329:exon6:c.T558C:p.I186I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	625.342	0	NaN	NA	NA	269	27	242	12
chr10	126686557	126686557	C	T	exonic	CTBP2	NaN	nonsynonymous SNV	CTBP2:NM_022802:exon4:c.G2161A:p.E721K,CTBP2:NM_001083914:exon6:c.G541A:p.E181K,CTBP2:NM_001290214:exon6:c.G541A:p.E181K,CTBP2:NM_001290215:exon6:c.G541A:p.E181K,CTBP2:NM_001329:exon6:c.G541A:p.E181K	NaN	NaN	NaN	0.6	T	0.337	B	0.292	B	0.000	D	1.000	D	-1.91	N	-1.07	T	-0.728	T	0.152	T	0.944	3.209	16.75	4.73	2.329	7.471	18.072	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	502.641	77	NaN	NA	NA	276	43	233	15
chr10	126686564	126686564	G	A	exonic	CTBP2	NaN	synonymous SNV	CTBP2:NM_022802:exon4:c.C2154T:p.I718I,CTBP2:NM_001083914:exon6:c.C534T:p.I178I,CTBP2:NM_001290214:exon6:c.C534T:p.I178I,CTBP2:NM_001290215:exon6:c.C534T:p.I178I,CTBP2:NM_001329:exon6:c.C534T:p.I178I	rs76961061	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	647.842	88	NaN	NA	NA	301	53	248	19
chr10	126686574	126686574	G	A	exonic	CTBP2	NaN	nonsynonymous SNV	CTBP2:NM_022802:exon4:c.C2144T:p.A715V,CTBP2:NM_001083914:exon6:c.C524T:p.A175V,CTBP2:NM_001290214:exon6:c.C524T:p.A175V,CTBP2:NM_001290215:exon6:c.C524T:p.A175V,CTBP2:NM_001329:exon6:c.C524T:p.A175V	rs76390727	NaN	NaN	0.01	D	0.998	D	0.868	P	0.000	D	1.000	D	-0.235	N	-1.37	T	0.042	D	0.409	T	0.833	3.694	18.77	4.73	2.329	9.455	18.072	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	656.461	79	NaN	NA	NA	320	55	265	19
chr10	126686593	126686593	G	A	exonic	CTBP2	NaN	nonsynonymous SNV	CTBP2:NM_022802:exon4:c.C2125T:p.R709C,CTBP2:NM_001083914:exon6:c.C505T:p.R169C,CTBP2:NM_001290214:exon6:c.C505T:p.R169C,CTBP2:NM_001290215:exon6:c.C505T:p.R169C,CTBP2:NM_001329:exon6:c.C505T:p.R169C	rs78860838	NaN	NaN	0	D	0.995	D	0.801	P	0.000	D	1.000	D	0.435	N	-1.44	T	0.038	D	0.451	T	0.934	4.657	25.6	4.73	2.329	5.108	18.072	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	540.592	86	NaN	NA	NA	295	53	242	18
chr10	126686605	126686605	C	T	exonic	CTBP2	NaN	nonsynonymous SNV	CTBP2:NM_022802:exon4:c.G2113A:p.V705M,CTBP2:NM_001083914:exon6:c.G493A:p.V165M,CTBP2:NM_001290214:exon6:c.G493A:p.V165M,CTBP2:NM_001290215:exon6:c.G493A:p.V165M,CTBP2:NM_001329:exon6:c.G493A:p.V165M	rs74442958	NaN	NaN	0.01	D	0.993	D	0.734	P	0.000	D	1.000	D	0.265	N	-1.75	D	0.175	D	0.501	D	0.701	3.729	18.93	4.73	2.329	4.686	18.072	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	86	NaN	NA	NA	256	38	218	33
chr10	126686619	126686619	G	T	exonic	CTBP2	NaN	nonsynonymous SNV	CTBP2:NM_022802:exon4:c.C2099A:p.T700K,CTBP2:NM_001083914:exon6:c.C479A:p.T160K,CTBP2:NM_001290214:exon6:c.C479A:p.T160K,CTBP2:NM_001290215:exon6:c.C479A:p.T160K,CTBP2:NM_001329:exon6:c.C479A:p.T160K	NaN	NaN	NaN	0.45	T	0.603	P	0.155	B	0.000	D	1.000	D	-0.66	N	-1.25	T	-0.797	T	0.157	T	0.854	2.008	12.67	3.75	2.329	3.806	14.611	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	63	NaN	NA	NA	236	27	209	33
chr10	126686629	126686629	G	A	exonic	CTBP2	NaN	nonsynonymous SNV	CTBP2:NM_022802:exon4:c.C2089T:p.R697W,CTBP2:NM_001083914:exon6:c.C469T:p.R157W,CTBP2:NM_001290214:exon6:c.C469T:p.R157W,CTBP2:NM_001290215:exon6:c.C469T:p.R157W,CTBP2:NM_001329:exon6:c.C469T:p.R157W	rs74523764	NaN	NaN	0	D	0.904	P	0.395	B	0.000	D	1.000	D	3.055	M	-1.62	D	0.398	D	0.595	D	0.961	3.814	19.37	4.73	2.329	3.787	13.877	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	188	27	161	9
chr10	126686648	126686648	C	T	exonic	CTBP2	NaN	synonymous SNV	CTBP2:NM_022802:exon4:c.G2070A:p.T690T,CTBP2:NM_001083914:exon6:c.G450A:p.T150T,CTBP2:NM_001290214:exon6:c.G450A:p.T150T,CTBP2:NM_001290215:exon6:c.G450A:p.T150T,CTBP2:NM_001329:exon6:c.G450A:p.T150T	rs75826544	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	215	26	189	1
chr10	126714530	126714530	GGT	G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.75494	0	NaN	NA	NA	43	35	6	1
chr10	126714966	126714966	A	G	exonic	CTBP2	NaN	nonsynonymous SNV	CTBP2:NM_022802:exon1:c.T1363C:p.Y455H	rs3012075	NaN	0.447883	0.03	D	0.001	B	0.003	B	0.077	N	0.000	P	.	.	-1.7	D	-0.944	T	0.000	T	0.13	2.508	14.35	4.04	1.829	4.895	12.024	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	34.2569	0	NaN	NA	NA	33	23	10	41
chr10	126715075	126715075	T	C	exonic	CTBP2	NaN	synonymous SNV	CTBP2:NM_022802:exon1:c.A1254G:p.A418A	rs3781413	ID=COSM427217;OCCURENCE=1(breast)	0.121605	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.106279	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	9	18	17
chr10	126715154	126715154	A	G	exonic	CTBP2	NaN	nonsynonymous SNV	CTBP2:NM_022802:exon1:c.T1175C:p.L392P	rs3781412	NaN	0.323482	0	D	0.986	D	0.858	P	0.625	N	0.000	P	.	.	-1.86	D	-1.012	T	0.000	T	0.156	1.765	11.86	-0.201	0.253	4.355	8.292	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.0018558308911190275	NA	0	38	NaN	NA	NA	68	38	30	25
chr10	126715436	126715436	C	T	exonic	CTBP2	NaN	nonsynonymous SNV	CTBP2:NM_022802:exon1:c.G893A:p.R298Q	rs3781411	NaN	0.122005	0	D	0.999	D	0.873	P	0.000	D	0.000	P	.	.	-2.27	D	-1.254	T	0.001	T	0.243	4.250	22.1	3.96	2.423	3.859	14.173	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.556873	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	3	9	16
chr10	126826678	126826678	A	C	intronic	CTBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	12687630	12687630	A	A	intronic	CAMK1D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	127020111	127020111	G	C	intergenic	CTBP2,TEX36-AS1	dist=170487;dist=242829	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	127132455	127132455	A	A	intergenic	CTBP2,TEX36-AS1	dist=282831;dist=130485	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	127414486	127414486	A	T	intronic	EDRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	150	102	38	0
chr10	127422324	127422324	A	A	intronic	EDRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	127426430	127426430	A	G	intronic	EDRF1	NaN	NaN	NaN	rs3740181	ID=COSN163805;OCCURENCE=1(breast)	0.589058	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	99.223373	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	0	36	54
chr10	127431923	127431923	A	G	intronic	EDRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	9	2	6	0
chr10	127451856	127451856	T	C	intronic	EDRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.724685	nearby_gap_events	REJECT	78	70	8	0
chr10	127456252	127456252	T	C	exonic	MMP21	NaN	nonsynonymous SNV	MMP21:NM_147191:exon6:c.A1259G:p.D420G	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.996	D	0.951	D	0.000	D	1.000	D	3.445	M	3.84	T	-1.069	T	0.059	T	0.925	4.219	21.9	5.69	2.162	6.664	13.894	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.361183	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	97	92	5	0
chr10	127460564	127460564	T	C	intronic	MMP21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	127505080	127505080	A	A	UTR5	UROS	NM_000375:c.-12T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	127524866	127524866	G	T	UTR3	BCCIP	NM_078468:c.*23G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr10	127524872	127524872	G	C	UTR3	BCCIP	NM_078468:c.*29G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	127542787	127542787	A	C	intronic	DHX32	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.762403	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	74	59	15	2
chr10	127548587	127548587	C	G	intronic	DHX32	NaN	NaN	NaN	rs1539315	NaN	0.899161	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	246.78389	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	85	0	85	58
chr10	127569190	127569190	T	C	exonic	DHX32	NaN	synonymous SNV	DHX32:NM_018180:exon1:c.A204G:p.K68K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.647983	nearby_gap_events	REJECT	94	89	5	0
chr10	127584325	127584325	C	T	upstream	FANK1	NaN	NaN	NaN	rs78795135	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	127584328	127584328	G	G	upstream	FANK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	127584341	127584341	C	T	upstream	FANK1	NaN	NaN	NaN	rs112474879	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr10	127668875	127668875	C	A	exonic	FANK1	NaN	nonsynonymous SNV	FANK1:NM_145235:exon2:c.C159A:p.D53E	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.994	D	0.982	D	0.000	D	0.878	N	1.79	L	1.65	T	-1.007	T	0.133	T	0.673	3.276	17.00	3.15	1.100	0.508	8.032	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.451047	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	119	109	10	0
chr10	127677285	127677285	A	C	intronic	FANK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	127677289	127677289	G	C	intronic	FANK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	0.231	B	0.027	B	.	.	1.000	N	.	.	1.31	T	-1.030	T	0.040	T	0.041	1.212	9.919	-1.07	-0.041	0.018	3.363	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	127677291	127677291	G	C	intronic	FANK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	0.058	B	0.027	B	.	.	1.000	N	.	.	1.38	T	-1.013	T	0.044	T	0.062	0.847	8.425	-1.23	-0.489	-0.544	4.230	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	127684089	127684089	T	G	intronic	FANK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.09124777089181957	NA	0	0	NaN	NA	NA	20	15	5	0
chr10	127696941	127696941	T	A	intronic	FANK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	127697136	127697136	A	G	intronic	FANK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr10	127727827	127727827	A	C	intronic	ADAM12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	127727828	127727828	T	G	intronic	ADAM12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr10	127727829	127727829	T	A	intronic	ADAM12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr10	127728034	127728034	A	C	intronic	ADAM12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	12778614	12778614	A	G	intronic	CAMK1D	NaN	NaN	NaN	rs11257964	NaN	0.836062	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	127914502	127914502	G	T	intronic	ADAM12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	1279769	1279769	T	C	exonic	ADARB2	NaN	synonymous SNV	ADARB2:NM_018702:exon6:c.A1380G:p.S460S	rs371206658	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.03924443677764369	NA	0	0	6.702835		KEEP	16	12	4	0
chr10	128118498	128118498	A	A	intronic	C10orf90	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr10	1284119	1284119	T	G	intronic	ADARB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1544117647058832	NA	0	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr10	128737	128737	C	T	intergenic	TUBB8,ZMYND11	dist=33559;dist=51668	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	128795200	128795200	A	A	intronic	DOCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr10	128807096	128807096	G	C	intronic	DOCK1	NaN	NaN	NaN	rs9418679	NaN	0.0820687	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	168.956414	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	84	15	69	16
chr10	128810669	128810669	C	T	intronic	DOCK1	NaN	NaN	NaN	rs9418691	NaN	0.192292	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.828243	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	50	15	26
chr10	128821636	128821636	C	T	intronic	DOCK1	NaN	NaN	NaN	rs9418698	NaN	0.40615	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	71.566813	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	6	26	32
chr10	128821748	128821748	G	A	intronic	DOCK1	NaN	NaN	NaN	rs9418700	NaN	0.0916534	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	53.786628	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	4	20	16
chr10	128829	128829	A	A	intergenic	TUBB8,ZMYND11	dist=33651;dist=51576	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr10	128840841	128840841	GA	G,GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1537.99	0	NaN	NA	NA	159	0	50	11
chr10	128851235	128851235	G	G	intronic	DOCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	51	44	0	0
chr10	128923675	128923675	T	T	intronic	DOCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	128952029	128952029	C	A	intronic	DOCK1,FAM196A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr10	128952033	128952033	G	G	intronic	DOCK1,FAM196A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	128952034	128952034	C	C	intronic	DOCK1,FAM196A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	128952037	128952037	C	C	intronic	DOCK1,FAM196A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	128952038	128952038	A	A	intronic	DOCK1,FAM196A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	128952040	128952040	A	A	intronic	DOCK1,FAM196A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	128952046	128952046	C	C	intronic	DOCK1,FAM196A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr10	128952276	128952276	A	A	intronic	DOCK1,FAM196A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	129090602	129090602	C	G	intronic	DOCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	129090603	129090603	T	A	intronic	DOCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	129090604	129090604	C	G	intronic	DOCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	129178367	129178367	A	T	exonic	DOCK1	NaN	stopgain	DOCK1:NM_001290223:exon36:c.A3697T:p.R1233X,DOCK1:NM_001380:exon36:c.A3634T:p.R1212X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	10.252	43	3.52	0.883	1.140	11.567	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.33324	0	NaN	NA	NA	13	11	2	1
chr10	129209213	129209213	C	A	intronic	DOCK1	NaN	NaN	NaN	rs11017952	NaN	0.222444	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	66.121603	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	13	33	35
chr10	129209256	129209256	C	T	intronic	DOCK1	NaN	NaN	NaN	rs11017953	NaN	0.222444	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	71.793689	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	12	30	34
chr10	129210876	129210876	A	A	intronic	DOCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	129231742	129231742	A	G	intronic	DOCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	32	3	29	0
chr10	129249701	129249701	C	G	UTR3	DOCK1	NM_001290223:c.*10C>G,NM_001380:c.*10C>G	NaN	NaN	rs2229606	NaN	0.855032	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	140.321306	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	1	51	56
chr10	129249852	129249852	A	C	UTR3	DOCK1	NM_001290223:c.*161A>C,NM_001380:c.*161A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	129249853	129249853	G	T	UTR3	DOCK1	NM_001290223:c.*162G>T,NM_001380:c.*162G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	12940377	12940377	T	C	UTR3	CCDC3	NM_031455:c.*39A>G,NM_001282658:c.*39A>G	NaN	NaN	rs10752280	NaN	0.960863	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.030014	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	51
chr10	12940455	12940455	A	G	exonic	CCDC3	NaN	synonymous SNV	CCDC3:NM_031455:exon3:c.T774C:p.N258N,CCDC3:NM_001282658:exon7:c.T399C:p.N133N	rs10906249	NaN	0.991414	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.961828	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	49
chr10	129536642	129536642	G	A	intronic	FOXI2	NaN	NaN	NaN	rs7085541	NaN	0.839058	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	72	NaN	NA	NA	82	7	75	56
chr10	129536648	129536648	G	T	intronic	FOXI2	NaN	NaN	NaN	rs7085544	NaN	0.839058	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	75	8	67	56
chr10	129650715	129650715	T	C	intergenic	FOXI2,CLRN3	dist=111265;dist=25399	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	129676769	129676769	A	C	intronic	CLRN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	129676770	129676770	T	A	intronic	CLRN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr10	129676772	129676772	T	G	intronic	CLRN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr10	129676774	129676774	T	C	intronic	CLRN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	129824727	129824727	T	C	intronic	PTPRE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	129860092	129860092	T	T	intronic	PTPRE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr10	129860093	129860093	A	T	intronic	PTPRE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	0	2	0
chr10	129864295	129864295	T	T	intronic	PTPRE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	129868503	129868503	T	T	intronic	PTPRE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	129868542	129868542	G	A	intronic	PTPRE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	21	14.130402	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	28	16	12	0
chr10	129899473	129899473	A	T	intronic	MKI67	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.229316	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	281	265	16	0
chr10	129899474	129899474	T	C	intronic	MKI67	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.867215	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	293	277	16	0
chr10	129903663	129903663	G	A	exonic	MKI67	NaN	synonymous SNV	MKI67:NM_001145966:exon12:c.C5361T:p.D1787D,MKI67:NM_002417:exon13:c.C6441T:p.D2147D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.005458636731857377	NA	0	49	NaN	NA	NA	94	59	35	31
chr10	129903676	129903676	G	T	exonic	MKI67	NaN	nonsynonymous SNV	MKI67:NM_001145966:exon12:c.C5348A:p.T1783N,MKI67:NM_002417:exon13:c.C6428A:p.T2143N	NaN	NaN	NaN	0.47	T	0.998	D	0.953	D	0.256	N	1.000	N	2.11	M	4.25	T	-0.980	T	0.026	T	0.059	2.281	13.59	0.885	0.392	-0.050	6.561	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.198954	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	97	90	7	0
chr10	129903678	129903678	C	G	exonic	MKI67	NaN	nonsynonymous SNV	MKI67:NM_001145966:exon12:c.G5346C:p.Q1782H,MKI67:NM_002417:exon13:c.G6426C:p.Q2142H	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.475	P	0.19	B	0.676	N	1.000	N	1.74	L	4.2	T	-1.053	T	0.009	T	0.069	1.806	12.00	-7.82	-2.031	-4.535	5.797	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.803462	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	83	78	5	0
chr10	129905857	129905857	T	G	exonic	MKI67	NaN	nonsynonymous SNV	MKI67:NM_001145966:exon12:c.A3167C:p.E1056A,MKI67:NM_002417:exon13:c.A4247C:p.E1416A	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.996	D	0.912	D	.	.	1.000	N	1.79	L	4.1	T	-0.979	T	0.018	T	0.084	1.175	9.779	-0.176	-0.092	-1.131	5.031	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.818289	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	88	82	6	0
chr10	129921414	129921414	G	A	exonic	MKI67	NaN	nonsynonymous SNV	MKI67:NM_001145966:exon3:c.C112T:p.R38C,MKI67:NM_002417:exon3:c.C112T:p.R38C	NaN	NaN	NaN	.	.	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	1.75	L	-2.18	D	0.457	D	0.723	D	0.82	4.046	20.8	4.5	2.354	6.732	15.165	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.699086	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	55	51	4	0
chr10	13000659	13000659	A	A	intronic	CCDC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	130014360	130014360	T	C	intergenic	MKI67,LINC01163	dist=89892;dist=69854	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr10	130309678	130309678	G	C	intergenic	LINC01163,MGMT	dist=193688;dist=955776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	130325245	130325245	C	C	intergenic	LINC01163,MGMT	dist=209255;dist=940209	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	13040283	13040283	C	C	intronic	CCDC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	130649221	130649221	G	A	intergenic	LINC01163,MGMT	dist=533231;dist=616233	NaN	NaN	rs77319081	NaN	0.023762	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	131339250	131339250	T	C	intronic	MGMT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr10	131473937	131473937	A	A	intronic	MGMT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	131506283	131506283	C	T	exonic	MGMT	NaN	nonsynonymous SNV	MGMT:NM_002412:exon3:c.C343T:p.L115F	rs12917	NaN	0.148363	0.22	T	0.633	P	0.187	B	0.004	N	0.009	P	1.245	L	2.56	T	-0.961	T	0.000	T	0.085	1.738	11.77	1.89	0.717	1.037	2.222	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	47.8307	0	NaN	NA	NA	71	52	19	14
chr10	131543101	131543101	G	T	intronic	MGMT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr10	131636313	131636313	C	T	intronic	EBF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.23448	0	NaN	NA	NA	28	20	3	3
chr10	131642617	131642617	T	T	intronic	EBF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr10	131667311	131667311	T	C	intronic	EBF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	131712721	131712721	T	A	intronic	EBF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	3	4	0
chr10	131714437	131714437	A	G	intronic	EBF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	131719778	131719778	C	A	intronic	EBF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	131739689	131739689	C	A	intronic	EBF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	131760589	131760589	A	G	intronic	EBF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr10	132123001	132123001	C	A	intergenic	GLRX3,MIR378C	dist=144355;dist=637850	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	132123004	132123004	C	G	intergenic	GLRX3,MIR378C	dist=144358;dist=637847	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	13214753	13214753	G	C	exonic	MCM10	NaN	nonsynonymous SNV	MCM10:NM_018518:exon5:c.G580C:p.A194P,MCM10:NM_182751:exon5:c.G583C:p.A195P	rs34630110	NaN	0.0411342	0.3	T	0.0	B	0.001	B	0.983	N	1.000	P	0.69	N	2.5	T	-0.951	T	0.000	T	0.032	1.317	10.32	-6.07	-1.167	-1.322	7.314	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	33.4732	68	NaN	NA	NA	45	4	41	0
chr10	13217697	13217697	A	G	intronic	MCM10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	14	7	4	0
chr10	132197810	132197810	C	T	intergenic	GLRX3,MIR378C	dist=219164;dist=563041	NaN	NaN	rs10829738	NaN	0.395168	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	132197833	132197833	T	C	intergenic	GLRX3,MIR378C	dist=219187;dist=563018	NaN	NaN	rs10829739	NaN	0.336062	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	132197861	132197861	G	G	intergenic	GLRX3,MIR378C	dist=219215;dist=562990	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	13222634	13222634	T	C	intronic	MCM10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.178572	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	81	78	3	0
chr10	13224886	13224886	G	T	intronic	MCM10	NaN	NaN	NaN	rs3765520	NaN	0.289337	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.501519	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	29	14	26
chr10	13225125	13225125	A	A	intronic	MCM10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	132291465	132291465	T	T	intergenic	GLRX3,MIR378C	dist=312819;dist=469386	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	13230837	13230837	A	G	intronic	MCM10	NaN	NaN	NaN	rs6602641	NaN	0.369209	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	132310169	132310169	A	A	intergenic	GLRX3,MIR378C	dist=331523;dist=450682	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	13236904	13236904	C	G	intronic	MCM10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.15584415584415545	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr10	13240721	13240721	A	G	exonic	MCM10	NaN	nonsynonymous SNV	MCM10:NM_018518:exon16:c.A2152G:p.R718G,MCM10:NM_182751:exon16:c.A2155G:p.R719G	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.632	P	0.606	P	0.000	D	0.991	D	2.255	M	1.46	T	-0.946	T	0.108	T	0.321	3.837	19.49	-3.5	-0.264	0.798	11.284	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.7279	0	NaN	NA	NA	39	30	3	0
chr10	132593977	132593977	C	A	intergenic	GLRX3,MIR378C	dist=615331;dist=166874	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	132594100	132594100	G	C	intergenic	GLRX3,MIR378C	dist=615454;dist=166751	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr10	132614633	132614633	C	T	intergenic	GLRX3,MIR378C	dist=635987;dist=146218	NaN	NaN	rs72845166	NaN	0.0513179	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	7	1	6	0
chr10	13264280	13264280	C	A	intronic	UCMA	NaN	NaN	NaN	rs2281797	NaN	0.392772	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	179	34	145	19
chr10	132662130	132662130	C	G	intergenic	GLRX3,MIR378C	dist=683484;dist=98721	NaN	NaN	rs35648460	NaN	0.272764	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	132728443	132728443	C	T	intergenic	GLRX3,MIR378C	dist=749797;dist=32408	NaN	NaN	rs60908242	NaN	0.102436	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr10	13275510	13275510	C	G	intronic	UCMA	NaN	NaN	NaN	rs7893239	NaN	0.344649	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	70	53	16	21
chr10	132929658	132929658	G	C	intronic	TCERG1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	21	1	20	0
chr10	132953008	132953008	C	C	intronic	TCERG1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	132961493	132961493	G	A	intronic	TCERG1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.10370370370370233	NA	0	0	NaN	NA	NA	16	12	4	0
chr10	132967218	132967218	A	C	intronic	TCERG1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	132967219	132967219	A	T	intronic	TCERG1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	132969094	132969094	C	T	intronic	TCERG1L	NaN	NaN	NaN	rs893504	NaN	0.757788	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	16	6	10	0
chr10	132969102	132969102	A	G	intronic	TCERG1L	NaN	NaN	NaN	rs2008589	NaN	0.757788	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	16	5	11	0
chr10	133011438	133011438	G	G	intronic	TCERG1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	133180097	133180097	C	A	intergenic	TCERG1L,LINC01164	dist=70113;dist=424637	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr10	133180098	133180098	C	G	intergenic	TCERG1L,LINC01164	dist=70114;dist=424636	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr10	13320411	13320411	A	T	intronic	PHYH	NaN	NaN	NaN	rs825625	NaN	0.951877	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	197.402815	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	75	1	74	58
chr10	133234131	133234131	A	G	intergenic	TCERG1L,LINC01164	dist=124147;dist=370603	NaN	NaN	rs3123158	NaN	0.609225	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr10	13333923	13333923	A	C	intronic	PHYH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.005323540246763428	NA	0	0	NaN	NA	NA	55	26	29	0
chr10	13333976	13333976	A	C	intronic	PHYH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	9	1	7	0
chr10	133356337	133356337	C	C	intergenic	TCERG1L,LINC01164	dist=246353;dist=248397	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr10	133368247	133368247	C	C	intergenic	TCERG1L,LINC01164	dist=258263;dist=236487	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	13337588	13337588	G	A	exonic	PHYH	NaN	synonymous SNV	PHYH:NM_006214:exon3:c.C153T:p.N51N	rs1747682	NaN	0.972444	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	101.079	0	30.758025	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	0	10	48
chr10	13378404	13378404	A	A	intronic	SEPHS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	133786586	133786586	T	C	exonic	BNIP3	NaN	synonymous SNV	BNIP3:NM_004052:exon3:c.A429G:p.R143R	rs1050704	NaN	0.0722843	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	149.117	0	NaN	NA	NA	190	137	53	3
chr10	133918198	133918198	A	T	upstream	JAKMIP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.799946	strand_artifact	REJECT	54	46	8	0
chr10	133937892	133937892	C	A	intronic	JAKMIP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	133937893	133937893	C	G	intronic	JAKMIP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	133950642	133950642	T	C	exonic	JAKMIP3	NaN	synonymous SNV	JAKMIP3:NM_001105521:exon6:c.T1236C:p.D412D	rs75996870	NaN	0.0802716	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	113.447411	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	58	14	44	9
chr10	133954181	133954181	G	A	intronic	JAKMIP3	NaN	NaN	NaN	rs182258408	NaN	0.00139776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	27	67.66469	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	5	29	2
chr10	133955427	133955427	A	G	exonic	JAKMIP3	NaN	nonsynonymous SNV	JAKMIP3:NM_001105521:exon10:c.A1477G:p.M493V	rs11592585	ID=COSM1128100;OCCURENCE=1(prostate)	0.186701	0.31	T	0.0	B	0.0	B	0.190	N	0.000	P	1.5	L	2.06	T	-0.928	T	0.000	T	0.071	1.504	10.98	-1.72	-0.382	-0.349	4.657	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.909608	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	11	22	28
chr10	133955708	133955708	A	A	intronic	JAKMIP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	133967539	133967539	C	G	intronic	JAKMIP3	NaN	NaN	NaN	rs7082416	NaN	0.154952	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.146313	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	6	10	19
chr10	133967555	133967555	G	C	intronic	JAKMIP3	NaN	NaN	NaN	rs77155409	NaN	0.0732827	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.738567	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	6	13	20
chr10	133967593	133967593	C	T	intronic	JAKMIP3	NaN	NaN	NaN	rs7906747	NaN	0.488419	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.933083	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	41
chr10	133978241	133978241	T	A	splicing	JAKMIP3	NM_001105521:exon20:c.2484+2T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.802	15.33	3.77	1.727	6.873	12.992	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.024667025471866603	NA	0	28	NaN	NA	NA	51	39	12	0
chr10	133978242	133978242	A	T	intronic	JAKMIP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.029450436195694447	NA	0	0	NaN	NA	NA	54	41	13	0
chr10	134004373	134004373	A	A	intronic	DPYSL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	134008610	134008610	G	G	intronic	DPYSL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	136	109	0	0
chr10	134010586	134010586	A	G	exonic	DPYSL4	NaN	nonsynonymous SNV	DPYSL4:NM_006426:exon6:c.A602G:p.N201S	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	3.285	M	-2.55	D	0.927	D	0.851	D	0.268	4.363	23.0	4.5	1.905	5.684	13.671	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.91674	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	40	37	3	0
chr10	134013906	134013906	C	T	exonic	DPYSL4	NaN	synonymous SNV	DPYSL4:NM_006426:exon9:c.C858T:p.D286D	rs56326856	ID=COSM35400;OCCURENCE=4(central_nervous_system),1(endometrium)	0.14996	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.843361	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	3	18	19
chr10	134015655	134015655	T	G	intronic	DPYSL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	134015656	134015656	T	T	intronic	DPYSL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	134016396	134016396	G	A	intronic	DPYSL4	NaN	NaN	NaN	rs3736258	NaN	0.323682	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.106604	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	33	13	32
chr10	134017248	134017248	C	G	intronic	DPYSL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.234176	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	19	14	5	14
chr10	134017250	134017250	C	G	intronic	DPYSL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.5309	0	NaN	NA	NA	21	19	2	0
chr10	134017295	134017295	A	G	exonic	DPYSL4	NaN	synonymous SNV	DPYSL4:NM_006426:exon13:c.A1491G:p.G497G	rs12313	NaN	0.841653	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.57866	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	0	13	53
chr10	134018447	134018447	G	GGCC	UTR3	DPYSL4	NM_006426:c.*13G>GGCC	NaN	NaN	NaN	NaN	0.0790735	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	155.203	0	NaN	NA	NA	89	35	32	8
chr10	134018483	134018483	G	A	UTR3	DPYSL4	NM_006426:c.*49G>A	NaN	NaN	rs114235518	NaN	0.137979	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	179.06	0	NaN	NA	NA	28	7	21	17
chr10	134018895	134018895	A	C	UTR3	DPYSL4	NM_006426:c.*461A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	134036128	134036128	C	A	intronic	STK32C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.668527	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	12	5	7	1
chr10	134036193	134036193	A	G	exonic	STK32C	NaN	synonymous SNV	STK32C:NM_173575:exon10:c.T1203C:p.R401R	rs2818401	NaN	0.766174	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.894725	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	41
chr10	134037983	134037983	C	T	exonic	STK32C	NaN	synonymous SNV	STK32C:NM_173575:exon8:c.G921A:p.V307V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.202071	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	55	51	4	0
chr10	134040657	134040657	A	C	intronic	STK32C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr10	134041267	134041267	T	G	intronic	STK32C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr10	134059262	134059262	T	T	intronic	STK32C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	134084686	134084686	C	A	intronic	STK32C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134151034	134151034	A	G	intronic	LRRC27	NaN	NaN	NaN	rs2259594	NaN	0.342452	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	80.439288	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	8	33	38
chr10	134151343	134151343	GT	GG,G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	230.033	0	NaN	NA	NA	51	15	2	3
chr10	134175151	134175151	A	A	intronic	LRRC27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	134175794	134175794	T	G	intronic	LRRC27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134176052	134176052	G	C	intronic	LRRC27	NaN	NaN	NaN	rs2497651	NaN	0.20008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	134212024	134212024	C	A	intronic	PWWP2B	NaN	NaN	NaN	rs4381299	NaN	0.0714856	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	134218269	134218269	C	T	exonic	PWWP2B	NaN	nonsynonymous SNV	PWWP2B:NM_001098637:exon2:c.C265T:p.R89C,PWWP2B:NM_138499:exon2:c.C265T:p.R89C	rs11146363	NaN	0.51897	0.09	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-0.205	N	1.49	T	-0.977	T	0.000	T	0.019	1.623	11.38	-7.28	-1.361	0.710	0.959	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.428432	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	18
chr10	134218849	134218849	C	T	exonic	PWWP2B	NaN	nonsynonymous SNV	PWWP2B:NM_001098637:exon2:c.C845T:p.P282L,PWWP2B:NM_138499:exon2:c.C845T:p.P282L	NaN	NaN	NaN	0.79	T	0.997	D	0.917	D	0.000	U	1.000	D	1.1	L	1.35	T	-0.902	T	0.200	T	0.468	3.216	16.78	4.13	2.318	7.023	15.942	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.270226	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	23	20	3	0
chr10	134219720	134219720	T	G	exonic	PWWP2B	NaN	nonsynonymous SNV	PWWP2B:NM_138499:exon2:c.T1716G:p.N572K	NaN	NaN	NaN	1	T	0.001	B	0.004	B	0.001	U	1.000	D	-1.445	N	-0.4	T	-0.911	T	0.043	T	0.112	-1.518	0.016	-8.56	-2.215	0.055	6.230	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.635742	clustered_read_position	REJECT	90	84	6	0
chr10	134219852	134219852	A	C	intronic	PWWP2B	NaN	NaN	NaN	rs12242690	NaN	0.110024	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.019583	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	9	14	30
chr10	134223770	134223770	G	T	intronic	PWWP2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134261088	134261088	G	T	intronic	C10orf91	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr10	134351873	134351873	A	A	intronic	INPP5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	134363297	134363297	G	T	intronic	INPP5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134364769	134364769	G	G	intronic	INPP5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	134469917	134469917	C	T	intronic	INPP5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134548685	134548685	A	G	intronic	INPP5A	NaN	NaN	NaN	rs12769533	NaN	0.161342	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr10	134558742	134558742	A	A	intronic	INPP5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	134598488	134598488	T	C	exonic	NKX6-2	NaN	nonsynonymous SNV	NKX6-2:NM_177400:exon3:c.A766G:p.K256E	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.999	D	0.937	D	0.000	D	1.000	D	0.695	N	0.55	T	-0.717	T	0.192	T	0.456	3.746	19.02	3.31	1.738	3.645	12.696	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.711803	possible_contamination	REJECT	49	45	4	0
chr10	134598569	134598569	C	T	exonic	NKX6-2	NaN	nonsynonymous SNV	NKX6-2:NM_177400:exon3:c.G685A:p.G229S	NaN	NaN	NaN	1	T	0.004	B	0.003	B	0.000	N	0.755	N	-0.55	N	0.68	T	-0.999	T	0.036	T	0.085	0.055	4.300	2.12	0.747	0.574	4.646	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.794691	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	51	48	3	0
chr10	134622526	134622526	A	G	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	13	3	10	0
chr10	134624504	134624504	C	T	exonic	CFAP46	NaN	synonymous SNV	CFAP46:NM_001200049:exon56:c.G7533A:p.A2511A	rs2274429	NaN	0.33107	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.371892	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	40	7	34
chr10	134624549	134624549	A	G	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.613456	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	61	54	7	0
chr10	134626507	134626507	A	A	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr10	134647516	134647516	G	A	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	22	14	8	0
chr10	134647538	134647538	C	A	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsM	3	Somatic	0.030498533724339652	Somatic	7.56786	0	11.93565	nearby_gap_events	REJECT	42	35	7	0
chr10	134647556	134647556	G	A	exonic	CFAP46	NaN	nonsynonymous SNV	CFAP46:NM_001200049:exon49:c.C6938T:p.T2313I	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.002	B	0.002	B	0.001	U	1.000	N	1.04	L	1.56	T	-1.086	T	0.051	T	0.244	-1.773	0.010	-1.53	-0.770	0.250	2.302	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	10.6763	0	12.438387	nearby_gap_events	REJECT	42	35	7	0
chr10	134682868	134682868	T	T	exonic	CFAP46	NaN	synonymous SNV	CFAP46:NM_001200049:exon33:c.A4520A:p.H1507H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	25	22	0	0
chr10	134686940	134686940	G	G	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	134726377	134726377	A	A	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	134730022	134730022	G	A	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	rs115347200	NaN	0.0353435	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	81.123039	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	127	88	39	3
chr10	134730024	134730024	T	C	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.098511	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	129	125	4	0
chr10	134730203	134730203	CG	CA,GC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	147.878	0	NaN	NA	NA	209	146	63	0
chr10	134738232	134738232	A	G	exonic	CFAP46	NaN	synonymous SNV	CFAP46:NM_001200049:exon11:c.T1224C:p.A408A	rs4075501	NaN	0.533147	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	64	NaN	NA	NA	131	107	24	41
chr10	134740215	134740215	A	A	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	134742180	134742180	G	A	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134750604	134750604	C	A	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	rs10870211	NaN	0.992612	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	159.037337	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	0	53	58
chr10	134752006	134752006	G	C	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.262664	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	130	102	28	0
chr10	134752016	134752016	C	G	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.012699796570764072	NA	0	0	8.536366	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	83	72	11	0
chr10	134752287	134752287	A	G	intronic	CFAP46	NaN	NaN	NaN	rs12247654	NaN	0.130591	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	27	6.418246	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	26	4	6
chr10	134756013	134756013	T	T	UTR5	CFAP46	NM_001200049:c.-25A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	134857568	134857568	G	T	intergenic	LINC01168,ADGRA1-AS1	dist=67567;dist=41185	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134863815	134863815	C	A	intergenic	LINC01168,ADGRA1-AS1	dist=73814;dist=34938	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134902770	134902770	C	A	intronic	ADGRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134902774	134902774	C	A	intronic	ADGRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134902777	134902777	C	T	intronic	ADGRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134902778	134902778	C	T	intronic	ADGRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134905458	134905458	T	C	intronic	ADGRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	134906492	134906492	T	C	intronic	ADGRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134942166	134942166	A	A	exonic	ADGRA1	NaN	synonymous SNV	ADGRA1:NM_001291085:exon4:c.A543A:p.S181S,ADGRA1:NM_001083909:exon7:c.A834A:p.S278S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	15	13	0	0
chr10	134975915	134975915	G	C	intronic	KNDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134975916	134975916	C	A	intronic	KNDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	134981779	134981779	T	G	exonic	KNDC1	NaN	nonsynonymous SNV	KNDC1:NM_152643:exon3:c.T323G:p.V108G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	2.08	M	1.61	T	0.083	D	0.521	D	0.827	2.590	14.62	4.14	1.668	6.736	11.451	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	37	35	2	0
chr10	134981781	134981781	C	T	exonic	KNDC1	NaN	nonsynonymous SNV	KNDC1:NM_152643:exon3:c.C325T:p.P109S	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.24	M	1.44	T	0.122	D	0.513	D	0.69	2.958	15.86	4.14	2.052	6.552	14.322	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr10	134981877	134981877	A	C	intronic	KNDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr10	134997514	134997514	A	G	intronic	KNDC1	NaN	NaN	NaN	rs67800134	NaN	0.419329	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	113.099004	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	2	41	32
chr10	134999583	134999583	A	G	exonic	KNDC1	NaN	nonsynonymous SNV	KNDC1:NM_152643:exon6:c.A731G:p.E244G	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.0	B	0.0	B	0.040	U	1.000	N	0.805	L	2.69	T	-1.020	T	0.033	T	0.072	0.780	8.116	-2.14	-0.469	-0.433	1.009	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.83148	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	48	41	7	0
chr10	135003308	135003308	A	G	exonic	KNDC1	NaN	synonymous SNV	KNDC1:NM_152643:exon9:c.A1566G:p.V522V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.729119	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr10	135003309	135003309	A	C	exonic	KNDC1	NaN	nonsynonymous SNV	KNDC1:NM_152643:exon9:c.A1567C:p.T523P	NaN	NaN	NaN	0.05	D	1.0	D	0.998	D	0.001	U	1.000	D	1.955	M	0.76	T	-0.666	T	0.239	T	0.679	2.159	13.18	3.9	1.536	3.092	9.439	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.929402	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr10	135003310	135003310	C	T	exonic	KNDC1	NaN	nonsynonymous SNV	KNDC1:NM_152643:exon9:c.C1568T:p.T523I	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.998	D	0.001	U	1.000	D	1.955	M	0.73	T	-0.572	T	0.252	T	0.693	2.430	14.09	3.9	1.884	3.433	11.770	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.525717	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr10	135012652	135012652	T	C	exonic	KNDC1	NaN	synonymous SNV	KNDC1:NM_152643:exon14:c.T2640C:p.D880D	rs3008388	ID=COSM427279;OCCURENCE=1(breast),1(large_intestine)	0.411342	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.667393	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	3	5	27
chr10	135012672	135012672	G	A	exonic	KNDC1	NaN	nonsynonymous SNV	KNDC1:NM_152643:exon14:c.G2660A:p.R887K	rs138963989	NaN	0.00678914	0.81	T	0.572	P	0.224	B	0.148	U	1.000	N	1.78	L	2.16	T	-1.029	T	0.018	T	0.013	1.672	11.55	0.338	0.121	-0.107	4.888	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	22.7351	0	9.233844	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	5	4	2
chr10	135012783	135012783	C	G	intronic	KNDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	10.5128	29	NaN	NA	NA	12	11	1	0
chr10	135015508	135015508	A	A	intronic	KNDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	135017243	135017243	C	A	intronic	KNDC1	NaN	NaN	NaN	rs3008382	NaN	0.410343	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	135020315	135020315	T	C	intronic	KNDC1	NaN	NaN	NaN	rs3008375	NaN	0.762979	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	153.214473	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	62	0	62	58
chr10	135020630	135020630	C	T	intronic	KNDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.629226	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	192	186	6	0
chr10	135032742	135032742	A	A	intronic	KNDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	135045022	135045022	C	T	UTR3	UTF1	NM_003577:c.*76C>T	NaN	NaN	rs2998111	NaN	0.651558	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.052268	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	1	17	53
chr10	135052900	135052900	C	T	intronic	VENTX	NaN	NaN	NaN	rs2270194	NaN	0.246006	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	9	1	8	0
chr10	135053770	135053770	G	G	exonic	VENTX	NaN	synonymous SNV	VENTX:NM_014468:exon3:c.G737G:p.R246R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr10	135076596	135076596	T	C	UTR3	ADAM8	NM_001164489:c.*143A>G,NM_001164490:c.*64A>G,NM_001109:c.*64A>G	NaN	NaN	rs2230576	NaN	0.737021	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	220.818274	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	74	0	74	54
chr10	135077056	135077056	T	C	intronic	ADAM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.006552	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	87	78	9	0
chr10	135082111	135082111	G	G	intronic	ADAM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	50	40	0	0
chr10	135082874	135082874	G	A	intronic	ADAM8	NaN	NaN	NaN	rs2995311	NaN	0.891573	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	162.638453	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	56	1	55	55
chr10	135084232	135084232	C	CAGCA	intronic	ADAM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.5887	0	NaN	NA	NA	7	4	2	0
chr10	135084322	135084322	A	G	intronic	ADAM8	NaN	NaN	NaN	rs3008321	NaN	0.902556	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	189.629941	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	0	65	55
chr10	135084601	135084601	T	C	intronic	ADAM8	NaN	NaN	NaN	rs2995314	NaN	0.902955	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	86.689304	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	0	29	54
chr10	135084948	135084948	G	G	intronic	ADAM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr10	135084949	135084949	A	A	intronic	ADAM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr10	135087089	135087089	G	T	intronic	ADAM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	25	9	16	0
chr10	135087607	135087607	A	G	intronic	ADAM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.003716	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	82	75	7	0
chr10	135089035	135089035	A	G	exonic	ADAM8	NaN	nonsynonymous SNV	ADAM8:NM_001109:exon2:c.T103C:p.W35R,ADAM8:NM_001164489:exon2:c.T103C:p.W35R	rs2275725	NaN	0.903155	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.552288	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	54
chr10	135090393	135090393	G	T	UTR5	ADAM8	NM_001164489:c.-72C>A,NM_001164490:c.-72C>A,NM_001109:c.-72C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	135093202	135093202	A	G	UTR3	TUBGCP2	NM_006659:c.*68T>C,NM_001256617:c.*68T>C,NM_001256618:c.*68T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.972083	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	71	61	10	0
chr10	135093442	135093442	C	T	intronic	TUBGCP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	32	17.431211	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	20	11	9	0
chr10	135093444	135093444	T	C	intronic	TUBGCP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	21	11	9	0
chr10	135098672	135098672	G	A	exonic	TUBGCP2	NaN	synonymous SNV	TUBGCP2:NM_001256618:exon12:c.C1551T:p.Y517Y,TUBGCP2:NM_006659:exon13:c.C1941T:p.Y647Y,TUBGCP2:NM_001256617:exon14:c.C2025T:p.Y675Y	rs3008334	NaN	0.887979	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	199.698479	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	81	1	80	55
chr10	135098830	135098830	T	C	intronic	TUBGCP2	NaN	NaN	NaN	rs3008335	NaN	0.897564	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	142.74506	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	0	47	55
chr10	135101960	135101960	C	T	intronic	TUBGCP2	NaN	NaN	NaN	rs3008343	NaN	0.98742	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.123084	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	7
chr10	135103262	135103262	G	A	intronic	TUBGCP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.62311	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	47	39	8	0
chr10	135103560	135103560	A	A	intronic	TUBGCP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr10	135106250	135106250	A	A	intronic	TUBGCP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	135106875	135106875	C	C	intronic	TUBGCP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	135111423	135111423	T	T	intronic	TUBGCP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	135123519	135123519	A	C	intronic	ZNF511	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	54.494	0	NaN	NA	NA	44	31	14	0
chr10	135126251	135126251	T	T	intronic	ZNF511	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	135160950	135160950	C	T	intronic	PRAP1	NaN	NaN	NaN	rs4838721	NaN	0.720647	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.892493	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	0	21	38
chr10	135163607	135163607	T	TC	exonic	PRAP1	NaN	frameshift substitution	PRAP1:NM_001145201:exon2:c.17_17delinsTC,PRAP1:NM_145202:exon2:c.17_17delinsTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.6696	0	NaN	NA	NA	74	57	8	7
chr10	135165429	135165429	C	G	intronic	PRAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	114.452	36	NaN	NA	NA	17	2	14	5
chr10	135165790	135165790	A	G	exonic	PRAP1	NaN	nonsynonymous SNV	PRAP1:NM_001145201:exon5:c.A275G:p.H92R,PRAP1:NM_145202:exon5:c.A302G:p.H101R	rs4369319	NaN	0.992013	1	T	0.0	B	0.0	B	0.047	N	1.000	P	0.895	L	1.67	T	-0.964	T	0.000	T	0.022	-0.941	0.359	-5.74	-2.364	-3.928	6.329	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.223205	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	0	23	43
chr10	135171364	135171364	T	C	intronic	FUOM	NaN	NaN	NaN	rs1891372	NaN	0.983027	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.428254	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	4
chr10	135182363	135182363	A	G	intronic	ECHS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	135202333	135202333	G	A	intronic	PAOX	NaN	NaN	NaN	rs10745296	NaN	0.0467252	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.385329	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	1	18	44
chr10	135205009	135205009	C	G	exonic	PAOX	NaN	synonymous SNV	PAOX:NM_207128:exon6:c.C1428G:p.P476P	rs1046178	NaN	0.845847	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	206.727198	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	68	0	68	57
chr10	135232971	135232971	A	G	intronic	MTG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr10	135232973	135232973	C	T	intronic	MTG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr10	135237166	135237166	G	A	exonic	SPRN	NaN	nonsynonymous SNV	SPRN:NM_001012508:exon2:c.C20T:p.T7M	rs2492666	ID=COSM1316964;OCCURENCE=1(haematopoietic_and_lymphoid_tissue)	0.484026	0.02	D	0.576	P	0.096	B	.	.	1.000	P	2.045	M	0.57	T	-0.954	T	0.000	T	0.102	2.360	13.85	1.2	0.248	0.844	7.140	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.007073	normal_lod	REJECT	3	0	3	5
chr10	135256555	135256555	C	A	intergenic	SPRN,SCART1	dist=18434;dist=10877	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	135348026	135348026	G	A	intronic	CYP2E1	NaN	NaN	NaN	rs8192775	NaN	0.140375	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	135352153	135352153	A	G	intronic	CYP2E1	NaN	NaN	NaN	rs2249694	NaN	0.554113	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	42.352	0	NaN	NA	NA	58	39	19	52
chr10	135368590	135368590	T	C	exonic	SYCE1	NaN	nonsynonymous SNV	SYCE1:NM_001143764:exon13:c.A962G:p.H321R	rs3737031	ID=COSM147095;OCCURENCE=1(stomach)	0.154752	0.11	T	0.004	B	0.005	B	0.044	N	1.000	P	0.895	L	3.07	T	-0.920	T	0.000	T	0.072	0.294	5.594	-0.027	-0.003	0.269	1.256	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	307.95684	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	172	57	115	10
chr10	135370221	135370221	G	C	intronic	SYCE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr10	135370633	135370633	C	T	exonic	SYCE1	NaN	synonymous SNV	SYCE1:NM_001143763:exon7:c.G402A:p.K134K,SYCE1:NM_001143764:exon7:c.G402A:p.K134K,SYCE1:NM_130784:exon8:c.G294A:p.K98K	rs8181356	ID=COSM147096,COSM147097;OCCURENCE=1(stomach)	0.154752	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	59	5	54	11
chr10	135370639	135370639	C	A	exonic	SYCE1	NaN	nonsynonymous SNV	SYCE1:NM_001143763:exon7:c.G396T:p.E132D,SYCE1:NM_001143764:exon7:c.G396T:p.E132D,SYCE1:NM_130784:exon8:c.G288T:p.E96D	rs8181357	ID=COSM147098,COSM147099;OCCURENCE=1(stomach)	0.154752	0.18	T	0.015	B	0.027	B	0.041	N	0.000	P	1.39	L	3.12	T	-0.997	T	0.000	T	0.031	1.997	12.63	0.217	0.050	-0.666	5.463	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	68	8	60	9
chr10	135371262	135371262	G	C	intronic	SYCE1	NaN	NaN	NaN	rs8181294	NaN	0.154752	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	113.3986	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	68	24	44	11
chr10	135371467	135371467	T	C	intronic	SYCE1	NaN	NaN	NaN	rs8181456	ID=COSN163848;OCCURENCE=1(breast)	0.154752	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr10	13538700	13538700	T	A	intronic	BEND7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr10	135404095	135404095	C	T	intergenic	SPRNP1,FRG2B	dist=20633;dist=34508	NaN	NaN	rs7098163	NaN	0.172324	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	135438888	135438888	C	T	exonic	FRG2B	NaN	synonymous SNV	FRG2B:NM_001080998:exon4:c.G552A:p.E184E	rs112001328	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	966	212	754	54
chr10	135440214	135440214	G	C	exonic	FRG2B	NaN	nonsynonymous SNV	FRG2B:NM_001080998:exon1:c.C33G:p.H11Q	rs75987380	NaN	NaN	0.01	D	0.077	B	0.079	B	0.037	N	1.000	N	0.695	N	0.92	T	-0.982	T	0.082	T	0.226	-0.090	3.559	0.109	0.181	0.831	.	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.08764	0	NaN	NA	NA	11	10	2	0
chr10	135440216	135440216	G	A	exonic	FRG2B	NaN	nonsynonymous SNV	FRG2B:NM_001080998:exon1:c.C31T:p.H11Y	rs79777505	NaN	NaN	0.01	D	0.202	B	0.084	B	0.037	N	1.000	N	0.695	N	0.93	T	-0.994	T	0.077	T	0.245	-0.024	3.891	0.109	0.181	0.831	.	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.46139	0	NaN	NA	NA	13	11	2	0
chr10	13655738	13655738	C	T	intronic	PRPF18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.541061	strand_artifact	REJECT	46	40	6	0
chr10	13699272	13699272	C	T	exonic	FRMD4A	NaN	nonsynonymous SNV	FRMD4A:NM_018027:exon22:c.G2317A:p.E773K	NaN	NaN	NaN	1	T	0.995	D	0.736	P	0.000	D	1.000	D	1.39	L	-1.69	D	-0.219	T	0.506	D	0.787	3.589	18.28	5.11	2.353	7.569	18.534	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	15	6.911308	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr10	13735722	13735722	T	T	intronic	FRMD4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	13736130	13736130	C	T	intronic	FRMD4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	13736131	13736131	A	C	intronic	FRMD4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	13736132	13736132	T	G	intronic	FRMD4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	13782662	13782662	A	A	intronic	FRMD4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	13789666	13789666	A	G	intronic	FRMD4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	6	0	5	0
chr10	13789667	13789667	T	A	intronic	FRMD4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr10	13804742	13804742	A	A	intronic	FRMD4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr10	13838604	13838604	A	A	intronic	FRMD4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	18	18	0	0
chr10	14415617	14415617	A	G	intergenic	FRMD4A,MIR4293	dist=42751;dist=9582	NaN	NaN	rs646646	NaN	0.541534	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	14415681	14415681	G	A	intergenic	FRMD4A,MIR4293	dist=42815;dist=9518	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	1451901	1451901	C	T	intronic	ADARB2	NaN	NaN	NaN	rs28553481	NaN	0.290136	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr10	14563835	14563835	A	C	intronic	FAM107B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.962948	nearby_gap_events	REJECT	40	34	6	0
chr10	14585526	14585526	A	A	intronic	FAM107B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	14862082	14862082	C	G	exonic	CDNF	NaN	nonsynonymous SNV	CDNF:NM_001029954:exon4:c.G461C:p.W154S	rs61738953	NaN	0.0135783	0.01	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.87	M	.	.	-0.198	T	0.244	T	0.377	4.693	26.0	5.9	2.806	6.699	19.054	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	91	68	23	9
chr10	14880455	14880455	T	G	exonic	HSPA14	NaN	stopgain	HSPA14:NM_001278205:exon1:c.T54G:p.Y18X,HSPA14:NM_016299:exon1:c.T54G:p.Y18X	NaN	NaN	NaN	0.25	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	7.509	39	-0.402	-0.199	1.232	10.680	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.485373	nearby_gap_events	REJECT	53	47	6	0
chr10	14909374	14909374	T	A	intronic	HSPA14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	14909375	14909375	A	T	intronic	HSPA14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	14913649	14913649	A	A	UTR3	HSPA14	NM_016299:c.*44A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	8	0	0
chr10	14923774	14923774	A	A	intronic	SUV39H2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	16	16	0	0
chr10	14943285	14943285	A	C	intronic	SUV39H2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr10	14943286	14943286	T	C	intronic	SUV39H2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr10	14943287	14943287	T	A	intronic	SUV39H2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr10	14943290	14943290	T	C	intronic	SUV39H2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr10	14943292	14943292	T	G	intronic	SUV39H2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr10	15014718	15014718	A	A	UTR3	MEIG1	NM_001080836:c.*78A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	17	15	0	0
chr10	15113657	15113657	T	T	intronic	OLAH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	15145361	15145361	G	A	exonic	RPP38	NaN	synonymous SNV	RPP38:NM_001265601:exon2:c.G48A:p.T16T,RPP38:NM_006414:exon2:c.G48A:p.T16T,RPP38:NM_001097590:exon3:c.G48A:p.T16T,RPP38:NM_183005:exon3:c.G48A:p.T16T	rs35539850	NaN	0.102037	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.752775	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	68	48	20	14
chr10	15256194	15256194	G	A	exonic	FAM171A1	NaN	nonsynonymous SNV	FAM171A1:NM_001010924:exon8:c.C1393T:p.P465S	rs3814165	NaN	0.124201	0.41	T	0.891	P	0.596	P	0.000	D	0.000	P	1.655	L	1.53	T	-1.058	T	0.000	T	0.083	2.075	12.90	4.35	1.445	7.060	14.242	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	19	26.487876	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	1	12	14
chr10	15256680	15256680	A	A	intronic	FAM171A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	15561244	15561244	A	C	intronic	ITGA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr10	15561248	15561248	G	T	intronic	ITGA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr10	15561250	15561250	C	G	intronic	ITGA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr10	15561251	15561251	C	T	intronic	ITGA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr10	15561254	15561254	C	T	intronic	ITGA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	9	2	7	0
chr10	15646155	15646155	T	C	intronic	ITGA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	15649851	15649851	A	G	intronic	ITGA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.929128	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	206	200	6	0
chr10	15658596	15658596	G	A	intronic	ITGA8	NaN	NaN	NaN	rs7099530	NaN	0.197085	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	0.0029032687542142363	Somatic	99.37	39	44.061367	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	11	17	24
chr10	15658659	15658659	T	C	intronic	ITGA8	NaN	NaN	NaN	rs7083600	NaN	0.201478	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSm	3	Somatic	0.00654166004555304	Somatic	108.266	44	NaN	NA	NA	26	10	16	21
chr10	15725823	15725823	C	A	intronic	ITGA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	15883640	15883640	A	G	intronic	FAM188A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.08357771260997007	NA	0	0	NaN	NA	NA	19	15	4	0
chr10	15883673	15883673	A	C	intronic	FAM188A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	15885024	15885024	T	A	intronic	FAM188A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.442254	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	50	42	8	0
chr10	15885382	15885382	A	A	intronic	FAM188A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	103	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr10	16737166	16737166	G	A	intronic	RSU1	NaN	NaN	NaN	rs3837313	NaN	0.451677	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	14	6	8	2
chr10	16737170	16737170	A	G	intronic	RSU1	NaN	NaN	NaN	rs199894279	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	83	29	54	0
chr10	16797033	16797033	A	G	intronic	RSU1	NaN	NaN	NaN	rs7910261	NaN	0.469848	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	228	146	82	26
chr10	16870950	16870950	C	T	exonic	CUBN	NaN	nonsynonymous SNV	CUBN:NM_001081:exon66:c.G10618A:p.V3540I	NaN	NaN	NaN	0.2	T	0.196	B	0.079	B	0.913	N	1.000	D	0.82	L	1.6	T	-1.070	T	0.051	T	0.059	0.667	7.572	-8.64	-1.596	-1.154	18.651	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.435199	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	62	59	3	0
chr10	16873209	16873209	T	C	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr10	16873212	16873212	T	G	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	16877224	16877224	A	C	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	11	4	5	0
chr10	16878204	16878204	T	T	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	162	116	0	0
chr10	16893429	16893429	T	G	exonic	CUBN	NaN	synonymous SNV	CUBN:NM_001081:exon60:c.A9468C:p.G3156G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.137718	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	19	16	3	0
chr10	16918997	16918997	T	C	exonic	CUBN	NaN	nonsynonymous SNV	CUBN:NM_001081:exon57:c.A9005G:p.E3002G	rs1801240	NaN	0.117013	0.25	T	0.006	B	0.005	B	0.034	N	0.998	P	1.595	L	2.22	T	-1.018	T	0.000	T	0.089	1.720	11.71	5.8	2.209	2.418	6.265	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	47.823755	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	43	22	11
chr10	16948177	16948177	A	G	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	rs780807	NaN	0.751997	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	33.6601	0	NaN	NA	NA	96	1	95	6
chr10	16948390	16948390	G	C	exonic	CUBN	NaN	nonsynonymous SNV	CUBN:NM_001081:exon50:c.C7724G:p.P2575R	rs1801236	NaN	0.067492	0.57	T	0.137	B	0.097	B	0.591	N	0.998	P	-0.535	N	2.28	T	-0.962	T	0.000	T	0.054	0.638	7.428	4.64	1.474	1.784	8.219	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	822.85	58	NaN	NA	NA	229	84	145	1
chr10	16970052	16970052	C	G	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	16970053	16970053	T	G	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	16975078	16975078	G	A	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	rs2271461	NaN	0.196885	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	61.2659	0	NaN	NA	NA	49	33	16	13
chr10	16981928	16981928	T	A	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	2	7	0
chr10	17086967	17086967	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	7	0	4,2	0
chr10	17127562	17127562	T	T	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	17130014	17130014	G	A	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.498562	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	26	23	3	0
chr10	17141922	17141922	T	C	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	17141924	17141924	T	A	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr10	17145314	17145314	A	C	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr10	17146652	17146652	C	A	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	rs7068549	NaN	0.364018	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	106	NaN	NA	NA	150	27	123	26
chr10	17146667	17146667	C	T	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	rs4748353	NaN	0.939696	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	905.306	60	NaN	NA	NA	161	34	126	48
chr10	17151575	17151575	T	T	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	17152994	17152994	G	A	exonic	CUBN	NaN	synonymous SNV	CUBN:NM_001081:exon9:c.C939T:p.N313N	rs1801223	NaN	0.214856	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.444738	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	14	32	21
chr10	17165751	17165751	A	A	intronic	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	17171820	17171820	A	C	upstream	CUBN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr10	1719477	1719477	G	C	intronic	ADARB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	17196670	17196670	T	C	intronic	TRDMT1	NaN	NaN	NaN	rs3736820	NaN	0.116014	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	77.690828	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	44	14	30	12
chr10	17201247	17201247	A	G	intronic	TRDMT1	NaN	NaN	NaN	rs17140049	NaN	0.116414	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	52.0952	0	NaN	NA	NA	85	17	68	3
chr10	17210881	17210881	A	G	exonic	TRDMT1	NaN	synonymous SNV	TRDMT1:NM_004412:exon3:c.T210C:p.F70F	rs7096233	NaN	0.116414	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	0.065	4.353	2.11	-0.052	1.196	10.962	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	291.207	0	NaN	NA	NA	169	43	126	10
chr10	17243656	17243656	C	G	UTR5	TRDMT1	NM_004412:c.-23G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr10	17271257	17271257	G	A	ncRNA_intronic	VIM-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.3985	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr10	17271400	17271400	G	C	ncRNA_exonic	VIM-AS1	NaN	NaN	NaN	rs3758410	NaN	0.414936	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	70.0659	0	23.940506	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	9	12	29
chr10	17272017	17272017	C	G	intronic	VIM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	17272744	17272744	A	C	intronic	VIM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.935132	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	34	28	6	0
chr10	17276658	17276658	T	G	intronic	VIM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	17277960	17277960	T	A	intronic	VIM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.526843	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	106	98	8	0
chr10	17279248	17279248	A	G	exonic	VIM	NaN	nonsynonymous SNV	VIM:NM_003380:exon10:c.A1379G:p.Q460R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.723	P	0.321	B	0.000	D	1.000	D	2.49	M	-4.76	D	1.049	D	0.925	D	0.843	4.464	23.8	6.16	2.367	7.873	15.987	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.27882	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	139	131	8	0
chr10	17363406	17363406	A	A	intronic	ST8SIA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr10	17432483	17432483	A	A	ncRNA_intronic	ST8SIA6-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	17432485	17432485	A	A	ncRNA_intronic	ST8SIA6-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	17432488	17432488	C	C	ncRNA_intronic	ST8SIA6-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	1755209	1755209	A	G	intronic	ADARB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	17659131	17659131	C	A	exonic	HACD1	NaN	nonsynonymous SNV	HACD1:NM_014241:exon1:c.G208T:p.V70F	rs11254692	NaN	1	0.5	T	0.0	B	0.001	B	0.986	N	1.000	P	0.345	N	2.72	T	-1.047	T	0.000	T	0.367	-0.176	3.143	-3.22	-1.288	0.509	5.681	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.584797	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	7
chr10	17659149	17659149	C	T	exonic	HACD1	NaN	nonsynonymous SNV	HACD1:NM_014241:exon1:c.G190A:p.E64K	rs7895850	NaN	0.891573	1	T	0.005	B	0.0	B	0.371	N	1.000	P	-1.895	N	2.86	T	-1.016	T	0.000	T	0.367	0.992	9.049	2.04	0.439	1.138	3.214	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.103549	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	4
chr10	17751054	17751054	C	T	intronic	STAM	NaN	NaN	NaN	rs61842352	NaN	0.0335463	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	216	164	52	4
chr10	1779349	1779349	G	A	UTR5	ADARB2	NM_018702:c.-5C>T	NaN	NaN	rs3750684	NaN	0.445887	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.532372	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	8	17	44
chr10	17865248	17865248	A	C	exonic	MRC1	NaN	synonymous SNV	MRC1:NM_002438:exon2:c.A237C:p.S79S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.9359	0	NaN	NA	NA	60	50	10	18
chr10	18254534	18254534	G	T	exonic	SLC39A12	NaN	synonymous SNV	SLC39A12:NM_001282734:exon3:c.G264T:p.L88L,SLC39A12:NM_001145195:exon4:c.G666T:p.L222L,SLC39A12:NM_001282733:exon4:c.G666T:p.L222L,SLC39A12:NM_152725:exon4:c.G666T:p.L222L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.12121212121212258	Somatic	10.4473	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr10	18254606	18254606	C	C	exonic	SLC39A12	NaN	synonymous SNV	SLC39A12:NM_001282734:exon3:c.C336C:p.T112T,SLC39A12:NM_001145195:exon4:c.C738C:p.T246T,SLC39A12:NM_001282733:exon4:c.C738C:p.T246T,SLC39A12:NM_152725:exon4:c.C738C:p.T246T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr10	18276598	18276598	A	G	intronic	SLC39A12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr10	18804136	18804136	A	A	intronic	CACNB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr10	18826922	18826922	T	T	intronic	CACNB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr10	18834811	18834811	C	G	UTR3	NSUN6	NM_182543:c.*51G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	20	15	5	0
chr10	18898853	18898853	C	T	exonic	NSUN6	NaN	nonsynonymous SNV	NSUN6:NM_182543:exon6:c.G578A:p.G193D	NaN	NaN	NaN	0.11	T	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	3.185	M	0.8	T	-0.160	T	0.393	T	0.853	3.348	17.27	5.34	2.491	6.157	18.658	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.11076923076923088	NA	0	0	5.636966	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	11	8	3	0
chr10	18940157	18940157	C	A	UTR5	NSUN6	NM_182543:c.-25G>T	NaN	NaN	rs3740102	NaN	0.40615	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.982437	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	24	7	39
chr10	18948422	18948422	G	C	UTR5	ARL5B	NM_178815:c.-145G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSm	3	Somatic	0.03488925934746391	Somatic	48.0281	25	NaN	NA	NA	10	3	7	41
chr10	18948688	18948688	G	A	intronic	ARL5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.005434018595521644	NA	0	0	NaN	NA	NA	260	202	58	0
chr10	18948789	18948789	A	C	intronic	ARL5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	18948790	18948790	C	T	intronic	ARL5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	18948791	18948791	G	C	intronic	ARL5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	20105936	20105936	T	C	UTR5	PLXDC2	NM_032812:c.-73T>C,NM_001282736:c.-73T>C	NaN	NaN	rs989767	NaN	0.697883	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.62032	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	0	18	50
chr10	20500722	20500722	T	C	intronic	PLXDC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.756014	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	427	419	8	0
chr10	20506418	20506418	G	A	exonic	PLXDC2	NaN	nonsynonymous SNV	PLXDC2:NM_001282736:exon10:c.G1039A:p.V347I,PLXDC2:NM_032812:exon11:c.G1186A:p.V396I	rs3817405	NaN	0.566294	0.44	T	0.003	B	0.002	B	0.194	N	1.000	P	1.39	L	-1.0	T	-1.011	T	0.000	T	0.026	-0.421	2.036	-11.1	-2.080	-2.181	4.875	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	48.965847	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	12	19	49
chr10	21101880	21101880	A	G	intronic	NEBL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.153595	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	98	90	8	1
chr10	21112111	21112111	A	T	intronic	NEBL	NaN	NaN	NaN	rs11012353	NaN	0.302117	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	394.276	0	NaN	NA	NA	36	20	16	5
chr10	21147299	21147299	A	A	intronic	NEBL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	21177164	21177164	T	A	intronic	NEBL	NaN	NaN	NaN	rs200929034	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	62	42	20	0
chr10	21250764	21250764	A	A	intronic	NEBL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr10	21461476	21461476	A	G	intronic	NEBL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	9	3	4	0
chr10	21806773	21806773	A	A	UTR5	SKIDA1	NM_207371:c.-22T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr10	21940511	21940511	T	T	intronic	MLLT10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	22024038	22024038	T	A	intronic	MLLT10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	22095196	22095196	T	C	intronic	DNAJC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	22193337	22193337	A	G	intronic	DNAJC1	NaN	NaN	NaN	rs77439330	NaN	0.000998403	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	22606853	22606853	A	C	exonic	COMMD3,COMMD3-BMI1	NaN	nonsynonymous SNV	COMMD3-BMI1:NM_001204062:exon2:c.A180C:p.K60N,COMMD3:NM_012071:exon2:c.A180C:p.K60N	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.99	D	0.000	D	1.000	D	2.275	M	2.68	T	-0.739	T	0.259	T	0.209	2.316	13.70	3.21	0.350	1.489	7.750	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.877141	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	33	25	8	0
chr10	22606854	22606854	C	A	exonic	COMMD3,COMMD3-BMI1	NaN	nonsynonymous SNV	COMMD3-BMI1:NM_001204062:exon2:c.C181A:p.H61N,COMMD3:NM_012071:exon2:c.C181A:p.H61N	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.985	D	0.824	P	0.000	D	1.000	D	2.135	M	2.93	T	-0.484	T	0.324	T	0.187	3.559	18.15	5.0	1.494	3.419	11.666	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.474126	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	32	25	7	0
chr10	22615797	22615797	A	C	intronic	BMI1,COMMD3-BMI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.693384	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	77	68	9	0
chr10	22616698	22616698	A	T	exonic	BMI1,COMMD3-BMI1	NaN	nonsynonymous SNV	BMI1:NM_005180:exon5:c.A293T:p.Y98F,COMMD3-BMI1:NM_001204062:exon9:c.A722T:p.Y241F	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.937	D	0.000	D	1.000	D	3.275	M	2.19	T	-0.275	T	0.297	T	0.632	4.644	25.5	5.92	2.274	9.339	16.040	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.75167	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	37	31	6	0
chr10	22617858	22617858	T	C	intronic	BMI1,COMMD3-BMI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	16	8	8	0
chr10	22618254	22618254	G	C	exonic	BMI1,COMMD3-BMI1	NaN	nonsynonymous SNV	BMI1:NM_005180:exon10:c.G764C:p.S255T,COMMD3-BMI1:NM_001204062:exon14:c.G1193C:p.S398T	NaN	NaN	NaN	0.22	T	0.998	D	0.993	D	0.000	D	1.000	D	2.3	M	1.35	T	-0.591	T	0.311	T	0.54	3.271	16.98	5.58	2.638	9.434	19.186	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.671186	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	74	69	5	1
chr10	22618510	22618510	A	G	UTR3	BMI1,COMMD3-BMI1	NM_005180:c.*39A>G;NM_001204062:c.*39A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.983262	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	101	89	12	0
chr10	22618511	22618511	T	A	UTR3	BMI1,COMMD3-BMI1	NM_005180:c.*40T>A;NM_001204062:c.*40T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.241939	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	97	85	12	0
chr10	22839463	22839463	C	A	intronic	PIP4K2A	NaN	NaN	NaN	rs10047326	NaN	0.731829	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	22839628	22839628	T	C	exonic	PIP4K2A	NaN	nonsynonymous SNV	PIP4K2A:NM_005028:exon7:c.A752G:p.N251S	rs2230469	NaN	0.21226	0.55	T	0.001	B	0.006	B	0.000	D	0.000	P	0.155	N	1.37	T	-0.924	T	0.000	T	0.088	1.132	9.613	6.07	2.330	5.912	16.628	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	57	48	9	26
chr10	22839755	22839755	A	C	intronic	PIP4K2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	212.589	0	NaN	NA	NA	58	21	35	3
chr10	22839758	22839758	A	A	intronic	PIP4K2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	22845126	22845126	C	C	intronic	PIP4K2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	31	29	0	0
chr10	22845127	22845127	G	G	intronic	PIP4K2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	31	29	0	0
chr10	22880743	22880743	G	A	intronic	PIP4K2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	192.343	45	75.104737	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	32	6	26	8
chr10	22880745	22880745	G	A	intronic	PIP4K2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	200.215	45	79.497047	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	33	6	27	7
chr10	23257204	23257204	T	A	intronic	ARMC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.21052631578947564	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr10	23270442	23270442	T	T	intronic	ARMC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	103	69	0	0
chr10	23297301	23297301	C	T	exonic	ARMC3	NaN	synonymous SNV	ARMC3:NM_001282747:exon12:c.C1137T:p.N379N,ARMC3:NM_001282745:exon15:c.C1926T:p.N642N,ARMC3:NM_001282746:exon15:c.C1926T:p.N642N,ARMC3:NM_173081:exon15:c.C1926T:p.N642N	rs11817610	NaN	0.5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	103.075	0	NaN	NA	NA	143	0	143	11
chr10	23297336	23297336	A	T	intronic	ARMC3	NaN	NaN	NaN	rs11819616	NaN	0.500399	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	173.709	0	NaN	NA	NA	149	0	149	16
chr10	23393251	23393251	A	T	intronic	MSRB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	23409713	23409713	T	C	exonic	MSRB2	NaN	synonymous SNV	MSRB2:NM_012228:exon5:c.T471C:p.F157F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.092421	nearby_gap_events	REJECT	133	126	7	0
chr10	23482642	23482642	C	T	exonic	PTF1A	NaN	nonsynonymous SNV	PTF1A:NM_178161:exon2:c.C794T:p.S265F	NaN	NaN	NaN	0.23	T	0.999	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	1.78	L	-3.74	D	0.909	D	0.904	D	0.759	3.811	19.35	5.5	2.602	7.698	19.058	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.485144	nearby_gap_events	REJECT	40	35	5	0
chr10	23607627	23607627	T	C	UTR3	C10orf67	NM_153714:c.*212A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	24600294	24600294	G	T	intronic	KIAA1217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	24655581	24655581	T	A	intronic	KIAA1217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	6	0	5	0
chr10	24669877	24669877	C	G	exonic	KIAA1217	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA1217:NM_001282767:exon3:c.C434G:p.A145G,KIAA1217:NM_001282768:exon3:c.C434G:p.A145G,KIAA1217:NM_019590:exon3:c.C434G:p.A145G,KIAA1217:NM_001098500:exon4:c.C194G:p.A65G	rs17506606	NaN	0.103634	0.44	T	0.003	B	0.006	B	0.011	N	0.000	P	0.65	N	-0.21	T	-1.040	T	0.000	T	0.067	1.455	10.81	-0.211	-0.005	1.095	15.518	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.211802	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	3	15	24
chr10	24784048	24784048	T	A	intronic	KIAA1217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr10	24820679	24820679	T	T	intronic	KIAA1217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	24825882	24825882	A	T	intronic	KIAA1217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr10	24825885	24825885	A	T	intronic	KIAA1217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	24825886	24825886	A	G	intronic	KIAA1217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	24908686	24908686	T	C	exonic	ARHGAP21	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGAP21:NM_020824:exon9:c.A2138G:p.N713S	rs3748222	ID=COSM146906;OCCURENCE=1(stomach)	0.438299	0.76	T	0.023	B	0.024	B	0.094	N	1.000	P	0.51	N	1.02	T	-0.920	T	0.000	T	0.066	-1.106	0.138	1.19	0.367	-0.783	1.035	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	516	148	368	46
chr10	25138879	25138879	A	G	intronic	PRTFDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.218665	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	56	52	4	0
chr10	25231210	25231210	T	T	intronic	PRTFDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	25304748	25304748	C	G	intronic	ENKUR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	25755565	25755565	A	T	intronic	GPR158	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.512888	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	94	85	9	0
chr10	25839849	25839849	T	T	intronic	GPR158	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	25883169	25883169	T	T	intronic	GPR158	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	8	0	0
chr10	26310679	26310679	A	C	intronic	MYO3A	NaN	NaN	NaN	rs17666079	NaN	0.330072	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	223	75	148	16
chr10	26313084	26313084	T	G	intronic	MYO3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr10	26313086	26313086	C	G	intronic	MYO3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr10	26356014	26356014	C	T	intronic	MYO3A	NaN	NaN	NaN	rs3824698	NaN	0.396565	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.012911561106731214	NA	0	34	NaN	NA	NA	35	18	17	0
chr10	26356015	26356015	A	G	intronic	MYO3A	NaN	NaN	NaN	rs3824697	NaN	0.396565	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.019257554171008776	NA	0	0	NaN	NA	NA	27	16	11	0
chr10	26356037	26356037	C	T	intronic	MYO3A	NaN	NaN	NaN	rs3824696	NaN	0.397165	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	60	22	38	19
chr10	26357625	26357625	T	C	intronic	MYO3A	NaN	NaN	NaN	rs3817421	NaN	0.396565	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	122	22	100	46
chr10	26357747	26357747	C	T	exonic	MYO3A	NaN	synonymous SNV	MYO3A:NM_017433:exon12:c.C1104T:p.Y368Y	rs35379457	ID=COSM1559312;OCCURENCE=3(central_nervous_system)	0.396565	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	81	NaN	NA	NA	119	13	106	0
chr10	26357748	26357748	G	A	exonic	MYO3A	NaN	nonsynonymous SNV	MYO3A:NM_017433:exon12:c.G1105A:p.V369I	rs3817420	NaN	0.66893	0.21	T	0.001	B	0.001	B	0.000	N	0.000	P	-0.345	N	-0.59	T	-0.903	T	0.000	T	0.051	1.999	12.64	3.19	0.068	4.224	6.144	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	97	NaN	NA	NA	117	13	104	4
chr10	26357820	26357820	C	T	intronic	MYO3A	NaN	NaN	NaN	rs3817419	NaN	0.396366	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	92	15	77	26
chr10	26417378	26417378	A	C	exonic	MYO3A	NaN	nonsynonymous SNV	MYO3A:NM_017433:exon20:c.A2173C:p.K725Q	NaN	NaN	NaN	0.4	T	0.392	B	0.348	B	0.000	N	1.000	D	1.26	L	-0.62	T	-0.697	T	0.275	T	0.483	2.811	15.36	4.82	2.291	7.480	13.437	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.414944	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	87	68	19	0
chr10	26443646	26443646	G	A	intronic	MYO3A	NaN	NaN	NaN	rs3818956	NaN	0.682708	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	669.386	0	NaN	NA	NA	115	31	84	45
chr10	26446209	26446209	T	T	intronic	MYO3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr10	26455067	26455067	A	G	exonic	MYO3A	NaN	nonsynonymous SNV	MYO3A:NM_017433:exon27:c.A3071G:p.E1024G	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.987	D	0.95	D	0.000	D	1.000	D	1.59	L	-0.68	T	-0.273	T	0.449	T	0.855	5.217	33	6.07	2.330	6.926	16.628	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.096912	nearby_gap_events	REJECT	60	54	6	0
chr10	26459261	26459261	G	A	intronic	MYO3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.46844	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	56	53	3	0
chr10	26462790	26462790	G	A	exonic	MYO3A	NaN	synonymous SNV	MYO3A:NM_017433:exon30:c.G3597A:p.E1199E	rs3740232	ID=COSM146911;OCCURENCE=1(stomach),1(large_intestine)	0.329073	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	286.19462	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	176	55	121	36
chr10	26463523	26463523	C	A	intronic	MYO3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	29	27	2	0
chr10	26500705	26500705	G	C	intronic	MYO3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.957296	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	127	113	14	4
chr10	26505559	26505559	C	A	UTR5	GAD2	NM_001134366:c.-180C>A,NM_000818:c.-180C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	51	0	6	0
chr10	26505782	26505782	A	T	exonic	GAD2	NaN	nonsynonymous SNV	GAD2:NM_000818:exon1:c.A44T:p.D15V,GAD2:NM_001134366:exon1:c.A44T:p.D15V	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.971	D	0.776	P	0.000	D	1.000	D	1.245	L	0.18	T	-0.636	T	0.238	T	0.451	2.319	13.71	4.92	1.852	5.481	13.573	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr10	26505789	26505789	T	G	exonic	GAD2	NaN	synonymous SNV	GAD2:NM_000818:exon1:c.T51G:p.S17S,GAD2:NM_001134366:exon1:c.T51G:p.S17S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	34	6	27	15
chr10	26505984	26505984	A	A	intronic	GAD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr10	2667222	2667222	A	C	intergenic	LINC00701,PFKP	dist=309954;dist=442490	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	2667225	2667225	A	T	intergenic	LINC00701,PFKP	dist=309957;dist=442487	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	2667226	2667226	T	G	intergenic	LINC00701,PFKP	dist=309958;dist=442486	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	26792239	26792239	A	A	intronic	APBB1IP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	26830491	26830491	T	G	intronic	APBB1IP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.34556747600225546	NA	0	0	NaN	NA	NA	18	14	4	0
chr10	27111941	27111941	T	T	intronic	ABI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	27318308	27318308	C	A	intronic	ANKRD26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.252877	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	52	46	6	0
chr10	27324319	27324319	A	G	exonic	ANKRD26	NaN	synonymous SNV	ANKRD26:NM_001256053:exon24:c.T3057C:p.R1019R,ANKRD26:NM_014915:exon24:c.T3060C:p.R1020R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.207004	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	378	371	7	0
chr10	27326348	27326348	A	G	intronic	ANKRD26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	14	8	6	0
chr10	27342163	27342163	T	G	intronic	ANKRD26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr10	27366247	27366247	T	G	intronic	ANKRD26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.08292220113851803	NA	0	37	NaN	NA	NA	24	18	6	0
chr10	27366250	27366250	T	A	intronic	ANKRD26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	66.0103	0	NaN	NA	NA	51	33	18	0
chr10	27366253	27366253	A	T	intronic	ANKRD26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	31	19	12	0
chr10	27366254	27366254	A	T	intronic	ANKRD26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	37	21	16	0
chr10	27366255	27366255	A	T	intronic	ANKRD26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.08604634537042948	NA	0	0	NaN	NA	NA	26	18	8	0
chr10	27366482	27366482	C	A	intronic	ANKRD26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.870583	nearby_gap_events	REJECT	64	57	7	0
chr10	27375601	27375601	T	A	intronic	ANKRD26	NaN	NaN	NaN	rs11015513	NaN	0.0585064	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.167352	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	11	5	2
chr10	27382519	27382519	C	T	intronic	ANKRD26	NaN	NaN	NaN	rs2297148	NaN	0.101038	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	391	297	94	2
chr10	27406705	27406705	A	C	intronic	YME1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.785283	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	64	59	5	0
chr10	27412669	27412669	A	T	intronic	YME1L1	NaN	NaN	NaN	rs2274743	NaN	0.340056	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	40	29	11	6
chr10	27423744	27423744	T	C	intronic	YME1L1	NaN	NaN	NaN	rs2275752	NaN	0.280351	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	18.2392	0	NaN	NA	NA	43	34	9	17
chr10	27443072	27443072	G	A	intronic	YME1L1	NaN	NaN	NaN	rs11816716	NaN	0.0303514	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.879473	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	22	11	2
chr10	27444344	27444344	T	G	UTR5	MASTL	NM_032844:c.-12T>G,NM_001172304:c.-12T>G,NM_001172303:c.-12T>G	NaN	NaN	rs7907988	NaN	0.855232	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.875738	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	86	67	19	58
chr10	27456003	27456003	G	A	intronic	MASTL	NaN	NaN	NaN	rs788238	NaN	0.991014	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	57.566961	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	0	20	57
chr10	27529549	27529549	C	A	UTR5	ACBD5	NM_001301252:c.-8825G>T,NM_001301254:c.-8825G>T,NM_001271512:c.-127G>T	NaN	NaN	rs2797078	NaN	0.677117	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1591.43	0	NaN	NA	NA	168	0	168	51
chr10	27687225	27687225	A	G	exonic	PTCHD3	NaN	stoploss	PTCHD3:NM_001034842:exon4:c.T2302C:p.X768Q	rs2505323	NaN	0.55012	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	-0.877	0.487	3.46	0.465	0.032	10.222	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.874115	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	0	36	53
chr10	27687775	27687775	T	C	exonic	PTCHD3	NaN	nonsynonymous SNV	PTCHD3:NM_001034842:exon4:c.A1752G:p.I584M	rs1638630	NaN	0.97504	1	T	.	.	.	.	0.009	N	1.000	P	.	.	-2.02	D	-0.929	T	0.000	T	0.036	-3.170	0.001	1.18	-0.159	-0.047	4.863	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2058.56	0	NaN	NA	NA	199	1	198	57
chr10	27687994	27687994	A	G	exonic	PTCHD3	NaN	synonymous SNV	PTCHD3:NM_001034842:exon4:c.T1533C:p.S511S	rs2484173	NaN	0.55012	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	635.254	0	NaN	NA	NA	66	1	65	36
chr10	27688109	27688109	T	C	exonic	PTCHD3	NaN	nonsynonymous SNV	PTCHD3:NM_001034842:exon4:c.A1418G:p.D473G	rs2429485	NaN	0.55012	0.4	T	0.001	B	0.008	B	0.601	N	1.000	P	0.47	N	-2.01	D	-0.938	T	0.000	T	0.04	-2.108	0.006	-0.118	-0.224	2.124	1.184	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.298935	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	22
chr10	2775750	2775750	C	T	intergenic	LINC00701,PFKP	dist=418482;dist=333962	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	27793316	27793316	A	G	exonic	RAB18	NaN	synonymous SNV	RAB18:NM_001256410:exon1:c.A18G:p.L6L,RAB18:NM_001256411:exon1:c.A18G:p.L6L,RAB18:NM_001256412:exon1:c.A18G:p.L6L,RAB18:NM_001256415:exon1:c.A18G:p.L6L,RAB18:NM_021252:exon1:c.A18G:p.L6L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.056473	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	36	33	3	0
chr10	27827048	27827048	A	T	UTR3	RAB18	NM_001256415:c.*68A>T,NM_001256412:c.*68A>T,NM_001256411:c.*28A>T,NM_021252:c.*68A>T,NM_001256410:c.*68A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	28032136	28032136	C	T	intronic	MKX	NaN	NaN	NaN	rs2252651	NaN	0.576677	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	61.486123	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	1	22	51
chr10	28228865	28228865	A	G	exonic	ARMC4	NaN	synonymous SNV	ARMC4:NM_001290021:exon7:c.T633C:p.N211N,ARMC4:NM_001290020:exon14:c.T2058C:p.N686N,ARMC4:NM_018076:exon14:c.T2058C:p.N686N	rs7893462	NaN	0.533147	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.52441	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	85	62	23	45
chr10	28233120	28233120	A	C	intronic	ARMC4	NaN	NaN	NaN	rs3824590	NaN	0.558706	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	170	140	30	44
chr10	28409615	28409615	A	G	intronic	MPP7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.059319	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	88	79	9	0
chr10	28527626	28527626	A	A	UTR5	MPP7	NM_173496:c.-93T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	285368	285368	C	C	intronic	ZMYND11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	44	37	0	0
chr10	285477	285477	T	TTG	intronic	ZMYND11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	538.441	0	NaN	NA	NA	67	3	7	17
chr10	287811	287811	A	G	intronic	ZMYND11	NaN	NaN	NaN	rs3740303	NaN	0.901757	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.52697	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	56
chr10	288198	288198	A	A	intronic	ZMYND11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	21	20	0	0
chr10	28878647	28878647	A	T	intronic	WAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.508045	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	82	69	13	0
chr10	28905079	28905079	A	G	intronic	WAC	NaN	NaN	NaN	rs332176	ID=COSN163598;OCCURENCE=1(breast)	0.149361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.822691	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	5	4	22
chr10	28966901	28966901	A	G	exonic	BAMBI	NaN	synonymous SNV	BAMBI:NM_012342:exon1:c.A75G:p.K25K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.891561	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	24	19	5	0
chr10	294953	294953	A	G	exonic	ZMYND11	NaN	synonymous SNV	ZMYND11:NM_001202465:exon12:c.A1356G:p.E452E,ZMYND11:NM_001202467:exon12:c.A1449G:p.E483E,ZMYND11:NM_001202464:exon13:c.A1449G:p.E483E,ZMYND11:NM_001202466:exon13:c.A1446G:p.E482E,ZMYND11:NM_001202468:exon13:c.A1611G:p.E537E,ZMYND11:NM_006624:exon14:c.A1611G:p.E537E,ZMYND11:NM_212479:exon14:c.A1608G:p.E536E	rs1017361	NaN	0.935903	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	63.514413	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	0	25	49
chr10	29581383	29581383	T	A	intronic	LYZL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	29598985	29598985	T	T	intronic	LYZL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr10	2966252	2966252	A	T	intergenic	LINC00701,PFKP	dist=608984;dist=143460	NaN	NaN	rs1909683	NaN	0.722045	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr10	29759443	29759443	T	C	ncRNA_intronic	SVIL-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr10	29759445	29759445	G	A	ncRNA_intronic	SVIL-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr10	29759449	29759449	G	T	ncRNA_intronic	SVIL-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	29775261	29775261	G	A	ncRNA_intronic	SVIL-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.06485610792618582	NA	0	0	NaN	NA	NA	24	15	9	0
chr10	2977918	2977918	C	C	intergenic	LINC00701,PFKP	dist=620650;dist=131794	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	29784004	29784004	G	A	intronic	SVIL	NaN	NaN	NaN	rs28427082	NaN	0.44349	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsM	3	Somatic	0.008331318211861744	Somatic	77.1282	0	33.231306	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	30	14	16	20
chr10	29784072	29784072	G	C	exonic	SVIL	NaN	nonsynonymous SNV	SVIL:NM_003174:exon17:c.C2425G:p.P809A,SVIL:NM_021738:exon19:c.C3703G:p.P1235A	rs2368406	ID=COSM1599890;OCCURENCE=1(central_nervous_system)	NaN	0.1	T	0.968	D	0.853	P	0.000	D	0.000	P	2.215	M	2.69	T	-0.976	T	0.000	T	0.523	4.030	20.7	4.37	2.267	6.346	17.153	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.007207706839802664	Somatic	18.0512	0	NaN	NA	NA	47	37	10	12
chr10	29795467	29795467	C	A	intronic	SVIL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	29811537	29811537	T	C	exonic	SVIL	NaN	nonsynonymous SNV	SVIL:NM_003174:exon14:c.A1913G:p.E638G,SVIL:NM_021738:exon16:c.A3191G:p.E1064G	NaN	NaN	NaN	0.32	T	1.0	D	0.959	D	0.000	N	1.000	D	2.175	M	2.62	T	-1.103	T	0.093	T	0.757	3.460	17.72	5.84	2.232	3.805	16.211	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.073965	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	139	133	6	0
chr10	29811574	29811574	A	A	intronic	SVIL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	29818594	29818594	G	G	intronic	SVIL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	86	71	0	0
chr10	30306710	30306710	G	A	UTR3	KIAA1462	NM_020848:c.*102C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	30306713	30306713	T	A	UTR3	KIAA1462	NM_020848:c.*99A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	30306804	30306804	G	A	UTR3	KIAA1462	NM_020848:c.*8C>T	NaN	NaN	rs2478839	NaN	0.264377	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	87.855967	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	69	33	36	44
chr10	30316072	30316072	C	G	exonic	KIAA1462	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA1462:NM_020848:exon3:c.G3005C:p.S1002T	rs3739998	NaN	0.251797	0.63	T	0.058	B	0.025	B	0.198	N	1.000	P	1.79	L	2.71	T	-0.914	T	0.000	T	0.029	0.932	8.798	-0.722	0.190	0.151	0.969	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	72.544415	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	11	27	41
chr10	30316208	30316208	T	C	exonic	KIAA1462	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA1462:NM_020848:exon3:c.A2869G:p.R957G	rs2185724	ID=COSM427458;OCCURENCE=1(breast)	0.337061	0.24	T	0.01	B	0.009	B	0.736	N	1.000	P	0.11	N	2.6	T	-0.954	T	0.000	T	0.031	1.705	11.66	-11.2	-3.245	-0.378	5.851	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.074798	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	29	12	39
chr10	30316872	30316872	T	C	exonic	KIAA1462	NaN	synonymous SNV	KIAA1462:NM_020848:exon3:c.A2205G:p.A735A	rs3739996	NaN	0.211262	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	93	NaN	NA	NA	192	157	35	35
chr10	30625972	30625972	A	A	intronic	MTPAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	26	26	0	0
chr10	30637995	30637995	C	G	intronic	MTPAP	NaN	NaN	NaN	rs10826783	NaN	0.310104	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	255.40779	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	83	0	83	46
chr10	30740379	30740379	G	A	intronic	MAP3K8	NaN	NaN	NaN	rs303426	NaN	0.381589	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	50	42	8	49
chr10	31040980	31040980	A	A	intergenic	SVILP1,ZNF438	dist=35038;dist=92585	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	31134557	31134557	T	C	intronic	ZNF438	NaN	NaN	NaN	rs17229657	NaN	0.460863	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	115.020014	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	62	15	47	41
chr10	31138817	31138817	G	A	exonic	ZNF438	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF438:NM_001143767:exon5:c.C517T:p.P173S,ZNF438:NM_001143768:exon6:c.C517T:p.P173S,ZNF438:NM_001143766:exon7:c.C517T:p.P173S,ZNF438:NM_001143769:exon7:c.C370T:p.P124S,ZNF438:NM_001143771:exon7:c.C487T:p.P163S,ZNF438:NM_182755:exon7:c.C517T:p.P173S,ZNF438:NM_001143770:exon8:c.C487T:p.P163S	rs10160116	NaN	0.375399	0.87	T	0.053	B	0.019	B	0.474	N	1.000	P	1.445	L	3.03	T	-0.923	T	0.000	T	0.099	0.060	4.324	1.18	0.010	0.165	2.587	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	14
chr10	3147518	3147518	G	C	intronic	PFKP	NaN	NaN	NaN	rs2388576	NaN	0.243211	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	160	120	40	0
chr10	3155408	3155408	C	T	intronic	PFKP	NaN	NaN	NaN	rs3816700	NaN	0.582268	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.307526	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	0	12	48
chr10	3155428	3155428	C	T	intronic	PFKP	NaN	NaN	NaN	rs3816701	NaN	0.568291	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.55952	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	0	13	46
chr10	3155753	3155753	G	C	intronic	PFKP	NaN	NaN	NaN	rs4881087	NaN	0.890575	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	105.113094	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	1	36	58
chr10	3161148	3161148	G	C	intronic	PFKP	NaN	NaN	NaN	rs3829915	NaN	0.442292	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	132	71	61	26
chr10	3172145	3172145	C	T	exonic	PFKP	NaN	synonymous SNV	PFKP:NM_002627:exon17:c.C1818T:p.F606F,PFKP:NM_001242339:exon19:c.C1794T:p.F598F	rs1052337	ID=COSM1347582,COSM1347583;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.1248	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	110	NaN	NA	NA	217	183	34	11
chr10	3172338	3172338	A	A	intronic	PFKP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	31749931	31749931	T	G	intronic	ZEB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr10	3177876	3177876	C	G	intronic	PFKP	NaN	NaN	NaN	rs2306317	NaN	0.119609	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.705868	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	22	9	11
chr10	3177878	3177878	C	T	intronic	PFKP	NaN	NaN	NaN	rs2306318	NaN	0.119609	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.462675	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	23	9	11
chr10	3178088	3178088	A	G	intronic	PFKP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	62	NaN	NA	NA	112	15	96	0
chr10	3178857	3178857	G	T	UTR3	PFKP	NM_002627:c.*86G>T,NM_001242339:c.*86G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	3178858	3178858	T	C	UTR3	PFKP	NM_002627:c.*87T>C,NM_001242339:c.*87T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	31791254	31791254	T	G	intronic	ZEB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr10	31799560	31799560	T	T	intronic	ZEB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	3180227	3180227	T	C	exonic	PITRM1	NaN	nonsynonymous SNV	PITRM1:NM_001242309:exon24:c.A2816G:p.Q939R,PITRM1:NM_001242307:exon27:c.A3113G:p.Q1038R,PITRM1:NM_014889:exon27:c.A3110G:p.Q1037R	rs6901	NaN	0.704273	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	.	.	3.88	T	-0.977	T	0.000	T	0.112	-0.504	1.692	0.73	-0.351	0.767	9.666	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	220.464455	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	73	0	73	54
chr10	3181062	3181062	T	T	intronic	PITRM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr10	3183076	3183076	A	A	intronic	PITRM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	3186458	3186458	C	G	ncRNA_intronic	PITRM1-AS1	NaN	NaN	NaN	rs3752803	NaN	0.581869	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	67.13835	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	17	35	48
chr10	3190166	3190166	C	A	ncRNA_exonic	PITRM1-AS1	NaN	NaN	NaN	rs59486411	NaN	0.128195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.349339	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	34	6	12
chr10	3190262	3190262	CAAA	CAA,CAAG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	288.898	0	NaN	NA	NA	39	3	8	4
chr10	3199391	3199391	T	T	intronic	PITRM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	3199392	3199392	G	G	intronic	PITRM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	3199394	3199394	A	A	intronic	PITRM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	3199395	3199395	A	A	intronic	PITRM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	3199396	3199396	T	T	intronic	PITRM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	3206027	3206027	A	G	exonic	PITRM1	NaN	synonymous SNV	PITRM1:NM_001242309:exon6:c.T585C:p.P195P,PITRM1:NM_001242307:exon7:c.T681C:p.P227P,PITRM1:NM_014889:exon7:c.T681C:p.P227P	rs4609511	NaN	0.624201	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	124.301715	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	1	49	55
chr10	3207638	3207638	G	A	exonic	PITRM1	NaN	nonsynonymous SNV	PITRM1:NM_001242309:exon4:c.C404T:p.T135I,PITRM1:NM_001242307:exon5:c.C500T:p.T167I,PITRM1:NM_014889:exon5:c.C500T:p.T167I	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.307	B	0.424	B	0.001	N	1.000	N	0.62	N	1.76	T	-1.016	T	0.059	T	0.293	2.355	13.83	3.17	1.274	3.842	10.439	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.905548	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	329	314	15	0
chr10	3207807	3207807	A	A	intronic	PITRM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr10	3208536	3208536	A	G	exonic	PITRM1	NaN	synonymous SNV	PITRM1:NM_001242309:exon3:c.T207C:p.G69G,PITRM1:NM_001242307:exon4:c.T303C:p.G101G,PITRM1:NM_014889:exon4:c.T303C:p.G101G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.15919732441471526	NA	0	0	5.97921	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	20	16	4	0
chr10	3208557	3208557	A	G	exonic	PITRM1	NaN	synonymous SNV	PITRM1:NM_001242309:exon3:c.T186C:p.T62T,PITRM1:NM_001242307:exon4:c.T282C:p.T94T,PITRM1:NM_014889:exon4:c.T282C:p.T94T	rs12359035	NaN	0.639577	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.243645	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	0	17	46
chr10	3208583	3208583	A	C	intronic	PITRM1	NaN	NaN	NaN	rs4242748	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	140.382	0	19.278445	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	1	9	16
chr10	32096803	32096803	G	C	intronic	ARHGAP12	NaN	NaN	NaN	rs1412493	NaN	0.291733	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.569987	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	58	43	15	26
chr10	32307614	32307614	T	G	intronic	KIF5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.630691	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	36	30	6	0
chr10	32307615	32307615	G	T	intronic	KIF5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.43175	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	36	30	6	0
chr10	32311304	32311304	T	A	intronic	KIF5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.401677	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	180	168	12	0
chr10	32325023	32325023	A	G	intronic	KIF5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.839393	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	168	160	8	0
chr10	32337529	32337529	A	C	intronic	KIF5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr10	32575793	32575793	A	G	intronic	EPC1	NaN	NaN	NaN	rs2986931	NaN	0.59405	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	130.734869	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	0	48	48
chr10	32581398	32581398	T	C	intronic	EPC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr10	32582471	32582471	T	C	intronic	EPC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	32594612	32594612	A	C	intronic	EPC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.536066	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	47	41	6	0
chr10	32594938	32594938	T	A	intronic	EPC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	74	NaN	NA	NA	68	64	4	0
chr10	3271251	3271251	A	A	intergenic	PITRM1,KLF6	dist=56218;dist=546937	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	32742258	32742258	T	A	intronic	CCDC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.004158004158004074	NA	0	0	NaN	NA	NA	20	13	7	0
chr10	32832286	32832286	A	A	exonic	CCDC7	NaN	synonymous SNV	CCDC7:NM_001026383:exon13:c.A1052A:p.D351D,CCDC7:NM_145023:exon13:c.A1052A:p.D351D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	32	26	0	0
chr10	32833108	32833108	T	A	intronic	CCDC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr10	329188	329188	G	T	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	rs45445697	NaN	0.238818	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	97	NaN	NA	NA	149	3	146	16
chr10	33134533	33134533	A	G	exonic	CCDC7	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC7:NM_024688:exon15:c.A1228G:p.T410A	NaN	NaN	NaN	0.51	T	0.007	B	0.018	B	.	.	1.000	N	0.61	N	1.68	T	-0.990	T	0.037	T	0.044	-1.548	0.015	0.724	0.194	-0.258	3.818	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.085038	nearby_gap_events	REJECT	137	130	7	0
chr10	33421685	33421685	T	A	intergenic	ITGB1,NRP1	dist=174392;dist=44734	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr10	33469062	33469062	T	C	exonic	NRP1	NaN	nonsynonymous SNV	NRP1:NM_001244972:exon17:c.A2696G:p.D899G,NRP1:NM_001244973:exon17:c.A2693G:p.D898G,NRP1:NM_003873:exon17:c.A2714G:p.D905G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	1.1	L	-3.07	D	1.027	D	0.896	D	0.948	4.285	22.4	5.57	2.121	7.698	15.740	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.510918	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	30	26	4	0
chr10	33469181	33469181	A	G	exonic	NRP1	NaN	synonymous SNV	NRP1:NM_001244972:exon17:c.T2577C:p.S859S,NRP1:NM_001244973:exon17:c.T2574C:p.S858S,NRP1:NM_003873:exon17:c.T2595C:p.S865S	rs1048804	ID=COSM146924;OCCURENCE=1(stomach)	0.424321	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	159.422563	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	90	26	64	28
chr10	33469332	33469332	A	A	intronic	NRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	33496686	33496686	A	C	intronic	NRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.832347	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	162	136	26	0
chr10	33496687	33496687	A	C	intronic	NRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	139	64	75	7
chr10	33496688	33496688	C	C	intronic	NRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	62	47	0	0
chr10	33510663	33510663	G	A	exonic	NRP1	NaN	synonymous SNV	NRP1:NM_001024628:exon8:c.C1266T:p.Y422Y,NRP1:NM_001024629:exon8:c.C1266T:p.Y422Y,NRP1:NM_001244972:exon8:c.C1266T:p.Y422Y,NRP1:NM_001244973:exon8:c.C1266T:p.Y422Y,NRP1:NM_003873:exon8:c.C1266T:p.Y422Y	rs2229935	NaN	0.359026	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	332.190999	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	111	0	111	36
chr10	33510769	33510769	G	A	exonic	NRP1	NaN	nonsynonymous SNV	NRP1:NM_001024628:exon8:c.C1160T:p.P387L,NRP1:NM_001024629:exon8:c.C1160T:p.P387L,NRP1:NM_001244972:exon8:c.C1160T:p.P387L,NRP1:NM_001244973:exon8:c.C1160T:p.P387L,NRP1:NM_003873:exon8:c.C1160T:p.P387L	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.98	D	0.000	D	1.000	D	1.775	L	-4.76	D	1.099	D	0.956	D	0.868	4.967	29.0	5.87	2.941	9.412	20.583	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	96	56	40	0
chr10	33646736	33646736	C	T	intergenic	NRP1,LINC00838	dist=22903;dist=401905	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	34666864	34666864	C	T	intronic	PARD3	NaN	NaN	NaN	rs10740890	ID=COSN163607;OCCURENCE=1(breast)	0.611621	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	217	50	167	39
chr10	34671930	34671930	A	G	intronic	PARD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr10	34688287	34688287	G	A	exonic	PARD3	NaN	synonymous SNV	PARD3:NM_001184790:exon6:c.C729T:p.H243H,PARD3:NM_001184791:exon6:c.C729T:p.H243H,PARD3:NM_001184785:exon7:c.C861T:p.H287H,PARD3:NM_001184786:exon7:c.C861T:p.H287H,PARD3:NM_001184787:exon7:c.C861T:p.H287H,PARD3:NM_001184788:exon7:c.C861T:p.H287H,PARD3:NM_001184789:exon7:c.C861T:p.H287H,PARD3:NM_001184792:exon7:c.C861T:p.H287H,PARD3:NM_001184793:exon7:c.C861T:p.H287H,PARD3:NM_001184794:exon7:c.C861T:p.H287H,PARD3:NM_019619:exon7:c.C861T:p.H287H	rs2796011	NaN	0.9998	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	109.069	0	33.433549	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	34
chr10	35456554	35456554	T	A	UTR5	CREM	NM_001267565:c.-100T>A,NM_001267564:c.-100T>A,NM_182772:c.-100T>A,NM_182771:c.-100T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr10	35477351	35477351	T	A	intronic	CREM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	18	12	6	0
chr10	35477357	35477357	T	G	intronic	CREM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	17	11	5	0
chr10	35477358	35477358	T	G	intronic	CREM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	17	11	5	0
chr10	355939	355939	A	G	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.441727	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	126	118	8	0
chr10	355947	355947	A	G	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.198875	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	133	113	20	0
chr10	35818891	35818891	T	T	intronic	CCNY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	35897225	35897225	G	G	exonic	GJD4	NaN	synonymous SNV	GJD4:NM_153368:exon2:c.G784G:p.A262A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr10	35897260	35897260	G	A	exonic	GJD4	NaN	synonymous SNV	GJD4:NM_153368:exon2:c.G819A:p.E273E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	15	7.148908	normal_lod	REJECT	4	1	3	0
chr10	35928224	35928224	C	G	UTR3	FZD8	NM_031866:c.*49G>C	NaN	NaN	rs625858	NaN	0.89976	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.930097	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	43
chr10	373161	373161	G	T	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr10	373163	373163	T	G	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	37346655	37346655	T	T	intergenic	LINC01452,ANKRD30A	dist=1256807;dist=68130	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	37346662	37346662	T	T	intergenic	LINC01452,ANKRD30A	dist=1256814;dist=68123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	37441072	37441072	T	G	intronic	ANKRD30A	NaN	NaN	NaN	rs1148257	NaN	0.32528	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	58	17	41	36
chr10	37441101	37441101	A	C	intronic	ANKRD30A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.321186	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	70	65	5	1
chr10	37490017	37490017	T	A	intronic	ANKRD30A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.17142857142857418	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr10	37505099	37505099	C	A	intronic	ANKRD30A	NaN	NaN	NaN	rs34285151	NaN	0.230431	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	94.329369	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	146	103	43	22
chr10	375493	375493	T	A	exonic	DIP2C	NaN	nonsynonymous SNV	DIP2C:NM_014974:exon30:c.A3633T:p.E1211D	NaN	NaN	NaN	0.32	T	0.704	P	0.6	P	0.000	D	1.000	D	1.955	M	2.85	T	-0.538	T	0.290	T	0.702	3.059	16.21	-1.86	-0.079	0.059	15.186	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.613295	nearby_gap_events	REJECT	109	103	6	0
chr10	38120621	38120621	C	G	exonic	ZNF248	NaN	synonymous SNV	ZNF248:NM_001267597:exon6:c.G1662C:p.G554G,ZNF248:NM_021045:exon6:c.G1662C:p.G554G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.818601	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	47	41	6	0
chr10	3822236	3822236	C	G	intronic	KLF6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	38343189	38343189	T	T	intronic	ZNF33A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	38343604	38343604	A	G	exonic	ZNF33A	NaN	synonymous SNV	ZNF33A:NM_001278170:exon4:c.A570G:p.E190E,ZNF33A:NM_001278177:exon5:c.A615G:p.E205E,ZNF33A:NM_001278178:exon5:c.A216G:p.E72E,ZNF33A:NM_006954:exon5:c.A552G:p.E184E,ZNF33A:NM_006974:exon5:c.A549G:p.E183E,ZNF33A:NM_001278171:exon6:c.A216G:p.E72E,ZNF33A:NM_001278173:exon6:c.A606G:p.E202E,ZNF33A:NM_001278174:exon6:c.A216G:p.E72E,ZNF33A:NM_001278175:exon6:c.A318G:p.E106E,ZNF33A:NM_001278176:exon6:c.A423G:p.E141E,ZNF33A:NM_001278179:exon6:c.A216G:p.E72E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.86747	poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	37	32	5	0
chr10	38345542	38345542	A	A	UTR3	ZNF33A	NM_001278175:c.*54A>A,NM_001278174:c.*54A>A,NM_001278173:c.*54A>A,NM_001278171:c.*54A>A,NM_006954:c.*54A>A,NM_001278177:c.*54A>A,NM_001278176:c.*54A>A,NM_001278170:c.*54A>A,NM_006974:c.*54A>A,NM_001278179:c.*54A>A,NM_001278178:c.*54A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	38404306	38404306	G	A	intronic	ZNF37A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	38897671	38897671	C	T	intergenic	LINC00999,ACTR3BP5	dist=156590;dist=92056	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	794	86	695	0
chr10	38897673	38897673	A	G	intergenic	LINC00999,ACTR3BP5	dist=156592;dist=92054	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	785	84	687	0
chr10	38897674	38897674	G	T	intergenic	LINC00999,ACTR3BP5	dist=156593;dist=92053	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	793	98	691	0
chr10	38897692	38897692	C	T	intergenic	LINC00999,ACTR3BP5	dist=156611;dist=92035	NaN	NaN	rs373096694	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	780	86	692	0
chr10	38897697	38897697	C	T	intergenic	LINC00999,ACTR3BP5	dist=156616;dist=92030	NaN	NaN	rs112170342	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	787	123	662	0
chr10	412391	412391	G	C	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.875531	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	170	160	10	0
chr10	415553	415553	T	G	exonic	DIP2C	NaN	nonsynonymous SNV	DIP2C:NM_014974:exon18:c.A2012C:p.Q671P	NaN	NaN	NaN	0.77	T	0.0	B	0.001	B	0.010	N	1.000	N	-1.6	N	2.88	T	-1.043	T	0.020	T	0.494	-1.298	0.038	5.09	2.044	3.391	10.432	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.43511	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	74	67	7	0
chr10	431110	431110	C	T	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	rs10904085	NaN	0.247804	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	43291757	43291757	T	T	intronic	BMS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	15	11	0	0
chr10	43292310	43292310	T	C	exonic	BMS1	NaN	nonsynonymous SNV	BMS1:NM_014753:exon10:c.T1618C:p.S540P	NaN	NaN	NaN	0.28	T	0.001	B	0.001	B	0.087	N	1.000	N	0.69	N	1.72	T	-1.043	T	0.040	T	0.088	-0.851	0.547	-1.5	-0.292	0.738	4.446	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.519068	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	110	104	6	0
chr10	43292647	43292647	A	G	exonic	BMS1	NaN	nonsynonymous SNV	BMS1:NM_014753:exon10:c.A1955G:p.K652R	rs787795	NaN	0.180511	0.48	T	0.001	B	0.001	B	0.115	N	1.000	P	1.1	L	1.73	T	-0.998	T	0.000	T	0.012	0.909	8.696	2.61	0.851	1.212	7.514	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	460.839	0	150.694519	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	113	37	76	18
chr10	43312806	43312806	C	A	exonic	BMS1	NaN	nonsynonymous SNV	BMS1:NM_014753:exon15:c.C2444A:p.P815H	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.602	P	0.526	P	0.668	N	1.000	N	0	N	3.11	T	-0.898	T	0.020	T	0.168	0.797	8.194	-0.014	0.017	0.659	8.950	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.403723	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	30	26	4	0
chr10	43367568	43367568	A	G	intergenic	BMS1,LINC01264	dist=37183;dist=106897	NaN	NaN	rs788243	NaN	0.432708	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr10	43524202	43524202	A	G	intergenic	MIR5100,RET	dist=31073;dist=48315	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	9	1	8	0
chr10	43582273	43582273	A	C	intronic	RET	NaN	NaN	NaN	rs2506004	NaN	0.742612	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr10	43598146	43598146	A	A	intronic	RET	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	43606591	43606591	T	T	intronic	RET	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	43606687	43606687	A	G	exonic	RET	NaN	synonymous SNV	RET:NM_020630:exon7:c.A1296G:p.A432A,RET:NM_020975:exon7:c.A1296G:p.A432A	rs1800860	NaN	0.77516	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	197.070719	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	0	72	54
chr10	43607759	43607759	GC	G,GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	165.974	0	NaN	NA	NA	35	8	24	30
chr10	43622049	43622049	T	C	exonic	RET	NaN	synonymous SNV	RET:NM_020630:exon19:c.T3066C:p.T1022T,RET:NM_020975:exon19:c.T3066C:p.T1022T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.029127	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	35	31	4	0
chr10	436327	436327	A	A	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	43662298	43662298	T	C	intronic	CSGALNACT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.910999	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	30	27	3	0
chr10	43671378	43671378	GTTTT	GTTTC,GTT,GTTT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	234.429	0	NaN	NA	NA	61	0	3	1
chr10	43671384	43671384	T	C	intronic	CSGALNACT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.924115	nearby_gap_events	REJECT	65	59	6	0
chr10	436829	436829	A	A	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	43691849	43691849	A	A	intronic	RASGEF1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	43692385	43692385	T	T	intronic	RASGEF1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	43694524	43694524	G	G	intronic	RASGEF1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	18	18	0	0
chr10	43696279	43696279	A	G	exonic	RASGEF1A	NaN	synonymous SNV	RASGEF1A:NM_001282862:exon5:c.T541C:p.L181L,RASGEF1A:NM_145313:exon5:c.T517C:p.L173L	rs41301585	ID=COSM118743;OCCURENCE=1(ovary)	0.08127	.	.	.	.	.	.	0.000	D	0.000	P	.	.	.	.	-1.018	T	0.006	T	.	1.308	10.29	5.18	1.191	3.180	13.949	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	70	NaN	NA	NA	159	124	35	7
chr10	43698980	43698980	C	G	intronic	RASGEF1A	NaN	NaN	NaN	rs1254961	NaN	0.611621	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	17	11.081018	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	30	9	43
chr10	43882430	43882430	G	A	exonic	HNRNPF	NaN	synonymous SNV	HNRNPF:NM_001098208:exon3:c.C903T:p.T301T,HNRNPF:NM_001098204:exon4:c.C903T:p.T301T,HNRNPF:NM_001098205:exon4:c.C903T:p.T301T,HNRNPF:NM_001098206:exon4:c.C903T:p.T301T,HNRNPF:NM_001098207:exon4:c.C903T:p.T301T,HNRNPF:NM_004966:exon4:c.C903T:p.T301T	rs151043426	NaN	0.00179712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	104.482855	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	135	88	47	1
chr10	44053225	44053225	G	GT	exonic	ZNF239	NaN	frameshift substitution	ZNF239:NM_001099283:exon2:c.303_303delinsAC,ZNF239:NM_005674:exon2:c.303_303delinsAC,ZNF239:NM_001099284:exon3:c.303_303delinsAC,ZNF239:NM_001099282:exon4:c.303_303delinsAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.31303	0	NaN	NA	NA	34	29	7	0
chr10	445174	445174	A	T	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr10	445179	445179	G	A	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	rs113528962	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr10	445181	445181	G	C	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr10	445183	445183	C	G	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr10	44669226	44669226	A	T	intergenic	LINC00841,C10orf142	dist=203871;dist=118972	NaN	NaN	rs11238890	NaN	0.110224	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	44755104	44755104	A	G	intergenic	LINC00841,C10orf142	dist=289749;dist=33094	NaN	NaN	rs579058	NaN	0.332468	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	44757626	44757626	G	T	intergenic	LINC00841,C10orf142	dist=292271;dist=30572	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	44757627	44757627	A	C	intergenic	LINC00841,C10orf142	dist=292272;dist=30571	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	44777560	44777560	G	C	intergenic	LINC00841,C10orf142	dist=312205;dist=10638	NaN	NaN	rs1657346	NaN	0.127396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	2	8	0
chr10	44840813	44840813	C	A	intergenic	C10orf142,CXCL12	dist=50716;dist=24788	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	0	9	0
chr10	44868856	44868856	A	C	intronic	CXCL12	NaN	NaN	NaN	rs266091	NaN	0.834265	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.519593	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	33	12	58
chr10	44868864	44868864	C	T	intronic	CXCL12	NaN	NaN	NaN	rs266090	NaN	0.0335463	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.055079	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	33	10	5
chr10	44871324	44871324	T	G	UTR3	CXCL12	NM_001033886:c.*63A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	44871438	44871438	T	C	exonic	CXCL12	NaN	synonymous SNV	CXCL12:NM_001033886:exon4:c.A309G:p.G103G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	78	NaN	NA	NA	38	34	4	8
chr10	44871440	44871440	C	T	exonic	CXCL12	NaN	nonsynonymous SNV	CXCL12:NM_001033886:exon4:c.G307A:p.G103R	NaN	NaN	NaN	0.92	T	1.0	D	0.999	D	.	.	1.000	D	.	.	1.95	T	-1.117	T	0.086	T	0.399	2.871	15.57	5.85	2.773	3.549	15.663	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	102	NaN	NA	NA	59	53	6	0
chr10	44871450	44871450	T	C	exonic	CXCL12	NaN	synonymous SNV	CXCL12:NM_001033886:exon4:c.A297G:p.K99K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.26960784313725505	NA	0	0	NaN	NA	NA	12	9	3	0
chr10	45284740	45284740	G	C	intergenic	CXCL12,TMEM72-AS1	dist=404195;dist=21732	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	45389980	45389980	A	A	ncRNA_intronic	TMEM72-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	45407061	45407061	T	G	ncRNA_intronic	TMEM72-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.25197	nearby_gap_events	REJECT	81	72	9	0
chr10	45423532	45423532	A	A	ncRNA_intronic	TMEM72-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	45448377	45448377	C	T	ncRNA_intronic	TMEM72-AS1	NaN	NaN	NaN	rs10793571	NaN	0.285543	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	45448438	45448438	C	T	ncRNA_intronic	TMEM72-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	45465784	45465784	A	A	intronic	RASSF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	45467051	45467051	T	C	intronic	RASSF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.03	D	.	.	.	.	0.001	N	1.000	N	.	.	.	.	-1.030	T	0.070	T	.	0.719	7.827	-0.529	-0.082	-0.030	0.713	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	14	6	8	0
chr10	45467488	45467488	A	A	intronic	RASSF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	45473044	45473044	C	G	exonic	C10orf10	NaN	nonsynonymous SNV	C10orf10:NM_007021:exon2:c.G435C:p.M145I	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.0	B	0.0	B	0.982	N	1.000	N	0	N	1.0	T	-0.988	T	0.039	T	0.11	1.066	9.354	-2.26	-0.352	-0.343	9.382	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	18	13	5	0
chr10	45473045	45473045	A	A	exonic	C10orf10	NaN	synonymous SNV	C10orf10:NM_007021:exon2:c.T434T:p.M145M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	75	64	0	0
chr10	45478092	45478092	A	G	exonic	RASSF4	NaN	nonsynonymous SNV	RASSF4:NM_032023:exon4:c.A262G:p.R88G	rs870957	NaN	0.280751	0.4	T	0.0	B	0.0	B	0.346	N	1.000	P	-1.32	N	2.56	T	-0.914	T	0.000	T	0.428	-1.362	0.027	1.39	0.069	0.681	5.042	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	66.1913	0	NaN	NA	NA	141	108	33	17
chr10	45478167	45478167	A	G	intronic	RASSF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	14	5	9	0
chr10	45479434	45479434	G	A	intronic	RASSF4	NaN	NaN	NaN	rs871043	NaN	0.273363	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	22.2623	0	NaN	NA	NA	35	26	9	17
chr10	45694201	45694201	G	T	intergenic	ANKRD30BP3,OR13A1	dist=12712;dist=103901	NaN	NaN	rs10793600	NaN	0.531949	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	45936783	45936783	C	T	intronic	ALOX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.378812	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	88	82	6	0
chr10	45938935	45938935	A	G	exonic	ALOX5	NaN	nonsynonymous SNV	ALOX5:NM_000698:exon11:c.A1523G:p.D508G,ALOX5:NM_001256153:exon11:c.A1427G:p.D476G,ALOX5:NM_001256154:exon11:c.A1523G:p.D508G	NaN	NaN	NaN	0.13	T	0.202	B	0.199	B	0.000	D	0.972	D	0.49	N	-2.54	D	-0.246	T	0.482	T	0.525	3.236	16.85	4.29	1.051	3.528	9.697	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5597	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr10	45939136	45939136	T	C	intronic	ALOX5	NaN	NaN	NaN	rs7900977	NaN	0.786542	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.126805	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	22
chr10	45954498	45954498	C	G	intronic	MARCH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	11	6	3	0
chr10	45959613	45959613	T	T	intronic	MARCH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	46159199	46159199	A	T	UTR5	ZFAND4	NM_001128324:c.-26T>A,NM_174890:c.-26T>A,NM_001282906:c.-10730T>A,NM_001282905:c.-10730T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	46261189	46261189	A	G	exonic	FAM21C	NaN	synonymous SNV	FAM21C:NM_001169107:exon18:c.A1728G:p.E576E,FAM21C:NM_001169106:exon19:c.A1800G:p.E600E,FAM21C:NM_015262:exon19:c.A1800G:p.E600E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.50656	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	87	82	5	0
chr10	468748	468748	C	T	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	rs4881290	NaN	0.980631	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	70.738836	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	0	23	58
chr10	46961964	46961964	G	A	UTR3	SYT15	NM_031912:c.*6C>T	NaN	NaN	rs9422211	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	36.4877	0	NaN	NA	NA	71	53	18	16
chr10	46965943	46965943	G	C	intronic	SYT15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	46966903	46966903	C	T	intronic	SYT15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr10	46967672	46967672	C	T	exonic	SYT15	NaN	synonymous SNV	SYT15:NM_031912:exon4:c.G405A:p.P135P,SYT15:NM_181519:exon4:c.G405A:p.P135P	rs2152530	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1706.79	0	NaN	NA	NA	345	89	256	46
chr10	46967855	46967855	C	G	intronic	SYT15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.432011	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	353	315	38	0
chr10	46967909	46967909	A	A	intronic	SYT15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr10	46993499	46993499	T	C	upstream	GPRIN2	NaN	NaN	NaN	rs3127806	NaN	0.865415	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	2	7	0
chr10	46993508	46993508	A	C	upstream	GPRIN2	NaN	NaN	NaN	rs3127807	NaN	0.865415	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	11	2	9	0
chr10	46994321	46994321	G	G	intronic	GPRIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr10	46997347	46997347	C	A	intronic	GPRIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	46997530	46997530	T	C	intronic	GPRIN2	NaN	NaN	NaN	rs3127813	NaN	0.861621	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	46999732	46999732	G	A	exonic	GPRIN2	NaN	synonymous SNV	GPRIN2:NM_014696:exon3:c.G852A:p.G284G	rs4579877	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	174.757	0	NaN	NA	NA	366	258	108	48
chr10	46999922	46999922	G	T	exonic	GPRIN2	NaN	nonsynonymous SNV	GPRIN2:NM_014696:exon3:c.G1042T:p.V348L	rs4926046	ID=COSM1347901;OCCURENCE=1(large_intestine)	NaN	0	D	0.999	D	0.994	D	0.002	N	1.000	D	2.36	M	1.51	T	-0.888	T	0.000	T	0.589	4.034	20.7	4.85	2.415	4.918	15.832	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.43578	0	NaN	NA	NA	112	95	15	34
chr10	47008580	47008580	G	A	intergenic	GPRIN2,NPY4R	dist=8012;dist=74954	NaN	NaN	rs3127854	NaN	0.749201	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr10	47046429	47046429	A	G	intergenic	GPRIN2,NPY4R	dist=45861;dist=37105	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	47086753	47086753	T	A	UTR5	LOC100996758,NPY4R	NM_001278795:c.-31T>A;NM_005972:c.-31T>A,NM_001278794:c.-31T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	5	3	0
chr10	47087819	47087819	C	T	exonic	LOC100996758,NPY4R	NaN	synonymous SNV	LOC100996758:NM_001278795:exon1:c.C1036T:p.L346L,NPY4R:NM_001278794:exon2:c.C1036T:p.L346L,NPY4R:NM_005972:exon3:c.C1036T:p.L346L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	639	560	79	0
chr10	47087820	47087820	T	C	exonic	LOC100996758,NPY4R	NaN	nonsynonymous SNV	LOC100996758:NM_001278795:exon1:c.T1037C:p.L346P,NPY4R:NM_001278794:exon2:c.T1037C:p.L346P,NPY4R:NM_005972:exon3:c.T1037C:p.L346P	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.0	B	0.001	B	0.649	N	0.741	N	-0.895	N	1.23	T	-1.051	T	0.023	T	0.065	-0.744	0.834	-6.78	-0.981	-1.001	0.788	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	1391	1317	74	0
chr10	47105261	47105261	C	G	ncRNA_intronic	LINC00842	NaN	NaN	NaN	rs28556316	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	47915852	47915852	CA	AT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.4375	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr10	47915898	47915898	A	G	intergenic	ANXA8L1,CTSLP2	dist=152858;dist=240045	NaN	NaN	rs61856727	ID=COSM146931;OCCURENCE=1(stomach)	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	90.8983	0	NaN	NA	NA	79	0	79	4
chr10	48357855	48357855	C	T	intronic	ZNF488	NaN	NaN	NaN	rs67517381	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	48357878	48357878	G	A	intronic	ZNF488	NaN	NaN	NaN	rs72792016	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	48370516	48370516	C	A	UTR5	ZNF488	NM_153034:c.-17C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.910104	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	59	40	19	0
chr10	48370524	48370524	G	G	UTR5	ZNF488	NM_153034:c.-9G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	67	40	0	0
chr10	48370800	48370800	C	G	exonic	ZNF488	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF488:NM_153034:exon2:c.C268G:p.P90A	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.001	B	0.244	N	1.000	N	-0.83	N	2.17	T	-0.936	T	0.027	T	0.19	-0.776	0.743	-6.55	-0.802	-1.263	10.583	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.13561253561253522	NA	0	0	NaN	NA	NA	17	13	4	0
chr10	48385859	48385859	A	G	exonic	RBP3	NaN	nonsynonymous SNV	RBP3:NM_002900:exon2:c.T3233C:p.I1078T	NaN	NaN	NaN	0	D	0.988	D	0.783	P	0.000	D	1.000	D	3.325	M	-1.02	T	0.502	D	0.638	D	0.801	3.307	17.11	5.14	2.065	8.773	14.42	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.408196	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	68	65	3	0
chr10	48438734	48438734	C	T	UTR5	GDF10	NM_004962:c.-24G>A	NaN	NaN	rs1126827	NaN	0.684904	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	103.076	0	30.915978	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	42
chr10	4881846	4881846	C	T	intronic	AKR1E2	NaN	NaN	NaN	rs34882719	NaN	0.0417332	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.037027	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	38	7	6
chr10	4884642	4884642	T	C	exonic	AKR1E2	NaN	synonymous SNV	AKR1E2:NM_001271025:exon5:c.T489C:p.N163N,AKR1E2:NM_001271021:exon6:c.T612C:p.N204N,AKR1E2:NM_001040177:exon8:c.T783C:p.N261N	rs12573669	NaN	0.0413339	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.61121	0	NaN	NA	NA	73	55	18	4
chr10	4885834	4885834	A	A	intronic	AKR1E2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	49401060	49401060	A	A	intronic	FRMPD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	49430309	49430309	T	G	intronic	FRMPD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	19	11	7	0
chr10	49431357	49431357	A	G	intronic	FRMPD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	18	6	12	0
chr10	49482483	49482483	G	G	intronic	FRMPD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	49617842	49617842	T	A	intronic	MAPK8	NaN	NaN	NaN	rs3730157	NaN	0.125599	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	330.298	0	NaN	NA	NA	50	24	26	2
chr10	49659084	49659084	C	G	exonic	ARHGAP22	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGAP22:NM_001256026:exon7:c.G818C:p.G273A,ARHGAP22:NM_001256024:exon9:c.G1136C:p.G379A,ARHGAP22:NM_001256025:exon9:c.G1106C:p.G369A,ARHGAP22:NM_021226:exon9:c.G1088C:p.G363A	NaN	NaN	NaN	0.3	T	0.473	P	0.084	B	0.322	N	1.000	N	1.43	L	2.92	T	-0.939	T	0.061	T	0.04	-0.228	2.900	-0.343	0.320	-0.125	16.087	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.004800049409819786	NA	0	0	NaN	NA	NA	54	40	14	0
chr10	49659144	49659144	C	T	exonic	ARHGAP22	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGAP22:NM_001256026:exon7:c.G758A:p.R253H,ARHGAP22:NM_001256024:exon9:c.G1076A:p.R359H,ARHGAP22:NM_001256025:exon9:c.G1046A:p.R349H,ARHGAP22:NM_021226:exon9:c.G1028A:p.R343H	NaN	NaN	NaN	0.2	T	0.196	B	0.033	B	0.000	N	0.844	N	0.445	N	2.77	T	-1.055	T	0.061	T	0.243	0.825	8.323	4.11	1.119	2.856	10.733	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.648654	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	260	254	6	0
chr10	49659239	49659239	G	T	intronic	ARHGAP22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	0.006	B	0.006	B	.	.	1.000	N	.	.	1.95	T	-0.976	T	0.023	T	0.151	2.135	13.10	-3.05	-0.694	-1.014	3.657	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.065077	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	250	240	10	0
chr10	49667936	49667936	T	C	splicing	ARHGAP22	NM_001256025:exon6:c.470-2A>G,NM_021226:exon6:c.452-2A>G,NM_001256026:exon4:c.182-2A>G,NM_001256024:exon6:c.500-2A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.717	18.88	4.9	2.074	7.778	13.860	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.118535	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	188	177	11	0
chr10	49835697	49835697	C	A	intronic	ARHGAP22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr10	49918031	49918031	A	A	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr10	49935792	49935792	A	A	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	49937566	49937566	A	G	exonic	WDFY4	NaN	nonsynonymous SNV	WDFY4:NM_020945:exon8:c.A1061G:p.E354G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.997	D	.	.	0.995	D	2.51	M	3.59	T	-0.374	T	0.318	T	0.96	4.751	26.6	5.76	2.324	6.907	14.103	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.9526	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	39	36	3	0
chr10	49939128	49939128	T	T	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	25	21	0	0
chr10	49984950	49984950	T	C	exonic	WDFY4	NaN	nonsynonymous SNV	WDFY4:NM_020945:exon16:c.T3019C:p.S1007P	NaN	NaN	NaN	.	.	0.998	D	0.905	P	.	.	1.000	D	1.39	L	0.93	T	-0.751	T	0.166	T	0.785	4.118	21.2	4.29	2.089	3.650	11.472	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.842147	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	98	89	9	0
chr10	49984951	49984951	C	T	exonic	WDFY4	NaN	nonsynonymous SNV	WDFY4:NM_020945:exon16:c.C3020T:p.S1007F	NaN	NaN	NaN	.	.	0.999	D	0.95	D	.	.	1.000	D	1.39	L	0.92	T	-0.880	T	0.200	T	0.815	4.863	27.8	5.49	2.586	7.446	18.346	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.155336	nearby_gap_events	REJECT	97	90	7	0
chr10	49988197	49988197	A	A	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	39	38	0	0
chr10	50013276	50013276	T	C	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	19	15	4	0
chr10	50013402	50013402	T	C	exonic	WDFY4	NaN	nonsynonymous SNV	WDFY4:NM_020945:exon26:c.T4582C:p.S1528P	rs2170132	NaN	0.576877	.	.	0.0	B	0.001	B	0.003	N	0.000	P	-0.205	N	0.53	T	-1.006	T	0.000	T	0.301	0.654	7.506	1.47	0.219	-0.165	4.150	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	125	102	23	35
chr10	50029088	50029088	T	T	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr10	50039024	50039024	A	C	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	15	3	12	0
chr10	50040809	50040809	A	A	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	50075461	50075461	G	A	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	rs2663019	NaN	0.517173	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.53995	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	69	50	19	31
chr10	50075473	50075473	A	A	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	50081439	50081439	T	T	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	63	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	50083111	50083111	T	T	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	20	18	0	0
chr10	50098739	50098739	G	C	exonic	WDFY4	NaN	nonsynonymous SNV	WDFY4:NM_020945:exon44:c.G7283C:p.G2428A	rs41283283	NaN	0.0311502	.	.	0.996	D	0.826	P	0.000	D	1.000	D	1.845	L	0.21	T	-1.036	T	0.019	T	0.265	3.039	16.14	4.83	2.373	3.689	13.775	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.456181	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	87	63	24	8
chr10	50121504	50121504	T	G	exonic	LRRC18	NaN	synonymous SNV	LRRC18:NM_001006939:exon1:c.A697C:p.R233R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.457945	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	173	165	8	0
chr10	5014542	5014542	T	G	intronic	AKR1C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.005586	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	122	114	8	0
chr10	5014543	5014543	G	T	intronic	AKR1C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.811405	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	120	112	8	0
chr10	50166253	50166253	T	C	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	50172175	50172175	A	A	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr10	50174556	50174556	T	T	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	50176975	50176975	C	A	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.857596	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	70	51	19	0
chr10	50176976	50176976	A	G	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.90963	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	71	49	22	0
chr10	50184874	50184874	G	A	exonic	WDFY4	NaN	synonymous SNV	WDFY4:NM_020945:exon59:c.G9141A:p.L3047L	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.805	T	0.215	T	.	1.721	11.71	3.8	1.341	0.397	8.643	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.494669	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	239	231	8	0
chr10	50186307	50186307	A	G	intronic	WDFY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.553362	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	25	22	3	0
chr10	50186415	50186415	C	T	exonic	WDFY4	NaN	nonsynonymous SNV	WDFY4:NM_020945:exon60:c.C9353T:p.P3118L	rs2292584	NaN	0.419129	.	.	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	0.345	N	0.52	T	-0.911	T	0.000	T	0.243	-0.796	0.687	-0.999	-0.062	-0.189	2.260	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	63.247256	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	2	22	46
chr10	50277698	50277698	G	C	intronic	VSTM4	NaN	NaN	NaN	rs12255090	NaN	0.394968	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr10	50315502	50315502	T	C	intronic	VSTM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	0	5	0
chr10	5032284	5032284	C	T	intronic	AKR1C2	NaN	NaN	NaN	rs12774733	NaN	0.116214	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.973502	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	1	29	27
chr10	50339675	50339675	G	A	exonic	FAM170B	NaN	stopgain	FAM170B:NM_001164484:exon2:c.C835T:p.Q279X	NaN	NaN	NaN	0.58	T	.	.	.	.	0.089	N	1.000	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.511	17.94	4.21	2.532	-0.283	10.105	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.301286	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	52	48	4	0
chr10	50339925	50339925	G	A	exonic	FAM170B	NaN	synonymous SNV	FAM170B:NM_001164484:exon2:c.C585T:p.D195D	rs12765281	NaN	0.245208	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.454063	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	14	6	28
chr10	50341954	50341954	A	G	exonic	FAM170B	NaN	nonsynonymous SNV	FAM170B:NM_001164484:exon1:c.T10C:p.Y4H	rs34110351	NaN	0.245208	1	T	0.0	B	0.0	B	0.849	N	1.000	P	-1.61	N	1.76	T	-0.935	T	0.000	T	0.009	-1.575	0.014	2.42	0.201	0.772	6.554	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	35.6672	0	NaN	NA	NA	49	32	17	28
chr10	50364064	50364064	G	G	UTR3	C10orf128	NM_001288743:c.*172C>C,NM_001288742:c.*131C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	50364067	50364067	A	A	UTR3	C10orf128	NM_001288743:c.*169T>T,NM_001288742:c.*128T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	50376004	50376004	A	G	exonic	C10orf128	NaN	nonsynonymous SNV	C10orf128:NM_001010863:exon2:c.T47C:p.V16A,C10orf128:NM_001288740:exon2:c.T47C:p.V16A,C10orf128:NM_001288741:exon2:c.T47C:p.V16A,C10orf128:NM_001288742:exon2:c.T47C:p.V16A,C10orf128:NM_001288743:exon2:c.T47C:p.V16A	rs61748312	NaN	0.0209665	0.02	D	0.093	B	0.018	B	.	.	1.000	N	0.695	N	0.75	T	-1.073	T	0.010	T	0.125	2.308	13.67	-1.04	-0.395	0.638	7.389	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	47.884988	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	15	22	8
chr10	50396249	50396249	T	T	intronic	C10orf128	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	50505210	50505210	A	G	ncRNA_intronic	C10orf71-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	56	10	46	0
chr10	50507615	50507615	G	C	intronic	C10orf71	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	50534593	50534593	T	A	exonic	C10orf71	NaN	nonsynonymous SNV	C10orf71:NM_001135196:exon3:c.T4003A:p.Y1335N	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	0.071	U	1.000	D	2.045	M	0.94	T	-0.689	T	0.214	T	0.376	3.517	17.96	5.42	2.061	3.073	15.456	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.352644	clustered_read_position	REJECT	30	24	6	0
chr10	50534862	50534862	T	C	exonic	C10orf71	NaN	synonymous SNV	C10orf71:NM_001135196:exon3:c.T4272C:p.D1424D	rs12411843	NaN	0.303714	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	58.341204	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	0	19	41
chr10	50574437	50574437	A	G	intronic	DRGX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.088705	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	104	93	11	0
chr10	50598128	50598128	A	G	intronic	DRGX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.31119	strand_artifact	REJECT	20	16	4	0
chr10	50599273	50599273	A	C	exonic	DRGX	NaN	nonsynonymous SNV	DRGX:NM_001276451:exon3:c.T69G:p.D23E	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.006	B	0.004	B	0.000	D	1.000	D	0	N	-3.75	D	-0.345	T	0.590	D	0.231	3.365	17.34	2.25	0.135	0.918	5.593	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.022683552101717904	NA	0	0	NaN	NA	NA	49	33	16	0
chr10	50678369	50678369	T	C	exonic	ERCC6	NaN	nonsynonymous SNV	ERCC6:NM_000124:exon18:c.A3637G:p.R1213G	rs2228527	NaN	0.184704	0.31	T	0.651	P	0.15	B	.	.	1.000	P	2.19	M	-1.48	T	-1.146	T	0.000	T	0.216	1.572	11.21	1.87	0.122	1.716	8.627	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	116.723623	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	81	28	53	22
chr10	50678396	50678396	G	T	exonic	ERCC6	NaN	nonsynonymous SNV	ERCC6:NM_000124:exon18:c.C3610A:p.Q1204K	NaN	NaN	NaN	0.96	T	0.049	B	0.026	B	.	.	1.000	N	1.95	M	-1.28	T	-0.767	T	0.378	T	0.15	0.854	8.453	3.58	0.771	1.462	6.252	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.685893	nearby_gap_events	REJECT	41	35	6	0
chr10	50681941	50681941	T	T	intronic	ERCC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	50708766	50708766	A	G	intronic	ERCC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	3	3	0
chr10	50713902	50713902	T	C	intronic	ERCC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	10	0	8	0
chr10	50723306	50723306	T	T	UTR3	ERCC6-PGBD3,PGBD3	NM_001277059:c.*73A>A,NM_001277058:c.*73A>A;NM_170753:c.*73A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	50736560	50736560	T	A	exonic	ERCC6,ERCC6-PGBD3	NaN	synonymous SNV	ERCC6:NM_000124:exon4:c.A555T:p.L185L,ERCC6-PGBD3:NM_001277058:exon4:c.A555T:p.L185L,ERCC6-PGBD3:NM_001277059:exon4:c.A555T:p.L185L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.17027863777089788	NA	0	0	NaN	NA	NA	11	8	3	0
chr10	50741083	50741083	A	G	intronic	ERCC6,ERCC6-PGBD3	NaN	NaN	NaN	rs1126112	NaN	0.047524	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.380883	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	10	4	7
chr10	50819486	50819486	A	C	exonic	SLC18A3	NaN	nonsynonymous SNV	SLC18A3:NM_003055:exon1:c.A700C:p.I234L	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.014	B	0.032	B	0.086	U	1.000	N	1.03	L	0.48	T	-1.060	T	0.085	T	0.17	2.129	13.08	-0.384	-0.362	0.839	2.585	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr10	50820589	50820589	G	T	UTR3	SLC18A3	NM_003055:c.*204G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	50887651	50887651	G	C	upstream	C10orf53	NaN	NaN	NaN	rs1153781	NaN	0.911941	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.091091	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	53
chr10	51032997	51032997	C	T	intronic	PARG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	9	0	9	0
chr10	5144599	5144599	T	C	intronic	AKR1C3	NaN	NaN	NaN	rs10904419	NaN	0.882188	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	34	5	29	0
chr10	5147733	5147733	T	T	intronic	AKR1C3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	5147769	5147769	G	T	intronic	AKR1C3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.627497	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	136	125	11	0
chr10	51623231	51623231	G	T	UTR5	TIMM23	NM_006327:c.-17C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.125442	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	33	29	4	0
chr10	51754148	51754148	T	A	intronic	AGAP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.14999999999999974	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr10	51779442	51779442	A	T	intergenic	AGAP6,FAM21EP	dist=9183;dist=1500	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	5199875	5199875	G	A	ncRNA_exonic	AKR1C8P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr10	52067722	52067722	T	C	intronic	SGMS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr10	52087095	52087095	A	G	intronic	SGMS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.626281	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	54	47	7	0
chr10	5242164	5242164	A	G	exonic	AKR1C4	NaN	synonymous SNV	AKR1C4:NM_001818:exon2:c.A105G:p.V35V	rs17306779	ID=COSM146867;OCCURENCE=1(stomach)	0.165136	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	188	137	51	23
chr10	52445688	52445688	T	G	intergenic	SGMS1-AS1,ASAH2B	dist=54292;dist=54000	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	5254730	5254730	A	A	intronic	AKR1C4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	17	13	0	0
chr10	5258850	5258850	G	A	intronic	AKR1C4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	5258852	5258852	C	T	intronic	AKR1C4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	5258853	5258853	C	T	intronic	AKR1C4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	5258855	5258855	G	A	intronic	AKR1C4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	52610375	52610375	T	T	intronic	A1CF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	38	32	0	0
chr10	52751361	52751361	C	T	exonic	PRKG1	NaN	nonsynonymous SNV	PRKG1:NM_001098512:exon1:c.C223T:p.H75Y	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.015	B	0.006	B	.	.	1.000	N	0.695	N	-0.26	T	-0.843	T	0.195	T	0.337	3.463	17.74	4.86	2.233	5.438	15.474	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.459609	nearby_gap_events	REJECT	103	97	6	0
chr10	52834829	52834829	G	C	intronic	PRKG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr10	53227654	53227654	G	T	intronic	PRKG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	53814383	53814383	C	T	intronic	PRKG1	NaN	NaN	NaN	rs12778630	NaN	0.333866	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	285	205	80	46
chr10	54074633	54074633	G	C	intronic	DKK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	12	6	5	0
chr10	54074634	54074634	G	A	intronic	DKK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	12	6	5	0
chr10	5416065	5416065	A	A	exonic	UCN3	NaN	synonymous SNV	UCN3:NM_053049:exon2:c.A382A:p.T128T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr10	54171514	54171514	T	T	intergenic	DKK1,LINC01468	dist=94097;dist=39123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	5436260	5436260	A	G	exonic	TUBAL3	NaN	synonymous SNV	TUBAL3:NM_001171864:exon4:c.T441C:p.A147A,TUBAL3:NM_024803:exon4:c.T561C:p.A187A	rs7910290	NaN	0.779153	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1445.27	0	NaN	NA	NA	104	0	104	43
chr10	5437454	5437454	G	C	intronic	TUBAL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr10	54528266	54528266	G	C	exonic	MBL2	NaN	synonymous SNV	MBL2:NM_000242:exon4:c.C378G:p.L126L	rs930507	ID=COSM1348195;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.738818	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	253.72138	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	87	1	86	54
chr10	5496526	5496526	A	G	intronic	NET1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr10	5496848	5496848	T	A	intronic	NET1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	5497213	5497213	A	A	intronic	NET1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr10	55588343	55588343	A	A	intronic	PCDH15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	55600285	55600285	C	G	intronic	PCDH15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr10	5567046	5567046	G	T	ncRNA_intronic	CALML3-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.226408	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	49	42	7	0
chr10	5569969	5569969	C	C	intergenic	CALML3,ASB13	dist=1738;dist=110851	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	55782453	55782453	T	T	intronic	PCDH15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	55782980	55782980	A	C	intronic	PCDH15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.510722	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	161	153	8	0
chr10	5588204	5588204	A	C	intergenic	CALML3,ASB13	dist=19973;dist=92616	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	55973589	55973589	C	T	intronic	PCDH15	NaN	NaN	NaN	rs10825279	NaN	0.360224	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.798356	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	15	16	48
chr10	55973889	55973889	G	A	intronic	PCDH15	NaN	NaN	NaN	rs10763086	NaN	0.560903	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.894498	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	17	9	49
chr10	56077209	56077209	G	A	intronic	PCDH15	NaN	NaN	NaN	rs10740579	NaN	0.603834	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	8.96528	33	NaN	NA	NA	51	45	6	46
chr10	5633799	5633799	G	T	intergenic	CALML3,ASB13	dist=65568;dist=47021	NaN	NaN	rs12766460	NaN	0.39357	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	5762987	5762987	T	G	intronic	FAM208B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.503178	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	94	84	10	0
chr10	5765622	5765622	T	T	intronic	FAM208B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	5773193	5773193	A	A	intronic	FAM208B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	5788689	5788689	C	T	exonic	FAM208B	NaN	nonsynonymous SNV	FAM208B:NM_017782:exon15:c.C3305T:p.A1102V	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.013	B	0.011	B	0.959	N	1.000	N	0.69	N	2.32	T	-0.954	T	0.026	T	0.079	-0.176	3.142	-0.741	-0.191	0.019	8.344	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.746515	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	250	244	6	0
chr10	5792058	5792058	A	A	intronic	FAM208B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	5803117	5803117	C	T	intronic	FAM208B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.219307	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	30	27	3	0
chr10	5808633	5808633	A	T	intronic	GDI2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr10	58118630	58118630	T	C	exonic	ZWINT	NaN	nonsynonymous SNV	ZWINT:NM_007057:exon6:c.A559G:p.R187G,ZWINT:NM_032997:exon6:c.A559G:p.R187G	rs2241666	NaN	0.761981	0.56	T	0.0	B	0.003	B	0.857	N	1.000	P	0.57	N	0.82	T	-0.980	T	0.000	T	0.03	-1.268	0.045	1.39	0.061	0.152	7.059	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	541.002	0	NaN	NA	NA	48	0	48	43
chr10	58121109	58121109	A	C	upstream	ZWINT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	58121112	58121112	A	T	upstream	ZWINT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	58121114	58121114	G	T	upstream	ZWINT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	58121116	58121116	A	G	upstream	ZWINT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	5837038	5837038	T	C	intronic	GDI2	NaN	NaN	NaN	rs10752110	NaN	0.444888	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	257.359942	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	83	0	83	49
chr10	5842431	5842431	T	T	intronic	GDI2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	5882818	5882818	G	T	intergenic	GDI2,ANKRD16	dist=27306;dist=20871	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	5882819	5882819	T	C	intergenic	GDI2,ANKRD16	dist=27307;dist=20870	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	5882823	5882823	G	T	intergenic	GDI2,ANKRD16	dist=27311;dist=20866	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	5882827	5882827	C	G	intergenic	GDI2,ANKRD16	dist=27315;dist=20862	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	5930092	5930092	A	C	intronic	ANKRD16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	18	12	6	0
chr10	5936578	5936578	A	A	intronic	FBXO18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr10	5965507	5965507	T	G	intronic	FBXO18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	38	28	10	0
chr10	5969555	5969555	A	A	intronic	FBXO18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	5994996	5994996	T	C	UTR3	IL15RA	NM_001243539:c.*62A>G,NM_002189:c.*62A>G,NM_172200:c.*62A>G,NM_001256765:c.*62A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr10	6001696	6001696	C	T	intronic	IL15RA	NaN	NaN	NaN	rs3136618	NaN	0.536941	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.906682	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	18	6	48
chr10	60123555	60123555	A	G	intronic	UBE2D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr10	60127639	60127639	G	T	intronic	UBE2D1	NaN	NaN	NaN	rs74377516	NaN	0.108027	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.007807	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	11	10	2
chr10	60127711	60127711	T	C	exonic	UBE2D1	NaN	synonymous SNV	UBE2D1:NM_001204880:exon5:c.T219C:p.C73C,UBE2D1:NM_003338:exon6:c.T333C:p.C111C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.269229	strand_artifact	REJECT	26	20	6	0
chr10	60544907	60544907	A	A	intronic	BICC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	60556298	60556298	A	A	intronic	BICC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr10	60559108	60559108	A	T	intronic	BICC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	60573787	60573787	A	A	intronic	BICC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	16	13	0	0
chr10	60577294	60577294	T	T	intronic	BICC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	6063397	6063397	T	G	intronic	IL2RA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	61005244	61005244	G	C	exonic	PHYHIPL	NaN	nonsynonymous SNV	PHYHIPL:NM_001143774:exon5:c.G946C:p.V316L,PHYHIPL:NM_032439:exon5:c.G1024C:p.V342L	rs2452505	NaN	0.739617	1	T	0.0	B	0.0	B	0.003	N	0.000	P	-1.61	N	1.32	T	-0.969	T	0.000	T	0.005	-0.625	1.226	5.56	1.359	1.542	10.076	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	25	13.508302	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	54	47	7	56
chr10	61062493	61062493	T	T	intronic	FAM13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	61412543	61412543	G	A	exonic	SLC16A9	NaN	nonsynonymous SNV	SLC16A9:NM_194298:exon6:c.C1517T:p.A506V	NaN	ID=COSM1702487;OCCURENCE=1(skin)	NaN	0.18	T	0.539	P	0.166	B	0.568	N	1.000	D	0.975	L	3.46	T	-0.912	T	0.021	T	0.354	3.829	19.44	5.57	2.603	8.215	19.533	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	32	19	13	0
chr10	6147077	6147077	A	G	intronic	RBM17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	61552692	61552692	G	T	exonic	CCDC6	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC6:NM_005436:exon9:c.C1408A:p.P470T	rs1053266	ID=COSM146940;OCCURENCE=1(stomach)	0.435304	0.02	D	0.998	D	0.987	D	0.030	N	0.000	P	1.39	L	0.54	T	-0.870	T	0.000	T	0.262	3.312	17.13	5.6	2.786	8.852	19.985	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	273.387	0	88.082823	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	0	29	36
chr10	61552774	61552774	C	T	exonic	CCDC6	NaN	synonymous SNV	CCDC6:NM_005436:exon9:c.G1326A:p.P442P	rs1053265	ID=COSM1348403;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.611621	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	66.9973	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	0	23	45
chr10	61552881	61552881	A	G	intronic	CCDC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	616026	616026	C	A	intronic	DIP2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	6182159	6182159	C	T	intergenic	RBM17,PFKFB3	dist=22737;dist=4684	NaN	NaN	rs12779809	NaN	0.028155	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	13	5	8	0
chr10	61845040	61845040	T	C	intronic	ANK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.184704		KEEP	73	68	5	0
chr10	61905685	61905685	T	T	intronic	ANK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	16	16	0	0
chr10	6246474	6246474	T	C	intronic	PFKFB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	62551889	62551889	A	G	intronic	CDK1	NaN	NaN	NaN	rs2456777	NaN	0.769768	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	730.11	0	NaN	NA	NA	58	0	58	0
chr10	6258009	6258009	G	C	intronic	PFKFB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.140475	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	130	123	7	0
chr10	6258722	6258722	T	G	exonic	PFKFB3	NaN	nonsynonymous SNV	PFKFB3:NM_001145443:exon5:c.T360G:p.F120L,PFKFB3:NM_001282630:exon5:c.T462G:p.F154L,PFKFB3:NM_004566:exon5:c.T420G:p.F140L	NaN	NaN	NaN	0.13	T	0.998	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	1.805	L	.	.	-0.658	T	0.287	T	0.827	3.700	18.80	2.22	0.457	1.027	8.822	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.003035175022896815	NA	0	0	NaN	NA	NA	62	46	16	0
chr10	6259206	6259206	A	A	intronic	PFKFB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	62652555	62652555	T	T	intronic	RHOBTB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr10	6265932	6265932	T	C	exonic	PFKFB3	NaN	nonsynonymous SNV	PFKFB3:NM_001145443:exon12:c.T1165C:p.Y389H,PFKFB3:NM_001282630:exon12:c.T1267C:p.Y423H,PFKFB3:NM_004566:exon12:c.T1225C:p.Y409H	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	2.215	M	.	.	-0.204	T	0.396	T	0.715	4.187	21.7	5.1	1.927	7.835	10.931	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.914473	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	155	147	8	0
chr10	6288042	6288042	A	G	intergenic	PFKFB3,LOC399715	dist=10535;dist=80465	NaN	NaN	rs10795936	NaN	0.748403	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	9	0	9	0
chr10	63196068	63196068	A	T	intronic	TMEM26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2569169960474291	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr10	63212629	63212629	C	T	ncRNA_exonic	TMEM26-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.008623	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	41	32	9	0
chr10	63760099	63760099	T	C	intronic	ARID5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.638688	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	168	148	20	0
chr10	64005686	64005686	T	T	intronic	RTKN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr10	64239669	64239669	A	G	UTR3	ZNF365	NM_199450:c.*14A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.90235	0	NaN	NA	NA	14	12	2	0
chr10	64415485	64415485	A	A	intronic	ZNF365	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	64564934	64564934	C	G	exonic	ADO	NaN	nonsynonymous SNV	ADO:NM_032804:exon1:c.C115G:p.P39A	rs10995311	NaN	0.245407	0.88	T	0.0	B	0.001	B	0.502	U	0.767	P	0.345	N	1.93	T	-0.951	T	0.000	T	0.036	1.286	10.20	0.214	0.131	1.377	3.960	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	23.6361	0	NaN	NA	NA	7	3	4	31
chr10	64573771	64573771	C	T	exonic	EGR2	NaN	synonymous SNV	EGR2:NM_000399:exon2:c.G627A:p.P209P,EGR2:NM_001136177:exon3:c.G627A:p.P209P,EGR2:NM_001136179:exon3:c.G477A:p.P159P,EGR2:NM_001136178:exon4:c.G627A:p.P209P	rs224083	NaN	0.986022	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	86.352233	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	0	30	53
chr10	64893116	64893116	G	T	UTR5	NRBF2	NM_001282405:c.-60G>T,NM_030759:c.-115G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.59931	clustered_read_position	REJECT	21	15	6	4
chr10	64927823	64927823	C	G	exonic	JMJD1C	NaN	nonsynonymous SNV	JMJD1C:NM_001282948:exon25:c.G7059C:p.E2353D,JMJD1C:NM_032776:exon26:c.G7605C:p.E2535D	rs1935	ID=COSM1128024,COSM1128022;OCCURENCE=1(prostate)	0.392173	0.14	T	0.355	B	0.057	B	0.000	D	0.000	P	1.245	L	0.83	T	-0.910	T	0.000	T	0.155	2.789	15.29	3.57	1.279	-0.006	5.196	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	57.493726	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	16	23	39
chr10	64945287	64945287	T	C	intronic	JMJD1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	18	4	14	0
chr10	64949290	64949290	A	A	intronic	JMJD1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	21	19	0	0
chr10	64967445	64967445	A	T	exonic	JMJD1C	NaN	synonymous SNV	JMJD1C:NM_001282948:exon9:c.T3438A:p.R1146R,JMJD1C:NM_032776:exon10:c.T3984A:p.R1328R	rs1904294	NaN	0.986821	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.026	T	0.000	T	.	0.297	5.609	0.898	-0.078	0.271	1.331	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	212.214342	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	71	0	71	57
chr10	64967655	64967655	T	C	exonic	JMJD1C	NaN	synonymous SNV	JMJD1C:NM_001282948:exon9:c.A3228G:p.K1076K,JMJD1C:NM_032776:exon10:c.A3774G:p.K1258K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.289496	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	111	106	5	0
chr10	64974248	64974248	T	T	exonic	JMJD1C	NaN	synonymous SNV	JMJD1C:NM_001282948:exon7:c.A1133A:p.D378D,JMJD1C:NM_032776:exon8:c.A1679A:p.D560D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	106	74	0	0
chr10	64974607	64974607	A	A	exonic	JMJD1C	NaN	synonymous SNV	JMJD1C:NM_001282948:exon7:c.T774T:p.D258D,JMJD1C:NM_032776:exon8:c.T1320T:p.D440D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	201	181	0	0
chr10	64975000	64975000	T	A	intronic	JMJD1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.897407	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	217	196	21	0
chr10	6498825	6498825	A	A	intronic	PRKCQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	8	0	0
chr10	6506210	6506210	A	G	intronic	PRKCQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.4672	0	NaN	NA	NA	159	131	24	4
chr10	6520844	6520844	T	T	intronic	PRKCQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	6606435	6606435	G	A	intronic	PRKCQ	NaN	NaN	NaN	rs943450	NaN	0.714856	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	6608733	6608733	G	G	intronic	PRKCQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	68686888	68686888	A	C	exonic	LRRTM3	NaN	nonsynonymous SNV	LRRTM3:NM_178011:exon2:c.A214C:p.S72R	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.982	D	0.906	P	0.000	D	1.000	D	-1.175	N	0.52	T	-0.777	T	0.108	T	0.815	2.905	15.68	5.53	2.112	9.339	14.651	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.795218	nearby_gap_events	REJECT	102	96	6	0
chr10	69299446	69299446	T	A	intronic	CTNNA3	NaN	NaN	NaN	rs1909654	NaN	0.195487	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.933226	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	12	36	13
chr10	69556829	69556829	T	A	UTR3	DNAJC12	NM_021800:c.*45A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	16	4	12	0
chr10	69565189	69565189	C	A	intronic	DNAJC12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	69597786	69597786	G	A	UTR5	DNAJC12	NM_021800:c.-17C>T,NM_201262:c.-17C>T	NaN	NaN	rs2273771	NaN	0.130192	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	68.000185	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	10	28	10
chr10	69648569	69648569	T	A	intronic	SIRT1	NaN	NaN	NaN	rs2236318	NaN	0.240615	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.527728	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	33	13	47
chr10	69773813	69773813	G	A	exonic	HERC4	NaN	nonsynonymous SNV	HERC4:NM_001278186:exon7:c.C274T:p.P92S,HERC4:NM_001278185:exon9:c.C1039T:p.P347S,HERC4:NM_015601:exon9:c.C1039T:p.P347S,HERC4:NM_022079:exon9:c.C1039T:p.P347S	NaN	NaN	NaN	1	T	0.655	P	0.194	B	0.001	N	1.000	D	0.69	N	-1.32	T	-0.746	T	0.203	T	0.271	-0.773	0.749	2.86	0.521	1.656	4.712	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.014482	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	24	21	3	0
chr10	69935059	69935059	A	G	intronic	MYPN	NaN	NaN	NaN	rs7097776	NaN	0.547524	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	236.923794	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	95	0	95	51
chr10	70044010	70044010	A	T	exonic	PBLD	NaN	nonsynonymous SNV	PBLD:NM_022129:exon10:c.T791A:p.I264N	NaN	NaN	NaN	0	D	0.858	P	0.83	P	0.006	N	1.000	D	2.15	M	1.44	T	-0.839	T	0.171	T	0.547	4.246	22.1	6.03	2.308	5.835	14.788	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	121	95	26	1
chr10	70045206	70045206	A	A	intronic	PBLD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	70051809	70051809	A	G	intronic	PBLD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.965849	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	150	142	8	0
chr10	70139096	70139096	T	T	intronic	RUFY2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	70140895	70140895	T	T	intronic	RUFY2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr10	70143774	70143774	C	T	intronic	RUFY2	NaN	NaN	NaN	rs7899885	NaN	0.663938	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	110.137428	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	0	42	54
chr10	70145721	70145721	T	G	intronic	RUFY2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr10	70145722	70145722	C	T	intronic	RUFY2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr10	70166646	70166646	C	G	UTR5	RUFY2	NM_017987:c.-27G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5343	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr10	70166913	70166913	T	G	UTR5	RUFY2	NM_017987:c.-294A>C	NaN	NaN	rs59831114	NaN	0.979233	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.428537	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	29
chr10	70192540	70192540	A	G	intronic	DNA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	70263503	70263503	A	A	intronic	SLC25A16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr10	70392239	70392239	T	T	intronic	TET1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	34	28	0	0
chr10	70392343	70392343	A	C	intronic	TET1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr10	70441028	70441028	T	T	intronic	TET1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	70451632	70451632	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	1	2,2	0
chr10	70521012	70521012	A	A	intronic	CCAR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr10	70546032	70546032	A	A	intronic	CCAR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr10	70550812	70550812	G	G	intronic	CCAR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	79	69	0	0
chr10	70641860	70641860	T	C	exonic	STOX1	NaN	nonsynonymous SNV	STOX1:NM_001130159:exon2:c.T457C:p.Y153H,STOX1:NM_001130160:exon2:c.T457C:p.Y153H,STOX1:NM_001130161:exon2:c.T457C:p.Y153H,STOX1:NM_152709:exon2:c.T457C:p.Y153H	rs1341667	NaN	0.61242	0.29	T	0.687	P	0.231	B	0.000	U	0.076	P	0.975	L	-1.03	T	-0.992	T	0.000	T	0.414	1.920	12.38	4.44	1.055	3.031	11.605	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	138.308	0	45.235326	normal_lod	REJECT	15	0	15	1
chr10	70661095	70661095	G	T	UTR5	DDX50	NM_024045:c.-46G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	70661096	70661096	G	C	UTR5	DDX50	NM_024045:c.-45G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	70670833	70670833	T	A	exonic	DDX50	NaN	nonsynonymous SNV	DDX50:NM_024045:exon4:c.T470A:p.V157E	NaN	NaN	NaN	0	D	0.993	D	0.954	D	0.000	D	1.000	D	0.975	L	2.09	T	-1.057	T	0.092	T	0.855	4.086	21.0	5.22	2.099	5.910	15.441	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	84	79	5	0
chr10	70670835	70670835	A	G	exonic	DDX50	NaN	nonsynonymous SNV	DDX50:NM_024045:exon4:c.A472G:p.T158A	NaN	NaN	NaN	0.23	T	0.23	B	0.074	B	0.000	D	0.936	D	0.895	L	1.95	T	-1.061	T	0.035	T	0.229	2.121	13.05	4.06	0.900	1.408	9.741	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	84	75	9	0
chr10	70679721	70679721	A	T	exonic	DDX50	NaN	nonsynonymous SNV	DDX50:NM_024045:exon8:c.A1223T:p.N408I	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.613	P	0.269	B	0.000	N	1.000	D	0.55	N	3.63	T	-0.871	T	0.013	T	0.712	3.985	20.4	4.4	1.739	8.725	13.933	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.885361	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	56	51	5	0
chr10	70679722	70679722	T	A	exonic	DDX50	NaN	nonsynonymous SNV	DDX50:NM_024045:exon8:c.T1224A:p.N408K	NaN	NaN	NaN	0.65	T	0.409	B	0.184	B	0.000	D	0.996	D	-0.105	N	3.64	T	-0.793	T	0.007	T	0.298	2.623	14.73	2.04	0.191	1.907	7.319	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.407339	possible_contamination	REJECT	56	51	5	0
chr10	70696640	70696640	T	C	intronic	DDX50	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	2	6	0
chr10	70700978	70700978	T	C	intronic	DDX50	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.582866	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	33	30	3	0
chr10	70716106	70716106	A	G	intronic	DDX21	NaN	NaN	NaN	rs5030896	NaN	0.953674	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.630102	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	0	18	57
chr10	70716206	70716206	G	A	UTR5	DDX21	NM_001256910:c.-3473G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.04633204633204724	NA	0	0	7.442645	nearby_gap_events	REJECT	24	20	4	0
chr10	70729934	70729934	T	G	intronic	DDX21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	2.3081988846978064E-5	NA	0	0	NaN	NA	NA	58	43	15	0
chr10	70733266	70733266	T	G	intronic	DDX21	NaN	NaN	NaN	rs5030899	ID=COSN163657;OCCURENCE=1(breast)	0.282748	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	112	53	59	24
chr10	70737476	70737476	A	A	intronic	DDX21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	70742236	70742236	C	C	intronic	DDX21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	16	16	0	0
chr10	70760304	70760304	A	T	intronic	KIAA1279	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.772099	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	91	83	8	0
chr10	70856852	70856852	G	A	exonic	SRGN	NaN	nonsynonymous SNV	SRGN:NM_002727:exon2:c.G92A:p.R31Q	rs2229498	NaN	0.589657	0.94	T	0.12	B	0.035	B	0.873	N	1.000	P	-0.345	N	0.79	T	-0.976	T	0.000	T	0.074	-0.099	3.514	-0.986	-0.372	-0.356	10.334	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	41.739146	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	48
chr10	70931050	70931050	G	T	UTR3	VPS26A	NM_004896:c.*25G>T,NM_001035260:c.*110G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.744338	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	90	85	5	0
chr10	70958042	70958042	A	G	intronic	SUPV3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	70958043	70958043	C	A	intronic	SUPV3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	70967717	70967717	A	A	intronic	SUPV3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	71003103	71003103	T	C	exonic	HKDC1	NaN	nonsynonymous SNV	HKDC1:NM_025130:exon7:c.T857C:p.L286P	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.074	B	0.017	B	0.005	N	1.000	D	1.41	L	-4.01	D	0.501	D	0.797	D	0.744	3.410	17.52	5.23	2.196	2.085	15.272	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.285714	clustered_read_position	REJECT	17	13	4	0
chr10	71005734	71005734	T	T	intronic	HKDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	71007378	71007378	A	C	intronic	HKDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr10	71055459	71055459	T	C	intronic	HK1	NaN	NaN	NaN	rs4746837	NaN	0.704473	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	405.3	45	NaN	NA	NA	18	0	18	27
chr10	71060556	71060556	G	A	UTR5	HK1	NM_033500:c.-35G>A	NaN	NaN	rs375657392	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr10	71136630	71136630	A	G	intronic	HK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	71144702	71144702	G	A	intronic	HK1	NaN	NaN	NaN	rs749105	NaN	0.655551	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1706.7	0	NaN	NA	NA	185	1	184	47
chr10	71152091	71152091	T	C	intronic	HK1	NaN	NaN	NaN	rs2278745	NaN	0.602436	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.068831	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	17	5	40
chr10	71158269	71158269	G	C	intronic	HK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.233319	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	349	322	27	0
chr10	71160689	71160689	G	T	intronic	HK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	71164914	71164914	A	A	intronic	TACR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr10	71168945	71168945	C	G	intronic	TACR2	NaN	NaN	NaN	rs1549797	NaN	0.559305	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.782696	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	10	3	17
chr10	71211320	71211320	G	G	UTR5	TSPAN15	NM_012339:c.-31G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr10	71211321	71211321	C	C	UTR5	TSPAN15	NM_012339:c.-30C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr10	71264325	71264325	G	A	intronic	TSPAN15	NaN	NaN	NaN	rs1652804	NaN	0.345447	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	105.05095	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	1	36	29
chr10	71266831	71266831	A	A	UTR3	TSPAN15	NM_012339:c.*97A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	11	8	0	0
chr10	71332204	71332204	A	G	exonic	NEUROG3	NaN	nonsynonymous SNV	NEUROG3:NM_020999:exon2:c.T596C:p.F199S	rs4536103	NaN	0.429912	0.87	T	0.0	B	0.0	B	0.023	N	1.000	P	-1.04	N	-3.14	D	-0.949	T	0.000	T	0.034	-0.182	3.112	2.94	0.643	1.496	9.496	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	93.053149	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	1	31	45
chr10	71332298	71332298	C	T	exonic	NEUROG3	NaN	nonsynonymous SNV	NEUROG3:NM_020999:exon2:c.G502A:p.D168N	NaN	NaN	NaN	0.44	T	0.003	B	0.002	B	0.731	N	1.000	N	0.805	L	-3.4	D	-0.380	T	0.613	D	0.053	3.656	18.58	3.78	1.164	2.145	8.958	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.17142857142857418	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr10	71640867	71640867	A	G	intronic	COL13A1	NaN	NaN	NaN	rs999705	NaN	0.819089	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	71647197	71647197	T	G	intronic	COL13A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.585179	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	41	34	7	0
chr10	71647350	71647350	A	A	intronic	COL13A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	71657040	71657040	G	A	intronic	COL13A1	NaN	NaN	NaN	rs3812701	NaN	0.754593	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	33.4849	33	13.262667	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	7	2	5	15
chr10	71665676	71665676	G	C	intronic	COL13A1	NaN	NaN	NaN	rs2683575	NaN	0.802716	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	262.748671	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	90	1	89	54
chr10	71678058	71678058	C	G	exonic	COL13A1	NaN	synonymous SNV	COL13A1:NM_080798:exon15:c.C843G:p.A281A,COL13A1:NM_080805:exon16:c.C861G:p.A287A,COL13A1:NM_080800:exon18:c.C957G:p.A319A,COL13A1:NM_080801:exon18:c.C948G:p.A316A,COL13A1:NM_080802:exon18:c.C948G:p.A316A,COL13A1:NM_001130103:exon19:c.C1014G:p.A338A	rs2274181	NaN	0.214058	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	47.0438	44	NaN	NA	NA	115	89	26	24
chr10	71681766	71681766	A	G	intronic	COL13A1	NaN	NaN	NaN	rs4237324	NaN	0.20607	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	73	60	13	29
chr10	71683694	71683694	A	T	intronic	COL13A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	71686765	71686765	T	T	intronic	COL13A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	71697335	71697335	A	C	intronic	COL13A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	71734735	71734735	G	C	intergenic	COL13A1,H2AFY2	dist=15831;dist=77622	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	71835666	71835666	A	G	intronic	H2AFY2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	71851624	71851624	C	C	exonic	H2AFY2	NaN	synonymous SNV	H2AFY2:NM_018649:exon4:c.C391C:p.P131P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	115	100	0	0
chr10	71880419	71880419	C	C	intronic	AIFM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	71906150	71906150	T	C	exonic	TYSND1	NaN	nonsynonymous SNV	TYSND1:NM_001040273:exon1:c.A193G:p.T65A,TYSND1:NM_173555:exon1:c.A193G:p.T65A	rs4746970	NaN	0.385383	0.13	T	0.002	B	0.003	B	0.362	N	1.000	P	1.5	L	0.85	T	-0.947	T	0.000	T	0.024	-0.179	3.128	2.59	0.905	0.483	2.304	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	88.733622	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	16	37	33
chr10	71917348	71917348	A	G	intronic	SAR1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.019222	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	184	173	11	0
chr10	71921649	71921649	A	G	exonic	SAR1A	NaN	nonsynonymous SNV	SAR1A:NM_020150:exon2:c.T23C:p.I8T,SAR1A:NM_001142648:exon3:c.T23C:p.I8T	NaN	NaN	NaN	0	D	0.868	P	0.432	B	0.000	D	1.000	D	1.7	L	-0.48	T	-0.358	T	0.316	T	0.762	3.786	19.22	5.56	2.107	7.335	14.540	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.358022		KEEP	111	105	6	0
chr10	71965971	71965971	A	T	intronic	PPA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.965057	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	153	141	12	0
chr10	71965972	71965972	G	A	intronic	PPA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.668668	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	149	136	13	0
chr10	71965973	71965973	T	G	intronic	PPA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.021833505751411613	NA	0	0	8.245002	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	143	133	10	0
chr10	71965990	71965990	T	G	intronic	PPA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.462037	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	150	135	15	0
chr10	71966173	71966173	A	G	intronic	PPA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr10	71969062	71969062	G	A	intronic	PPA1	NaN	NaN	NaN	rs9415006	NaN	0.928315	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	186.911557	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	0	65	57
chr10	71993083	71993083	T	C	exonic	PPA1	NaN	nonsynonymous SNV	PPA1:NM_021129:exon1:c.A1G:p.M1V	NaN	NaN	NaN	0	D	0.195	B	0.21	B	0.048	N	1.000	D	.	.	0.99	T	-0.947	T	0.109	T	0.946	1.855	12.16	4.32	1.805	3.278	9.773	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.063016	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	14	12	2	0
chr10	72043460	72043460	T	G	upstream	NPFFR1	NaN	NaN	NaN	rs10999239	NaN	0.234026	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.587771	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	5	20	27
chr10	72052480	72052480	G	T	intergenic	NPFFR1,LRRC20	dist=9030;dist=6246	NaN	NaN	rs10762358	NaN	0.39996	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	72061079	72061079	C	T	UTR3	LRRC20	NM_018205:c.*31G>A,NM_207119:c.*31G>A,NM_018239:c.*31G>A,NM_001278212:c.*31G>A,NM_001278211:c.*31G>A,NM_001278214:c.*31G>A,NM_001278213:c.*31G>A	NaN	NaN	rs10740336	NaN	0.987819	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.3247	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	53
chr10	7214127	7214127	A	A	intronic	SFMBT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	15	11	0	0
chr10	72183069	72183069	A	A	UTR3	EIF4EBP2	NM_004096:c.*1566A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	72201219	72201219	G	G	intronic	NODAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	72285581	72285581	C	G	intronic	PALD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	72285588	72285588	T	G	intronic	PALD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr10	72289701	72289701	G	G	exonic	PALD1	NaN	synonymous SNV	PALD1:NM_014431:exon4:c.G345G:p.V115V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	34	30	0	0
chr10	72294085	72294085	G	C	intronic	PALD1	NaN	NaN	NaN	rs78436482	NaN	0.00898562	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	72298631	72298631	T	C	intronic	PALD1	NaN	NaN	NaN	rs1122918	NaN	0.900559	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.281784	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	52
chr10	72307101	72307101	C	C	exonic	PALD1	NaN	synonymous SNV	PALD1:NM_014431:exon18:c.C2161C:p.R721R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr10	72358246	72358246	G	A	exonic	PRF1	NaN	stopgain	PRF1:NM_001083116:exon3:c.C1231T:p.Q411X,PRF1:NM_005041:exon3:c.C1231T:p.Q411X	NaN	NaN	NaN	0.88	T	.	.	.	.	0.849	N	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	5.775	36	-3.08	-0.216	-0.477	10.841	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.831386	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	46	43	3	0
chr10	72434194	72434194	G	A	intronic	ADAMTS14	NaN	NaN	NaN	rs614201	NaN	0.647764	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	102	NaN	NA	NA	153	125	28	40
chr10	72462265	72462265	A	A	intronic	ADAMTS14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	72469612	72469612	T	T	intronic	ADAMTS14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	72495120	72495120	A	A	intronic	ADAMTS14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr10	72500761	72500761	CCT	C,CC,CCC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1101.81	0	NaN	NA	NA	127	0	24	12
chr10	72500943	72500943	A	T	intronic	ADAMTS14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr10	72503810	72503810	C	A	intronic	ADAMTS14	NaN	NaN	NaN	rs41307559	NaN	0.0403355	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.61114	0	NaN	NA	NA	18	15	3	11
chr10	72520567	72520567	A	G	exonic	ADAMTS14	NaN	synonymous SNV	ADAMTS14:NM_080722:exon22:c.A3630G:p.R1210R,ADAMTS14:NM_139155:exon22:c.A3639G:p.R1213R	rs10823616	NaN	0.243011	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	68	NaN	NA	NA	19	18	1	11
chr10	72533910	72533910	C	T	intronic	TBATA	NaN	NaN	NaN	rs7077672	NaN	0.795727	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	110.215326	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	0	38	53
chr10	72534195	72534195	A	A	intronic	TBATA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	72537103	72537103	A	T	intronic	TBATA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	72537104	72537104	A	C	intronic	TBATA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	72537105	72537105	A	G	intronic	TBATA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	72610957	72610957	T	C	exonic	SGPL1	NaN	nonsynonymous SNV	SGPL1:NM_003901:exon4:c.T251C:p.I84T	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.76	P	0.288	B	0.017	N	1.000	D	1.965	M	1.11	T	-1.017	T	0.116	T	0.304	1.371	10.51	3.04	0.426	4.272	6.491	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.295746	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	38	35	3	0
chr10	72610973	72610973	T	C	intronic	SGPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.184565	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	38	35	3	0
chr10	72632985	72632985	T	G	intronic	SGPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	9	4	4	0
chr10	72643674	72643674	C	C	UTR3	PCBD1	NM_000281:c.*33G>G,NM_001289797:c.*33G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	102	83	0	0
chr10	7269733	7269733	T	G	intronic	SFMBT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr10	7269734	7269734	T	C	intronic	SFMBT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	7269736	7269736	A	G	intronic	SFMBT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	7269737	7269737	T	G	intronic	SFMBT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	2	3	0
chr10	72727385	72727385	T	C	intergenic	PCBD1,UNC5B	dist=78842;dist=244907	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	72727386	72727386	C	A	intergenic	PCBD1,UNC5B	dist=78843;dist=244906	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	72727394	72727394	A	G	intergenic	PCBD1,UNC5B	dist=78851;dist=244898	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73007215	73007215	T	A	intronic	UNC5B	NaN	NaN	NaN	rs6480502	NaN	0.618411	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73044580	73044580	G	A	exonic	UNC5B	NaN	synonymous SNV	UNC5B:NM_001244889:exon3:c.G408A:p.A136A,UNC5B:NM_170744:exon3:c.G408A:p.A136A	rs12770025	NaN	0.498003	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	71.236205	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	9	27	53
chr10	73047266	73047266	G	C	intronic	UNC5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr10	73048632	73048632	T	C	intronic	UNC5B	NaN	NaN	NaN	rs2277258	NaN	0.105631	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr10	73050770	73050770	C	T	exonic	UNC5B	NaN	nonsynonymous SNV	UNC5B:NM_001244889:exon8:c.C1165T:p.R389C,UNC5B:NM_170744:exon9:c.C1198T:p.R400C	NaN	NaN	NaN	0.16	T	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	1.53	L	0.57	T	-0.567	T	0.309	T	0.821	3.572	18.20	5.39	2.535	4.725	14.821	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.419124	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	61	57	4	0
chr10	73051038	73051038	G	C	intronic	UNC5B	NaN	NaN	NaN	rs3740461	NaN	0.740415	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	156.845504	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	51	0	51	51
chr10	73053783	73053783	G	C	intronic	UNC5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.31315	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr10	73053830	73053830	C	T	intronic	UNC5B	NaN	NaN	NaN	rs113326142	NaN	0.00698882	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	13.771	0	NaN	NA	NA	11	8	3	4
chr10	73056507	73056507	A	A	intronic	UNC5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	73057578	73057578	T	T	intronic	UNC5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	73104056	73104056	A	G	intronic	SLC29A3	NaN	NaN	NaN	rs2243540	NaN	0.814297	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	285.464603	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	97	0	97	57
chr10	73121591	73121591	A	C	intronic	SLC29A3	NaN	NaN	NaN	rs2487066	NaN	0.505391	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	63	54	9	48
chr10	73121645	73121645	C	C	intronic	SLC29A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	48	38	0	0
chr10	73121912	73121912	C	T	exonic	SLC29A3	NaN	synonymous SNV	SLC29A3:NM_018344:exon6:c.C975T:p.A325A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	436.511	0	6.519979	nearby_gap_events	REJECT	45	40	5	0
chr10	7318842	7318842	T	T	intronic	SFMBT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr10	73269983	73269983	T	C	splicing	CDH23	NM_022124:exon4:c.288+2T>C,NM_001171932:exon4:c.288+2T>C,NM_001171931:exon4:c.288+2T>C,NM_052836:exon4:c.288+2T>C,NM_001171930:exon4:c.288+2T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.115	13.03	5.23	1.973	6.948	14.811	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.171185	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	23	20	3	0
chr10	73326358	73326358	GCC	GC,GCT,GGC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	199.429	0	NaN	NA	NA	23	0	9	0
chr10	73329650	73329650	A	T	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	15	8	7	0
chr10	73337810	73337810	A	A	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr10	73428067	73428067	G	T	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73428070	73428070	C	T	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73428071	73428071	C	G	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73428072	73428072	A	T	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73428073	73428073	T	G	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73436971	73436971	C	C	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	73439101	73439101	T	C	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	rs1227042	NaN	0.915136	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	76.634995	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	0	34	56
chr10	73442151	73442151	G	A	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73442152	73442152	G	A	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73442155	73442155	T	G	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	rs138560543	NaN	0.00938498	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73442156	73442156	C	G	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73454108	73454108	A	A	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	73455371	73455371	A	T	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr10	73466982	73466982	A	A	UTR3	CDH23	NM_001171931:c.*96A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	73483945	73483945	A	A	intronic	C10orf105,CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr10	73490393	73490393	A	A	intronic	C10orf105,CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr10	73499561	73499561	C	G	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	rs10762474	NaN	0.415935	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.620278	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	0	36	49
chr10	73501556	73501556	G	A	exonic	CDH23	NaN	nonsynonymous SNV	CDH23:NM_022124:exon36:c.G4723A:p.A1575T	rs1227051	NaN	0.728834	0.61	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.000	P	.	.	.	.	-0.999	T	0.000	T	0.093	0.055	4.299	5.09	0.798	6.202	10.883	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	207.905049	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	68	0	68	55
chr10	73502214	73502214	G	G	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	73537302	73537302	C	T	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	rs7901038	NaN	0.38099	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	69.994	36	19.477623	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	9	2	7	3
chr10	73537388	73537388	T	C	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	rs7917781	NaN	0.407947	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	43.7483	33	10.597498	normal_lod	REJECT	6	2	4	7
chr10	73542839	73542839	T	T	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	73550969	73550969	G	A	exonic	CDH23	NaN	nonsynonymous SNV	CDH23:NM_022124:exon45:c.G6130A:p.E2044K	rs10466026	ID=COSM146953;OCCURENCE=1(stomach),1(large_intestine)	0.332668	0.78	T	0.635	P	0.32	B	0.002	N	0.000	P	-0.665	N	.	.	-1.032	T	0.000	T	0.232	4.131	21.3	5.91	2.793	2.222	11.484	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	91.83007	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	19	40	26
chr10	73557944	73557944	T	T	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	73558109	73558109	A	G	splicing	CDH23	NM_022124:exon48:c.6830-2A>G,NM_001171933:exon3:c.110-2A>G,NM_001171934:exon3:c.110-2A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.752	19.05	5.53	2.109	9.273	15.652	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.816917	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	300	286	14	0
chr10	73562744	73562744	G	A	exonic	CDH23	NaN	synonymous SNV	CDH23:NM_001171933:exon7:c.G852A:p.A284A,CDH23:NM_001171934:exon7:c.G852A:p.A284A,CDH23:NM_022124:exon52:c.G7572A:p.A2524A	rs10823849	ID=COSM146956;OCCURENCE=1(stomach)	0.328474	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	131	23	108	25
chr10	73569749	73569749	C	T	exonic	CDH23	NaN	synonymous SNV	CDH23:NM_001171933:exon14:c.C2175T:p.P725P,CDH23:NM_001171934:exon14:c.C2175T:p.P725P,CDH23:NM_022124:exon59:c.C8895T:p.P2965P	rs11000009	NaN	0.0808706	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	68	NaN	NA	NA	166	117	49	20
chr10	73571125	73571125	A	T	exonic	CDH23	NaN	nonsynonymous SNV	CDH23:NM_001171933:exon16:c.A2411T:p.N804I,CDH23:NM_001171934:exon16:c.A2411T:p.N804I,CDH23:NM_022124:exon61:c.A9131T:p.N3044I	NaN	NaN	NaN	0	D	0.124	B	0.042	B	0.001	N	1.000	D	1.39	L	0.38	T	-0.955	T	0.131	T	0.476	3.277	17.00	4.37	0.926	4.919	11.419	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.299385	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	50	45	5	0
chr10	73571127	73571127	T	G	exonic	CDH23	NaN	nonsynonymous SNV	CDH23:NM_001171933:exon16:c.T2413G:p.Y805D,CDH23:NM_001171934:exon16:c.T2413G:p.Y805D,CDH23:NM_022124:exon61:c.T9133G:p.Y3045D	NaN	NaN	NaN	0	D	0.79	P	0.377	B	0.000	D	1.000	D	1.845	L	0.26	T	-0.667	T	0.203	T	0.931	3.735	18.97	5.51	2.102	6.242	12.718	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.570378	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	50	46	4	0
chr10	73571533	73571533	A	G	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	15	9.880171	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	16	11	5	0
chr10	73571581	73571581	C	CCT	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.788139	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	47.2687	0	NaN	NA	NA	11	4	7	43
chr10	73573230	73573230	T	G	intronic	CDH23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.425677	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	129	117	12	0
chr10	73587941	73587941	A	G	intronic	PSAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73587944	73587944	T	A	intronic	PSAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73587949	73587949	G	A	intronic	PSAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73767880	73767880	G	C	exonic	CHST3	NaN	nonsynonymous SNV	CHST3:NM_004273:exon3:c.G1091C:p.G364A	NaN	NaN	NaN	0	D	0.906	P	0.696	P	0.001	D	1.000	D	2.66	M	-1.53	D	0.386	D	0.634	D	0.644	4.575	24.8	5.55	2.630	5.607	18.503	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.16414	0	NaN	NA	NA	6	5	2	0
chr10	73771282	73771282	C	T	UTR3	CHST3	NM_004273:c.*3053C>T	NaN	NaN	rs12172746	NaN	0.240615	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	73822343	73822343	T	C	UTR3	SPOCK2	NM_014767:c.*175A>G,NM_001244950:c.*175A>G	NaN	NaN	rs3088251	NaN	0.322684	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	13	6	7	0
chr10	73822514	73822514	G	C	UTR3	SPOCK2	NM_014767:c.*4C>G,NM_001244950:c.*4C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	127.59	0	14.918293	nearby_gap_events	REJECT	13	5	8	13
chr10	73828124	73828124	A	A	intronic	SPOCK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	73833727	73833727	G	G	intronic	SPOCK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	73892824	73892824	C	T	exonic	ASCC1	NaN	nonsynonymous SNV	ASCC1:NM_001198798:exon8:c.G862A:p.D288N,ASCC1:NM_001198800:exon8:c.G862A:p.D288N,ASCC1:NM_001198799:exon9:c.G946A:p.D316N	NaN	NaN	NaN	0.35	T	1.0	D	0.989	D	0.000	D	1.000	D	1.955	M	2.76	T	-0.498	T	0.352	T	0.096	4.700	26.1	5.86	2.776	6.131	17.119	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.198182	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	106	100	6	0
chr10	73892825	73892825	T	C	exonic	ASCC1	NaN	synonymous SNV	ASCC1:NM_001198798:exon8:c.A861G:p.K287K,ASCC1:NM_001198800:exon8:c.A861G:p.K287K,ASCC1:NM_001198799:exon9:c.A945G:p.K315K	NaN	NaN	NaN	0.28	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	-0.909	T	0.203	T	.	1.124	9.584	2.3	0.147	1.542	8.019	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.024398	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	70	64	6	0
chr10	73970451	73970451	G	T	intronic	ASCC1	NaN	NaN	NaN	rs7069703	NaN	0.31889	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.402831	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	61	46	15	43
chr10	74100997	74100997	A	A	intronic	DNAJB12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr10	74237041	74237041	A	A	intronic	MICU1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr10	74268031	74268031	T	C	exonic	MICU1	NaN	unknown	UNKNOWN	rs3793927	NaN	0.297923	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	80.113929	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	5	30	52
chr10	74326338	74326338	T	C	intronic	MICU1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	1	7	0
chr10	74326570	74326570	A	A	intronic	MICU1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	74671562	74671562	G	C	exonic	OIT3	NaN	nonsynonymous SNV	OIT3:NM_152635:exon5:c.G755C:p.G252A	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.999	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	3.21	M	-4.82	D	1.081	D	0.973	D	0.883	4.519	24.3	5.96	2.832	9.018	20.422	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.659648	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	139	129	10	0
chr10	74671563	74671563	C	G	exonic	OIT3	NaN	synonymous SNV	OIT3:NM_152635:exon5:c.C756G:p.G252G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.841346	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	84	74	10	0
chr10	74671611	74671611	C	C	intronic	OIT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	154	115	0	0
chr10	74673015	74673015	T	C	intronic	OIT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	74673019	74673019	C	G	intronic	OIT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	74673021	74673021	C	T	intronic	OIT3	NaN	NaN	NaN	rs201798169	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	74673025	74673025	T	C	intronic	OIT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	74683913	74683913	T	T	intronic	OIT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	74684261	74684261	C	A	exonic	OIT3	NaN	nonsynonymous SNV	OIT3:NM_152635:exon7:c.C1226A:p.T409N	NaN	NaN	NaN	0.34	T	0.193	B	0.129	B	0.006	N	0.797	D	1.67	L	-1.71	D	-0.448	T	0.402	T	0.221	2.417	14.04	3.35	0.570	1.581	7.257	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.922732	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	244	216	28	0
chr10	74813364	74813364	A	A	intronic	P4HA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr10	74831984	74831984	A	C	intronic	P4HA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr10	74890588	74890588	C	T	exonic	NUDT13	NaN	nonsynonymous SNV	NUDT13:NM_001283014:exon7:c.C719T:p.P240L,NUDT13:NM_001283019:exon8:c.C395T:p.P132L,NUDT13:NM_001283017:exon9:c.C395T:p.P132L,NUDT13:NM_015901:exon9:c.C986T:p.P329L,NUDT13:NM_001283016:exon10:c.C608T:p.P203L	NaN	NaN	NaN	1	T	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	1.75	L	1.07	T	-0.624	T	0.347	T	0.925	3.664	18.62	5.4	2.692	6.910	19.119	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.311361	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	231	216	15	0
chr10	74890589	74890589	T	A	exonic	NUDT13	NaN	synonymous SNV	NUDT13:NM_001283014:exon7:c.T720A:p.P240P,NUDT13:NM_001283019:exon8:c.T396A:p.P132P,NUDT13:NM_001283017:exon9:c.T396A:p.P132P,NUDT13:NM_015901:exon9:c.T987A:p.P329P,NUDT13:NM_001283016:exon10:c.T609A:p.P203P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.686854	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	233	218	15	0
chr10	74896420	74896420	A	G	intronic	ECD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	74896424	74896424	T	A	intronic	ECD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	74896426	74896426	G	C	intronic	ECD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	74896786	74896786	A	G	intronic	ECD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr10	74899507	74899507	A	T	intronic	ECD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.710762	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	232	216	16	0
chr10	74987783	74987783	T	T	intronic	FAM149B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr10	75013662	75013662	A	T	ncRNA_intronic	DNAJC9-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	75013663	75013663	T	G	ncRNA_intronic	DNAJC9-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	75032837	75032837	A	C	ncRNA_intronic	DNAJC9-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	75056964	75056964	A	A	intronic	CFAP70	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr10	75185961	75185961	T	T	exonic	MSS51	NaN	synonymous SNV	MSS51:NM_001024593:exon5:c.A677A:p.D226D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	96	86	0	0
chr10	75187359	75187359	C	A	intronic	MSS51	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.640419	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	247	240	7	0
chr10	75198082	75198082	G	A	exonic	PPP3CB	NaN	nonsynonymous SNV	PPP3CB:NM_001142354:exon13:c.C1466T:p.A489V,PPP3CB:NM_001142353:exon14:c.C1496T:p.A499V,PPP3CB:NM_021132:exon14:c.C1493T:p.A498V	NaN	NaN	NaN	0.31	T	0.001	B	0.005	B	0.010	N	1.000	D	0.345	N	2.5	T	-1.084	T	0.068	T	0.102	1.253	10.08	5.74	2.716	5.053	14.121	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.162846	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	82	79	3	0
chr10	75204417	75204417	T	T	exonic	PPP3CB	NaN	synonymous SNV	PPP3CB:NM_001289968:exon13:c.A1486A:p.N496N,PPP3CB:NM_001289969:exon13:c.A1174A:p.N392N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	75239376	75239376	A	C	intronic	PPP3CB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr10	75260321	75260321	C	A	intronic	USP54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.270589	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	85	76	9	13
chr10	75264560	75264560	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	0	4,3	0
chr10	75406071	75406071	G	T	UTR3	SYNPO2L	NM_001114133:c.*405C>A,NM_024875:c.*405C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	75406072	75406072	C	G	UTR3	SYNPO2L	NM_001114133:c.*404G>C,NM_024875:c.*404G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	75406081	75406081	G	T	UTR3	SYNPO2L	NM_001114133:c.*395C>A,NM_024875:c.*395C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	75407706	75407706	G	C	exonic	SYNPO2L	NaN	synonymous SNV	SYNPO2L:NM_024875:exon2:c.C1032G:p.P344P,SYNPO2L:NM_001114133:exon4:c.C1704G:p.P568P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.002148482673885391	NA	0	18	NaN	NA	NA	43	25	18	0
chr10	75414067	75414067	A	A	intronic	SYNPO2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	75415518	75415518	T	T	intronic	SYNPO2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr10	75525754	75525754	CCT	ACC,CCC,CC,C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	480.916	0	NaN	NA	NA	62	0	8	0
chr10	75526960	75526960	A	A	intronic	SEC24C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr10	75528555	75528555	T	G	intronic	SEC24C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr10	75530504	75530504	A	G	exonic	SEC24C	NaN	nonsynonymous SNV	SEC24C:NM_198597:exon22:c.A3092G:p.K1031R,SEC24C:NM_004922:exon23:c.A3092G:p.K1031R	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.002	B	0.000	D	1.000	D	-0.315	N	0.61	T	-1.028	T	0.045	T	0.051	0.143	4.770	4.87	2.304	0.930	7.917	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.370086	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	56	53	3	0
chr10	75535236	75535236	A	C	exonic	FUT11	NaN	nonsynonymous SNV	FUT11:NM_001284194:exon3:c.A1394C:p.E465A	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.034	B	0.04	B	.	.	1.000	N	.	.	1.23	T	-1.015	T	0.072	T	0.098	0.796	8.192	3.54	0.731	0.820	8.193	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	7	0	4	0
chr10	75535237	75535237	A	C	exonic	FUT11	NaN	nonsynonymous SNV	FUT11:NM_001284194:exon3:c.A1395C:p.E465D	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.0	B	0.002	B	.	.	0.999	N	.	.	1.25	T	-1.021	T	0.059	T	0.054	0.851	8.443	2.05	0.617	-0.060	3.947	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	11	4	7	0
chr10	75535238	75535238	A	C	exonic	FUT11	NaN	nonsynonymous SNV	FUT11:NM_001284194:exon3:c.A1396C:p.K466Q	NaN	NaN	NaN	0.37	T	0.571	P	0.302	B	.	.	1.000	N	.	.	1.2	T	-1.053	T	0.074	T	0.216	1.340	10.40	5.0	1.978	2.490	12.511	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	16	8	4	0
chr10	75545927	75545927	C	G	intronic	ZSWIM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.68053	clustered_read_position	REJECT	95	87	8	0
chr10	75549409	75549409	T	T	intronic	ZSWIM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	46	41	0	0
chr10	75550147	75550147	A	A	intronic	ZSWIM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr10	75553512	75553512	CA	AC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.44316	0	NaN	NA	NA	13	11	2	0
chr10	75558867	75558867	G	A	exonic	ZSWIM8	NaN	synonymous SNV	ZSWIM8:NM_001242487:exon21:c.G4269A:p.L1423L,ZSWIM8:NM_001242488:exon21:c.G4269A:p.L1423L,ZSWIM8:NM_015037:exon21:c.G4284A:p.L1428L	rs2271271	ID=COSM146971;OCCURENCE=1(stomach)	0.487819	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.011	T	0.000	T	.	0.510	6.766	-7.37	-1.254	-0.488	7.221	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.09497	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	25	13	47
chr10	75564642	75564642	A	A	intronic	NDST2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	75602380	75602380	A	A	intronic	CAMK2G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr10	75613091	75613091	A	A	intronic	CAMK2G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	75623269	75623269	C	A	intronic	CAMK2G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	75623272	75623272	C	T	intronic	CAMK2G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	75632760	75632760	C	T	exonic	CAMK2G	NaN	synonymous SNV	CAMK2G:NM_001204492:exon2:c.G147A:p.K49K,CAMK2G:NM_001222:exon2:c.G147A:p.K49K,CAMK2G:NM_172169:exon2:c.G147A:p.K49K,CAMK2G:NM_172170:exon2:c.G147A:p.K49K,CAMK2G:NM_172171:exon2:c.G147A:p.K49K,CAMK2G:NM_172173:exon2:c.G147A:p.K49K	rs2675671	ID=COSM1349091,COSM1349090;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.284345	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	5	2	42
chr10	75634116	75634116	C	A	intronic	CAMK2G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	23	7.868784	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	5	2	3	0
chr10	75673101	75673101	T	C	exonic	PLAU	NaN	nonsynonymous SNV	PLAU:NM_001145031:exon5:c.T371C:p.L124P,PLAU:NM_002658:exon6:c.T422C:p.L141P	rs2227564	NaN	0.775359	0.2	T	0.723	P	0.797	P	0.022	N	0.630	P	.	.	-0.07	T	-1.003	T	0.000	T	0.224	0.738	7.917	3.07	0.045	0.567	6.454	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.389856	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	75	52	23	50
chr10	75855355	75855355	T	T	intronic	VCL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr10	75860627	75860627	T	C	intronic	VCL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	75863758	75863758	G	T	intronic	VCL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	75936611	75936611	C	T	UTR5	ADK	NM_001202449:c.-20C>T,NM_001123:c.-20C>T	NaN	NaN	rs10824095	NaN	0.630192	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	60.203953	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	53
chr10	7605067	7605067	C	T	exonic	ITIH5	NaN	nonsynonymous SNV	ITIH5:NM_032817:exon11:c.G2165A:p.R722Q,ITIH5:NM_030569:exon15:c.G2807A:p.R936Q	rs3824658	NaN	0.571685	0.44	T	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	4.64	T	-1.046	T	0.000	T	0.025	1.277	10.17	-6.94	-1.075	-1.061	2.044	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	66.371041	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	2	23	55
chr10	7605101	7605101	A	G	exonic	ITIH5	NaN	nonsynonymous SNV	ITIH5:NM_032817:exon10:c.T2132C:p.F711S,ITIH5:NM_030569:exon14:c.T2774C:p.F925S	rs10795551	NaN	0.966653	0.85	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.000	P	.	.	5.11	T	-0.930	T	0.000	T	0.228	-0.500	1.706	4.88	1.466	3.775	12.193	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	57.740211	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	1	22	54
chr10	76158177	76158177	C	T	intronic	ADK	NaN	NaN	NaN	rs2126763	NaN	0.529952	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	50.1426	0	NaN	NA	NA	109	0	109	3
chr10	76430068	76430068	A	A	intronic	ADK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	7658115	7658115	A	T	intronic	ITIH5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	7658116	7658116	T	C	intronic	ITIH5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	7658117	7658117	A	G	intronic	ITIH5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	76735323	76735323	A	G	exonic	KAT6B	NaN	nonsynonymous SNV	KAT6B:NM_001256468:exon8:c.A1228G:p.T410A,KAT6B:NM_012330:exon8:c.A1228G:p.T410A	NaN	ID=COSM176787;OCCURENCE=1(large_intestine)	NaN	.	.	0.011	B	0.01	B	0.000	D	1.000	N	0.55	N	-1.0	T	-0.757	T	0.240	T	0.219	0.702	7.746	4.83	1.068	4.179	10.941	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.198929	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	70	65	5	0
chr10	76735684	76735684	C	T	exonic	KAT6B	NaN	nonsynonymous SNV	KAT6B:NM_012330:exon8:c.C1589T:p.S530F	NaN	NaN	NaN	.	.	0.999	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	0.345	N	0.07	T	-0.727	T	0.243	T	0.855	2.361	13.85	6.08	2.890	7.143	18.845	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.577548	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	76	63	13	0
chr10	76781067	76781067	A	A	intronic	KAT6B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	76797909	76797909	A	A	intronic	DUPD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	76818077	76818077	C	T	exonic	DUPD1	NaN	nonsynonymous SNV	DUPD1:NM_001003892:exon1:c.G196A:p.D66N	rs11594934	NaN	0.113019	0.11	T	0.989	D	0.881	P	0.000	D	1.000	D	0.665	N	0.26	T	-1.012	T	0.019	T	0.092	3.432	17.61	5.37	2.518	6.736	16.029	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	62.168896	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	10	26	9
chr10	76854564	76854564	C	T	exonic	DUSP13	NaN	nonsynonymous SNV	DUSP13:NM_001007272:exon4:c.G617A:p.C206Y,DUSP13:NM_016364:exon4:c.G467A:p.C156Y,DUSP13:NM_001007273:exon6:c.G746A:p.C249Y	rs3088142	NaN	0.641773	1	T	0.052	B	0.015	B	0.220	N	0.000	P	-0.135	N	-1.87	D	-0.984	T	0.000	T	0.065	-0.513	1.656	-2.21	-1.260	-0.120	7.288	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	197.071499	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	0	66	37
chr10	76855392	76855392	A	G	exonic	DUSP13	NaN	nonsynonymous SNV	DUSP13:NM_001007272:exon3:c.T485C:p.L162P,DUSP13:NM_016364:exon3:c.T335C:p.L112P,DUSP13:NM_001007273:exon5:c.T614C:p.L205P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	4.08	H	-2.21	D	1.014	D	0.870	D	0.918	4.387	23.2	5.11	1.921	8.823	14.901	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.6004	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	614	606	8	0
chr10	76855563	76855563	A	C	intronic	DUSP13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	21	14	7	0
chr10	76855564	76855564	G	C	intronic	DUSP13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	21	14	7	0
chr10	76855565	76855565	G	T	intronic	DUSP13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	21	14	7	0
chr10	76861792	76861792	A	A	intronic	DUSP13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr10	76868046	76868046	A	G	intronic	DUSP13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.753863	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	83	73	10	0
chr10	76953082	76953082	C	G	intergenic	SAMD8,VDAC2	dist=11201;dist=16830	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	76990583	76990583	A	T	intronic	VDAC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	0	3	0
chr10	77158634	77158634	T	T	exonic	ZNF503	NaN	synonymous SNV	ZNF503:NM_032772:exon2:c.A1814A:p.Y605Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr10	77400311	77400311	G	A	intergenic	MIR606,C10orf11	dist=88000;dist=142208	NaN	NaN	rs117680565	NaN	0.00539137	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	7768882	7768882	T	T	intronic	ITIH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr10	77807099	77807099	A	G	intronic	C10orf11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	7786942	7786942	A	A	intronic	ITIH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	7788495	7788495	T	C	intronic	ITIH2	NaN	NaN	NaN	rs7912419	NaN	0.826078	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	133	105	28	52
chr10	7807833	7807833	T	T	intronic	KIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	7807837	7807837	A	A	intronic	KIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	7807838	7807838	T	T	intronic	KIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	7825231	7825231	T	C	intronic	KIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.093261	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	129	119	10	0
chr10	7830064	7830064	A	T	upstream	ATP5C1,KIN	NaN	NaN	NaN	rs2070594	NaN	0.203075	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.833013	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	6	6	28
chr10	7830235	7830235	G	A	intronic	ATP5C1	NaN	NaN	NaN	rs192483778	NaN	0.000998403	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.124937	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	5	4	1
chr10	7841582	7841582	G	T	intronic	ATP5C1	NaN	NaN	NaN	rs1244425	NaN	0.362819	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	80.256032	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	22	37	40
chr10	78708690	78708690	G	C	ncRNA_intronic	KCNMA1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	2	0
chr10	78713484	78713484	T	T	ncRNA_intronic	KCNMA1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	78943216	78943216	G	C	exonic	KCNMA1	NaN	synonymous SNV	KCNMA1:NM_001271518:exon4:c.C609G:p.P203P,KCNMA1:NM_001014797:exon5:c.C771G:p.P257P,KCNMA1:NM_001161352:exon5:c.C771G:p.P257P,KCNMA1:NM_001161353:exon5:c.C771G:p.P257P,KCNMA1:NM_001271519:exon5:c.C771G:p.P257P,KCNMA1:NM_002247:exon5:c.C771G:p.P257P	rs367642241	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	-4.91	D	-0.836	T	0.111	T	.	0.556	7.006	-11.8	-3.823	-1.447	4.855	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.021984380501043434	NA	0	0	NaN	NA	NA	48	33	15	0
chr10	79103939	79103939	C	C	intronic	KCNMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	15	13	0	0
chr10	79103940	79103940	T	T	intronic	KCNMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	15	13	0	0
chr10	79169403	79169403	T	C	intronic	KCNMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	79507558	79507558	C	C	intergenic	KCNMA1,DLG5	dist=109981;dist=42991	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	79576510	79576510	A	A	intronic	DLG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr10	79581878	79581878	G	A	intronic	DLG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr10	79588806	79588806	A	T	intronic	DLG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	6	3	2	0
chr10	79616605	79616605	T	C	exonic	DLG5	NaN	nonsynonymous SNV	DLG5:NM_004747:exon3:c.A419G:p.Q140R	rs1248696	NaN	0.965655	1	T	0.0	B	0.001	B	0.240	N	1.000	P	-0.51	N	0.82	T	-0.947	T	0.000	T	0.029	-1.478	0.018	1.51	-0.211	1.769	9.109	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	152.504367	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	55	0	55	58
chr10	79628849	79628849	T	T	intronic	DLG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	31	27	0	0
chr10	79741169	79741169	G	C	intronic	POLR3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03356939678652319	NA	0	0	NaN	NA	NA	59	43	16	0
chr10	79741843	79741843	G	C	intronic	POLR3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr10	79741844	79741844	T	T	intronic	POLR3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr10	79742413	79742413	T	G	exonic	POLR3A	NaN	nonsynonymous SNV	POLR3A:NM_007055:exon27:c.A3592C:p.K1198Q	NaN	NaN	NaN	.	.	0.695	P	0.341	B	0.000	D	1.000	D	1.415	L	-0.32	T	-0.711	T	0.247	T	0.73	3.396	17.46	6.07	2.326	7.579	16.629	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.481147	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	74	69	5	0
chr10	79746028	79746028	A	A	intronic	POLR3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	79750759	79750759	G	T	intronic	POLR3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	79750760	79750760	T	G	intronic	POLR3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	79750761	79750761	T	C	intronic	POLR3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	1	4	0
chr10	79940299	79940299	G	A	intergenic	RPS24,LINC00856	dist=123728;dist=68083	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	79941582	79941582	A	C	intergenic	RPS24,LINC00856	dist=125011;dist=66800	NaN	NaN	rs149103054	NaN	0.00499201	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	16	1	14	0
chr10	8005853	8005853	T	A	intronic	TAF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.23684210526315766	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr10	80061416	80061416	A	T	intergenic	LINC00595,ZMIZ1-AS1	dist=21446;dist=641667	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	80061418	80061418	A	T	intergenic	LINC00595,ZMIZ1-AS1	dist=21448;dist=641665	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	80061419	80061419	A	G	intergenic	LINC00595,ZMIZ1-AS1	dist=21449;dist=641664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	80061420	80061420	C	T	intergenic	LINC00595,ZMIZ1-AS1	dist=21450;dist=641663	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	80061421	80061421	G	C	intergenic	LINC00595,ZMIZ1-AS1	dist=21451;dist=641662	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	80061422	80061422	A	T	intergenic	LINC00595,ZMIZ1-AS1	dist=21452;dist=641661	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	80203825	80203825	G	A	intergenic	LINC00595,ZMIZ1-AS1	dist=163855;dist=499258	NaN	NaN	rs11002554	NaN	0.158746	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	80343379	80343379	G	T	intergenic	LINC00595,ZMIZ1-AS1	dist=303409;dist=359704	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	80530658	80530658	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	2	2,2	0
chr10	80535039	80535039	A	T	intergenic	LINC00595,ZMIZ1-AS1	dist=495069;dist=168044	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	8055642	8055642	G	G	intronic	TAF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	94	79	0	0
chr10	8055858	8055858	A	T	intronic	TAF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	8078208	8078208	C	A	intergenic	TAF3,GATA3-AS1	dist=21192;dist=14205	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	80784858	80784858	A	A	ncRNA_intronic	ZMIZ1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	80809118	80809118	C	C	ncRNA_intronic	ZMIZ1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	80809121	80809121	C	C	ncRNA_intronic	ZMIZ1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	80843522	80843522	C	C	intronic	ZMIZ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr10	80928472	80928472	C	T	intronic	ZMIZ1	NaN	NaN	NaN	rs11597985	NaN	0.135383	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr10	80928517	80928517	G	T	intronic	ZMIZ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	80949874	80949874	G	C	intronic	ZMIZ1	NaN	NaN	NaN	rs748179	NaN	0.824081	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	81052984	81052984	G	T	intronic	ZMIZ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.368472	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	11	7	4	0
chr10	81069213	81069213	A	T	intronic	ZMIZ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	81069214	81069214	T	C	intronic	ZMIZ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	81070713	81070713	C	C	exonic	ZMIZ1	NaN	synonymous SNV	ZMIZ1:NM_020338:exon24:c.C2868C:p.H956H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	162	134	0	0
chr10	81112068	81112068	T	G	intronic	PPIF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.624474	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	45	38	7	0
chr10	81153993	81153993	C	G	intronic	ZCCHC24	NaN	NaN	NaN	rs11002956	NaN	0.0273562	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	108	90	18	12
chr10	81192524	81192524	A	A	intronic	ZCCHC24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr10	81205050	81205050	T	G	exonic	ZCCHC24	NaN	synonymous SNV	ZCCHC24:NM_153367:exon1:c.A147C:p.A49A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.4997	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr10	81317317	81317317	A	G	exonic	SFTPA2	NaN	nonsynonymous SNV	SFTPA2:NM_001098668:exon6:c.T395C:p.M132T	NaN	NaN	NaN	0.37	T	0.0	B	0.001	B	0.164	N	1.000	N	-0.895	N	-1.74	D	-0.836	T	0.247	T	0.174	-0.182	3.112	2.98	1.124	-0.245	5.569	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.42938	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	86	81	5	0
chr10	81318820	81318820	G	A	intronic	SFTPA2	NaN	NaN	NaN	rs17880349	NaN	0.517971	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	65.142246	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	36
chr10	81374251	81374251	C	T	UTR3	SFTPA1	NM_001164644:c.*382C>T,NM_001093770:c.*382C>T,NM_005411:c.*382C>T,NM_001164647:c.*382C>T,NM_001164646:c.*382C>T,NM_001164645:c.*382C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	81374252	81374252	C	G	UTR3	SFTPA1	NM_001164644:c.*383C>G,NM_001093770:c.*383C>G,NM_005411:c.*383C>G,NM_001164647:c.*383C>G,NM_001164646:c.*383C>G,NM_001164645:c.*383C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	81700615	81700615	A	C	intronic	SFTPD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	81701322	81701322	T	G	intronic	SFTPD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.707249	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	136	119	17	0
chr10	81701722	81701722	T	C	exonic	SFTPD	NaN	nonsynonymous SNV	SFTPD:NM_003019:exon5:c.A538G:p.T180A	rs2243639	NaN	0.770367	0.85	T	0.0	B	0.001	B	0.880	N	1.000	P	0.145	N	-1.72	D	-0.941	T	0.000	T	0.267	-2.239	0.005	-3.79	-0.386	-1.321	1.600	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	164	135	29	52
chr10	81706101	81706101	T	T	intronic	SFTPD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	81841898	81841898	C	T	intronic	TMEM254	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.829004	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	34	28	6	0
chr10	81917708	81917708	A	G	intronic	ANXA11	NaN	NaN	NaN	rs1079242	NaN	0.408147	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	867.279573	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	288	0	288	49
chr10	81917885	81917885	A	A	intronic	ANXA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	81925983	81925983	A	C	intronic	ANXA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.330229	nearby_gap_events	REJECT	36	27	9	0
chr10	81926773	81926773	A	A	intronic	ANXA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	81927120	81927120	A	C	intronic	ANXA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	15	8	7	0
chr10	81928844	81928844	G	T	exonic	ANXA11	NaN	nonsynonymous SNV	ANXA11:NM_001157:exon4:c.C442A:p.P148T,ANXA11:NM_145868:exon5:c.C442A:p.P148T,ANXA11:NM_001278407:exon6:c.C442A:p.P148T,ANXA11:NM_001278408:exon6:c.C442A:p.P148T,ANXA11:NM_001278409:exon6:c.C343A:p.P115T,ANXA11:NM_145869:exon6:c.C442A:p.P148T	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.099	B	0.04	B	0.152	N	1.000	D	1.935	M	4.34	T	-0.999	T	0.012	T	0.328	2.563	14.53	3.25	1.251	3.741	9.154	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.4471	0	NaN	NA	NA	8	6	2	4
chr10	81929053	81929053	G	A	exonic	ANXA11	NaN	nonsynonymous SNV	ANXA11:NM_001157:exon4:c.C233T:p.P78L,ANXA11:NM_145868:exon5:c.C233T:p.P78L,ANXA11:NM_001278407:exon6:c.C233T:p.P78L,ANXA11:NM_001278408:exon6:c.C233T:p.P78L,ANXA11:NM_001278409:exon6:c.C134T:p.P45L,ANXA11:NM_145869:exon6:c.C233T:p.P78L	NaN	NaN	NaN	0.14	T	0.982	D	0.781	P	0.067	N	1.000	D	2.31	M	4.4	T	-1.091	T	0.023	T	0.452	3.606	18.35	4.8	2.387	7.323	15.730	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.704089	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	137	120	17	0
chr10	81932690	81932690	A	A	intronic	ANXA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	82034225	82034225	T	T	intronic	MAT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	82034262	82034262	G	A	intronic	MAT1A	NaN	NaN	NaN	rs2994388	NaN	0.588059	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.072847	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	74	56	18	39
chr10	82034482	82034482	C	G	intronic	MAT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	1	4	0
chr10	82034485	82034485	C	G	intronic	MAT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr10	82034749	82034749	C	C	intronic	MAT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	82043860	82043860	C	T	intronic	MAT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	10	0	10	0
chr10	82043861	82043861	A	G	intronic	MAT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	1	9	0
chr10	82043862	82043862	G	T	intronic	MAT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	10	0	9	0
chr10	82095968	82095968	T	G	intronic	DYDC1	NaN	NaN	NaN	rs1340383	NaN	0.85004	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	65.347008	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	52
chr10	82111779	82111779	C	T	intronic	DYDC1,DYDC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.473772	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	60	57	3	0
chr10	82185803	82185803	A	A	intronic	FAM213A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr10	82264423	82264423	G	A	intronic	TSPAN14	NaN	NaN	NaN	rs2343550	NaN	0.177716	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	53.357305	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	123	91	32	28
chr10	82268644	82268644	G	A	intronic	TSPAN14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	82268645	82268645	G	C	intronic	TSPAN14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	82289573	82289573	A	G	ncRNA_exonic	LOC101929574	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	82348595	82348595	A	A	intronic	SH2D4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	82372888	82372888	A	G	intronic	SH2D4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	82403725	82403725	A	G	intronic	SH2D4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.409719	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	197	188	9	0
chr10	84056017	84056017	G	G	intronic	NRG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	84733495	84733495	C	T	intronic	NRG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	84745256	84745256	C	T	exonic	NRG3	NaN	synonymous SNV	NRG3:NM_001010848:exon9:c.C1986T:p.S662S,NRG3:NM_001165972:exon9:c.C1983T:p.S661S,NRG3:NM_001165973:exon11:c.C1395T:p.S465S	rs2295933	NaN	0.469649	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	55.127038	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	37	23	35
chr10	84865176	84865176	C	T	intergenic	NRG3,GHITM	dist=118241;dist=1034009	NaN	NaN	rs12783533	NaN	0.0625	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	16	2	14	0
chr10	858912	858912	T	A	exonic	LARP4B	NaN	nonsynonymous SNV	LARP4B:NM_015155:exon18:c.A2171T:p.K724M	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.956	D	0.000	D	1.000	D	1.24	L	1.15	T	-0.959	T	0.142	T	0.479	3.212	16.76	3.74	0.530	3.565	10.121	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	23.4476	0	NaN	NA	NA	8	4	4	7
chr10	85903888	85903888	G	A	intronic	GHITM	NaN	NaN	NaN	rs10887241	NaN	0.100839	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	232	179	53	18
chr10	85911890	85911890	T	T	intronic	GHITM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	85956436	85956436	G	C	intronic	CDHR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.406379	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	99	86	13	1
chr10	85956439	85956439	A	A	intronic	CDHR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr10	85960542	85960542	T	T	intronic	CDHR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr10	85967918	85967918	T	T	intronic	CDHR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	85971322	85971322	T	T	intronic	CDHR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	85971438	85971438	T	C	exonic	CDHR1	NaN	nonsynonymous SNV	CDHR1:NM_001171971:exon14:c.T1520C:p.V507A,CDHR1:NM_033100:exon14:c.T1520C:p.V507A	NaN	NaN	NaN	0	D	0.996	D	0.883	P	0.000	D	1.000	D	4.185	H	0.67	T	-0.037	T	0.385	T	0.848	3.934	20.1	5.74	2.178	5.248	8.581	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.200586	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	290	282	8	0
chr10	85971604	85971604	C	A	intronic	CDHR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	85972043	85972043	A	G	exonic	CDHR1	NaN	synonymous SNV	CDHR1:NM_001171971:exon15:c.A1662G:p.E554E,CDHR1:NM_033100:exon15:c.A1662G:p.E554E	rs10749482	NaN	0.429113	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	113.496248	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	2	43	37
chr10	85974236	85974236	T	C	exonic	CDHR1	NaN	synonymous SNV	CDHR1:NM_033100:exon17:c.T2439C:p.T813T	rs3814213	NaN	0.573682	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	97.658395	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	0	35	42
chr10	85974381	85974381	A	G	UTR3	CDHR1	NM_033100:c.*4A>G	NaN	NaN	rs3814212	NaN	0.627396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	172.89681	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	58	0	58	51
chr10	85978990	85978990	TC	T,TT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1753.29	0	NaN	NA	NA	180	0	94	0
chr10	85985135	85985135	TA	CA,CT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.15835	0	NaN	NA	NA	30	25	2	1
chr10	85992477	85992477	CT	C,CC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	262.494	0	NaN	NA	NA	27	0	7	0
chr10	85992511	85992511	T	C	exonic	LRIT1	NaN	synonymous SNV	LRIT1:NM_015613:exon4:c.A1044G:p.P348P	rs3814209	NaN	0.492812	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	77.502608	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	0	27	44
chr10	85996968	85996968	A	C	intronic	LRIT1	NaN	NaN	NaN	rs4933988	NaN	0.454673	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	213.861	0	NaN	NA	NA	262	0	262	35
chr10	85997214	85997214	G	A	exonic	LRIT1	NaN	synonymous SNV	LRIT1:NM_015613:exon2:c.C351T:p.N117N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1830065359477151	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr10	85997250	85997250	G	A	exonic	LRIT1	NaN	synonymous SNV	LRIT1:NM_015613:exon2:c.C315T:p.G105G	rs10887259	NaN	0.460663	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	27	29.755454	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	0	10	13
chr10	86001267	86001267	T	T	upstream	LRIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	74	67	0	0
chr10	86005482	86005482	A	A	intronic	RGR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	86007239	86007239	T	T	intronic	RGR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr10	86132314	86132314	G	A	intronic	CCSER2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr10	86223795	86223795	G	A	intronic	CCSER2	NaN	NaN	NaN	rs11598369	NaN	0.212061	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1460.72	0	NaN	NA	NA	117	2	115	16
chr10	86424218	86424218	G	C	intergenic	CCSER2,LINC01519	dist=145941;dist=528959	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	871642	871642	T	C	intronic	LARP4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr10	87362105	87362105	G	A	exonic	GRID1	NaN	synonymous SNV	GRID1:NM_017551:exon16:c.C2955T:p.I985I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.010478544758409246	NA	0	0	8.187312	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	83	75	8	0
chr10	87487601	87487601	T	G	intronic	GRID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr10	87755137	87755137	A	C	intronic	GRID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	87755139	87755139	G	A	intronic	GRID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	87830693	87830693	G	A	intronic	GRID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.00139776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	87965993	87965993	T	T	intronic	GRID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	87965994	87965994	A	A	intronic	GRID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	87965995	87965995	T	T	intronic	GRID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	87966000	87966000	T	T	intronic	GRID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	87986820	87986820	T	C	intronic	GRID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	87986821	87986821	C	A	intronic	GRID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	88006324	88006324	T	A	intronic	GRID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr10	88049275	88049275	C	G	intronic	GRID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr10	88127532	88127532	G	A	intergenic	GRID1,WAPAL	dist=1282;dist=67481	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	88127538	88127538	T	A	intergenic	GRID1,WAPAL	dist=1288;dist=67475	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	88127540	88127540	T	C	intergenic	GRID1,WAPAL	dist=1290;dist=67473	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	88127543	88127543	T	G	intergenic	GRID1,WAPAL	dist=1293;dist=67470	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	88134722	88134722	G	G	intergenic	GRID1,WAPAL	dist=8472;dist=60291	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	88197244	88197244	T	C	UTR3	WAPAL	NM_015045:c.*56A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr10	88233628	88233628	C	G	intronic	WAPAL	NaN	NaN	NaN	rs3758520	NaN	0.263778	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	149.516179	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	0	52	40
chr10	88256943	88256943	C	T	intronic	WAPAL	NaN	NaN	NaN	rs4934215	NaN	0.961062	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	192.497467	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	0	66	58
chr10	88421016	88421016	G	A	intronic	OPN4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.264295	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	78	73	5	0
chr10	88422116	88422116	C	T	exonic	OPN4	NaN	nonsynonymous SNV	OPN4:NM_033282:exon8:c.C1181T:p.T394I,OPN4:NM_001030015:exon9:c.C1214T:p.T405I	rs1079610	NaN	0.753195	0.52	T	0.001	B	0.003	B	0.041	N	0.999	P	1.2	L	1.47	T	-1.018	T	0.000	T	0.305	-0.310	2.522	1.06	-0.014	2.962	10.994	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	56.1246	0	NaN	NA	NA	88	63	25	33
chr10	88423623	88423623	A	A	intronic	OPN4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr10	88425555	88425555	C	A	UTR3	OPN4	NM_033282:c.*47C>A,NM_001030015:c.*47C>A	NaN	NaN	rs2803554	NaN	0.139976	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	9	7	2	15
chr10	88439040	88439040	T	C	intronic	LDB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr10	88439723	88439723	A	A	intronic	LDB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	17	13	0	0
chr10	88439724	88439724	T	T	intronic	LDB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	19	16	0	0
chr10	88445385	88445385	G	C	intronic	LDB3	NaN	NaN	NaN	rs3740345	NaN	0.624201	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	68.751723	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	0	24	52
chr10	88466415	88466415	C	T	exonic	LDB3	NaN	nonsynonymous SNV	LDB3:NM_007078:exon7:c.C1024T:p.H342Y	NaN	NaN	NaN	1	T	0.104	B	0.044	B	.	.	1.000	N	0.69	N	0.64	T	-1.007	T	0.058	T	0.184	-1.424	0.021	0.939	0.232	0.420	3.794	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.393771	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	47	43	4	0
chr10	88469769	88469769	T	TC	exonic	LDB3	NaN	frameshift substitution	LDB3:NM_001080114:exon8:c.863_863delinsTC,LDB3:NM_007078:exon8:c.1193_1193delinsTC,LDB3:NM_001171610:exon9:c.1208_1208delinsTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.2388	0	NaN	NA	NA	15	11	4	0
chr10	88478684	88478684	A	G	intronic	LDB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	88485821	88485821	T	T	intronic	LDB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	88492598	88492598	T	T	intronic	LDB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr10	88702350	88702350	G	C	exonic	MMRN2	NaN	nonsynonymous SNV	MMRN2:NM_024756:exon6:c.C2191G:p.H731D	rs4934281	NaN	0.952077	0.75	T	0.0	B	0.0	B	0.068	N	1.000	P	-0.895	N	2.61	T	-0.975	T	0.000	T	0.027	0.437	6.376	1.02	-0.017	0.541	11.723	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	62.518645	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	57
chr10	88704199	88704199	A	A	intronic	MMRN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr10	88704208	88704208	A	A	intronic	MMRN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr10	88704211	88704211	T	T	intronic	MMRN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr10	88718436	88718436	A	C	UTR5	SNCG	NM_003087:c.-19A>C	NaN	NaN	rs1800373	NaN	0.538139	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.357917	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	67	51	16	37
chr10	88719973	88719973	C	T	intronic	SNCG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.03670745272524988	NA	0	0	4.067342	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	19	16	3	0
chr10	88722596	88722596	T	T	intronic	SNCG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	88827952	88827952	T	A	intronic	GLUD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.753572	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	316	292	24	0
chr10	88827955	88827955	G	A	intronic	GLUD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.39037	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	317	300	17	0
chr10	88827956	88827956	A	G	intronic	GLUD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.430179	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	268	251	17	0
chr10	88854299	88854299	G	A	exonic	GLUD1	NaN	synonymous SNV	GLUD1:NM_005271:exon1:c.C228T:p.R76R	NaN	NaN	NaN	0.03	D	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	-0.772	T	0.227	T	.	2.041	12.78	1.94	0.281	1.340	6.702	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.569851	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	34	30	4	0
chr10	89473050	89473050	A	A	exonic	PAPSS2	NaN	synonymous SNV	PAPSS2:NM_001015880:exon3:c.A364A:p.I122I,PAPSS2:NM_004670:exon3:c.A364A:p.I122I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	89487026	89487026	T	T	intronic	PAPSS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	89514630	89514630	A	T	intronic	ATAD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr10	89530630	89530630	T	T	intronic	ATAD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr10	89544279	89544279	G	A	exonic	ATAD1	NaN	synonymous SNV	ATAD1:NM_032810:exon5:c.C531T:p.V177V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.428236	clustered_read_position	REJECT	34	29	5	0
chr10	89574176	89574176	T	T	intronic	ATAD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	89690896	89690896	T	A	intronic	PTEN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.08563	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr10	90034702	90034702	T	T	UTR3	RNLS	NM_018363:c.*16A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr10	90045087	90045087	A	C	UTR3	RNLS	NM_001031709:c.*24T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	90122123	90122123	T	G	intronic	RNLS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr10	90342909	90342909	T	C	exonic	RNLS	NaN	synonymous SNV	RNLS:NM_001031709:exon1:c.A39G:p.G13G,RNLS:NM_018363:exon1:c.A39G:p.G13G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.162278	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	226	194	32	0
chr10	90351246	90351246	A	T	exonic	LIPJ	NaN	stopgain	LIPJ:NM_001010939:exon4:c.A121T:p.K41X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.158	N	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.267	22.3	3.18	0.795	0.546	7.079	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.021206787678886417	NA	0	0	NaN	NA	NA	196	154	42	0
chr10	90427282	90427282	CTA	CAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	125.139	0	NaN	NA	NA	39	12	6	0
chr10	90431569	90431569	T	T	intronic	LIPF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	15	14	0	0
chr10	90435280	90435280	G	T	intronic	LIPF	NaN	NaN	NaN	rs17333900	NaN	0.0850639	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.384109	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	7	3	12
chr10	90484423	90484423	A	A	intronic	LIPK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr10	90486734	90486734	A	G	intronic	LIPK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	90499719	90499719	A	C	intronic	LIPK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	90499720	90499720	T	A	intronic	LIPK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	90499721	90499721	T	G	intronic	LIPK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	90499724	90499724	C	G	intronic	LIPK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	90499746	90499746	T	C	intronic	LIPK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.959856	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	339	331	8	0
chr10	90534792	90534792	G	T	intronic	LIPN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.960924	nearby_gap_events	REJECT	126	119	7	0
chr10	90574221	90574221	TC	T,TG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	507.736	0	NaN	NA	NA	53	0	10	9
chr10	90574684	90574684	A	A	intronic	LIPM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	135	80	0	0
chr10	90577593	90577593	T	C	exonic	LIPM	NaN	synonymous SNV	LIPM:NM_001128215:exon8:c.T942C:p.S314S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.54211	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	59	54	5	0
chr10	90585819	90585819	G	A	exonic	ANKRD22	NaN	synonymous SNV	ANKRD22:NM_144590:exon4:c.C375T:p.G125G	rs7893917	NaN	0.341254	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.316527	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	64	48	16	38
chr10	90588154	90588154	A	G	intronic	ANKRD22	NaN	NaN	NaN	rs1977537	NaN	0.927915	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.595229	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	28	9	51
chr10	90588535	90588535	G	A	intronic	ANKRD22	NaN	NaN	NaN	rs1029024	NaN	0.701278	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	42.7392	35	NaN	NA	NA	87	67	20	38
chr10	90661372	90661372	T	C	intronic	STAMBPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	2	0
chr10	90683124	90683124	T	T	UTR3	STAMBPL1	NM_020799:c.*143T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	35	32	0	0
chr10	90695165	90695165	T	G	ncRNA_exonic	ACTA2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	90695166	90695166	T	G	ncRNA_exonic	ACTA2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr10	90699236	90699236	T	T	ncRNA_exonic	ACTA2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	90707022	90707022	A	T	exonic	ACTA2	NaN	nonsynonymous SNV	ACTA2:NM_001141945:exon3:c.T251A:p.M84K,ACTA2:NM_001613:exon3:c.T251A:p.M84K	NaN	NaN	NaN	0	D	0.939	P	0.409	B	0.000	D	1.000	D	5.25	H	-3.52	D	1.060	D	0.957	D	0.977	3.444	17.66	5.57	2.105	9.339	14.548	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.418807	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	113	102	11	0
chr10	90708530	90708530	T	T	intronic	ACTA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr10	90762756	90762756	T	T	intronic	FAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr10	90967126	90967126	A	A	upstream	CH25H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	90983603	90983603	A	G	intronic	LIPA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr10	91007360	91007360	T	G	exonic	LIPA	NaN	nonsynonymous SNV	LIPA:NM_000235:exon2:c.A46C:p.T16P,LIPA:NM_001127605:exon2:c.A46C:p.T16P	rs1051338	NaN	0.286142	0.21	T	0.002	B	0.002	B	.	.	0.000	P	0	N	-0.39	T	-1.083	T	0.000	T	0.437	1.653	11.49	3.72	2.216	-0.090	7.513	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	169	134	35	33
chr10	91061995	91061995	A	A	intronic	IFIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr10	91065628	91065628	T	A	intronic	IFIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr10	91065630	91065630	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	0	2,2	0
chr10	91137755	91137755	A	T	upstream	IFIT1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.17786561264821815	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr10	91152519	91152519	A	G	intronic	IFIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.697275	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	101	88	13	0
chr10	91222087	91222087	A	G	ncRNA_intronic	SLC16A12-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr10	91222089	91222089	A	T	ncRNA_intronic	SLC16A12-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr10	91353785	91353785	A	A	intronic	PANK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	91470687	91470687	A	G	intronic	KIF20B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.431754	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	335	328	7	0
chr10	91479285	91479285	T	A	exonic	KIF20B	NaN	nonsynonymous SNV	KIF20B:NM_001284259:exon13:c.T1544A:p.V515E,KIF20B:NM_016195:exon13:c.T1544A:p.V515E	NaN	NaN	NaN	1	T	0.001	B	0.002	B	0.169	N	1.000	N	0.29	N	1.1	T	-0.992	T	0.043	T	0.157	-1.634	0.013	3.07	0.352	0.814	3.723	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.634159	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	118	102	16	0
chr10	91479286	91479286	A	T	exonic	KIF20B	NaN	synonymous SNV	KIF20B:NM_001284259:exon13:c.A1545T:p.V515V,KIF20B:NM_016195:exon13:c.A1545T:p.V515V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.041146155773754245	NA	0	0	NaN	NA	NA	53	40	13	0
chr10	91479291	91479291	G	G	exonic	KIF20B	NaN	synonymous SNV	KIF20B:NM_001284259:exon13:c.G1550G:p.R517R,KIF20B:NM_016195:exon13:c.G1550G:p.R517R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	121	109	0	0
chr10	91479489	91479489	A	A	intronic	KIF20B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr10	91484754	91484754	T	T	intronic	KIF20B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	19	19	0	0
chr10	91497595	91497595	T	C	exonic	KIF20B	NaN	synonymous SNV	KIF20B:NM_001284259:exon20:c.T2997C:p.S999S,KIF20B:NM_016195:exon20:c.T2877C:p.S959S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.820697	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	77	73	4	0
chr10	91518616	91518616	A	G	exonic	KIF20B	NaN	nonsynonymous SNV	KIF20B:NM_001284259:exon27:c.A4657G:p.I1553V,KIF20B:NM_016195:exon27:c.A4537G:p.I1513V	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.0	B	0.585	N	1.000	N	1.7	L	1.0	T	-0.947	T	0.072	T	0.024	2.375	13.90	-2.14	-0.318	0.192	8.546	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.903496	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	179	147	32	0
chr10	91625158	91625158	G	A	intergenic	LINC00865,LINC01375	dist=24540;dist=50088	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	91625159	91625159	G	A	intergenic	LINC00865,LINC01375	dist=24541;dist=50087	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	92635940	92635940	A	A	intronic	RPP30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr10	92638610	92638610	A	A	intronic	RPP30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	92638635	92638635	G	A	intronic	RPP30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.889826	clustered_read_position	REJECT	56	51	5	0
chr10	92655559	92655559	T	A	intronic	RPP30	NaN	NaN	NaN	rs10881848	NaN	0.285543	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	131.151218	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	44	0	44	18
chr10	92656232	92656232	A	A	intronic	RPP30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	92677651	92677651	A	A	intronic	ANKRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr10	92678871	92678871	A	C	intronic	ANKRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.720803	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	45	37	8	0
chr10	92680118	92680118	A	G	intronic	ANKRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr10	93024117	93024117	T	A	intronic	PCGF5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	24.7293	0	NaN	NA	NA	7	3	3	3
chr10	931705	931705	A	T	intronic	LARP4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.713936	nearby_gap_events	REJECT	37	32	5	0
chr10	93244860	93244860	T	T	ncRNA_intronic	HECTD2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr10	93260188	93260188	T	T	ncRNA_intronic	HECTD2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	93604600	93604600	A	T	intronic	TNKS2	NaN	NaN	NaN	rs2297960	NaN	0.402955	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.764495	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	55	42	13	31
chr10	93719923	93719923	A	A	intronic	BTAF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr10	93756409	93756409	A	A	intronic	BTAF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	23	21	0	0
chr10	93771082	93771082	T	C	exonic	BTAF1	NaN	synonymous SNV	BTAF1:NM_003972:exon30:c.T4221C:p.H1407H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.46139	0	NaN	NA	NA	13	11	2	0
chr10	93841275	93841275	A	C	intronic	CPEB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr10	93870792	93870792	A	C	intronic	CPEB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.77185	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	127	122	5	0
chr10	93999232	93999232	G	T	exonic	CPEB3	NaN	synonymous SNV	CPEB3:NM_001178137:exon2:c.C876A:p.L292L,CPEB3:NM_014912:exon2:c.C876A:p.L292L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.17758	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	209	194	15	0
chr10	94050486	94050486	A	A	intronic	CPEB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	94050487	94050487	G	G	intronic	CPEB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	94215477	94215477	A	A	intronic	IDE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	0	0
chr10	94223375	94223375	C	T	intronic	IDE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.90125	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	12	8	4	0
chr10	94266306	94266306	A	G	intronic	IDE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	94266308	94266308	A	G	intronic	IDE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	94268673	94268673	A	T	intronic	IDE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	94268676	94268676	T	A	intronic	IDE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	94393441	94393441	T	C	exonic	KIF11	NaN	synonymous SNV	KIF11:NM_004523:exon14:c.T1764C:p.S588S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.205958	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	202	195	7	0
chr10	94409651	94409651	C	G	exonic	KIF11	NaN	nonsynonymous SNV	KIF11:NM_004523:exon20:c.C2830G:p.R944G	NaN	NaN	NaN	0.12	T	1.0	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	2.095	M	-0.22	T	-0.225	T	0.435	T	0.689	3.991	20.4	4.98	2.617	1.697	13.694	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.929937	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	57	53	4	0
chr10	94409800	94409800	C	T	intronic	KIF11	NaN	NaN	NaN	rs6583833	NaN	0.655351	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.132904	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	7	7	40
chr10	94454321	94454321	T	T	exonic	HHEX	NaN	synonymous SNV	HHEX:NM_002729:exon4:c.T609T:p.N203N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	81	74	0	0
chr10	94545	94545	C	T	intronic	TUBB8	NaN	NaN	NaN	rs10904047	NaN	0.671526	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	74.9769	0	NaN	NA	NA	8	0	8	40
chr10	94653417	94653417	A	A	intronic	EXOC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr10	94654578	94654578	T	T	exonic	EXOC6	NaN	synonymous SNV	EXOC6:NM_001013848:exon3:c.T286T:p.F96F,EXOC6:NM_019053:exon3:c.T301T:p.F101F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	55	49	0	0
chr10	94821387	94821387	G	C	intronic	CYP26C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	853.288	0	NaN	NA	NA	144	29	111	13
chr10	94825715	94825715	G	A	exonic	CYP26C1	NaN	synonymous SNV	CYP26C1:NM_183374:exon5:c.G864A:p.E288E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.101626	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	17	14	3	0
chr10	94833949	94833949	T	T	intronic	CYP26A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	20	19	0	0
chr10	94835152	94835152	G	T	intronic	CYP26A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	24	7.724809	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	4	1	3	0
chr10	94836529	94836529	A	T	intronic	CYP26A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	94836530	94836530	A	G	intronic	CYP26A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr10	95083039	95083039	C	T	exonic	MYOF	NaN	nonsynonymous SNV	MYOF:NM_133337:exon46:c.G5309A:p.R1770Q,MYOF:NM_013451:exon47:c.G5348A:p.R1783Q	rs11594445	NaN	0.0447284	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.885	M	-2.17	D	-0.058	T	0.308	T	0.761	5.723	36	5.89	2.797	7.818	20.256	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	982.282	0	NaN	NA	NA	106	0	106	6
chr10	95085690	95085690	C	G	exonic	MYOF	NaN	nonsynonymous SNV	MYOF:NM_133337:exon45:c.G5125C:p.A1709P,MYOF:NM_013451:exon46:c.G5164C:p.A1722P	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	D	-1.79	N	-1.56	D	-0.732	T	0.158	T	0.359	0.367	5.995	2.86	0.797	4.246	16.845	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.289081	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	26	20	6	0
chr10	95095667	95095667	A	G	intronic	MYOF	NaN	NaN	NaN	rs7097740	NaN	0.430112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	138.112976	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	0	45	20
chr10	95152624	95152624	T	C	intronic	MYOF	NaN	NaN	NaN	rs788084	NaN	0.317891	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	115.44492	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	0	41	40
chr10	95162140	95162140	C	A	intronic	MYOF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.004955552374930458	NA	0	0	NaN	NA	NA	95	64	31	0
chr10	95163985	95163985	A	C	intronic	MYOF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.282533	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	290	279	11	0
chr10	95226	95226	A	T	upstream	TUBB8	NaN	NaN	NaN	rs6560829	NaN	0.95028	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.222668	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	52
chr10	95229	95229	C	T	upstream	TUBB8	NaN	NaN	NaN	rs6560830	NaN	0.95028	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.328207	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	54
chr10	95241986	95241986	C	A	UTR5	MYOF	NM_013451:c.-35G>T,NM_133337:c.-35G>T	NaN	NaN	rs882873	NaN	0.23123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.281732	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	14
chr10	95241999	95241999	A	C	UTR5	MYOF	NM_013451:c.-48T>G,NM_133337:c.-48T>G	NaN	NaN	rs947597	NaN	0.941494	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.813191	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	51
chr10	95259952	95259952	A	G	exonic	CEP55	NaN	synonymous SNV	CEP55:NM_001127182:exon2:c.A144G:p.K48K,CEP55:NM_018131:exon2:c.A144G:p.K48K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.952548	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	164	157	7	0
chr10	95279381	95279381	T	T	intronic	CEP55	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	95279506	95279506	A	T	exonic	CEP55	NaN	nonsynonymous SNV	CEP55:NM_001127182:exon8:c.A1133T:p.H378L,CEP55:NM_018131:exon8:c.A1133T:p.H378L	rs2293277	NaN	0.559704	0.13	T	0.483	P	0.084	B	0.006	N	0.035	P	1.59	L	2.21	T	-1.097	T	0.000	T	0.158	3.849	19.55	5.79	2.208	6.083	14.690	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	78	56	22	50
chr10	95326772	95326772	C	T	exonic	FFAR4	NaN	nonsynonymous SNV	FFAR4:NM_001195755:exon1:c.C295T:p.R99C,FFAR4:NM_181745:exon1:c.C295T:p.R99C	NaN	NaN	NaN	0.17	T	1.0	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	1.7	L	1.22	T	-0.877	T	0.200	T	0.896	4.901	28.2	5.22	2.714	2.314	18.977	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.840955		KEEP	135	128	7	0
chr10	95346923	95346923	T	T	intronic	FFAR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr10	95347381	95347381	C	A	UTR3	FFAR4	NM_181745:c.*15C>A,NM_001195755:c.*15C>A	NaN	NaN	rs41290218	NaN	0.20028	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.009320939859222985	Somatic	1073.27	0	NaN	NA	NA	83	60	23	8
chr10	95353526	95353526	T	T	intronic	RBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr10	95389083	95389083	A	G	intronic	PDE6C	NaN	NaN	NaN	rs714549	NaN	0.396166	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	238.7117	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	125	27	98	35
chr10	95400365	95400365	A	A	intronic	PDE6C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	95405667	95405667	A	C	intronic	PDE6C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	0	5	0
chr10	95421708	95421708	C	G	intronic	PDE6C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	13	6	4	0
chr10	95425046	95425046	T	T	intronic	PDE6C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr10	95441287	95441287	T	A	exonic	FRA10AC1	NaN	nonsynonymous SNV	FRA10AC1:NM_145246:exon11:c.A737T:p.K246I	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.994	D	0.855	P	0.000	D	1.000	D	2.135	M	1.73	T	-1.019	T	0.116	T	0.495	2.246	13.47	4.04	0.925	2.603	8.601	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.822098	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	151	144	7	0
chr10	95441289	95441289	A	G	exonic	FRA10AC1	NaN	synonymous SNV	FRA10AC1:NM_145246:exon11:c.T735C:p.H245H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.564219	nearby_gap_events	REJECT	140	132	8	0
chr10	95441348	95441348	C	T	exonic	FRA10AC1	NaN	nonsynonymous SNV	FRA10AC1:NM_145246:exon11:c.G676A:p.E226K	NaN	NaN	NaN	0.23	T	0.993	D	0.971	D	0.000	D	1.000	D	2.135	M	1.87	T	-0.980	T	0.153	T	0.659	4.062	20.9	5.17	2.572	4.014	15.746	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.962892	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	95	87	8	0
chr10	95459817	95459817	C	T	exonic	FRA10AC1	NaN	nonsynonymous SNV	FRA10AC1:NM_145246:exon2:c.G47A:p.R16H	rs726817	NaN	0.622604	0.3	T	0.001	B	0.001	B	0.049	N	1.000	P	-0.345	N	1.96	T	-1.027	T	0.000	T	0.047	0.784	8.136	4.07	0.958	0.538	5.582	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	196.774769	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	67	0	67	51
chr10	95518149	95518149	A	A	intronic	LGI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr10	95552925	95552925	T	C	intronic	LGI1	NaN	NaN	NaN	rs1108877	NaN	0.240615	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	272.696	0	NaN	NA	NA	84	33	51	1
chr10	95557330	95557330	C	A	exonic	LGI1	NaN	nonsynonymous SNV	LGI1:NM_005097:exon8:c.C1444A:p.L482I	NaN	NaN	NaN	0.15	T	0.005	B	0.03	B	0.003	N	1.000	D	-0.205	N	-1.47	T	-0.698	T	0.250	T	0.213	1.213	9.923	5.17	2.683	1.991	13.797	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.570278	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	345	337	8	0
chr10	95557583	95557583	A	T	UTR3	LGI1	NM_005097:c.*23A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	95987031	95987031	A	C	intronic	PLCE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	95987032	95987032	A	G	intronic	PLCE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	95987033	95987033	T	A	intronic	PLCE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr10	96014791	96014791	A	G	exonic	PLCE1	NaN	nonsynonymous SNV	PLCE1:NM_001165979:exon10:c.A2615G:p.N872S,PLCE1:NM_016341:exon11:c.A3539G:p.N1180S	NaN	NaN	NaN	0.91	T	0.018	B	0.016	B	0.003	N	0.996	N	0.69	N	1.92	T	-0.982	T	0.029	T	0.069	1.792	11.95	3.43	2.176	2.028	4.725	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.833131	possible_contamination	REJECT	51	47	4	0
chr10	96033493	96033493	A	A	intronic	PLCE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	96043474	96043474	A	C	ncRNA_intronic	PLCE1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	96043476	96043476	A	T	ncRNA_intronic	PLCE1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	96058212	96058212	C	T	exonic	PLCE1	NaN	synonymous SNV	PLCE1:NM_001165979:exon23:c.C4320T:p.I1440I,PLCE1:NM_001288989:exon24:c.C5196T:p.I1732I,PLCE1:NM_016341:exon24:c.C5244T:p.I1748I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.393859	nearby_gap_events	REJECT	88	80	8	0
chr10	96066160	96066160	T	C	intronic	PLCE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr10	96081865	96081865	A	A	intronic	PLCE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr10	96100267	96100267	A	G	intronic	NOC3L	NaN	NaN	NaN	rs77550343	NaN	0.147364	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.15247	0	NaN	NA	NA	64	56	10	3
chr10	96100268	96100268	G	A	intronic	NOC3L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	20.4862	0	NaN	NA	NA	58	45	14	10
chr10	96104665	96104665	T	G	exonic	NOC3L	NaN	nonsynonymous SNV	NOC3L:NM_022451:exon12:c.A1415C:p.E472A	rs3758526	NaN	0.206869	0.22	T	0.962	D	0.637	P	0.000	D	0.002	P	1.66	L	2.38	T	-0.916	T	0.000	T	0.234	3.517	17.97	4.92	1.095	7.007	13.471	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	74.063518	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	12	28	16
chr10	96114835	96114835	G	A	exonic	NOC3L	NaN	nonsynonymous SNV	NOC3L:NM_022451:exon6:c.C581T:p.P194L	rs12572897	NaN	0.20607	0.28	T	0.001	B	0.002	B	0.001	D	0.000	P	0.345	N	2.6	T	-0.903	T	0.000	T	0.058	1.779	11.91	4.02	1.490	4.602	12.032	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	477.558	0	NaN	NA	NA	117	47	70	15
chr10	96121270	96121270	C	T	intronic	NOC3L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	32	18	10	0
chr10	96271298	96271298	A	C	intronic	TBC1D12	NaN	NaN	NaN	rs2860761	NaN	0.992412	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.357077	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	1	24	54
chr10	96305729	96305729	T	C	intronic	HELLS	NaN	NaN	NaN	rs10882474	NaN	0.561701	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.833135	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	6	17	32
chr10	96334578	96334578	T	C	intronic	HELLS	NaN	NaN	NaN	rs7079934	NaN	0.521765	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	176.588203	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	98	30	68	35
chr10	96340925	96340925	G	C	intronic	HELLS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	96352363	96352363	A	A	intronic	HELLS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	18	16	0	0
chr10	96357022	96357022	A	G	intronic	HELLS	NaN	NaN	NaN	rs2274417	NaN	0.438099	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.454108	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	9	10	37
chr10	96447510	96447510	T	C	intronic	CYP2C18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	19	6	13	0
chr10	96480155	96480155	A	C	exonic	CYP2C18	NaN	nonsynonymous SNV	CYP2C18:NM_001128925:exon5:c.A645C:p.E215D,CYP2C18:NM_000772:exon6:c.A822C:p.E274D	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.164	B	0.084	B	0.001	U	1.000	D	1.88	L	2.72	T	-1.085	T	0.031	T	0.471	2.845	15.48	-0.885	-0.365	0.772	8.033	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.27795	clustered_read_position	REJECT	5	0	5	0
chr10	96480156	96480156	A	T	exonic	CYP2C18	NaN	stopgain	CYP2C18:NM_001128925:exon5:c.A646T:p.K216X,CYP2C18:NM_000772:exon6:c.A823T:p.K275X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	U	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	6.619	37	4.2	1.744	2.448	11.286	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.27795	clustered_read_position	REJECT	5	0	5	0
chr10	96480357	96480357	T	T	intronic	CYP2C18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	96480358	96480358	T	T	intronic	CYP2C18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	96541616	96541616	G	A	exonic	CYP2C19	NaN	synonymous SNV	CYP2C19:NM_000769:exon5:c.G681A:p.P227P	rs4244285	NaN	0.221446	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	189	28	161	13
chr10	96580238	96580238	T	T	intronic	CYP2C19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr10	96701957	96701957	T	C	exonic	CYP2C9	NaN	nonsynonymous SNV	CYP2C9:NM_000771:exon3:c.T340C:p.F114L	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.027	B	0.078	B	0.058	U	0.659	D	1.39	L	-0.32	T	-0.597	T	0.210	T	0.075	1.871	12.21	3.34	1.499	2.417	9.955	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.327769	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	333	327	6	0
chr10	96731788	96731788	A	G	intronic	CYP2C9	NaN	NaN	NaN	rs9332172	NaN	0.18111	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.32238	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	49	39	10	25
chr10	96748893	96748893	C	G	UTR3	CYP2C9	NM_000771:c.*108C>G	NaN	NaN	rs9332242	NaN	0.0479233	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	129	94	35	2
chr10	96817953	96817953	T	T	intronic	CYP2C8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr10	96818325	96818325	C	T	intronic	CYP2C8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr10	96824504	96824504	T	T	intronic	CYP2C8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	96824883	96824883	T	C	intronic	CYP2C8	NaN	NaN	NaN	rs3752988	NaN	0.397165	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	294.354	0	NaN	NA	NA	54	1	53	22
chr10	96954298	96954298	A	G	exonic	ACSM6	NaN	nonsynonymous SNV	ACSM6:NM_207321:exon2:c.A56G:p.E19G	rs591157	NaN	0.389976	0.47	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	-0.345	N	2.06	T	-0.955	T	0.000	T	0.048	0.001	4.021	1.29	-0.131	-0.045	4.526	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	337.119	0	NaN	NA	NA	31	7	24	25
chr10	96954360	96954360	T	A	exonic	ACSM6	NaN	nonsynonymous SNV	ACSM6:NM_207321:exon2:c.T118A:p.C40S	rs11188225	NaN	0.197284	0.73	T	0.038	B	0.007	B	.	.	1.000	P	0.55	N	2.25	T	-0.908	T	0.000	T	0.072	0.311	5.686	-4.37	-1.234	-0.509	1.115	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	117.601756	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	21	44	27
chr10	96971638	96971638	G	A	exonic	ACSM6	NaN	synonymous SNV	ACSM6:NM_207321:exon6:c.G759A:p.R253R	rs75252129	ID=COSM328275,COSM328274;OCCURENCE=1(pancreas)	0.0357428	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	527.648	0	214.234499	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	106	28	78	5
chr10	96972576	96972576	T	T	intronic	ACSM6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr10	96974762	96974762	A	A	intronic	ACSM6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr10	97074887	97074887	T	C	intronic	SORBS1	NaN	NaN	NaN	rs35348091	NaN	0.0315495	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	41.6287	0	NaN	NA	NA	108	84	23	3
chr10	97117349	97117349	T	T	intronic	SORBS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	97117569	97117569	A	A	intronic	SORBS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	971177	971177	T	C	intronic	LARP4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	97156908	97156908	T	C	intronic	SORBS1	NaN	NaN	NaN	rs17110707	NaN	0.180511	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	63.558719	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	37	28	12
chr10	97200782	97200782	A	T	intronic	SORBS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.285341	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	114	100	14	0
chr10	97366497	97366497	T	T	UTR3	ALDH18A1	NM_001017423:c.*22A>A,NM_002860:c.*22A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	97369939	97369939	C	T	intronic	ALDH18A1	NaN	NaN	NaN	rs10882640	NaN	0.279553	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	217.040128	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	125	43	82	41
chr10	97376413	97376413	A	A	intronic	ALDH18A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr10	97385282	97385282	A	A	intronic	ALDH18A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	97423708	97423708	C	A	UTR3	TCTN3	NM_001143973:c.*116G>T,NM_015631:c.*116G>T	NaN	NaN	rs6946	NaN	0.194089	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	177.694108	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	87	21	66	31
chr10	97444365	97444365	T	C	exonic	TCTN3	NaN	nonsynonymous SNV	TCTN3:NM_015631:exon9:c.A986G:p.E329G	NaN	NaN	NaN	0.33	T	1.0	D	0.985	D	0.009	N	1.000	D	1.725	L	-1.62	D	-0.698	T	0.252	T	0.688	3.166	16.59	5.63	2.263	4.852	12.512	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.464224	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	303	297	6	0
chr10	97515892	97515892	T	G	ncRNA_exonic	ENTPD1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	12	5	3	0
chr10	97681924	97681924	A	T	ncRNA_intronic	ENTPD1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr10	97772596	97772596	A	G	ncRNA_intronic	ENTPD1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	97772598	97772598	A	G	ncRNA_intronic	ENTPD1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	97772599	97772599	T	C	ncRNA_intronic	ENTPD1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	97772600	97772600	A	G	ncRNA_intronic	ENTPD1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr10	97779632	97779632	A	G	ncRNA_intronic	ENTPD1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	97817819	97817819	C	T	exonic	CCNJ	NaN	synonymous SNV	CCNJ:NM_001134375:exon6:c.C973T:p.L325L,CCNJ:NM_001134376:exon6:c.C937T:p.L313L,CCNJ:NM_019084:exon6:c.C940T:p.L314L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.042474	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	326	318	8	0
chr10	97919825	97919825	A	G	exonic	ZNF518A	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.033999	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	134	126	8	0
chr10	97975073	97975073	T	C	intronic	BLNK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.735358	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	21	14	7	0
chr10	97975074	97975074	T	C	intronic	BLNK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.840509	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	21	14	7	0
chr10	97976420	97976420	G	A	exonic	BLNK	NaN	nonsynonymous SNV	BLNK:NM_001114094:exon7:c.C596T:p.P199L,BLNK:NM_001258440:exon7:c.C596T:p.P199L,BLNK:NM_001258441:exon7:c.C596T:p.P199L,BLNK:NM_013314:exon7:c.C596T:p.P199L	NaN	NaN	NaN	0.15	T	0.775	P	0.267	B	0.038	N	1.000	N	1.79	L	.	.	-1.025	T	0.095	T	0.211	2.232	13.42	3.08	1.111	1.553	9.681	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.264016		KEEP	61	55	6	0
chr10	98006864	98006864	G	A	intronic	BLNK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	130	80	42	0
chr10	98078239	98078239	A	G	exonic	DNTT	NaN	nonsynonymous SNV	DNTT:NM_001017520:exon2:c.A334G:p.R112G,DNTT:NM_004088:exon2:c.A334G:p.R112G	rs6584066	NaN	0.992812	0.74	T	0.0	B	0.001	B	0.416	N	1.000	P	-0.075	N	0.88	T	-0.966	T	0.000	T	0.052	-1.325	0.032	-3.49	-0.849	-0.023	13.862	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	557.446083	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	196	1	195	58
chr10	98080578	98080578	A	A	intronic	DNTT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	98095576	98095576	A	C	intronic	DNTT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	98095577	98095577	G	T	intronic	DNTT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	98133251	98133251	C	T	intronic	TLL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.159475	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	129	113	16	0
chr10	98156991	98156991	G	T	exonic	TLL2	NaN	nonsynonymous SNV	TLL2:NM_012465:exon11:c.C1336A:p.R446S	NaN	NaN	NaN	0.65	T	1.0	D	0.992	D	0.001	D	1.000	D	2.12	M	1.33	T	-0.868	T	0.198	T	0.936	5.213	33	4.79	2.481	6.187	17.024	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.959173	clustered_read_position	REJECT	66	60	6	0
chr10	98164919	98164919	T	T	intronic	TLL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	98165146	98165146	A	G	intronic	TLL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr10	98217893	98217893	A	T	intronic	TLL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	98319491	98319491	T	A	exonic	TM9SF3	NaN	synonymous SNV	TM9SF3:NM_020123:exon5:c.A585T:p.V195V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.603669	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	40	30	10	0
chr10	98336607	98336607	A	C	intronic	TM9SF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.644671	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	66	57	9	0
chr10	98336611	98336611	A	T	intronic	TM9SF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.69247	nearby_gap_events	REJECT	66	54	12	0
chr10	98355427	98355427	T	C	intronic	PIK3AP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.43964	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	106	96	10	0
chr10	98379928	98379928	T	C	intronic	PIK3AP1	NaN	NaN	NaN	rs3748235	NaN	0.605032	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	50.1428	0	17.84088	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	10
chr10	98386558	98386558	G	A	exonic	PIK3AP1	NaN	synonymous SNV	PIK3AP1:NM_152309:exon10:c.C1576T:p.L526L	rs4344416	NaN	0.891773	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	164.102333	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	64	1	63	57
chr10	98428534	98428534	A	G	intronic	PIK3AP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	98561550	98561550	G	T	intergenic	PIK3AP1,MIR607	dist=81271;dist=26876	NaN	NaN	rs185762176	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	17	6	11	0
chr10	98714676	98714676	T	T	intronic	LCOR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	98761117	98761117	A	A	intronic	SLIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	98771049	98771049	A	G	intronic	SLIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	98794142	98794142	T	T	intronic	SLIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr10	98794199	98794199	C	G	intronic	SLIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	77	NaN	NA	NA	81	42	39	0
chr10	98797609	98797609	A	G	intronic	SLIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	2	0
chr10	98803052	98803052	T	T	intronic	SLIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr10	98806901	98806901	A	A	intronic	SLIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr10	98820036	98820036	A	A	intronic	SLIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	98820604	98820604	A	A	intronic	SLIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr10	98823501	98823501	A	A	intronic	SLIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	98859493	98859493	G	G	intronic	SLIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	98859541	98859541	G	G	intronic	SLIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	99003573	99003573	T	T	ncRNA_intronic	ARHGAP19-SLIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	99006083	99006083	G	A	exonic	ARHGAP19	NaN	synonymous SNV	ARHGAP19:NM_001204300:exon6:c.C852T:p.Y284Y,ARHGAP19:NM_001256423:exon7:c.C912T:p.Y304Y,ARHGAP19:NM_032900:exon7:c.C939T:p.Y313Y	rs13439	ID=COSM147011;OCCURENCE=1(stomach)	0.252196	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.320146	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	10	8	29
chr10	99019104	99019104	A	C	ncRNA_intronic	ARHGAP19-SLIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr10	99025611	99025611	T	A	ncRNA_intronic	ARHGAP19-SLIT1	NaN	NaN	NaN	rs10882884	NaN	0.503794	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	205	147	58	42
chr10	99079878	99079878	G	A	exonic	FRAT1	NaN	nonsynonymous SNV	FRAT1:NM_005479:exon1:c.G668A:p.R223Q	NaN	NaN	NaN	0.12	T	1.0	D	0.953	D	0.063	U	0.716	D	1.39	L	.	.	-0.527	T	0.229	T	0.245	4.482	24.0	3.8	2.109	1.615	11.333	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.650023	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	19	16	3	0
chr10	99116903	99116903	C	T	exonic	RRP12	NaN	nonsynonymous SNV	RRP12:NM_001284337:exon31:c.G3542A:p.R1181Q,RRP12:NM_001145114:exon32:c.G3659A:p.R1220Q,RRP12:NM_015179:exon34:c.G3842A:p.R1281Q	rs1048445	NaN	0.283347	0.52	T	0.013	B	0.003	B	0.004	N	0.804	P	-1.24	N	1.56	T	-0.950	T	0.000	T	0.052	1.543	11.11	3.1	0.374	2.901	10.381	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.437989	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	4	4	29
chr10	99118223	99118223	T	C	intronic	RRP12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr10	99118382	99118382	T	C	intronic	RRP12	NaN	NaN	NaN	rs2297988	NaN	0.425519	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	138	110	28	39
chr10	99123540	99123540	T	T	intronic	RRP12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	99125914	99125914	T	C	exonic	RRP12	NaN	nonsynonymous SNV	RRP12:NM_001284337:exon26:c.A3168G:p.I1056M,RRP12:NM_001145114:exon27:c.A3285G:p.I1095M,RRP12:NM_015179:exon29:c.A3468G:p.I1156M	NaN	NaN	NaN	0.04	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.02	M	0.93	T	-0.375	T	0.331	T	0.728	3.498	17.88	3.17	0.410	1.806	12.412	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.512526		KEEP	52	46	6	0
chr10	99130127	99130127	A	G	intronic	RRP12	NaN	NaN	NaN	rs3737194	NaN	0.465455	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.738558	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	23	8	30
chr10	99131726	99131726	T	C	intronic	RRP12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	2	5	0
chr10	99133305	99133305	G	A	intronic	RRP12	NaN	NaN	NaN	rs376505249	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.462456	nearby_gap_events	REJECT	40	35	5	0
chr10	99139609	99139609	T	C	intronic	RRP12	NaN	NaN	NaN	rs11189175	NaN	0.403355	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	46.616949	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	109	83	26	39
chr10	99140787	99140787	C	C	intronic	RRP12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	31	31	0	0
chr10	99141321	99141321	G	A	intronic	RRP12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr10	99141326	99141326	C	C	intronic	RRP12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr10	99141437	99141437	T	T	intronic	RRP12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr10	99141484	99141484	C	T	exonic	RRP12	NaN	synonymous SNV	RRP12:NM_001284337:exon8:c.G1008A:p.T336T,RRP12:NM_001145114:exon9:c.G1125A:p.T375T,RRP12:NM_015179:exon11:c.G1308A:p.T436T	rs12218483	ID=COSM1350177;OCCURENCE=6(large_intestine)	0.26278	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	119.277	0	NaN	NA	NA	158	110	48	25
chr10	99147975	99147975	T	C	intronic	RRP12	NaN	NaN	NaN	rs869967	NaN	0.405152	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	89	NaN	NA	NA	146	129	17	38
chr10	99150160	99150160	T	T	intronic	RRP12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr10	99153540	99153540	T	G	intronic	RRP12	NaN	NaN	NaN	rs7898743	NaN	0.502596	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	22.6923	0	NaN	NA	NA	26	20	6	42
chr10	99196335	99196335	C	A	intronic	EXOSC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.377474	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	70	66	4	0
chr10	99203124	99203124	A	A	intronic	EXOSC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	99205395	99205395	T	T	intronic	EXOSC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr10	99212315	99212315	A	A	intronic	ZDHHC16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	99212581	99212581	T	A	intronic	ZDHHC16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	12	4	7	0
chr10	99214596	99214596	G	A	intronic	ZDHHC16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.354288	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	64	56	8	2
chr10	99214605	99214605	T	G	intronic	ZDHHC16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.929351	nearby_gap_events	REJECT	51	39	12	0
chr10	99216481	99216481	T	T	intronic	ZDHHC16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr10	99219777	99219777	T	T	intronic	MMS19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr10	99220383	99220383	T	T	intronic	MMS19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	99220543	99220543	G	T	intronic	MMS19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.756683	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	249	239	10	0
chr10	99227974	99227974	T	T	intronic	MMS19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	99237027	99237027	T	T	intronic	MMS19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	99327526	99327526	T	T	intronic	UBTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	99327905	99327905	G	T	intronic	UBTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.276366	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	101	96	5	0
chr10	99338439	99338439	A	A	intronic	ANKRD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr10	99359411	99359411	GC	GCT,G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	64.3082	0	NaN	NA	NA	8	0	2	1
chr10	99359412	99359412	C	C	intronic	HOGA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr10	99359739	99359739	T	C	intronic	HOGA1	NaN	NaN	NaN	rs2297644	ID=COSN163727;OCCURENCE=1(breast)	0.10024	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	55.476444	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	20
chr10	99400549	99400549	A	A	exonic	PI4K2A	NaN	synonymous SNV	PI4K2A:NM_018425:exon1:c.A50A:p.D17D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	99422648	99422648	A	G	intronic	PI4K2A	NaN	NaN	NaN	rs7905087	ID=COSN163728;OCCURENCE=1(breast)	0.406949	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	101.53	0	NaN	NA	NA	129	0	129	7
chr10	99437606	99437606	T	A	UTR3	AVPI1	NM_021732:c.*20A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr10	99439673	99439673	C	G	splicing	AVPI1	NaN	NaN	NaN	rs3818780	NaN	0.21246	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	177	132	45	18
chr10	99439696	99439696	A	G	intronic	AVPI1	NaN	NaN	NaN	rs45491602	NaN	0.21246	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	179	131	48	18
chr10	99502769	99502769	A	C	intronic	ZFYVE27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	23.2522	20	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr10	99508159	99508159	A	C	intronic	ZFYVE27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr10	99511278	99511278	A	T	intronic	ZFYVE27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr10	99516955	99516955	G	A	intronic	ZFYVE27	NaN	NaN	NaN	rs10882995	NaN	0.561102	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	891.376	0	NaN	NA	NA	152	32	120	32
chr10	99519097	99519097	A	G	UTR3	ZFYVE27	NM_144588:c.*40A>G,NM_001174121:c.*40A>G,NM_001174122:c.*40A>G,NM_001174120:c.*40A>G,NM_001174119:c.*40A>G,NM_001002262:c.*40A>G,NM_001002261:c.*40A>G	NaN	NaN	rs1981237	NaN	0.679712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	231.69	0	NaN	NA	NA	40	13	27	53
chr10	99521811	99521811	T	G	intergenic	ZFYVE27,SFRP5	dist=1147;dist=4697	NaN	NaN	rs7916164	NaN	0.708067	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr10	99530851	99530851	C	A	intronic	SFRP5	NaN	NaN	NaN	rs4244330	NaN	0.561102	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	20	8	12	0
chr10	99619379	99619379	T	C	intronic	GOLGA7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.466997	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	348	340	8	0
chr10	99619464	99619464	A	A	intronic	GOLGA7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr10	99642664	99642664	A	A	intronic	CRTAC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr10	99651450	99651450	G	T	intronic	CRTAC1	NaN	NaN	NaN	rs510393	NaN	0.284744	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr10	99656671	99656671	C	C	exonic	CRTAC1	NaN	synonymous SNV	CRTAC1:NM_001206528:exon9:c.G1211G:p.G404G,CRTAC1:NM_018058:exon9:c.G1211G:p.G404G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr10	99667718	99667718	T	T	intronic	CRTAC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	99677449	99677449	A	A	intronic	CRTAC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr10	99695877	99695877	T	T	intronic	CRTAC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr10	99876121	99876121	G	A	intergenic	CRTAC1,R3HCC1L	dist=85536;dist=18260	NaN	NaN	rs1334465	NaN	0.675319	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr10	99995742	99995742	T	T	intronic	R3HCC1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	100095603	100095603	A	A	intronic	CNTN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr11	10022635	10022635	T	A	intronic	SBF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	100830693	100830693	T	C	intronic	ARHGAP42	NaN	NaN	NaN	rs563460	NaN	0.827476	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	288.406216	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	92	2	90	54
chr11	100999341	100999341	G	C	exonic	PGR	NaN	nonsynonymous SNV	PGR:NM_000926:exon1:c.C461G:p.A154G	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.971	D	0.653	P	0.387	N	0.998	N	2.045	M	3.14	T	-1.062	T	0.035	T	0.2	0.108	4.584	1.16	0.062	0.496	6.354	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.00910447179764568	NA	0	0	NaN	NA	NA	48	38	10	0
chr11	1010478	1010478	G	C	intronic	AP2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	8	0	8	0
chr11	1010479	1010479	G	T	intronic	AP2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	8	0	8	0
chr11	1010481	1010481	G	T	intronic	AP2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	8	0	8	0
chr11	1010483	1010483	A	C	intronic	AP2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	8	0	8	0
chr11	1011490	1011490	G	A	UTR3	AP2A2	NM_012305:c.*865G>A,NM_001242837:c.*865G>A	NaN	NaN	rs7950955	NaN	0.429313	0	D	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	.	.	-0.945	T	0.000	T	.	0.033	4.184	0.17	0.037	1.159	4.282	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	101325848	101325848	A	A	intronic	TRPC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	101347346	101347346	T	G	intronic	TRPC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	5	3	0
chr11	101454192	101454192	G	A	exonic	TRPC6	NaN	nonsynonymous SNV	TRPC6:NM_004621:exon1:c.C43T:p.P15S	rs3802829	NaN	0.0676917	0.44	T	0.151	B	0.154	B	0.280	N	1.000	P	0	N	-1.0	T	-1.064	T	0.004	T	0.437	1.252	10.08	4.61	2.100	2.484	12.941	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.558051	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	4	3	4
chr11	1016869	1016869	A	T	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.T5932A:p.F1978I	rs35469308	NaN	0.0299521	0.41	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	N	0	N	2.27	T	-0.987	T	0.000	T	0.073	-0.231	2.886	-5.51	-4.027	-5.070	5.525	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	137	87	50	22
chr11	1016890	1016890	G	A	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.C5911T:p.P1971S	rs113508205	ID=COSM1321960,COSM1321961;OCCURENCE=1(ovary)	NaN	0.9	T	0.003	B	0.001	B	.	.	1.000	N	1.295	L	2.77	T	-0.895	T	0.013	T	0.077	2.358	13.84	-6.16	-1.753	-6.290	0.168	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	136	100	36	42
chr11	1016894	1016894	G	A	exonic	MUC6	NaN	synonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.C5907T:p.H1969H	rs34281988	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	22.5777	0	NaN	NA	NA	138	115	24	22
chr11	1016914	1016914	G	T	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.C5887A:p.P1963T	rs74632841	NaN	NaN	0.88	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	N	0.14	N	2.28	T	-0.961	T	0.019	T	0.055	-1.807	0.009	2.19	0.630	-0.097	8.372	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	146.127	0	NaN	NA	NA	84	39	45	34
chr11	1016978	1016978	T	C/G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.6909	0	NaN	NA	NA	50	31	19	0
chr11	1017183	1017183	G	T	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.C5618A:p.P1873Q	rs34844844	ID=COSM1350278,COSM1350279;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.000399361	0.24	T	0.999	D	0.994	D	.	.	1.000	N	1.895	L	2.18	T	-1.060	T	0.103	T	0.094	1.822	12.05	2.12	0.585	0.775	8.576	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	358	237	121	57
chr11	1017239	1017239	C	T	exonic	MUC6	NaN	synonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.G5562A:p.T1854T	rs56386804	NaN	0.0493211	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	337	164	173	0
chr11	1017240	1017240	G	A	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.C5561T:p.T1854M	rs62891761	NaN	0.0501198	0.14	T	1.0	D	0.996	D	.	.	1.000	N	1.24	L	2.21	T	-1.076	T	0.051	T	0.105	1.071	9.372	-4.65	-2.028	-1.937	0.191	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	339	123	216	0
chr11	1017302	1017302	G	C	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.C5499G:p.H1833Q	rs35330958	NaN	0.00139776	0.59	T	0.046	B	0.041	B	.	.	1.000	N	-0.975	N	2.65	T	-0.928	T	0.011	T	0.013	-1.990	0.007	2.27	0.188	-1.109	3.789	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	903.446	0	NaN	NA	NA	354	145	209	21
chr11	1017317	1017317	G	T	exonic	MUC6	NaN	synonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.C5484A:p.T1828T	rs33943903	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	1546.61	25	NaN	NA	NA	320	83	237	43
chr11	1017325	1017325	A	C	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.T5476G:p.Y1826D	rs55903826	ID=COSM1317403,COSM1317402;OCCURENCE=1(ovary),1(haematopoietic_and_lymphoid_tissue)	NaN	0.22	T	0.999	D	0.993	D	.	.	1.000	N	0.695	N	2.18	T	-1.085	T	0.049	T	0.177	1.059	9.324	-6.41	-2.482	-4.881	1.527	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	113	NaN	NA	NA	869	498	371	52
chr11	1017337	1017337	TC	CA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	98.5958	0	NaN	NA	NA	1369	1154	215	52
chr11	1017384	1017384	G	C	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.C5417G:p.T1806S	rs34095361	NaN	0.000798722	0.8	T	0.05	B	0.108	B	.	.	1.000	N	-1.15	N	2.11	T	-0.931	T	0.016	T	0.021	-1.806	0.009	0.828	-0.224	-2.055	7.759	100	11	3035	SNV	VTsM	3	Somatic	0.16205376499494337	Somatic	22.0945	0	6.442114	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	28	23	5	41
chr11	1017401	1017401	G	A	exonic	MUC6	NaN	synonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.C5400T:p.H1800H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.10188	0	NaN	NA	NA	36	31	5	2
chr11	1017421	1017421	G	T	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.C5380A:p.P1794T	rs35549382	NaN	NaN	0.59	T	0.761	P	0.645	P	.	.	1.000	N	1.39	L	2.28	T	-1.030	T	0.046	T	0.046	-1.605	0.014	1.25	0.182	-0.938	6.922	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	56.6853	0	NaN	NA	NA	39	21	8	24
chr11	1017530	1017530	G	A	exonic	MUC6	NaN	synonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.C5271T:p.H1757H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	24.7774	0	NaN	NA	NA	239	200	38	8
chr11	1017552	1017552	T	C	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.A5249G:p.H1750R	rs35868469	NaN	NaN	0.37	T	0.967	D	0.835	P	.	.	1.000	N	1.355	L	2.26	T	-1.134	T	0.003	T	0.008	-0.683	1.026	-4.87	-1.333	-4.662	3.517	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	32.4486	0	NaN	NA	NA	284	236	47	14
chr11	1017596	1017596	T	G	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.A5205C:p.Q1735H	rs201522029	ID=COSM220069;OCCURENCE=1(prostate)	0.126398	0.12	T	0.996	D	0.964	D	.	.	1.000	N	0.695	N	2.04	T	-1.055	T	0.011	T	0.032	0.111	4.598	-4.14	-2.302	-2.097	8.065	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.4595	0	NaN	NA	NA	24	20	4	1
chr11	101776649	101776649	A	C	intronic	ANGPTL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	101776651	101776651	T	G	intronic	ANGPTL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	101776653	101776653	T	C	intronic	ANGPTL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	101776654	101776654	T	G	intronic	ANGPTL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1017773	1017773	G	A	exonic	MUC6	NaN	synonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.C5028T:p.S1676S	rs57384288	ID=COSM118291;OCCURENCE=1(ovary)	0.296725	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	54.6688	23	NaN	NA	NA	160	119	41	27
chr11	1017783	1017783	A	G	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.T5018C:p.L1673P	rs36101709	NaN	0.28734	0.33	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	N	-0.345	N	2.17	T	-1.030	T	0.016	T	0.04	-1.281	0.042	-3.57	-2.926	-7.641	0.342	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	66.8974	20	NaN	NA	NA	159	117	42	29
chr11	101786184	101786184	A	T	intronic	ANGPTL5,KIAA1377	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr11	1017935	1017935	A	G	exonic	MUC6	NaN	synonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon31:c.T4866C:p.S1622S	rs138784536	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.7839	0	NaN	NA	NA	91	74	15	1
chr11	101828758	101828758	T	C	intronic	KIAA1377	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	21	13	5	0
chr11	101828879	101828879	T	C	intronic	KIAA1377	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.8755	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	387	370	17	0
chr11	101857758	101857758	G	A	exonic	KIAA1377	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA1377:NM_020802:exon9:c.G3230A:p.S1077N	rs6590942	NaN	0.98742	1	T	0.0	B	0.0	B	0.002	N	1.000	P	-1.265	N	4.04	T	-0.986	T	0.000	T	0.025	-0.524	1.610	4.24	0.431	3.110	9.406	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	56.6837	0	NaN	NA	NA	195	0	195	8
chr11	101868248	101868248	A	G	intronic	KIAA1377	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.51529	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	242	236	6	0
chr11	1019912	1019912	T	A	intronic	MUC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	24	7	17	0
chr11	102161761	102161761	C	A	intergenic	YAP1,BIRC3	dist=57607;dist=26420	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	102207024	102207024	C	T	intronic	BIRC3	NaN	NaN	NaN	rs7124969	NaN	0.711462	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	115	83	32	2
chr11	102207851	102207851	G	A	UTR3	BIRC3	NM_001165:c.*18G>A,NM_182962:c.*18G>A	NaN	NaN	rs1055088	NaN	0.65635	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	123.649	0	57.564128	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	18	23	8
chr11	102264059	102264059	G	A	intergenic	BIRC2,TMEM123	dist=14658;dist=2997	NaN	NaN	rs7934594	NaN	0.349441	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	102264126	102264126	G	T	intergenic	BIRC2,TMEM123	dist=14725;dist=2930	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	102323110	102323110	C	A	intronic	TMEM123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	19	7.450649	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	4	1	3	0
chr11	102323493	102323493	G	C	UTR5	TMEM123	NM_052932:c.-139C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	102449931	102449931	T	C	intronic	MMP20	NaN	NaN	NaN	rs10502004	NaN	0.0229633	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	59.973183	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	55	28	27	7
chr11	1024738	1024738	G	G	intronic	MUC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	27	24	0	0
chr11	1024788	1024788	C	C	intronic	MUC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	33	33	0	0
chr11	102482445	102482445	T	C	intronic	MMP20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	20	7	7	0
chr11	102562700	102562700	C	T	exonic	MMP27	NaN	nonsynonymous SNV	MMP27:NM_022122:exon10:c.G1339A:p.D447N	rs2509010	NaN	0.163738	0.47	T	0.576	P	0.031	B	0.000	D	0.244	P	1.255	L	2.53	T	-0.903	T	0.000	T	0.039	2.422	14.06	3.86	2.819	1.080	10.216	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	258.323004	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	93	0	93	26
chr11	102567147	102567147	T	A	exonic	MMP27	NaN	nonsynonymous SNV	MMP27:NM_022122:exon6:c.A857T:p.D286V	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	4.095	H	3.07	T	-0.565	T	0.143	T	0.928	3.953	20.2	6.08	2.333	5.974	16.651	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.135108	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	108	101	7	0
chr11	102585368	102585368	A	G	exonic	MMP8	NaN	nonsynonymous SNV	MMP8:NM_002424:exon8:c.T1109C:p.F370S,MMP8:NM_001304441:exon9:c.T1040C:p.F347S,MMP8:NM_001304442:exon9:c.T1040C:p.F347S	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.925	M	3.99	T	-1.118	T	0.056	T	0.792	4.635	25.4	5.58	2.120	7.988	15.431	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	33.4025	0	NaN	NA	NA	7	2	5	8
chr11	102646111	102646111	T	A	intronic	MMP10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.393436	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	466	439	27	0
chr11	102663477	102663477	GAAAAA	GAAAAT,GGAAAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	214.371	0	NaN	NA	NA	104	53	45	0
chr11	102709807	102709807	T	C	intronic	MMP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	4	2	0
chr11	1027280	1027280	T	C	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon17:c.A2219G:p.N740S	NaN	NaN	NaN	0.34	T	0.493	P	0.109	B	.	.	1.000	N	0.975	L	2.01	T	-1.053	T	0.030	T	0.053	1.288	10.21	2.96	1.852	1.516	5.396	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.568424	nearby_gap_events	REJECT	82	76	6	0
chr11	102742493	102742493	A	G	intronic	MMP12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.000015	possible_contamination	REJECT	179	173	6	0
chr11	1028422	1028422	A	A	intronic	MUC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	1028576	1028576	T	C	intronic	MUC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	26	17	6	0
chr11	1029320	1029320	C	T	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon10:c.G1183A:p.G395R	rs11604757	NaN	0.0423323	0.06	T	0.84	P	0.116	B	0.972	N	0.526	P	2.11	M	-0.08	T	-1.062	T	0.004	T	0.112	3.068	16.24	2.68	0.489	1.681	9.550	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.753671	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	6	6	15
chr11	102934873	102934873	A	G	intronic	DCUN1D5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	102953599	102953599	A	A	intronic	DCUN1D5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	102980324	102980324	C	T	exonic	DYNC2H1	NaN	synonymous SNV	DYNC2H1:NM_001080463:exon1:c.C21T:p.D7D,DYNC2H1:NM_001377:exon1:c.C21T:p.D7D	rs17301028	NaN	0.0411342	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	70.903568	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	51	23	28	8
chr11	102980624	102980624	C	C	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	102996047	102996047	T	G	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	102996050	102996050	C	A	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	102996051	102996051	T	G	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	103005197	103005197	A	A	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	22	18	0	0
chr11	103026040	103026040	C	T	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.0830671	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.163631	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	99	90	9	0
chr11	103029516	103029516	A	G	exonic	DYNC2H1	NaN	nonsynonymous SNV	DYNC2H1:NM_001080463:exon27:c.A4238G:p.K1413R,DYNC2H1:NM_001377:exon27:c.A4238G:p.K1413R	rs688906	NaN	0.668331	0.1	T	0.661	P	0.309	B	0.002	U	0.000	P	1.68	L	-0.43	T	-0.935	T	0.000	T	0.292	2.270	13.55	5.79	2.212	4.130	12.011	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.567274	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	0
chr11	103033643	103033643	T	C	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	103055827	103055827	A	A	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	7	0	0
chr11	1030648	1030648	T	A	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon7:c.A817T:p.T273S	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.999	D	.	.	0.740	D	1.755	L	-1.0	T	0.210	D	0.496	T	0.388	2.422	14.06	3.55	1.385	4.927	12.418	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	10.0686	0	15.222079	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	51	43	8	1
chr11	103070217	103070217	A	A	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	103070846	103070846	T	C	exonic	DYNC2H1	NaN	synonymous SNV	DYNC2H1:NM_001080463:exon50:c.T8160C:p.P2720P,DYNC2H1:NM_001377:exon50:c.T8160C:p.P2720P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.07277	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	120	106	14	0
chr11	103086381	103086381	G	T	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	rs679691	NaN	0.740415	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	333.2	0	NaN	NA	NA	34	0	34	50
chr11	103086399	103086399	G	A,GTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	292.335	0	NaN	NA	NA	36	0	3	14
chr11	103086530	103086530	T	T	exonic	DYNC2H1	NaN	synonymous SNV	DYNC2H1:NM_001080463:exon55:c.T8775T:p.L2925L,DYNC2H1:NM_001377:exon55:c.T8775T:p.L2925L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	40	37	0	0
chr11	103086542	103086542	A	G	exonic	DYNC2H1	NaN	synonymous SNV	DYNC2H1:NM_001080463:exon55:c.A8787G:p.Q2929Q,DYNC2H1:NM_001377:exon55:c.A8787G:p.Q2929Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.358168	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	271	263	8	0
chr11	103091448	103091448	G	A	exonic	DYNC2H1	NaN	nonsynonymous SNV	DYNC2H1:NM_001080463:exon57:c.G9043A:p.D3015N,DYNC2H1:NM_001377:exon57:c.G9043A:p.D3015N	NaN	NaN	NaN	0.58	T	0.999	D	0.967	D	0.000	D	1.000	D	2.55	M	-0.67	T	-0.236	T	0.543	D	0.316	5.643	36	6.17	2.941	9.869	20.879	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.059557	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	43	39	4	0
chr11	1030978	1030978	A	G	exonic	MUC6	NaN	nonsynonymous SNV	MUC6:NM_005961:exon6:c.T653C:p.I218T	NaN	NaN	NaN	0.24	T	0.808	P	0.206	B	0.193	U	1.000	N	1.185	L	2.23	T	-1.038	T	0.025	T	0.237	1.744	11.79	2.31	1.363	1.562	6.184	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	32.3382	16	NaN	NA	NA	8	3	5	4
chr11	103104930	103104930	C	A	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	rs1784259	NaN	0.920927	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	71.596641	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	0	25	53
chr11	103130860	103130860	A	A	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	103178339	103178339	C	T	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	rs7118015	NaN	0.172524	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	43.9975	25	NaN	NA	NA	15	7	8	8
chr11	103187096	103187096	T	A	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	103187178	103187178	G	T	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.367879	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	36	6	0
chr11	103194592	103194592	T	A	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.557253	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	74	65	9	0
chr11	103229027	103229027	T	C	exonic	DYNC2H1	NaN	synonymous SNV	DYNC2H1:NM_001377:exon83:c.T12096C:p.D4032D,DYNC2H1:NM_001080463:exon84:c.T12117C:p.D4039D	rs2566913	NaN	0.495008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	60.6956	0	29.195471	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	15	13	46
chr11	103229110	103229110	G	A	intronic	DYNC2H1	NaN	NaN	NaN	rs2671333	NaN	0.495008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	67.9013	0	29.43899	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	15	14	46
chr11	10327284	10327284	T	C	exonic	ADM	NaN	nonsynonymous SNV	ADM:NM_001124:exon2:c.T37C:p.S13P	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.977	D	0.859	P	0.028	N	1.000	D	1.5	L	1.69	T	-0.906	T	0.098	T	0.751	2.846	15.48	3.82	0.885	2.774	10.234	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	13	8	4	0
chr11	10328152	10328152	A	C	exonic	ADM	NaN	synonymous SNV	ADM:NM_001124:exon4:c.A522C:p.P174P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr11	10328153	10328153	G	G	exonic	ADM	NaN	synonymous SNV	ADM:NM_001124:exon4:c.G523G:p.A175A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	17	17	0	0
chr11	10328154	10328154	C	C	exonic	ADM	NaN	synonymous SNV	ADM:NM_001124:exon4:c.C524C:p.A175A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	15	15	0	0
chr11	103870841	103870841	T	G	exonic	PDGFD	NaN	synonymous SNV	PDGFD:NM_025208:exon2:c.A267C:p.T89T,PDGFD:NM_033135:exon2:c.A249C:p.T83T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.728201	nearby_gap_events	REJECT	69	62	7	0
chr11	104825746	104825746	A	G	intronic	CASP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	16	7	8	0
chr11	104872958	104872958	A	G	intronic	CASP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr11	104897192	104897192	A	G	intronic	CASP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	104897743	104897743	A	A	intronic	CASP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr11	104914367	104914367	A	A	intronic	CARD16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	104970010	104970010	T	C	intronic	CARD17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	13	6	3	0
chr11	104970227	104970227	A	A	intronic	CARD17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	104972036	104972036	T	T	intronic	CARD17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	30	27	0	0
chr11	104972248	104972248	A	A	upstream	CARD17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	10499868	10499868	T	T	intronic	AMPD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr11	10499870	10499870	G	A	intronic	AMPD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.12871	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	117	110	7	0
chr11	10510152	10510152	A	C	intronic	AMPD3	NaN	NaN	NaN	rs12416948	NaN	0.495607	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr11	10510159	10510159	G	T	intronic	AMPD3	NaN	NaN	NaN	rs12418145	NaN	0.295527	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr11	10518534	10518534	A	A	intronic	AMPD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	10522846	10522846	A	G	intronic	AMPD3	NaN	NaN	NaN	rs4910147	NaN	0.994209	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	345.08	0	NaN	NA	NA	31	0	31	52
chr11	10536381	10536381	T	T	UTR3	RNF141	NM_016422:c.*82A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	10555509	10555509	T	T	intronic	RNF141	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	105591796	105591796	T	G	intronic	GRIA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	105591800	105591800	A	C	intronic	GRIA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	105781085	105781085	T	T	intronic	GRIA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	10582356	10582356	A	A	ncRNA_intronic	MRVI1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	105850472	105850472	A	C	UTR3	GRIA4	NM_000829:c.*6A>C,NM_001077243:c.*173A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.394826	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	178	161	17	3
chr11	105923564	105923564	C	T	UTR3	KBTBD3	NM_152433:c.*13G>A,NM_198439:c.*13G>A	NaN	NaN	rs3737347	NaN	0.199081	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.565961	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	9	21	16
chr11	10603598	10603598	A	A	ncRNA_intronic	MRVI1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr11	10603601	10603601	T	A	ncRNA_intronic	MRVI1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	10603602	10603602	T	C	ncRNA_intronic	MRVI1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	10603604	10603604	T	C	ncRNA_intronic	MRVI1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	10603607	10603607	G	C	ncRNA_intronic	MRVI1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	10624623	10624623	T	T	intronic	MRVI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	10628320	10628320	C	A	splicing	MRVI1	NM_001206881:exon11:c.627-1G>T,NM_001100167:exon13:c.627-1G>T,NM_130385:exon13:c.1572-1G>T,NM_001098579:exon12:c.1548-1G>T,NM_001206880:exon12:c.954-1G>T,NM_001100163:exon13:c.1299-1G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.545	24.6	5.47	2.558	7.000	19.319	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.21374	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	198	182	16	0
chr11	10653652	10653652	A	C	intronic	MRVI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	7	1	6	0
chr11	10653656	10653656	G	T	intronic	MRVI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr11	106558496	106558496	A	T	intronic	GUCY1A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	15	8	7	0
chr11	106680653	106680653	CAATTT	C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	98.8969	0	NaN	NA	NA	46	23	20	22
chr11	106849520	106849520	T	T	intronic	GUCY1A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	70	60	0	0
chr11	106888359	106888359	A	G	intronic	GUCY1A2	NaN	NaN	NaN	rs1840570	NaN	0.44349	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	43.6831	43	13.162717	normal_lod	REJECT	7	2	5	22
chr11	107304460	107304460	T	G	exonic	CWF19L2	NaN	nonsynonymous SNV	CWF19L2:NM_152434:exon7:c.A680C:p.D227A	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.38	M	2.03	T	-0.770	T	0.179	T	0.887	4.098	21.1	5.81	2.217	6.732	15.358	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	107304462	107304462	T	C	exonic	CWF19L2	NaN	synonymous SNV	CWF19L2:NM_152434:exon7:c.A678G:p.E226E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	107304463	107304463	T	A	exonic	CWF19L2	NaN	nonsynonymous SNV	CWF19L2:NM_152434:exon7:c.A677T:p.E226V	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.999	D	0.91	D	0.000	D	0.998	D	2.42	M	0.83	T	-0.498	T	0.288	T	0.812	4.201	21.8	5.81	2.217	4.959	15.358	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	107304466	107304466	A	G	exonic	CWF19L2	NaN	nonsynonymous SNV	CWF19L2:NM_152434:exon7:c.T674C:p.V225A	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.883	P	0.354	B	0.001	N	0.997	D	2.62	M	0.94	T	-0.717	T	0.160	T	0.347	4.205	21.8	5.69	2.168	7.725	15.136	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	107304467	107304467	C	T	exonic	CWF19L2	NaN	nonsynonymous SNV	CWF19L2:NM_152434:exon7:c.G673A:p.V225I	rs377024861	NaN	NaN	0.38	T	0.023	B	0.016	B	0.001	N	0.935	D	1.82	L	0.94	T	-1.028	T	0.090	T	0.064	2.068	12.87	1.67	0.701	1.399	9.413	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	107304468	107304468	C	G	exonic	CWF19L2	NaN	synonymous SNV	CWF19L2:NM_152434:exon7:c.G672C:p.V224V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	107312113	107312113	T	A	intronic	CWF19L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.155328	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	107	94	13	0
chr11	107393169	107393169	C	A	exonic	ALKBH8	NaN	nonsynonymous SNV	ALKBH8:NM_001301010:exon10:c.G1152T:p.E384D,ALKBH8:NM_138775:exon10:c.G1143T:p.E381D	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.029	B	0.022	B	0.003	N	1.000	D	1.535	L	0.93	T	-1.092	T	0.065	T	0.187	1.198	9.866	-0.754	-0.127	0.786	2.155	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	5.560844517424626E-4	NA	0	0	NaN	NA	NA	75	52	23	0
chr11	107423917	107423917	A	A	exonic	ALKBH8	NaN	synonymous SNV	ALKBH8:NM_001301010:exon5:c.T521T:p.L174L,ALKBH8:NM_138775:exon5:c.T512T:p.L171L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	34	28	0	0
chr11	107431636	107431636	AC	A,AA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1155.1	0	NaN	NA	NA	454	211	75	5
chr11	107518189	107518189	T	C	intronic	ELMOD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.16601	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	55	45	10	0
chr11	107526753	107526753	C	A	exonic	ELMOD1	NaN	nonsynonymous SNV	ELMOD1:NM_001130037:exon10:c.C769A:p.P257T,ELMOD1:NM_018712:exon11:c.C793A:p.P265T	NaN	NaN	NaN	0.58	T	0.274	B	0.18	B	0.000	D	1.000	D	1.415	L	1.61	T	-1.091	T	0.083	T	0.858	4.002	20.5	6.16	2.937	5.770	20.860	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.323586	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	318	310	8	0
chr11	107535965	107535965	C	G	UTR3	ELMOD1	NM_018712:c.*42C>G,NM_001130037:c.*42C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	107627861	107627861	C	T	intergenic	SLN,SLC35F2	dist=45074;dist=33856	NaN	NaN	rs185899022	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	105	NaN	NA	NA	72	50	22	0
chr11	107729330	107729330	G	T	intronic	SLC35F2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.264	0	NaN	NA	NA	14	11	3	5
chr11	10777384	10777384	A	T	intronic	CTR9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr11	107832611	107832611	T	C	intronic	RAB39A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	10785582	10785582	G	C	intronic	CTR9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	10786044	10786044	A	A	intronic	CTR9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	88	72	0	0
chr11	107916785	107916785	T	G	intronic	CUL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	1	0
chr11	107917087	107917087	A	G	exonic	CUL5	NaN	synonymous SNV	CUL5:NM_003478:exon3:c.A225G:p.Q75Q	rs7117111	NaN	0.662141	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.028	T	0.000	T	.	1.042	9.257	5.81	2.210	4.341	11.997	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	124.116819	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	93	40	53	50
chr11	107940724	107940724	T	A	intronic	CUL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.220854700854699	NA	0	0	NaN	NA	NA	19	15	4	0
chr11	107941086	107941086	C	C	intronic	CUL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	1079826	1079826	T	A	intronic	MUC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	108004847	108004847	A	G	intronic	ACAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.491532	nearby_gap_events	REJECT	68	57	11	0
chr11	108004849	108004849	A	G	intronic	ACAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.074268	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	85	74	11	0
chr11	108012510	108012510	A	AAAGT	intronic	ACAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.989816	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1001.39	0	NaN	NA	NA	135	10	108	26
chr11	108017131	108017131	T	T	intronic	ACAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	108040822	108040822	C	C	intronic	NPAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	108047664	108047664	T	T	intronic	NPAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	1080498	1080498	G	T	exonic	MUC2	NaN	nonsynonymous SNV	MUC2:NM_002457:exon9:c.G1140T:p.W380C	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	U	1.000	D	3.615	H	-0.17	T	0.430	D	0.558	D	0.875	3.010	16.04	4.07	2.115	7.684	16.415	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.344552	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	68	63	5	0
chr11	108119947	108119947	A	A	intronic	ATM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	9	6	0	0
chr11	108122804	108122804	A	A	intronic	ATM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	1081351	1081351	A	G	intronic	MUC2	NaN	NaN	NaN	rs10902082	NaN	0.365216	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	21	9	11	19
chr11	108138068	108138068	A	G	exonic	ATM	NaN	nonsynonymous SNV	ATM:NM_000051:exon17:c.A2637G:p.I879M	NaN	NaN	NaN	0.24	T	0.001	B	0.002	B	0.089	N	1.000	N	0.41	N	-0.66	T	-1.036	T	0.137	T	0.15	0.593	7.199	-0.38	-0.266	0.055	4.236	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.65687	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	259	253	6	0
chr11	1081381	1081381	A	G	intronic	MUC2	NaN	NaN	NaN	rs10902083	NaN	0.368011	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.06372	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	13	11	21
chr11	108139097	108139097	T	T	intronic	ATM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr11	1081392	1081392	T	C	intronic	MUC2	NaN	NaN	NaN	rs10902084	NaN	0.376398	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.202549	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	14	11	20
chr11	108139453	108139453	A	A	intronic	ATM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	25	22	0	0
chr11	108141743	108141743	T	T	intronic	ATM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	108173822	108173822	A	A	intronic	ATM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr11	1081757	1081757	G	C	exonic	MUC2	NaN	nonsynonymous SNV	MUC2:NM_002457:exon13:c.G1685C:p.S562T	rs57737240	NaN	0.367013	1	T	0.119	B	0.119	B	0.713	U	1.000	P	.	.	2.67	T	-0.928	T	0.000	T	0.027	-0.839	0.576	-0.045	-0.239	0.085	6.608	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	75.310574	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	67	34	33	25
chr11	108192031	108192031	A	T	exonic	ATM	NaN	synonymous SNV	ATM:NM_000051:exon45:c.A6456T:p.V2152V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.492839	nearby_gap_events	REJECT	50	44	6	0
chr11	108196761	108196761	T	T	intronic	ATM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	108198502	108198502	A	A	intronic	ATM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	108198507	108198507	T	T	intronic	ATM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	108225638	108225638	T	C	intronic	ATM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.882984	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	213	199	14	0
chr11	10823616	10823616	C	A	exonic	EIF4G2	NaN	nonsynonymous SNV	EIF4G2:NM_001042559:exon13:c.G1279T:p.G427C,EIF4G2:NM_001172705:exon13:c.G1279T:p.G427C,EIF4G2:NM_001418:exon13:c.G1279T:p.G427C	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.975	D	0.62	P	0.028	N	0.579	D	0.55	N	2.24	T	-1.035	T	0.062	T	0.682	2.826	15.41	6.07	2.885	2.545	13.806	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.717695	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	69	64	5	0
chr11	10823839	10823839	AC	GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.979	0	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	10823840	10823840	C	G	splicing	EIF4G2	NM_001172705:exon13:c.1138+1G>C,NM_001418:exon13:c.1138+1G>C,NM_001042559:exon13:c.1138+1G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.589	18.28	5.77	2.885	7.671	20.363	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	18	7.356798	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	7	4	3	0
chr11	10823842	10823842	T	A	exonic	EIF4G2	NaN	synonymous SNV	EIF4G2:NM_001042559:exon12:c.A1137T:p.P379P,EIF4G2:NM_001172705:exon12:c.A1137T:p.P379P,EIF4G2:NM_001418:exon12:c.A1137T:p.P379P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.979	0	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	10824731	10824731	C	T	intronic	EIF4G2	NaN	NaN	NaN	rs2270620	NaN	0.515775	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	20.4191	0	NaN	NA	NA	316	138	178	2
chr11	10826420	10826420	T	T	intronic	EIF4G2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr11	10828443	10828443	G	A	intronic	EIF4G2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.553141	nearby_gap_events	REJECT	81	74	7	0
chr11	1083357	1083357	C	G	intronic	MUC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.926663	nearby_gap_events	REJECT	49	43	6	0
chr11	1083495	1083495	G	T	intronic	MUC2	NaN	NaN	NaN	rs11245933	NaN	0.366214	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.257258	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	17	6	23
chr11	1083700	1083700	C	T	intronic	MUC2	NaN	NaN	NaN	rs11245934	NaN	0.371206	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.168337	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	2	3	14
chr11	108461201	108461201	A	G	intronic	EXPH5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	108463986	108463986	C	A	intronic	EXPH5	NaN	NaN	NaN	rs12791136	NaN	0.330871	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.698055	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	0	17	30
chr11	108536086	108536086	G	A	intronic	DDX10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	30	19	10	0
chr11	108593728	108593728	C	A	exonic	DDX10	NaN	nonsynonymous SNV	DDX10:NM_004398:exon13:c.C1504A:p.L502I	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.981	D	0.000	D	1.000	D	3.155	M	0.81	T	-0.109	T	0.390	T	0.362	4.530	24.4	5.53	2.766	5.124	18.015	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.597857	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	158	153	5	0
chr11	1086413	1086413	C	T	exonic	MUC2	NaN	nonsynonymous SNV	MUC2:NM_002457:exon23:c.C3122T:p.P1041L	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.988	D	0.773	P	0.006	U	0.981	D	1.445	L	2.5	T	-1.109	T	0.064	T	0.239	2.573	14.56	2.62	0.812	2.440	13.157	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	6.267889495502623E-13	Somatic	118.948	31	125.018	nearby_gap_events	REJECT	242	180	62	0
chr11	108815424	108815424	G	C	intergenic	DDX10,C11orf87	dist=3767;dist=477422	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	108815430	108815430	G	T	intergenic	DDX10,C11orf87	dist=3773;dist=477416	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	108815465	108815465	T	C	intergenic	DDX10,C11orf87	dist=3808;dist=477381	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1093945	1093945	T	C	intronic	MUC2	NaN	NaN	NaN	rs7934606	NaN	0.823482	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	205.705025	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	67	0	67	46
chr11	1096252	1096252	C	G	intronic	MUC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	28	13	15	3
chr11	1098637	1098637	A	G	intronic	MUC2	NaN	NaN	NaN	rs12418069	NaN	0.813299	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	121.094859	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	0	40	49
chr11	1098939	1098939	T	C	intronic	MUC2	NaN	NaN	NaN	rs10794293	NaN	0.811302	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	64.1555	0	NaN	NA	NA	9	1	7	32
chr11	1099711	1099711	T	G	intronic	MUC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.020090076747650617	NA	0	0	NaN	NA	NA	72	45	27	0
chr11	1099712	1099712	C	T	intronic	MUC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.01241796698250938	NA	0	0	NaN	NA	NA	62	35	27	0
chr11	110033888	110033888	T	T	intronic	ZC3H12C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	110034172	110034172	A	C	intronic	ZC3H12C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	21	28.788833	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	35	16	19	0
chr11	110036307	110036307	A	A	exonic	ZC3H12C	NaN	synonymous SNV	ZC3H12C:NM_033390:exon6:c.A2497A:p.R833R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	157	137	0	0
chr11	110377572	110377572	A	G	intergenic	FDX1,ARHGAP20	dist=41964;dist=70187	NaN	NaN	rs328289	NaN	0.53734	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	44	19	25	0
chr11	110452999	110452999	C	A	intronic	ARHGAP20	NaN	NaN	NaN	rs2008772	NaN	0.763778	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	90.25429	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	0	34	56
chr11	110453009	110453009	G	A	intronic	ARHGAP20	NaN	NaN	NaN	rs4079590	NaN	0.736222	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	97.16733	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	0	33	55
chr11	110477147	110477147	T	A	intronic	ARHGAP20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	110479642	110479642	T	T	intronic	ARHGAP20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	18	16	0	0
chr11	110756655	110756655	G	T	intergenic	ARHGAP20,C11orf53	dist=172743;dist=370052	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	111000521	111000521	T	C	intergenic	ARHGAP20,C11orf53	dist=416609;dist=126186	NaN	NaN	rs321369	NaN	0.105431	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	15	7	8	0
chr11	111111829	111111829	A	A	intergenic	ARHGAP20,C11orf53	dist=527917;dist=14878	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	111152008	111152008	T	C	intronic	C11orf53	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	111152068	111152068	T	A	intronic	C11orf53	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.825133	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	78	69	9	0
chr11	111249819	111249819	A	G	intronic	POU2AF1	NaN	NaN	NaN	rs10789825	NaN	0.473043	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	107.746614	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	0	37	43
chr11	111293250	111293250	A	C	intergenic	LOC100132078,BTG4	dist=4339;dist=45006	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr11	111326469	111326469	T	C	intergenic	LOC100132078,BTG4	dist=37558;dist=11787	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	111368047	111368047	G	T	exonic	BTG4	NaN	synonymous SNV	BTG4:NM_017589:exon4:c.C399A:p.A133A	rs489078	NaN	0.978634	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	215.329531	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	73	1	72	57
chr11	111385419	111385419	GC	CG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	27.2227	0	NaN	NA	NA	7	2	4	2
chr11	111385420	111385420	C	G	upstream	C11orf88	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	25	7.829183	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	7	3	4	0
chr11	111385597	111385597	T	T	exonic	C11orf88	NaN	synonymous SNV	C11orf88:NM_001100388:exon1:c.T88T:p.S30S,C11orf88:NM_207430:exon1:c.T88T:p.S30S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	10	7	0	0
chr11	111385811	111385811	A	G	intronic	C11orf88	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	3	2	0
chr11	111594876	111594876	G	T	UTR3	SIK2	NM_015191:c.*23G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	111597883	111597883	T	G	intronic	PPP2R1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	111612212	111612212	T	T	UTR3	PPP2R1B	NM_001177562:c.*108A>A,NM_002716:c.*108A>A,NM_001177563:c.*108A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	16	14	0	0
chr11	111623090	111623090	A	A	intronic	PPP2R1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	13	10	0	0
chr11	111625711	111625711	T	C	exonic	PPP2R1B	NaN	synonymous SNV	PPP2R1B:NM_001177563:exon5:c.A570G:p.K190K,PPP2R1B:NM_181700:exon5:c.A759G:p.K253K,PPP2R1B:NM_001177562:exon7:c.A951G:p.K317K,PPP2R1B:NM_002716:exon7:c.A951G:p.K317K,PPP2R1B:NM_181699:exon7:c.A951G:p.K317K	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.766	T	0.224	T	.	1.169	9.755	4.64	2.195	3.774	9.273	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.757516	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	171	157	14	0
chr11	111626259	111626259	T	A	intronic	PPP2R1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	27	12	15	0
chr11	111630706	111630706	A	A	intronic	PPP2R1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr11	111636778	111636778	T	T	intronic	PPP2R1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr11	111740988	111740988	A	G	exonic	ALG9	NaN	synonymous SNV	ALG9:NM_001077690:exon3:c.T237C:p.S79S,ALG9:NM_024740:exon3:c.T237C:p.S79S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.408652	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	140	136	4	0
chr11	111741087	111741087	A	A	exonic	ALG9	NaN	synonymous SNV	ALG9:NM_001077690:exon3:c.T138T:p.S46S,ALG9:NM_024740:exon3:c.T138T:p.S46S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	111745567	111745567	G	T	UTR3	FDXACB1	NM_138378:c.*79C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	111745569	111745569	C	G	UTR3	FDXACB1	NM_138378:c.*77G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	111745570	111745570	T	C	UTR3	FDXACB1	NM_138378:c.*76A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	111745571	111745571	A	C	UTR3	FDXACB1	NM_138378:c.*75T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr11	111745572	111745572	C	T	UTR3	FDXACB1	NM_138378:c.*74G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	111784333	111784333	T	C	exonic	HSPB2	NaN	nonsynonymous SNV	HSPB2:NM_001541:exon2:c.T263C:p.V88A	NaN	NaN	NaN	0	D	0.968	D	0.831	P	0.003	N	1.000	D	1.735	L	-3.08	D	0.857	D	0.797	D	0.696	3.323	17.18	4.84	2.171	6.172	14.872	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.13322	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	296	289	7	0
chr11	111845120	111845120	G	G	intronic	DIXDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	105	89	0	0
chr11	111865909	111865909	A	G	intronic	DIXDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr11	111887581	111887581	A	A	intronic	DIXDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr11	111896784	111896784	T	C	intronic	DLAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr11	111899659	111899659	C	T	exonic	DLAT	NaN	nonsynonymous SNV	DLAT:NM_001931:exon4:c.C650T:p.P217L	NaN	NaN	NaN	0.26	T	0.304	B	0.052	B	0.119	N	1.000	D	1.15	L	2.34	T	-1.083	T	0.036	T	0.149	2.686	14.94	4.51	1.263	2.804	9.446	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.891159	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	136	123	13	0
chr11	111930462	111930462	A	A	intronic	DLAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	111934828	111934828	T	C	UTR3	DLAT,PIH1D2	NM_001931:c.*1569T>C;NM_001082619:c.*64A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr11	111941710	111941710	T	T	intronic	PIH1D2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	112071572	112071572	A	A	intronic	BCO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	76	57	0	0
chr11	112099332	112099332	T	C	exonic	PTS	NaN	synonymous SNV	PTS:NM_000317:exon2:c.T99C:p.D33D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	112123095	112123095	A	G	exonic	PLET1	NaN	nonsynonymous SNV	PLET1:NM_001145024:exon3:c.T424C:p.S142P	rs2564872	NaN	0.645767	0.05	D	1.0	D	0.995	D	0.338	N	1.000	P	0	N	0.59	T	-1.006	T	0.000	T	0.341	2.493	14.29	2.62	0.799	-0.016	7.267	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.349498	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	0	32	45
chr11	112335631	112335631	C	T	intergenic	LOC283140,LOC101928823	dist=102374;dist=17324	NaN	NaN	rs7933113	NaN	0.0796725	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1124898	1124898	G	A	intergenic	MUC2,MUC5AC	dist=20482;dist=26682	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	1124901	1124901	T	A	intergenic	MUC2,MUC5AC	dist=20485;dist=26679	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	1125151	1125151	G	C	intergenic	MUC2,MUC5AC	dist=20735;dist=26429	NaN	NaN	rs11245969	NaN	0.490615	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr11	112832383	112832383	G	G	exonic	NCAM1	NaN	synonymous SNV	NCAM1:NM_000615:exon2:c.G49G:p.A17A,NCAM1:NM_001076682:exon2:c.G49G:p.A17A,NCAM1:NM_001242607:exon2:c.G49G:p.A17A,NCAM1:NM_001242608:exon2:c.G49G:p.A17A,NCAM1:NM_181351:exon2:c.G49G:p.A17A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	37	34	0	0
chr11	112832407	112832407	A	A	ncRNA_intronic	LOC101928847	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	31	22	0	0
chr11	11292922	11292922	G	T	intronic	GALNT18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	11292923	11292923	G	C	intronic	GALNT18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	113018947	113018947	T	C	intronic	NCAM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	113085244	113085244	C	G	intronic	NCAM1	NaN	NaN	NaN	rs686050	NaN	0.463059	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	63.93005	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	19	26	26
chr11	113102064	113102064	A	A	intronic	NCAM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr11	113103397	113103397	T	T	intronic	NCAM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	113111501	113111501	T	C	intronic	NCAM1	NaN	NaN	NaN	rs2303377	NaN	0.413938	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	199.314	39	51.890643	normal_lod	REJECT	20	0	20	29
chr11	113130967	113130967	G	A	exonic	NCAM1	NaN	nonsynonymous SNV	NCAM1:NM_000615:exon16:c.G2023A:p.V675M,NCAM1:NM_001242608:exon16:c.G2023A:p.V675M,NCAM1:NM_181351:exon17:c.G2053A:p.V685M,NCAM1:NM_001242607:exon18:c.G2131A:p.V711M,NCAM1:NM_001076682:exon19:c.G2128A:p.V710M	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.991	D	0.935	D	0.002	U	1.000	D	.	.	0.36	T	-0.517	T	0.299	T	0.712	3.870	19.67	5.53	2.603	4.165	12.367	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.618827	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	202	196	6	0
chr11	113143529	113143529	G	C	ncRNA_intronic	NCAM1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	11314556	11314556	C	G	intronic	GALNT18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.553387	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	84	74	10	0
chr11	113186915	113186915	T	G	intronic	TTC12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr11	113200765	113200765	A	A	intronic	TTC12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	16	12	0	0
chr11	113210226	113210226	G	C	intronic	TTC12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	113222963	113222963	A	A	intronic	TTC12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	113230600	113230600	C	T	intronic	TTC12	NaN	NaN	NaN	rs2276070	NaN	0.28135	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	23.6361	0	NaN	NA	NA	152	74	78	8
chr11	113235378	113235378	G	C	intronic	TTC12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	113265595	113265595	G	A	intronic	ANKK1	NaN	NaN	NaN	rs117599758	NaN	0.00139776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	28.5009	0	NaN	NA	NA	12	7	5	1
chr11	113266965	113266965	A	T	intronic	ANKK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.121549	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	249	236	13	0
chr11	113266966	113266966	C	A	intronic	ANKK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.372136	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	196	182	14	0
chr11	113270015	113270015	G	C	exonic	ANKK1	NaN	nonsynonymous SNV	ANKK1:NM_178510:exon8:c.G1324C:p.G442R	rs4938016	ID=COSM428436;OCCURENCE=1(breast)	0.549321	0.66	T	0.0	B	0.0	B	0.003	N	1.000	P	-0.105	N	2.4	T	-1.003	T	0.000	T	0.07	-1.107	0.137	1.82	-0.013	-0.708	2.025	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	60.297646	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	49	22	27	53
chr11	113281698	113281698	A	A	intronic	DRD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr11	113295034	113295034	T	G	intronic	DRD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr11	11354404	11354404	T	G	intronic	GALNT18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	12	7	4	0
chr11	11354405	11354405	G	T	intronic	GALNT18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	10	6	3	0
chr11	11354406	11354406	A	G	intronic	GALNT18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	6	3	0
chr11	113564026	113564026	A	A	intronic	TMPRSS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	113565176	113565176	T	T	intronic	TMPRSS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	113570405	113570405	T	C	exonic	TMPRSS5	NaN	synonymous SNV	TMPRSS5:NM_001288751:exon3:c.A90G:p.A30A,TMPRSS5:NM_001288752:exon3:c.A117G:p.A39A,TMPRSS5:NM_030770:exon3:c.A117G:p.A39A	rs4936280	NaN	0.770767	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.901915	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	33
chr11	113577052	113577052	A	A	UTR5	TMPRSS5	NM_030770:c.-106T>T,NM_001288751:c.-6290T>T,NM_001288752:c.-106T>T,NM_001288749:c.-6663T>T,NM_001288750:c.-6663T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr11	113577058	113577058	G	G	UTR5	TMPRSS5	NM_030770:c.-112C>C,NM_001288751:c.-6296C>C,NM_001288752:c.-112C>C,NM_001288749:c.-6669C>C,NM_001288750:c.-6669C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr11	113608450	113608450	G	A	intronic	ZW10	NaN	NaN	NaN	rs2279996	NaN	0.0792732	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	140.336532	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	109	54	55	11
chr11	113608962	113608962	T	G	intronic	ZW10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr11	113609142	113609142	A	T	intronic	ZW10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.062643	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	89	80	9	0
chr11	113610132	113610132	A	A	intronic	ZW10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr11	113618470	113618470	T	A	intronic	ZW10	NaN	NaN	NaN	rs2459977	NaN	0.874601	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	408.224	0	NaN	NA	NA	42	0	42	44
chr11	113670153	113670153	A	A	intronic	USP28	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	20	16	0	0
chr11	113673924	113673924	C	A	exonic	USP28	NaN	nonsynonymous SNV	USP28:NM_001301029:exon20:c.G2347T:p.V783F,USP28:NM_020886:exon23:c.G2818T:p.V940F	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.999	D	0.968	D	0.000	D	1.000	D	1.445	L	1.35	T	-0.667	T	0.253	T	0.67	3.989	20.4	5.28	2.758	4.164	19.104	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.20220588235294293	NA	0	0	NaN	NA	NA	11	8	3	0
chr11	113678998	113678998	T	T	intronic	USP28	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr11	113684539	113684539	T	C	intronic	USP28	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	13	5	7	0
chr11	113723410	113723410	A	A	intronic	USP28	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr11	113816472	113816472	T	T	intronic	HTR3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	113816877	113816877	A	A	UTR3	HTR3B	NM_006028:c.*18A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	113848273	113848273	A	T	UTR5	HTR3A	NM_001161772:c.-4A>T	NaN	NaN	rs1985242	NaN	0.554513	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	132.096	0	NaN	NA	NA	49	27	22	48
chr11	113850065	113850065	A	A	intronic	HTR3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr11	113856681	113856681	G	T	intronic	HTR3A	NaN	NaN	NaN	rs10160548	NaN	0.511382	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	1140041	1140041	G	C	intergenic	MUC2,MUC5AC	dist=35625;dist=11539	NaN	NaN	rs7105198	NaN	0.613618	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	114113100	114113100	A	A	intronic	ZBTB16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	114118025	114118025	A	G	exonic	ZBTB16	NaN	nonsynonymous SNV	ZBTB16:NM_001018011:exon6:c.A1730G:p.N577S,ZBTB16:NM_006006:exon6:c.A1730G:p.N577S	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.998	D	0.949	D	0.000	D	1.000	D	0.035	N	2.35	T	-1.016	T	0.053	T	0.111	4.813	27.2	5.57	2.113	7.423	15.723	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	19.5096	0	NaN	NA	NA	177	150	28	17
chr11	114271536	114271536	T	C	intronic	RBM7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.399153		KEEP	30	26	4	0
chr11	114320734	114320734	A	G	UTR3	REXO2	NM_015523:c.*37A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr11	114393314	114393314	T	C	intronic	NXPE1	NaN	NaN	NaN	rs492840	NaN	0.76238	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	76.316197	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	41	31	51
chr11	114450708	114450708	G	A	intronic	NXPE4	NaN	NaN	NaN	rs487707	NaN	0.684704	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.099221	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	21	25	41
chr11	114549134	114549134	T	T	upstream	NXPE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	9	6	0	0
chr11	114574843	114574843	A	G	intronic	NXPE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.024169	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	65	59	6	0
chr11	114576455	114576455	T	A	intronic	NXPE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.315316	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	156	144	12	0
chr11	114800488	114800488	C	T	intergenic	NXPE2,CADM1	dist=222836;dist=243857	NaN	NaN	rs372534654	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	115049522	115049522	A	A	intronic	CADM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	115109186	115109186	A	C	intronic	CADM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	5	3	0
chr11	115109187	115109187	T	G	intronic	CADM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	11	6	4	0
chr11	115109188	115109188	T	A	intronic	CADM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	5	3	0
chr11	11521064	11521064	G	C	intronic	GALNT18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	11521066	11521066	A	C	intronic	GALNT18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	115373492	115373492	T	C	intronic	CADM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	22	4	18	0
chr11	115671399	115671399	G	A	intergenic	LINC00900,BUD13	dist=40481;dist=947487	NaN	NaN	rs7926600	NaN	0.311502	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	115810094	115810094	T	G	intergenic	LINC00900,BUD13	dist=179176;dist=808792	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	115974254	115974254	T	A	intergenic	LINC00900,BUD13	dist=343336;dist=644632	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	116050473	116050473	A	G	intergenic	LINC00900,BUD13	dist=419555;dist=568413	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	116109056	116109056	G	A	intergenic	LINC00900,BUD13	dist=478138;dist=509830	NaN	NaN	rs10891933	NaN	0.370607	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr11	116294634	116294634	T	C	intergenic	LINC00900,BUD13	dist=663716;dist=324252	NaN	NaN	rs471840	NaN	0.577476	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr11	116353800	116353800	G	T	intergenic	LINC00900,BUD13	dist=722882;dist=265086	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr11	116461139	116461139	C	A	intergenic	LINC00900,BUD13	dist=830221;dist=157747	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	116461141	116461141	C	A	intergenic	LINC00900,BUD13	dist=830223;dist=157745	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	116513762	116513762	A	G	intergenic	LINC00900,BUD13	dist=882844;dist=105124	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	11	0	11	0
chr11	116653762	116653762	C	T	intronic	ZPR1	NaN	NaN	NaN	rs76836072	NaN	0.04373	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	193.605641	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	159	77	82	14
chr11	116655221	116655221	A	G	intronic	ZPR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr11	116655675	116655675	A	A	intronic	ZPR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	28	24	0	0
chr11	116657099	116657099	A	C	intronic	ZPR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	116657101	116657101	C	A	intronic	ZPR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	116657313	116657313	A	A	intronic	ZPR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr11	116661559	116661559	A	G	exonic	APOA5	NaN	nonsynonymous SNV	APOA5:NM_001166598:exon4:c.T386C:p.L129P,APOA5:NM_052968:exon4:c.T386C:p.L129P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.585	M	-1.65	D	0.576	D	0.716	D	0.988	3.842	19.51	4.98	2.088	3.141	13.065	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.755753	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	111	105	6	0
chr11	116661560	116661560	G	A	exonic	APOA5	NaN	synonymous SNV	APOA5:NM_001166598:exon4:c.C385T:p.L129L,APOA5:NM_052968:exon4:c.C385T:p.L129L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.483104	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	110	104	6	0
chr11	116661796	116661796	A	G	intronic	APOA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	116732485	116732485	T	T	intronic	SIK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	116766916	116766916	T	T	intronic	SIK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr11	116798100	116798100	T	C	intronic	SIK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.45497	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	285	278	7	0
chr11	116824860	116824860	A	C	intronic	SIK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	116824861	116824861	A	C	intronic	SIK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	116827596	116827596	T	T	intronic	SIK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr11	117034619	117034619	G	T	intronic	PAFAH1B2	NaN	NaN	NaN	rs7122944	NaN	0.750399	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	266.18983	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	100	0	100	56
chr11	117057334	117057334	C	T	exonic	SIDT2	NaN	stopgain	SIDT2:NM_001040455:exon10:c.C997T:p.R333X	NaN	NaN	NaN	0.56	T	.	.	.	.	0.322	N	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	9.297	42	4.66	2.442	0.654	8.663	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.20854	0	NaN	NA	NA	17	14	3	4
chr11	117057946	117057946	G	T	intronic	SIDT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	117059387	117059387	T	T	intronic	SIDT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	117059697	117059697	T	T	intronic	SIDT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	7	0	0
chr11	117062872	117062872	A	C	intronic	SIDT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.75603	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	83	75	8	0
chr11	117064492	117064492	T	T	intronic	SIDT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	117064506	117064506	T	G	intronic	SIDT2	NaN	NaN	NaN	rs115787357	NaN	0.0816693	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.714131	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	38	19	15
chr11	117064735	117064735	A	A	intronic	SIDT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr11	117074376	117074376	A	A	intronic	TAGLN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	117074845	117074845	T	T	intronic	TAGLN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	117150571	117150571	T	A	intronic	RNF214	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr11	117152236	117152236	T	G	intronic	RNF214	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.259078	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	235	206	29	0
chr11	117155724	117155724	T	T	intronic	RNF214	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	117209268	117209268	C	T	intronic	CEP164	NaN	NaN	NaN	rs573801	NaN	0.217652	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	216.848	0	NaN	NA	NA	57	25	32	18
chr11	117233298	117233298	A	C	intronic	CEP164	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	0	3	0
chr11	117233300	117233300	A	C	intronic	CEP164	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr11	117233304	117233304	T	G	intronic	CEP164	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	117246348	117246348	T	G	intronic	CEP164	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	117257876	117257876	G	T	intronic	CEP164	NaN	NaN	NaN	rs2305829	NaN	0.207069	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	112.317631	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	83	36	47	13
chr11	117288834	117288834	C	C	intergenic	CEP164,DSCAML1	dist=4852;dist=9654	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	117299015	117299015	T	C	UTR3	DSCAML1	NM_020693:c.*29A>G	NaN	NaN	rs2925768	NaN	0.444688	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	110.352	0	39.927106	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	26	24	51
chr11	117306293	117306293	A	G	intronic	DSCAML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	91	87	4	0
chr11	117306295	117306295	G	A	intronic	DSCAML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	43	36	7	4
chr11	117308541	117308541	T	T	intronic	DSCAML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	117309576	117309576	C	T	intronic	DSCAML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2631578947368443	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr11	117309583	117309583	A	A	intronic	DSCAML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	47	42	0	0
chr11	117310718	117310718	T	G	intronic	DSCAML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	117342401	117342401	T	T	intronic	DSCAML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr11	117352974	117352974	T	C	intronic	DSCAML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	117374414	117374414	C	T	intronic	DSCAML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.291973	nearby_gap_events	REJECT	86	76	10	0
chr11	117374522	117374522	T	T	intronic	DSCAML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	97	70	0	0
chr11	117376101	117376101	T	A	intronic	DSCAML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	117376102	117376102	A	T	intronic	DSCAML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr11	117380732	117380732	G	A	intronic	DSCAML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr11	117572278	117572278	A	A	intronic	DSCAML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr11	117698582	117698582	A	G	intronic	FXYD2,FXYD6-FXYD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	117712461	117712461	C	T	intronic	FXYD6,FXYD6-FXYD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.5232	0	NaN	NA	NA	119	102	18	4
chr11	117726465	117726465	C	T	intronic	FXYD6,FXYD6-FXYD2	NaN	NaN	NaN	rs4084120	NaN	0.221246	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	117741231	117741231	C	C	intronic	FXYD6,FXYD6-FXYD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	117774926	117774926	G	T	intronic	TMPRSS13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	16	8	6	0
chr11	117774927	117774927	A	C	intronic	TMPRSS13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	0	3	0
chr11	117780492	117780492	G	A	intronic	TMPRSS13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	16	9	7	0
chr11	117780493	117780493	T	A	intronic	TMPRSS13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	16	9	7	0
chr11	117780496	117780496	A	C	intronic	TMPRSS13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	18	10	7	0
chr11	117800083	117800083	T	C	UTR5	TMPRSS13	NM_001206789:c.-61A>G,NM_001077263:c.-61A>G,NM_001244995:c.-61A>G,NM_001206790:c.-61A>G	NaN	NaN	rs10892196	NaN	0.621605	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.067738	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	32
chr11	117864063	117864063	A	G	exonic	IL10RA	NaN	nonsynonymous SNV	IL10RA:NM_001558:exon4:c.A475G:p.S159G	rs3135932	NaN	0.0816693	0.19	T	0.841	P	0.142	B	0.788	N	1.000	P	1.78	L	0.92	T	-1.083	T	0.000	T	0.187	2.242	13.45	2.05	0.088	0.409	6.596	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	170.472	0	NaN	NA	NA	70	34	16	1
chr11	117864520	117864520	T	C	intronic	IL10RA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	20	10	9	0
chr11	117866508	117866508	A	A	intronic	IL10RA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	117973759	117973759	T	T	intronic	TMPRSS4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	22	18	0	0
chr11	117975313	117975313	T	G	intronic	TMPRSS4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	5	9	0
chr11	11799017	11799017	A	G	intergenic	MIR4299,MIR8070	dist=120748;dist=5665	NaN	NaN	rs4451726	NaN	0.834265	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	118023377	118023377	A	A	exonic	SCN4B	NaN	synonymous SNV	SCN4B:NM_001142348:exon1:c.T12T:p.A4A,SCN4B:NM_174934:exon1:c.T12T:p.A4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	40	33	0	0
chr11	118037466	118037466	G	C	UTR3	SCN2B	NM_004588:c.*136C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.925684	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	118	106	12	1
chr11	118068631	118068631	T	T	intronic	AMICA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	118081276	118081276	T	C	exonic	AMICA1	NaN	nonsynonymous SNV	AMICA1:NM_001286570:exon3:c.A233G:p.E78G,AMICA1:NM_001286571:exon3:c.A233G:p.E78G,AMICA1:NM_153206:exon3:c.A320G:p.E107G,AMICA1:NM_001098526:exon4:c.A350G:p.E117G	NaN	NaN	NaN	0.09	T	1.0	D	1.0	D	0.000	D	0.997	D	2.14	M	-0.13	T	-0.278	T	0.392	T	0.779	2.959	15.87	5.14	2.156	1.659	11.281	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.904528	nearby_gap_events	REJECT	91	83	8	0
chr11	118100715	118100715	A	A	intronic	MPZL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	118183153	118183153	C	G	intronic	CD3E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	118183154	118183154	C	A	intronic	CD3E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	118183157	118183157	T	C	intronic	CD3E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	118183158	118183158	C	G	intronic	CD3E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	118183159	118183159	A	G	intronic	CD3E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	118184412	118184412	C	C	intronic	CD3E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	121	94	0	0
chr11	118255466	118255466	A	A	ncRNA_intronic	LOC100131626	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	101	80	0	0
chr11	118257132	118257132	T	C	ncRNA_intronic	LOC100131626	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr11	118257355	118257355	C	A	ncRNA_intronic	LOC100131626	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	37.8067	0	NaN	NA	NA	410	335	90	11
chr11	118279714	118279714	G	A	splicing	ATP5L	NM_006476:exon3:c.214-1G>A	NaN	NaN	NaN	ID=COSM541015;OCCURENCE=1(lung)	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.862	19.62	4.71	1.378	9.039	14.199	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.0477	0	NaN	NA	NA	19	16	3	0
chr11	118354856	118354856	T	T	intronic	KMT2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr11	118355550	118355550	T	C	intronic	KMT2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.376322	possible_contamination	REJECT	59	55	4	0
chr11	118370527	118370527	T	T	intronic	KMT2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr11	118382548	118382548	T	T	intronic	KMT2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	118405343	118405343	G	A	UTR3	TMEM25	NM_032780:c.*48G>A,NM_001144036:c.*48G>A,NM_001144035:c.*48G>A,NM_001144034:c.*48G>A	NaN	NaN	rs512849	NaN	0.983427	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	90.138488	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	88	45	43	55
chr11	118416659	118416659	A	G	intronic	IFT46,TMEM25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.07871	0	NaN	NA	NA	12	10	2	0
chr11	118422472	118422472	T	T	intronic	IFT46	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr11	118464263	118464263	T	C	intronic	ARCN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	21	12	9	0
chr11	118464451	118464451	A	A	intronic	ARCN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr11	118468288	118468288	T	TAGAG	intronic	ARCN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.978634	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	63.7739	0	NaN	NA	NA	50	31	18	39
chr11	118499182	118499182	C	T	exonic	PHLDB1	NaN	nonsynonymous SNV	PHLDB1:NM_001144758:exon6:c.C1643T:p.T548I,PHLDB1:NM_001144759:exon6:c.C1643T:p.T548I,PHLDB1:NM_015157:exon7:c.C1643T:p.T548I	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.956	P	0.527	P	0.002	N	1.000	D	1.245	L	1.45	T	-1.127	T	0.080	T	0.146	4.027	20.7	4.74	2.688	3.461	14.541	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.310803	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	97	90	7	0
chr11	118499510	118499510	A	A	intronic	PHLDB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	118502212	118502212	A	A	intronic	PHLDB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	118502659	118502659	G	T	exonic	PHLDB1	NaN	nonsynonymous SNV	PHLDB1:NM_001144758:exon8:c.G2130T:p.Q710H,PHLDB1:NM_001144759:exon8:c.G2130T:p.Q710H,PHLDB1:NM_015157:exon9:c.G2130T:p.Q710H	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.997	D	0.892	P	0.086	N	1.000	D	1.59	L	1.48	T	-1.074	T	0.115	T	0.509	2.432	14.09	2.04	0.146	2.491	9.068	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.58161	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	156	152	4	0
chr11	118516009	118516009	T	A	intronic	PHLDB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	118516011	118516011	C	A	intronic	PHLDB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	118516051	118516051	A	G	intronic	PHLDB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.814095	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	153	145	8	0
chr11	118528960	118528960	T	T	UTR3	TREH	NM_007180:c.*39A>A,NM_001301065:c.*39A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr11	118529044	118529044	C	CG	exonic	TREH	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	0.9998	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	629.506	0	NaN	NA	NA	66	0	65	22
chr11	118529078	118529078	G	C	exonic	TREH	NaN	unknown	UNKNOWN	rs6589671	NaN	1	0.27	T	0.0	B	0.002	B	0.901	N	1.000	P	.	.	2.54	T	-1.020	T	0.000	T	0.068	-0.705	0.956	-9.7	-1.997	-0.744	2.296	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	36	0	36	46
chr11	118529176	118529176	A	A	intronic	TREH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	118529444	118529444	T	T	splicing	TREH	NM_007180:exon15:c.1546-2A>A,NM_001301065:exon14:c.1453-2A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	16	13	0	0
chr11	11862847	11862847	A	G	upstream	USP47	NaN	NaN	NaN	rs11606956	NaN	0.470048	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	11863783	11863783	C	G	intronic	USP47	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	7	6	1	0
chr11	118639111	118639111	A	C	intronic	DDX6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	118639117	118639117	C	G	intronic	DDX6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	118769656	118769656	TCG	CGG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	65.4459	30	NaN	NA	NA	14	3	7	5
chr11	118769928	118769928	C	CG	exonic	BCL9L	NaN	frameshift substitution	BCL9L:NM_182557:exon8:c.3696_3696delinsCG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.89544	0	NaN	NA	NA	55	45	8	0
chr11	118770005	118770005	C	T	exonic	BCL9L	NaN	nonsynonymous SNV	BCL9L:NM_182557:exon8:c.G3619A:p.G1207R	NaN	NaN	NaN	0.14	T	0.999	D	0.956	D	0.111	N	0.994	D	0.55	N	-0.41	T	-0.462	T	0.301	T	0.568	1.738	11.77	3.06	2.003	5.545	15.333	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.282518	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	184	172	12	0
chr11	118770060	118770060	A	G	exonic	BCL9L	NaN	synonymous SNV	BCL9L:NM_182557:exon8:c.T3564C:p.H1188H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	34.8275	0	NaN	NA	NA	6	1	5	9
chr11	118773156	118773156	C	G	exonic	BCL9L	NaN	nonsynonymous SNV	BCL9L:NM_182557:exon6:c.G1296C:p.K432N	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.818	P	0.543	P	0.038	N	0.637	D	0.55	N	-0.17	T	-0.698	T	0.166	T	0.219	0.003	4.029	2.87	0.609	1.743	9.920	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.26666666666666755	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr11	118773616	118773616	G	A	exonic	BCL9L	NaN	nonsynonymous SNV	BCL9L:NM_182557:exon6:c.C836T:p.A279V	NaN	NaN	NaN	0.28	T	0.001	B	0.003	B	0.000	D	0.990	N	0.345	N	-0.16	T	-1.039	T	0.105	T	0.085	2.314	13.69	2.22	0.403	3.457	6.838	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.286796	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	10	8	2	0
chr11	118778356	118778356	A	C	intronic	BCL9L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	18	10	8	0
chr11	118788517	118788517	C	A	intergenic	BCL9L,UPK2	dist=6904;dist=38491	NaN	NaN	rs73575424	NaN	0.0780751	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr11	118842686	118842686	C	T	exonic	FOXR1	NaN	synonymous SNV	FOXR1:NM_181721:exon1:c.C45T:p.P15P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.09022556390977425	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr11	118882059	118882059	A	A	intronic	CCDC84	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	16	15	0	0
chr11	118889612	118889612	T	C	exonic	TRAPPC4	NaN	nonsynonymous SNV	TRAPPC4:NM_016146:exon1:c.T107C:p.L36P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.605	M	0.39	T	0.706	D	0.772	D	0.992	5.528	35	5.86	2.246	7.694	16.246	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.731379	nearby_gap_events	REJECT	47	41	6	0
chr11	118897457	118897457	T	T	intronic	SLC37A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	118916227	118916227	C	T	UTR3	HYOU1	NM_006389:c.*78G>A,NM_001130991:c.*78G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.26216	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	157	145	12	0
chr11	118916269	118916269	G	G	UTR3	HYOU1	NM_006389:c.*36C>C,NM_001130991:c.*36C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	177	163	0	0
chr11	118921734	118921734	C	T	intronic	HYOU1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.694626	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	202	190	12	0
chr11	118947585	118947585	T	T	intronic	VPS11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	118947817	118947817	A	T	intronic	VPS11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	118952348	118952348	G	C	UTR3	VPS11	NM_021729:c.*15G>C,NM_001290185:c.*15G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	19	13	4	0
chr11	118959506	118959506	A	T	intronic	HMBS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	118959507	118959507	A	G	intronic	HMBS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	118959993	118959993	A	G	intronic	HMBS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	53	28	23	0
chr11	118960011	118960011	C	C	intronic	HMBS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	118960012	118960012	T	T	intronic	HMBS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	118960986	118960986	A	A	intronic	HMBS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr11	118963048	118963048	T	T	intronic	HMBS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	118984904	118984904	C	A	exonic	C2CD2L	NaN	nonsynonymous SNV	C2CD2L:NM_001290474:exon13:c.C1738A:p.P580T,C2CD2L:NM_014807:exon13:c.C1741A:p.P581T	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.902	P	0.415	B	0.000	D	0.837	D	1.1	L	0.41	T	-0.828	T	0.137	T	0.374	3.049	16.17	5.41	2.798	0.909	14.618	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	6.86458	0	25.416591	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	111	98	13	9
chr11	118985173	118985173	A	T	intronic	C2CD2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr11	118997869	118997869	C	T	intronic	HINFP	NaN	NaN	NaN	rs547345	NaN	0.419329	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	164.481	0	NaN	NA	NA	253	1	252	9
chr11	119021027	119021027	A	A	intronic	ABCG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr11	119029455	119029455	G	C	intronic	ABCG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.20798319327731155	NA	0	0	9.15284	nearby_gap_events	REJECT	35	28	7	1
chr11	119029731	119029731	C	A	intronic	ABCG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	119029733	119029733	T	G	intronic	ABCG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	119031677	119031677	A	G	exonic	ABCG4	NaN	nonsynonymous SNV	ABCG4:NM_001142505:exon15:c.A1802G:p.E601G,ABCG4:NM_022169:exon15:c.A1802G:p.E601G	NaN	NaN	NaN	0.46	T	0.004	B	0.008	B	0.344	N	1.000	N	1.445	L	1.01	T	-1.027	T	0.094	T	0.174	0.811	8.260	5.55	2.118	5.154	10.879	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.730802	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	446	437	9	0
chr11	119043201	119043201	A	G	intronic	NLRX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr11	119044827	119044827	A	A	intronic	NLRX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr11	119045068	119045068	T	T	intronic	NLRX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	17	13	0	0
chr11	119054473	119054473	T	T	UTR3	NLRX1	NM_001282358:c.*325T>T,NM_001282144:c.*325T>T,NM_024618:c.*325T>T,NM_001282143:c.*325T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr11	119056522	119056522	T	C	intronic	PDZD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.176493	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	175	154	21	0
chr11	119056523	119056523	G	T	intronic	PDZD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.137162	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	175	153	22	0
chr11	119056524	119056524	C	G	intronic	PDZD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.223996	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	174	152	22	0
chr11	119058248	119058248	C	T	intronic	PDZD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.47067	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	139	129	10	0
chr11	119058605	119058605	T	T	intronic	PDZD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr11	119060089	119060089	C	G	intronic	PDZD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	63	32	31	0
chr11	119061391	119061391	T	T	intronic	CCDC153	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr11	119063794	119063794	T	A	intronic	CCDC153	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	119064014	119064014	A	G	intronic	CCDC153	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.432568	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	36	26	10	0
chr11	119066056	119066056	T	C	intronic	CCDC153	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	119170536	119170536	A	G	UTR3	CBL	NM_005188:c.*45A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr11	119182691	119182691	A	G	intronic	MCAM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	3	4	1
chr11	119183133	119183133	G	C	exonic	MCAM	NaN	synonymous SNV	MCAM:NM_006500:exon8:c.C867G:p.P289P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	113	76	37	0
chr11	119185179	119185179	T	T	intronic	MCAM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	119205788	119205788	C	A	UTR5	RNF26	NM_032015:c.-45C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	83	19	56	0
chr11	119205789	119205789	C	G	UTR5	RNF26	NM_032015:c.-44C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	94	36	49	0
chr11	119206601	119206601	G	A	exonic	RNF26	NaN	nonsynonymous SNV	RNF26:NM_032015:exon1:c.G769A:p.A257T	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.018	B	0.009	B	0.026	N	1.000	N	1.39	L	1.44	T	-1.028	T	0.057	T	0.326	2.746	15.14	4.29	1.195	1.112	5.210	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.452239	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	215	209	6	0
chr11	119206745	119206745	G	A	exonic	RNF26	NaN	nonsynonymous SNV	RNF26:NM_032015:exon1:c.G913A:p.G305R	rs200106607	NaN	0.000199681	0.55	T	0.664	P	0.117	B	0.079	N	0.959	D	1.5	L	1.31	T	-1.072	T	0.064	T	0.555	0.925	8.766	5.42	2.542	5.205	11.582	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.876795	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	181	169	12	0
chr11	119213204	119213204	C	G	intronic	C1QTNF5,MFRP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.825353	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	532	500	32	0
chr11	119213765	119213765	G	C	intronic	C1QTNF5,MFRP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	76	NaN	NA	NA	17	15	2	0
chr11	119213766	119213766	C	A	intronic	C1QTNF5,MFRP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	37	35	2	0
chr11	119213767	119213767	A	A	intronic	C1QTNF5,MFRP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	38	34	0	0
chr11	119213782	119213782	A	T	intronic	C1QTNF5,MFRP	NaN	NaN	NaN	rs948411	NaN	0.131989	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	106.177606	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	0	38	21
chr11	119215253	119215253	G	C	intronic	C1QTNF5,MFRP	NaN	NaN	NaN	rs2509388	NaN	0.611621	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	140.797134	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	1	47	1
chr11	119215256	119215256	C	T	intronic	C1QTNF5,MFRP	NaN	NaN	NaN	rs10892350	NaN	0.509984	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	140.904471	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	0	47	39
chr11	119216504	119216504	C	T	exonic	MFRP	NaN	nonsynonymous SNV	MFRP:NM_031433:exon4:c.G406A:p.V136M	rs3814762	NaN	0.182109	0.22	T	0.079	B	0.009	B	0.132	N	1.000	P	-0.625	N	1.83	T	-0.994	T	0.000	T	0.062	0.623	7.352	-3.06	-0.646	-1.868	6.357	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	41	19	22	7
chr11	119217311	119217311	G	A	UTR5	C1QTNF5,MFRP	NM_015645:c.-6204C>T;NM_031433:c.-88C>T	NaN	NaN	rs883245	NaN	0.583866	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	55.8206	0	NaN	NA	NA	30	19	11	27
chr11	119229452	119229452	A	G	intronic	USP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	119230060	119230060	A	A	intronic	USP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr11	119241393	119241393	C	T	intronic	USP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	119241394	119241394	A	G	intronic	USP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	11924500	11924500	A	A	intronic	USP47	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr11	119252150	119252150	C	CT	intronic	USP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	888.87	0	NaN	NA	NA	102	0	19	12
chr11	119290722	119290722	T	C	ncRNA_intronic	USP2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	119290724	119290724	T	A	ncRNA_intronic	USP2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	119290726	119290726	C	A	ncRNA_intronic	USP2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	119341038	119341038	C	T	ncRNA_intronic	USP2-AS1	NaN	NaN	NaN	rs634182	NaN	0.714457	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	15	0	15	0
chr11	11941744	11941744	T	G	exonic	USP47	NaN	nonsynonymous SNV	USP47:NM_017944:exon8:c.T807G:p.D269E,USP47:NM_001282659:exon9:c.T1011G:p.D337E	NaN	NaN	NaN	0.86	T	0.098	B	0.124	B	0.000	D	1.000	D	0.165	N	3.54	T	-0.973	T	0.010	T	0.801	2.294	13.63	2.83	0.822	1.495	9.155	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.17135	0	NaN	NA	NA	23	20	3	0
chr11	11944464	11944464	A	T	intronic	USP47	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr11	119508734	119508734	T	G	downstream	PVRL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	119510751	119510751	A	C	intronic	PVRL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	11954579	11954579	A	G	exonic	USP47	NaN	synonymous SNV	USP47:NM_017944:exon14:c.A1476G:p.E492E,USP47:NM_001282659:exon15:c.A1680G:p.E560E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.408519	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	51	46	5	0
chr11	119545919	119545919	G	T	exonic	PVRL1	NaN	nonsynonymous SNV	PVRL1:NM_002855:exon5:c.C953A:p.A318D,PVRL1:NM_203285:exon5:c.C953A:p.A318D,PVRL1:NM_203286:exon5:c.C953A:p.A318D	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	4.145	H	1.89	T	-0.090	T	0.303	T	0.997	5.023	29.6	5.46	2.559	9.426	18.308	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	9.96155	0	16.907254	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	60	51	9	20
chr11	11958114	11958114	T	G	intronic	USP47	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.472291	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	162	149	13	0
chr11	11958185	11958185	A	G	intronic	USP47	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	33	6	25	0
chr11	119606985	119606985	C	G	ncRNA_intronic	LOC102724301	NaN	NaN	NaN	rs11217437	NaN	0.417931	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	119607659	119607659	A	G	ncRNA_intronic	LOC102724301	NaN	NaN	NaN	rs12786505	NaN	0.505391	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	11976580	11976580	G	A	splicing	USP47	NM_017944:exon26:c.3559-1G>A,NM_001282659:exon27:c.3763-1G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.921	19.95	5.91	2.791	9.869	19.884	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	314	200	74	0
chr11	11986264	11986264	A	G	intronic	DKK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.77	T	0.002	B	0.001	B	.	.	1.000	N	.	.	2.23	T	-0.941	T	0.017	T	0.051	0.043	4.237	-0.523	-0.084	-0.060	5.054	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.679142	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	325	318	7	0
chr11	11986372	11986372	A	C	intronic	DKK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	119983248	119983248	C	A	intronic	TRIM29	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.084623	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	58	51	7	0
chr11	120099927	120099927	A	A	UTR3	OAF	NM_178507:c.*76A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	120130684	120130684	T	G	ncRNA_intronic	LOC649133	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	120170525	120170525	A	A	intronic	POU2F3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	120178159	120178159	G	C	intronic	POU2F3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	120178160	120178160	C	G	intronic	POU2F3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	120178161	120178161	T	A	intronic	POU2F3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	120300327	120300327	A	C	intronic	ARHGEF12	NaN	NaN	NaN	rs11217865	NaN	0.105831	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.307677	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	21	18	20
chr11	120328614	120328614	T	C	intronic	ARHGEF12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	34	5	27	0
chr11	120334919	120334919	A	A	intronic	ARHGEF12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	120340060	120340060	A	T	exonic	ARHGEF12	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGEF12:NM_001198665:exon29:c.A2861T:p.Y954F,ARHGEF12:NM_001301084:exon30:c.A2609T:p.Y870F,ARHGEF12:NM_015313:exon30:c.A2918T:p.Y973F	rs2305013	NaN	0.0632987	0.49	T	0.01	B	0.012	B	0.001	D	0.023	P	0.205	N	-0.03	T	-1.072	T	0.002	T	0.19	2.949	15.83	4.89	1.833	5.921	10.439	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	61.547087	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	32	27	6
chr11	120347886	120347886	T	TTGTTG	intronic	ARHGEF12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.424521	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	907.665	0	NaN	NA	NA	100	1	84	26
chr11	120348051	120348051	A	A	intronic	ARHGEF12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	120351167	120351167	A	A	intronic	ARHGEF12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr11	120530963	120530963	C	A	intronic	GRIK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.198789	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	109	97	12	0
chr11	120530973	120530973	C	T	intronic	GRIK4	NaN	NaN	NaN	rs6589829	NaN	0.51278	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	270.062	0	NaN	NA	NA	72	29	43	44
chr11	120769196	120769196	T	T	intronic	GRIK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	120769429	120769429	A	A	intronic	GRIK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr11	120957421	120957421	T	T	intronic	TBCEL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr11	120957540	120957540	A	G	exonic	TBCEL	NaN	nonsynonymous SNV	TBCEL:NM_001130047:exon8:c.A1010G:p.D337G,TBCEL:NM_152715:exon8:c.A1010G:p.D337G	NaN	NaN	NaN	0.08	T	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	2.36	M	1.33	T	-0.636	T	0.241	T	0.664	4.402	23.3	5.76	2.195	8.846	16.075	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.71022	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	109	104	5	0
chr11	120973343	120973343	T	A	upstream	TECTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.827417	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	129	118	11	0
chr11	120984007	120984007	C	T	intronic	TECTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	120984009	120984009	A	G	intronic	TECTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	120984215	120984215	T	T	intronic	TECTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	121000241	121000241	C	A	intronic	TECTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	121000242	121000242	T	G	intronic	TECTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	8	0	6	0
chr11	121000268	121000268	G	C	intronic	TECTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.663645	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	38	34	4	0
chr11	121032978	121032978	G	A	exonic	TECTA	NaN	nonsynonymous SNV	TECTA:NM_005422:exon15:c.G5171A:p.S1724N	rs526433	NaN	0.996805	0.75	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.999	P	-0.55	N	-1.06	T	-0.948	T	0.000	T	0.048	0.492	6.668	5.54	0.932	5.901	11.584	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	289.893038	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	111	0	111	58
chr11	121035975	121035975	T	C	intronic	TECTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.021585	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	72	64	8	0
chr11	121039650	121039650	A	T	intronic	TECTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr11	121060643	121060643	A	A	intronic	TECTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	15	13	0	0
chr11	121175009	121175009	T	C	intronic	SC5D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	121340870	121340870	A	G	intronic	SORL1	NaN	NaN	NaN	rs116967561	NaN	0.0155751	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	85.905196	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	81	44	37	4
chr11	1213566	1213566	G	C	exonic	MUC5AC	NaN	unknown	UNKNOWN	rs72846342	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr11	121425955	121425955	A	T	exonic	SORL1	NaN	synonymous SNV	SORL1:NM_003105:exon18:c.A2499T:p.T833T	rs78274293	NaN	0.0367412	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	116.460404	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	24	48	7
chr11	12143044	12143044	G	A	intronic	MICAL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr11	121454149	121454149	C	G	intronic	SORL1	NaN	NaN	NaN	rs73595277	NaN	0.127396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.941494	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	6	7	5
chr11	121460729	121460729	G	A	intronic	SORL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.529602	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	273	267	6	0
chr11	121481930	121481930	A	G	intronic	SORL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	4	5	0
chr11	121490452	121490452	T	T	intronic	SORL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	121490646	121490646	A	A	intronic	SORL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	121527592	121527592	A	G	intergenic	SORL1,MIR100HG	dist=23121;dist=432219	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1218582	1218582	A	T	intronic	MUC5AC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1219626	1219626	C	T	intronic	MUC5AC	NaN	NaN	NaN	rs56013970	NaN	0.0123802	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	1	10	0
chr11	1219632	1219632	G	G	intronic	MUC5AC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr11	12243325	12243325	G	C	intronic	MICAL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.287649	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	79	67	12	0
chr11	12243326	12243326	C	G	intronic	MICAL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.326664	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	79	67	12	0
chr11	12244916	12244916	T	G	intronic	MICAL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	40	14	26	0
chr11	12244922	12244922	A	G	intronic	MICAL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	490	310	180	0
chr11	12248538	12248538	T	A	intronic	MICAL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	5	3	0
chr11	122505581	122505581	G	A	intergenic	MIR100HG,UBASH3B	dist=431811;dist=20817	NaN	NaN	rs11218724	NaN	0.234225	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	12264144	12264144	A	A	intronic	MICAL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	122646837	122646837	T	A	intronic	UBASH3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	122647944	122647944	G	A	intronic	UBASH3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.426543	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	98	91	7	0
chr11	122650172	122650172	C	G	intronic	UBASH3B	NaN	NaN	NaN	rs4935813	NaN	0.733227	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	56.939831	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	70	43	27	54
chr11	122662737	122662737	G	C	intronic	UBASH3B	NaN	NaN	NaN	rs11218813	NaN	0.134185	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr11	122665329	122665329	C	C	intronic	UBASH3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	122665330	122665330	C	C	intronic	UBASH3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	122665331	122665331	A	A	intronic	UBASH3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	122666816	122666816	T	C	intronic	UBASH3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	122669572	122669572	T	G	intronic	UBASH3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	11	0	11	0
chr11	122669819	122669819	A	T	intronic	UBASH3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	122680630	122680630	A	T	UTR3	UBASH3B	NM_032873:c.*36A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	122775078	122775078	G	T	exonic	C11orf63	NaN	stopgain	C11orf63:NM_024806:exon3:c.G790T:p.G264X,C11orf63:NM_199124:exon3:c.G790T:p.G264X	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	6.153	37	5.74	2.704	6.258	18.101	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.920264		KEEP	35	31	4	0
chr11	12279937	12279937	T	C	intronic	MICAL2	NaN	NaN	NaN	rs2270513	NaN	0.400759	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	134.89462	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	87	34	53	26
chr11	12279987	12279987	T	C	intronic	MICAL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.018079	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	34	29	5	0
chr11	122928622	122928622	A	G	exonic	HSPA8	NaN	synonymous SNV	HSPA8:NM_006597:exon9:c.T1761C:p.A587A	rs4802	NaN	0.432308	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSm	3	Somatic	0.032337626338764885	Somatic	125.969	20	NaN	NA	NA	107	84	23	10
chr11	122929562	122929562	A	T	intronic	HSPA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	16	9	7	0
chr11	122945576	122945576	A	A	intronic	CLMP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	123068842	123068842	G	T	intergenic	CLMP,MIR4493	dist=2835;dist=183306	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	12313887	12313887	C	G	intronic	MICALCL	NaN	NaN	NaN	rs1874043	NaN	0.917532	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	45.5459	0	NaN	NA	NA	89	0	89	10
chr11	12315407	12315407	G	C	exonic	MICALCL	NaN	synonymous SNV	MICALCL:NM_032867:exon3:c.G429C:p.G143G	rs10741579	NaN	0.921725	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	399.614509	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	130	0	130	55
chr11	123456271	123456271	C	C	intronic	GRAMD1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	12345688	12345688	T	C	intronic	MICALCL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	123480981	123480981	T	C	exonic	GRAMD1B	NaN	synonymous SNV	GRAMD1B:NM_001286564:exon13:c.T1305C:p.H435H,GRAMD1B:NM_020716:exon13:c.T1425C:p.H475H,GRAMD1B:NM_001286563:exon14:c.T1446C:p.H482H	rs10893053	NaN	0.241813	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	59.760645	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	30	29	33
chr11	123485561	123485561	T	C	intronic	GRAMD1B	NaN	NaN	NaN	rs1275061	NaN	0.373602	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	49.208738	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	16	21	37
chr11	123489381	123489381	T	C	intronic	GRAMD1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2941176470588277	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr11	123489750	123489750	G	T	intronic	GRAMD1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	123516268	123516268	A	G	intronic	SCN3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	123524411	123524411	G	A	intronic	SCN3B	NaN	NaN	NaN	rs3851102	NaN	0.142173	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	201.723821	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	231	135	96	13
chr11	123598289	123598289	T	G	exonic	ZNF202	NaN	synonymous SNV	ZNF202:NM_001301819:exon5:c.A175C:p.R59R,ZNF202:NM_001301780:exon6:c.A847C:p.R283R,ZNF202:NM_001301779:exon7:c.A847C:p.R283R,ZNF202:NM_003455:exon8:c.A847C:p.R283R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.309973	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	144	131	13	0
chr11	123598290	123598290	G	T	exonic	ZNF202	NaN	synonymous SNV	ZNF202:NM_001301819:exon5:c.C174A:p.P58P,ZNF202:NM_001301780:exon6:c.C846A:p.P282P,ZNF202:NM_001301779:exon7:c.C846A:p.P282P,ZNF202:NM_003455:exon8:c.C846A:p.P282P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.662786	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	149	135	14	0
chr11	123599772	123599772	T	T	intronic	ZNF202	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr11	123754073	123754073	A	T	intronic	TMEM225	NaN	NaN	NaN	rs4587739	NaN	0.348442	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1709.47	0	NaN	NA	NA	114	0	114	31
chr11	123810593	123810593	T	C	exonic	OR4D5	NaN	synonymous SNV	OR4D5:NM_001001965:exon1:c.T270C:p.P90P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.169113	nearby_gap_events	REJECT	40	35	5	0
chr11	123814251	123814251	T	C	exonic	OR6T1	NaN	nonsynonymous SNV	OR6T1:NM_001005187:exon1:c.A295G:p.I99V	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.009	B	0.007	B	.	.	1.000	N	-0.295	N	4.09	T	-0.904	T	0.004	T	0.114	0.394	6.137	-6.77	-0.647	-2.802	1.220	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.47645	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	503	494	9	0
chr11	123886352	123886352	T	C	exonic	OR10G4	NaN	nonsynonymous SNV	OR10G4:NM_001004462:exon1:c.T71C:p.L24P	rs547068	NaN	NaN	0.35	T	0.0	B	0.0	B	0.108	N	1.000	P	0.51	N	6.01	T	-0.903	T	0.002	T	0.268	-0.213	2.968	-2.71	-1.205	-0.326	12.255	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	42.8593	0	NaN	NA	NA	103	78	15	5
chr11	123894234	123894234	A	G	exonic	OR10G9	NaN	nonsynonymous SNV	OR10G9:NM_001001953:exon1:c.A515G:p.Q172R	rs11219413	ID=COSM147358;OCCURENCE=1(stomach)	0.312899	0.48	T	0.0	B	0.007	B	0.604	N	1.000	P	0.38	N	8.73	T	-1.136	T	0.000	T	0.079	-1.106	0.137	-0.337	-0.180	-1.239	3.862	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	597	342	255	34
chr11	123894402	123894402	A	G	exonic	OR10G9	NaN	nonsynonymous SNV	OR10G9:NM_001001953:exon1:c.A683G:p.H228R	rs12221656	ID=COSM147361;OCCURENCE=1(stomach)	0.325479	1	T	0.0	B	0.0	B	0.231	N	1.000	P	-0.855	N	1.36	T	-0.924	T	0.000	T	0.102	-2.265	0.004	2.52	0.297	-1.055	3.881	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.010965864827951985	NA	0	0	NaN	NA	NA	100	71	29	34
chr11	123908744	123908744	A	G	downstream	OR10G7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.9964	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	173	147	26	0
chr11	124007916	124007916	A	G	exonic	VWA5A	NaN	nonsynonymous SNV	VWA5A:NM_014622:exon14:c.A1820G:p.D607G,VWA5A:NM_001130142:exon15:c.A1820G:p.D607G	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.001	B	0.003	B	0.174	N	0.999	D	2.125	M	3.71	T	-1.068	T	0.019	T	0.16	1.366	10.49	4.13	0.829	1.773	10.558	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	99	60	39	0
chr11	124121067	124121067	T	C	exonic	OR8G1	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.41343	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	688	680	8	0
chr11	124134743	124134743	G	A	exonic	OR8G5	NaN	synonymous SNV	OR8G5:NM_001005198:exon1:c.G21A:p.G7G	rs2466637	NaN	0.438299	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	267.851026	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	94	1	93	45
chr11	124189976	124189976	C	A	exonic	OR8D2	NaN	nonsynonymous SNV	OR8D2:NM_001002918:exon1:c.G118T:p.V40L	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.132	B	0.049	B	0.070	N	0.894	N	0.015	N	8.41	T	-1.153	T	0.000	T	0.064	1.402	10.62	2.45	0.959	-1.866	7.590	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.760825	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	440	412	28	0
chr11	124267177	124267177	T	C	exonic	OR8B3	NaN	nonsynonymous SNV	OR8B3:NM_001005467:exon1:c.A71G:p.Q24R	rs507360	NaN	0.856829	0.06	T	0.338	B	0.167	B	0.009	N	0.999	P	1.74	L	6.33	T	-1.125	T	0.000	T	0.08	0.286	5.549	2.52	0.745	2.013	9.472	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	235.521	0	NaN	NA	NA	181	0	181	15
chr11	124267189	124267189	T	C	exonic	OR8B3	NaN	nonsynonymous SNV	OR8B3:NM_001005467:exon1:c.A59G:p.H20R	rs507335	NaN	0.858826	0.51	T	0.0	B	0.0	B	0.685	N	1.000	P	0.52	N	5.0	T	-1.054	T	0.000	T	0.045	-1.403	0.023	-5.33	-1.778	-9.050	1.650	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	186.033	0	NaN	NA	NA	194	0	194	13
chr11	124267210	124267210	A	G	exonic	OR8B3	NaN	nonsynonymous SNV	OR8B3:NM_001005467:exon1:c.T38C:p.I13T	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.05	B	0.045	B	0.694	N	1.000	N	2.49	M	5.44	T	-1.023	T	0.007	T	0.149	0.020	4.117	3.64	1.877	1.960	12.981	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.465548	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	197	190	7	0
chr11	124413569	124413569	A	G	upstream	OR8B12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	124439910	124439910	G	C	upstream	OR8A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr11	124439912	124439912	A	C	upstream	OR8A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	12	6	3	0
chr11	124439914	124439914	G	C	upstream	OR8A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	19	11	8	0
chr11	124439915	124439915	T	A	upstream	OR8A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	19	10	4	0
chr11	124439917	124439917	T	C	upstream	OR8A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	19	11	3	0
chr11	124539151	124539151	T	A	intronic	SIAE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr11	124543564	124543564	A	G	exonic	SIAE	NaN	nonsynonymous SNV	SIAE:NM_170601:exon1:c.T41C:p.L14S	NaN	NaN	NaN	0.54	T	0.856	P	0.282	B	0.047	N	1.000	D	0.95	L	-2.28	D	-0.520	T	0.482	T	0.508	3.425	17.58	4.69	2.094	0.948	10.703	100	11	3035	SNV	VTsM	3	Somatic	0.14130434782608636	Somatic	9.8329	0	4.183583	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	15	12	3	0
chr11	124593859	124593859	A	T	intergenic	SPA17,NRGN	dist=29172;dist=15970	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	124615396	124615396	C	A	intronic	NRGN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsM	3	Somatic	0.15919732441471526	Somatic	9.33964	0	8.07027	nearby_gap_events	REJECT	22	16	6	0
chr11	124615397	124615397	A	C	splicing	NRGN	NM_001126181:exon2:c.16-2A>C,NM_006176:exon2:c.16-2A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.319	13.71	4.33	2.060	8.798	7.262	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.05703703703703642	NA	0	0	9.672377	nearby_gap_events	REJECT	22	16	6	0
chr11	124631869	124631869	A	G	ncRNA_intronic	LOC101929340	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	124644768	124644768	A	A	UTR5	MSANTD2	NM_001301087:c.-78T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	20	18	0	0
chr11	124739332	124739332	A	C	intronic	ROBO3	NaN	NaN	NaN	rs11219820	NaN	0.196086	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	127.138	0	31.927419	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	0	13	10
chr11	124742470	124742470	A	A	intronic	ROBO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr11	124756556	124756556	G	T	exonic	ROBO4	NaN	synonymous SNV	ROBO4:NM_001301088:exon16:c.C2163A:p.P721P,ROBO4:NM_019055:exon16:c.C2598A:p.P866P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.863325	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	119	108	11	0
chr11	124761294	124761294	G	T	exonic	ROBO4	NaN	nonsynonymous SNV	ROBO4:NM_001301088:exon12:c.C1414A:p.P472T,ROBO4:NM_019055:exon12:c.C1849A:p.P617T	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.993	D	0.836	P	0.002	N	0.525	D	2.075	M	-0.09	T	0.012	D	0.431	T	0.425	3.960	20.3	5.0	1.488	3.147	13.095	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.932285	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	255	244	11	0
chr11	124764310	124764310	A	A	intronic	ROBO4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	124766247	124766247	A	A	intronic	ROBO4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	124766707	124766707	T	C	intronic	ROBO4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.2215	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	54	51	3	0
chr11	124766729	124766729	C	G	intronic	ROBO4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	124766731	124766731	G	C	intronic	ROBO4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	124766734	124766734	A	T	intronic	ROBO4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	124766735	124766735	T	G	intronic	ROBO4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	124790984	124790984	G	C	UTR3	HEPACAM	NM_152722:c.*50C>G	NaN	NaN	rs192160991	NaN	0.0159744	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.35521	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	1
chr11	124793157	124793157	T	T	intronic	HEPACAM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	124793392	124793392	A	G	intronic	HEPACAM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	9	4	4	0
chr11	124805998	124805998	A	A	UTR5	HEPACAM	NM_152722:c.-96T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	1248197	1248197	G	T	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	rs908224	NaN	0.6252	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	40.6413	0	NaN	NA	NA	14	3	11	37
chr11	124824036	124824036	G	A	UTR5	CCDC15	NM_025004:c.-593G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	124829174	124829174	T	C	intronic	CCDC15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.50491	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	139	132	7	0
chr11	1248491	1248491	T	G	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	rs908223	NaN	0.995008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	497.191	0	NaN	NA	NA	26	1	25	48
chr11	124857496	124857496	C	A	exonic	CCDC15	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC15:NM_025004:exon8:c.C1374A:p.H458Q	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.001	B	0.0	B	.	.	1.000	N	0.345	N	1.56	T	-1.021	T	0.039	T	0.127	0.168	4.902	-1.41	-0.257	.	8.162	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.975482	nearby_gap_events	REJECT	88	77	11	0
chr11	124857497	124857497	A	C	exonic	CCDC15	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC15:NM_025004:exon8:c.A1375C:p.K459Q	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.902	P	0.268	B	.	.	1.000	N	1.445	L	1.32	T	-1.046	T	0.064	T	0.138	1.457	10.81	-0.85	-0.178	0.805	6.929	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.0304	nearby_gap_events	REJECT	70	59	11	0
chr11	124857520	124857520	A	T	exonic	CCDC15	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC15:NM_025004:exon8:c.A1398T:p.K466N	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.011	B	0.007	B	.	.	1.000	N	1.83	L	1.27	T	-0.984	T	0.078	T	0.046	0.558	7.015	0.442	0.074	0.621	5.026	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.206579	nearby_gap_events	REJECT	69	63	6	0
chr11	124857521	124857521	T	A	exonic	CCDC15	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC15:NM_025004:exon8:c.T1399A:p.Y467N	NaN	NaN	NaN	0.51	T	0.972	D	0.6	P	.	.	1.000	N	1.04	L	1.56	T	-1.066	T	0.061	T	0.202	0.959	8.911	1.91	0.585	-0.581	6.529	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.502326	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	69	63	6	0
chr11	124857741	124857741	T	A	exonic	CCDC15	NaN	stopgain	CCDC15:NM_025004:exon8:c.T1619A:p.L540X	rs377372741	NaN	NaN	0.33	T	.	.	.	.	0.447	U	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	5.825	36	1.41	0.150	0.500	1.611	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.452407	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	174	162	12	0
chr11	1248731	1248731	A	G	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	rs2075854	NaN	0.598043	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.599222	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	4	4	40
chr11	124874914	124874914	A	G	intronic	CCDC15	NaN	NaN	NaN	rs12286897	NaN	0.229433	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	23.6362	0	NaN	NA	NA	133	88	45	2
chr11	124875124	124875124	T	C	intronic	CCDC15	NaN	NaN	NaN	rs35971753	NaN	0.228834	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.07399	0	NaN	NA	NA	106	69	37	5
chr11	124908172	124908172	C	A	intronic	CCDC15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	124908173	124908173	A	G	intronic	CCDC15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	124908352	124908352	T	C	exonic	CCDC15	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC15:NM_025004:exon14:c.T2437C:p.C813R	rs7107487	NaN	0.229433	1	T	0.0	B	0.0	B	.	.	0.162	P	-1.975	N	2.16	T	-0.921	T	0.000	T	0.092	-0.819	0.627	3.11	0.244	1.147	5.819	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	43.7903	0	NaN	NA	NA	177	84	93	9
chr11	124933351	124933351	C	T	intronic	SLC37A2	NaN	NaN	NaN	rs12791554	NaN	0.237819	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.664458	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	8	7	16
chr11	124951769	124951769	T	C	exonic	SLC37A2	NaN	synonymous SNV	SLC37A2:NM_001145290:exon9:c.T852C:p.A284A,SLC37A2:NM_198277:exon9:c.T852C:p.A284A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.117789	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	342	335	7	0
chr11	124953197	124953197	G	C	intronic	SLC37A2	NaN	NaN	NaN	rs10437702	NaN	0.107827	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	124955760	124955760	A	G	intronic	SLC37A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr11	124955768	124955768	T	T	intronic	SLC37A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	124957183	124957183	T	G	intronic	SLC37A2	NaN	NaN	NaN	rs6590125	NaN	0.648163	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	124972208	124972208	A	G	exonic	TMEM218	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM218:NM_001258239:exon3:c.T35C:p.L12S,TMEM218:NM_001258242:exon3:c.T35C:p.L12S,TMEM218:NM_001258246:exon3:c.T35C:p.L12S,TMEM218:NM_001258243:exon4:c.T35C:p.L12S	rs14065	NaN	0.791933	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	154.502	0	NaN	NA	NA	34	10	24	29
chr11	1250051	1250051	A	G	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	101.069	0	NaN	NA	NA	10	0	10	2
chr11	125047663	125047663	G	T	intronic	PKNOX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1250696	1250696	C	T	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	rs10832955	NaN	0.391374	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr11	125138452	125138452	T	C	intronic	PKNOX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	12518193	12518193	C	T	intronic	PARVA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr11	12518194	12518194	C	G	intronic	PARVA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr11	12518196	12518196	G	T	intronic	PARVA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	1252114	1252114	T	T	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	62	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	125212952	125212952	G	G	intronic	PKNOX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	125221438	125221438	G	C	intronic	PKNOX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	63.397	36	20.027099	normal_lod	REJECT	15	5	10	0
chr11	1252601	1252601	G	G	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	122	105	0	0
chr11	125280546	125280546	T	T	intronic	PKNOX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	125299829	125299829	T	T	intronic	PKNOX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	125299928	125299928	A	C	exonic	PKNOX2	NaN	nonsynonymous SNV	PKNOX2:NM_022062:exon12:c.A1083C:p.K361N	NaN	NaN	NaN	0.05	D	1.0	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	2.015	M	-2.0	D	0.383	D	0.682	D	0.197	3.776	19.17	3.6	1.910	4.315	9.946	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.760339	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	47	40	7	3
chr11	125351394	125351394	T	T	intronic	FEZ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	12535663	12535663	C	T	intronic	PARVA	NaN	NaN	NaN	rs11022381	NaN	0.101637	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	281.635	0	NaN	NA	NA	116	61	55	14
chr11	1253860	1253860	T	C	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	48.243	0	NaN	NA	NA	42	27	15	7
chr11	1253942	1253942	T	C	exonic	MUC5B	NaN	synonymous SNV	MUC5B:NM_002458:exon17:c.T2007C:p.Y669Y	rs908229	NaN	0.544928	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	108.730277	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	84	39	45	46
chr11	125442506	125442506	T	C	intronic	EI24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	125442507	125442507	T	C	intronic	EI24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	125447979	125447979	T	G	intronic	EI24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	0	2	0
chr11	125447980	125447980	T	C	intronic	EI24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	8	1	4	0
chr11	125488260	125488260	T	C	intronic	STT3A	NaN	NaN	NaN	rs76751219	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.80624	strand_artifact	REJECT	23	19	4	0
chr11	125488261	125488261	C	T	intronic	STT3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.347125	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	21	4	0
chr11	12549312	12549312	T	T	intronic	PARVA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr11	125513686	125513686	G	A	splicing	CHEK1	NM_001114122:exon9:c.815-1G>A,NM_001114121:exon9:c.815-1G>A,NM_001244846:exon9:c.815-1G>A,NM_001274:exon9:c.815-1G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.346	17.27	4.9	2.461	4.570	15.441	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.837647	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	232	220	12	0
chr11	125525195	125525195	A	G	exonic	CHEK1	NaN	nonsynonymous SNV	CHEK1:NM_001244846:exon12:c.A1309G:p.I437V,CHEK1:NM_001114121:exon13:c.A1411G:p.I471V,CHEK1:NM_001114122:exon13:c.A1411G:p.I471V,CHEK1:NM_001274:exon13:c.A1411G:p.I471V	rs506504	NaN	0.985823	1	T	0.0	B	0.001	B	0.001	N	1.000	P	-0.895	N	-0.16	T	-0.951	T	0.000	T	0.056	-0.213	2.970	1.8	0.448	1.178	2.296	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	158.391	0	NaN	NA	NA	127	0	127	5
chr11	125617152	125617152	C	T	intronic	PATE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	125617153	125617153	T	A	intronic	PATE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	125648503	125648503	G	A	intronic	PATE2	NaN	NaN	NaN	rs494361	NaN	0.889976	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	70.552246	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	0	26	53
chr11	1256732	1256732	A	A	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	125763660	125763660	T	T	UTR3	PUS3	NM_001271985:c.*20A>A,NM_031307:c.*20A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr11	125765134	125765134	T	T	exonic	PUS3	NaN	synonymous SNV	PUS3:NM_001271985:exon2:c.A305A:p.Q102Q,PUS3:NM_031307:exon3:c.A929A:p.Q310Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	67	56	0	0
chr11	125765441	125765441	T	C	exonic	PUS3	NaN	nonsynonymous SNV	PUS3:NM_031307:exon3:c.A622G:p.T208A	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.0	B	0.528	N	1.000	N	-2.665	N	0.7	T	-0.963	T	0.018	T	0.069	-1.484	0.018	-5.42	-1.585	0.634	11.938	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.144453	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	182	175	7	0
chr11	125766023	125766023	G	T	exonic	PUS3	NaN	nonsynonymous SNV	PUS3:NM_031307:exon2:c.C157A:p.R53S	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.818	P	0.626	P	0.000	D	1.000	D	2.085	M	1.31	T	-0.613	T	0.278	T	0.78	4.777	26.9	6.17	2.941	6.018	20.879	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	2.418912	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	36	34	2	0
chr11	125766044	125766044	C	A	exonic	PUS3	NaN	nonsynonymous SNV	PUS3:NM_031307:exon2:c.G136T:p.A46S	rs549990	ID=COSM1127862;OCCURENCE=1(prostate)	0.63738	0.84	T	0.0	B	0.0	B	0.257	N	1.000	P	-1.04	N	1.55	T	-0.939	T	0.000	T	0.075	-2.066	0.006	3.91	1.082	0.706	2.141	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.253681	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	14	21	55
chr11	125766207	125766207	C	T	UTR5	PUS3	NM_031307:c.-28G>A	NaN	NaN	rs471980	NaN	0.795327	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	147.543285	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	2	51	57
chr11	125817885	125817885	C	C	intergenic	DDX25,CDON	dist=24879;dist=8828	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	125876013	125876013	A	A	intronic	CDON	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr11	125970497	125970497	C	A	intergenic	CDON,RPUSD4	dist=37310;dist=101492	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	125988917	125988917	G	A	intergenic	CDON,RPUSD4	dist=55730;dist=83072	NaN	NaN	rs184226865	NaN	0.000998403	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	126046107	126046107	T	A	intergenic	CDON,RPUSD4	dist=112920;dist=25882	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	1260468	1260468	T	G	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr11	126068497	126068497	T	G	intergenic	CDON,RPUSD4	dist=135310;dist=3492	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	126068500	126068500	A	G	intergenic	CDON,RPUSD4	dist=135313;dist=3489	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1260733	1260733	C	C	exonic	MUC5B	NaN	synonymous SNV	MUC5B:NM_002458:exon27:c.C3520C:p.P1174P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	33	25	0	0
chr11	126075400	126075400	A	G	exonic	RPUSD4	NaN	synonymous SNV	RPUSD4:NM_001144827:exon5:c.T666C:p.T222T,RPUSD4:NM_032795:exon5:c.T759C:p.T253T	NaN	NaN	NaN	0.08	T	.	.	.	.	.	.	0.953	N	.	.	1.86	T	-0.984	T	0.037	T	.	1.167	9.751	-7.39	-1.263	-0.532	1.108	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	1.061804	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	63	62	1	0
chr11	126120354	126120354	T	T	intronic	FAM118B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr11	126120671	126120671	T	G	intronic	FAM118B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr11	126134492	126134492	A	A	intronic	SRPR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr11	126136397	126136397	C	T	exonic	SRPR	NaN	nonsynonymous SNV	SRPR:NM_001177842:exon5:c.G730A:p.A244T,SRPR:NM_003139:exon6:c.G814A:p.A272T	NaN	NaN	NaN	0.57	T	0.001	B	0.004	B	0.590	N	1.000	N	1.245	L	.	.	-1.058	T	0.103	T	0.057	0.759	8.020	4.67	2.941	1.221	12.548	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	134	89	45	0
chr11	126138736	126138736	A	A	UTR5	SRPR	NM_001177842:c.-37T>T,NM_003139:c.-37T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	126141567	126141567	A	T	intronic	FOXRED1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	1	8	0
chr11	126145691	126145691	T	C	exonic	FOXRED1	NaN	nonsynonymous SNV	FOXRED1:NM_017547:exon7:c.T736C:p.F246L	NaN	NaN	NaN	0.14	T	0.329	B	0.246	B	0.000	D	1.000	D	0.97	L	-1.0	T	-0.618	T	0.270	T	0.271	2.437	14.11	4.57	2.198	2.001	9.988	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.185522	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	204	198	6	0
chr11	126146283	126146283	T	T	intronic	FOXRED1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr11	126147190	126147190	T	G	intronic	FOXRED1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr11	1261640	1261640	C	T	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	rs2735733	NaN	0.461861	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	137.104	0	69.002128	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	56	28	28	40
chr11	126201290	126201290	A	G	intronic	DCPS	NaN	NaN	NaN	rs651922	NaN	0.23103	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	81.0169	0	39.508601	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	22	18	22
chr11	126201403	126201403	T	C	exonic	DCPS	NaN	synonymous SNV	DCPS:NM_014026:exon3:c.T480C:p.N160N	rs616360	NaN	0.23103	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	110.157	0	NaN	NA	NA	43	22	21	23
chr11	126201458	126201458	A	G	intronic	DCPS	NaN	NaN	NaN	rs651034	NaN	0.230032	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	135.309	0	NaN	NA	NA	56	28	28	22
chr11	1262462	1262462	A	T	exonic	MUC5B	NaN	nonsynonymous SNV	MUC5B:NM_002458:exon31:c.A4352T:p.E1451V	NaN	NaN	NaN	0	D	0.478	P	0.095	B	.	.	1.000	N	0.55	N	2.43	T	-1.027	T	0.021	T	0.191	1.522	11.04	-3.32	-0.871	-1.377	6.833	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.23684210526315766	NA	0	0	4.067096	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	14	12	2	0
chr11	1262659	1262659	T	T	exonic	MUC5B	NaN	synonymous SNV	MUC5B:NM_002458:exon31:c.T4549T:p.Y1517Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	19	17	0	0
chr11	1262701	1262701	G	A	exonic	MUC5B	NaN	nonsynonymous SNV	MUC5B:NM_002458:exon31:c.G4591A:p.D1531N	NaN	NaN	NaN	0	D	0.854	P	0.213	B	.	.	1.000	N	0.46	N	2.26	T	-1.018	T	0.020	T	0.027	1.592	11.28	0.843	-0.087	0.020	3.735	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.875157	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	217	210	7	0
chr11	126277953	126277953	A	G	intronic	ST3GAL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.191054	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	21	19	2	0
chr11	126279365	126279365	A	T	intronic	ST3GAL4	NaN	NaN	NaN	rs1316361	NaN	0.334864	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	63.250903	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	61	28	33	28
chr11	126305099	126305099	C	T	intronic	KIRREL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.560695	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	71	63	8	0
chr11	126305135	126305135	G	G	intronic	KIRREL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	53	42	0	0
chr11	126316620	126316620	C	A	intronic	KIRREL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.440712	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	558	526	32	0
chr11	126316621	126316621	A	C	intronic	KIRREL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.273389	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	558	525	33	0
chr11	1263776	1263776	C	T	exonic	MUC5B	NaN	nonsynonymous SNV	MUC5B:NM_002458:exon31:c.C5666T:p.P1889L	rs2943510	NaN	0.11881	0	D	0.252	B	0.022	B	.	.	1.000	P	0.345	N	2.34	T	-1.018	T	0.000	T	0.042	1.504	10.98	2.72	1.534	0.339	9.196	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	478.87	0	NaN	NA	NA	171	74	97	12
chr11	126396375	126396375	T	T	intronic	KIRREL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	1264742	1264742	G	C	exonic	MUC5B	NaN	nonsynonymous SNV	MUC5B:NM_002458:exon31:c.G6632C:p.R2211P	rs137973688	NaN	NaN	0	D	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	-1.59	N	2.15	T	-0.980	T	0.000	T	0.096	-0.265	2.728	1.83	0.353	-0.863	8.229	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.76011	0	NaN	NA	NA	130	81	49	3
chr11	1264823	1264823	T	C	exonic	MUC5B	NaN	nonsynonymous SNV	MUC5B:NM_002458:exon31:c.T6713C:p.L2238P	rs4963031	ID=COSM1600234,COSM1600233;OCCURENCE=1(central_nervous_system)	0.796925	0	D	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	-0.69	N	2.05	T	-1.044	T	0.000	T	0.047	-0.445	1.936	-0.497	-0.462	-2.462	2.215	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	1846	1020	826	51
chr11	1267325	1267325	T	C	exonic	MUC5B	NaN	nonsynonymous SNV	MUC5B:NM_002458:exon31:c.T9215C:p.F3072S	rs3021161	NaN	0.480631	0	D	0.012	B	0.001	B	.	.	1.000	P	-0.49	N	2.42	T	-0.972	T	0.000	T	0.084	-0.154	3.245	-0.504	-0.825	0.258	6.250	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0055000105127328835	NA	0	0	NaN	NA	NA	104	79	25	13
chr11	1268637	1268637	G	T	exonic	MUC5B	NaN	synonymous SNV	MUC5B:NM_002458:exon31:c.G10527T:p.L3509L	rs2943525	NaN	0.147764	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	138.066	0	NaN	NA	NA	111	66	45	9
chr11	126954990	126954990	G	C	ncRNA_intronic	LOC101929473	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	12706633	12706633	A	G	intronic	TEAD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr11	1271321	1271321	C	G	exonic	MUC5B	NaN	nonsynonymous SNV	MUC5B:NM_002458:exon31:c.C13211G:p.A4404G	rs2943517	NaN	0.451877	0	D	0.949	P	0.528	P	.	.	1.000	P	1.7	L	2.47	T	-1.027	T	0.044	T	0.08	0.039	4.216	-0.666	-0.552	-0.172	5.331	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	20.8207	0	NaN	NA	NA	27	20	7	10
chr11	1271343	1271343	G	C	exonic	MUC5B	NaN	synonymous SNV	MUC5B:NM_002458:exon31:c.G13233C:p.P4411P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.192365	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	85	75	10	0
chr11	1272548	1272548	T	C	exonic	MUC5B	NaN	nonsynonymous SNV	MUC5B:NM_002458:exon31:c.T14438C:p.L4813P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	N	-1.83	N	2.47	T	-0.938	T	0.009	T	0.05	-0.288	2.622	-4.23	-1.246	-0.734	5.322	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	1.41699	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	22	21	1	0
chr11	1273833	1273833	T	T	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr11	1273989	1273989	T	C	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr11	1276505	1276505	T	T	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	16	13	0	0
chr11	12785998	12785998	A	C	intronic	TEAD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	1281134	1281134	T	C	intronic	MUC5B	NaN	NaN	NaN	rs2857476	NaN	0.577276	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	128.929	0	NaN	NA	NA	54	29	25	39
chr11	128293244	128293244	C	C	intergenic	LOC101929497,ETS1	dist=1086316;dist=35412	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	128295920	128295920	T	A	intergenic	LOC101929497,ETS1	dist=1088992;dist=32736	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr11	128332240	128332240	A	C	UTR3	ETS1	NM_005238:c.*16T>G,NM_001162422:c.*16T>G,NM_001143820:c.*16T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	147	119	28	0
chr11	128333353	128333353	T	T	intronic	ETS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr11	128333355	128333355	T	T	intronic	ETS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	10	0	0
chr11	128333503	128333503	T	C	exonic	ETS1	NaN	synonymous SNV	ETS1:NM_001162422:exon3:c.A363G:p.L121L,ETS1:NM_005238:exon7:c.A1011G:p.L337L,ETS1:NM_001143820:exon9:c.A1143G:p.L381L	rs2230004	NaN	0.479633	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	409	323	84	46
chr11	128443083	128443083	G	C	intronic	ETS1	NaN	NaN	NaN	rs7935676	NaN	0.364217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	254.484876	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	90	1	89	39
chr11	128489695	128489695	T	G	intergenic	ETS1,FLI1	dist=32242;dist=66735	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	128628357	128628357	A	A	intronic	FLI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr11	128651893	128651893	A	G	exonic	FLI1	NaN	synonymous SNV	FLI1:NM_001271012:exon3:c.A51G:p.Q17Q,FLI1:NM_002017:exon5:c.A630G:p.Q210Q,FLI1:NM_001167681:exon6:c.A531G:p.Q177Q,FLI1:NM_001271010:exon6:c.A432G:p.Q144Q	rs35195224	NaN	0.214058	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	21.6008	0	NaN	NA	NA	10	6	4	2
chr11	12868894	12868894	T	T	intronic	TEAD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	128855852	128855852	T	T	intronic	ARHGAP32	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr11	128910756	128910756	C	G	intronic	ARHGAP32	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	128910757	128910757	T	G	intronic	ARHGAP32	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	128932125	128932125	TAAA	TAA,TAAAG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	74.9862	0	NaN	NA	NA	59	36	6	4
chr11	129245937	129245937	T	G	exonic	BARX2	NaN	nonsynonymous SNV	BARX2:NM_003658:exon1:c.T7G:p.C3G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.437	B	0.186	B	0.000	D	1.000	D	0.975	L	-3.15	D	0.241	D	0.641	D	0.766	4.060	20.9	5.06	1.895	4.384	8.329	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.342937	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	1	3	0
chr11	129307068	129307068	A	C	intronic	BARX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	4	4	0
chr11	129307080	129307080	A	A	intronic	BARX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	129307082	129307082	A	C	intronic	BARX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	2	1	0
chr11	129307083	129307083	T	T	intronic	BARX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	129312698	129312698	C	T	intronic	BARX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	-2.23	D	-0.524	T	0.502	D	0.066	0.523	6.835	2.29	0.281	0.951	7.739	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.39689	0	NaN	NA	NA	15	13	2	0
chr11	12945470	12945470	C	G	intronic	TEAD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	129514146	129514146	C	G	intergenic	LINC01395,TMEM45B	dist=26982;dist=171595	NaN	NaN	rs7952046	NaN	0.478834	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	129727375	129727375	A	T	intronic	TMEM45B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	13	8	5	0
chr11	129727376	129727376	G	C	intronic	TMEM45B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	13	8	5	0
chr11	129727377	129727377	C	G	intronic	TMEM45B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	13	8	5	0
chr11	129747362	129747362	A	A	intronic	NFRKB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	129795148	129795148	T	G	intronic	PRDM10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	3	2	0
chr11	129795155	129795155	G	C	intronic	PRDM10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr11	129801124	129801124	T	C	exonic	PRDM10	NaN	synonymous SNV	PRDM10:NM_199438:exon7:c.A1059G:p.Q353Q,PRDM10:NM_199439:exon7:c.A1059G:p.Q353Q,PRDM10:NM_020228:exon11:c.A1317G:p.Q439Q,PRDM10:NM_199437:exon11:c.A1317G:p.Q439Q	rs2277032	NaN	0.0990415	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	87.274422	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	83	43	40	12
chr11	129816991	129816991	A	G	intronic	PRDM10	NaN	NaN	NaN	rs34161604	NaN	0.28734	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	129827626	129827626	T	T	intronic	PRDM10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	130012082	130012082	A	C	intronic	APLP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr11	130066335	130066335	C	T	exonic	ST14	NaN	synonymous SNV	ST14:NM_021978:exon10:c.C1215T:p.N405N	rs476106	NaN	0.638978	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	42.2257	0	15.169562	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	3	6	35
chr11	130066372	130066372	G	A	intronic	ST14	NaN	NaN	NaN	rs858713	NaN	0.876797	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.778049	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	51
chr11	130067892	130067892	C	T	intronic	ST14	NaN	NaN	NaN	rs858715	NaN	0.311302	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	62.2535	0	15.83364	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	29
chr11	130079187	130079187	C	T	intronic	ST14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.027529	nearby_gap_events	REJECT	57	49	8	0
chr11	130079234	130079234	G	C	intronic	ST14	NaN	NaN	NaN	rs519419	NaN	0.515176	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	186.688407	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	63	0	63	49
chr11	130088860	130088860	T	G	intergenic	ST14,ZBTB44	dist=8603;dist=7714	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	130088864	130088864	G	C	intergenic	ST14,ZBTB44	dist=8607;dist=7710	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	130088866	130088866	A	T	intergenic	ST14,ZBTB44	dist=8609;dist=7708	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	130088867	130088867	G	T	intergenic	ST14,ZBTB44	dist=8610;dist=7707	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	130088871	130088871	T	A	intergenic	ST14,ZBTB44	dist=8614;dist=7703	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	130088873	130088873	A	T	intergenic	ST14,ZBTB44	dist=8616;dist=7701	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	130088874	130088874	C	G	intergenic	ST14,ZBTB44	dist=8617;dist=7700	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	130088877	130088877	C	G	intergenic	ST14,ZBTB44	dist=8620;dist=7697	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	130088879	130088879	G	C	intergenic	ST14,ZBTB44	dist=8622;dist=7695	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	130271209	130271209	T	C	intergenic	ZBTB44,ADAMTS8	dist=86602;dist=3609	NaN	NaN	rs1021205	NaN	0.0856629	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	18	3	15	0
chr11	130284790	130284790	A	A	intronic	ADAMTS8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	130286294	130286294	A	A	intronic	ADAMTS8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	130297948	130297948	C	G	exonic	ADAMTS8	NaN	nonsynonymous SNV	ADAMTS8:NM_007037:exon1:c.G234C:p.E78D	rs7927048	NaN	0.469249	0.12	T	0.0	B	0.006	B	0.013	N	1.000	P	0.495	N	3.44	T	-0.948	T	0.000	T	0.058	2.036	12.76	-1.93	-0.600	-0.981	6.549	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.509496	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	0	15	27
chr11	130297957	130297957	T	C	exonic	ADAMTS8	NaN	synonymous SNV	ADAMTS8:NM_007037:exon1:c.A225G:p.L75L	rs7942034	NaN	0.913738	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.410656	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	0	15	37
chr11	130319145	130319145	G	C	exonic	ADAMTS15	NaN	nonsynonymous SNV	ADAMTS15:NM_139055:exon1:c.G277C:p.G93R	rs138290327	NaN	0.000599042	0.51	T	0.0	B	0.002	B	.	.	1.000	N	0.13	N	3.41	T	-0.903	T	0.009	T	0.055	-0.053	3.744	0.5	0.017	0.374	8.254	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	35	33	2	0
chr11	130319834	130319834	A	A	intronic	ADAMTS15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr11	130339054	130339054	T	T	intronic	ADAMTS15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	130341411	130341411	A	A	intronic	ADAMTS15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	130639440	130639440	T	T	intergenic	C11orf44,LOC100507431	dist=52193;dist=74648	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	130773329	130773329	A	A	intronic	SNX19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr11	130777814	130777814	G	A	intronic	SNX19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.381263	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	192	185	7	0
chr11	130780015	130780015	C	T	exonic	SNX19	NaN	synonymous SNV	SNX19:NM_001301089:exon4:c.G72A:p.P24P,SNX19:NM_014758:exon4:c.G1932A:p.P644P	rs1781	NaN	0.576877	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.555589	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	20	17	54
chr11	130820536	130820536	G	G	intergenic	SNX19,NTM	dist=34154;dist=419835	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	130820538	130820538	C	C	intergenic	SNX19,NTM	dist=34156;dist=419833	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	1309554	1309554	C	A	intronic	TOLLIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	1309555	1309555	C	G	intronic	TOLLIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	131074879	131074879	G	T	intergenic	SNX19,NTM	dist=288497;dist=165492	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	131074883	131074883	A	T	intergenic	SNX19,NTM	dist=288501;dist=165488	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	131074884	131074884	G	C	intergenic	SNX19,NTM	dist=288502;dist=165487	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	131074885	131074885	A	T	intergenic	SNX19,NTM	dist=288503;dist=165486	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	131289819	131289819	A	G	intronic	NTM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	131450301	131450301	C	C	intronic	NTM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	131530518	131530518	G	T	intronic	NTM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-0.870	T	0.187	T	.	1.953	12.49	4.53	2.255	2.261	13.117	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	131666624	131666624	A	G	intronic	NTM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	131671230	131671230	C	C	intronic	NTM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	132180185	132180185	A	A	intronic	NTM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr11	132205097	132205097	A	C	UTR3	NTM	NM_001048209:c.*57A>C,NM_016522:c.*57A>C,NM_001144058:c.*57A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr11	132526865	132526865	A	G	intronic	OPCML	NaN	NaN	NaN	rs1784519	NaN	0.776158	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	515.725701	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	180	0	180	56
chr11	132527249	132527249	A	T	intronic	OPCML	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	2	2	0
chr11	132733083	132733083	C	A	intronic	OPCML	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	132812642	132812642	G	A	intronic	OPCML	NaN	NaN	NaN	rs12575270	NaN	0.122604	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.570512	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	45	21	13
chr11	132812767	132812767	T	C	intronic	OPCML	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	118	61	55	0
chr11	13331805	13331805	G	T	intronic	ARNTL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	13331808	13331808	G	A	intronic	ARNTL	NaN	NaN	NaN	rs55769038	NaN	0.372404	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	133368176	133368176	G	A	intronic	OPCML	NaN	NaN	NaN	rs12419575	NaN	0.188299	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	133402085	133402085	T	T	intronic	OPCML	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr11	133774863	133774863	A	C	intergenic	MIR4697HG,IGSF9B	dist=3228;dist=3657	NaN	NaN	rs510306	NaN	0.555511	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	133790379	133790379	G	C	exonic	IGSF9B	NaN	nonsynonymous SNV	IGSF9B:NM_001277285:exon18:c.C3241G:p.P1081A	NaN	NaN	NaN	0.24	T	0.798	P	0.221	B	0.000	D	1.000	D	0.345	N	0.14	T	-0.834	T	0.133	T	0.303	2.230	13.41	5.15	2.394	4.991	18.208	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	10	9	1	0
chr11	133790380	133790380	C	C	exonic	IGSF9B	NaN	synonymous SNV	IGSF9B:NM_001277285:exon18:c.G3240G:p.L1080L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	33	28	0	0
chr11	133792165	133792165	C	G	intronic	IGSF9B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.178991	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	30	23	7	0
chr11	133800769	133800769	G	A	intronic	IGSF9B	NaN	NaN	NaN	rs11223627	NaN	0.307907	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.310095	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	12	13	33
chr11	133800773	133800773	C	A	intronic	IGSF9B	NaN	NaN	NaN	rs12796441	NaN	0.30631	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.446984	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	11	14	33
chr11	133800775	133800775	G	A	intronic	IGSF9B	NaN	NaN	NaN	rs11223628	NaN	0.30651	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.14322	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	11	14	33
chr11	133805544	133805544	G	C	exonic	IGSF9B	NaN	nonsynonymous SNV	IGSF9B:NM_001277285:exon7:c.C935G:p.S312C	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.995	D	0.932	D	.	.	1.000	D	1.705	L	-0.31	T	-0.222	T	0.427	T	0.69	4.920	28.4	5.36	2.500	9.448	19.088	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.018974	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	109	100	9	0
chr11	133807485	133807485	A	G	intronic	IGSF9B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	133807486	133807486	T	G	intronic	IGSF9B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	133912834	133912834	C	A	intergenic	LOC100128239,JAM3	dist=1598;dist=25986	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	13399791	13399791	A	G	intronic	ARNTL	NaN	NaN	NaN	rs10832030	NaN	0.708067	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	294.880366	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	101	1	100	56
chr11	134014095	134014095	T	C	intronic	JAM3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr11	134018933	134018933	T	T	intronic	JAM3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr11	134054996	134054996	A	T	intronic	NCAPD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr11	134064689	134064689	A	A	intronic	NCAPD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	134078650	134078650	T	T	intronic	NCAPD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr11	134095147	134095147	A	G	exonic	VPS26B	NaN	nonsynonymous SNV	VPS26B:NM_052875:exon1:c.A131G:p.E44G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.685	H	2.46	T	-0.501	T	0.186	T	0.957	5.381	34	4.92	1.828	9.090	14.549	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.48253	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	171	162	9	0
chr11	134104994	134104994	A	A	intronic	VPS26B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	134114777	134114777	T	T	intronic	VPS26B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	134119878	134119878	A	A	intronic	THYN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	134123379	134123379	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	8	0	5,3	0
chr11	134123492	134123492	G	T	UTR5	ACAD8	NM_014384:c.-3G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr11	134132636	134132636	A	T	intronic	ACAD8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	134132637	134132637	G	T	intronic	ACAD8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	134132639	134132639	C	T	intronic	ACAD8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	134132640	134132640	T	G	intronic	ACAD8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	134147824	134147824	A	G	intronic	GLB1L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr11	134152030	134152030	G	A	intronic	GLB1L3	NaN	NaN	NaN	rs10791352	NaN	0.718251	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	128.212277	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	0	46	53
chr11	134158713	134158713	A	C	exonic	GLB1L3	NaN	nonsynonymous SNV	GLB1L3:NM_001080407:exon7:c.A658C:p.I220L	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.997	D	0.919	D	.	.	0.998	D	2.345	M	-5.11	D	1.057	D	0.956	D	0.549	4.272	22.3	5.01	2.227	6.204	12.639	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.470047	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	120	111	9	0
chr11	134158817	134158817	A	C	intronic	GLB1L3	NaN	NaN	NaN	rs10894794	NaN	0.233626	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	168.303485	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	120	54	66	17
chr11	134162866	134162866	G	A	intronic	GLB1L3	NaN	NaN	NaN	rs1144223	NaN	0.35643	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	134182212	134182212	G	T	intronic	GLB1L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.416936	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	170	144	26	0
chr11	134214921	134214921	T	T	intronic	GLB1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr11	134226123	134226123	T	T	intronic	GLB1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	134241550	134241550	T	T	intronic	GLB1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	134250583	134250583	G	T	UTR3	B3GAT1	NM_054025:c.*73C>A,NM_018644:c.*73C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	134251992	134251992	A	A	intronic	B3GAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	134341920	134341920	T	T	ncRNA_intronic	LOC283177	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	134399760	134399760	G	A	intergenic	LOC283177,NONE	dist=24205;dist=NONE	NaN	NaN	rs4936238	NaN	0.576078	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	22	10	12	0
chr11	134447602	134447602	C	A	intergenic	LOC283177,NONE	dist=72047;dist=NONE	NaN	NaN	rs61908918	NaN	0.0503195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	134734296	134734296	C	T	intergenic	LOC283177,NONE	dist=358741;dist=NONE	NaN	NaN	rs7125596	NaN	0.53754	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	134853374	134853374	T	C	intergenic	LOC283177,NONE	dist=477819;dist=NONE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	134853375	134853375	C	A	intergenic	LOC283177,NONE	dist=477820;dist=NONE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	13513929	13513929	T	C	UTR3	PTH	NM_000315:c.*23A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.926834	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	72	69	3	0
chr11	13514263	13514263	C	T	intronic	PTH	NaN	NaN	NaN	rs6254	NaN	0.18111	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	145.067215	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	54	0	54	35
chr11	1361543	1361543	C	C	intergenic	TOLLIP-AS1,BRSK2	dist=29606;dist=49586	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	13716182	13716182	G	A	intronic	FAR1	NaN	NaN	NaN	rs12282039	NaN	0.0153754	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	133	88	45	1
chr11	13729656	13729656	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	1	3,3	0
chr11	13729661	13729661	G	T	intronic	FAR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	13729662	13729662	A	C	intronic	FAR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	13729664	13729664	C	T	intronic	FAR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	13733681	13733681	A	T	intronic	FAR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	16	9	5	0
chr11	13984583	13984583	C	T	exonic	SPON1	NaN	unknown	UNKNOWN	rs3761859	NaN	0.238219	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	114.096007	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	0	37	17
chr11	14096993	14096993	G	G	intronic	SPON1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	118	101	0	0
chr11	14275870	14275870	T	T	intronic	SPON1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr11	14282080	14282080	T	T	intronic	SPON1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	14287045	14287045	T	T	intronic	SPON1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr11	14490475	14490475	G	C	intronic	COPB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr11	14490477	14490477	C	A	intronic	COPB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr11	14502653	14502653	A	G	intronic	COPB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.986636	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	232	213	19	0
chr11	14502661	14502661	A	T	intronic	COPB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.374622	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	216	208	8	0
chr11	14512060	14512060	C	T	intronic	COPB1	NaN	NaN	NaN	rs2597189	NaN	0.746605	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	29.9995	26	13.454553	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	15	8	44
chr11	14539596	14539596	A	A	intronic	PSMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	14632633	14632633	A	A	UTR5	PSMA1	NM_148976:c.-101T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	1464413	1464413	G	G	intronic	BRSK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	14665608	14665608	C	T	UTR5	PDE3B	NM_000922:c.-14C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.14229249011857667	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr11	1475665	1475665	T	C	intronic	BRSK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1475666	1475666	G	C	intronic	BRSK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1475670	1475670	G	A	intronic	BRSK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1475672	1475672	T	A	intronic	BRSK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1475678	1475678	A	C	intronic	BRSK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1477507	1477507	G	A	intronic	BRSK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.302028	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	8	4	4	0
chr11	14810762	14810762	A	G	exonic	PDE3B	NaN	synonymous SNV	PDE3B:NM_000922:exon4:c.A1389G:p.R463R	rs4757268	ID=COSM147149;OCCURENCE=1(stomach)	0.671326	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	134.772753	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	109	49	60	45
chr11	14810850	14810850	T	G	intronic	PDE3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	14810853	14810853	T	C	intronic	PDE3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1482625	1482625	G	A	UTR3	BRSK2	NM_003957:c.*406G>A,NM_001256627:c.*672G>A,NM_001256629:c.*435G>A,NM_001282218:c.*435G>A,NM_001256630:c.*672G>A	NaN	NaN	rs117277254	NaN	0.00758786	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr11	1491452	1491452	C	C	exonic	MOB2	NaN	synonymous SNV	MOB2:NM_001172223:exon5:c.G757G:p.G253G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	1491453	1491453	A	A	exonic	MOB2	NaN	synonymous SNV	MOB2:NM_001172223:exon5:c.T756T:p.D252D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	1501931	1501931	G	G	intronic	MOB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	20	19	0	0
chr11	1507731	1507731	A	G	exonic	MOB2	NaN	nonsynonymous SNV	MOB2:NM_001172223:exon1:c.T56C:p.L19P	rs1881503	ID=COSM1133933,COSM428748;OCCURENCE=1(breast)	0.940296	1	T	0.0	B	0.0	B	.	.	0.132	P	-0.895	N	1.0	T	-0.951	T	0.000	T	0.055	-1.911	0.008	3.93	0.805	2.224	10.912	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.507798	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	51
chr11	15170838	15170838	A	A	intronic	INSC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	15199816	15199816	T	T	intronic	INSC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	1533634	1533634	C	T	intergenic	MOB2,DUSP8	dist=25625;dist=41647	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	15620586	15620586	A	G	intergenic	INSC,LOC102724957	dist=351830;dist=44845	NaN	NaN	rs17439299	NaN	0.101038	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1571345	1571345	T	C	intergenic	MOB2,DUSP8	dist=63336;dist=3936	NaN	NaN	rs57380219	NaN	0.558906	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	1573563	1573563	C	C	intergenic	MOB2,DUSP8	dist=65554;dist=1718	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	21	18	0	0
chr11	16036655	16036655	C	G	intronic	SOX6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	1605904	1605904	T	G	exonic	KRTAP5-1	NaN	synonymous SNV	KRTAP5-1:NM_001005922:exon1:c.A576C:p.G192G	rs113408385	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	24.8493	0	10.300459	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	8	4	4	17
chr11	1606129	1606129	A	C	exonic	KRTAP5-1	NaN	synonymous SNV	KRTAP5-1:NM_001005922:exon1:c.T351G:p.G117G	rs76191756	NaN	0.538538	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	89	63	26	45
chr11	1606147	1606147	A	G	exonic	KRTAP5-1	NaN	synonymous SNV	KRTAP5-1:NM_001005922:exon1:c.T333C:p.S111S	rs138363822	NaN	0.444289	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	60	36	24	37
chr11	1606164	1606164	T	C	exonic	KRTAP5-1	NaN	nonsynonymous SNV	KRTAP5-1:NM_001005922:exon1:c.A316G:p.K106E	NaN	NaN	NaN	0.21	T	0.021	B	0.01	B	.	.	1.000	N	2.325	M	3.47	T	-0.985	T	0.021	T	0.297	-1.158	0.097	1.13	-0.063	0.000	4.493	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.0991	0	NaN	NA	NA	86	73	15	3
chr11	16071115	16071115	T	G	intronic	SOX6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr11	16071117	16071117	A	C	intronic	SOX6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr11	16117704	16117704	A	C	intronic	SOX6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.927763	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	131	123	8	0
chr11	1619115	1619115	A	G	exonic	KRTAP5-2	NaN	synonymous SNV	KRTAP5-2:NM_001004325:exon1:c.T366C:p.C122C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	20.1641	0	NaN	NA	NA	116	96	20	1
chr11	1619124	1619124	A	G	exonic	KRTAP5-2	NaN	synonymous SNV	KRTAP5-2:NM_001004325:exon1:c.T357C:p.C119C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0034427664370466444	NA	0	0	NaN	NA	NA	84	65	19	0
chr11	1619361	1619361	A	A	exonic	KRTAP5-2	NaN	synonymous SNV	KRTAP5-2:NM_001004325:exon1:c.T120T:p.S40S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr11	1619490	1619490	G	A	ncRNA_exonic	KRTAP5-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.07152	0	NaN	NA	NA	34	29	5	0
chr11	1651643	1651643	C	T	exonic	KRTAP5-5	NaN	synonymous SNV	KRTAP5-5:NM_001001480:exon1:c.C573T:p.P191P	rs4752771	ID=COSM428756;OCCURENCE=1(breast)	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	16.6212	0	NaN	NA	NA	26	20	6	11
chr11	16803461	16803461	A	A	intergenic	C11orf58,PLEKHA7	dist=23560;dist=5746	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	16816688	16816688	A	A	intronic	PLEKHA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	16877335	16877335	T	A	intronic	PLEKHA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	17035718	17035718	A	G	exonic	PLEKHA7	NaN	synonymous SNV	PLEKHA7:NM_175058:exon2:c.T117C:p.H39H	rs61881311	NaN	0.707867	0	D	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.061	T	0.000	T	.	0.886	8.595	3.15	0.316	1.878	8.259	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.788	0	NaN	NA	NA	15	11	4	24
chr11	17113230	17113230	A	C	intronic	PIK3C2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr11	17113535	17113535	A	T	intronic	PIK3C2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.113458	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	193	178	15	0
chr11	17140711	17140711	T	C	intronic	PIK3C2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr11	17140950	17140950	A	C	intronic	PIK3C2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	16	1	8	0
chr11	17140951	17140951	C	T	intronic	PIK3C2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	16	6	9	0
chr11	1718694	1718694	TGGGGGCT	TGGGGCT,TGGGGCTG,TGGGGGCTG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	155.128	0	NaN	NA	NA	178	88	26	3
chr11	17373654	17373654	C	G	intronic	NCR3LG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.130441	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	6	3	3	0
chr11	17408404	17408404	C	T	UTR3	KCNJ11	NM_000525:c.*62G>A,NM_001166290:c.*62G>A	NaN	NaN	rs5213	NaN	0.735823	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	17415190	17415190	C	G	intronic	ABCC8	NaN	NaN	NaN	rs4148646	NaN	0.73103	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	80.1764	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	27	33	41
chr11	17416070	17416070	C	A	intronic	ABCC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	17418689	17418689	A	A	intronic	ABCC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	19	18	0	0
chr11	17428696	17428696	A	A	intronic	ABCC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr11	17429055	17429055	A	G	intronic	ABCC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr11	17434284	17434284	G	A	exonic	ABCC8	NaN	synonymous SNV	ABCC8:NM_000352:exon21:c.C2485T:p.L829L,ABCC8:NM_001287174:exon21:c.C2488T:p.L830L	rs1805036	NaN	0.120208	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	143.705966	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	122	57	65	22
chr11	17453903	17453903	A	A	intronic	ABCC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr11	17464701	17464701	A	G	intronic	ABCC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.858566	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	566	522	44	0
chr11	17464722	17464722	C	G	intronic	ABCC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	66.28153	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	571	507	64	0
chr11	17496386	17496386	T	T	intronic	ABCC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	17523128	17523128	T	G	intronic	USH1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.7932	nearby_gap_events	REJECT	105	92	13	0
chr11	17526254	17526254	GAA	GA,GAG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	392.072	0	NaN	NA	NA	95	0	12	3
chr11	17526256	17526256	A	G	intronic	USH1C	NaN	NaN	NaN	rs76769358	NaN	0.0261581	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	23	14	9	6
chr11	17527567	17527567	T	C	intronic	USH1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr11	17531233	17531233	C	G	exonic	USH1C	NaN	nonsynonymous SNV	USH1C:NM_153676:exon18:c.G1683C:p.L561F	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.978	D	0.497	P	0.102	N	1.000	N	.	.	1.11	T	-0.992	T	0.085	T	0.229	3.319	17.16	1.75	0.070	-0.042	4.447	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	20.7916	26	8.676173	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	11	7	4	1
chr11	17542593	17542593	A	A	intronic	USH1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	17565655	17565655	T	T	intronic	USH1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr11	17659741	17659741	T	A	intronic	OTOG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	17659742	17659742	T	A	intronic	OTOG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	1771737	1771737	G	T	UTR5	IFITM10	NM_001170820:c.-65C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	6	3	0
chr11	17743038	17743038	A	A	exonic	MYOD1	NaN	synonymous SNV	MYOD1:NM_002478:exon3:c.A946A:p.I316I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr11	1774666	1774666	T	C	UTR3	CTSD	NM_001909:c.*67A>G	NaN	NaN	rs12214	NaN	0.200479	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.737377	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	14	10	17
chr11	1774907	1774907	C	T	intronic	CTSD	NaN	NaN	NaN	rs149019571	NaN	0.00339457	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	10	8	2	1
chr11	1775426	1775426	A	C	intronic	CTSD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	0.61	T	-1.023	T	0.067	T	0.126	0.618	7.324	-2.69	-0.860	-1.307	2.029	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.261547	nearby_gap_events	REJECT	89	80	9	0
chr11	1776013	1776013	T	T	intronic	CTSD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr11	1776332	1776332	G	A	intronic	CTSD	NaN	NaN	NaN	rs2292963	NaN	0.133387	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.214534	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	3	4	11
chr11	1780391	1780391	A	T	intronic	CTSD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	24	7	17	0
chr11	17868902	17868902	A	G	intronic	SERGEF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	17981047	17981047	C	T	exonic	SERGEF	NaN	synonymous SNV	SERGEF:NM_012139:exon9:c.G981A:p.S327S	rs211146	NaN	0.688498	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	.	.	-1.040	T	0.000	T	.	2.209	13.34	-12.3	-3.475	-4.254	7.626	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.156874	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	13	16	42
chr11	18034584	18034584	G	A	UTR5	SERGEF	NM_012139:c.-27C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	48	15.78049	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	5	0	5	0
chr11	18034585	18034585	G	C	UTR5	SERGEF	NM_012139:c.-28C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	48	16.181012	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	5	0	5	0
chr11	18034605	18034605	C	C	UTR5	SERGEF	NM_012139:c.-48G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr11	18047255	18047255	G	T	intronic	TPH1	NaN	NaN	NaN	rs1799913	ID=COSM147151;OCCURENCE=1(stomach)	0.321086	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	59.757941	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	25	25	44
chr11	18048019	18048019	T	T	intronic	TPH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	18101948	18101948	A	T	exonic	SAAL1	NaN	stoploss	SAAL1:NM_138421:exon12:c.T1423A:p.X475K	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.460	14.18	5.13	2.237	1.842	14.209	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.681335	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	48	42	6	0
chr11	18108385	18108385	C	G	intronic	SAAL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	18108390	18108390	T	A	intronic	SAAL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	18108392	18108392	A	G	intronic	SAAL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	18108394	18108394	C	A	intronic	SAAL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	18118456	18118456	A	A	intronic	SAAL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	18127558	18127558	C	CCGG	exonic	SAAL1	NaN	nonframeshift substitution	SAAL1:NM_138421:exon1:c.31_31delinsCCGG	NaN	NaN	0.146565	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	31.4996	0	NaN	NA	NA	38	22	4	15
chr11	18253251	18253251	A	A	intronic	SAA2-SAA4,SAA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr11	18291321	18291321	T	C	exonic	SAA1	NaN	synonymous SNV	SAA1:NM_000331:exon4:c.T288C:p.A96A,SAA1:NM_199161:exon4:c.T288C:p.A96A,SAA1:NM_001178006:exon5:c.T288C:p.A96A	rs12218	ID=COSM147155;OCCURENCE=1(stomach)	0.297524	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	55.574853	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	24	24	48
chr11	18308992	18308992	T	T	intronic	HPS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	18316850	18316850	A	C	intronic	HPS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	18327152	18327152	A	G	intronic	HPS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr11	18327684	18327684	G	T	exonic	HPS5	NaN	synonymous SNV	HPS5:NM_007216:exon6:c.C480A:p.L160L,HPS5:NM_181508:exon6:c.C480A:p.L160L,HPS5:NM_181507:exon7:c.C822A:p.L274L	rs1140047	NaN	0.804712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	107.95	0	NaN	NA	NA	53	29	24	49
chr11	18327958	18327958	T	G	intronic	HPS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	18327960	18327960	C	G	intronic	HPS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	18327962	18327962	A	G	intronic	HPS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	18359730	18359730	A	G	exonic	GTF2H1	NaN	nonsynonymous SNV	GTF2H1:NM_005316:exon4:c.A422G:p.E141G,GTF2H1:NM_001142307:exon5:c.A422G:p.E141G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.975	D	0.932	D	0.000	D	1.000	D	2.22	M	0.7	T	-0.486	T	0.285	T	0.892	4.840	27.5	5.66	2.174	8.859	15.942	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.81149	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	58	54	4	0
chr11	18362649	18362649	T	C	intronic	GTF2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	7	3	0
chr11	18369044	18369044	C	C	intronic	GTF2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	18369045	18369045	A	A	intronic	GTF2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	18369049	18369049	T	A	intronic	GTF2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr11	18373822	18373822	T	T	intronic	GTF2H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	18414082	18414082	T	C	intergenic	GTF2H1,LDHA	dist=25492;dist=1854	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	18420924	18420924	T	T	intronic	LDHA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	18424356	18424356	T	T	intronic	LDHA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	18499115	18499115	G	A	intronic	LDHAL6A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	18579943	18579943	A	A	intronic	UEVLD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	18591590	18591590	T	C	intronic	UEVLD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	1	4	0
chr11	18591716	18591716	A	T	intronic	UEVLD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.91612	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	120	93	27	0
chr11	18596967	18596967	A	G	intronic	UEVLD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.720055	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	55	45	10	0
chr11	18597009	18597009	A	G	intronic	UEVLD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr11	1859942	1859942	G	C	upstream	TNNI2	NaN	NaN	NaN	rs7933508	NaN	0.450679	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	1861760	1861760	T	C	exonic	TNNI2	NaN	synonymous SNV	TNNI2:NM_001145841:exon3:c.T60C:p.S20S	rs907610	NaN	0.827676	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	276.225259	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	97	0	97	56
chr11	1861871	1861871	CA	TG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.6524	0	NaN	NA	NA	11	6	2	0
chr11	18726161	18726161	A	A	UTR3	TMEM86A	NM_153347:c.*2605A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	18727555	18727555	G	T	exonic	IGSF22	NaN	nonsynonymous SNV	IGSF22:NM_173588:exon22:c.C3719A:p.P1240Q	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.997	D	0.963	D	.	.	0.996	N	4.62	H	-0.81	T	-0.146	T	0.704	D	0.289	3.595	18.31	1.77	0.427	2.198	8.463	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	27	21	6	0
chr11	18732386	18732386	A	C	intronic	IGSF22	NaN	NaN	NaN	rs56412752	NaN	0.274161	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	129	91	38	7
chr11	18735204	18735204	T	T	intronic	IGSF22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	1	0	0
chr11	18735380	18735380	G	A	intronic	IGSF22	NaN	NaN	NaN	rs11605980	NaN	0.0704872	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	86.1453	0	NaN	NA	NA	35	20	15	2
chr11	18736942	18736942	G	A	intronic	IGSF22	NaN	NaN	NaN	rs3887900	NaN	0.61881	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.988157	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	24	11	49
chr11	18754082	18754082	C	G	intronic	PTPN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	18754085	18754085	A	T	intronic	PTPN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	18764623	18764623	C	G	splicing	PTPN5	NM_001278238:exon6:c.328-1G>C,NM_001278239:exon6:c.232-1G>C,NM_032781:exon7:c.400-1G>C,NM_006906:exon7:c.400-1G>C,NM_001039970:exon7:c.304-1G>C,NM_001278236:exon7:c.304-1G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1.983	12.59	4.77	2.192	4.089	14.512	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	33	32	1	0
chr11	18764900	18764900	A	C	exonic	PTPN5	NaN	nonsynonymous SNV	PTPN5:NM_001278238:exon4:c.T296G:p.L99W,PTPN5:NM_006906:exon5:c.T368G:p.L123W,PTPN5:NM_032781:exon5:c.T368G:p.L123W	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.758	P	0.171	B	0.961	N	1.000	N	0.695	N	3.56	T	-0.940	T	0.009	T	0.324	0.444	6.412	-0.335	-0.145	-0.133	6.481	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.292292	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	138	128	10	0
chr11	18812567	18812567	G	A	intronic	PTPN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	1886226	1886226	C	A	intronic	LSP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	18956345	18956345	A	A	UTR5	MRGPRX1	NM_147199:c.-14T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr11	18994290	18994290	A	A	intergenic	MRGPRX1,MRGPRX2	dist=37741;dist=81713	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr11	19194298	19194298	A	G	exonic	ZDHHC13	NaN	nonsynonymous SNV	ZDHHC13:NM_001001483:exon15:c.A1271G:p.E424G,ZDHHC13:NM_019028:exon16:c.A1661G:p.E554G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.78	M	1.15	T	-0.471	T	0.264	T	0.976	4.395	23.3	5.79	2.223	6.338	15.127	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.270955	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	70	67	3	0
chr11	19207705	19207705	T	T	intronic	CSRP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	19209650	19209650	T	A	intronic	CSRP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	19246094	19246094	T	C	UTR3	E2F8	NM_024680:c.*111A>G,NM_001256371:c.*111A>G,NM_001256372:c.*111A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	19246297	19246297	A	G	exonic	E2F8	NaN	nonsynonymous SNV	E2F8:NM_001256371:exon13:c.T2512C:p.C838R,E2F8:NM_001256372:exon13:c.T2512C:p.C838R,E2F8:NM_024680:exon13:c.T2512C:p.C838R	NaN	NaN	NaN	0.39	T	0.257	B	0.1	B	0.468	N	1.000	N	1.78	L	2.29	T	-1.032	T	0.051	T	0.623	0.192	5.032	6.07	2.326	2.285	14.870	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.174055	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	93	86	7	0
chr11	19246457	19246457	A	A	intronic	E2F8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	19253761	19253761	T	G	intronic	E2F8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.866167	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	92	86	6	0
chr11	19259376	19259376	T	T	intronic	E2F8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	193096	193096	T	C	UTR5	SCGB1C1,SCGB1C2	NM_145651:c.-4T>C;NM_001097610:c.-4T>C	NaN	NaN	rs2280539	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.720216	normal_lod	REJECT	3	0	3	4
chr11	193112	193112	C	T	exonic	SCGB1C1,SCGB1C2	NaN	nonsynonymous SNV	SCGB1C2:NM_001097610:exon1:c.C13T:p.R5C,SCGB1C1:NM_145651:exon1:c.C13T:p.R5C	rs7951297	NaN	0.266174	0.17	T	0.0	B	0.0	B	0.867	N	1.000	N	.	.	1.9	T	-0.945	T	0.000	T	0.028	0.195	5.048	-7.44	-1.580	-1.404	1.826	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	23.6361	0	11.032715	normal_lod	REJECT	7	3	4	1
chr11	194573	194573	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	0	2,3	0
chr11	194575	194575	A	T	downstream	SCGB1C1,SCGB1C2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	19473593	19473593	C	T	intronic	NAV2	NaN	NaN	NaN	rs76384550	NaN	0.0764776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	1951100	1951100	T	G	intronic	TNNT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.652819	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	50	40	10	0
chr11	1956276	1956276	A	A	intronic	TNNT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	19585798	19585798	G	G	intronic	NAV2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	19735457	19735457	G	A	exonic	NAV2	NaN	synonymous SNV	NAV2:NM_001244963:exon1:c.G216A:p.E72E,NAV2:NM_145117:exon1:c.G216A:p.E72E,NAV2:NM_182964:exon1:c.G216A:p.E72E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.70966	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	296	263	33	0
chr11	19864320	19864320	T	T	intronic	NAV2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	20057481	20057481	C	T	intronic	NAV2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	20057630	20057630	A	C	exonic	NAV2	NaN	nonsynonymous SNV	NAV2:NM_001111019:exon3:c.A152C:p.N51T,NAV2:NM_001111018:exon12:c.A2702C:p.N901T,NAV2:NM_145117:exon12:c.A2894C:p.N965T,NAV2:NM_182964:exon12:c.A2894C:p.N965T,NAV2:NM_001244963:exon13:c.A2963C:p.N988T	NaN	NaN	NaN	.	.	0.881	P	0.511	P	0.000	D	0.996	D	1.79	L	3.07	T	-1.039	T	0.112	T	0.268	4.002	20.5	4.75	1.034	2.875	12.089	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	1.4786604141271627E-5	NA	0	0	NaN	NA	NA	19	12	7	0
chr11	20065779	20065779	C	G	exonic	NAV2	NaN	nonsynonymous SNV	NAV2:NM_001111019:exon4:c.C418G:p.P140A,NAV2:NM_001111018:exon13:c.C2968G:p.P990A,NAV2:NM_145117:exon13:c.C3160G:p.P1054A,NAV2:NM_182964:exon13:c.C3160G:p.P1054A,NAV2:NM_001244963:exon14:c.C3229G:p.P1077A	rs3802800	NaN	0.88139	.	.	0.009	B	0.006	B	0.088	N	0.362	P	0.805	L	1.68	T	-0.990	T	0.000	T	0.189	2.370	13.88	2.17	0.631	0.943	11.574	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	67.705243	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	2	26	57
chr11	20067189	20067189	C	A	exonic	NAV2	NaN	nonsynonymous SNV	NAV2:NM_001111019:exon5:c.C1133A:p.P378Q,NAV2:NM_001111018:exon14:c.C3683A:p.P1228Q,NAV2:NM_145117:exon14:c.C3875A:p.P1292Q,NAV2:NM_182964:exon14:c.C3875A:p.P1292Q,NAV2:NM_001244963:exon15:c.C3944A:p.P1315Q	NaN	NaN	NaN	.	.	0.993	D	0.857	P	0.000	D	1.000	D	1.79	L	3.3	T	-1.006	T	0.163	T	0.63	4.073	20.9	5.91	2.802	4.632	20.298	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.731866	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	312	295	17	0
chr11	20070817	20070817	A	A	ncRNA_exonic	NAV2-AS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr11	20075817	20075817	A	A	intronic	NAV2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	8	4	0	0
chr11	20090026	20090026	G	C	intronic	NAV2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	13	8	4	0
chr11	20101556	20101556	T	T	intronic	NAV2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	25	22	0	0
chr11	20112389	20112389	A	G	intronic	NAV2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.944127	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	259	253	6	0
chr11	20119113	20119113	T	A	intronic	NAV2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.903102	nearby_gap_events	REJECT	114	106	8	0
chr11	20178131	20178131	C	G	intronic	DBX1	NaN	NaN	NaN	rs75944386	NaN	0.0461262	0.11	T	0.001	B	0.001	B	.	.	1.000	N	.	.	0.06	T	-1.107	T	0.003	T	0.062	0.725	7.858	1.91	0.186	0.517	4.055	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	39.2094	0	NaN	NA	NA	15	8	7	11
chr11	20178553	20178553	G	G	intronic	DBX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	20178747	20178747	A	G	exonic	DBX1	NaN	nonsynonymous SNV	DBX1:NM_001029865:exon3:c.T508C:p.W170R	NaN	NaN	NaN	0.13	T	0.98	D	0.804	P	0.000	D	1.000	D	1.955	M	-3.71	D	0.866	D	0.872	D	0.863	3.126	16.45	4.5	1.999	7.148	14.256	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.549627	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	48	43	5	0
chr11	2033187	2033187	G	A	intergenic	H19,IGF2	dist=14122;dist=117155	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	20403641	20403641	A	A	intronic	HTATIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	129	110	0	0
chr11	20403859	20403859	A	G	intronic	HTATIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr11	20424463	20424463	A	G	splicing	PRMT3	NM_001145167:exon7:c.475-2A>G,NM_001145166:exon6:c.520-2A>G,NM_005788:exon8:c.706-2A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.831	19.45	5.55	2.109	8.926	13.912	100	11	3035	SNV	VtSM	3	Somatic	0.051203321421548265	NA	0	20	14.15964	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	27	21	6	0
chr11	20429437	20429437	T	G	intronic	PRMT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	25.2946	0	NaN	NA	NA	28	21	8	12
chr11	20429454	20429454	T	C	intronic	PRMT3	NaN	NaN	NaN	rs10741836	NaN	0.910144	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	284.154	0	NaN	NA	NA	55	0	55	37
chr11	20515555	20515555	G	A	intronic	PRMT3	NaN	NaN	NaN	rs6483697	NaN	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	282.448375	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	98	0	98	58
chr11	20515872	20515872	A	A	intronic	PRMT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	20568150	20568150	T	T	intergenic	PRMT3,SLC6A5	dist=37271;dist=52796	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	205846	205846	A	A	intronic	BET1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	20	17	0	0
chr11	205865	205865	T	G	intronic	BET1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	20623023	20623023	C	T	exonic	SLC6A5	NaN	synonymous SNV	SLC6A5:NM_004211:exon2:c.C352T:p.L118L	rs2241941	NaN	0.326877	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	16.2346	0	NaN	NA	NA	6	3	3	24
chr11	20623042	20623042	T	C	exonic	SLC6A5	NaN	nonsynonymous SNV	SLC6A5:NM_004211:exon2:c.T371C:p.F124S	rs1443548	ID=COSM428827;OCCURENCE=1(breast)	0.793131	0.26	T	0.0	B	0.0	B	0.615	N	1.000	P	0	N	-0.48	T	-0.983	T	0.000	T	0.066	0.411	6.233	2.8	0.078	3.062	7.112	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.608972	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	43
chr11	20636431	20636431	A	T	intronic	SLC6A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	20659944	20659944	T	T	intronic	SLC6A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	20939878	20939878	A	G	intronic	NELL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	20948709	20948709	A	C	intronic	NELL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.276195	nearby_gap_events	REJECT	87	76	11	0
chr11	20959429	20959429	T	C	intronic	NELL1	NaN	NaN	NaN	rs1880087	NaN	0.563898	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.244057	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	6	12	48
chr11	2106613	2106613	A	A	intergenic	H19,IGF2	dist=87548;dist=43729	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	214421	214421	G	G	UTR3	RIC8A	NM_001286134:c.*71G>G,NM_021932:c.*71G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	2154065	2154065	T	T	UTR3	IGF2	NM_000612:c.*152A>A,NM_001127598:c.*152A>A,NM_001291862:c.*152A>A,NM_001291861:c.*152A>A,NM_001007139:c.*152A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr11	2156431	2156431	C	T	intronic	IGF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.25541082526376024	NA	0	0	NaN	NA	NA	30	24	6	0
chr11	21592515	21592515	A	A	intronic	NELL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	2168799	2168799	T	A	ncRNA_exonic	IGF2-AS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr11	2182004	2182004	A	G	intronic	INS,INS-IGF2	NaN	NaN	NaN	rs5506	NaN	0.933906	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	81.7861	0	28.184177	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	39
chr11	2191973	2191973	A	A	exonic	TH	NaN	synonymous SNV	TH:NM_199292:exon2:c.T130T:p.S44S,TH:NM_199293:exon2:c.T118T:p.S40S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	2191974	2191974	G	G	exonic	TH	NaN	synonymous SNV	TH:NM_199292:exon2:c.C129C:p.G43G,TH:NM_199293:exon2:c.C117C:p.G39G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	2191980	2191980	G	G	exonic	TH	NaN	synonymous SNV	TH:NM_199292:exon2:c.C123C:p.L41L,TH:NM_199293:exon2:c.C111C:p.L37L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	2191981	2191981	A	A	exonic	TH	NaN	synonymous SNV	TH:NM_199292:exon2:c.T122T:p.L41L,TH:NM_199293:exon2:c.T110T:p.L37L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	2192748	2192748	A	C	intronic	TH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.128012	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	164	147	17	0
chr11	2217046	2217046	A	G	intergenic	MIR4686,ASCL2	dist=22678;dist=72682	NaN	NaN	rs10770163	NaN	0.861222	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	22271958	22271958	A	A	intronic	ANO5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	22759393	22759393	A	A	intronic	GAS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	22881002	22881002	C	T	exonic	CCDC179	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC179:NM_001195637:exon2:c.G86A:p.R29Q	rs3213706	NaN	0.458866	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	187.615239	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	63	0	63	35
chr11	2329935	2329935	T	T	intronic	TSPAN32	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	233298	233298	T	G	intronic	SIRT3	NaN	NaN	NaN	rs12365010	NaN	0.114617	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	547.821	0	NaN	NA	NA	191	88	103	18
chr11	2337754	2337754	G	A	intronic	TSPAN32	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.812945	nearby_gap_events	REJECT	98	87	11	0
chr11	2411602	2411602	T	A	intronic	CD81	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	2426984	2426984	G	C	intronic	TRPM5	NaN	NaN	NaN	rs2301696	NaN	0.302316	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	465.811	0	NaN	NA	NA	50	1	49	45
chr11	2428341	2428341	G	A	intronic	TRPM5	NaN	NaN	NaN	rs11022676	ID=COSM1604441;OCCURENCE=1(liver)	0.233826	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	46.853639	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	18	21	16
chr11	2429213	2429213	A	G	intronic	TRPM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	20	6	14	0
chr11	2432819	2432819	GA	G,GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	102.63	0	NaN	NA	NA	11	0	2	1
chr11	2433549	2433549	G	A	intronic	TRPM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	2433553	2433553	A	G	intronic	TRPM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	2433556	2433556	C	G	intronic	TRPM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	2435425	2435425	C	T	exonic	TRPM5	NaN	nonsynonymous SNV	TRPM5:NM_014555:exon12:c.G1756A:p.E586K	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.968	D	0.586	P	0.000	D	1.000	D	2.06	M	-1.14	T	-0.161	T	0.430	T	0.604	2.782	15.27	2.51	0.775	2.647	11.288	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.331765	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	13	11	2	0
chr11	2437714	2437714	A	G	intronic	TRPM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr11	2438963	2438963	C	A	exonic	TRPM5	NaN	nonsynonymous SNV	TRPM5:NM_014555:exon7:c.G1003T:p.V335L	rs34350821	NaN	0.0393371	0.74	T	1.0	D	0.998	D	0.000	D	0.035	P	0.305	N	0.0	T	-1.012	T	0.003	T	0.341	2.700	14.99	2.09	0.271	1.974	6.318	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	47.426977	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	2	17	10
chr11	244236	244236	A	A	intronic	PSMD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr11	2442437	2442437	A	A	intronic	TRPM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	2443286	2443286	C	T	intronic	TRPM5	NaN	NaN	NaN	rs111967878	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.242828	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	1	3	0
chr11	24784862	24784862	A	T	intronic	LUZP2	NaN	NaN	NaN	rs2716532	NaN	0.594848	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	149.669	0	48.710945	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	11
chr11	24936031	24936031	A	T	exonic	LUZP2	NaN	nonsynonymous SNV	LUZP2:NM_001009909:exon7:c.A469T:p.I157F,LUZP2:NM_001252008:exon7:c.A211T:p.I71F	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	0.975	L	1.7	T	-1.008	T	0.111	T	0.9	3.880	19.72	5.54	2.093	3.894	13.611	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.126344	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	157	142	15	0
chr11	24936032	24936032	T	C	exonic	LUZP2	NaN	nonsynonymous SNV	LUZP2:NM_001009909:exon7:c.T470C:p.I157T,LUZP2:NM_001252008:exon7:c.T212C:p.I71T	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.996	D	0.000	D	0.996	D	0.975	L	1.71	T	-1.003	T	0.111	T	0.948	3.747	19.03	5.54	2.093	6.544	13.611	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.044884	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	237	221	16	0
chr11	2537911	2537911	G	C	intronic	KCNQ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	2537912	2537912	C	A	intronic	KCNQ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	2537913	2537913	T	G	intronic	KCNQ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	2610415	2610415	C	G	intronic	KCNQ1	NaN	NaN	NaN	rs10766203	NaN	0.847244	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	2613427	2613427	T	C	intronic	KCNQ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	14	9	5	0
chr11	26465427	26465427	A	A	intronic	ANO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	26529620	26529620	A	G	intronic	ANO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.297836	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	328	319	9	0
chr11	26529861	26529861	T	C	intronic	ANO3	NaN	NaN	NaN	rs118181050	NaN	0.00878594	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	147.773908	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	108	47	61	8
chr11	26529988	26529988	T	C	intronic	ANO3	NaN	NaN	NaN	rs118043383	NaN	0.00878594	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	129.459154	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	106	49	57	8
chr11	26538314	26538314	T	T	intronic	ANO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	26574884	26574884	T	A	exonic	ANO3	NaN	nonsynonymous SNV	ANO3:NM_031418:exon13:c.T1378A:p.Y460N	NaN	NaN	NaN	0.14	T	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.345	M	-0.52	T	0.016	D	0.525	D	0.886	4.144	21.4	5.59	2.127	7.775	15.751	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	24	15	7	0
chr11	26574886	26574886	T	A	exonic	ANO3	NaN	stopgain	ANO3:NM_031418:exon13:c.T1380A:p.Y460X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	7.336	39	0.536	-0.149	-0.030	10.615	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	25	15	10	0
chr11	26656696	26656696	A	A	intronic	ANO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	26669461	26669461	A	A	intronic	ANO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	26681668	26681668	A	G	intronic	ANO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.07417	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	189	177	12	0
chr11	26682004	26682004	A	A	UTR3	ANO3	NM_031418:c.*13A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	26700182	26700182	A	G	intronic	SLC5A12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	12	4	8	0
chr11	26702565	26702565	T	C	intronic	SLC5A12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	1	4	0
chr11	26724996	26724996	C	C	intronic	SLC5A12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	44	37	0	0
chr11	26725570	26725570	A	G	intronic	SLC5A12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr11	26734115	26734115	T	G	intronic	SLC5A12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	27078708	27078708	T	T	ncRNA_intronic	BBOX1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	2708889	2708889	G	C	ncRNA_exonic	KCNQ1OT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr11	27149052	27149052	T	C	ncRNA_intronic	BBOX1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	2	2	0
chr11	27149054	27149054	T	A	ncRNA_intronic	BBOX1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	2	0
chr11	27238086	27238086	A	A	ncRNA_intronic	BBOX1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	27384442	27384442	G	A	exonic	CCDC34	NaN	synonymous SNV	CCDC34:NM_030771:exon1:c.C300T:p.A100A,CCDC34:NM_080654:exon1:c.C300T:p.A100A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.738065	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	258	251	7	0
chr11	27389556	27389556	T	T	exonic	LGR4	NaN	synonymous SNV	LGR4:NM_018490:exon18:c.A2714A:p.H905H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	27393298	27393298	A	G	intronic	LGR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	17	6	11	0
chr11	27393813	27393813	G	A	intronic	LGR4	NaN	NaN	NaN	rs2448001	NaN	0.417532	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	282.847	0	NaN	NA	NA	89	59	30	20
chr11	27395078	27395078	A	G	intronic	LGR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.472883	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	108	99	9	0
chr11	27400084	27400084	C	A	intronic	LGR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	73	32	41	0
chr11	27402004	27402004	A	A	intronic	LGR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr11	27528363	27528363	G	A	upstream	BDNF-AS,LIN7C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.4467	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr11	2756314	2756314	G	A	intronic	KCNQ1	NaN	NaN	NaN	rs450852	NaN	0.311901	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	27680150	27680150	A	A	ncRNA_intronic	BDNF-AS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	31	31	0	0
chr11	27722650	27722650	T	C	intronic	BDNF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.906398	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	160	154	6	0
chr11	2797320	2797320	A	G	intronic	KCNQ1	NaN	NaN	NaN	rs163150	NaN	0.668331	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.0197	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	53
chr11	28045419	28045419	T	C	intronic	KIF18A	NaN	NaN	NaN	rs12273233	NaN	0.196685	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.024581	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	14	11	13
chr11	28056857	28056857	A	T	intronic	KIF18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.955946	nearby_gap_events	REJECT	173	163	10	0
chr11	280673	280673	C	T	exonic	NLRP6	NaN	synonymous SNV	NLRP6:NM_001276700:exon4:c.C939T:p.S313S,NLRP6:NM_138329:exon4:c.C939T:p.S313S	rs12807092	NaN	0.48742	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.400896	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	14
chr11	28116498	28116498	A	A	intronic	KIF18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	28134974	28134974	C	A	exonic	METTL15	NaN	nonsynonymous SNV	METTL15:NM_001113528:exon3:c.C93A:p.N31K,METTL15:NM_001297775:exon3:c.C93A:p.N31K,METTL15:NM_152636:exon3:c.C93A:p.N31K	rs11553132	NaN	0.604034	1	T	0.0	B	0.0	B	0.043	N	1.000	P	.	.	2.1	T	-1.002	T	0.000	T	0.028	-2.406	0.003	-3.88	-1.457	0.395	7.620	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	30.1466	0	NaN	NA	NA	13	8	5	26
chr11	2832114	2832114	C	A	intronic	KCNQ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr11	284070	284070	C	G	intronic	NLRP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	284072	284072	A	G	intronic	NLRP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	2842419	2842419	A	C	intronic	KCNQ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	284737	284737	G	C	intronic	NLRP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	285405	285405	A	A	downstream	NLRP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	290835	290835	G	A	exonic	ATHL1	NaN	nonsynonymous SNV	ATHL1:NM_025092:exon4:c.G628A:p.E210K	NaN	NaN	NaN	0.26	T	0.948	P	0.533	P	0.075	N	1.000	N	1.7	L	.	.	-0.971	T	0.130	T	0.156	0.976	8.982	3.96	1.947	2.244	15.376	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.623164	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	156	151	5	0
chr11	2930987	2930987	G	C	intronic	SLC22A18	NaN	NaN	NaN	rs61871179	NaN	0.228235	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.883134	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	16
chr11	2935050	2935050	A	G	intronic	SLC22A18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	2939392	2939392	G	A	intronic	SLC22A18	NaN	NaN	NaN	rs445679	NaN	0.98103	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.082675	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	38
chr11	2943310	2943310	T	T	intronic	SLC22A18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	2946157	2946157	T	T	intronic	SLC22A18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr11	295808	295808	A	G	downstream	ATHL1	NaN	NaN	NaN	rs11246057	NaN	0.446486	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	295876	295876	C	T	downstream	ATHL1	NaN	NaN	NaN	rs2242566	NaN	0.405751	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	2970369	2970369	T	C	intronic	NAP1L4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	1	3	0
chr11	2981179	2981179	A	A	intronic	NAP1L4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	27	24	0	0
chr11	2992620	2992620	A	T	intronic	NAP1L4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.00119808	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.41558	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	285	257	28	0
chr11	2992621	2992621	T	G	intronic	NAP1L4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.974814	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	316	288	28	0
chr11	2997396	2997396	A	A	intronic	NAP1L4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	30032301	30032301	T	G	exonic	KCNA4	NaN	nonsynonymous SNV	KCNA4:NM_002233:exon2:c.A1925C:p.N642T	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.23	B	0.05	B	0.000	D	1.000	D	2.435	M	-4.32	D	0.837	D	0.878	D	0.435	3.322	17.17	5.7	2.168	6.272	15.975	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	106.784311	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	609	524	85	0
chr11	3013996	3013996	C	T	upstream	NAP1L4	NaN	NaN	NaN	rs16925010	NaN	0.349241	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	3023664	3023664	C	G	intronic	CARS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	3023665	3023665	T	G	intronic	CARS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	3023897	3023897	A	G	intronic	CARS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr11	30352473	30352473	C	CAG,G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	1495.76	41	NaN	NA	NA	170	0	117	23
chr11	30358033	30358033	C	T	intronic	ARL14EP	NaN	NaN	NaN	rs201877693	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	45	30	15	0
chr11	30433180	30433180	G	A	intronic	MPPED2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	30549128	30549128	T	G	intronic	MPPED2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	12	2	10	0
chr11	30557534	30557534	T	C	intronic	MPPED2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	30601743	30601743	T	C	intronic	MPPED2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.910145	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	109	96	13	0
chr11	3064175	3064175	G	A	intronic	CARS	NaN	NaN	NaN	rs78731866	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr11	3078584	3078584	GA	AC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.07715	0	NaN	NA	NA	30	26	4	0
chr11	308296	308296	A	C	exonic	IFITM2	NaN	nonsynonymous SNV	IFITM2:NM_006435:exon1:c.A104C:p.H35P	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.054	B	0.062	B	0.249	N	1.000	N	2.12	M	-0.99	T	-0.838	T	0.341	T	0.301	1.559	11.17	-3.69	-0.634	-0.558	0.343	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.677683	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	91	80	11	0
chr11	308303	308303	T	C	exonic	IFITM2	NaN	synonymous SNV	IFITM2:NM_006435:exon1:c.T111C:p.P37P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.574186	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	78	64	14	0
chr11	3088979	3088979	C	T	intergenic	CARS,OSBPL5	dist=10298;dist=19367	NaN	NaN	rs755950	NaN	0.380391	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	30922158	30922158	A	T	intronic	DCDC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	30922165	30922165	C	A	intronic	DCDC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	30922166	30922166	A	G	intronic	DCDC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	3109403	3109403	A	G	UTR3	OSBPL5	NM_001144063:c.*32T>C,NM_020896:c.*32T>C,NM_145638:c.*32T>C	NaN	NaN	rs2289999	NaN	0.758786	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.740785	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	13	14	44
chr11	3109408	3109408	C	T	UTR3	OSBPL5	NM_001144063:c.*27G>A,NM_020896:c.*27G>A,NM_145638:c.*27G>A	NaN	NaN	rs2289998	NaN	0.758786	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.708255	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	14	13	43
chr11	3112101	3112101	G	T	intronic	OSBPL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	3113249	3113249	G	A	intronic	OSBPL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	3113250	3113250	G	A	intronic	OSBPL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	3115642	3115642	A	T	intronic	OSBPL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	3115643	3115643	G	C	intronic	OSBPL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	3121553	3121553	A	T	intronic	OSBPL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr11	3123399	3123399	A	G	intronic	OSBPL5	NaN	NaN	NaN	rs58090999	NaN	0.138978	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	117.667	0	28.807317	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	0	13	9
chr11	3123620	3123620	C	T	intronic	OSBPL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	3125767	3125767	A	A	intronic	OSBPL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	31284499	31284499	C	A	UTR3	DCDC1	NM_181807:c.*111G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	31284501	31284501	G	C	UTR3	DCDC1	NM_181807:c.*109C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	13	3	7	0
chr11	3129027	3129027	G	A	exonic	OSBPL5	NaN	synonymous SNV	OSBPL5:NM_001144063:exon7:c.C636T:p.T212T,OSBPL5:NM_145638:exon7:c.C636T:p.T212T,OSBPL5:NM_020896:exon8:c.C840T:p.T280T	rs3741350	NaN	0.454073	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.753173	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	1	15	27
chr11	3129092	3129092	C	T	exonic	OSBPL5	NaN	nonsynonymous SNV	OSBPL5:NM_001144063:exon7:c.G571A:p.G191R,OSBPL5:NM_145638:exon7:c.G571A:p.G191R,OSBPL5:NM_020896:exon8:c.G775A:p.G259R	NaN	NaN	0.000199681	0.26	T	0.987	D	0.588	P	0.001	D	1.000	D	2.125	M	1.56	T	-1.073	T	0.088	T	0.199	1.984	12.59	2.32	0.417	0.582	5.761	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	15.8103	0	7.233881	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	8	5	3	0
chr11	31349845	31349845	A	G	intronic	DCDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.023652	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	133	127	6	0
chr11	314207	314207	C	G	exonic	IFITM1	NaN	nonsynonymous SNV	IFITM1:NM_003641:exon1:c.C37G:p.P13A	rs9667990	NaN	1	1	T	0.0	B	0.0	B	0.356	N	1.000	P	-2.43	N	-1.16	T	-0.966	T	0.000	T	0.104	-1.377	0.025	2.02	0.592	0.320	3.796	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	226.416	43	NaN	NA	NA	25	0	19	51
chr11	31447943	31447943	A	G	intronic	DNAJC24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.501753	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	97	87	10	0
chr11	31447967	31447967	A	C	intronic	DNAJC24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.023081539930844594	NA	0	0	31.587649	nearby_gap_events	REJECT	105	85	20	0
chr11	31447968	31447968	C	T	intronic	DNAJC24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.302059	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	157	138	19	0
chr11	31447969	31447969	T	A	intronic	DNAJC24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.654866	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	159	141	18	0
chr11	31484598	31484598	A	A	intronic	IMMP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	171	112	0	0
chr11	3151264	3151264	C	T	intronic	OSBPL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	15	0	15	0
chr11	3166846	3166846	C	T	intronic	OSBPL5	NaN	NaN	NaN	rs11025598	NaN	0.169928	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	18	10	8	0
chr11	31669208	31669208	G	G	intronic	ELP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	31671711	31671711	A	G	exonic	ELP4	NaN	nonsynonymous SNV	ELP4:NM_001288725:exon9:c.A1088G:p.D363G,ELP4:NM_001288726:exon9:c.A1085G:p.D362G,ELP4:NM_019040:exon9:c.A1085G:p.D362G	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.993	D	0.884	P	0.000	D	1.000	D	1.495	L	1.05	T	-0.940	T	0.180	T	0.725	1.206	9.899	5.97	2.285	8.047	16.453	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.567158	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	5	2	3	0
chr11	31815426	31815426	C	A	intronic	PAX6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.022346	nearby_gap_events	REJECT	84	77	7	0
chr11	31823067	31823067	T	A	intronic	PAX6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr11	31827887	31827887	T	C	intronic	PAX6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	16	6	10	0
chr11	31845026	31845026	G	G	ncRNA_intronic	DKFZp686K1684	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	320606	320606	G	T	exonic	IFITM3	NaN	nonsynonymous SNV	IFITM3:NM_021034:exon1:c.C208A:p.P70T	rs199749095	ID=COSM42691;OCCURENCE=1(haematopoietic_and_lymphoid_tissue),8(large_intestine),2(central_nervous_system),2(endometrium)	NaN	0.4	T	0.0	B	0.001	B	.	.	1.000	N	0.895	L	-0.94	T	-0.991	T	0.186	T	0.103	-1.194	0.076	-9.3	-3.272	-1.460	2.563	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	191.634	0	NaN	NA	NA	216	136	80	1
chr11	32113057	32113057	A	G	intronic	RCN1	NaN	NaN	NaN	rs223045	NaN	0.478834	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.726523	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	20
chr11	32119863	32119863	T	T	intronic	RCN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	32125961	32125961	C	T	exonic	RCN1	NaN	synonymous SNV	RCN1:NM_002901:exon6:c.C939T:p.V313V	rs11586	NaN	0.504593	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	522.664075	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	186	0	186	46
chr11	32207691	32207691	A	G	intergenic	RCN1,WT1	dist=80419;dist=201631	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	32615391	32615391	T	A	intronic	EIF3M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	11	4	6	0
chr11	32623814	32623814	T	C	UTR3	CCDC73	NM_001008391:c.*543A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.407153	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	85	79	6	0
chr11	32636475	32636475	A	C	exonic	CCDC73	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC73:NM_001008391:exon16:c.T1389G:p.F463L	NaN	NaN	NaN	0.69	T	0.001	B	0.004	B	0.405	N	1.000	D	0.11	N	.	.	-1.053	T	0.060	T	0.134	-0.906	0.425	-0.035	-0.165	1.202	5.072	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.971454	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	276	258	18	0
chr11	326718	326718	G	A	intergenic	IFITM3,B4GALNT4	dist=5804;dist=43077	NaN	NaN	rs9704354	NaN	0.120807	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	32975389	32975389	T	G	intronic	QSER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr11	33047614	33047614	A	G	intronic	DEPDC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	16	10	4	0
chr11	33047617	33047617	A	T	intronic	DEPDC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr11	33065280	33065280	T	G	intronic	TCP11L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0014934495423388284	NA	0	0	NaN	NA	NA	44	20	24	0
chr11	33078631	33078631	C	G	intronic	TCP11L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.61555	nearby_gap_events	REJECT	28	22	6	0
chr11	33079280	33079280	A	A	intronic	TCP11L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	148	64	0	0
chr11	33187848	33187848	C	G	ncRNA_intronic	CSTF3-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr11	33360783	33360783	A	G	intronic	HIPK3	NaN	NaN	NaN	rs3847592	NaN	0.521765	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	110.462	16	47.946361	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	28	25	47
chr11	33360887	33360887	T	A	intronic	HIPK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr11	33581306	33581306	G	A	exonic	KIAA1549L	NaN	synonymous SNV	KIAA1549L:NM_012194:exon6:c.G2976A:p.T992T	rs2281380	NaN	0.388978	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-0.931	T	0.000	T	.	0.664	7.557	-5.21	-0.823	-0.872	5.833	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.84043	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	27	14	33
chr11	33583197	33583197	T	T	intronic	KIAA1549L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	33596427	33596427	A	A	intronic	KIAA1549L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr11	33640104	33640104	A	C	exonic	KIAA1549L	NaN	synonymous SNV	KIAA1549L:NM_012194:exon15:c.A4414C:p.R1472R	rs768474	NaN	0.745607	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	373.952	0	NaN	NA	NA	100	49	51	47
chr11	33667596	33667596	T	C	intronic	KIAA1549L	NaN	NaN	NaN	rs1033542	NaN	0.608626	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	54.076702	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	2	23	24
chr11	33775972	33775972	G	A	intronic	FBXO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.25258	0	NaN	NA	NA	82	79	3	6
chr11	33795916	33795916	C	T	intronic	FBXO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.838061	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	51	41	10	0
chr11	33795917	33795917	T	C	intronic	FBXO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.963186	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	48	38	10	0
chr11	33880896	33880896	T	A	UTR3	LMO2	NM_005574:c.*6A>T,NM_001142316:c.*6A>T,NM_001142315:c.*6A>T	NaN	NaN	rs3740616	NaN	0.146166	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	131.393	0	NaN	NA	NA	90	56	34	22
chr11	33885961	33885961	T	T	intronic	LMO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	33886551	33886551	A	A	intronic	LMO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	7	0	0
chr11	3392768	3392768	T	T	intronic	ZNF195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	34093357	34093357	T	A	intronic	CAPRIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.487678	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	310	294	16	0
chr11	34101344	34101344	A	A	intronic	CAPRIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr11	34110881	34110881	T	T	intronic	CAPRIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	34111028	34111028	T	TA	intronic	CAPRIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	55.5707	0	NaN	NA	NA	9	1	7	1
chr11	34118231	34118231	A	T	intronic	CAPRIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.923847	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	111	101	10	0
chr11	34118665	34118665	T	C	intronic	CAPRIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr11	34119190	34119190	T	T	intronic	CAPRIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	34129692	34129692	G	A	intronic	NAT10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr11	34156021	34156021	C	A	intronic	NAT10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.835782	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	245	238	7	0
chr11	34160848	34160848	A	G	intronic	NAT10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.658946	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	113	99	14	0
chr11	34160855	34160855	T	G	intronic	NAT10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.521783	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	108	99	9	0
chr11	34172939	34172939	G	T	UTR3	ABTB2	NM_145804:c.*995C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	34181516	34181516	G	C	exonic	ABTB2	NaN	nonsynonymous SNV	ABTB2:NM_145804:exon13:c.C2543G:p.T848S	NaN	NaN	NaN	0.03	D	1.0	D	0.988	D	0.000	N	1.000	D	2.01	M	-0.56	T	0.067	D	0.521	D	0.257	4.870	27.9	5.05	2.506	7.926	18.774	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.253317	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	144	133	11	0
chr11	34188695	34188695	T	T	intronic	ABTB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	34201013	34201013	A	G	intronic	ABTB2	NaN	NaN	NaN	rs2957492	NaN	0.360224	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	34216830	34216830	A	G	intronic	ABTB2	NaN	NaN	NaN	rs12291748	NaN	0.214457	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	34216881	34216881	T	T	intronic	ABTB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	34216916	34216916	A	G	intronic	ABTB2	NaN	NaN	NaN	rs12291795	NaN	0.21905	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr11	34218719	34218719	T	T	intronic	ABTB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	34219002	34219002	G	T	exonic	ABTB2	NaN	nonsynonymous SNV	ABTB2:NM_145804:exon3:c.C1114A:p.Q372K	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.017	B	0.007	B	0.023	N	0.996	D	1.245	L	1.02	T	-1.056	T	0.107	T	0.667	3.488	17.84	5.75	2.714	6.865	18.123	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.05397727272727297	NA	0	0	11.261809	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	23	18	5	0
chr11	34490006	34490006	A	A	intronic	CAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr11	34673052	34673052	GA	AT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	1817.81	59	NaN	NA	NA	180	0	15	17
chr11	34673244	34673244	G	G	intronic	EHF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	114	NaN	NA	NA	140	117	0	0
chr11	34678335	34678335	T	T	intronic	EHF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	34805922	34805922	C	G	intergenic	EHF,APIP	dist=121088;dist=97921	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	34904372	34904372	G	A	intronic	APIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.066776	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	255	243	12	0
chr11	34904399	34904399	C	T	intronic	APIP	NaN	NaN	NaN	rs2288667	NaN	0.579473	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	325.535	0	NaN	NA	NA	240	147	93	48
chr11	34909827	34909827	GAAAAAA	GGAAAAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	131.909	0	NaN	NA	NA	331	133	13	5
chr11	34909828	34909828	A	G	intronic	APIP	NaN	NaN	NaN	rs374135766	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.366059	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	100	78	22	1
chr11	34912037	34912037	T	A	intronic	APIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	2	0
chr11	35240939	35240939	G	T	intronic	CD44	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.489841	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	67	58	9	0
chr11	35240940	35240940	T	G	intronic	CD44	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.782203	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	63	54	9	0
chr11	35243326	35243326	A	A	intronic	CD44	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr11	35336541	35336541	T	G	intronic	SLC1A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	35336542	35336542	T	G	intronic	SLC1A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr11	35463264	35463264	G	C	intronic	PAMR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	35489716	35489716	A	A	intronic	PAMR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	35492387	35492387	G	G	intronic	PAMR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	35547037	35547037	T	A	intronic	PAMR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	35547039	35547039	T	A	intronic	PAMR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	2	3	0
chr11	35641654	35641654	A	C	UTR3	FJX1	NM_014344:c.*156A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr11	36120050	36120050	C	T	intronic	LDLRAD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr11	36262832	36262832	A	T	intergenic	LDLRAD3,COMMD9	dist=9146;dist=31010	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	36440719	36440719	C	A	intronic	PRR5L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.300263	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	139	127	12	0
chr11	36458873	36458873	C	T	intronic	PRR5L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	36518695	36518695	T	G	exonic	TRAF6	NaN	nonsynonymous SNV	TRAF6:NM_004620:exon4:c.A569C:p.D190A,TRAF6:NM_145803:exon5:c.A569C:p.D190A	NaN	NaN	NaN	0.73	T	0.002	B	0.008	B	0.437	N	1.000	N	0.345	N	1.83	T	-1.011	T	0.031	T	0.065	0.061	4.332	-1.9	-0.619	0.427	5.560	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	0.319918	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	64	63	1	0
chr11	3660231	3660231	A	G	splicing	ART5	NM_053017:exon4:c.820+2T>C,NM_001297668:exon4:c.616+2T>C,NM_001079536:exon5:c.820+2T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1.463	10.84	5.87	2.371	4.529	12.957	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.923988	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	151	147	4	0
chr11	3662966	3662966	C	G	intronic	ART5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.53125	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr11	3662980	3662980	T	C	intronic	ART5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	6.39696	0	4.50753	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	12	10	2	0
chr11	3663011	3663011	G	A	intronic	ART5	NaN	NaN	NaN	rs932097	NaN	0.438698	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.016542	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	7	6	41
chr11	36719299	36719299	G	A	intergenic	C11orf74,LOC103312105	dist=38458;dist=1920515	NaN	NaN	rs994182	NaN	0.323283	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	3681115	3681115	A	G	exonic	ART1	NaN	synonymous SNV	ART1:NM_004314:exon3:c.A366G:p.T122T	rs35136756	NaN	0.157947	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.267989	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	24	13	9
chr11	3688420	3688420	C	A	intronic	CHRNA10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.832222	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	25	17	8	0
chr11	3688960	3688960	T	TTG	exonic	CHRNA10	NaN	frameshift substitution	CHRNA10:NM_020402:exon4:c.397_397delinsCAA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.8447	0	NaN	NA	NA	12	10	2	0
chr11	3690638	3690638	C	T	intronic	CHRNA10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	12	7	3	0
chr11	3690639	3690639	T	C	intronic	CHRNA10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr11	3697952	3697952	G	A	intronic	NUP98	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	3714489	3714489	C	T	exonic	NUP98	NaN	synonymous SNV	NUP98:NM_016320:exon27:c.G4284A:p.A1428A,NUP98:NM_139132:exon27:c.G4284A:p.A1428A	rs1875	NaN	0.275759	0.03	D	.	.	.	.	0.000	D	0.000	P	.	.	.	.	-0.996	T	0.000	T	.	1.254	10.09	-4.15	-0.463	-0.501	0.534	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	67.3577	0	35.676308	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	18	15	13
chr11	372095	372095	T	C	intronic	B4GALNT4	NaN	NaN	NaN	rs72847391	NaN	0.0664936	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	75	NaN	NA	NA	415	121	294	13
chr11	372157	372157	C	T	exonic	B4GALNT4	NaN	nonsynonymous SNV	B4GALNT4:NM_178537:exon2:c.C200T:p.A67V	rs34063493	NaN	0.375599	1	T	0.002	B	0.001	B	0.102	N	1.000	P	0.345	N	3.54	T	-0.918	T	0.000	T	0.041	-0.175	3.145	-3.99	-0.770	-0.321	10.270	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	3.065881382005842E-4	NA	0	103	NaN	NA	NA	434	310	124	31
chr11	372225	372225	C	T	intronic	B4GALNT4	NaN	NaN	NaN	rs79491678	NaN	0.0662939	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	402	121	281	13
chr11	3723933	3723933	G	T	exonic	NUP98	NaN	nonsynonymous SNV	NUP98:NM_016320:exon23:c.C3272A:p.T1091K,NUP98:NM_139132:exon23:c.C3272A:p.T1091K	NaN	NaN	NaN	0.54	T	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	1.955	M	.	.	-0.508	T	0.390	T	0.808	4.391	23.2	5.48	2.565	5.424	18.332	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.779784	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	142	129	13	0
chr11	3723934	3723934	T	G	exonic	NUP98	NaN	nonsynonymous SNV	NUP98:NM_016320:exon23:c.A3271C:p.T1091P,NUP98:NM_139132:exon23:c.A3271C:p.T1091P	NaN	NaN	NaN	0.31	T	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	1.955	M	.	.	-0.415	T	0.383	T	0.815	4.333	22.8	5.48	2.073	4.882	14.742	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.122538	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	125	112	13	0
chr11	3740589	3740589	A	T	intronic	NUP98	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	16.0115	0	NaN	NA	NA	147	140	24	5
chr11	3756424	3756424	T	A	exonic	NUP98	NaN	nonsynonymous SNV	NUP98:NM_005387:exon13:c.A1590T:p.E530D,NUP98:NM_016320:exon13:c.A1539T:p.E513D,NUP98:NM_139131:exon13:c.A1539T:p.E513D,NUP98:NM_139132:exon13:c.A1539T:p.E513D	NaN	NaN	NaN	0.61	T	0.999	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	1.73	L	.	.	-0.733	T	0.229	T	0.502	4.219	21.9	5.5	2.085	2.783	9.314	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.76521	0	NaN	NA	NA	10	9	2	0
chr11	376248	376248	C	C	intronic	B4GALNT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr11	377331	377331	T	G	intronic	B4GALNT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.796799	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	73	65	8	0
chr11	377332	377332	G	T	intronic	B4GALNT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.24497	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	60	52	8	0
chr11	378222	378222	G	G	intronic	B4GALNT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	378223	378223	T	T	intronic	B4GALNT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	381073	381073	G	G	intronic	B4GALNT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	3832463	3832463	T	C	intronic	PGAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.95683	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	40	32	8	0
chr11	3846095	3846095	T	C	intronic	PGAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr11	3849420	3849420	C	T	UTR5	RHOG	NM_001665:c.-52G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.099528	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	608	600	8	0
chr11	400109	400109	A	G	exonic	PKP3	NaN	synonymous SNV	PKP3:NM_007183:exon6:c.A1416G:p.A472A,PKP3:NM_001303029:exon7:c.A1461G:p.A487A	rs8858	NaN	0.897364	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.363306	normal_lod	REJECT	5	2	3	9
chr11	400189	400189	T	T	intronic	PKP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	404076	404076	A	A	exonic	PKP3	NaN	synonymous SNV	PKP3:NM_007183:exon11:c.A2211A:p.R737R,PKP3:NM_001303029:exon12:c.A2256A:p.R752R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	27	26	0	0
chr11	405736	405736	T	T	UTR3	SIGIRR	NM_021805:c.*160A>A,NM_001135054:c.*160A>A,NM_001135053:c.*160A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	405737	405737	T	T	UTR3	SIGIRR	NM_021805:c.*159A>A,NM_001135054:c.*159A>A,NM_001135053:c.*159A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	405738	405738	T	T	UTR3	SIGIRR	NM_021805:c.*158A>A,NM_001135054:c.*158A>A,NM_001135053:c.*158A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	406049	406049	C	G	exonic	SIGIRR	NaN	synonymous SNV	SIGIRR:NM_001135053:exon10:c.G1080C:p.G360G,SIGIRR:NM_001135054:exon10:c.G1080C:p.G360G,SIGIRR:NM_021805:exon10:c.G1080C:p.G360G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.61	P	0.207	B	.	.	1.000	N	.	.	3.69	T	-1.001	T	0.038	T	.	1.241	10.04	0.124	0.080	-0.047	8.232	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	101	101	0	0
chr11	406473	406473	A	C	exonic	SIGIRR	NaN	synonymous SNV	SIGIRR:NM_001135053:exon9:c.T945G:p.P315P,SIGIRR:NM_001135054:exon9:c.T945G:p.P315P,SIGIRR:NM_021805:exon9:c.T945G:p.P315P	rs3087588	NaN	0.907149	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	.	.	-1.031	T	0.000	T	.	0.270	5.462	-6.01	-2.206	-3.243	0.384	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.841869	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	6	6	23
chr11	406483	406483	T	C	exonic	SIGIRR	NaN	nonsynonymous SNV	SIGIRR:NM_001135053:exon9:c.A935G:p.Q312R,SIGIRR:NM_001135054:exon9:c.A935G:p.Q312R,SIGIRR:NM_021805:exon9:c.A935G:p.Q312R	rs3210908	NaN	0.927117	0.88	T	0.0	B	0.001	B	0.351	N	1.000	P	0.805	L	4.14	T	-1.029	T	0.000	T	0.152	-1.499	0.017	-2.77	-1.273	-0.395	7.634	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	34.7824	0	9.794103	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	6	6	23
chr11	4076948	4076948	A	T	intronic	STIM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	4076949	4076949	G	T	intronic	STIM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	4112479	4112479	T	T	intronic	STIM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	41302789	41302789	T	A	intronic	LRRC4C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	4156297	4156297	G	C	intronic	RRM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	4156298	4156298	T	A	intronic	RRM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	4156299	4156299	T	C	intronic	RRM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	4156301	4156301	T	G	intronic	RRM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr11	418348	418348	T	T	UTR3	ANO9	NM_001012302:c.*23A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr11	418451	418451	C	A	exonic	ANO9	NaN	nonsynonymous SNV	ANO9:NM_001012302:exon23:c.G2269T:p.V757L	NaN	NaN	NaN	0.3	T	0.017	B	0.007	B	0.001	N	1.000	N	0	N	-0.14	T	-1.074	T	0.097	T	0.121	1.669	11.54	-1.68	-0.392	-0.049	0.369	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.123846	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	131	121	10	0
chr11	418693	418693	C	T	intronic	ANO9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.442922	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	158	145	13	0
chr11	4214611	4214611	G	T	ncRNA_intronic	LOC100506082	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	431834	431834	A	G	intronic	ANO9	NaN	NaN	NaN	rs55914928	NaN	0.924321	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.221733	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	11	10	49
chr11	43218029	43218029	C	G	intergenic	LOC100507205,HNRNPKP3	dist=942789;dist=65025	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	43218031	43218031	T	A	intergenic	LOC100507205,HNRNPKP3	dist=942791;dist=65023	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	433965	433965	G	A	intronic	ANO9	NaN	NaN	NaN	rs7396778	NaN	0.196885	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.271903	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	12	12	19
chr11	433995	433995	G	A	intronic	ANO9	NaN	NaN	NaN	rs7396776	NaN	0.534944	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.562651	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	10	10	48
chr11	43465581	43465581	T	T	intronic	TTC17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	70	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr11	43543720	43543720	C	G	intergenic	TTC17,MIR670	dist=27237;dist=37486	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	17	0	17	0
chr11	43543724	43543724	C	A	intergenic	TTC17,MIR670	dist=27241;dist=37482	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	17	0	17	0
chr11	43543729	43543729	T	C	intergenic	TTC17,MIR670	dist=27246;dist=37477	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	17	0	17	0
chr11	43543734	43543734	T	C	intergenic	TTC17,MIR670	dist=27251;dist=37472	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	17	0	17	0
chr11	43543819	43543819	T	C	intergenic	TTC17,MIR670	dist=27336;dist=37387	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	0	10	0
chr11	43543822	43543822	A	G	intergenic	TTC17,MIR670	dist=27339;dist=37384	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	11	0	11	0
chr11	43543824	43543824	A	G	intergenic	TTC17,MIR670	dist=27341;dist=37382	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	11	0	11	0
chr11	43543826	43543826	A	G	intergenic	TTC17,MIR670	dist=27343;dist=37380	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	0	8	0
chr11	43543870	43543870	G	A	intergenic	TTC17,MIR670	dist=27387;dist=37336	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	0	10	0
chr11	43543885	43543885	A	G	intergenic	TTC17,MIR670	dist=27402;dist=37321	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	0	10	0
chr11	43596897	43596897	T	G	intergenic	MIR670,MIR129-2	dist=15594;dist=6047	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	43702252	43702252	T	C	UTR5	HSD17B12	NM_016142:c.-126T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	43702257	43702257	C	A	UTR5	HSD17B12	NM_016142:c.-121C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	43702260	43702260	A	C	UTR5	HSD17B12	NM_016142:c.-118A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	43702263	43702263	T	G	UTR5	HSD17B12	NM_016142:c.-115T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	43702581	43702581	G	A	intronic	HSD17B12	NaN	NaN	NaN	rs4573669	NaN	0.746406	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.361803	normal_lod	REJECT	4	1	3	15
chr11	43702615	43702615	G	C	intronic	HSD17B12	NaN	NaN	NaN	rs4573668	NaN	0.994409	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.646768	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	1	11	48
chr11	43775733	43775733	G	A	intronic	HSD17B12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	2219.71	0	15.155949	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	230	219	11	0
chr11	43852491	43852491	T	C	intronic	HSD17B12	NaN	NaN	NaN	rs6485471	NaN	0.389577	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	307.731	0	NaN	NA	NA	102	43	59	23
chr11	43876851	43876851	A	A	UTR3	HSD17B12	NM_016142:c.*53A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	43913753	43913753	A	C	intronic	ALKBH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	43923000	43923000	T	C	intronic	ALKBH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.109557	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	343	317	26	0
chr11	44073146	44073146	T	A	intronic	ACCSL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	37	4	33	0
chr11	44077448	44077448	T	T	intronic	ACCSL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr11	44080210	44080210	T	C	exonic	ACCSL	NaN	nonsynonymous SNV	ACCSL:NM_001031854:exon13:c.T1585C:p.C529R	rs2074051	NaN	0.794329	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.141	P	-3.295	N	3.87	T	-0.973	T	0.000	T	0.129	-2.431	0.003	1.53	0.086	0.123	13.578	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	76.851459	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	68	35	33	56
chr11	44080327	44080327	A	A	intronic	ACCSL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	44096238	44096238	G	A	intronic	ACCS	NaN	NaN	NaN	rs178521	NaN	0.771166	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	62.2352	0	NaN	NA	NA	7	0	7	1
chr11	44101208	44101208	A	A	intronic	ACCS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr11	44104730	44104730	C	T	exonic	ACCS	NaN	stopgain	ACCS:NM_001127219:exon13:c.C1123T:p.Q375X,ACCS:NM_032592:exon13:c.C1123T:p.Q375X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.204	N	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	8.255	40	4.84	1.400	2.163	16.269	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.422106	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	120	116	4	0
chr11	44135670	44135670	T	T	intronic	EXT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	442185	442185	T	T	upstream	ANO9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	44265875	44265875	A	A	UTR3	EXT2	NM_001178083:c.*38A>A,NM_207122:c.*38A>A,NM_000401:c.*38A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr11	44286566	44286566	G	A	exonic	ALX4	NaN	synonymous SNV	ALX4:NM_021926:exon4:c.C1074T:p.H358H	rs3802805	ID=COSM1178421;OCCURENCE=1(prostate)	0.358427	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.132284	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	3	4	12
chr11	44288289	44288289	C	A	intronic	ALX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	44296828	44296828	C	T	intronic	ALX4	NaN	NaN	NaN	rs11037927	NaN	0.394369	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	114.82	0	36.214371	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	9	18	40
chr11	44315390	44315390	A	G	intronic	ALX4	NaN	NaN	NaN	rs1828656	NaN	0.368411	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	12	3	9	0
chr11	44445310	44445310	A	G	intergenic	ALX4,CD82	dist=113594;dist=141831	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	1	4	0
chr11	44490477	44490477	T	C	intergenic	ALX4,CD82	dist=158761;dist=96664	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	44640797	44640797	A	A	UTR3	CD82	NM_002231:c.*121A>A,NM_001024844:c.*121A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	44640798	44640798	C	C	UTR3	CD82	NM_002231:c.*122C>C,NM_001024844:c.*122C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	44640801	44640801	A	A	UTR3	CD82	NM_002231:c.*125A>A,NM_001024844:c.*125A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	44645970	44645970	G	T	intergenic	CD82,TSPAN18	dist=4655;dist=140006	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	44647306	44647306	G	A	intergenic	CD82,TSPAN18	dist=5991;dist=138670	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	4470559	4470559	T	T	UTR5	OR52K2	NM_001005172:c.-11T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	4470630	4470630	G	G	exonic	OR52K2	NaN	synonymous SNV	OR52K2:NM_001005172:exon1:c.G61G:p.G21G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	158	129	0	0
chr11	44746612	44746612	G	T	intergenic	CD82,TSPAN18	dist=105297;dist=39364	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr11	44824249	44824249	G	T	intronic	TSPAN18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	1	6	0
chr11	44824259	44824259	G	C	intronic	TSPAN18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	44883691	44883691	C	G	intronic	TSPAN18	NaN	NaN	NaN	rs11038180	NaN	0.0157748	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	44950784	44950784	G	A	UTR3	TSPAN18	NM_130783:c.*55G>A	NaN	NaN	rs835990	NaN	0.875	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	68.056906	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	54
chr11	44957223	44957223	G	A	intronic	TP53I11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.4476	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr11	44957345	44957345	C	G	intronic	TP53I11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.665379	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	20	16	4	0
chr11	44957346	44957346	C	T	intronic	TP53I11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.597516	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	20	16	4	0
chr11	44959083	44959083	C	G	intronic	TP53I11	NaN	NaN	NaN	rs12792390	NaN	0.11881	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	753.405	0	NaN	NA	NA	83	0	83	22
chr11	45176940	45176940	T	A	intronic	PRDM11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr11	45204766	45204766	A	A	intronic	PRDM11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	22	18	0	0
chr11	45245863	45245863	A	C	exonic	PRDM11	NaN	nonsynonymous SNV	PRDM11:NM_001256695:exon7:c.A838C:p.K280Q,PRDM11:NM_001256696:exon7:c.A838C:p.K280Q	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.879	P	0.344	B	0.000	D	0.796	N	0.55	N	0.78	T	-0.954	T	0.096	T	0.38	4.063	20.9	5.54	2.131	6.496	15.742	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.937488	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	667	621	46	0
chr11	45246104	45246104	A	G	exonic	PRDM11	NaN	nonsynonymous SNV	PRDM11:NM_001256695:exon7:c.A1079G:p.Q360R,PRDM11:NM_001256696:exon7:c.A1079G:p.Q360R	NaN	NaN	NaN	0.7	T	0.001	B	0.003	B	0.020	N	1.000	N	0	N	2.01	T	-0.973	T	0.021	T	0.08	0.861	8.485	4.37	0.923	0.446	5.189	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.742049	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	100	87	13	0
chr11	45246128	45246128	C	T	exonic	PRDM11	NaN	nonsynonymous SNV	PRDM11:NM_001256695:exon7:c.C1103T:p.P368L,PRDM11:NM_001256696:exon7:c.C1103T:p.P368L	NaN	NaN	NaN	0	D	0.879	P	0.494	P	0.006	N	0.969	D	0.695	N	1.68	T	-1.094	T	0.062	T	0.398	3.361	17.33	4.54	2.616	2.339	10.939	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.896079	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	87	69	18	0
chr11	45267897	45267897	T	T	intronic	SYT13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr11	45344554	45344554	G	A	intergenic	SYT13,LOC101928812	dist=36670;dist=32368	NaN	NaN	rs10838447	NaN	0.336861	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	45360613	45360613	T	G	intergenic	SYT13,LOC101928812	dist=52729;dist=16309	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr11	45627939	45627939	G	C	intergenic	LOC399886,CHST1	dist=217880;dist=41300	NaN	NaN	rs7934965	NaN	0.820088	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr11	45671944	45671944	TC	T,TCT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1414.99	0	NaN	NA	NA	166	0	58	4
chr11	45827641	45827641	T	C	exonic	SLC35C1	NaN	nonsynonymous SNV	SLC35C1:NM_018389:exon1:c.T289C:p.C97R,SLC35C1:NM_001145265:exon2:c.T250C:p.C84R,SLC35C1:NM_001145266:exon2:c.T250C:p.C84R	NaN	NaN	NaN	0.37	T	0.0	B	0.0	B	0.016	N	1.000	D	0.55	N	0.76	T	-1.062	T	0.075	T	0.32	1.741	11.78	4.97	1.876	2.190	9.246	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.353168	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	110	98	12	0
chr11	45919813	45919813	A	C	intronic	MAPK8IP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	14	7	7	0
chr11	45923440	45923440	T	T	intronic	MAPK8IP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr11	45924783	45924783	G	C	intronic	MAPK8IP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	31	18	13	0
chr11	4592882	4592882	A	C	intronic	C11orf40	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	15	8	7	0
chr11	45931979	45931979	G	C	intronic	PEX16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.283057	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	132	120	12	0
chr11	45931980	45931980	C	G	intronic	PEX16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.999888	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	124	113	11	0
chr11	4593335	4593335	C	A	intronic	C11orf40	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.955839	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	128	116	12	0
chr11	45935984	45935984	G	T	exonic	PEX16	NaN	nonsynonymous SNV	PEX16:NM_004813:exon7:c.C577A:p.Q193K,PEX16:NM_057174:exon7:c.C577A:p.Q193K	NaN	NaN	NaN	0.87	T	0.519	P	0.269	B	0.001	N	0.998	D	1.3	L	1.98	T	-1.121	T	0.050	T	0.307	2.875	15.58	5.8	2.747	3.588	20.044	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.714955	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	10	4	0
chr11	45936035	45936035	G	A	intronic	PEX16	NaN	NaN	NaN	rs3802758	NaN	0.684904	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	51.183464	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	0	17	56
chr11	45937878	45937878	A	G	intronic	PEX16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.675879	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	213	207	6	0
chr11	45944994	45944994	G	G	intronic	GYLTL1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	91	NaN	NA	NA	171	147	0	0
chr11	45945651	45945651	T	C	intronic	GYLTL1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	45947927	45947927	TGGGGGG	TGGGGG,TGGGGGC,TGGTGGGGG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	927.49	0	NaN	NA	NA	191	0	108	0
chr11	45950146	45950146	C	G	intronic	GYLTL1B	NaN	NaN	NaN	rs141206902	NaN	0.00359425	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	118.167357	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	97	45	52	4
chr11	45975059	45975059	T	A	intronic	PHF21A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.01328502415458941	NA	0	35	NaN	NA	NA	15	9	6	0
chr11	4598684	4598684	T	T	intronic	C11orf40	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	4616279	4616279	A	C	downstream	OR52I1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr11	4624641	4624641	A	A	intronic	TRIM68	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	14	10	0	0
chr11	46300727	46300727	A	G	intronic	CREB3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	46300730	46300730	C	A	intronic	CREB3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	46329340	46329340	T	C	intronic	CREB3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	46334218	46334218	A	C	exonic	CREB3L1	NaN	nonsynonymous SNV	CREB3L1:NM_052854:exon7:c.A959C:p.K320T	NaN	NaN	NaN	0.27	T	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	1.305	L	0.58	T	-0.741	T	0.244	T	0.784	3.677	18.68	4.69	1.974	7.033	14.319	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	46334219	46334219	G	T	exonic	CREB3L1	NaN	nonsynonymous SNV	CREB3L1:NM_052854:exon7:c.G960T:p.K320N	NaN	NaN	NaN	0.2	T	1.0	D	0.998	D	0.000	D	0.999	D	1.405	L	0.59	T	-0.795	T	0.221	T	0.356	1.557	11.16	3.78	1.208	1.408	7.829	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	46334220	46334220	A	G	exonic	CREB3L1	NaN	nonsynonymous SNV	CREB3L1:NM_052854:exon7:c.A961G:p.K321E	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.925	D	0.000	D	1.000	D	1.415	L	0.28	T	-0.474	T	0.285	T	0.765	4.316	22.6	4.69	1.974	7.033	14.319	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr11	46338882	46338882	G	A	intronic	CREB3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	46338883	46338883	A	C	intronic	CREB3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	46338888	46338888	A	G	intronic	CREB3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	46355193	46355193	A	A	intronic	DGKZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	46375579	46375579	G	T	intronic	DGKZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	46388881	46388881	C	C	exonic	DGKZ	NaN	synonymous SNV	DGKZ:NM_001199266:exon2:c.C202C:p.P68P,DGKZ:NM_001199267:exon2:c.C202C:p.P68P,DGKZ:NM_001199268:exon2:c.C202C:p.P68P,DGKZ:NM_003646:exon2:c.C202C:p.P68P,DGKZ:NM_201532:exon2:c.C253C:p.P85P,DGKZ:NM_201533:exon2:c.C217C:p.P73P,DGKZ:NM_001105540:exon3:c.C769C:p.P257P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	46391114	46391114	G	T	intronic	DGKZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2916666666666663	NA	0	0	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	46393462	46393462	A	T	intronic	DGKZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	46393464	46393464	G	T	intronic	DGKZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	46393571	46393571	T	T	intronic	DGKZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr11	46394084	46394084	G	T	intronic	DGKZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	63	NaN	NA	NA	76	62	14	0
chr11	46396782	46396782	A	A	intronic	DGKZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr11	46399788	46399788	T	T	intronic	DGKZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	101	101	0	0
chr11	46400143	46400143	A	T	intronic	DGKZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	46403504	46403504	T	T	UTR5	MDK	NM_001270551:c.-104T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	46419512	46419512	A	G	intronic	AMBRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	46430031	46430031	T	T	intronic	AMBRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr11	46430263	46430263	A	G	intronic	AMBRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	46515764	46515764	A	T	intronic	AMBRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.236888	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	363	346	17	0
chr11	46637740	46637740	G	A	exonic	HARBI1	NaN	synonymous SNV	HARBI1:NM_173811:exon2:c.C48T:p.G16G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.955529	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	216	206	10	0
chr11	46666801	46666801	T	T	intronic	ATG13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	46678588	46678588	T	T	intronic	ATG13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr11	46680867	46680867	T	T	intronic	ATG13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	46689236	46689236	C	G	intronic	ATG13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	46701333	46701333	T	G	intronic	ARHGAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.359815	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	190	179	11	0
chr11	46702232	46702232	C	G	exonic	ARHGAP1	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGAP1:NM_004308:exon8:c.G701C:p.R234P	NaN	NaN	NaN	0.35	T	0.147	B	0.031	B	0.000	D	1.000	D	1.645	L	2.08	T	-1.106	T	0.053	T	0.514	3.477	17.79	4.91	2.568	6.353	18.295	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr11	46703909	46703909	G	T	intronic	ARHGAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	65	31	34	0
chr11	46722731	46722731	T	C	intronic	ZNF408	NaN	NaN	NaN	rs4752928	NaN	0.999201	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	223.331971	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	78	0	78	58
chr11	46750182	46750182	G	G	intronic	F2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	46760591	46760591	T	C	intronic	F2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.88203	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	25	21	4	0
chr11	46760756	46760756	G	A	intronic	F2	NaN	NaN	NaN	rs3136516	NaN	0.282947	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	161.747661	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	0	53	44
chr11	46766181	46766181	A	T	intronic	CKAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	46766182	46766182	A	C	intronic	CKAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	46776653	46776653	T	A	intronic	CKAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	46782348	46782348	A	A	intronic	CKAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr11	46812118	46812118	T	G	exonic	CKAP5	NaN	nonsynonymous SNV	CKAP5:NM_001008938:exon14:c.A1666C:p.K556Q,CKAP5:NM_014756:exon14:c.A1666C:p.K556Q	NaN	NaN	NaN	0.28	T	0.948	P	0.614	P	0.000	D	1.000	D	2.545	M	0.73	T	-0.723	T	0.218	T	0.486	3.068	16.24	5.93	2.276	7.145	14.953	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	61.9536	0	NaN	NA	NA	13	4	9	1
chr11	46812166	46812166	A	A	intronic	CKAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	46822674	46822674	T	T	intronic	CKAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	15	12	0	0
chr11	46840118	46840118	C	G	intronic	CKAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	2.7566127181844533E-9	NA	0	0	80.015016	nearby_gap_events	REJECT	192	136	56	0
chr11	46840119	46840119	T	C	intronic	CKAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	90.560747	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	192	137	55	0
chr11	46840120	46840120	G	T	intronic	CKAP5	NaN	NaN	NaN	rs373565261	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	66	120.692901	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	97	42	55	0
chr11	46840129	46840129	G	G	intronic	CKAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	183	178	0	0
chr11	46884108	46884108	T	T	ncRNA_intronic	LRP4-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr11	46886584	46886584	T	T	ncRNA_intronic	LRP4-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	46893108	46893108	T	C	exonic	LRP4	NaN	nonsynonymous SNV	LRP4:NM_002334:exon31:c.A4660G:p.S1554G	rs2306029	NaN	0.367612	0.04	D	0.233	B	0.3	B	0.000	D	0.000	P	2.015	M	-3.81	D	-1.117	T	0.000	T	0.353	3.634	18.48	5.81	2.210	7.437	12.391	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	54.070074	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	41
chr11	46893277	46893277	A	A	ncRNA_intronic	LRP4-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	46897253	46897253	G	C	intronic	LRP4	NaN	NaN	NaN	rs2306032	NaN	0.445088	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	303.345	0	NaN	NA	NA	32	3	29	35
chr11	46898678	46898678	T	T	intronic	LRP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	46911139	46911139	A	C	intronic	LRP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr11	46916460	46916460	A	A	intronic	LRP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	47178920	47178920	A	A	intronic	C11orf49	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	47188314	47188314	T	C	exonic	ARFGAP2	NaN	synonymous SNV	ARFGAP2:NM_001242832:exon12:c.A1245G:p.A415A,ARFGAP2:NM_032389:exon13:c.A1329G:p.A443A	rs4752820	NaN	0.998802	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.017	T	0.000	T	.	1.891	12.28	-9.14	-2.249	-1.137	0.259	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	202.555404	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	64	0	64	52
chr11	47193920	47193920	A	G	intronic	ARFGAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.15228	0	NaN	NA	NA	18	15	2	0
chr11	47199453	47199453	T	T	UTR3	PACSIN3	NM_001184975:c.*29A>A,NM_016223:c.*29A>A,NM_001184974:c.*29A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	47238615	47238615	A	A	intronic	DDB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	47264995	47264995	A	A	intronic	ACP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	47280689	47280689	G	T	intronic	NR1H3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	47280697	47280697	T	C	intronic	NR1H3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	47282762	47282762	T	T	intronic	NR1H3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	7	3	0	0
chr11	47315596	47315596	A	A	intronic	MADD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr11	47336930	47336930	A	G	intronic	MADD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	14	5	8	0
chr11	47350762	47350762	A	A	UTR3	MADD	NM_130470:c.*61A>A,NM_130471:c.*61A>A,NM_003682:c.*61A>A,NM_130472:c.*61A>A,NM_001135944:c.*61A>A,NM_130473:c.*61A>A,NM_130474:c.*189A>A,NM_001135943:c.*61A>A,NM_130476:c.*61A>A,NM_130475:c.*189A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	47353910	47353910	A	A	intronic	MYBPC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	47354053	47354053	T	T	intronic	MYBPC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	47364773	47364773	T	T	intronic	MYBPC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	194	169	0	0
chr11	47380592	47380592	G	GA	intronic	SPI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	134.112	0	NaN	NA	NA	17	0	2	0
chr11	47380593	47380593	G	A	intronic	SPI1	NaN	NaN	NaN	rs3740689	NaN	0.427516	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	39.411369	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	33
chr11	473808	473808	T	T	intronic	PTDSS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	47413475	47413475	G	A	intergenic	SPI1,MIR4487	dist=13348;dist=9046	NaN	NaN	rs12803525	NaN	0.276757	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	47431622	47431622	C	A	UTR5	SLC39A13	NM_152264:c.-24C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	47432007	47432007	T	C	intronic	SLC39A13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	2	0
chr11	47432008	47432008	T	T	intronic	SLC39A13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	47432009	47432009	C	G	intronic	SLC39A13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr11	47432010	47432010	T	T	intronic	SLC39A13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	47436531	47436531	G	T	intronic	SLC39A13	NaN	NaN	NaN	rs11039228	NaN	0.99381	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.761456	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	51
chr11	47437098	47437098	A	T	UTR3	SLC39A13	NM_152264:c.*184A>T,NM_001128225:c.*184A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	13	5	4	0
chr11	47442002	47442002	A	T	intronic	PSMC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	8	1	6	0
chr11	47442003	47442003	C	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	8	1	4,3	0
chr11	47442004	47442004	A	T	intronic	PSMC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr11	47442005	47442005	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	2	3,3	0
chr11	47442006	47442006	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	8	1	3,3	0
chr11	47442007	47442007	T	C	intronic	PSMC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr11	47446300	47446300	A	C	intronic	PSMC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	14	7	7	0
chr11	47463305	47463305	A	G	intronic	RAPSN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	26	10.975776	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	10	5	5	1
chr11	47506187	47506187	A	C	intronic	CELF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	47508485	47508485	A	A	intronic	CELF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	47595377	47595377	A	A	intronic	KBTBD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr11	47600971	47600971	A	A	intronic	NDUFS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	47688557	47688557	T	TA	exonic	AGBL2	NaN	frameshift substitution	AGBL2:NM_024783:exon17:c.2399_2399delinsTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.88388	0	NaN	NA	NA	81	66	14	2
chr11	47701528	47701528	C	A	exonic	AGBL2	NaN	nonsynonymous SNV	AGBL2:NM_024783:exon13:c.G2013T:p.M671I	rs12286721	NaN	0.580671	0.14	T	0.0	B	0.0	B	0.004	N	0.999	P	0	N	3.01	T	-1.026	T	0.000	T	0.067	1.418	10.68	0.549	0.212	0.469	6.045	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	132.072413	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	0	47	48
chr11	47741451	47741451	C	T	intronic	FNBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	47741453	47741453	A	T	intronic	FNBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr11	47741454	47741454	T	C	intronic	FNBP4	NaN	NaN	NaN	rs200042627	NaN	0.00179712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr11	47772864	47772864	A	A	intronic	FNBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	23	18	0	0
chr11	47786920	47786920	T	T	intronic	FNBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	64	52	0	0
chr11	47788768	47788768	T	A	exonic	FNBP4	NaN	nonsynonymous SNV	FNBP4:NM_015308:exon1:c.A73T:p.S25C	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.758	P	0.319	B	0.001	D	0.887	D	1.7	L	1.28	T	-0.934	T	0.083	T	0.302	3.028	16.10	3.85	2.218	0.812	8.510	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr11	47788769	47788769	G	C	exonic	FNBP4	NaN	synonymous SNV	FNBP4:NM_015308:exon1:c.C72G:p.G24G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr11	47788770	47788770	C	A	exonic	FNBP4	NaN	nonsynonymous SNV	FNBP4:NM_015308:exon1:c.G71T:p.G24V	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.151	B	0.084	B	0.000	D	0.996	D	0.69	N	1.4	T	-1.090	T	0.068	T	0.113	2.803	15.33	4.96	2.746	3.548	15.415	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr11	47788949	47788949	G	A	UTR5	FNBP4	NM_015308:c.-109C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.371277	clustered_read_position	REJECT	23	20	3	0
chr11	47788950	47788950	T	G	UTR5	FNBP4	NM_015308:c.-110A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.370799	clustered_read_position	REJECT	23	20	3	0
chr11	47806634	47806634	G	T	intronic	NUP160	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.723581	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	154	143	11	0
chr11	47806635	47806635	A	G	intronic	NUP160	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.34942	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	144	134	10	0
chr11	47809923	47809923	T	G	intronic	NUP160	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.214024	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	438	420	18	0
chr11	47839799	47839799	A	A	intronic	NUP160	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	17	15	0	0
chr11	47869493	47869493	G	A	exonic	NUP160	NaN	nonsynonymous SNV	NUP160:NM_015231:exon2:c.C221T:p.A74V	NaN	NaN	NaN	0.7	T	0.708	P	0.251	B	0.517	N	0.991	N	0	N	0.99	T	-1.089	T	0.044	T	0.167	2.008	12.67	3.24	1.320	2.590	5.370	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.418479	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	76	66	10	0
chr11	47869494	47869494	C	G	exonic	NUP160	NaN	nonsynonymous SNV	NUP160:NM_015231:exon2:c.G220C:p.A74P	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.015	B	0.007	B	0.517	N	1.000	N	-0.69	N	1.07	T	-1.030	T	0.031	T	0.139	1.151	9.686	-1.62	-0.270	-0.682	1.451	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.795913	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	72	62	10	0
chr11	4790308	4790308	A	G	exonic	OR51F1	NaN	synonymous SNV	OR51F1:NM_001004752:exon1:c.T840C:p.N280N	rs1030725	NaN	0.215655	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	156.864301	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	91	30	61	23
chr11	479235	479235	A	T	intronic	PTDSS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	48145440	48145440	C	G	intronic	PTPRJ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	48149654	48149654	A	A	intronic	PTPRJ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr11	48157467	48157467	GCC	CGT,GCT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3281.4	0	NaN	NA	NA	371	0	79	3
chr11	48175289	48175289	T	T	intronic	PTPRJ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr11	48184983	48184983	G	T	intronic	PTPRJ	NaN	NaN	NaN	rs2270990	NaN	0.719649	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	426.220051	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	143	0	143	55
chr11	48185873	48185873	C	G	intronic	PTPRJ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.425684	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	82	77	5	0
chr11	48238943	48238943	G	A	exonic	OR4B1	NaN	synonymous SNV	OR4B1:NM_001005470:exon1:c.G582A:p.G194G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.023621	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	389	377	12	0
chr11	48285857	48285857	G	T	exonic	OR4X1	NaN	nonsynonymous SNV	OR4X1:NM_001004726:exon1:c.G445T:p.G149W	NaN	NaN	NaN	0	D	0.814	P	0.729	P	.	.	0.992	N	2.475	M	1.18	T	-0.897	T	0.183	T	0.381	2.596	14.64	4.27	2.399	-0.230	9.900	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	38.4739	0	NaN	NA	NA	219	183	36	17
chr11	48285981	48285981	CCTT	C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2293.5	0	NaN	NA	NA	266	12	228	40
chr11	48346423	48346423	A	G	upstream	OR4C3	NaN	NaN	NaN	rs75646016	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	158.784	0	NaN	NA	NA	76	36	40	45
chr11	48346427	48346427	T	C	upstream	OR4C3	NaN	NaN	NaN	rs74892148	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	170.112	0	NaN	NA	NA	72	33	39	45
chr11	48355288	48355288	T	C	intergenic	OR4C3,OR4C45	dist=7806;dist=11612	NaN	NaN	rs77747871	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	48367097	48367097	A	G	exonic	OR4C45	NaN	unknown	UNKNOWN	rs73453179	ID=COSN229008;OCCURENCE=1(skin)	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	472.571	36	NaN	NA	NA	630	416	214	32
chr11	48632421	48632421	C	T	intergenic	OR4A47,TRIM49B	dist=121147;dist=420731	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr11	488332	488332	C	G	intronic	PTDSS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.007610037021801783	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	2	7	0
chr11	488337	488337	G	C	intronic	PTDSS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.052941176470588346	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr11	488388	488388	C	A,CA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	210.613	0	NaN	NA	NA	47	12	2	0
chr11	488389	488389	C	A	intronic	PTDSS2	NaN	NaN	NaN	rs11822000	NaN	0.21865	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	177.479	0	NaN	NA	NA	34	7	27	16
chr11	488701	488701	C	T	intronic	PTDSS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.016745298908836713	NA	0	33	NaN	NA	NA	31	18	13	0
chr11	489349	489349	G	C	intronic	PTDSS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.717653	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	54	45	9	0
chr11	489350	489350	C	G	intronic	PTDSS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.590965	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	54	44	10	0
chr11	489386	489386	T	C	intronic	PTDSS2	NaN	NaN	NaN	rs67492572	NaN	0.222045	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	120.974483	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	75	28	47	15
chr11	48987539	48987539	C	A	intergenic	OR4A47,TRIM49B	dist=476265;dist=65613	NaN	NaN	rs1809986	NaN	0.462859	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	48997107	48997107	G	A	intergenic	OR4A47,TRIM49B	dist=485833;dist=56045	NaN	NaN	rs2047941	NaN	0.272564	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	156	98	58	23
chr11	49000579	49000579	G	T	intergenic	OR4A47,TRIM49B	dist=489305;dist=52573	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.626225	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	240	225	15	0
chr11	49146036	49146036	G	A	intergenic	TRIM64C,FOLH1	dist=65372;dist=22151	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	70	9	61	0
chr11	49197416	49197416	A	G	exonic	FOLH1	NaN	synonymous SNV	FOLH1:NM_001193473:exon6:c.T90C:p.S30S,FOLH1:NM_001014986:exon8:c.T1014C:p.S338S,FOLH1:NM_004476:exon8:c.T1014C:p.S338S,FOLH1:NM_001193471:exon9:c.T969C:p.S323S,FOLH1:NM_001193472:exon9:c.T969C:p.S323S	rs144950409	NaN	0.140775	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.979	0	NaN	NA	NA	38	24	14	8
chr11	4935923	4935923	G	A	downstream	OR51G2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	4935928	4935928	T	A	downstream	OR51G2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	8	1	5	0
chr11	4944703	4944703	C	T	exonic	OR51G1	NaN	nonsynonymous SNV	OR51G1:NM_001005237:exon1:c.G867A:p.M289I	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.001	B	0.004	B	0.021	U	1.000	N	0.895	L	1.38	T	-1.056	T	0.056	T	0.184	2.051	12.81	2.6	0.506	-1.956	6.151	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.281147	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	60	51	9	0
chr11	495057	495057	G	T	intronic	RNH1	NaN	NaN	NaN	rs67912009	NaN	0.0870607	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.630656	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	14	5	12
chr11	495103	495103	A	G	intronic	RNH1	NaN	NaN	NaN	rs11246165	NaN	0.417732	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	60.211508	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	0	20	26
chr11	4975900	4975900	T	C	downstream	OR51A2	NaN	NaN	NaN	rs4482027	NaN	0.79992	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	243.942	0	NaN	NA	NA	73	0	73	17
chr11	4976086	4976086	C	T	exonic	OR51A2	NaN	synonymous SNV	OR51A2:NM_001004748:exon1:c.G858A:p.P286P	rs2570572	NaN	0.786542	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	103.068	0	NaN	NA	NA	96	0	96	30
chr11	498695	498695	G	C	intronic	RNH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.548262	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	213	200	13	0
chr11	499059	499059	C	T	exonic	RNH1	NaN	synonymous SNV	RNH1:NM_203384:exon5:c.G570A:p.L190L,RNH1:NM_203385:exon5:c.G570A:p.L190L,RNH1:NM_203388:exon5:c.G570A:p.L190L,RNH1:NM_203389:exon5:c.G570A:p.L190L,RNH1:NM_002939:exon6:c.G570A:p.L190L,RNH1:NM_203383:exon6:c.G570A:p.L190L,RNH1:NM_203386:exon6:c.G570A:p.L190L,RNH1:NM_203387:exon6:c.G570A:p.L190L	rs17584	NaN	0.222045	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	156.714	0	81.164164	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	71	37	34	14
chr11	499066	499066	C	T	exonic	RNH1	NaN	nonsynonymous SNV	RNH1:NM_203384:exon5:c.G563A:p.R188H,RNH1:NM_203385:exon5:c.G563A:p.R188H,RNH1:NM_203388:exon5:c.G563A:p.R188H,RNH1:NM_203389:exon5:c.G563A:p.R188H,RNH1:NM_002939:exon6:c.G563A:p.R188H,RNH1:NM_203383:exon6:c.G563A:p.R188H,RNH1:NM_203386:exon6:c.G563A:p.R188H,RNH1:NM_203387:exon6:c.G563A:p.R188H	rs17849355	ID=COSM1354240;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.0185703	0.08	T	0.012	B	0.001	B	0.492	N	1.000	N	2.275	M	1.11	T	-0.970	T	0.038	T	0.314	1.796	11.96	-2.9	-0.291	-1.729	6.246	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	153.587	0	76.372921	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	69	36	33	7
chr11	49942197	49942197	C	T	intergenic	LOC440040,OR4C13	dist=110228;dist=31746	NaN	NaN	rs28526824	NaN	0.127396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr11	499768	499768	G	A	intronic	RNH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	45	22	23	0
chr11	5013277	5013277	T	T	exonic	MMP26	NaN	synonymous SNV	MMP26:NM_021801:exon5:c.T679T:p.Y227Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	102	92	0	0
chr11	5013421	5013421	G	G	intronic	MMP26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	307	257	0	0
chr11	5068705	5068705	T	G	downstream	OR52J3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	5068706	5068706	T	A	downstream	OR52J3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	5068707	5068707	A	G	downstream	OR52J3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	51516000	51516000	C	T	exonic	OR4C46	NaN	nonsynonymous SNV	OR4C46:NM_001004703:exon1:c.C719T:p.S240F	rs11246607	NaN	0.433307	0.01	D	0.884	P	0.68	P	0.000	D	0.917	P	3.045	M	1.1	T	-0.903	T	0.000	T	0.264	1.461	10.83	2.33	1.345	5.273	10.462	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	522	289	233	37
chr11	51516036	51516036	G	A	exonic	OR4C46	NaN	nonsynonymous SNV	OR4C46:NM_001004703:exon1:c.G755A:p.C252Y	rs11246608	NaN	0.4375	0	D	1.0	D	0.991	D	0.000	D	1.000	P	2.63	M	8.77	T	-1.113	T	0.000	T	0.191	-0.037	3.827	2.47	1.433	0.197	5.354	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	428	219	209	37
chr11	5222022	5222022	A	T	upstream	OR51V1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.755341	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	128	107	21	1
chr11	5222123	5222123	A	A	upstream	OR51V1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	9	0	0
chr11	5246779	5246779	T	T	UTR3	HBB	NM_000518:c.*49A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	5254379	5254379	G	C	intronic	HBD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr11	5290946	5290946	C	A	intronic	HBE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.941631	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	190	178	12	0
chr11	5290947	5290947	A	C	intronic	HBE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.092398	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	153	141	12	0
chr11	5322195	5322195	T	T	downstream	OR51B4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	532848	532848	C	T	intronic	HRAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.285827	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	166	161	5	0
chr11	5372590	5372590	A	G	intronic	OR51B5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	5373738	5373738	A	G	intronic	OR51B5	NaN	NaN	NaN	rs5024038	NaN	0.233626	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	123.856	0	NaN	NA	NA	130	87	43	13
chr11	540759	540759	G	C	exonic	LRRC56	NaN	nonsynonymous SNV	LRRC56:NM_198075:exon4:c.G75C:p.W25C	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.983	D	0.635	P	0.006	N	1.000	D	1.935	M	2.85	T	-1.155	T	0.045	T	0.525	3.240	16.86	3.9	2.287	1.319	12.318	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	4.4816812442706586E-4	NA	0	0	NaN	NA	NA	96	76	20	0
chr11	5410761	5410761	T	C	exonic	OR51M1	NaN	nonsynonymous SNV	OR51M1:NM_001004756:exon1:c.T133C:p.F45L	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.001	B	0.801	N	1.000	N	-0.57	N	7.46	T	-1.004	T	0.000	T	0.151	-2.245	0.004	2.35	0.811	-1.015	4.240	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.28565	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	486	462	24	0
chr11	5443893	5443893	G	A	exonic	OR51Q1	NaN	nonsynonymous SNV	OR51Q1:NM_001004757:exon1:c.G463A:p.V155I	rs10838094	NaN	0.453674	0.4	T	0.039	B	0.039	B	0.205	N	1.000	P	0.295	N	1.24	T	-0.989	T	0.000	T	0.007	-0.547	1.521	1.97	0.734	-1.229	6.206	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2023.53	0	NaN	NA	NA	185	0	185	32
chr11	5443963	5443963	G	A	exonic	OR51Q1	NaN	nonsynonymous SNV	OR51Q1:NM_001004757:exon1:c.G533A:p.R178H	rs10838095	NaN	0.453474	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.000	P	-3.43	N	8.88	T	-0.989	T	0.000	T	0.161	-1.632	0.013	5.0	0.960	3.515	9.981	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	396.677181	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	141	0	141	32
chr11	544827	544827	C	T	intronic	LRRC56	NaN	NaN	NaN	rs76537666	NaN	0.106629	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.791299	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	5	7	12
chr11	5461650	5461650	T	C	intronic	OR51B5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.507598	nearby_gap_events	REJECT	83	78	5	0
chr11	549959	549959	C	T	exonic	LRRC56	NaN	synonymous SNV	LRRC56:NM_198075:exon7:c.C384T:p.L128L	rs7942030	NaN	0.78115	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	242.052	0	NaN	NA	NA	88	40	48	47
chr11	550028	550028	C	G	intronic	LRRC56	NaN	NaN	NaN	rs11246180	NaN	0.852037	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	33	29	5	41
chr11	55036841	55036841	C	T	intronic	TRIM48	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.83091	0	NaN	NA	NA	62	54	8	2
chr11	551405	551405	G	A	intronic	LRRC56	NaN	NaN	NaN	rs7396875	NaN	0.847244	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.164808	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	6	8	52
chr11	551670	551670	C	C	exonic	LRRC56	NaN	synonymous SNV	LRRC56:NM_198075:exon10:c.C816C:p.P272P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	36	29	0	0
chr11	551671	551671	A	C	exonic	LRRC56	NaN	nonsynonymous SNV	LRRC56:NM_198075:exon10:c.A817C:p.I273L	NaN	NaN	NaN	0.68	T	0.0	B	0.001	B	0.916	N	1.000	N	0.895	L	3.06	T	-0.912	T	0.011	T	0.063	0.647	7.471	-5.21	-0.986	-0.196	1.256	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	25	22	3	0
chr11	552547	552547	T	C	intronic	LRRC56	NaN	NaN	NaN	rs3740652	NaN	0.893171	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	129.728804	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	51	0	51	58
chr11	552711	552711	C	A	intronic	LRRC56	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.20588235294117738	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr11	552756	552756	T	T	intronic	LRRC56	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	552787	552787	TG	CC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	10.5005	18	NaN	NA	NA	7	5	2	22
chr11	55322298	55322298	C	T	exonic	OR4C15	NaN	synonymous SNV	OR4C15:NM_001001920:exon1:c.C516T:p.A172A	rs8181485	NaN	0.18131	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	72.223024	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	54	23	31	12
chr11	55322638	55322638	C	T	exonic	OR4C15	NaN	nonsynonymous SNV	OR4C15:NM_001001920:exon1:c.C856T:p.R286C	rs12225462	NaN	0.18151	0.01	D	0.999	D	0.954	D	.	.	1.000	P	3.35	M	8.05	T	-0.943	T	0.000	T	0.243	1.259	10.11	3.01	1.298	0.179	11.026	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	84.945388	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	103	61	42	12
chr11	55340232	55340232	T	C	exonic	OR4C16	NaN	nonsynonymous SNV	OR4C16:NM_001004701:exon1:c.T629C:p.V210A	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.454	P	0.515	P	0.001	D	1.000	N	1.005	L	1.15	T	-1.028	T	0.082	T	0.154	1.617	11.36	1.27	0.380	0.380	4.580	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.3185	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	225	220	5	0
chr11	5536147	5536147	T	T	UTR3	UBQLNL	NM_145053:c.*97A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	5537693	5537693	T	G	UTR5	UBQLNL	NM_145053:c.-22A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.256783	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	143	134	9	0
chr11	55418548	55418548	A	A	exonic	OR4S2	NaN	synonymous SNV	OR4S2:NM_001004059:exon1:c.A169A:p.M57M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	15	13	0	0
chr11	55418693	55418693	T	C	exonic	OR4S2	NaN	nonsynonymous SNV	OR4S2:NM_001004059:exon1:c.T314C:p.F105S	rs11230541	NaN	0.33726	0.01	D	0.96	D	0.685	P	0.000	D	0.028	P	2.25	M	4.95	T	-0.822	T	0.000	T	0.607	4.163	21.5	5.36	2.031	0.727	14.178	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	67.939029	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	1	23	11
chr11	554299	554299	C	G	UTR3	LRRC56	NM_198075:c.*23C>G	NaN	NaN	rs10902172	NaN	0.881989	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	93.860084	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	84	46	38	54
chr11	55563045	55563045	TA	GA,T,TT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	161.577	0	NaN	NA	NA	23	1	10	0
chr11	55563046	55563046	A	A	exonic	OR5D14	NaN	synonymous SNV	OR5D14:NM_001004735:exon1:c.A15A:p.L5L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	17	13	0	0
chr11	55563048	55563048	G	G	exonic	OR5D14	NaN	synonymous SNV	OR5D14:NM_001004735:exon1:c.G17G:p.R6R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	23	20	0	0
chr11	55563049	55563049	G	T	exonic	OR5D14	NaN	nonsynonymous SNV	OR5D14:NM_001004735:exon1:c.G18T:p.R6S	NaN	NaN	NaN	0.22	T	0.146	B	0.104	B	0.524	N	1.000	N	0.73	N	3.95	T	-0.923	T	0.008	T	0.065	0.408	6.217	-1.18	-0.014	0.252	5.560	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	23	13	10	0
chr11	55563050	55563050	A	A	exonic	OR5D14	NaN	synonymous SNV	OR5D14:NM_001004735:exon1:c.A19A:p.N7N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	23	21	0	0
chr11	55563051	55563051	A	C	exonic	OR5D14	NaN	nonsynonymous SNV	OR5D14:NM_001004735:exon1:c.A20C:p.N7T	NaN	NaN	NaN	0	D	0.998	D	0.931	D	0.000	D	1.000	N	3.1	M	-0.09	T	-0.351	T	0.464	T	0.176	2.636	14.77	4.54	1.912	3.461	12.888	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	23	12	10	0
chr11	55587953	55587953	T	C	exonic	OR5D18	NaN	nonsynonymous SNV	OR5D18:NM_001001952:exon1:c.T848C:p.I283T	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.59	P	0.25	B	0.001	N	0.966	N	0.595	N	1.27	T	-1.050	T	0.052	T	0.32	0.623	7.353	4.01	0.901	-0.022	4.633	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	18.2209	0	NaN	NA	NA	86	71	14	1
chr11	55607232	55607232	A	A	downstream	OR5D16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	55653609	55653609	TAAAAAAAA	CTAAAAAAC,TAAAAAAAC,TAAAAAAA,TAAAAAA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	369.025	0	NaN	NA	NA	57	2	6	0
chr11	55656437	55656437	ATT	AT,CTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	732.465	0	NaN	NA	NA	330	0	123	1
chr11	556857	556857	G	C	exonic	LMNTD2	NaN	synonymous SNV	LMNTD2:NM_173573:exon8:c.C954G:p.G318G	rs7938269	NaN	0.878195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	56.525066	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	16	25	56
chr11	557042	557042	G	A	exonic	LMNTD2	NaN	nonsynonymous SNV	LMNTD2:NM_173573:exon8:c.C769T:p.H257Y	NaN	NaN	NaN	0.33	T	0.952	P	0.396	B	0.058	N	1.000	N	0.805	L	1.51	T	-1.043	T	0.054	T	0.059	1.622	11.38	0.136	0.053	-0.133	5.162	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.058773	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	93	88	5	0
chr11	557708	557708	A	G	intronic	LMNTD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	27	8	19	0
chr11	55861705	55861705	C	T	exonic	OR8I2	NaN	nonsynonymous SNV	OR8I2:NM_001003750:exon1:c.C922T:p.L308F	NaN	NaN	NaN	0.5	T	0.047	B	0.015	B	0.746	N	1.000	N	0.55	N	1.18	T	-1.021	T	0.045	T	0.144	0.822	8.311	-0.009	-0.090	-0.075	1.997	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.367129	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	190	180	10	0
chr11	55889987	55889987	C	A	exonic	OR8H3	NaN	nonsynonymous SNV	OR8H3:NM_001005201:exon1:c.C139A:p.L47I	rs7107077	NaN	0.063099	1	T	0.0	B	0.0	B	0.003	N	1.000	P	-1.535	N	7.66	T	-1.063	T	0.000	T	0.047	-2.824	0	3.44	0.334	0.065	5.511	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	482	262	220	8
chr11	559016	559016	C	T	intronic	LMNTD2	NaN	NaN	NaN	rs3943356	NaN	0.758187	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	0.66	T	-1.054	T	0.000	T	0.157	2.653	14.83	2.75	0.872	0.653	8.454	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	55904830	55904830	C	T	exonic	OR8J3	NaN	nonsynonymous SNV	OR8J3:NM_001004064:exon1:c.G365A:p.R122H	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.063	B	0.052	B	0.000	D	0.930	N	2.95	M	-1.1	T	-0.427	T	0.412	T	0.499	2.754	15.17	1.24	0.475	2.973	6.622	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.061854	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	125	119	6	0
chr11	55927820	55927820	A	C	upstream	OR8K5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	55927821	55927821	A	T	upstream	OR8K5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	55927822	55927822	A	G	upstream	OR8K5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr11	56043076	56043076	A	T	upstream	OR5T1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr11	56043084	56043084	T	T	upstream	OR5T1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	56043085	56043085	T	T	upstream	OR5T1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	56043474	56043474	A	G	exonic	OR5T1	NaN	synonymous SNV	OR5T1:NM_001004745:exon1:c.A360G:p.G120G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	29	19	10	1
chr11	56113516	56113516	T	C	exonic	OR8K1	NaN	nonsynonymous SNV	OR8K1:NM_001002907:exon1:c.T2C:p.M1T	rs1905055	NaN	0.779952	0	D	0.009	B	0.006	B	.	.	0.000	P	.	.	8.29	T	-0.931	T	0.000	T	0.102	0.708	7.772	2.01	0.285	-0.018	5.128	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	175.895705	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	0	57	47
chr11	56127846	56127846	A	G	exonic	OR8J1	NaN	nonsynonymous SNV	OR8J1:NM_001005205:exon1:c.A124G:p.N42D	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	0.642	N	3.79	H	-0.96	T	0.566	D	0.683	D	0.487	4.206	21.8	4.57	1.828	8.562	13.046	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.11000000000000153	NA	0	0	NaN	NA	NA	13	10	3	0
chr11	56229910	56229910	T	G	downstream	OR5M9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	3	2	0
chr11	5624717	5624717	T	C	exonic	TRIM6,TRIM6-TRIM34	NaN	nonsynonymous SNV	TRIM6:NM_001003818:exon2:c.T259C:p.C87R,TRIM6-TRIM34:NM_001003819:exon2:c.T259C:p.C87R,TRIM6:NM_058166:exon2:c.T175C:p.C59R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	.	.	1.000	D	3.935	H	0.55	T	0.155	D	0.460	T	0.949	2.207	13.34	4.39	2.198	7.081	12.232	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.46746	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	302	296	6	0
chr11	5626430	5626430	T	T	intronic	TRIM6,TRIM6-TRIM34	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	56380134	56380134	C	G	exonic	OR5M1	NaN	nonsynonymous SNV	OR5M1:NM_001004740:exon1:c.G845C:p.S282T	rs4939078	NaN	0.418331	0.01	D	0.996	D	0.955	D	.	.	0.985	P	-1.85	N	1.15	T	-1.045	T	0.000	T	0.128	1.884	12.26	2.77	0.775	0.674	6.886	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.012693609417280517	NA	0	0	NaN	NA	NA	39	20	19	23
chr11	56467926	56467926	A	G	exonic	OR9G1,OR9G9	NaN	synonymous SNV	OR9G1:NM_001005213:exon1:c.A63G:p.G21G,OR9G9:NM_001013358:exon1:c.A63G:p.G21G	rs1704284	NaN	0.00179712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	748	489	259	58
chr11	56468448	56468448	A	G	exonic	OR9G1,OR9G9	NaN	synonymous SNV	OR9G1:NM_001005213:exon1:c.A585G:p.K195K,OR9G9:NM_001013358:exon1:c.A585G:p.K195K	rs80194264	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2211.9	0	NaN	NA	NA	1039	524	515	0
chr11	56468699	56468699	T	A	exonic	OR9G1,OR9G9	NaN	nonsynonymous SNV	OR9G1:NM_001005213:exon1:c.T836A:p.V279E,OR9G9:NM_001013358:exon1:c.T836A:p.V279E	rs79251113	NaN	NaN	0	D	0.996	D	0.988	D	0.000	D	0.208	P	4.015	H	8.13	T	-1.032	T	0.004	T	0.897	1.922	12.39	4.62	2.044	5.198	14.125	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	775	637	137	53
chr11	56468704	56468704	T	C	exonic	OR9G1,OR9G9	NaN	nonsynonymous SNV	OR9G1:NM_001005213:exon1:c.T841C:p.F281L,OR9G9:NM_001013358:exon1:c.T841C:p.F281L	rs79288825	NaN	NaN	0	D	0.022	B	0.06	B	0.000	D	1.000	P	0.09	N	1.24	T	-1.025	T	0.050	T	0.158	1.895	12.29	3.4	2.044	-0.360	9.31	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	764	633	133	53
chr11	5662565	5662565	A	A	intronic	TRIM34,TRIM6-TRIM34	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	56756358	56756358	T	C	upstream	OR5AK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	23	13	8	0
chr11	56757350	56757350	A	A	downstream	OR5AK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	25	18	0	0
chr11	56785534	56785534	T	C	intergenic	OR5AK2,OR5AK4P	dist=28216;dist=19475	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	4	3	0
chr11	5688821	5688821	T	T	intronic	TRIM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	5700444	5700444	A	A	intronic	TRIM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr11	5700976	5700976	A	C	intronic	TRIM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	73.30629	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	117	83	34	0
chr11	5700977	5700977	T	G	intronic	TRIM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	61	65.166415	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	113	82	31	0
chr11	57068554	57068554	A	A	intronic	TNKS1BP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr11	57076185	57076185	G	C	exonic	TNKS1BP1	NaN	nonsynonymous SNV	TNKS1BP1:NM_033396:exon6:c.C4000G:p.L1334V	NaN	NaN	NaN	1	T	0.031	B	0.015	B	0.872	N	1.000	N	-0.805	N	1.55	T	-0.973	T	0.020	T	0.135	-1.227	0.060	0.374	0.521	0.638	1.389	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.579197	nearby_gap_events	REJECT	52	43	9	0
chr11	57076186	57076186	C	G	exonic	TNKS1BP1	NaN	synonymous SNV	TNKS1BP1:NM_033396:exon6:c.G3999C:p.G1333G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.506301	nearby_gap_events	REJECT	46	37	9	0
chr11	57076189	57076189	C	C	exonic	TNKS1BP1	NaN	synonymous SNV	TNKS1BP1:NM_033396:exon6:c.G3996G:p.Q1332Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	56	38	0	0
chr11	57076190	57076190	T	T	exonic	TNKS1BP1	NaN	synonymous SNV	TNKS1BP1:NM_033396:exon6:c.A3995A:p.Q1332Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	55	37	0	0
chr11	57077690	57077690	C	A	exonic	TNKS1BP1	NaN	nonsynonymous SNV	TNKS1BP1:NM_033396:exon6:c.G2495T:p.G832V	NaN	NaN	NaN	0	D	0.944	P	0.714	P	0.036	N	1.000	N	1.845	L	0.98	T	-1.024	T	0.178	T	0.27	1.898	12.30	3.27	1.082	0.165	5.021	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.894788	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	296	287	9	0
chr11	57078053	57078053	G	G	intronic	TNKS1BP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr11	57095082	57095082	C	G	intronic	SSRP1	NaN	NaN	NaN	rs7129491	NaN	0.066893	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	84.97229	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	36	36	12
chr11	57098464	57098464	A	T	intronic	SSRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr11	57098465	57098465	T	C	intronic	SSRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	57100351	57100351	G	A	intronic	SSRP1	NaN	NaN	NaN	rs7106462	NaN	0.153954	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.443138	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	23	17	13
chr11	57101071	57101071	A	A	intronic	SSRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	57113127	57113127	A	A	intronic	P2RX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	57113128	57113128	T	T	intronic	P2RX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	57114209	57114209	A	A	intronic	P2RX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	57144236	57144236	A	T	downstream	PRG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	57144237	57144237	G	T	downstream	PRG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	57144473	57144473	A	A	intronic	PRG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	57146896	57146896	A	G	intronic	PRG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	57146898	57146898	T	T	intronic	PRG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	57147016	57147016	A	G	exonic	PRG3	NaN	nonsynonymous SNV	PRG3:NM_006093:exon3:c.T326C:p.I109T	rs540687	NaN	0.958466	1	T	0.0	B	0.0	B	0.865	N	1.000	P	-0.49	N	1.04	T	-0.974	T	0.000	T	0.021	-1.140	0.110	-0.445	-0.543	-0.623	3.204	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	220.495877	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	81	0	81	58
chr11	57147289	57147289	A	G	intronic	PRG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	2	3	0
chr11	57155288	57155288	T	C	exonic	PRG2	NaN	synonymous SNV	PRG2:NM_001243245:exon5:c.A516G:p.A172A,PRG2:NM_001302926:exon5:c.A549G:p.A183A,PRG2:NM_001302927:exon5:c.A549G:p.A183A,PRG2:NM_002728:exon5:c.A549G:p.A183A	rs630396	NaN	0.941094	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	157.932259	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	54	0	54	58
chr11	57157268	57157268	T	T	intronic	PRG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	57157405	57157405	A	G	exonic	PRG2	NaN	synonymous SNV	PRG2:NM_001243245:exon2:c.T13C:p.L5L,PRG2:NM_001302926:exon2:c.T13C:p.L5L,PRG2:NM_001302927:exon2:c.T13C:p.L5L,PRG2:NM_002728:exon2:c.T13C:p.L5L	rs490358	NaN	0.752196	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	107.977	0	NaN	NA	NA	152	1	151	12
chr11	57188919	57188919	A	A	intronic	SLC43A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	57254567	57254567	C	A	splicing	SLC43A1	NM_003627:exon15:c.1533+1G>T,NM_001198810:exon15:c.1533+1G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.626	18.44	4.92	2.560	6.850	17.045	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.375466	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	8	5	0
chr11	57258677	57258677	T	C	intronic	SLC43A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	13	7	4	0
chr11	57268558	57268558	A	C	intronic	SLC43A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	27.2772	0	NaN	NA	NA	15	7	8	1
chr11	57311466	57311466	C	A	intronic	SMTNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.884488	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	403	391	12	0
chr11	57311467	57311467	A	C	intronic	SMTNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.141859	nearby_gap_events	REJECT	419	401	18	0
chr11	57317725	57317725	A	A	UTR3	SMTNL1	NM_001105565:c.*140A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	57327990	57327990	A	A	intronic	UBE2L6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	57414008	57414008	A	A	intronic	YPEL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	57466900	57466900	A	T	intronic	ZDHHC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	12	3	9	0
chr11	57471922	57471922	T	TA	UTR3	MED19	NM_153450:c.*172A>TA	NaN	NaN	NaN	NaN	0.251398	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	97.041	0	NaN	NA	NA	91	56	31	12
chr11	57564520	57564520	A	T	ncRNA_intronic	TMX2-CTNND1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	80	NaN	NA	NA	58	1	56	0
chr11	57574313	57574313	A	G	ncRNA_intronic	TMX2-CTNND1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	22	15	7	0
chr11	5776287	5776287	C	T	exonic	OR52N4	NaN	nonsynonymous SNV	OR52N4:NM_001005175:exon1:c.C317T:p.T106I	rs7936512	NaN	0.922125	1	T	0.0	B	0.0	B	0.044	N	1.000	P	-2.24	N	4.19	T	-1.022	T	0.000	T	0.16	-1.874	0.008	2.21	-0.107	0.453	9.995	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	295.513274	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	96	0	96	57
chr11	57798942	57798942	A	G	exonic	OR6Q1	NaN	nonsynonymous SNV	OR6Q1:NM_001005186:exon1:c.A518G:p.Y173C	rs2513726	NaN	0.408147	1	T	0.0	B	0.0	B	0.001	N	0.000	P	-3.245	N	9.05	T	-0.993	T	0.000	T	0.076	-0.527	1.599	5.04	1.136	5.148	9.753	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.932242	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	18	9	23
chr11	57799397	57799397	A	A	intronic	OR9Q1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	57931578	57931578	A	T	intronic	OR9Q1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	57947866	57947866	A	G	UTR3	OR9Q1	NM_001005212:c.*17A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	13	7	5	0
chr11	57970496	57970496	T	G	downstream	OR1S2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	1	6	0
chr11	57970967	57970967	G	A	exonic	OR1S2	NaN	synonymous SNV	OR1S2:NM_001004459:exon1:c.C687T:p.F229F	rs138762515	ID=COSM1135208;OCCURENCE=1(kidney)	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.008630850421116543	NA	0	0	NaN	NA	NA	222	168	54	0
chr11	58034543	58034543	C	T	exonic	OR10W1	NaN	nonsynonymous SNV	OR10W1:NM_207374:exon1:c.G788A:p.R263Q	rs10792156	NaN	0.513578	0.07	T	0.0	B	0.001	B	0.121	N	1.000	P	0.89	L	8.75	T	-0.899	T	0.000	T	0.045	0.364	5.977	-2.59	-0.762	-0.521	4.216	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	76.828503	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	17	30	36
chr11	58034575	58034575	G	C	exonic	OR10W1	NaN	nonsynonymous SNV	OR10W1:NM_207374:exon1:c.C756G:p.C252W	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.258	B	0.074	B	0.003	N	0.717	D	-0.155	N	1.11	T	-1.078	T	0.040	T	0.19	2.194	13.29	-0.135	0.015	-1.978	4.200	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.357643	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	57	49	8	0
chr11	58034576	58034576	C	G	exonic	OR10W1	NaN	nonsynonymous SNV	OR10W1:NM_207374:exon1:c.G755C:p.C252S	NaN	NaN	NaN	0	D	0.0	B	0.0	B	0.003	N	1.000	N	-0.93	N	1.18	T	-1.014	T	0.039	T	0.055	2.107	13.00	5.8	2.741	0.082	14.256	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.966262	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	56	48	8	0
chr11	58059747	58059747	A	C	intergenic	OR10W1,OR5B17	dist=24015;dist=65851	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr11	58059748	58059748	G	A	intergenic	OR10W1,OR5B17	dist=24016;dist=65850	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	3	5	0
chr11	5810102	5810102	AAATA	AAA,AA,AAAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1877.57	0	NaN	NA	NA	322	0	80	8
chr11	58190460	58190460	T	C	exonic	OR5B2	NaN	nonsynonymous SNV	OR5B2:NM_001005566:exon1:c.A275G:p.Y92C	NaN	NaN	NaN	0	D	0.813	P	0.413	B	0.006	U	0.933	N	3.57	H	8.08	T	-1.071	T	0.002	T	0.564	1.166	9.746	2.55	1.728	-0.032	7.506	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.66139	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	247	242	5	0
chr11	58275344	58275344	T	C	exonic	OR5B21	NaN	nonsynonymous SNV	OR5B21:NM_001005218:exon1:c.A235G:p.T79A	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.0	B	0.001	B	0.076	U	1.000	N	0.26	N	4.11	T	-0.942	T	0.005	T	0.039	0.312	5.690	-1.39	-0.135	-1.197	6.801	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.329807	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	239	232	7	0
chr11	58343116	58343116	T	T	intronic	LPXN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr11	58343118	58343118	A	G	intronic	LPXN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.9259	0	NaN	NA	NA	282	244	41	0
chr11	58384273	58384273	G	A	exonic	ZFP91	NaN	nonsynonymous SNV	ZFP91:NM_001197051:exon10:c.G1184A:p.G395D,ZFP91:NM_053023:exon10:c.G1187A:p.G396D	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.993	D	0.000	D	1.000	D	1.065	L	1.72	T	-1.017	T	0.125	T	0.792	5.182	32	5.92	2.822	7.646	19.106	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.471506	nearby_gap_events	REJECT	91	84	7	0
chr11	5842087	5842087	C	A	exonic	OR52N2	NaN	nonsynonymous SNV	OR52N2:NM_001005174:exon1:c.C522A:p.N174K	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.013	B	0.098	B	0.032	N	1.000	N	2.125	M	8.53	T	-0.980	T	0.001	T	0.238	0.386	6.098	-1.2	-0.245	-2.827	10.566	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.340957	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	67	59	8	0
chr11	58478084	58478084	T	C	exonic	GLYAT	NaN	nonsynonymous SNV	GLYAT:NM_005838:exon5:c.A467G:p.N156S,GLYAT:NM_201648:exon5:c.A467G:p.N156S	rs675815	NaN	0.926518	1	T	0.0	B	0.001	B	0.201	N	1.000	P	-0.315	N	2.6	T	-0.991	T	0.000	T	0.009	-0.898	0.442	-8.33	-2.311	-3.403	4.582	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.124575	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	1	31	58
chr11	58605875	58605875	A	C	intronic	GLYATL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	58715513	58715513	T	G	ncRNA_intronic	LOC283194	NaN	NaN	NaN	rs11229707	NaN	0.453075	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	5780.69	0	NaN	NA	NA	497	0	497	32
chr11	58891641	58891641	T	C	intronic	FAM111B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr11	58892386	58892386	A	G	exonic	FAM111B	NaN	synonymous SNV	FAM111B:NM_001142704:exon2:c.A726G:p.K242K,FAM111B:NM_001142703:exon3:c.A726G:p.K242K,FAM111B:NM_198947:exon4:c.A816G:p.K272K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.507483	nearby_gap_events	REJECT	95	81	14	0
chr11	58940102	58940102	T	T	exonic	DTX4	NaN	synonymous SNV	DTX4:NM_015177:exon1:c.T34T:p.W12W	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	58978353	58978353	C	A	exonic	MPEG1	NaN	synonymous SNV	MPEG1:NM_001039396:exon1:c.G1986T:p.V662V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	116	NaN	NA	NA	171	156	15	0
chr11	58978354	58978354	A	C	exonic	MPEG1	NaN	nonsynonymous SNV	MPEG1:NM_001039396:exon1:c.T1985G:p.V662G	NaN	NaN	NaN	0.2	T	0.112	B	0.039	B	0.999	N	1.000	N	1.245	L	1.72	T	-1.057	T	0.052	T	0.369	0.930	8.787	4.41	2.103	3.292	6.963	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	214	190	24	0
chr11	5906290	5906290	A	AC	exonic	OR52E4	NaN	frameshift substitution	OR52E4:NM_001005165:exon1:c.768_768delinsAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	457.942	0	NaN	NA	NA	237	113	28	4
chr11	59224694	59224694	A	C	exonic	OR4D6	NaN	synonymous SNV	OR4D6:NM_001004708:exon1:c.A261C:p.S87S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.087756	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	111	105	6	0
chr11	59244962	59244962	T	T	exonic	OR4D10	NaN	synonymous SNV	OR4D10:NM_001004705:exon1:c.T60T:p.N20N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	75	65	0	0
chr11	59345832	59345832	A	G	intronic	OSBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr11	59361036	59361036	C	C	intronic	OSBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	59361037	59361037	A	A	intronic	OSBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	59361742	59361742	A	A	intronic	OSBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	59361748	59361748	T	T	intronic	OSBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	59361749	59361749	A	A	intronic	OSBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	59361751	59361751	A	A	intronic	OSBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	59361754	59361754	A	A	intronic	OSBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	59361756	59361756	C	C	intronic	OSBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	59361759	59361759	T	T	intronic	OSBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	59361761	59361761	C	C	intronic	OSBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	59361762	59361762	T	T	intronic	OSBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	59368098	59368098	G	A	exonic	OSBP	NaN	synonymous SNV	OSBP:NM_002556:exon7:c.C1182T:p.Y394Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.44784	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	49	46	3	0
chr11	59419891	59419891	T	C	intronic	PATL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr11	59424815	59424815	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	0	4,3	0
chr11	59436238	59436238	C	A	intronic	PATL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.184297	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	8	3	5	0
chr11	59629191	59629191	A	C	intronic	TCN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	6	2	2	0
chr11	59629192	59629192	A	T	intronic	TCN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	1	2	0
chr11	59629195	59629195	G	T	intronic	TCN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr11	59837161	59837161	A	C	intronic	MS4A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.034115	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	186	169	17	0
chr11	59942798	59942798	T	C	intronic	MS4A6A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr11	60068545	60068545	C	T	intronic	MS4A4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.221348	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	117	105	12	0
chr11	60073597	60073597	C	T	exonic	MS4A4A	NaN	synonymous SNV	MS4A4A:NM_001243266:exon5:c.C412T:p.L138L,MS4A4A:NM_148975:exon6:c.C571T:p.L191L,MS4A4A:NM_024021:exon7:c.C514T:p.L172L	rs4644658	NaN	0.926318	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	277.76559	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	96	0	96	57
chr11	60152516	60152516	A	A	intronic	MS4A7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	7	0	0
chr11	60170567	60170567	A	A	intronic	MS4A14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr11	60231725	60231725	C	C	intronic	MS4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr11	60274604	60274604	A	A	UTR3	MS4A12	NM_001164470:c.*7A>A,NM_017716:c.*7A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr11	60309947	60309947	A	T	intronic	MS4A13	NaN	NaN	NaN	rs4939400	NaN	0.943091	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	209.308	0	NaN	NA	NA	21	0	21	41
chr11	60310083	60310083	A	T	UTR3	MS4A13	NM_001278320:c.*35A>T,NM_001100909:c.*35A>T,NM_001012417:c.*35A>T	NaN	NaN	rs11230378	NaN	0.265176	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.761048	normal_lod	REJECT	7	4	3	6
chr11	60468441	60468441	T	T	exonic	MS4A8	NaN	synonymous SNV	MS4A8:NM_031457:exon2:c.T108T:p.Y36Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	44	38	0	0
chr11	60468626	60468626	A	G	intronic	MS4A8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr11	6048046	6048046	T	T	exonic	OR56A1	NaN	synonymous SNV	OR56A1:NM_001001917:exon1:c.A889A:p.I297I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	64	58	0	0
chr11	605054	605054	T	G	intronic	PHRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr11	60531066	60531066	T	T	intronic	MS4A15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr11	60534901	60534901	G	C	intronic	MS4A15	NaN	NaN	NaN	rs4939450	NaN	0.729034	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.097276	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	46
chr11	60609765	60609765	G	C	exonic	CCDC86	NaN	synonymous SNV	CCDC86:NM_024098:exon1:c.G168C:p.L56L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.961241	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	99	87	12	0
chr11	60620531	60620531	A	T	exonic	PTGDR2	NaN	nonsynonymous SNV	PTGDR2:NM_004778:exon2:c.T665A:p.I222N	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	3.425	M	0.77	T	-0.092	T	0.375	T	0.704	4.226	22.0	4.74	1.776	9.159	12.208	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5597	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr11	60620590	60620590	C	G	exonic	PTGDR2	NaN	synonymous SNV	PTGDR2:NM_004778:exon2:c.G606C:p.R202R	rs2428461	NaN	0.984625	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	153.691522	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	63	1	62	58
chr11	60634976	60634976	T	T	upstream	ZP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	60637164	60637164	C	T	exonic	ZP1	NaN	nonsynonymous SNV	ZP1:NM_207341:exon3:c.C473T:p.T158I	rs489172	NaN	0.693291	0.53	T	0.061	B	0.006	B	0.206	N	1.000	P	0.69	N	1.9	T	-0.995	T	0.000	T	0.046	0.958	8.909	1.19	0.406	-0.258	4.400	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	549.308	0	161.859276	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	1	56	47
chr11	60637214	60637214	T	C	exonic	ZP1	NaN	nonsynonymous SNV	ZP1:NM_207341:exon3:c.T523C:p.S175P	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.039	B	0.003	B	0.856	U	1.000	N	1.39	L	1.71	T	-0.998	T	0.043	T	0.359	0.824	8.320	0.474	0.100	-0.400	3.461	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.767257		KEEP	26	22	4	0
chr11	60640716	60640716	T	C	exonic	ZP1	NaN	synonymous SNV	ZP1:NM_207341:exon7:c.T1194C:p.P398P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.963649	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	170	152	18	0
chr11	60642739	60642739	T	C	intronic	ZP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.855256	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	495	452	43	0
chr11	60658802	60658802	A	A	intronic	PRPF19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	60665931	60665931	C	T	intronic	PRPF19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	60665932	60665932	C	G	intronic	PRPF19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	60665936	60665936	A	T	intronic	PRPF19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	60668857	60668857	G	C	intronic	PRPF19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.564797	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	247	235	12	0
chr11	60670170	60670170	A	G	intronic	PRPF19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.680923	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	268	262	6	0
chr11	60695042	60695042	T	T	intronic	TMEM132A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	60696531	60696531	A	A	intronic	TMEM132A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr11	60698054	60698054	G	A	exonic	TMEM132A	NaN	synonymous SNV	TMEM132A:NM_017870:exon5:c.G939A:p.L313L,TMEM132A:NM_178031:exon5:c.G939A:p.L313L	rs2074416	NaN	0.296126	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	26.8073	0	13.978091	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	10	6	36
chr11	60702378	60702378	A	G	intronic	TMEM132A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	4	3	0
chr11	60702602	60702602	T	T	intronic	TMEM132A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	60702625	60702625	G	A	intronic	TMEM132A	NaN	NaN	NaN	rs552940	NaN	0.421326	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.9802	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	78	47	31	41
chr11	60704254	60704254	G	C	exonic	TMEM132A	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM132A:NM_017870:exon11:c.G2950C:p.A984P,TMEM132A:NM_178031:exon11:c.G2947C:p.A983P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.383	B	0.106	B	0.009	N	0.888	D	1.04	L	3.37	T	-1.012	T	0.016	T	0.37	1.501	10.97	4.39	2.459	0.000	12.049	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.176141	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	61	51	10	0
chr11	60705454	60705454	A	G	exonic	SLC15A3	NaN	synonymous SNV	SLC15A3:NM_016582:exon7:c.T1479C:p.G493G	rs2905692	NaN	0.994209	.	.	0.0	B	0.002	B	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.048	T	0.000	T	.	1.169	9.758	-8.17	-1.894	-2.531	3.999	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	102.922424	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	0	35	32
chr11	60709678	60709678	A	A	intronic	SLC15A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	60776103	60776103	T	C	exonic	CD6	NaN	synonymous SNV	CD6:NM_001254750:exon4:c.T567C:p.T189T,CD6:NM_001254751:exon4:c.T567C:p.T189T,CD6:NM_006725:exon4:c.T567C:p.T189T	rs61899223	NaN	0.158746	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.045	T	0.000	T	.	-0.669	1.073	-8.0	-2.159	-0.993	6.244	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	81.6639	15	28.849826	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	17	17	10
chr11	60780828	60780828	T	C	intronic	CD6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	60780829	60780829	G	A	intronic	CD6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	60780831	60780831	A	G	intronic	CD6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	60892606	60892606	A	G	exonic	CD5	NaN	nonsynonymous SNV	CD5:NM_014207:exon9:c.A1382G:p.H461R	rs637186	NaN	0.967851	1	T	0.0	B	0.0	B	0.230	N	1.000	P	-0.345	N	1.64	T	-0.978	T	0.000	T	0.009	-2.092	0.006	-2.65	-0.647	-0.231	11.233	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.231584	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	0	10	41
chr11	60893435	60893435	A	C	intronic	CD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr11	60899767	60899767	A	G	exonic	VPS37C	NaN	nonsynonymous SNV	VPS37C:NM_017966:exon5:c.T593C:p.L198S	rs754382	NaN	0.853235	1	T	0.0	B	0.0	B	0.334	N	1.000	P	-0.975	N	0.95	T	-0.966	T	0.000	T	0.021	-1.227	0.060	2.84	0.102	4.483	8.191	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.439058	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	10	5	35
chr11	60913107	60913107	A	A	intronic	VPS37C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	609522	609522	G	GAC	exonic	PHRF1	NaN	frameshift substitution	PHRF1:NM_001286581:exon14:c.4066_4066delinsGAC,PHRF1:NM_001286582:exon14:c.4060_4060delinsGAC,PHRF1:NM_001286583:exon14:c.4054_4054delinsGAC,PHRF1:NM_020901:exon14:c.4063_4063delinsGAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.3554	0	NaN	NA	NA	8	5	2	5
chr11	61039294	61039294	A	G	intronic	VWCE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	5	4	0
chr11	610499	610499	A	A	splicing	PHRF1	NM_020901:exon16:c.4414-2A>A,NM_001286583:exon16:c.4405-2A>A,NM_001286581:exon16:c.4417-2A>A,NM_001286582:exon16:c.4411-2A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	38	31	0	0
chr11	61079335	61079335	A	G	exonic	DDB1	NaN	nonsynonymous SNV	DDB1:NM_001923:exon18:c.T2198C:p.F733S	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	3.06	M	1.77	T	-0.532	T	0.221	T	0.97	5.183	32	5.66	2.163	9.339	15.895	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.339267	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	100	91	9	0
chr11	61105619	61105619	G	T	intronic	DAK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	32	20	12	0
chr11	61105629	61105629	G	T	intronic	DAK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	51	27	24	0
chr11	61106525	61106525	C	T	intronic	DAK	NaN	NaN	NaN	rs2512809	NaN	0.77476	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.078037	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	1	14	58
chr11	61117995	61117995	A	A	intronic	CYB561A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr11	61118654	61118654	A	A	intronic	CYB561A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr11	61118658	61118658	T	C	intronic	CYB561A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	61123965	61123965	A	G	intronic	CYB561A3	NaN	NaN	NaN	rs76030461	NaN	0.987819	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	182.765	0	57.486474	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	1	19	49
chr11	61124144	61124144	C	A	exonic	CYB561A3	NaN	synonymous SNV	CYB561A3:NM_001161452:exon1:c.G42T:p.G14G,CYB561A3:NM_001300763:exon3:c.G42T:p.G14G,CYB561A3:NM_153611:exon3:c.G42T:p.G14G,CYB561A3:NM_001161454:exon4:c.G93T:p.G31G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.600993	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	602	575	27	0
chr11	61124788	61124788	A	A	UTR5	CYB561A3	NM_001161454:c.-78T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	61165731	61165731	C	CA	splicing	TMEM216	NM_001173991:exon5:c.432-2C>CA,NM_016499:exon5:c.249-2C>CA	NaN	NaN	NaN	NaN	0.855831	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1723.05	0	NaN	NA	NA	179	0	171	33
chr11	61178377	61178377	C	T	intronic	CPSF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.443139	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	186	162	24	0
chr11	61249383	61249383	C	A	exonic	PPP1R32	NaN	synonymous SNV	PPP1R32:NM_001170753:exon2:c.C102A:p.T34T,PPP1R32:NM_145017:exon2:c.C102A:p.T34T	rs3019200	NaN	0.775559	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	95.471861	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	0	34	56
chr11	61253224	61253224	T	T	intronic	PPP1R32	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	61277424	61277424	C	T	UTR3	LRRC10B	NM_001145077:c.*75C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.02272727272727276	NA	0	0	9.793233	nearby_gap_events	REJECT	21	16	5	0
chr11	61295330	61295330	G	G	intronic	SYT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	61295331	61295331	G	G	intronic	SYT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	61295332	61295332	G	G	intronic	SYT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	61295333	61295333	G	G	intronic	SYT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	61295335	61295335	A	A	intronic	SYT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	61295338	61295338	G	G	intronic	SYT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	61323519	61323519	G	A	intronic	SYT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr11	61487690	61487690	G	A	exonic	DAGLA	NaN	synonymous SNV	DAGLA:NM_006133:exon2:c.G63A:p.P21P	rs198430	ID=COSM429407;OCCURENCE=1(breast)	0.30012	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	57.766208	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	20	23	19
chr11	61490439	61490439	C	G	intronic	DAGLA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0021333623458714137	NA	0	0	NaN	NA	NA	261	180	81	0
chr11	61490441	61490441	G	T	intronic	DAGLA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.031974548796388294	NA	0	0	NaN	NA	NA	187	142	45	0
chr11	61505168	61505168	G	A	exonic	DAGLA	NaN	synonymous SNV	DAGLA:NM_006133:exon15:c.G1524A:p.A508A	rs198444	NaN	0.491414	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	139.205254	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	49	0	49	32
chr11	61511498	61511498	C	T	exonic	DAGLA	NaN	nonsynonymous SNV	DAGLA:NM_006133:exon20:c.C2666T:p.P889L	rs3741252	NaN	0.178914	0.65	T	0.0	B	0.0	B	0.005	N	1.000	P	-0.55	N	2.07	T	-0.967	T	0.000	T	0.05	-2.792	0	-5.51	-1.994	-2.895	9.937	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	33.4849	0	12.767644	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	2	5	5
chr11	61533588	61533588	C	CA	exonic	MYRF	NaN	frameshift substitution	MYRF:NM_001127392:exon3:c.293_293delinsCA,MYRF:NM_013279:exon3:c.266_266delinsCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.47658	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr11	61539132	61539132	G	A	exonic	MYRF	NaN	nonsynonymous SNV	MYRF:NM_001127392:exon6:c.G901A:p.G301S,MYRF:NM_013279:exon6:c.G874A:p.G292S	NaN	NaN	NaN	0.61	T	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	0.55	N	1.56	T	-1.074	T	0.100	T	0.501	4.045	20.8	4.41	2.187	5.264	15.580	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.519171	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	69	57	12	0
chr11	61544243	61544243	C	A	intronic	MYRF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.22480237154149807	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr11	61544369	61544369	A	A	intronic	MYRF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	61547235	61547235	T	T	intronic	MYRF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	61547593	61547593	T	T	intronic	MYRF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr11	61548874	61548874	G	A	intronic	MYRF	NaN	NaN	NaN	rs174532	NaN	0.10024	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.565627	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	3	6	18
chr11	61551272	61551272	T	G	intronic	MYRF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.092701	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	97	89	8	0
chr11	61551892	61551892	C	A	intronic	MYRF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0112631970758735	NA	0	0	NaN	NA	NA	33	24	9	0
chr11	61551893	61551893	C	G	intronic	MYRF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.01922589737352029	NA	0	0	NaN	NA	NA	43	34	9	0
chr11	61551895	61551895	G	A	intronic	MYRF	NaN	NaN	NaN	rs201290496	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.023588075769193247	NA	0	0	NaN	NA	NA	44	35	9	0
chr11	61558133	61558133	A	A	intronic	TMEM258	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr11	61569813	61569813	C	A	UTR3	FADS1	NM_013402:c.*70G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.801388	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	240	234	6	0
chr11	61569950	61569950	G	T	intronic	FADS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.151739	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	240	218	22	0
chr11	61570591	61570591	A	G	intronic	FADS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	61572087	61572087	G	T	intronic	FADS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.44992	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	155	144	11	0
chr11	61580117	61580117	C	A	exonic	FADS1	NaN	synonymous SNV	FADS1:NM_013402:exon3:c.G510T:p.R170R	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.994	T	0.127	T	.	1.367	10.50	2.54	0.845	-0.767	2.13	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	25	20.90898	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	36	27	9	0
chr11	61584208	61584208	G	T	exonic	FADS1	NaN	nonsynonymous SNV	FADS1:NM_013402:exon1:c.C194A:p.A65D	NaN	NaN	NaN	0.52	T	0.079	B	0.071	B	.	.	1.000	N	0	N	0.22	T	-1.011	T	0.047	T	0.179	0.985	9.023	1.75	0.466	-0.733	11.038	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	101.079	0	NaN	NA	NA	10	0	10	17
chr11	61605442	61605442	A	A	intronic	FADS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	61606324	61606324	G	T	intronic	FADS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	61624586	61624586	C	T	intronic	FADS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.850693	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	188	176	12	0
chr11	61630592	61630592	T	C	intronic	FADS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.240687	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	129	125	4	0
chr11	61641211	61641211	A	G	UTR3	FADS3	NM_021727:c.*75T>C	NaN	NaN	rs6591665	NaN	0.988818	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	50.1428	0	15.516775	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	35
chr11	61645772	61645772	A	C	intronic	FADS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	61658629	61658629	T	C	intronic	FADS3	NaN	NaN	NaN	rs693672	NaN	0.697284	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.867147	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	48
chr11	61658800	61658800	C	T	exonic	FADS3	NaN	synonymous SNV	FADS3:NM_021727:exon1:c.G54A:p.A18A	rs174465	NaN	0.471645	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.256917	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	26
chr11	61672265	61672265	T	C	exonic	RAB3IL1	NaN	synonymous SNV	RAB3IL1:NM_001271686:exon5:c.A669G:p.R223R,RAB3IL1:NM_013401:exon6:c.A747G:p.R249R	rs174474	NaN	0.313698	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	69	58	10	20
chr11	61719492	61719492	TG	GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.41691	0	NaN	NA	NA	21	16	2	0
chr11	61731493	61731493	T	C	intronic	BEST1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	61731494	61731494	T	A	intronic	BEST1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	61731495	61731495	T	A	intronic	BEST1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	61731531	61731531	A	G	intronic	BEST1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.766932	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	415	404	11	0
chr11	61732179	61732179	T	G	UTR3	FTH1	NM_002032:c.*20A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	16	5	11	0
chr11	617397	617397	C	A	exonic	CDHR5	NaN	nonsynonymous SNV	CDHR5:NM_031264:exon14:c.G1910T:p.G637V,CDHR5:NM_001171968:exon15:c.G2474T:p.G825V,CDHR5:NM_021924:exon15:c.G2492T:p.G831V	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.615	P	0.141	B	.	.	1.000	N	1.1	L	-0.27	T	-0.972	T	0.156	T	0.201	1.327	10.35	-6.05	-1.759	-0.065	5.741	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.297429	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	33	28	5	0
chr11	617967	617967	C	G	exonic	CDHR5	NaN	nonsynonymous SNV	CDHR5:NM_031264:exon13:c.G1523C:p.C508S,CDHR5:NM_001171968:exon14:c.G2087C:p.C696S,CDHR5:NM_021924:exon14:c.G2105C:p.C702S	rs2740379	NaN	0.980831	0.91	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	-1.78	N	1.45	T	-1.011	T	0.000	T	0.134	-1.517	0.016	1.07	0.155	0.165	4.873	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	101.038602	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	0	34	56
chr11	61897903	61897903	T	C	exonic	INCENP	NaN	nonsynonymous SNV	INCENP:NM_001040694:exon4:c.T904C:p.S302P,INCENP:NM_020238:exon4:c.T904C:p.S302P	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.049	B	0.03	B	0.028	N	1.000	N	1.355	L	1.72	T	-1.035	T	0.047	T	0.204	0.627	7.372	2.66	0.253	0.929	6.714	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.376481	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	53	44	9	0
chr11	618993	618993	CGGGGGC	CGGGGAC,CGGGGC,CGGGGG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	130.076	0	NaN	NA	NA	29	1	11	0
chr11	61906374	61906374	T	C	exonic	INCENP	NaN	synonymous SNV	INCENP:NM_001040694:exon7:c.T1188C:p.N396N,INCENP:NM_020238:exon7:c.T1188C:p.N396N	rs1675126	ID=COSM147259;OCCURENCE=1(stomach)	0.785942	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	118.130795	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	0	43	57
chr11	61907645	61907645	C	A	intronic	INCENP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.07407407407407368	NA	0	25	NaN	NA	NA	8	6	2	1
chr11	61908526	61908526	C	G	intronic	INCENP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	62	60	2	5
chr11	61913196	61913196	G	T	exonic	INCENP	NaN	nonsynonymous SNV	INCENP:NM_020238:exon13:c.G1920T:p.E640D,INCENP:NM_001040694:exon14:c.G1932T:p.E644D	rs7129085	NaN	0.29393	0.09	T	1.0	D	0.996	D	0.000	D	0.175	P	1.625	L	2.17	T	-0.935	T	0.000	T	0.098	2.390	13.95	0.398	0.281	1.144	8.874	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	50.1427	0	18.153068	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	15
chr11	62037615	62037615	T	T	upstream	SCGB2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	62037821	62037821	A	A	intronic	SCGB2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	62066325	62066325	T	T	intronic	SCGB1D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr11	621068	621068	C	T	intronic	CDHR5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.208014	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	12	10	2	0
chr11	62123952	62123952	A	A	intronic	ASRGL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	22	21	0	0
chr11	62159729	62159729	C	T	exonic	ASRGL1	NaN	synonymous SNV	ASRGL1:NM_001083926:exon7:c.C900T:p.D300D,ASRGL1:NM_025080:exon7:c.C900T:p.D300D	rs140693977	ID=COSM929598;OCCURENCE=1(endometrium)	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	136.734986	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	102	47	55	1
chr11	62160511	62160511	A	T	UTR3	ASRGL1	NM_001083926:c.*755A>T,NM_025080:c.*755A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	62201458	62201458	A	G	intronic	AHNAK	NaN	NaN	NaN	rs4084164	NaN	0.392173	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	86.969732	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	0	34	45
chr11	62281189	62281189	A	G	intronic	AHNAK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	62285762	62285762	A	G	exonic	AHNAK	NaN	nonsynonymous SNV	AHNAK:NM_001620:exon5:c.T16127C:p.V5376A	NaN	NaN	NaN	0.77	T	0.988	D	0.985	D	0.097	N	1.000	D	1.735	L	4.8	T	-0.967	T	0.013	T	0.12	2.510	14.35	2.57	0.564	2.132	7.283	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.352929	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	154	149	5	0
chr11	62289306	62289306	TG	GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.979	0	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	62292860	62292860	T	C	exonic	AHNAK	NaN	nonsynonymous SNV	AHNAK:NM_001620:exon5:c.A9029G:p.D3010G	NaN	NaN	NaN	0.22	T	0.993	D	0.879	P	.	.	1.000	D	3.23	M	4.58	T	-0.995	T	0.032	T	0.392	2.146	13.13	3.97	1.570	1.319	12.883	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	11.4442	35	NaN	NA	NA	8	2	4	1
chr11	62296127	62296127	T	G	exonic	AHNAK	NaN	nonsynonymous SNV	AHNAK:NM_001620:exon5:c.A5762C:p.K1921T	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.965	D	0.767	P	.	.	1.000	N	3.685	H	4.96	T	-1.099	T	0.021	T	0.251	1.523	11.04	2.74	1.277	2.970	9.369	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.16113	0	NaN	NA	NA	23	20	3	0
chr11	62302673	62302673	A	A	intronic	AHNAK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr11	62306706	62306706	A	G	intronic	AHNAK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr11	62312318	62312318	C	C	intronic	AHNAK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr11	62341423	62341423	A	A	UTR5	EEF1G	NM_001404:c.-109T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr11	62356479	62356479	T	A	intronic	TUT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	4	3	0
chr11	62363303	62363303	G	A	exonic	MTA2	NaN	nonsynonymous SNV	MTA2:NM_004739:exon13:c.C1175T:p.A392V	NaN	NaN	NaN	0.23	T	0.033	B	0.029	B	0.000	D	1.000	D	0.92	L	-6.35	D	0.922	D	0.931	D	0.572	3.289	17.05	4.72	2.663	6.521	11.580	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.438432	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	71	64	7	0
chr11	62363304	62363304	C	A	exonic	MTA2	NaN	nonsynonymous SNV	MTA2:NM_004739:exon13:c.G1174T:p.A392S	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.006	B	0.007	B	0.000	D	0.999	D	0.225	N	-6.27	D	0.877	D	0.908	D	0.313	2.210	13.35	4.72	2.663	3.664	11.580	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.537033	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	72	64	8	0
chr11	62363306	62363306	C	A	exonic	MTA2	NaN	nonsynonymous SNV	MTA2:NM_004739:exon13:c.G1172T:p.C391F	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	2.775	M	-12.07	D	1.015	D	1.000	D	0.984	4.439	23.6	5.87	2.778	7.618	17.716	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.43532	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	72	64	8	0
chr11	62368240	62368240	T	G	intronic	MTA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	62369954	62369954	T	C	exonic	EML3	NaN	nonsynonymous SNV	EML3:NM_153265:exon22:c.A2684G:p.D895G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.002	B	0.003	B	0.158	N	1.000	D	0	N	1.58	T	-1.005	T	0.097	T	0.404	1.734	11.76	5.34	2.146	2.538	11.988	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	13	6	7	0
chr11	62369955	62369955	C	A	exonic	EML3	NaN	nonsynonymous SNV	EML3:NM_001300793:exon22:c.G2576T:p.R859L,EML3:NM_001300794:exon22:c.G2573T:p.R858L,EML3:NM_153265:exon22:c.G2683T:p.D895Y	NaN	NaN	NaN	0	D	0.971	D	0.626	P	0.158	N	0.965	N	0	N	1.53	T	-1.027	T	0.045	T	0.604	1.318	10.32	4.42	1.366	3.412	12.304	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	13	6	7	0
chr11	62381106	62381106	G	C	exonic	ROM1	NaN	nonsynonymous SNV	ROM1:NM_000327:exon1:c.G353C:p.G118A	rs1799959	NaN	0.935304	1	T	0.0	B	0.001	B	0.004	N	1.000	P	-1.31	N	-1.04	T	-0.932	T	0.000	T	0.132	-2.342	0.004	3.72	0.564	0.103	11.333	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2069.17	0	NaN	NA	NA	229	3	226	22
chr11	62381865	62381865	A	G	exonic	ROM1	NaN	synonymous SNV	ROM1:NM_000327:exon2:c.A726G:p.R242R	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	.	.	0.922	N	.	.	.	.	-0.873	T	0.082	T	.	1.380	10.54	-10.8	-2.015	-1.358	6.140	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	51	36	13	0
chr11	62383278	62383278	C	T	UTR3	B3GAT3	NM_001288723:c.*396G>A,NM_001288722:c.*380G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.004349	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	195	188	7	0
chr11	62384829	62384829	A	A	intronic	B3GAT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr11	6238903	6238903	A	C	exonic	FAM160A2	NaN	nonsynonymous SNV	FAM160A2:NM_001098794:exon9:c.T1913G:p.V638G,FAM160A2:NM_032127:exon9:c.T1955G:p.V652G	NaN	NaN	NaN	0.39	T	0.112	B	0.039	B	0.237	N	0.996	N	0.345	N	1.0	T	-1.071	T	0.054	T	0.36	0.918	8.735	4.17	2.234	2.888	6.377	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.023302	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr11	6239042	6239042	T	C	exonic	FAM160A2	NaN	nonsynonymous SNV	FAM160A2:NM_001098794:exon9:c.A1774G:p.T592A,FAM160A2:NM_032127:exon9:c.A1816G:p.T606A	NaN	NaN	NaN	1	T	0.905	P	0.369	B	0.043	N	0.878	D	1.61	L	0.67	T	-0.925	T	0.106	T	0.479	2.569	14.55	5.16	2.174	2.337	13.947	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	20	11	7	1
chr11	6239373	6239373	T	A	exonic	FAM160A2	NaN	synonymous SNV	FAM160A2:NM_001098794:exon9:c.A1443T:p.G481G,FAM160A2:NM_032127:exon9:c.A1485T:p.G495G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.42299	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	105	78	27	1
chr11	62396665	62396665	C	A	splicing	GANAB	NM_198335:exon18:c.2002+1G>T,NM_198334:exon17:c.1936+1G>T,NM_001278194:exon16:c.1645+1G>T,NM_001278193:exon14:c.1594+1G>T,NM_001278192:exon15:c.1660+1G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.872	19.68	5.19	2.711	7.612	16.258	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	17	13	4	0
chr11	62396774	62396774	A	G	intronic	GANAB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr11	62399997	62399997	A	G	intronic	GANAB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	62400248	62400248	A	T	intronic	GANAB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	0	2	0
chr11	62400249	62400249	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	0	3,2	0
chr11	62406623	62406623	A	A	intronic	GANAB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	62415634	62415634	A	G	exonic	INTS5	NaN	nonsynonymous SNV	INTS5:NM_030628:exon2:c.T1918C:p.S640P	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.891	P	0.261	B	0.000	D	0.956	N	0.205	N	.	.	-1.072	T	0.032	T	0.642	-0.234	2.871	3.01	1.050	1.490	6.938	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	355	146	206	0
chr11	62417480	62417480	A	G	intronic	INTS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	10	0	10	0
chr11	62433470	62433470	G	A	intronic	LBHD1,METTL12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.514587	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	16	10	6	0
chr11	62439569	62439569	G	A	exonic	UQCC3	NaN	nonsynonymous SNV	UQCC3:NM_001085372:exon2:c.G265A:p.G89S	rs13941	ID=COSM429461;OCCURENCE=1(breast),1(prostate)	0.749401	0.22	T	0.078	B	0.013	B	.	.	1.000	P	.	.	.	.	-1.026	T	0.000	T	0.029	1.220	9.952	-3.42	-0.828	0.297	8.551	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	64.756563	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	55	27	28	53
chr11	6244900	6244900	A	G	exonic	FAM160A2	NaN	synonymous SNV	FAM160A2:NM_001098794:exon3:c.T717C:p.A239A,FAM160A2:NM_032127:exon3:c.T717C:p.A239A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.15826086956521787	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr11	62462228	62462228	A	A	ncRNA_intronic	HNRNPUL2-BSCL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr11	62484799	62484799	A	A	ncRNA_intronic	HNRNPUL2-BSCL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	15	13	0	0
chr11	62488919	62488919	A	G	ncRNA_intronic	HNRNPUL2-BSCL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.586174	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	264	236	28	0
chr11	62491070	62491070	A	AT,T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	43.5315	0	NaN	NA	NA	13	5	6	13
chr11	62505923	62505923	A	A	UTR3	TTC9C	NM_173810:c.*69A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	62520562	62520562	C	T	exonic	ZBTB3	NaN	nonsynonymous SNV	ZBTB3:NM_024784:exon2:c.G725A:p.G242E	NaN	NaN	NaN	0.62	T	0.675	P	0.19	B	0.121	N	1.000	N	0.695	N	2.66	T	-1.010	T	0.021	T	0.345	1.308	10.28	4.89	2.512	1.825	13.437	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.898713	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	289	276	13	0
chr11	62521408	62521408	A	T	intronic	ZBTB3	NaN	NaN	NaN	rs72929469	NaN	0.13778	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	39.024956	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	14	16	18
chr11	62521475	62521475	T	C	exonic	ZBTB3	NaN	synonymous SNV	ZBTB3:NM_024784:exon1:c.A60G:p.R20R	rs72929471	NaN	0.13778	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.596837	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	16	15	23
chr11	62529532	62529532	G	A	intronic	POLR2G	NaN	NaN	NaN	rs4061933	NaN	0.297524	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	108.065	0	32.402237	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	1	11	7
chr11	62534081	62534081	A	A	UTR3	POLR2G	NM_002696:c.*102A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	62546462	62546462	A	C	intronic	TAF6L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	8	0	7	0
chr11	62555015	62555015	G	C	intronic	TMEM179B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.874398	nearby_gap_events	REJECT	30	21	9	0
chr11	62556874	62556874	T	C	exonic	TMEM179B	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM179B:NM_199337:exon3:c.T395C:p.I132T	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.879	P	0.344	B	0.010	N	1.000	D	1.79	L	.	.	-0.678	T	0.162	T	0.763	3.129	16.46	5.92	2.270	2.499	12.755	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.739298	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	438	420	18	0
chr11	62563353	62563353	G	A	intronic	NXF1	NaN	NaN	NaN	rs539465	NaN	0.975439	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	49.203495	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	0	18	57
chr11	62567966	62567966	G	G	intronic	NXF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	63	50	0	0
chr11	62567969	62567969	T	T	intronic	NXF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	203	199	0	0
chr11	62569154	62569154	G	G	intronic	NXF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	46	45	0	0
chr11	62592045	62592045	A	G	intronic	STX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	25	6	19	0
chr11	62601032	62601032	T	A	intronic	WDR74	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	62623680	62623680	T	T	UTR5	SLC3A2	NM_002394:c.-62T>T,NM_001012664:c.-62T>T,NM_001012662:c.-62T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	6265196	6265196	C	A	exonic	CNGA4	NaN	nonsynonymous SNV	CNGA4:NM_001037329:exon6:c.C1285A:p.R429S	NaN	NaN	NaN	0	D	0.996	D	0.948	D	0.000	D	1.000	D	2.64	M	-4.11	D	1.070	D	0.935	D	0.919	4.301	22.5	5.19	2.706	1.226	17.495	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.053995	nearby_gap_events	REJECT	68	63	5	0
chr11	6265206	6265206	C	T	exonic	CNGA4	NaN	nonsynonymous SNV	CNGA4:NM_001037329:exon6:c.C1295T:p.A432V	NaN	NaN	NaN	0	D	0.988	D	0.928	D	0.000	D	1.000	D	3.375	M	-3.35	D	1.038	D	0.912	D	0.956	5.246	33	5.19	2.706	7.320	17.495	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.515395	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	69	64	5	0
chr11	62653123	62653123	A	A	intronic	SLC3A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	62677150	62677150	T	T	UTR3	CHRM1	NM_000738:c.*40A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	626940	626940	G	A	exonic	SCT	NaN	nonsynonymous SNV	SCT:NM_021920:exon2:c.C121T:p.R41W	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.995	D	.	.	1.000	N	1.995	M	1.47	T	-1.045	T	0.141	T	0.293	1.494	10.94	1.66	1.577	0.915	6.197	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2631578947368443	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr11	62744706	62744706	T	A	exonic	SLC22A6	NaN	synonymous SNV	SLC22A6:NM_004790:exon9:c.A1515T:p.P505P,SLC22A6:NM_153276:exon9:c.A1515T:p.P505P,SLC22A6:NM_153277:exon9:c.A1383T:p.P461P,SLC22A6:NM_153278:exon9:c.A1383T:p.P461P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.500149	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	33	28	5	1
chr11	62762279	62762279	T	C	intronic	SLC22A8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	13	4	6	0
chr11	62763678	62763678	A	G	intronic	SLC22A8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr11	62848943	62848943	T	T	intronic	SLC22A24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	62886825	62886825	A	C	intronic	SLC22A24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	24	16	8	0
chr11	62902172	62902172	A	C	exonic	SLC22A24	NaN	synonymous SNV	SLC22A24:NM_001136506:exon2:c.T471G:p.L157L,SLC22A24:NM_173586:exon2:c.T471G:p.L157L	rs1939782	NaN	0.991813	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	385.369988	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	124	0	124	58
chr11	63059192	63059192	A	G	intronic	SLC22A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr11	63138593	63138593	T	C	intronic	SLC22A9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	63175750	63175750	A	A	intronic	SLC22A9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr11	63273789	63273789	T	T	UTR5	LGALS12	NM_001142536:c.-76T>T,NM_033101:c.-76T>T,NM_001142535:c.-76T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	63276017	63276017	T	C	UTR5	LGALS12	NM_001142538:c.-56T>C,NM_001142537:c.-56T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.426637	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	330	323	7	0
chr11	63278042	63278042	A	A	intronic	LGALS12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	63278621	63278621	C	G	intronic	LGALS12	NaN	NaN	NaN	rs2239679	NaN	0.302316	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	195.847575	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	74	1	73	41
chr11	63307095	63307095	A	A	exonic	RARRES3	NaN	synonymous SNV	RARRES3:NM_004585:exon2:c.A117A:p.P39P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr11	63313644	63313644	T	C	exonic	RARRES3	NaN	synonymous SNV	RARRES3:NM_004585:exon4:c.T411C:p.V137V	rs584905	NaN	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	211.884987	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	73	1	72	57
chr11	6340706	6340706	A	G	exonic	PRKCDBP	NaN	nonsynonymous SNV	PRKCDBP:NM_145040:exon2:c.T473C:p.L158P	rs1051992	ID=COSM429498;OCCURENCE=1(breast),1(large_intestine)	0.527955	0.22	T	0.0	B	0.001	B	0.415	N	1.000	P	-0.805	N	0.21	T	-0.933	T	0.000	T	0.044	0.422	6.291	-3.56	-0.455	-1.174	3.969	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.107871	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	15	6	46
chr11	63410985	63410985	G	C	intronic	ATL3	NaN	NaN	NaN	rs12274980	NaN	0.188299	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.267692	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	8	15	13
chr11	6341365	6341365	C	T	exonic	PRKCDBP	NaN	synonymous SNV	PRKCDBP:NM_145040:exon1:c.G342A:p.G114G	rs11544764	ID=COSM429499;OCCURENCE=1(breast)	0.0864617	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.258194	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	10	11	8
chr11	6341748	6341748	C	T	upstream	PRKCDBP	NaN	NaN	NaN	rs1994519	NaN	0.525359	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.93669	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	15	22	50
chr11	63438836	63438836	C	T	UTR5	ATL3	NM_015459:c.-29G>A	NaN	NaN	rs2959880	NaN	0.135982	1	T	0.0	B	0.0	B	0.322	N	0.997	P	.	.	0.71	T	-1.065	T	0.000	T	0.101	-1.947	0.007	2.91	0.169	0.730	8.879	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	24.3435	32	NaN	NA	NA	6	2	4	8
chr11	63487117	63487117	T	C	exonic	RTN3	NaN	synonymous SNV	RTN3:NM_001265590:exon2:c.T807C:p.T269T,RTN3:NM_201428:exon2:c.T1086C:p.T362T,RTN3:NM_001265589:exon3:c.T1143C:p.T381T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.592743	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	372	349	23	0
chr11	63487118	63487118	A	T	exonic	RTN3	NaN	nonsynonymous SNV	RTN3:NM_001265590:exon2:c.A808T:p.S270C,RTN3:NM_201428:exon2:c.A1087T:p.S363C,RTN3:NM_001265589:exon3:c.A1144T:p.S382C	NaN	NaN	NaN	0	D	0.001	B	0.003	B	0.324	N	1.000	N	0.205	N	2.2	T	-1.035	T	0.027	T	0.086	0.511	6.772	3.68	1.122	2.004	4.405	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.11826	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	367	344	23	0
chr11	63532389	63532389	G	A	exonic	C11orf95	NaN	synonymous SNV	C11orf95:NM_001144936:exon3:c.C975T:p.A325A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	51	27	24	0
chr11	63532740	63532740	A	A	intronic	C11orf95	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	63532742	63532742	G	G	intronic	C11orf95	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	63533440	63533440	T	T	exonic	C11orf95	NaN	synonymous SNV	C11orf95:NM_001144936:exon2:c.A476A:p.E159E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	71	66	0	0
chr11	63636968	63636968	T	G	intronic	MARK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	63672679	63672679	A	T	intronic	MARK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	63675676	63675676	C	G	intronic	MARK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	102.991	0	17.451676	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	6	0	6	2
chr11	63679370	63679370	T	C	exonic	RCOR2	NaN	synonymous SNV	RCOR2:NM_173587:exon12:c.A1539G:p.G513G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	8.67694	0	8.177591	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	93	84	9	1
chr11	63679841	63679841	A	G	exonic	RCOR2	NaN	nonsynonymous SNV	RCOR2:NM_173587:exon11:c.T1193C:p.V398A	NaN	NaN	NaN	0.79	T	0.0	B	0.0	B	0.944	N	0.500	N	0.06	N	0.88	T	-0.932	T	0.043	T	0.092	0.293	5.584	-1.38	-0.232	-0.188	5.536	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	11	11	0	1
chr11	63682315	63682315	C	G	intronic	RCOR2	NaN	NaN	NaN	rs34212439	NaN	0.86262	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	89	NaN	NA	NA	46	1	45	45
chr11	63682318	63682318	G	C	intronic	RCOR2	NaN	NaN	NaN	rs11231638	NaN	0.789936	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	364.039	0	NaN	NA	NA	37	1	36	20
chr11	63682319	63682319	A	C	intronic	RCOR2	NaN	NaN	NaN	rs57942405	NaN	0.330272	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	115.18	0	NaN	NA	NA	66	39	27	19
chr11	63721907	63721907	C	T	exonic	NAA40	NaN	nonsynonymous SNV	NAA40:NM_001300800:exon8:c.C607T:p.H203Y,NAA40:NM_024771:exon8:c.C670T:p.H224Y	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.006	B	0.007	B	0.001	D	0.987	N	0	N	.	.	-1.006	T	0.066	T	0.221	3.250	16.90	4.68	2.429	4.126	16.547	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.27982	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	211	205	6	0
chr11	63742553	63742553	T	G	intronic	COX8A	NaN	NaN	NaN	rs11231664	NaN	0.173722	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	19	11	8	0
chr11	63756032	63756032	G	A	intronic	OTUB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	63756033	63756033	T	G	intronic	OTUB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr11	63756034	63756034	G	A	intronic	OTUB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	637622	637622	C	T	intronic	DRD4	NaN	NaN	NaN	rs752306	NaN	0.0794728	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.85683	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	11	10	5
chr11	63763981	63763981	G	C	intronic	OTUB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.403212	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	157	149	8	0
chr11	63764765	63764765	C	G	intronic	OTUB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.184104	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	84	75	9	0
chr11	63764786	63764786	C	C	intronic	OTUB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	91	82	0	0
chr11	63766962	63766962	C	A	intronic	MACROD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.245664	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	62	52	10	0
chr11	63767096	63767096	C	T	intronic	MACROD1	NaN	NaN	NaN	rs74751881	NaN	0.0609026	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	68.7233	0	NaN	NA	NA	21	8	13	1
chr11	63771452	63771452	C	T	intronic	MACROD1	NaN	NaN	NaN	rs492357	NaN	0.16873	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	63782228	63782228	T	G	intronic	MACROD1	NaN	NaN	NaN	rs500493	NaN	0.415935	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	63849353	63849353	G	T	intronic	MACROD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr11	63885846	63885846	A	A	UTR3	FLRT1	NM_013280:c.*82A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	63890322	63890322	T	T	intronic	MACROD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	63890326	63890326	T	T	intronic	MACROD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	63918531	63918531	T	G	intronic	MACROD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr11	63918532	63918532	T	C	intronic	MACROD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	63963290	63963290	T	G	intronic	STIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	1.0	D	0.98	D	.	.	1.000	N	.	.	-0.84	T	-0.547	T	0.393	T	0.332	2.535	14.44	-7.97	-1.977	-2.340	2.427	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.909443	nearby_gap_events	REJECT	251	234	17	0
chr11	63987552	63987552	T	C	intronic	FERMT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.473047	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	23	20	3	0
chr11	63992138	63992138	T	T	exonic	TRPT1	NaN	synonymous SNV	TRPT1:NM_001160393:exon4:c.A379A:p.M127M,TRPT1:NM_031472:exon4:c.A232A:p.M78M,TRPT1:NM_001033678:exon5:c.A379A:p.M127M,TRPT1:NM_001160389:exon5:c.A385A:p.M129M,TRPT1:NM_001160390:exon5:c.A379A:p.M127M,TRPT1:NM_001160392:exon5:c.A379A:p.M127M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	138	105	0	0
chr11	63997329	63997329	A	G	exonic	NUDT22	NaN	nonsynonymous SNV	NUDT22:NM_001128613:exon5:c.A680G:p.Q227R,NUDT22:NM_001271831:exon5:c.A680G:p.Q227R,NUDT22:NM_001128612:exon6:c.A779G:p.Q260R,NUDT22:NM_032344:exon6:c.A779G:p.Q260R	rs633561	NaN	0.94389	0.88	T	0.0	B	0.001	B	0.831	N	1.000	P	1.04	L	2.35	T	-0.987	T	0.000	T	0.075	1.205	9.895	-8.76	-2.544	-0.873	4.880	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	199.832194	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	75	0	75	57
chr11	63999827	63999827	T	T	intronic	DNAJC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr11	64002782	64002782	T	T	intronic	VEGFB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	14	0	0
chr11	64003575	64003575	C	G	intronic	VEGFB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	70	49	15	0
chr11	64010222	64010222	A	T	intronic	FKBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	64012225	64012225	G	C	UTR3	PPP1R14B	NM_138689:c.*1C>G	NaN	NaN	rs605187	NaN	0.953474	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.369409	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	2	5	50
chr11	64012672	64012672	T	T	intronic	PPP1R14B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	36	31	0	0
chr11	64012695	64012695	G	C	exonic	PPP1R14B	NaN	nonsynonymous SNV	PPP1R14B:NM_138689:exon2:c.C323G:p.A108G	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.224	B	0.091	B	0.062	U	0.999	N	0.345	N	.	.	-1.042	T	0.062	T	0.033	2.045	12.79	4.05	1.983	5.737	10.784	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	86.9472	0	NaN	NA	NA	19	6	13	7
chr11	64022935	64022935	C	T	intronic	PLCB3	NaN	NaN	NaN	rs374202960	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.639111	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	193	170	23	0
chr11	64029290	64029290	A	G	intronic	PLCB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	16.2257	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	64029292	64029292	T	TG	intronic	PLCB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	17.4053	0	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	64029294	64029294	T	A	intronic	PLCB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	15.979	20	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	64032780	64032780	A	T	splicing	PLCB3	NM_001184883:exon23:c.2642-2A>T,NM_000932:exon25:c.2843-2A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.693	18.76	5.2	1.978	6.362	11.441	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.7574	0	NaN	NA	NA	11	9	2	0
chr11	64033555	64033555	C	T	intronic	PLCB3	NaN	NaN	NaN	rs3815362	NaN	0.179912	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	184.187077	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	157	81	76	41
chr11	640349	640349	G	G	intronic	DRD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr11	64039057	64039057	T	T	intronic	BAD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	64055117	64055117	T	G	intronic	GPR137	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.159867	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	132	99	33	2
chr11	64056789	64056789	G	T	exonic	GPR137	NaN	nonsynonymous SNV	GPR137:NM_020155:exon7:c.G1206T:p.W402C,GPR137:NM_001170726:exon9:c.G1380T:p.W460C	NaN	NaN	NaN	0	D	0.932	P	0.321	B	0.388	N	0.957	D	0	N	0.8	T	-1.054	T	0.079	T	0.446	1.802	11.99	3.71	1.312	0.654	8.388	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	64056791	64056791	C	T	exonic	GPR137	NaN	nonsynonymous SNV	GPR137:NM_020155:exon7:c.C1208T:p.P403L,GPR137:NM_001170726:exon9:c.C1382T:p.P461L	NaN	NaN	NaN	0	D	0.001	B	0.001	B	0.177	N	0.996	N	0	N	0.82	T	-1.070	T	0.046	T	0.252	2.436	14.11	-2.88	-0.176	-0.588	1.531	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	64056792	64056792	G	T	exonic	GPR137	NaN	synonymous SNV	GPR137:NM_020155:exon7:c.G1209T:p.P403P,GPR137:NM_001170726:exon9:c.G1383T:p.P461P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr11	64066824	64066824	G	A	exonic	KCNK4	NaN	nonsynonymous SNV	KCNK4:NM_033310:exon7:c.G808A:p.G270S	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.997	D	0.921	D	0.001	U	1.000	D	0.805	L	2.47	T	-0.593	T	0.237	T	0.696	3.655	18.58	4.52	2.524	6.786	15.135	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.17500000000000135	NA	0	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr11	64066834	64066834	C	T	exonic	KCNK4	NaN	nonsynonymous SNV	KCNK4:NM_033310:exon7:c.C818T:p.A273V	NaN	NaN	NaN	0.03	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	0.805	L	2.22	T	-1.101	T	0.072	T	0.594	5.338	34	4.52	2.524	3.787	15.135	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1238390092879262	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr11	64066859	64066859	G	A	exonic	KCNK4	NaN	synonymous SNV	KCNK4:NM_033310:exon7:c.G843A:p.T281T	rs2232417	NaN	0.791733	0	D	0.043	B	0.005	B	.	.	0.393	P	.	.	.	.	-0.986	T	0.000	T	.	1.811	12.02	-9.03	-3.285	-2.551	2.941	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	57.1699	0	NaN	NA	NA	12	0	12	4
chr11	64071195	64071195	T	T	intronic	TEX40	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	64072195	64072195	A	A	UTR3	TEX40	NM_001039496:c.*77A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	64082697	64082697	C	T	exonic	ESRRA	NaN	stopgain	ESRRA:NM_001282450:exon6:c.C967T:p.R323X,ESRRA:NM_001282451:exon6:c.C964T:p.R322X,ESRRA:NM_004451:exon6:c.C967T:p.R323X	NaN	NaN	NaN	0.81	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	0.976	8.983	4.14	2.309	1.658	9.538	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.200539	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	47	44	3	0
chr11	64111928	64111928	T	C	exonic	CCDC88B	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC88B:NM_032251:exon14:c.T1915C:p.W639R	rs685870	ID=COSM429538;OCCURENCE=1(breast)	0.533746	0.58	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	0	N	2.05	T	-0.995	T	0.000	T	0.012	-0.453	1.901	-1.31	-0.307	-0.975	5.154	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1485.19	0	NaN	NA	NA	96	0	96	35
chr11	64118811	64118811	T	T	intronic	CCDC88B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	35	31	0	0
chr11	64118812	64118812	A	A	intronic	CCDC88B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	22	18	0	0
chr11	64120030	64120030	G	G	intronic	CCDC88B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr11	6412234	6412234	A	T	intronic	SMPD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr11	64122897	64122897	A	C	intronic	CCDC88B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.860295	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	234	216	18	0
chr11	64127744	64127744	A	G	exonic	RPS6KA4	NaN	synonymous SNV	RPS6KA4:NM_001006944:exon3:c.A237G:p.Q79Q,RPS6KA4:NM_001300802:exon3:c.A237G:p.Q79Q,RPS6KA4:NM_003942:exon3:c.A237G:p.Q79Q	rs521950	NaN	0.269569	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.470667	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	16	10	23
chr11	64127882	64127882	T	G	intronic	RPS6KA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.131196	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	225	214	11	2
chr11	64128423	64128423	G	T	intronic	RPS6KA4	NaN	NaN	NaN	rs516124	NaN	0.251797	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	180	112	68	25
chr11	64129532	64129532	C	A	intronic	RPS6KA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.655501	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	111	107	4	0
chr11	64132990	64132990	T	C	intronic	RPS6KA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	40	23	17	0
chr11	64135502	64135502	C	T	intronic	RPS6KA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.987926	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	83	75	8	0
chr11	64135638	64135638	A	G	exonic	RPS6KA4	NaN	nonsynonymous SNV	RPS6KA4:NM_001006944:exon10:c.A1106G:p.D369G,RPS6KA4:NM_001300802:exon10:c.A1106G:p.D369G,RPS6KA4:NM_003942:exon10:c.A1106G:p.D369G	NaN	NaN	NaN	0.24	T	0.002	B	0.003	B	0.000	D	0.982	D	-0.08	N	1.03	T	-0.991	T	0.115	T	0.535	1.250	10.07	4.73	1.772	5.779	7.069	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.886126	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	8	3	5	0
chr11	64138805	64138805	T	C	exonic	RPS6KA4	NaN	synonymous SNV	RPS6KA4:NM_001006944:exon17:c.T2154C:p.N718N,RPS6KA4:NM_001300802:exon17:c.T2151C:p.N717N,RPS6KA4:NM_003942:exon17:c.T2172C:p.N724N	rs11542299	NaN	0.252995	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	48.8695	0	NaN	NA	NA	16	8	8	23
chr11	6422935	6422935	A	C	intronic	APBB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	64274370	64274370	G	T	intergenic	LOC100996455,SLC22A11	dist=55242;dist=48728	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	642826	642826	T	A	intergenic	DRD4,DEAF1	dist=2121;dist=1394	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	46	30	16	0
chr11	642844	642844	G	G	intergenic	DRD4,DEAF1	dist=2139;dist=1376	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr11	642846	642846	G	G	intergenic	DRD4,DEAF1	dist=2141;dist=1374	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr11	642848	642848	T	T	intergenic	DRD4,DEAF1	dist=2143;dist=1372	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	642854	642854	A	A	intergenic	DRD4,DEAF1	dist=2149;dist=1366	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	6432369	6432369	A	T	exonic	APBB1	NaN	nonsynonymous SNV	APBB1:NM_001164:exon2:c.T209A:p.L70Q,APBB1:NM_145689:exon2:c.T209A:p.L70Q	NaN	NaN	NaN	0	D	0.966	D	0.653	P	0.003	N	1.000	N	0.345	N	2.42	T	-1.110	T	0.034	T	0.543	2.699	14.99	4.35	1.750	5.050	7.526	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.7231	0	NaN	NA	NA	36	32	5	2
chr11	64326547	64326547	C	C	intronic	SLC22A11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	64326548	64326548	G	C	intronic	SLC22A11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	64326753	64326753	A	C	intronic	SLC22A11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	25	16	9	0
chr11	64360432	64360432	A	A	intronic	SLC22A12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	64361324	64361324	T	T	intronic	SLC22A12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	64365944	64365944	G	C	intronic	SLC22A12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.090516	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	99	87	12	17
chr11	64368186	64368186	T	T	intronic	SLC22A12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	64383472	64383472	A	G	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	64383473	64383473	C	T	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	64383474	64383474	A	G	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	64383475	64383475	C	T	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	64383476	64383476	T	G	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	64383477	64383477	G	T	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	64383478	64383478	C	G	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	64383534	64383534	C	T	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	64395136	64395136	G	T	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	64415867	64415867	A	A	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	64419448	64419448	A	G	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	64419460	64419460	A	T	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	13	7	4	0
chr11	64419463	64419463	G	T	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	14	8	4	0
chr11	64421058	64421058	T	T	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	15	14	0	0
chr11	64421224	64421224	A	A	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	64428191	64428191	G	G	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	27	26	0	0
chr11	64435876	64435876	C	A	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	64435877	64435877	T	C	intronic	NRXN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	644675	644675	A	A	intronic	DEAF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	64496547	64496547	A	A	intronic	RASGRP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr11	64497406	64497406	A	A	intronic	RASGRP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	27	21	0	0
chr11	64504200	64504200	C	A	intronic	RASGRP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	17	16	1	0
chr11	64504413	64504413	TC	CG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	41.8536	47	NaN	NA	NA	9	3	6	9
chr11	64509763	64509763	G	T	intronic	RASGRP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	64510224	64510224	G	C	intronic	RASGRP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.042613	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	67	58	9	0
chr11	64520974	64520974	T	T	intronic	PYGM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	64521172	64521172	A	A	intronic	PYGM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	64522194	64522194	G	A	exonic	PYGM	NaN	nonsynonymous SNV	PYGM:NM_001164716:exon6:c.C706T:p.R236C,PYGM:NM_005609:exon8:c.C970T:p.R324C	NaN	NaN	NaN	0	D	0.992	D	0.748	P	0.001	D	1.000	D	2.94	M	-3.18	D	0.956	D	0.872	D	0.861	4.980	29.1	4.89	2.551	1.648	15.584	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.908427	nearby_gap_events	REJECT	174	166	8	0
chr11	64522349	64522349	G	C	intronic	PYGM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.163911	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	142	132	10	0
chr11	64524911	64524911	C	C	intronic	PYGM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	64525482	64525482	A	A	intronic	PYGM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr11	64529786	64529786	G	T	intergenic	PYGM,SF1	dist=1599;dist=2290	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr11	64533311	64533311	T	T	exonic	SF1	NaN	synonymous SNV	SF1:NM_001178031:exon13:c.A1821A:p.P607P,SF1:NM_004630:exon13:c.A1899A:p.P633P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	18	16	0	0
chr11	64535361	64535361	A	A	intronic	SF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	64563935	64563935	C	G	intronic	MAP4K2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	22.3275	0	9.650633	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	52	41	11	2
chr11	64565150	64565150	A	G	intronic	MAP4K2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	12	5	6	0
chr11	64568603	64568603	A	G	exonic	MAP4K2	NaN	synonymous SNV	MAP4K2:NM_004579:exon8:c.T510C:p.S170S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.076655	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	145	135	10	0
chr11	64572178	64572178	G	G	exonic	MEN1	NaN	synonymous SNV	MEN1:NM_000244:exon10:c.C1476C:p.S492S,MEN1:NM_130799:exon10:c.C1461C:p.S487S,MEN1:NM_130800:exon10:c.C1476C:p.S492S,MEN1:NM_130801:exon10:c.C1476C:p.S492S,MEN1:NM_130802:exon10:c.C1476C:p.S492S,MEN1:NM_130803:exon10:c.C1476C:p.S492S,MEN1:NM_130804:exon11:c.C1476C:p.S492S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	64575260	64575260	T	C	intronic	MEN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr11	6458656	6458656	T	G	intronic	HPX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr11	64594410	64594410	C	A	intronic	CDC42BPG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	64601366	64601366	T	T	intronic	CDC42BPG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	26	25	0	0
chr11	64602782	64602782	C	T	intronic	CDC42BPG	NaN	NaN	NaN	rs11605623	NaN	0.36222	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	39.336602	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	1	13	46
chr11	64603108	64603108	G	A	intronic	CDC42BPG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	10	9	1	0
chr11	64603544	64603544	G	G	intronic	CDC42BPG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr11	64604609	64604609	G	G	intronic	CDC42BPG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	64622016	64622016	G	T	exonic	EHD1	NaN	nonsynonymous SNV	EHD1:NM_006795:exon5:c.C1394A:p.A465D,EHD1:NM_001282445:exon6:c.C1436A:p.A479D,EHD1:NM_001282444:exon7:c.C1394A:p.A465D	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.009	B	0.018	B	0.000	D	1.000	D	0.51	N	1.78	T	-1.099	T	0.045	T	0.881	3.803	19.31	4.53	2.355	9.550	14.799	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	25.0174	0	NaN	NA	NA	134	110	24	9
chr11	64641955	64641955	T	G	exonic	EHD1	NaN	nonsynonymous SNV	EHD1:NM_006795:exon2:c.A440C:p.D147A,EHD1:NM_001282445:exon3:c.A482C:p.D161A,EHD1:NM_001282444:exon4:c.A440C:p.D147A	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.066	B	0.099	B	0.000	D	1.000	D	1.025	L	0.95	T	0.518	D	0.784	D	0.357	3.627	18.45	4.58	2.061	7.577	12.222	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	7.312577976082171E-5	NA	0	0	NaN	NA	NA	211	157	54	1
chr11	64645509	64645509	C	C	intronic	EHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	67	56	0	0
chr11	64669588	64669588	CCA	CGA,GAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	377.859	0	NaN	NA	NA	117	38	22	0
chr11	64669590	64669590	A	A	exonic	ATG2A	NaN	synonymous SNV	ATG2A:NM_015104:exon29:c.T3963T:p.S1321S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	117	88	0	0
chr11	64670259	64670259	A	C	intronic	ATG2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	16	5	11	0
chr11	64670767	64670767	C	G	exonic	ATG2A	NaN	nonsynonymous SNV	ATG2A:NM_015104:exon26:c.G3605C:p.G1202A	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.199	B	0.061	B	0.032	N	0.994	D	1.495	L	3.06	T	-1.005	T	0.018	T	0.273	2.504	14.33	1.78	0.164	1.563	4.578	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.90468	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	84	73	11	0
chr11	64674026	64674026	C	G	intronic	ATG2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.471366	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	138	119	19	0
chr11	64678485	64678485	T	C	intronic	ATG2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.134094	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	34	31	3	0
chr11	64681656	64681656	G	T	exonic	ATG2A	NaN	nonsynonymous SNV	ATG2A:NM_015104:exon3:c.C384A:p.S128R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	2.65	M	0.41	T	-0.490	T	0.310	T	0.574	3.831	19.46	3.16	1.089	3.183	6.359	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.671497	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	56	53	3	0
chr11	64699361	64699361	G	A	intronic	PPP2R5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.998655	nearby_gap_events	REJECT	259	243	16	0
chr11	64700807	64700807	A	G	intronic	PPP2R5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	3	2	0
chr11	64757360	64757360	A	A	intronic	BATF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	64786298	64786298	A	A	ncRNA_intronic	ARL2-SNX15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr11	6478668	6478668	C	G	exonic	TRIM3	NaN	nonsynonymous SNV	TRIM3:NM_001248007:exon4:c.G197C:p.G66A,TRIM3:NM_001248006:exon5:c.G554C:p.G185A,TRIM3:NM_033278:exon5:c.G554C:p.G185A,TRIM3:NM_006458:exon6:c.G554C:p.G185A	NaN	NaN	NaN	0.68	T	0.008	B	0.017	B	0.000	D	0.999	D	0	N	1.07	T	-0.829	T	0.221	T	0.163	2.575	14.57	4.13	2.402	5.289	4.022	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	77	36	41	0
chr11	6479344	6479344	A	G	exonic	TRIM3	NaN	nonsynonymous SNV	TRIM3:NM_001248006:exon3:c.T314C:p.L105P,TRIM3:NM_033278:exon3:c.T314C:p.L105P,TRIM3:NM_006458:exon4:c.T314C:p.L105P	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.0	B	0.001	B	0.000	D	1.000	D	0.345	N	0.35	T	-1.049	T	0.093	T	0.616	2.103	12.99	5.33	2.028	4.859	12.682	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.65132	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	68	59	9	0
chr11	6479345	6479345	G	A	exonic	TRIM3	NaN	nonsynonymous SNV	TRIM3:NM_001248006:exon3:c.C313T:p.L105F,TRIM3:NM_033278:exon3:c.C313T:p.L105F,TRIM3:NM_006458:exon4:c.C313T:p.L105F	NaN	NaN	NaN	0.71	T	0.545	P	0.222	B	0.000	D	1.000	D	0.345	N	0.33	T	-1.003	T	0.107	T	0.202	2.232	13.42	5.33	2.507	3.689	15.753	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.900053	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	68	59	9	0
chr11	64802503	64802503	C	T	ncRNA_intronic	ARL2-SNX15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.651114	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	225	210	15	0
chr11	64807294	64807294	G	A	ncRNA_exonic	ARL2-SNX15	NaN	NaN	NaN	rs653111	NaN	0.366214	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.797621	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	27	20	41
chr11	64809441	64809441	C	T	intronic	SAC3D1	NaN	NaN	NaN	rs3862374	NaN	0.353235	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	22.9963	0	NaN	NA	NA	45	26	19	23
chr11	64815219	64815219	A	A	intronic	NAALADL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	64820283	64820283	C	T	intronic	NAALADL1	NaN	NaN	NaN	rs566221	NaN	0.394768	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr11	64825687	64825687	G	A	exonic	NAALADL1	NaN	nonsynonymous SNV	NAALADL1:NM_005468:exon2:c.C221T:p.P74L	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.077	B	0.043	B	0.012	N	0.923	D	2.045	M	0.93	T	-1.019	T	0.088	T	0.333	1.806	12.00	1.21	0.468	1.901	2.667	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.317625	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	21	15	6	0
chr11	64846764	64846764	G	A	intronic	CDCA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	0.62	T	-0.956	T	0.129	T	0.209	1.672	11.55	2.64	0.530	0.191	5.427	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	68	38	20	0
chr11	64846765	64846765	C	G	intronic	CDCA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	31	22	9	0
chr11	64855850	64855850	T	T	UTR3	TMEM262,ZFPL1	NM_001242631:c.*51A>A,NM_001282448:c.*77A>A;NM_006782:c.*264T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	64863828	64863828	A	A	exonic	VPS51	NaN	synonymous SNV	VPS51:NM_013265:exon1:c.A106A:p.M36M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr11	64876668	64876668	G	C	intronic	VPS51	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.006373159671591886	NA	0	0	NaN	NA	NA	41	25	16	0
chr11	64876997	64876997	A	A	intronic	VPS51	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	64878100	64878100	G	A	intronic	VPS51	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	37	25.28878	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	44	29	15	0
chr11	64880090	64880090	G	C	exonic	TM7SF2	NaN	synonymous SNV	TM7SF2:NM_001277233:exon2:c.G156C:p.P52P,TM7SF2:NM_003273:exon2:c.G156C:p.P52P	rs4930284	NaN	0.996406	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.272024	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	13
chr11	64880756	64880756	G	T	exonic	TM7SF2	NaN	synonymous SNV	TM7SF2:NM_001277233:exon4:c.G369T:p.L123L,TM7SF2:NM_003273:exon4:c.G369T:p.L123L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.17786561264821815	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr11	64888525	64888525	A	C	intronic	FAU	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	64889343	64889343	A	A	intronic	FAU	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	64895715	64895715	T	T	UTR3	SYVN1	NM_032431:c.*139A>A,NM_172230:c.*139A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	64898255	64898255	T	T	exonic	SYVN1	NaN	synonymous SNV	SYVN1:NM_032431:exon11:c.A982A:p.T328T,SYVN1:NM_172230:exon11:c.A982A:p.T328T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr11	64938784	64938784	T	C	intronic	SPDYC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr11	64973076	64973076	T	T	intronic	CAPN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	64975909	64975909	G	T	intronic	CAPN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	64978367	64978367	G	T	intronic	CAPN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.656965	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	78	70	8	0
chr11	64978648	64978648	G	A	intronic	CAPN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.02077	0	NaN	NA	NA	17	16	2	0
chr11	64978865	64978865	A	A	UTR3	CAPN1	NM_001198868:c.*108A>A,NM_001198869:c.*108A>A,NM_005186:c.*108A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	64985125	64985125	C	G	exonic	SLC22A20	NaN	nonsynonymous SNV	SLC22A20:NM_001004326:exon3:c.C605G:p.T202S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	23.6361	0	10.331608	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	7	3	4	0
chr11	6498937	6498937	G	T	intronic	ARFIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.762583	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	72	65	7	0
chr11	6499130	6499130	G	A	intronic	ARFIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.609788	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	184	175	9	0
chr11	64992917	64992917	T	T	intronic	SLC22A20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	64993319	64993319	T	G	UTR3	SLC22A20	NM_001004326:c.*152T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.42424242424242303	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr11	6501364	6501364	A	G	intronic	ARFIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	6502868	6502868	A	G	intronic	TIMM10B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	65043349	65043349	T	C	intronic	POLA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.32881	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	70	61	9	0
chr11	65047183	65047183	A	A	intronic	POLA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	65063267	65063267	G	A	intronic	POLA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.276133	clustered_read_position	REJECT	224	213	11	0
chr11	65063491	65063491	A	G	intronic	POLA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.075336	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	95	88	7	0
chr11	65064547	65064547	T	G	intronic	POLA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	65064690	65064690	G	A	exonic	POLA2	NaN	nonsynonymous SNV	POLA2:NM_002689:exon18:c.G1747A:p.G583R	rs487989	NaN	0.15016	0.41	T	0.474	P	0.039	B	0.709	N	1.000	P	1.845	L	1.9	T	-1.024	T	0.000	T	0.047	2.042	12.79	-0.784	0.040	0.736	1.044	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	53.460989	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	12	21	9
chr11	65144444	65144444	A	A	exonic	SLC25A45	NaN	synonymous SNV	SLC25A45:NM_001278250:exon4:c.T371T:p.V124V,SLC25A45:NM_001300820:exon4:c.T257T:p.V86V,SLC25A45:NM_001077241:exon5:c.T317T:p.V106V,SLC25A45:NM_182556:exon6:c.T443T:p.V148V,SLC25A45:NM_001278251:exon9:c.T317T:p.V106V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	72	59	0	0
chr11	65144445	65144445	C	G	exonic	SLC25A45	NaN	nonsynonymous SNV	SLC25A45:NM_001278250:exon4:c.G370C:p.V124L,SLC25A45:NM_001300820:exon4:c.G256C:p.V86L,SLC25A45:NM_001077241:exon5:c.G316C:p.V106L,SLC25A45:NM_182556:exon6:c.G442C:p.V148L,SLC25A45:NM_001278251:exon9:c.G316C:p.V106L	NaN	NaN	NaN	0.81	T	0.035	B	0.028	B	0.247	N	0.994	N	-0.12	N	-1.11	T	-0.877	T	0.114	T	0.079	-0.494	1.730	-6.6	-0.811	-2.174	1.05	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.123728	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	78	68	10	0
chr11	65144446	65144446	G	C	exonic	SLC25A45	NaN	synonymous SNV	SLC25A45:NM_001278250:exon4:c.C369G:p.P123P,SLC25A45:NM_001300820:exon4:c.C255G:p.P85P,SLC25A45:NM_001077241:exon5:c.C315G:p.P105P,SLC25A45:NM_182556:exon6:c.C441G:p.P147P,SLC25A45:NM_001278251:exon9:c.C315G:p.P105P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.08063241106719234	NA	0	0	NaN	NA	NA	20	12	8	0
chr11	65144449	65144449	C	G	exonic	SLC25A45	NaN	synonymous SNV	SLC25A45:NM_001278250:exon4:c.G366C:p.G122G,SLC25A45:NM_001300820:exon4:c.G252C:p.G84G,SLC25A45:NM_001077241:exon5:c.G312C:p.G104G,SLC25A45:NM_182556:exon6:c.G438C:p.G146G,SLC25A45:NM_001278251:exon9:c.G312C:p.G104G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.44582	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	74	62	12	0
chr11	65146788	65146788	G	A	intronic	SLC25A45	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	65146793	65146793	A	G	intronic	SLC25A45	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr11	65149514	65149514	A	A	UTR5	SLC25A45	NM_001278250:c.-92T>T,NM_001300820:c.-92T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	65156653	65156653	T	T	intronic	FRMD8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	65161908	65161908	T	C	intronic	FRMD8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	21	7.736785		KEEP	8	5	3	0
chr11	65164357	65164357	C	T	exonic	FRMD8	NaN	synonymous SNV	FRMD8:NM_001300832:exon6:c.C501T:p.A167A,FRMD8:NM_001300833:exon6:c.C567T:p.A189A,FRMD8:NM_031904:exon7:c.C669T:p.A223A	rs12417665	NaN	0.142772	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	127.525	0	36.822759	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	14
chr11	65168095	65168095	T	T	intronic	FRMD8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	65185462	65185462	G	C	intergenic	FRMD8,NEAT1	dist=4467;dist=4807	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	65185465	65185465	G	T	intergenic	FRMD8,NEAT1	dist=4470;dist=4804	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	65185469	65185469	A	C	intergenic	FRMD8,NEAT1	dist=4474;dist=4800	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	6520164	6520164	T	A	exonic	DNHD1	NaN	nonsynonymous SNV	DNHD1:NM_173589:exon2:c.T719A:p.V240E,DNHD1:NM_144666:exon3:c.T719A:p.V240E	rs2555158	NaN	0.488419	0.68	T	0.0	B	0.0	B	0.757	N	1.000	P	-1.79	N	2.91	T	-0.962	T	0.000	T	0.114	-0.638	1.182	-1.25	-0.418	0.377	0.770	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	179.658378	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	0	60	50
chr11	65293586	65293586	T	G	intronic	SCYL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	138	81	54	0
chr11	65293938	65293938	T	C	intronic	SCYL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.07415	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	45	41	4	0
chr11	65298939	65298939	G	G	intronic	SCYL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	6530240	6530240	C	G	exonic	DNHD1	NaN	nonsynonymous SNV	DNHD1:NM_173589:exon4:c.C1051G:p.H351D,DNHD1:NM_144666:exon5:c.C1051G:p.H351D	NaN	NaN	NaN	0.34	T	0.001	B	0.002	B	0.889	N	0.994	N	-0.095	N	2.54	T	-0.992	T	0.020	T	0.538	1.402	10.62	3.44	1.267	1.322	12.650	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.371165	clustered_read_position	REJECT	34	30	4	0
chr11	65305244	65305244	T	T	intronic	SCYL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	65305767	65305767	C	C	exonic	SCYL1	NaN	synonymous SNV	SCYL1:NM_001048218:exon17:c.C2223C:p.D741D,SCYL1:NM_020680:exon17:c.C2274C:p.D758D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	77	NaN	NA	NA	63	58	0	0
chr11	65306538	65306538	G	A	UTR3	LTBP3	NM_001164266:c.*13C>T,NM_021070:c.*13C>T,NM_001130144:c.*13C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.263047	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	14	12	2	0
chr11	65310526	65310526	T	G	intronic	LTBP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	65310527	65310527	T	C	intronic	LTBP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	65314902	65314902	C	T	intronic	LTBP3	NaN	NaN	NaN	rs74202491	NaN	0.0632987	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.937288	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	10	17	7
chr11	65315347	65315347	C	T	intronic	LTBP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	23	14	9	0
chr11	65319751	65319751	G	A	exonic	LTBP3	NaN	nonsynonymous SNV	LTBP3:NM_001130144:exon7:c.C1313T:p.A438V,LTBP3:NM_001164266:exon7:c.C962T:p.A321V,LTBP3:NM_021070:exon7:c.C1313T:p.A438V	rs11545200	NaN	0.0628994	0.16	T	0.997	D	0.748	P	0.016	N	0.080	P	0.345	N	-3.02	D	-0.214	T	0.147	T	0.24	3.736	18.97	3.99	2.064	1.747	13.613	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.735732	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	17	6	5
chr11	6532710	6532710	A	A	intronic	DNHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	65338034	65338034	A	G	UTR5	SSSCA1	NM_001303024:c.-133A>G	NaN	NaN	rs1151496	NaN	0.298522	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	72.656774	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	0	26	21
chr11	65340811	65340811	A	A	intronic	FAM89B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	44	36	0	0
chr11	65341116	65341116	G	C	UTR3	FAM89B	NM_001098784:c.*119G>C,NM_001098785:c.*4G>C,NM_152832:c.*4G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	2.3889696020637556E-4	NA	0	0	NaN	NA	NA	83	62	21	0
chr11	65341141	65341141	A	A	UTR3	FAM89B	NM_001098784:c.*144A>A,NM_001098785:c.*29A>A,NM_152832:c.*29A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	65346782	65346782	T	G,TG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	142.489	0	NaN	NA	NA	27	3	17	0
chr11	65349677	65349677	A	G	exonic	EHBP1L1	NaN	nonsynonymous SNV	EHBP1L1:NM_001099409:exon9:c.A1534G:p.R512G	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.007	B	0.003	B	0.002	N	1.000	N	1.04	L	-0.23	T	-0.971	T	0.139	T	0.431	2.599	14.65	1.38	0.815	0.587	1.215	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.240815	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	121	115	6	0
chr11	65352017	65352017	T	G	intronic	EHBP1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.687737	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	155	144	11	0
chr11	65354197	65354197	G	T	intronic	EHBP1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	65357193	65357193	C	T	intronic	EHBP1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.300159	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	59	56	3	0
chr11	65357672	65357672	A	G	exonic	EHBP1L1	NaN	nonsynonymous SNV	EHBP1L1:NM_001099409:exon15:c.A4174G:p.M1392V	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.999	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	2.645	M	0.97	T	-0.548	T	0.255	T	0.667	3.312	17.14	4.36	1.849	4.777	9.903	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.653547	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	107	102	5	0
chr11	65358089	65358089	A	A	intronic	EHBP1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	65363275	65363275	G	A	UTR5	KCNK7	NM_005714:c.-32C>T,NM_033455:c.-32C>T,NM_033348:c.-32C>T,NM_033347:c.-32C>T	NaN	NaN	rs3814752	NaN	0.17512	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.346502	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	3	4	14
chr11	65364247	65364247	A	A	upstream;downstream	KCNK7;MAP3K11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	65366240	65366240	T	C	intronic	MAP3K11	NaN	NaN	NaN	rs7932616	NaN	0.161342	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	19	11	8	0
chr11	65367253	65367253	C	T	intronic	MAP3K11	NaN	NaN	NaN	rs4326800	NaN	0.133387	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.502514	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	5	14	24
chr11	65367264	65367264	A	T	intronic	MAP3K11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.694268	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	17	14	3	0
chr11	65373395	65373395	T	T	intronic	MAP3K11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	78	NaN	NA	NA	123	107	0	0
chr11	65373589	65373589	A	A	intronic	MAP3K11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	65385606	65385606	A	G	exonic	PCNXL3	NaN	nonsynonymous SNV	PCNXL3:NM_032223:exon6:c.A773G:p.Q258R	rs1151489	NaN	0.996206	0.7	T	0.0	B	0.0	B	0.666	N	1.000	P	0	N	3.34	T	-1.006	T	0.000	T	0.01	-0.814	0.639	3.04	0.553	2.698	5.409	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	66.474302	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	0	24	56
chr11	65385626	65385626	A	G	exonic	PCNXL3	NaN	nonsynonymous SNV	PCNXL3:NM_032223:exon6:c.A793G:p.R265G	NaN	NaN	NaN	0.39	T	0.652	P	0.112	B	0.001	D	0.912	N	0.55	N	3.14	T	-0.986	T	0.011	T	0.733	3.177	16.63	4.01	1.917	1.471	8.095	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.029996	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	24	21	3	0
chr11	65385822	65385822	C	G	exonic	PCNXL3	NaN	nonsynonymous SNV	PCNXL3:NM_032223:exon6:c.C989G:p.P330R	NaN	NaN	NaN	0.46	T	0.005	B	0.01	B	0.754	N	1.000	N	0	N	5.54	T	-0.923	T	0.002	T	0.116	0.773	8.085	-2.05	0.017	0.380	8.277	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	65	40	25	8
chr11	65388259	65388259	G	A	intronic	PCNXL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.164069	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	39	31	8	0
chr11	65393369	65393369	C	T	intronic	PCNXL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.158261	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	39	29	10	0
chr11	65393370	65393370	T	G	intronic	PCNXL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.468922	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	39	29	10	0
chr11	65394320	65394320	T	C	intronic	PCNXL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	18	9	8	0
chr11	65397783	65397783	T	T	intronic	PCNXL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	23	21	0	0
chr11	65402062	65402062	T	C	exonic	PCNXL3	NaN	synonymous SNV	PCNXL3:NM_032223:exon29:c.T4755C:p.C1585C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.272829	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	187	180	7	0
chr11	65403032	65403032	C	A	exonic	PCNXL3	NaN	synonymous SNV	PCNXL3:NM_032223:exon32:c.C5217A:p.A1739A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	6541370	6541370	C	T	UTR3	DNHD1	NM_173589:c.*29C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.388399	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	247	227	20	0
chr11	65414009	65414009	G	T	exonic	SIPA1	NaN	nonsynonymous SNV	SIPA1:NM_006747:exon8:c.G1504T:p.D502Y,SIPA1:NM_153253:exon8:c.G1504T:p.D502Y	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.998	D	0.969	D	0.041	U	0.860	D	1.2	L	-3.59	D	0.843	D	0.831	D	0.525	3.434	17.62	3.39	0.936	4.238	10.233	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.812788		KEEP	58	53	5	0
chr11	65415028	65415028	T	G	exonic	SIPA1	NaN	synonymous SNV	SIPA1:NM_006747:exon9:c.T2205G:p.T735T,SIPA1:NM_153253:exon9:c.T2205G:p.T735T	rs4930157	NaN	0.996406	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.228029	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	6
chr11	6541637	6541637	A	G	UTR3	DNHD1	NM_173589:c.*296A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	10	4	4	0
chr11	65417434	65417434	G	A	exonic	SIPA1	NaN	synonymous SNV	SIPA1:NM_006747:exon13:c.G2760A:p.A920A,SIPA1:NM_153253:exon13:c.G2760A:p.A920A	rs746429	NaN	0.236422	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	198	120	78	32
chr11	65418246	65418246	A	A	UTR3	SIPA1	NM_006747:c.*60A>A,NM_153253:c.*60A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	65423524	65423524	C	G	intronic	RELA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	65481166	65481166	T	C	intronic	KAT5	NaN	NaN	NaN	rs1151500	NaN	0.804912	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	225.054393	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	74	0	74	58
chr11	65486697	65486697	G	C	UTR3	KAT5,RNASEH2C	NM_001206833:c.*45G>C,NM_182709:c.*45G>C,NM_006388:c.*45G>C,NM_182710:c.*45G>C;NM_032193:c.*557C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.049920299498400315	NA	0	0	NaN	NA	NA	34	27	7	0
chr11	65547161	65547161	C	G	exonic	AP5B1	NaN	nonsynonymous SNV	AP5B1:NM_138368:exon2:c.G803C:p.R268P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.524667	nearby_gap_events	REJECT	41	30	11	0
chr11	65547162	65547162	G	C	exonic	AP5B1	NaN	nonsynonymous SNV	AP5B1:NM_138368:exon2:c.C802G:p.R268G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.713865	nearby_gap_events	REJECT	41	30	11	0
chr11	6555318	6555318	G	A	exonic	DNHD1	NaN	synonymous SNV	DNHD1:NM_144666:exon14:c.G2913A:p.E971E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.8872	0	NaN	NA	NA	496	437	60	4
chr11	65554716	65554716	T	T	UTR5	OVOL1	NM_004561:c.-129T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr11	65561468	65561468	C	T	intronic	OVOL1	NaN	NaN	NaN	rs644740	NaN	0.449281	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	77.879849	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	49	18	31	31
chr11	65562450	65562450	T	T	intronic	OVOL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	16	16	0	0
chr11	65562825	65562825	C	T	UTR3	OVOL1	NM_004561:c.*13C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.529547	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	113	98	15	0
chr11	6560053	6560053	A	A	intronic	DNHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	65617324	65617324	A	G	intronic	SNX32	NaN	NaN	NaN	rs654638	NaN	0.141973	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	113.51279	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	78	28	50	15
chr11	65618229	65618229	T	G	exonic	SNX32	NaN	nonsynonymous SNV	SNX32:NM_152760:exon6:c.T506G:p.V169G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.98	D	0.361	B	0.108	N	1.000	D	2.32	M	2.1	T	-1.085	T	0.058	T	0.774	2.538	14.45	3.56	0.835	5.451	8.272	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	28	27	1	0
chr11	65618230	65618230	C	T	exonic	SNX32	NaN	synonymous SNV	SNX32:NM_152760:exon6:c.C507T:p.V169V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	40	40	0	0
chr11	65618232	65618232	G	C	exonic	SNX32	NaN	nonsynonymous SNV	SNX32:NM_152760:exon6:c.G509C:p.R170P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.47	P	0.07	B	0.009	N	1.000	D	2.835	M	1.96	T	-0.960	T	0.068	T	0.792	3.127	16.45	3.53	1.071	6.545	12.043	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr11	65620883	65620883	A	A	UTR3	SNX32	NM_152760:c.*77A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	65623656	65623656	G	A	exonic	CFL1	NaN	nonsynonymous SNV	CFL1:NM_005507:exon2:c.C61T:p.R21C	NaN	NaN	NaN	0.2	T	0.143	B	0.141	B	0.000	D	1.000	D	1.485	L	-1.71	D	-0.559	T	0.389	T	0.449	2.661	14.86	2.24	0.678	0.569	7.084	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.833141	nearby_gap_events	REJECT	192	184	8	0
chr11	65628334	65628334	G	A	exonic	MUS81	NaN	nonsynonymous SNV	MUS81:NM_025128:exon1:c.G110A:p.R37H	rs13817	NaN	0.427915	0.12	T	0.999	D	0.813	P	0.001	D	0.000	P	1.905	M	0.84	T	-0.948	T	0.000	T	0.216	3.349	17.28	3.44	1.277	0.876	6.787	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.704038	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	0	15	16
chr11	65630698	65630698	T	G	intronic	MUS81	NaN	NaN	NaN	rs538394	NaN	0.430112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	688.015	0	NaN	NA	NA	42	0	42	37
chr11	65631973	65631973	G	A	exonic	MUS81	NaN	synonymous SNV	MUS81:NM_025128:exon11:c.G1065A:p.R355R	rs630303	ID=COSM1179750;OCCURENCE=1(prostate)	0.429912	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-0.943	T	0.000	T	.	-0.321	2.473	-0.587	-0.290	-0.241	9.883	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	110.063967	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	1	39	50
chr11	65632825	65632825	A	G	intronic	MUS81	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	65633219	65633219	C	T	intronic	MUS81	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.186306	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	127	116	11	0
chr11	65633575	65633575	A	A	UTR3	MUS81	NM_025128:c.*52A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	65635998	65635998	G	T	exonic	EFEMP2	NaN	nonsynonymous SNV	EFEMP2:NM_016938:exon8:c.C830A:p.A277D	NaN	NaN	NaN	0.98	T	0.801	P	0.412	B	0.009	N	0.974	D	0.07	N	-1.16	T	-0.415	T	0.329	T	0.175	0.692	7.694	4.25	2.420	4.331	7.261	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	40	17	23	4
chr11	65636053	65636053	T	C	exonic	EFEMP2	NaN	nonsynonymous SNV	EFEMP2:NM_016938:exon8:c.A775G:p.I259V	rs601314	NaN	0.894569	1	T	0.0	B	0.001	B	0.018	N	1.000	P	-0.515	N	-1.1	T	-0.945	T	0.000	T	0.045	-0.106	3.482	1.9	0.610	0.543	3.603	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.374591	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	57
chr11	65639374	65639374	C	T	intronic	EFEMP2	NaN	NaN	NaN	rs2234458	NaN	0.565296	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.448272	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	48
chr11	65647386	65647386	G	A	exonic	CTSW	NaN	nonsynonymous SNV	CTSW:NM_001335:exon1:c.G61A:p.G21S	NaN	NaN	NaN	0.23	T	0.079	B	0.025	B	0.004	N	1.000	N	1.04	L	2.35	T	-0.949	T	0.227	T	0.358	3.215	16.77	2.2	0.599	0.149	4.965	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.754857	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	157	137	20	0
chr11	65649546	65649546	T	G	intronic	CTSW	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	19	12	7	0
chr11	65650190	65650190	T	C	intronic	CTSW	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.747701	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	450	441	9	0
chr11	65650470	65650470	T	G	intronic	CTSW	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.575159	nearby_gap_events	REJECT	135	126	9	0
chr11	65650471	65650471	G	G	intronic	CTSW	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	98	NaN	NA	NA	138	116	0	0
chr11	65650910	65650910	T	T	intronic	CTSW	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	63	49	0	0
chr11	65651138	65651138	G	A	UTR3	CTSW	NM_001335:c.*49G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.576348	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	74	70	4	0
chr11	65651280	65651280	T	T	UTR3	FIBP	NM_004214:c.*165A>A,NM_198897:c.*165A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	65651281	65651281	C	C	UTR3	FIBP	NM_004214:c.*164G>G,NM_198897:c.*164G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	6565294	6565294	T	T	intronic	DNHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	65658862	65658862	G	T	exonic	CCDC85B	NaN	stoploss	CCDC85B:NM_006848:exon1:c.G608T:p.X203L	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.101	12.98	3.77	2.109	4.376	7.332	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.465972	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	125	117	8	0
chr11	65660518	65660518	T	G	exonic	FOSL1	NaN	nonsynonymous SNV	FOSL1:NM_001300857:exon2:c.A349C:p.T117P,FOSL1:NM_001300844:exon3:c.A547C:p.T183P,FOSL1:NM_001300856:exon3:c.A457C:p.T153P,FOSL1:NM_005438:exon4:c.A655C:p.T219P	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.994	D	0.865	P	0.000	D	1.000	D	1.1	L	-1.12	T	-0.123	T	0.450	T	0.487	3.514	17.95	4.96	1.852	2.686	12.603	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	28	14	14	45
chr11	65684896	65684896	G	C	UTR3	C11orf68	NM_001135635:c.*34C>G,NM_031450:c.*34C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	21	17	4	0
chr11	65687662	65687662	G	G	intronic	DRAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	65687663	65687663	C	C	intronic	DRAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	65714532	65714532	C	G	intronic	TSGA10IP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.06324635117204747	NA	0	0	11.807001	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	22	14	8	0
chr11	65715412	65715412	G	C	intronic	TSGA10IP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr11	65715413	65715413	C	C	intronic	TSGA10IP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	35	29	0	0
chr11	65721176	65721176	T	G	exonic	TSGA10IP	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.968113	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	88	79	9	0
chr11	65735174	65735174	G	C	exonic	SART1	NaN	nonsynonymous SNV	SART1:NM_005146:exon12:c.G1454C:p.G485A	rs660118	NaN	0.366214	0	D	0.271	B	0.054	B	0.030	N	0.005	P	1.445	L	2.0	T	-0.959	T	0.000	T	0.083	0.436	6.367	4.17	1.090	-0.229	11.238	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	22	10.232518	normal_lod	REJECT	7	3	4	22
chr11	65746584	65746584	C	T	UTR3	SART1	NM_005146:c.*83C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	65746585	65746585	A	C	UTR3	SART1	NM_005146:c.*84A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	65767853	65767853	T	C	exonic	EIF1AD	NaN	nonsynonymous SNV	EIF1AD:NM_001242481:exon2:c.A8G:p.Q3R,EIF1AD:NM_001242482:exon2:c.A8G:p.Q3R,EIF1AD:NM_001242483:exon2:c.A8G:p.Q3R,EIF1AD:NM_001242484:exon2:c.A8G:p.Q3R,EIF1AD:NM_001242485:exon2:c.A8G:p.Q3R,EIF1AD:NM_001242486:exon2:c.A8G:p.Q3R,EIF1AD:NM_032325:exon2:c.A8G:p.Q3R	rs201150583	NaN	0.000199681	1	T	0.012	B	0.007	B	0.000	D	1.000	D	-0.445	N	1.07	T	-1.045	T	0.042	T	0.458	2.446	14.14	5.09	1.927	3.924	12.837	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.653546	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	170	164	6	0
chr11	65770884	65770884	G	T	intronic	BANF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.196177	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	126	112	14	0
chr11	65771208	65771208	G	C	exonic	BANF1	NaN	nonsynonymous SNV	BANF1:NM_001143985:exon3:c.G235C:p.G79R,BANF1:NM_003860:exon3:c.G235C:p.G79R	NaN	NaN	NaN	0.28	T	0.657	P	0.196	B	0.000	D	1.000	D	.	.	0.61	T	-1.035	T	0.101	T	0.54	0.866	8.511	4.91	2.575	3.934	15.648	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.565976	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	67	54	13	0
chr11	65780307	65780307	G	T	exonic	CST6	NaN	nonsynonymous SNV	CST6:NM_001323:exon2:c.G251T:p.G84V	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	3.42	M	1.78	T	-0.552	T	0.216	T	0.894	3.974	20.3	4.75	1.398	5.010	10.538	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.013287984939055227	NA	0	0	NaN	NA	NA	178	136	42	1
chr11	65784679	65784679	G	G	intronic	CATSPER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr11	65784680	65784680	C	G	intronic	CATSPER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr11	65788072	65788072	C	T	exonic	CATSPER1	NaN	nonsynonymous SNV	CATSPER1:NM_053054:exon7:c.G1954A:p.V652I	rs3814747	NaN	0.936502	0.76	T	0.147	B	0.02	B	0.160	N	1.000	P	0.435	N	-5.0	D	-0.941	T	0.000	T	0.08	1.403	10.63	3.54	0.288	1.350	6.534	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1029.63	0	NaN	NA	NA	98	1	97	52
chr11	65788415	65788415	G	T	exonic	CATSPER1	NaN	synonymous SNV	CATSPER1:NM_053054:exon6:c.C1794A:p.S598S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.902235	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	96	91	5	0
chr11	65788868	65788868	C	A	intronic	CATSPER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	30	24	6	0
chr11	65788869	65788869	A	A	intronic	CATSPER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	83	74	0	0
chr11	65792692	65792692	A	C	exonic	CATSPER1	NaN	nonsynonymous SNV	CATSPER1:NM_053054:exon1:c.T1159G:p.S387A	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.991	D	0.754	P	.	.	1.000	N	2.015	M	-4.32	D	0.441	D	0.882	D	0.104	1.812	12.02	1.34	0.393	0.145	4.325	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.535393	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	55	50	5	0
chr11	65809875	65809875	C	A	UTR3	GAL3ST3	NM_033036:c.*103G>T	NaN	NaN	rs1125078	NaN	0.739417	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.857441	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	1	3	38
chr11	65810045	65810045	T	G	exonic	GAL3ST3	NaN	nonsynonymous SNV	GAL3ST3:NM_033036:exon3:c.A1229C:p.E410A	rs4565902	NaN	0.164736	0.27	T	0.0	B	0.0	B	0.012	N	1.000	P	0	N	2.23	T	-0.998	T	0.000	T	0.083	1.035	9.227	2.84	1.816	0.942	8.837	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	13.7659	0	NaN	NA	NA	11	8	3	16
chr11	65810749	65810749	T	C	exonic	GAL3ST3	NaN	synonymous SNV	GAL3ST3:NM_033036:exon3:c.A525G:p.V175V	rs7937692	NaN	0.935903	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.938809	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	53
chr11	65820718	65820718	G	G	intronic	SF3B2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr11	65823072	65823072	C	T	intronic	SF3B2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	168	90	78	0
chr11	65824389	65824389	G	A	exonic	SF3B2	NaN	nonsynonymous SNV	SF3B2:NM_006842:exon6:c.G630A:p.M210I	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.077	B	0.013	B	0.004	N	0.728	D	0.695	N	.	.	-0.861	T	0.131	T	0.416	3.339	17.24	5.76	2.726	2.815	15.481	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.565574	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	267	259	8	0
chr11	65824813	65824813	T	C	exonic	SF3B2	NaN	synonymous SNV	SF3B2:NM_006842:exon7:c.T744C:p.G248G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.21159	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	233	220	13	0
chr11	65824827	65824827	C	T	exonic	SF3B2	NaN	nonsynonymous SNV	SF3B2:NM_006842:exon7:c.C758T:p.P253L	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.948	P	0.489	P	0.000	D	1.000	D	0.695	N	.	.	-0.879	T	0.139	T	0.369	3.828	19.44	5.41	2.700	5.625	17.056	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.798632	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	241	222	19	0
chr11	65824828	65824828	T	C	exonic	SF3B2	NaN	synonymous SNV	SF3B2:NM_006842:exon7:c.T759C:p.P253P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.022322	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	244	226	18	0
chr11	65829446	65829446	G	G	exonic	SF3B2	NaN	synonymous SNV	SF3B2:NM_006842:exon16:c.G1954G:p.G652G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	156	134	0	0
chr11	6584776	6584776	C	T	exonic	DNHD1	NaN	synonymous SNV	DNHD1:NM_144666:exon30:c.C9834T:p.C3278C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.885448	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	266	253	13	0
chr11	6587252	6587252	C	G	intronic	DNHD1	NaN	NaN	NaN	rs12292436	NaN	0.0770767	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	.	.	-0.978	T	0.000	T	.	-0.473	1.817	-4.08	-0.898	-0.179	0.982	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	123.936	0	NaN	NA	NA	51	23	28	33
chr11	6587253	6587253	T	G	intronic	DNHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.327516	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	58	52	6	0
chr11	6588109	6588109	A	C	intronic	DNHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	28	11.670695	nearby_gap_events	REJECT	19	13	6	0
chr11	6588711	6588711	A	G	exonic	DNHD1	NaN	nonsynonymous SNV	DNHD1:NM_144666:exon36:c.A11972G:p.E3991G	NaN	NaN	NaN	0.4	T	0.0	B	0.001	B	0.369	N	0.882	N	-0.49	N	3.08	T	-0.918	T	0.010	T	0.114	-2.005	0.007	1.82	0.204	0.769	9.049	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.596831	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	104	98	6	0
chr11	6589152	6589152	C	A	intronic	DNHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.18571428571428442	NA	0	0	NaN	NA	NA	13	10	3	0
chr11	6589324	6589324	A	T	exonic	DNHD1	NaN	nonsynonymous SNV	DNHD1:NM_144666:exon37:c.A12390T:p.E4130D	NaN	NaN	NaN	0.54	T	0.951	P	0.708	P	0.282	N	1.000	N	1.95	M	1.73	T	-1.049	T	0.074	T	0.332	0.738	7.916	1.38	0.446	0.622	4.505	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.270415	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	49	40	9	0
chr11	66031450	66031450	T	C	intronic	KLC2	NaN	NaN	NaN	rs525698	NaN	0.973642	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	231.311	0	NaN	NA	NA	19	0	19	34
chr11	66033301	66033301	C	T	intronic	KLC2	NaN	NaN	NaN	rs474005	NaN	0.332268	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	224.107192	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	0	72	40
chr11	66034421	66034421	G	T	exonic	KLC2	NaN	synonymous SNV	KLC2:NM_001134774:exon15:c.G1632T:p.V544V,KLC2:NM_001134775:exon16:c.G1863T:p.V621V,KLC2:NM_001134776:exon16:c.G1863T:p.V621V,KLC2:NM_022822:exon16:c.G1863T:p.V621V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.285852	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	277	261	16	0
chr11	66039942	66039942	A	A	intronic	RAB1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr11	66049495	66049495	T	T	intronic	CNIH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	66055480	66055480	T	T	intronic	YIF1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	83	75	0	0
chr11	66059497	66059497	G	A	exonic	TMEM151A	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM151A:NM_153266:exon1:c.G13A:p.G5S	NaN	NaN	NaN	0.89	T	0.092	B	0.004	B	.	.	1.000	N	0.55	N	.	.	-1.008	T	0.040	T	0.098	0.579	7.124	1.57	1.219	1.127	5.162	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	66059500	66059500	G	C	exonic	TMEM151A	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM151A:NM_153266:exon1:c.G16C:p.A6P	NaN	NaN	NaN	0.26	T	0.959	D	0.238	B	.	.	1.000	N	0	N	.	.	-1.065	T	0.023	T	0.201	2.132	13.08	1.57	1.219	1.836	3.977	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	66059501	66059501	C	G	exonic	TMEM151A	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM151A:NM_153266:exon1:c.C17G:p.A6G	NaN	NaN	NaN	0.56	T	0.001	B	0.001	B	.	.	1.000	N	-0.345	N	.	.	-0.989	T	0.034	T	0.072	-0.442	1.948	0.367	0.150	-0.770	7.192	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	66059502	66059502	T	C	exonic	TMEM151A	NaN	synonymous SNV	TMEM151A:NM_153266:exon1:c.T18C:p.A6A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr11	66082488	66082488	G	A	exonic	CD248	NaN	synonymous SNV	CD248:NM_020404:exon1:c.C2011T:p.L671L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.548511	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	42	34	8	0
chr11	66082618	66082618	A	A	exonic	CD248	NaN	synonymous SNV	CD248:NM_020404:exon1:c.T1881T:p.T627T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	36	35	0	0
chr11	66083180	66083180	T	T	exonic	CD248	NaN	synonymous SNV	CD248:NM_020404:exon1:c.A1319A:p.Y440Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	62	NaN	NA	NA	32	29	0	0
chr11	66083782	66083782	G	A	exonic	CD248	NaN	synonymous SNV	CD248:NM_020404:exon1:c.C717T:p.N239N	rs3741368	ID=COSM429643;OCCURENCE=1(breast)	0.255391	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.882391	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	3	5	36
chr11	66101138	66101138	A	A	intronic	RIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	66102250	66102250	C	G	exonic	RIN1	NaN	synonymous SNV	RIN1:NM_004292:exon6:c.G1020C:p.L340L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	20	17	3	0
chr11	66105409	66105409	A	G	intronic	BRMS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.508229	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	88	84	4	0
chr11	66108964	66108964	A	C	intronic	BRMS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.541102	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	97	86	11	0
chr11	66113541	66113541	G	T	exonic	B4GAT1	NaN	synonymous SNV	B4GAT1:NM_006876:exon2:c.C1227A:p.P409P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.023366085075267724	NA	0	0	NaN	NA	NA	85	68	17	0
chr11	66115024	66115024	G	C	UTR5	B4GAT1	NM_006876:c.-8C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	44	41	3	0
chr11	66135404	66135404	A	C	intronic	SLC29A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr11	66188761	66188761	G	T	exonic	NPAS4	NaN	synonymous SNV	NPAS4:NM_178864:exon1:c.G111T:p.L37L	rs77600363	NaN	0.169728	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.04229080124481724	NA	0	0	38.42378	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	25	16	23
chr11	66188904	66188904	T	C	intronic	NPAS4	NaN	NaN	NaN	rs111442339	NaN	0.297125	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	31.0573	0	NaN	NA	NA	18	11	7	20
chr11	66190504	66190504	T	G	intronic	NPAS4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.340319	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	15	10	5	1
chr11	66204969	66204969	A	A	intronic	MRPL11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	20	19	0	0
chr11	66206169	66206169	C	T	exonic	MRPL11	NaN	synonymous SNV	MRPL11:NM_016050:exon1:c.G57A:p.V19V,MRPL11:NM_170739:exon1:c.G57A:p.V19V	rs11110	NaN	0.23123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.628309	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	16	12	23
chr11	66206279	66206279	C	G	UTR5	MRPL11	NM_170739:c.-54G>C,NM_016050:c.-54G>C,NM_170738:c.-54G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.17984189723320118	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr11	66252705	66252705	A	G	exonic	DPP3	NaN	nonsynonymous SNV	DPP3:NM_005700:exon3:c.A332G:p.D111G,DPP3:NM_130443:exon3:c.A332G:p.D111G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.991	D	0.906	P	0.000	D	1.000	D	2.72	M	0.92	T	-0.147	T	0.385	T	0.975	4.475	23.9	5.0	1.890	8.058	12.687	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.3333333333333329	NA	0	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr11	6625653	6625653	G	T	intronic	ILK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	6625654	6625654	T	C	intronic	ILK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr11	66260412	66260412	C	A	intronic	DPP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.012051	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	67	60	7	0
chr11	66260413	66260413	A	C	intronic	DPP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.212901	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	67	59	8	0
chr11	66262579	66262579	C	G	intronic	DPP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	66262580	66262580	T	A	intronic	DPP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	66262749	66262749	G	A	intronic	DPP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.996999	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	247	239	8	0
chr11	66263276	66263276	A	C	intronic	DPP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	66272142	66272142	A	G	exonic	DPP3	NaN	synonymous SNV	DPP3:NM_001256670:exon16:c.A1848G:p.T616T,DPP3:NM_005700:exon17:c.A1938G:p.T646T,DPP3:NM_130443:exon17:c.A1938G:p.T646T	rs1671063	NaN	0.615016	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	101.939042	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	0	36	44
chr11	66276746	66276746	A	A	UTR3	DPP3	NM_130443:c.*24A>A,NM_005700:c.*24A>A,NM_001256670:c.*24A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr11	66283088	66283088	C	T	intronic	BBS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	22	19	3	0
chr11	66283236	66283236	G	A	intronic	BBS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.74197	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	270	263	7	0
chr11	66287276	66287276	A	C	intronic	BBS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	15	4	11	0
chr11	66291434	66291434	A	A	intronic	BBS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	66297363	66297363	C	T	exonic	BBS1	NaN	synonymous SNV	BBS1:NM_024649:exon14:c.C1413T:p.L471L	rs3816492	NaN	0.143371	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	102.488404	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	95	48	47	31
chr11	66297510	66297510	A	A	intronic	BBS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	66313203	66313203	T	C	exonic	ZDHHC24	NaN	nonsynonymous SNV	ZDHHC24:NM_207340:exon1:c.A272G:p.Q91R	rs2305534	NaN	0.227835	0.66	T	0.611	P	0.425	B	0.000	N	0.003	P	0.41	N	0.92	T	-1.023	T	0.000	T	0.066	2.941	15.80	2.62	0.850	1.694	5.862	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.882255	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	14	10	24
chr11	66324762	66324762	C	T	intronic	ACTN3	NaN	NaN	NaN	rs677488	NaN	0.566693	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	74.260812	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	0	25	42
chr11	6632731	6632731	G	T	intronic	TAF10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	6632734	6632734	A	C	intronic	TAF10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	6632879	6632879	T	C	intronic	TAF10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr11	66329639	66329639	G	A	exonic	ACTN3	NaN	unknown	UNKNOWN	rs77239910	NaN	0.0804712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	640.169	0	NaN	NA	NA	266	135	131	11
chr11	66331383	66331383	T	T	UTR3	CTSF	NM_003793:c.*21A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr11	66335170	66335170	A	A	intronic	CTSF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr11	66372066	66372066	C	C	intronic	CCS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	6638376	6638376	G	C	exonic	TPP1	NaN	nonsynonymous SNV	TPP1:NM_000391:exon6:c.C517G:p.L173V	NaN	NaN	NaN	0.95	T	0.032	B	0.023	B	0.000	D	1.000	D	0.355	N	-0.93	T	-0.897	T	0.174	T	0.401	0.577	7.116	4.43	2.290	3.311	11.791	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	149	140	9	0
chr11	6638377	6638377	T	G	exonic	TPP1	NaN	synonymous SNV	TPP1:NM_000391:exon6:c.A516C:p.G172G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	136	118	18	0
chr11	6638378	6638378	C	T	exonic	TPP1	NaN	nonsynonymous SNV	TPP1:NM_000391:exon6:c.G515A:p.G172E	NaN	NaN	NaN	0.09	T	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.94	M	-0.79	T	0.363	D	0.626	D	0.91	4.040	20.7	4.43	2.290	6.151	15.790	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	18	8	10	0
chr11	66392880	66392880	C	T	exonic	RBM14	NaN	synonymous SNV	RBM14:NM_006328:exon2:c.C1533T:p.T511T	rs11550057	NaN	0.0796725	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.772687	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	11	5	13
chr11	66393248	66393248	GTCTTCTCTTCTCTAT	GTCTTCTCTAT,GTCTTCTCTTCTCTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	480.177	0	NaN	NA	NA	209	100	63	6
chr11	66393263	66393263	T	A	intronic	RBM14,RBM14-RBM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	53.639473	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	176	139	37	0
chr11	66410895	66410895	A	T	intronic	RBM14-RBM4,RBM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	66410903	66410903	T	G	intronic	RBM14-RBM4,RBM4	NaN	NaN	NaN	rs484514	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	66411690	66411690	C	C	intronic	RBM14-RBM4,RBM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	66454795	66454795	T	A	intronic	SPTBN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr11	6645542	6645542	T	C	exonic	DCHS1	NaN	synonymous SNV	DCHS1:NM_003737:exon21:c.A7365G:p.R2455R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.244721	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	199	193	6	0
chr11	66455634	66455634	T	C	intronic	SPTBN2	NaN	NaN	NaN	rs376056474	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.283429	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	32	28	4	0
chr11	66456650	66456650	A	A	exonic	SPTBN2	NaN	synonymous SNV	SPTBN2:NM_006946:exon29:c.T5951T:p.I1984I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	65	47	0	0
chr11	66456660	66456660	G	C	intronic	SPTBN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.538699	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	54	46	8	0
chr11	66459164	66459164	G	T	intronic	SPTBN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	66459865	66459865	A	C	intronic	SPTBN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.843655	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	310	298	12	0
chr11	66461397	66461397	T	T	intronic	SPTBN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	24	19	0	0
chr11	66467038	66467038	C	C	exonic	SPTBN2	NaN	synonymous SNV	SPTBN2:NM_006946:exon17:c.G3615G:p.Q1205Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	63	NaN	NA	NA	52	46	0	0
chr11	66473082	66473082	A	A	intronic	SPTBN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	66474940	66474940	C	C	intronic	SPTBN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	141	102	0	0
chr11	66475427	66475427	A	A	intronic	SPTBN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	66481070	66481070	A	G	intronic	SPTBN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	19	14	5	0
chr11	6653187	6653187	T	G	intronic	DCHS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.063071	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	114	101	13	0
chr11	6653568	6653568	C	T	exonic	DCHS1	NaN	nonsynonymous SNV	DCHS1:NM_003737:exon6:c.G3175A:p.A1059T	NaN	NaN	NaN	0.57	T	0.052	B	0.112	B	0.000	D	0.925	D	0.7	N	4.65	T	-0.837	T	0.005	T	0.143	1.741	11.78	2.58	0.610	0.298	9.004	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.742815	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	230	224	6	0
chr11	66610270	66610270	C	C	intronic	C11orf80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	66611227	66611227	T	T	intronic	RCE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr11	66611680	66611680	C	G	intronic	RCE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.492085	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	26	21	5	0
chr11	66611681	66611681	T	C	intronic	RCE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.12444444444444239	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr11	66616967	66616967	T	T	intronic	PC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	66619249	66619249	C	A	intronic	PC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.005636	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	175	162	13	0
chr11	66619864	66619864	A	G	intronic	PC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.510719	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	132	127	5	0
chr11	6662299	6662299	T	C	exonic	DCHS1	NaN	synonymous SNV	DCHS1:NM_003737:exon2:c.A546G:p.L182L	rs112143988	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	192.077	0	NaN	NA	NA	70	33	37	0
chr11	66625667	66625667	A	C	exonic	LRFN4	NaN	nonsynonymous SNV	LRFN4:NM_024036:exon1:c.A452C:p.D151A	NaN	NaN	NaN	0.03	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	3	M	0.2	T	-0.097	T	0.416	T	0.879	3.873	19.68	4.18	1.880	7.122	11.477	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.926375	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	114	108	6	0
chr11	66626337	66626337	T	C	exonic	LRFN4	NaN	synonymous SNV	LRFN4:NM_024036:exon1:c.T1122C:p.G374G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.969077	nearby_gap_events	REJECT	80	73	7	0
chr11	66629513	66629513	A	C	intronic	PC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	66637996	66637996	A	C	intronic	PC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	13	4	9	0
chr11	66638030	66638030	A	T	intronic	PC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	66638033	66638033	G	C	intronic	PC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	66639391	66639391	CA	C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.9044	0	NaN	NA	NA	22	17	4	0
chr11	66647430	66647430	T	G	intronic	PC	NaN	NaN	NaN	rs2380759	NaN	0.242612	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr11	66647431	66647431	T	C	intronic	PC	NaN	NaN	NaN	rs2380760	NaN	0.242612	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr11	66719661	66719661	C	C	intronic	PC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	66802360	66802360	A	A	intronic	SYT12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	66807268	66807268	T	G	intronic	SYT12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	66807269	66807269	T	A	intronic	SYT12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	66842064	66842064	C	G	intergenic	RHOD,KDM2A	dist=2576;dist=44676	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	66888719	66888719	T	T	UTR5	KDM2A	NM_012308:c.-69T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr11	66949227	66949227	T	G	intronic	KDM2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr11	66995465	66995465	T	T	intronic	KDM2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr11	66995603	66995603	T	C	exonic	KDM2A	NaN	synonymous SNV	KDM2A:NM_012308:exon11:c.T1053C:p.T351T	rs3741189	NaN	0.944888	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	102.571689	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	49	0	49	43
chr11	66999272	66999272	T	A	exonic	KDM2A	NaN	nonsynonymous SNV	KDM2A:NM_012308:exon12:c.T1320A:p.D440E	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.0	B	0.096	N	1.000	D	0	N	0.92	T	-1.001	T	0.037	T	0.245	1.282	10.19	0.549	0.122	-1.082	5.758	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.061873	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	183	171	12	0
chr11	66999273	66999273	C	T	exonic	KDM2A	NaN	nonsynonymous SNV	KDM2A:NM_012308:exon12:c.C1321T:p.P441S	NaN	NaN	NaN	0.73	T	0.0	B	0.0	B	0.702	N	1.000	D	1.585	L	1.84	T	-1.046	T	0.043	T	0.127	2.183	13.26	1.73	0.131	1.438	3.326	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	16	6	10	0
chr11	66999443	66999443	A	G	intronic	KDM2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr11	67012559	67012559	G	T	intronic	KDM2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	67012560	67012560	T	C	intronic	KDM2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	67012562	67012562	G	A	intronic	KDM2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	67018001	67018001	C	G	exonic	KDM2A	NaN	nonsynonymous SNV	KDM2A:NM_001256405:exon6:c.C1183G:p.R395G,KDM2A:NM_012308:exon17:c.C2500G:p.R834G	NaN	NaN	NaN	.	.	0.799	P	0.225	B	0.086	N	1.000	D	0	N	2.04	T	-1.070	T	0.043	T	0.665	2.448	14.15	5.91	2.802	2.834	18.479	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.537352	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	38	31	7	0
chr11	67018002	67018002	G	T	exonic	KDM2A	NaN	nonsynonymous SNV	KDM2A:NM_001256405:exon6:c.G1184T:p.R395L,KDM2A:NM_012308:exon17:c.G2501T:p.R834L	NaN	NaN	NaN	.	.	0.799	P	0.225	B	0.086	N	1.000	D	0	N	2.05	T	-1.070	T	0.043	T	0.684	2.977	15.92	5.91	2.802	5.950	18.479	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.823247	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	45	37	8	0
chr11	67018003	67018003	T	C	exonic	KDM2A	NaN	synonymous SNV	KDM2A:NM_001256405:exon6:c.T1185C:p.R395R,KDM2A:NM_012308:exon17:c.T2502C:p.R834R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.664397	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	47	39	8	0
chr11	67032570	67032570	T	T	intergenic	KDM2A,ADRBK1	dist=7020;dist=1335	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	67032596	67032596	C	C	intergenic	KDM2A,ADRBK1	dist=7046;dist=1309	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	6704568	6704568	A	C	UTR5	MRPL17	NM_022061:c.-41T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	67050218	67050218	C	T	intronic	ADRBK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.92904	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	13	9	4	0
chr11	67071088	67071088	C	T	UTR5	SSH3	NM_017857:c.-9C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.388887	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	13	10	3	1
chr11	67075614	67075614	C	A	intronic	SSH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.034172101691692824	NA	0	0	NaN	NA	NA	35	25	10	0
chr11	67120208	67120208	A	G	exonic	POLD4	NaN	nonsynonymous SNV	POLD4:NM_021173:exon3:c.T253C:p.W85R	NaN	NaN	NaN	0.61	T	0.0	B	0.0	B	0.003	N	0.527	N	-0.285	N	1.56	T	-0.985	T	0.035	T	0.1	0.700	7.734	-3.96	-1.245	0.230	10.778	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.532617	nearby_gap_events	REJECT	28	21	7	0
chr11	67147271	67147271	T	T	ncRNA_intronic	LOC100130987	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr11	67163723	67163723	C	T	intronic	RAD9A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.967351	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	104	95	9	0
chr11	67171801	67171801	T	C	exonic	TBC1D10C	NaN	nonsynonymous SNV	TBC1D10C:NM_001256508:exon2:c.T128C:p.I43T,TBC1D10C:NM_198517:exon2:c.T128C:p.I43T	rs201269302	NaN	0.000199681	0.19	T	0.34	B	0.171	B	0.002	N	1.000	D	1.5	L	2.24	T	-1.095	T	0.038	T	0.435	3.078	16.28	3.87	1.883	3.053	9.207	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1428571428571436	NA	0	0	NaN	NA	NA	6	4	2	2
chr11	67177278	67177278	G	A	UTR3	TBC1D10C	NM_198517:c.*53G>A,NM_001256508:c.*267G>A	NaN	NaN	rs7122299	NaN	0.997204	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	67185031	67185031	T	C	exonic	CARNS1	NaN	nonsynonymous SNV	CARNS1:NM_001166222:exon3:c.T157C:p.S53P	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.729	P	0.354	B	.	.	1.000	D	0.55	N	1.14	T	-1.108	T	0.064	T	0.267	2.124	13.06	2.23	0.668	-0.253	5.440	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.013742038838734275	Somatic	211.506	0	NaN	NA	NA	59	34	25	0
chr11	67185032	67185032	C	T	exonic	CARNS1	NaN	nonsynonymous SNV	CARNS1:NM_001166222:exon3:c.C158T:p.S53F	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.729	P	0.533	P	.	.	1.000	D	0.55	N	1.13	T	-1.012	T	0.096	T	0.225	2.284	13.59	3.85	0.990	0.111	11.624	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	33	8	25	0
chr11	67186095	67186095	A	G	intronic	CARNS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	67192225	67192225	A	A	UTR3	CARNS1	NM_020811:c.*153A>A,NM_001166222:c.*153A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	15	14	0	0
chr11	67196523	67196523	G	G	intronic	RPS6KB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	17	15	0	0
chr11	67200046	67200046	G	A	intronic	RPS6KB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	67205978	67205978	G	A	intronic	CORO1B	NaN	NaN	NaN	rs872375	NaN	0.354433	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.878785	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	14	19	39
chr11	67209576	67209576	G	C	intronic	CORO1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	4.747887266328698E-8	NA	0	0	NaN	NA	NA	168	117	51	0
chr11	67209577	67209577	C	G	intronic	CORO1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	463	297	154	0
chr11	67209850	67209850	T	T	intronic	CORO1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	67210035	67210035	T	C	exonic	CORO1B	NaN	nonsynonymous SNV	CORO1B:NM_020441:exon2:c.A65G:p.N22S,CORO1B:NM_001018070:exon3:c.A65G:p.N22S	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.036	B	0.038	B	0.000	D	0.542	N	0.515	N	0.19	T	-0.737	T	0.216	T	0.132	2.731	15.09	4.07	1.820	2.676	10.276	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.391673	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	51	48	3	0
chr11	67223920	67223920	C	G	intronic	CABP4	NaN	NaN	NaN	rs1638564	NaN	0.506589	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.437135	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	19	12	0
chr11	67223921	67223921	A	C	intronic	CABP4	NaN	NaN	NaN	rs1638565	NaN	0.506589	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.436966	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	19	12	0
chr11	67257737	67257737	G	A	ncRNA_exonic	MIR6752	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.691088	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	156	145	11	0
chr11	67258391	67258391	A	G	exonic	AIP	NaN	nonsynonymous SNV	AIP:NM_001302959:exon6:c.A743G:p.Q248R,AIP:NM_003977:exon6:c.A920G:p.Q307R	rs4930199	NaN	0.999401	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-0.895	N	-0.76	T	-0.939	T	0.000	T	0.012	-0.488	1.754	4.49	0.792	0.596	8.946	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	308.506	0	NaN	NA	NA	20	0	20	8
chr11	67259473	67259473	T	T	UTR3	PITPNM1	NM_001130848:c.*31A>A,NM_004910:c.*31A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	67260888	67260888	A	G	exonic	PITPNM1	NaN	nonsynonymous SNV	PITPNM1:NM_001130848:exon22:c.T3332C:p.V1111A,PITPNM1:NM_004910:exon22:c.T3335C:p.V1112A	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.625	P	0.192	B	0.951	N	0.872	D	2.075	M	-1.0	T	-0.525	T	0.311	T	0.27	3.192	16.69	2.59	0.817	3.595	5.699	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.876159	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	23	20	3	0
chr11	67262282	67262282	C	CGA	intronic	PITPNM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.350839	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	19.2908	0	NaN	NA	NA	23	17	6	20
chr11	67262286	67262286	T	A	intronic	PITPNM1	NaN	NaN	NaN	rs12789119	NaN	0.28155	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	22.499	37	NaN	NA	NA	20	14	6	28
chr11	67262289	67262289	G	A	intronic	PITPNM1	NaN	NaN	NaN	rs7932071	NaN	0.844449	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	111	20	91	20
chr11	67263643	67263643	G	C	intronic	PITPNM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.351518	nearby_gap_events	REJECT	165	151	14	0
chr11	67263767	67263767	A	G	exonic	PITPNM1	NaN	synonymous SNV	PITPNM1:NM_001130848:exon15:c.T2196C:p.A732A,PITPNM1:NM_004910:exon15:c.T2199C:p.A733A	rs618633	NaN	0.932308	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	50.1427	0	16.343986	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	30
chr11	67264679	67264679	C	T	intronic	PITPNM1	NaN	NaN	NaN	rs2276120	NaN	0.291933	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	120.206	0	37.753742	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	6	17	24
chr11	67264899	67264899	GCC	GCCG,GC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.75261	0	NaN	NA	NA	17	14	2	1
chr11	67267332	67267332	G	T	intronic	PITPNM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.966706	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	281	263	18	0
chr11	67267725	67267725	G	C	exonic	PITPNM1	NaN	nonsynonymous SNV	PITPNM1:NM_001130848:exon6:c.C808G:p.P270A,PITPNM1:NM_004910:exon6:c.C808G:p.P270A	NaN	NaN	NaN	0.66	T	0.007	B	0.01	B	0.347	N	0.953	N	0	N	1.03	T	-1.029	T	0.038	T	0.125	0.889	8.610	0.941	0.416	1.345	1.489	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.3213	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	77	68	9	0
chr11	67286538	67286538	T	T	UTR3	CABP2	NM_016366:c.*72A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr11	67289429	67289429	T	C	exonic	CABP2	NaN	nonsynonymous SNV	CABP2:NM_016366:exon3:c.A238G:p.I80V	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.021	B	0.018	B	0.040	N	0.895	D	0.69	N	3.03	T	-1.004	T	0.014	T	0.175	2.054	12.83	2.72	0.632	1.255	3.558	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.033047	normal_lod,strand_artifact	REJECT	6	2	4	0
chr11	67290899	67290899	A	A	UTR5	CABP2	NM_016366:c.-102T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr11	67351540	67351540	A	G	intronic	GSTP1	NaN	NaN	NaN	rs1871041	NaN	0.88119	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.16299	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	25
chr11	67352074	67352074	T	T	intronic	GSTP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	98	90	0	0
chr11	67376210	67376210	G	C	intronic	NDUFV1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	79	NaN	NA	NA	276	144	124	0
chr11	67377225	67377225	A	G	intronic	NDUFV1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	8	0	8	0
chr11	67378426	67378426	C	A	intronic	NDUFV1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.511112	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	55	50	5	0
chr11	67378877	67378877	G	C	exonic	NDUFV1	NaN	nonsynonymous SNV	NDUFV1:NM_001166102:exon7:c.G890C:p.G297A,NDUFV1:NM_007103:exon7:c.G917C:p.G306A	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.986	D	0.000	D	1.000	D	4.39	H	-0.13	T	0.586	D	0.606	D	0.822	4.238	22.1	3.91	2.173	9.458	15.021	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	106	69	22	0
chr11	67395714	67395714	C	T	exonic	NUDT8	NaN	synonymous SNV	NUDT8:NM_001243750:exon4:c.G414A:p.E138E	rs7124513	NaN	0.232827	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.267855	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	19	9	36
chr11	67400149	67400149	A	A	intronic	TBX10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	67400598	67400598	T	T	intronic	TBX10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	137	125	0	0
chr11	67401635	67401635	G	C	intronic	TBX10	NaN	NaN	NaN	rs12787511	NaN	0.217053	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	139.247	0	NaN	NA	NA	40	17	23	20
chr11	67412460	67412460	T	C	intronic	ACY3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.331869	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	85	76	9	0
chr11	67413132	67413132	T	G	intronic	ACY3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	49.5065	0	8.811453	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	1	5	0
chr11	67413133	67413133	G	T	intronic	ACY3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.974109	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	0
chr11	67413386	67413386	A	A	intronic	ACY3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr11	67543096	67543096	G	G	intergenic	ALDH3B2,FAM86C2P	dist=94411;dist=16142	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	67552923	67552923	C	A	intergenic	ALDH3B2,FAM86C2P	dist=104238;dist=6315	NaN	NaN	rs7941186	NaN	0.366214	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	68	36	32	0
chr11	67762966	67762966	T	TC	intronic	UNC93B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.1612	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr11	67763009	67763009	G	C	intronic	UNC93B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5005	0	NaN	NA	NA	7	5	2	1
chr11	67763060	67763060	C	A	intronic	UNC93B1	NaN	NaN	NaN	rs367982446	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.692723	normal_lod,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	5	1	4	2
chr11	67765440	67765440	G	T	intronic	UNC93B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	67765442	67765442	T	G	intronic	UNC93B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	67782913	67782913	C	G	exonic	ALDH3B1	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.4374	0	NaN	NA	NA	9	6	2	0
chr11	67786441	67786441	T	T	intronic	ALDH3B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr11	67790011	67790011	G	T	intronic	ALDH3B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	80	64	16	0
chr11	67795012	67795012	T	T	intronic	ALDH3B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	67795015	67795015	C	C	intronic	ALDH3B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	67795016	67795016	C	C	intronic	ALDH3B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	67795299	67795299	G	A	exonic	ALDH3B1	NaN	unknown	UNKNOWN	rs308341	NaN	0.247604	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	64.011026	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	56	28	28	22
chr11	67795353	67795353	G	A	exonic	ALDH3B1	NaN	unknown	UNKNOWN	rs3751082	NaN	0.178315	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	61.43929	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	24	26	22
chr11	67808895	67808895	A	A	intronic	TCIRG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	67810591	67810591	C	T	UTR5	TCIRG1	NM_006053:c.-465C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.410971	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	157	152	5	0
chr11	67810635	67810635	A	A	UTR5	TCIRG1	NM_006053:c.-421A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	67811380	67811380	T	G	intronic	TCIRG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.833609	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	132	123	9	0
chr11	67815213	67815213	A	G	exonic	TCIRG1	NaN	nonsynonymous SNV	TCIRG1:NM_006053:exon7:c.A757G:p.T253A,TCIRG1:NM_006019:exon12:c.A1405G:p.T469A	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.152	B	0.141	B	0.001	N	0.965	N	0.55	N	-2.06	D	-0.654	T	0.348	T	0.211	0.841	8.397	2.63	0.630	1.436	4.592	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.706332	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	33	12	1
chr11	67821617	67821617	A	A	intronic	CHKA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	16	15	0	0
chr11	67831930	67831930	T	T	intronic	CHKA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	67837771	67837771	A	T	intronic	CHKA	NaN	NaN	NaN	rs3819255	ID=COSN163988;OCCURENCE=1(NS)	0.319888	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	43.7127	0	NaN	NA	NA	71	51	21	12
chr11	67838154	67838154	T	A	intronic	CHKA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr11	6790106	6790106	T	C	exonic	OR2AG2	NaN	nonsynonymous SNV	OR2AG2:NM_001004490:exon1:c.A83G:p.Y28C	rs7102536	NaN	0.877196	0.32	T	0.0	B	0.0	B	0.001	N	1.000	P	0.55	N	4.01	T	-1.036	T	0.000	T	0.064	-0.648	1.145	3.36	0.749	0.488	5.400	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	174.698602	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	0	57	58
chr11	67934327	67934327	A	G	UTR3	SUV420H1	NM_016028:c.*114T>C,NM_001300909:c.*114T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.494666	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	173	169	4	0
chr11	67957336	67957336	C	A	intronic	SUV420H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	67957340	67957340	C	T	intronic	SUV420H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	67957342	67957342	C	T	intronic	SUV420H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	67957343	67957343	A	G	intronic	SUV420H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	67957344	67957344	T	A	intronic	SUV420H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	67957345	67957345	A	T	intronic	SUV420H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	67957564	67957564	A	A	UTR5	SUV420H1	NM_001300907:c.-15053T>T,NM_017635:c.-21T>T,NM_001300908:c.-18455T>T,NM_016028:c.-21T>T,NM_001300909:c.-21T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr11	68029107	68029107	C	G	UTR3	C11orf24	NM_022338:c.*6G>C,NM_001300913:c.*6G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.901932	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	106	97	9	0
chr11	68029131	68029131	A	G	exonic	C11orf24	NaN	synonymous SNV	C11orf24:NM_022338:exon4:c.T1332C:p.Y444Y,C11orf24:NM_001300913:exon5:c.T327C:p.Y109Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.665922	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	146	141	5	0
chr11	68125045	68125045	G	G	intronic	LRP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	66	61	0	0
chr11	68133144	68133144	A	T	exonic	LRP5	NaN	nonsynonymous SNV	LRP5:NM_002335:exon5:c.A989T:p.Q330L	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.001	B	0.266	U	0.851	N	-0.28	N	-4.02	D	-0.300	T	0.578	D	0.171	0.934	8.804	2.48	0.727	0.940	6.109	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.3994	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr11	68177353	68177353	T	G	intronic	LRP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	13	10	3	0
chr11	68179166	68179166	A	G	intronic	LRP5	NaN	NaN	NaN	rs689179	NaN	0.702676	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.207477	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	38
chr11	68192784	68192784	A	A	intronic	LRP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr11	68204273	68204273	A	A	intronic	LRP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	68215109	68215109	A	T	intronic	LRP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	68304975	68304975	T	A	intronic	PPP6R3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr11	68318700	68318700	A	C	intronic	PPP6R3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.038428	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	96	85	11	0
chr11	68382255	68382255	G	T	UTR3	PPP6R3	NM_001164164:c.*110G>T,NM_001164162:c.*1670G>T,NM_001164160:c.*1670G>T,NM_001164163:c.*1670G>T,NM_001164161:c.*1670G>T,NM_018312:c.*1670G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	68382256	68382256	G	C	UTR3	PPP6R3	NM_001164164:c.*111G>C,NM_001164162:c.*1671G>C,NM_001164160:c.*1671G>C,NM_001164163:c.*1671G>C,NM_001164161:c.*1671G>C,NM_018312:c.*1671G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	68382257	68382257	A	C	UTR3	PPP6R3	NM_001164164:c.*112A>C,NM_001164162:c.*1672A>C,NM_001164160:c.*1672A>C,NM_001164163:c.*1672A>C,NM_001164161:c.*1672A>C,NM_018312:c.*1672A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	68456456	68456456	A	A	intronic	GAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	68458314	68458314	G	C	intronic	GAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	68483465	68483465	A	G	intronic	MTL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.016155	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	190	182	8	0
chr11	68500097	68500097	C	G	intronic	MTL5	NaN	NaN	NaN	rs4075299	NaN	0.607228	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	68530046	68530046	T	A	intronic	CPT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	12	6	4	0
chr11	68562403	68562403	G	A	intronic	CPT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.382369	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	173	168	5	0
chr11	68566649	68566649	AAA	GCT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	399.499	0	NaN	NA	NA	43	0	42	34
chr11	68580090	68580090	A	A	intronic	CPT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	68582985	68582985	G	T	intronic	CPT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	68593521	68593521	A	A	intronic	CPT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	68593523	68593523	A	A	intronic	CPT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	68593524	68593524	C	C	intronic	CPT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	68671104	68671104	A	G	intronic	MRPL21	NaN	NaN	NaN	rs629426	NaN	0.270567	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	110.937	0	NaN	NA	NA	53	28	25	18
chr11	68671666	68671666	A	A	intronic	IGHMBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	68671999	68671999	G	C	intronic	IGHMBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	68672002	68672002	G	C	intronic	IGHMBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	68672003	68672003	A	T	intronic	IGHMBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	68672006	68672006	G	A	intronic	IGHMBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	68728990	68728990	T	C	intergenic	IGHMBP2,MRGPRD	dist=20921;dist=18500	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	68748003	68748003	T	C	exonic	MRGPRD	NaN	synonymous SNV	MRGPRD:NM_198923:exon1:c.A453G:p.T151T	rs34847539	NaN	0.629193	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	47.056738	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	26	20	51
chr11	68773403	68773403	G	A	exonic	MRGPRF	NaN	synonymous SNV	MRGPRF:NM_001098515:exon3:c.C375T:p.C125C,MRGPRF:NM_145015:exon3:c.C375T:p.C125C	rs11544722	NaN	0.232428	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.581221	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	14	13	24
chr11	687979	687979	T	C	exonic	DEAF1	NaN	nonsynonymous SNV	DEAF1:NM_001293634:exon4:c.A596G:p.Y199C,DEAF1:NM_021008:exon4:c.A596G:p.Y199C	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.999	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	1.59	L	-0.07	T	0.011	D	0.448	T	0.83	4.377	23.1	4.77	1.904	5.924	13.591	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.414533	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	288	281	7	0
chr11	687999	687999	G	A	exonic	DEAF1	NaN	synonymous SNV	DEAF1:NM_001293634:exon4:c.C576T:p.Y192Y,DEAF1:NM_021008:exon4:c.C576T:p.Y192Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.362429	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	286	279	7	0
chr11	68816339	68816339	C	C	upstream	TPCN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	68816370	68816370	A	G	UTR5	TPCN2	NM_139075:c.-96A>G	NaN	NaN	rs4930642	NaN	0.808706	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.556967	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	29
chr11	68821648	68821648	G	C	intronic	TPCN2	NaN	NaN	NaN	rs12285715	NaN	0.258586	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	288.215912	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	97	0	97	24
chr11	68839313	68839313	T	C	intronic	TPCN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.139414	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	93	86	7	1
chr11	68840000	68840000	A	G	intronic	TPCN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	3	2	0
chr11	68840248	68840248	A	A	intronic	TPCN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	68846098	68846098	A	G	intronic	TPCN2	NaN	NaN	NaN	rs4930649	NaN	0.752995	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	158.084641	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	0	53	53
chr11	68851414	68851414	T	C	exonic	TPCN2	NaN	nonsynonymous SNV	TPCN2:NM_139075:exon19:c.T1691C:p.L564P	rs2376558	NaN	0.752995	0.21	T	0.001	B	0.001	B	0.143	N	0.000	P	0.44	N	-4.93	D	-0.952	T	0.000	T	0.041	0.203	5.095	2.65	0.180	3.571	5.787	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	142.212544	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	51	0	51	58
chr11	68853503	68853503	A	AT	intronic	TPCN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	523.967	0	NaN	NA	NA	149	0	19	3
chr11	68853504	68853504	C	T	intronic	TPCN2	NaN	NaN	NaN	rs2290421	NaN	0.402356	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1410.24	0	NaN	NA	NA	119	0	119	40
chr11	68854518	68854518	G	A	intronic	TPCN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.422616	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	5	6	0
chr11	68854519	68854519	A	C	intronic	TPCN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSM	3	Somatic	0.005533596837944647	NA	0	16	10.657965	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	5	6	0
chr11	68854712	68854712	G	T	intronic	TPCN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.440449	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	29	24	5	0
chr11	68854774	68854774	G	A	intronic	TPCN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	0.0016604954765813088	Somatic	21.6606	19	16.17158	nearby_gap_events	REJECT	38	29	9	0
chr11	68872415	68872415	G	G	intergenic	TPCN2,LOC338694	dist=14343;dist=42281	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	68925365	68925365	G	G	ncRNA_intronic	LOC338694	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	69189692	69189692	C	A	intergenic	MYEOV,LINC01488	dist=124938;dist=110637	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	24	10	13	0
chr11	69189693	69189693	A	C	intergenic	MYEOV,LINC01488	dist=124939;dist=110636	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	24	10	13	0
chr11	69193903	69193903	A	G	intergenic	MYEOV,LINC01488	dist=129149;dist=106426	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	69482248	69482248	T	T	UTR3	ORAOV1	NM_153451:c.*39A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	17	13	0	0
chr11	69588989	69588989	G	T	intronic	FGF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.798795	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	42	36	6	0
chr11	69627658	69627658	T	C	intronic	FGF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr11	69677911	69677911	A	G	intergenic	FGF3,LOC101928443	dist=43719;dist=224425	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	69680230	69680230	C	C	intergenic	FGF3,LOC101928443	dist=46038;dist=222106	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	69698871	69698871	T	A	intergenic	FGF3,LOC101928443	dist=64679;dist=203465	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	69866412	69866412	A	C	intergenic	FGF3,LOC101928443	dist=232220;dist=35924	NaN	NaN	rs7950460	NaN	0.858227	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr11	69922748	69922748	T	T	intergenic	ANO1-AS2,ANO1	dist=1294;dist=1660	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	69933833	69933833	T	T	intronic	ANO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr11	69954097	69954097	C	T	intronic	ANO1	NaN	NaN	NaN	rs2509181	NaN	0.570887	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	69970420	69970420	A	G	intronic	ANO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	9	5	0
chr11	69970426	69970426	T	A	intronic	ANO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	16	9	4	0
chr11	69995949	69995949	T	C	intronic	ANO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	306.381	39	69.182755	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	69	37	32	0
chr11	69995951	69995951	C	A	intronic	ANO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.382426	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	70	56	14	0
chr11	69998529	69998529	T	T	intronic	ANO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr11	69999122	69999122	A	C	intronic	ANO1	NaN	NaN	NaN	rs10160639	NaN	0.689696	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.028707	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	8	13	52
chr11	69999252	69999252	G	A	intronic	ANO1	NaN	NaN	NaN	rs3781663	NaN	0.685503	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.933039	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	7	9	51
chr11	70007254	70007254	T	C	intronic	ANO1	NaN	NaN	NaN	rs371810168	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	21	2	18	0
chr11	70011011	70011011	T	C	intronic	ANO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	70013472	70013472	A	C	exonic	ANO1	NaN	nonsynonymous SNV	ANO1:NM_018043:exon21:c.A2176C:p.T726P	NaN	NaN	NaN	.	.	0.234	B	0.179	B	0.000	D	1.000	D	2.045	M	-0.06	T	-0.711	T	0.246	T	0.792	3.368	17.35	4.93	1.851	8.874	14.606	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	78	53	25	0
chr11	70028825	70028825	A	A	intronic	ANO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr11	70176169	70176169	T	A	intronic	PPFIA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	40	19	20	0
chr11	70253379	70253379	T	C	intronic	CTTN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	2	2	0
chr11	70260609	70260609	T	C	intronic	CTTN	NaN	NaN	NaN	rs7932550	NaN	0.179712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.038854	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	18	16	20
chr11	70277210	70277210	C	G	intronic	CTTN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	70277299	70277299	G	A	exonic	CTTN	NaN	synonymous SNV	CTTN:NM_001184740:exon14:c.G1068A:p.E356E,CTTN:NM_138565:exon14:c.G1068A:p.E356E,CTTN:NM_005231:exon15:c.G1179A:p.E393E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.122748	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	172	164	8	0
chr11	70332586	70332586	C	T	exonic	SHANK2	NaN	nonsynonymous SNV	SHANK2:NM_133266:exon10:c.G2048A:p.G683E	NaN	NaN	NaN	0.04	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.36	M	1.98	T	-0.852	T	0.146	T	0.644	1.418	10.68	4.18	1.141	3.600	15.080	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.197415	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	504	485	19	0
chr11	70349104	70349104	A	A	intronic	SHANK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr11	705630	705630	C	T	upstream;downstream	EPS8L2;TMEM80	NaN	NaN	NaN	rs12804878	NaN	0.627396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	24	6	18	0
chr11	7065227	7065227	A	A	intronic	NLRP14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	70653297	70653297	A	C	intronic	SHANK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	29	15	14	0
chr11	7068095	7068095	T	C	intronic	NLRP14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	8	3	0
chr11	70739214	70739214	A	C	intronic	SHANK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	70742516	70742516	T	T	intronic	SHANK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr11	7091497	7091497	T	C	intronic	NLRP14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.407932	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	121	85	36	0
chr11	710550	710550	A	A	intronic	EPS8L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	7110363	7110363	G	A	exonic	RBMXL2	NaN	synonymous SNV	RBMXL2:NM_014469:exon1:c.G12A:p.A4A	rs4758158	NaN	0.317292	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	170.280461	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	141	72	69	42
chr11	7110751	7110751	A	G	exonic	RBMXL2	NaN	nonsynonymous SNV	RBMXL2:NM_014469:exon1:c.A400G:p.T134A	rs11041171	NaN	0.965855	0.57	T	0.0	B	0.0	B	0.993	N	1.000	P	0.145	N	-0.9	T	-0.992	T	0.000	T	0.02	-1.265	0.046	-2.91	-1.383	-1.159	1.386	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.352076	normal_lod	REJECT	2	0	2	0
chr11	7111092	7111092	T	C	exonic	RBMXL2	NaN	synonymous SNV	RBMXL2:NM_014469:exon1:c.T741C:p.S247S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.332603	normal_lod	REJECT	11	8	3	1
chr11	71146691	71146691	A	G	exonic	DHCR7	NaN	synonymous SNV	DHCR7:NM_001163817:exon9:c.T1158C:p.D386D,DHCR7:NM_001360:exon9:c.T1158C:p.D386D	rs760241	ID=COSM1475860,COSM429787;OCCURENCE=2(breast)	0.75639	0.05	D	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	-5.64	D	-0.882	T	0.000	T	.	-0.953	0.336	-10.2	-2.600	-0.798	11.943	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	81.577228	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	0	30	54
chr11	71149763	71149763	T	C	intronic	DHCR7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr11	71152461	71152461	A	G	exonic	DHCR7	NaN	synonymous SNV	DHCR7:NM_001163817:exon6:c.T438C:p.N146N,DHCR7:NM_001360:exon6:c.T438C:p.N146N	rs949177	NaN	0.807308	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	51.653498	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	0	19	55
chr11	71153459	71153459	C	A	intronic	DHCR7	NaN	NaN	NaN	rs11603330	NaN	0.349042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	245.62	0	NaN	NA	NA	186	115	71	43
chr11	71155153	71155153	A	G	exonic	DHCR7	NaN	synonymous SNV	DHCR7:NM_001163817:exon4:c.T207C:p.T69T,DHCR7:NM_001360:exon4:c.T207C:p.T69T	rs1790334	NaN	0.810104	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	65.007837	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	0	23	56
chr11	71155171	71155171	C	T	exonic	DHCR7	NaN	synonymous SNV	DHCR7:NM_001163817:exon4:c.G189A:p.Q63Q,DHCR7:NM_001360:exon4:c.G189A:p.Q63Q	rs1044482	NaN	0.400958	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	25.0634	0	11.672549	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	16	6	49
chr11	71164608	71164608	A	A	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr11	71174452	71174452	A	G	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	rs2276362	NaN	0.394169	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.856103	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	10	10	52
chr11	71174589	71174589	T	C	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	rs1629304	NaN	0.991813	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	48.144622	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	0	18	58
chr11	71177399	71177399	T	C	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr11	71183690	71183690	C	C	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	71185294	71185294	T	C	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	11	4	7	0
chr11	71185479	71185479	T	C	exonic	NADSYN1	NaN	synonymous SNV	NADSYN1:NM_018161:exon9:c.T705C:p.C235C	rs2276354	NaN	0.801917	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2279.45	0	NaN	NA	NA	204	0	204	45
chr11	71193113	71193113	G	C	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	129	73	42	0
chr11	71193135	71193135	G	C	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	rs7949129	NaN	0.265375	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	214.192	0	NaN	NA	NA	121	68	53	17
chr11	71193454	71193454	G	T	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	71193456	71193456	C	T	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	71193458	71193458	T	G	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	71195527	71195527	G	T	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.43843	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	483	464	19	0
chr11	71195539	71195539	A	A	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	15	12	0	0
chr11	71195542	71195542	A	A	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr11	71208445	71208445	T	T	intronic	NADSYN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	71212465	71212465	A	A	UTR3	NADSYN1	NM_018161:c.*67A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	71239002	71239002	A	A	UTR3	KRTAP5-7	NM_001012503:c.*158A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr11	71249183	71249183	T	C	exonic	KRTAP5-8	NaN	nonsynonymous SNV	KRTAP5-8:NM_021046:exon1:c.T82C:p.C28R	rs55921335	ID=COSM1356753;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.33107	0.01	D	0.999	D	0.982	D	.	.	0.004	P	3.125	M	4.0	T	-0.928	T	0.000	T	0.143	-0.808	0.655	1.57	0.974	2.213	3.337	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.198076	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	19
chr11	71507148	71507148	T	C	exonic	FAM86C1	NaN	nonsynonymous SNV	FAM86C1:NM_152563:exon3:c.T245C:p.L82P,FAM86C1:NM_001099653:exon4:c.T326C:p.L109P,FAM86C1:NM_018172:exon4:c.T347C:p.L116P	NaN	NaN	0.000199681	0.04	D	0.983	D	0.483	P	.	.	1.000	N	0.695	N	1.99	T	-1.039	T	0.047	T	0.809	0.896	8.641	-2.98	-0.606	-0.110	5.884	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.699132	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	151	144	7	0
chr11	71668363	71668363	T	C	intronic	RNF121	NaN	NaN	NaN	rs199684147	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.105998	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	6	2	4	0
chr11	71711780	71711780	A	A	intronic	IL18BP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	15	13	0	0
chr11	71712175	71712175	G	A	intronic	IL18BP	NaN	NaN	NaN	rs1892919	NaN	0.795128	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	317.441	68	108.409009	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	159	101	58	50
chr11	71712557	71712557	G	A	exonic	IL18BP	NaN	nonsynonymous SNV	IL18BP:NM_005699:exon4:c.G466A:p.E156K,IL18BP:NM_173042:exon4:c.G466A:p.E156K,IL18BP:NM_001039660:exon5:c.G466A:p.E156K,IL18BP:NM_001145057:exon5:c.G466A:p.E156K,IL18BP:NM_001039659:exon6:c.G466A:p.E156K	NaN	NaN	NaN	0.75	T	0.11	B	0.056	B	0.042	N	0.861	N	1.59	L	1.57	T	-0.966	T	0.079	T	0.144	1.805	12.00	3.8	1.174	1.720	10.155	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.05232	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	483	470	13	0
chr11	71713420	71713420	C	G	UTR3	IL18BP	NM_001039660:c.*513C>G,NM_001039659:c.*513C>G,NM_173044:c.*478C>G,NM_005699:c.*729C>G,NM_173042:c.*513C>G,NM_001145057:c.*513C>G,NM_001145055:c.*478C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	71715215	71715215	C	G	intronic	NUMA1	NaN	NaN	NaN	rs2845857	NaN	0.802716	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	93.108781	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	78	41	37	58
chr11	71715218	71715218	T	C	intronic	NUMA1	NaN	NaN	NaN	rs2852365	NaN	0.879792	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	225.424291	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	78	0	78	58
chr11	71717133	71717133	A	G	exonic	NUMA1	NaN	synonymous SNV	NUMA1:NM_001286561:exon22:c.T5598C:p.T1866T,NUMA1:NM_006185:exon22:c.T5640C:p.T1880T	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.974	T	0.097	T	.	0.349	5.893	-3.82	-0.445	-1.162	1.000	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.983723	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	274	266	8	0
chr11	71721757	71721757	C	G	intronic	NUMA1	NaN	NaN	NaN	rs78266495	NaN	0.0441294	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	129.91	0	NaN	NA	NA	35	8	27	0
chr11	71729640	71729640	A	G	ncRNA_intronic	LOC100128494	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.731978	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	250	230	20	0
chr11	71729662	71729662	T	C	ncRNA_intronic	LOC100128494	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.715258	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	253	247	6	0
chr11	71735479	71735479	A	A	intronic	NUMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr11	71806179	71806179	G	C	UTR3	LRTOMT	NM_001271471:c.*33G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	17	8	9	0
chr11	71806180	71806180	C	C	UTR3	LRTOMT	NM_001271471:c.*34C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	63	53	0	0
chr11	71816134	71816134	A	A	intronic	LRTOMT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	71816981	71816981	G	A	splicing	LRTOMT	NM_001145308:exon5:c.84-1G>A,NM_001145309:exon7:c.84-1G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	0.968	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	-0.125	3.389	3.02	0.997	1.680	10.779	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.887245	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	108	98	10	0
chr11	71819992	71819992	T	C	UTR3	LRTOMT	NM_001145308:c.*21T>C,NM_001145310:c.*21T>C,NM_001145309:c.*21T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	10.135	35	NaN	NA	NA	32	27	7	1
chr11	71822165	71822165	G	A	intronic	ANAPC15	NaN	NaN	NaN	rs11235439	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.559941	nearby_gap_events	REJECT	150	132	18	0
chr11	71849996	71849996	T	T	intronic	FOLR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr11	71850211	71850211	A	A	intronic	FOLR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	71932888	71932888	A	A	UTR3	FOLR2	NM_001113536:c.*82A>A,NM_000803:c.*82A>A,NM_001113535:c.*82A>A,NM_001113534:c.*82A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr11	71939089	71939089	T	T	intronic	INPPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	71939341	71939341	G	A	intronic	INPPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.167415	nearby_gap_events	REJECT	68	62	6	0
chr11	71939793	71939793	G	C	exonic	INPPL1	NaN	synonymous SNV	INPPL1:NM_001567:exon4:c.G420C:p.P140P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	32	24	8	0
chr11	71944486	71944486	T	G	exonic	INPPL1	NaN	nonsynonymous SNV	INPPL1:NM_001567:exon18:c.T2042G:p.V681G	NaN	NaN	NaN	0.26	T	0.922	P	0.674	P	0.000	D	1.000	D	0.675	N	-1.33	T	-0.308	T	0.407	T	0.591	5.043	29.9	5.42	2.192	7.555	14.582	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.102641	nearby_gap_events	REJECT	180	168	12	0
chr11	71944487	71944487	C	T	exonic	INPPL1	NaN	synonymous SNV	INPPL1:NM_001567:exon18:c.C2043T:p.V681V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.977559	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	176	161	15	0
chr11	71944661	71944661	A	C	intronic	INPPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.996363	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	76	69	7	0
chr11	71948992	71948992	T	C	intronic	INPPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr11	71951053	71951053	C	A	exonic	PHOX2A	NaN	nonsynonymous SNV	PHOX2A:NM_005169:exon3:c.G595T:p.G199C	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.953	P	0.392	B	0.032	N	1.000	N	0.805	L	-2.75	D	-0.371	T	0.495	T	0.277	1.374	10.52	1.76	0.332	0.482	6.461	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	30	8.726132	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr11	71955020	71955020	T	C	exonic	PHOX2A	NaN	nonsynonymous SNV	PHOX2A:NM_005169:exon1:c.A29G:p.D10G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.939	D	0.425	N	1.000	D	1.7	L	-2.83	D	0.563	D	0.779	D	0.652	4.563	24.7	4.11	1.855	6.990	11.403	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.09523809523809613	NA	0	0	NaN	NA	NA	5	3	2	0
chr11	72005005	72005005	T	G	intronic	CLPB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.65159	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	125	111	14	0
chr11	72013244	72013244	T	C	intronic	CLPB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr11	72028100	72028100	T	T	intronic	CLPB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	720479	720479	C	T	intronic	EPS8L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.333483	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	41	37	4	0
chr11	72083935	72083935	G	A	intronic	CLPB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.460045	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	193	171	22	0
chr11	721570	721570	C	T	exonic	EPS8L2	NaN	synonymous SNV	EPS8L2:NM_022772:exon10:c.C774T:p.I258I	rs7635	ID=COSM1356757;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.279752	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	49.552271	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	0	18	34
chr11	722683	722683	C	A	exonic	EPS8L2	NaN	nonsynonymous SNV	EPS8L2:NM_022772:exon14:c.C1219A:p.P407T	NaN	NaN	NaN	0.18	T	1.0	D	0.999	D	0.002	U	1.000	D	1.425	L	0.87	T	-0.848	T	0.184	T	0.443	3.250	16.90	2.89	1.645	5.284	12.999	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.047511	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	87	79	8	0
chr11	722788	722788	T	C	exonic	EPS8L2	NaN	nonsynonymous SNV	EPS8L2:NM_022772:exon14:c.T1324C:p.S442P	NaN	NaN	NaN	0.28	T	0.0	B	0.0	B	0.006	N	1.000	N	0.55	N	1.98	T	-1.033	T	0.032	T	0.087	-0.341	2.387	-4.05	-2.381	-1.386	6.466	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.66463	0	NaN	NA	NA	9	8	2	0
chr11	72286045	72286045	G	A	intergenic	LINC01537,PDE2A	dist=1779;dist=1139	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	72289291	72289291	T	C	exonic	PDE2A	NaN	synonymous SNV	PDE2A:NM_001143839:exon29:c.A2580G:p.A860A,PDE2A:NM_001243784:exon30:c.A2538G:p.A846A,PDE2A:NM_002599:exon30:c.A2601G:p.A867A,PDE2A:NM_001146209:exon31:c.A2574G:p.A858A	rs1135029	NaN	0.298323	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	203.265425	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	67	0	67	36
chr11	72291883	72291883	C	A	intronic	PDE2A	NaN	NaN	NaN	rs644698	NaN	0.976637	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.183902	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	0	13	39
chr11	72291927	72291927	T	C	intronic	PDE2A	NaN	NaN	NaN	rs577536	NaN	0.976637	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.825281	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	57
chr11	72295906	72295906	A	G	intronic	PDE2A	NaN	NaN	NaN	rs452228	NaN	0.976637	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2181.25	0	NaN	NA	NA	216	0	216	52
chr11	72297056	72297056	T	T	intronic	PDE2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr11	72297578	72297578	T	T	intronic	PDE2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	72300923	72300923	C	T	intronic	PDE2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	0.14971377025292512	Somatic	15.5443	35	15.141094	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	34	27	7	5
chr11	72300940	72300940	T	T	intronic	PDE2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	97	96	0	0
chr11	72302297	72302297	T	T	intronic	PDE2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr11	72302494	72302494	A	C	intronic	PDE2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	15	7	8	0
chr11	72351358	72351358	C	T	intronic	PDE2A	NaN	NaN	NaN	rs455631	NaN	0.477835	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr11	72352153	72352153	G	A	intronic	PDE2A	NaN	NaN	NaN	rs71477739	NaN	0.128395	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	3	5	0
chr11	72368281	72368281	G	A	intronic	PDE2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	72385265	72385265	C	T	UTR5	PDE2A	NM_002599:c.-14G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.488247	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	110	97	13	0
chr11	72385279	72385279	A	A	UTR5	PDE2A	NM_002599:c.-28T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	72396049	72396049	G	G	downstream	ARAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr11	72396050	72396050	A	A	downstream	ARAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	72396976	72396976	G	C	intronic	ARAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-1.073	T	0.039	T	.	-0.444	1.938	-7.52	-3.503	-0.049	2.288	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.761431	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	185	170	15	0
chr11	72404860	72404860	G	T	intronic	ARAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	72404864	72404864	A	C	intronic	ARAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	72408657	72408657	C	T	exonic	ARAP1	NaN	synonymous SNV	ARAP1:NM_001135190:exon17:c.G1857A:p.L619L,ARAP1:NM_015242:exon18:c.G2040A:p.L680L,ARAP1:NM_001040118:exon20:c.G2775A:p.L925L	rs2291289	NaN	0.258986	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	78.322439	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	2	27	38
chr11	72412703	72412703	C	G	exonic	ARAP1	NaN	nonsynonymous SNV	ARAP1:NM_001135190:exon13:c.G1375C:p.A459P,ARAP1:NM_015242:exon14:c.G1558C:p.A520P,ARAP1:NM_001040118:exon16:c.G2293C:p.A765P	NaN	NaN	NaN	0.24	T	0.3	B	0.105	B	0.056	N	0.906	N	0	N	-0.99	T	-0.915	T	0.160	T	0.38	1.754	11.82	2.41	1.363	0.719	8.692	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.312392	nearby_gap_events	REJECT	25	18	7	0
chr11	72414189	72414189	G	A	intronic	ARAP1	NaN	NaN	NaN	rs3765105	NaN	0.434505	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	24.3488	0	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	72420784	72420784	C	A	intronic	ARAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	72423712	72423712	A	A	intronic	ARAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	724313	724313	T	C	intronic	EPS8L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	72492241	72492241	G	A	UTR5	STARD10	NM_006645:c.-15C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.842581	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	67	57	10	0
chr11	72497616	72497616	A	G	intronic	STARD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	13	7	6	0
chr11	726178	726178	G	C	intronic	EPS8L2	NaN	NaN	NaN	rs28498399	NaN	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	101.079	0	NaN	NA	NA	10	0	10	38
chr11	726666	726666	T	T	exonic	EPS8L2	NaN	synonymous SNV	EPS8L2:NM_022772:exon20:c.T1982T:p.L661L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	19	19	0	0
chr11	72861872	72861872	G	C	intergenic	FCHSD2,P2RY2	dist=8729;dist=67471	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	72861873	72861873	G	T	intergenic	FCHSD2,P2RY2	dist=8730;dist=67470	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	72861874	72861874	T	G	intergenic	FCHSD2,P2RY2	dist=8731;dist=67469	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	72880193	72880193	G	A	intergenic	FCHSD2,P2RY2	dist=27050;dist=49150	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr11	72888564	72888564	T	G	intergenic	FCHSD2,P2RY2	dist=35421;dist=40779	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	72888565	72888565	C	T	intergenic	FCHSD2,P2RY2	dist=35422;dist=40778	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	72945214	72945214	G	C	exonic	P2RY2	NaN	nonsynonymous SNV	P2RY2:NM_002564:exon3:c.G10C:p.D4H,P2RY2:NM_176071:exon3:c.G10C:p.D4H,P2RY2:NM_176072:exon3:c.G10C:p.D4H	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.214	B	0.085	B	0.491	N	1.000	N	0	N	-0.81	T	-0.866	T	0.210	T	0.14	1.589	11.27	4.36	1.222	1.517	7.716	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.890369	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	61	52	9	0
chr11	73063832	73063832	G	A	intronic	ARHGEF17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	73073592	73073592	G	C	exonic	ARHGEF17	NaN	synonymous SNV	ARHGEF17:NM_014786:exon14:c.G4809C:p.G1603G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr11	73073594	73073594	C	C	exonic	ARHGEF17	NaN	synonymous SNV	ARHGEF17:NM_014786:exon14:c.C4811C:p.P1604P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	38	31	0	0
chr11	73074151	73074151	T	T	intronic	ARHGEF17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	73078501	73078501	T	T	intronic	ARHGEF17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	73095319	73095319	C	G	intronic	RELT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	73105016	73105016	A	A	intronic	RELT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	7324584	7324584	G	A	exonic	SYT9	NaN	nonsynonymous SNV	SYT9:NM_175733:exon2:c.G460A:p.V154M	rs78477754	NaN	0.0139776	0.23	T	0.006	B	0.007	B	0.006	N	1.000	N	-0.405	N	0.53	T	-1.066	T	0.016	T	0.222	0.049	4.269	1.29	0.368	2.068	8.314	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	205.39	0	113.553171	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	106	57	49	2
chr11	73308167	73308167	A	T	intronic	FAM168A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	73361813	73361813	A	A	intronic	PLEKHB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	73418461	73418461	T	G	intronic	RAB6A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.572491	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	203	193	10	0
chr11	73499137	73499137	A	A	intronic	MRPL48	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	73575254	73575254	T	T	intronic	MRPL48	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	73686240	73686240	C	G	intronic	UCP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	73686241	73686241	A	G	intronic	UCP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	73712403	73712403	T	T	UTR3	UCP3	NM_003356:c.*54A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr11	73714838	73714838	T	T	UTR3	UCP3	NM_022803:c.*30A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	73715652	73715652	G	A	intronic	UCP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.338454	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	124	113	11	0
chr11	73715666	73715666	G	A	intronic	UCP3	NaN	NaN	NaN	rs2734828	NaN	0.272764	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	620.326	60	NaN	NA	NA	103	18	85	23
chr11	73718124	73718124	A	A	UTR5	UCP3	NM_003356:c.-37T>T,NM_022803:c.-37T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	24	23	0	0
chr11	73745746	73745746	A	A	intronic	C2CD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	31	27	0	0
chr11	73765731	73765731	A	C	intronic	C2CD3	NaN	NaN	NaN	rs117181508	NaN	0.0253594	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	59.2787	0	NaN	NA	NA	167	76	91	2
chr11	73796037	73796037	A	G	intronic	C2CD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.780333	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	194	186	8	0
chr11	73796990	73796990	AT	A,TA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1800.67	0	NaN	NA	NA	267	0	69	4
chr11	73796991	73796991	T	A	intronic	C2CD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	5.6576536069813655E-15	NA	0	0	NaN	NA	NA	147	51	96	0
chr11	73850910	73850910	A	A	intronic	C2CD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	73882410	73882410	T	C	UTR5	PPME1	NM_001271593:c.-57T>C,NM_016147:c.-57T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr11	73961901	73961901	T	T	intronic	PPME1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr11	73978243	73978243	G	A	exonic	P4HA3	NaN	stopgain	P4HA3:NM_001288748:exon13:c.C1678T:p.Q560X	rs3741132	NaN	0.226637	0.3	T	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	5.342	34	0.713	0.045	0.401	4.675	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.531871	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	44	28	16	17
chr11	74009254	74009254	T	T	intronic	P4HA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr11	74015500	74015500	A	A	intronic	P4HA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr11	74022429	74022429	C	T	ncRNA_exonic	LOC101928580	NaN	NaN	NaN	rs7944333	NaN	0.27516	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.554154	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	4	3	26
chr11	74049569	74049569	A	G	exonic	PGM2L1	NaN	synonymous SNV	PGM2L1:NM_173582:exon13:c.T1710C:p.S570S	rs3867270	NaN	0.554712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	22.7352	0	9.928379	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	5	4	20
chr11	74054346	74054346	G	T	intronic	PGM2L1	NaN	NaN	NaN	rs641271	NaN	0.619409	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.014184675043520705	NA	0	25	NaN	NA	NA	51	26	25	51
chr11	74058030	74058030	T	A	intronic	PGM2L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	3	4	0
chr11	74204727	74204727	A	G	exonic	LIPT2	NaN	synonymous SNV	LIPT2:NM_001144869:exon1:c.T22C:p.L8L	rs4944895	NaN	0.932708	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.253891	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	13
chr11	74305042	74305042	T	C	intronic	POLD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	12	5	5	0
chr11	74315896	74315896	A	A	intronic	POLD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr11	7436701	7436701	A	G	intronic	SYT9	NaN	NaN	NaN	rs17289871	NaN	0.120807	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	15	6	9	0
chr11	74407722	74407722	A	A	intronic	CHRDL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr11	74408263	74408263	A	G	exonic	CHRDL2	NaN	nonsynonymous SNV	CHRDL2:NM_001304417:exon8:c.T1060C:p.W354R,CHRDL2:NM_001304391:exon9:c.T1000C:p.W334R,CHRDL2:NM_001304390:exon10:c.T1195C:p.W399R,CHRDL2:NM_015424:exon11:c.T1255C:p.W419R	NaN	NaN	NaN	0.93	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	D	0	N	1.02	T	-0.871	T	0.045	T	0.183	-0.321	2.474	-2.95	-0.119	-0.145	5.834	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.72849	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	153	141	12	0
chr11	74413818	74413818	T	T	intronic	CHRDL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr11	74413841	74413841	T	C	exonic	CHRDL2	NaN	nonsynonymous SNV	CHRDL2:NM_001304417:exon6:c.A923G:p.K308R,CHRDL2:NM_001304391:exon7:c.A863G:p.K288R,CHRDL2:NM_001304415:exon7:c.A863G:p.K288R,CHRDL2:NM_001304416:exon7:c.A770G:p.K257R,CHRDL2:NM_001304390:exon8:c.A1058G:p.K353R,CHRDL2:NM_001278473:exon9:c.A1118G:p.K373R,CHRDL2:NM_015424:exon9:c.A1118G:p.K373R	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.569	P	0.342	B	0.000	D	0.935	D	1.7	L	0.77	T	-0.785	T	0.144	T	0.183	3.356	17.31	5.09	2.037	3.316	11.538	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.617973	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	226	220	6	0
chr11	74419283	74419283	T	T	intronic	CHRDL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	74500615	74500615	T	T	intronic	RNF169	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr11	74554147	74554147	G	A	UTR3	XRRA1	NM_001270380:c.*313C>T,NM_182969:c.*98C>T,NM_001270381:c.*98C>T	NaN	NaN	rs517666	NaN	0.229233	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	48.711667	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	22	20	16
chr11	74555969	74555969	C	G	intronic	XRRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	74555970	74555970	T	G	intronic	XRRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	1	3	0
chr11	74562067	74562067	G	A	intronic	XRRA1	NaN	NaN	NaN	rs557037	NaN	0.0726837	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	77.811199	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	27	33	7
chr11	74562965	74562965	T	G	intronic	XRRA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	18	6	12	0
chr11	74676640	74676640	T	T	intronic	SPCS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	74680784	74680784	A	A	intronic	SPCS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr11	74705696	74705696	T	C	exonic	NEU3	NaN	synonymous SNV	NEU3:NM_006656:exon2:c.T237C:p.S79S	rs544115	NaN	0.704073	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.541798	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	19	16	56
chr11	74800161	74800161	G	T	exonic	OR2AT4	NaN	nonsynonymous SNV	OR2AT4:NM_001005285:exon1:c.C598A:p.Q200K	NaN	NaN	NaN	0	D	0.65	P	0.615	P	0.009	U	0.996	N	-0.1	N	1.25	T	-1.094	T	0.060	T	0.421	2.207	13.34	3.34	1.318	0.159	4.392	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	69	61	8	0
chr11	74862356	74862356	T	C	UTR5	SLCO2B1	NM_007256:c.-71T>C,NM_001145212:c.-71T>C	NaN	NaN	rs2851069	NaN	0.376997	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	625.202	0	NaN	NA	NA	70	2	68	34
chr11	74862391	74862391	A	G	UTR5	SLCO2B1	NM_007256:c.-36A>G,NM_001145212:c.-36A>G	NaN	NaN	rs1944612	NaN	0.975839	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	572.755	0	NaN	NA	NA	65	3	61	51
chr11	74902169	74902169	C	A	intronic	SLCO2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	74902171	74902171	G	A	intronic	SLCO2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	74904362	74904362	T	C	exonic	SLCO2B1	NaN	nonsynonymous SNV	SLCO2B1:NM_001145212:exon6:c.T743C:p.I248T,SLCO2B1:NM_001145211:exon9:c.T1109C:p.I370T,SLCO2B1:NM_007256:exon9:c.T1175C:p.I392T	rs1621378	NaN	1	1	T	0.0	B	0.0	B	0.001	N	1.000	P	-2.975	N	1.28	T	-0.979	T	0.000	T	0.257	-1.607	0.013	3.3	0.649	2.678	6.692	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.731001	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	0	19	48
chr11	74913821	74913821	T	T	intronic	SLCO2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	74977155	74977155	T	C	UTR3	ARRB1	NM_020251:c.*52A>G,NM_004041:c.*52A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr11	74989750	74989750	G	A	exonic	ARRB1	NaN	nonsynonymous SNV	ARRB1:NM_004041:exon8:c.C521T:p.A174V,ARRB1:NM_020251:exon8:c.C521T:p.A174V	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.934	D	0.000	D	1.000	D	3.2	M	1.63	T	-0.430	T	0.241	T	0.804	4.985	29.2	4.98	2.301	9.869	15.752	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.192295	nearby_gap_events	REJECT	148	140	8	0
chr11	74992909	74992909	T	G	intronic	ARRB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr11	74993145	74993145	A	A	intronic	ARRB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	7507278	7507278	A	A	intronic	OLFML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	75110680	75110680	C	T	intronic	RPS3	NaN	NaN	NaN	rs7131286	NaN	0.29393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.54591	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	10
chr11	75111883	75111883	A	G	intronic	RPS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	12	4	7	0
chr11	75115945	75115945	A	C	intronic	RPS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	75132768	75132768	C	T	intronic	RPS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	75133612	75133612	T	T	UTR3	KLHL35	NM_001039548:c.*12A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr11	75154370	75154370	A	A	intronic	GDPD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	75154737	75154737	T	T	intronic	GDPD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	75160575	75160575	G	A	exonic	GDPD5	NaN	synonymous SNV	GDPD5:NM_030792:exon8:c.C555T:p.R185R	rs518611	NaN	0.534944	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	77.130731	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	0	24	52
chr11	75161082	75161082	A	A	intronic	GDPD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	75210914	75210914	C	G	intronic	GDPD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	75210917	75210917	C	A	intronic	GDPD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	75224798	75224798	C	G	intronic	GDPD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	75281609	75281609	C	G	intronic	SERPINH1	NaN	NaN	NaN	rs1790304	NaN	0.693291	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	75294333	75294333	A	G	intergenic	SERPINH1,MAP6	dist=10484;dist=3630	NaN	NaN	rs1793395	NaN	0.698083	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr11	75378560	75378560	G	G	exonic	MAP6	NaN	synonymous SNV	MAP6:NM_033063:exon1:c.C855C:p.L285L,MAP6:NM_207577:exon1:c.C855C:p.L285L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	75431126	75431126	C	T	exonic	MOGAT2	NaN	stopgain	MOGAT2:NM_025098:exon2:c.C181T:p.R61X	NaN	NaN	NaN	0.52	T	.	.	.	.	0.603	N	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.753	15.17	-8.94	-1.553	-0.395	8.976	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.064416	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	87	79	8	0
chr11	75480063	75480063	C	C	exonic	DGAT2	NaN	synonymous SNV	DGAT2:NM_001253891:exon1:c.C27C:p.S9S,DGAT2:NM_032564:exon1:c.C27C:p.S9S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	19	15	0	0
chr11	75480227	75480227	G	C	intronic	DGAT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.8481	0	NaN	NA	NA	16	13	3	1
chr11	75495844	75495844	A	A	intronic	DGAT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr11	75507234	75507234	A	C	intronic	DGAT2	NaN	NaN	NaN	rs12222542	NaN	0.234225	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	86.922413	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	104	64	40	12
chr11	75509341	75509341	C	T	exonic	DGAT2	NaN	synonymous SNV	DGAT2:NM_001253891:exon6:c.C750T:p.G250G,DGAT2:NM_032564:exon7:c.C879T:p.G293G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.785382	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	266	253	13	2
chr11	75882889	75882889	T	T	intergenic	UVRAG,WNT11	dist=27607;dist=14481	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr11	75882890	75882890	G	G	intergenic	UVRAG,WNT11	dist=27608;dist=14480	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr11	75883151	75883151	G	T	intergenic	UVRAG,WNT11	dist=27869;dist=14219	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr11	75883152	75883152	A	C	intergenic	UVRAG,WNT11	dist=27870;dist=14218	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr11	75883154	75883154	G	T	intergenic	UVRAG,WNT11	dist=27872;dist=14216	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr11	75905526	75905526	C	A	intronic	WNT11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	16.3429	0	7.207952	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	28	21	7	3
chr11	75905528	75905528	CA	AC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	30.3521	0	NaN	NA	NA	17	9	2	7
chr11	75905529	75905529	A	A	intronic	WNT11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr11	75907777	75907777	A	T	intronic	WNT11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	75907778	75907778	A	C	intronic	WNT11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	75954246	75954246	A	G	intergenic	WNT11,PRKRIR	dist=36672;dist=106755	NaN	NaN	rs685739	NaN	0.597244	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	75954392	75954392	A	G	intergenic	WNT11,PRKRIR	dist=36818;dist=106609	NaN	NaN	rs35008227	NaN	0.0932508	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	75968202	75968202	G	A	intergenic	WNT11,PRKRIR	dist=50628;dist=92799	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	75977142	75977142	G	A	intergenic	WNT11,PRKRIR	dist=59568;dist=83859	NaN	NaN	rs653384	NaN	0.90595	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	76022274	76022274	A	A	intergenic	WNT11,PRKRIR	dist=104700;dist=38727	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	76022282	76022282	G	G	intergenic	WNT11,PRKRIR	dist=104708;dist=38719	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	7614552	7614552	A	G	intronic	PPFIBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	76156545	76156545	G	C	intronic	C11orf30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr11	76156546	76156546	A	T	intronic	C11orf30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr11	76156547	76156547	G	C	intronic	C11orf30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	76156548	76156548	A	C	intronic	C11orf30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	76156549	76156549	G	C	intronic	C11orf30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr11	76156550	76156550	G	T	intronic	C11orf30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr11	76156551	76156551	T	C	intronic	C11orf30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	76156554	76156554	G	T	intronic	C11orf30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	76156556	76156556	G	C	intronic	C11orf30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	76156558	76156558	G	T	intronic	C11orf30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	76158075	76158075	T	A,G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	45.2004	0	NaN	NA	NA	7	1	4	0
chr11	7618720	7618720	T	C	intronic	PPFIBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.837002	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	380	349	31	0
chr11	7619027	7619027	C	C	intronic	PPFIBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	76227166	76227166	T	G	intronic	C11orf30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr11	76227398	76227398	A	T	intronic	C11orf30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	9	0	8	0
chr11	76227402	76227402	A	T	intronic	C11orf30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr11	76253453	76253453	A	A	intronic	C11orf30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	76255815	76255815	C	G	exonic	C11orf30	NaN	synonymous SNV	C11orf30:NM_001300943:exon19:c.C3225G:p.P1075P,C11orf30:NM_001300944:exon19:c.C3225G:p.P1075P,C11orf30:NM_020193:exon19:c.C3222G:p.P1074P,C11orf30:NM_001300942:exon20:c.C3267G:p.P1089P	rs35962163	NaN	0.00539137	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	288.957	0	NaN	NA	NA	67	27	40	4
chr11	76372560	76372560	G	A	intronic	LRRC32	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.371509	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	172	164	8	0
chr11	76389458	76389458	A	A	intergenic	LRRC32,GUCY2EP	dist=7667;dist=1752	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	76441098	76441098	G	C	intergenic	GUCY2EP,TSKU	dist=8265;dist=52259	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	76507105	76507105	T	C	exonic	TSKU	NaN	nonsynonymous SNV	TSKU:NM_001258210:exon2:c.T445C:p.S149P,TSKU:NM_015516:exon2:c.T445C:p.S149P	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.86	P	0.454	P	0.006	N	1.000	N	1.79	L	3.54	T	-0.960	T	0.130	T	0.471	1.048	9.278	1.59	0.296	4.372	2.288	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.071683	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	200	193	7	0
chr11	76507401	76507401	C	T	exonic	TSKU	NaN	synonymous SNV	TSKU:NM_001258210:exon2:c.C741T:p.P247P,TSKU:NM_015516:exon2:c.C741T:p.P247P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.695168	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	134	128	6	0
chr11	7654018	7654018	T	C	intronic	PPFIBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr11	76572172	76572172	A	G	intronic	ACER3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.471714	nearby_gap_events	REJECT	77	70	7	0
chr11	76572544	76572544	T	G	intronic	ACER3	NaN	NaN	NaN	rs6592675	NaN	0.65595	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	76687448	76687448	A	C	intronic	ACER3	NaN	NaN	NaN	rs1517908	NaN	0.664137	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5119	0	NaN	NA	NA	68	31	37	0
chr11	76687516	76687516	T	C	intronic	ACER3	NaN	NaN	NaN	rs1517907	NaN	0.532947	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	22.9872	0	NaN	NA	NA	75	33	42	15
chr11	76813967	76813967	C	T	exonic	OMP	NaN	nonsynonymous SNV	OMP:NM_006189:exon1:c.C82T:p.R28C	rs368066786	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.991	D	.	.	1.000	D	0.975	L	0.86	T	-0.733	T	0.207	T	0.867	3.589	18.28	5.12	2.675	2.092	14.325	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	28.7303	0	35.890991	nearby_gap_events	REJECT	105	84	21	0
chr11	76823616	76823616	C	C	intronic	CAPN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	24	22	0	0
chr11	76823934	76823934	A	A	intronic	CAPN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	76826631	76826631	A	G	exonic	CAPN5	NaN	nonsynonymous SNV	CAPN5:NM_004055:exon6:c.A890G:p.D297G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	4.335	H	-3.09	D	1.082	D	0.926	D	0.913	4.863	27.8	5.07	1.898	9.279	14.015	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.134775	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	21	14	7	0
chr11	76827360	76827360	A	G	intronic	CAPN5	NaN	NaN	NaN	rs11604536	NaN	0.355431	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	49.3048	0	NaN	NA	NA	25	0	25	14
chr11	76833475	76833475	T	T	intronic	CAPN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	76853782	76853782	T	TC	exonic	MYO7A	NaN	frameshift substitution	MYO7A:NM_000260:exon3:c.46_46delinsTC,MYO7A:NM_001127179:exon3:c.46_46delinsTC,MYO7A:NM_001127180:exon3:c.46_46delinsTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	569.454	0	NaN	NA	NA	156	0	16	1
chr11	76853784	76853784	G	C	exonic	MYO7A	NaN	nonsynonymous SNV	MYO7A:NM_000260:exon3:c.G48C:p.L16F,MYO7A:NM_001127179:exon3:c.G48C:p.L16F,MYO7A:NM_001127180:exon3:c.G48C:p.L16F	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.08	B	0.138	B	0.000	D	1.000	N	0.55	N	-2.28	D	-0.693	T	0.368	T	0.069	2.269	13.54	-6.37	-0.915	-2.936	2.046	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.26113	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	172	159	13	0
chr11	76853849	76853849	T	C	exonic	MYO7A	NaN	nonsynonymous SNV	MYO7A:NM_000260:exon3:c.T113C:p.V38A,MYO7A:NM_001127179:exon3:c.T113C:p.V38A,MYO7A:NM_001127180:exon3:c.T113C:p.V38A	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.989	D	0.853	P	0.000	D	1.000	D	2.315	M	-2.34	D	0.562	D	0.759	D	0.77	4.363	23.0	4.54	1.903	7.525	14.038	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.69248	nearby_gap_events	REJECT	200	190	10	0
chr11	76871978	76871978	G	A	intronic	MYO7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.04024767801857623	NA	0	0	25.143079	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	91	76	15	0
chr11	76871979	76871979	A	G	intronic	MYO7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.585469	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	91	75	16	0
chr11	76883793	76883793	G	A	splicing	MYO7A	NM_001127179:exon16:c.1798-1G>A,NM_000260:exon16:c.1798-1G>A,NM_001127180:exon16:c.1798-1G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.755	19.06	4.77	2.368	9.294	18.157	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.331678	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	59	49	10	0
chr11	76908387	76908387	T	T	intronic	MYO7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	76908791	76908791	A	G	intronic	MYO7A	NaN	NaN	NaN	rs4944149	NaN	0.546526	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	28	18	10	22
chr11	76913322	76913322	G	C	intronic	MYO7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	162	137	25	0
chr11	76913323	76913323	C	G	intronic	MYO7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	79	NaN	NA	NA	109	106	3	0
chr11	76915322	76915322	G	C	intronic	MYO7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	76918493	76918493	C	T	intronic	MYO7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr11	76918494	76918494	A	T	intronic	MYO7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	76922135	76922135	T	T	intronic	MYO7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	76922256	76922256	G	G	exonic	MYO7A	NaN	synonymous SNV	MYO7A:NM_000260:exon45:c.G6111G:p.L2037L,MYO7A:NM_001127180:exon45:c.G5997G:p.L1999L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	56	51	0	0
chr11	76922312	76922312	T	T	exonic	MYO7A	NaN	synonymous SNV	MYO7A:NM_000260:exon45:c.T6167T:p.I2056I,MYO7A:NM_001127180:exon45:c.T6053T:p.I2018I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	94	75	0	0
chr11	76924130	76924130	A	T	intronic	MYO7A	NaN	NaN	NaN	rs2276289	NaN	0.807708	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	75.487414	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	0	26	55
chr11	770676	770676	T	T	UTR3	PDDC1	NM_182612:c.*221A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	77122469	77122469	C	T	intronic	PAK1	NaN	NaN	NaN	rs563731	NaN	0.119609	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	7712523	7712523	G	A	exonic	OVCH2	NaN	nonsynonymous SNV	OVCH2:NM_198185:exon15:c.C1616T:p.T539I	rs4633461	NaN	0.168331	0.23	T	0.111	B	0.116	B	0.211	N	1.000	P	2.28	M	2.14	T	-1.031	T	0.000	T	0.182	1.654	11.49	3.65	0.654	1.163	10.123	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	58.196861	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	33	26	14
chr11	7725387	7725387	C	T	intronic	OVCH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.306307	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	193	180	13	15
chr11	77333493	77333493	A	T	intronic	CLNS1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	77333496	77333496	T	G	intronic	CLNS1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	77333499	77333499	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	1	2,3	0
chr11	77333772	77333772	T	C	intronic	CLNS1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	10	4	3	0
chr11	77333775	77333775	A	C	intronic	CLNS1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	6	3	0
chr11	77333776	77333776	A	C	intronic	CLNS1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr11	77335982	77335982	C	A	intronic	CLNS1A	NaN	NaN	NaN	rs2013296	NaN	0.743011	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	66	39	26	38
chr11	77382993	77382993	T	A	intronic	RSF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	14	9	3	0
chr11	77386394	77386394	A	A	intronic	RSF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	77404711	77404711	A	A	intronic	RSF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	77412162	77412162	G	T	exonic	RSF1	NaN	nonsynonymous SNV	RSF1:NM_016578:exon6:c.C2112A:p.S704R	rs142112266	NaN	0.000399361	0.12	T	0.045	B	0.012	B	0.001	D	0.695	D	0.805	L	-2.03	D	-0.446	T	0.360	T	0.455	1.855	12.16	1.98	0.678	1.094	8.964	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.353414	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	155	147	8	0
chr11	77412164	77412164	T	C	exonic	RSF1	NaN	nonsynonymous SNV	RSF1:NM_016578:exon6:c.A2110G:p.S704G	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.199	B	0.079	B	0.001	D	0.917	D	0.805	L	-2.02	D	-0.254	T	0.415	T	0.195	2.404	14.00	5.23	2.201	1.859	14.956	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.124571	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	96	88	8	0
chr11	77413657	77413657	G	C	intronic	RSF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr11	77436596	77436596	T	A	exonic	RSF1	NaN	stopgain	RSF1:NM_016578:exon5:c.A727T:p.K243X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	7.358	39	5.87	2.239	1.425	11.058	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.027338515143394155	NA	0	0	NaN	NA	NA	18	14	4	0
chr11	774982	774982	C	A	intronic	PDDC1	NaN	NaN	NaN	rs7952095	NaN	0.47484	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	268.763053	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	92	0	92	38
chr11	775218	775218	A	C	intronic	PDDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	77590192	77590192	A	G	intronic	INTS4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	14	6	7	0
chr11	77705665	77705665	C	A	exonic	INTS4	NaN	nonsynonymous SNV	INTS4:NM_033547:exon1:c.G25T:p.V9F	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	1.845	L	.	.	-0.247	T	0.418	T	0.884	5.474	35	5.63	2.932	6.695	19.873	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2941176470588277	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr11	77734090	77734090	A	G	intronic	KCTD14,NDUFC2-KCTD14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.06666666666666758	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	11	4	0
chr11	77734097	77734097	G	T	intronic	KCTD14,NDUFC2-KCTD14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.09774436090225457	NA	0	0	NaN	NA	NA	13	9	4	0
chr11	77749801	77749801	C	A	exonic	NDUFC2-KCTD14	NaN	nonsynonymous SNV	NDUFC2-KCTD14:NM_001203262:exon2:c.G170T:p.G57V,NDUFC2-KCTD14:NM_001203260:exon3:c.G314T:p.G105V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.01234752682516007	NA	0	0	NaN	NA	NA	242	173	69	0
chr11	77780837	77780837	A	T	ncRNA_intronic	RNU6-83P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	77780839	77780839	T	T	ncRNA_intronic	RNU6-83P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	77820670	77820670	T	C	ncRNA_intronic	RNU6-83P	NaN	NaN	NaN	rs1783515	NaN	0.258586	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	22.7295	17	10.126201	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	5	4	7
chr11	77820673	77820673	T	C	ncRNA_intronic	RNU6-83P	NaN	NaN	NaN	rs1789032	NaN	0.258387	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	22.7352	15	NaN	NA	NA	9	5	4	7
chr11	77832263	77832263	T	G	intronic	ALG8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	77911325	77911325	G	T	intronic	USP35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.180602	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	101	91	10	0
chr11	77911335	77911335	A	C	intronic	USP35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.777451	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	104	94	10	0
chr11	77916703	77916703	A	A	intronic	USP35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	77920930	77920930	A	G	exonic	USP35	NaN	nonsynonymous SNV	USP35:NM_020798:exon10:c.A2029G:p.I677V	rs2511188	NaN	0.35004	0.59	T	0.0	B	0.0	B	0.143	N	1.000	P	-0.065	N	3.47	T	-0.917	T	0.000	T	0.04	-0.532	1.578	4.24	0.737	0.431	7.012	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	17	7	10	2
chr11	77921486	77921486	A	G	exonic	USP35	NaN	nonsynonymous SNV	USP35:NM_020798:exon10:c.A2585G:p.H862R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	3.52	H	1.83	T	-0.364	T	0.240	T	0.963	4.282	22.4	4.8	2.016	8.894	14.513	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.063048	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	184	178	6	0
chr11	77930621	77930621	A	G	intronic	GAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	77930623	77930623	G	T	intronic	GAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	77930624	77930624	T	C	intronic	GAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	77930626	77930626	G	T	intronic	GAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	77936166	77936166	A	G	exonic	GAB2	NaN	synonymous SNV	GAB2:NM_012296:exon5:c.T1176C:p.V392V,GAB2:NM_080491:exon5:c.T1290C:p.V430V	rs1385600	NaN	0.346246	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	309.834	0	NaN	NA	NA	106	49	57	23
chr11	77937800	77937800	G	A	exonic	GAB2	NaN	synonymous SNV	GAB2:NM_012296:exon4:c.C804T:p.F268F,GAB2:NM_080491:exon4:c.C918T:p.F306F	rs2248407	NaN	0.315895	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	63.5194	0	NaN	NA	NA	25	20	5	21
chr11	77991508	77991508	A	A	intronic	GAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	77991509	77991509	C	C	intronic	GAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	77991512	77991512	C	G	intronic	GAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	2	1	0
chr11	77991513	77991513	T	G	intronic	GAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	1	2	0
chr11	77991514	77991514	T	T	intronic	GAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr11	78048469	78048469	T	C	intronic	GAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr11	7817496	7817496	T	C	downstream	OR5P2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	7817498	7817498	T	G	downstream	OR5P2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr11	7818056	7818056	T	C	exonic	OR5P2	NaN	nonsynonymous SNV	OR5P2:NM_153444:exon1:c.A434G:p.Y145C	rs73406604	ID=COSM1559363;OCCURENCE=1(central_nervous_system)	0.236422	0.02	D	0.023	B	0.169	B	0.000	D	1.000	P	2.095	M	1.15	T	-0.991	T	0.000	T	0.261	0.266	5.438	3.18	0.511	0.078	4.477	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1627.7	0	NaN	NA	NA	156	0	156	32
chr11	78189460	78189460	T	C	intronic	NARS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr11	78279615	78279615	T	A	intronic	NARS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.030487736962115423	NA	0	0	NaN	NA	NA	61	38	23	0
chr11	78282878	78282878	C	C	intronic	NARS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	78282890	78282890	G	G	intronic	NARS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	78443586	78443586	G	A	exonic	TENM4	NaN	synonymous SNV	TENM4:NM_001098816:exon21:c.C2913T:p.I971I	rs17826919	NaN	0.121006	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	73.2165	0	NaN	NA	NA	20	8	11	25
chr11	78565367	78565367	A	G	intronic	TENM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	14	4	9	0
chr11	78614384	78614384	G	A	exonic	TENM4	NaN	synonymous SNV	TENM4:NM_001098816:exon7:c.C678T:p.A226A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.678739	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	59	55	4	0
chr11	78614401	78614401	A	A	exonic	TENM4	NaN	synonymous SNV	TENM4:NM_001098816:exon7:c.T661T:p.S221S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr11	78972670	78972670	G	T	intronic	TENM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	79053420	79053420	A	G	intronic	TENM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	790711	790711	A	C	UTR3	SLC25A22	NM_001191061:c.*1204T>G,NM_001191060:c.*1204T>G,NM_024698:c.*1204T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	793465	793465	G	A	intronic	SLC25A22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	79378992	79378992	C	G	intergenic	TENM4,LOC101928944	dist=227297;dist=1083252	NaN	NaN	rs1944703	NaN	0.454473	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	794441	794441	G	A	intronic	SLC25A22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.137076	nearby_gap_events	REJECT	48	44	4	0
chr11	7961096	7961096	A	A	upstream	OR10A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	7982514	7982514	C	G	exonic	NLRP10	NaN	synonymous SNV	NLRP10:NM_176821:exon2:c.G645C:p.L215L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.453294	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	134	127	7	0
chr11	799291	799291	T	T	UTR3	PIDD1	NM_145887:c.*16A>A,NM_145886:c.*16A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	8015885	8015885	T	A	intronic	EIF3F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	8015886	8015886	T	G	intronic	EIF3F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	8015888	8015888	C	A	intronic	EIF3F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	8015891	8015891	C	G	intronic	EIF3F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	801678	801678	C	G	intronic	PIDD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	801840	801840	T	T	intronic	PIDD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	17	14	0	0
chr11	803973	803973	T	G	intronic	PIDD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	16	3	13	0
chr11	8060362	8060362	T	C	UTR5	TUB	NM_003320:c.-59T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	8060363	8060363	C	G	UTR5	TUB	NM_003320:c.-58C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	8060364	8060364	T	A	UTR5	TUB	NM_003320:c.-57T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	8101941	8101941	G	A	intronic	TUB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	810389	810389	G	T	intronic	RPLP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr11	8111880	8111880	A	C	intronic	TUB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	3	2	0
chr11	8118200	8118200	C	A	intronic	TUB	NaN	NaN	NaN	rs7931842	NaN	0.996006	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	147.348703	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	51	0	51	58
chr11	8120249	8120249	T	C	intronic	TUB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	14	8	5	0
chr11	8159741	8159741	T	C	intronic	RIC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr11	82443778	82443778	T	T	exonic	FAM181B	NaN	synonymous SNV	FAM181B:NM_175885:exon1:c.A994A:p.T332T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	15	14	0	0
chr11	824744	824744	A	C	exonic	PNPLA2	NaN	nonsynonymous SNV	PNPLA2:NM_020376:exon10:c.A1397C:p.D466A	NaN	NaN	NaN	0.74	T	0.001	B	0.001	B	0.014	N	1.000	N	0	N	1.57	T	-1.046	T	0.033	T	0.16	0.312	5.689	-2.68	-0.898	-1.011	4.994	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	32.3937	18	10.064303	clustered_read_position	REJECT	8	3	5	0
chr11	824789	824789	T	C	exonic	PNPLA2	NaN	nonsynonymous SNV	PNPLA2:NM_020376:exon10:c.T1442C:p.L481P	rs1138693	NaN	0.654353	0.84	T	0.943	P	0.766	P	.	.	1.000	P	0	N	1.46	T	-1.017	T	0.000	T	0.05	1.389	10.58	.	0.000	0.000	.	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.122482	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	12
chr11	82536108	82536108	G	C	exonic	PRCP	NaN	nonsynonymous SNV	PRCP:NM_005040:exon9:c.C1331G:p.T444S,PRCP:NM_199418:exon10:c.C1394G:p.T465S	rs2228312	NaN	0.0101837	.	.	0.021	B	0.048	B	0.000	D	0.944	D	-0.375	N	-2.94	D	-0.373	T	0.248	T	0.062	0.513	6.780	4.42	2.513	5.211	15.044	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	105.580162	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	98	54	44	2
chr11	82560013	82560013	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	0	2,4	0
chr11	82560049	82560049	A	G	intronic	PRCP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.70771	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	146	135	11	0
chr11	82560946	82560946	T	T	intronic	PRCP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	82611577	82611577	G	A	upstream	PRCP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	82639740	82639740	A	T	intronic	DDIAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.452564	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	216	201	15	0
chr11	82639798	82639798	T	C	intronic	DDIAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.04005227199881492	NA	0	0	22.424456	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	109	93	16	0
chr11	82868855	82868855	G	A	intronic	PCF11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.007197	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	59	51	8	0
chr11	82872530	82872530	T	A	intronic	PCF11	NaN	NaN	NaN	rs11233498	NaN	0.19369	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	71.1089	0	NaN	NA	NA	71	46	9	1
chr11	82875558	82875558	T	C	intronic	PCF11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.986753	nearby_gap_events	REJECT	79	73	6	0
chr11	82875559	82875559	C	T	intronic	PCF11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.620437	nearby_gap_events	REJECT	91	84	7	0
chr11	82879365	82879365	C	A	intronic	PCF11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	16	7	8	0
chr11	82887963	82887963	G	T	intronic	PCF11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.813248	nearby_gap_events	REJECT	129	122	7	0
chr11	82895962	82895962	T	C	UTR3	PCF11	NM_015885:c.*26T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.3521671826625399	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	11	4	0
chr11	82909464	82909464	C	C	intronic	ANKRD42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	47	40	0	0
chr11	82909588	82909588	T	C	exonic	ANKRD42	NaN	synonymous SNV	ANKRD42:NM_001300972:exon2:c.T126C:p.L42L,ANKRD42:NM_001300973:exon2:c.T126C:p.L42L,ANKRD42:NM_001300975:exon2:c.T126C:p.L42L,ANKRD42:NM_001300976:exon2:c.T126C:p.L42L,ANKRD42:NM_001300977:exon2:c.T126C:p.L42L,ANKRD42:NM_182603:exon2:c.T126C:p.L42L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.058688	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	66	61	5	0
chr11	829539	829539	A	G	exonic	CRACR2B	NaN	nonsynonymous SNV	CRACR2B:NM_001286606:exon3:c.A457G:p.K153E,CRACR2B:NM_173584:exon3:c.A457G:p.K153E	rs28558789	NaN	0.665535	0.52	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.000	P	-1.52	N	3.5	T	-1.029	T	0.000	T	0.046	1.094	9.463	3.97	0.496	1.679	9.366	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.272617	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	12	11	49
chr11	82985547	82985547	A	G	intronic	CCDC90B	NaN	NaN	NaN	rs632906	NaN	0.232029	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	64.4386	0	NaN	NA	NA	49	20	29	14
chr11	831317	831317	A	A	intronic	CRACR2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	83170788	83170788	T	T	UTR3	DLG2	NM_001142702:c.*73A>A,NM_001142699:c.*73A>A,NM_001300983:c.*73A>A,NM_001142700:c.*73A>A,NM_001206769:c.*73A>A,NM_001364:c.*73A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr11	831719	831719	A	A	UTR3	CRACR2B	NM_173584:c.*158A>A,NM_001286606:c.*10A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	83182637	83182637	T	G	intronic	DLG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.877493	nearby_gap_events	REJECT	125	116	9	0
chr11	83195341	83195341	A	C	intronic	DLG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.04226	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	121	111	10	0
chr11	8333149	8333149	G	A	intergenic	LMO1,STK33	dist=42967;dist=80264	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	8334463	8334463	A	A	intergenic	LMO1,STK33	dist=44281;dist=78950	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	83359758	83359758	C	A	intronic	DLG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr11	83497909	83497909	A	A	intronic	DLG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	8351765	8351765	C	A	intergenic	LMO1,STK33	dist=61583;dist=61648	NaN	NaN	rs68010090	NaN	0.177316	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	0	6	0
chr11	836227	836227	A	G	intronic	CD151	NaN	NaN	NaN	rs28434354	NaN	0.969249	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.997693	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	42
chr11	837661	837661	GTG	GG,GGG,GGT,GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	277.837	0	NaN	NA	NA	171	86	19	0
chr11	8378655	8378655	A	G	intergenic	LMO1,STK33	dist=88473;dist=34758	NaN	NaN	rs4758350	NaN	0.384385	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	83962251	83962251	A	G	intronic	DLG2	NaN	NaN	NaN	rs7933566	NaN	0.71246	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	236.734	0	NaN	NA	NA	65	23	42	52
chr11	84027951	84027951	T	C	exonic	DLG2	NaN	nonsynonymous SNV	DLG2:NM_001206769:exon1:c.A238G:p.S80G	NaN	NaN	NaN	.	.	0.036	B	0.014	B	.	.	1.000	D	0	N	0.78	T	-1.051	T	0.071	T	0.226	2.570	14.55	5.86	2.238	5.614	15.914	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.493916	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	332	315	17	0
chr11	8411904	8411904	T	C	intergenic	LMO1,STK33	dist=121722;dist=1509	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	84149098	84149098	C	G	intronic	DLG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr11	84149099	84149099	A	G	intronic	DLG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr11	8483335	8483335	G	A	intronic	STK33	NaN	NaN	NaN	rs1900273	NaN	0.597244	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	37.7617	0	22.239087	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	18	10	39
chr11	84865845	84865845	C	G	intronic	DLG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr11	85339683	85339683	A	G	exonic	TMEM126B	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM126B:NM_001256547:exon1:c.A16G:p.S6G,TMEM126B:NM_018480:exon1:c.A32G:p.K11R	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	0.695	N	1.48	T	-0.927	T	0.159	T	0.153	2.875	15.58	5.09	2.267	1.173	12.648	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.038500506585612625	NA	0	0	NaN	NA	NA	24	18	6	0
chr11	85339819	85339819	A	A	intronic	TMEM126B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr11	85345066	85345066	A	G	intronic	TMEM126B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr11	85345329	85345329	T	T	intronic	TMEM126B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	41	35	0	0
chr11	85345332	85345332	A	A	intronic	TMEM126B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	45	37	0	0
chr11	853946	853946	C	C	intronic	TSPAN4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	85435056	85435056	A	T	intronic	SYTL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.752885	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	111	100	11	0
chr11	85437208	85437208	C	T	intronic	SYTL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	0.013	B	0.022	B	0.409	N	1.000	N	0.975	L	0.72	T	-1.016	T	0.089	T	0.038	2.555	14.50	2.92	0.357	0.231	8.167	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.10758	nearby_gap_events	REJECT	91	86	5	0
chr11	85623643	85623643	T	T	intronic	CCDC83	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	85626571	85626571	T	A	intronic	CCDC83	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.580502	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	15	10	5	6
chr11	85692181	85692181	A	C	exonic	PICALM	NaN	synonymous SNV	PICALM:NM_001008660:exon16:c.T1620G:p.A540A,PICALM:NM_001206947:exon16:c.T1467G:p.A489A,PICALM:NM_001206946:exon17:c.T1749G:p.A583A,PICALM:NM_007166:exon17:c.T1770G:p.A590A	rs76719109	ID=COSM1357534;OCCURENCE=2(large_intestine)	0.622804	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-0.934	T	0.000	T	.	1.441	10.76	3.17	1.010	2.399	5.702	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	160.316365	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	110	40	70	50
chr11	85701234	85701234	T	T	intronic	PICALM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr11	85718641	85718641	T	C	intronic	PICALM	NaN	NaN	NaN	rs10792821	NaN	0.232029	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	27.4002	0	NaN	NA	NA	339	163	176	2
chr11	85956441	85956441	T	A	intronic	EED	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.18131868131868062	NA	0	0	6.444408	nearby_gap_events	REJECT	37	32	5	0
chr11	85967393	85967393	A	C	intronic	EED	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.947353	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	174	160	14	0
chr11	86013588	86013588	G	A	intronic	C11orf73	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.6606	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	65	56	9	0
chr11	86017602	86017602	T	C	intronic	C11orf73	NaN	NaN	NaN	rs11822824	NaN	0.0972444	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	220.509	0	NaN	NA	NA	93	69	24	4
chr11	86103559	86103559	C	A	intronic	CCDC81	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.447599	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	247	216	31	0
chr11	86111894	86111894	G	G	intronic	CCDC81	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	53	42	0	0
chr11	86118683	86118683	C	A	exonic	CCDC81	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC81:NM_021827:exon7:c.C639A:p.H213Q,CCDC81:NM_001156474:exon8:c.C909A:p.H303Q	rs61736174	NaN	0.0135783	.	.	0.051	B	0.085	B	0.854	N	1.000	N	0.345	N	1.05	T	-1.019	T	0.018	T	0.032	0.325	5.761	-2.67	-0.249	0.165	0.872	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	129.128283	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	96	41	55	3
chr11	86126413	86126413	A	C	intronic	CCDC81	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	86133784	86133784	C	T	UTR3	CCDC81	NM_001156474:c.*27C>T,NM_021827:c.*27C>T	NaN	NaN	rs1056194	NaN	0.804113	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	508.744	0	NaN	NA	NA	55	0	55	52
chr11	86219732	86219732	T	A	intronic	ME3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr11	86219737	86219737	T	T	intronic	ME3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	862933	862933	G	C	intronic	TSPAN4	NaN	NaN	NaN	rs72847240	NaN	0.0944489	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.811164	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	4	4	18
chr11	86349146	86349146	C	G	intronic	ME3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	8641552	8641552	T	T	intronic	TRIM66	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	8642876	8642876	A	G	intronic	TRIM66	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr11	8646670	8646670	T	G	exonic	TRIM66	NaN	nonsynonymous SNV	TRIM66:NM_014818:exon11:c.A1981C:p.N661H	rs7947230	NaN	0.27496	0.2	T	0.291	B	0.087	B	0.004	N	0.999	P	0	N	-0.09	T	-0.994	T	0.000	T	0.029	2.217	13.37	4.71	1.025	0.430	6.856	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	208.959686	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	203	109	94	12
chr11	865503	865503	G	A	intronic	TSPAN4	NaN	NaN	NaN	rs28581489	NaN	0.973642	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	519.753	0	NaN	NA	NA	28	0	28	47
chr11	865505	865505	ACC	ACA,AC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	289.157	0	NaN	NA	NA	51	5	9	10
chr11	865507	865507	C	A	intronic	TSPAN4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.389201	nearby_gap_events	REJECT	54	45	9	0
chr11	865626	865626	G	C	intronic	TSPAN4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.17984189723320118	NA	0	0	5.183959	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	19	15	4	0
chr11	865627	865627	C	G	intronic	TSPAN4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.1288366805608176	NA	0	0	5.96963	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	19	15	4	0
chr11	8660176	8660176	T	T	intronic	TRIM66	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	8662119	8662119	C	A	exonic	TRIM66	NaN	nonsynonymous SNV	TRIM66:NM_014818:exon9:c.G1368T:p.Q456H	NaN	NaN	NaN	0.03	D	1.0	D	0.997	D	0.247	N	0.767	N	1.935	M	2.31	T	-1.013	T	0.095	T	0.386	3.155	16.55	2.18	0.188	1.037	10.274	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.074	0	NaN	NA	NA	12	10	2	0
chr11	866459	866459	G	C	intronic	TSPAN4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.96448	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	153	142	11	0
chr11	86719116	86719116	G	A	intergenic	LOC100506368,TMEM135	dist=7127;dist=29770	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	86719158	86719158	A	G	intergenic	LOC100506368,TMEM135	dist=7169;dist=29728	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr11	86947609	86947609	T	T	intronic	TMEM135	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr11	87006845	87006845	A	G	exonic	TMEM135	NaN	synonymous SNV	TMEM135:NM_001168724:exon6:c.A465G:p.G155G,TMEM135:NM_022918:exon7:c.A531G:p.G177G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.675208	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	21	17	4	0
chr11	87007030	87007030	A	G	intronic	TMEM135	NaN	NaN	NaN	rs10898664	NaN	0.304513	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	46.542381	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	15	19	27
chr11	870077	870077	A	A	intronic	CHID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	54	45	0	0
chr11	87032099	87032099	A	A	intronic	TMEM135	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr11	87032156	87032156	A	G	intronic	TMEM135	NaN	NaN	NaN	rs17759556	NaN	0.0061901	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	40.3082	0	NaN	NA	NA	296	127	169	0
chr11	8704432	8704432	C	T	intronic	RPL27A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.723396	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	73	66	7	0
chr11	8715541	8715541	T	G	UTR3	ST5	NM_005418:c.*102A>C,NM_213618:c.*102A>C,NM_139157:c.*102A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr11	8718042	8718042	A	C	exonic	ST5	NaN	nonsynonymous SNV	ST5:NM_139157:exon17:c.T1964G:p.V655G,ST5:NM_213618:exon18:c.T3224G:p.V1075G,ST5:NM_005418:exon21:c.T3224G:p.V1075G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.993	D	0.967	D	0.000	D	1.000	D	2.14	M	0.91	T	-0.560	T	0.259	T	0.928	4.928	28.5	5.87	2.253	6.996	16.274	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.585382	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	101	93	8	2
chr11	8725792	8725792	A	G	intronic	ST5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	8729099	8729099	G	A	intronic	ST5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	8736331	8736331	A	A	intronic	ST5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	8736993	8736993	T	T	intronic	ST5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	8736994	8736994	G	G	intronic	ST5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	8747741	8747741	A	C	exonic	ST5	NaN	nonsynonymous SNV	ST5:NM_139157:exon3:c.T96G:p.F32L,ST5:NM_213618:exon4:c.T1356G:p.F452L,ST5:NM_005418:exon7:c.T1356G:p.F452L	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.018	B	0.057	B	0.001	D	1.000	D	0.865	L	2.87	T	-1.079	T	0.030	T	0.305	3.218	16.78	5.92	2.270	2.802	12.241	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.09420289855072331	NA	0	0	6.768509	nearby_gap_events	REJECT	35	30	5	0
chr11	8747812	8747812	C	G	intronic	ST5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr11	8752365	8752365	G	A	exonic	ST5	NaN	nonsynonymous SNV	ST5:NM_213618:exon3:c.C472T:p.R158C,ST5:NM_005418:exon6:c.C472T:p.R158C	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.002	B	0.001	B	0.036	N	1.000	D	1.39	L	1.74	T	-1.115	T	0.061	T	0.361	2.583	14.60	4.97	1.498	5.114	15.046	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.399855	nearby_gap_events	REJECT	143	137	6	0
chr11	87908448	87908448	A	G	exonic	RAB38	NaN	synonymous SNV	RAB38:NM_022337:exon1:c.T105C:p.S35S	rs302646	NaN	0.745607	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	-0.63	T	-1.005	T	0.000	T	.	1.773	11.89	2.16	0.048	1.058	7.172	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	222.6721	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	76	0	76	56
chr11	88045669	88045669	C	A	exonic	CTSC	NaN	synonymous SNV	CTSC:NM_001814:exon3:c.G372T:p.G124G	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	-3.87	D	-0.100	T	0.734	D	.	1.120	9.568	-4.77	-0.738	-0.978	3.437	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.329195	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	141	121	20	0
chr11	88300185	88300185	G	G	intronic	GRM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	55	51	0	0
chr11	887698	887698	C	C	intronic	CHID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	88910999	88910999	T	T	upstream	TYR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	88960876	88960876	T	G	intronic	TYR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.532552	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	132	123	9	0
chr11	88960877	88960877	G	T	intronic	TYR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.974153	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	134	125	9	0
chr11	89070413	89070413	T	T	intronic	NOX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	9	6	0	0
chr11	891571	891571	C	C	intronic	CHID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	89166144	89166144	A	A	intronic	NOX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr11	89224340	89224340	C	T	intronic	NOX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.1830065359477151	NA	0	0	4.977735	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	10	7	3	0
chr11	89224477	89224477	G	A	UTR5	NOX4	NM_016931:c.-63C>T,NM_001143836:c.-63C>T,NM_001291926:c.-39483C>T	NaN	NaN	rs2289124	NaN	0.245407	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.459153	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	2	3	11
chr11	8934101	8934101	A	G	intronic	AKIP1	NaN	NaN	NaN	rs2742518	NaN	0.894569	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	299.509576	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	106	0	106	58
chr11	89402557	89402557	G	T	intronic	FOLH1B	NaN	NaN	NaN	rs11018717	NaN	0.219848	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	90.8141	0	NaN	NA	NA	125	1	124	13
chr11	89402687	89402687	T	C	intronic	FOLH1B	NaN	NaN	NaN	rs11018718	NaN	0.216454	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	32.2612	0	NaN	NA	NA	68	28	40	14
chr11	89409158	89409158	A	G	intronic	FOLH1B	NaN	NaN	NaN	rs4753234	NaN	0.220048	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	378.083	0	NaN	NA	NA	61	0	61	12
chr11	89409166	89409166	G	C	intronic	FOLH1B	NaN	NaN	NaN	rs4753235	NaN	0.203674	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	97.6623	0	NaN	NA	NA	65	32	33	12
chr11	8943071	8943071	A	A	intronic	C11orf16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr11	89443808	89443808	A	C	exonic	TRIM77	NaN	synonymous SNV	TRIM77:NM_001146162:exon1:c.A342C:p.L114L,TRIM77:NM_001271942:exon1:c.A342C:p.L114L	rs11018745	ID=COSN164018;OCCURENCE=1(breast)	0.259585	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	691	331	360	31
chr11	89451071	89451071	C	A	downstream	TRIM77	NaN	NaN	NaN	rs3881254	NaN	0.259784	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	474	217	257	31
chr11	8954018	8954018	C	T	intronic	C11orf16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	895744	895744	C	G	intronic	CHID1	NaN	NaN	NaN	rs9704267	NaN	0.327875	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr11	8959718	8959718	A	A	UTR5	ASCL3	NM_020646:c.-10T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	89603924	89603924	T	C	exonic	TRIM64B	NaN	synonymous SNV	TRIM64B:NM_001164397:exon6:c.A1215G:p.R405R	rs202169525	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	28.8643	0	NaN	NA	NA	506	296	210	0
chr11	89604264	89604264	G	C	exonic	TRIM64B	NaN	nonsynonymous SNV	TRIM64B:NM_001164397:exon6:c.C875G:p.T292R	rs200143665	NaN	0.076278	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	1.155	L	0.16	T	-0.989	T	0.106	T	0.171	-1.015	0.240	-2.63	-0.409	0.096	0.127	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	7.433854146910835E-4	NA	0	0	NaN	NA	NA	227	138	89	0
chr11	89883595	89883595	G	T	intronic	NAALAD2	NaN	NaN	NaN	rs201705969	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.061014	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	371	347	24	0
chr11	89883597	89883597	T	G	intronic	NAALAD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.636077	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	185	167	18	0
chr11	900258	900258	A	A	intronic	CHID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr11	9007223	9007223	T	T	intronic	NRIP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	20	18	0	0
chr11	9007261	9007261	C	A	exonic	NRIP3	NaN	nonsynonymous SNV	NRIP3:NM_020645:exon4:c.G559T:p.V187F	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.901	P	0.692	P	0.025	N	1.000	D	2.28	M	0.88	T	-0.864	T	0.170	T	0.814	3.584	18.26	4.11	0.829	0.608	7.753	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03058668075353255	NA	0	0	NaN	NA	NA	20	11	9	0
chr11	900894	900894	T	G	intronic	CHID1	NaN	NaN	NaN	rs28454252	NaN	0.987819	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	394.882	0	NaN	NA	NA	36	0	36	21
chr11	903125	903125	A	G	intronic	CHID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr11	9043566	9043566	A	A	intronic	SCUBE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr11	9055377	9055377	A	C	intronic	SCUBE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr11	9069046	9069046	G	A	exonic	SCUBE2	NaN	nonsynonymous SNV	SCUBE2:NM_001170690:exon12:c.C1394T:p.T465M,SCUBE2:NM_020974:exon16:c.C1859T:p.T620M	rs3751055	ID=COSM147143;OCCURENCE=1(stomach)	0.154353	0.24	T	0.883	P	0.633	P	0.000	D	0.000	P	1.415	L	-1.3	T	-1.134	T	0.000	T	0.456	2.852	15.50	2.03	0.594	4.686	7.899	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.266908	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	10	16	13
chr11	9072281	9072281	A	A	intronic	SCUBE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	13	8	0	0
chr11	9072284	9072284	T	C	intronic	SCUBE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr11	9072289	9072289	T	C	intronic	SCUBE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	9081026	9081026	A	A	intronic	SCUBE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr11	9088177	9088177	T	T	intronic	SCUBE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr11	9088404	9088404	C	T	intronic	SCUBE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	9166728	9166728	C	G	intronic	DENND5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr11	9167413	9167413	A	A	intronic	DENND5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	9173832	9173832	T	T	intronic	DENND5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr11	92373185	92373185	T	C	intronic	FAT3	NaN	NaN	NaN	rs2511284	NaN	0.544928	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr11	924904	924904	C	C	upstream	AP2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	92535134	92535134	T	A	intronic	FAT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr11	92535135	92535135	G	A	intronic	FAT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr11	92535138	92535138	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	2	2,4	0
chr11	92535139	92535139	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	2	2,4	0
chr11	92535140	92535140	G	C	intronic	FAT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr11	92539345	92539345	T	G	intronic	FAT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr11	92600424	92600424	G	C	intronic	FAT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	92881839	92881839	C	T	exonic	SLC36A4	NaN	nonsynonymous SNV	SLC36A4:NM_001286139:exon11:c.G974A:p.G325E,SLC36A4:NM_152313:exon11:c.G1379A:p.G460E	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.195	M	4.06	T	-1.054	T	0.058	T	0.974	4.080	21.0	4.6	1.330	6.407	14.382	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.074188	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	52	49	3	0
chr11	93141401	93141401	T	C	exonic	CCDC67	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC67:NM_181645:exon12:c.T1331C:p.M444T	NaN	NaN	NaN	0.58	T	0.241	B	0.086	B	0.034	N	1.000	N	1.355	L	2.29	T	-1.025	T	0.046	T	0.38	2.547	14.48	6.17	2.371	1.533	14.563	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.173737	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	220	211	9	0
chr11	93141427	93141427	A	T	exonic	CCDC67	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC67:NM_181645:exon12:c.A1357T:p.R453W	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.992	D	0.725	P	0.213	N	1.000	N	1.61	L	2.11	T	-1.082	T	0.062	T	0.586	3.498	17.88	2.39	0.543	0.664	5.687	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.597086	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	228	219	9	0
chr11	93141580	93141580	C	A	exonic	CCDC67	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC67:NM_181645:exon12:c.C1510A:p.Q504K	rs2259633	NaN	0.829473	1	T	0.0	B	0.0	B	0.570	N	0.000	P	-1.1	N	2.43	T	-1.001	T	0.000	T	0.036	-0.192	3.066	2.44	0.142	1.159	3.994	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	88.2174	0	NaN	NA	NA	144	0	144	3
chr11	93170925	93170925	G	A	UTR3	CCDC67	NM_181645:c.*40G>A	NaN	NaN	rs2605584	NaN	0.52516	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.660577	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	25	15	43
chr11	93211987	93211987	T	T	UTR3	SMCO4	NM_020179:c.*189A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr11	93402006	93402006	A	G	exonic	CEP295	NaN	synonymous SNV	CEP295:NM_033395:exon4:c.A342G:p.A114A	rs61743303	ID=COSM147308;OCCURENCE=1(stomach)	0.133187	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	58.4624	0	NaN	NA	NA	32	21	11	11
chr11	93402096	93402096	C	A	exonic	CEP295	NaN	synonymous SNV	CEP295:NM_033395:exon4:c.C432A:p.T144T	rs1944101	NaN	0.884385	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	30.2053	19	NaN	NA	NA	29	20	9	52
chr11	93408831	93408831	G	A	exonic	CEP295	NaN	nonsynonymous SNV	CEP295:NM_033395:exon6:c.G623A:p.R208Q	rs10831088	NaN	0.908746	1	T	0.001	B	0.0	B	0.001	N	0.000	P	-1.24	N	3.23	T	-0.966	T	0.000	T	0.052	0.786	8.146	5.54	0.936	4.834	10.033	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.876743	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	23	11	57
chr11	93425159	93425159	C	A	exonic	CEP295	NaN	nonsynonymous SNV	CEP295:NM_033395:exon12:c.C1496A:p.A499E	rs4753495	NaN	0.908347	1	T	0.0	B	0.0	B	0.449	N	0.000	P	-1.245	N	3.22	T	-0.925	T	0.000	T	0.133	-0.294	2.595	-0.2	-0.694	0.773	16.670	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	169.850916	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	171	95	76	58
chr11	93433012	93433012	T	G	exonic	CEP295	NaN	nonsynonymous SNV	CEP295:NM_033395:exon15:c.T4934G:p.L1645W	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.912	D	0.278	N	1.000	N	1.75	L	2.73	T	-1.030	T	0.072	T	0.437	1.671	11.55	-0.248	-0.216	-0.063	7.081	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.174459	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	93	87	6	0
chr11	93457585	93457585	A	T	intronic	CEP295	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	20	6	14	0
chr11	93460954	93460954	A	A	intronic	CEP295	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr11	93461822	93461822	T	G	intronic	CEP295	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.1302	0	NaN	NA	NA	98	84	14	2
chr11	93469522	93469522	A	A	intronic	TAF1D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	44	38	0	0
chr11	93471123	93471123	T	T	intronic	TAF1D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	93528357	93528357	A	C	intronic	MED17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr11	93534930	93534930	T	G	intronic	MED17	NaN	NaN	NaN	rs35544640	NaN	0.933706	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	444.614	0	NaN	NA	NA	38	3	35	0
chr11	93545239	93545239	A	C	UTR3	MED17	NM_004268:c.*9A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	11	4	7	0
chr11	93583790	93583790	T	G	upstream	VSTM5	NaN	NaN	NaN	rs10831106	NaN	0.500998	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	149.987	0	NaN	NA	NA	68	36	32	18
chr11	93806416	93806416	T	C	intronic	HEPHL1	NaN	NaN	NaN	rs1914725	NaN	0.989217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	1129.19	35	NaN	NA	NA	88	2	86	47
chr11	93806554	93806554	C	A	exonic	HEPHL1	NaN	nonsynonymous SNV	HEPHL1:NM_001098672:exon8:c.C1453A:p.P485T	NaN	NaN	NaN	0.1	T	1.0	D	0.992	D	0.000	D	1.000	D	2.69	M	-5.88	D	1.072	D	0.982	D	0.744	3.976	20.4	5.51	2.581	4.362	15.975	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.329654	nearby_gap_events	REJECT	117	108	9	0
chr11	93862493	93862493	A	C	exonic	PANX1	NaN	nonsynonymous SNV	PANX1:NM_015368:exon1:c.A15C:p.Q5H	rs1138800	NaN	0.698283	1	T	0.0	B	0.0	B	0.001	N	1.000	P	-1.845	N	1.67	T	-0.985	T	0.000	T	0.021	0.265	5.433	3.3	0.442	0.217	4.959	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.064465	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	11	5	47
chr11	93913513	93913513	A	A	intronic	PANX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr11	93920004	93920004	C	C	intergenic	PANX1,IZUMO1R	dist=4867;dist=118799	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr11	94038857	94038857	G	C	exonic	IZUMO1R	NaN	nonsynonymous SNV	IZUMO1R:NM_001199206:exon1:c.G55C:p.A19P	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.041	B	0.067	B	0.004	N	1.000	N	1.645	L	-0.92	T	-0.886	T	0.223	T	0.386	0.292	5.580	-0.797	-0.222	0.266	0.562	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.26666666666666755	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr11	94039862	94039862	C	G	exonic	IZUMO1R	NaN	nonsynonymous SNV	IZUMO1R:NM_001199206:exon2:c.C322G:p.Q108E	NaN	NaN	NaN	0.32	T	0.721	P	0.476	P	0.096	N	0.991	D	2.31	M	-1.02	T	-0.201	T	0.467	T	0.214	2.947	15.82	4.6	2.565	3.016	15.301	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.912848	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	226	201	25	0
chr11	94040875	94040875	A	A	downstream	IZUMO1R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	94129742	94129742	C	C	intronic	GPR83	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr11	94134005	94134005	C	A	intronic	GPR83	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	17	9.427946	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr11	94153208	94153208	T	A	UTR3	MRE11A	NM_005591:c.*83A>T,NM_005590:c.*83A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr11	94212930	94212930	T	A	intronic	MRE11A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.909073	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	172	150	22	0
chr11	94212941	94212941	A	G	intronic	MRE11A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.544623	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	45	38	7	0
chr11	94225967	94225967	T	A	exonic	MRE11A	NaN	nonsynonymous SNV	MRE11A:NM_005590:exon2:c.A1T:p.M1L,MRE11A:NM_005591:exon2:c.A1T:p.M1L	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.244	B	0.099	B	0.050	N	1.000	D	.	.	-0.69	T	-0.540	T	0.290	T	0.966	1.444	10.77	5.01	1.889	3.533	11.142	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0565217391304345	NA	0	0	NaN	NA	NA	13	9	4	0
chr11	94245740	94245740	A	G	exonic	C11orf97	NaN	nonsynonymous SNV	C11orf97:NM_001190462:exon1:c.A46G:p.K16E	rs2509324	NaN	0.53095	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.867027	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	16	14	43
chr11	9424998	9424998	A	G	intronic	IPO7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr11	94261255	94261255	C	G	exonic	C11orf97	NaN	nonsynonymous SNV	C11orf97:NM_001190462:exon3:c.C256G:p.L86V	rs647484	NaN	0.675919	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	91.228973	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	97	53	44	55
chr11	94308094	94308094	T	G	intronic	PIWIL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.305312	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	331	315	16	0
chr11	9431442	9431442	A	T	intronic	IPO7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.989457	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	297	281	16	0
chr11	9431443	9431443	T	A	intronic	IPO7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.284918	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	224	207	17	0
chr11	9431667	9431667	A	A	intronic	IPO7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr11	94320461	94320461	A	A	intronic	PIWIL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr11	94331125	94331125	A	G	intronic	PIWIL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	3.879468	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	110	107	3	0
chr11	94337294	94337294	A	A	intronic	PIWIL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	19	18	0	0
chr11	94351328	94351328	A	A	intronic	PIWIL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	15	12	0	0
chr11	9450745	9450745	T	G	splicing	IPO7	NM_006391:exon14:c.1591+2T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.847	19.54	5.83	2.230	5.066	16.201	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.443983	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	174	165	9	0
chr11	94602325	94602325	A	G	intronic	AMOTL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.865512	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	61	53	8	0
chr11	94602331	94602331	A	G	intronic	AMOTL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.768166	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	68	56	12	0
chr11	94699660	94699660	A	C	intronic	CWC15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.434491	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	69	64	5	1
chr11	94699661	94699661	A	C	intronic	CWC15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.133884	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	60	44	16	14
chr11	94699662	94699662	C	C	intronic	CWC15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	48	38	0	0
chr11	94699664	94699664	A	A	intronic	CWC15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	94705497	94705497	T	T	intronic	CWC15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	119	86	0	0
chr11	94911660	94911660	A	G	intronic	SESN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	5	5	0
chr11	94911685	94911685	T	T	intronic	SESN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	20	20	0	0
chr11	9499924	9499924	T	T	intronic	ZNF143	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr11	9499974	9499974	G	A	exonic	ZNF143	NaN	synonymous SNV	ZNF143:NM_001282657:exon5:c.G318A:p.L106L,ZNF143:NM_001282656:exon6:c.G408A:p.L136L,ZNF143:NM_003442:exon6:c.G411A:p.L137L	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.666	14.87	3.13	0.509	4.546	11.602	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.661358	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	611	603	8	0
chr11	9522881	9522881	A	A	intronic	ZNF143	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr11	9546764	9546764	T	G	intronic	ZNF143	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	95546347	95546347	A	T	intronic	CEP57	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	12	5	5	0
chr11	95546349	95546349	T	G	intronic	CEP57	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	12	6	4	0
chr11	95546350	95546350	A	C	intronic	CEP57	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr11	95561203	95561203	T	G	intronic	CEP57	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.149474	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	64	53	11	0
chr11	95569485	95569485	G	C	exonic	MTMR2	NaN	nonsynonymous SNV	MTMR2:NM_016156:exon14:c.C1597G:p.L533V,MTMR2:NM_201281:exon15:c.C1381G:p.L461V,MTMR2:NM_201278:exon16:c.C1381G:p.L461V,MTMR2:NM_001243571:exon17:c.C1381G:p.L461V	NaN	NaN	NaN	0.64	T	0.0	B	0.0	B	0.043	N	1.000	D	-0.355	N	-2.56	D	-0.549	T	0.366	T	0.207	-1.855	0.009	5.1	1.509	1.346	12.782	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.776882	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	135	127	8	0
chr11	95569487	95569487	T	A	exonic	MTMR2	NaN	nonsynonymous SNV	MTMR2:NM_016156:exon14:c.A1595T:p.N532I,MTMR2:NM_201281:exon15:c.A1379T:p.N460I,MTMR2:NM_201278:exon16:c.A1379T:p.N460I,MTMR2:NM_001243571:exon17:c.A1379T:p.N460I	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.135	B	0.07	B	0.000	D	1.000	D	1.675	L	-2.7	D	0.034	D	0.604	D	0.297	1.180	9.800	6.03	2.308	2.710	6.441	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.605476	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	134	126	8	0
chr11	95581105	95581105	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	9	2	4,3	0
chr11	95581109	95581109	C	G	intronic	MTMR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr11	95713175	95713175	C	T	intronic	MAML2	NaN	NaN	NaN	rs74393839	NaN	0.0882588	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	367.333879	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	133	0	133	18
chr11	95724563	95724563	T	C	intronic	MAML2	NaN	NaN	NaN	rs623543	NaN	0.518371	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	184.770987	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	121	48	73	33
chr11	95826493	95826493	A	C	exonic	MAML2	NaN	synonymous SNV	MAML2:NM_032427:exon2:c.T702G:p.P234P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.37964	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	87	83	4	0
chr11	96091977	96091977	G	A	intronic	CCDC82	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr11	96091979	96091979	C	G	intronic	CCDC82	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr11	96091981	96091981	T	A	intronic	CCDC82	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr11	96091982	96091982	C	G	intronic	CCDC82	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr11	96091984	96091984	A	T	intronic	CCDC82	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr11	96116444	96116444	T	C	exonic	CCDC82	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC82:NM_024725:exon5:c.A980G:p.Q327R	rs10831519	NaN	0.226038	0.42	T	0.099	B	0.039	B	0.660	N	0.982	P	0.805	L	0.95	T	-0.956	T	0.000	T	0.087	0.766	8.051	2.99	0.966	0.740	8.462	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	121.07	0	NaN	NA	NA	330	162	168	19
chr11	96117562	96117562	T	C	exonic	CCDC82	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC82:NM_024725:exon4:c.A350G:p.K117R	NaN	NaN	NaN	0.5	T	0.023	B	0.015	B	0.721	N	1.000	N	1.7	L	1.69	T	-0.986	T	0.057	T	0.078	0.476	6.584	3.04	1.023	1.021	5.750	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.684332	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	619	610	9	0
chr11	9685962	9685962	G	T	intronic	SWAP70	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.11000000000000153	Somatic	8.61014	0	NaN	NA	NA	13	10	3	0
chr11	970029	970029	C	T	intronic	AP2A2	NaN	NaN	NaN	rs7396107	NaN	0.435903	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	239.035	0	NaN	NA	NA	95	45	50	34
chr11	972270	972270	C	T	intronic	AP2A2	NaN	NaN	NaN	rs7933889	NaN	0.436102	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	62.237249	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	30	27	34
chr11	9754036	9754036	A	G	intronic	SWAP70	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr11	9761944	9761944	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	0	3,2	0
chr11	9761946	9761946	A	G	intronic	SWAP70	NaN	NaN	NaN	rs146320667	NaN	0.000798722	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	9806640	9806640	T	C	ncRNA_intronic	SBF2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr11	9812096	9812096	A	G	ncRNA_intronic	SBF2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.533913	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	175	168	7	0
chr11	9817521	9817521	A	A	ncRNA_intronic	SBF2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	98436004	98436004	A	T	intergenic	NONE,CNTN5	dist=NONE;dist=455702	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	20	10	10	0
chr11	9861352	9861352	G	A	ncRNA_intronic	LOC101928008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.666824	nearby_gap_events	REJECT	178	169	9	0
chr11	9879982	9879982	A	C	ncRNA_intronic	LOC101928008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr11	990337	990337	C	C	intronic	AP2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr11	993225	993225	C	T	intronic	AP2A2	NaN	NaN	NaN	rs139719615	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.792377	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	191	186	5	0
chr11	993684	993684	C	A	intronic	AP2A2	NaN	NaN	NaN	rs112511283	NaN	0.0952476	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	93.6261	0	NaN	NA	NA	19	11	8	4
chr11	993690	993690	CGGGGGC	CCGGAGC,CGGGAGC,CGGGGC,CGGGGCG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	274.009	0	NaN	NA	NA	48	3	2	3
chr11	993810	993810	C	A	exonic	AP2A2	NaN	nonsynonymous SNV	AP2A2:NM_001242837:exon13:c.C1610A:p.T537N,AP2A2:NM_012305:exon13:c.C1607A:p.T536N	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	3.58	H	1.61	T	-0.213	T	0.269	T	0.499	4.383	23.2	3.01	1.997	5.798	15.258	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.400052	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	134	123	11	0
chr11	99427077	99427077	A	G	intronic	CNTN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	99427079	99427079	A	C	intronic	CNTN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr11	9985271	9985271	T	G	intronic	SBF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	16	10	6	0
chr11	9990117	9990117	T	A	intronic	SBF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.933157	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	96	89	7	0
chr12	10041458	10041458	A	A	intronic	KLRF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	100433306	100433306	A	A	intronic	UHRF1BP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	91	69	0	0
chr12	100478608	100478608	C	G	intronic	UHRF1BP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr12	100492039	100492039	T	A	intronic	UHRF1BP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	2	6	0
chr12	1005162	1005162	T	C	intronic	WNK1	NaN	NaN	NaN	rs35956200	ID=COSN164107;OCCURENCE=1(breast)	0.108626	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	127.867	0	NaN	NA	NA	54	20	34	9
chr12	100552514	100552514	C	C	ncRNA_intronic	GOLGA2P5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	100552515	100552515	T	T	ncRNA_intronic	GOLGA2P5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	100552517	100552517	C	C	ncRNA_intronic	GOLGA2P5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	100552634	100552634	G	T	ncRNA_exonic	GOLGA2P5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	11	2	9	0
chr12	100552635	100552635	A	C	ncRNA_exonic	GOLGA2P5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	11	2	9	0
chr12	100552636	100552636	T	C	ncRNA_exonic	GOLGA2P5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.00399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	11	2	9	0
chr12	100560252	100560252	C	C	ncRNA_exonic	GOLGA2P5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	100566668	100566668	G	A	ncRNA_intronic	GOLGA2P5	NaN	NaN	NaN	rs375074020	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	14	0	14	0
chr12	100717360	100717360	A	G	exonic	SCYL2	NaN	nonsynonymous SNV	SCYL2:NM_017988:exon11:c.A1453G:p.K485E	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.58	P	0.32	B	0.000	D	1.000	D	2.725	M	1.5	T	-0.704	T	0.184	T	0.882	4.408	23.4	5.68	2.289	9.172	16.224	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.11000000000000153	NA	0	0	NaN	NA	NA	13	10	3	0
chr12	100806503	100806503	C	T	intronic	SLC17A8	NaN	NaN	NaN	rs11568536	NaN	0.336462	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	86.803131	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	0	28	37
chr12	100811986	100811986	T	C	intronic	SLC17A8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	100930232	100930232	T	T	intronic	NR1H4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	101011335	101011335	T	G	intronic	GAS2L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	43	30.560773	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	29	15	14	4
chr12	101015916	101015916	A	A	intronic	GAS2L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	101017321	101017321	T	T	intronic	GAS2L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr12	101017323	101017323	T	G	intronic	GAS2L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.199751	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	132	124	8	0
chr12	101018585	101018585	G	T	exonic	GAS2L3	NaN	stopgain	GAS2L3:NM_001303130:exon9:c.G2002T:p.G668X,GAS2L3:NM_001303131:exon10:c.G1690T:p.G564X,GAS2L3:NM_174942:exon10:c.G2002T:p.G668X	NaN	NaN	NaN	0.6	T	.	.	.	.	0.084	N	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.502	17.90	3.98	0.808	3.907	12.420	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.63806	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	101	96	5	0
chr12	101381485	101381485	A	A	intronic	ANO4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr12	10145723	10145723	T	T	UTR3	CLEC1B	NM_016509:c.*19A>A,NM_001099431:c.*19A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr12	101487928	101487928	T	T	intronic	ANO4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	101493415	101493415	A	G	exonic	ANO4	NaN	nonsynonymous SNV	ANO4:NM_001286616:exon21:c.A2066G:p.K689R,ANO4:NM_178826:exon21:c.A1961G:p.K654R,ANO4:NM_001286615:exon22:c.A2066G:p.K689R	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.865	P	0.725	P	0.000	D	1.000	D	1.115	L	-0.1	T	-0.747	T	0.260	T	0.289	2.942	15.80	5.8	2.212	8.826	16.136	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.356093	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	475	466	9	0
chr12	101520897	101520897	A	C	intronic	ANO4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	3	5	0
chr12	101520898	101520898	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	1	4,2	0
chr12	101555989	101555989	A	C	intronic	SLC5A8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr12	101581327	101581327	C	G	intronic	SLC5A8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	101673957	101673957	G	C	UTR5	UTP20	NM_014503:c.-104G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	101673959	101673959	G	C	UTR5	UTP20	NM_014503:c.-102G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	101673960	101673960	A	C	UTR5	UTP20	NM_014503:c.-101A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	101673961	101673961	A	C	UTR5	UTP20	NM_014503:c.-100A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	101714743	101714743	T	C	intronic	UTP20	NaN	NaN	NaN	rs2305856	NaN	0.312899	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.4931	0	NaN	NA	NA	64	41	23	0
chr12	1017197	1017197	C	T	exonic	WNK1	NaN	synonymous SNV	WNK1:NM_014823:exon25:c.C6084T:p.Y2028Y,WNK1:NM_001184985:exon27:c.C7608T:p.Y2536Y,WNK1:NM_018979:exon27:c.C6828T:p.Y2276Y,WNK1:NM_213655:exon27:c.C7584T:p.Y2528Y	rs4766334	NaN	0.987021	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1907.67	0	NaN	NA	NA	146	0	146	53
chr12	101727049	101727049	T	T	intronic	UTP20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	48	35	0	0
chr12	101728294	101728294	C	T	intronic	UTP20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.014308	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	114	104	10	0
chr12	101736077	101736077	A	C	intronic	UTP20	NaN	NaN	NaN	rs12578425	NaN	0.0315495	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	162.492	0	NaN	NA	NA	41	18	23	2
chr12	101738350	101738350	T	C	intronic	UTP20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.169774	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	87	75	12	0
chr12	101738355	101738355	T	A	intronic	UTP20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.702918	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	108	89	19	0
chr12	101738548	101738548	A	A	intronic	UTP20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr12	101750900	101750900	A	A	intronic	UTP20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr12	101755809	101755809	T	C	exonic	UTP20	NaN	synonymous SNV	UTP20:NM_014503:exon44:c.T5761C:p.L1921L	rs12309241	NaN	0.364417	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	77.316339	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	69	36	33	6
chr12	101757446	101757446	T	C	exonic	UTP20	NaN	synonymous SNV	UTP20:NM_014503:exon45:c.T5883C:p.S1961S	rs2305863	NaN	0.0479233	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	85.070611	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	86	49	37	3
chr12	101764347	101764347	C	G	intronic	UTP20	NaN	NaN	NaN	rs7977155	NaN	0.364617	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	204.707626	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	183	91	92	6
chr12	101777153	101777153	T	C	intronic	UTP20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	101777156	101777156	T	C	intronic	UTP20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	101777158	101777158	G	C	intronic	UTP20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	1017778	1017778	A	C	exonic	WNK1	NaN	synonymous SNV	WNK1:NM_014823:exon26:c.A6225C:p.P2075P,WNK1:NM_001184985:exon28:c.A7749C:p.P2583P,WNK1:NM_018979:exon28:c.A6969C:p.P2323P,WNK1:NM_213655:exon28:c.A7725C:p.P2575P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.724211	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	741	704	37	0
chr12	101779834	101779834	T	C	exonic	UTP20	NaN	nonsynonymous SNV	UTP20:NM_014503:exon62:c.T8291C:p.L2764P	NaN	NaN	NaN	0.2	T	0.995	D	0.91	D	0.001	D	1.000	D	2.085	M	2.1	T	-1.051	T	0.119	T	0.693	4.834	27.5	5.93	2.272	7.545	14.961	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.243367	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	84	80	4	0
chr12	101779877	101779877	G	A	exonic	UTP20	NaN	synonymous SNV	UTP20:NM_014503:exon62:c.G8334A:p.L2778L	rs149045326	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.965425	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	86	78	8	0
chr12	101779882	101779882	A	T	exonic	UTP20	NaN	nonsynonymous SNV	UTP20:NM_014503:exon62:c.A8339T:p.D2780V	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.891	P	0.617	P	0.000	D	1.000	D	1.245	L	1.86	T	-1.101	T	0.084	T	0.49	3.414	17.54	5.93	2.272	8.776	14.961	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.018362705364638774	NA	0	0	NaN	NA	NA	64	47	17	0
chr12	101779883	101779883	T	A	exonic	UTP20	NaN	nonsynonymous SNV	UTP20:NM_014503:exon62:c.T8340A:p.D2780E	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.017	B	0.012	B	0.000	N	0.949	D	1.245	L	2.0	T	-1.086	T	0.032	T	0.053	1.433	10.73	-2.44	-0.330	-0.096	6.841	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0026115027583421507	NA	0	0	NaN	NA	NA	55	34	21	0
chr12	101779907	101779907	C	T	UTR3	UTP20	NM_014503:c.*6C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.722834	nearby_gap_events	REJECT	87	81	6	0
chr12	1017967	1017967	A	G	UTR3	WNK1	NM_014823:c.*9A>G,NM_018979:c.*9A>G,NM_213655:c.*9A>G,NM_001184985:c.*9A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	11	5	4	0
chr12	101801325	101801325	T	T	intronic	ARL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr12	101880232	101880232	T	A	exonic	SPIC	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.999	D	0.978	D	0.000	D	1.000	D	2.015	M	1.8	T	-0.909	T	0.148	T	0.836	4.196	21.8	4.69	1.883	5.681	14.451	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.438481	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	92	85	7	0
chr12	102040481	102040481	T	G	intronic	MYBPC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	10206973	10206973	A	C	intronic	CLEC9A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.625444	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	316	301	15	0
chr12	102108129	102108129	T	G	intronic	CHPT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.34473	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	189	177	12	0
chr12	102140838	102140838	T	T	UTR3	GNPTAB	NM_024312:c.*104A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	102142852	102142852	T	T	intronic	GNPTAB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	102151113	102151113	A	G	intronic	GNPTAB	NaN	NaN	NaN	rs3736476	NaN	0.307508	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	58.7095	0	NaN	NA	NA	78	34	44	25
chr12	102154867	102154867	T	T	intronic	GNPTAB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	102164750	102164750	T	T	intronic	GNPTAB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr12	102179657	102179657	T	C	intronic	GNPTAB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.630207	nearby_gap_events	REJECT	158	151	7	0
chr12	102437703	102437703	T	C	intronic	CCDC53	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	102468720	102468720	T	C	intronic	NUP37	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	21	3	18	0
chr12	10251445	10251445	C	G	exonic	CLEC1A	NaN	nonsynonymous SNV	CLEC1A:NM_001297748:exon1:c.G77C:p.G26A,CLEC1A:NM_001297749:exon1:c.G77C:p.G26A,CLEC1A:NM_016511:exon1:c.G77C:p.G26A	rs2306894	ID=COSM147434;OCCURENCE=1(stomach),1(large_intestine)	0.670527	0.83	T	0.0	B	0.0	B	0.035	N	1.000	P	-1.23	N	5.49	T	-0.981	T	0.000	T	0.159	-0.540	1.549	4.66	0.715	0.958	7.889	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	191.482	0	NaN	NA	NA	117	70	47	53
chr12	102547576	102547576	T	C	intronic	PARPBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	2	2	0
chr12	102576311	102576311	T	C	intronic	PARPBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.9264	0	NaN	NA	NA	7	4	3	1
chr12	102591349	102591349	T	A	exonic	PMCH	NaN	nonsynonymous SNV	PMCH:NM_002674:exon1:c.A200T:p.K67I	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.972	D	0.000	D	1.000	D	0.975	L	.	.	-0.504	T	0.281	T	0.865	3.967	20.3	5.52	2.111	2.208	15.659	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.89412	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	46	35	11	0
chr12	102591356	102591356	G	C	exonic	PMCH	NaN	nonsynonymous SNV	PMCH:NM_002674:exon1:c.C193G:p.Q65E	NaN	NaN	NaN	0.35	T	0.001	B	0.002	B	0.058	N	0.999	N	0.695	N	.	.	-1.051	T	0.070	T	0.148	1.291	10.22	2.7	0.298	1.054	13.142	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.228556	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	48	39	9	0
chr12	10280403	10280403	T	G	exonic	CLEC7A	NaN	nonsynonymous SNV	CLEC7A:NM_022570:exon2:c.A145C:p.I49L,CLEC7A:NM_197947:exon2:c.A145C:p.I49L,CLEC7A:NM_197948:exon2:c.A145C:p.I49L,CLEC7A:NM_197949:exon2:c.A145C:p.I49L,CLEC7A:NM_197954:exon2:c.A145C:p.I49L	NaN	NaN	NaN	0.32	T	0.484	P	0.17	B	0.666	N	0.998	N	1.835	L	4.86	T	-0.973	T	0.025	T	0.298	1.523	11.04	2.96	0.920	0.462	5.669	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.6219	0	NaN	NA	NA	18	14	4	0
chr12	102874212	102874212	C	A	UTR5	IGF1	NM_000618:c.-53G>T,NM_001111283:c.-53G>T,NM_001111285:c.-53G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	52	18	34	0
chr12	10313075	10313075	T	C	intronic	OLR1	NaN	NaN	NaN	rs3736235	NaN	0.31869	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	88.2153	0	27.481252	normal_lod	REJECT	9	0	9	6
chr12	103237997	103237997	T	G	intronic	PAH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr12	103271326	103271326	G	C	exonic	PAH	NaN	nonsynonymous SNV	PAH:NM_000277:exon4:c.C355G:p.P119A	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.98	D	0.000	D	1.000	D	3.78	H	-4.96	D	1.069	D	0.978	D	0.884	4.758	26.6	5.86	2.766	9.402	20.177	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.475459	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	168	144	24	0
chr12	103271327	103271327	C	G	exonic	PAH	NaN	synonymous SNV	PAH:NM_000277:exon4:c.G354C:p.V118V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.946791	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	169	145	24	0
chr12	103306550	103306550	A	G	intronic	PAH	NaN	NaN	NaN	rs17842947	NaN	0.216853	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	840.035751	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	269	0	269	17
chr12	10332104	10332104	T	G	UTR5	TMEM52B	NM_001079815:c.-70T>G,NM_153022:c.-86T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	103352106	103352106	A	T	exonic	ASCL1	NaN	synonymous SNV	ASCL1:NM_004316:exon1:c.A84T:p.A28A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	21	11	10	0
chr12	103352107	103352107	G	C	exonic	ASCL1	NaN	nonsynonymous SNV	ASCL1:NM_004316:exon1:c.G85C:p.A29P	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.997	D	0.878	P	0.000	U	1.000	D	0	N	-5.42	D	0.903	D	0.911	D	0.557	2.133	13.09	4.12	2.013	2.521	13.650	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	21	10	11	0
chr12	103352108	103352108	C	T	exonic	ASCL1	NaN	nonsynonymous SNV	ASCL1:NM_004316:exon1:c.C86T:p.A29V	NaN	NaN	NaN	0.34	T	0.97	D	0.678	P	0.000	U	1.000	D	0	N	-5.36	D	0.878	D	0.891	D	0.455	3.583	18.25	4.12	2.013	3.257	13.650	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	21	9	11	0
chr12	10339350	10339350	A	T	intronic	TMEM52B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	10342456	10342456	T	C	intronic	TMEM52B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	6	7	0
chr12	10365670	10365670	G	C	UTR5	GABARAPL1	NM_031412:c.-59G>C	NaN	NaN	rs11545794	NaN	0.0453275	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.6793	0	NaN	NA	NA	10	7	3	7
chr12	10370763	10370763	A	G	intronic	GABARAPL1	NaN	NaN	NaN	rs73058099	NaN	0.0515176	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	92.987046	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	94	45	49	15
chr12	103866340	103866340	T	T	intronic	C12orf42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	1040373	1040373	T	C	intronic	RAD52	NaN	NaN	NaN	rs7303748	NaN	0.544928	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	44.6309	0	23.630058	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	7	9	33
chr12	1040398	1040398	G	T	exonic	RAD52	NaN	synonymous SNV	RAD52:NM_001297420:exon2:c.C174A:p.G58G,RAD52:NM_001297419:exon3:c.C174A:p.G58G,RAD52:NM_001297422:exon3:c.C174A:p.G58G,RAD52:NM_134424:exon3:c.C174A:p.G58G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.474678	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	15	12	3	1
chr12	104064620	104064620	A	A	intronic	STAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	104084348	104084348	A	A	intronic	STAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	104099578	104099578	A	A	intronic	STAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	104100804	104100804	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	3	4,4	0
chr12	104100805	104100805	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	10	0	4,6	0
chr12	104102138	104102138	T	G	intronic	STAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	104129190	104129190	T	G	intronic	STAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.598835	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	54	36	18	12
chr12	104134341	104134341	G	T	intronic	STAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	104142957	104142957	A	C	intronic	STAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	104142959	104142959	T	C	intronic	STAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	104142960	104142960	T	A	intronic	STAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	104142961	104142961	T	G	intronic	STAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	104142963	104142963	G	C	intronic	STAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	104190600	104190600	T	T	intronic	NT5DC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr12	104190837	104190837	A	A	intronic	NT5DC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr12	104200261	104200261	A	G	intronic	NT5DC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	0	5	0
chr12	104331450	104331450	T	T	intronic	HSP90B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	104333191	104333191	T	T	intronic	HSP90B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr12	104335398	104335398	T	G	intronic	HSP90B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.386675	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	206	186	20	0
chr12	104336791	104336791	T	G	intronic	HSP90B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	104336796	104336796	T	G	intronic	HSP90B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	6	1	4	0
chr12	104341052	104341052	T	C	intronic	HSP90B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	104341242	104341242	A	A	intronic	HSP90B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr12	104341505	104341505	G	T	UTR3	HSP90B1	NM_003299:c.*65G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.583201	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	198	182	16	0
chr12	104350397	104350397	T	T	intronic	C12orf73	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr12	104413543	104413543	A	G	intronic	GLT8D2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	104413544	104413544	C	G	intronic	GLT8D2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	104473091	104473091	T	A	intronic	HCFC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	104473092	104473092	G	C	intronic	HCFC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	104473101	104473101	A	T	intronic	HCFC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	104515107	104515107	A	G	intronic	NFYB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	10.6816	0	19.890853	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	151	130	21	0
chr12	104515110	104515110	A	G	intronic	NFYB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.297424	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	67	56	11	0
chr12	104645363	104645363	G	A	exonic	TXNRD1	NaN	unknown	UNKNOWN	rs7960443	NaN	0.777356	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	450.115782	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	148	0	148	56
chr12	10467233	10467233	T	C	intronic	KLRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	16	1	14	0
chr12	104697766	104697766	T	G	exonic	EID3	NaN	synonymous SNV	EID3:NM_001008394:exon1:c.T54G:p.S18S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.181272	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	326	312	14	0
chr12	104712869	104712869	T	C	intronic	TXNRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.146543	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	93	84	9	0
chr12	104712871	104712871	T	C	intronic	TXNRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.033686	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	191	173	18	0
chr12	104721100	104721100	G	A	intronic	TXNRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	104721102	104721102	A	G	intronic	TXNRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	104721103	104721103	C	G	intronic	TXNRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	104721104	104721104	C	T	intronic	TXNRD1	NaN	NaN	NaN	rs372525046	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	104721106	104721106	T	C	intronic	TXNRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	8	3	0
chr12	104851112	104851112	T	C	UTR5	CHST11	NM_001173982:c.-78T>C,NM_018413:c.-78T>C	NaN	NaN	rs111789728	NaN	0.122604	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	22	21.03657	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	23	12	5
chr12	105027571	105027571	T	G	intronic	CHST11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	105151589	105151589	G	G	UTR3	CHST11	NM_001173982:c.*8G>G,NM_018413:c.*8G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	57	54	0	0
chr12	105279956	105279956	T	T	intronic	SLC41A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	10531253	10531253	C	A	exonic	KLRC4-KLRK1,KLRK1	NaN	nonsynonymous SNV	KLRK1:NM_007360:exon6:c.G329T:p.C110F,KLRC4-KLRK1:NM_001199805:exon11:c.G329T:p.C110F	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	3.065	M	0.64	T	-0.171	T	0.359	T	0.948	2.316	13.70	5.07	1.530	2.021	13.374	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.013905	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	58	55	3	0
chr12	105433523	105433523	T	A	exonic	ALDH1L2	NaN	synonymous SNV	ALDH1L2:NM_001034173:exon17:c.A2013T:p.G671G	rs4964317	NaN	0.310503	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	170.89976	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	201	121	80	42
chr12	105446761	105446761	A	A	intronic	ALDH1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	105509160	105509160	G	T	intronic	KIAA1033	NaN	NaN	NaN	rs1196801	NaN	0.934105	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1139.53	0	NaN	NA	NA	342	177	165	55
chr12	105515082	105515082	A	G	intronic	KIAA1033	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	37	6	30	0
chr12	105558100	105558100	A	A	intronic	KIAA1033	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr12	105583986	105583986	A	C	intronic	APPL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr12	105589356	105589356	T	A	intronic	APPL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.14999999999999866	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr12	10560800	10560800	T	T	intronic	KLRC4,KLRC4-KLRK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	18	13	0	0
chr12	10561391	10561391	T	T	intronic	KLRC4,KLRC4-KLRK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	10562025	10562025	C	T	exonic	KLRC4	NaN	synonymous SNV	KLRC4:NM_013431:exon1:c.G150A:p.S50S	rs1841957	NaN	0.49401	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	136.882058	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	0	45	52
chr12	10571504	10571504	C	T	intronic	KLRC3	NaN	NaN	NaN	rs4579992	NaN	0.97524	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	161.524	0	53.364942	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	0	25	42
chr12	10571514	10571514	C	G	intronic	KLRC3	NaN	NaN	NaN	rs4275705	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	127.567	0	59.609549	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	39
chr12	10602727	10602727	A	G	intronic	KLRC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	106461760	106461760	G	A	intronic	NUAK1	NaN	NaN	NaN	rs3741884	NaN	0.10603	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	136	53	83	17
chr12	106464732	106464732	A	A	intronic	NUAK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr12	106532072	106532072	C	A	intronic	NUAK1	NaN	NaN	NaN	rs1215597	NaN	0.376797	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.226963	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	12	5	42
chr12	106641060	106641060	G	A	intronic	CKAP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.784419	clustered_read_position	REJECT	43	35	8	3
chr12	106708277	106708277	CT	C,CG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1897.75	0	NaN	NA	NA	197	0	104	1
chr12	106730054	106730054	A	G	intronic	TCP11L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.448247		KEEP	114	107	7	0
chr12	106773772	106773772	T	T	intronic	POLR3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr12	106857145	106857145	T	G	intronic	POLR3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr12	106895276	106895276	A	C	ncRNA_intronic	LOC100287944	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr12	106903141	106903141	T	T	ncRNA_intronic	LOC100287944	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	107019306	107019306	C	A	ncRNA_intronic	LOC100287944	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	107033062	107033062	T	C	ncRNA_intronic	LOC100287944	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.07313049853372199	NA	0	0	NaN	NA	NA	21	16	5	0
chr12	10763419	10763419	CTAGACATG	C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	704.248	0	NaN	NA	NA	77	0	72	27
chr12	10786745	10786745	A	G	intronic	STYK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.367934	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	349	342	7	0
chr12	107974813	107974813	G	T	intronic	BTBD11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.046868	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	118	111	7	0
chr12	107979573	107979573	T	A	intronic	BTBD11	NaN	NaN	NaN	rs11832945	NaN	0.345847	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr12	108014085	108014085	A	G	intronic	BTBD11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	108051556	108051556	A	A	UTR3	BTBD11	NM_001018072:c.*61A>A,NM_001017523:c.*61A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	108079604	108079604	T	T	UTR5	PWP1	NM_007062:c.-73T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	108082592	108082592	A	A	intronic	PWP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr12	108086879	108086879	T	C	intronic	PWP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.542063	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	711	703	8	0
chr12	108150588	108150588	T	T	ncRNA_intronic	LOC101929162	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr12	10816817	10816817	T	C	intronic	STYK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	108415636	108415636	C	G	intergenic	LOC728739,WSCD2	dist=118088;dist=107612	NaN	NaN	rs11612212	NaN	0.096246	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr12	10854752	10854752	A	G	intronic	YBX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.55666	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	282	274	8	0
chr12	108603822	108603822	A	C	intronic	WSCD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.16185	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	66	58	8	0
chr12	108634092	108634092	T	T	intronic	WSCD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	108634093	108634093	C	C	intronic	WSCD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	108731601	108731601	T	C	intronic	CMKLR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	108763672	108763672	T	C	intergenic	CMKLR1,LINC01498	dist=30578;dist=89530	NaN	NaN	rs2012943	NaN	0.958067	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	16	9	7	0
chr12	108930201	108930201	T	T	intronic	SART3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	108932025	108932025	A	C	intronic	SART3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	108956417	108956417	T	G	exonic	ISCU	NaN	nonsynonymous SNV	ISCU:NM_001301140:exon1:c.T19G:p.F7V,ISCU:NM_001301141:exon1:c.T19G:p.F7V,ISCU:NM_213595:exon1:c.T19G:p.F7V	rs10778647	NaN	0.89397	0.5	T	0.0	B	0.0	B	0.001	N	0.000	P	0	N	0.07	T	-0.988	T	0.000	T	0.451	1.396	10.60	4.95	1.467	2.348	11.030	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.297827	normal_lod	REJECT	3	0	3	0
chr12	108956433	108956433	C	T	exonic	ISCU	NaN	nonsynonymous SNV	ISCU:NM_001301140:exon1:c.C35T:p.A12V,ISCU:NM_001301141:exon1:c.C35T:p.A12V,ISCU:NM_213595:exon1:c.C35T:p.A12V	rs2287555	NaN	0.507588	0.23	T	0.999	D	0.972	D	0.007	N	0.000	P	0	N	-0.18	T	-0.975	T	0.000	T	0.329	2.392	13.96	4.39	1.467	2.971	11.989	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.91085	normal_lod	REJECT	3	0	3	6
chr12	108958271	108958271	A	A	intronic	ISCU	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	19	16	0	0
chr12	108986033	108986033	C	T	exonic	TMEM119	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM119:NM_181724:exon2:c.G127A:p.E43K	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.979	D	0.747	P	0.037	N	0.999	D	1.87	L	0.61	T	-0.568	T	0.245	T	0.421	3.963	20.3	4.6	2.291	4.050	16.005	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.93958	0	NaN	NA	NA	72	62	10	0
chr12	109016752	109016752	A	G	UTR3	SELPLG	NM_003006:c.*93T>C,NM_001206609:c.*93T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	109016769	109016769	T	T	UTR3	SELPLG	NM_003006:c.*76A>A,NM_001206609:c.*76A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr12	109017667	109017667	C	T	exonic	SELPLG	NaN	synonymous SNV	SELPLG:NM_001206609:exon2:c.G465A:p.T155T,SELPLG:NM_003006:exon2:c.G417A:p.T139T	rs200694582	ID=COSM934611,COSM934612;OCCURENCE=1(endometrium)	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	13	7	6	0
chr12	109017670	109017670	G	C	exonic	SELPLG	NaN	synonymous SNV	SELPLG:NM_001206609:exon2:c.C462G:p.P154P,SELPLG:NM_003006:exon2:c.C414G:p.P138P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	5.360223114249207E-4	Somatic	190.709	0	NaN	NA	NA	21	9	12	0
chr12	109052479	109052479	T	T	intronic	CORO1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	109055781	109055781	A	G	intronic	CORO1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	146	95	45	1
chr12	109183029	109183029	A	G	intronic	SSH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr12	109186393	109186393	G	A	exonic	SSH1	NaN	nonsynonymous SNV	SSH1:NM_001161331:exon13:c.C1595T:p.S532F,SSH1:NM_001161330:exon14:c.C1562T:p.S521F,SSH1:NM_018984:exon14:c.C1562T:p.S521F	NaN	NaN	NaN	0	D	0.958	D	0.748	P	0.173	N	1.000	N	1.735	L	2.67	T	-1.096	T	0.059	T	0.199	3.984	20.4	4.38	1.355	3.671	10.960	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	14	6	8	0
chr12	109186395	109186395	A	G	exonic	SSH1	NaN	synonymous SNV	SSH1:NM_001161331:exon13:c.T1593C:p.P531P,SSH1:NM_001161330:exon14:c.T1560C:p.P520P,SSH1:NM_018984:exon14:c.T1560C:p.P520P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	24	15	9	0
chr12	109186407	109186407	G	T	exonic	SSH1	NaN	nonsynonymous SNV	SSH1:NM_001161331:exon13:c.C1581A:p.D527E,SSH1:NM_001161330:exon14:c.C1548A:p.D516E,SSH1:NM_018984:exon14:c.C1548A:p.D516E	NaN	NaN	NaN	0.51	T	1.0	D	0.996	D	0.000	N	0.773	D	2.135	M	2.65	T	-1.046	T	0.105	T	0.633	3.241	16.87	3.67	0.806	3.851	10.539	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	18	2	16	0
chr12	109186408	109186408	T	C	exonic	SSH1	NaN	nonsynonymous SNV	SSH1:NM_001161331:exon13:c.A1580G:p.D527G,SSH1:NM_001161330:exon14:c.A1547G:p.D516G,SSH1:NM_018984:exon14:c.A1547G:p.D516G	NaN	NaN	NaN	0.13	T	1.0	D	0.998	D	0.000	N	1.000	D	2.135	M	2.58	T	-1.209	T	0.129	T	0.88	3.728	18.93	5.48	2.210	5.303	14.463	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	30	14	16	0
chr12	109186409	109186409	C	G	exonic	SSH1	NaN	nonsynonymous SNV	SSH1:NM_001161331:exon13:c.G1579C:p.D527H,SSH1:NM_001161330:exon14:c.G1546C:p.D516H,SSH1:NM_018984:exon14:c.G1546C:p.D516H	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.999	D	0.000	N	1.000	D	2.135	M	2.57	T	-1.121	T	0.142	T	0.888	3.805	19.32	5.48	2.736	4.041	17.926	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	34	15	19	0
chr12	109186634	109186634	A	G	intronic	SSH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	109186636	109186636	G	C	intronic	SSH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	109200012	109200012	T	C	intronic	SSH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	14	9	4	0
chr12	109200257	109200257	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	0	3,2	0
chr12	109200258	109200258	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	0	2,2	0
chr12	109200259	109200259	A	T	intronic	SSH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	109216998	109216998	A	G	intronic	SSH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.042749	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	513	474	39	0
chr12	109216999	109216999	G	C	intronic	SSH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.753819	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	514	476	38	0
chr12	109217000	109217000	C	A	intronic	SSH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.698676	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	516	477	39	0
chr12	109278831	109278831	C	A	exonic	DAO	NaN	nonsynonymous SNV	DAO:NM_001917:exon2:c.C49A:p.L17I	NaN	NaN	NaN	0.23	T	0.998	D	0.993	D	0.000	D	1.000	D	1.795	L	-1.74	D	0.144	D	0.627	D	0.332	4.300	22.5	5.44	2.541	2.059	11.340	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.324947	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	320	314	6	0
chr12	109316394	109316394	G	A	intronic	SVOP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	19	10	7	0
chr12	109316622	109316622	A	A	intronic	SVOP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	28	24	0	0
chr12	109338990	109338990	G	T	intronic	SVOP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.884856	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	137	124	13	0
chr12	109366668	109366668	A	A	intronic	SVOP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	109371349	109371349	A	A	intronic	SVOP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	109372496	109372496	A	G	intronic	SVOP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	109490601	109490601	C	T	ncRNA_intronic	USP30-AS1	NaN	NaN	NaN	rs2304267	NaN	0.179513	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.981401	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	13
chr12	109519751	109519751	C	A	exonic	USP30	NaN	nonsynonymous SNV	USP30:NM_032663:exon9:c.C794A:p.T265N,USP30:NM_001301175:exon12:c.C701A:p.T234N	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.67	P	0.643	P	0.000	D	1.000	D	1.79	L	1.25	T	-0.888	T	0.166	T	0.322	4.914	28.4	5.31	2.640	6.997	18.329	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.023965267358202817	NA	0	0	NaN	NA	NA	152	112	40	0
chr12	109519753	109519753	C	T	exonic	USP30	NaN	synonymous SNV	USP30:NM_032663:exon9:c.C796T:p.L266L,USP30:NM_001301175:exon12:c.C703T:p.L235L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.490506	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	319	310	9	0
chr12	109537145	109537145	T	A	intronic	UNG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.187791	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	85	72	13	6
chr12	109539853	109539853	A	T	intronic	UNG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	17	5	7	0
chr12	109539858	109539858	T	G	intronic	UNG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr12	109541226	109541226	T	C	intronic	UNG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.043008	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	205	199	6	0
chr12	10958658	10958658	T	C	exonic	TAS2R8	NaN	nonsynonymous SNV	TAS2R8:NM_023918:exon1:c.A922G:p.M308V	rs2537817	NaN	0.873403	1	T	0.0	B	0.0	B	0.367	N	1.000	P	0.69	N	5.85	T	-0.922	T	0.000	T	0.026	-1.792	0.010	-9.75	-2.329	-1.137	3.455	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	119.516	0	39.381596	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	0	13	33
chr12	109617976	109617976	A	A	intronic	ACACB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr12	109623357	109623357	T	C	intronic	ACACB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr12	109623489	109623489	C	T	exonic	ACACB	NaN	nonsynonymous SNV	ACACB:NM_001093:exon11:c.C1924T:p.P642S	NaN	NaN	NaN	0	D	0.985	D	0.897	P	0.000	D	1.000	D	2.75	M	-4.0	D	1.075	D	0.937	D	0.764	3.848	19.55	5.33	2.664	7.794	18.987	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.198577	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	299	282	17	0
chr12	109623599	109623599	G	T	intronic	ACACB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	109623601	109623601	G	C	intronic	ACACB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	109629790	109629790	A	A	intronic	ACACB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	109691991	109691991	A	G	intronic	ACACB	NaN	NaN	NaN	rs2075259	NaN	0.714657	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	58.33923	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	0	19	53
chr12	109693693	109693693	G	G	intronic	ACACB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	109693694	109693694	T	T	intronic	ACACB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	109695980	109695980	T	T	intronic	ACACB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr12	109696838	109696838	G	A	exonic	ACACB	NaN	nonsynonymous SNV	ACACB:NM_001093:exon46:c.G6421A:p.V2141I	rs2075260	NaN	0.738818	1	T	0.002	B	0.001	B	0.000	N	0.000	P	-2.945	N	-4.36	D	-0.903	T	0.000	T	0.117	0.936	8.814	5.07	1.039	6.173	11.476	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.049036	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	49
chr12	109702242	109702242	A	A	intronic	ACACB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr12	109702787	109702787	T	T	intronic	ACACB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	109719535	109719535	T	G	exonic	FOXN4	NaN	nonsynonymous SNV	FOXN4:NM_213596:exon9:c.A971C:p.E324A	NaN	NaN	NaN	0.68	T	0.004	B	0.004	B	0.297	N	0.977	N	1.7	L	-3.11	D	-0.249	T	0.706	D	0.261	0.665	7.561	4.14	2.133	2.752	10.073	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.136248	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	44	39	5	0
chr12	10978402	10978402	G	A	exonic	TAS2R10	NaN	nonsynonymous SNV	TAS2R10:NM_023921:exon1:c.C467T:p.T156M	rs597468	NaN	0.942891	0.25	T	0.0	B	0.001	B	0.000	N	1.000	P	-1.245	N	1.18	T	-0.929	T	0.000	T	0.023	0.445	6.415	-8.28	-1.587	-3.532	3.904	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2005.87	0	NaN	NA	NA	192	1	191	39
chr12	109835590	109835590	A	G	exonic	MYO1H	NaN	synonymous SNV	MYO1H:NM_001101421:exon4:c.A495G:p.K165K	rs11611358	ID=COSM1358610;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.252396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	200.6448	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	70	0	70	21
chr12	109839107	109839107	A	C	intronic	MYO1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	19	9	6	0
chr12	109839108	109839108	C	T	intronic	MYO1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr12	109839109	109839109	T	G	intronic	MYO1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr12	109839111	109839111	T	C	intronic	MYO1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	14	8	6	0
chr12	109843651	109843651	C	A	intronic	MYO1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr12	109870664	109870664	T	G	intronic	MYO1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr12	109870855	109870855	A	A	intronic	MYO1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	109876500	109876500	T	G	intronic	MYO1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	109878672	109878672	G	C	intronic	MYO1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.611226	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	45	39	6	0
chr12	109883374	109883374	T	C	exonic	MYO1H	NaN	nonsynonymous SNV	MYO1H:NM_001101421:exon30:c.T3002C:p.L1001P	rs3825393	NaN	0.704673	1	T	0.0	B	0.0	B	.	.	0.997	P	-1.845	N	1.36	T	-0.989	T	0.000	T	0.131	1.432	10.73	2.79	0.402	0.012	8.431	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	143.790515	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	51	0	51	52
chr12	109893892	109893892	C	G	intronic	KCTD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	109893895	109893895	C	G	intronic	KCTD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	109893896	109893896	T	C	intronic	KCTD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	14	0	14	0
chr12	109895954	109895954	G	G	intronic	KCTD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr12	109895956	109895956	C	C	intronic	KCTD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr12	109895957	109895957	A	A	intronic	KCTD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr12	109895958	109895958	G	A	intronic	KCTD10	NaN	NaN	NaN	rs11609019	NaN	0.160543	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr12	109895959	109895959	G	G	intronic	KCTD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr12	109895961	109895961	T	T	intronic	KCTD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr12	109929008	109929008	A	G	intronic	UBE3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr12	109929014	109929014	A	C	intronic	UBE3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr12	109939380	109939380	G	C	intronic	UBE3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	109940803	109940803	A	A	intronic	UBE3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	109940848	109940848	C	A	exonic	UBE3B	NaN	nonsynonymous SNV	UBE3B:NM_130466:exon14:c.C1303A:p.Q435K,UBE3B:NM_183415:exon14:c.C1303A:p.Q435K	NaN	NaN	NaN	0.56	T	0.488	P	0.079	B	0.000	D	1.000	D	1.79	L	1.59	T	-1.025	T	0.103	T	0.853	3.867	19.65	5.81	2.741	7.079	18.662	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.848813	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	242	232	10	0
chr12	109941023	109941023	A	A	intronic	UBE3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	109971291	109971291	A	G	exonic	UBE3B	NaN	synonymous SNV	UBE3B:NM_130466:exon27:c.A2943G:p.R981R,UBE3B:NM_183415:exon27:c.A2943G:p.R981R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.478435	nearby_gap_events	REJECT	119	113	6	0
chr12	109972736	109972736	A	A	UTR3	UBE3B	NM_183415:c.*149A>A,NM_130466:c.*149A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	10998570	10998570	A	C	ncRNA_intronic	PRH1-PRR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.374233	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	130	104	26	0
chr12	109999138	109999138	T	T	intronic	MMAB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	109999454	109999454	T	T	intronic	MMAB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	109999456	109999456	C	C	intronic	MMAB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	110006687	110006687	A	A	intronic	MMAB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	110013982	110013982	A	T	intronic	MVK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr12	110019371	110019371	A	A	intronic	MVK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr12	11002108	11002108	A	A	ncRNA_intronic	PRH1-PRR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	11002113	11002113	A	A	ncRNA_intronic	PRH1-PRR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	11002114	11002114	A	A	ncRNA_intronic	PRH1-PRR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	110029032	110029032	C	C	intronic	MVK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	110029244	110029244	A	A	intronic	MVK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	110035260	110035260	A	T	downstream	MVK	NaN	NaN	NaN	rs66513915	NaN	0.159545	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	32	22	10	0
chr12	110232329	110232329	A	G	intronic	TRPV4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.883336		KEEP	38	33	5	0
chr12	110252408	110252408	G	A	exonic	TRPV4	NaN	nonsynonymous SNV	TRPV4:NM_001177428:exon1:c.C194T:p.P65L,TRPV4:NM_001177433:exon1:c.C194T:p.P65L,TRPV4:NM_147204:exon1:c.C194T:p.P65L,TRPV4:NM_001177431:exon2:c.C92T:p.P31L,TRPV4:NM_021625:exon2:c.C194T:p.P65L	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.95	P	0.574	P	0.001	U	0.957	D	0	N	-2.31	D	-0.014	T	0.446	T	0.189	2.521	14.39	2.64	1.615	6.008	7.898	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.182751	clustered_read_position	REJECT	21	17	4	0
chr12	110295509	110295509	A	A	intronic	GLTP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	36	34	0	0
chr12	110345444	110345444	C	T	exonic	TCHP	NaN	synonymous SNV	TCHP:NM_001143852:exon6:c.C639T:p.D213D,TCHP:NM_032300:exon6:c.C639T:p.D213D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.648082	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	158	151	7	0
chr12	110397766	110397766	A	A	intronic	GIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	90	71	0	0
chr12	110399031	110399031	A	C	intronic	GIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	110399032	110399032	T	G	intronic	GIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	110399034	110399034	A	C	intronic	GIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	110399036	110399036	A	T	intronic	GIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	110399037	110399037	T	C	intronic	GIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	110399319	110399319	T	T	intronic	GIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr12	110399320	110399320	C	C	intronic	GIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr12	110404965	110404965	T	T	intronic	GIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	110426742	110426742	T	A	intronic	GIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	15	10	5	0
chr12	110429597	110429597	A	A	intronic	GIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr12	110457172	110457172	A	A	intronic	ANKRD13A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr12	110467472	110467472	A	A	intronic	ANKRD13A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	110474220	110474220	T	C	intronic	ANKRD13A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	110494907	110494907	A	C	intronic	C12orf76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr12	110494910	110494910	T	T	intronic	C12orf76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr12	110565997	110565997	A	A	intronic	IFT81	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	110572816	110572816	A	G	exonic	IFT81	NaN	nonsynonymous SNV	IFT81:NM_001143779:exon6:c.A583G:p.R195G,IFT81:NM_014055:exon6:c.A583G:p.R195G,IFT81:NM_031473:exon6:c.A583G:p.R195G	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.996	D	0.99	D	0.000	D	1.000	D	1.59	L	-1.29	T	0.148	D	0.577	D	0.947	3.622	18.43	5.42	2.072	4.381	12.052	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.716531	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	26	23	3	0
chr12	110584729	110584729	T	C	intronic	IFT81	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.180956	nearby_gap_events	REJECT	55	45	10	0
chr12	110628670	110628670	T	A	intronic	IFT81	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	110782586	110782586	T	T	intronic	ATP2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	110783241	110783241	G	A	intronic	ATP2A2	NaN	NaN	NaN	rs1860561	NaN	0.138179	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	80	52	29	22
chr12	110826291	110826291	T	T	intronic	ANAPC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	110873053	110873053	G	T	intronic	ARPC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	110874481	110874481	G	T	exonic	ARPC3	NaN	nonsynonymous SNV	ARPC3:NM_001278556:exon5:c.C260A:p.S87Y,ARPC3:NM_001287222:exon5:c.C260A:p.S87Y	NaN	NaN	NaN	0	D	0.958	D	0.815	P	0.000	D	1.000	D	2.585	M	.	.	0.015	D	0.491	T	0.681	5.134	32	5.86	2.778	9.348	20.177	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.929439	clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr12	110874482	110874482	A	G	exonic	ARPC3	NaN	nonsynonymous SNV	ARPC3:NM_001278556:exon5:c.T259C:p.S87P,ARPC3:NM_001287222:exon5:c.T259C:p.S87P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.014	B	0.017	B	0.000	N	1.000	D	1.89	L	.	.	-0.786	T	0.205	T	0.401	2.707	15.01	4.72	1.067	6.913	8.043	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.826582	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr12	110874815	110874815	T	T	intronic	ARPC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	110905869	110905869	G	A	intronic	GPN3	NaN	NaN	NaN	rs7958683	NaN	0.855831	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.790534	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	16	16	51
chr12	110922854	110922854	T	T	intronic	FAM216A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr12	110933923	110933923	T	C	exonic	VPS29	NaN	nonsynonymous SNV	VPS29:NM_001282151:exon2:c.A89G:p.K30R,VPS29:NM_016226:exon2:c.A89G:p.K30R,VPS29:NM_057180:exon3:c.A101G:p.K34R,VPS29:NM_001282150:exon4:c.A185G:p.K62R	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.039	B	0.197	B	0.000	D	1.000	D	1.2	L	2.34	T	-1.106	T	0.054	T	0.438	4.286	22.4	6.17	2.371	7.951	16.822	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.910734	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	104	99	5	0
chr12	110957570	110957570	T	T	intronic	RAD9B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr12	110969522	110969522	A	A	UTR3	RAD9B	NM_001286532:c.*1064A>A,NM_152442:c.*88A>A,NM_001286531:c.*1064A>A,NM_001286533:c.*1064A>A,NM_001286536:c.*36A>A,NM_001286535:c.*1064A>A,NM_001286534:c.*1064A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	111052064	111052064	C	T	exonic	TCTN1	NaN	nonsynonymous SNV	TCTN1:NM_001082537:exon1:c.C77T:p.A26V,TCTN1:NM_001082538:exon1:c.C77T:p.A26V,TCTN1:NM_024549:exon1:c.C77T:p.A26V	NaN	NaN	NaN	0.22	T	0.58	P	0.254	B	0.000	N	0.940	D	0.805	L	-1.21	T	-0.835	T	0.342	T	0.185	2.530	14.42	4.39	1.365	2.218	11.737	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.658285	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	156	150	6	0
chr12	111057629	111057629	T	C	intronic	TCTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.34210526315789824	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr12	111057630	111057630	T	C	intronic	TCTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.216851	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	125	116	9	0
chr12	111085744	111085744	A	G	intronic	TCTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr12	111098957	111098957	T	G	intronic	HVCN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	111098959	111098959	C	G	intronic	HVCN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.493428	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	70	63	7	2
chr12	111311659	111311659	A	G	exonic	CCDC63	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC63:NM_001286244:exon3:c.A146G:p.E49G,CCDC63:NM_001286243:exon4:c.A263G:p.E88G,CCDC63:NM_152591:exon5:c.A383G:p.E128G	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.999	D	0.974	D	0.014	N	0.508	N	2.32	M	1.25	T	-0.621	T	0.192	T	0.544	2.333	13.76	4.34	0.989	5.097	9.959	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.080059	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	46	39	7	0
chr12	111330814	111330814	T	A	intronic	CCDC63	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	20	7	13	0
chr12	111358158	111358158	T	T	intronic	MYL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	11139589	11139589	C	T	ncRNA_intronic	PRH1-PRR4	NaN	NaN	NaN	rs10772398	NaN	0.801518	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.9558	0	NaN	NA	NA	29	25	4	14
chr12	111649400	111649400	T	T	intronic	CUX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	111649401	111649401	C	C	intronic	CUX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	111652016	111652016	T	C	exonic	CUX2	NaN	nonsynonymous SNV	CUX2:NM_015267:exon2:c.T76C:p.S26P	NaN	NaN	NaN	0.06	T	1.0	D	0.984	D	0.000	D	0.641	D	0.805	L	1.42	T	-0.819	T	0.116	T	0.769	3.193	16.69	5.61	2.254	5.902	13.136	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	111694225	111694225	C	T	intronic	CUX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	111701484	111701484	T	T	intronic	CUX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr12	111746347	111746347	C	C	intronic	CUX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	61	54	0	0
chr12	111749833	111749833	C	T	intronic	CUX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.23076923076923198	NA	0	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr12	11175314	11175314	A	A	ncRNA_intronic	PRH1-PRR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	111772567	111772567	A	C	intronic	CUX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	11183217	11183217	C	T	exonic	TAS2R31	NaN	nonsynonymous SNV	TAS2R31:NM_176885:exon1:c.G718A:p.V240I	rs10772423	NaN	0.335264	1	T	0.002	B	0.002	B	.	.	1.000	P	-0.76	N	1.25	T	-0.983	T	0.000	T	0.021	-1.651	0.012	-4.77	-1.565	-4.168	3.216	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	800	498	302	42
chr12	111856738	111856738	T	T	intronic	SH2B3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	111885965	111885965	G	A	exonic	SH2B3	NaN	synonymous SNV	SH2B3:NM_001291424:exon7:c.G981A:p.V327V,SH2B3:NM_005475:exon8:c.G1587A:p.V529V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.451581	nearby_gap_events	REJECT	140	134	6	0
chr12	112082000	112082000	A	C	UTR3	BRAP	NM_006768:c.*3T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.756047	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	128	109	19	0
chr12	112097207	112097207	G	T	intronic	BRAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	112117037	112117037	A	G	exonic	BRAP	NaN	nonsynonymous SNV	BRAP:NM_006768:exon4:c.T551C:p.F184S	NaN	NaN	NaN	0.26	T	0.984	D	0.773	P	0.000	D	1.000	D	1.195	L	0.93	T	-0.977	T	0.149	T	0.916	2.706	15.01	5.28	2.126	6.892	15.483	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.304003	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	121	116	5	0
chr12	112130732	112130732	A	A	intronic	ACAD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr12	112143534	112143534	G	A	intronic	ACAD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.708669	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	87	80	7	0
chr12	112147293	112147293	T	C	intronic	ACAD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	15	7	6	0
chr12	112147520	112147520	A	A	intronic	ACAD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	112165971	112165971	A	A	intronic	ACAD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	112182452	112182452	G	T	exonic	ACAD10	NaN	nonsynonymous SNV	ACAD10:NM_025247:exon13:c.G1720T:p.A574S,ACAD10:NM_001136538:exon14:c.G1813T:p.A605S	NaN	NaN	NaN	0.15	T	0.421	B	0.31	B	0.000	D	1.000	D	2.305	M	1.53	T	-0.963	T	0.116	T	0.254	2.187	13.27	4.77	2.712	3.527	16.471	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	115.528934	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	511	422	89	0
chr12	112186327	112186327	A	C	intronic	ACAD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr12	112220903	112220903	G	A	intronic	ALDH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	112220904	112220904	T	G	intronic	ALDH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	112220906	112220906	A	C	intronic	ALDH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	112220909	112220909	A	T	intronic	ALDH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	112230055	112230055	T	T	intronic	ALDH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	112230056	112230056	G	G	intronic	ALDH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	112318166	112318166	T	T	intronic	MAPKAPK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	112330727	112330727	C	T	intronic	MAPKAPK5	NaN	NaN	NaN	rs370536412	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	112370333	112370333	T	T	intronic	TMEM116	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	112375879	112375879	T	T	intronic	TMEM116	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	112375990	112375990	A	C	exonic	TMEM116	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM116:NM_001193453:exon5:c.T235G:p.C79G,TMEM116:NM_138341:exon5:c.T64G:p.C22G,TMEM116:NM_001193531:exon6:c.T340G:p.C114G,TMEM116:NM_001294314:exon8:c.T64G:p.C22G	rs3752630	NaN	0.22484	1	T	0.0	B	0.0	B	0.001	N	0.000	P	-1.735	N	1.13	T	-0.960	T	0.000	T	0.126	0.999	9.079	3.84	0.363	0.422	5.684	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.453221	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	24	22	13
chr12	112457720	112457720	C	T	intronic	ERP29	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.002128	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	212	204	8	0
chr12	112486054	112486054	T	G	intronic	NAA25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	112486056	112486056	T	A	intronic	NAA25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	112491380	112491380	A	G	exonic	NAA25	NaN	synonymous SNV	NAA25:NM_024953:exon15:c.T1710C:p.F570F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.033495759860008446	NA	0	0	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr12	112579045	112579045	A	G	intronic	TRAFD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	3	2	0
chr12	112589586	112589586	T	T	intronic	TRAFD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	112590000	112590000	A	A	intronic	TRAFD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	112601601	112601601	C	G	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	112607262	112607262	T	T	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	112613487	112613487	T	C	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	112641608	112641608	A	A	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	112654878	112654878	C	G	exonic	HECTD4	NaN	nonsynonymous SNV	HECTD4:NM_001109662:exon46:c.G6794C:p.R2265P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.996	D	0.979	D	.	.	1.000	D	0.55	N	0.55	T	-0.603	T	0.238	T	0.91	5.116	32	5.81	2.756	7.277	20.083	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.530666	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	174	159	15	0
chr12	112654901	112654901	G	C	exonic	HECTD4	NaN	synonymous SNV	HECTD4:NM_001109662:exon46:c.C6771G:p.P2257P	NaN	NaN	NaN	0.6	T	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-1.040	T	0.142	T	.	1.134	9.620	3.9	2.756	0.672	9.725	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.28941	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	79	67	12	1
chr12	112666079	112666079	G	C	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	42	28	14	2
chr12	112667727	112667727	G	A	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.050146	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	250	242	8	0
chr12	112673085	112673085	C	C	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	16	15	0	0
chr12	112673602	112673602	A	G	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	13	7	6	0
chr12	112677058	112677058	A	A	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	112690189	112690189	T	C	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	rs191580592	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	112690191	112690191	G	A	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	112690192	112690192	T	C	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	rs367685196	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	3	0
chr12	112696454	112696454	T	C	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr12	112696455	112696455	G	A	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr12	112696459	112696459	T	C	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr12	112746749	112746749	A	C	intronic	HECTD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	16	7	9	0
chr12	112842975	112842975	T	A	downstream	RPL6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.850172	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	109	99	10	0
chr12	112846551	112846551	C	T	intronic	RPL6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.393883	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	111	103	8	0
chr12	112888109	112888109	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	2	2,2	0
chr12	112891203	112891203	G	C	intronic	PTPN11	NaN	NaN	NaN	rs41304351	NaN	0.00599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.449	0	NaN	NA	NA	48	25	23	0
chr12	113285728	113285728	A	A	intronic	RPH3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	113285729	113285729	A	A	intronic	RPH3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	113328580	113328580	T	T	intronic	RPH3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr12	113346561	113346561	T	C	exonic	OAS1	NaN	nonsynonymous SNV	OAS1:NM_001032409:exon2:c.T401C:p.F134S,OAS1:NM_002534:exon2:c.T401C:p.F134S,OAS1:NM_016816:exon2:c.T401C:p.F134S	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.027	N	0.519	D	3.215	M	2.45	T	-0.597	T	0.144	T	0.766	3.812	19.36	4.31	1.959	3.004	10.020	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.02535707923630661	NA	0	0	NaN	NA	NA	65	48	17	0
chr12	113346562	113346562	C	T	exonic	OAS1	NaN	synonymous SNV	OAS1:NM_001032409:exon2:c.C402T:p.F134F,OAS1:NM_002534:exon2:c.C402T:p.F134F,OAS1:NM_016816:exon2:c.C402T:p.F134F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	6.78816037756942E-5	NA	0	0	NaN	NA	NA	91	65	26	0
chr12	113346588	113346588	A	G	exonic	OAS1	NaN	nonsynonymous SNV	OAS1:NM_001032409:exon2:c.A428G:p.E143G,OAS1:NM_002534:exon2:c.A428G:p.E143G,OAS1:NM_016816:exon2:c.A428G:p.E143G	rs200753414	NaN	0.00119808	0.03	D	0.645	P	0.313	B	0.098	N	1.000	N	1.905	M	3.06	T	-0.995	T	0.028	T	0.175	2.642	14.80	-1.23	0.006	1.464	4.010	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.167651	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	203	192	11	0
chr12	113349060	113349060	C	G	intronic	OAS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.699972	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	59	47	12	0
chr12	113354593	113354593	A	A	intronic	OAS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr12	113384804	113384804	A	A	intronic	OAS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	35	33	0	0
chr12	113387066	113387066	A	G	intronic	OAS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	46	5	40	0
chr12	113387068	113387068	G	C	intronic	OAS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	113402014	113402014	T	T	intronic	OAS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr12	113402063	113402063	A	A	exonic	OAS3	NaN	synonymous SNV	OAS3:NM_006187:exon11:c.A2253A:p.P751P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	182	134	0	0
chr12	113496313	113496313	C	T	intronic	DTX1	NaN	NaN	NaN	rs1732785	NaN	0.302117	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	85.079	0	NaN	NA	NA	20	7	13	35
chr12	113530845	113530845	C	CAG	intronic	DTX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.872404	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	170.333	0	NaN	NA	NA	21	1	19	37
chr12	113530899	113530899	A	G	intronic	DTX1	NaN	NaN	NaN	rs1628639	NaN	0.872404	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	138.547	0	42.566691	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	0	15	43
chr12	113531545	113531545	A	A	intronic	DTX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	113532484	113532484	T	A	intronic	DTX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	25	7	9	0
chr12	113532485	113532485	A	G	intronic	DTX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	64	29	33	0
chr12	113532511	113532511	A	T	intronic	DTX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	126	40	79	0
chr12	113534464	113534464	G	C	intronic	DTX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	9.244578431623114E-5	NA	0	0	NaN	NA	NA	78	58	20	0
chr12	113537985	113537985	A	A	intronic	RASAL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	96	90	0	0
chr12	113544874	113544874	C	T	intronic	RASAL1	NaN	NaN	NaN	rs2468355	NaN	0.804712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	368.1991	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	121	0	121	58
chr12	113553408	113553408	C	T	intronic	RASAL1	NaN	NaN	NaN	rs1284878	NaN	0.786542	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	166.472824	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	0	60	44
chr12	113553436	113553436	T	C	intronic	RASAL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.49534	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	64	61	3	0
chr12	113557148	113557148	T	T	intronic	RASAL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	113	88	0	0
chr12	113593040	113593040	T	T	intronic	CCDC42B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr12	113599225	113599225	G	T	intronic	DDX54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.363026	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	70	62	8	0
chr12	113602195	113602195	A	C	intronic	DDX54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr12	113610432	113610432	A	AC	intronic	DDX54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.11354	0	NaN	NA	NA	8	7	3	0
chr12	113623326	113623326	G	T	upstream	DDX54,RITA1	NaN	NaN	NaN	rs11066508	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	48.183557	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	0	18	20
chr12	113707704	113707704	A	A	intronic	TPCN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	113724653	113724653	T	T	intronic	TPCN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	113727923	113727923	C	A	intronic	TPCN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.116496	clustered_read_position	REJECT	81	75	6	0
chr12	113727924	113727924	T	A	intronic	TPCN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.312266	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	81	75	6	0
chr12	113729808	113729808	A	T	intronic	TPCN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	113735332	113735332	T	T	UTR3	TPCN1	NM_001143819:c.*1451T>T,NM_017901:c.*1451T>T,NM_001301214:c.*1451T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	29	25	0	0
chr12	113735333	113735333	C	C	UTR3	TPCN1	NM_001143819:c.*1452C>C,NM_017901:c.*1452C>C,NM_001301214:c.*1452C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	29	25	0	0
chr12	113737737	113737737	G	A	exonic	SLC8B1	NaN	synonymous SNV	SLC8B1:NM_024959:exon16:c.C1600T:p.L534L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.967908	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	309	264	45	0
chr12	113742286	113742286	A	C	intronic	SLC8B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	15	8	3	0
chr12	113742287	113742287	T	A	intronic	SLC8B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	11	4	3	0
chr12	113742289	113742289	C	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	10	1	4,5	0
chr12	113742291	113742291	A	T	intronic	SLC8B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	113742294	113742294	G	T	intronic	SLC8B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	113742296	113742296	A	T	intronic	SLC8B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	113770628	113770628	A	G	exonic	SLC8B1	NaN	nonsynonymous SNV	SLC8B1:NM_024959:exon2:c.T56C:p.L19P	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.61	P	0.146	B	0.403	U	1.000	N	1.5	L	1.77	T	-0.999	T	0.121	T	0.488	1.139	9.641	-2.45	-0.470	0.238	1.412	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.136607	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	86	80	6	0
chr12	113807077	113807077	A	C	intronic	PLBD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr12	113818481	113818481	T	T	intronic	PLBD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr12	113825513	113825513	T	T	intronic	PLBD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	67	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	113836996	113836996	A	A	intronic	SDS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr12	113865713	113865713	T	T	intronic	SDSL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	6	0	0
chr12	113866137	113866137	T	T	intronic	SDSL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	113874705	113874705	G	G	intronic	SDSL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	175	113	0	0
chr12	113874844	113874844	A	A	intronic	SDSL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	113876049	113876049	A	A	UTR3	SDSL	NM_001304993:c.*165A>A,NM_138432:c.*165A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	113909166	113909166	G	A	exonic	LHX5	NaN	synonymous SNV	LHX5:NM_022363:exon1:c.C138T:p.R46R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.250827	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	29	26	3	0
chr12	11420268	11420268	G	C	exonic	PRB3	NaN	nonsynonymous SNV	PRB3:NM_006249:exon4:c.C788G:p.P263R	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.982	D	0.554	P	.	.	1.000	N	.	.	1.39	T	-1.037	T	0.079	T	0.162	0.065	4.352	-1.22	-0.349	0.536	3.827	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr12	11421536	11421536	T	A	intronic	PRB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.669786	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	70	59	11	0
chr12	114276471	114276471	C	A	intronic	RBM19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	114282440	114282440	A	G	intronic	RBM19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.271701	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	118	109	9	0
chr12	114346105	114346105	C	A	intronic	RBM19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	114346111	114346111	C	A	intronic	RBM19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr12	114362621	114362621	A	G	intronic	RBM19	NaN	NaN	NaN	rs1458713	NaN	0.934704	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	393.302653	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	132	0	132	54
chr12	114366289	114366289	C	A	intronic	RBM19	NaN	NaN	NaN	rs2384345	NaN	0.248203	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	114390458	114390458	A	G	intronic	RBM19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr12	114395616	114395616	T	C	exonic	RBM19	NaN	nonsynonymous SNV	RBM19:NM_001146698:exon6:c.A811G:p.K271E,RBM19:NM_001146699:exon6:c.A811G:p.K271E,RBM19:NM_016196:exon6:c.A811G:p.K271E	NaN	NaN	NaN	0.91	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	N	0	N	3.41	T	-0.980	T	0.009	T	0.201	1.169	9.755	-1.97	-0.211	0.159	5.047	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.0012005041478405632	NA	0	0	13.638443	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	96	84	12	0
chr12	114395619	114395619	C	T	exonic	RBM19	NaN	nonsynonymous SNV	RBM19:NM_001146698:exon6:c.G808A:p.G270R,RBM19:NM_001146699:exon6:c.G808A:p.G270R,RBM19:NM_016196:exon6:c.G808A:p.G270R	NaN	NaN	NaN	0.39	T	0.002	B	0.002	B	0.605	N	1.000	N	0	N	3.39	T	-0.910	T	0.009	T	0.175	0.477	6.590	-0.094	-0.120	-0.175	7.745	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.954735	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	99	86	13	0
chr12	11461470	11461470	A	G	exonic	PRB4	NaN	synonymous SNV	PRB4:NM_002723:exon3:c.T447C:p.G149G	rs1052807	NaN	0.755391	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.336295	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	5
chr12	11461836	11461836	T	C	intronic	PRB4	NaN	NaN	NaN	rs6488386	NaN	0.89976	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	88.2152	0	NaN	NA	NA	9	0	9	44
chr12	11463208	11463208	T	T	intronic	PRB4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	114823428	114823428	A	A	intronic	TBX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	114844246	114844246	G	C	intronic	TBX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	114844294	114844294	C	C	intronic	TBX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	114903807	114903807	C	A	intergenic	TBX5-AS1,TBX3	dist=53170;dist=204252	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr12	115117284	115117284	T	A	intronic	TBX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	31	9	22	0
chr12	115121124	115121124	C	C	UTR5	TBX3	NM_016569:c.-119G>G,NM_005996:c.-119G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	121	103	0	0
chr12	11547330	11547330	T	T	intronic	PRB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr12	116418777	116418777	C	A	intronic	MED13L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.544915	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	28	24	4	0
chr12	116420771	116420771	T	G	intronic	MED13L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	116420772	116420772	A	G	intronic	MED13L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	116424000	116424000	A	G	intronic	MED13L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.168413	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	140	134	6	0
chr12	116434673	116434673	T	T	intronic	MED13L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	116457829	116457829	T	C	intronic	MED13L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	27	18	9	0
chr12	116457832	116457832	A	G	intronic	MED13L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	27	18	9	0
chr12	116534618	116534618	A	A	intronic	MED13L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	117013730	117013730	G	C	UTR5	MAP1LC3B2	NM_001085481:c.-18G>C	NaN	NaN	rs7303998	NaN	0.521765	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	87.815862	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	0	36	49
chr12	117065371	117065371	C	T	intergenic	MAP1LC3B2,C12orf49	dist=50946;dist=85754	NaN	NaN	rs4767427	NaN	0.600839	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	11	2	9	0
chr12	117065428	117065428	G	A	intergenic	MAP1LC3B2,C12orf49	dist=51003;dist=85697	NaN	NaN	rs185558775	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	13	3	10	0
chr12	117158295	117158295	G	T	intronic	C12orf49	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	117158297	117158297	C	T	intronic	C12orf49	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	117187828	117187828	T	C	exonic	RNFT2	NaN	nonsynonymous SNV	RNFT2:NM_001109903:exon4:c.T266C:p.I89T,RNFT2:NM_032814:exon4:c.T266C:p.I89T	NaN	NaN	NaN	0	D	0.501	P	0.073	B	.	.	0.973	D	1.445	L	0.35	T	-0.839	T	0.124	T	0.517	2.747	15.15	4.74	2.277	5.848	12.899	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.846019	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	43	39	4	0
chr12	117187834	117187834	T	G	exonic	RNFT2	NaN	nonsynonymous SNV	RNFT2:NM_001109903:exon4:c.T272G:p.M91R,RNFT2:NM_032814:exon4:c.T272G:p.M91R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.998	D	0.988	D	0.000	D	1.000	D	1.445	L	0.6	T	-0.506	T	0.289	T	0.933	3.867	19.65	5.95	2.277	7.623	16.405	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.83046	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	41	37	4	0
chr12	117274112	117274112	T	G	intronic	RNFT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	117387349	117387349	T	T	intronic	FBXW8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	117465371	117465371	C	A	intronic	FBXW8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.502799	nearby_gap_events	REJECT	38	29	9	0
chr12	117465386	117465386	C	T	intronic	FBXW8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	117465387	117465387	A	C	intronic	FBXW8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	117465388	117465388	C	G	intronic	FBXW8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	117477116	117477116	A	A	intronic	TESC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	117477117	117477117	C	A	intronic	TESC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	117477118	117477118	C	G	intronic	TESC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr12	117477119	117477119	A	G	intronic	TESC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	117615503	117615503	T	C	intronic	FBXO21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.297876	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	86	76	10	1
chr12	117624447	117624447	A	G	intronic	FBXO21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	117627897	117627897	C	T	intronic	FBXO21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.000225	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	14	2	12	0
chr12	117627901	117627901	G	T	intronic	FBXO21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	159.156	0	NaN	NA	NA	21	2	19	0
chr12	117657861	117657861	A	C	intronic	NOS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr12	117657862	117657862	A	C	intronic	NOS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr12	117657863	117657863	G	C	intronic	NOS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr12	117658083	117658083	A	A	intronic	NOS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr12	117660467	117660467	C	G	intronic	NOS1	NaN	NaN	NaN	rs816363	NaN	0.543331	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	85.008817	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	80	45	35	34
chr12	117662746	117662746	T	T	intronic	NOS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr12	117693817	117693817	G	A	exonic	NOS1	NaN	nonsynonymous SNV	NOS1:NM_001204218:exon17:c.C2557T:p.P853S	rs11068428	NaN	0.347444	0.32	T	.	.	.	.	.	.	0.000	P	0	N	5.08	T	-1.087	T	0.000	T	0.165	1.296	10.24	5.05	1.529	2.955	11.083	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	232.648	45	NaN	NA	NA	106	69	37	11
chr12	117715649	117715649	T	C	intronic	NOS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.059555	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	115	106	9	0
chr12	117728091	117728091	T	T	intronic	NOS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	117767682	117767682	G	A	intronic	NOS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr12	117905110	117905110	A	A	intronic	KSR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	118016852	118016852	T	T	intronic	KSR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	118020115	118020115	G	A	exonic	KSR2	NaN	synonymous SNV	KSR2:NM_173598:exon6:c.C1134T:p.L378L	rs11068551	NaN	0.399161	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.53931	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	12	19	43
chr12	118033811	118033811	T	C	intronic	KSR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	118109786	118109786	G	G	intronic	KSR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	118327258	118327258	A	G	intronic	KSR2	NaN	NaN	NaN	rs76118284	NaN	0.224241	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	16	8	8	0
chr12	118405908	118405908	G	A	exonic	KSR2	NaN	synonymous SNV	KSR2:NM_173598:exon1:c.C66T:p.L22L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.190822	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	38	35	3	0
chr12	118454833	118454833	C	G	intronic	RFC5	NaN	NaN	NaN	rs2241737	NaN	0.689896	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.631132	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	8	13	45
chr12	118456825	118456825	A	G	intronic	RFC5	NaN	NaN	NaN	rs5745811	NaN	0.0990415	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	30.1363	0	NaN	NA	NA	67	26	41	9
chr12	118463259	118463259	A	T	intronic	RFC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	118509078	118509078	T	T	intronic	VSIG10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	118509157	118509157	T	C	intronic	VSIG10	NaN	NaN	NaN	rs7296643	NaN	0.682308	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.361908	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	92	76	16	41
chr12	118533650	118533650	C	T	intronic	VSIG10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	118533653	118533653	T	G	intronic	VSIG10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	118533655	118533655	T	C	intronic	VSIG10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	118619093	118619093	T	C	intronic	TAOK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	64	NaN	NA	NA	9	1	6	0
chr12	118676037	118676037	A	A	intronic	TAOK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr12	118681158	118681158	T	A	intronic	TAOK3	NaN	NaN	NaN	rs708862	NaN	0.423522	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	134.971	0	NaN	NA	NA	31	10	21	32
chr12	118848819	118848819	G	T	intronic	SUDS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.370446	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	96	87	9	0
chr12	11905290	11905290	C	T	intronic	ETV6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	16	9	7	0
chr12	119581937	119581937	G	G	intronic	SRRM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	119624936	119624936	AGG	AGA,AG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	691.479	0	NaN	NA	NA	104	0	12	5
chr12	119926731	119926731	A	C	intronic	CCDC60	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	9	4	4	0
chr12	119958079	119958079	A	A	intronic	CCDC60	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr12	119958162	119958162	G	A	intronic	CCDC60	NaN	NaN	NaN	rs574509	NaN	0.761981	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	119961447	119961447	G	A	intronic	CCDC60	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	10.9373	0	10.464474	clustered_read_position	REJECT	91	82	9	4
chr12	120118096	120118096	A	G	exonic	PRKAB1	NaN	nonsynonymous SNV	PRKAB1:NM_006253:exon7:c.A779G:p.K260R	NaN	NaN	NaN	0.05	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.31	M	.	.	0.323	D	0.587	D	0.861	5.428	35	6.08	2.333	8.962	16.644	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.823852	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	500	492	8	0
chr12	120118217	120118217	C	T	UTR3	PRKAB1	NM_006253:c.*87C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	120118218	120118218	A	C	UTR3	PRKAB1	NM_006253:c.*88A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	120118219	120118219	T	G	UTR3	PRKAB1	NM_006253:c.*89T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	120195379	120195379	A	A	intronic	CIT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	12022779	12022779	C	T	exonic	ETV6	NaN	synonymous SNV	ETV6:NM_001987:exon5:c.C885T:p.D295D	rs140005721	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	353.792	0	NaN	NA	NA	146	71	75	0
chr12	120270528	120270528	T	C	intronic	CIT	NaN	NaN	NaN	rs4767849	NaN	0.652157	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	112.404	0	NaN	NA	NA	55	30	25	49
chr12	120306992	120306992	A	G	exonic	CIT	NaN	nonsynonymous SNV	CIT:NM_001206999:exon3:c.T110C:p.F37S,CIT:NM_007174:exon3:c.T110C:p.F37S	NaN	NaN	NaN	0.51	T	0.0	B	0.0	B	0.002	N	0.968	N	1.355	L	-0.04	T	-0.996	T	0.150	T	0.134	1.740	11.78	2.38	0.172	1.332	9.786	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.410595	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	266	258	8	0
chr12	120499464	120499464	G	C	intronic	CCDC64	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	120541516	120541516	C	A	intronic	RAB35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	120569161	120569161	A	A	intronic	GCN1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr12	120572538	120572538	A	A	intronic	GCN1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr12	120575532	120575532	G	A	exonic	GCN1L1	NaN	synonymous SNV	GCN1L1:NM_006836:exon49:c.C6480T:p.T2160T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.783508	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	151	144	7	0
chr12	120580760	120580760	A	C	intronic	GCN1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	8	1	6	0
chr12	120582313	120582313	C	C	intronic	GCN1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr12	120591143	120591143	A	G	exonic	GCN1L1	NaN	synonymous SNV	GCN1L1:NM_006836:exon33:c.T3936C:p.Y1312Y	rs12312562	ID=COSM1359333;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.341853	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.534793	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	14	5	13
chr12	120593367	120593367	A	G	intronic	GCN1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.840486	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	234	227	7	0
chr12	120599669	120599669	T	T	intronic	GCN1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr12	120612966	120612966	T	G	exonic	GCN1L1	NaN	synonymous SNV	GCN1L1:NM_006836:exon12:c.A1092C:p.S364S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	120615154	120615154	TCCCCCCT	TCCCCCT,TCCCCCTC,TCCTCCCCCT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	619.455	0	NaN	NA	NA	107	0	21	8
chr12	120636549	120636549	C	A	intronic	RPLP0	NaN	NaN	NaN	rs2074540	NaN	0.326278	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	298.081	0	NaN	NA	NA	337	225	112	8
chr12	120650091	120650091	G	A	ncRNA_intronic	PXN-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.515413	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	52	46	6	1
chr12	120652691	120652691	A	G	exonic	PXN	NaN	synonymous SNV	PXN:NM_001243756:exon8:c.T1257C:p.C419C,PXN:NM_002859:exon8:c.T1113C:p.C371C,PXN:NM_025157:exon8:c.T714C:p.C238C,PXN:NM_001080855:exon9:c.T1215C:p.C405C	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.742	T	0.227	T	.	1.364	10.49	5.18	1.955	0.950	9.419	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.908641	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	167	160	7	0
chr12	120652857	120652857	C	A	intronic	PXN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.157725	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	72	60	12	0
chr12	120661936	120661936	C	G	intronic	PXN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.101787	nearby_gap_events	REJECT	41	34	7	0
chr12	120661946	120661946	C	G	intronic	PXN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.495808	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	111	102	9	0
chr12	120661947	120661947	G	C	intronic	PXN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.895059	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	111	102	9	0
chr12	120703409	120703409	C	A	intronic	PXN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.552865	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	2	0	2	0
chr12	120762703	120762703	T	T	intronic	PLA2G1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr12	120783887	120783887	T	T	intronic	MSI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	62	50	0	0
chr12	120789059	120789059	T	C	intronic	MSI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	120802653	120802653	A	A	intronic	MSI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	15	15	0	0
chr12	120884328	120884328	C	T	exonic	GATC	NaN	synonymous SNV	GATC:NM_176818:exon1:c.C45T:p.G15G	rs2235217	NaN	0.259385	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.688037	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	14	19	23
chr12	120901941	120901941	A	A	intronic	SRSF9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	21	21	0	0
chr12	120929502	120929502	T	C	ncRNA_exonic	NRAV	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	120929503	120929503	G	A	ncRNA_exonic	NRAV	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	120929505	120929505	G	C	ncRNA_exonic	NRAV	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	120934414	120934414	A	A	intronic	DYNLL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	120942641	120942641	T	C	intronic	COQ5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr12	120947788	120947788	G	C	intronic	COQ5	NaN	NaN	NaN	rs4766968	ID=COSN164381;OCCURENCE=1(NS)	0.264377	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	64.39203	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	70	41	29	24
chr12	120966659	120966659	G	A	intronic	COQ5	NaN	NaN	NaN	rs55848094	NaN	0.264577	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.777863	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	14	11	20
chr12	120972656	120972656	C	G	exonic	RNF10	NaN	nonsynonymous SNV	RNF10:NM_014868:exon1:c.C42G:p.D14E	NaN	NaN	NaN	0.48	T	0.849	P	0.222	B	0.806	N	0.865	D	0.895	L	-2.42	D	-0.449	T	0.472	T	0.238	3.252	16.91	4.49	1.256	2.960	8.638	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	120972657	120972657	A	C	exonic	RNF10	NaN	nonsynonymous SNV	RNF10:NM_014868:exon1:c.A43C:p.M15L	NaN	NaN	NaN	0.21	T	0.003	B	0.003	B	0.409	N	1.000	D	1.65	L	-2.43	D	-0.129	T	0.588	D	0.315	2.803	15.34	5.38	2.037	5.586	13.620	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	120990574	120990574	CTTTTTTTA	CTTTTTTA,CTTTTTTTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	582.804	0	NaN	NA	NA	182	46	20	0
chr12	120995332	120995332	G	A	intronic	RNF10	NaN	NaN	NaN	rs2292681	NaN	0.523363	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	95.103895	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	90	46	44	47
chr12	121001012	121001012	T	C	intronic	RNF10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	16	6	10	0
chr12	121026926	121026926	G	T	intergenic	POP5,CABP1	dist=7725;dist=51496	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	121079153	121079153	C	T	intronic	CABP1	NaN	NaN	NaN	rs117649554	NaN	0.0363419	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.547221	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	3	4	5
chr12	121088309	121088309	T	C	intronic	CABP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr12	121088525	121088525	G	T	intronic	CABP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	54	33	21	0
chr12	121094110	121094110	T	C	intronic	CABP1	NaN	NaN	NaN	rs569499	NaN	0.466054	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	55.890119	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	17	22	36
chr12	121097902	121097902	C	T	intronic	CABP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	121099071	121099071	A	A	intronic	CABP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr12	121132998	121132998	A	A	intronic	MLEC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr12	121154866	121154866	A	A	intronic	UNC119B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	121174899	121174899	T	C	exonic	ACADS	NaN	synonymous SNV	ACADS:NM_000017:exon3:c.T321C:p.R107R,ACADS:NM_001302554:exon3:c.T321C:p.R107R	rs3914	NaN	0.590655	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	60.237287	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	29	30	38
chr12	121183170	121183170	C	T	intergenic	ACADS,SPPL3	dist=5359;dist=17143	NaN	NaN	rs73227016	NaN	0.0391374	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	7	1	6	0
chr12	121206325	121206325	A	C	intronic	SPPL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	2	7	0
chr12	121206327	121206327	T	C	intronic	SPPL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr12	121220404	121220404	A	G	intronic	SPPL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	7	1	6	0
chr12	121220405	121220405	T	G	intronic	SPPL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	7	1	6	0
chr12	121432117	121432117	G	G	exonic	HNF1A	NaN	synonymous SNV	HNF1A:NM_000545:exon4:c.G864G:p.G288G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	55	45	0	0
chr12	121434319	121434319	G	C	intronic	HNF1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.697491	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	68	61	7	3
chr12	121437221	121437221	T	C	intronic	HNF1A	NaN	NaN	NaN	rs1169304	NaN	0.776957	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	-5.3	D	-0.976	T	0.000	T	0.05	2.063	12.85	-10.8	-2.680	-3.799	7.644	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.818318	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	0	18	53
chr12	121438736	121438736	T	T	intronic	HNF1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr12	121439127	121439127	A	A	UTR3	HNF1A	NM_000545:c.*132A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	15	14	0	0
chr12	121469216	121469216	T	G	intronic	OASL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	21	14	7	0
chr12	121476444	121476444	T	T	intronic	OASL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	121527685	121527685	T	C	intergenic	OASL,P2RX7	dist=50640;dist=42946	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	121605355	121605355	G	A	exonic	P2RX7	NaN	nonsynonymous SNV	P2RX7:NM_002562:exon8:c.G809A:p.R270H	rs7958311	ID=COSM147626;OCCURENCE=1(stomach)	0.255791	0.66	T	0.984	D	0.607	P	0.057	N	1.000	P	1.435	L	3.67	T	-0.972	T	0.000	T	0.466	2.343	13.79	0.975	0.124	0.757	5.665	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.016772	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	17	9	30
chr12	121666943	121666943	T	G	intronic	P2RX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.866726	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	70	63	7	0
chr12	121670395	121670395	T	C	intronic	P2RX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.868091	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	98	86	12	0
chr12	121682996	121682996	GA	G,TG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	787.231	0	NaN	NA	NA	87	0	23	20
chr12	121691061	121691061	C	T	intronic	CAMKK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	9.87128	0	7.543343	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	30	25	5	2
chr12	121693273	121693273	T	T	intronic	CAMKK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr12	121698278	121698278	T	C	intronic	CAMKK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	N	.	.	-0.78	T	-0.979	T	0.190	T	0.054	-0.103	3.495	1.61	0.238	-0.210	5.506	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	121707321	121707321	G	A	intronic	CAMKK2	NaN	NaN	NaN	rs1109453	NaN	0.283946	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	176.675	0	NaN	NA	NA	137	67	70	31
chr12	121712077	121712077	T	A	exonic	CAMKK2	NaN	nonsynonymous SNV	CAMKK2:NM_001270486:exon1:c.A253T:p.T85S,CAMKK2:NM_001270485:exon2:c.A253T:p.T85S,CAMKK2:NM_006549:exon2:c.A253T:p.T85S,CAMKK2:NM_153499:exon2:c.A253T:p.T85S,CAMKK2:NM_153500:exon2:c.A253T:p.T85S,CAMKK2:NM_172214:exon2:c.A253T:p.T85S,CAMKK2:NM_172215:exon2:c.A253T:p.T85S,CAMKK2:NM_172216:exon2:c.A253T:p.T85S,CAMKK2:NM_172226:exon2:c.A253T:p.T85S	rs3817190	ID=COSM430533,COSM1476248;OCCURENCE=1(breast)	0.411741	0.67	T	0.0	B	0.001	B	0.992	N	1.000	P	-0.345	N	2.03	T	-0.937	T	0.000	T	0.307	-1.021	0.231	-0.591	0.061	-0.775	2.735	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	162.144711	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	150	80	70	44
chr12	121773552	121773552	T	C	intronic	ANAPC5	NaN	NaN	NaN	rs3751162	NaN	0.667133	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	250.5437	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	84	0	84	58
chr12	121855166	121855166	G	G	intronic	RNF34	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	37	33	0	0
chr12	121858390	121858390	T	C	exonic	RNF34	NaN	nonsynonymous SNV	RNF34:NM_001256858:exon4:c.T161C:p.L54P,RNF34:NM_025126:exon5:c.T737C:p.L246P,RNF34:NM_194271:exon6:c.T740C:p.L247P	NaN	NaN	NaN	0.32	T	0.771	P	0.533	P	0.060	N	1.000	D	1.265	L	1.36	T	-1.097	T	0.081	T	0.664	1.901	12.31	3.61	1.124	2.025	6.045	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.042422	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	147	135	12	0
chr12	121858629	121858629	T	G	intronic	RNF34	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	121861068	121861068	T	T	intronic	RNF34	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	121861297	121861297	G	A	exonic	RNF34	NaN	nonsynonymous SNV	RNF34:NM_001256858:exon5:c.G461A:p.C154Y,RNF34:NM_025126:exon6:c.G1037A:p.C346Y,RNF34:NM_194271:exon7:c.G1040A:p.C347Y	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.87	H	-4.74	D	1.078	D	0.975	D	0.959	4.921	28.4	6.06	2.879	9.807	20.624	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.308461	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	883	872	11	0
chr12	121861407	121861407	C	A	UTR3	RNF34	NM_001256858:c.*28C>A,NM_025126:c.*28C>A,NM_194271:c.*28C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	311	96	215	0
chr12	121881452	121881452	G	T	intronic	KDM2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	17	12	5	0
chr12	121890797	121890797	T	C	intronic	KDM2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	11	4	7	0
chr12	121891087	121891087	C	T	exonic	KDM2B	NaN	nonsynonymous SNV	KDM2B:NM_001005366:exon13:c.G1702A:p.A568T,KDM2B:NM_032590:exon13:c.G1795A:p.A599T	rs368120753	NaN	NaN	0.19	T	0.957	D	0.225	B	0.000	D	1.000	D	1.245	L	2.44	T	-1.072	T	0.086	T	0.244	3.459	17.72	3.21	0.721	2.163	11.527	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.660061	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	3	9	1
chr12	121891179	121891179	G	A	intronic	KDM2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	121947633	121947633	T	C	exonic	KDM2B	NaN	nonsynonymous SNV	KDM2B:NM_001005366:exon11:c.A1291G:p.K431E,KDM2B:NM_032590:exon11:c.A1384G:p.K462E	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.189	B	0.036	B	0.509	N	1.000	D	1.445	L	2.41	T	-0.989	T	0.138	T	0.428	3.575	18.22	3.78	0.817	1.635	11.953	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.124857	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	259	248	11	0
chr12	1219668	1219668	C	G	intronic	ERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	1219669	1219669	C	T	intronic	ERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	121972415	121972415	A	G	exonic	KDM2B	NaN	nonsynonymous SNV	KDM2B:NM_001005366:exon7:c.T671C:p.F224S,KDM2B:NM_032590:exon7:c.T764C:p.F255S	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.994	D	0.952	D	0.006	N	1.000	D	2.125	M	1.97	T	0.072	D	0.507	D	0.913	3.872	19.67	5.52	2.076	6.889	15.620	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	22	13	9	1
chr12	121987258	121987258	C	A	intronic	KDM2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.296253	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	132	126	6	0
chr12	121998981	121998981	T	C	intronic	KDM2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr12	122018117	122018117	A	A	UTR5	KDM2B	NM_001005366:c.-160T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr12	122018678	122018678	C	T	intronic	KDM2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	48	30	18	0
chr12	122078909	122078909	T	T	intronic	ORAI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	122079298	122079298	G	T	exonic	ORAI1	NaN	nonsynonymous SNV	ORAI1:NM_032790:exon2:c.G661T:p.G221C	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.38	B	0.428	B	0.187	N	1.000	N	0.345	N	1.51	T	-0.985	T	0.071	T	0.472	-0.088	3.570	-6.32	-1.135	.	1.995	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	91	61	20	0
chr12	122079573	122079573	A	A	UTR3	ORAI1	NM_032790:c.*24A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	122090626	122090626	C	A	intronic	MORN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.3234	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	104	94	10	0
chr12	122090779	122090779	G	A	intronic	MORN3	NaN	NaN	NaN	rs12578883	NaN	0.0415335	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	291.519	0	NaN	NA	NA	67	19	48	1
chr12	122092147	122092147	G	T	intronic	MORN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	25	8.453666	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	1	3	0
chr12	122186413	122186413	A	T	intronic	TMEM120B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	122224409	122224409	G	T	intronic	RHOF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	122224417	122224417	G	T	intronic	RHOF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	122224418	122224418	A	C	intronic	RHOF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	122224419	122224419	G	C	intronic	RHOF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	122224420	122224420	G	T	intronic	RHOF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	122231209	122231209	T	A	intronic	RHOF	NaN	NaN	NaN	rs113086400	NaN	0.00698882	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	31.5966	0	7.070808	normal_lod	REJECT	9	4	5	1
chr12	122242987	122242987	A	AC,C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	39.5782	0	NaN	NA	NA	19	8	7	0
chr12	122252093	122252093	A	A	exonic	SETD1B	NaN	synonymous SNV	SETD1B:NM_015048:exon6:c.A1972A:p.K658K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	122257179	122257179	T	G	intronic	SETD1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	122261189	122261189	G	G	exonic	SETD1B	NaN	synonymous SNV	SETD1B:NM_015048:exon12:c.G4575G:p.R1525R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr12	122261190	122261190	A	A	exonic	SETD1B	NaN	synonymous SNV	SETD1B:NM_015048:exon12:c.A4576A:p.T1526T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	122261456	122261456	G	A	exonic	SETD1B	NaN	synonymous SNV	SETD1B:NM_015048:exon12:c.G4842A:p.A1614A	rs3741593	NaN	0.372005	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	208.268985	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	71	0	71	47
chr12	122294521	122294521	A	G	exonic	HPD	NaN	nonsynonymous SNV	HPD:NM_002150:exon5:c.T209C:p.V70A,HPD:NM_001171993:exon7:c.T92C:p.V31A	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.012	B	0.08	B	0.003	N	1.000	D	1.465	L	-0.14	T	-0.800	T	0.220	T	0.419	3.035	16.13	4.23	0.991	5.984	9.133	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.987885	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	219	213	6	0
chr12	122295437	122295437	A	A	intronic	HPD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	122296774	122296774	A	T	intronic	HPD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	8	0	6	0
chr12	122326812	122326812	T	C	exonic	PSMD9	NaN	nonsynonymous SNV	PSMD9:NM_001261400:exon1:c.T50C:p.V17A,PSMD9:NM_002813:exon1:c.T50C:p.V17A	rs2230681	NaN	0.833666	0.8	T	0.0	B	0.0	B	0.215	N	1.000	P	-1.01	N	2.4	T	-1.034	T	0.000	T	0.197	1.121	9.571	-0.448	-0.439	-0.092	9.141	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.332593	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	0	26	56
chr12	122353749	122353749	A	C	intronic	PSMD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	122380730	122380730	A	G	intronic	WDR66	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.6029	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	201	195	6	0
chr12	122391963	122391963	A	G	intronic	WDR66	NaN	NaN	NaN	rs1154513	NaN	0.871805	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1668.42	0	NaN	NA	NA	132	0	132	42
chr12	122395305	122395305	A	G	intronic	WDR66	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	122399725	122399725	T	T	intronic	WDR66	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	15	10	0	0
chr12	12240345	12240345	G	C	intronic	BCL2L14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	12240346	12240346	T	A	intronic	BCL2L14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	12240348	12240348	T	C	intronic	BCL2L14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	122406035	122406035	G	A	exonic	WDR66	NaN	nonsynonymous SNV	WDR66:NM_001178003:exon17:c.G2731A:p.G911R,WDR66:NM_144668:exon17:c.G2731A:p.G911R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.88	P	0.003	N	1.000	D	2.79	M	3.21	T	-1.101	T	0.071	T	0.361	2.867	15.55	5.19	2.420	4.439	13.066	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.211103	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	34	24	10	0
chr12	122437898	122437898	A	A	intronic	WDR66	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	122439369	122439369	T	C	intronic	WDR66	NaN	NaN	NaN	rs1182927	NaN	0.867013	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	90.805936	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	0	29	56
chr12	122468579	122468579	T	A	intronic	BCL7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	122468712	122468712	G	T	intronic	BCL7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.658631	nearby_gap_events	REJECT	80	73	7	0
chr12	1224972	1224972	A	C	intronic	ERC1	NaN	NaN	NaN	rs7973392	NaN	0.229034	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.050875	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	55	36	19	22
chr12	122501485	122501485	G	A	intergenic	BCL7A,MLXIP	dist=1535;dist=15149	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	122617989	122617989	A	G	exonic	MLXIP	NaN	nonsynonymous SNV	MLXIP:NM_014938:exon9:c.A1187G:p.E396G	rs7978353	ID=COSM430564;OCCURENCE=1(breast),1(large_intestine)	0.455871	0.59	T	0.0	B	0.001	B	0.013	N	1.000	P	.	.	2.51	T	-0.926	T	0.000	T	0.035	0.159	4.856	-0.212	-0.658	0.805	6.064	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	176.306	0	NaN	NA	NA	122	75	47	23
chr12	122618118	122618118	C	T	exonic	MLXIP	NaN	nonsynonymous SNV	MLXIP:NM_014938:exon9:c.C1316T:p.P439L	NaN	NaN	NaN	0.09	T	1.0	D	0.999	D	0.002	N	1.000	D	.	.	-2.39	D	0.609	D	0.779	D	0.153	1.958	12.50	5.23	2.437	2.866	10.045	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	8.80829	0	4.191873	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	11	9	2	0
chr12	122618292	122618292	C	A	exonic	MLXIP	NaN	nonsynonymous SNV	MLXIP:NM_014938:exon9:c.C1490A:p.P497H	NaN	NaN	NaN	0	D	0.814	P	0.503	P	0.042	N	1.000	N	.	.	-2.41	D	-0.121	T	0.635	D	0.087	1.608	11.33	3.36	0.555	2.906	10.439	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.054987	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	25	21	4	0
chr12	122667730	122667730	T	C	exonic	LRRC43	NaN	synonymous SNV	LRRC43:NM_001098519:exon1:c.T39C:p.S13S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	27	1	26	57
chr12	122667734	122667734	G	T	exonic	LRRC43	NaN	nonsynonymous SNV	LRRC43:NM_001098519:exon1:c.G43T:p.A15S	NaN	NaN	NaN	0.51	T	0.007	B	0.006	B	.	.	1.000	N	0	N	0.54	T	-1.039	T	0.056	T	0.054	0.668	7.575	-0.967	-0.227	-1.040	1.438	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	21	1	20	53
chr12	122685294	122685294	A	G	exonic	LRRC43	NaN	nonsynonymous SNV	LRRC43:NM_001098519:exon10:c.A1622G:p.E541G,LRRC43:NM_152759:exon10:c.A1067G:p.E356G	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.008	B	0.006	B	0.645	N	1.000	N	0.895	L	0.76	T	-0.970	T	0.135	T	0.108	2.071	12.88	2.3	0.755	0.230	6.122	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.7248	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	30	25	5	0
chr12	122685346	122685346	C	A	exonic	LRRC43	NaN	nonsynonymous SNV	LRRC43:NM_001098519:exon10:c.C1674A:p.D558E,LRRC43:NM_152759:exon10:c.C1119A:p.D373E	NaN	NaN	NaN	0.2	T	0.999	D	0.998	D	0.000	D	0.986	N	2.33	M	0.17	T	-0.626	T	0.407	T	0.324	3.670	18.65	2.02	0.612	-0.021	8.945	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2941176470588277	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr12	122685497	122685497	A	A	intronic	LRRC43	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	122691647	122691647	G	A	exonic	B3GNT4	NaN	nonsynonymous SNV	B3GNT4:NM_030765:exon3:c.G849A:p.M283I	NaN	NaN	NaN	0.21	T	0.669	P	0.176	B	0.000	D	0.542	N	1.125	L	1.14	T	-0.985	T	0.061	T	0.46	2.747	15.15	3.22	1.142	3.339	11.036	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.535845	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	122	114	8	0
chr12	122701002	122701002	A	T	intronic	DIABLO	NaN	NaN	NaN	rs190518526	NaN	0.00119808	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.189641	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	59	53	6	0
chr12	122702971	122702971	A	C	intronic	DIABLO	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	122717031	122717031	A	A	intronic	VPS33A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	122724344	122724344	A	A	intronic	VPS33A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	157	131	0	0
chr12	122758762	122758762	A	G	intronic	CLIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	122762593	122762593	A	C	intronic	CLIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.699879	clustered_read_position	REJECT	137	129	8	0
chr12	122794218	122794218	G	A	intronic	CLIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	122801528	122801528	G	C	intronic	CLIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	1	0
chr12	122817507	122817507	A	G	intronic	CLIP1	NaN	NaN	NaN	rs7956480	NaN	0.820687	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.8087	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	13	19	47
chr12	122818518	122818518	C	T	intronic	CLIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.00789	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	28	25	3	0
chr12	122819334	122819334	T	C	intronic	CLIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	122819337	122819337	T	A	intronic	CLIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	122862618	122862618	A	A	intronic	CLIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr12	122866316	122866316	T	T	intronic	CLIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	122958206	122958206	A	T	exonic	ZCCHC8	NaN	synonymous SNV	ZCCHC8:NM_017612:exon14:c.T1962A:p.T654T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0016376912596533294	NA	0	0	NaN	NA	NA	230	160	70	0
chr12	122967146	122967146	T	G	intronic	ZCCHC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	122967148	122967148	T	G	intronic	ZCCHC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	122991478	122991478	C	G	intronic	RSRC2	NaN	NaN	NaN	rs9988963	NaN	0.817692	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	43.6843	0	NaN	NA	NA	166	75	91	1
chr12	123002063	123002063	C	T	intronic	RSRC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.825849	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	166	160	6	0
chr12	123031304	123031304	A	T	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr12	123035847	123035847	T	T	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	18	14	0	0
chr12	123047054	123047054	T	T	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	123065103	123065103	T	C	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.904834	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	30	27	3	0
chr12	123067219	123067219	C	A	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	123067220	123067220	T	A	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	123067226	123067226	C	T	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr12	123067228	123067228	T	G	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	123067229	123067229	T	G	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	123069092	123069092	A	A	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr12	123069093	123069093	A	A	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr12	123069097	123069097	G	G	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr12	123072450	123072450	T	C	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	10	4	3	0
chr12	123072451	123072451	T	C	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr12	123072452	123072452	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	10	4	3,3	0
chr12	123072455	123072455	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	3	3,3	0
chr12	123072456	123072456	T	C	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	9	3	3	0
chr12	123089869	123089869	T	T	exonic	KNTC1	NaN	synonymous SNV	KNTC1:NM_014708:exon51:c.T5403T:p.A1801A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	39	36	0	0
chr12	123099523	123099523	T	C	intronic	KNTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.634957	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	88	83	5	0
chr12	12311664	12311664	T	G	intronic	LRP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr12	12317242	12317242	C	T	exonic	LRP6	NaN	nonsynonymous SNV	LRP6:NM_002336:exon9:c.G2017A:p.D673N	NaN	NaN	NaN	0.74	T	0.44	B	0.217	B	0.000	U	1.000	D	1.5	L	-2.77	D	0.058	D	0.627	D	0.104	3.462	17.73	5.41	2.709	7.743	19.571	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.775639	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	174	169	5	0
chr12	123200693	123200693	A	G	exonic	HCAR3	NaN	nonsynonymous SNV	HCAR3:NM_006018:exon1:c.T592C:p.F198L	rs17884481	ID=COSM1359644,COSM1359643,COSM1359645;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.463858	0.83	T	0.688	P	0.305	B	.	.	0.000	P	.	.	-0.46	T	-0.958	T	0.000	T	0.138	1.867	12.20	2.2	0.289	0.279	7.213	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	118.507	0	NaN	NA	NA	123	83	40	40
chr12	123238444	123238444	A	G	intronic	DENR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr12	123253512	123253512	A	G	intronic	DENR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.162538	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	116	99	17	0
chr12	123253513	123253513	G	T	intronic	DENR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.003649	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	117	99	18	0
chr12	123282551	123282551	G	C	intronic	CCDC62	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	123282553	123282553	T	A	intronic	CCDC62	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	123333065	123333065	C	T	exonic	HIP1R	NaN	synonymous SNV	HIP1R:NM_001303097:exon3:c.C210T:p.Y70Y,HIP1R:NM_001303099:exon3:c.C174T:p.Y58Y,HIP1R:NM_003959:exon3:c.C210T:p.Y70Y	rs2135014	ID=COSM430595;OCCURENCE=1(breast)	0.780551	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	94.185633	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	0	32	57
chr12	123339296	123339296	C	G	intronic	HIP1R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	123339297	123339297	C	T	intronic	HIP1R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	123339298	123339298	C	G	intronic	HIP1R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	123339301	123339301	A	T	intronic	HIP1R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr12	123339302	123339302	G	C	intronic	HIP1R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	123339303	123339303	G	T	intronic	HIP1R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	1	3	0
chr12	123340937	123340937	G	A	intronic	HIP1R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.648679	nearby_gap_events	REJECT	176	167	9	0
chr12	123341136	123341136	A	C	intronic	HIP1R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.620725	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	95	86	9	0
chr12	123344320	123344320	A	C	exonic	HIP1R	NaN	nonsynonymous SNV	HIP1R:NM_003959:exon24:c.A2408C:p.D803A	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.032	B	0.015	B	0.000	D	1.000	D	0.345	N	1.53	T	-1.077	T	0.045	T	0.326	3.786	19.22	5.24	1.973	7.352	13.380	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.872911	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	21	17	4	0
chr12	123344322	123344322	A	T	exonic	HIP1R	NaN	nonsynonymous SNV	HIP1R:NM_003959:exon24:c.A2410T:p.M804L	NaN	NaN	NaN	1	T	0.109	B	0.089	B	0.000	D	1.000	D	0.14	N	1.74	T	-1.066	T	0.029	T	0.712	3.784	19.21	4.07	0.806	6.180	10.936	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.16484	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	20	16	4	0
chr12	123346961	123346961	A	G	UTR3	HIP1R	NM_003959:c.*661A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	123409207	123409207	T	C	UTR3	ABCB9	NM_203444:c.*139A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.85024	0	NaN	NA	NA	12	10	2	0
chr12	123414288	123414288	T	T	UTR3	ABCB9	NM_019624:c.*170A>A,NM_019625:c.*170A>A,NM_001243013:c.*170A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	123414388	123414388	G	C	UTR3	ABCB9	NM_019624:c.*70C>G,NM_019625:c.*70C>G,NM_001243013:c.*70C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	25	17	8	0
chr12	123414390	123414390	C	C	UTR3	ABCB9	NM_019624:c.*68G>G,NM_019625:c.*68G>G,NM_001243013:c.*68G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	54	45	0	0
chr12	123414391	123414391	T	T	UTR3	ABCB9	NM_019624:c.*67A>A,NM_019625:c.*67A>A,NM_001243013:c.*67A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	54	44	0	0
chr12	123424810	123424810	G	T	exonic	ABCB9	NaN	nonsynonymous SNV	ABCB9:NM_001243013:exon8:c.C1402A:p.P468T,ABCB9:NM_019624:exon8:c.C1462A:p.P488T,ABCB9:NM_001243014:exon9:c.C1591A:p.P531T,ABCB9:NM_019625:exon9:c.C1591A:p.P531T,ABCB9:NM_203444:exon9:c.C1591A:p.P531T	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.988	D	0.000	D	1.000	D	2.425	M	-3.33	D	0.978	D	0.890	D	0.868	3.881	19.73	4.96	2.585	9.657	18.389	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.802881	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	131	125	6	0
chr12	123435152	123435152	G	G	intronic	ABCB9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	52	48	0	0
chr12	123465068	123465068	A	G	exonic	ARL6IP4	NaN	nonsynonymous SNV	ARL6IP4:NM_001002251:exon1:c.A317G:p.D106G,ARL6IP4:NM_001002252:exon1:c.A317G:p.D106G,ARL6IP4:NM_001278378:exon1:c.A317G:p.D106G,ARL6IP4:NM_016638:exon1:c.A317G:p.D106G,ARL6IP4:NM_018694:exon1:c.A317G:p.D106G	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.006	B	0.001	B	.	.	1.000	N	0	N	1.92	T	-1.017	T	0.023	T	0.452	2.380	13.92	-3.92	-0.927	0.159	0.248	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.08615384615384619	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr12	123466614	123466614	C	A	exonic	ARL6IP4	NaN	nonsynonymous SNV	ARL6IP4:NM_001002251:exon4:c.C1108A:p.R370S,ARL6IP4:NM_001002252:exon4:c.C1075A:p.R359S,ARL6IP4:NM_001278378:exon4:c.C964A:p.R322S,ARL6IP4:NM_001278379:exon4:c.C715A:p.R239S,ARL6IP4:NM_001278380:exon4:c.C547A:p.R183S,ARL6IP4:NM_016638:exon4:c.C1075A:p.R359S,ARL6IP4:NM_018694:exon4:c.C1132A:p.R378S	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.685	M	-0.17	T	-0.058	T	0.444	T	0.971	2.860	15.53	4.41	1.211	2.194	12.489	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.942906	nearby_gap_events	REJECT	73	61	12	0
chr12	123470586	123470586	C	T	exonic	PITPNM2	NaN	synonymous SNV	PITPNM2:NM_001300801:exon25:c.G4020A:p.A1340A,PITPNM2:NM_020845:exon25:c.G4038A:p.A1346A	rs12828755	NaN	0.128594	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.357994	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	3
chr12	123471094	123471094	G	A	exonic	PITPNM2	NaN	synonymous SNV	PITPNM2:NM_001300801:exon24:c.C3597T:p.H1199H,PITPNM2:NM_020845:exon24:c.C3615T:p.H1205H	rs12811109	ID=COSM1359710;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.122404	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	251.15731	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	85	1	84	23
chr12	123471402	123471402	T	C	intronic	PITPNM2	NaN	NaN	NaN	rs2049506	NaN	0.996206	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.617415	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	43
chr12	123473019	123473019	A	A	intronic	PITPNM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	123473651	123473651	T	A	intronic	PITPNM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	123476940	123476940	T	T	intronic	PITPNM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	123485833	123485833	A	C	intronic	PITPNM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	84	NaN	NA	NA	22	8	14	0
chr12	123488956	123488956	A	C	exonic	PITPNM2	NaN	nonsynonymous SNV	PITPNM2:NM_001300801:exon7:c.T1033G:p.F345V,PITPNM2:NM_020845:exon7:c.T1033G:p.F345V	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.971	D	0.831	P	0.000	D	1.000	D	2.64	M	2.3	T	0.024	D	0.455	T	0.66	3.619	18.42	4.85	1.945	9.302	14.729	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.688622	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	73	58	15	0
chr12	123488957	123488957	C	T	exonic	PITPNM2	NaN	synonymous SNV	PITPNM2:NM_001300801:exon7:c.G1032A:p.E344E,PITPNM2:NM_020845:exon7:c.G1032A:p.E344E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.581407	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	73	58	15	0
chr12	123488958	123488958	T	C	exonic	PITPNM2	NaN	nonsynonymous SNV	PITPNM2:NM_001300801:exon7:c.A1031G:p.E344G,PITPNM2:NM_020845:exon7:c.A1031G:p.E344G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.66	M	1.98	T	0.339	D	0.599	D	0.8	4.240	22.1	4.85	1.945	8.008	14.729	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.208689	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	73	58	15	0
chr12	123489075	123489075	G	C	intronic	PITPNM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr12	123494356	123494356	G	T	intronic	PITPNM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.53132	nearby_gap_events	REJECT	86	77	9	0
chr12	123504532	123504532	T	T	intronic	PITPNM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	123583980	123583980	G	C	intronic	PITPNM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	123646820	123646820	A	A	intronic	MPHOSPH9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr12	123651365	123651365	T	G	intronic	MPHOSPH9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	123746415	123746415	A	A	intronic	CDK2AP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr12	123751192	123751192	C	T	intronic	CDK2AP1	NaN	NaN	NaN	rs115403924	NaN	0.0299521	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	123782705	123782705	T	G	exonic	SBNO1	NaN	nonsynonymous SNV	SBNO1:NM_001167856:exon30:c.A3859C:p.K1287Q,SBNO1:NM_018183:exon30:c.A3856C:p.K1286Q	NaN	NaN	NaN	0.37	T	0.999	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	2.345	M	-1.73	D	0.281	D	0.693	D	0.679	4.783	26.9	6.03	2.322	7.991	16.613	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.281076	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	142	130	12	0
chr12	123825559	123825559	C	T	exonic	SBNO1	NaN	synonymous SNV	SBNO1:NM_001167856:exon4:c.G627A:p.K209K,SBNO1:NM_018183:exon4:c.G624A:p.K208K	rs12322888	NaN	0.245407	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	143.474895	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	0	46	21
chr12	123829712	123829712	C	A	intronic	SBNO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	123829714	123829714	G	C	intronic	SBNO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	123829715	123829715	T	A	intronic	SBNO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	123829716	123829716	T	G	intronic	SBNO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	3	4	0
chr12	123832714	123832714	A	G	intronic	SBNO1	NaN	NaN	NaN	rs112452549	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	315	58	256	13
chr12	123950059	123950059	T	G	intronic	SNRNP35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr12	123957306	123957306	A	A	intronic	RILPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr12	123983319	123983319	A	G	intronic	RILPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	4	4	0
chr12	124011367	124011367	T	G	intronic	RILPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	124075010	124075010	G	A	intronic	TMED2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.331724	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	214	209	5	0
chr12	124075055	124075055	A	A	intronic	TMED2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	124086617	124086617	T	A	upstream	DDX55	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	124090425	124090425	A	G	intronic	DDX55	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.768432	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	384	375	9	0
chr12	124111785	124111785	A	G	intronic	EIF2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	9	3	5	0
chr12	124118284	124118284	T	A	UTR5	EIF2B1	NM_001414:c.-180A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	11	3	7	0
chr12	124139394	124139394	T	C	intronic	GTF2H3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	2	3	0
chr12	124171229	124171229	T	T	intronic	TCTN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	124179499	124179499	G	T	exonic	TCTN2	NaN	nonsynonymous SNV	TCTN2:NM_001143850:exon10:c.G1207T:p.A403S,TCTN2:NM_024809:exon10:c.G1210T:p.A404S	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.996	D	0.946	D	0.000	D	0.995	D	2.43	M	-1.71	D	0.411	D	0.712	D	0.516	4.842	27.6	5.46	2.575	6.232	19.372	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	9.600130882855503E-5	NA	0	0	NaN	NA	NA	225	167	58	0
chr12	124179695	124179695	A	T	intronic	TCTN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr12	124209352	124209352	C	T	intronic	ATP6V0A2	NaN	NaN	NaN	rs11837144	NaN	0.7498	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	135.506166	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	0	50	48
chr12	124226839	124226839	T	T	intronic	ATP6V0A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	124226840	124226840	T	T	intronic	ATP6V0A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	124228373	124228373	C	C	exonic	ATP6V0A2	NaN	synonymous SNV	ATP6V0A2:NM_012463:exon10:c.C1080C:p.I360I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	101	NaN	NA	NA	612	488	0	0
chr12	124229429	124229429	T	C	exonic	ATP6V0A2	NaN	synonymous SNV	ATP6V0A2:NM_012463:exon13:c.T1515C:p.N505N	rs7135542	ID=COSM1127520;OCCURENCE=1(prostate)	0.799521	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	355.910823	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	117	0	117	50
chr12	124265584	124265584	A	G	intronic	DNAH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.737255	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	51	44	7	1
chr12	124265687	124265687	T	C	exonic	DNAH10	NaN	nonsynonymous SNV	DNAH10:NM_207437:exon6:c.T499C:p.S167P	rs11057353	NaN	0.713259	0.34	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	0.345	N	1.93	T	-1.004	T	0.000	T	0.025	1.095	9.468	-10.6	-2.568	-2.199	15.110	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.0003	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	38	19	47
chr12	124268386	124268386	G	C	intronic	DNAH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	124268391	124268391	A	T	intronic	DNAH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	124272418	124272418	G	A	exonic	DNAH10	NaN	nonsynonymous SNV	DNAH10:NM_207437:exon10:c.G1306A:p.A436T	NaN	NaN	NaN	0.99	T	0.001	B	0.005	B	0.026	N	0.999	N	-0.48	N	0.51	T	-1.016	T	0.058	T	0.154	-0.048	3.771	2.09	0.143	1.423	13.854	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.026133	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	52	45	7	1
chr12	124274688	124274688	A	G	intronic	DNAH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr12	124337709	124337709	T	G	intronic	DNAH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	124337711	124337711	T	C	intronic	DNAH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	9	1	8	0
chr12	124341806	124341806	A	A	intronic	DNAH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr12	124363777	124363777	T	C	intronic	DNAH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.379538	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	393	378	15	0
chr12	124364152	124364152	T	T	intronic	DNAH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	124366150	124366150	C	C	intronic	DNAH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	124371846	124371846	A	G	exonic	DNAH10	NaN	nonsynonymous SNV	DNAH10:NM_207437:exon51:c.A8627G:p.N2876S	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.999	D	0.992	D	0.000	U	1.000	D	1.83	L	1.0	T	-0.674	T	0.227	T	0.182	4.658	25.6	5.02	2.103	9.139	14.888	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.724107	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	253	247	6	0
chr12	124382641	124382641	A	A	intronic	DNAH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	16	11	0	0
chr12	124393718	124393718	T	T	intronic	DNAH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	18	15	0	0
chr12	124403011	124403011	T	A	intronic	DNAH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	124403156	124403156	T	C	intronic	DNAH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	104	99	5	0
chr12	124749683	124749683	G	A	intronic	ZNF664-FAM101A	NaN	NaN	NaN	rs10846641	NaN	0.207668	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	124796066	124796066	T	C	intronic	FAM101A,ZNF664-FAM101A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr12	124796455	124796455	A	G	exonic	FAM101A,ZNF664-FAM101A	NaN	nonsynonymous SNV	FAM101A:NM_181709:exon2:c.A56G:p.E19G,ZNF664-FAM101A:NM_001204299:exon4:c.A56G:p.E19G	NaN	NaN	NaN	0.24	T	0.206	B	0.085	B	0.008	N	0.643	N	2.015	M	.	.	-0.899	T	0.141	T	0.398	2.082	12.92	2.24	0.146	4.985	8.571	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	12
chr12	124809879	124809879	T	C	UTR3	NCOR2	NM_006312:c.*69A>G,NM_001206654:c.*69A>G,NM_001077261:c.*69A>G	NaN	NaN	rs77571124	NaN	0.236022	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	23.3317	0	6.932346	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	3	3	15
chr12	124810847	124810847	A	G	exonic	NCOR2	NaN	nonsynonymous SNV	NCOR2:NM_001077261:exon47:c.T7085C:p.L2362P,NCOR2:NM_001206654:exon47:c.T7223C:p.L2408P,NCOR2:NM_006312:exon48:c.T7253C:p.L2418P	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	1.78	L	2.35	T	-0.730	T	0.234	T	0.561	2.477	14.24	4.68	1.735	2.809	9.526	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.515677	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	179	173	6	0
chr12	124821454	124821454	C	A	exonic	NCOR2	NaN	nonsynonymous SNV	NCOR2:NM_001077261:exon39:c.G5930T:p.G1977V,NCOR2:NM_001206654:exon39:c.G5930T:p.G1977V,NCOR2:NM_006312:exon40:c.G5960T:p.G1987V	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.998	D	0.905	P	0.004	U	0.994	D	0.805	L	2.5	T	-1.085	T	0.067	T	0.092	1.816	12.03	4.29	1.928	3.890	16.759	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	24	10	14	2
chr12	124825250	124825250	G	T	exonic	NCOR2	NaN	nonsynonymous SNV	NCOR2:NM_001077261:exon36:c.C5206A:p.P1736T,NCOR2:NM_001206654:exon36:c.C5206A:p.P1736T,NCOR2:NM_006312:exon37:c.C5236A:p.P1746T	NaN	NaN	NaN	0.33	T	1.0	D	0.996	D	0.000	U	0.998	D	1.01	L	0.99	T	-0.909	T	0.172	T	0.611	2.682	14.93	4.13	1.854	8.787	16.374	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.586811	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	42	38	4	0
chr12	124827656	124827656	A	G	exonic	NCOR2	NaN	nonsynonymous SNV	NCOR2:NM_001077261:exon34:c.T4801C:p.Y1601H,NCOR2:NM_001206654:exon34:c.T4801C:p.Y1601H,NCOR2:NM_006312:exon35:c.T4831C:p.Y1611H	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	1.87	L	0.95	T	-0.627	T	0.234	T	0.831	3.125	16.44	5.27	1.975	8.415	15.188	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.234956	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	107	97	10	0
chr12	124832606	124832606	A	G	intronic	NCOR2	NaN	NaN	NaN	rs1244063	NaN	0.765775	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.674095	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	32
chr12	124840068	124840068	C	A	exonic	NCOR2	NaN	synonymous SNV	NCOR2:NM_001077261:exon25:c.G3261T:p.P1087P,NCOR2:NM_001206654:exon25:c.G3261T:p.P1087P,NCOR2:NM_006312:exon26:c.G3291T:p.P1097P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.865828	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	29	25	4	0
chr12	124840106	124840106	G	C	exonic	NCOR2	NaN	nonsynonymous SNV	NCOR2:NM_001077261:exon25:c.C3223G:p.P1075A,NCOR2:NM_001206654:exon25:c.C3223G:p.P1075A,NCOR2:NM_006312:exon26:c.C3253G:p.P1085A	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.936	P	0.64	P	0.068	N	0.999	N	1.43	L	2.44	T	-1.034	T	0.092	T	0.269	1.969	12.54	-0.098	0.063	2.288	7.754	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.22365	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	132	118	14	0
chr12	124841368	124841368	G	T	intronic	NCOR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.374165	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	43	39	4	0
chr12	12484609	12484609	A	G	intronic	MANSC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	124848137	124848137	T	C	intronic	NCOR2	NaN	NaN	NaN	rs1794956	NaN	0.922724	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	213.232	0	NaN	NA	NA	25	1	24	57
chr12	124858938	124858938	G	C	intronic	NCOR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.5396	0	NaN	NA	NA	22	17	5	4
chr12	124859135	124859135	G	G	intronic	NCOR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	124870311	124870311	G	C	exonic	NCOR2	NaN	nonsynonymous SNV	NCOR2:NM_001077261:exon19:c.C1996G:p.Q666E,NCOR2:NM_001206654:exon19:c.C1996G:p.Q666E,NCOR2:NM_006312:exon19:c.C1999G:p.Q667E	NaN	NaN	NaN	0	D	0.99	D	0.979	D	0.000	U	1.000	D	1.7	L	2.0	T	-0.516	T	0.263	T	0.369	2.678	14.92	4.56	2.089	7.774	17.332	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.116201	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	248	240	8	0
chr12	124930127	124930127	C	G	intronic	NCOR2	NaN	NaN	NaN	rs12231617	NaN	0.134385	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr12	124932893	124932893	A	G	intronic	NCOR2	NaN	NaN	NaN	rs4765567	NaN	0.132388	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	16	8	7	0
chr12	124953788	124953788	A	C	intronic	NCOR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	15	10	5	0
chr12	125263034	125263034	C	C	exonic	SCARB1	NaN	synonymous SNV	SCARB1:NM_001082959:exon12:c.G1500G:p.Q500Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	56	51	0	0
chr12	125270845	125270845	T	C	intronic	SCARB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	1	T	0.038	B	0.011	B	.	.	1.000	N	.	.	0.09	T	-1.020	T	0.068	T	0.199	1.235	10.02	-1.55	-0.598	0.105	2.554	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	13	2	11	0
chr12	125295028	125295028	C	T	intronic	SCARB1	NaN	NaN	NaN	rs61762481	NaN	0.0670927	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	125299688	125299688	C	G	intronic	SCARB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.556729	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	58	43	15	0
chr12	125299693	125299693	C	C	intronic	SCARB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	51	47	0	0
chr12	125299830	125299830	C	T	intronic	SCARB1	NaN	NaN	NaN	rs4765615	NaN	0.439896	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	153.636	0	79.754271	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	64	31	33	38
chr12	125396833	125396833	G	A	exonic	UBC	NaN	synonymous SNV	UBC:NM_021009:exon2:c.C1485T:p.D495D	rs112961078	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.20928	0	NaN	NA	NA	17	14	3	10
chr12	125396902	125396902	T	C	exonic	UBC	NaN	synonymous SNV	UBC:NM_021009:exon2:c.A1416G:p.E472E	rs17840840	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	35.2695	0	NaN	NA	NA	14	8	6	1
chr12	125434487	125434487	T	T	intronic	DHX37	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	125449611	125449611	G	A	intronic	DHX37	NaN	NaN	NaN	rs149607258	NaN	0.0103834	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	53.973689	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	55	31	24	3
chr12	125451487	125451487	C	T	intronic	DHX37	NaN	NaN	NaN	rs35364982	NaN	0.272364	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	113.23825	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	2	40	18
chr12	125453439	125453439	A	C	exonic	DHX37	NaN	nonsynonymous SNV	DHX37:NM_032656:exon9:c.T1267G:p.F423V	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.98	D	0.000	D	1.000	D	3.495	M	2.09	T	-0.524	T	0.194	T	0.827	3.160	16.57	4.6	1.836	8.426	13.945	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.427891	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	156	151	5	0
chr12	125455773	125455773	A	A	intronic	DHX37	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	125455774	125455774	G	G	intronic	DHX37	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	125456004	125456004	C	A	intronic	DHX37	NaN	NaN	NaN	rs4542508	NaN	0.722644	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	99.064747	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	77	36	41	50
chr12	125457029	125457029	A	G	intronic	DHX37	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.871287	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	111	106	5	0
chr12	125457203	125457203	G	A	intronic	DHX37	NaN	NaN	NaN	rs7304979	NaN	0.172724	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	307.538	0	NaN	NA	NA	62	16	46	21
chr12	125470839	125470839	A	A	intronic	DHX37	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr12	125473582	125473582	G	A	UTR5	DHX37	NM_032656:c.-14C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.500353	nearby_gap_events	REJECT	19	14	5	0
chr12	125509502	125509502	C	T	intronic	BRI3BP	NaN	NaN	NaN	rs7303493	NaN	0.466054	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.784188	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	6	13	36
chr12	125572485	125572485	T	C	intronic	AACS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	125582327	125582327	C	C	intronic	AACS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	125621050	125621050	T	C	intronic	AACS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr12	125626590	125626590	C	T	intronic	AACS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.143312	clustered_read_position	REJECT	68	58	10	0
chr12	125780136	125780136	G	C	intergenic	AACS,TMEM132B	dist=152265;dist=31026	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	125834395	125834395	T	C	exonic	TMEM132B	NaN	synonymous SNV	TMEM132B:NM_052907:exon2:c.T450C:p.S150S	rs3803155	NaN	0.661142	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	288.936038	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	97	0	97	54
chr12	126004178	126004178	A	A	intronic	TMEM132B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr12	126004180	126004180	T	G	intronic	TMEM132B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr12	12629862	12629862	T	C	exonic	DUSP16	NaN	nonsynonymous SNV	DUSP16:NM_030640:exon7:c.A1903G:p.S635G	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.001	B	0.020	N	1.000	D	-0.395	N	5.02	T	-0.816	T	0.003	T	0.044	-0.654	1.126	-1.49	-0.341	1.510	10.606	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.778941	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	345	338	7	0
chr12	126541276	126541276	C	C	intergenic	LINC00939,LOC101927464	dist=73356;dist=39262	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	126590795	126590795	A	G	intergenic	LOC101927464,LOC100128554	dist=2317;dist=336232	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	128318199	128318199	C	T	intergenic	LOC101927637,FLJ37505	dist=197187;dist=47963	NaN	NaN	rs10744326	NaN	0.379792	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	128882404	128882404	C	T	intronic	TMEM132C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	129028688	129028688	T	G	intronic	TMEM132C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	57.336	0	NaN	NA	NA	34	18	16	3
chr12	129178357	129178357	T	T	intronic	TMEM132C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr12	129178591	129178591	A	A	intronic	TMEM132C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	129181834	129181834	A	G	exonic	TMEM132C	NaN	synonymous SNV	TMEM132C:NM_001136103:exon8:c.A1995G:p.V665V	rs902060	NaN	0.984824	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	256.403172	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	87	0	87	57
chr12	129293346	129293346	C	T	exonic	SLC15A4	NaN	synonymous SNV	SLC15A4:NM_145648:exon5:c.G1245A:p.S415S	rs11059924	NaN	0.467053	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	147.605995	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	123	60	63	44
chr12	12940602	12940602	C	T	UTR3	APOLD1	NM_001130415:c.*16C>T,NM_030817:c.*16C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.649288	clustered_read_position	REJECT	110	102	8	0
chr12	129433032	129433032	C	T	intronic	GLT1D1	NaN	NaN	NaN	rs7303011	NaN	0.217452	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr12	129433088	129433088	T	A	intronic	GLT1D1	NaN	NaN	NaN	rs7312893	NaN	0.391174	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr12	129467669	129467669	A	C	UTR3	GLT1D1	NM_144669:c.*34A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	17	12	5	0
chr12	129467672	129467672	C	G	UTR3	GLT1D1	NM_144669:c.*37C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	17	11	5	0
chr12	129467675	129467675	C	G	UTR3	GLT1D1	NM_144669:c.*40C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	16	11	5	0
chr12	129559614	129559614	A	G	intronic	TMEM132D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	129559617	129559617	A	G	intronic	TMEM132D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	129559619	129559619	A	C	intronic	TMEM132D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	129559621	129559621	G	T	intronic	TMEM132D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	129559622	129559622	T	C	intronic	TMEM132D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	129569123	129569123	C	T	exonic	TMEM132D	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM132D:NM_133448:exon6:c.G1568A:p.R523Q	rs369239393	ID=COSM936934;OCCURENCE=1(endometrium)	NaN	.	.	0.804	P	0.304	B	0.000	N	1.000	D	2.865	M	2.48	T	-1.062	T	0.055	T	0.348	3.242	16.87	3.9	0.998	3.205	12.864	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	1.003180067619651E-9	Somatic	188.574	55	220.17336	nearby_gap_events	REJECT	492	373	119	0
chr12	12966258	12966258	G	C	upstream	DDX47	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr12	12966259	12966259	C	G	upstream	DDX47	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr12	129694024	129694024	T	G	ncRNA_intronic	LOC101927735	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	129694258	129694258	A	A	ncRNA_exonic	LOC101927735	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	129870447	129870447	C	C	intronic	TMEM132D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	130015691	130015691	C	T	exonic	TMEM132D	NaN	stopgain	TMEM132D:NM_133448:exon3:c.G1028A:p.W343X	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	0.001	N	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	7.316	39	5.09	2.371	4.706	16.685	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.080224	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	267	261	6	0
chr12	130627805	130627805	G	A	intergenic	LOC100190940,FZD10-AS1	dist=100918;dist=8333	NaN	NaN	rs10848017	NaN	0.383387	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	130647709	130647709	G	C	exonic	FZD10	NaN	synonymous SNV	FZD10:NM_007197:exon1:c.G222C:p.L74L	rs10848026	NaN	0.320088	0	D	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-0.922	T	0.000	T	.	1.093	9.459	0.030	-0.345	1.702	9.756	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.287216	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	38	22	23
chr12	130649268	130649268	A	A	UTR3	FZD10	NM_007197:c.*35A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr12	130668393	130668393	G	T	intergenic	FZD10,PIWIL1	dist=18108;dist=154040	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	130785926	130785926	G	T	intergenic	FZD10,PIWIL1	dist=135641;dist=36507	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	130818237	130818237	A	C	intergenic	FZD10,PIWIL1	dist=167952;dist=4196	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	130818238	130818238	C	T	intergenic	FZD10,PIWIL1	dist=167953;dist=4195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	130818239	130818239	A	G	intergenic	FZD10,PIWIL1	dist=167954;dist=4194	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	130840216	130840216	A	G	intronic	PIWIL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.89498	0	NaN	NA	NA	11	9	2	0
chr12	130840319	130840319	G	C	intronic	PIWIL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	5	0	3	0
chr12	130840320	130840320	T	C	intronic	PIWIL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	130840321	130840321	A	C	intronic	PIWIL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr12	130840323	130840323	G	T	intronic	PIWIL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	130847132	130847132	T	C	intronic	PIWIL1	NaN	NaN	NaN	rs2242364	NaN	0.420927	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	178.088365	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	170	88	82	51
chr12	130892231	130892231	G	A	intronic	RIMBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.232385	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	62	59	3	0
chr12	130922870	130922870	G	A	intronic	RIMBP2	NaN	NaN	NaN	rs2292665	NaN	0.158546	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.228556	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	1	9	6
chr12	130935033	130935033	C	C	intronic	RIMBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr12	130963740	130963740	A	A	intronic	RIMBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	131045074	131045074	C	G	intergenic	RIMBP2,STX2	dist=42664;dist=229071	NaN	NaN	rs34322552	NaN	0.171725	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	131285596	131285596	A	G	intronic	STX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	131285597	131285597	A	G	intronic	STX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	131285601	131285601	C	T	intronic	STX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	131285602	131285602	A	G	intronic	STX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	131285603	131285603	G	A	intronic	STX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	131285606	131285606	T	C	intronic	STX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	7	2	3	0
chr12	131314167	131314167	G	C	intronic	STX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	131357151	131357151	G	A	exonic	RAN	NaN	nonsynonymous SNV	RAN:NM_006325:exon2:c.G13A:p.G5R	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.01	B	0.005	B	0.065	U	1.000	D	0.55	N	-0.41	T	-0.833	T	0.183	T	0.337	3.328	17.20	2.87	1.289	4.457	10.698	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.700588	clustered_read_position	REJECT	30	26	4	0
chr12	131357157	131357157	C	A	exonic	RAN	NaN	nonsynonymous SNV	RAN:NM_006325:exon2:c.C19A:p.P7T	NaN	NaN	NaN	0.58	T	0.0	B	0.001	B	0.000	U	1.000	D	0.79	N	-1.35	T	-0.792	T	0.270	T	0.286	2.277	13.57	2.87	1.289	3.530	10.698	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.279605	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	26	22	4	0
chr12	131479443	131479443	A	G	intronic	ADGRD1	NaN	NaN	NaN	rs4759820	NaN	0.40635	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	24	17	7	0
chr12	131487908	131487908	A	G	intronic	ADGRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	131498923	131498923	A	G	intronic	ADGRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	4	4	0
chr12	131569338	131569338	A	A	intronic	ADGRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	131582585	131582585	C	T	intronic	ADGRD1	NaN	NaN	NaN	rs78285193	NaN	0.25639	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	131590214	131590214	T	T	intronic	ADGRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	131605542	131605542	G	C	intronic	ADGRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr12	131605543	131605543	C	G	intronic	ADGRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	64	60	4	0
chr12	131621664	131621664	A	A	intronic	ADGRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	131622790	131622790	A	A	intronic	ADGRD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	131623887	131623887	A	A	UTR3	ADGRD1	NM_198827:c.*79A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	131735888	131735888	T	C	intergenic	LINC01257,LOC338797	dist=38412;dist=96127	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	131736494	131736494	C	C	intergenic	LINC01257,LOC338797	dist=39018;dist=95521	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr12	131736596	131736596	G	T	intergenic	LINC01257,LOC338797	dist=39120;dist=95419	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	131848711	131848711	C	C	ncRNA_intronic	LOC338797	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	63	49	0	0
chr12	131852974	131852974	A	T	downstream	LOC338797	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	131913035	131913035	A	G	intergenic	LOC338797,SFSWAP	dist=60935;dist=282597	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	13	8	5	0
chr12	132096377	132096377	T	G	intergenic	LOC338797,SFSWAP	dist=244277;dist=99255	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	132106463	132106463	G	A	intergenic	LOC338797,SFSWAP	dist=254363;dist=89169	NaN	NaN	rs58833501	NaN	0.13139	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr12	132195674	132195674	A	C	UTR5	SFSWAP	NM_001261411:c.-101A>C,NM_004592:c.-101A>C	NaN	NaN	rs7134849	NaN	0.894369	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.038126	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	0	10	46
chr12	13220183	13220183	G	T	exonic	KIAA1467	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA1467:NM_020853:exon7:c.G1095T:p.W365C	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	2.24	M	1.05	T	-0.535	T	0.273	T	0.873	3.904	19.85	5.44	2.545	6.257	17.463	100	11	3035	SNV	VTsM	3	Somatic	1.7767046898879763E-12	Somatic	81.119	0	128.364283	nearby_gap_events	REJECT	334	264	70	0
chr12	132209932	132209932	ATGTGTGT	ATGTG,ATGTGT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	370.537	0	NaN	NA	NA	170	85	22	15
chr12	132213234	132213234	T	G	intronic	SFSWAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	132238886	132238886	G	A	intronic	SFSWAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.778323	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	82	73	9	0
chr12	132310962	132310962	A	C	intergenic	SFSWAP,MMP17	dist=26679;dist=1979	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	132380006	132380006	T	A	intronic	ULK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr12	132390201	132390201	G	T	intronic	ULK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	132396603	132396603	C	T	exonic	ULK1	NaN	synonymous SNV	ULK1:NM_003565:exon13:c.C1065T:p.D355D	rs11616018	ID=COSM430751;OCCURENCE=1(breast)	0.551717	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	215.560709	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	74	0	74	58
chr12	132399671	132399671	T	C	exonic	ULK1	NaN	nonsynonymous SNV	ULK1:NM_003565:exon17:c.T1417C:p.F473L	NaN	NaN	NaN	0.52	T	0.0	B	0.001	B	0.000	D	1.000	D	2.045	M	1.13	T	-1.025	T	0.104	T	0.355	2.099	12.98	4.36	1.831	4.641	11.434	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	216	78	138	0
chr12	132401035	132401035	A	G	exonic	ULK1	NaN	synonymous SNV	ULK1:NM_003565:exon20:c.A1971G:p.R657R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.863012	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	243	223	20	0
chr12	132401617	132401617	T	T	intronic	ULK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	132404094	132404094	T	T	exonic	ULK1	NaN	synonymous SNV	ULK1:NM_003565:exon25:c.T2762T:p.I921I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	15	15	0	0
chr12	132404259	132404259	C	T	intronic	ULK1	NaN	NaN	NaN	rs7296365	NaN	0.959465	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	85.153157	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	1	34	58
chr12	132416912	132416912	A	A	intronic	PUS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr12	132429649	132429649	G	A	intergenic	PUS1,EP400	dist=1243;dist=4816	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	132471251	132471251	G	A	exonic	EP400	NaN	nonsynonymous SNV	EP400:NM_015409:exon6:c.G2122A:p.G708R	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.085	M	-2.62	D	0.810	D	0.840	D	0.834	1.846	12.13	5.71	2.691	4.105	19.871	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.686148	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	300	271	29	0
chr12	132490875	132490875	A	A	intronic	EP400	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	132495977	132495977	C	T	intronic	EP400	NaN	NaN	NaN	rs146586649	NaN	0.000798722	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.664112	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	63	28	35	2
chr12	132514530	132514530	C	T	intronic	EP400	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.718713	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	373	365	8	0
chr12	132522079	132522079	G	A	intronic	EP400	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	132522081	132522081	C	A	intronic	EP400	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	132522082	132522082	T	A	intronic	EP400	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	132530132	132530132	C	T	intronic	EP400	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.619356	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	196	183	13	0
chr12	132530520	132530520	A	A	intronic	EP400	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	132534834	132534834	T	T	intronic	EP400	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr12	132549368	132549368	G	C	exonic	EP400	NaN	synonymous SNV	EP400:NM_015409:exon48:c.G8490C:p.T2830T	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.400731	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	16	13	3	0
chr12	132561828	132561828	T	C	intronic	EP400	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.066663	nearby_gap_events	REJECT	68	61	7	0
chr12	132562100	132562100	G	C	exonic	EP400	NaN	nonsynonymous SNV	EP400:NM_015409:exon53:c.G9254C:p.G3085A	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.891	P	0.487	P	0.000	D	1.000	D	0.895	L	-2.69	D	0.481	D	0.611	D	0.766	1.558	11.16	5.62	2.642	4.482	12.938	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	22.4838	42	16.255854	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	35	27	8	15
chr12	132562107	132562107	C	T	exonic	EP400	NaN	synonymous SNV	EP400:NM_015409:exon53:c.C9261T:p.P3087P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.111508	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	33	28	5	0
chr12	132625023	132625023	C	T	exonic	DDX51	NaN	nonsynonymous SNV	DDX51:NM_175066:exon11:c.G1618A:p.G540R	NaN	NaN	NaN	0.67	T	0.164	B	0.038	B	0.046	N	1.000	N	-0.28	N	-0.86	T	-0.996	T	0.132	T	0.175	-0.978	0.294	2.28	0.184	0.250	7.336	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.724448	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	191	184	7	0
chr12	132630020	132630020	T	C	intronic	NOC4L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	1	1	0
chr12	132703302	132703302	G	G	intronic	GALNT9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	132824450	132824450	G	T	intronic	GALNT9	NaN	NaN	NaN	rs73166888	NaN	0.154153	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	68	48	20	12
chr12	132828894	132828894	G	T	intronic	GALNT9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	132828895	132828895	C	T	intronic	GALNT9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	132837475	132837475	A	A	intronic	GALNT9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	13	10	0	0
chr12	132862976	132862976	G	A	exonic	GALNT9	NaN	synonymous SNV	GALNT9:NM_001122636:exon2:c.C279T:p.G93G	rs28503969	NaN	0.342452	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	191.322	0	NaN	NA	NA	78	39	39	20
chr12	132885971	132885971	C	G	intronic	GALNT9	NaN	NaN	NaN	rs28678314	NaN	0.852835	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	1	6	0
chr12	132885975	132885975	A	G	intronic	GALNT9	NaN	NaN	NaN	rs28585384	NaN	0.852835	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	132915537	132915537	C	C	intergenic	LOC101928416,FBRSL1	dist=7376;dist=151620	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	132930169	132930169	C	A	intergenic	LOC101928416,FBRSL1	dist=22008;dist=136988	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	132950931	132950931	A	G	intergenic	LOC101928416,FBRSL1	dist=42770;dist=116226	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	132965938	132965938	G	G	intergenic	LOC101928416,FBRSL1	dist=57777;dist=101219	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	16	16	0	0
chr12	132965939	132965939	A	A	intergenic	LOC101928416,FBRSL1	dist=57778;dist=101218	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr12	132982064	132982064	C	G	intergenic	LOC101928416,FBRSL1	dist=73903;dist=85093	NaN	NaN	rs28620230	NaN	0.704872	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	24	14	10	0
chr12	132992118	132992118	G	T	intergenic	LOC101928416,FBRSL1	dist=83957;dist=75039	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	133035294	133035294	G	T	intergenic	LOC101928416,FBRSL1	dist=127133;dist=31863	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	133067382	133067382	T	A	exonic	FBRSL1	NaN	nonsynonymous SNV	FBRSL1:NM_001142641:exon1:c.T226A:p.S76T	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.987	D	0.708	P	.	.	1.000	D	1.525	L	1.35	T	-1.080	T	0.100	T	0.1	3.727	18.93	2.68	0.536	.	8.146	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	1	2	0
chr12	133074349	133074349	G	C	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	rs11612819	NaN	0.262181	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	150	86	64	0
chr12	133088738	133088738	C	G	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	133088739	133088739	A	C	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	133102134	133102134	C	C	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	133102135	133102135	C	C	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	133102136	133102136	C	C	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	133102380	133102380	G	A	exonic	FBRSL1	NaN	nonsynonymous SNV	FBRSL1:NM_001142641:exon3:c.G550A:p.A184T	NaN	NaN	NaN	0.58	T	0.999	D	0.964	D	.	.	0.999	N	1.04	L	1.42	T	-1.045	T	0.100	T	0.198	3.907	19.87	3.59	0.846	4.888	9.631	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.200807	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	96	87	9	1
chr12	133124725	133124725	G	T	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.028249	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	101	92	9	0
chr12	133124730	133124730	G	A	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.715434	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	159	140	19	0
chr12	133124731	133124731	A	C	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.968782	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	149	127	22	0
chr12	133124733	133124733	C	T	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	17	1	16	0
chr12	133124734	133124734	C	T	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.136776	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	216	200	16	9
chr12	133124740	133124740	C	G	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.520804	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	247	215	32	0
chr12	133146416	133146416	A	G	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	rs7312710	NaN	0.379393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	110.223961	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	0	36	28
chr12	133146457	133146457	G	A	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	rs3751316	NaN	0.363618	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	58.395148	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	0	25	27
chr12	133147972	133147972	G	T	exonic	FBRSL1	NaN	synonymous SNV	FBRSL1:NM_001142641:exon9:c.G1293T:p.P431P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.969967	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	5	2	3	0
chr12	133147973	133147973	G	T	exonic	FBRSL1	NaN	nonsynonymous SNV	FBRSL1:NM_001142641:exon9:c.G1294T:p.G432W	NaN	NaN	NaN	0.08	T	1.0	D	0.987	D	0.001	N	0.983	N	1.845	L	2.76	T	-1.118	T	0.060	T	0.557	3.562	18.16	3.01	0.552	5.934	9.232	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.673498	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	5	2	3	0
chr12	133148259	133148259	A	G	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	rs12311310	NaN	0.133986	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	15.979	26	7.657065	normal_lod	REJECT	7	4	3	0
chr12	133148266	133148266	T	C	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	rs10781622	NaN	0.988419	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	62.2578	0	20.426996	normal_lod	REJECT	7	0	7	3
chr12	133148519	133148519	G	A	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	rs12811683	NaN	0.0692891	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr12	133148970	133148970	C	T	intronic	FBRSL1	NaN	NaN	NaN	rs34140384	NaN	0.0726837	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.758855	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	17	15	9
chr12	133150996	133150996	G	G	exonic	FBRSL1	NaN	synonymous SNV	FBRSL1:NM_001142641:exon12:c.G1676G:p.R559R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	32	26	0	0
chr12	133158023	133158023	A	G	splicing	FBRSL1	NM_001142641:exon14:c.1964-2A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.711	18.85	4.94	1.861	6.602	14.306	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.800354	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	50	44	6	0
chr12	133166486	133166486	G	C	intergenic	FBRSL1,LRCOL1	dist=4713;dist=13250	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr12	133188055	133188055	A	A	intergenic	LRCOL1,P2RX2	dist=1018;dist=7311	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr12	133196596	133196596	T	C	exonic	P2RX2	NaN	synonymous SNV	P2RX2:NM_012226:exon3:c.T252C:p.T84T,P2RX2:NM_174872:exon3:c.T192C:p.T64T,P2RX2:NM_016318:exon4:c.T396C:p.T132T,P2RX2:NM_001282165:exon5:c.T468C:p.T156T,P2RX2:NM_170682:exon5:c.T468C:p.T156T,P2RX2:NM_170683:exon5:c.T468C:p.T156T,P2RX2:NM_174873:exon5:c.T468C:p.T156T	rs7964634	ID=COSM430767;OCCURENCE=1(breast)	0.712859	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-0.986	T	0.000	T	.	-0.469	1.836	-6.26	-1.059	-8.920	1.296	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.552301	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	3	8	39
chr12	133196773	133196773	T	G	intronic	P2RX2	NaN	NaN	NaN	rs7964872	NaN	0.710863	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	302.443	0	NaN	NA	NA	120	64	56	39
chr12	133197018	133197018	G	A	intronic	P2RX2	NaN	NaN	NaN	rs6560891	NaN	0.707668	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	39.514081	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	19	19	44
chr12	133197389	133197389	T	C	intronic	P2RX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	9	5	0
chr12	133197494	133197494	TG	CC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	113.794	0	NaN	NA	NA	21	5	14	40
chr12	133198556	133198556	T	C	exonic	P2RX2	NaN	stoploss	P2RX2:NM_012226:exon9:c.T1198C:p.X400R,P2RX2:NM_174872:exon9:c.T1138C:p.X380R,P2RX2:NM_016318:exon10:c.T1342C:p.X448R,P2RX2:NM_170683:exon10:c.T1492C:p.X498R,P2RX2:NM_001282164:exon11:c.T1111C:p.X371R,P2RX2:NM_170682:exon11:c.T1414C:p.X472R,P2RX2:NM_174873:exon12:c.T1213C:p.X405R	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.425	17.58	4.11	1.729	2.483	10.711	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.151797	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	25	22	3	0
chr12	133210985	133210985	C	T	intronic	POLE	NaN	NaN	NaN	rs5745005	NaN	0.713458	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	28.3444	0	NaN	NA	NA	286	134	152	9
chr12	133212382	133212382	G	A	intronic	POLE	NaN	NaN	NaN	rs5744993	NaN	0.126797	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr12	133219630	133219630	G	T	intronic	POLE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	41	29	12	0
chr12	133234029	133234029	A	A	intronic	POLE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr12	133241160	133241160	A	A	intronic	POLE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	15	15	0	0
chr12	133250137	133250137	G	A	intronic	POLE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	133250138	133250138	C	C	intronic	POLE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	133250292	133250292	A	G	exonic	POLE	NaN	nonsynonymous SNV	POLE:NM_006231:exon13:c.T1228C:p.W410R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.295	M	2.85	T	-0.789	T	0.127	T	0.923	4.017	20.6	5.63	2.152	9.239	15.835	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.423245	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	208	202	6	0
chr12	133253995	133253995	G	A	exonic	POLE	NaN	nonsynonymous SNV	POLE:NM_006231:exon8:c.C755T:p.A252V	rs5744751	NaN	0.0569089	0.32	T	0.007	B	0.027	B	0.000	D	0.000	P	0.38	N	2.93	T	-0.913	T	0.001	T	0.267	2.042	12.78	5.64	2.654	5.457	19.707	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.871496	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	68	45	23	16
chr12	133256389	133256389	T	T	intronic	POLE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	17	16	0	0
chr12	133281320	133281320	G	T	UTR3	PXMP2	NM_018663:c.*47G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-0.961	T	0.040	T	.	0.891	8.621	-4.95	-1.234	-0.461	13.210	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.004805367376407851	NA	0	0	NaN	NA	NA	137	107	30	0
chr12	133295270	133295270	T	C	intronic	PGAM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	1	4	0
chr12	133297293	133297293	T	G	exonic	PGAM5	NaN	nonsynonymous SNV	PGAM5:NM_001170543:exon6:c.T749G:p.L250R,PGAM5:NM_001170544:exon6:c.T746G:p.L249R	NaN	NaN	NaN	.	.	1.0	D	0.988	D	.	.	1.000	D	3.245	M	.	.	0.310	D	0.569	D	0.971	4.008	20.5	5.72	2.185	7.502	16.009	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.869442	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	5	2	3	0
chr12	133297300	133297300	C	G	exonic	PGAM5	NaN	synonymous SNV	PGAM5:NM_001170543:exon6:c.C756G:p.L252L,PGAM5:NM_001170544:exon6:c.C753G:p.L251L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.125014	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	6	3	3	0
chr12	133303888	133303888	G	C	exonic	ANKLE2	NaN	nonsynonymous SNV	ANKLE2:NM_015114:exon13:c.C2757G:p.S919R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.974	D	0.000	D	1.000	D	2.255	M	1.19	T	-0.392	T	0.372	T	0.918	3.222	16.80	2.91	0.352	0.707	8.761	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0012921240267353498	NA	0	0	NaN	NA	NA	65	41	24	0
chr12	133306590	133306590	G	T	exonic	ANKLE2	NaN	nonsynonymous SNV	ANKLE2:NM_015114:exon11:c.C2158A:p.R720S	NaN	NaN	NaN	1	T	0.003	B	0.001	B	0.454	N	1.000	N	-0.805	N	2.04	T	-1.072	T	0.027	T	0.083	0.723	7.848	-11.5	-2.940	-2.628	8.789	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	136	129	19	11
chr12	133324359	133324359	T	T	intronic	ANKLE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	133349789	133349789	T	C	exonic	GOLGA3	NaN	nonsynonymous SNV	GOLGA3:NM_005895:exon24:c.A4399G:p.T1467A	NaN	NaN	NaN	0.4	T	0.0	B	0.001	B	0.683	N	1.000	N	0	N	1.97	T	-0.976	T	0.021	T	0.124	0.940	8.831	-1.35	-0.975	-0.641	4.445	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.387474	nearby_gap_events	REJECT	177	168	9	0
chr12	133354262	133354262	C	T	exonic	GOLGA3	NaN	nonsynonymous SNV	GOLGA3:NM_005895:exon19:c.G3712A:p.D1238N	rs143232411	NaN	0.0117812	0.21	T	0.03	B	0.011	B	0.045	N	1.000	D	1.5	L	1.86	T	-0.845	T	0.078	T	0.023	1.210	9.913	4.7	1.355	3.448	11.479	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	35.0456	0	18.507785	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	16	9	1
chr12	133363212	133363212	GCCTCCCCCCCGGCCCCCGCA	G,GCCTCCCACCTGGCCCCCGCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3195.11	0	NaN	NA	NA	419	0	213	9
chr12	133367948	133367948	A	A	intronic	GOLGA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr12	133373295	133373295	A	A	intronic	GOLGA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	133378266	133378266	T	A	intronic	GOLGA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	17	7	10	0
chr12	133378610	133378610	G	A	intronic	GOLGA3	NaN	NaN	NaN	rs75002364	NaN	0.171925	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	648.09	0	NaN	NA	NA	219	98	121	28
chr12	133381104	133381104	A	G	intronic	GOLGA3	NaN	NaN	NaN	rs10735671	NaN	0.969649	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.91085	normal_lod	REJECT	3	0	3	27
chr12	133381126	133381126	C	T	intronic	GOLGA3	NaN	NaN	NaN	rs10735672	NaN	0.96246	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.624756	normal_lod,strand_artifact	REJECT	3	0	3	2
chr12	133381582	133381582	C	T	exonic	GOLGA3	NaN	synonymous SNV	GOLGA3:NM_001172557:exon7:c.G1317A:p.Q439Q,GOLGA3:NM_005895:exon7:c.G1317A:p.Q439Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.583538	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	65	59	6	0
chr12	133381583	133381583	T	G	exonic	GOLGA3	NaN	nonsynonymous SNV	GOLGA3:NM_001172557:exon7:c.A1316C:p.Q439P,GOLGA3:NM_005895:exon7:c.A1316C:p.Q439P	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.987	D	0.831	P	0.000	D	1.000	D	0.975	L	-1.19	T	-0.082	T	0.451	T	0.966	4.655	25.6	5.31	1.999	8.001	15.250	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.732524	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	65	59	6	0
chr12	133424562	133424562	G	C	intronic	CHFR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr12	133424563	133424563	C	T	intronic	CHFR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr12	133424565	133424565	G	A	intronic	CHFR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr12	133424575	133424575	T	T	intronic	CHFR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	16	13	0	0
chr12	133428181	133428181	C	T	intronic	CHFR	NaN	NaN	NaN	rs76946232	NaN	0.0211661	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	104.931977	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	25	40	3
chr12	133429204	133429204	C	A	intronic	CHFR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	133433173	133433173	T	C	exonic	CHFR	NaN	synonymous SNV	CHFR:NM_001161347:exon8:c.A870G:p.R290R,CHFR:NM_001161344:exon10:c.A1146G:p.R382R,CHFR:NM_001161345:exon10:c.A1146G:p.R382R,CHFR:NM_001161346:exon10:c.A1110G:p.R370R,CHFR:NM_018223:exon10:c.A1023G:p.R341R	rs2062163	NaN	0.970248	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1257.24	0	NaN	NA	NA	104	1	103	46
chr12	133434240	133434240	A	T	intronic	CHFR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	133434241	133434241	C	G	intronic	CHFR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	133435716	133435716	T	G	exonic	CHFR	NaN	synonymous SNV	CHFR:NM_001161347:exon6:c.A609C:p.P203P,CHFR:NM_001161344:exon8:c.A885C:p.P295P,CHFR:NM_001161345:exon8:c.A885C:p.P295P,CHFR:NM_001161346:exon8:c.A849C:p.P283P,CHFR:NM_018223:exon8:c.A762C:p.P254P	rs35011845	NaN	0.142173	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.392066	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	30	20	30
chr12	133454310	133454310	A	A	intronic	CHFR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	133502181	133502181	T	C	exonic	ZNF605	NaN	synonymous SNV	ZNF605:NM_001164715:exon5:c.A1797G:p.K599K,ZNF605:NM_183238:exon5:c.A1704G:p.K568K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.392743	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	299	290	9	0
chr12	133503660	133503660	A	C	exonic	ZNF605	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF605:NM_001164715:exon5:c.T318G:p.F106L,ZNF605:NM_183238:exon5:c.T225G:p.F75L	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.0	B	0.001	B	0.617	N	1.000	N	0.29	N	3.27	T	-0.989	T	0.014	T	0.057	-1.322	0.033	-4.72	-0.670	0.426	15.971	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.861438	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	191	177	14	2
chr12	133509236	133509236	A	G	intronic	ZNF605	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	133518366	133518366	G	T	intronic	ZNF605	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr12	13364426	13364426	CAAAAAAAAA	CAAAAAAAA,CAAAAAAA,CAAAAAAAAG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	876.511	0	NaN	NA	NA	276	1	100	0
chr12	133659860	133659860	A	C	intronic	ZNF140	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	133660192	133660192	A	G	intronic	ZNF140	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	13366775	13366775	A	A	intronic	EMP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	20	16	0	0
chr12	13573634	13573634	A	C	intergenic	LINC01559,GRIN2B	dist=43955;dist=140776	NaN	NaN	rs10845767	NaN	0.556909	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	13573636	13573636	C	T	intergenic	LINC01559,GRIN2B	dist=43957;dist=140774	NaN	NaN	rs11055414	NaN	0.29393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	13761675	13761675	C	G	exonic	GRIN2B	NaN	nonsynonymous SNV	GRIN2B:NM_000834:exon9:c.G1872C:p.K624N	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.991	D	0.000	D	1.000	D	2.595	M	0.49	T	-0.239	T	0.369	T	0.597	4.254	22.2	5.57	2.607	1.536	14.782	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0011797208402062088	NA	0	0	NaN	NA	NA	117	88	29	0
chr12	14018608	14018608	T	C	intronic	GRIN2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	14577016	14577016	C	T	exonic	ATF7IP	NaN	nonsynonymous SNV	ATF7IP:NM_001286514:exon2:c.C167T:p.T56I,ATF7IP:NM_001286515:exon2:c.C167T:p.T56I,ATF7IP:NM_018179:exon2:c.C167T:p.T56I,ATF7IP:NM_181352:exon2:c.C191T:p.T64I	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.98	D	0.663	P	0.075	N	0.957	N	1.61	L	2.2	T	-1.085	T	0.071	T	0.217	3.706	18.83	3.36	1.430	1.769	7.460	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.537925	nearby_gap_events	REJECT	126	119	7	0
chr12	14577186	14577186	T	C	exonic	ATF7IP	NaN	nonsynonymous SNV	ATF7IP:NM_001286514:exon2:c.T337C:p.S113P,ATF7IP:NM_001286515:exon2:c.T337C:p.S113P,ATF7IP:NM_018179:exon2:c.T337C:p.S113P,ATF7IP:NM_181352:exon2:c.T361C:p.S121P	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.102	B	0.051	B	0.005	N	1.000	N	1.78	L	1.88	T	-1.017	T	0.064	T	0.307	0.384	6.087	2.69	0.484	1.695	5.012	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.150445	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	133	123	10	0
chr12	14634165	14634165	C	A	UTR3	ATF7IP	NM_001286515:c.*5C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	14634167	14634167	T	C	UTR3	ATF7IP	NM_001286515:c.*7T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	14825734	14825734	T	C	intronic	GUCY2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	6	3	0
chr12	14825736	14825736	C	A	intronic	GUCY2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	6	4	0
chr12	14825737	14825737	T	C	intronic	GUCY2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	18	11	6	0
chr12	14829893	14829893	A	C	exonic	GUCY2C	NaN	nonsynonymous SNV	GUCY2C:NM_004963:exon7:c.T843G:p.F281L	rs1420635	NaN	0.986222	0.31	T	0.011	B	0.015	B	0.000	D	0.999	P	1.01	L	-0.69	T	-1.005	T	0.000	T	0.435	0.423	6.299	-1.85	-0.576	0.120	10.192	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	176.730149	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	64	0	64	58
chr12	14940367	14940367	G	A	exonic	WBP11	NaN	nonsynonymous SNV	WBP11:NM_016312:exon12:c.C1558T:p.P520S	NaN	NaN	NaN	0.83	T	0.002	B	0.002	B	0.000	N	0.999	D	-0.06	N	-2.8	D	-0.645	T	0.388	T	0.296	1.345	10.42	3.35	0.757	4.265	8.164	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.804121	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	141	132	9	0
chr12	14941901	14941901	A	A	exonic	WBP11	NaN	synonymous SNV	WBP11:NM_016312:exon11:c.T1476T:p.P492P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	49	37	0	0
chr12	14947686	14947686	A	C	intronic	WBP11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.614684	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	81	69	12	0
chr12	14953736	14953736	A	G	intronic	WBP11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.85942	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	25	22	3	0
chr12	14959682	14959682	A	C	intronic	C12orf60,SMCO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	2	2	0
chr12	15035081	15035081	T	C	exonic	MGP	NaN	nonsynonymous SNV	MGP:NM_000900:exon4:c.A304G:p.T102A,MGP:NM_001190839:exon5:c.A379G:p.T127A	rs4236	ID=COSM147452;OCCURENCE=1(stomach)	0.385383	1	T	0.0	B	0.0	B	0.329	N	1.000	P	0	N	1.58	T	-0.951	T	0.000	T	0.04	-0.800	0.677	0.156	-0.068	-0.553	5.053	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.942072	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	12	15	37
chr12	15073861	15073861	T	C	intronic	ERP27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.561752	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	237	230	7	0
chr12	15103442	15103442	AC	ACCA,A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1979.44	0	NaN	NA	NA	231	0	57	33
chr12	15103635	15103635	T	C	exonic	ARHGDIB	NaN	synonymous SNV	ARHGDIB:NM_001175:exon2:c.A12G:p.K4K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.088336	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	187	165	22	0
chr12	15702201	15702201	G	G	intronic	PTPRO	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	310	257	0	0
chr12	15702202	15702202	A	A	intronic	PTPRO	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	342	277	0	0
chr12	15704662	15704662	A	G	intronic	PTPRO	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	15710515	15710515	A	T	intronic	PTPRO	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr12	15718510	15718510	T	C	intronic	PTPRO	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	13	4	9	0
chr12	15733059	15733059	A	G	intronic	PTPRO	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.269952	nearby_gap_events	REJECT	80	72	8	0
chr12	15734770	15734770	A	A	intronic	PTPRO	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	15748001	15748001	G	A	UTR3	PTPRO	NM_030671:c.*26G>A,NM_030670:c.*26G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.787448	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	367	360	7	0
chr12	15774351	15774351	C	A	exonic	EPS8	NaN	nonsynonymous SNV	EPS8:NM_004447:exon21:c.G2369T:p.S790I	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.981	D	0.491	P	0.001	N	0.999	D	0	N	2.01	T	-1.078	T	0.037	T	0.855	2.499	14.32	5.45	2.551	4.113	17.472	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.856598	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	129	120	9	1
chr12	15784238	15784238	G	A	intronic	EPS8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	15784547	15784547	A	C	exonic	EPS8	NaN	nonsynonymous SNV	EPS8:NM_004447:exon18:c.T1873G:p.S625A	NaN	NaN	NaN	0.54	T	0.001	B	0.003	B	0.035	N	1.000	N	1.59	L	3.4	T	-0.960	T	0.015	T	0.197	2.172	13.22	1.75	0.967	2.185	7.196	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5597	0	NaN	NA	NA	6	4	2	1
chr12	15793912	15793912	A	C	intronic	EPS8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	12	5	4	0
chr12	15807068	15807068	T	T	intronic	EPS8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	25	25	0	0
chr12	16035856	16035856	G	A	intronic	STRAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.293545	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	192	173	19	0
chr12	16035903	16035903	A	A	intronic	STRAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	0	0
chr12	16064332	16064332	T	T	exonic	DERA	NaN	synonymous SNV	DERA:NM_001300779:exon1:c.T15T:p.N5N,DERA:NM_015954:exon1:c.T15T:p.N5N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	16064334	16064334	G	C	exonic	DERA	NaN	nonsynonymous SNV	DERA:NM_001300779:exon1:c.G17C:p.R6P,DERA:NM_015954:exon1:c.G17C:p.R6P	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	N	-1.24	N	.	.	-0.991	T	0.015	T	0.411	2.310	13.68	-2.78	-0.475	-0.870	1.681	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.44091	clustered_read_position	REJECT	45	40	5	2
chr12	16064367	16064367	T	C	intronic	DERA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.907458	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	59	53	6	0
chr12	16109944	16109944	A	G	exonic	DERA	NaN	nonsynonymous SNV	DERA:NM_001300779:exon2:c.A106G:p.R36G,DERA:NM_015954:exon2:c.A106G:p.R36G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.666	P	0.252	B	0.000	D	0.993	D	2.74	M	.	.	-0.494	T	0.266	T	0.764	2.432	14.09	3.98	0.939	2.748	11.704	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.868989	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	48	45	3	0
chr12	16115898	16115898	A	A	intronic	DERA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	16369830	16369830	C	A	exonic	SLC15A5	NaN	nonsynonymous SNV	SLC15A5:NM_001170798:exon7:c.G1480T:p.D494Y	NaN	NaN	NaN	0.01	D	.	.	.	.	0.000	D	1.000	N	1.04	L	-0.09	T	-0.733	T	0.230	T	0.31	2.321	13.72	5.15	2.673	3.650	14.630	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.487262	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	142	133	9	0
chr12	16425338	16425338	C	G	intronic	SLC15A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	0	3	0
chr12	1742166	1742166	A	A	intronic	WNT5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	1755193	1755193	C	G	exonic	WNT5B	NaN	synonymous SNV	WNT5B:NM_030775:exon5:c.C855G:p.P285P,WNT5B:NM_032642:exon5:c.C855G:p.P285P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	97	37	60	10
chr12	176671	176671	A	T	intronic	IQSEC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	17.9197	0	NaN	NA	NA	12	9	3	0
chr12	18234399	18234399	T	C	exonic	RERGL	NaN	nonsynonymous SNV	RERGL:NM_001286201:exon5:c.A341G:p.E114G,RERGL:NM_024730:exon6:c.A344G:p.E115G	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.978	D	0.871	P	0.000	D	1.000	D	1.18	L	-1.19	T	-0.173	T	0.455	T	0.396	3.029	16.11	4.87	2.127	4.785	13.795	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	18237688	18237688	C	A	intronic	RERGL	NaN	NaN	NaN	rs6486881	NaN	0.450679	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	79.248235	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	61	30	31	33
chr12	18435401	18435401	C	A	exonic	PIK3C2G	NaN	nonsynonymous SNV	PIK3C2G:NM_001288772:exon2:c.C386A:p.P129H,PIK3C2G:NM_004570:exon2:c.C386A:p.P129H	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.99	D	0.789	P	0.000	N	1.000	N	1.04	L	1.14	T	-0.859	T	0.297	T	0.261	2.228	13.41	1.68	0.388	1.242	4.359	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	14	4	3	0
chr12	18443750	18443750	G	A	intronic	PIK3C2G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	12	8	3	0
chr12	185052	185052	C	A	intronic	IQSEC3	NaN	NaN	NaN	rs59384445	NaN	0.294129	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	2	7	0
chr12	1863728	1863728	A	T	intronic	ADIPOR2	NaN	NaN	NaN	rs11061971	NaN	0.605032	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	345.407	0	NaN	NA	NA	45	3	40	18
chr12	18704727	18704727	G	G	intronic	PIK3C2G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	18704728	18704728	G	G	intronic	PIK3C2G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	18704730	18704730	A	A	intronic	PIK3C2G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	18848131	18848131	T	C	intronic	PLCZ1	NaN	NaN	NaN	rs1487070	NaN	0.485224	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	64.595865	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	70	41	29	39
chr12	18854479	18854479	C	T	exonic	PLCZ1	NaN	nonsynonymous SNV	PLCZ1:NM_033123:exon9:c.G973A:p.G325R	NaN	NaN	NaN	0.45	T	0.003	B	0.001	B	0.000	N	1.000	N	1.355	L	2.88	T	-1.047	T	0.210	T	0.241	0.711	7.789	-0.287	0.260	-0.143	1.349	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.044372	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	87	77	10	0
chr12	18889149	18889149	T	C	intronic	PLCZ1	NaN	NaN	NaN	rs12300257	NaN	0.276957	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	94.530633	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	27	38	19
chr12	1890016	1890016	A	T	intronic	ADIPOR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.091145	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	159	144	15	0
chr12	1890019	1890019	T	A	intronic	ADIPOR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.056011	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	132	113	19	0
chr12	1893055	1893055	T	G	exonic	ADIPOR2	NaN	nonsynonymous SNV	ADIPOR2:NM_024551:exon7:c.T848G:p.L283W	NaN	NaN	NaN	0	D	0.996	D	0.928	D	0.000	D	1.000	D	2.69	M	1.22	T	-0.532	T	0.243	T	0.707	4.535	24.5	5.67	2.159	8.040	15.927	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.16483516483516467	NA	0	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr12	1906653	1906653	T	G	exonic	CACNA2D4	NaN	nonsynonymous SNV	CACNA2D4:NM_172364:exon35:c.A3044C:p.Y1015S	NaN	NaN	NaN	0.62	T	1.0	D	0.993	D	0.000	D	1.000	D	2.485	M	0.54	T	-0.056	T	0.540	D	0.808	3.102	16.36	4.54	1.910	4.234	14.040	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.549927	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	114	106	8	0
chr12	1910889	1910889	A	A	intronic	CACNA2D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	29	24	0	0
chr12	19406856	19406856	C	T	intronic	PLEKHA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.196446	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	316	302	14	0
chr12	19406863	19406863	C	T	intronic	PLEKHA5	NaN	NaN	NaN	rs6486942	NaN	0.758786	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	122	17	105	55
chr12	19436690	19436690	T	A	intronic	PLEKHA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr12	19436693	19436693	T	G	intronic	PLEKHA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	5	3	0
chr12	19440529	19440529	A	A	intronic	PLEKHA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	11	8	0	0
chr12	1949821	1949821	G	G	intronic	CACNA2D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	1949822	1949822	C	C	intronic	CACNA2D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	1949824	1949824	G	G	intronic	CACNA2D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	1949825	1949825	G	G	intronic	CACNA2D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	1950011	1950011	A	AC	intronic	CACNA2D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.938498	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2670.6	0	NaN	NA	NA	287	0	252	44
chr12	19511429	19511429	A	G	intronic	PLEKHA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	13	3	6	0
chr12	1955602	1955602	A	G	intronic	CACNA2D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	19671474	19671474	A	C	UTR3	AEBP2	NM_153207:c.*423A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr12	19671476	19671476	A	C	UTR3	AEBP2	NM_153207:c.*425A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr12	19671478	19671478	T	C	UTR3	AEBP2	NM_153207:c.*427T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr12	19671480	19671480	G	A	UTR3	AEBP2	NM_153207:c.*429G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	12	6	4	0
chr12	1983933	1983933	A	C	intronic	CACNA2D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	63	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr12	1987427	1987427	T	T	intronic	CACNA2D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	1988999	1988999	TG	CG,GA,GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	21.662	0	NaN	NA	NA	66	49	6	0
chr12	1989000	1989000	G	T	exonic	CACNA2D4	NaN	synonymous SNV	CACNA2D4:NM_172364:exon14:c.C1533A:p.A511A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.11139692250648577	NA	0	0	NaN	NA	NA	23	17	6	0
chr12	1989001	1989001	GCCA	GCA,GCCAG,GCCAGG,GGCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	328.865	0	NaN	NA	NA	68	6	8	0
chr12	1991971	1991971	A	G	intronic	CACNA2D4	NaN	NaN	NaN	rs55779143	NaN	0.367412	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.834572	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	44	10	34	16
chr12	1993555	1993555	A	A	intronic	CACNA2D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	14	10	0	0
chr12	2016550	2016550	A	ATTGTC	intronic	CACNA2D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.937101	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1041.4	0	NaN	NA	NA	123	4	112	35
chr12	2041906	2041906	G	A	ncRNA_intronic	LINC00940	NaN	NaN	NaN	rs10774008	NaN	0.469249	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	20522252	20522252	G	A	exonic	PDE3A	NaN	nonsynonymous SNV	PDE3A:NM_000921:exon1:c.G34A:p.D12N	rs12305038	ID=COSM430859;OCCURENCE=1(breast)	0.333666	0.23	T	0.079	B	0.032	B	0.000	N	1.000	P	0	N	0.04	T	-0.988	T	0.000	T	0.01	1.152	9.693	3.9	1.999	3.310	11.498	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	538.713	0	NaN	NA	NA	127	43	84	13
chr12	20522374	20522374	G	T	exonic	PDE3A	NaN	synonymous SNV	PDE3A:NM_000921:exon1:c.G156T:p.L52L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.495128	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	137	131	6	0
chr12	2076966	2076966	A	C	intronic	DCP1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr12	20783153	20783153	A	A	intronic	PDE3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr12	20799924	20799924	A	C	intronic	PDE3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	20801791	20801791	A	C	exonic	PDE3A	NaN	nonsynonymous SNV	PDE3A:NM_001244683:exon12:c.A1769C:p.K590T,PDE3A:NM_000921:exon13:c.A2735C:p.K912T	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.993	D	0.000	D	1.000	D	1.84	L	-1.16	T	0.224	D	0.578	D	0.852	4.376	23.1	5.33	2.144	8.831	15.591	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.668852	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	50	46	4	0
chr12	20893108	20893108	C	T	intronic	SLCO1C1	NaN	NaN	NaN	rs2271656	NaN	0.442292	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	91.6662	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	81	40	41	46
chr12	21007792	21007792	A	G	intronic	SLCO1B3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.132911	clustered_read_position	REJECT	65	59	6	0
chr12	21008149	21008149	A	A	intronic	SLCO1B3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	21030582	21030582	G	A	intronic	SLCO1B3	NaN	NaN	NaN	rs4149135	NaN	0.704073	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	62.2578	0	NaN	NA	NA	86	0	86	3
chr12	21030590	21030590	C	T	intronic	SLCO1B3	NaN	NaN	NaN	rs4149137	NaN	0.515375	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.979	0	NaN	NA	NA	82	37	45	0
chr12	21051489	21051489	C	T	intronic	SLCO1B3	NaN	NaN	NaN	rs4149153	NaN	0.705272	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	74.9769	0	20.581228	normal_lod	REJECT	8	0	8	7
chr12	21054369	21054369	G	A	exonic	SLCO1B3	NaN	synonymous SNV	SLCO1B3:NM_019844:exon15:c.G1833A:p.G611G	rs3764006	NaN	0.678714	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	175.918556	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	61	0	61	58
chr12	2113416	2113416	G	T	intronic	DCP1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.25	T	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-1.016	T	0.092	T	0.102	1.773	11.89	1.62	0.640	2.397	8.484	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.328401	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	54	47	7	0
chr12	21242801	21242801	A	T	intronic	SLCO1B7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.686721	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	149	133	16	0
chr12	21329761	21329761	G	A	exonic	SLCO1B1	NaN	synonymous SNV	SLCO1B1:NM_006446:exon5:c.G411A:p.S137S	rs11045818	NaN	0.0517173	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.839076	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	5	3	9
chr12	21331599	21331599	T	C	exonic	SLCO1B1	NaN	synonymous SNV	SLCO1B1:NM_006446:exon6:c.T571C:p.L191L	rs4149057	NaN	0.367412	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	73.304724	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	2	26	45
chr12	21331625	21331625	C	T	exonic	SLCO1B1	NaN	synonymous SNV	SLCO1B1:NM_006446:exon6:c.C597T:p.F199F	rs2291075	NaN	0.415535	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.487893	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	13	13	25
chr12	21331816	21331816	A	G	intronic	SLCO1B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	11	7	3	0
chr12	21331996	21331996	A	A	intronic	SLCO1B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr12	21353381	21353381	T	T	intronic	SLCO1B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr12	21369993	21369993	T	G	intronic	SLCO1B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	21369994	21369994	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	0	2,2	0
chr12	21369995	21369995	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	0	2,2	0
chr12	21370259	21370259	A	A	intronic	SLCO1B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	59	45	0	0
chr12	21375216	21375216	G	T	intronic	SLCO1B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.0763	0	NaN	NA	NA	12	10	2	0
chr12	21446708	21446708	T	T	intronic	SLCO1A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	21457536	21457536	A	A	intronic	SLCO1A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr12	21590621	21590621	T	C	UTR5	PYROXD1	NM_024854:c.-44T>C	NaN	NaN	rs2058464	NaN	0.486621	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.082507	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	12	14	40
chr12	21590663	21590663	G	A	UTR5	PYROXD1	NM_024854:c.-2G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	3.066825	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	27	25	2	0
chr12	21598195	21598195	G	A	intronic	PYROXD1	NaN	NaN	NaN	rs1963330	NaN	0.475839	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.018072	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	24	18	24
chr12	21629993	21629993	A	AC	intronic	RECQL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.488818	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	511.6	0	NaN	NA	NA	351	199	137	14
chr12	21636442	21636442	T	C	exonic	RECQL	NaN	nonsynonymous SNV	RECQL:NM_002907:exon6:c.A568G:p.T190A,RECQL:NM_032941:exon7:c.A568G:p.T190A	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	1.375	L	1.4	T	0.229	D	0.574	D	0.928	4.469	23.9	4.67	1.955	7.656	14.299	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.172629	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	405	384	21	0
chr12	21644667	21644667	G	A	intronic	RECQL	NaN	NaN	NaN	rs10841834	ID=COSN164190;OCCURENCE=1(NS)	0.373203	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	15.7878	19	6.733434	normal_lod	REJECT	8	5	3	7
chr12	21654831	21654831	G	T	UTR5	GOLT1B	NM_016072:c.-27G>T	NaN	NaN	rs1060126	NaN	0.705671	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	50.1428	0	18.956074	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	42
chr12	21659703	21659703	T	T	intronic	GOLT1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	21695360	21695360	T	T	intronic	GYS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	15	14	0	0
chr12	21699437	21699437	G	G	intronic	GYS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	21712545	21712545	A	G	intronic	GYS2	NaN	NaN	NaN	rs1871136	NaN	0.740615	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.373518	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	1	9	17
chr12	21712574	21712574	C	T	intronic	GYS2	NaN	NaN	NaN	rs1871137	NaN	0.740615	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.438384	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	0	10	18
chr12	21713308	21713308	T	A	intronic	GYS2	NaN	NaN	NaN	rs4639981	NaN	0.754593	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	290.293849	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	92	0	92	57
chr12	21716098	21716098	T	C	intronic	GYS2	NaN	NaN	NaN	rs1473423	NaN	0.72504	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	163.552325	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	1	58	56
chr12	21721751	21721751	T	T	intronic	GYS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr12	21789968	21789968	G	T	intronic	LDHB	NaN	NaN	NaN	rs1677134	NaN	0.964856	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	99.055051	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	0	31	51
chr12	21791455	21791455	A	T	intronic	LDHB	NaN	NaN	NaN	rs1427830	NaN	0.952276	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	268.086	0	NaN	NA	NA	46	11	34	31
chr12	21799781	21799781	T	G	intronic	LDHB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.343615	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	178	170	8	0
chr12	21961525	21961525	T	G	intronic	ABCC9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	21981801	21981801	A	G	intronic	ABCC9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	22005003	22005003	T	G	intronic	ABCC9	NaN	NaN	NaN	rs2307024	NaN	0.334665	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	68.533086	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	37	29	38
chr12	22016006	22016006	A	G	intronic	ABCC9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.822914	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	106	99	7	0
chr12	22061293	22061293	A	C	intronic	ABCC9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	7	1	4	0
chr12	22063353	22063353	A	C	intronic	ABCC9	NaN	NaN	NaN	rs4148655	NaN	0.295927	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	85	0	85	33
chr12	22063749	22063749	T	C	intronic	ABCC9	NaN	NaN	NaN	rs4762720	NaN	0.991613	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	203.064855	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	74	0	74	56
chr12	22086882	22086882	A	C	intronic	ABCC9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	12.7945	0	14.629404	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	53	44	9	5
chr12	2219433	2219433	A	A	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr12	22214426	22214426	T	G	intronic	CMAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.127513	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	171	152	19	2
chr12	22214428	22214428	A	A	intronic	CMAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	22215408	22215408	GAATTAA	GAA,GAATTAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1238.48	0	NaN	NA	NA	132	0	24	1
chr12	2229635	2229635	A	A	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	22354921	22354921	A	G	exonic	ST8SIA1	NaN	synonymous SNV	ST8SIA1:NM_001304450:exon4:c.T207C:p.I69I,ST8SIA1:NM_003034:exon5:c.T636C:p.I212I	rs704219	NaN	0.810104	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	199.41	0	NaN	NA	NA	46	12	34	53
chr12	22487068	22487068	A	T	exonic	ST8SIA1	NaN	nonsynonymous SNV	ST8SIA1:NM_003034:exon1:c.T99A:p.S33R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.454	P	0.107	B	0.000	D	1.000	D	1.59	L	1.83	T	-1.011	T	0.095	T	0.846	2.503	14.33	3.24	0.814	1.776	5.489	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.575783	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	40	36	4	0
chr12	22602902	22602902	T	C	intronic	C2CD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	22631475	22631475	T	T	intronic	C2CD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	164	107	0	0
chr12	22637877	22637877	A	A	intronic	C2CD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	70	60	0	0
chr12	22659634	22659634	T	A	intronic	C2CD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.002296484224795551	NA	0	0	NaN	NA	NA	86	68	18	0
chr12	22659773	22659773	A	G	intronic	C2CD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	2	4	0
chr12	22666378	22666378	T	C	intronic	C2CD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	22666379	22666379	T	C	intronic	C2CD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	22666380	22666380	C	T	intronic	C2CD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	22797164	22797164	T	TTGC	exonic	ETNK1	NaN	nonframeshift substitution	ETNK1:NM_001039481:exon3:c.703_703delinsTTGC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	13.0845	0	NaN	NA	NA	12	8	2	0
chr12	234893	234893	A	A	exonic	IQSEC3	NaN	synonymous SNV	IQSEC3:NM_001170738:exon3:c.A718A:p.K240K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr12	235022	235022	C	T	exonic	IQSEC3	NaN	nonsynonymous SNV	IQSEC3:NM_001170738:exon3:c.C847T:p.P283S	rs12822449	NaN	0.958267	0.66	T	.	.	.	.	0.802	N	0.000	P	-1.995	N	-0.98	T	-0.968	T	0.000	T	0.035	-0.558	1.479	1.45	-0.014	2.039	1.746	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	57.979685	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	1	20	28
chr12	23757290	23757290	T	T	intronic	SOX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	23818559	23818559	A	A	intronic	SOX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	2409460	2409460	T	G	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	24328636	24328636	T	T	intronic	SOX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	24328638	24328638	C	C	intronic	SOX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	24328645	24328645	A	A	intronic	SOX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	2447523	2447523	C	C	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	2447602	2447602	C	C	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	2486113	2486113	C	C	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	24989444	24989444	C	A	splicing	BCAT1	NM_001178093:exon9:c.939+1G>T,NM_001178091:exon8:c.792+1G>T,NM_001178092:exon7:c.720+1G>T,NM_001178094:exon9:c.900+1G>T,NM_005504:exon9:c.903+1G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.842	15.47	5.11	2.538	6.545	18.936	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.661756	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	51	39	12	0
chr12	24989605	24989605	T	A	intronic	BCAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	114.139	0	NaN	NA	NA	57	32	27	31
chr12	25148888	25148888	T	T	exonic	C12orf77	NaN	synonymous SNV	C12orf77:NM_001101339:exon3:c.A260A:p.E87E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	56	52	0	0
chr12	25222194	25222194	T	T	intronic	LRMP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	25243131	25243131	G	A	exonic	LRMP	NaN	synonymous SNV	LRMP:NM_001204126:exon12:c.G606A:p.E202E,LRMP:NM_001204127:exon12:c.G606A:p.E202E,LRMP:NM_006152:exon13:c.G606A:p.E202E	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.442	T	0.364	T	.	3.055	16.20	5.66	2.676	5.962	17.247	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.903202	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	131	126	5	0
chr12	25254175	25254175	T	C	exonic	LRMP	NaN	nonsynonymous SNV	LRMP:NM_001204126:exon14:c.T805C:p.Y269H,LRMP:NM_001204127:exon14:c.T805C:p.Y269H,LRMP:NM_006152:exon15:c.T805C:p.Y269H	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.992	D	0.972	D	0.000	D	1.000	D	1.87	L	1.57	T	-0.852	T	0.167	T	0.862	4.186	21.7	5.51	2.218	7.407	14.738	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.239657	nearby_gap_events	REJECT	98	93	5	0
chr12	25271912	25271912	A	T	intronic	CASC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	2	2	0
chr12	25272267	25272267	A	A	intronic	CASC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr12	25302483	25302483	T	A	intronic	CASC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.1015	0	NaN	NA	NA	102	87	16	1
chr12	25307504	25307504	A	C	intronic	CASC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.578114	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	141	125	16	2
chr12	25311489	25311489	G	T	exonic	CASC1	NaN	nonsynonymous SNV	CASC1:NM_001082973:exon3:c.C97A:p.R33S,CASC1:NM_001082972:exon4:c.C289A:p.R97S,CASC1:NM_018272:exon4:c.C115A:p.R39S	rs10842496	NaN	0.253794	0.02	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	0.000	P	2.125	M	1.99	T	-1.027	T	0.000	T	0.302	3.402	17.49	5.42	2.535	3.836	14.726	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	58.907206	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	13	24	36
chr12	25343516	25343516	C	T	intronic	CASC1	NaN	NaN	NaN	rs10842501	NaN	0.552316	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	28.2172	0	10.057375	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	9	6	31
chr12	25357260	25357260	A	A	UTR3	LYRM5	NM_001001660:c.*14A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	25706052	25706052	A	A	UTR5	LMNTD1	NM_152590:c.-24T>T,NM_001145728:c.-159T>T,NM_001145729:c.-159T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr12	2602665	2602665	A	A	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr12	26231898	26231898	G	A	intronic	RASSF8	NaN	NaN	NaN	rs4963952	NaN	0.819888	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	76.9169	0	NaN	NA	NA	125	0	125	2
chr12	26534002	26534002	G	A	intronic	ITPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	2659041	2659041	T	G	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	266149	266149	T	T	intronic	IQSEC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	26633995	26633995	C	G	intronic	ITPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	266955	266955	G	C	intronic	IQSEC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	15	8	6	0
chr12	266958	266958	G	T	intronic	IQSEC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	13	7	6	0
chr12	266962	266962	A	T	intronic	IQSEC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr12	266964	266964	C	T	intronic	IQSEC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr12	266965	266965	T	G	intronic	IQSEC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr12	266969	266969	G	A	intronic	IQSEC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr12	26732936	26732936	A	G	intronic	ITPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	26775468	26775468	A	A	intronic	ITPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	26848444	26848444	C	G	intronic	ITPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr12	26848445	26848445	C	A	intronic	ITPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr12	26868996	26868996	T	T	intronic	ITPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr12	2693810	2693810	G	T	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.393906	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	50	33	17	0
chr12	26953885	26953885	T	C	intronic	ITPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr12	26953886	26953886	C	A	intronic	ITPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr12	2705003	2705003	T	A	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	2705224	2705224	A	C	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	13	6	7	0
chr12	27081535	27081535	T	T	intronic	ASUN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	25	25	0	0
chr12	271022	271022	G	A	intronic	IQSEC3	NaN	NaN	NaN	rs12579600	NaN	0.822883	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	62.663543	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	0	21	48
chr12	271049	271049	C	T	intronic	IQSEC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.46139	0	NaN	NA	NA	13	11	2	1
chr12	271060	271060	C	T	intronic	IQSEC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.225174	normal_lod	REJECT	13	9	4	0
chr12	2714174	2714174	T	C	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	2714415	2714415	A	A	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	2716110	2716110	T	T	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	27175494	27175494	T	C	UTR5	MED21	NM_001271811:c.-19T>C,NM_004264:c.-19T>C	NaN	NaN	rs3963548	NaN	0.932308	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	257.541052	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	97	1	96	58
chr12	27180175	27180175	T	T	intronic	MED21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr12	2721137	2721137	C	T	exonic	CACNA1C	NaN	synonymous SNV	CACNA1C:NM_000719:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129829:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129830:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129831:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129833:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129834:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129835:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129836:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129837:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129838:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129839:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129840:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129841:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129842:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129843:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129844:exon29:c.C3777T:p.F1259F,CACNA1C:NM_001129846:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001167623:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001167624:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001167625:exon29:c.C3786T:p.F1262F,CACNA1C:NM_001129827:exon30:c.C3846T:p.F1282F,CACNA1C:NM_001129832:exon30:c.C3846T:p.F1282F,CACNA1C:NM_199460:exon30:c.C3846T:p.F1282F	rs216008	NaN	0.259185	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.198741	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	31	10	18
chr12	27233956	27233956	A	C	downstream	C12orf71	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	27234200	27234200	T	C	exonic	C12orf71	NaN	synonymous SNV	C12orf71:NM_001080406:exon2:c.A717G:p.K239K	rs708165	NaN	0.20028	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2354.13	0	NaN	NA	NA	347	128	219	42
chr12	27450844	27450844	T	G	intronic	STK38L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr12	27454982	27454982	T	G	intronic	STK38L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	27465464	27465464	A	C	intronic	STK38L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.442983	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	131	120	11	0
chr12	27568772	27568772	T	A	ncRNA_intronic	ARNTL2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.831424	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	156	145	11	0
chr12	2760344	2760344	A	G	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	rs216043	NaN	0.885583	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	2760970	2760970	G	A	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	rs1990322	NaN	0.553914	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	165.518884	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	55	0	55	53
chr12	2763125	2763125	A	A	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	27641343	27641343	T	T	intronic	SMCO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	2774688	2774688	C	A	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	13	4	6	0
chr12	2778250	2778250	A	A	ncRNA_intronic	CACNA1C-AS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	25	24	0	0
chr12	27808253	27808253	T	C	intronic	PPFIBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.207153	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	49	44	5	0
chr12	27826780	27826780	T	G	intronic	PPFIBP1	NaN	NaN	NaN	rs2052673	NaN	0.778155	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	47	1	46	50
chr12	27835430	27835430	T	C	exonic	PPFIBP1	NaN	synonymous SNV	PPFIBP1:NM_001198915:exon20:c.T1716C:p.T572T,PPFIBP1:NM_001198916:exon21:c.T2082C:p.T694T,PPFIBP1:NM_177444:exon22:c.T2175C:p.T725T,PPFIBP1:NM_003622:exon23:c.T2157C:p.T719T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.708857	strand_artifact	REJECT	152	142	10	0
chr12	2783827	2783827	C	A	intronic	CACNA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	81	30	51	2
chr12	27844663	27844663	G	C	intronic	PPFIBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	27844664	27844664	T	G	intronic	PPFIBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	27844665	27844665	T	A	intronic	PPFIBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	2786222	2786222	T	C	ncRNA_exonic	CACNA1C-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	27877136	27877136	T	A	intronic	MRPS35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr12	27877147	27877147	T	T	intronic	MRPS35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	16	14	0	0
chr12	27877150	27877150	A	A	intronic	MRPS35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	18	17	0	0
chr12	27915718	27915718	A	T	exonic	MANSC4	NaN	nonsynonymous SNV	MANSC4:NM_001146221:exon3:c.T976A:p.S326T	rs10842975	NaN	0.492212	0.31	T	0.455	P	0.146	B	0.497	N	1.000	P	1.39	L	0.73	T	-0.929	T	0.000	T	0.057	0.453	6.461	0.253	0.035	1.085	6.621	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	262.506739	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	103	0	103	47
chr12	27944474	27944474	A	C	intronic	KLHL42	NaN	NaN	NaN	rs2288233	NaN	0.33766	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	88.228098	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	37	35	50
chr12	280204	280204	T	C	intronic	IQSEC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.751129	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	82	77	5	0
chr12	28105225	28105225	C	T	intergenic	KLHL42,PTHLH	dist=149252;dist=5792	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	28116747	28116747	A	T	intronic	PTHLH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	18	13	5	0
chr12	284058	284058	T	C	exonic	IQSEC3	NaN	synonymous SNV	IQSEC3:NM_001170738:exon14:c.T3408C:p.G1136G	rs216230	NaN	0.923722	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.804897	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	40
chr12	2847760	2847760	G	A	intergenic	CACNA1C,LOC283440	dist=40645;dist=22606	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	18	11	7	0
chr12	28603360	28603360	A	A	intronic	CCDC91	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	28636985	28636985	G	A	exonic	CCDC91	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC91:NM_018318:exon11:c.G1102A:p.E368K	NaN	NaN	NaN	.	.	0.996	D	0.99	D	0.000	D	0.918	D	0.345	N	1.22	T	-0.768	T	0.194	T	0.72	4.126	21.3	5.83	2.756	5.342	15.616	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.725038	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	40	37	3	0
chr12	28637115	28637115	G	A	intronic	CCDC91	NaN	NaN	NaN	rs1511550	NaN	0.128195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	104.914084	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	0	35	32
chr12	2909765	2909765	T	T	intronic	FKBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr12	2909768	2909768	A	A	intronic	FKBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	2910537	2910537	G	T	intronic	FKBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.309805	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	108	97	11	0
chr12	2930373	2930373	T	T	intronic	ITFG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	18	15	0	0
chr12	2932839	2932839	T	T	intronic	ITFG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	29362419	29362419	G	C	intronic	FAR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	2937269	2937269	A	A	intronic	NRIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	29446286	29446286	T	C	exonic	FAR2	NaN	synonymous SNV	FAR2:NM_001271783:exon3:c.T243C:p.A81A,FAR2:NM_018099:exon3:c.T243C:p.A81A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.212633	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	662	654	8	0
chr12	29464882	29464882	G	T	exonic	FAR2	NaN	nonsynonymous SNV	FAR2:NM_001271784:exon7:c.G663T:p.M221I,FAR2:NM_001271783:exon8:c.G954T:p.M318I,FAR2:NM_018099:exon8:c.G954T:p.M318I	NaN	NaN	NaN	0.68	T	0.001	B	0.001	B	0.000	D	0.989	D	0.73	N	2.07	T	-1.046	T	0.026	T	0.227	-0.034	3.838	3.99	2.411	2.342	6.398	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.069615	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	85	76	9	0
chr12	29496241	29496241	A	G	intronic	ERGIC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	20	4	16	0
chr12	29502905	29502905	T	C	intronic	ERGIC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.471789	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	182	169	13	0
chr12	2964376	2964376	A	A	ncRNA_intronic	LOC100507424	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	29668296	29668296	T	A	intronic	TMTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	11	0	11	0
chr12	29668297	29668297	A	C	intronic	TMTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	11	0	11	0
chr12	29725028	29725028	T	C	intronic	TMTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.658808		KEEP	89	81	8	0
chr12	2977930	2977930	A	A	intronic	FOXM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr12	3018689	3018689	T	A	intronic	TULP3	NaN	NaN	NaN	rs75726969	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	3.021625	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	43	38	5	0
chr12	3040175	3040175	T	G	intronic	TULP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.756983	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	151	134	17	0
chr12	3043787	3043787	A	A	intronic	TULP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	305254	305254	T	C	intronic	SLC6A12	NaN	NaN	NaN	rs533572	NaN	0.714058	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	75.1047	0	NaN	NA	NA	25	0	25	20
chr12	306104	306104	A	G	intronic	SLC6A12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr12	307020	307020	A	A	intronic	SLC6A12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	45	39	0	0
chr12	30876260	30876260	A	T	intronic	CAPRIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	128	98	30	0
chr12	30906707	30906707	A	A	UTR5	CAPRIN2	NM_023925:c.-10T>T,NM_032156:c.-10T>T,NM_001206856:c.-10T>T,NM_001002259:c.-10T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr12	31117041	31117041	AGTGGGAGGGGCTGAGGCT	A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	25.215	0	NaN	NA	NA	9	4	4	2
chr12	31135478	31135478	T	C	exonic	TSPAN11	NaN	synonymous SNV	TSPAN11:NM_001080509:exon6:c.T468C:p.C156C	rs35089	ID=COSM431013;OCCURENCE=1(breast)	0.951478	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.782807	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	47
chr12	31135579	31135579	T	T	exonic	TSPAN11	NaN	synonymous SNV	TSPAN11:NM_001080509:exon6:c.T569T:p.V190V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr12	311949	311949	A	G	exonic	SLC6A12	NaN	synonymous SNV	SLC6A12:NM_001206931:exon4:c.T447C:p.T149T,SLC6A12:NM_001122847:exon5:c.T447C:p.T149T,SLC6A12:NM_001122848:exon5:c.T447C:p.T149T,SLC6A12:NM_003044:exon6:c.T447C:p.T149T	rs216250	NaN	0.616014	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	207.602319	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	76	0	76	38
chr12	31249319	31249319	T	C	intronic	DDX11	NaN	NaN	NaN	rs71455621	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	26.5491	0	NaN	NA	NA	12	7	5	1
chr12	31256368	31256368	G	T	intronic	DDX11	NaN	NaN	NaN	rs3925642	NaN	0.632188	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1151.48	0	NaN	NA	NA	130	0	130	39
chr12	31256546	31256546	G	A	exonic	DDX11	NaN	nonsynonymous SNV	DDX11:NM_004399:exon25:c.G2422A:p.V808I,DDX11:NM_001257144:exon26:c.G2567A:p.R856H,DDX11:NM_001257145:exon26:c.G2494A:p.V832I,DDX11:NM_030653:exon26:c.G2572A:p.V858I,DDX11:NM_152438:exon26:c.G2567A:p.R856H	rs1046457	NaN	0.634185	1	T	0.001	B	0.0	B	0.280	N	0.000	P	.	.	-2.76	D	-0.942	T	0.000	T	0.288	-1.428	0.021	3.14	0.313	2.796	6.492	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1109.06	0	NaN	NA	NA	161	0	161	32
chr12	3126509	3126509	G	G	intronic	TEAD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	3128388	3128388	C	G	intronic	TEAD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	20	10	10	0
chr12	3129753	3129753	G	G	intronic	TEAD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	31374799	31374799	C	T	intergenic	DDX11,FAM60A	dist=117074;dist=58721	NaN	NaN	rs6487981	NaN	0.610623	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr12	31448186	31448186	T	G	exonic	FAM60A	NaN	synonymous SNV	FAM60A:NM_001135812:exon3:c.A210C:p.S70S,FAM60A:NM_001135811:exon4:c.A210C:p.S70S,FAM60A:NM_021238:exon4:c.A210C:p.S70S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.17142857142857418	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr12	31542191	31542191	A	G	intronic	DENND5B	NaN	NaN	NaN	rs10843937	NaN	0.470847	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	200.287741	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	142	65	77	42
chr12	31600400	31600400	G	A	intronic	DENND5B	NaN	NaN	NaN	rs7976644	NaN	0.653954	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.063458	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	20	16	53
chr12	31769501	31769501	G	C	intergenic	DENND5B-AS1,METTL20	dist=1216;dist=30593	NaN	NaN	rs498080	NaN	0.870208	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr12	31820545	31820545	T	C	intronic	METTL20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr12	3207241	3207241	C	T	intronic	TSPAN9	NaN	NaN	NaN	rs66707615	NaN	0.152157	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr12	32134638	32134638	T	C	exonic	KIAA1551	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA1551:NM_018169:exon4:c.T749C:p.L250P	rs2166807	NaN	0.840256	.	.	0.0	B	0.0	B	0.386	N	1.000	P	-1.1	N	4.06	T	-1.022	T	0.000	T	0.424	-0.890	0.460	4.69	1.412	0.959	8.221	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2777.47	0	NaN	NA	NA	245	0	245	35
chr12	32369413	32369413	A	A	intronic	BICD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	18	18	0	0
chr12	32415366	32415366	T	C	intronic	BICD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	32481369	32481369	C	T	exonic	BICD1	NaN	synonymous SNV	BICD1:NM_001003398:exon5:c.C1980T:p.A660A,BICD1:NM_001714:exon5:c.C1980T:p.A660A	rs34447944	ID=COSM1361245;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.0463259	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	297	158	139	7
chr12	32491656	32491656	T	T	intronic	BICD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	131	95	0	0
chr12	32751596	32751596	A	T	intronic	FGD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr12	32763617	32763617	T	T	intronic	FGD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	22	18	0	0
chr12	32764036	32764036	T	T	intronic	FGD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	32866116	32866116	T	G	intronic	DNM1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	32886769	32886769	A	A	intronic	DNM1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	32892964	32892964	T	G	intronic	DNM1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	32892996	32892996	A	G	splicing	DNM1L	NM_012062:exon17:c.1708-2A>G,NM_001278465:exon17:c.1714-2A>G,NM_012063:exon16:c.1630-2A>G,NM_001278466:exon14:c.1099-2A>G,NM_005690:exon15:c.1597-2A>G,NM_001278464:exon18:c.1747-2A>G,NM_001278463:exon16:c.1675-2A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.452	17.69	6.17	2.371	5.277	13.229	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.044906	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	129	125	4	0
chr12	32948971	32948971	C	T	intronic	PKP2	NaN	NaN	NaN	rs61927769	NaN	0.249401	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3651.95	0	NaN	NA	NA	11	0	11	35
chr12	32955512	32955512	A	A	intronic	PKP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr12	32955516	32955516	G	C	intronic	PKP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr12	33022023	33022023	A	A	intronic	PKP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	24	23	0	0
chr12	33049590	33049590	C	T	exonic	PKP2	NaN	nonsynonymous SNV	PKP2:NM_001005242:exon1:c.G76A:p.D26N,PKP2:NM_004572:exon1:c.G76A:p.D26N	rs143004808	NaN	0.00299521	0.06	T	0.992	D	0.874	P	0.004	N	0.999	D	0.895	L	-1.72	D	0.033	D	0.451	T	0.042	5.291	33	4.07	2.081	3.560	15.410	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	24.7328	0	7.490514	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	8	4	1
chr12	331079	331079	A	A	intronic	SLC6A13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	3327889	3327889	G	C	intronic	TSPAN9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	3327890	3327890	G	A	intronic	TSPAN9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	333098	333098	A	C	intronic	SLC6A13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	333100	333100	G	T	intronic	SLC6A13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	333101	333101	T	C	intronic	SLC6A13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	33532933	33532933	A	A	intronic	SYT10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	11	6	0	0
chr12	33535510	33535510	T	G	intronic	SYT10	NaN	NaN	NaN	rs74075211	NaN	0.264776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2291.69	0	NaN	NA	NA	229	2	227	28
chr12	3387014	3387014	G	G	intronic	TSPAN9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	3390584	3390584	A	A	intronic	TSPAN9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	34175357	34175357	A	G	UTR5	ALG10	NM_032834:c.-178A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr12	34362313	34362313	T	G	intergenic	ALG10,NONE	dist=181077;dist=NONE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	13	0	13	0
chr12	34362317	34362317	A	G	intergenic	ALG10,NONE	dist=181081;dist=NONE	NaN	NaN	rs75830137	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	13	0	13	0
chr12	34362320	34362320	T	G	intergenic	ALG10,NONE	dist=181084;dist=NONE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	13	0	10	0
chr12	34362350	34362350	T	C	intergenic	ALG10,NONE	dist=181114;dist=NONE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	3437397	3437397	G	C	intergenic	TSPAN9,PRMT8	dist=41667;dist=53118	NaN	NaN	rs992899	NaN	0.719449	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	34431006	34431006	C	T	intergenic	ALG10,NONE	dist=249770;dist=NONE	NaN	NaN	rs77324264	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr12	3689753	3689753	T	G	intronic	PRMT8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	3712013	3712013	C	T	intergenic	PRMT8,CRACR2A	dist=8875;dist=12481	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	3750812	3750812	G	A	intronic	CRACR2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	3750814	3750814	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	0	2,2	0
chr12	3763373	3763373	C	G	intronic	CRACR2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.97732	0	NaN	NA	NA	29	24	2	0
chr12	3782720	3782720	T	C	exonic	CRACR2A	NaN	nonsynonymous SNV	CRACR2A:NM_001144958:exon7:c.A563G:p.K188R,CRACR2A:NM_032680:exon7:c.A563G:p.K188R	NaN	NaN	NaN	.	.	0.999	D	0.994	D	0.000	N	0.752	N	1.385	L	2.59	T	-0.582	T	0.281	T	0.071	0.889	8.611	4.75	1.765	4.356	12.227	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.048386	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	314	306	8	0
chr12	3805814	3805814	T	T	intronic	CRACR2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr12	38478752	38478752	C	C	intergenic	NONE,ALG10B	dist=NONE;dist=231805	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	38482916	38482916	T	T	intergenic	NONE,ALG10B	dist=NONE;dist=227641	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	38482918	38482918	T	T	intergenic	NONE,ALG10B	dist=NONE;dist=227639	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	38482921	38482921	G	G	intergenic	NONE,ALG10B	dist=NONE;dist=227636	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	38482922	38482922	C	C	intergenic	NONE,ALG10B	dist=NONE;dist=227635	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	38493586	38493586	G	C	intergenic	NONE,ALG10B	dist=NONE;dist=216971	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	11	0	11	0
chr12	38493642	38493642	A	G	intergenic	NONE,ALG10B	dist=NONE;dist=216915	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	32	1	30	0
chr12	38493661	38493661	C	G	intergenic	NONE,ALG10B	dist=NONE;dist=216896	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	26	2	24	0
chr12	39233571	39233571	T	T	intronic	CPNE8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	39266792	39266792	A	G	intronic	CPNE8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	53	35	12	0
chr12	39299470	39299470	T	T	upstream	CPNE8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr12	39299471	39299471	G	G	upstream	CPNE8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr12	394608	394608	T	T	UTR3	KDM5A	NM_001042603:c.*14A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	16	13	0	0
chr12	39723948	39723948	T	T	intronic	KIF21A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	39751039	39751039	T	T	intronic	KIF21A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	40013486	40013486	A	C	UTR5	ABCD2	NM_005164:c.-69T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	14	7	7	0
chr12	40041844	40041844	T	C	intronic	C12orf40	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.220917	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	361	338	23	0
chr12	40153775	40153775	T	TC	UTR3	SLC2A13	NM_052885:c.*53A>GA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.59813	0	NaN	NA	NA	14	13	3	0
chr12	40344924	40344924	T	T	intronic	SLC2A13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	40345296	40345296	A	A	intronic	SLC2A13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	40643772	40643772	A	G	intronic	LRRK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	17	5	12	0
chr12	40645257	40645257	C	A	intronic	LRRK2	NaN	NaN	NaN	rs7955902	NaN	0.319489	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	364.067968	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	118	1	117	36
chr12	40657771	40657771	C	G	intronic	LRRK2	NaN	NaN	NaN	rs10784462	NaN	0.400359	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	505.922	0	NaN	NA	NA	44	0	44	32
chr12	40671729	40671729	T	T	exonic	LRRK2	NaN	synonymous SNV	LRRK2:NM_198578:exon17:c.T1981T:p.S661S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	64	55	0	0
chr12	40715850	40715850	C	T	exonic	LRRK2	NaN	synonymous SNV	LRRK2:NM_198578:exon36:c.C5184T:p.R1728R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.0029091101340574512	NA	0	0	29.823585	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	71	55	16	0
chr12	40716323	40716323	A	A	intronic	LRRK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr12	40722183	40722183	T	C	exonic	LRRK2	NaN	nonsynonymous SNV	LRRK2:NM_198578:exon39:c.T5678C:p.V1893A	NaN	NaN	NaN	0	D	0.995	D	0.986	D	0.000	D	1.000	D	3.44	M	-4.83	D	1.088	D	0.971	D	0.924	4.553	24.6	5.02	2.125	6.708	14.957	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.46034	0	NaN	NA	NA	13	11	2	0
chr12	40742254	40742254	G	A	exonic	LRRK2	NaN	synonymous SNV	LRRK2:NM_198578:exon43:c.G6324A:p.E2108E	rs10878405	NaN	0.273762	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	50.1428	0	NaN	NA	NA	23	0	23	0
chr12	40748395	40748395	G	A	intronic	LRRK2	NaN	NaN	NaN	rs890575	NaN	0.703075	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1530.01	0	NaN	NA	NA	143	0	143	44
chr12	40758923	40758923	A	A	intronic	LRRK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr12	40761592	40761592	A	T	UTR3	LRRK2	NM_198578:c.*25A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	40764269	40764269	T	C	intergenic	LRRK2,MUC19	dist=1183;dist=22927	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	40764271	40764271	G	T	intergenic	LRRK2,MUC19	dist=1185;dist=22925	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	40764272	40764272	C	T	intergenic	LRRK2,MUC19	dist=1186;dist=22924	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	40929594	40929594	C	A	exonic	MUC19	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-1.009	T	0.058	T	.	-0.682	1.030	-0.391	-0.214	-0.290	.	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	41122608	41122608	G	A	intronic	CNTN1	NaN	NaN	NaN	rs115972811	NaN	0.0219649	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	41327426	41327426	T	G	intronic	CNTN1	NaN	NaN	NaN	rs55976072	NaN	0.0732827	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	121.601	0	NaN	NA	NA	120	81	39	0
chr12	41352873	41352873	T	T	intronic	CNTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr12	416672	416672	T	C	exonic	KDM5A	NaN	nonsynonymous SNV	KDM5A:NM_001042603:exon23:c.A3878G:p.E1293G	NaN	NaN	NaN	0.13	T	0.991	D	0.796	P	0.000	D	1.000	D	0.975	L	-1.81	D	0.163	D	0.584	D	0.739	4.356	22.9	5.66	2.283	7.997	16.176	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.913436	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	322	314	8	0
chr12	419050	419050	T	C	exonic	KDM5A	NaN	synonymous SNV	KDM5A:NM_001042603:exon22:c.A3297G:p.K1099K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.564554	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	232	221	11	0
chr12	4231804	4231804	C	T	intergenic	PARP11,CCND2-AS1	dist=249190;dist=126129	NaN	NaN	rs2003578	NaN	0.381989	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	42707437	42707437	C	G	intronic	ZCRB1	NaN	NaN	NaN	rs3761677	ID=COSN164218;OCCURENCE=1(NS)	0.234824	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	163.459368	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	179	98	81	38
chr12	42707809	42707809	G	A	intronic	ZCRB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.495787	nearby_gap_events	REJECT	131	118	13	0
chr12	42707811	42707811	A	G	intronic	ZCRB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.340453	nearby_gap_events	REJECT	146	133	13	0
chr12	427213	427213	T	T	intronic	KDM5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	427254	427254	T	C	intronic	KDM5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.401854	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	358	350	8	0
chr12	42749072	42749072	T	C	intronic	PPHLN1	NaN	NaN	NaN	rs17091102	NaN	0.18151	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	181.175653	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	140	65	75	9
chr12	42768570	42768570	T	T	intronic	PPHLN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	56	49	0	0
chr12	42853632	42853632	G	A	exonic	PRICKLE1	NaN	synonymous SNV	PRICKLE1:NM_001144881:exon8:c.C2475T:p.G825G,PRICKLE1:NM_001144882:exon8:c.C2475T:p.G825G,PRICKLE1:NM_001144883:exon8:c.C2475T:p.G825G,PRICKLE1:NM_153026:exon8:c.C2475T:p.G825G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.547799	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	77	71	6	0
chr12	43822448	43822448	T	T	exonic	ADAMTS20	NaN	synonymous SNV	ADAMTS20:NM_025003:exon25:c.A3644A:p.D1215D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	103	86	0	0
chr12	43823521	43823521	C	T	exonic	ADAMTS20	NaN	nonsynonymous SNV	ADAMTS20:NM_025003:exon24:c.G3388A:p.V1130I	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.002	B	0.006	B	0.466	N	1.000	D	0.03	N	0.61	T	-1.026	T	0.060	T	0.022	0.792	8.171	-3.14	-0.465	0.190	6.668	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.686473	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	51	47	4	0
chr12	43826302	43826302	G	T	intronic	ADAMTS20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.028408	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	101	88	13	0
chr12	43826304	43826304	A	G	intronic	ADAMTS20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.001750803307620296	NA	0	0	13.361875	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	79	66	13	0
chr12	44130132	44130132	A	C	intronic	PUS7L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.632283	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	113	102	11	0
chr12	44136101	44136101	G	C	intronic	PUS7L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	15	9	6	0
chr12	44136102	44136102	A	C	intronic	PUS7L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	19	12	7	0
chr12	44180542	44180542	A	A	UTR3	IRAK4	NM_001145257:c.*24A>A,NM_001145256:c.*24A>A,NM_001145258:c.*24A>A,NM_001114182:c.*24A>A,NM_016123:c.*24A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr12	44196308	44196308	A	G	intronic	TWF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr12	44338153	44338153	T	A	intronic	TMEM117	NaN	NaN	NaN	rs6582491	NaN	0.982228	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2533.43	0	NaN	NA	NA	249	0	249	53
chr12	44537235	44537235	T	T	intronic	TMEM117	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	4459048	4459048	A	G	exonic	C12orf5	NaN	nonsynonymous SNV	C12orf5:NM_020375:exon4:c.A256G:p.R86G	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.998	D	0.96	D	0.000	D	0.986	D	1.14	L	-0.7	T	-0.384	T	0.371	T	0.865	1.594	11.29	3.39	0.841	1.775	11.411	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.603724	nearby_gap_events	REJECT	47	42	5	0
chr12	44782165	44782165	A	G	exonic	TMEM117	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM117:NM_001286212:exon7:c.A943G:p.K315E,TMEM117:NM_001286213:exon7:c.A823G:p.K275E,TMEM117:NM_032256:exon8:c.A1255G:p.K419E	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.264	B	0.055	B	0.000	D	1.000	D	1.61	L	0.89	T	-1.022	T	0.108	T	0.13	3.611	18.38	5.73	2.180	7.424	16.032	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.877344	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	381	359	22	0
chr12	44926549	44926549	A	A	intronic	NELL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr12	45001048	45001048	C	T	splicing	NELL2	NM_001145109:exon16:c.1565-1G>A,NM_001145110:exon17:c.1637-1G>A,NM_001145107:exon17:c.1718-1G>A,NM_001145108:exon16:c.1568-1G>A,NM_006159:exon17:c.1568-1G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.237	22.0	5.68	2.838	6.896	20.147	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	7.551762288697307E-14	Somatic	190.447	23	209.355461	nearby_gap_events	REJECT	495	373	122	0
chr12	45209723	45209723	A	G	intronic	NELL2	NaN	NaN	NaN	rs34034808	NaN	0.0632987	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.686562	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	0	12	10
chr12	45445093	45445093	A	C	upstream	DBX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	45445095	45445095	C	A	upstream	DBX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	4553255	4553255	T	T	intronic	FGF6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	45610302	45610302	G	T	intronic	ANO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	51.2821	0	NaN	NA	NA	28	16	12	0
chr12	45797121	45797121	T	A	intronic	ANO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.140827	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	213	199	14	0
chr12	45814843	45814843	T	A	intronic	ANO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	45816894	45816894	A	A	intronic	ANO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	21	15	0	0
chr12	46233011	46233011	T	C	intronic	ARID2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	46233013	46233013	A	C	intronic	ARID2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr12	46339005	46339005	A	T	intronic	SCAF11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.347028	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	116	109	7	0
chr12	4638959	4638959	A	T	intronic	C12orf4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.667441	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	172	155	17	0
chr12	4639044	4639044	A	T	exonic	C12orf4	NaN	stopgain	C12orf4:NM_001304811:exon4:c.T497A:p.L166X,C12orf4:NM_020374:exon4:c.T497A:p.L166X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	7.729	39	5.4	2.176	8.780	14.298	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.63682	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	191	173	18	0
chr12	4639046	4639046	T	A	exonic	C12orf4	NaN	nonsynonymous SNV	C12orf4:NM_001304811:exon4:c.A495T:p.K165N,C12orf4:NM_020374:exon4:c.A495T:p.K165N	NaN	NaN	NaN	0.33	T	0.015	B	0.018	B	0.000	D	1.000	D	0.865	L	.	.	-1.058	T	0.110	T	0.337	1.543	11.11	0.023	0.124	0.166	9.998	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.920047	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	135	117	18	0
chr12	4643492	4643492	A	A	intronic	C12orf4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	4645034	4645034	T	T	intronic	C12orf4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	465580	465580	T	C	intronic	KDM5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr12	4657461	4657461	A	A	intronic	RAD51AP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr12	46592562	46592562	A	A	intronic	SLC38A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr12	46758494	46758494	A	G	intronic	SLC38A2	NaN	NaN	NaN	rs2307061	NaN	0.759385	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	76.0029	0	NaN	NA	NA	80	50	30	34
chr12	46760530	46760530	T	C	intronic	SLC38A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	13	6	5	0
chr12	4700360	4700360	A	G	exonic	DYRK4	NaN	nonsynonymous SNV	DYRK4:NM_003845:exon3:c.A14G:p.E5G	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.978	D	0.736	P	0.473	N	1.000	D	1.79	L	-0.17	T	-0.747	T	0.324	T	0.35	4.549	24.6	4.34	1.911	1.018	10.475	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.072014	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	23	20	3	0
chr12	47162211	47162211	C	T	intronic	SLC38A4	NaN	NaN	NaN	rs2465583	NaN	0.211262	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	181.731524	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	63	0	63	35
chr12	47170910	47170910	A	G	intronic	SLC38A4	NaN	NaN	NaN	rs2430922	NaN	0.165735	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	413.529965	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	133	0	133	34
chr12	47171878	47171878	A	G	intronic	SLC38A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	47172199	47172199	G	A	intronic	SLC38A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.497205	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	208	201	7	0
chr12	47172581	47172581	G	G	intronic	SLC38A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	51	33	0	0
chr12	47172582	47172582	A	G	intronic	SLC38A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.180139	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	42	34	8	0
chr12	47173662	47173662	A	G	intronic	SLC38A4	NaN	NaN	NaN	rs180426	NaN	0.583866	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	196.232774	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	75	1	74	54
chr12	47173956	47173956	A	G	intronic	SLC38A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr12	47173965	47173965	T	G	intronic	SLC38A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	47173967	47173967	C	T	intronic	SLC38A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	47179042	47179042	A	T	intronic	SLC38A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	47179045	47179045	T	G	intronic	SLC38A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	47179047	47179047	A	G	intronic	SLC38A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	4719251	4719251	A	C	intronic	DYRK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	17	11	4	0
chr12	4736678	4736678	T	C	exonic	AKAP3	NaN	nonsynonymous SNV	AKAP3:NM_001278309:exon5:c.A1390G:p.T464A,AKAP3:NM_006422:exon5:c.A1390G:p.T464A	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.012	B	0.009	B	0.768	N	1.000	N	0	N	3.3	T	-0.941	T	0.012	T	0.029	0.256	5.383	3.31	0.474	0.931	7.435	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.845366	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	78	72	6	0
chr12	47630209	47630209	A	A	UTR3	PCED1B	NM_138371:c.*64A>A,NM_001281429:c.*64A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	47630222	47630222	A	T	UTR3	PCED1B	NM_138371:c.*77A>T,NM_001281429:c.*77A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	4767021	4767021	T	C	intronic	NDUFA9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.551123	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	33	29	4	0
chr12	48083042	48083042	A	C	intronic	RPAP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.910486	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	39	33	6	1
chr12	48104746	48104746	G	C	intronic	ENDOU	NaN	NaN	NaN	rs1235152	NaN	0.786542	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	164.848494	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	0	52	53
chr12	48107003	48107003	A	C	intronic	ENDOU	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	48107010	48107010	T	C	intronic	ENDOU	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr12	48107011	48107011	T	G	intronic	ENDOU	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	10	5	3	0
chr12	48110012	48110012	T	C	intronic	ENDOU	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	21	13	8	0
chr12	48111895	48111895	T	G	intronic	ENDOU	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.625175	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	464	452	12	0
chr12	48134361	48134361	G	T	intronic	RAPGEF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.787324	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	66	60	6	0
chr12	48145171	48145171	C	T	intronic	RAPGEF3	NaN	NaN	NaN	rs757286	NaN	0.391973	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	345.713	30	NaN	NA	NA	126	63	63	8
chr12	48148698	48148698	C	C	intronic	RAPGEF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	48173907	48173907	T	T	intronic	SLC48A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	48181997	48181997	A	C	intronic	HDAC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	23	5	18	0
chr12	48183408	48183408	A	A	intronic	HDAC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	48183750	48183750	G	T	intronic	HDAC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	48189469	48189469	G	G	exonic	HDAC7	NaN	synonymous SNV	HDAC7:NM_001098416:exon9:c.C877C:p.P293P,HDAC7:NM_015401:exon10:c.C988C:p.P330P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr12	48189470	48189470	C	C	exonic	HDAC7	NaN	synonymous SNV	HDAC7:NM_001098416:exon9:c.G876G:p.L292L,HDAC7:NM_015401:exon10:c.G987G:p.L329L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr12	48190166	48190166	G	A	intronic	HDAC7	NaN	NaN	NaN	rs11831940	NaN	0.196685	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.820713	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	19	14	29
chr12	48191871	48191871	G	A	intronic	HDAC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.90573	0	NaN	NA	NA	14	12	2	0
chr12	48212558	48212558	G	T	intronic	HDAC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr12	48240609	48240609	A	G	intronic	VDR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	2	5	0
chr12	48244434	48244434	G	C	intronic	VDR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	48244435	48244435	G	T	intronic	VDR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	48251617	48251617	A	A	intronic	VDR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr12	4830092	4830092	G	T	intronic	GALNT8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.736479	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	121	115	6	0
chr12	4836020	4836020	C	T	intronic	GALNT8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	4836022	4836022	A	A	intronic	GALNT8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	48362071	48362071	A	A	UTR3	TMEM106C	NM_001143841:c.*59A>A,NM_024056:c.*59A>A,NM_001143842:c.*59A>A,NM_001143843:c.*59A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr12	48364761	48364761	G	G	intergenic	TMEM106C,COL2A1	dist=2100;dist=1987	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	48373357	48373357	G	A	intronic	COL2A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.46145	0	NaN	NA	NA	13	11	2	3
chr12	48374492	48374492	C	T	intronic	COL2A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.659477	nearby_gap_events	REJECT	58	52	6	0
chr12	48374648	48374648	T	T	intronic	COL2A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	48374785	48374785	C	G	intronic	COL2A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.007194217547052483	NA	0	0	NaN	NA	NA	28	16	12	0
chr12	48375668	48375668	C	A	intronic	COL2A1	NaN	NaN	NaN	rs41263861	NaN	0.0335463	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.564614	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	15	11	9
chr12	48376574	48376574	G	A	intronic	COL2A1	NaN	NaN	NaN	rs55967487	NaN	0.0277556	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	78.428073	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	61	28	33	9
chr12	48377298	48377298	A	A	intronic	COL2A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr12	48377635	48377635	A	G	intronic	COL2A1	NaN	NaN	NaN	rs10219510	NaN	0.0271565	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	94.168917	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	92	50	42	9
chr12	48378933	48378933	C	G	intronic	COL2A1	NaN	NaN	NaN	rs56006800	NaN	0.0373403	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	68.3627	0	NaN	NA	NA	70	47	23	6
chr12	48389825	48389825	C	T	intronic	COL2A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	48398002	48398002	G	C	intronic	COL2A1	NaN	NaN	NaN	rs3803184	NaN	0.685903	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.160901	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	53
chr12	48398080	48398080	T	A	exonic	COL2A1	NaN	nonsynonymous SNV	COL2A1:NM_001844:exon1:c.A25T:p.T9S,COL2A1:NM_033150:exon1:c.A25T:p.T9S	rs3803183	NaN	0.685304	0.9	T	0.0	B	0.001	B	0.000	N	0.923	P	0	N	-2.43	D	-0.948	T	0.000	T	0.07	2.395	13.97	2.88	0.486	1.888	7.296	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.817158	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	38
chr12	48439173	48439173	G	A	intronic	SENP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	210	166	44	0
chr12	48440052	48440052	T	G	intronic	SENP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	48443048	48443048	T	C	intronic	SENP1	NaN	NaN	NaN	rs7975632	NaN	0.820288	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	358.167145	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	116	0	116	47
chr12	48468589	48468589	A	C	intronic	SENP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2582559339525296	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr12	4848557	4848557	A	T	intronic	GALNT8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr12	48490033	48490033	T	T	intronic	SENP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr12	48490035	48490035	T	G	intronic	SENP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.707063	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	107	100	7	0
chr12	48491688	48491688	T	C	intronic	SENP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	48491689	48491689	T	T	intronic	SENP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	48491690	48491690	T	G	intronic	SENP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	48504626	48504626	G	A	intronic	PFKM	NaN	NaN	NaN	rs77942811	NaN	0.0275559	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	48528385	48528385	T	T	intronic	PFKM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	15	14	0	0
chr12	48533234	48533234	T	T	intronic	PFKM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	48535500	48535500	C	C	intronic	PFKM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr12	48543865	48543865	A	A	intronic	ASB8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	48723595	48723595	G	A	exonic	H1FNT	NaN	nonsynonymous SNV	H1FNT:NM_181788:exon1:c.G521A:p.R174Q	rs1471997	NaN	0.161142	0.14	T	0.032	B	0.006	B	0.154	N	1.000	P	1.32	L	2.18	T	-0.989	T	0.000	T	0.034	1.867	12.20	-1.27	-0.379	0.557	1.784	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	58.859136	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	55	29	26	23
chr12	48737345	48737345	A	G	exonic	ZNF641	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF641:NM_001172682:exon5:c.T659C:p.L220P,ZNF641:NM_001172681:exon6:c.T686C:p.L229P,ZNF641:NM_152320:exon7:c.T728C:p.L243P	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.028	B	0.018	B	0.008	N	1.000	D	1.245	L	3.25	T	-1.030	T	0.020	T	0.379	2.094	12.96	4.44	2.266	2.285	10.232	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.766864	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	116	111	5	0
chr12	48739300	48739300	A	A	intronic	ZNF641	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	48743717	48743717	T	T	intronic	ZNF641	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	48880614	48880614	A	A	intronic	C12orf54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	48919659	48919659	T	C	exonic	OR8S1	NaN	nonsynonymous SNV	OR8S1:NM_001005203:exon1:c.T245C:p.L82P	rs4075258	NaN	0.578275	0	D	1.0	D	0.992	D	0.006	N	0.000	P	3.885	H	7.41	T	-1.097	T	0.000	T	0.485	3.831	19.46	5.03	2.105	4.302	12.762	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.894072	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	10	14	3
chr12	48919660	48919660	G	A	exonic	OR8S1	NaN	synonymous SNV	OR8S1:NM_001005203:exon1:c.G246A:p.L82L	rs35367885	NaN	0.226837	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.715479	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	10	14	0
chr12	49061511	49061511	T	C	exonic	KANSL2	NaN	nonsynonymous SNV	KANSL2:NM_017822:exon7:c.A938G:p.N313S	rs17238800	NaN	0.00838658	0.17	T	0.999	D	0.981	D	0.000	D	1.000	D	1.405	L	1.05	T	-0.976	T	0.080	T	0.099	4.104	21.1	5.68	2.289	2.692	15.204	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	69.603	0	NaN	NA	NA	49	30	19	2
chr12	49086763	49086763	A	G	UTR3	CCNT1	NM_001277842:c.*1515T>C,NM_001240:c.*53T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.37368	nearby_gap_events	REJECT	34	22	12	0
chr12	49091733	49091733	A	C	intronic	CCNT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.7594	0	NaN	NA	NA	16	12	4	20
chr12	49110223	49110223	C	A	intronic	CCNT1	NaN	NaN	NaN	rs11168699	NaN	0.121605	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	41.9295	0	NaN	NA	NA	26	16	11	9
chr12	49164825	49164825	T	C	intronic	ADCY6	NaN	NaN	NaN	rs9804777	NaN	0.110823	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	184.801	0	99.041656	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	75	36	39	10
chr12	49167610	49167610	T	G	intronic	ADCY6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr12	49167683	49167683	C	A	intronic	ADCY6	NaN	NaN	NaN	rs3730074	NaN	0.108427	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	63.4903	0	NaN	NA	NA	405	179	226	6
chr12	4919267	4919267	A	G	exonic	KCNA6	NaN	synonymous SNV	KCNA6:NM_002235:exon1:c.A60G:p.G20G	rs758534	NaN	0.447085	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.155263	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	22	6	29
chr12	49217593	49217593	GACC	CCGA,GAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	272.953	0	NaN	NA	NA	75	0	7	1
chr12	49219209	49219209	T	C	intronic	CACNB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	15	0	15	0
chr12	49219569	49219569	A	G	intronic	CACNB3	NaN	NaN	NaN	rs2453469	NaN	0.416733	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	98.115793	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	0	32	37
chr12	49220672	49220672	C	T	intronic	CACNB3	NaN	NaN	NaN	rs375340677	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	138.6	0	NaN	NA	NA	57	24	33	0
chr12	49221622	49221622	G	A	exonic	CACNB3	NaN	synonymous SNV	CACNB3:NM_001206915:exon12:c.G1272A:p.E424E,CACNB3:NM_000725:exon13:c.G1395A:p.E465E,CACNB3:NM_001206916:exon13:c.G1392A:p.E464E,CACNB3:NM_001206917:exon13:c.G1356A:p.E452E	rs1045340	NaN	0.432109	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	56.773307	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	23	27	37
chr12	49225132	49225132	A	C	intronic	DDX23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr12	49226169	49226169	T	T	intronic	DDX23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr12	49227035	49227035	T	C	intronic	DDX23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	3	5	0
chr12	49237681	49237681	T	G	intronic	DDX23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	20	12	8	0
chr12	49259373	49259373	T	A	intronic	RND1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	34	20	14	0
chr12	49298143	49298143	C	T	exonic	CCDC65	NaN	synonymous SNV	CCDC65:NM_033124:exon1:c.C24T:p.A8A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.125258	nearby_gap_events	REJECT	90	84	6	0
chr12	49319235	49319235	G	C	UTR5	FKBP11	NM_016594:c.-24C>G,NM_001143782:c.-24C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	15	9	6	0
chr12	49334713	49334713	T	T	intronic	ARF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr12	49362134	49362134	A	A	intronic	WNT10B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr12	49364365	49364365	A	A	intronic	WNT10B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	49390801	49390801	G	T	exonic	DDN	NaN	nonsynonymous SNV	DDN:NM_015086:exon2:c.C1858A:p.R620S	NaN	NaN	NaN	0	D	0.98	D	0.718	P	0.000	D	0.850	D	0.975	L	0.27	T	-0.557	T	0.196	T	0.718	3.830	19.45	3.21	1.321	5.026	11.850	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.344144	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	9	6	3	0
chr12	49391489	49391489	A	A	exonic	DDN	NaN	synonymous SNV	DDN:NM_015086:exon2:c.T1170T:p.P390P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	32	29	0	0
chr12	49398471	49398471	A	C	intronic	PRKAG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	21	15	4	0
chr12	49398473	49398473	C	G	intronic	PRKAG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	20	15	5	0
chr12	49399650	49399650	A	A	intronic	PRKAG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	4940592	4940592	G	G	intronic	KCNA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	4940594	4940594	G	G	intronic	KCNA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	49406736	49406736	T	T	intronic	PRKAG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	49406962	49406962	A	A	intronic	PRKAG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr12	49420905	49420905	T	A	exonic	KMT2D	NaN	synonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon48:c.A14844T:p.S4948S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	15	8.927252	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	13	9	4	0
chr12	49421215	49421215	A	A	intronic	KMT2D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	49421940	49421940	A	G	intronic	KMT2D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	49424254	49424254	A	A	intronic	KMT2D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr12	49425575	49425575	C	T	exonic	KMT2D	NaN	nonsynonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon39:c.G12913A:p.V4305I	rs199895011	NaN	0.000599042	0	D	0.039	B	0.01	B	0.097	N	1.000	N	0.55	N	-1.27	T	-0.858	T	0.229	T	0.104	0.832	8.357	4.2	2.643	1.561	6.158	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	187.518	0	NaN	NA	NA	49	17	32	0
chr12	49427850	49427850	C	T	exonic	KMT2D	NaN	synonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon38:c.G10740A:p.Q3580Q	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.837681	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	407	370	37	0
chr12	49431000	49431000	T	C	exonic	KMT2D	NaN	nonsynonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon34:c.A10139G:p.K3380R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.976	D	0.696	P	0.001	N	0.736	N	0.69	N	-1.3	T	-0.135	T	0.426	T	0.251	1.934	12.42	5.47	2.226	2.199	14.855	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.011333	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	215	193	22	0
chr12	49431144	49431144	G	C	exonic	KMT2D	NaN	nonsynonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon34:c.C9995G:p.T3332S	NaN	NaN	0.000199681	0	D	0.004	B	0.002	B	0.393	N	1.000	N	0	N	-1.15	T	-0.905	T	0.186	T	0.117	0.422	6.291	1.21	0.346	0.349	4.468	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.526388	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	72	68	4	0
chr12	49437339	49437339	T	C	intronic	KMT2D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.196402	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	208	201	7	0
chr12	49438050	49438050	G	A	exonic	KMT2D	NaN	synonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon21:c.C5121T:p.H1707H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.322925	nearby_gap_events	REJECT	343	325	18	0
chr12	49444478	49444478	C	T	exonic	KMT2D	NaN	nonsynonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon11:c.G2893A:p.G965R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.956	D	0.003	N	0.939	N	0	N	-1.98	D	-0.297	T	0.503	D	0.421	1.242	10.04	4.74	2.170	1.573	10.500	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2142857142857145	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr12	49444986	49444986	T	G	exonic	KMT2D	NaN	nonsynonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon10:c.A2480C:p.Q827P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.009	B	0.007	B	.	.	1.000	N	0	N	1.39	T	-0.999	T	0.035	T	0.196	-0.064	3.687	-7.24	-3.136	-6.696	3.900	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.54611	0	NaN	NA	NA	188	166	24	8
chr12	49445040	49445040	TG	GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.00226	0	NaN	NA	NA	17	14	3	4
chr12	49445046	49445046	G	A	exonic	KMT2D	NaN	nonsynonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon10:c.C2420T:p.S807F	NaN	NaN	NaN	0	D	0.94	P	0.283	B	.	.	0.896	N	0.805	L	1.11	T	-1.042	T	0.068	T	0.343	1.291	10.22	3.68	2.357	0.062	8.751	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.88781	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	12	7	5	0
chr12	49445047	49445047	A	G	exonic	KMT2D	NaN	nonsynonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon10:c.T2419C:p.S807P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.995	D	0.72	P	.	.	0.924	N	0.805	L	1.09	T	-1.006	T	0.117	T	0.412	1.833	12.09	3.68	1.910	0.562	10.957	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.842815	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	15	10	5	0
chr12	49445114	49445114	C	A	exonic	KMT2D	NaN	nonsynonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon10:c.G2352T:p.E784D	NaN	NaN	NaN	0	D	0.037	B	0.011	B	.	.	1.000	N	0.695	N	1.3	T	-1.026	T	0.060	T	0.075	2.490	14.29	2.87	1.151	0.346	8.835	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr12	49445115	49445115	T	A	exonic	KMT2D	NaN	nonsynonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon10:c.A2351T:p.E784V	NaN	NaN	NaN	0	D	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	N	0.345	N	1.27	T	-1.013	T	0.042	T	0.201	2.129	13.07	-0.007	-0.004	-0.157	0.817	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr12	49445149	49445149	G	T	exonic	KMT2D	NaN	nonsynonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon10:c.C2317A:p.Q773K	NaN	NaN	NaN	0	D	0.001	B	0.0	B	.	.	1.000	N	0.695	N	1.44	T	-1.011	T	0.053	T	0.111	1.671	11.55	1.69	0.426	-0.262	11.972	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.026223	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	140	131	9	0
chr12	49445825	49445825	T	G	exonic	KMT2D	NaN	synonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon10:c.A1641C:p.P547P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.904762	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	33	28	5	0
chr12	49446113	49446113	T	T	exonic	KMT2D	NaN	synonymous SNV	KMT2D:NM_003482:exon10:c.A1353A:p.P451P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	42	32	0	0
chr12	49449190	49449190	A	A	upstream	KMT2D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	49487803	49487803	T	A	intronic	DHH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr12	49487805	49487805	T	G	intronic	DHH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr12	49487808	49487808	T	C	intronic	DHH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr12	49487809	49487809	C	G	intronic	DHH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr12	49495782	49495782	A	T	intronic	LMBR1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.581583	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	43	38	5	0
chr12	49663561	49663561	T	C	intronic	TUBA1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	4	5	0
chr12	49691371	49691371	A	T	ncRNA_exonic	LOC101927267	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.051191	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	0	4	0
chr12	49691677	49691677	T	T	ncRNA_intronic	LOC101927267	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	49717880	49717880	A	T	ncRNA_intronic	LOC101927267	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.948509	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	56	48	8	0
chr12	49721166	49721166	A	G	intronic	TROAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	49723261	49723261	A	T	intronic	TROAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	38	7	31	0
chr12	49729629	49729629	C	C	intronic	C1QL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	45	39	0	0
chr12	49739400	49739400	C	A	intergenic	C1QL4,DNAJC22	dist=8429;dist=1300	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr12	49744924	49744924	C	T	intronic	DNAJC22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.797263	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	575	482	93	0
chr12	498234	498234	G	C	exonic	KDM5A	NaN	synonymous SNV	KDM5A:NM_001042603:exon1:c.C24G:p.G8G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	19	8	9	0
chr12	498235	498235	C	G	exonic	KDM5A	NaN	nonsynonymous SNV	KDM5A:NM_001042603:exon1:c.G23C:p.G8A	rs200083382	NaN	NaN	0.09	T	0.03	B	0.037	B	0.015	N	0.762	N	0.205	N	-1.01	T	-0.579	T	0.327	T	0.248	2.504	14.33	3.89	1.203	2.684	7.380	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	27	24.14149	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	5	11	0
chr12	49893889	49893889	G	A	exonic	SPATS2	NaN	nonsynonymous SNV	SPATS2:NM_001293286:exon8:c.G740A:p.R247H,SPATS2:NM_023071:exon9:c.G740A:p.R247H,SPATS2:NM_001293285:exon10:c.G740A:p.R247H	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.54	M	.	.	0.057	D	0.524	D	0.924	5.497	35	6.08	2.894	9.146	18.166	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.52081	0	NaN	NA	NA	20	17	3	0
chr12	49937827	49937827	A	A	exonic	KCNH3	NaN	synonymous SNV	KCNH3:NM_012284:exon6:c.A953A:p.D318D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr12	49937962	49937962	T	T	exonic	KCNH3	NaN	synonymous SNV	KCNH3:NM_012284:exon7:c.T986T:p.F329F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	24	20	0	0
chr12	49950313	49950313	A	A	intronic	KCNH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	49959298	49959298	T	G	intronic	MCRS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.920129	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	39	33	6	0
chr12	49959300	49959300	C	T	intronic	MCRS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.503895	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	38	32	6	0
chr12	49959303	49959303	A	C	intronic	MCRS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.770639	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	31	25	6	0
chr12	50026681	50026681	A	A	intronic	PRPF40B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	10	0	0
chr12	50026682	50026682	G	A	intronic	PRPF40B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr12	50027176	50027176	T	T	intronic	PRPF40B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	50027892	50027892	A	A	intronic	PRPF40B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr12	50027895	50027895	G	T	intronic	PRPF40B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr12	50027896	50027896	C	G	intronic	PRPF40B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	50031099	50031099	T	T	intronic	PRPF40B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	50036231	50036231	A	A	UTR3	FMNL3	NM_198900:c.*3367T>T,NM_175736:c.*3367T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr12	50036599	50036599	T	T	UTR3	FMNL3	NM_198900:c.*2999A>A,NM_175736:c.*2999A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr12	50037561	50037561	C	C	UTR3	FMNL3	NM_198900:c.*2037G>G,NM_175736:c.*2037G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	63	43	0	0
chr12	50044428	50044428	G	A	intronic	FMNL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	50047449	50047449	T	C	intronic	FMNL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	50152150	50152150	T	T	intronic	TMBIM6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	195	132	0	0
chr12	50187085	50187085	T	T	intronic	NCKAP5L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	50190235	50190235	T	G	exonic	NCKAP5L	NaN	nonsynonymous SNV	NCKAP5L:NM_001037806:exon8:c.A1408C:p.S470R	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.126	B	0.063	B	0.000	D	0.871	N	0.695	N	0.65	T	-1.008	T	0.080	T	0.307	2.266	13.54	3.49	1.880	1.204	8.993	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.631941	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	80	72	8	0
chr12	50197839	50197839	A	A	UTR5	NCKAP5L	NM_001037806:c.-12T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	5021228	5021228	T	C	exonic	KCNA1	NaN	synonymous SNV	KCNA1:NM_000217:exon2:c.T684C:p.C228C	rs1048500	ID=COSM1362235;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.489018	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.406387	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	18	7	39
chr12	5022037	5022037	C	A	UTR3	KCNA1	NM_000217:c.*5C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.717868	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	134	126	8	0
chr12	50281095	50281095	T	T	intronic	FAIM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	26	24	0	0
chr12	50282855	50282855	C	T	intronic	FAIM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.447344	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	38	31	7	0
chr12	50283257	50283257	A	G	intronic	FAIM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.033182	nearby_gap_events	REJECT	71	64	7	0
chr12	50291290	50291290	C	A	intronic	FAIM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.742993	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	42	37	5	0
chr12	50291291	50291291	T	G	intronic	FAIM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.151275	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	42	37	5	0
chr12	50311667	50311667	G	G	ncRNA_intronic	LOC101927292	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	50349090	50349090	A	G	ncRNA_intronic	LOC101927318	NaN	NaN	NaN	rs410837	NaN	0.881789	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	54.4224	0	NaN	NA	NA	7	0	6	34
chr12	50349143	50349143	C	G	ncRNA_intronic	LOC101927318	NaN	NaN	NaN	rs403201	NaN	0.666534	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	50.1422	0	18.053951	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	25
chr12	50358732	50358732	G	T	intronic	AQP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	17	11	5	0
chr12	50358733	50358733	G	C	intronic	AQP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	17	12	5	0
chr12	50358734	50358734	T	C	intronic	AQP5	NaN	NaN	NaN	rs370191507	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	20	14	6	0
chr12	50361100	50361100	G	A	intergenic	AQP5,AQP6	dist=1635;dist=5520	NaN	NaN	rs296762	NaN	0.485024	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr12	50385730	50385730	T	T	intronic	RACGAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	37	33	0	0
chr12	50436014	50436014	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	0	2,3	0
chr12	50457530	50457530	T	A	intronic	ASIC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	50473641	50473641	G	G	intronic	ASIC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	50482251	50482251	T	T	intronic	SMARCD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	50492489	50492489	T	T	intronic	SMARCD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	5	0	0
chr12	50497919	50497919	A	A	intronic	GPD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr12	50499400	50499400	T	A	exonic	GPD1	NaN	nonsynonymous SNV	GPD1:NM_001257199:exon3:c.T220A:p.F74I,GPD1:NM_005276:exon3:c.T289A:p.F97I	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.99	D	0.000	D	1.000	D	3.945	H	0.3	T	0.380	D	0.537	D	0.834	5.262	33	5.49	2.225	7.991	15.903	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.585602	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	10	6	4	0
chr12	50503269	50503269	C	T	exonic	GPD1	NaN	synonymous SNV	GPD1:NM_001257199:exon8:c.C948T:p.I316I,GPD1:NM_005276:exon8:c.C1017T:p.I339I	rs836180	NaN	0.205671	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	59.481469	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	25	25	38
chr12	50506253	50506253	C	C	UTR5	COX14	NM_001257134:c.-7574C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	50524513	50524513	A	G	intronic	CERS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr12	50524515	50524515	A	T	intronic	CERS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr12	50529736	50529736	G	A	exonic	CERS5	NaN	synonymous SNV	CERS5:NM_147190:exon7:c.C753T:p.D251D,CERS5:NM_001281731:exon8:c.C579T:p.D193D	rs3741562	NaN	0.314896	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-0.948	T	0.000	T	.	0.813	8.269	4.63	2.567	3.398	8.538	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	53.023659	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	80	44	36	30
chr12	50532246	50532246	T	T	intronic	CERS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	50535981	50535981	A	G	intronic	CERS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	55	10	43	0
chr12	50536767	50536767	A	C	intronic	CERS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	50537636	50537636	T	G	intronic	CERS5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	50586187	50586187	T	A	intronic	LIMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr12	50586398	50586398	A	A	intronic	LIMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	50721055	50721055	T	T	downstream	FAM186A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	50745719	50745719	C	A	exonic	FAM186A	NaN	synonymous SNV	FAM186A:NM_001145475:exon4:c.G4896T:p.A1632A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.662009	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	117	107	10	23
chr12	50745857	50745857	T	G	exonic	FAM186A	NaN	nonsynonymous SNV	FAM186A:NM_001145475:exon4:c.A4758C:p.E1586D	rs12297653	ID=COSM1362248;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.27516	0.49	T	0.413	B	0.131	B	.	.	1.000	N	0	N	3.63	T	-0.998	T	0.005	T	0.085	-0.711	0.936	-8.22	-3.428	-1.486	2.244	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	249.093	23	NaN	NA	NA	21	6	15	0
chr12	50745858	50745858	T	G	exonic	FAM186A	NaN	nonsynonymous SNV	FAM186A:NM_001145475:exon4:c.A4757C:p.E1586A	rs374020295	ID=COSM147512;OCCURENCE=1(stomach),1(large_intestine)	0.276358	1	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	-0.345	N	3.82	T	-0.936	T	0.004	T	0.099	-0.749	0.818	-8.22	-2.575	-1.314	11.046	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	40	5	35	0
chr12	50745863	50745863	C	G	exonic	FAM186A	NaN	synonymous SNV	FAM186A:NM_001145475:exon4:c.G4752C:p.A1584A	rs12317337	ID=COSM147513;OCCURENCE=1(stomach)	0.353035	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	62	NaN	NA	NA	39	4	35	51
chr12	50746348	50746348	A	C,G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	159.338	0	NaN	NA	NA	17	0	2	0
chr12	50747168	50747168	A	C	exonic	FAM186A	NaN	synonymous SNV	FAM186A:NM_001145475:exon4:c.T3447G:p.P1149P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.318079	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	46	42	4	0
chr12	50754731	50754731	A	T	intronic	FAM186A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.240457	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	206	190	16	0
chr12	50829238	50829238	T	G	intronic	LARP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	128.833268	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	102	47	55	1
chr12	50829536	50829536	A	T	intronic	LARP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	50829539	50829539	C	T	intronic	LARP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	51019839	51019839	T	A	intronic	DIP2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.332843	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	61	53	8	0
chr12	51019840	51019840	A	T	intronic	DIP2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.236929	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	44	36	8	0
chr12	51069013	51069013	C	T	intronic	DIP2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	6.114648862338261E-5	Somatic	224.151	146	133.590441	nearby_gap_events	REJECT	173	107	66	0
chr12	51072673	51072673	A	A	intronic	DIP2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	51076877	51076877	T	T	intronic	DIP2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	51084912	51084912	G	T	exonic	DIP2B	NaN	synonymous SNV	DIP2B:NM_173602:exon13:c.G1632T:p.S544S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	2.4212363525370955E-11	Somatic	59.2821	47	110.052368	nearby_gap_events	REJECT	215	161	54	0
chr12	51088979	51088979	T	G	intronic	DIP2B	NaN	NaN	NaN	rs34553264	NaN	0.320088	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.940166	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	17	10	27
chr12	51093025	51093025	A	A	intronic	DIP2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	51115209	51115209	A	A	intronic	DIP2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	51121474	51121474	T	C	intronic	DIP2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.77512	nearby_gap_events	REJECT	40	33	7	0
chr12	51121677	51121677	A	T	intronic	DIP2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	51128742	51128742	A	A	intronic	DIP2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	51128744	51128744	T	T	intronic	DIP2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	51203371	51203371	C	T	exonic	ATF1	NaN	synonymous SNV	ATF1:NM_005171:exon4:c.C327T:p.Y109Y	rs1129406	NaN	0.393371	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	130.391829	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	0	41	31
chr12	51203376	51203376	T	C	intronic	ATF1	NaN	NaN	NaN	rs4986838	NaN	0.318291	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	128.3007	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	0	41	30
chr12	51237468	51237468	T	T	intronic	TMPRSS12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr12	51390792	51390792	A	A	intronic	SLC11A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	51402323	51402323	G	A	exonic	SLC11A2	NaN	nonsynonymous SNV	SLC11A2:NM_001174130:exon2:c.C107T:p.P36L,SLC11A2:NM_000617:exon3:c.C119T:p.P40L,SLC11A2:NM_001174125:exon3:c.C206T:p.P69L,SLC11A2:NM_001174126:exon3:c.C119T:p.P40L,SLC11A2:NM_001174127:exon3:c.C119T:p.P40L,SLC11A2:NM_001174128:exon3:c.C119T:p.P40L,SLC11A2:NM_001174129:exon3:c.C119T:p.P40L	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.005	B	0.01	B	0.110	N	1.000	N	1.815	L	1.89	T	-0.999	T	0.107	T	0.129	0.381	6.067	1.11	0.340	0.533	7.770	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.904926	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	514	485	29	0
chr12	51442255	51442255	C	G	exonic	LETMD1	NaN	nonsynonymous SNV	LETMD1:NM_001243689:exon1:c.C116G:p.A39G,LETMD1:NM_001300765:exon1:c.C116G:p.A39G,LETMD1:NM_015416:exon1:c.C116G:p.A39G	NaN	NaN	NaN	0.28	T	0.007	B	0.004	B	0.692	N	0.997	N	0.695	N	0.8	T	-1.026	T	0.079	T	0.13	2.940	15.80	0.487	0.080	0.291	9.156	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.103694	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	54	46	8	0
chr12	51458278	51458278	A	G	exonic	CSRNP2	NaN	nonsynonymous SNV	CSRNP2:NM_030809:exon5:c.T883C:p.S295P	NaN	NaN	NaN	0.28	T	0.003	B	0.004	B	0.011	N	0.537	N	0	N	2.62	T	-1.065	T	0.015	T	0.16	1.030	9.207	3.02	1.874	1.885	6.470	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	17.4224	0	NaN	NA	NA	206	175	31	0
chr12	51489138	51489138	A	A	intronic	TFCP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	51493561	51493561	T	C	exonic	TFCP2	NaN	nonsynonymous SNV	TFCP2:NM_001173453:exon11:c.A1000G:p.M334V,TFCP2:NM_001173452:exon12:c.A1153G:p.M385V,TFCP2:NM_005653:exon12:c.A1153G:p.M385V	NaN	NaN	NaN	0.52	T	0.024	B	0.002	B	0.000	D	0.995	D	0	N	2.33	T	-1.059	T	0.058	T	0.161	1.014	9.141	5.63	2.278	2.762	15.120	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.47037	0	NaN	NA	NA	16	13	2	0
chr12	51495713	51495713	C	T	intronic	TFCP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.989705	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	98	91	7	0
chr12	5153341	5153341	A	C	exonic	KCNA5	NaN	nonsynonymous SNV	KCNA5:NM_002234:exon1:c.A28C:p.N10H	NaN	NaN	NaN	0	D	0.015	B	0.012	B	0.005	U	0.804	D	0.895	L	-4.65	D	0.158	D	0.851	D	0.184	3.925	19.97	4.32	1.811	1.739	7.680	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.391797	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	25	20	5	0
chr12	5153854	5153854	T	T	exonic	KCNA5	NaN	synonymous SNV	KCNA5:NM_002234:exon1:c.T541T:p.S181S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	22	21	0	0
chr12	5154841	5154841	C	A	exonic	KCNA5	NaN	nonsynonymous SNV	KCNA5:NM_002234:exon1:c.C1528A:p.L510M	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.99	D	0.000	D	1.000	D	2.85	M	-5.5	D	1.099	D	0.970	D	0.784	2.574	14.57	3.34	0.768	1.205	8.114	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.740109	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	262	252	10	0
chr12	51590848	51590848	C	T	intronic	POU6F1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	51590849	51590849	A	G	intronic	POU6F1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	51592133	51592133	G	G	upstream	POU6F1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	51681846	51681846	C	T	intronic	BIN2	NaN	NaN	NaN	rs4611251	NaN	0.834465	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	68	0	68	54
chr12	51693357	51693357	G	A	intronic	BIN2	NaN	NaN	NaN	rs2288368	NaN	0.503994	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	54.7097	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	51	27	24	46
chr12	51693395	51693395	G	G	exonic	BIN2	NaN	synonymous SNV	BIN2:NM_001290008:exon5:c.C512C:p.A171A,BIN2:NM_001290009:exon5:c.C140C:p.A47A,BIN2:NM_001290007:exon6:c.C434C:p.A145A,BIN2:NM_016293:exon6:c.C608C:p.A203A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	55	52	0	0
chr12	51693528	51693528	A	A	intronic	BIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr12	51696770	51696770	T	T	intronic	BIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	51707767	51707767	A	A	intronic	BIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	51714755	51714755	T	A	intronic	BIN2	NaN	NaN	NaN	rs3916138	NaN	0.501198	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	18	4	14	0
chr12	51722272	51722272	T	C	UTR3	CELA1	NM_001971:c.*89A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	11	4	7	0
chr12	51752729	51752729	A	T	intronic	GALNT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	51752735	51752735	T	A	intronic	GALNT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr12	51758253	51758253	A	A	intronic	GALNT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr12	51759538	51759538	A	G	intronic	GALNT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	15	10	4	0
chr12	51847496	51847496	A	A	intronic	SLC4A8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	16	12	0	0
chr12	51853944	51853944	A	A	intronic	SLC4A8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr12	51868027	51868027	C	A	intronic	SLC4A8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	51868030	51868030	G	A	intronic	SLC4A8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	52080965	52080965	C	T	exonic	SCN8A	NaN	synonymous SNV	SCN8A:NM_001177984:exon5:c.C576T:p.D192D,SCN8A:NM_014191:exon5:c.C576T:p.D192D	rs4761829	NaN	0.784944	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	367.226	0	NaN	NA	NA	33	0	33	48
chr12	52093224	52093224	T	T	intronic	SCN8A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	17	16	0	0
chr12	52100402	52100402	A	A	exonic	SCN8A	NaN	synonymous SNV	SCN8A:NM_001177984:exon11:c.A1538A:p.E513E,SCN8A:NM_014191:exon11:c.A1538A:p.E513E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	31	27	0	0
chr12	52159987	52159987	A	A	intronic	SCN8A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	52182623	52182623	A	G	intronic	SCN8A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	52215102	52215102	T	G	exonic	FIGNL2	NaN	nonsynonymous SNV	FIGNL2:NM_001013690:exon2:c.A1096C:p.T366P	rs303819	NaN	0.840256	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	117.695	0	NaN	NA	NA	12	0	12	47
chr12	52282458	52282458	C	G	exonic	ANKRD33	NaN	nonsynonymous SNV	ANKRD33:NM_182608:exon2:c.C252G:p.C84W	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.999	D	0.947	D	.	.	0.779	D	0.695	N	2.02	T	-1.006	T	0.066	T	0.222	2.393	13.96	3.41	1.153	0.466	8.221	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.009036527390253683	NA	0	0	10.610786	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	100	89	11	0
chr12	52282461	52282461	G	C	exonic	ANKRD33	NaN	synonymous SNV	ANKRD33:NM_182608:exon2:c.G255C:p.P85P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.456664	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	77	64	13	0
chr12	52283353	52283353	A	A	intronic	ANKRD33	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	52300505	52300505	C	C	upstream	ACVRL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	52306866	52306866	T	T	intronic	ACVRL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	52307145	52307145	C	T	intronic	ACVRL1	NaN	NaN	NaN	rs2071218	NaN	0.43111	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.111714	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	14	18	42
chr12	52308194	52308194	T	G	intronic	ACVRL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr12	52312863	52312863	G	C	exonic	ACVRL1	NaN	nonsynonymous SNV	ACVRL1:NM_001077401:exon8:c.G1341C:p.Q447H,ACVRL1:NM_000020:exon9:c.G1341C:p.Q447H	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.11	B	0.204	B	0.002	N	1.000	D	1.22	L	-0.17	T	-0.909	T	0.187	T	0.71	2.090	12.94	3.17	0.825	3.157	10.871	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	21	21	0	0
chr12	52312864	52312864	A	A	exonic	ACVRL1	NaN	synonymous SNV	ACVRL1:NM_001077401:exon8:c.A1342A:p.T448T,ACVRL1:NM_000020:exon9:c.A1342A:p.T448T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	21	21	0	0
chr12	52312865	52312865	C	A	exonic	ACVRL1	NaN	nonsynonymous SNV	ACVRL1:NM_001077401:exon8:c.C1343A:p.T448N,ACVRL1:NM_000020:exon9:c.C1343A:p.T448N	NaN	NaN	NaN	0	D	0.746	P	0.731	P	0.001	D	0.991	D	0.51	N	-0.2	T	-0.615	T	0.233	T	0.464	3.999	20.5	4.99	2.767	1.398	13.317	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr12	52337868	52337868	T	C	intergenic	ACVRL1,ACVR1B	dist=20723;dist=7583	NaN	NaN	rs772231	NaN	0.583666	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr12	52376442	52376442	T	G	intronic	ACVR1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr12	52376443	52376443	A	C	intronic	ACVR1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr12	52376446	52376446	T	T	intronic	ACVR1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	15	12	0	0
chr12	52385831	52385831	A	G	intronic	ACVR1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	12	3	6	0
chr12	52435576	52435576	T	G	intronic	NR4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	52435632	52435632	A	C	exonic	NR4A1	NaN	synonymous SNV	NR4A1:NM_001202234:exon2:c.A79C:p.R27R	rs138157115	NaN	0.0139776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	60	44	16	6
chr12	52436112	52436112	C	T	intronic	NR4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	52449165	52449165	A	C	intronic	NR4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	52449980	52449980	A	A	intronic	NR4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr12	52451291	52451291	T	C	exonic	NR4A1	NaN	nonsynonymous SNV	NR4A1:NM_173157:exon6:c.T1517C:p.L506P,NR4A1:NM_001202233:exon7:c.T1556C:p.L519P,NR4A1:NM_001202234:exon7:c.T1679C:p.L560P,NR4A1:NM_002135:exon7:c.T1517C:p.L506P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.565	H	-0.52	T	0.492	D	0.630	D	0.985	4.440	23.6	4.97	2.228	7.819	14.060	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.594238	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	195	189	6	0
chr12	52470556	52470556	T	T	intronic	ATG101	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	7	0	0
chr12	52470737	52470737	C	C	exonic	ATG101	NaN	synonymous SNV	ATG101:NM_001098673:exon4:c.C420C:p.C140C,ATG101:NM_021934:exon4:c.C420C:p.C140C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	120	114	0	0
chr12	52566283	52566283	T	G	intronic	KRT80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.909482	nearby_gap_events	REJECT	45	36	9	0
chr12	52566964	52566964	G	GC	intronic	KRT80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	36.4504	0	NaN	NA	NA	20	11	7	4
chr12	52595006	52595006	C	T	intergenic	KRT80,C12orf80	dist=9222;dist=4359	NaN	NaN	rs7958522	NaN	0.502196	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	63	NaN	NA	NA	13	0	13	0
chr12	52598495	52598495	C	T	downstream	C12orf80	NaN	NaN	NaN	rs1870214	NaN	0.404553	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	52600261	52600261	G	T	intronic	C12orf80	NaN	NaN	NaN	rs73105130	NaN	0.00499201	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	333.715	0	NaN	NA	NA	130	83	47	7
chr12	52624945	52624945	A	C	intergenic	LINC00592,KRT7	dist=7348;dist=2009	NaN	NaN	rs7958201	NaN	0.890974	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr12	52627215	52627215	A	G	exonic	KRT7	NaN	synonymous SNV	KRT7:NM_005556:exon1:c.A135G:p.S45S	rs7308888	NaN	0.888778	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.880261	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	12	10	47
chr12	52679937	52679937	C	G	UTR3	KRT81	NM_002281:c.*102G>C	NaN	NaN	rs3660	NaN	0.419728	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	46.308697	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	0	18	41
chr12	52680008	52680008	T	C	UTR3	KRT81	NM_002281:c.*31A>G	NaN	NaN	rs3657	NaN	0.394569	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.350164	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	40
chr12	52680290	52680290	A	G	intronic	KRT81	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr12	52681671	52681671	T	T	intronic	KRT81	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	52681714	52681714	T	C	intronic	KRT81	NaN	NaN	NaN	rs6580872	NaN	0.936302	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	213.151276	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	74	0	74	53
chr12	52681733	52681733	A	C	intronic	KRT81	NaN	NaN	NaN	rs7954186	NaN	0.45008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	304.033633	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	109	0	109	42
chr12	52681968	52681968	T	C	intronic	KRT81	NaN	NaN	NaN	rs6580874	NaN	0.99361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	321.56	0	NaN	NA	NA	63	0	63	48
chr12	52710198	52710198	C	T	intronic	KRT83	NaN	NaN	NaN	rs55722266	NaN	0.375799	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	160.759	0	NaN	NA	NA	42	15	27	28
chr12	52710423	52710423	A	A	intronic	KRT83	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	52711808	52711808	A	A	intronic	KRT83	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr12	52713202	52713202	A	G	intronic	KRT83	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.114529	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	305	294	11	0
chr12	52713203	52713203	G	A	intronic	KRT83	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.427457	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	305	294	11	0
chr12	52776385	52776385	A	A	intronic	KRT84	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr12	52776697	52776697	T	T	intronic	KRT84	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	52790166	52790166	A	A	intronic	KRT82	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	52794991	52794991	G	C	intronic	KRT82	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	52794993	52794993	T	G	intronic	KRT82	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	52794994	52794994	T	C	intronic	KRT82	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	52794997	52794997	A	C	intronic	KRT82	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	52794998	52794998	C	T	intronic	KRT82	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	52799931	52799931	C	T	exonic	KRT82	NaN	nonsynonymous SNV	KRT82:NM_033033:exon1:c.G131A:p.R44K	NaN	NaN	NaN	0.3	T	0.0	B	0.0	B	0.000	D	1.000	N	0.805	L	-0.91	T	-0.906	T	0.234	T	0.115	0.912	8.713	4.64	2.571	1.860	13.794	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	52799932	52799932	T	T	exonic	KRT82	NaN	synonymous SNV	KRT82:NM_033033:exon1:c.A130A:p.R44R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	20	15	0	0
chr12	52825908	52825908	G	A	intronic	KRT75	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr12	52825911	52825911	T	C	intronic	KRT75	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr12	52842601	52842601	T	C	intronic	KRT6B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.104622	nearby_gap_events	REJECT	128	119	9	0
chr12	52842602	52842602	C	T	intronic	KRT6B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.246735	nearby_gap_events	REJECT	128	120	8	0
chr12	52863800	52863800	A	A	intronic	KRT6C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	52865548	52865548	G	C	intronic	KRT6C	NaN	NaN	NaN	rs28759265	NaN	0.2498	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	415.542	0	NaN	NA	NA	224	79	145	23
chr12	52866060	52866060	C	T	exonic	KRT6C	NaN	nonsynonymous SNV	KRT6C:NM_173086:exon2:c.G545A:p.R182Q	rs11608915	NaN	0.400559	0.03	D	0.998	D	0.899	P	0.000	D	0.002	P	2.93	M	-2.97	D	-1.273	T	0.000	T	0.273	3.412	17.53	2.12	0.814	5.704	11.195	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	165.939699	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	2	57	32
chr12	52882071	52882071	G	A	intronic	KRT6A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	52964423	52964423	G	G	intronic	KRT74	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	52964425	52964425	T	T	intronic	KRT74	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	52964442	52964442	T	T	intronic	KRT74	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	21	17	0	0
chr12	52965877	52965877	T	G	intronic	KRT74	NaN	NaN	NaN	rs11170175	NaN	0.115815	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	390.786	0	NaN	NA	NA	140	72	68	13
chr12	52980072	52980072	G	C	intronic	KRT72	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr12	52985839	52985839	C	G	intronic	KRT72	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	52986132	52986132	T	A	intronic	KRT72	NaN	NaN	NaN	rs617820	NaN	0.885982	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	119.23225	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	0	42	54
chr12	53012001	53012001	C	A	exonic	KRT73	NaN	nonsynonymous SNV	KRT73:NM_175068:exon1:c.G308T:p.G103V	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.155	M	-2.82	D	0.916	D	0.866	D	0.654	1.915	12.36	4.64	2.512	1.502	12.873	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0032418018991380716	NA	0	0	NaN	NA	NA	32	23	9	0
chr12	53040411	53040411	T	C	intronic	KRT2	NaN	NaN	NaN	rs2232559	NaN	0.632388	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	164.701002	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	115	48	67	50
chr12	53078242	53078242	A	A	intergenic	KRT1,KRT77	dist=4051;dist=5169	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	53085706	53085706	G	T	intronic	KRT77	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.728946	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	138	126	12	0
chr12	53090087	53090087	T	T	intronic	KRT77	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	53096913	53096913	G	A	exonic	KRT77	NaN	synonymous SNV	KRT77:NM_175078:exon1:c.C306T:p.T102T	rs1625862	NaN	0.973442	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	149.669	0	NaN	NA	NA	16	0	12	42
chr12	53109558	53109558	G	T	intergenic	KRT77,KRT76	dist=12311;dist=52381	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	53109559	53109559	A	C	intergenic	KRT77,KRT76	dist=12312;dist=52380	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	53109565	53109565	A	G	intergenic	KRT77,KRT76	dist=12318;dist=52374	NaN	NaN	rs623750	NaN	0.558906	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	53109572	53109572	G	C	intergenic	KRT77,KRT76	dist=12325;dist=52367	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	53109573	53109573	C	T	intergenic	KRT77,KRT76	dist=12326;dist=52366	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr12	53163066	53163066	A	T	intronic	KRT76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	53163067	53163067	A	G	intronic	KRT76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	53167313	53167313	T	C	intronic	KRT76	NaN	NaN	NaN	rs7399317	NaN	0.866813	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1327.24	0	NaN	NA	NA	120	0	120	53
chr12	53169071	53169071	A	G	intronic	KRT76	NaN	NaN	NaN	rs57024267	NaN	0.198882	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	210.130935	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	154	67	87	15
chr12	53170427	53170427	C	G	intronic	KRT76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	16.1647	0	NaN	NA	NA	6	3	3	2
chr12	53184152	53184152	A	G	intronic	KRT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr12	53185997	53185997	T	T	intronic	KRT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	53186088	53186088	G	C	exonic	KRT3	NaN	nonsynonymous SNV	KRT3:NM_057088:exon5:c.C1123G:p.R375G	rs3887954	NaN	0.377796	0	D	0.996	D	0.944	D	0.175	N	1.000	P	3.385	M	-3.21	D	-0.941	T	0.000	T	0.169	1.612	11.35	0.697	0.289	0.076	14.767	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	199.662	0	NaN	NA	NA	113	65	48	48
chr12	53187816	53187816	T	G	intronic	KRT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.549761	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	161	147	14	0
chr12	53187823	53187823	G	C	intronic	KRT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	47	28	19	0
chr12	53199333	53199333	T	A	downstream	KRT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	53199335	53199335	C	T	downstream	KRT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	53201413	53201413	T	T	intronic	KRT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	67	51	0	0
chr12	53201809	53201809	A	T	intronic	KRT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	53201811	53201811	A	C	intronic	KRT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	53204609	53204609	G	G	intronic	KRT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	103	74	0	0
chr12	53207307	53207307	G	T	intronic	KRT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	226.168	0	NaN	NA	NA	120	58	43	20
chr12	53223957	53223957	C	G	intronic	KRT79	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.109424	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	328	315	13	0
chr12	53232688	53232688	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	7	1	3,3	0
chr12	53232689	53232689	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	7	1	4,2	0
chr12	53233302	53233302	C	G	intronic	KRT78	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	53238516	53238516	A	A	intronic	KRT78	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	53240309	53240309	C	C	intronic	KRT78	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	53240584	53240584	A	G	exonic	KRT78	NaN	synonymous SNV	KRT78:NM_001300814:exon3:c.T294C:p.R98R,KRT78:NM_173352:exon3:c.T624C:p.R208R	rs2682342	NaN	0.3123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	130.145924	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	115	54	61	9
chr12	53400088	53400088	T	G	UTR5	EIF4B	NM_001300821:c.-180T>G,NM_001417:c.-180T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	53432107	53432107	A	G	intronic	EIF4B	NaN	NaN	NaN	rs55927246	NaN	0.107428	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	133.692193	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	122	66	56	25
chr12	53446132	53446132	T	T	ncRNA_intronic	LOC283335	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr12	53447318	53447318	A	A	ncRNA_exonic	LOC283335	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	53451237	53451237	T	T	intronic	TNS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr12	53455032	53455032	T	C	exonic	TNS2	NaN	synonymous SNV	TNS2:NM_015319:exon20:c.T3372C:p.N1124N,TNS2:NM_170754:exon20:c.T3342C:p.N1114N,TNS2:NM_198316:exon20:c.T2970C:p.N990N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.037911	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	318	303	15	0
chr12	53455877	53455877	T	T	intronic	TNS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr12	53460258	53460258	TC	CG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	26.0509	0	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr12	53462120	53462120	G	G	intronic	SPRYD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	95	78	0	0
chr12	53462121	53462121	A	A	intronic	SPRYD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	95	78	0	0
chr12	53467301	53467301	A	A	intronic	SPRYD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	53495044	53495044	A	A	intronic	IGFBP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr12	53495769	53495769	T	C	intronic	IGFBP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	12	6	5	0
chr12	53499268	53499268	C	C	intronic	SOAT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	53499272	53499272	T	T	intronic	SOAT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	53499274	53499274	T	T	intronic	SOAT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	16	16	0	0
chr12	53499278	53499278	C	C	intronic	SOAT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	18	18	0	0
chr12	53499281	53499281	T	T	intronic	SOAT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	70	NaN	NA	NA	25	19	0	0
chr12	53499516	53499516	A	A	intronic	SOAT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr12	53509779	53509779	T	C	intronic	SOAT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	53512355	53512355	A	G	intronic	SOAT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	15	8	6	0
chr12	53514997	53514997	T	T	intronic	SOAT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr12	53517689	53517689	A	A	intronic	SOAT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	5	0	0
chr12	53564365	53564365	A	A	intronic	CSAD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	53567310	53567310	A	A	intronic	CSAD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	53567370	53567370	T	T	intronic	CSAD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr12	53573535	53573535	T	T	intronic	CSAD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	53579121	53579121	T	G	intronic	ZNF740	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.78182	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	175	170	5	0
chr12	53587403	53587403	T	G	intronic	ITGB7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.950129	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	195	174	21	0
chr12	53587404	53587404	G	T	intronic	ITGB7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.55932	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	183	164	19	0
chr12	53589374	53589374	T	G	intronic	ITGB7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	13.073	16	NaN	NA	NA	24	19	5	12
chr12	53589635	53589635	T	G	intronic	ITGB7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	5	4	0
chr12	53590340	53590340	A	C	intronic	ITGB7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.807024	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	37	30	7	0
chr12	53606815	53606815	T	T	intronic	RARG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	53664148	53664148	G	A	intronic	ESPL1	NaN	NaN	NaN	rs4758963	NaN	0.459864	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.470837	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	6	10	31
chr12	53670835	53670835	A	A	intronic	ESPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	53677089	53677089	G	A	intronic	ESPL1	NaN	NaN	NaN	rs4454760	NaN	0.954473	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	404.668849	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	132	0	132	58
chr12	53681857	53681857	G	C	exonic	ESPL1	NaN	synonymous SNV	ESPL1:NM_012291:exon19:c.G4278C:p.G1426G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.23569474004256313	NA	0	0	NaN	NA	NA	21	15	6	0
chr12	53681913	53681913	C	G	exonic	ESPL1	NaN	nonsynonymous SNV	ESPL1:NM_012291:exon19:c.C4334G:p.A1445G	NaN	NaN	NaN	0.51	T	0.0	B	0.001	B	0.322	N	1.000	N	1.1	L	2.7	T	-0.957	T	0.024	T	0.119	-0.095	3.533	2.65	0.374	-0.601	6.556	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.036414920149402036	NA	0	0	NaN	NA	NA	60	43	17	0
chr12	53682267	53682267	CAA	C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	126.808	0	NaN	NA	NA	45	19	24	21
chr12	53685481	53685481	T	C	exonic	ESPL1	NaN	nonsynonymous SNV	ESPL1:NM_012291:exon26:c.T5528C:p.L1843P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.955	M	2.0	T	-0.728	T	0.166	T	0.934	2.040	12.78	4.67	2.110	5.688	12.432	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.982881	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	237	231	6	0
chr12	53686765	53686765	A	T	intronic	ESPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	53689307	53689307	T	A	UTR5	PFDN5	NM_145897:c.-45T>A,NM_002624:c.-45T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	53689922	53689922	T	C	intronic	PFDN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	15	5	10	0
chr12	53693205	53693205	A	A	UTR3	PFDN5	NM_145897:c.*76A>A,NM_002624:c.*76A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr12	53693532	53693532	A	G	exonic	C12orf10	NaN	nonsynonymous SNV	C12orf10:NM_021640:exon1:c.A11G:p.Q4R	rs1534284	NaN	0.949681	1	T	0.0	B	0.0	B	0.111	N	0.997	P	0	N	1.03	T	-0.954	T	0.000	T	0.008	-0.913	0.412	-0.122	-0.053	-0.784	3.389	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	187.528	0	NaN	NA	NA	14	0	14	0
chr12	53693907	53693907	G	G	intronic	C12orf10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	61	55	0	0
chr12	53693908	53693908	C	G	intronic	C12orf10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	26	21	5	0
chr12	53703426	53703426	C	T	exonic	AAAS	NaN	nonsynonymous SNV	AAAS:NM_001173466:exon7:c.G670A:p.G224R,AAAS:NM_015665:exon8:c.G769A:p.G257R	NaN	ID=COSM138883;OCCURENCE=1(skin)	NaN	0.66	T	0.982	D	0.867	P	0.016	N	0.951	D	-0.865	N	0.26	T	0.191	D	0.654	D	0.533	2.345	13.80	4.66	1.511	1.803	12.431	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.008809063054345936	NA	0	0	9.344679	nearby_gap_events	REJECT	31	26	5	0
chr12	53703566	53703566	T	A	intronic	AAAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr12	53709408	53709408	T	C	intronic	AAAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	1	5	0
chr12	53709410	53709410	G	A	intronic	AAAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	1	5	0
chr12	53709412	53709412	G	T	intronic	AAAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr12	53715108	53715108	C	T	intronic	AAAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.847271	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	146	136	10	0
chr12	53721721	53721721	T	T	UTR3	SP7	NM_152860:c.*209A>A,NM_001173467:c.*209A>A,NM_001300837:c.*209A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr12	53722587	53722587	G	A	exonic	SP7	NaN	synonymous SNV	SP7:NM_152860:exon2:c.C639T:p.P213P,SP7:NM_001173467:exon3:c.C639T:p.P213P,SP7:NM_001300837:exon3:c.C585T:p.P195P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.910568	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	128	117	11	1
chr12	53773943	53773943	G	T	upstream	SP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.30000000000000215	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr12	53854967	53854967	A	A	intronic	PCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr12	53856285	53856285	G	C	exonic	PCBP2	NaN	synonymous SNV	PCBP2:NM_001098620:exon8:c.G513C:p.P171P,PCBP2:NM_001128911:exon8:c.G525C:p.P175P,PCBP2:NM_001128912:exon8:c.G513C:p.P171P,PCBP2:NM_001128913:exon8:c.G525C:p.P175P,PCBP2:NM_001128914:exon8:c.G513C:p.P171P,PCBP2:NM_005016:exon8:c.G525C:p.P175P,PCBP2:NM_031989:exon8:c.G513C:p.P171P	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.818	T	0.203	T	.	2.174	13.23	4.93	2.559	0.940	6.952	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.110876	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	16	12	4	0
chr12	53861638	53861638	A	T	intronic	PCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.401519	nearby_gap_events	REJECT	12	8	4	0
chr12	53876180	53876180	T	C	intronic	MAP3K12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	140	123	17	0
chr12	53876526	53876526	G	C	exonic	MAP3K12	NaN	nonsynonymous SNV	MAP3K12:NM_001193511:exon11:c.C2061G:p.S687R,MAP3K12:NM_006301:exon12:c.C1962G:p.S654R	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.995	D	0.986	D	0.000	D	0.999	D	1.5	L	-1.0	T	-0.079	T	0.502	D	0.647	3.201	16.72	3.25	1.343	1.806	11.726	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.884952	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	110	99	11	0
chr12	53876527	53876527	C	T	exonic	MAP3K12	NaN	nonsynonymous SNV	MAP3K12:NM_001193511:exon11:c.G2060A:p.S687N,MAP3K12:NM_006301:exon12:c.G1961A:p.S654N	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.981	D	0.969	D	0.000	D	1.000	D	1.5	L	-0.99	T	-0.082	T	0.484	T	0.147	4.283	22.4	4.14	2.604	3.549	16.367	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.833598	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	110	100	10	0
chr12	53877354	53877354	G	A	intronic	MAP3K12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.564358	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	449	442	7	0
chr12	53877964	53877964	T	T	intronic	MAP3K12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	53894465	53894465	G	A	upstream	TARBP2	NaN	NaN	NaN	rs784567	NaN	0.223043	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	53899110	53899110	A	A	intronic	TARBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	6	0	0
chr12	53901069	53901069	T	C	intronic	NPFF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	53911066	53911066	G	A	exonic	ATF7	NaN	nonsynonymous SNV	ATF7:NM_001130060:exon12:c.C1244T:p.P415L,ATF7:NM_006856:exon12:c.C1307T:p.P436L	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.155	B	0.059	B	0.002	N	1.000	D	1.1	L	0.87	T	-0.969	T	0.115	T	0.461	3.324	17.18	4.6	2.582	6.808	16.792	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.556867	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	294	283	11	0
chr12	53911264	53911264	T	G	ncRNA_exonic	LOC100652999	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.00239617	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	49	26	23	45
chr12	53926262	53926262	G	A	intronic	ATF7	NaN	NaN	NaN	rs7307804	NaN	0.255591	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	185.831	0	NaN	NA	NA	57	23	34	15
chr12	54059098	54059098	T	C	exonic	ATP5G2	NaN	stoploss	ATP5G2:NM_001002031:exon5:c.A474G:p.X158W,ATP5G2:NM_005176:exon5:c.A597G:p.X199W	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.633	25.4	5.32	2.371	7.712	14.709	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.068997	nearby_gap_events	REJECT	89	82	7	0
chr12	54070139	54070139	A	A	UTR5	ATP5G2	NM_001002031:c.-163T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	54108908	54108908	T	T	intronic	CALCOCO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr12	54113452	54113452	G	G	intronic	CALCOCO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	54118366	54118366	T	A	intronic	CALCOCO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-0.949	T	0.092	T	.	0.644	7.459	-2.38	-0.512	-0.057	4.609	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	16	10	5	0
chr12	54333057	54333057	TA	AC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	31.5626	0	NaN	NA	NA	9	4	5	7
chr12	54348567	54348567	TGG	GGT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	95.0399	0	NaN	NA	NA	54	25	16	0
chr12	54348592	54348592	A	C	upstream	HOXC12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.99725	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	70	65	5	0
chr12	54355501	54355501	C	T	downstream	HOTAIR	NaN	NaN	NaN	rs12826786	NaN	0.357628	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr12	54367061	54367061	T	G	exonic	HOXC11	NaN	synonymous SNV	HOXC11:NM_014212:exon1:c.T36G:p.S12S	rs4759315	NaN	0.999401	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	180.807156	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	61	0	61	58
chr12	54379578	54379578	A	G	exonic	HOXC10	NaN	nonsynonymous SNV	HOXC10:NM_017409:exon1:c.A535G:p.S179G	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.0	B	0.0	B	0.013	N	0.886	N	1.385	L	-2.87	D	-0.487	T	0.527	D	0.206	0.929	8.784	0.903	-0.018	1.168	7.804	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.797725	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	381	372	9	0
chr12	54394304	54394304	C	G	exonic	HOXC9	NaN	nonsynonymous SNV	HOXC9:NM_006897:exon1:c.C332G:p.A111G	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.001	B	0.013	B	0.000	D	1.000	D	-0.155	N	-3.26	D	-0.132	T	0.556	D	0.151	2.210	13.35	4.04	2.268	2.888	15.497	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.07792207792207759	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr12	54394497	54394497	C	T	exonic	HOXC9	NaN	synonymous SNV	HOXC9:NM_006897:exon1:c.C525T:p.A175A	rs2241820	NaN	0.578075	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	17	8.853427	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	1	3	11
chr12	54403219	54403219	C	A	exonic	HOXC8	NaN	nonsynonymous SNV	HOXC8:NM_022658:exon1:c.C151A:p.H51N	NaN	NaN	NaN	0.34	T	0.651	P	0.214	B	0.000	D	1.000	D	2.8	M	0.89	T	-0.842	T	0.140	T	0.472	3.370	17.36	3.95	1.904	7.710	15.120	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0024056518667976076	NA	0	0	NaN	NA	NA	36	13	23	0
chr12	54403221	54403221	C	G	exonic	HOXC8	NaN	nonsynonymous SNV	HOXC8:NM_022658:exon1:c.C153G:p.H51Q	NaN	NaN	0.000199681	0.15	T	0.06	B	0.018	B	0.000	D	1.000	D	2.8	M	0.9	T	-0.828	T	0.151	T	0.638	3.268	16.97	3.95	1.904	2.139	15.120	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0024544668507517258	NA	0	0	NaN	NA	NA	33	10	23	0
chr12	54403566	54403566	C	CT	intronic	HOXC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	22.2574	0	NaN	NA	NA	19	13	6	0
chr12	54428032	54428032	T	C	intronic	HOXC4,HOXC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	54428366	54428366	CGGGGG	CGGGGA,CGGGG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	257.17	0	NaN	NA	NA	34	2	19	4
chr12	54428403	54428403	A	A	UTR3	HOXC5	NM_018953:c.*127A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr12	54447559	54447559	T	T	intronic	HOXC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	54448106	54448106	A	G	exonic	HOXC4	NaN	nonsynonymous SNV	HOXC4:NM_153633:exon1:c.A400G:p.I134V,HOXC4:NM_014620:exon3:c.A400G:p.I134V	rs75256744	NaN	0.110623	1	T	0.001	B	0.003	B	0.000	D	0.022	P	-1.755	N	-2.37	D	-0.948	T	0.001	T	0.034	-1.025	0.226	4.26	1.918	2.533	12.792	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.857766	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	4	3	13
chr12	54513943	54513943	T	T	ncRNA_exonic	FLJ12825	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	54513944	54513944	C	C	ncRNA_exonic	FLJ12825	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	54513945	54513945	C	C	ncRNA_exonic	FLJ12825	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	54636411	54636411	G	T	intronic	CBX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	54636414	54636414	C	T	intronic	CBX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	54636417	54636417	A	G	intronic	CBX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	54636418	54636418	A	G	intronic	CBX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	54646036	54646036	A	T	intronic	CBX5	NaN	NaN	NaN	rs201497909	NaN	0.00139776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.07792207792207759	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr12	54676566	54676566	T	A	ncRNA_intronic	HNRNPA1P10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0055480140347128875	NA	0	0	NaN	NA	NA	58	36	22	0
chr12	54741731	54741731	T	C	intronic	COPZ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.723441	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	171	165	6	0
chr12	54767950	54767950	G	C	ncRNA_intronic	LOC102724050	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	54778303	54778303	G	C	exonic	ZNF385A	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF385A:NM_001130967:exon2:c.C56G:p.P19R,ZNF385A:NM_001130968:exon2:c.C56G:p.P19R	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	1.56	T	-0.697	T	0.200	T	0.175	3.678	18.69	4.3	2.136	4.394	12.616	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.04146434300867634	NA	0	0	NaN	NA	NA	145	97	48	0
chr12	54793762	54793762	A	A	ncRNA_intronic	LOC102724050	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	54802096	54802096	A	A	ncRNA_intronic	LOC102724050	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	54802719	54802719	T	C	exonic	ITGA5	NaN	synonymous SNV	ITGA5:NM_002205:exon5:c.A603G:p.G201G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.822675	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	99	92	7	0
chr12	54803522	54803522	A	C	ncRNA_intronic	LOC102724050	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr12	54812912	54812912	G	G	exonic	ITGA5	NaN	synonymous SNV	ITGA5:NM_002205:exon1:c.C71C:p.P24P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	54912784	54912784	T	C	intronic	NCKAP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.461151	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	67	63	4	0
chr12	54914929	54914929	T	C	exonic	NCKAP1L	NaN	synonymous SNV	NCKAP1L:NM_001184976:exon18:c.T1635C:p.L545L,NCKAP1L:NM_005337:exon18:c.T1785C:p.L595L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.076436	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	105	94	11	0
chr12	54914930	54914930	C	A	exonic	NCKAP1L	NaN	nonsynonymous SNV	NCKAP1L:NM_001184976:exon18:c.C1636A:p.H546N,NCKAP1L:NM_005337:exon18:c.C1786A:p.H596N	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.004	B	0.005	B	0.001	N	0.948	N	0.345	N	1.59	T	-1.066	T	0.044	T	0.263	1.572	11.21	5.14	2.558	0.824	12.249	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.281417	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	106	94	12	0
chr12	54921980	54921980	T	T	intronic	NCKAP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	54932787	54932787	A	G	intronic	NCKAP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.581348	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	78	74	4	0
chr12	54932788	54932788	T	C	intronic	NCKAP1L	NaN	NaN	NaN	rs4758966	NaN	0.889177	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	240.309259	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	78	0	78	58
chr12	5493409	5493409	A	G	intergenic	LOC101929584,NTF3	dist=141092;dist=47871	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	17	0	15	0
chr12	54960994	54960994	A	A	intronic	PDE1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	54963417	54963417	A	A	intronic	PDE1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	54967320	54967320	T	A	intronic	PDE1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.52493	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	68	60	8	0
chr12	54970309	54970309	T	T	intronic	PDE1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	54976904	54976904	T	C	intronic	PPP1R1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	5	3	0
chr12	54977139	54977139	T	C	intronic	PPP1R1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	54982029	54982029	G	A	intronic	PPP1R1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.213536	nearby_gap_events	REJECT	23	18	5	0
chr12	54982055	54982055	C	G	intronic	PPP1R1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.397759	nearby_gap_events	REJECT	42	37	5	0
chr12	550190	550190	G	T	intronic	CCDC77	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr12	550192	550192	G	C	intronic	CCDC77	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	550194	550194	G	T	intronic	CCDC77	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	550197	550197	A	T	intronic	CCDC77	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr12	550198	550198	A	C	intronic	CCDC77	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	550199	550199	G	T	intronic	CCDC77	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	55027112	55027112	A	A	intronic	LACRT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	55039326	55039326	C	T	intronic	DCD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	55354934	55354934	T	A	intronic	TESPA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr12	55361560	55361560	T	C	intronic	TESPA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	55367151	55367151	T	C	intronic	TESPA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	55367152	55367152	T	G	intronic	TESPA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	55367153	55367153	T	C	intronic	TESPA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	5564892	5564892	A	A	intronic	NTF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	55688047	55688047	T	T	downstream	OR6C6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	21	19	0	0
chr12	55714772	55714772	G	A	exonic	OR6C1	NaN	nonsynonymous SNV	OR6C1:NM_001005182:exon1:c.G389A:p.C130Y	rs7132431	NaN	0.782748	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.999	P	-3.92	N	7.44	T	-0.999	T	0.000	T	0.035	-2.230	0.005	3.41	0.266	6.800	6.561	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	252.040366	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	80	0	80	56
chr12	55715119	55715119	G	A	exonic	OR6C1	NaN	nonsynonymous SNV	OR6C1:NM_001005182:exon1:c.G736A:p.V246I	rs7132916	NaN	0.780351	0.37	T	0.0	B	0.006	B	0.004	N	1.000	P	2.06	M	8.04	T	-0.910	T	0.000	T	0.04	0.006	4.045	-0.5	-0.225	-0.994	1.375	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1919.68	0	NaN	NA	NA	198	2	196	55
chr12	55794951	55794951	T	C	exonic	OR6C65	NaN	synonymous SNV	OR6C65:NM_001005518:exon1:c.T639C:p.V213V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.379442	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	60	57	3	0
chr12	55794976	55794976	A	G	exonic	OR6C65	NaN	nonsynonymous SNV	OR6C65:NM_001005518:exon1:c.A664G:p.T222A	rs7971073	NaN	0.780551	0.04	D	0.623	P	0.595	P	0.125	N	1.000	P	1.425	L	8.91	T	-0.971	T	0.000	T	0.023	2.258	13.51	3.71	1.688	0.741	4.443	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	149.231033	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	1	51	55
chr12	55805617	55805617	A	C	intergenic	OR6C65,OR6C76	dist=10366;dist=14421	NaN	NaN	rs113584176	NaN	0.132588	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	23	14	9	0
chr12	55945991	55945991	A	A	downstream	OR6C4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	19	18	0	0
chr12	55968551	55968551	A	G	exonic	OR2AP1	NaN	nonsynonymous SNV	OR2AP1:NM_001258285:exon1:c.A353G:p.Y118C	NaN	NaN	NaN	0.02	D	.	.	.	.	0.000	D	0.809	D	.	.	5.31	T	-0.974	T	0.011	T	0.874	2.915	15.71	4.86	1.813	1.344	13.448	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	56005458	56005458	A	A	intergenic	OR2AP1,OR10P1	dist=36330;dist=25218	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	5603521	5603521	G	A	exonic	NTF3	NaN	synonymous SNV	NTF3:NM_002527:exon1:c.G141A:p.K47K,NTF3:NM_001102654:exon2:c.G180A:p.K60K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.184017	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	503	474	29	0
chr12	56077574	56077574	A	G	intronic	METTL7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	56077575	56077575	C	A	intronic	METTL7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	56077964	56077964	A	C	UTR3	METTL7B	NM_152637:c.*131A>C	NaN	NaN	rs2293409	NaN	0.732029	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	119.083459	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	102	47	55	45
chr12	56082572	56082572	C	T	intronic	ITGA7	NaN	NaN	NaN	rs117082867	NaN	0.00698882	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	106.08	0	NaN	NA	NA	51	27	24	1
chr12	56087649	56087649	C	G	intronic	ITGA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr12	56087651	56087651	C	A	intronic	ITGA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	56087652	56087652	C	A	intronic	ITGA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	56087653	56087653	T	C	intronic	ITGA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	1	5	0
chr12	56087654	56087654	T	G	intronic	ITGA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	7	1	5	0
chr12	56087656	56087656	C	A	intronic	ITGA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr12	56087657	56087657	C	G	intronic	ITGA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr12	56087714	56087714	G	A	intronic	ITGA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.293621	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	273	266	7	0
chr12	56088537	56088537	C	A	intronic	ITGA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.767614	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	79	71	8	0
chr12	56089357	56089357	C	T	exonic	ITGA7	NaN	nonsynonymous SNV	ITGA7:NM_001144996:exon14:c.G1964A:p.R655H,ITGA7:NM_001144997:exon14:c.G1673A:p.R558H,ITGA7:NM_002206:exon14:c.G1952A:p.R651H	rs1800974	NaN	0.599441	0.53	T	0.001	B	0.002	B	0.573	N	1.000	P	0.425	N	0.84	T	-1.002	T	0.000	T	0.246	1.140	9.646	-0.706	-0.033	0.204	9.220	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	75.480455	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	51	22	29	41
chr12	56089449	56089449	T	C	intronic	ITGA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.918345	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	58	55	3	0
chr12	56090000	56090000	T	T	intronic	ITGA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	56090560	56090560	T	T	intronic	ITGA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr12	56091002	56091002	A	G	exonic	ITGA7	NaN	nonsynonymous SNV	ITGA7:NM_001144996:exon11:c.T1577C:p.V526A,ITGA7:NM_001144997:exon11:c.T1286C:p.V429A,ITGA7:NM_002206:exon11:c.T1565C:p.V522A	NaN	NaN	NaN	0	D	0.177	B	0.243	B	0.001	D	0.985	D	1.5	L	0.86	T	-0.853	T	0.140	T	0.321	2.014	12.69	4.27	1.718	5.716	11.686	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.72909		KEEP	44	39	5	0
chr12	56114293	56114293	C	T	ncRNA_intronic	BLOC1S1-RDH5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	56117930	56117930	G	A	ncRNA_intronic	BLOC1S1-RDH5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.164101	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	66	55	11	0
chr12	56120060	56120060	A	A	intronic	CD63	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	56143784	56143784	C	G	UTR3	GDF11	NM_005811:c.*118C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.64422	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	145	136	9	0
chr12	56143786	56143786	A	A	UTR3	GDF11	NM_005811:c.*120A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr12	56151188	56151188	T	C	UTR3	SARNP	NM_033082:c.*108A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	56188541	56188541	T	T	intronic	SARNP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr12	56235102	56235102	G	A	intronic	MMP19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.34548	clustered_read_position	REJECT	99	92	7	0
chr12	56330435	56330435	A	A	intronic	DGKA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	56331133	56331133	T	C	intronic	DGKA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr12	56331896	56331896	A	C	intronic	DGKA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr12	56332281	56332281	A	A	intronic	DGKA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	73	52	0	0
chr12	56334108	56334108	A	AG	exonic	DGKA	NaN	frameshift substitution	DGKA:NM_001345:exon11:c.809_809delinsAG,DGKA:NM_201444:exon11:c.809_809delinsAG,DGKA:NM_201554:exon11:c.809_809delinsAG,DGKA:NM_201445:exon12:c.809_809delinsAG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.19176	0	NaN	NA	NA	9	7	2	2
chr12	56334791	56334791	A	T	intronic	DGKA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	56334792	56334792	T	C	intronic	DGKA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	56334793	56334793	G	T	intronic	DGKA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	56352455	56352455	A	A	intronic	PMEL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr12	56363272	56363272	G	C	exonic	CDK2	NaN	nonsynonymous SNV	CDK2:NM_001798:exon5:c.G500C:p.W167S	NaN	NaN	NaN	0	D	0.97	D	0.917	D	0.000	D	1.000	D	2.055	M	0.86	T	-0.535	T	0.258	T	0.957	4.267	22.3	4.55	1.626	9.785	13.668	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.141727	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	16	10	6	1
chr12	56365044	56365044	A	C	intronic	CDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr12	56380746	56380746	T	T	exonic	RAB5B	NaN	synonymous SNV	RAB5B:NM_001252036:exon2:c.T2T:p.M1M,RAB5B:NM_001252037:exon2:c.T2T:p.M1M,RAB5B:NM_002868:exon2:c.T2T:p.M1M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	56384651	56384651	A	C	intronic	RAB5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	15	5	10	0
chr12	56385146	56385146	G	A	exonic	RAB5B	NaN	synonymous SNV	RAB5B:NM_001252037:exon4:c.G318A:p.E106E,RAB5B:NM_001252036:exon5:c.G441A:p.E147E,RAB5B:NM_002868:exon5:c.G441A:p.E147E	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.789	T	0.219	T	.	2.056	12.83	4.12	1.482	0.087	9.059	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.729178	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	46	43	3	0
chr12	56415426	56415426	A	C	intronic	IKZF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr12	56421769	56421769	C	G	intronic	IKZF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	56426447	56426447	A	C	exonic	IKZF4	NaN	nonsynonymous SNV	IKZF4:NM_022465:exon6:c.A818C:p.Y273S	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	2.045	M	3.1	T	-1.161	T	0.067	T	0.943	4.760	26.7	5.31	2.234	6.099	14.375	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.30443	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	137	128	9	0
chr12	56435920	56435920	C	G	UTR5	RPS26	NM_001029:c.-31C>G	NaN	NaN	rs17118262	NaN	0.0477236	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.426191	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	8	7	11
chr12	56482507	56482507	CACTG	AGCTG,AGGCT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	71.09	26	NaN	NA	NA	36	17	8	2
chr12	56482508	56482508	A	G	intronic	ERBB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.014318288511836379	NA	0	19	NaN	NA	NA	22	13	9	0
chr12	56482511	56482511	G	T	intronic	ERBB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.04996543892564475	NA	0	0	NaN	NA	NA	24	19	5	0
chr12	56482515	56482515	C	G	intronic	ERBB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.23925	0	NaN	NA	NA	35	30	10	2
chr12	56487116	56487116	T	T	intronic	ERBB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	56490746	56490746	TG	GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	29.8844	0	NaN	NA	NA	6	0	4	8
chr12	56490747	56490747	G	T	intronic	ERBB3	NaN	NaN	NaN	rs186183394	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.294764	normal_lod	REJECT	5	1	4	0
chr12	56491023	56491023	A	G	intronic	ERBB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr12	56491025	56491025	C	G	intronic	ERBB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	56491027	56491027	T	A	intronic	ERBB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr12	56493822	56493822	A	C	intronic	ERBB3	NaN	NaN	NaN	rs2292238	NaN	0.295128	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	53.06449	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	22	26	34
chr12	56495265	56495265	A	G	intronic	ERBB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.234698	nearby_gap_events	REJECT	81	74	7	0
chr12	56495616	56495616	G	A	exonic	ERBB3	NaN	nonsynonymous SNV	ERBB3:NM_001982:exon28:c.G3806A:p.G1269E	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.003	B	0.006	B	0.128	N	1.000	D	0.345	N	-0.78	T	-0.777	T	0.213	T	0.207	0.544	6.945	3.4	0.450	1.381	5.015	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	2.517501048838457E-4	NA	0	26	NaN	NA	NA	52	27	25	34
chr12	56495628	56495628	G	T	exonic	ERBB3	NaN	nonsynonymous SNV	ERBB3:NM_001982:exon28:c.G3818T:p.G1273V	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.958	D	0.483	P	0.000	D	1.000	D	0.345	N	-1.18	T	-0.508	T	0.312	T	0.706	0.290	5.570	4.93	1.473	2.070	13.817	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.345495	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	48	44	4	0
chr12	56511142	56511142	A	G	intronic	RPL41	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	17	11	5	0
chr12	56511143	56511143	A	G	intronic	RPL41	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr12	56522276	56522276	T	T	exonic	ESYT1	NaN	synonymous SNV	ESYT1:NM_001184796:exon1:c.T173T:p.F58F,ESYT1:NM_015292:exon1:c.T173T:p.F58F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	30	28	0	0
chr12	56525736	56525736	A	G	intronic	ESYT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	24	14	9	0
chr12	56536449	56536449	T	G	exonic	ESYT1	NaN	nonsynonymous SNV	ESYT1:NM_001184796:exon26:c.T2851G:p.S951A,ESYT1:NM_015292:exon26:c.T2821G:p.S941A	NaN	NaN	NaN	0.87	T	0.001	B	0.003	B	0.186	N	1.000	N	0	N	0.57	T	-1.025	T	0.079	T	0.091	-0.785	0.717	2.04	0.319	0.279	8.641	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	86	84	2	0
chr12	56536451	56536451	G	C	exonic	ESYT1	NaN	synonymous SNV	ESYT1:NM_001184796:exon26:c.G2853C:p.S951S,ESYT1:NM_015292:exon26:c.G2823C:p.S941S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr12	56566170	56566170	T	C	intronic	SMARCC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr12	56566572	56566572	A	G	intronic	SMARCC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	56572167	56572167	A	G	intronic	SMARCC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.341057	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	75	71	4	0
chr12	56574712	56574712	T	T	intronic	SMARCC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	56576044	56576044	A	C	intronic	SMARCC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	56579880	56579880	A	T	intronic	SMARCC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	56581160	56581160	C	T	intronic	SMARCC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.4460784313725478	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr12	56581166	56581166	G	A	intronic	SMARCC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.128205128205128	NA	0	0	NaN	NA	NA	5	3	2	0
chr12	56619498	56619498	A	A	intronic	NABP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	56619897	56619897	T	G	intronic	NABP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr12	56625045	56625045	T	C	UTR5	SLC39A5	NM_173596:c.-14T>C,NM_001135195:c.-14T>C	NaN	NaN	rs1274497	NaN	0.989816	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.07523	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	27
chr12	56626448	56626448	T	T	intronic	SLC39A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	56629146	56629146	A	T	intronic	SLC39A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	56629147	56629147	T	C	intronic	SLC39A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	56669655	56669655	T	A	intronic	CS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	56679628	56679628	T	T	intronic	CS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	56749923	56749923	T	T	exonic	STAT2	NaN	synonymous SNV	STAT2:NM_005419:exon3:c.A278A:p.D93D,STAT2:NM_198332:exon3:c.A278A:p.D93D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	38	34	0	0
chr12	56756626	56756626	A	A	upstream	APOF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr12	56815415	56815415	T	T	intronic	TIMELESS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr12	56816828	56816828	A	A	intronic	TIMELESS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr12	56868762	56868762	C	C	intronic	GLS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	82	60	0	0
chr12	56869623	56869623	T	T	intronic	GLS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	5687026	5687026	T	T	intronic	ANO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	56871598	56871598	G	T	intronic	GLS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	56871599	56871599	A	C	intronic	GLS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	56871600	56871600	G	T	intronic	GLS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	56872802	56872802	T	C	intronic	GLS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr12	56956398	56956398	A	A	intronic	RBMS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr12	56963632	56963632	T	C	intronic	RBMS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.568358		KEEP	81	76	5	0
chr12	56982626	56982626	C	G	intronic	RBMS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	56982628	56982628	C	C	intronic	RBMS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	56982838	56982838	A	T	intronic	RBMS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.958113	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	145	139	6	0
chr12	56993693	56993693	A	C	intronic	BAZ2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.414265	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	113	95	18	0
chr12	56993694	56993694	C	A	intronic	BAZ2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.006707936354403374	NA	0	0	18.3073	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	105	86	19	0
chr12	56994342	56994342	A	C	intronic	BAZ2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.681455	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	83	74	9	0
chr12	56998355	56998355	T	T	intronic	BAZ2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr12	56998592	56998592	A	G	intronic	BAZ2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr12	56999925	56999925	C	G	intronic	BAZ2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	57004351	57004351	T	C	intronic	BAZ2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.297393	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	59	56	3	0
chr12	57006040	57006040	A	A	intronic	BAZ2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	57011203	57011203	T	A	exonic	BAZ2A	NaN	nonsynonymous SNV	BAZ2A:NM_001300905:exon2:c.A112T:p.M38L,BAZ2A:NM_013449:exon2:c.A118T:p.M40L	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.428	B	0.155	B	0.000	D	0.986	N	0.695	N	2.5	T	-1.031	T	0.022	T	0.546	4.275	22.3	4.45	2.263	2.952	8.078	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	45	33	12	0
chr12	57011204	57011204	G	G	exonic	BAZ2A	NaN	synonymous SNV	BAZ2A:NM_001300905:exon2:c.C111C:p.P37P,BAZ2A:NM_013449:exon2:c.C117C:p.P39P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	56	41	0	0
chr12	57029837	57029837	T	G	intronic	BAZ2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr12	57033992	57033992	A	A	intronic	ATP5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr12	57037592	57037592	T	T	intronic	ATP5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	57037595	57037595	A	G	intronic	ATP5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.153776	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	140	124	16	0
chr12	5708602	5708602	C	A	intronic	ANO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	57109720	57109720	G	A	exonic	NACA	NaN	nonsynonymous SNV	NACA:NM_001113203:exon5:c.C2135T:p.P712L	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.996	D	.	.	1.000	D	0.55	N	0.78	T	-0.707	T	0.184	T	0.714	3.292	17.06	4.21	2.171	6.846	15.460	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.607465	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	369	335	34	0
chr12	57109931	57109931	A	T	exonic	NACA	NaN	nonsynonymous SNV	NACA:NM_001113203:exon5:c.T1924A:p.S642T	rs2926747	NaN	0.648562	0.33	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	0	N	1.02	T	-1.006	T	0.000	T	0.018	-0.844	0.563	2.55	0.051	-0.595	4.162	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1606.15	0	NaN	NA	NA	140	0	140	28
chr12	57115168	57115168	C	G	exonic	NACA	NaN	nonsynonymous SNV	NACA:NM_001113203:exon3:c.G146C:p.C49S	NaN	NaN	0.000199681	0.93	T	0.03	B	0.01	B	.	.	1.000	N	0	N	1.49	T	-0.990	T	0.024	T	0.12	0.354	5.918	-1.83	-0.115	-0.011	1.791	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.810091	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	175	157	18	0
chr12	57140057	57140057	A	G	intronic	PRIM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	57317847	57317847	A	C	intronic	SDR9C7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr12	5734791	5734791	C	A	intronic	ANO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	57396736	57396736	A	A	exonic	ZBTB39	NaN	synonymous SNV	ZBTB39:NM_014830:exon2:c.T1966T:p.S656S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	224	171	0	0
chr12	57396970	57396970	C	G	exonic	ZBTB39	NaN	nonsynonymous SNV	ZBTB39:NM_014830:exon2:c.G1732C:p.A578P	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.57	P	0.241	B	0.764	N	0.990	N	0.55	N	3.03	T	-0.984	T	0.019	T	0.67	1.146	9.667	4.8	1.375	0.487	9.517	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.867337	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	225	207	18	0
chr12	57397627	57397627	T	G	exonic	ZBTB39	NaN	nonsynonymous SNV	ZBTB39:NM_014830:exon2:c.A1075C:p.I359L	rs141597750	NaN	0.000998403	0.07	T	0.894	P	0.322	B	0.000	D	1.000	D	-0.045	N	3.23	T	-0.906	T	0.010	T	0.629	2.891	15.63	5.22	2.196	4.321	13.103	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	143.483544	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	122	64	58	1
chr12	57406109	57406109	C	A	intronic	TAC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	22	8.225947	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	1	3	0
chr12	57406124	57406124	C	A	intronic	TAC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	18	7.567982	normal_lod	REJECT	5	2	3	0
chr12	5740998	5740998	G	A	intronic	ANO2	NaN	NaN	NaN	rs12372107	NaN	0.190895	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	13	3	10	0
chr12	57424774	57424774	G	A	intronic	MYO1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	16.1262	0	NaN	NA	NA	6	3	3	4
chr12	57430116	57430116	A	C	exonic	MYO1A	NaN	nonsynonymous SNV	MYO1A:NM_005379:exon22:c.T2324G:p.L775W,MYO1A:NM_001256041:exon23:c.T2324G:p.L775W	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.999	D	0.862	P	0.001	N	0.999	D	1.95	M	-2.29	D	0.414	D	0.687	D	0.694	4.083	21.0	4.79	2.010	4.504	10.642	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.574041	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	163	152	11	0
chr12	57435181	57435181	T	G	intronic	MYO1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.118932	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	106	99	7	0
chr12	57456776	57456776	T	T	intronic	TMEM194A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	17	17	0	0
chr12	57464748	57464748	T	A	intronic	TMEM194A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.98613	0	NaN	NA	NA	68	59	11	3
chr12	57464749	57464749	A	T	intronic	TMEM194A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.25572	clustered_read_position	REJECT	63	57	6	7
chr12	57485347	57485347	G	T	exonic	NAB2	NaN	nonsynonymous SNV	NAB2:NM_005967:exon2:c.G523T:p.G175W	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.998	D	0.914	D	0.004	N	0.964	D	0	N	.	.	-0.698	T	0.157	T	0.182	3.599	18.32	4.15	2.131	7.223	13.982	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.897597	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	63	56	7	0
chr12	57486647	57486647	A	G	intronic	NAB2	NaN	NaN	NaN	rs324019	NaN	0.567492	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	124.74466	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	123	70	53	51
chr12	57487075	57487075	G	C	intronic	NAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	57487077	57487077	G	C	intronic	NAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	57487079	57487079	T	T	intronic	NAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr12	57487133	57487133	G	A	intronic	NAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.969468	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	328	322	6	0
chr12	57493484	57493484	T	C	intronic	STAT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.77606	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	135	129	6	0
chr12	57493517	57493517	A	C	intronic	STAT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.965409	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	152	144	8	0
chr12	57496478	57496478	A	A	intronic	STAT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	57496479	57496479	A	G	intronic	STAT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	57498748	57498748	A	T	intronic	STAT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	57498750	57498750	C	G	intronic	STAT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	57499199	57499199	C	T	intronic	STAT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.139274	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	165	155	10	0
chr12	57499453	57499453	A	A	intronic	STAT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr12	57537387	57537387	T	T	intronic	LRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	57547961	57547961	C	A	intronic	LRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.04218	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	112	100	12	0
chr12	57554550	57554550	T	T	intronic	LRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	57560731	57560731	A	C	exonic	LRP1	NaN	nonsynonymous SNV	LRP1:NM_002332:exon18:c.A2816C:p.N939T	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.999	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	0.735	N	-3.81	D	0.654	D	0.840	D	0.523	4.652	25.6	4.72	2.117	7.096	13.618	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.1166	0	NaN	NA	NA	13	5	8	5
chr12	57565085	57565085	G	G	intronic	LRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	57566831	57566831	T	T	intronic	LRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	57566883	57566883	G	C	intronic	LRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.933675	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	223	205	18	0
chr12	57566884	57566884	C	G	intronic	LRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.163039	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	223	203	20	0
chr12	57571411	57571411	G	C	intronic	LRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr12	57572325	57572325	A	A	exonic	LRP1	NaN	synonymous SNV	LRP1:NM_002332:exon27:c.A4545A:p.V1515V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	86	65	0	0
chr12	57579700	57579700	A	A	intronic	LRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr12	57584807	57584807	T	G	intronic	LRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.7245	clustered_read_position	REJECT	9	5	4	0
chr12	57585144	57585144	C	T	exonic	LRP1	NaN	synonymous SNV	LRP1:NM_002332:exon44:c.C7278T:p.A2426A	rs1800139	NaN	0.536542	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	103.430878	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	1	39	50
chr12	57586531	57586531	G	C	intronic	LRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.30769230769230677	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr12	57590869	57590869	T	C	exonic	LRP1	NaN	synonymous SNV	LRP1:NM_002332:exon56:c.T8997C:p.T2999T	rs7308698	NaN	0.984625	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.26137	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	56
chr12	57598861	57598861	A	G	intronic	LRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.066881	nearby_gap_events	REJECT	36	30	6	0
chr12	57600141	57600141	G	C	intronic	LRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	57600143	57600143	C	A	intronic	LRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr12	57603616	57603616	A	C	exonic	LRP1	NaN	nonsynonymous SNV	LRP1:NM_002332:exon80:c.A12404C:p.D4135A	NaN	NaN	NaN	0.31	T	0.999	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	2.095	M	1.38	T	-0.867	T	0.188	T	0.806	3.112	16.40	4.45	2.011	8.752	13.123	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	54	43	10	8
chr12	57606358	57606358	G	G	UTR3	LRP1	NM_002332:c.*20G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr12	57606386	57606386	A	G	UTR3	LRP1	NM_002332:c.*48A>G	NaN	NaN	rs7304504	NaN	0.899361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.541818	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	53
chr12	57627789	57627789	C	G	exonic	SHMT2	NaN	nonsynonymous SNV	SHMT2:NM_001166356:exon11:c.C1253G:p.A418G,SHMT2:NM_001166357:exon11:c.C1220G:p.A407G,SHMT2:NM_001166358:exon11:c.C1220G:p.A407G,SHMT2:NM_001166359:exon11:c.C1220G:p.A407G,SHMT2:NM_005412:exon11:c.C1283G:p.A428G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.808	P	0.61	P	0.000	D	1.000	D	2.335	M	1.53	T	-0.570	T	0.230	T	0.627	3.482	17.81	4.84	2.415	4.839	17.113	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.673784	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	49	39	10	0
chr12	57628167	57628167	A	A	UTR3	SHMT2	NM_001166356:c.*23A>A,NM_005412:c.*23A>A,NM_001166358:c.*23A>A,NM_001166359:c.*23A>A,NM_001166357:c.*23A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr12	57628194	57628194	C	T	UTR3	SHMT2	NM_001166356:c.*50C>T,NM_005412:c.*50C>T,NM_001166358:c.*50C>T,NM_001166359:c.*50C>T,NM_001166357:c.*50C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	57628196	57628196	A	C	UTR3	SHMT2	NM_001166356:c.*52A>C,NM_005412:c.*52A>C,NM_001166358:c.*52A>C,NM_001166359:c.*52A>C,NM_001166357:c.*52A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	57629299	57629299	T	T	UTR3	NDUFA4L2	NM_020142:c.*47A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr12	57638320	57638320	G	A	exonic	STAC3	NaN	nonsynonymous SNV	STAC3:NM_001286257:exon6:c.C248T:p.P83L,STAC3:NM_001286256:exon8:c.C689T:p.P230L,STAC3:NM_145064:exon9:c.C806T:p.P269L	rs367590066	NaN	NaN	.	.	0.797	P	0.138	B	0.002	N	1.000	D	0.12	N	0.9	T	-1.085	T	0.046	T	0.413	2.786	15.28	5.1	2.551	2.402	11.432	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.091616	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	355	346	9	0
chr12	57648907	57648907	A	A	intronic	R3HDM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	124	119	0	0
chr12	57649734	57649734	G	T	intronic	R3HDM2	NaN	NaN	NaN	rs367938273	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.983819	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	162	147	15	0
chr12	57663786	57663786	A	G	intronic	R3HDM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	13	5	5	0
chr12	57677563	57677563	C	T	intronic	R3HDM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.392945	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	132	127	5	0
chr12	57849262	57849262	T	T	UTR5	INHBE	NM_031479:c.-58T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	57858414	57858414	A	G	intronic	GLI1	NaN	NaN	NaN	rs3817475	NaN	0.365216	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	258.091	0	NaN	NA	NA	108	55	53	49
chr12	57858460	57858460	A	C	exonic	GLI1	NaN	synonymous SNV	GLI1:NM_005269:exon4:c.A198C:p.P66P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.894879	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	95	86	9	0
chr12	57863427	57863427	C	T	exonic	GLI1	NaN	stopgain	GLI1:NM_001160045:exon9:c.C1138T:p.Q380X,GLI1:NM_001167609:exon10:c.C1399T:p.Q467X,GLI1:NM_005269:exon11:c.C1522T:p.Q508X	NaN	NaN	NaN	0.23	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.843	27.6	3.72	1.278	6.240	12.770	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.778562	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	302	295	7	0
chr12	57865584	57865584	G	G	exonic	GLI1	NaN	synonymous SNV	GLI1:NM_001160045:exon10:c.G2677G:p.G893G,GLI1:NM_001167609:exon11:c.G2938G:p.G980G,GLI1:NM_005269:exon12:c.G3061G:p.G1021G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	76	NaN	NA	NA	140	113	0	0
chr12	57867873	57867873	G	T	exonic	ARHGAP9	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGAP9:NM_001080156:exon14:c.C1318A:p.Q440K,ARHGAP9:NM_001080157:exon15:c.C1870A:p.Q624K,ARHGAP9:NM_032496:exon16:c.C1870A:p.Q624K	NaN	NaN	NaN	0	D	0.489	P	0.266	B	0.000	D	0.970	D	1.065	L	2.82	T	-0.948	T	0.095	T	0.34	3.309	17.12	4.06	1.440	2.570	13.057	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.358442	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	228	216	12	0
chr12	57868763	57868763	A	G	intronic	ARHGAP9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	57870463	57870463	AG	A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	603.111	0	NaN	NA	NA	260	124	132	17
chr12	57870529	57870529	A	A	intronic	ARHGAP9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	36	34	0	0
chr12	57870648	57870648	A	G	intronic	ARHGAP9	NaN	NaN	NaN	rs512490	NaN	0.846645	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.08324	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	1	17	46
chr12	57870917	57870917	T	T	intronic	ARHGAP9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	57871471	57871471	A	G	intronic	ARHGAP9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-1.020	T	0.044	T	0.062	0.245	5.324	-1.05	-0.339	0.315	0.318	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr12	57881944	57881944	G	C	exonic	MARS	NaN	nonsynonymous SNV	MARS:NM_004990:exon1:c.G71C:p.G24A	NaN	NaN	NaN	0.67	T	0.312	B	0.128	B	0.001	D	1.000	D	0.69	N	-1.02	T	-0.841	T	0.230	T	0.266	0.069	4.374	3.54	1.188	1.104	10.839	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.4615384615384648	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr12	57905687	57905687	A	G	intronic	MARS	NaN	NaN	NaN	rs1284467	NaN	0.966653	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	811.004868	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	296	0	296	58
chr12	57910207	57910207	C	T	intronic	MARS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.8696	0	NaN	NA	NA	83	71	14	0
chr12	57919249	57919249	A	A	exonic	MBD6	NaN	synonymous SNV	MBD6:NM_052897:exon6:c.A498A:p.P166P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	90	77	0	0
chr12	57927836	57927836	C	T	exonic	DCTN2	NaN	nonsynonymous SNV	DCTN2:NM_001261412:exon7:c.G575A:p.G192E,DCTN2:NM_001261413:exon7:c.G569A:p.G190E	NaN	NaN	NaN	1	T	0.001	B	0.002	B	0.024	N	1.000	N	0.695	N	.	.	-0.996	T	0.039	T	0.583	0.284	5.539	2.31	0.388	1.220	4.028	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2941176470588277	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr12	5793340	5793340	G	A	intronic	ANO2	NaN	NaN	NaN	rs10774364	NaN	0.386581	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	57957817	57957817	T	A	intronic	KIF5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	57958791	57958791	G	GC	intronic	KIF5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.3785	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr12	57961188	57961188	T	T	intronic	KIF5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	57971639	57971639	C	T	intronic	KIF5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	57971641	57971641	T	G	intronic	KIF5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	57975177	57975177	T	T	intronic	KIF5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	16	14	0	0
chr12	57985055	57985055	T	T	UTR5	PIP4K2C	NM_024779:c.-18T>T,NM_001146259:c.-18T>T,NM_001146260:c.-18T>T,NM_001146258:c.-18T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	10	7	0	0
chr12	57985182	57985182	A	G	exonic	PIP4K2C	NaN	nonsynonymous SNV	PIP4K2C:NM_001146258:exon1:c.A110G:p.K37R,PIP4K2C:NM_001146259:exon1:c.A110G:p.K37R,PIP4K2C:NM_001146260:exon1:c.A110G:p.K37R,PIP4K2C:NM_024779:exon1:c.A110G:p.K37R	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.005	B	0.003	B	0.000	D	0.999	D	2.34	M	1.47	T	-0.827	T	0.156	T	0.146	3.567	18.18	3.95	1.786	3.311	7.647	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.478794	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	403	396	7	0
chr12	57989597	57989597	T	C	intronic	PIP4K2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr12	57994674	57994674	G	A	exonic	PIP4K2C	NaN	synonymous SNV	PIP4K2C:NM_001146260:exon7:c.G750A:p.E250E,PIP4K2C:NM_001146258:exon8:c.G894A:p.E298E,PIP4K2C:NM_001146259:exon8:c.G840A:p.E280E,PIP4K2C:NM_024779:exon8:c.G894A:p.E298E	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.976	T	0.160	T	.	0.226	5.219	0.182	0.059	0.681	4.524	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.67653	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	60	57	3	0
chr12	58000378	58000378	G	A	intronic	DTX3	NaN	NaN	NaN	rs703834	NaN	0.908946	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1787.23	0	NaN	NA	NA	149	1	148	51
chr12	58000620	58000620	C	A	intronic	DTX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.686382	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	187	176	11	0
chr12	58008909	58008909	G	A	intronic	ARHGEF25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	103	59	44	0
chr12	58014089	58014089	C	T	exonic	SLC26A10	NaN	nonsynonymous SNV	SLC26A10:NM_133489:exon1:c.C86T:p.S29F	NaN	NaN	NaN	0	D	0.005	B	0.007	B	.	.	1.000	N	0	N	-3.28	D	-0.427	T	0.548	D	0.35	1.891	12.28	-3.01	-0.714	-0.929	5.494	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.006493	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	403	377	26	0
chr12	58015494	58015494	G	A	exonic	SLC26A10	NaN	nonsynonymous SNV	SLC26A10:NM_133489:exon4:c.G577A:p.A193T	rs923828	NaN	0.265176	0.25	T	0.734	P	0.501	P	.	.	0.737	P	0.975	L	-2.99	D	-1.169	T	0.000	T	0.195	3.441	17.65	3.89	2.197	4.390	11.585	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.7857	0	NaN	NA	NA	8	5	3	30
chr12	58022955	58022955	A	A	intronic	B4GALNT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	58023981	58023981	C	A	exonic	B4GALNT1	NaN	synonymous SNV	B4GALNT1:NM_001276468:exon5:c.G501T:p.L167L,B4GALNT1:NM_001276469:exon6:c.G666T:p.L222L,B4GALNT1:NM_001478:exon6:c.G666T:p.L222L	rs715930	ID=COSM147556;OCCURENCE=1(stomach)	0.213059	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	94.4783	0	NaN	NA	NA	63	37	26	19
chr12	58025813	58025813	G	C	exonic	B4GALNT1	NaN	nonsynonymous SNV	B4GALNT1:NM_001276468:exon2:c.C103G:p.L35V,B4GALNT1:NM_001276469:exon2:c.C103G:p.L35V,B4GALNT1:NM_001478:exon2:c.C103G:p.L35V	rs774896	NaN	0.251997	0.33	T	0.015	B	0.004	B	0.050	N	1.000	P	0	N	2.37	T	-0.926	T	0.000	T	0.218	-0.911	0.416	1.53	-0.127	-0.446	3.265	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.713557	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	5	9	22
chr12	58026021	58026021	A	G	intronic	B4GALNT1	NaN	NaN	NaN	rs2258877	NaN	0.23762	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	166.806	0	NaN	NA	NA	215	133	82	21
chr12	58089985	58089985	T	T	intronic	OS9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	15	13	0	0
chr12	58090214	58090214	A	A	intronic	OS9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	58111944	58111944	G	C	exonic	OS9	NaN	nonsynonymous SNV	OS9:NM_001261421:exon10:c.G1054C:p.G352R,OS9:NM_001261422:exon10:c.G994C:p.G332R,OS9:NM_001261423:exon10:c.G973C:p.G325R,OS9:NM_001017956:exon11:c.G1150C:p.G384R,OS9:NM_001017957:exon11:c.G1150C:p.G384R,OS9:NM_001017958:exon11:c.G1150C:p.G384R,OS9:NM_001261420:exon11:c.G1153C:p.G385R,OS9:NM_006812:exon11:c.G1150C:p.G384R	NaN	NaN	NaN	0.52	T	1.0	D	0.998	D	0.890	N	1.000	N	0.46	N	1.39	T	-1.001	T	0.112	T	0.105	2.134	13.09	4.42	1.229	1.497	6.783	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.919987	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	88	74	14	1
chr12	58111946	58111946	C	C	exonic	OS9	NaN	synonymous SNV	OS9:NM_001261421:exon10:c.C1056C:p.G352G,OS9:NM_001261422:exon10:c.C996C:p.G332G,OS9:NM_001261423:exon10:c.C975C:p.G325G,OS9:NM_001017956:exon11:c.C1152C:p.G384G,OS9:NM_001017957:exon11:c.C1152C:p.G384G,OS9:NM_001017958:exon11:c.C1152C:p.G384G,OS9:NM_001261420:exon11:c.C1155C:p.G385G,OS9:NM_006812:exon11:c.C1152C:p.G384G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	108	88	0	0
chr12	58120616	58120616	G	A	ncRNA_intronic	AGAP2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.367344	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	16	11	5	0
chr12	58131033	58131033	C	T	exonic	AGAP2	NaN	nonsynonymous SNV	AGAP2:NM_001122772:exon1:c.G997A:p.E333K	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.865	P	0.298	B	0.035	N	1.000	D	0.55	N	1.23	T	-0.859	T	0.131	T	0.525	2.798	15.32	4.3	2.392	1.683	14.156	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.901435	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	85	78	7	0
chr12	58145279	58145279	T	T	intronic	CDK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	49	42	0	0
chr12	58150643	58150643	T	C	intronic	MARCH9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr12	58152209	58152209	C	C	intronic	MARCH9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	136	91	0	0
chr12	58157036	58157036	G	A	exonic	CYP27B1	NaN	synonymous SNV	CYP27B1:NM_000785:exon9:c.C1416T:p.I472I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.490986	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	334	327	7	0
chr12	58157475	58157475	T	T	exonic	CYP27B1	NaN	synonymous SNV	CYP27B1:NM_000785:exon8:c.A1332A:p.A444A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	117	97	0	0
chr12	58157800	58157800	T	T	intronic	CYP27B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	58158761	58158761	A	C	intronic	CYP27B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.616216	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	301	287	14	0
chr12	58158762	58158762	T	A	intronic	CYP27B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.883858	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	303	289	14	0
chr12	58159009	58159009	G	G	intronic	CYP27B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	44	43	0	0
chr12	58159010	58159010	C	C	intronic	CYP27B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	44	43	0	0
chr12	58160607	58160607	T	T	intronic	CYP27B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	58196892	58196892	C	T	intronic	AVIL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	58200440	58200440	A	T	intronic	AVIL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	14	7	5	0
chr12	58202164	58202164	G	T	intronic	AVIL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.01936798014433159	NA	0	0	NaN	NA	NA	78	62	16	0
chr12	58203686	58203686	A	G	intronic	AVIL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	65	NaN	NA	NA	47	13	32	0
chr12	58204096	58204096	C	CCCAGCTT	intronic	AVIL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.0091853	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	114.674	0	NaN	NA	NA	154	101	41	1
chr12	5877823	5877823	T	G	intronic	ANO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	5900741	5900741	G	T	intronic	ANO2	NaN	NaN	NaN	rs4930803	NaN	0.808307	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	5915366	5915366	C	C	intronic	ANO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	74	65	0	0
chr12	5915367	5915367	A	C	intronic	ANO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	15	6	9	0
chr12	59270188	59270188	T	C	intronic	LRIG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	9	0	9	0
chr12	5963375	5963375	A	C	intronic	ANO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	60165189	60165189	T	C	intronic	SLC16A7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.553087	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	163	148	15	0
chr12	60173356	60173356	A	T	exonic	SLC16A7	NaN	nonsynonymous SNV	SLC16A7:NM_004731:exon5:c.A1333T:p.T445S,SLC16A7:NM_001270622:exon6:c.A1333T:p.T445S,SLC16A7:NM_001270623:exon6:c.A1333T:p.T445S	rs3763980	NaN	0.245008	.	.	0.0	B	0.002	B	0.256	N	1.000	P	-0.695	N	2.49	T	-0.933	T	0.000	T	0.027	-1.902	0.008	-2.51	-0.635	1.138	2.930	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.239343	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	19	28	20
chr12	6030153	6030153	C	T	intronic	ANO2	NaN	NaN	NaN	rs112864756	NaN	0.00419329	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	95.784923	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	62	24	38	6
chr12	6030405	6030405	A	G	exonic	ANO2	NaN	nonsynonymous SNV	ANO2:NM_001278596:exon3:c.T335C:p.V112A,ANO2:NM_001278597:exon3:c.T323C:p.V108A	rs3741903	NaN	0.15655	1	T	0.0	B	0.0	B	0.313	N	1.000	P	-0.6	N	-0.22	T	-1.062	T	0.000	T	0.035	-2.586	0	1.37	-0.076	0.524	7.122	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	330.427	0	NaN	NA	NA	237	151	86	12
chr12	6032129	6032129	A	A	intronic	ANO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	6058913	6058913	G	A	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	rs2362482	NaN	0.10004	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.9363	0	NaN	NA	NA	14	9	3	1
chr12	6094147	6094147	T	T	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr12	6103398	6103398	T	T	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr12	6128170	6128170	C	G	exonic	VWF	NaN	nonsynonymous SNV	VWF:NM_000552:exon28:c.G4414C:p.D1472H	rs1800383	NaN	0.233227	0.15	T	0.0	B	0.001	B	0.094	N	1.000	P	-1.085	N	-1.11	T	-1.040	T	0.000	T	0.119	-1.288	0.040	0.812	-0.533	-0.229	10.044	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.043167456142427875	NA	0	0	NaN	NA	NA	162	99	63	0
chr12	6138712	6138712	T	G	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	2	2	0
chr12	6142841	6142841	C	C	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	6145718	6145718	A	A	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	6145719	6145719	G	G	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	6145721	6145721	C	C	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	6145722	6145722	C	C	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	6173310	6173310	G	A	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	6173313	6173313	G	T	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	6173318	6173318	C	G	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	6173321	6173321	G	C	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	6173323	6173323	C	G	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	6174414	6174414	T	G	exonic	VWF	NaN	synonymous SNV	VWF:NM_000552:exon11:c.A1182C:p.S394S	rs1800376	NaN	0.279752	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	77.228092	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	19	29	17
chr12	6174423	6174423	T	A	exonic	VWF	NaN	synonymous SNV	VWF:NM_000552:exon11:c.A1173T:p.T391T	rs1800375	ID=COSM147397;OCCURENCE=1(stomach)	0.270966	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.791394	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	19	29	17
chr12	6180603	6180603	A	A	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	6182999	6182999	A	A	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	6203048	6203048	A	A	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	62148614	62148614	T	T	intronic	FAM19A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	6219758	6219758	A	C	intronic	VWF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	6245950	6245950	T	C	intergenic	VWF,CD9	dist=12114;dist=63532	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	62743120	62743120	A	C	intronic	USP15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr12	62749105	62749105	C	T	intronic	USP15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.412933	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	110	99	11	0
chr12	62749106	62749106	T	C	intronic	USP15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.169852	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	90	77	13	0
chr12	62777973	62777973	T	C	exonic	USP15	NaN	nonsynonymous SNV	USP15:NM_006313:exon10:c.T1276C:p.S426P,USP15:NM_001252078:exon11:c.T1363C:p.S455P	NaN	NaN	NaN	.	.	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	3.645	H	3.68	T	-0.109	T	0.330	T	0.948	4.515	24.3	5.16	2.173	7.868	15.166	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.039301	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	62	54	8	0
chr12	62798053	62798053	T	T	exonic	USP15	NaN	synonymous SNV	USP15:NM_006313:exon21:c.T2757T:p.T919T,USP15:NM_001252078:exon22:c.T2844T:p.T948T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	29	24	0	0
chr12	62877981	62877981	C	C	exonic	MON2	NaN	synonymous SNV	MON2:NM_001278469:exon2:c.C143C:p.T48T,MON2:NM_001278470:exon2:c.C143C:p.T48T,MON2:NM_001278471:exon2:c.C143C:p.T48T,MON2:NM_015026:exon2:c.C143C:p.T48T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	82	66	0	0
chr12	62918394	62918394	T	C	exonic	MON2	NaN	nonsynonymous SNV	MON2:NM_001278469:exon9:c.T1084C:p.F362L,MON2:NM_001278470:exon9:c.T1084C:p.F362L,MON2:NM_001278471:exon9:c.T1084C:p.F362L,MON2:NM_015026:exon9:c.T1084C:p.F362L,MON2:NM_001278472:exon10:c.T868C:p.F290L	NaN	NaN	NaN	.	.	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	N	-1.22	N	1.96	T	-1.044	T	0.060	T	0.135	0.491	6.666	4.19	1.481	3.651	13.195	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.840326	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	410	400	10	0
chr12	62918705	62918705	T	T	intronic	MON2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	62931187	62931187	A	T	intronic	MON2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr12	62932431	62932431	A	A	intronic	MON2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	62940988	62940988	A	A	intronic	MON2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr12	63087879	63087879	A	A	intronic	PPM1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	6309569	6309569	C	T	UTR5	CD9	NM_001769:c.-97C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	54.633028	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	16	22	1
chr12	63113915	63113915	T	C	intronic	PPM1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.627622	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	227	220	7	0
chr12	63195400	63195400	T	T	intronic	PPM1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	63195786	63195786	G	A	exonic	PPM1H	NaN	nonsynonymous SNV	PPM1H:NM_020700:exon3:c.C566T:p.P189L	NaN	NaN	NaN	.	.	0.857	P	0.613	P	0.000	D	1.000	D	2.415	M	1.84	T	-0.927	T	0.122	T	0.649	3.034	16.12	4.46	2.181	8.894	17.477	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	72	NaN	NA	NA	53	51	2	0
chr12	6344341	6344341	T	C	intronic	CD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	6345472	6345472	G	C	intronic	CD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	63954245	63954245	T	G	UTR3	DPY19L2	NM_173812:c.*47A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.524435	clustered_read_position	REJECT	133	119	14	0
chr12	64055275	64055275	A	T	intronic	DPY19L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	64062006	64062006	C	G	exonic	DPY19L2	NaN	synonymous SNV	DPY19L2:NM_173812:exon1:c.G168C:p.P56P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	58	4	54	0
chr12	64198863	64198863	T	C	intronic	TMEM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	64202717	64202717	C	A	exonic	TMEM5	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM5:NM_001278237:exon6:c.C397A:p.P133T,TMEM5:NM_014254:exon6:c.C1177A:p.P393T	NaN	NaN	NaN	.	.	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.295	M	.	.	-0.179	T	0.447	T	0.874	4.435	23.6	4.96	2.693	7.648	19.100	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.110971	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	298	291	7	0
chr12	64217198	64217198	T	T	intergenic	TMEM5-AS1,SRGAP1	dist=1262;dist=21343	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	29	26	0	0
chr12	6422912	6422912	C	G	exonic	PLEKHG6	NaN	nonsynonymous SNV	PLEKHG6:NM_001144857:exon2:c.C160G:p.H54D,PLEKHG6:NM_001144856:exon3:c.C256G:p.H86D,PLEKHG6:NM_018173:exon3:c.C256G:p.H86D	NaN	NaN	NaN	0.21	T	0.442	B	0.173	B	0.879	N	1.000	N	1.7	L	0.16	T	-0.934	T	0.181	T	0.233	0.090	4.486	-0.894	-0.012	-0.453	7.413	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.774803	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	347	327	20	0
chr12	6424878	6424878	A	G	intronic	PLEKHG6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	2	4	0
chr12	6425375	6425375	G	T	intronic	PLEKHG6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.794272	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	139	128	11	0
chr12	6425386	6425386	A	C	intronic	PLEKHG6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.537152	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	168	148	20	0
chr12	6435946	6435946	A	G	intronic	PLEKHG6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	6437142	6437142	G	A	intronic	PLEKHG6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.04836	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	109	93	16	0
chr12	6440224	6440224	A	A	intronic	TNFRSF1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	11	8	0	0
chr12	6442193	6442193	C	A	intronic	TNFRSF1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.45526	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	48	41	7	0
chr12	6442194	6442194	A	C	intronic	TNFRSF1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.781302	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	47	40	7	0
chr12	6443278	6443278	A	G	exonic	TNFRSF1A	NaN	nonsynonymous SNV	TNFRSF1A:NM_001065:exon2:c.T172C:p.C58R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.045	M	-8.3	D	0.867	D	0.995	D	0.959	2.876	15.58	4.02	1.701	4.398	9.277	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.811886	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	281	274	7	0
chr12	644501	644501	A	A	intronic	B4GALNT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	64488810	64488810	A	T	intronic	SRGAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	12	0	12	0
chr12	64488822	64488822	G	GA	intronic	SRGAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	22.8831	0	NaN	NA	NA	9	2	3	1
chr12	64536056	64536056	T	T	intronic	SRGAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	6457503	6457503	G	A	intronic	SCNN1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	6457505	6457505	T	A	intronic	SCNN1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr12	6457506	6457506	G	G	intronic	SCNN1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	6457513	6457513	T	T	intronic	SCNN1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	6458274	6458274	G	C	intronic	SCNN1A	NaN	NaN	NaN	rs3764874	NaN	0.186901	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	74	NaN	NA	NA	228	139	89	20
chr12	64609430	64609430	T	C	intronic	C12orf66	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.136087	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	238	230	8	0
chr12	64609431	64609431	T	C	intronic	C12orf66	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.133254	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	245	237	8	0
chr12	6463816	6463816	T	C	intronic	SCNN1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.262243	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	274	247	27	0
chr12	64712266	64712266	T	T	intronic	C12orf56	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	6471514	6471514	A	A	intronic	SCNN1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	64784025	64784025	G	T	intronic	C12orf56	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.793702	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	31	25	6	0
chr12	64815158	64815158	G	A	exonic	XPOT	NaN	synonymous SNV	XPOT:NM_007235:exon9:c.G987A:p.V329V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.82574	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	313	305	8	0
chr12	64823681	64823681	A	C	intronic	XPOT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	64823687	64823687	C	A	intronic	XPOT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	64825192	64825192	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	1	3,2	0
chr12	64825270	64825270	T	C	intronic	XPOT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.683413	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	129	123	6	0
chr12	64849612	64849612	T	C	intronic	TBK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.538693	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	53	43	10	0
chr12	64854203	64854203	A	A	intronic	TBK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	8	3	0	0
chr12	64875571	64875571	G	GT	intronic	TBK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.65301	0	NaN	NA	NA	13	11	4	1
chr12	64891040	64891040	G	A	splicing	TBK1	NM_013254:exon18:c.1959+1G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	0.136	4.732	0.235	0.308	0.364	.	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.412957	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	230	223	7	0
chr12	6493967	6493967	G	G	intronic	LTBR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	6495635	6495635	C	CA,CG,CGG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	586.378	0	NaN	NA	NA	122	0	30	1
chr12	6495636	6495636	G	A	intronic	LTBR	NaN	NaN	NaN	rs41429344	NaN	0.344848	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	127	NaN	NA	NA	34	28	6	17
chr12	6499533	6499533	G	A	intronic	LTBR	NaN	NaN	NaN	rs2286599	NaN	0.11901	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	88.2657	0	NaN	NA	NA	23	9	14	6
chr12	65085409	65085409	A	A	intronic	RASSF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr12	65258695	65258695	A	C	intronic	TBC1D30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	65260508	65260508	T	C	intronic	TBC1D30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	65462518	65462518	T	C	intronic	WIF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr12	654698	654698	A	A	intronic	B4GALNT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	6	0	0
chr12	65563463	65563463	A	A	exonic	LEMD3	NaN	synonymous SNV	LEMD3:NM_001167614:exon1:c.A87A:p.G29G,LEMD3:NM_014319:exon1:c.A87A:p.G29G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr12	6559631	6559631	A	G	ncRNA_exonic	CD27-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.89455	possible_contamination	REJECT	55	51	4	0
chr12	6559688	6559688	T	C	ncRNA_exonic	CD27-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.297036	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	130	110	20	0
chr12	6560032	6560032	T	A	ncRNA_exonic	CD27-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr12	6561549	6561549	A	G	intronic	TAPBPL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr12	6562285	6562285	C	T	exonic	TAPBPL	NaN	synonymous SNV	TAPBPL:NM_018009:exon2:c.C117T:p.C39C	rs2041384	NaN	0.228035	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	160	41	119	21
chr12	6562810	6562810	A	G	exonic	TAPBPL	NaN	nonsynonymous SNV	TAPBPL:NM_018009:exon3:c.A493G:p.T165A	rs2532500	NaN	0.6873	1	T	0.0	B	0.0	B	0.440	N	1.000	P	-1.175	N	3.22	T	-0.962	T	0.000	T	0.011	-2.259	0.004	1.68	0.079	0.518	7.420	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	109.071	0	NaN	NA	NA	139	0	139	42
chr12	6562823	6562823	C	T	exonic	TAPBPL	NaN	nonsynonymous SNV	TAPBPL:NM_018009:exon3:c.C506T:p.A169V	rs2041387	NaN	0.258187	0.42	T	0.003	B	0.003	B	0.049	N	1.000	P	1.78	L	3.02	T	-1.014	T	0.000	T	0.224	1.074	9.385	4.56	2.097	1.069	12.858	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	13.7706	0	NaN	NA	NA	151	82	69	15
chr12	6562836	6562836	G	A	exonic	TAPBPL	NaN	synonymous SNV	TAPBPL:NM_018009:exon3:c.G519A:p.P173P	rs2041388	NaN	0.202875	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.3993	0	NaN	NA	NA	147	88	59	13
chr12	65637253	65637253	A	G	intronic	LEMD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.253356	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	61	56	5	0
chr12	65639329	65639329	A	G	intronic	LEMD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.845225	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	213	202	11	0
chr12	6571369	6571369	A	A	UTR3	TAPBPL	NM_018009:c.*54A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	6572092	6572092	A	A	UTR3	VAMP1	NM_014231:c.*1544T>T,NM_199245:c.*1950T>T,NM_001297438:c.*33T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	6572101	6572101	A	A	UTR3	VAMP1	NM_014231:c.*1535T>T,NM_199245:c.*1941T>T,NM_001297438:c.*24T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	6572104	6572104	C	C	UTR3	VAMP1	NM_014231:c.*1532G>G,NM_199245:c.*1938G>G,NM_001297438:c.*21G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	6572105	6572105	A	A	UTR3	VAMP1	NM_014231:c.*1531T>T,NM_199245:c.*1937T>T,NM_001297438:c.*20T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	6573622	6573622	G	A	UTR3	VAMP1	NM_014231:c.*14C>T,NM_199245:c.*420C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.191034	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	52	46	6	0
chr12	6573716	6573716	T	C	UTR3	VAMP1	NM_199245:c.*326A>G	NaN	NaN	rs2534716	NaN	0.272564	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	128.632	27	NaN	NA	NA	77	44	33	20
chr12	6575191	6575191	A	T	intronic	VAMP1	NaN	NaN	NaN	rs2534718	NaN	0.985823	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	226.564085	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	76	0	76	57
chr12	6579757	6579757	T	C	UTR5	VAMP1	NM_016830:c.-60A>G,NM_014231:c.-60A>G,NM_199245:c.-60A>G,NM_001297438:c.-60A>G	NaN	NaN	rs2532489	NaN	0.996805	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.11779	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	0	18	52
chr12	6579812	6579812	T	C	UTR5	VAMP1	NM_016830:c.-115A>G,NM_014231:c.-115A>G,NM_199245:c.-115A>G,NM_001297438:c.-115A>G	NaN	NaN	rs2072376	NaN	0.461262	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	17	12	5	31
chr12	66235864	66235864	A	A	intronic	HMGA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	662448	662448	T	C	exonic	B4GALNT3	NaN	synonymous SNV	B4GALNT3:NM_173593:exon14:c.T1359C:p.L453L	rs758790	NaN	0.847244	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	246.175641	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	199	98	101	48
chr12	6634709	6634709	T	T	intronic	NCAPD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr12	6635274	6635274	G	A	exonic	NCAPD2	NaN	nonsynonymous SNV	NCAPD2:NM_014865:exon19:c.G2389A:p.V797M	rs10849482	NaN	0.107827	0.11	T	0.947	P	0.66	P	0.000	D	0.245	P	1.74	L	0.46	T	-1.123	T	0.000	T	0.622	4.010	20.6	5.62	2.653	2.367	13.892	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	543.492771	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	187	3	184	33
chr12	6636256	6636256	A	A	intronic	NCAPD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	6637136	6637136	A	G	exonic	NCAPD2	NaN	nonsynonymous SNV	NCAPD2:NM_014865:exon24:c.A3022G:p.K1008E	NaN	NaN	NaN	0.48	T	0.001	B	0.002	B	0.037	N	0.999	N	0.535	N	2.57	T	-1.011	T	0.040	T	0.234	0.371	6.013	3.42	0.446	2.124	7.456	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.188818	possible_contamination	REJECT	168	161	7	0
chr12	6643963	6643963	T	T	UTR5	GAPDH	NM_001289746:c.-36T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr12	66452500	66452500	A	G	intergenic	MIR6074,LLPH	dist=34994;dist=64349	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	6646077	6646077	C	A	intronic	GAPDH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.289584	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	34	28	6	0
chr12	6646665	6646665	C	C	intronic	GAPDH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	34	34	0	0
chr12	6649759	6649759	A	G	intronic	IFFO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.23076923076923198	NA	0	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr12	66541634	66541634	A	G	intronic	TMBIM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.831385	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	187	180	7	0
chr12	66546316	66546316	A	T	intronic	TMBIM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	66546317	66546317	A	C	intronic	TMBIM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	66546318	66546318	A	G	intronic	TMBIM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	66563705	66563705	A	G	exonic	TMBIM4	NaN	synonymous SNV	TMBIM4:NM_001282606:exon1:c.T27C:p.P9P,TMBIM4:NM_001282609:exon1:c.T27C:p.P9P,TMBIM4:NM_016056:exon1:c.T27C:p.P9P	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.472	T	0.224	T	.	0.894	8.634	-9.5	-2.732	-2.024	14.806	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.987819	nearby_gap_events	REJECT	113	106	7	0
chr12	6657900	6657900	T	T	exonic	IFFO1	NaN	synonymous SNV	IFFO1:NM_001039670:exon6:c.A1172A:p.D391D,IFFO1:NM_001193457:exon6:c.A1196A:p.D399D,IFFO1:NM_080730:exon6:c.A1172A:p.D391D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	70	NaN	NA	NA	22	22	0	0
chr12	666053	666053	C	T	intronic	B4GALNT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.028369194598967355	NA	0	0	NaN	NA	NA	56	31	25	0
chr12	6664273	6664273	C	T	intronic	IFFO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.242737	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	147	131	16	0
chr12	66704207	66704207	T	A	exonic	HELB	NaN	nonsynonymous SNV	HELB:NM_033647:exon4:c.T1499A:p.V500E	NaN	NaN	NaN	.	.	0.993	D	0.939	D	0.001	D	0.996	D	1.845	L	2.48	T	-1.146	T	0.076	T	0.616	4.326	22.7	4.9	1.116	3.570	12.128	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	30.7867	0	NaN	NA	NA	63	43	13	3
chr12	667059	667059	G	G	intronic	B4GALNT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	92	NaN	NA	NA	207	186	0	0
chr12	667060	667060	G	G	intronic	B4GALNT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	64	NaN	NA	NA	147	131	0	0
chr12	6670856	6670856	G	G	exonic	NOP2	NaN	synonymous SNV	NOP2:NM_001033714:exon11:c.C1169C:p.A390A,NOP2:NM_001258308:exon11:c.C1181C:p.A394A,NOP2:NM_001258310:exon11:c.C1169C:p.A390A,NOP2:NM_006170:exon11:c.C1169C:p.A390A,NOP2:NM_001258309:exon12:c.C1280C:p.A427A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	84	79	0	0
chr12	66716402	66716402	T	T	intronic	HELB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	15	13	0	0
chr12	66716603	66716603	T	G	intronic	HELB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr12	66716604	66716604	T	A	intronic	HELB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr12	66716607	66716607	T	A	intronic	HELB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	66731864	66731864	C	A	exonic	HELB	NaN	synonymous SNV	HELB:NM_033647:exon13:c.C3246A:p.T1082T	rs1168329	NaN	0.536342	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	65.823719	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	63	35	28	37
chr12	66765734	66765734	A	C	intronic	GRIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr12	6682447	6682447	A	G	intronic	CHD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr12	66839060	66839060	A	A	intronic	GRIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	6688160	6688160	A	A	intronic	CHD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	16	14	0	0
chr12	6692346	6692346	G	C	intronic	CHD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.039	B	0.04	B	0.013	N	1.000	D	.	.	-2.61	D	-0.123	T	0.559	D	0.226	2.472	14.22	5.96	2.832	5.729	11.280	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.305222	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	85	78	7	0
chr12	66935772	66935772	A	G	intronic	GRIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	3	4	0
chr12	66990589	66990589	A	G	intronic	GRIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	66990590	66990590	A	G	intronic	GRIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	6701234	6701234	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	10	1	4,4	0
chr12	6756244	6756244	A	A	intronic	ACRBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	15	12	0	0
chr12	6762090	6762090	C	C	intronic	ING4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	52	46	0	0
chr12	6762139	6762139	T	C	exonic	ING4	NaN	synonymous SNV	ING4:NM_001127585:exon3:c.A282G:p.S94S,ING4:NM_001127582:exon4:c.A354G:p.S118S,ING4:NM_001127583:exon4:c.A354G:p.S118S,ING4:NM_001127584:exon4:c.A354G:p.S118S,ING4:NM_001127586:exon4:c.A354G:p.S118S,ING4:NM_016162:exon4:c.A354G:p.S118S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.289154	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	64	61	3	0
chr12	6765875	6765875	T	C	intronic	ING4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.160384	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	206	197	9	0
chr12	67911487	67911487	C	C	intergenic	CAND1,LOC100507175	dist=203015;dist=2375	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	6804680	6804680	G	T	exonic	PIANP	NaN	nonsynonymous SNV	PIANP:NM_001244014:exon5:c.C743A:p.P248H,PIANP:NM_001244015:exon5:c.C743A:p.P248H,PIANP:NM_153685:exon5:c.C743A:p.P248H	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.991	D	0.001	U	0.973	D	0	N	0.87	T	-0.801	T	0.122	T	0.47	3.164	16.59	3.58	1.829	4.329	13.531	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.55335	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	6	3	3	0
chr12	6806546	6806546	T	T	exonic	PIANP	NaN	synonymous SNV	PIANP:NM_001244014:exon3:c.A430A:p.N144N,PIANP:NM_001244015:exon3:c.A430A:p.N144N,PIANP:NM_153685:exon3:c.A430A:p.N144N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	38	37	0	0
chr12	681506	681506	C	A	intronic	NINJ2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr12	681554	681554	G	A	intronic	NINJ2	NaN	NaN	NaN	rs2535415	NaN	0.195687	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	13	5	8	0
chr12	6833774	6833774	T	G	UTR5	COPS7A	NM_001164093:c.-49T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	6833775	6833775	T	A	UTR5	COPS7A	NM_001164093:c.-48T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	6839494	6839494	T	C	intronic	COPS7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	6839495	6839495	T	G	intronic	COPS7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	6839496	6839496	T	A	intronic	COPS7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	6840209	6840209	G	A	UTR3	COPS7A	NM_001164095:c.*4G>A,NM_001164094:c.*4G>A,NM_016319:c.*4G>A,NM_001164093:c.*4G>A	NaN	NaN	rs3168600	NaN	0.668331	1	T	0.131	B	0.04	B	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.003	T	0.000	T	0.298	1.783	11.92	4.82	2.497	4.150	16.270	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	69.2693	0	NaN	NA	NA	56	0	56	32
chr12	68549329	68549329	A	G	intronic	IFNG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	11	7	3	0
chr12	68549330	68549330	A	C	intronic	IFNG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	6	3	0
chr12	68552054	68552054	A	G	intronic	IFNG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.821862	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	112	103	9	0
chr12	68552056	68552056	A	G	intronic	IFNG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.016992	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	152	137	15	0
chr12	68646596	68646596	T	C	exonic	IL22	NaN	nonsynonymous SNV	IL22:NM_020525:exon2:c.A200G:p.D67G	NaN	NaN	NaN	.	.	0.131	B	0.047	B	0.000	D	1.000	D	2.425	M	0.31	T	-0.862	T	0.189	T	0.532	1.531	11.07	3.98	1.053	2.776	8.881	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.551912	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	273	261	12	0
chr12	68646617	68646617	A	A	intronic	IL22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	68688842	68688842	T	T	UTR3	MDM1	NM_001205028:c.*192A>A,NM_017440:c.*192A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	68707381	68707381	A	G	intronic	MDM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	2.15477	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	36	34	2	0
chr12	68719216	68719216	G	A	UTR3	MDM1	NM_001205029:c.*1998C>T,NM_020128:c.*1050C>T	NaN	NaN	rs2870812	NaN	0.678315	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.744685	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	11	14	49
chr12	6906407	6906407	C	A	intronic	CD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	69080809	69080809	C	T	UTR5	NUP107	NM_020401:c.-37C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	1.3815988493513166E-13	Somatic	152.053	48	140.236569	nearby_gap_events	REJECT	273	198	75	0
chr12	6909380	6909380	TG	GT,T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	507.896	0	NaN	NA	NA	54	0	2	3
chr12	6909381	6909381	G	T	intronic	CD4	NaN	NaN	NaN	rs200829690	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.599166	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	3	0	3	0
chr12	6909658	6909658	A	C	intronic	CD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	4	5	0
chr12	69124799	69124799	T	C	intronic	NUP107	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	21	8	7	0
chr12	69125378	69125378	A	T	intronic	NUP107	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.16541353383458768	NA	0	0	NaN	NA	NA	12	9	3	0
chr12	69125518	69125518	G	C	intronic	NUP107	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	21	11	10	0
chr12	69140420	69140420	T	C	exonic	SLC35E3	NaN	nonsynonymous SNV	SLC35E3:NM_018656:exon1:c.T263C:p.V88A	NaN	NaN	NaN	.	.	1.0	D	0.987	D	0.000	D	1.000	D	2.75	M	0.34	T	-0.207	T	0.374	T	0.881	4.961	28.9	4.98	1.996	7.534	14.980	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.927435	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	101	94	7	0
chr12	69202326	69202326	C	T	intronic	MDM2	NaN	NaN	NaN	rs2870820	NaN	0.232228	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	43	13.460253	normal_lod	REJECT	5	0	5	28
chr12	69210596	69210596	T	C	exonic	MDM2	NaN	nonsynonymous SNV	MDM2:NM_001145337:exon4:c.T161C:p.L54P,MDM2:NM_001145339:exon4:c.T179C:p.L60P,MDM2:NM_002392:exon4:c.T179C:p.L60P	NaN	NaN	NaN	.	.	0.99	D	0.947	D	0.000	D	1.000	D	1.67	L	1.43	T	-0.723	T	0.239	T	0.813	3.078	16.28	5.22	2.272	6.805	14.774	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.777236	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	146	139	7	0
chr12	69214167	69214167	T	G	intronic	MDM2	NaN	NaN	NaN	rs370498220	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.37896	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	163	153	10	0
chr12	69233487	69233487	C	A	exonic	MDM2	NaN	nonsynonymous SNV	MDM2:NM_001145340:exon5:c.C746A:p.P249H,MDM2:NM_001278462:exon6:c.C824A:p.P275H,MDM2:NM_001145339:exon9:c.C1187A:p.P396H,MDM2:NM_001145337:exon11:c.C1193A:p.P398H,MDM2:NM_002392:exon11:c.C1352A:p.P451H	NaN	NaN	NaN	.	.	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.405	M	-1.31	T	0.382	D	0.690	D	0.794	4.578	24.9	5.36	2.671	7.306	19.476	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	120	53	56	0
chr12	6925038	6925038	T	T	UTR5	CD4	NM_001195014:c.-114T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr12	6925125	6925125	C	C	UTR5	CD4	NM_001195014:c.-27C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	257	238	0	0
chr12	6932768	6932768	T	T	UTR5	GPR162	NM_014449:c.-147T>T,NM_019858:c.-297T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	21	20	0	0
chr12	6933787	6933787	A	G	exonic	GPR162	NaN	synonymous SNV	GPR162:NM_019858:exon2:c.A723G:p.V241V	rs1051409	NaN	0.489417	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	50.1425	0	14.716096	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	18
chr12	6935631	6935631	A	C	intronic	GPR162	NaN	NaN	NaN	rs2071081	NaN	0.215056	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	6935977	6935977	A	G	exonic	GPR162	NaN	nonsynonymous SNV	GPR162:NM_014449:exon5:c.A523G:p.R175G,GPR162:NM_019858:exon5:c.A1375G:p.R459G	rs11612427	NaN	0.105232	0.01	D	0.0	B	0.001	B	.	.	1.000	P	1.385	L	3.07	T	-1.029	T	0.000	T	0.282	1.529	11.06	3.13	1.006	1.813	10.942	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.130428	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	37	15	26
chr12	6938026	6938026	T	T	exonic	P3H3	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	6939787	6939787	T	T	intronic	P3H3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr12	6940313	6940313	T	T	intronic	P3H3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	6940353	6940353	C	A	intronic	P3H3	NaN	NaN	NaN	rs374368532	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	60.678798	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	279	208	71	0
chr12	6940381	6940381	G	C	exonic	P3H3	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.53715	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	230	212	18	0
chr12	6940563	6940563	A	C	intronic	P3H3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	17	5	10	0
chr12	6941021	6941021	G	A	exonic	P3H3	NaN	unknown	UNKNOWN	rs1047771	NaN	0.304912	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSm	3	Somatic	0.03965316160438195	Somatic	131.907	36	NaN	NA	NA	34	14	20	14
chr12	6946247	6946247	G	T	exonic	P3H3	NaN	unknown	UNKNOWN	rs1129646	ID=COSM431758,COSM431757;OCCURENCE=1(breast)	0.391374	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	163.529231	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	170	96	74	22
chr12	6946493	6946493	T	C	intronic	P3H3	NaN	NaN	NaN	rs4963518	NaN	0.81849	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	148.871666	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	0	53	36
chr12	6948370	6948370	A	G	intronic	P3H3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	10	1	9	0
chr12	6948468	6948468	T	C	exonic	P3H3	NaN	unknown	UNKNOWN	rs1129649	NaN	0.378794	0.26	T	0.0	B	0.0	B	0.204	N	1.000	P	.	.	1.87	T	-0.924	T	0.000	T	0.42	0.775	8.095	2.36	0.203	0.795	7.603	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.788	0	NaN	NA	NA	274	141	133	16
chr12	6950579	6950579	G	A	intronic	GNB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.502928	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	67	60	7	0
chr12	6950793	6950793	G	C	intronic	GNB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.425506	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	118	106	12	0
chr12	6950794	6950794	A	G	intronic	GNB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.3156	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	119	109	10	0
chr12	6950795	6950795	C	A	intronic	GNB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.641171	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	110	100	10	0
chr12	6958542	6958542	G	A	exonic	CDCA3	NaN	nonsynonymous SNV	CDCA3:NM_001297602:exon5:c.C521T:p.S174F,CDCA3:NM_031299:exon5:c.C596T:p.S199F	NaN	NaN	NaN	0	D	0.998	D	0.939	D	0.000	D	1.000	D	2.075	M	.	.	-0.213	T	0.401	T	0.776	4.382	23.2	5.08	2.802	5.525	16.787	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	70	43	27	0
chr12	6958543	6958543	A	A	exonic	CDCA3	NaN	synonymous SNV	CDCA3:NM_001297602:exon5:c.T520T:p.S174S,CDCA3:NM_031299:exon5:c.T595T:p.S199S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	187	156	0	0
chr12	69646659	69646659	T	G	intronic	CPSF6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	20	14	6	0
chr12	69651719	69651719	A	A	intronic	CPSF6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr12	69653357	69653357	T	C	intronic	CPSF6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.706321	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	121	116	5	0
chr12	6965801	6965801	GCCCT	GCCC,GCCCC,GCCT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	4122.9	0	NaN	NA	NA	480	0	61	17
chr12	6967584	6967584	A	G	intronic	USP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	19	7.667774	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	5	2	3	0
chr12	6972270	6972270	T	A	intronic	USP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	6975292	6975292	G	G	UTR3	USP5	NM_001098536:c.*51G>G,NM_003481:c.*51G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	69753595	69753595	C	T	UTR5	YEATS4	NM_006530:c.-158C>T,NM_001300950:c.-158C>T	NaN	NaN	rs622656	NaN	0.636182	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	125.723181	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	0	43	48
chr12	69754012	69754012	C	T	intronic	YEATS4	NaN	NaN	NaN	rs634512	NaN	0.434105	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	69756625	69756625	A	T	exonic	YEATS4	NaN	stopgain	YEATS4:NM_001300950:exon2:c.A109T:p.K37X,YEATS4:NM_006530:exon2:c.A109T:p.K37X	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	6.849	38	5.76	2.195	9.337	16.080	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.35109	0	NaN	NA	NA	21	17	2	6
chr12	69764417	69764417	A	T	intronic	YEATS4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.05784204671857579	NA	0	0	7.018729	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	30	24	6	0
chr12	6980532	6980532	A	A	intronic	SPSB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr12	69964108	69964108	T	A	intronic	FRS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.07382281066491647	NA	0	0	NaN	NA	NA	24	19	5	0
chr12	69965883	69965883	T	T	intronic	FRS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	69979190	69979190	GGCCCCGCCCCCCG	GCCCGCCCCCCG,GGCCCGCCCCCCG,GGCCCGCCCCCCGC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	589.681	0	NaN	NA	NA	69	1	16	0
chr12	69979195	69979195	C	G	upstream;downstream	CCT2,MIR3913-1;MIR3913-2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.39912280701755176	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr12	69981453	69981453	A	A	intronic	CCT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr12	69981862	69981862	G	A	intronic	CCT2	NaN	NaN	NaN	rs530701	NaN	0.785543	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	389.595	0	NaN	NA	NA	32	0	32	42
chr12	69983175	69983175	T	T	intronic	CCT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	69994975	69994975	T	C	intronic	CCT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	69994980	69994980	A	C	intronic	CCT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	70195376	70195376	C	C	intronic	RAB3IP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	33	29	0	0
chr12	70209121	70209121	ATC	ATA,A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	152.853	0	NaN	NA	NA	131	74	10	1
chr12	70209123	70209123	C	A	intronic	RAB3IP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.686763	nearby_gap_events	REJECT	101	90	11	0
chr12	7030706	7030706	T	T	intronic	ENO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	587	489	0	0
chr12	7043723	7043723	A	C	exonic	ATN1	NaN	synonymous SNV	ATN1:NM_001007026:exon4:c.A261C:p.P87P,ATN1:NM_001940:exon4:c.A261C:p.P87P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.52471	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	217	201	16	0
chr12	7046745	7046745	G	C	intronic	ATN1	NaN	NaN	NaN	rs12426246	NaN	0.146765	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.533276	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	3	4	16
chr12	7047034	7047034	T	T	exonic	ATN1	NaN	synonymous SNV	ATN1:NM_001007026:exon6:c.T2321T:p.F774F,ATN1:NM_001940:exon6:c.T2321T:p.F774F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	38	37	0	0
chr12	7047742	7047742	G	C	exonic	ATN1	NaN	synonymous SNV	ATN1:NM_001007026:exon7:c.G2616C:p.V872V,ATN1:NM_001940:exon7:c.G2616C:p.V872V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.78365	nearby_gap_events	REJECT	23	16	7	0
chr12	7047743	7047743	C	G	exonic	ATN1	NaN	nonsynonymous SNV	ATN1:NM_001007026:exon7:c.C2617G:p.P873A,ATN1:NM_001940:exon7:c.C2617G:p.P873A	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.989	D	0.937	D	0.005	U	0.999	D	1.625	L	0.49	T	-0.572	T	0.258	T	0.329	3.649	18.55	3.8	1.351	7.139	13.485	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.327847	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	14	7	7	0
chr12	7061466	7061466	A	G	intronic	PTPN6	NaN	NaN	NaN	rs4963514	NaN	0.983227	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	874.454	0	NaN	NA	NA	32	0	32	45
chr12	7064787	7064787	T	T	intronic	PTPN6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	47	43	0	0
chr12	7067073	7067073	T	C	intronic	PTPN6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.324415	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	205	200	5	0
chr12	70672123	70672123	A	A	intronic	CNOT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	7068923	7068923	T	T	intronic	PTPN6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	7069247	7069247	C	A	intronic	PTPN6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr12	70724292	70724292	A	A	intronic	CNOT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	70737853	70737853	AT	A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	607.472	0	NaN	NA	NA	308	158	144	4
chr12	70740194	70740194	G	A	intronic	CNOT2	NaN	NaN	NaN	rs3817487	NaN	0.570487	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	224.749805	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	81	0	81	40
chr12	70793956	70793956	A	G	intronic	KCNMB4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.561656	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	193	186	7	0
chr12	7080212	7080212	T	G	splicing	EMG1	NM_006331:exon1:c.125+1T>G,NM_006331:exon2:c.126-1T>G	NaN	NaN	rs17857448	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	1837.76	51	NaN	NA	NA	22	0	22	0
chr12	70925986	70925986	A	T	intronic	PTPRB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	18	7	11	0
chr12	70933687	70933687	A	G	intronic	PTPRB	NaN	NaN	NaN	rs919595	NaN	0.579673	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	65.425517	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	10	25	51
chr12	70953046	70953046	G	G	intronic	PTPRB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	72	61	0	0
chr12	70954737	70954737	A	A	intronic	PTPRB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	70981068	70981068	A	A	intronic	PTPRB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	18	15	0	0
chr12	71002775	71002775	T	T	intronic	PTPRB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	71003081	71003081	C	A	exonic	PTPRB	NaN	synonymous SNV	PTPRB:NM_001206971:exon2:c.G93T:p.L31L,PTPRB:NM_001206972:exon2:c.G93T:p.L31L,PTPRB:NM_002837:exon2:c.G93T:p.L31L,PTPRB:NM_001109754:exon4:c.G747T:p.L249L	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.506	T	0.329	T	.	-1.358	0.028	4.89	2.533	2.523	15.104	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.358011	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	122	116	6	0
chr12	71003515	71003515	C	T	intronic	PTPRB	NaN	NaN	NaN	rs2252674	NaN	0.269369	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	215.205	0	NaN	NA	NA	99	57	42	11
chr12	71033129	71033129	T	T	intronic	PTPRR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	71050444	71050444	T	C	intronic	PTPRR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	2	3	0
chr12	71148097	71148097	A	C	UTR5	PTPRR	NM_130846:c.-124T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.789677	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	36	32	4	0
chr12	71523134	71523134	A	C	exonic	TSPAN8	NaN	nonsynonymous SNV	TSPAN8:NM_004616:exon8:c.T637G:p.S213A	rs1051334	NaN	0.250799	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-2.935	N	-1.04	T	-0.957	T	0.000	T	0.059	0.001	4.019	4.88	0.895	1.278	12.030	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	79.39113	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	14	31	33
chr12	71531694	71531694	A	C	intronic	TSPAN8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	71531695	71531695	T	G	intronic	TSPAN8	NaN	NaN	NaN	rs368303868	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	71531696	71531696	G	A	intronic	TSPAN8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	71532078	71532078	A	C	intronic	TSPAN8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	71533432	71533432	T	T	intronic	TSPAN8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	71533534	71533534	C	G	exonic	TSPAN8	NaN	nonsynonymous SNV	TSPAN8:NM_004616:exon4:c.G218C:p.G73A	rs3763978	ID=COSM1364054;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.227037	0.01	D	0.999	D	0.989	D	0.000	D	0.000	P	3.59	H	-3.52	D	-1.673	T	0.000	T	0.381	3.885	19.74	5.09	2.525	4.362	16.363	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	70.349806	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	30	30	34
chr12	7169279	7169279	A	G	intronic	C1S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	16	7	6	0
chr12	7174257	7174257	T	T	intronic	C1S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr12	71898516	71898516	T	C	intronic	LGR5	NaN	NaN	NaN	rs79673104	NaN	0.0355431	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	94.803302	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	63	24	39	6
chr12	71946671	71946671	T	C	intronic	LGR5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	3	5	0
chr12	71972567	71972567	T	G	intronic	LGR5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr12	71974223	71974223	G	C	intronic	LGR5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	71977908	71977908	T	C	exonic	LGR5	NaN	synonymous SNV	LGR5:NM_001277226:exon17:c.T2046C:p.Y682Y,LGR5:NM_001277227:exon17:c.T1902C:p.Y634Y,LGR5:NM_003667:exon18:c.T2118C:p.Y706Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.143003	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	265	257	8	0
chr12	72014214	72014214	A	A	intronic	ZFC3H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	72038690	72038690	T	C	exonic	ZFC3H1	NaN	nonsynonymous SNV	ZFC3H1:NM_144982:exon4:c.A1246G:p.K416E	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.993	D	0.971	D	0.000	D	1.000	D	0.55	N	1.2	T	-0.928	T	0.132	T	0.526	4.188	21.7	5.48	2.079	5.149	15.567	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.1718	0	NaN	NA	NA	21	16	3	0
chr12	72083508	72083508	A	A	intronic	TMEM19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	72175804	72175804	A	A	intronic	RAB21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	163	146	0	0
chr12	72425483	72425483	A	A	UTR3	TPH2	NM_173353:c.*8A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	15	13	0	0
chr12	72680747	72680747	A	A	intronic	TRHDE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr12	72706626	72706626	T	C	intronic	TRHDE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	72706629	72706629	C	G	intronic	TRHDE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	72867037	72867037	A	A	intronic	TRHDE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	18	15	0	0
chr12	72893499	72893499	T	C	intronic	TRHDE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.496348	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	63	57	6	0
chr12	72955901	72955901	C	T	intronic	TRHDE	NaN	NaN	NaN	rs2272507	NaN	0.243011	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	107.941	19	57.712024	normal_lod	REJECT	54	29	25	0
chr12	72956100	72956100	T	G	intronic	TRHDE	NaN	NaN	NaN	rs2272506	NaN	0.34984	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	43.7885	0	16.187269	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	5	7	4
chr12	72956570	72956570	T	C	intronic	TRHDE	NaN	NaN	NaN	rs1968965	NaN	0.34984	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.320987	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	27	19	9
chr12	7295928	7295928	G	A	intronic	CLSTN3	NaN	NaN	NaN	rs113899462	NaN	0.0251597	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	34.8275	23	NaN	NA	NA	136	25	111	1
chr12	7301878	7301878	A	C	intronic	CLSTN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	7301879	7301879	A	T	intronic	CLSTN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	7301883	7301883	G	C	intronic	CLSTN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	7303450	7303450	T	T	intronic	CLSTN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	7308759	7308759	G	C	intronic	CLSTN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	7308760	7308760	G	A	intronic	CLSTN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	7309965	7309965	C	T	intronic	CLSTN3	NaN	NaN	NaN	rs77250502	NaN	0.164537	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	68.822511	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	0	25	10
chr12	7311837	7311837	C	T	downstream	CLSTN3	NaN	NaN	NaN	rs3742086	NaN	0.171725	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	21	2	19	0
chr12	7351765	7351765	A	A	intronic	PEX5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	74565044	74565044	G	A	ncRNA_intronic	LOC100507377	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr12	7456915	7456915	T	C	upstream	ACSM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr12	7475738	7475738	T	C	intronic	ACSM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	7	1	5	0
chr12	7509927	7509927	T	T	intronic	CD163L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr12	7525901	7525901	T	T	intronic	CD163L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	7526279	7526279	A	G	intronic	CD163L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr12	7548607	7548607	T	T	intronic	CD163L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	7549022	7549022	A	A	intronic	CD163L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr12	7550840	7550840	T	T	intronic	CD163L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	75687185	75687185	G	A	intronic	CAPS2	NaN	NaN	NaN	rs7967562	NaN	0.625799	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.451589	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	21	17	53
chr12	75706720	75706720	T	C	intronic	CAPS2	NaN	NaN	NaN	rs60971359	NaN	0.291733	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	192.749465	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	145	66	79	35
chr12	75715371	75715371	A	G	intronic	CAPS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.754372	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	181	169	12	0
chr12	75715443	75715443	A	A	intronic	CAPS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	75719088	75719088	T	T	intronic	CAPS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	68	59	0	0
chr12	75720258	75720258	T	C	exonic	CAPS2	NaN	synonymous SNV	CAPS2:NM_001286547:exon2:c.A42G:p.G14G,CAPS2:NM_032606:exon2:c.A78G:p.G26G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.83007	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	330	319	11	0
chr12	75720380	75720380	A	A	intronic	CAPS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	75728451	75728451	C	G	UTR5	GLIPR1L1	NM_001304964:c.-58C>G,NM_152779:c.-58C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.33939393939393997	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr12	75756976	75756976	C	C	intronic	CAPS2,GLIPR1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	51	42	0	0
chr12	75816819	75816819	G	C	exonic	GLIPR1L2	NaN	nonsynonymous SNV	GLIPR1L2:NM_152436:exon4:c.G720C:p.K240N	rs77365041	ID=COSM300060;OCCURENCE=1(large_intestine)	NaN	.	.	0.004	B	0.003	B	.	.	1.000	N	.	.	3.15	T	-0.927	T	0.011	T	0.015	1.275	10.16	-0.073	0.327	1.699	2.901	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.325921	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	138	130	8	3
chr12	7585247	7585247	T	C	exonic	CD163L1	NaN	synonymous SNV	CD163L1:NM_001297650:exon4:c.A561G:p.G187G,CD163L1:NM_174941:exon4:c.A531G:p.G177G	rs58195891	NaN	0.605831	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	567.843	0	NaN	NA	NA	268	133	84	23
chr12	75889511	75889511	A	A	intronic	GLIPR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr12	75897617	75897617	T	T	intronic	KRR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr12	7632403	7632403	T	C	intronic	CD163	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	12	4	8	0
chr12	7639864	7639864	T	G	intronic	CD163	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr12	76461145	76461145	C	T	intronic	NAP1L1	NaN	NaN	NaN	rs7972289	NaN	0.84984	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	162.507308	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	58	0	58	57
chr12	7649484	7649484	T	C	exonic	CD163	NaN	nonsynonymous SNV	CD163:NM_004244:exon5:c.A1024G:p.I342V,CD163:NM_203416:exon5:c.A1024G:p.I342V	rs4883263	NaN	0.76258	0.09	T	0.004	B	0.007	B	0.033	N	1.000	P	0.96	L	1.31	T	-1.020	T	0.000	T	0.035	0.253	5.366	-1.5	-0.925	-0.207	11.112	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	138.308	0	NaN	NA	NA	125	0	125	41
chr12	76780491	76780491	T	C	intronic	OSBPL8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.27752	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	88	84	4	0
chr12	76786208	76786208	T	T	intronic	OSBPL8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	76853683	76853683	G	A	intronic	OSBPL8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.978815	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	74	59	15	0
chr12	77157983	77157983	C	G	UTR5	ZDHHC17	NM_015336:c.-34C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	77157991	77157991	G	T	UTR5	ZDHHC17	NM_015336:c.-26G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	77157994	77157994	A	T	UTR5	ZDHHC17	NM_015336:c.-23A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	77157996	77157996	G	T	UTR5	ZDHHC17	NM_015336:c.-21G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	77158003	77158003	C	T	UTR5	ZDHHC17	NM_015336:c.-14C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	77158005	77158005	C	T	UTR5	ZDHHC17	NM_015336:c.-12C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	77158006	77158006	T	G	UTR5	ZDHHC17	NM_015336:c.-11T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	77158010	77158010	T	T	UTR5	ZDHHC17	NM_015336:c.-7T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	77158217	77158217	A	A	intronic	ZDHHC17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	77209613	77209613	G	G	intronic	ZDHHC17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	21	17	0	0
chr12	77235926	77235926	A	A	intronic	ZDHHC17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	77421601	77421601	T	A	intronic	E2F7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.571199	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	243	235	8	0
chr12	7802092	7802092	T	T	UTR3	APOBEC1	NM_001644:c.*51A>A,NM_005889:c.*51A>A,NM_001304566:c.*51A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	78334261	78334261	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	8	2	2,4	0
chr12	78513130	78513130	C	G	exonic	NAV3	NaN	nonsynonymous SNV	NAV3:NM_001024383:exon15:c.C3154G:p.P1052A,NAV3:NM_014903:exon15:c.C3154G:p.P1052A	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.998	D	0.001	U	1.000	D	2.275	M	0.73	T	-0.441	T	0.336	T	0.52	4.541	24.5	6.0	2.836	7.590	20.483	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.065185	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	295	281	14	0
chr12	78513581	78513581	A	G	exonic	NAV3	NaN	nonsynonymous SNV	NAV3:NM_001024383:exon15:c.A3605G:p.E1202G,NAV3:NM_014903:exon15:c.A3605G:p.E1202G	NaN	NaN	NaN	0.74	T	1.0	D	0.998	D	0.001	U	1.000	D	0.695	N	1.55	T	-1.031	T	0.123	T	0.705	1.158	9.714	5.55	2.101	6.998	15.698	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.002500299789636575	NA	0	0	16.113412	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	69	53	16	0
chr12	78515694	78515694	G	G	intronic	NAV3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	74	66	0	0
chr12	78530979	78530979	G	A	exonic	NAV3	NaN	synonymous SNV	NAV3:NM_001024383:exon19:c.G4464A:p.Q1488Q,NAV3:NM_014903:exon19:c.G4464A:p.Q1488Q	rs1852464	NaN	0.61222	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.126	T	0.000	T	.	-0.898	0.442	-7.26	-2.031	0.745	19.419	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	326.344	0	87.939852	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	0	33	43
chr12	78542699	78542699	T	C	exonic	NAV3	NaN	synonymous SNV	NAV3:NM_001024383:exon22:c.T4785C:p.N1595N,NAV3:NM_014903:exon22:c.T4785C:p.N1595N	rs366527	NaN	0.365815	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-0.900	T	0.000	T	.	1.580	11.24	1.72	0.337	0.670	9.038	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.227806	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	1	6	20
chr12	78562497	78562497	T	T	intronic	NAV3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	78562687	78562687	A	G	intronic	NAV3	NaN	NaN	NaN	rs1726431	NaN	0.960863	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	222.738686	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	81	0	81	57
chr12	78570947	78570947	T	T	exonic	NAV3	NaN	synonymous SNV	NAV3:NM_001024383:exon27:c.T5151T:p.F1717F,NAV3:NM_014903:exon27:c.T5151T:p.F1717F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	20	19	0	0
chr12	78582194	78582194	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	0	2,4	0
chr12	78583742	78583742	ATT	A,AT,CTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	161.376	0	NaN	NA	NA	58	0	9	0
chr12	78592992	78592992	ATGGGAACATTATTAC	A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	59.6821	0	NaN	NA	NA	11	3	8	7
chr12	78594418	78594418	C	C	intronic	NAV3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	189	146	0	0
chr12	7945559	7945559	T	C	exonic	NANOG	NaN	synonymous SNV	NANOG:NM_001297698:exon2:c.T165C:p.P55P,NANOG:NM_024865:exon2:c.T165C:p.P55P	rs4294629	NaN	0.379593	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1793.48	0	NaN	NA	NA	154	1	153	39
chr12	7947304	7947304	T	C	exonic	NANOG	NaN	synonymous SNV	NANOG:NM_024865:exon4:c.T531C:p.L177L	rs4012939	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1045.85	0	NaN	NA	NA	252	0	252	13
chr12	79480629	79480629	C	T	intronic	SYT1	NaN	NaN	NaN	rs1877912	NaN	0.158347	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	79611536	79611536	T	C	intronic	SYT1	NaN	NaN	NaN	rs2400390	NaN	0.628195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	72.684268	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	0	26	44
chr12	79842709	79842709	G	T	exonic	SYT1	NaN	synonymous SNV	SYT1:NM_001135806:exon10:c.G1074T:p.V358V,SYT1:NM_001291901:exon10:c.G1065T:p.V355V,SYT1:NM_005639:exon11:c.G1074T:p.V358V,SYT1:NM_001135805:exon12:c.G1074T:p.V358V	rs12812916	NaN	0.0185703	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	134.802034	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	128	66	62	9
chr12	79986519	79986519	A	G	intronic	PAWR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr12	80007166	80007166	T	T	intronic	PAWR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr12	80182327	80182327	C	A	intronic	PPP1R12A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.495658	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	106	98	8	0
chr12	80222074	80222074	T	TTA	intronic	PPP1R12A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.05541	0	NaN	NA	NA	19	16	3	0
chr12	80222214	80222214	A	G	exonic	PPP1R12A	NaN	synonymous SNV	PPP1R12A:NM_001143886:exon5:c.T417C:p.N139N,PPP1R12A:NM_001244992:exon5:c.T678C:p.N226N,PPP1R12A:NM_002480:exon5:c.T678C:p.N226N,PPP1R12A:NM_001143885:exon6:c.T678C:p.N226N,PPP1R12A:NM_001244990:exon6:c.T678C:p.N226N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.273565	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	70	66	4	0
chr12	80611324	80611324	T	T	intronic	OTOGL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr12	80648399	80648399	C	T	intronic	OTOGL	NaN	NaN	NaN	rs7295623	NaN	0.995407	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	869.315	0	NaN	NA	NA	82	0	82	40
chr12	80660923	80660923	G	A	intronic	OTOGL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	80660928	80660928	T	C	intronic	OTOGL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	0	2	0
chr12	80730561	80730561	C	T	intronic	OTOGL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.009709	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	68	60	8	0
chr12	80730664	80730664	G	A	intronic	OTOGL	NaN	NaN	NaN	rs10862093	NaN	0.487021	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	63.440941	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	36
chr12	80736047	80736047	A	C	intronic	OTOGL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.02843	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	206	164	42	2
chr12	80746239	80746239	T	A	intronic	OTOGL	NaN	NaN	NaN	rs201981317	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.958093	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	114	99	15	0
chr12	80750535	80750535	T	C	intronic	OTOGL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.676732	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	205	193	12	0
chr12	80750536	80750536	C	A	intronic	OTOGL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.239261	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	215	203	12	0
chr12	80750739	80750739	A	G	intronic	OTOGL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.247465	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	375	340	35	0
chr12	80750741	80750741	G	A	intronic	OTOGL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.372985	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	365	339	26	0
chr12	8085631	8085631	C	A	exonic	SLC2A3	NaN	nonsynonymous SNV	SLC2A3:NM_006931:exon3:c.G221T:p.G74V	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	4.175	H	-0.9	T	0.712	D	0.711	D	0.895	3.313	17.14	4.04	2.238	6.999	14.068	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.439222	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	160	149	11	0
chr12	80862652	80862652	A	G	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr12	80878174	80878174	T	A	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	rs7311413	NaN	0.766174	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	49.1638	0	NaN	NA	NA	82	14	68	1
chr12	80878181	80878181	C	C	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	77	NaN	NA	NA	253	194	0	0
chr12	80890325	80890325	T	TG	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.751398	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1425.54	0	NaN	NA	NA	162	3	137	31
chr12	80900495	80900495	C	C	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	191	137	0	0
chr12	80935907	80935907	T	C	exonic	PTPRQ	NaN	nonsynonymous SNV	PTPRQ:NM_001145026:exon19:c.T2969C:p.L990P	NaN	NaN	NaN	0.29	T	1.0	D	0.998	D	.	.	1.000	D	.	.	0.36	T	-0.701	T	0.261	T	0.658	2.049	12.81	4.33	0.923	3.917	6.532	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.271354	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	71	67	4	0
chr12	80936688	80936688	A	T	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.0027396778169701836	Somatic	1208.95	0	NaN	NA	NA	97	73	24	1
chr12	80936690	80936690	T	A	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.014311657444183898	NA	0	0	NaN	NA	NA	54	37	17	1
chr12	81013359	81013359	A	G	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	81014170	81014170	T	A	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	81015832	81015832	T	A	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.855914	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	155	147	8	0
chr12	81042638	81042638	T	T	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	81064300	81064300	A	G	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	15	3	12	0
chr12	81066893	81066893	T	A	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr12	81072322	81072322	T	C	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	23	13	9	0
chr12	81072525	81072525	A	C	intronic	PTPRQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr12	81102159	81102159	A	A	intronic	MYF6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	81331238	81331238	C	T	intronic	LIN7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.604507	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	81	77	4	0
chr12	81471816	81471816	C	C	UTR5	ACSS3	NM_024560:c.-84C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	82	NaN	NA	NA	173	139	0	0
chr12	81545810	81545810	GT	TG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.8814	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr12	81647065	81647065	G	A	intronic	ACSS3	NaN	NaN	NaN	rs2895868	NaN	0.221645	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	171.557	0	NaN	NA	NA	165	60	105	9
chr12	81676765	81676765	T	T	ncRNA_intronic	LOC102724663	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr12	81676767	81676767	T	T	ncRNA_intronic	LOC102724663	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr12	81676768	81676768	T	T	ncRNA_intronic	LOC102724663	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	15	11	0	0
chr12	81696487	81696487	G	A	ncRNA_intronic	LOC102724663	NaN	NaN	NaN	rs1921052	NaN	0.25599	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	41.6837	0	NaN	NA	NA	91	51	40	27
chr12	81732923	81732923	A	A	intronic	PPFIA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	81741679	81741679	A	T	intronic	PPFIA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.347856	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	243	234	9	0
chr12	81741681	81741681	T	A	intronic	PPFIA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.723851	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	134	125	9	0
chr12	81762446	81762446	T	T	intronic	PPFIA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr12	8205300	8205300	A	T	intronic	FOXJ2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	62	NaN	NA	NA	442	217	225	0
chr12	82746843	82746843	T	T	UTR3	CCDC59	NM_014167:c.*87A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr12	82751987	82751987	T	C	intronic	CCDC59	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.621847	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	69	65	4	0
chr12	82752543	82752543	T	G	exonic	METTL25	NaN	nonsynonymous SNV	METTL25:NM_032230:exon1:c.T199G:p.S67A	rs112592060	NaN	0.0423323	0.8	T	0.0	B	0.0	B	0.504	N	1.000	N	-0.55	N	1.56	T	-1.031	T	0.001	T	0.017	-0.702	0.966	0.59	0.280	0.707	6.107	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	19.1504	0	6.682395	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	8	4	7
chr12	82752559	82752559	T	G	exonic	METTL25	NaN	nonsynonymous SNV	METTL25:NM_032230:exon1:c.T215G:p.L72R	rs113882703	NaN	0.0423323	0.38	T	0.0	B	0.0	B	0.125	N	0.987	N	-1.43	N	1.49	T	-1.053	T	0.001	T	0.081	0.093	4.504	-5.17	-0.704	.	1.300	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	19.1504	0	8.38981	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	8	4	7
chr12	8276423	8276423	A	T	UTR5	CLEC4A	NM_016184:c.-52A>T,NM_194447:c.-52A>T,NM_194450:c.-52A>T,NM_194448:c.-52A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.631055	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	152	134	18	0
chr12	82780638	82780638	G	A	exonic	METTL25	NaN	nonsynonymous SNV	METTL25:NM_032230:exon2:c.G316A:p.E106K	NaN	NaN	NaN	0.64	T	0.544	P	0.077	B	0.025	N	0.617	N	2.42	M	1.46	T	-0.401	T	0.291	T	0.821	3.681	18.70	6.14	2.937	3.889	13.909	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	2.702235	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	130	127	3	0
chr12	82796923	82796923	A	A	intronic	METTL25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr12	82870376	82870376	A	G	intronic	METTL25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.517065	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	77	66	11	0
chr12	8290916	8290916	T	C	UTR3	CLEC4A	NM_016184:c.*33T>C,NM_194447:c.*33T>C,NM_194450:c.*33T>C,NM_194448:c.*33T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	83250926	83250926	G	A	exonic	TMTC2	NaN	nonsynonymous SNV	TMTC2:NM_152588:exon2:c.G221A:p.R74H	NaN	NaN	NaN	0.08	T	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.375	M	0.41	T	-0.066	T	0.515	D	0.908	5.156	32	6.16	2.937	9.869	19.040	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.869883	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	277	271	6	0
chr12	83290441	83290441	A	A	intronic	TMTC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	19	16	0	0
chr12	8329652	8329652	A	G	exonic	ZNF705A	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF705A:NM_001004328:exon5:c.A376G:p.T126A	rs10743251	ID=COSM147414;OCCURENCE=1(stomach)	NaN	0.3	T	0.225	B	0.02	B	.	.	1.000	P	0.61	N	3.21	T	-0.963	T	0.000	T	0.053	0.649	7.485	1.35	0.891	2.005	4.263	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	28.3021	0	NaN	NA	NA	68	24	44	30
chr12	8329676	8329676	C	T	exonic	ZNF705A	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF705A:NM_001004328:exon5:c.C400T:p.R134C	rs10743252	ID=COSM147415;OCCURENCE=1(stomach)	0.501398	0.05	D	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	0.205	N	3.07	T	-0.928	T	0.000	T	0.044	-0.677	1.048	-2.7	-2.873	-1.071	3.854	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	34.6967	0	NaN	NA	NA	71	26	45	30
chr12	8329700	8329700	A	C	exonic	ZNF705A	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF705A:NM_001004328:exon5:c.A424C:p.K142Q	rs10743253	ID=COSM147416;OCCURENCE=1(stomach)	0.429712	0	D	0.981	D	0.854	P	.	.	0.997	P	2.955	M	4.36	T	-0.959	T	0.000	T	0.097	3.111	16.40	1.35	0.891	3.275	6.812	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	44.3983	0	NaN	NA	NA	68	23	45	29
chr12	8329833	8329833	G	A	exonic	ZNF705A	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF705A:NM_001004328:exon5:c.G557A:p.R186H	rs11043758	ID=COSM147417;OCCURENCE=1(stomach)	NaN	.	.	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	-0.795	N	3.76	T	-0.981	T	0.000	T	0.047	-1.495	0.017	-2.7	-2.388	-2.401	2.885	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.39586	0	NaN	NA	NA	351	148	203	1
chr12	83526187	83526187	A	A	UTR3	TMTC2	NM_152588:c.*19A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr12	8377444	8377444	G	C	UTR5	FAM90A1	NM_018088:c.-16C>G	NaN	NaN	rs35091321	NaN	0.00858626	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.4825	0	NaN	NA	NA	16	12	4	2
chr12	84022813	84022813	C	T	intergenic	TMTC2,SLC6A15	dist=494746;dist=1230454	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	85279363	85279363	A	A	intronic	SLC6A15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr12	85423743	85423743	T	C	UTR5	TSPAN19	NM_001100917:c.-19A>G	NaN	NaN	rs7962577	NaN	0.578275	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	164.728067	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	120	54	66	36
chr12	85438499	85438499	G	A	exonic	LRRIQ1	NaN	nonsynonymous SNV	LRRIQ1:NM_001079910:exon4:c.G248A:p.C83Y	rs3765044	NaN	0.206669	1	T	0.0	B	0.0	B	0.525	N	1.000	P	0.805	L	0.95	T	-1.012	T	0.000	T	0.247	-3.384	0.001	-2.93	-0.584	-0.698	9.209	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	70.589068	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	18	27	22
chr12	85449319	85449319	T	G	intronic	LRRIQ1	NaN	NaN	NaN	rs35058290	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	23.7378	0	NaN	NA	NA	30	22	8	33
chr12	85492094	85492094	C	T	intronic	LRRIQ1	NaN	NaN	NaN	rs34798402	NaN	0.206869	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	77.254006	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	27	32	24
chr12	85546303	85546303	A	A	intronic	LRRIQ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr12	85547515	85547515	A	G	exonic	LRRIQ1	NaN	nonsynonymous SNV	LRRIQ1:NM_001079910:exon22:c.A4616G:p.E1539G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.984	D	.	.	0.897	N	0.55	N	0.43	T	-0.797	T	0.207	T	0.264	2.824	15.41	5.66	2.137	3.005	11.835	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.623245	nearby_gap_events	REJECT	163	154	9	0
chr12	8612109	8612109	G	C	intronic	CLEC6A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	8612111	8612111	A	G	intronic	CLEC6A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	8612336	8612336	G	C	intronic	CLEC6A	NaN	NaN	NaN	rs10770736	NaN	0.780751	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	201.785388	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	68	0	68	50
chr12	862641	862641	T	G	UTR5	WNK1	NM_014823:c.-91T>G,NM_018979:c.-91T>G,NM_213655:c.-91T>G,NM_001184985:c.-91T>G	NaN	NaN	rs3088353	NaN	0.339856	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.881225	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	17	13	45
chr12	86270609	86270609	G	A	intronic	NTS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.73172	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	152	137	15	0
chr12	86270637	86270637	A	G	intronic	NTS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr12	862989	862989	T	C	exonic	WNK1	NaN	synonymous SNV	WNK1:NM_001184985:exon1:c.T258C:p.C86C,WNK1:NM_014823:exon1:c.T258C:p.C86C,WNK1:NM_018979:exon1:c.T258C:p.C86C,WNK1:NM_213655:exon1:c.T258C:p.C86C	rs3168640	NaN	0.975639	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	95.981249	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	0	32	57
chr12	863505	863505	A	ACTT,T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	368.844	0	NaN	NA	NA	136	60	70	2
chr12	86373036	86373036	C	G	downstream	MGAT4C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	86373037	86373037	T	A	UTR3	MGAT4C	NM_013244:c.*30A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	86373776	86373776	G	A	exonic	MGAT4C	NaN	nonsynonymous SNV	MGAT4C:NM_013244:exon7:c.C728T:p.S243F	rs199811466	NaN	NaN	0.03	D	0.999	D	0.979	D	0.000	D	1.000	D	2.255	M	-2.05	D	0.583	D	0.760	D	0.932	3.139	16.49	5.79	2.722	9.864	20.047	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.012569263969405277	NA	0	0	NaN	NA	NA	44	35	9	0
chr12	8671724	8671724	C	G	exonic	CLEC4D	NaN	nonsynonymous SNV	CLEC4D:NM_080387:exon4:c.C352G:p.H118D	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.988	D	0.782	P	.	.	1.000	N	1.92	M	2.27	T	-1.087	T	0.075	T	0.716	1.781	11.91	3.48	1.119	2.126	9.979	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.979292	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	375	343	32	0
chr12	8757538	8757538	A	G	intronic	AICDA	NaN	NaN	NaN	rs201657224	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.573553	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	34	28	6	1
chr12	8757730	8757730	T	C	intronic	AICDA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr12	8759428	8759428	T	T	intronic	AICDA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	8813373	8813373	A	T	intronic	MFAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	88437504	88437504	T	T	intronic	C12orf29	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	88444096	88444096	T	C	intronic	CEP290	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr12	88449642	88449642	A	A	intronic	CEP290	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr12	88462271	88462271	A	G	intronic	CEP290	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.364416	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	30	25	5	0
chr12	88470871	88470871	A	C	intronic	CEP290	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.233299	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	182	174	8	0
chr12	88476842	88476842	A	T	exonic	CEP290	NaN	nonsynonymous SNV	CEP290:NM_025114:exon37:c.T4978A:p.L1660I	rs372557655	NaN	NaN	0.17	T	0.199	B	0.047	B	0.062	N	1.000	N	0.695	N	-2.88	D	-0.520	T	0.480	T	0.138	1.567	11.20	1.8	0.945	0.199	2.369	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.598291	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	549	526	23	0
chr12	88480117	88480117	T	C	intronic	CEP290	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr12	88523725	88523725	A	T	intronic	CEP290	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	13	6	7	0
chr12	88532978	88532978	T	A	intronic	CEP290	NaN	NaN	NaN	rs190383141	NaN	0.0185703	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	28	18	10	0
chr12	88532987	88532987	A	G	intronic	CEP290	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	29	11.108493	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	16	10	6	0
chr12	88547969	88547969	A	G	intronic	TMTC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.036495	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	37	30	7	0
chr12	88588900	88588900	T	A	exonic	TMTC3	NaN	nonsynonymous SNV	TMTC3:NM_181783:exon14:c.T2219A:p.I740N	NaN	NaN	NaN	0.31	T	1.0	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	2.215	M	-0.1	T	-0.349	T	0.406	T	0.788	4.173	21.6	5.54	2.108	7.975	15.652	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.588331	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	161	151	10	0
chr12	88909931	88909931	T	T	intronic	KITLG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	88926291	88926291	A	C	intronic	KITLG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.126234	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	32	24	8	0
chr12	8926011	8926011	T	C	exonic	RIMKLB	NaN	synonymous SNV	RIMKLB:NM_001297776:exon6:c.T792C:p.D264D,RIMKLB:NM_020734:exon6:c.T792C:p.D264D	rs2969089	NaN	0.998403	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	93.925528	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	0	34	58
chr12	89745768	89745768	T	C	exonic	DUSP6	NaN	nonsynonymous SNV	DUSP6:NM_001946:exon1:c.A49G:p.S17G,DUSP6:NM_022652:exon1:c.A49G:p.S17G	NaN	NaN	NaN	0.66	T	0.032	B	0.047	B	0.000	D	1.000	D	0.28	N	0.92	T	-1.083	T	0.051	T	0.211	1.286	10.21	4.3	1.050	3.103	4.776	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.540286	clustered_read_position	REJECT	37	32	5	0
chr12	89865521	89865521	T	C	intronic	POC1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	89865525	89865525	A	G	intronic	POC1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	8991103	8991103	A	A	intronic	A2ML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr12	8991104	8991104	G	G	intronic	A2ML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	8991881	8991881	C	T	intronic	A2ML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr12	8995729	8995729	G	G	splicing	A2ML1	NM_144670:exon12:c.1249-1G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	88	60	0	0
chr12	8995734	8995734	A	A	exonic	A2ML1	NaN	synonymous SNV	A2ML1:NM_144670:exon12:c.A1253A:p.K418K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	90	67	0	0
chr12	8995736	8995736	T	A	exonic	A2ML1	NaN	nonsynonymous SNV	A2ML1:NM_144670:exon12:c.T1255A:p.F419I	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.149	B	0.032	B	0.001	N	1.000	D	1.43	L	1.6	T	-1.068	T	0.089	T	0.547	0.669	7.580	4.24	2.147	1.312	13.159	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.13501	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	86	74	12	0
chr12	89998157	89998157	G	T	intronic	ATP2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.145147	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	86	75	11	0
chr12	9000330	9000330	A	G	intronic	A2ML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr12	90018206	90018206	T	G	intronic	ATP2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr12	90018211	90018211	A	G	intronic	ATP2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr12	90020290	90020290	T	C	exonic	ATP2B1	NaN	nonsynonymous SNV	ATP2B1:NM_001001323:exon7:c.A1070G:p.K357R,ATP2B1:NM_001682:exon7:c.A1070G:p.K357R	NaN	NaN	NaN	.	.	0.998	D	0.991	D	0.000	D	1.000	D	1.875	L	-2.39	D	0.898	D	0.880	D	0.662	4.873	27.9	5.71	2.178	8.040	15.984	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.765302	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	142	133	9	0
chr12	9002254	9002254	A	G	intronic	A2ML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.931853	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	245	237	8	0
chr12	9004722	9004722	G	C/A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	72	57	15	0
chr12	9007469	9007469	A	G	intronic	A2ML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	0	2	0
chr12	9008009	9008009	T	T	intronic	A2ML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr12	9016456	9016456	C	T	exonic	A2ML1	NaN	nonsynonymous SNV	A2ML1:NM_001282424:exon18:c.C2096T:p.A699V,A2ML1:NM_144670:exon29:c.C3569T:p.A1190V	rs73040625	NaN	0.0225639	0.13	T	0.147	B	0.066	B	0.051	N	1.000	N	0.32	N	1.2	T	-1.038	T	0.004	T	0.03	1.287	10.21	-1.35	-0.242	-0.559	8.987	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	90.727245	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	58	23	35	12
chr12	9082855	9082855	A	G	intronic	PHC1	NaN	NaN	NaN	rs1805778	NaN	0.818091	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	259.953853	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	93	0	93	58
chr12	9082936	9082936	G	A	intronic	PHC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.380476	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	109	104	5	0
chr12	9086429	9086429	T	C	intronic	PHC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	22	8	14	0
chr12	9094376	9094376	G	T	UTR3	M6PR	NM_002355:c.*38C>A,NM_001207024:c.*38C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.29138	0	NaN	NA	NA	193	174	22	0
chr12	9097982	9097982	T	T	intronic	M6PR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr12	91230501	91230501	C	C	intergenic	LINC00936,LINC00615	dist=1124772;dist=81299	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	9161623	9161623	A	AT	exonic	KLRG1	NaN	frameshift substitution	KLRG1:NM_005810:exon4:c.410_410delinsAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.43446	0	NaN	NA	NA	19	16	3	0
chr12	9222286	9222286	C	T	intronic	A2M	NaN	NaN	NaN	rs1805664	ID=COSN164144;OCCURENCE=1(breast)	0.213658	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	178.909291	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	81	1	80	37
chr12	9232428	9232428	A	T	intronic	A2M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	11	6	3	0
chr12	92381591	92381591	A	C	intronic	C12orf79	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr12	92381594	92381594	A	C	intronic	C12orf79	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	92381598	92381598	A	C	intronic	C12orf79	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	9241931	9241931	A	G	intronic	A2M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	9244096	9244096	A	A	intronic	A2M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	9246217	9246217	A	A	intronic	A2M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	50	46	0	0
chr12	9268473	9268473	A	C	UTR5	A2M	NM_000014:c.-28T>G	NaN	NaN	rs226380	NaN	0.473243	1	T	.	.	.	.	.	.	0.981	P	.	.	.	.	-0.937	T	0.000	T	.	0.775	8.092	-2.01	-0.637	-0.299	0.424	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	111.921385	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	0	39	49
chr12	9302165	9302165	C	A	exonic	PZP	NaN	nonsynonymous SNV	PZP:NM_002864:exon35:c.G4418T:p.C1473F	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.997	D	0.896	P	0.021	U	0.956	N	2.115	M	1.17	T	-0.963	T	0.164	T	0.314	1.771	11.88	2.81	0.832	1.027	10.098	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.93593	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	186	169	17	0
chr12	9302166	9302166	A	C	exonic	PZP	NaN	nonsynonymous SNV	PZP:NM_002864:exon35:c.T4417G:p.C1473G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.995	D	0.021	U	0.986	N	3.36	M	1.18	T	-0.805	T	0.250	T	0.376	2.021	12.71	2.56	0.567	3.802	7.953	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.742775	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	182	165	17	0
chr12	9302167	9302167	G	A	exonic	PZP	NaN	synonymous SNV	PZP:NM_002864:exon35:c.C4416T:p.P1472P	rs373508497	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.23342	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	162	145	17	0
chr12	9312788	9312788	T	T	intronic	PZP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr12	93163775	93163775	AT	A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	286.969	0	NaN	NA	NA	185	105	75	6
chr12	93170774	93170774	A	T	intronic	EEA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	8	2	4	0
chr12	93178090	93178090	A	T	intronic	EEA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	93195596	93195596	A	C	intronic	EEA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	4	4	0
chr12	93195601	93195601	A	T	intronic	EEA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr12	93204968	93204968	T	A	intronic	EEA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	19	5	12	0
chr12	9321267	9321267	C	T	intronic	PZP	NaN	NaN	NaN	rs7964970	NaN	0.63119	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	88.2138	0	NaN	NA	NA	197	0	197	1
chr12	93236419	93236419	T	G	intronic	EEA1	NaN	NaN	NaN	rs7316894	NaN	0.472644	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	32.4426	0	NaN	NA	NA	147	85	62	0
chr12	93247774	93247774	A	T	intronic	EEA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	859.173	0	9.902955	nearby_gap_events	REJECT	145	136	9	0
chr12	93247775	93247775	G	A	intronic	EEA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.479104	nearby_gap_events	REJECT	143	134	9	0
chr12	93251311	93251311	C	T	intronic	EEA1	NaN	NaN	NaN	rs114169104	NaN	0.0369409	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	47.1421	0	NaN	NA	NA	74	52	22	1
chr12	936500	936500	C	G	intronic	WNK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	1	4	0
chr12	93792697	93792697	A	T	ncRNA_intronic	NUDT4P1,NUDT4P2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.351723	clustered_read_position	REJECT	50	45	5	4
chr12	93793126	93793126	A	C	exonic	NUDT4	NaN	nonsynonymous SNV	NUDT4:NM_001301022:exon5:c.A361C:p.T121P,NUDT4:NM_001301023:exon5:c.A358C:p.T120P,NUDT4:NM_001301024:exon5:c.A358C:p.T120P,NUDT4:NM_019094:exon5:c.A514C:p.T172P,NUDT4:NM_199040:exon5:c.A517C:p.T173P	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.0	B	0.001	B	0.001	N	0.853	D	0.205	N	1.49	T	-1.074	T	0.044	T	0.339	0.554	6.997	4.37	1.013	3.426	12.692	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	32.0636	0	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr12	93862989	93862989	G	A	UTR5	MRPL42	NM_172177:c.-73G>A,NM_014050:c.-73G>A	NaN	NaN	rs4761720	NaN	0.106629	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.3994	0	NaN	NA	NA	32	22	10	4
chr12	93944796	93944796	C	G	intergenic	MRPL42,SOCS2-AS1	dist=47248;dist=14608	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr12	93985229	93985229	G	T	intergenic	SOCS2,CRADD	dist=14708;dist=85922	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	94534382	94534382	G	G	intergenic	CRADD,PLXNC1	dist=289851;dist=8117	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	94534936	94534936	G	G	intergenic	CRADD,PLXNC1	dist=290405;dist=7563	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	94534938	94534938	T	T	intergenic	CRADD,PLXNC1	dist=290407;dist=7561	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr12	94534946	94534946	C	C	intergenic	CRADD,PLXNC1	dist=290415;dist=7553	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	94535030	94535030	A	C	intergenic	CRADD,PLXNC1	dist=290499;dist=7469	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	9464748	9464748	G	A	ncRNA_intronic	LOC642846	NaN	NaN	NaN	rs10771516	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	94688305	94688305	A	AAT	exonic	PLXNC1	NaN	frameshift substitution	PLXNC1:NM_005761:exon24:c.3923_3923delinsAAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.48984	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr12	94691219	94691219	A	A	intronic	PLXNC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	94697529	94697529	C	G	intronic	PLXNC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr12	94698915	94698915	T	G	intronic	PLXNC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr12	94706537	94706537	T	A	intronic	CEP83	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.223986	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	110	104	6	0
chr12	9487476	9487476	G	A	intergenic	LOC642846,LOC101930452	dist=20792;dist=32584	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	9487477	9487477	A	C	intergenic	LOC642846,LOC101930452	dist=20793;dist=32583	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	9487478	9487478	A	C	intergenic	LOC642846,LOC101930452	dist=20794;dist=32582	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	94972125	94972125	T	C	intronic	TMCC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr12	9505756	9505756	A	A	intergenic	LOC642846,LOC101930452	dist=39072;dist=14304	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	93	66	0	0
chr12	9505758	9505758	G	G	intergenic	LOC642846,LOC101930452	dist=39074;dist=14302	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	87	61	0	0
chr12	95315036	95315036	T	T	intergenic	KRT19P2,NDUFA12	dist=86232;dist=50068	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr12	95416199	95416199	A	G	intronic	NR2C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.85327	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	131	116	15	1
chr12	95486675	95486675	A	C	intronic	FGD6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	0	3	0
chr12	95651093	95651093	T	G	intronic	VEZT	NaN	NaN	NaN	rs3751272	NaN	0.317093	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	168.986039	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	0	66	14
chr12	95656706	95656706	T	C	exonic	VEZT	NaN	synonymous SNV	VEZT:NM_017599:exon4:c.T283C:p.L95L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.60708	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	153	147	6	0
chr12	95668706	95668706	A	T	intronic	VEZT	NaN	NaN	NaN	rs375689997	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	10	1	5	0
chr12	95694154	95694154	T	T	exonic	VEZT	NaN	synonymous SNV	VEZT:NM_017599:exon12:c.T2045T:p.F682F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	88	65	0	0
chr12	95888857	95888857	A	G	exonic	METAP2	NaN	nonsynonymous SNV	METAP2:NM_006838:exon6:c.A715G:p.T239A	rs199634227	NaN	NaN	0.21	T	0.001	B	0.005	B	0.000	D	0.994	D	1.935	M	-1.0	T	-0.559	T	0.308	T	0.156	2.656	14.84	4.43	2.095	2.153	10.684	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.088385	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	144	139	5	0
chr12	96052913	96052913	T	C	exonic	NTN4	NaN	synonymous SNV	NTN4:NM_021229:exon10:c.A1836G:p.K612K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.398257	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	379	372	7	0
chr12	96063999	96063999	T	A	ncRNA_intronic	PGAM1P5	NaN	NaN	NaN	rs3829304	NaN	0.127596	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	247	163	84	3
chr12	96076573	96076573	C	T	exonic	NTN4	NaN	nonsynonymous SNV	NTN4:NM_021229:exon7:c.G1420A:p.E474K	NaN	NaN	NaN	0.87	T	0.036	B	0.013	B	0.015	N	0.995	D	1.79	L	1.31	T	-0.988	T	0.092	T	0.755	2.693	14.97	5.39	2.530	3.729	19.147	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.560652	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	369	363	6	0
chr12	96077548	96077548	A	G	intronic	NTN4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr12	96077549	96077549	G	T	intronic	NTN4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	96106920	96106920	A	G	intronic	NTN4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	96180646	96180646	T	T	intronic	NTN4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	96259865	96259865	A	T	UTR3	SNRPF	NM_003095:c.*16A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.916725	nearby_gap_events	REJECT	195	185	10	0
chr12	96263467	96263467	A	A	intronic	CCDC38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	190	123	0	0
chr12	96275354	96275354	G	A	intronic	CCDC38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.650707	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	66	56	10	0
chr12	96292518	96292518	A	C	intronic	CCDC38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr12	96330312	96330312	A	G	intronic	CCDC38	NaN	NaN	NaN	rs200717161	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.177932	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	152	133	19	0
chr12	96337183	96337183	A	G	exonic	AMDHD1	NaN	nonsynonymous SNV	AMDHD1:NM_152435:exon1:c.A7G:p.S3G	rs7955450	NaN	0.71845	0.41	T	0.0	B	0.0	B	0.361	N	1.000	P	-0.805	N	1.52	T	-1.004	T	0.000	T	0.067	0.287	5.553	-8.69	-2.316	-0.592	1.883	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.126851	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	4	9	31
chr12	96354417	96354417	A	T	intronic	AMDHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	26	4	21	0
chr12	96361514	96361514	G	T	intronic	AMDHD1	NaN	NaN	NaN	rs201333155	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.755997	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	115	89	26	0
chr12	96361515	96361515	T	G	intronic	AMDHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.250092	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	87	72	15	0
chr12	96361516	96361516	T	G	intronic	AMDHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.15874	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	92	82	10	0
chr12	96371923	96371923	T	T	intronic	HAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	96374718	96374718	A	T	intronic	HAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	26	4	22	0
chr12	96381043	96381043	A	G	intronic	HAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	96381045	96381045	A	C	intronic	HAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	96381047	96381047	A	T	intronic	HAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	96381049	96381049	C	T	intronic	HAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	96402801	96402801	T	C	intronic	LTA4H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr12	96408601	96408601	A	G	intronic	LTA4H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.586806	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	55	49	6	0
chr12	96408887	96408887	C	A	intronic	LTA4H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr12	96411397	96411397	G	A	intronic	LTA4H	NaN	NaN	NaN	rs12049939	NaN	0.0664936	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	559.516	0	NaN	NA	NA	187	89	98	6
chr12	96421212	96421212	T	C	intronic	LTA4H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	16	10	6	0
chr12	96617490	96617490	A	C	exonic	ELK3	NaN	nonsynonymous SNV	ELK3:NM_005230:exon2:c.A146C:p.K49T	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	3.08	M	-0.35	T	0.296	D	0.558	D	0.943	4.776	26.8	5.48	2.094	9.335	15.581	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.217017	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	83	78	5	0
chr12	96641487	96641487	T	C	exonic	ELK3	NaN	nonsynonymous SNV	ELK3:NM_005230:exon3:c.T977C:p.L326P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.97	D	0.694	P	0.000	D	1.000	D	2.445	M	0.89	T	-0.632	T	0.211	T	0.859	4.235	22.0	5.82	2.225	7.698	16.178	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.138526	nearby_gap_events	REJECT	43	36	7	0
chr12	96641563	96641563	A	G	intronic	ELK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	108	51	43	0
chr12	96674146	96674146	A	A	UTR3	CDK17	NM_001170464:c.*402T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr12	96676445	96676445	A	G	intronic	CDK17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	970566	970566	A	T	intronic	WNK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	15	5	10	0
chr12	971148	971148	T	T	intronic	WNK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr12	971336	971336	A	A	exonic	WNK1	NaN	synonymous SNV	WNK1:NM_001184985:exon8:c.A2039A:p.Q680Q,WNK1:NM_014823:exon8:c.A2039A:p.Q680Q,WNK1:NM_018979:exon8:c.A2039A:p.Q680Q,WNK1:NM_213655:exon8:c.A2039A:p.Q680Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	21	21	0	0
chr12	97303682	97303682	TAAAAAAAAAAAAC	TAAAAAAAAAAAC,TAAAAAAAAAAACA,TAAAAAAAAAACAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	652.059	0	NaN	NA	NA	244	0	61	9
chr12	97328722	97328722	A	T	intronic	NEDD1	NaN	NaN	NaN	rs200076088	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.069526	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	6	0	6	0
chr12	9748072	9748072	C	T	intronic	KLRB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr12	98061709	98061709	G	C	intergenic	MIR135A2,LOC643711	dist=104020;dist=45481	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	98061714	98061714	G	A	intergenic	MIR135A2,LOC643711	dist=104025;dist=45476	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr12	98318447	98318447	T	C	intergenic	LOC643711,MIR4495	dist=168152;dist=14387	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr12	9840606	9840606	A	G	exonic	CLEC2D	NaN	nonsynonymous SNV	CLEC2D:NM_001197317:exon2:c.A170G:p.K57R,CLEC2D:NM_001197319:exon2:c.A170G:p.K57R,CLEC2D:NM_001004419:exon3:c.A281G:p.K94R,CLEC2D:NM_001197318:exon3:c.A281G:p.K94R,CLEC2D:NM_013269:exon3:c.A281G:p.K94R	NaN	NaN	NaN	.	.	0.067	B	0.074	B	0.444	U	1.000	N	0.705	N	0.46	T	-1.017	T	0.077	T	0.109	0.618	7.328	-4.36	-0.757	-1.091	7.336	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.252356	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	452	442	10	0
chr12	987482	987482	G	A	exonic	WNK1	NaN	synonymous SNV	WNK1:NM_014823:exon10:c.G2325A:p.Q775Q,WNK1:NM_018979:exon10:c.G2328A:p.Q776Q,WNK1:NM_001184985:exon11:c.G3567A:p.Q1189Q,WNK1:NM_213655:exon12:c.G3822A:p.Q1274Q	rs1012729	NaN	0.679513	.	.	.	.	.	.	.	.	0.038	P	.	.	.	.	-1.037	T	0.000	T	.	-0.284	2.642	-3.21	-0.958	-0.868	14.975	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	129.483533	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	0	48	55
chr12	9885881	9885881	A	A	UTR5	CLECL1	NM_001253750:c.-21T>T,NM_001267701:c.-21T>T,NM_172004:c.-21T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr12	989033	989033	A	G	exonic	WNK1	NaN	nonsynonymous SNV	WNK1:NM_018979:exon11:c.A2668G:p.T890A	NaN	NaN	NaN	0.49	T	0.001	B	0.001	B	0.002	N	1.000	N	0.895	L	2.24	T	-0.998	T	0.020	T	0.187	1.617	11.36	-0.972	-0.418	1.001	2.609	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.72662	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	113	103	10	0
chr12	98909836	98909836	A	G	exonic	TMPO	NaN	nonsynonymous SNV	TMPO:NM_001032283:exon1:c.A191G:p.D64G,TMPO:NM_001032284:exon1:c.A191G:p.D64G,TMPO:NM_003276:exon1:c.A191G:p.D64G	NaN	NaN	NaN	0.04	D	1.0	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	1.975	M	1.56	T	0.081	D	0.523	D	0.821	5.002	29.4	4.51	1.800	2.917	13.807	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	12	0	12	40
chr12	98926698	98926698	T	C	exonic	TMPO	NaN	synonymous SNV	TMPO:NM_003276:exon4:c.T663C:p.G221G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.696869	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	290	282	8	0
chr12	98938863	98938863	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	3	3,4	0
chr12	98991842	98991842	TC	T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	822.627	0	NaN	NA	NA	377	185	185	6
chr12	98991864	98991864	A	A	intronic	SLC25A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr12	98994931	98994931	T	C	intronic	SLC25A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr12	99007325	99007325	T	T	UTR3	IKBIP	NM_201612:c.*38A>A,NM_201613:c.*760A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	99019779	99019779	AG	A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.18914	0	NaN	NA	NA	15	13	2	0
chr12	99056125	99056125	T	A	intronic	APAF1	NaN	NaN	NaN	rs10745833	NaN	0.489018	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	44	18	26	0
chr12	99060128	99060128	A	C	exonic	APAF1	NaN	nonsynonymous SNV	APAF1:NM_001160:exon9:c.A1322C:p.Q441P,APAF1:NM_013229:exon9:c.A1322C:p.Q441P,APAF1:NM_181861:exon9:c.A1355C:p.Q452P,APAF1:NM_181868:exon9:c.A1355C:p.Q452P	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.997	D	0.985	D	0.000	D	1.000	D	1.935	M	0.34	T	-0.521	T	0.311	T	0.798	3.590	18.28	4.62	1.012	4.832	8.820	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.103014	clustered_read_position	REJECT	4	0	4	0
chr12	99060129	99060129	G	T	exonic	APAF1	NaN	nonsynonymous SNV	APAF1:NM_001160:exon9:c.G1323T:p.Q441H,APAF1:NM_013229:exon9:c.G1323T:p.Q441H,APAF1:NM_181861:exon9:c.G1356T:p.Q452H,APAF1:NM_181868:exon9:c.G1356T:p.Q452H	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.997	D	0.98	D	0.000	D	1.000	D	1.935	M	0.38	T	-0.581	T	0.289	T	0.498	3.670	18.65	-0.642	0.047	0.539	10.313	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.103014	clustered_read_position	REJECT	4	0	4	0
chr12	9907884	9907884	A	A	intronic	CD69	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr12	99093356	99093356	T	C	intronic	APAF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	405	277	128	0
chr12	99093359	99093359	A	T	intronic	APAF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	345	195	150	0
chr12	991080	991080	A	G	exonic	WNK1	NaN	synonymous SNV	WNK1:NM_014823:exon12:c.A2472G:p.A824A,WNK1:NM_001184985:exon14:c.A3993G:p.A1331A,WNK1:NM_018979:exon14:c.A3213G:p.A1071A,WNK1:NM_213655:exon14:c.A3969G:p.A1323A	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.878	T	0.208	T	.	1.396	10.60	3.44	0.436	0.365	8.303	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.683699	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	339	331	8	0
chr12	99116792	99116792	T	T	intronic	APAF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr12	99117461	99117461	T	T	exonic	APAF1	NaN	synonymous SNV	APAF1:NM_001160:exon23:c.T3087T:p.C1029C,APAF1:NM_181868:exon23:c.T3120T:p.C1040C,APAF1:NM_013229:exon24:c.T3216T:p.C1072C,APAF1:NM_181861:exon24:c.T3249T:p.C1083C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr12	99145092	99145092	T	C	intronic	ANKS1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr12	99145162	99145162	T	T	exonic	ANKS1B	NaN	synonymous SNV	ANKS1B:NM_001204080:exon9:c.A661A:p.K221K,ANKS1B:NM_001204081:exon9:c.A661A:p.K221K,ANKS1B:NM_001204065:exon10:c.A733A:p.K245K,ANKS1B:NM_001204070:exon10:c.A1141A:p.K381K,ANKS1B:NM_001204079:exon10:c.A736A:p.K246K,ANKS1B:NM_020140:exon10:c.A1141A:p.K381K,ANKS1B:NM_001204066:exon11:c.A937A:p.K313K,ANKS1B:NM_001204067:exon11:c.A1048A:p.K350K,ANKS1B:NM_001204068:exon11:c.A1321A:p.K441K,ANKS1B:NM_001204069:exon11:c.A1213A:p.K405K,ANKS1B:NM_181670:exon12:c.A1393A:p.K465K,ANKS1B:NM_152788:exon25:c.A3643A:p.K1215K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	80	75	0	0
chr12	99478875	99478875	T	C	intronic	ANKS1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	27	9.270746	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	1	3	0
chr12	9980049	9980049	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	17	0	4,8	0
chr12	9980050	9980050	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	17	0	8,5	0
chr12	9980077	9980077	A	C	UTR5	KLRF1	NM_016523:c.-64A>C,NM_001291822:c.-64A>C,NM_001291823:c.-64A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	41	7	34	0
chr12	9980243	9980243	A	G	intronic	KLRF1	NaN	NaN	NaN	rs2232543	NaN	0.933906	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	587.983	0	NaN	NA	NA	54	0	54	54
chr12	99837480	99837480	T	G	exonic	ANKS1B	NaN	nonsynonymous SNV	ANKS1B:NM_152788:exon11:c.A1546C:p.K516Q	NaN	NaN	NaN	.	.	0.995	D	0.919	D	0.000	D	1.000	D	1.245	L	0.92	T	-0.649	T	0.277	T	0.633	4.178	21.6	6.04	2.317	5.094	15.160	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	39	25	14	0
chr12	99837481	99837481	G	T	exonic	ANKS1B	NaN	synonymous SNV	ANKS1B:NM_152788:exon11:c.C1545A:p.L515L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	67	43	22	0
chr12	999543	999543	T	T	intronic	WNK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr13	100078915	100078915	T	T	intergenic	MIR548AN,LINC01232	dist=20361;dist=60301	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	100172272	100172272	T	A	intronic	TM9SF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.157497	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	232	215	17	0
chr13	100181630	100181630	A	C	intronic	TM9SF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr13	100515455	100515455	A	A	ncRNA_intronic	LOC101927437	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	100515456	100515456	T	T	ncRNA_intronic	LOC101927437	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	100515461	100515461	A	A	ncRNA_intronic	LOC101927437	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	100622365	100622365	G	A	intronic	ZIC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.690922	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	3	1	2	0
chr13	100635377	100635377	C	T	exonic	ZIC2	NaN	synonymous SNV	ZIC2:NM_007129:exon1:c.C1059T:p.H353H	rs1831992	NaN	0.0417332	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.209374	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	12	27	15
chr13	100637102	100637102	T	C	intronic	ZIC2	NaN	NaN	NaN	rs9585308	NaN	0.409145	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	70.953836	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	10	38	34
chr13	100962290	100962290	A	G	intronic	PCCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr13	101130223	101130223	C	A	ncRNA_intronic	PCCA-AS1	NaN	NaN	NaN	rs118036082	NaN	0.0379393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	28	8	20	0
chr13	101167542	101167542	A	T	intronic	PCCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr13	101167543	101167543	G	C	intronic	PCCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	101182490	101182490	A	A	UTR3	GGACT,PCCA	NM_001195087:c.*1894T>T,NM_033110:c.*1894T>T;NM_001178004:c.*70A>A,NM_001127692:c.*70A>A,NM_000282:c.*70A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr13	101266631	101266631	G	T	exonic	TMTC4	NaN	synonymous SNV	TMTC4:NM_001286453:exon13:c.C1500A:p.T500T,TMTC4:NM_001079669:exon15:c.C1833A:p.T611T,TMTC4:NM_032813:exon16:c.C1890A:p.T630T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.843525	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	169	164	5	0
chr13	101266735	101266735	C	T	intronic	TMTC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	101266736	101266736	T	C	intronic	TMTC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	101274501	101274501	T	A	intronic	TMTC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	101287403	101287403	CG	CA,GC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	54.026	0	NaN	NA	NA	99	69	25	0
chr13	101289865	101289865	A	G	exonic	TMTC4	NaN	nonsynonymous SNV	TMTC4:NM_001286453:exon6:c.T536C:p.I179T,TMTC4:NM_001079669:exon8:c.T869C:p.I290T,TMTC4:NM_032813:exon9:c.T926C:p.I309T	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.989	D	0.000	D	1.000	D	2.61	M	0.75	T	-0.301	T	0.333	T	0.936	4.698	26.0	5.6	2.132	8.948	15.789	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.999413	nearby_gap_events	REJECT	164	156	8	0
chr13	101289969	101289969	C	T	intronic	TMTC4	NaN	NaN	NaN	rs3809372	NaN	0.272963	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	187	149	38	37
chr13	101294428	101294428	C	G	intronic	TMTC4	NaN	NaN	NaN	rs9585476	NaN	0.391973	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	27	73.674884	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	3	26	28
chr13	101322734	101322734	C	T	UTR5	TMTC4	NM_032813:c.-118G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	101322737	101322737	C	T	UTR5	TMTC4	NM_032813:c.-121G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	101710468	101710468	A	A	ncRNA_exonic	NALCN-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	43	40	0	0
chr13	101714376	101714376	C	G	exonic	NALCN	NaN	nonsynonymous SNV	NALCN:NM_052867:exon41:c.G4699C:p.V1567L	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	0.755	N	-5.04	D	1.125	D	0.948	D	0.585	5.312	34	5.94	2.820	7.293	20.366	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.352728	clustered_read_position	REJECT	9	6	3	8
chr13	101717909	101717909	A	C	exonic	NALCN	NaN	nonsynonymous SNV	NALCN:NM_052867:exon40:c.T4451G:p.V1484G	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.882	P	0.554	P	0.000	D	1.000	D	1.495	L	-4.52	D	0.953	D	0.894	D	0.952	3.742	19.00	5.71	2.172	7.145	15.988	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.373455	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	236	210	26	0
chr13	101717910	101717910	C	A	exonic	NALCN	NaN	nonsynonymous SNV	NALCN:NM_052867:exon40:c.G4450T:p.V1484L	NaN	NaN	NaN	0.24	T	0.091	B	0.032	B	0.000	D	1.000	D	1.15	L	-4.43	D	0.511	D	0.831	D	0.809	2.974	15.91	5.71	2.689	5.705	19.863	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.510878	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	195	169	26	0
chr13	101717956	101717956	A	A	intronic	NALCN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr13	101735659	101735659	A	A	intronic	NALCN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	101755480	101755480	G	T	intronic	NALCN	NaN	NaN	NaN	rs9300647	NaN	0.544129	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	300.08044	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	111	0	111	48
chr13	101757197	101757197	A	T	intronic	NALCN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr13	101757199	101757199	A	T	intronic	NALCN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	3	3	0
chr13	101795422	101795422	A	G	intronic	NALCN	NaN	NaN	NaN	rs661585	NaN	0.521765	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	64	NaN	NA	NA	269	52	217	39
chr13	101844262	101844262	A	C	intronic	NALCN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.561819	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	164	154	10	0
chr13	101890040	101890040	A	G	intronic	NALCN	NaN	NaN	NaN	rs9518352	NaN	0.692093	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	49.7124	0	NaN	NA	NA	81	0	81	1
chr13	102344890	102344890	T	T	intronic	ITGBL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr13	102366742	102366742	C	T	intronic	ITGBL1	NaN	NaN	NaN	rs2281990	NaN	0.127596	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	84	NaN	NA	NA	248	189	59	22
chr13	102379119	102379119	A	A	exonic	FGF14	NaN	synonymous SNV	FGF14:NM_004115:exon4:c.T450T:p.F150F,FGF14:NM_175929:exon4:c.T465T:p.F155F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	144	133	0	0
chr13	102521223	102521223	A	C	intronic	FGF14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr13	102521225	102521225	G	T	intronic	FGF14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr13	102521228	102521228	A	C	intronic	FGF14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	102521229	102521229	G	T	intronic	FGF14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	102863977	102863977	T	G	intronic	FGF14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr13	103271206	103271206	G	A	intronic	TPP2	NaN	NaN	NaN	rs4576935	NaN	0.472644	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	70	NaN	NA	NA	185	28	157	42
chr13	103292686	103292686	A	G	exonic	TPP2	NaN	synonymous SNV	TPP2:NM_003291:exon16:c.A1980G:p.R660R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.429622	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	10	6	4	0
chr13	103298609	103298609	T	C	intronic	TPP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.989044	nearby_gap_events	REJECT	82	75	7	0
chr13	103316113	103316113	G	A	intronic	TPP2	NaN	NaN	NaN	rs7334625	NaN	0.473642	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	60.415645	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	8	25	28
chr13	103328493	103328493	A	AC	intronic	TPP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	325.306	0	NaN	NA	NA	49	6	5	7
chr13	103330541	103330541	T	C	intronic	TPP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr13	103330718	103330718	G	A	UTR3	TPP2	NM_003291:c.*52G>A	NaN	NaN	rs3806	NaN	0.474241	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	141	34	107	31
chr13	103383323	103383323	A	T	exonic	CCDC168	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC168:NM_001146197:exon4:c.T19724A:p.M6575K	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.395	B	0.068	B	.	.	1.000	N	0.55	N	3.75	T	-0.940	T	0.008	T	0.406	0.434	6.355	0.381	0.066	0.034	3.280	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	13.9481	0	16.869439	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	64	53	11	0
chr13	103385015	103385015	A	G	exonic	CCDC168	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC168:NM_001146197:exon4:c.T18032C:p.L6011P	rs6491707	NaN	0.995807	0.13	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	0	N	3.57	T	-1.065	T	0.000	T	0.101	-0.769	0.762	1.34	0.061	-0.049	3.530	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3131.36	0	NaN	NA	NA	244	0	244	55
chr13	103395295	103395295	A	A	exonic	CCDC168	NaN	synonymous SNV	CCDC168:NM_001146197:exon4:c.T7752T:p.V2584V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	61	59	0	0
chr13	103396490	103396490	T	A	exonic	CCDC168	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC168:NM_001146197:exon4:c.A6557T:p.H2186L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.114855	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	91	81	10	0
chr13	103396966	103396966	G	A	exonic	CCDC168	NaN	synonymous SNV	CCDC168:NM_001146197:exon4:c.C6081T:p.P2027P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.223021	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	433	424	9	0
chr13	103399233	103399233	C	C	exonic	CCDC168	NaN	synonymous SNV	CCDC168:NM_001146197:exon4:c.G3814G:p.D1272D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	107	94	0	0
chr13	103402241	103402241	G	A	exonic	CCDC168	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC168:NM_001146197:exon4:c.C806T:p.T269I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.497131	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	793	784	9	0
chr13	103419023	103419023	A	A	intronic	TEX30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	17	17	0	0
chr13	103421925	103421925	A	T	intronic	TEX30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr13	103441645	103441645	A	A	intronic	KDELC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	103468958	103468958	G	A	intronic	BIVM,BIVM-ERCC5	NaN	NaN	NaN	rs7320687	NaN	0.311502	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	103.076	0	NaN	NA	NA	173	0	173	6
chr13	103473511	103473511	A	C	intronic	BIVM,BIVM-ERCC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	20	5	14	0
chr13	103474476	103474476	C	C	exonic	BIVM,BIVM-ERCC5	NaN	synonymous SNV	BIVM:NM_001159596:exon5:c.C181C:p.P61P,BIVM-ERCC5:NM_001204425:exon5:c.C868C:p.P290P,BIVM:NM_017693:exon7:c.C868C:p.P290P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	35	27	0	0
chr13	103491906	103491906	A	T	exonic	BIVM	NaN	synonymous SNV	BIVM:NM_001159596:exon9:c.A537T:p.T179T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.220175	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	71	63	8	0
chr13	103498563	103498563	T	T	UTR5	ERCC5	NM_000123:c.-54T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr13	103504517	103504517	T	C	exonic	BIVM-ERCC5,ERCC5	NaN	synonymous SNV	ERCC5:NM_000123:exon2:c.T138C:p.H46H,BIVM-ERCC5:NM_001204425:exon10:c.T1500C:p.H500H	rs1047768	NaN	0.493011	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	290.13355	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	97	0	97	44
chr13	103515051	103515051	A	A	exonic	BIVM-ERCC5,ERCC5	NaN	synonymous SNV	ERCC5:NM_000123:exon8:c.A1552A:p.N518N,BIVM-ERCC5:NM_001204425:exon16:c.A2914A:p.N972N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	86	79	0	0
chr13	103518769	103518769	T	C	intronic	BIVM-ERCC5,ERCC5	NaN	NaN	NaN	rs6491716	NaN	0.998203	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	195.938566	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	70	0	70	58
chr13	103527809	103527809	T	C	exonic	BIVM-ERCC5,ERCC5	NaN	synonymous SNV	ERCC5:NM_000123:exon15:c.T3117C:p.V1039V,BIVM-ERCC5:NM_001204425:exon23:c.T4479C:p.V1493V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.324688	normal_lod	REJECT	18	15	3	0
chr13	103527849	103527849	G	C	exonic	BIVM-ERCC5,ERCC5	NaN	nonsynonymous SNV	ERCC5:NM_000123:exon15:c.G3157C:p.G1053R,BIVM-ERCC5:NM_001204425:exon23:c.G4519C:p.G1507R	rs9514066	NaN	0.998203	0.54	T	0.926	P	0.454	P	0.059	N	1.000	P	1.87	L	3.59	T	-0.856	T	0.000	T	0.278	3.305	17.11	4.28	1.267	3.255	5.688	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.154877	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	2	14	22
chr13	103703573	103703573	T	T	intronic	SLC10A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	103718130	103718130	C	C	intronic	SLC10A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr13	104766442	104766442	G	T	intergenic	LINC01309,DAOA-AS1	dist=686407;dist=1344964	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	104766443	104766443	A	T	intergenic	LINC01309,DAOA-AS1	dist=686408;dist=1344963	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	104766446	104766446	G	T	intergenic	LINC01309,DAOA-AS1	dist=686411;dist=1344960	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	104849830	104849830	C	T	intergenic	LINC01309,DAOA-AS1	dist=769795;dist=1261576	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	107076225	107076225	C	A	intergenic	LINC00460,EFNB2	dist=46083;dist=65854	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	107164740	107164740	A	G	intronic	EFNB2	NaN	NaN	NaN	rs11840980	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	38	15.092281	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	9	3	6	2
chr13	108518532	108518532	C	T	exonic	FAM155A	NaN	nonsynonymous SNV	FAM155A:NM_001080396:exon1:c.G413A:p.G138D	NaN	NaN	NaN	0.78	T	0.992	D	0.676	P	.	.	0.672	N	1.15	L	.	.	-0.951	T	0.146	T	0.399	2.217	13.37	5.41	2.539	3.968	17.805	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	16	6.352508	normal_lod	REJECT	2	0	2	0
chr13	108862436	108862436	G	A	exonic	LIG4	NaN	nonsynonymous SNV	LIG4:NM_001098268:exon2:c.C1181T:p.T394I,LIG4:NM_002312:exon2:c.C1181T:p.T394I,LIG4:NM_206937:exon3:c.C1181T:p.T394I	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.006	B	0.049	B	0.003	N	0.911	D	1.125	L	-1.48	T	-0.804	T	0.292	T	0.155	-0.689	1.007	1.79	0.023	4.043	5.239	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.172467	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	165	138	27	0
chr13	108862437	108862437	T	G	exonic	LIG4	NaN	nonsynonymous SNV	LIG4:NM_001098268:exon2:c.A1180C:p.T394P,LIG4:NM_002312:exon2:c.A1180C:p.T394P,LIG4:NM_206937:exon3:c.A1180C:p.T394P	NaN	NaN	NaN	0.2	T	0.708	P	0.797	P	0.003	N	0.942	D	1.69	L	-1.46	T	-0.014	T	0.540	D	0.499	0.946	8.856	4.32	0.926	3.340	10.439	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.270631	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	166	140	26	0
chr13	108870713	108870713	T	C	UTR5	LIG4	NM_001098268:c.-7097A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	108882646	108882646	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	9	2	3,4	0
chr13	108959296	108959296	A	G	UTR3	TNFSF13B	NM_001145645:c.*10A>G,NM_006573:c.*10A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr13	108959297	108959297	C	T	UTR3	TNFSF13B	NM_001145645:c.*11C>T,NM_006573:c.*11C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr13	108959299	108959299	A	G	UTR3	TNFSF13B	NM_001145645:c.*13A>G,NM_006573:c.*13A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr13	108959303	108959303	C	T	UTR3	TNFSF13B	NM_001145645:c.*17C>T,NM_006573:c.*17C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr13	108959304	108959304	T	C	UTR3	TNFSF13B	NM_001145645:c.*18T>C,NM_006573:c.*18T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr13	109064840	109064840	T	C	intergenic	TNFSF13B,MYO16	dist=104008;dist=183660	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	109437731	109437731	G	A	intronic	MYO16	NaN	NaN	NaN	rs34943408	NaN	0.0423323	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr13	109472601	109472601	G	C	intronic	MYO16	NaN	NaN	NaN	rs2146327	NaN	0.858427	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	425.198021	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	147	0	147	58
chr13	109475677	109475677	C	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	0	2,2	0
chr13	109609951	109609951	G	A	intronic	MYO16	NaN	NaN	NaN	rs9559450	NaN	0.0726837	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	55	48	7	14
chr13	109614725	109614725	T	T	intronic	MYO16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr13	109661385	109661385	C	A	exonic	MYO16	NaN	nonsynonymous SNV	MYO16:NM_001198950:exon22:c.C2583A:p.D861E,MYO16:NM_015011:exon22:c.C2517A:p.D839E	NaN	NaN	NaN	.	.	0.701	P	0.369	B	0.018	N	0.999	D	1.935	M	-2.26	D	-0.193	T	0.544	D	0.586	1.397	10.60	3.05	0.486	1.601	8.069	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.934661	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	106	100	6	0
chr13	109704890	109704890	T	A	intronic	MYO16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.713044	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	28	23	5	0
chr13	109704896	109704896	A	T	intronic	MYO16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.04710144927536224	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	9	5	0
chr13	109779825	109779825	C	C	exonic	MYO16	NaN	synonymous SNV	MYO16:NM_001198950:exon31:c.C3978C:p.P1326P,MYO16:NM_015011:exon31:c.C3912C:p.P1304P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	80	65	0	0
chr13	109792699	109792699	A	G	exonic	MYO16	NaN	nonsynonymous SNV	MYO16:NM_001198950:exon32:c.A4139G:p.K1380R,MYO16:NM_015011:exon32:c.A4073G:p.K1358R	NaN	NaN	NaN	.	.	0.996	D	0.596	P	0.763	U	1.000	D	2.08	M	0.7	T	-0.896	T	0.180	T	0.149	4.215	21.9	3.67	0.716	8.453	9.313	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	24.3714	19	10.649366	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	6	2	4	0
chr13	109817164	109817164	T	G	ncRNA_intronic	MYO16-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.955579	nearby_gap_events	REJECT	78	72	6	0
chr13	110380584	110380584	G	A	upstream	LINC00676	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr13	110397153	110397153	T	C	intergenic	LINC00676,IRS2	dist=14772;dist=9031	NaN	NaN	rs9559638	NaN	0.487819	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr13	110435102	110435102	C	G	exonic	IRS2	NaN	nonsynonymous SNV	IRS2:NM_003749:exon1:c.G3299C:p.S1100T	NaN	NaN	NaN	0.13	T	0.993	D	0.953	D	0.017	U	1.000	D	1.895	L	1.35	T	-0.778	T	0.192	T	0.323	3.312	17.13	3.92	2.039	7.125	16.202	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.825421	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	36	29	7	0
chr13	110437483	110437483	G	A	exonic	IRS2	NaN	synonymous SNV	IRS2:NM_003749:exon1:c.C918T:p.S306S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	110766239	110766239	C	T	intergenic	LINC00396,COL4A1	dist=58940;dist=35066	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	110818598	110818598	T	G	exonic	COL4A1	NaN	nonsynonymous SNV	COL4A1:NM_001845:exon45:c.A4002C:p.Q1334H	rs3742207	NaN	0.288339	0.17	T	0.264	B	0.253	B	0.000	D	0.000	P	0.98	L	-3.2	D	-1.098	T	0.000	T	0.075	0.526	6.850	-1.19	-0.086	0.460	10.213	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	67	56	11	29
chr13	110819418	110819418	T	C	intronic	COL4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr13	110819422	110819422	T	A	intronic	COL4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr13	110819424	110819424	C	A	intronic	COL4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr13	110819425	110819425	T	T	intronic	COL4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr13	110821456	110821456	G	A	intronic	COL4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	110825005	110825005	T	T	intronic	COL4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr13	110838814	110838814	A	G	exonic	COL4A1	NaN	synonymous SNV	COL4A1:NM_001845:exon26:c.T1815C:p.P605P	rs61749897	NaN	0.096246	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	33	27	6	5
chr13	110850790	110850790	T	T	intronic	COL4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr13	110855830	110855830	C	T	intronic	COL4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.416288	nearby_gap_events	REJECT	50	42	8	0
chr13	110859069	110859069	G	C	intronic	COL4A1	NaN	NaN	NaN	rs9588116	NaN	0.370008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	92	NaN	NA	NA	131	110	21	37
chr13	110861767	110861767	G	C	exonic	COL4A1	NaN	nonsynonymous SNV	COL4A1:NM_001303110:exon11:c.C623G:p.P208R,COL4A1:NM_001845:exon11:c.C623G:p.P208R	NaN	NaN	NaN	0.35	T	0.999	D	0.985	D	0.003	N	1.000	D	1.765	L	-2.46	D	0.452	D	0.767	D	0.704	2.004	12.66	5.24	2.438	5.685	18.831	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.420216	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	81	72	9	0
chr13	111080777	111080777	G	A	intronic	COL4A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.746247	clustered_read_position	REJECT	65	59	6	0
chr13	111090909	111090909	T	C	intronic	COL4A2	NaN	NaN	NaN	rs7984937	NaN	0.31849	0.38	T	.	.	.	.	0.001	D	1.000	P	.	.	.	.	-0.921	T	0.000	T	.	-0.179	3.128	-0.114	-0.613	-2.530	4.100	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	225.870532	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	105	22	83	34
chr13	111090924	111090924	G	A	intronic	COL4A2	NaN	NaN	NaN	rs7984100	NaN	0.312899	0.57	T	.	.	.	.	0.420	N	1.000	P	.	.	.	.	-0.925	T	0.000	T	.	-0.702	0.965	-2.04	-0.693	-0.354	3.868	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	94	13	81	34
chr13	111091032	111091032	A	A	intronic	COL4A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr13	111098226	111098226	C	T	exonic	COL4A2	NaN	synonymous SNV	COL4A2:NM_001846:exon17:c.C1008T:p.P336P	rs4103	ID=COSM1365445;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.482827	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	80	NaN	NA	NA	183	146	37	37
chr13	111098301	111098301	A	A	intronic	COL4A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr13	111099122	111099122	G	A	intronic	COL4A2	NaN	NaN	NaN	rs7326449	NaN	0.688898	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	5049.71	0	NaN	NA	NA	430	0	430	51
chr13	111099123	111099123	T	A	intronic	COL4A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.717907	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	535	498	37	15
chr13	111107399	111107399	A	G	intronic	COL4A2	NaN	NaN	NaN	rs56171126	NaN	0.16853	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	111119315	111119315	G	T	intronic	COL4A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.795084	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	36	29	7	0
chr13	111125491	111125491	T	C	exonic	COL4A2	NaN	nonsynonymous SNV	COL4A2:NM_001846:exon29:c.T2419C:p.F807L	NaN	NaN	NaN	0.38	T	0.127	B	0.086	B	0.002	N	0.799	D	-0.46	N	-3.16	D	-0.212	T	0.474	T	0.206	0.159	4.857	5.21	2.092	0.713	5.850	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.325694	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	41	35	6	0
chr13	111142248	111142248	A	C	intronic	COL4A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	6	3	0
chr13	111143559	111143559	G	A	intronic	COL4A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr13	111145428	111145428	G	C	intronic	COL4A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.38778	0	NaN	NA	NA	11	9	2	13
chr13	111154061	111154061	T	C	exonic	COL4A2	NaN	synonymous SNV	COL4A2:NM_001846:exon41:c.T3807C:p.G1269G	rs409858	NaN	0.939497	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	294.611573	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	101	1	100	58
chr13	111154159	111154159	C	T	intronic	COL4A2	NaN	NaN	NaN	rs388222	NaN	0.428714	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	70	NaN	NA	NA	97	84	13	34
chr13	111155628	111155628	A	G	exonic	COL4A2	NaN	synonymous SNV	COL4A2:NM_001846:exon42:c.A4038G:p.K1346K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.340179	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	180	173	7	0
chr13	111155773	111155773	T	C	exonic	COL4A2	NaN	synonymous SNV	COL4A2:NM_001846:exon43:c.T4083C:p.T1361T	rs438758	NaN	0.980232	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2825.92	0	NaN	NA	NA	236	0	236	31
chr13	111156153	111156153	G	A	ncRNA_intronic	COL4A2-AS1	NaN	NaN	NaN	rs9301460	NaN	0.359625	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	18	82.344134	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	3	30	29
chr13	111156333	111156333	A	A	exonic	COL4A2	NaN	synonymous SNV	COL4A2:NM_001846:exon44:c.A4278A:p.G1426G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	48	38	0	0
chr13	111176519	111176519	G	T	exonic	RAB20	NaN	synonymous SNV	RAB20:NM_017817:exon2:c.C198A:p.G66G	rs375814	ID=COSM1477060,COSM432120;OCCURENCE=1(breast)	0.380192	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.050249	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	112	84	28	39
chr13	111213652	111213652	G	G	intronic	RAB20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr13	111290628	111290628	G	C	exonic	CARKD	NaN	nonsynonymous SNV	CARKD:NM_018210:exon10:c.G933C:p.E311D	rs41275124	NaN	0.0141773	0.5	T	0.003	B	0.006	B	0.029	U	1.000	N	.	.	1.87	T	-1.044	T	0.005	T	0.012	0.690	7.685	1.16	0.418	0.636	4.602	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	283	217	66	10
chr13	111293847	111293847	G	A	UTR3	CARS2	NM_024537:c.*37C>T	NaN	NaN	rs330570	NaN	0.258786	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	145	114	31	12
chr13	111293915	111293915	T	G	exonic	CARS2	NaN	nonsynonymous SNV	CARS2:NM_024537:exon15:c.A1664C:p.Q555P	rs1043886	NaN	0.081869	0.24	T	0.0	B	0.0	B	0.239	N	1.000	P	0	N	1.52	T	-1.007	T	0.000	T	0.064	1.620	11.37	-0.906	-0.031	0.017	7.776	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	124	NaN	NA	NA	129	108	21	16
chr13	111295952	111295952	C	C	intronic	CARS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	111295955	111295955	A	A	intronic	CARS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	111299818	111299818	A	A	intronic	CARS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr13	111302044	111302044	C	C	intronic	CARS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	111303545	111303545	A	A	intronic	CARS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr13	111329307	111329307	G	A	intronic	CARS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	18	8.472178	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	19	15	4	0
chr13	111345612	111345612	C	T	intronic	CARS2	NaN	NaN	NaN	rs72661697	NaN	0.185104	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	19	10	9	0
chr13	111366439	111366439	C	G	UTR5	ING1	NM_198219:c.-58C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.848389	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	124	106	18	0
chr13	111366440	111366440	G	C	UTR5	ING1	NM_198219:c.-57G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.312679	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	133	122	11	0
chr13	111367650	111367650	A	G	UTR5	ING1	NM_005537:c.-141A>G	NaN	NaN	rs1441043	NaN	0.692093	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	60.863892	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	6	22	51
chr13	111368164	111368164	T	G	exonic	ING1	NaN	nonsynonymous SNV	ING1:NM_005537:exon1:c.T374G:p.L125R	rs7338333	NaN	0.999401	1	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	0	N	0.42	T	-0.969	T	0.000	T	0.035	1.408	10.64	-4.35	-1.492	-0.029	2.896	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	184.954	0	NaN	NA	NA	9	0	9	29
chr13	111563137	111563137	A	T	intronic	ANKRD10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr13	111598699	111598699	T	T	intergenic	ANKRD10,LINC00431	dist=31245;dist=19675	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	111857753	111857753	G	T	intronic	ARHGEF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.407431	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	95	84	11	0
chr13	111870037	111870037	T	C	exonic	ARHGEF7	NaN	synonymous SNV	ARHGEF7:NM_001113512:exon4:c.T393C:p.D131D,ARHGEF7:NM_001113513:exon4:c.T9C:p.D3D,ARHGEF7:NM_003899:exon4:c.T9C:p.D3D,ARHGEF7:NM_145735:exon5:c.T480C:p.D160D,ARHGEF7:NM_001113511:exon6:c.T543C:p.D181D	rs2296354	NaN	0.248802	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	115	NaN	NA	NA	297	256	41	15
chr13	111932598	111932598	G	G	intronic	ARHGEF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	50	41	0	0
chr13	111932607	111932607	G	T	intronic	ARHGEF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.431987	nearby_gap_events	REJECT	77	70	7	0
chr13	111932608	111932608	G	C	intronic	ARHGEF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.793812	nearby_gap_events	REJECT	56	49	7	0
chr13	111935576	111935576	T	G	exonic	ARHGEF7	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGEF7:NM_001113512:exon15:c.T1729G:p.S577A,ARHGEF7:NM_001113513:exon15:c.T1345G:p.S449A,ARHGEF7:NM_003899:exon15:c.T1345G:p.S449A,ARHGEF7:NM_145735:exon16:c.T1816G:p.S606A,ARHGEF7:NM_001113511:exon17:c.T1879G:p.S627A	NaN	NaN	NaN	0.38	T	0.753	P	0.406	B	0.000	D	1.000	D	1.7	L	0.74	T	-0.848	T	0.193	T	0.551	3.004	16.02	4.73	1.770	5.540	14.240	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	14	9	5	0
chr13	111935577	111935577	C	A	exonic	ARHGEF7	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGEF7:NM_001113512:exon15:c.C1730A:p.S577Y,ARHGEF7:NM_001113513:exon15:c.C1346A:p.S449Y,ARHGEF7:NM_003899:exon15:c.C1346A:p.S449Y,ARHGEF7:NM_145735:exon16:c.C1817A:p.S606Y,ARHGEF7:NM_001113511:exon17:c.C1880A:p.S627Y	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.997	D	0.935	D	0.000	D	1.000	D	1.7	L	0.61	T	-0.231	T	0.373	T	0.855	3.670	18.65	4.59	2.090	7.051	17.409	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	16	11	5	0
chr13	111935578	111935578	C	G	exonic	ARHGEF7	NaN	synonymous SNV	ARHGEF7:NM_001113512:exon15:c.C1731G:p.S577S,ARHGEF7:NM_001113513:exon15:c.C1347G:p.S449S,ARHGEF7:NM_003899:exon15:c.C1347G:p.S449S,ARHGEF7:NM_145735:exon16:c.C1818G:p.S606S,ARHGEF7:NM_001113511:exon17:c.C1881G:p.S627S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	16	11	5	0
chr13	111935876	111935876	G	G	intronic	ARHGEF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	111953903	111953903	T	C	intronic	ARHGEF7	NaN	NaN	NaN	rs3742181	NaN	0.470647	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	94	NaN	NA	NA	95	76	19	21
chr13	111955465	111955465	T	C	UTR3	ARHGEF7	NM_003899:c.*5T>C,NM_001113513:c.*5T>C	NaN	NaN	rs1555751	NaN	0.935903	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	319	248	71	58
chr13	111977423	111977423	C	A	intronic	TEX29	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	12	2	10	0
chr13	111996412	111996412	T	C	intronic	TEX29	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.265426	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	245	238	7	0
chr13	111996420	111996420	A	T	intronic	TEX29	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.45766	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	220	199	21	0
chr13	112054044	112054044	C	T	intergenic	TEX29,LINC00354	dist=57450;dist=493648	NaN	NaN	rs7332901	NaN	0.332069	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr13	112088798	112088798	T	G	intergenic	TEX29,LINC00354	dist=92204;dist=458894	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	112088799	112088799	G	C	intergenic	TEX29,LINC00354	dist=92205;dist=458893	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	112095632	112095632	C	T	intergenic	TEX29,LINC00354	dist=99038;dist=452060	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	112114633	112114633	T	T	intergenic	TEX29,LINC00354	dist=118039;dist=433059	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	15	15	0	0
chr13	112513045	112513045	T	A	intergenic	TEX29,LINC00354	dist=516451;dist=34647	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	112513046	112513046	G	C	intergenic	TEX29,LINC00354	dist=516452;dist=34646	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	112513047	112513047	G	A	intergenic	TEX29,LINC00354	dist=516453;dist=34645	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	112548385	112548385	C	T	ncRNA_intronic	LINC00354	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	70	NaN	NA	NA	21	0	21	0
chr13	112548389	112548389	C	G	ncRNA_intronic	LINC00354	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	21	0	21	0
chr13	112548394	112548394	G	T	ncRNA_intronic	LINC00354	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	76	NaN	NA	NA	21	0	21	0
chr13	112581704	112581704	C	T	intergenic	LINC00354,LINC00403	dist=26214;dist=44920	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	112581706	112581706	T	C	intergenic	LINC00354,LINC00403	dist=26216;dist=44918	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	112600819	112600819	C	C	intergenic	LINC00354,LINC00403	dist=45329;dist=25805	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr13	112709859	112709859	A	G	ncRNA_intronic	LINC00403	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	112709905	112709905	C	T	ncRNA_intronic	LINC00403	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	112857505	112857505	C	A	intergenic	LINC01070,LOC101928730	dist=2189;dist=53535	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	113019302	113019302	C	G	intergenic	LINC01044,SPACA7	dist=33763;dist=11349	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	113047520	113047520	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	0	3,3	0
chr13	113086698	113086698	T	T	intronic	SPACA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	113176719	113176719	T	C	exonic	TUBGCP3	NaN	nonsynonymous SNV	TUBGCP3:NM_001286277:exon14:c.A1630G:p.S544G,TUBGCP3:NM_001286278:exon14:c.A1660G:p.S554G,TUBGCP3:NM_006322:exon14:c.A1660G:p.S554G	NaN	NaN	NaN	0.21	T	0.003	B	0.016	B	0.001	N	0.934	N	-0.205	N	3.17	T	-1.001	T	0.013	T	0.156	2.766	15.21	4.6	1.027	5.664	11.691	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.400425	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	125	119	6	0
chr13	113181815	113181815	A	C	intronic	TUBGCP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	16	4	12	0
chr13	113201864	113201864	C	T	exonic	TUBGCP3	NaN	nonsynonymous SNV	TUBGCP3:NM_001286279:exon10:c.G1238A:p.R413H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	35	28	7	2
chr13	113202347	113202347	T	A	intronic	TUBGCP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.24053316600591837	NA	0	0	NaN	NA	NA	25	19	6	8
chr13	113210541	113210541	A	T	intronic	TUBGCP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.140168	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	127	112	15	0
chr13	113219558	113219558	T	T	intronic	TUBGCP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr13	113219559	113219559	T	T	intronic	TUBGCP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr13	113280234	113280234	A	T	intergenic	TUBGCP3,ATP11AUN	dist=37735;dist=21124	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	113280235	113280235	G	C	intergenic	TUBGCP3,ATP11AUN	dist=37736;dist=21123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	113280236	113280236	G	T	intergenic	TUBGCP3,ATP11AUN	dist=37737;dist=21122	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	113280237	113280237	A	C	intergenic	TUBGCP3,ATP11AUN	dist=37738;dist=21121	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	113280240	113280240	A	T	intergenic	TUBGCP3,ATP11AUN	dist=37741;dist=21118	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	113280243	113280243	C	G	intergenic	TUBGCP3,ATP11AUN	dist=37744;dist=21115	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	113303351	113303351	T	T	intronic	ATP11AUN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	113311408	113311408	C	G	intronic	ATP11AUN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	9	0	9	0
chr13	113333975	113333975	A	A	intronic	ATP11AUN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr13	113333988	113333988	A	C	intronic	ATP11AUN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	1	2	0
chr13	113333990	113333990	T	G	intronic	ATP11AUN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr13	113489079	113489079	A	C	intronic	ATP11A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	12	3	9	0
chr13	113508839	113508839	G	C	exonic	ATP11A	NaN	synonymous SNV	ATP11A:NM_015205:exon19:c.G2238C:p.L746L,ATP11A:NM_032189:exon19:c.G2238C:p.L746L	rs9549573	NaN	0.696286	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.039	T	0.000	T	.	-0.814	0.639	2.84	0.391	2.234	10.743	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	250.368843	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	130	36	94	52
chr13	113526009	113526009	A	T	intronic	ATP11A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.678743	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	160	150	10	0
chr13	113530322	113530322	G	A	intronic	ATP11A	NaN	NaN	NaN	rs1278756	NaN	0.28734	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	125	24	101	36
chr13	113532471	113532471	T	T	intronic	ATP11A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr13	113534423	113534423	T	T	intronic	ATP11A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr13	113567914	113567914	T	T	intergenic	ATP11A,MCF2L-AS1	dist=26432;dist=53884	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	23	20	0	0
chr13	113616242	113616242	C	T	intergenic	ATP11A,MCF2L-AS1	dist=74760;dist=5556	NaN	NaN	rs2873371	NaN	0.221046	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	113654309	113654309	C	T	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	rs112547885	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	113656216	113656216	C	T	UTR5	MCF2L	NM_024979:c.-9C>T	NaN	NaN	rs7986677	NaN	0.494409	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.215777	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	4	10	41
chr13	113668334	113668334	G	G	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr13	113668882	113668882	A	G	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	113668883	113668883	C	A	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	113673588	113673588	A	A	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr13	113676175	113676175	T	T	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr13	113676248	113676248	G	G	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	113699551	113699551	A	G	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr13	113699553	113699553	A	C	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr13	113699555	113699555	A	T	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr13	113699556	113699556	T	G	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr13	113699557	113699557	T	G	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr13	113700830	113700830	G	T	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	113718566	113718566	T	T	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr13	113719504	113719504	A	A	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr13	113724600	113724600	T	G	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	rs41286604	NaN	0.0255591	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	75	NaN	NA	NA	199	170	37	5
chr13	113730496	113730496	T	A	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	113732784	113732784	A	C	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	56	49	7	0
chr13	113732785	113732785	C	A	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr13	113735681	113735681	C	A	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	19	6	13	2
chr13	113735684	113735684	C	G	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	129.281	27	NaN	NA	NA	19	3	16	6
chr13	113737391	113737391	C	G	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	113738229	113738229	T	T	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr13	113741672	113741672	T	C	exonic	MCF2L	NaN	nonsynonymous SNV	MCF2L:NM_001112732:exon22:c.T2497C:p.F833L,MCF2L:NM_024979:exon22:c.T2491C:p.F831L	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	3.845	H	1.99	T	0.292	D	0.580	D	0.787	3.313	17.14	3.35	0.681	7.784	11.476	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.839942	possible_contamination	REJECT	66	61	5	0
chr13	113741851	113741851	C	A	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	rs514181	NaN	0.464856	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	129	102	27	52
chr13	113742775	113742775	A	T	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.144741	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	105	98	7	0
chr13	113743698	113743698	C	C	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	113750437	113750437	A	G	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr13	113750442	113750442	A	G	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	rs55719740	NaN	0.115815	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr13	113751079	113751079	T	C	intronic	MCF2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	77	NaN	NA	NA	57	3	54	1
chr13	113771933	113771933	C	T	intronic	F7	NaN	NaN	NaN	rs371040193	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	20	8	12	1
chr13	113772712	113772712	G	C	intronic	F7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2055335968379435	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr13	113783841	113783841	A	G	exonic	F10	NaN	nonsynonymous SNV	F10:NM_000504:exon2:c.A146G:p.K49R	NaN	NaN	NaN	0.64	T	0.985	D	0.905	P	0.000	D	0.999	D	1.14	L	-5.43	D	1.014	D	0.940	D	0.38	1.386	10.57	4.6	1.831	5.660	13.960	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.715738	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	453	441	12	0
chr13	113814526	113814526	A	T	intronic	PROZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	2	6	0
chr13	113849445	113849445	G	A	intronic	PCID2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.04251102943655243	NA	0	0	NaN	NA	NA	103	81	22	0
chr13	113859028	113859028	A	A	intronic	PCID2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr13	113873076	113873076	T	A	intronic	CUL4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	113873077	113873077	G	T	intronic	CUL4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	113882452	113882452	A	A	intronic	CUL4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr13	113889355	113889355	A	G	intronic	CUL4A	NaN	NaN	NaN	rs2287249	NaN	0.271765	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	133.318468	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	0	46	30
chr13	113891069	113891069	T	C	intronic	CUL4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	20	6	14	0
chr13	113893729	113893729	G	A	intronic	CUL4A	NaN	NaN	NaN	rs3794422	NaN	0.252396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	174.007282	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	61	1	60	31
chr13	113897499	113897499	T	G	intronic	CUL4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.786836	nearby_gap_events	REJECT	321	298	23	0
chr13	113909571	113909571	A	A	intronic	CUL4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	113960965	113960965	A	G	intronic	LAMP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	2	4	0
chr13	113965176	113965176	C	A	exonic	LAMP1	NaN	synonymous SNV	LAMP1:NM_005561:exon4:c.C556A:p.R186R	rs9577503	NaN	0.979233	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	92.233924	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	0	33	57
chr13	113976580	113976580	T	T	intronic	LAMP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr13	114073161	114073161	C	T	intergenic	LOC101928841,ADPRHL1	dist=4453;dist=3094	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	114087997	114087997	T	C	intronic	ADPRHL1	NaN	NaN	NaN	rs12874568	NaN	0.326478	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	17.3746	0	NaN	NA	NA	19	14	5	33
chr13	114152812	114152812	A	G	exonic	TMCO3	NaN	synonymous SNV	TMCO3:NM_017905:exon3:c.A600G:p.E200E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.393041	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	64	61	3	0
chr13	114175127	114175127	A	T	intronic	TMCO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	114175128	114175128	A	T	intronic	TMCO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	114175132	114175132	G	C	intronic	TMCO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	114186681	114186681	T	C	intronic	TMCO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr13	114188189	114188189	T	C	intronic	TMCO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr13	114188191	114188191	T	G	intronic	TMCO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	71	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr13	114188607	114188607	A	C	intronic	TMCO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr13	114188608	114188608	C	G	intronic	TMCO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr13	114200785	114200785	A	G	intronic	TMCO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	114265451	114265451	A	A	intronic	TFDP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	114309035	114309035	T	T	intronic	ATP4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	114312354	114312354	T	G	exonic	ATP4B	NaN	synonymous SNV	ATP4B:NM_000705:exon1:c.A106C:p.R36R	rs9285616	NaN	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.815222	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	55
chr13	114313349	114313349	G	A	upstream	ATP4B	NaN	NaN	NaN	rs9669831	NaN	0.516973	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr13	114323997	114323997	T	C	intronic	GRK1	NaN	NaN	NaN	rs9796234	NaN	0.48123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	202	NaN	NA	NA	176	22	154	43
chr13	114324172	114324172	A	A	intronic	GRK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	114467700	114467700	A	G	intronic	TMEM255B	NaN	NaN	NaN	rs6422414	NaN	0.786342	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	114468794	114468794	A	C	intronic	TMEM255B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	114468796	114468796	G	A	intronic	TMEM255B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	114503907	114503907	C	C	intronic	TMEM255B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	32	30	0	0
chr13	114503915	114503915	C	T	intronic	TMEM255B	NaN	NaN	NaN	rs9577890	NaN	0.620607	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	39.894984	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	4	16	0
chr13	114503916	114503916	A	G	intronic	TMEM255B	NaN	NaN	NaN	rs9577889	NaN	0.621805	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.290947	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	3	17	0
chr13	114503989	114503989	TA	CG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	107.703	0	NaN	NA	NA	14	1	8	11
chr13	114504003	114504003	A	C	intronic	TMEM255B	NaN	NaN	NaN	rs3934940	NaN	0.998602	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	319.612	0	NaN	NA	NA	30	3	27	29
chr13	114504024	114504024	A	G	intronic	TMEM255B	NaN	NaN	NaN	rs3934941	NaN	0.464856	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	141.078	0	NaN	NA	NA	40	16	24	29
chr13	114504025	114504025	A	C	intronic	TMEM255B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	33.8325	0	NaN	NA	NA	47	34	13	14
chr13	114504036	114504036	T	C	intronic	TMEM255B	NaN	NaN	NaN	rs67005433	NaN	0.73123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	309.568	0	69.919662	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	6	24	43
chr13	114504535	114504535	C	G	intronic	TMEM255B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.002838816655980264	NA	0	0	NaN	NA	NA	35	22	13	0
chr13	114526164	114526164	T	G	ncRNA_intronic	GAS6-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr13	114531495	114531495	A	G	ncRNA_intronic	GAS6-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.823039	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	94	88	6	0
chr13	114537517	114537517	C	T	ncRNA_intronic	GAS6-AS1	NaN	NaN	NaN	rs8191974	NaN	0.247804	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.252576	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	38	14	19
chr13	114585454	114585454	G	A	intergenic	GAS6-AS2,LINC00452	dist=15649;dist=12622	NaN	NaN	rs7490083	NaN	0.3127	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	9	2	7	0
chr13	114750928	114750928	T	C	intronic	RASA3	NaN	NaN	NaN	rs28623162	NaN	0.281949	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.58816	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	24
chr13	114751040	114751040	G	A	intronic	RASA3	NaN	NaN	NaN	rs71449038	NaN	0.273363	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	88.0206	0	21.629311	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	25
chr13	114766230	114766230	T	G	intronic	RASA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	114766432	114766432	G	G	intronic	RASA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	33	29	0	0
chr13	114773193	114773193	A	A	intronic	RASA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr13	114780756	114780756	C	C	exonic	RASA3	NaN	synonymous SNV	RASA3:NM_007368:exon14:c.G1334G:p.G445G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	47	42	0	0
chr13	114786813	114786813	T	A	intronic	RASA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr13	114795254	114795254	G	A	intronic	RASA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.468215		KEEP	34	30	4	0
chr13	114806402	114806402	T	T	intronic	RASA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr13	114810906	114810906	G	G	intronic	RASA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	114875238	114875238	G	A	intronic	RASA3	NaN	NaN	NaN	rs9525180	NaN	0.584065	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr13	114911087	114911087	T	T	intergenic	RASA3,CDC16	dist=12992;dist=89275	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	115000650	115000650	G	T	intronic	CDC16	NaN	NaN	NaN	rs7331680	NaN	0.215256	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	11	9	2	12
chr13	115000719	115000719	G	G	intronic	CDC16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr13	115002100	115002100	T	C	intronic	CDC16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.428687	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	15	10	5	2
chr13	115002305	115002305	G	A	exonic	CDC16	NaN	synonymous SNV	CDC16:NM_001078645:exon3:c.G135A:p.Q45Q,CDC16:NM_003903:exon3:c.G135A:p.Q45Q	rs8002514	NaN	0.341653	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	227	178	49	21
chr13	115004914	115004914	C	T	exonic	CDC16	NaN	synonymous SNV	CDC16:NM_001078645:exon5:c.C330T:p.D110D,CDC16:NM_003903:exon5:c.C330T:p.D110D	rs2296971	NaN	0.444289	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.974527	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	31	14	26
chr13	115008836	115008836	A	A	intronic	CDC16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	115010298	115010298	T	C	intronic	CDC16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr13	115010330	115010330	G	T	intronic	CDC16	NaN	NaN	NaN	rs2039092	NaN	0.292332	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	126	NaN	NA	NA	137	120	17	16
chr13	115027462	115027462	T	A	intronic	CDC16	NaN	NaN	NaN	rs7985356	NaN	0.369409	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	103	NaN	NA	NA	263	216	47	19
chr13	115028326	115028326	T	C	intronic	CDC16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.356063	nearby_gap_events	REJECT	175	164	11	0
chr13	115037613	115037613	G	A	intronic	CDC16	NaN	NaN	NaN	rs2274638	NaN	0.553514	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	17.9189	0	NaN	NA	NA	86	70	15	12
chr13	115047464	115047464	C	T	intronic	UPF3A	NaN	NaN	NaN	rs112035922	NaN	0.321885	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.66737	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	17	5	18
chr13	115056857	115056857	T	C	intronic	UPF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.918173	clustered_read_position,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	46	42	4	0
chr13	115064279	115064279	T	T	intronic	UPF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	115067516	115067516	A	A	intronic	UPF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr13	115090632	115090632	C	T	exonic	CHAMP1	NaN	nonsynonymous SNV	CHAMP1:NM_001164144:exon3:c.C1315T:p.L439F,CHAMP1:NM_001164145:exon3:c.C1315T:p.L439F,CHAMP1:NM_032436:exon3:c.C1315T:p.L439F	NaN	NaN	NaN	.	.	0.999	D	0.952	D	0.023	N	0.882	D	1.59	L	5.08	T	-0.909	T	0.014	T	0.323	3.011	16.04	5.5	2.741	1.975	13.494	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.274001	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	99	91	8	0
chr13	19240958	19240958	A	C	intergenic	NONE,LINC00417	dist=NONE;dist=71282	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr13	19525048	19525048	G	G	intergenic	LINC00408,LINC00442	dist=24167;dist=57351	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr13	19646962	19646962	A	G	intergenic	LINC00442,RNU6-52P	dist=60188;dist=70160	NaN	NaN	rs78343372	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	19801420	19801420	C	C	intergenic	LOC101928697,ANKRD26P3	dist=39815;dist=35520	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	175	144	0	0
chr13	19923230	19923230	A	G	intergenic	LINC00421,TPTE2	dist=2341;dist=73789	NaN	NaN	rs61954436	NaN	0.15016	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	76	NaN	NA	NA	88	48	40	0
chr13	19923367	19923367	G	T	intergenic	LINC00421,TPTE2	dist=2478;dist=73652	NaN	NaN	rs61954437	NaN	0.15016	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	86	46	40	0
chr13	20066994	20066994	T	C	exonic	TPTE2	NaN	nonsynonymous SNV	TPTE2:NM_130785:exon4:c.A115G:p.K39E,TPTE2:NM_199254:exon4:c.A115G:p.K39E,TPTE2:NM_001141968:exon5:c.A115G:p.K39E	rs78472618	ID=COSM1128401,COSM226286;OCCURENCE=1(NS),1(prostate)	NaN	.	.	0.0	B	0.0	B	0.019	N	1.000	N	0.665	N	-3.47	D	-0.470	T	0.558	D	0.153	-0.713	0.931	-1.53	-0.630	-1.444	4.294	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.044461741374709915	NA	0	0	NaN	NA	NA	84	62	22	0
chr13	20217719	20217719	A	G	intronic	MPHOSPH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	20221570	20221570	A	A	intronic	MPHOSPH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	3	0	0
chr13	20224202	20224202	G	T	exonic	MPHOSPH8	NaN	nonsynonymous SNV	MPHOSPH8:NM_017520:exon5:c.G1378T:p.D460Y	rs75390100	NaN	0.0171725	0.01	D	1.0	D	0.988	D	0.835	N	0.997	D	1.735	L	1.22	T	-0.960	T	0.055	T	0.24	3.905	19.86	5.49	2.746	3.834	19.740	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	2.0685041245943877E-4	Somatic	481.271	0	NaN	NA	NA	63	15	48	2
chr13	20224256	20224256	A	G	exonic	MPHOSPH8	NaN	nonsynonymous SNV	MPHOSPH8:NM_017520:exon5:c.A1432G:p.I478V	NaN	NaN	NaN	0.65	T	0.114	B	0.036	B	0.869	N	1.000	N	0	N	1.36	T	-1.001	T	0.041	T	0.067	-0.084	3.589	1.67	0.429	1.221	8.209	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.301286	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	135	122	13	0
chr13	20242463	20242463	G	G	intronic	MPHOSPH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr13	20242464	20242464	G	G	intronic	MPHOSPH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr13	20242465	20242465	C	C	intronic	MPHOSPH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr13	20242466	20242466	T	T	intronic	MPHOSPH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr13	20242680	20242680	A	A	intronic	MPHOSPH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr13	20580429	20580429	T	C	intronic	ZMYM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	7	5	0
chr13	20580847	20580847	A	C	intronic	ZMYM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	0	2	0
chr13	20608627	20608627	A	C	intronic	ZMYM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr13	20626491	20626491	G	T	intronic	ZMYM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.30242	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	73	66	7	0
chr13	20626552	20626552	T	G	intronic	ZMYM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.967458	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	36	29	7	0
chr13	20716939	20716939	G	A	exonic	GJA3	NaN	synonymous SNV	GJA3:NM_021954:exon2:c.C489T:p.F163F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.207215	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	104	99	5	0
chr13	21002988	21002988	T	C	intronic	CRYL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	21012552	21012552	C	C	intronic	CRYL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	21157111	21157111	G	GGA	exonic	IFT88	NaN	frameshift substitution	IFT88:NM_006531:exon3:c.106_106delinsGGA,IFT88:NM_175605:exon5:c.133_133delinsGGA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.49353	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr13	21175750	21175750	T	T	intronic	IFT88	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr13	21205125	21205125	G	T	intronic	IFT88	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	33	14.010487	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	19	10	9	0
chr13	21215425	21215425	T	A	intronic	IFT88	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.02121836778625995	NA	0	0	NaN	NA	NA	41	30	11	0
chr13	21215714	21215714	A	T	intronic	IFT88	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr13	21303393	21303393	A	G	intronic	N6AMT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	21303394	21303394	C	A	intronic	N6AMT2	NaN	NaN	NaN	rs369021061	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	21418094	21418094	T	G	intronic	XPO4	NaN	NaN	NaN	rs716480	NaN	0.455272	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.653179	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	18	10	24
chr13	21553987	21553987	A	A	intronic	LATS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr13	21555544	21555544	C	G	intronic	LATS2	NaN	NaN	NaN	rs870846	NaN	0.422324	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	83.856374	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	10	30	0
chr13	21555545	21555545	T	A	intronic	LATS2	NaN	NaN	NaN	rs870847	NaN	0.422324	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.839184	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	10	30	0
chr13	21555554	21555554	G	A	intronic	LATS2	NaN	NaN	NaN	rs870848	NaN	0.352835	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.540672	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	9	30	42
chr13	21562948	21562948	G	A	exonic	LATS2	NaN	nonsynonymous SNV	LATS2:NM_014572:exon4:c.C971T:p.A324V	rs558614	ID=COSM1477132,COSM432208;OCCURENCE=1(breast)	0.629593	0.34	T	0.216	B	0.028	B	0.912	N	1.000	P	-0.695	N	0.29	T	-0.968	T	0.000	T	0.094	0.517	6.803	2.72	0.682	6.231	12.146	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.196686	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	2	17	28
chr13	21563196	21563196	T	G	exonic	LATS2	NaN	synonymous SNV	LATS2:NM_014572:exon4:c.A723C:p.A241A	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	38	11.031713	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	7	3	4	0
chr13	21620085	21620085	T	C	exonic	LATS2	NaN	synonymous SNV	LATS2:NM_014572:exon2:c.A81G:p.K27K	rs7317471	NaN	0.807508	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	135	21	114	58
chr13	21720925	21720925	T	A	intronic	SAP18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	235	156	57	0
chr13	21733956	21733956	T	T	intronic	SKA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr13	21742547	21742547	A	G	intronic	SKA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	13	6	5	0
chr13	21750633	21750633	A	G	UTR5	MRPL57,SKA3	NM_024026:c.-423A>G;NM_001166017:c.-17T>C,NM_145061:c.-17T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	21751005	21751005	G	C	intronic	MRPL57	NaN	NaN	NaN	rs9550717	NaN	0.836861	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	69.2893	0	19.821721	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	1	8	48
chr13	21893948	21893948	A	A	ncRNA_intronic	LINC00539,MIPEPP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr13	22084419	22084419	T	G	intronic	MICU2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr13	22084421	22084421	A	G	intronic	MICU2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	9	3	4	0
chr13	22084422	22084422	C	G	intronic	MICU2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr13	22084427	22084427	G	T	intronic	MICU2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr13	22084429	22084429	T	C	intronic	MICU2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr13	22096843	22096843	T	C	intronic	MICU2	NaN	NaN	NaN	rs1200028	NaN	0.97484	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	250.342519	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	82	0	82	58
chr13	22178308	22178308	G	A	UTR5	MICU2	NM_152726:c.-21C>T	NaN	NaN	rs2761924	NaN	0.995208	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	68.821135	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	0	23	37
chr13	22620115	22620115	A	G	intergenic	LINC00424,LINC00540	dist=167816;dist=164309	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	23043316	23043316	C	T	intergenic	LINC00540,BASP1P1	dist=192657;dist=427853	NaN	NaN	rs9506856	NaN	0.304712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	23319591	23319591	T	C	intergenic	LINC00540,BASP1P1	dist=468932;dist=151578	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	23709792	23709792	A	G	intergenic	BASP1P1,SGCG	dist=237472;dist=45268	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr13	23907677	23907677	C	T	exonic	SACS	NaN	synonymous SNV	SACS:NM_001278055:exon8:c.G9897A:p.Q3299Q,SACS:NM_014363:exon10:c.G10338A:p.Q3446Q	rs2737701	NaN	0.985423	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	335.374744	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	120	0	120	58
chr13	23908034	23908034	A	G	exonic	SACS	NaN	synonymous SNV	SACS:NM_001278055:exon8:c.T9540C:p.A3180A,SACS:NM_014363:exon10:c.T9981C:p.A3327A	rs2737700	NaN	0.338658	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	8.97442	0	9.62216	nearby_gap_events	REJECT	55	47	8	39
chr13	23908169	23908169	T	C	exonic	SACS	NaN	synonymous SNV	SACS:NM_001278055:exon8:c.A9405G:p.P3135P,SACS:NM_014363:exon10:c.A9846G:p.P3282P	rs61753111	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	108.676257	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	23	49	1
chr13	23914679	23914679	G	T	exonic	SACS	NaN	synonymous SNV	SACS:NM_001278055:exon8:c.C2895A:p.A965A,SACS:NM_014363:exon10:c.C3336A:p.A1112A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.726282	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	156	144	12	0
chr13	23914682	23914682	T	C	exonic	SACS	NaN	synonymous SNV	SACS:NM_001278055:exon8:c.A2892G:p.E964E,SACS:NM_014363:exon10:c.A3333G:p.E1111E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.03284	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	154	143	11	0
chr13	23930163	23930163	A	A	intronic	SACS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	23	21	0	0
chr13	23985478	23985478	A	A	UTR5	SACS	NM_014363:c.-100T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr13	24233232	24233232	C	A	exonic	TNFRSF19	NaN	synonymous SNV	TNFRSF19:NM_001204459:exon4:c.C93A:p.S31S,TNFRSF19:NM_001204458:exon6:c.C489A:p.S163S,TNFRSF19:NM_018647:exon6:c.C489A:p.S163S,TNFRSF19:NM_148957:exon6:c.C489A:p.S163S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.148532	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	42	37	5	0
chr13	24233236	24233236	C	A	exonic	TNFRSF19	NaN	nonsynonymous SNV	TNFRSF19:NM_001204459:exon4:c.C97A:p.P33T,TNFRSF19:NM_001204458:exon6:c.C493A:p.P165T,TNFRSF19:NM_018647:exon6:c.C493A:p.P165T,TNFRSF19:NM_148957:exon6:c.C493A:p.P165T	NaN	NaN	NaN	0.03	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.255	M	1.93	T	-0.828	T	0.189	T	0.739	5.108	32	5.77	2.723	7.456	19.984	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.202853	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	43	38	5	0
chr13	24334408	24334408	A	A	intronic	MIPEP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr13	24436563	24436563	A	G	intronic	MIPEP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	24443418	24443418	T	T	intronic	MIPEP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr13	24471079	24471079	T	C	exonic	C1QTNF9B	NaN	nonsynonymous SNV	C1QTNF9B:NM_001007537:exon1:c.A47G:p.N16S	NaN	NaN	NaN	0.6	T	0.0	B	0.0	B	0.557	N	1.000	N	-0.14	N	-2.39	D	-0.708	T	0.289	T	0.057	-1.517	0.016	-7.98	-2.364	-0.551	1.073	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.53274	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr13	24588089	24588089	G	T	intronic	SPATA13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr13	24797148	24797148	C	G	exonic	SPATA13	NaN	synonymous SNV	SPATA13:NM_001166271:exon2:c.C81G:p.P27P,SPATA13:NM_001286792:exon4:c.C267G:p.P89P	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-0.995	T	0.064	T	.	0.425	6.311	-10.5	-1.408	-0.156	10.549	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.15826086956521787	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr13	24797153	24797153	C	G	exonic	SPATA13	NaN	nonsynonymous SNV	SPATA13:NM_001166271:exon2:c.C86G:p.A29G,SPATA13:NM_001286792:exon4:c.C272G:p.A91G	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	0.702	U	1.000	N	1.04	L	-0.85	T	-0.988	T	0.085	T	0.088	2.326	13.74	-0.753	-0.101	0.148	9.466	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	25	15	9	0
chr13	24823699	24823699	G	A	exonic	SPATA13	NaN	nonsynonymous SNV	SPATA13:NM_001166271:exon3:c.G1738A:p.G580S,SPATA13:NM_001286792:exon5:c.G1924A:p.G642S	rs41287016	NaN	0.0335463	0.09	T	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	-1.08	T	-0.757	T	0.070	T	0.168	3.779	19.19	4.08	0.812	1.644	8.672	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	115	NaN	NA	NA	241	50	191	5
chr13	24826058	24826058	A	G	intronic	SPATA13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	24864937	24864937	G	C	exonic	SPATA13	NaN	nonsynonymous SNV	SPATA13:NM_001286793:exon5:c.G700C:p.G234R,SPATA13:NM_001286795:exon6:c.G886C:p.G296R,SPATA13:NM_001286794:exon7:c.G952C:p.G318R,SPATA13:NM_153023:exon8:c.G1120C:p.G374R,SPATA13:NM_001166271:exon9:c.G2995C:p.G999R,SPATA13:NM_001286792:exon11:c.G3181C:p.G1061R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.32	M	-0.35	T	0.379	D	0.594	D	0.949	5.055	30	5.44	2.569	9.369	18.267	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.390008	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	149	136	13	0
chr13	24869025	24869025	A	G	intronic	SPATA13	NaN	NaN	NaN	rs7993660	NaN	0.991014	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	76.423003	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	0	27	50
chr13	24876873	24876873	T	C	exonic	SPATA13	NaN	nonsynonymous SNV	SPATA13:NM_001286793:exon9:c.T1501C:p.W501R,SPATA13:NM_001286795:exon10:c.T1687C:p.W563R,SPATA13:NM_001286794:exon11:c.T1753C:p.W585R,SPATA13:NM_153023:exon12:c.T1921C:p.W641R,SPATA13:NM_001166271:exon13:c.T3796C:p.W1266R,SPATA13:NM_001286792:exon15:c.T3982C:p.W1328R	NaN	NaN	NaN	0.3	T	0.999	D	0.999	D	0.001	D	0.966	D	2.475	M	1.23	T	-0.710	T	0.217	T	0.933	2.927	15.75	4.86	1.060	3.026	11.814	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.366085	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	146	138	8	0
chr13	24890157	24890157	C	T	exonic	C1QTNF9	NaN	nonsynonymous SNV	C1QTNF9:NM_001303138:exon2:c.C16T:p.L6F,C1QTNF9:NM_178540:exon2:c.C16T:p.L6F,C1QTNF9:NM_001303137:exon3:c.C16T:p.L6F	rs1974332	NaN	0.263978	0.14	T	0.062	B	0.05	B	0.480	N	0.058	P	1.525	L	-2.73	D	-1.094	T	0.000	T	0.031	-0.136	3.336	0.772	0.076	-0.508	4.544	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	287	65	222	14
chr13	24891424	24891424	T	G	intronic	C1QTNF9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	24891425	24891425	T	C	intronic	C1QTNF9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	24895437	24895437	G	A	exonic	C1QTNF9	NaN	nonsynonymous SNV	C1QTNF9:NM_001303138:exon4:c.G533A:p.R178Q,C1QTNF9:NM_178540:exon4:c.G533A:p.R178Q,C1QTNF9:NM_001303137:exon5:c.G533A:p.R178Q	rs3751356	NaN	0.173722	.	.	0.054	B	0.013	B	0.000	D	0.013	P	0.17	N	-3.92	D	-1.015	T	0.000	T	0.171	3.364	17.34	3.1	2.180	2.310	4.216	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	176.88	0	NaN	NA	NA	20	1	19	7
chr13	24895631	24895631	T	A	exonic	C1QTNF9	NaN	nonsynonymous SNV	C1QTNF9:NM_001303138:exon4:c.T727A:p.C243S,C1QTNF9:NM_178540:exon4:c.T727A:p.C243S,C1QTNF9:NM_001303137:exon5:c.T727A:p.C243S	rs78083136	NaN	NaN	0.03	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.685	M	-1.27	T	-0.849	T	0.017	T	0.868	2.640	14.79	3.96	1.768	7.715	8.898	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	717	297	420	14
chr13	24895745	24895745	A	G	exonic	C1QTNF9	NaN	nonsynonymous SNV	C1QTNF9:NM_001303138:exon4:c.A841G:p.M281V,C1QTNF9:NM_178540:exon4:c.A841G:p.M281V,C1QTNF9:NM_001303137:exon5:c.A841G:p.M281V	rs77554188	NaN	NaN	0.16	T	0.004	B	0.045	B	0.001	N	1.000	D	0.44	N	-0.86	T	-1.108	T	0.004	T	0.045	0.391	6.123	1.3	0.637	1.841	10.521	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	811	475	336	14
chr13	25008588	25008588	A	G	exonic	PARP4	NaN	nonsynonymous SNV	PARP4:NM_006437:exon31:c.T4691C:p.I1564T	rs1372085	NaN	0.948083	0.63	T	0.0	B	0.0	B	0.270	N	1.000	P	-1.1	N	4.73	T	-1.041	T	0.000	T	0.022	-1.310	0.035	-3.16	-1.036	-1.612	1.328	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	93.92226	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	0	33	58
chr13	25008630	25008630	A	G	exonic	PARP4	NaN	nonsynonymous SNV	PARP4:NM_006437:exon31:c.T4649C:p.L1550P	rs1822135	NaN	0.942692	0.62	T	0.0	B	0.0	B	0.333	U	1.000	P	-1.1	N	4.62	T	-1.066	T	0.000	T	0.014	-0.226	2.910	-0.141	0.049	-0.655	5.110	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	97.475063	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	0	39	58
chr13	25016585	25016585	G	A	intronic	PARP4	NaN	NaN	NaN	rs3816226	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	219.133	0	NaN	NA	NA	35	6	29	17
chr13	25016870	25016870	C	A	intronic	PARP4	NaN	NaN	NaN	rs3816221	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	171	37	134	39
chr13	25020910	25020910	G	A	intronic	PARP4	NaN	NaN	NaN	rs9507346	NaN	0.876597	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1914.1	0	NaN	NA	NA	54	0	54	13
chr13	25027744	25027744	A	G	exonic	PARP4	NaN	nonsynonymous SNV	PARP4:NM_006437:exon23:c.T2807C:p.M936T	rs4770684	NaN	0.936502	0.63	T	0.001	B	0.003	B	0.064	N	1.000	P	1.1	L	3.21	T	-1.000	T	0.000	T	0.043	-0.793	0.694	-8.59	-2.265	-1.813	5.619	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	455.443918	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	155	0	155	57
chr13	25029083	25029083	G	A	intronic	PARP4	NaN	NaN	NaN	rs3818938	NaN	0.326078	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	85.4035	0	NaN	NA	NA	23	8	15	16
chr13	25043121	25043121	T	A	intronic	PARP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr13	25051718	25051718	T	C	intronic	PARP4	NaN	NaN	NaN	rs9511302	NaN	0.544529	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	47	39	8	49
chr13	25052261	25052261	C	T	exonic	PARP4	NaN	synonymous SNV	PARP4:NM_006437:exon13:c.G1602A:p.S534S	rs4770696	NaN	0.544529	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	203	148	55	51
chr13	25052420	25052420	T	A	intronic	PARP4	NaN	NaN	NaN	rs17080653	NaN	0.302316	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	200	151	49	33
chr13	25065008	25065008	A	G	intronic	PARP4	NaN	NaN	NaN	rs1361577	NaN	0.28155	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	89	76	13	32
chr13	25073400	25073400	T	G	intronic	PARP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	85.4741	23	32.098332	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	22	8	14	3
chr13	25073402	25073402	T	G	intronic	PARP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	18.3756	0	NaN	NA	NA	80	66	14	0
chr13	25187404	25187404	C	A	intergenic	TPTE2P6,ATP12A	dist=15592;dist=67145	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	25263370	25263370	T	T	intronic	ATP12A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr13	25267110	25267110	A	A	intronic	ATP12A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr13	25274785	25274785	T	A	intronic	ATP12A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr13	25284566	25284566	T	T	intronic	ATP12A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr13	25356053	25356053	T	C	exonic	RNF17	NaN	synonymous SNV	RNF17:NM_001184993:exon6:c.T582C:p.F194F,RNF17:NM_031277:exon6:c.T582C:p.F194F	rs9707144	NaN	0.437899	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.699485	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	3	12	30
chr13	25418996	25418996	T	G	intronic	RNF17	NaN	NaN	NaN	rs9511472	NaN	0.21226	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	66	51	15	31
chr13	25419176	25419176	A	G	exonic	RNF17	NaN	synonymous SNV	RNF17:NM_001184993:exon22:c.A3060G:p.T1020T,RNF17:NM_031277:exon22:c.A3060G:p.T1020T	rs6490984	NaN	0.864217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	62.2504	0	NaN	NA	NA	63	0	63	1
chr13	25425723	25425723	T	A	intronic	RNF17	NaN	NaN	NaN	rs2305369	NaN	0.116014	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.329367	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	119	111	8	4
chr13	25425771	25425771	A	C	intronic	RNF17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	25425773	25425773	A	C	intronic	RNF17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	25425775	25425775	C	G	intronic	RNF17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	25425777	25425777	T	C	intronic	RNF17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	25425778	25425778	A	G	intronic	RNF17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	25440318	25440318	G	A	exonic	RNF17	NaN	nonsynonymous SNV	RNF17:NM_001184993:exon30:c.G4126A:p.E1376K,RNF17:NM_031277:exon30:c.G4138A:p.E1380K	rs9507425	NaN	0.212061	0.81	T	0.002	B	0.004	B	0.000	D	0.012	P	1.265	L	3.52	T	-0.983	T	0.000	T	0.244	1.155	9.703	3.9	1.367	3.135	9.227	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	175	134	41	33
chr13	25444934	25444934	C	T	intronic	RNF17	NaN	NaN	NaN	rs2305368	NaN	0.211661	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	92	76	16	33
chr13	25451097	25451097	G	G	intronic	RNF17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	72	62	0	0
chr13	25457207	25457207	T	C	UTR3	CENPJ	NM_018451:c.*108A>G	NaN	NaN	rs9318911	NaN	0.966653	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	179.372088	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	71	0	71	56
chr13	25458042	25458042	A	G	intronic	CENPJ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.212055	nearby_gap_events	REJECT	108	101	7	0
chr13	25458232	25458232	AGTT	A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	811.109	0	NaN	NA	NA	159	45	102	17
chr13	25459713	25459713	G	GTT	intronic	CENPJ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.15595	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	78.2551	0	NaN	NA	NA	316	246	46	13
chr13	25466968	25466968	A	C	exonic	CENPJ	NaN	nonsynonymous SNV	CENPJ:NM_018451:exon10:c.T3029G:p.L1010W	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	2.275	M	1.44	T	-0.532	T	0.260	T	0.634	4.402	23.3	5.22	2.106	7.303	14.382	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.68303	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	104	94	10	0
chr13	25671786	25671786	G	A	exonic	PABPC3	NaN	nonsynonymous SNV	PABPC3:NM_030979:exon1:c.G1450A:p.V484M	rs113301206	ID=COSM1600288;OCCURENCE=1(central_nervous_system)	0.123203	0.27	T	0.0	B	0.004	B	0.001	N	0.998	N	-1.87	N	1.7	T	-0.967	T	0.012	T	0.082	0.121	4.651	-0.771	-0.307	0.521	4.302	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.5246	0	NaN	NA	NA	826	593	233	4
chr13	25671795	25671795	C	T	exonic	PABPC3	NaN	nonsynonymous SNV	PABPC3:NM_030979:exon1:c.C1459T:p.R487C	rs113416318	ID=COSM1562332;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.0349441	0.01	D	0.984	D	0.489	P	0.006	U	1.000	D	1.845	L	1.5	T	-1.054	T	0.074	T	0.305	2.862	15.53	0.875	0.759	4.773	7.549	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	19.3056	53	NaN	NA	NA	813	572	241	3
chr13	25671850	25671850	G	A	exonic	PABPC3	NaN	nonsynonymous SNV	PABPC3:NM_030979:exon1:c.G1514A:p.R505Q	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.001	B	0.010	N	0.983	N	-2.3	N	1.03	T	-0.953	T	0.015	T	0.065	-1.110	0.134	-0.678	-0.182	3.029	4.335	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	801	573	228	0
chr13	25827738	25827738	T	G	intronic	MTMR6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	14	4	10	0
chr13	25876011	25876011	G	A	exonic	NUPL1	NaN	nonsynonymous SNV	NUPL1:NM_001008564:exon1:c.G100A:p.A34T,NUPL1:NM_014089:exon1:c.G100A:p.A34T	rs11556093	NaN	0.367212	1	T	0.001	B	0.001	B	0.045	N	0.153	P	0.35	N	1.45	T	-0.926	T	0.000	T	0.244	0.535	6.899	-0.146	0.069	-0.185	3.944	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	223.683409	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	74	0	74	40
chr13	25882128	25882128	A	G	intronic	NUPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	14	1	12	0
chr13	25887293	25887293	A	G	intronic	NUPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	22	14	7	0
chr13	25893363	25893363	GTTTATA	G,GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	143.725	0	NaN	NA	NA	19	1	4	0
chr13	25901560	25901560	T	C	intronic	NUPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.374709	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	416	407	9	0
chr13	25911073	25911073	G	C	splicing	NUPL1	NM_014089:exon14:c.1436-1G>C,NM_001008564:exon13:c.1400-1G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.141	21.4	5.68	2.676	9.085	19.791	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr13	26104641	26104641	T	T	intronic	ATP8A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr13	26106415	26106415	A	G	exonic	ATP8A2	NaN	synonymous SNV	ATP8A2:NM_016529:exon5:c.A426G:p.R142R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.030286	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	78	75	3	0
chr13	26129272	26129272	A	G	intronic	ATP8A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	17	8	6	0
chr13	26144829	26144829	T	T	intronic	ATP8A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr13	26153910	26153910	T	C	intronic	ATP8A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr13	26155953	26155953	G	C	intronic	ATP8A2	NaN	NaN	NaN	rs7335339	NaN	0.43111	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	256.806273	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	93	0	93	50
chr13	26417361	26417361	C	T	intronic	ATP8A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	26521705	26521705	G	A	intronic	ATP8A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr13	26535668	26535668	T	T	intronic	ATP8A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	28	28	0	0
chr13	26587441	26587441	C	C	intronic	ATP8A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	26594176	26594176	A	A	UTR3	ATP8A2	NM_016529:c.*53A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr13	26974562	26974562	G	A	intronic	CDK8	NaN	NaN	NaN	rs998692	NaN	0.746006	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	189.854883	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	64	0	64	47
chr13	27241903	27241903	A	C	intronic	WASF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	13	4	6	0
chr13	27241906	27241906	G	T	intronic	WASF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	7	1	4	0
chr13	27241908	27241908	T	C	intronic	WASF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	1	4	0
chr13	27333896	27333896	C	G	exonic	GPR12	NaN	nonsynonymous SNV	GPR12:NM_005288:exon2:c.G69C:p.E23D	NaN	NaN	NaN	0.57	T	0.0	B	0.0	B	0.277	N	0.999	D	0.95	L	-1.01	T	-1.005	T	0.323	T	0.096	2.355	13.83	5.19	2.441	2.168	13.079	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.486346	clustered_read_position	REJECT	13	10	3	0
chr13	27333899	27333899	C	A	exonic	GPR12	NaN	synonymous SNV	GPR12:NM_005288:exon2:c.G66T:p.A22A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	18	11	5	0
chr13	27333948	27333948	T	G	exonic	GPR12	NaN	nonsynonymous SNV	GPR12:NM_005288:exon2:c.A17C:p.K6T	NaN	NaN	NaN	0.58	T	0.0	B	0.0	B	0.129	N	0.597	N	0.69	N	-1.0	T	-0.790	T	0.210	T	0.089	1.150	9.685	4.67	1.976	3.780	11.565	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.703261	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	93	83	10	0
chr13	27645095	27645095	G	T	intronic	USP12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.055562	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	170	157	13	0
chr13	27664139	27664139	A	T	intronic	USP12	NaN	NaN	NaN	rs41300570	NaN	0.0509185	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	271	55	216	4
chr13	27830373	27830373	T	C	exonic	RPL21	NaN	nonsynonymous SNV	RPL21:NM_000982:exon5:c.T295C:p.S99P	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.332	B	0.255	B	0.000	U	1.000	D	3.165	M	-0.31	T	-0.118	T	0.404	T	0.984	3.453	17.69	4.83	1.939	6.019	14.700	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.839875		KEEP	25	21	4	0
chr13	27845284	27845284	C	A	intronic	RASL11A	NaN	NaN	NaN	rs9507866	NaN	0.531749	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	79.6693	0	23.434055	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	1	9	10
chr13	28009346	28009346	T	A	intronic	GTF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr13	28009350	28009350	C	G	intronic	GTF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr13	28009352	28009352	A	T	intronic	GTF3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr13	28014551	28014551	T	C	exonic	MTIF3	NaN	nonsynonymous SNV	MTIF3:NM_001166261:exon3:c.A35G:p.Q12R,MTIF3:NM_001166262:exon3:c.A35G:p.Q12R,MTIF3:NM_152912:exon3:c.A35G:p.Q12R,MTIF3:NM_001166263:exon4:c.A35G:p.Q12R	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.59	P	0.075	B	0.009	N	0.978	N	2.24	M	1.28	T	-0.976	T	0.085	T	0.202	2.628	14.75	4.77	2.267	2.063	11.466	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.43307	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	107	103	4	0
chr13	28097477	28097477	C	A	intergenic	MTIF3,LNX2	dist=72738;dist=22573	NaN	NaN	rs927576	NaN	0.882987	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	28097567	28097567	T	C	intergenic	MTIF3,LNX2	dist=72828;dist=22483	NaN	NaN	rs1218887	NaN	0.429912	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	28097596	28097596	A	G	intergenic	MTIF3,LNX2	dist=72857;dist=22454	NaN	NaN	rs1218886	NaN	0.438498	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	28122453	28122453	T	T	UTR3	LNX2	NM_153371:c.*19A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr13	28124410	28124410	G	T	intronic	LNX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	28142094	28142094	A	A	intronic	LNX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr13	28155390	28155390	T	C	intronic	LNX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.21052631578947564	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr13	28196206	28196206	G	G	intronic	POLR1D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	36	32	0	0
chr13	28233853	28233853	A	T	intronic	POLR1D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr13	28235672	28235672	A	G	intronic	POLR1D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr13	28240075	28240075	G	T	exonic	POLR1D	NaN	synonymous SNV	POLR1D:NM_001206559:exon3:c.G270T:p.R90R,POLR1D:NM_152705:exon3:c.G354T:p.R118R	rs75314566	NaN	0.0155751	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	67.2008	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	5	27	7
chr13	28371275	28371275	T	C	intergenic	GSX1,PDX1-AS1	dist=3186;dist=32621	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	28498323	28498323	G	C	intronic	PDX1	NaN	NaN	NaN	rs9805632	NaN	0.205871	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.270334	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	15	7	19
chr13	28537242	28537242	A	C	UTR3	CDX2	NM_001265:c.*10T>G	NaN	NaN	rs1805108	NaN	0.726238	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	58.989744	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	0	26	44
chr13	28537278	28537278	C	A	exonic	CDX2	NaN	nonsynonymous SNV	CDX2:NM_001265:exon3:c.G916T:p.V306L	NaN	NaN	NaN	0	D	0.635	P	0.122	B	0.000	D	0.825	N	0.695	N	-2.42	D	-0.129	T	0.446	T	0.266	3.865	19.64	5.37	2.513	1.605	11.404	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.04515599343185498	NA	0	0	NaN	NA	NA	11	8	3	0
chr13	28589706	28589706	G	C	intronic	FLT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	1	5	0
chr13	28597447	28597447	ATCT	A,AT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	617.451	0	NaN	NA	NA	146	42	18	0
chr13	28597596	28597596	T	G	exonic	FLT3	NaN	nonsynonymous SNV	FLT3:NM_004119:exon19:c.A2309C:p.N770T	NaN	NaN	NaN	0.33	T	0.981	D	0.795	P	0.001	D	0.806	D	1.485	L	-2.43	D	0.367	D	0.661	D	0.232	2.784	15.27	5.16	2.084	1.543	10.118	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.714623	nearby_gap_events	REJECT	151	136	15	0
chr13	28609991	28609991	T	C	intronic	FLT3	NaN	NaN	NaN	rs2491229	NaN	0.563099	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	492.197392	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	186	2	184	54
chr13	28610183	28610183	A	G	intronic	FLT3	NaN	NaN	NaN	rs2491231	NaN	0.563299	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	62.2366	0	NaN	NA	NA	79	0	79	1
chr13	28622356	28622356	G	A	intronic	FLT3	NaN	NaN	NaN	rs2153000	NaN	0.837061	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	168	129	39	54
chr13	28623759	28623759	C	T	intronic	FLT3	NaN	NaN	NaN	rs9513004	NaN	0.102436	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	125	27	98	22
chr13	28636312	28636312	C	T	intronic	FLT3	NaN	NaN	NaN	rs1319107	NaN	0.105831	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	100	NaN	NA	NA	283	43	240	22
chr13	28681810	28681810	T	C	intergenic	FLT3,PAN3-AS1	dist=7081;dist=29170	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr13	28752148	28752148	A	C	intronic	PAN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	9	4	0
chr13	28752152	28752152	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	11	2	3,6	0
chr13	28752153	28752153	T	C	intronic	PAN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	2	8	0
chr13	28830704	28830704	A	T	intronic	PAN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr13	28835527	28835527	T	TC	intronic	PAN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.995208	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1093.13	0	NaN	NA	NA	113	0	110	36
chr13	28844967	28844967	T	C	exonic	PAN3	NaN	nonsynonymous SNV	PAN3:NM_175854:exon13:c.T1922C:p.M641T	rs141264044	NaN	0.000399361	0	D	0.952	P	0.754	P	0.000	D	1.000	D	1.445	L	2.12	T	-1.091	T	0.088	T	0.914	4.062	20.9	5.42	2.184	7.997	15.756	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	163	134	29	1
chr13	28877593	28877593	A	T	intronic	FLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr13	28877594	28877594	T	C	intronic	FLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr13	28877596	28877596	T	G	intronic	FLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr13	28877598	28877598	T	C	intronic	FLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr13	28877599	28877599	T	C	intronic	FLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr13	28877601	28877601	A	G	intronic	FLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr13	28880751	28880751	T	C	intronic	FLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	18	6	12	0
chr13	28880904	28880904	G	A	exonic	FLT1	NaN	synonymous SNV	FLT1:NM_002019:exon29:c.C3726T:p.Y1242Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.531343	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	287	280	7	0
chr13	28882918	28882918	T	T	intronic	FLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	28892522	28892522	A	G	intronic	FLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr13	28919758	28919758	A	A	intronic	FLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	29001113	29001113	A	C	intronic	FLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr13	29001114	29001114	T	A	intronic	FLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr13	29001122	29001122	A	C	intronic	FLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr13	29236489	29236489	C	T	intronic	POMP	NaN	NaN	NaN	rs1340815	NaN	0.474641	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	34.1506	0	NaN	NA	NA	143	29	114	7
chr13	29242555	29242555	T	T	intronic	POMP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr13	29246316	29246316	T	T	intronic	POMP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr13	29274986	29274986	T	T	UTR3	SLC46A3	NM_001135919:c.*98A>A,NM_181785:c.*648A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr13	29275841	29275841	A	G	intronic	SLC46A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	12	7	4	0
chr13	29674718	29674718	T	C	intronic	MTUS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	29675049	29675049	A	T	exonic	MTUS2	NaN	synonymous SNV	MTUS2:NM_001033602:exon3:c.A2616T:p.S872S	rs140464903	ID=COSM946570;OCCURENCE=1(endometrium)	0.0227636	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	15	22.19193	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	38	12	5
chr13	30017876	30017876	A	C	intronic	MTUS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	30077037	30077037	T	C	intronic	MTUS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr13	30106927	30106927	T	G	intronic	SLC7A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	30106928	30106928	C	A	intronic	SLC7A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	30423769	30423769	T	G	UTR5	UBL3	NM_007106:c.-94A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.682058	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	79	70	9	7
chr13	30423940	30423940	C	A	UTR5	UBL3	NM_007106:c.-265G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr13	30423941	30423941	A	G	UTR5	UBL3	NM_007106:c.-266T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr13	30595330	30595330	A	A	intergenic	LINC00544,KATNAL1	dist=70705;dist=181437	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr13	30804797	30804797	A	G	intronic	KATNAL1	NaN	NaN	NaN	rs73163470	NaN	0.0982428	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	4180.07	0	NaN	NA	NA	269	0	269	18
chr13	30805626	30805626	C	CG,G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	352.45	0	NaN	NA	NA	39	0	9	9
chr13	30805627	30805627	A	G	intronic	KATNAL1	NaN	NaN	NaN	rs202087	NaN	0.88738	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	159	21	138	40
chr13	31035841	31035841	A	G	intronic	HMGB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.737323	nearby_gap_events	REJECT	100	94	6	0
chr13	31036642	31036642	C	G	intronic	HMGB1	NaN	NaN	NaN	rs3742305	NaN	0.159944	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	138.032	0	NaN	NA	NA	27	7	19	28
chr13	31037903	31037903	G	C	intronic	HMGB1	NaN	NaN	NaN	rs2249825	NaN	0.147364	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	65.6758	0	NaN	NA	NA	173	38	135	0
chr13	31221122	31221122	T	C	exonic	USPL1	NaN	nonsynonymous SNV	USPL1:NM_005800:exon7:c.T1166C:p.L389P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.983	D	0.000	D	1.000	D	1.975	M	-0.05	T	-0.214	T	0.393	T	0.871	3.915	19.91	5.56	2.244	4.909	14.248	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.367287	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	285	279	6	0
chr13	31231806	31231806	T	C	exonic	USPL1	NaN	nonsynonymous SNV	USPL1:NM_005800:exon9:c.T1592C:p.L531S	rs7984952	NaN	0.478634	0.68	T	0.0	B	0.0	B	0.881	N	1.000	P	-0.345	N	3.15	T	-1.044	T	0.000	T	0.027	1.476	10.88	3.46	0.715	0.369	8.089	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	86	NaN	NA	NA	235	43	192	47
chr13	31231919	31231919	G	A	exonic	USPL1	NaN	nonsynonymous SNV	USPL1:NM_005800:exon9:c.G1705A:p.G569R	NaN	NaN	NaN	0.22	T	0.923	P	0.504	P	0.996	N	1.000	N	1.7	L	3.05	T	-1.008	T	0.029	T	0.172	2.758	15.18	2.95	0.323	0.726	5.920	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.712996	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	240	232	8	0
chr13	31338158	31338158	A	G	exonic	ALOX5AP	NaN	nonsynonymous SNV	ALOX5AP:NM_001629:exon5:c.A401G:p.Y134C,ALOX5AP:NM_001204406:exon6:c.A572G:p.Y191C	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.976	D	0.685	P	0.007	N	0.998	D	1.1	L	-0.4	T	-0.794	T	0.226	T	0.551	3.433	17.61	1.15	-0.026	2.099	6.340	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.300196	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	160	154	6	0
chr13	31445449	31445449	A	C	intergenic	LINC00398,LINC00545	dist=60667;dist=11250	NaN	NaN	rs9535480	NaN	0.633986	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr13	31495179	31495179	G	A	exonic	MEDAG	NaN	synonymous SNV	MEDAG:NM_032849:exon3:c.G417A:p.T139T	rs11841583	NaN	0.112021	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.040	T	0.000	T	.	1.101	9.492	1.28	0.038	0.002	5.498	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	127.027504	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	11	48	9
chr13	31495637	31495637	C	G	ncRNA_intronic	TEX26-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr13	31495638	31495638	T	G	ncRNA_intronic	TEX26-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr13	31495639	31495639	A	G	ncRNA_intronic	TEX26-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr13	31495641	31495641	A	T	ncRNA_intronic	TEX26-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr13	31513931	31513931	T	A	intronic	TEX26	NaN	NaN	NaN	rs2225505	NaN	0.410543	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	303	60	243	36
chr13	31531121	31531121	C	A	exonic	TEX26	NaN	nonsynonymous SNV	TEX26:NM_152325:exon4:c.C424A:p.Q142K	NaN	NaN	NaN	0	D	0.996	D	0.987	D	0.000	D	0.996	D	2.135	M	0.55	T	-0.378	T	0.319	T	0.755	3.292	17.06	4.86	2.207	3.309	13.494	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.339988	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	39	34	5	0
chr13	31531122	31531122	A	C	exonic	TEX26	NaN	nonsynonymous SNV	TEX26:NM_152325:exon4:c.A425C:p.Q142P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.996	D	0.000	D	0.999	D	2.135	M	0.39	T	-0.422	T	0.308	T	0.899	2.880	15.59	4.86	1.791	2.454	10.850	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.396792	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	38	33	5	0
chr13	31543095	31543095	C	T	exonic	TEX26	NaN	synonymous SNV	TEX26:NM_152325:exon6:c.C720T:p.Y240Y	rs2274869	NaN	0.192692	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	64	NaN	NA	NA	45	39	6	25
chr13	31604816	31604816	G	C	intergenic	TEX26,HSPH1	dist=55663;dist=104295	NaN	NaN	rs4942783	NaN	0.333666	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	31604830	31604830	A	C	intergenic	TEX26,HSPH1	dist=55677;dist=104281	NaN	NaN	rs4942785	NaN	0.328275	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	31617083	31617083	A	G	intergenic	TEX26,HSPH1	dist=67930;dist=92028	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr13	31695580	31695580	C	T	intergenic	TEX26,HSPH1	dist=146427;dist=13531	NaN	NaN	rs9537831	NaN	0.645168	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	13	1	12	0
chr13	31711319	31711319	C	T	UTR3	HSPH1	NM_001286504:c.*136G>A,NM_006644:c.*136G>A,NM_001286505:c.*136G>A,NM_001286503:c.*136G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.580048	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	104	93	11	0
chr13	31711363	31711363	G	A	UTR3	HSPH1	NM_001286504:c.*92C>T,NM_006644:c.*92C>T,NM_001286505:c.*92C>T,NM_001286503:c.*92C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.301228	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	109	102	7	0
chr13	31715134	31715134	T	T	intronic	HSPH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr13	31722159	31722159	G	C	exonic	HSPH1	NaN	nonsynonymous SNV	HSPH1:NM_001286505:exon8:c.C1087G:p.P363A,HSPH1:NM_001286503:exon10:c.C1315G:p.P439A,HSPH1:NM_001286504:exon10:c.C1321G:p.P441A,HSPH1:NM_006644:exon10:c.C1315G:p.P439A	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.529	P	0.58	P	0.000	D	1.000	D	0.79	N	3.61	T	-1.032	T	0.023	T	0.34	4.195	21.7	5.84	2.779	7.440	15.607	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.513566	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	170	163	7	0
chr13	31724344	31724344	A	A	intronic	HSPH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	63	NaN	NA	NA	27	27	0	0
chr13	31728748	31728748	T	T	intronic	HSPH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	32352881	32352881	A	A	intronic	RXFP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr13	32376246	32376246	C	A	intronic	RXFP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.541429	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	140	130	10	0
chr13	32376247	32376247	T	C	intronic	RXFP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.009451	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	132	120	12	0
chr13	32606069	32606069	A	G	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	rs424118	NaN	0.434305	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	252.677	0	67.021743	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	2	26	35
chr13	32606087	32606087	T	C	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	rs433551	NaN	0.416334	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	223.909	0	NaN	NA	NA	53	0	53	32
chr13	32735544	32735544	A	A	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	32745413	32745413	T	G	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	32745417	32745417	A	T	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	32758834	32758834	A	G	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	rs798971	NaN	0.821685	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	235.528	0	62.46796	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	0	25	43
chr13	32759079	32759079	G	T	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.140805	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	413	406	7	0
chr13	32759326	32759326	A	A	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr13	32760369	32760369	T	G	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	32783912	32783912	A	A	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr13	32786416	32786416	T	A	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	rs798983	NaN	0.383187	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	83.856615	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	0	31	41
chr13	32798562	32798562	A	A	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr13	32821669	32821669	A	G	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	1	2	0
chr13	32821673	32821673	T	G	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	32836668	32836668	A	C	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	rs74044963	NaN	0.00279553	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.025287356321838834	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	8	6	0
chr13	32848954	32848954	A	C	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	32848959	32848959	G	T	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	32848961	32848961	C	A	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	32848966	32848966	T	G	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	32848968	32848968	T	G	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	32852725	32852725	A	A	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	32863922	32863922	A	C	intronic	FRY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	26.8481	0	9.112614	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	36	26	10	15
chr13	32885903	32885903	T	A	exonic	ZAR1L	NaN	nonsynonymous SNV	ZAR1L:NM_001136571:exon1:c.A160T:p.N54Y	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.956	D	.	.	0.997	N	1.735	L	.	.	-0.928	T	0.179	T	0.417	2.031	12.75	4.38	1.863	1.783	5.037	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.108389	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	30	26	4	0
chr13	32890522	32890522	T	C	intronic	BRCA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr13	32912299	32912299	T	C	exonic	BRCA2	NaN	synonymous SNV	BRCA2:NM_000059:exon11:c.T3807C:p.V1269V	rs543304	NaN	0.168131	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	68.351297	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	80	50	30	18
chr13	32913055	32913055	A	G	exonic	BRCA2	NaN	synonymous SNV	BRCA2:NM_000059:exon11:c.A4563G:p.L1521L	rs206075	NaN	0.974042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	190.084108	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	1	65	58
chr13	32913315	32913315	A	G	exonic	BRCA2	NaN	nonsynonymous SNV	BRCA2:NM_000059:exon11:c.A4823G:p.E1608G	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.799	P	0.276	B	0.416	N	1.000	N	1.67	L	5.74	T	-0.884	T	0.004	T	0.617	1.902	12.32	1.54	0.917	2.691	7.514	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.14038	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	247	240	7	0
chr13	32969080	32969080	C	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	3	3,4	0
chr13	32969081	32969081	T	C	intronic	BRCA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr13	32969082	32969082	T	G	intronic	BRCA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr13	32969084	32969084	T	G	intronic	BRCA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr13	32972181	32972181	G	A	intronic	BRCA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr13	33095620	33095620	G	A	intronic	N4BP2L2	NaN	NaN	NaN	rs621450	NaN	0.316494	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	92	73	19	36
chr13	33261545	33261545	T	A	intronic	PDS5B	NaN	NaN	NaN	rs3858846	NaN	0.271565	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	94	19	75	40
chr13	33284066	33284066	T	A	intronic	PDS5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.284104	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	110	97	13	0
chr13	33284067	33284067	A	T	intronic	PDS5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.51143	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	101	87	14	0
chr13	33284338	33284338	A	G	intronic	PDS5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	33306224	33306224	T	A	intronic	PDS5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.318061	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	98	90	8	0
chr13	33320054	33320054	A	G	intronic	PDS5B	NaN	NaN	NaN	rs4942867	NaN	0.27516	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	134	27	107	6
chr13	33332099	33332099	T	C	intronic	PDS5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5016	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr13	33591474	33591474	A	G	intronic	KL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	33628138	33628138	T	G	exonic	KL	NaN	nonsynonymous SNV	KL:NM_004795:exon2:c.T1054G:p.F352V	rs9536314	NaN	0.129992	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	0.000	P	2.265	M	1.44	T	-1.192	T	0.000	T	0.468	4.502	24.2	5.9	2.264	7.914	16.332	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	171	24	147	21
chr13	33628193	33628193	G	C	exonic	KL	NaN	nonsynonymous SNV	KL:NM_004795:exon2:c.G1109C:p.C370S	rs9527025	NaN	0.129992	0.37	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.995	P	-2.78	N	1.82	T	-0.998	T	0.000	T	0.142	0.677	7.622	5.9	1.527	5.982	17.329	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	139	31	108	21
chr13	33635463	33635463	T	C	exonic	KL	NaN	synonymous SNV	KL:NM_004795:exon4:c.T2247C:p.A749A	rs648202	NaN	0.710863	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	108.364784	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	13	46	57
chr13	33636017	33636017	A	G	intronic	KL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	5	2	0
chr13	33680870	33680870	T	T	intronic	STARD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	33685851	33685851	T	T	intronic	STARD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr13	33686808	33686808	T	T	intronic	STARD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr13	33687827	33687827	T	C	intronic	STARD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	33716613	33716613	C	T	intronic	STARD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	33739649	33739649	T	C	intronic	STARD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr13	33739651	33739651	T	G	intronic	STARD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	33739652	33739652	A	C	intronic	STARD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	33739654	33739654	T	G	intronic	STARD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	33739657	33739657	C	G	intronic	STARD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	33739660	33739660	T	A	intronic	STARD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	34013847	34013847	G	C	exonic	STARD13	NaN	nonsynonymous SNV	STARD13:NM_001243476:exon5:c.C45G:p.N15K	rs876133	NaN	0.51877	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	156.973922	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	0	53	37
chr13	34013959	34013959	T	C	intronic	STARD13	NaN	NaN	NaN	rs651327	NaN	0.51857	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	91.359276	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	0	35	31
chr13	34403850	34403850	G	A	intronic	RFC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr13	34403946	34403946	A	G	intronic	RFC3	NaN	NaN	NaN	rs1805374	NaN	0.00379393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	137	NaN	NA	NA	213	172	41	5
chr13	34404791	34404791	T	C	intronic	RFC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr13	34405544	34405544	A	G	intronic	RFC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	8	2	4	0
chr13	34409229	34409229	T	T	intronic	RFC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	35516301	35516301	G	G	upstream	NBEA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr13	35644952	35644952	A	C	exonic	NBEA	NaN	synonymous SNV	NBEA:NM_015678:exon10:c.A1534C:p.R512R	rs7995564	NaN	0.117013	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	56	9	47	8
chr13	35672372	35672372	T	T	intronic	NBEA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr13	35691537	35691537	C	T	intronic	NBEA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.997822	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	12	8	4	0
chr13	35738637	35738637	A	G	exonic	NBEA	NaN	synonymous SNV	NBEA:NM_015678:exon24:c.A4224G:p.T1408T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.646621	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	31	27	4	0
chr13	35806862	35806862	G	T	intronic	NBEA	NaN	NaN	NaN	rs114146564	NaN	0.0209665	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1897.49	0	NaN	NA	NA	359	89	270	4
chr13	35864688	35864688	A	T	intronic	NBEA	NaN	NaN	NaN	rs41292203	NaN	0.0211661	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	99.7948	0	12.660026	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	4
chr13	36129114	36129114	T	T	ncRNA_intronic	MIR548F5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	24	24	0	0
chr13	36158265	36158265	A	G	ncRNA_intronic	MIR548F5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	25	15	10	0
chr13	36204816	36204816	A	G	ncRNA_intronic	MIR548F5	NaN	NaN	NaN	rs7321187	NaN	0.26238	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr13	36229578	36229578	A	G	ncRNA_intronic	MIR548F5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr13	36241497	36241497	T	T	ncRNA_intronic	MIR548F5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	17	14	0	0
chr13	36319188	36319188	T	C	ncRNA_intronic	MIR548F5	NaN	NaN	NaN	rs73176126	NaN	0.176917	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr13	36376244	36376244	G	G	ncRNA_intronic	MIR548F5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	36413390	36413390	A	A	ncRNA_intronic	MIR548F5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	36604943	36604943	A	G	intronic	DCLK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr13	36801579	36801579	A	G	intronic	CCDC169,CCDC169-SOHLH2	NaN	NaN	NaN	rs9546786	NaN	0.375998	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	220.29382	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	75	1	74	22
chr13	36805301	36805301	A	G	UTR3	CCDC169	NM_001144986:c.*29T>C,NM_001144981:c.*29T>C,NM_001144985:c.*29T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.537485	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	144	133	11	0
chr13	37007379	37007379	A	G	intronic	CCNA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr13	37015415	37015415	A	G	intronic	CCNA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	37269140	37269140	G	A	UTR5	SERTM1	NM_203451:c.-76G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	69	42	27	0
chr13	37399388	37399388	T	T	intronic	RFXAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr13	37399748	37399748	A	G	intronic	RFXAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	25	5	20	0
chr13	37546280	37546280	G	C	intronic	ALG5	NaN	NaN	NaN	rs9576146	NaN	0.427316	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	7.46187	34	NaN	NA	NA	13	11	2	3
chr13	37577252	37577252	A	C	intronic	EXOSC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	37577253	37577253	T	A	intronic	EXOSC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	37577254	37577254	T	C	intronic	EXOSC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	37578827	37578827	A	A	intronic	EXOSC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr13	37580139	37580139	G	A	exonic	EXOSC8	NaN	synonymous SNV	EXOSC8:NM_181503:exon6:c.G321A:p.Q107Q	rs1127446	NaN	0.413538	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	215	168	47	36
chr13	37581051	37581051	T	G	intronic	EXOSC8	NaN	NaN	NaN	rs9576154	NaN	0.952875	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	378.047304	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	128	0	128	57
chr13	37583831	37583831	G	A	exonic	SUPT20H	NaN	nonsynonymous SNV	SUPT20H:NM_001014286:exon26:c.C2318T:p.T773M	rs9469	NaN	0.413139	0.16	T	0.006	B	0.004	B	0.001	N	0.000	P	0.665	N	1.4	T	-1.003	T	0.000	T	0.193	0.874	8.546	4.18	0.832	3.130	10.349	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	109	NaN	NA	NA	153	135	18	36
chr13	37598099	37598099	A	G	intronic	SUPT20H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	34	21	13	0
chr13	37598113	37598113	A	G	intronic	SUPT20H	NaN	NaN	NaN	rs4943441	NaN	0.84385	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.966459	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	0	34	57
chr13	37618054	37618054	T	T	intronic	SUPT20H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr13	37618290	37618290	T	C	exonic	SUPT20H	NaN	synonymous SNV	SUPT20H:NM_001014286:exon7:c.A321G:p.E107E,SUPT20H:NM_001278480:exon7:c.A321G:p.E107E,SUPT20H:NM_001278481:exon7:c.A324G:p.E108E,SUPT20H:NM_001278482:exon7:c.A324G:p.E108E,SUPT20H:NM_017569:exon7:c.A324G:p.E108E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.243176	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	175	160	15	0
chr13	37678704	37678704	T	G	exonic	CSNK1A1L	NaN	nonsynonymous SNV	CSNK1A1L:NM_145203:exon1:c.A690C:p.K230N	NaN	NaN	NaN	0	D	0.978	D	0.853	P	0.000	D	0.925	D	2.82	M	3.01	T	-1.071	T	0.060	T	0.151	2.510	14.35	1.08	0.725	-0.094	2.928	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.547986	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	489	471	18	0
chr13	37679268	37679268	G	T	exonic	CSNK1A1L	NaN	nonsynonymous SNV	CSNK1A1L:NM_145203:exon1:c.C126A:p.D42E	rs9576175	ID=COSM1128380;OCCURENCE=1(prostate)	0.596845	1	T	0.0	B	0.003	B	0.000	N	1.000	P	-1.71	N	2.25	T	-1.014	T	0.000	T	0.018	-2.284	0.004	0.778	-0.206	0.197	4.867	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	376	306	70	45
chr13	37679535	37679535	G	C	UTR5	CSNK1A1L	NM_145203:c.-142C>G	NaN	NaN	rs9576176	NaN	0.595248	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	117	97	20	45
chr13	38138756	38138756	A	T	intronic	POSTN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	4	3	0
chr13	38143736	38143736	A	C	intronic	POSTN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr13	38153499	38153499	A	G	intronic	POSTN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.62207	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	145	128	17	0
chr13	38153983	38153983	T	A	intronic	POSTN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr13	38154715	38154715	T	G	exonic	POSTN	NaN	nonsynonymous SNV	POSTN:NM_001135934:exon11:c.A1512C:p.K504N,POSTN:NM_001135935:exon11:c.A1512C:p.K504N,POSTN:NM_001135936:exon11:c.A1512C:p.K504N,POSTN:NM_001286665:exon11:c.A1512C:p.K504N,POSTN:NM_001286666:exon11:c.A1512C:p.K504N,POSTN:NM_001286667:exon11:c.A1512C:p.K504N,POSTN:NM_006475:exon11:c.A1512C:p.K504N	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.469	P	0.135	B	0.017	N	1.000	N	0.525	N	-2.87	D	-0.574	T	0.432	T	0.052	1.410	10.65	1.01	-0.038	-0.757	6.031	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.3181818181818176	NA	0	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr13	38164445	38164445	G	A	intronic	POSTN	NaN	NaN	NaN	rs1006416	NaN	0.859824	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	62.2575	0	NaN	NA	NA	180	0	180	0
chr13	38211581	38211581	T	T	exonic	TRPC4	NaN	synonymous SNV	TRPC4:NM_001135958:exon10:c.A1874A:p.D625D,TRPC4:NM_003306:exon11:c.A2408A:p.D803D,TRPC4:NM_016179:exon11:c.A2393A:p.D798D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	119	83	0	0
chr13	38248271	38248271	T	A	intronic	TRPC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	38924083	38924083	A	T	intronic	UFM1	NaN	NaN	NaN	rs2231330	NaN	0.864217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	114.995008	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	0	41	50
chr13	39263714	39263714	T	C	exonic	FREM2	NaN	nonsynonymous SNV	FREM2:NM_207361:exon1:c.T2233C:p.S745P	rs2496423	NaN	1	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-1.905	N	0.45	T	-0.941	T	0.000	T	0.06	-0.247	2.810	4.94	0.785	3.168	11.813	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	197.581	0	NaN	NA	NA	4	0	4	38
chr13	39264359	39264359	G	T	exonic	FREM2	NaN	nonsynonymous SNV	FREM2:NM_207361:exon1:c.G2878T:p.G960W	NaN	NaN	NaN	0	D	0.967	D	0.806	P	0.000	D	1.000	D	3.12	M	1.83	T	-0.811	T	0.157	T	0.503	2.028	12.74	3.79	0.665	3.557	9.841	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.814912	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	352	333	19	0
chr13	39420663	39420663	T	C	intronic	FREM2	NaN	NaN	NaN	rs9548502	NaN	0.109625	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	250	197	53	10
chr13	39422489	39422489	T	C	intronic	FREM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	16	9	3	0
chr13	39430313	39430313	A	AT	exonic	FREM2	NaN	frameshift substitution	FREM2:NM_207361:exon12:c.6976_6976delinsAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	222.456	0	NaN	NA	NA	47	0	8	5
chr13	39430314	39430314	C	T	exonic	FREM2	NaN	nonsynonymous SNV	FREM2:NM_207361:exon12:c.C6977T:p.T2326I	rs9548509	ID=COSM432379;OCCURENCE=1(breast)	0.771965	0.39	T	0.0	B	0.0	B	0.001	N	1.000	P	-1.33	N	1.78	T	-0.965	T	0.000	T	0.044	1.264	10.12	5.66	0.979	6.137	11.738	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	36	0	36	25
chr13	39435815	39435815	A	A	intronic	FREM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	20	16	0	0
chr13	39438824	39438824	A	A	intronic	FREM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	39450139	39450139	A	C	intronic	FREM2	NaN	NaN	NaN	rs1945510	NaN	0.201078	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	31	25	6	11
chr13	39452934	39452934	C	T	intronic	FREM2	NaN	NaN	NaN	rs9532296	NaN	0.254193	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	177.716251	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	80	18	62	34
chr13	39544114	39544114	T	T	intronic	STOML3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr13	39602529	39602529	A	T	intronic	PROSER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	9	5	0
chr13	39605643	39605643	T	T	intronic	PROSER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr13	39608335	39608335	TAAAAAAAAAAA	TAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	182.399	0	NaN	NA	NA	67	0	23	0
chr13	39608346	39608346	A	C	intronic	PROSER1	NaN	NaN	NaN	rs184864093	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.851966	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	69	60	9	8
chr13	40229891	40229891	G	A	exonic	COG6	NaN	nonsynonymous SNV	COG6:NM_001145079:exon1:c.G28A:p.A10T,COG6:NM_020751:exon1:c.G28A:p.A10T	rs3812882	NaN	0.484425	0.37	T	0.003	B	0.001	B	0.565	N	1.000	P	1.355	L	1.18	T	-0.938	T	0.000	T	0.13	4.802	27.1	2.68	0.621	-0.010	4.427	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	62.2578	18	22.033044	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	22
chr13	40229957	40229957	T	A	exonic	COG6	NaN	nonsynonymous SNV	COG6:NM_001145079:exon1:c.T94A:p.C32S,COG6:NM_020751:exon1:c.T94A:p.C32S	rs3812883	NaN	0.484225	1	T	0.0	B	0.0	B	0.173	N	1.000	P	-1.04	N	1.71	T	-0.923	T	0.000	T	0.247	0.235	5.269	3.0	0.056	2.549	2.253	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.256905	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	1	9	36
chr13	40261945	40261945	A	G	intronic	COG6	NaN	NaN	NaN	rs4129745	NaN	0.295527	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	93	NaN	NA	NA	77	68	9	15
chr13	40293710	40293710	T	T	intronic	COG6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr13	40298762	40298762	C	G	intronic	COG6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.009748	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	148	139	9	0
chr13	40298763	40298763	T	C	intronic	COG6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.935828	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	133	125	8	0
chr13	40298805	40298805	C	T	intronic	COG6	NaN	NaN	NaN	rs9532421	NaN	0.994409	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	450.029809	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	153	0	153	58
chr13	40937263	40937263	A	T	ncRNA_intronic	LINC00598	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	41010598	41010598	A	A	ncRNA_intronic	LINC00598	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	41341208	41341208	T	A	intronic	MRPS31	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.939501	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	176	162	14	0
chr13	41345297	41345297	A	G	UTR5	MRPS31	NM_005830:c.-25T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr13	41507723	41507723	T	G	exonic	ELF1	NaN	synonymous SNV	ELF1:NM_001145353:exon8:c.A1626C:p.T542T,ELF1:NM_172373:exon9:c.A1698C:p.T566T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	127	101	26	1
chr13	41517406	41517406	A	C	intronic	ELF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr13	41635835	41635835	A	G	intronic	WBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.242649	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	46	43	3	0
chr13	41635932	41635932	A	A	intronic	WBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	41642891	41642891	A	G	intronic	WBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	41642892	41642892	A	G	intronic	WBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	41642895	41642895	C	G	intronic	WBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	41642896	41642896	T	A	intronic	WBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	41767183	41767183	T	C	exonic	KBTBD7	NaN	nonsynonymous SNV	KBTBD7:NM_032138:exon1:c.A1211G:p.D404G	NaN	NaN	NaN	0.35	T	0.001	B	0.002	B	0.001	U	0.999	D	0.46	N	-0.47	T	-0.899	T	0.179	T	0.53	1.677	11.57	4.9	1.823	5.315	12.496	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.584709	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	368	359	9	0
chr13	41767338	41767338	A	G	exonic	KBTBD7	NaN	synonymous SNV	KBTBD7:NM_032138:exon1:c.T1056C:p.P352P	rs2039134	ID=COSM1366901;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.508786	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	88.2685	0	NaN	NA	NA	42	0	42	11
chr13	41767341	41767341	A	G	exonic	KBTBD7	NaN	synonymous SNV	KBTBD7:NM_032138:exon1:c.T1053C:p.H351H	rs2039135	NaN	0.508786	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	74.977	0	NaN	NA	NA	49	0	49	13
chr13	41828796	41828796	T	C	intronic	MTRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.769268	nearby_gap_events	REJECT	26	22	4	0
chr13	41835039	41835039	T	C	exonic	MTRF1	NaN	nonsynonymous SNV	MTRF1:NM_004294:exon2:c.A5G:p.N2S	rs9532758	NaN	0.0706869	0.55	T	0.01	B	0.005	B	0.378	N	0.996	P	0.145	N	3.05	T	-0.938	T	0.000	T	0.069	1.630	11.41	-0.275	0.036	0.594	9.832	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	131	107	24	6
chr13	41902922	41902922	G	A	exonic	NAA16	NaN	nonsynonymous SNV	NAA16:NM_001110798:exon7:c.G754A:p.D252N,NAA16:NM_018527:exon7:c.G754A:p.D252N,NAA16:NM_024561:exon7:c.G754A:p.D252N	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.127	B	0.185	B	0.000	D	1.000	D	1.15	L	0.77	T	-0.765	T	0.225	T	0.072	3.185	16.66	5.37	2.533	7.316	19.096	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.649785	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	39	36	3	0
chr13	41941416	41941416	T	A	intronic	NAA16	NaN	NaN	NaN	rs6560981	NaN	0.964457	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0052642249789594305	NA	0	0	NaN	NA	NA	41	13	28	47
chr13	41941823	41941823	A	G	intronic	NAA16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr13	42142282	42142282	T	C	UTR3	VWA8	NM_015058:c.*51A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.378387	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	160	155	5	0
chr13	42164935	42164935	A	A	intronic	VWA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr13	42273439	42273439	T	A	intronic	VWA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr13	42273444	42273444	A	G	intronic	VWA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	42273445	42273445	C	A	intronic	VWA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	42275646	42275646	T	C	exonic	VWA8	NaN	nonsynonymous SNV	VWA8:NM_015058:exon28:c.A3246G:p.I1082M	rs371683248	NaN	NaN	0.25	T	0.017	B	0.014	B	0.006	N	1.000	D	0.55	N	2.88	T	-0.998	T	0.011	T	0.125	1.835	12.10	-7.53	-0.639	0.577	2.512	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.295904	nearby_gap_events	REJECT	132	125	7	0
chr13	42277606	42277606	A	T	intronic	VWA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.472414	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	84	78	6	0
chr13	42460292	42460292	A	C	intronic	VWA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr13	42460293	42460293	T	A	intronic	VWA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr13	42461573	42461573	A	A	intronic	VWA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr13	42481894	42481894	A	A	intronic	VWA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr13	42701717	42701717	A	G	intronic	DGKH	NaN	NaN	NaN	rs605371	ID=COSM147677;OCCURENCE=1(stomach)	0.361621	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	231.181903	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	118	27	91	37
chr13	42703682	42703682	T	C	intronic	DGKH	NaN	NaN	NaN	rs3742261	ID=COSM147678;OCCURENCE=1(stomach)	0.315096	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	337	54	283	45
chr13	42714473	42714473	T	C	intronic	DGKH	NaN	NaN	NaN	rs4941416	NaN	0.314097	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr13	42729986	42729986	A	G	intronic	DGKH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	13	1	8	0
chr13	42772547	42772547	G	T	intronic	DGKH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	42773629	42773629	A	G	intronic	DGKH	NaN	NaN	NaN	rs4942097	NaN	0.0966454	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	220.639	0	74.683745	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	8	29	17
chr13	42793288	42793288	A	A	intronic	DGKH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr13	42793292	42793292	T	T	intronic	DGKH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr13	42793298	42793298	G	T	intronic	DGKH	NaN	NaN	NaN	rs9315899	NaN	0.204073	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	128	NaN	NA	NA	313	258	55	30
chr13	42793479	42793479	G	A	exonic	DGKH	NaN	synonymous SNV	DGKH:NM_001297429:exon23:c.G2592A:p.E864E,DGKH:NM_001204505:exon25:c.G2919A:p.E973E,DGKH:NM_001204506:exon25:c.G2919A:p.E973E,DGKH:NM_152910:exon27:c.G3327A:p.E1109E,DGKH:NM_178009:exon27:c.G3327A:p.E1109E,DGKH:NM_001204504:exon28:c.G3327A:p.E1109E	rs180870	NaN	0.626797	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	131	NaN	NA	NA	303	251	52	52
chr13	42803341	42803341	T	C	UTR3	DGKH	NM_001204504:c.*54T>C,NM_152910:c.*54T>C,NM_178009:c.*17T>C,NM_001204506:c.*17T>C,NM_001204505:c.*17T>C,NM_001297429:c.*54T>C	NaN	NaN	rs545602	NaN	0.810304	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	53	43	10	8
chr13	43148313	43148313	C	G	UTR5	TNFSF11	NM_003701:c.-127C>G	NaN	NaN	rs9533157	NaN	0.998802	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.977885	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	32
chr13	43462283	43462283	T	T	UTR3	EPSTI1	NM_033255:c.*347A>A,NM_001002264:c.*103A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr13	43462652	43462652	A	G	intronic	EPSTI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	15	6	9	0
chr13	43463299	43463299	T	C	intronic	EPSTI1	NaN	NaN	NaN	rs1323864	NaN	0.677516	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	72	15	57	43
chr13	43469022	43469022	T	T	intronic	EPSTI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	43493632	43493632	A	G	intronic	EPSTI1	NaN	NaN	NaN	rs7988150	NaN	0.629593	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	127.221946	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	0	45	54
chr13	43788158	43788158	G	A	exonic	ENOX1	NaN	synonymous SNV	ENOX1:NM_001127615:exon17:c.C1900T:p.L634L,ENOX1:NM_001242863:exon17:c.C1900T:p.L634L,ENOX1:NM_017993:exon17:c.C1900T:p.L634L	rs703207	NaN	0.731629	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	256	194	62	57
chr13	43930337	43930337	A	G	intronic	ENOX1	NaN	NaN	NaN	rs2281713	NaN	0.860024	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1205.44	0	NaN	NA	NA	111	0	111	51
chr13	43930447	43930447	A	C	intronic	ENOX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr13	44432834	44432834	A	G	intronic	CCDC122	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.271659	clustered_read_position	REJECT	20	16	4	0
chr13	44433700	44433700	G	A	intronic	CCDC122	NaN	NaN	NaN	rs1562216	NaN	0.863419	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	318.248542	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	119	1	118	58
chr13	44464237	44464237	T	A	intronic	LACC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.303402	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	100	88	12	0
chr13	44948220	44948220	A	T	exonic	SERP2	NaN	nonsynonymous SNV	SERP2:NM_001010897:exon1:c.A59T:p.Q20L	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.0	B	0.002	B	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	-0.972	T	0.129	T	0.371	2.226	13.40	3.34	1.376	4.381	9.700	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.94686	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	1	3	0
chr13	44948221	44948221	G	T	exonic	SERP2	NaN	nonsynonymous SNV	SERP2:NM_001010897:exon1:c.G60T:p.Q20H	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.001	B	0.009	B	0.000	D	0.996	D	.	.	.	.	-0.990	T	0.126	T	0.344	1.991	12.61	2.68	0.681	2.589	5.796	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.752453	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	5	1	4	0
chr13	44948222	44948222	A	C	exonic	SERP2	NaN	synonymous SNV	SERP2:NM_001010897:exon1:c.A61C:p.R21R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.454157	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	1	3	0
chr13	44997079	44997079	G	G	intergenic	TUSC8,TSC22D1	dist=16959;dist=9200	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	45008838	45008838	G	A	exonic	TSC22D1	NaN	nonsynonymous SNV	TSC22D1:NM_001243797:exon3:c.C185T:p.P62L,TSC22D1:NM_001243798:exon3:c.C185T:p.P62L,TSC22D1:NM_006022:exon3:c.C359T:p.P120L,TSC22D1:NM_183422:exon3:c.C3146T:p.P1049L	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.825	P	0.255	B	0.003	N	1.000	D	1.79	L	1.25	T	-0.985	T	0.105	T	0.408	1.972	12.55	5.91	2.793	6.116	18.877	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	22	22	0	0
chr13	45009084	45009084	A	A	intronic	TSC22D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr13	45170102	45170102	G	G	intergenic	TSC22D1-AS1,LINC00330	dist=15534;dist=203538	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr13	45423601	45423601	T	T	intergenic	LINC00330,NUFIP1	dist=39835;dist=89783	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	45553391	45553391	G	A	exonic	NUFIP1	NaN	nonsynonymous SNV	NUFIP1:NM_012345:exon5:c.C668T:p.P223L	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	2.255	M	0.72	T	-0.430	T	0.308	T	0.512	4.460	23.8	5.4	2.545	5.781	16.735	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.801839		KEEP	91	86	5	0
chr13	45580333	45580333	T	T	intronic	GPALPP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	44	41	0	0
chr13	45970241	45970241	A	C	intronic	SLC25A30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr13	45975190	45975190	A	A	intronic	SLC25A30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr13	45975192	45975192	T	T	intronic	SLC25A30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr13	45975198	45975198	A	A	intronic	SLC25A30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr13	45983210	45983210	C	A	splicing	SLC25A30	NM_001010875:exon4:c.65-1G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.479	24.0	5.88	2.779	7.338	19.226	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.18081	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	66	60	6	0
chr13	46039534	46039534	A	G	intronic	COG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr13	46050637	46050637	T	C	intronic	COG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr13	46067593	46067593	G	A	exonic	COG3	NaN	synonymous SNV	COG3:NM_031431:exon12:c.G1299A:p.E433E	rs2985959	ID=COSM147683;OCCURENCE=1(stomach)	0.360423	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	432.029047	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	152	0	152	41
chr13	46077381	46077381	G	A	exonic	COG3	NaN	synonymous SNV	COG3:NM_031431:exon14:c.G1491A:p.Q497Q	rs3014960	NaN	0.903355	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	107.596597	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	0	36	56
chr13	46090153	46090153	T	G	intronic	COG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	46115396	46115396	T	T	downstream	ERICH6B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr13	46137837	46137837	T	C	intronic	ERICH6B	NaN	NaN	NaN	rs3014917	NaN	0.604233	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	99	NaN	NA	NA	146	19	127	37
chr13	46277016	46277016	A	G	intronic	SPERT	NaN	NaN	NaN	rs755428	NaN	0.132388	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	265.11666	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	126	29	97	19
chr13	46288145	46288145	A	G	exonic	SPERT	NaN	nonsynonymous SNV	SPERT:NM_001286341:exon2:c.A904G:p.K302E,SPERT:NM_001286342:exon3:c.A877G:p.K293E,SPERT:NM_152719:exon3:c.A985G:p.K329E	rs7317245	NaN	0.494609	1	T	0.0	B	0.0	B	0.057	N	1.000	P	-0.895	N	1.19	T	-0.935	T	0.000	T	0.019	-1.813	0.009	3.16	0.277	1.217	5.027	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	123	NaN	NA	NA	212	176	36	55
chr13	46357982	46357982	A	A	exonic	SIAH3	NaN	synonymous SNV	SIAH3:NM_198849:exon2:c.T346T:p.W116W	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr13	46468815	46468815	A	A	intergenic	SIAH3,ZC3H13	dist=42969;dist=67499	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	46543789	46543789	T	G	exonic	ZC3H13	NaN	nonsynonymous SNV	ZC3H13:NM_015070:exon14:c.A2890C:p.K964Q	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.998	D	0.943	D	0.000	D	1.000	D	2.125	M	2.13	T	-0.832	T	0.208	T	0.38	2.326	13.74	6.08	2.333	7.499	16.644	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.341133	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	163	156	7	0
chr13	46550062	46550062	A	T	intronic	ZC3H13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr13	46584689	46584689	A	G	intronic	ZC3H13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	46619308	46619308	T	C	intronic	ZC3H13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	887.398	0	NaN	NA	NA	159	40	119	0
chr13	46619448	46619448	T	G	intronic	ZC3H13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr13	46627973	46627973	T	G	ncRNA_intronic	CPB2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	46658300	46658300	A	G	ncRNA_intronic	CPB2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	46728924	46728924	C	T	intronic	LCP1	NaN	NaN	NaN	rs2296122	NaN	0.541534	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	203.008916	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	104	27	77	37
chr13	46730776	46730776	A	G	intronic	LCP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	46919762	46919762	T	G	intronic	KIAA0226L	NaN	NaN	NaN	rs259735	NaN	0.288538	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	141	NaN	NA	NA	349	297	49	29
chr13	46919786	46919786	C	T	intronic	KIAA0226L	NaN	NaN	NaN	rs11617125	NaN	0.131789	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	325	282	43	18
chr13	46930372	46930372	T	C	intronic	KIAA0226L	NaN	NaN	NaN	rs9526171	NaN	0.538139	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	46930536	46930536	C	A	intronic	KIAA0226L	NaN	NaN	NaN	rs181977	NaN	0.461661	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	68	NaN	NA	NA	218	177	41	33
chr13	46937193	46937193	T	C	intronic	KIAA0226L	NaN	NaN	NaN	rs259699	NaN	0.388578	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	155	127	28	21
chr13	46946157	46946157	C	T	exonic	KIAA0226L	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA0226L:NM_001286762:exon2:c.G454A:p.G152R,KIAA0226L:NM_001286764:exon2:c.G49A:p.G17R,KIAA0226L:NM_001286761:exon3:c.G454A:p.G152R,KIAA0226L:NM_001286763:exon3:c.G253A:p.G85R,KIAA0226L:NM_025113:exon3:c.G454A:p.G152R	rs1408184	NaN	0.451478	0.75	T	0.0	B	0.0	B	0.386	N	1.000	P	-1.1	N	1.03	T	-0.931	T	0.000	T	0.282	0.698	7.723	0.984	0.153	-0.213	8.513	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	86	71	15	33
chr13	47289840	47289840	A	G	intronic	LRCH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.311625		KEEP	39	34	5	0
chr13	47302961	47302961	T	T	intronic	LRCH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr13	47308109	47308109	A	G	exonic	LRCH1	NaN	synonymous SNV	LRCH1:NM_001164213:exon18:c.A1956G:p.A652A,LRCH1:NM_015116:exon18:c.A1956G:p.A652A,LRCH1:NM_001164211:exon19:c.A2061G:p.A687A	rs2298086	NaN	0.911941	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	127.429	0	NaN	NA	NA	62	0	62	13
chr13	47327255	47327255	T	G	downstream	LRCH1	NaN	NaN	NaN	rs912125	NaN	0.323283	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	47354101	47354101	C	T	exonic	ESD	NaN	nonsynonymous SNV	ESD:NM_001984:exon8:c.G569A:p.G190E	rs9778	NaN	0.192093	0.11	T	0.685	P	0.301	B	0.000	N	0.000	P	2.595	M	1.49	T	-0.961	T	0.000	T	0.397	4.072	20.9	4.42	0.912	4.842	10.904	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	278	212	66	7
chr13	47361322	47361322	A	G	intronic	ESD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.319457	nearby_gap_events	REJECT	86	81	5	0
chr13	47365388	47365388	G	T	intronic	ESD	NaN	NaN	NaN	rs997167	NaN	0.202276	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	50	22	28	7
chr13	48571213	48571213	C	T	intronic	SUCLA2	NaN	NaN	NaN	rs8001509	NaN	0.942093	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	581.667794	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	208	0	208	58
chr13	48612214	48612214	G	A	intronic	NUDT15	NaN	NaN	NaN	rs45465203	NaN	0.0896565	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	41.8581	0	NaN	NA	NA	43	30	13	10
chr13	48615017	48615017	A	A	intronic	NUDT15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	88	48	0	0
chr13	48619751	48619751	T	G	intronic	NUDT15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.95982	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	130	119	11	2
chr13	48653957	48653957	AAC	A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	62.5608	0	NaN	NA	NA	239	185	46	11
chr13	48830601	48830601	A	C	intronic	ITM2B	NaN	NaN	NaN	rs3818455	NaN	0.170327	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.102994	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	16	6	24
chr13	48934155	48934155	G	T	exonic	RB1	NaN	stopgain	RB1:NM_000321:exon7:c.G610T:p.E204X	NaN	NaN	NaN	0.91	T	.	.	.	.	0.002	N	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.245	22.1	3.83	0.688	1.601	6.452	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.096435	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	83	72	11	0
chr13	48951308	48951308	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	12	2	4,6	0
chr13	48954198	48954198	C	T	exonic	RB1	NaN	stopgain	RB1:NM_000321:exon15:c.C1399T:p.R467X	NaN	ID=COSM1587098,COSM866;OCCURENCE=1(bone),1(endometrium)	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	7.068	38	4.72	1.468	3.143	14.496	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	6.758082406893228E-4	NA	0	102	NaN	NA	NA	53	35	18	0
chr13	48955373	48955373	T	C	intronic	RB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.716776	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	269	254	15	0
chr13	49033747	49033747	G	A	intronic	RB1	NaN	NaN	NaN	rs198580	NaN	0.867212	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2297.28	0	NaN	NA	NA	187	0	187	57
chr13	49034006	49034006	A	A	intronic	RB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr13	49051481	49051481	T	T	intronic	RB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	94	80	0	0
chr13	49085794	49085794	A	G	intronic	RCBTB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr13	49089503	49089503	A	C	intronic	RCBTB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.632458	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	163	145	18	2
chr13	49720100	49720100	A	A	intronic	FNDC3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr13	49772240	49772240	T	G	exonic	FNDC3A	NaN	nonsynonymous SNV	FNDC3A:NM_014923:exon20:c.T2445G:p.H815Q,FNDC3A:NM_001079673:exon22:c.T2613G:p.H871Q,FNDC3A:NM_001278438:exon22:c.T2613G:p.H871Q	NaN	NaN	NaN	0.61	T	0.0	B	0.012	B	0.529	N	0.996	D	1.04	L	0.47	T	-1.063	T	0.103	T	0.084	0.305	5.650	3.49	1.043	0.404	8.947	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.701678	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	80	72	8	0
chr13	49772241	49772241	T	G	exonic	FNDC3A	NaN	nonsynonymous SNV	FNDC3A:NM_014923:exon20:c.T2446G:p.Y816D,FNDC3A:NM_001079673:exon22:c.T2614G:p.Y872D,FNDC3A:NM_001278438:exon22:c.T2614G:p.Y872D	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.063	B	0.032	B	0.000	D	1.000	D	1.32	L	0.43	T	-0.986	T	0.141	T	0.869	1.948	12.47	5.88	2.243	7.078	15.478	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.19674	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	79	71	8	0
chr13	49776193	49776193	A	T	intronic	FNDC3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr13	49789164	49789164	T	C	intergenic	FNDC3A,MLNR	dist=5249;dist=5310	NaN	NaN	rs972297	NaN	0.560903	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	8	0	8	0
chr13	49794713	49794713	G	A	exonic	MLNR	NaN	nonsynonymous SNV	MLNR:NM_001507:exon1:c.G240A:p.M80I	NaN	NaN	NaN	0	D	0.704	P	0.228	B	0.000	U	0.986	D	1.945	M	-0.59	T	-0.338	T	0.292	T	0.385	4.999	29.4	4.23	1.902	9.453	15.145	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.359054	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	22	19	3	0
chr13	49860496	49860496	A	T	intronic	CDADC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr13	49860498	49860498	A	C	intronic	CDADC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr13	49951359	49951359	T	C	intronic	CAB39L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.53262		KEEP	79	72	7	0
chr13	50054325	50054325	T	C	intronic	SETDB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	50054326	50054326	T	C	intronic	SETDB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr13	50094930	50094930	T	T	intronic	PHF11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	50115669	50115669	C	T	intronic	RCBTB1	NaN	NaN	NaN	rs1536195	NaN	0.831669	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	103	NaN	NA	NA	316	280	36	55
chr13	50116015	50116015	G	A	intronic	RCBTB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.545657	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	159	151	8	0
chr13	50123622	50123622	G	C	exonic	RCBTB1	NaN	synonymous SNV	RCBTB1:NM_018191:exon9:c.C1017G:p.P339P	rs3751384	NaN	0.47524	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	62	NaN	NA	NA	161	128	33	51
chr13	50126382	50126382	G	A	exonic	RCBTB1	NaN	synonymous SNV	RCBTB1:NM_018191:exon7:c.C643T:p.L215L	rs2274278	NaN	0.859026	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	119	NaN	NA	NA	155	122	33	55
chr13	50265503	50265503	C	A	exonic	EBPL	NaN	nonsynonymous SNV	EBPL:NM_001278636:exon1:c.G58T:p.A20S,EBPL:NM_032565:exon1:c.G58T:p.A20S	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.124	B	0.045	B	0.026	N	0.970	D	0.745	N	-4.78	D	0.368	D	0.817	D	0.16	1.888	12.27	1.91	0.340	0.163	11.105	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.452686	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	2	0	2	0
chr13	50283923	50283923	A	G	intronic	KPNA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.865655	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	285	279	6	0
chr13	50299648	50299648	AC	A,AA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	167.044	0	NaN	NA	NA	354	267	52	7
chr13	50299649	50299649	C	A	intronic	KPNA3	NaN	NaN	NaN	rs200661623	NaN	0.0081869	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	184	NaN	NA	NA	248	228	20	17
chr13	50320979	50320979	T	T	intronic	KPNA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	50502223	50502223	TA	AT,T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1129.89	0	NaN	NA	NA	162	0	37	3
chr13	50502224	50502224	A	T	intronic	SPRYD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	85	63	22	0
chr13	50510184	50510184	G	G	intronic	SPRYD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr13	50510185	50510185	A	A	intronic	SPRYD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr13	50510187	50510187	C	C	intronic	SPRYD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	51287271	51287271	T	T	UTR3	DLEU7	NM_198989:c.*82A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr13	51504762	51504762	T	T	intronic	RNASEH2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr13	51508961	51508961	T	T	intronic	RNASEH2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	129	103	0	0
chr13	51519486	51519486	A	G	intronic	RNASEH2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr13	51855393	51855393	A	C	UTR3	FAM124A	NM_001242312:c.*1A>C,NM_145019:c.*1A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.192329	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	99	84	15	0
chr13	51918683	51918683	C	T	intronic	SERPINE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr13	51922677	51922677	A	A	intronic	SERPINE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr13	51950153	51950153	A	T	intronic	INTS6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.912442	nearby_gap_events	REJECT	114	105	9	0
chr13	51953723	51953723	A	G	intronic	INTS6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.054972	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	281	270	11	0
chr13	51953854	51953854	A	A	intronic	INTS6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr13	52194718	52194718	G	G	intronic	WDFY2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	52293541	52293541	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	0	2,2	0
chr13	52313195	52313195	C	T	exonic	WDFY2	NaN	synonymous SNV	WDFY2:NM_052950:exon7:c.C609T:p.T203T	rs1885854	NaN	0.125399	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	120	NaN	NA	NA	167	25	142	18
chr13	52325488	52325488	A	G	exonic	WDFY2	NaN	synonymous SNV	WDFY2:NM_052950:exon8:c.A768G:p.Q256Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	232.883343	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	105	21	84	1
chr13	52329655	52329655	T	A	intronic	WDFY2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr13	52333968	52333968	A	G	UTR3	WDFY2	NM_052950:c.*63A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	37	4	33	0
chr13	52509635	52509635	T	T	intronic	ATP7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr13	52520764	52520764	A	A	intronic	ATP7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr13	52524560	52524560	C	T	intronic	ATP7B	NaN	NaN	NaN	rs9526811	NaN	0.306909	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	424.008	0	NaN	NA	NA	68	13	55	30
chr13	52544941	52544941	A	A	intronic	ATP7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr13	52548140	52548140	A	C	exonic	ATP7B	NaN	nonsynonymous SNV	ATP7B:NM_000053:exon2:c.T1216G:p.S406A,ATP7B:NM_001005918:exon2:c.T1216G:p.S406A,ATP7B:NM_001243182:exon3:c.T883G:p.S295A	rs1801243	NaN	0.376198	0.78	T	0.113	B	0.078	B	0.666	N	1.000	P	0.895	L	-2.09	D	-0.999	T	0.000	T	0.054	2.623	14.73	-0.027	0.055	-0.669	4.421	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	28.479	0	11.397807	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	6	5	27
chr13	52584353	52584353	C	G	intronic	ATP7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	52598799	52598799	G	A	exonic	ALG11	NaN	synonymous SNV	ALG11:NM_001004127:exon3:c.G933A:p.P311P	rs61958802	NaN	0.0301518	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	151	123	28	6
chr13	52602686	52602686	A	A	exonic	ALG11	NaN	synonymous SNV	ALG11:NM_001004127:exon4:c.A1439A:p.E480E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	23	18	0	0
chr13	52602919	52602919	A	C	UTR5;UTR3	UTP14C;ALG11	NM_021645:c.-22A>C;NM_001004127:c.*193A>C	NaN	NaN	rs3825528	NaN	0.368411	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	84.91564	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	17	36	38
chr13	52603194	52603194	G	T	exonic	UTP14C	NaN	nonsynonymous SNV	UTP14C:NM_021645:exon2:c.G254T:p.G85V	rs3742289	NaN	0.58127	0.4	T	0.0	B	0.0	B	0.321	N	0.000	P	-1.26	N	2.32	T	-1.048	T	0.000	T	0.114	0.405	6.201	0.050	-0.133	0.238	3.868	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	462.249065	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	149	0	149	51
chr13	52620903	52620903	A	A	intergenic	UTP14C,NEK5	dist=13167;dist=17997	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr13	52657375	52657375	T	T	intronic	NEK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr13	52660391	52660391	T	C	intronic	NEK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr13	52663491	52663491	A	G	intronic	NEK5	NaN	NaN	NaN	rs9535861	NaN	0.506789	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	300.808	0	NaN	NA	NA	62	17	45	44
chr13	52667228	52667228	G	A	exonic	NEK5	NaN	synonymous SNV	NEK5:NM_199289:exon13:c.C1170T:p.Y390Y	rs55715265	NaN	0.0309505	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	318	249	69	6
chr13	52676272	52676272	T	C	exonic	NEK5	NaN	nonsynonymous SNV	NEK5:NM_199289:exon10:c.A766G:p.R256G	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.936	P	0.74	P	0.000	D	0.994	D	1.04	L	1.86	T	-1.121	T	0.086	T	0.483	3.070	16.25	5.98	2.289	4.337	16.468	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.751589	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	141	131	10	0
chr13	52678755	52678755	A	A	intronic	NEK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr13	52707240	52707240	C	G	UTR3	NEK3	NM_002498:c.*38G>C,NM_152720:c.*38G>C,NM_001146099:c.*38G>C	NaN	NaN	rs3368	NaN	0.390176	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	446	79	367	44
chr13	52709939	52709939	G	C	exonic	NEK3	NaN	nonsynonymous SNV	NEK3:NM_001146099:exon13:c.C1184G:p.P395R,NEK3:NM_002498:exon14:c.C1235G:p.P412R,NEK3:NM_152720:exon14:c.C1235G:p.P412R	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.948	D	0.000	D	1.000	D	2.135	M	-1.11	T	0.401	D	0.659	D	0.678	2.606	14.68	5.21	2.570	6.905	19.122	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.178624	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	113	103	10	0
chr13	52717950	52717950	C	T	intronic	NEK3	NaN	NaN	NaN	rs3783242	NaN	0.515575	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.103417	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	34
chr13	52951802	52951802	T	C	exonic	THSD1	NaN	nonsynonymous SNV	THSD1:NM_199263:exon4:c.A2144G:p.K715R,THSD1:NM_018676:exon5:c.A2303G:p.K768R	rs9536041	NaN	0.0299521	1	T	0.004	B	0.005	B	0.000	N	0.843	N	-0.955	N	2.66	T	-0.980	T	0.003	T	0.093	-0.300	2.570	2.66	0.760	1.465	7.428	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	131	100	31	6
chr13	52952486	52952486	A	A	exonic	THSD1	NaN	synonymous SNV	THSD1:NM_199263:exon4:c.T1460T:p.M487M,THSD1:NM_018676:exon5:c.T1619T:p.M540M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	71	61	0	0
chr13	52952575	52952575	G	A	exonic	THSD1	NaN	synonymous SNV	THSD1:NM_199263:exon4:c.C1371T:p.A457A,THSD1:NM_018676:exon5:c.C1530T:p.A510A	rs9536042	NaN	0.0706869	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	45	39	9	6
chr13	52992038	52992038	T	T	intronic	VPS36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr13	53016635	53016635	G	A	intronic	VPS36	NaN	NaN	NaN	rs61959664	NaN	0.0239617	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	75	NaN	NA	NA	264	214	50	6
chr13	53024596	53024596	T	A	intronic	VPS36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.704969	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	0	4	0
chr13	53024597	53024597	T	A	intronic	VPS36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.604791	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	0	4	0
chr13	53024598	53024598	C	A	intronic	VPS36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.092592	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	0	4	0
chr13	53035665	53035665	T	A	exonic	CKAP2	NaN	nonsynonymous SNV	CKAP2:NM_001098525:exon4:c.T707A:p.M236K,CKAP2:NM_001286686:exon4:c.T560A:p.M187K,CKAP2:NM_001286687:exon4:c.T704A:p.M235K,CKAP2:NM_018204:exon4:c.T704A:p.M235K	rs35975899	NaN	0.0297524	.	.	0.61	P	0.275	B	0.190	N	1.000	N	1.1	L	2.39	T	-1.028	T	0.006	T	0.067	-0.865	0.514	-7.65	-0.865	-0.438	2.374	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	211	168	43	6
chr13	53036163	53036163	G	A	intronic	CKAP2	NaN	NaN	NaN	rs9536083	NaN	0.0297524	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	36.416	0	35.480549	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	74	56	18	5
chr13	53036349	53036349	G	C	intronic	CKAP2	NaN	NaN	NaN	rs9536084	NaN	0.0519169	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	21	20	1	5
chr13	53217035	53217035	C	A	exonic	HNRNPA1L2	NaN	synonymous SNV	HNRNPA1L2:NM_001011725:exon6:c.C408A:p.I136I,HNRNPA1L2:NM_001011724:exon7:c.C408A:p.I136I	rs9536211	ID=COSM432516;OCCURENCE=1(breast)	0.270767	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	99.2766	0	NaN	NA	NA	185	56	129	33
chr13	53217213	53217213	C	CA	exonic	HNRNPA1L2	NaN	frameshift substitution	HNRNPA1L2:NM_001011725:exon6:c.586_586delinsCA,HNRNPA1L2:NM_001011724:exon7:c.586_586delinsCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	13.0476	0	NaN	NA	NA	12	8	3	1
chr13	53227301	53227301	C	T	intronic	SUGT1	NaN	NaN	NaN	rs9536219	ID=COSN164506;OCCURENCE=1(breast)	0.282348	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	122.01464	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	70	23	47	38
chr13	53233194	53233194	A	T	intronic	SUGT1	NaN	NaN	NaN	rs9536223	ID=COSN164507;OCCURENCE=1(breast)	0.29393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	71.624	0	22.707939	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	2	9	28
chr13	53313905	53313905	A	A	UTR5	LECT1	NM_007015:c.-69T>T,NM_001011705:c.-69T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr13	53419139	53419139	T	G	intronic	PCDH8	NaN	NaN	NaN	rs2236363	NaN	0.283546	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	165	132	33	23
chr13	53608479	53608479	G	A	intronic	OLFM4	NaN	NaN	NaN	rs2298230	NaN	0.342252	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	257.812828	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	87	0	87	41
chr13	53983445	53983445	G	C	intergenic	LINC01065,LINC00558	dist=257410;dist=406109	NaN	NaN	rs7987501	NaN	0.431909	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	34	2	32	0
chr13	55052407	55052407	A	G	intergenic	MIR1297,MIR5007	dist=166224;dist=696182	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr13	57754360	57754360	T	G	intergenic	PRR20C,PCDH17	dist=10008;dist=451429	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr13	58207979	58207979	G	C	exonic	PCDH17	NaN	nonsynonymous SNV	PCDH17:NM_001040429:exon1:c.G1299C:p.E433D	NaN	NaN	NaN	.	.	1.0	D	0.999	D	0.000	D	0.999	D	4.305	H	-0.65	T	0.564	D	0.677	D	0.797	1.891	12.28	4.85	2.704	4.189	11.157	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr13	58209425	58209425	A	A	intronic	PCDH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	58299435	58299435	A	G	UTR3	PCDH17	NM_001040429:c.*7A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.651957	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	39	31	8	0
chr13	60348464	60348464	T	C	intronic	DIAPH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.79862	0	NaN	NA	NA	12	9	2	9
chr13	60348467	60348467	A	C	intronic	DIAPH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	13	6	7	0
chr13	60385190	60385190	A	C	intronic	DIAPH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr13	60385193	60385193	G	T	intronic	DIAPH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr13	60385194	60385194	T	G	intronic	DIAPH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr13	60407490	60407490	A	A	intronic	DIAPH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr13	60498904	60498904	C	T	intronic	DIAPH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.1304347826086963	NA	0	0	4.48477	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	9	7	2	0
chr13	60566644	60566644	T	C	exonic	DIAPH3	NaN	nonsynonymous SNV	DIAPH3:NM_001258370:exon4:c.A299G:p.N100S,DIAPH3:NM_030932:exon4:c.A299G:p.N100S,DIAPH3:NM_001258367:exon8:c.A950G:p.N317S,DIAPH3:NM_001258368:exon8:c.A878G:p.N293S,DIAPH3:NM_001258366:exon9:c.A1055G:p.N352S,DIAPH3:NM_001042517:exon10:c.A1088G:p.N363S,DIAPH3:NM_001258369:exon10:c.A1088G:p.N363S	rs36084898	NaN	0.0742812	0.41	T	1.0	D	0.998	D	0.000	D	0.996	D	2	M	-1.59	D	-0.626	T	0.059	T	0.153	2.680	14.92	5.8	2.207	7.606	16.137	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	205	154	51	7
chr13	60566765	60566765	A	G	intronic	DIAPH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr13	60582597	60582597	T	G	intronic	DIAPH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.110349	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	60	50	10	4
chr13	60590299	60590299	C	T	ncRNA_intronic	DIAPH3-AS1	NaN	NaN	NaN	rs2762134	NaN	0.71845	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	223.364643	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	84	0	84	52
chr13	61034675	61034675	G	T	splicing	TDRD3	NM_001146071:exon4:c.74+1G>T,NM_030794:exon4:c.74+1G>T,NM_001146070:exon4:c.353+1G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.491	24.1	5.77	2.720	9.476	19.980	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.024253	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	90	79	11	0
chr13	61102575	61102575	GATA	G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	620.416	0	NaN	NA	NA	180	71	102	12
chr13	61103438	61103438	A	G	intronic	TDRD3	NaN	NaN	NaN	rs9538735	NaN	0.120807	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	409.213	51	NaN	NA	NA	107	33	67	21
chr13	61103526	61103526	A	A	intronic	TDRD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr13	66878878	66878878	C	G	exonic	PCDH9	NaN	nonsynonymous SNV	PCDH9:NM_020403:exon4:c.G3521C:p.G1174A,PCDH9:NM_203487:exon5:c.G3623C:p.G1208A	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.224	B	0.136	B	0.000	D	1.000	D	0.55	N	0.67	T	-1.024	T	0.126	T	0.534	2.670	14.89	5.72	2.878	5.677	20.269	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.59556	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	98	86	12	0
chr13	67800934	67800934	T	A,TA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	492.465	0	NaN	NA	NA	82	0	4	0
chr13	67800953	67800953	A	T	exonic	PCDH9	NaN	nonsynonymous SNV	PCDH9:NM_020403:exon2:c.T1620A:p.F540L,PCDH9:NM_203487:exon2:c.T1620A:p.F540L	NaN	NaN	NaN	0.46	T	0.999	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	-0.06	N	2.98	T	-0.988	T	0.029	T	0.848	2.079	12.91	3.69	0.556	2.774	8.296	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.431949	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	58	52	6	0
chr13	69559243	69559243	G	C	intergenic	LINC00550,LINC00383	dist=99786;dist=237235	NaN	NaN	rs61952199	NaN	0.319888	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	70456636	70456636	A	A	intronic	KLHL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr13	71498428	71498428	G	G	intergenic	ATXN8OS,LINC00348	dist=784543;dist=90845	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr13	72049704	72049704	C	A	intronic	DACH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.404672	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	64	53	11	0
chr13	73293263	73293263	A	C	intronic	MZT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.909093	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	166	157	9	0
chr13	73336295	73336295	A	A	intronic	DIS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr13	73345167	73345167	G	A	intronic	DIS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.208235	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	12	10	2	0
chr13	73346511	73346511	A	C	intronic	DIS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	14	5	9	0
chr13	73350079	73350079	T	C	exonic	DIS3	NaN	nonsynonymous SNV	DIS3:NM_001128226:exon5:c.A716G:p.N239S,DIS3:NM_014953:exon5:c.A806G:p.N269S	rs4883918	NaN	0.327077	0.75	T	0.0	B	0.0	B	0.180	N	1.000	P	0.805	L	2.09	T	-0.938	T	0.000	T	0.018	-0.489	1.751	-8.07	-1.333	0.585	14.091	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	82	NaN	NA	NA	213	164	49	31
chr13	73396052	73396052	A	G	exonic	PIBF1	NaN	synonymous SNV	PIBF1:NM_006346:exon6:c.A738G:p.E246E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.97143	possible_contamination	REJECT	79	74	5	0
chr13	73428185	73428185	T	A	intronic	PIBF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.87995	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	101	93	8	2
chr13	73636825	73636825	G	GA	exonic	KLF5	NaN	frameshift substitution	KLF5:NM_001286818:exon2:c.815_815delinsGA,KLF5:NM_001730:exon2:c.1088_1088delinsGA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.94781	0	NaN	NA	NA	15	11	2	3
chr13	74420118	74420118	G	A	exonic	KLF12	NaN	synonymous SNV	KLF12:NM_007249:exon4:c.C516T:p.P172P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.317797	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	125	120	5	0
chr13	74734988	74734988	G	G	intergenic	KLF12,LINC00381	dist=26922;dist=258322	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr13	75814344	75814344	C	C	ncRNA_exonic	CTAGE11P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	101	79	0	0
chr13	75831288	75831288	C	T	intergenic	CTAGE11P,TBC1D4	dist=16771;dist=27512	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr13	75880386	75880386	A	C	intronic	TBC1D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	15	10	5	0
chr13	75884296	75884296	A	G	intronic	TBC1D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	9	5	3	0
chr13	75915554	75915554	T	T	intronic	TBC1D4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	22	20	0	0
chr13	75923326	75923326	T	C	exonic	TBC1D4	NaN	nonsynonymous SNV	TBC1D4:NM_001286658:exon5:c.A1388G:p.K463R,TBC1D4:NM_001286659:exon5:c.A1388G:p.K463R,TBC1D4:NM_014832:exon5:c.A1388G:p.K463R	NaN	NaN	NaN	0.13	T	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	1.61	L	3.57	T	-1.196	T	0.050	T	0.649	4.892	28.1	6.04	2.308	5.828	16.582	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.4888	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	458	442	16	0
chr13	76104483	76104483	A	A	intronic	COMMD6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	76135028	76135028	T	A	intronic	UCHL3	NaN	NaN	NaN	rs4884008	NaN	0.499401	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.470953	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	6	13	44
chr13	76141272	76141272	T	T	intronic	UCHL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr13	76179811	76179811	T	G	ncRNA_intronic	LMO7-AS1	NaN	NaN	NaN	rs35132045	NaN	0.052516	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	143.355	0	43.822455	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	3	18	11
chr13	76370768	76370768	T	A	intronic	LMO7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.0425935708116137	NA	0	0	26.094942	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	138	113	25	0
chr13	76370770	76370770	A	G	splicing	LMO7	NM_005358:exon7:c.505-2A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.477	17.80	5.38	2.162	8.277	15.672	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.697744	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	248	223	25	0
chr13	76378399	76378399	A	G	intronic	LMO7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.960201	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	269	262	7	0
chr13	76395399	76395399	C	T	exonic	LMO7	NaN	nonsynonymous SNV	LMO7:NM_015842:exon11:c.C1595T:p.P532L,LMO7:NM_005358:exon13:c.C1448T:p.P483L	NaN	NaN	NaN	0	D	0.483	P	0.084	B	0.068	N	0.977	N	2.395	M	1.53	T	-0.899	T	0.128	T	0.253	2.605	14.67	5.15	1.436	2.745	14.114	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.196435	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	98	92	6	0
chr13	76395766	76395766	A	A	intronic	LMO7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr13	76398098	76398098	G	C	intronic	LMO7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr13	76398099	76398099	T	A	intronic	LMO7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr13	76398101	76398101	T	A	intronic	LMO7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr13	76398102	76398102	T	G	intronic	LMO7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	5	0	3	0
chr13	76409436	76409436	A	G	exonic	LMO7	NaN	synonymous SNV	LMO7:NM_015842:exon15:c.A2595G:p.L865L,LMO7:NM_005358:exon17:c.A2448G:p.L816L	rs2273997	ID=COSM1651144,COSM1128352,COSM1128351;OCCURENCE=1(prostate)	0.226238	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-0.979	T	0.000	T	.	-0.944	0.352	-9.28	-1.404	-1.837	4.204	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	188.655139	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	64	0	64	35
chr13	76415237	76415237	T	A	intronic	LMO7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.168442	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	173	159	14	0
chr13	77459229	77459229	T	G	UTR3	KCTD12	NM_138444:c.*77A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr13	77459230	77459230	G	A	UTR3	KCTD12	NM_138444:c.*76C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr13	77459970	77459970	T	C	exonic	KCTD12	NaN	nonsynonymous SNV	KCTD12:NM_138444:exon1:c.A314G:p.D105G	NaN	NaN	0.000199681	0.11	T	0.991	D	0.843	P	0.000	D	1.000	D	2.18	M	-1.06	T	0.090	D	0.540	D	0.494	4.751	26.6	4.54	1.806	7.705	13.836	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.022635	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr13	77630040	77630040	A	A	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr13	77669454	77669454	T	T	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr13	77672280	77672280	T	A	exonic	MYCBP2	NaN	nonsynonymous SNV	MYCBP2:NM_015057:exon56:c.A9009T:p.K3003N	NaN	NaN	NaN	0.3	T	0.997	D	0.966	D	0.000	D	0.999	D	1.7	L	1.57	T	-1.047	T	0.122	T	0.346	1.790	11.94	0.027	0.088	0.444	10.922	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	31	20	11	0
chr13	77751776	77751776	T	T	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	16	12	0	0
chr13	77754330	77754330	C	T	exonic	MYCBP2	NaN	nonsynonymous SNV	MYCBP2:NM_015057:exon34:c.G5065A:p.V1689I	rs61749892	NaN	0.000798722	0.14	T	0.984	D	0.46	P	0.000	D	1.000	D	1.12	L	1.57	T	-1.120	T	0.083	T	0.387	3.470	17.77	5.61	2.801	7.445	19.997	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	148	123	25	2
chr13	77759119	77759119	T	C	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr13	77759120	77759120	G	T	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr13	77759122	77759122	T	G	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr13	77759124	77759124	T	C	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr13	77759896	77759896	A	G	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.590447	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	199	194	5	0
chr13	77763060	77763060	C	T	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.068899	nearby_gap_events	REJECT	64	58	6	1
chr13	77763301	77763301	A	A	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr13	77786059	77786059	T	T	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr13	77786397	77786397	A	G	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	19	10	5	0
chr13	77825577	77825577	A	A	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	77831718	77831718	T	T	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr13	77842127	77842127	A	C	intronic	MYCBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.884344	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	113	101	12	0
chr13	78134109	78134109	A	G	intronic	SCEL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	14	5	8	0
chr13	78146208	78146208	T	G	intronic	SCEL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr13	78146407	78146407	T	C	intronic	SCEL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	78146411	78146411	G	T	intronic	SCEL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	78146413	78146413	G	T	intronic	SCEL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	78167789	78167789	A	A	intronic	SCEL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr13	78176769	78176769	T	G	ncRNA_intronic	SCEL-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.36786	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	110	100	10	0
chr13	78188076	78188076	C	T	exonic	SCEL	NaN	synonymous SNV	SCEL:NM_001160706:exon22:c.C1311T:p.V437V,SCEL:NM_003843:exon23:c.C1377T:p.V459V,SCEL:NM_144777:exon24:c.C1437T:p.V479V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.732314	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	58	52	6	0
chr13	78216873	78216873	A	G	exonic	SCEL	NaN	synonymous SNV	SCEL:NM_001160706:exon30:c.A1854G:p.L618L,SCEL:NM_003843:exon31:c.A1920G:p.L640L,SCEL:NM_144777:exon32:c.A1980G:p.L660L	rs1053985	ID=COSM147703;OCCURENCE=1(stomach)	0.41234	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	101	NaN	NA	NA	162	137	25	49
chr13	78470514	78470514	T	T	ncRNA_intronic	EDNRB-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr13	78470756	78470756	G	T	ncRNA_intronic	EDNRB-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr13	79209382	79209382	A	C	intronic	RNF219	NaN	NaN	NaN	rs9805409	NaN	0.348243	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	65	51	14	34
chr13	79216418	79216418	A	G	intronic	RNF219	NaN	NaN	NaN	rs7327732	NaN	0.359225	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	113	NaN	NA	NA	149	127	22	40
chr13	79932468	79932468	T	C	exonic	RBM26	NaN	nonsynonymous SNV	RBM26:NM_001286631:exon11:c.A1645G:p.N549D,RBM26:NM_001286632:exon11:c.A1630G:p.N544D,RBM26:NM_022118:exon11:c.A1630G:p.N544D	NaN	NaN	NaN	.	.	0.999	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	2.27	M	3.29	T	-1.133	T	0.072	T	0.53	4.667	25.7	5.14	2.043	7.439	15.236	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.251837	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	89	86	3	0
chr13	79939921	79939921	TAAGAGA	T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	957.758	0	NaN	NA	NA	99	0	93	29
chr13	79940033	79940033	A	C	intronic	RBM26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.150854	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	67	60	7	8
chr13	79951554	79951554	T	A	exonic	RBM26	NaN	nonsynonymous SNV	RBM26:NM_001286631:exon3:c.A287T:p.E96V,RBM26:NM_001286632:exon3:c.A287T:p.E96V,RBM26:NM_022118:exon3:c.A287T:p.E96V	NaN	NaN	NaN	.	.	0.435	B	0.136	B	0.002	N	1.000	D	-0.69	N	3.4	T	-0.719	T	0.009	T	0.393	3.412	17.53	6.16	2.367	5.712	16.806	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.048841	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	318	300	18	0
chr13	79951682	79951682	A	C	intronic	RBM26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.240435	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	126	113	13	0
chr13	79951683	79951683	C	A	intronic	RBM26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.552768	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	128	114	14	0
chr13	79953085	79953085	A	G	intronic	RBM26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	80095144	80095144	T	C	intronic	NDFIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	35	20	15	0
chr13	80107332	80107332	A	G	intronic	NDFIP2	NaN	NaN	NaN	rs7992646	NaN	0.151558	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	256.151616	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	131	31	100	17
chr13	80113947	80113947	A	T	intronic	NDFIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr13	80910786	80910786	C	A	UTR3	SPRY2	NM_005842:c.*107G>T	NaN	NaN	rs4728	NaN	0.598842	1	T	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.010	T	0.000	T	.	1.154	9.701	5.73	1.010	1.212	13.199	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	63	47	16	53
chr13	80915403	80915403	G	T	upstream	SPRY2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr13	83397236	83397236	C	G	intergenic	LINC00564,SLITRK1	dist=1596118;dist=1054104	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr13	83397237	83397237	C	A	intergenic	LINC00564,SLITRK1	dist=1596119;dist=1054103	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr13	84453532	84453532	C	T	UTR3	SLITRK1	NM_052910:c.*20G>A,NM_001281503:c.*20G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.081801	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	604	572	32	0
chr13	84455668	84455668	A	A	UTR5	SLITRK1	NM_052910:c.-26T>T,NM_001281503:c.-26T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr13	85785705	85785705	T	C	intergenic	LINC00375,LINC00351	dist=63513;dist=152033	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	88328238	88328238	T	C	exonic	SLITRK5	NaN	nonsynonymous SNV	SLITRK5:NM_015567:exon2:c.T595C:p.F199L	NaN	NaN	NaN	.	.	0.645	P	0.297	B	0.000	D	1.000	D	-1.07	N	1.25	T	-0.989	T	0.036	T	0.578	2.437	14.11	5.88	2.257	4.087	14.251	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.406158	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	234	228	6	0
chr13	92101309	92101309	A	A	intronic	GPC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr13	93051781	93051781	T	A	intronic	GPC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	93051784	93051784	C	A	intronic	GPC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	95034749	95034749	G	A	exonic	GPC6	NaN	nonsynonymous SNV	GPC6:NM_005708:exon7:c.G1234A:p.V412M	rs1535692	ID=COSM1239009;OCCURENCE=1(oesophagus)	0.170927	0.68	T	0.112	B	0.064	B	0.004	N	0.684	P	-0.49	N	0.76	T	-1.019	T	0.000	T	0.099	-0.412	2.075	3.97	0.734	5.119	10.440	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	120	97	23	21
chr13	95034858	95034858	A	A	intronic	GPC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	95092115	95092115	T	T	UTR3	DCT	NM_001129889:c.*37A>A,NM_001922:c.*37A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	95229598	95229598	T	C	intronic	TGDS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	4	4	0
chr13	95248257	95248257	T	A	UTR5	TGDS	NM_001304430:c.-2106A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr13	95254382	95254382	A	G	intronic	GPR180	NaN	NaN	NaN	rs9556404	NaN	0.629593	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.976731	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	19
chr13	95279247	95279247	T	C	intronic	GPR180	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr13	95359959	95359959	A	A	ncRNA_exonic	LOC101927248	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	95364337	95364337	T	G	UTR5	SOX21	NM_007084:c.-34A>C	NaN	NaN	rs2253604	NaN	0.775559	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	41.279503	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	7	17	53
chr13	95673776	95673776	T	T	UTR3	ABCC4	NM_001301829:c.*53A>A,NM_005845:c.*53A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr13	95714858	95714858	A	C	intronic	ABCC4	NaN	NaN	NaN	rs1751033	NaN	0.813498	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	43	6	37	25
chr13	95714891	95714891	G	C	intronic	ABCC4	NaN	NaN	NaN	rs1729747	NaN	0.794329	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	536.836	0	NaN	NA	NA	122	43	79	30
chr13	95730702	95730702	T	G	intronic	ABCC4	NaN	NaN	NaN	rs1751048	NaN	0.806709	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	19	7	11	0
chr13	95730703	95730703	G	T	intronic	ABCC4	NaN	NaN	NaN	rs1617888	NaN	0.806709	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	19	8	11	0
chr13	95735437	95735437	A	T	exonic	ABCC4	NaN	stopgain	ABCC4:NM_001301829:exon20:c.T2502A:p.Y834X,ABCC4:NM_005845:exon21:c.T2643A:p.Y881X	NaN	NaN	NaN	0.62	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	7.852	39	-0.379	0.069	1.111	10.180	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.804232	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	114	106	8	0
chr13	95735438	95735438	T	A	exonic	ABCC4	NaN	nonsynonymous SNV	ABCC4:NM_001301829:exon20:c.A2501T:p.Y834F,ABCC4:NM_005845:exon21:c.A2642T:p.Y881F	NaN	NaN	NaN	1	T	0.584	P	0.439	B	0.000	D	1.000	D	1.72	L	-2.55	D	-0.132	T	0.583	D	0.538	1.280	10.18	4.09	0.919	5.795	11.523	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.466145	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	136	126	10	0
chr13	95815775	95815775	T	T	intronic	ABCC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr13	95816735	95816735	C	T	exonic	ABCC4	NaN	nonsynonymous SNV	ABCC4:NM_001301830:exon15:c.G1847A:p.R616H,ABCC4:NM_001105515:exon16:c.G2072A:p.R691H,ABCC4:NM_005845:exon16:c.G2072A:p.R691H	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.591	P	0.131	B	0.000	D	1.000	D	3.485	M	-2.89	D	0.707	D	0.779	D	0.649	2.058	12.84	4.73	2.653	4.774	14.994	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.767213	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	84	80	4	0
chr13	96086354	96086354	A	G	intronic	CLDN10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	17	5	12	0
chr13	96205080	96205080	C	A	exonic	CLDN10	NaN	nonsynonymous SNV	CLDN10:NM_006984:exon1:c.C73A:p.L25M	NaN	NaN	NaN	0.22	T	0.139	B	0.125	B	0.012	N	1.000	D	1.845	L	-2.57	D	-0.541	T	0.527	D	0.383	1.340	10.40	-0.004	-0.609	0.285	5.147	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.900672	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	142	136	6	0
chr13	96234615	96234615	A	C	intronic	DZIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr13	96242045	96242045	T	T	intronic	DZIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr13	96264434	96264434	G	A	intronic	DZIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.038976	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	15	11	4	0
chr13	96264435	96264435	A	G	intronic	DZIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1672514619883056	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr13	96439348	96439348	G	G	exonic	DNAJC3	NaN	synonymous SNV	DNAJC3:NM_006260:exon11:c.G1296G:p.K432K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	67	56	0	0
chr13	96485314	96485314	G	T	intronic	UGGT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.866404	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	207	195	12	0
chr13	96505952	96505952	T	C	intronic	UGGT2	NaN	NaN	NaN	rs3099360	NaN	0.351238	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	108	57	51	19
chr13	96506664	96506664	A	G	exonic	UGGT2	NaN	synonymous SNV	UGGT2:NM_020121:exon35:c.T4074C:p.T1358T	rs11070154	ID=COSM1128340;OCCURENCE=1(prostate)	0.329073	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	72	63	9	33
chr13	96513027	96513027	A	T	intronic	UGGT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	53	41	12	0
chr13	96513187	96513187	T	C	intronic	UGGT2	NaN	NaN	NaN	rs34859372	NaN	0.260982	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	176.761	68	56.003861	normal_lod	REJECT	19	1	18	8
chr13	96540141	96540141	T	C	intronic	UGGT2	NaN	NaN	NaN	rs9525075	NaN	0.965455	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.454481	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	3
chr13	96540204	96540204	T	T	exonic	UGGT2	NaN	synonymous SNV	UGGT2:NM_020121:exon26:c.A2980A:p.M994M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	41	35	0	0
chr13	96543120	96543120	A	G	exonic	UGGT2	NaN	nonsynonymous SNV	UGGT2:NM_020121:exon25:c.T2954C:p.L985S	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.49	M	1.2	T	-0.188	T	0.318	T	0.976	3.496	17.87	5.46	2.202	8.648	15.841	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.719093	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	58	55	3	0
chr13	96555149	96555149	C	T	exonic	UGGT2	NaN	nonsynonymous SNV	UGGT2:NM_020121:exon21:c.G2461A:p.A821T	rs33949518	NaN	0.115016	0.53	T	0.049	B	0.027	B	0.031	N	0.008	P	2.33	M	3.07	T	-1.003	T	0.000	T	0.076	2.082	12.92	4.81	1.384	2.713	12.307	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	276	212	64	18
chr13	96599271	96599271	C	T	intronic	UGGT2	NaN	NaN	NaN	rs7986005	NaN	0.365615	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	87	75	12	18
chr13	96599445	96599445	C	T	intronic	UGGT2	NaN	NaN	NaN	rs9556513	NaN	0.363618	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.110394	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	74	57	17	37
chr13	96622223	96622223	T	T	intronic	UGGT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr13	96648444	96648444	A	G	intronic	UGGT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.909642	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	53	41	12	0
chr13	96648445	96648445	G	A	intronic	UGGT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.212775	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	53	43	10	0
chr13	96676054	96676054	A	A	intronic	UGGT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr13	96684240	96684240	G	A	intronic	UGGT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.13466	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	34	31	3	0
chr13	98009832	98009832	T	G	exonic	MBNL2	NaN	nonsynonymous SNV	MBNL2:NM_144778:exon6:c.T901G:p.Y301D,MBNL2:NM_207304:exon6:c.T901G:p.Y301D	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.99	D	0.956	D	0.000	D	1.000	D	2.51	M	1.19	T	-0.254	T	0.363	T	0.825	3.439	17.64	5.86	2.241	8.040	16.253	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.3396	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	148	143	5	0
chr13	98452727	98452727	G	A	intergenic	RAP2A,IPO5	dist=332475;dist=153202	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr13	98654683	98654683	T	C	intronic	IPO5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.309882	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	182	175	7	0
chr13	98658358	98658358	G	A	intronic	IPO5	NaN	NaN	NaN	rs633161	NaN	0.639776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	411	331	80	44
chr13	98658594	98658594	A	G	exonic	IPO5	NaN	nonsynonymous SNV	IPO5:NM_002271:exon17:c.A1762G:p.K588E	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.291	B	0.2	B	0.000	D	1.000	D	2.23	M	-0.29	T	-0.453	T	0.307	T	0.769	3.494	17.87	5.1	2.042	7.151	15.168	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr13	98669233	98669233	A	A	intronic	IPO5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr13	98671076	98671076	A	A	intronic	IPO5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr13	98896776	98896776	C	T	exonic	FARP1	NaN	nonsynonymous SNV	FARP1:NM_001001715:exon3:c.C203T:p.T68I	rs7318267	NaN	0.376997	0	D	0.001	B	0.001	B	.	.	1.000	P	0	N	0.65	T	-0.947	T	0.000	T	0.012	1.160	9.722	-0.857	-0.241	0.015	0.567	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	195	38	157	45
chr13	99045874	99045874	T	A	intronic	FARP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.462727	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	48	39	9	0
chr13	99047566	99047566	T	G	exonic	FARP1	NaN	nonsynonymous SNV	FARP1:NM_001286839:exon13:c.T1250G:p.V417G,FARP1:NM_005766:exon13:c.T1250G:p.V417G	NaN	NaN	NaN	0.5	T	0.02	B	0.009	B	0.000	N	1.000	N	0	N	-1.1	T	-0.852	T	0.213	T	0.13	1.773	11.89	-8.81	-2.043	-0.985	9.497	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.736927	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	8	5	3	0
chr13	99069246	99069246	A	G	intronic	FARP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr13	99069248	99069248	G	A	intronic	FARP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr13	99076965	99076965	A	G	intronic	FARP1	NaN	NaN	NaN	rs7984394	NaN	0.391573	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	84	NaN	NA	NA	181	149	32	21
chr13	99076980	99076980	A	C	intronic	FARP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	99087771	99087771	T	T	intronic	FARP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr13	99091317	99091317	T	G	intronic	FARP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr13	99091319	99091319	T	C	intronic	FARP1	NaN	NaN	NaN	rs373899086	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr13	99100547	99100547	T	C	exonic	FARP1	NaN	synonymous SNV	FARP1:NM_005766:exon27:c.T3114C:p.S1038S,FARP1:NM_001286839:exon28:c.T3207C:p.S1069S	rs12261	NaN	0.502396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	471	375	96	50
chr13	99112754	99112754	T	G	intronic	STK24	NaN	NaN	NaN	rs4772083	NaN	0.648163	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	163.976363	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	58	2	56	0
chr13	99134585	99134585	A	C	intronic	STK24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.733775	nearby_gap_events	REJECT	63	56	7	0
chr13	99134623	99134623	A	T	intronic	STK24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.029953515258201866	NA	0	0	NaN	NA	NA	44	35	9	0
chr13	99134674	99134674	G	C	intronic	STK24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	2	0
chr13	99181600	99181600	C	T	intronic	STK24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr13	99181601	99181601	C	G	intronic	STK24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr13	99191007	99191007	C	A	intronic	STK24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr13	99191010	99191010	G	C	intronic	STK24	NaN	NaN	NaN	rs140605325	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr13	99191016	99191016	C	A	intronic	STK24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr13	99338372	99338372	T	T	intronic	SLC15A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	16	13	0	0
chr13	99364665	99364665	G	A	intronic	SLC15A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	99447005	99447005	T	C	intronic	DOCK9	NaN	NaN	NaN	rs812808	NaN	0.755591	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	95	13	82	56
chr13	99452380	99452380	C	G	intronic	DOCK9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	99459464	99459464	C	A	intronic	DOCK9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	99459466	99459466	C	A	intronic	DOCK9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	99460127	99460127	G	A	intronic	DOCK9	NaN	NaN	NaN	rs61040361	NaN	0.174321	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	89	NaN	NA	NA	113	97	16	10
chr13	99462609	99462609	T	C	intronic	DOCK9	NaN	NaN	NaN	rs1290519	NaN	0.188698	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	57	49	8	10
chr13	99498090	99498090	G	C	intronic	DOCK9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	99520665	99520665	A	A	intronic	DOCK9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr13	99535255	99535255	A	A	intronic	DOCK9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	207	101	0	0
chr13	99536031	99536031	G	A	intronic	DOCK9	NaN	NaN	NaN	rs9517474	NaN	0.678315	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	507.560842	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	167	1	166	56
chr13	99537217	99537217	G	T	intronic	DOCK9	NaN	NaN	NaN	rs2274642	NaN	0.672125	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.686851	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	0	12	42
chr13	99540395	99540395	A	G	intronic	DOCK9	NaN	NaN	NaN	rs1928104	NaN	0.677516	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	71.227	31	NaN	NA	NA	8	1	6	12
chr13	99575466	99575466	T	T	intronic	DOCK9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr13	99890839	99890839	A	T	ncRNA_intronic	MIR548AN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr13	99896012	99896012	T	C	ncRNA_intronic	MIR548AN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.136921		KEEP	74	68	6	0
chr13	99907678	99907678	A	G	exonic	GPR18	NaN	nonsynonymous SNV	GPR18:NM_001098200:exon2:c.T449C:p.L150P,GPR18:NM_005292:exon3:c.T449C:p.L150P	NaN	NaN	NaN	.	.	0.983	D	0.844	P	0.000	D	1.000	D	2.71	M	0.88	T	-0.555	T	0.249	T	0.852	4.045	20.8	4.87	1.078	7.106	13.467	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.91548	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	287	280	7	0
chr13	99966291	99966291	A	G	ncRNA_intronic	MIR548AN	NaN	NaN	NaN	rs9517681	NaN	0.214856	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.892983	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	8	16	10
chr13	99970268	99970268	T	C	ncRNA_intronic	MIR548AN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.572795	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	112	105	7	0
chr14	100011342	100011342	G	A	intronic	CCDC85C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	100020292	100020292	C	T	intronic	CCDC85C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	100040336	100040336	T	T	intronic	CCDC85C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	100040339	100040339	T	T	intronic	CCDC85C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	100040340	100040340	C	C	intronic	CCDC85C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	100056595	100056595	C	G	intronic	CCDC85C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	100118768	100118768	G	T	exonic	HHIPL1	NaN	nonsynonymous SNV	HHIPL1:NM_001127258:exon2:c.G463T:p.D155Y,HHIPL1:NM_032425:exon2:c.G463T:p.D155Y	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	2.785	M	1.02	T	-0.320	T	0.311	T	0.967	4.199	21.8	4.98	2.294	8.022	18.271	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.82255	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	127	120	7	0
chr14	100125730	100125730	AC	A,AT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	81.0811	0	NaN	NA	NA	20	4	7	1
chr14	100192641	100192641	G	T	intronic	CYP46A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.302101	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	138	127	11	0
chr14	100192662	100192662	A	C	intronic	CYP46A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	11	6	4	0
chr14	100192665	100192665	C	G	intronic	CYP46A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr14	100192667	100192667	T	C	intronic	CYP46A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	9	4	4	0
chr14	100192668	100192668	C	A	intronic	CYP46A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr14	100192669	100192669	T	G	intronic	CYP46A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	9	4	4	0
chr14	100192671	100192671	C	A	intronic	CYP46A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	9	4	4	0
chr14	100192678	100192678	C	A	intronic	CYP46A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	100192682	100192682	T	G	intronic	CYP46A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	100192683	100192683	C	A	intronic	CYP46A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	100192688	100192688	G	A	intronic	CYP46A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	100341199	100341199	T	A	intronic	EML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	74	59	15	0
chr14	100356804	100356804	C	G	intronic	EML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	23	15	8	0
chr14	100356806	100356806	C	T	intronic	EML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	21	15	6	0
chr14	100363315	100363315	G	T	intronic	EML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.189458	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	73	61	12	3
chr14	100374214	100374214	A	G	intronic	EML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	100375707	100375707	C	T	exonic	EML1	NaN	nonsynonymous SNV	EML1:NM_004434:exon11:c.C1130T:p.A377V,EML1:NM_001008707:exon12:c.C1187T:p.A396V	rs34198557	ID=COSM1371950;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.2502	1	T	0.029	B	0.023	B	0.000	N	0.000	P	0.275	N	5.28	T	-0.917	T	0.000	T	0.223	0.756	8.003	2.37	0.209	2.132	10.438	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	289.745897	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	97	0	97	15
chr14	100376502	100376502	C	T	intronic	EML1	NaN	NaN	NaN	rs10140426	NaN	0.381589	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	50.1425	0	10.071276	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	0
chr14	100386827	100386827	C	T	intronic	EML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	100404099	100404099	T	T	intronic	EML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr14	100405519	100405519	T	C	intronic	EML1	NaN	NaN	NaN	rs150410178	NaN	0.0105831	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	113.587472	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	0	41	4
chr14	100406268	100406268	T	T	intronic	EML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	100603760	100603760	T	T	intronic	EVL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	100604146	100604146	A	A	intronic	EVL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr14	100607360	100607360	T	C	intronic	EVL	NaN	NaN	NaN	rs1951486	NaN	0.428315	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	99.114207	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	0	39	48
chr14	100613438	100613438	A	A	intronic	DEGS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	100741201	100741201	A	C	intronic	YY1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	17	12	5	0
chr14	100770523	100770523	C	A	intronic	SLC25A29	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr14	100789738	100789738	G	A	UTR5	SLC25A47	NM_207117:c.-14G>A	NaN	NaN	rs369679310	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.122698	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	49	45	4	0
chr14	100791821	100791821	A	G	intronic	SLC25A47	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	6	0	5	0
chr14	100792220	100792220	C	T	intronic	SLC25A47	NaN	NaN	NaN	rs7155877	NaN	0.959465	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	282.538525	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	94	0	94	56
chr14	100795261	100795261	T	TC	exonic	SLC25A47	NaN	frameshift substitution	SLC25A47:NM_207117:exon5:c.526_526delinsTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	24.5421	0	NaN	NA	NA	10	4	5	0
chr14	100803682	100803682	T	T	intronic	WARS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	100808944	100808944	A	A	intronic	WARS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	100809721	100809721	T	C	exonic	WARS	NaN	nonsynonymous SNV	WARS:NM_213645:exon7:c.A707G:p.K236R,WARS:NM_213646:exon7:c.A707G:p.K236R,WARS:NM_004184:exon8:c.A830G:p.K277R,WARS:NM_173701:exon8:c.A830G:p.K277R	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.884	P	0.764	P	0.000	D	1.000	D	2.395	M	0.7	T	-0.263	T	0.407	T	0.82	4.778	26.9	6.07	2.330	8.013	16.628	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.819537	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	105	95	10	0
chr14	100809723	100809723	C	T	exonic	WARS	NaN	synonymous SNV	WARS:NM_213645:exon7:c.G705A:p.G235G,WARS:NM_213646:exon7:c.G705A:p.G235G,WARS:NM_004184:exon8:c.G828A:p.G276G,WARS:NM_173701:exon8:c.G828A:p.G276G	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	-1.0	T	-0.671	T	0.305	T	.	2.479	14.25	2.86	0.871	-0.121	3.822	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.179388	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	95	85	10	0
chr14	100847427	100847427	G	A	exonic	WDR25	NaN	nonsynonymous SNV	WDR25:NM_001161476:exon2:c.G166A:p.D56N,WDR25:NM_024515:exon2:c.G166A:p.D56N	NaN	NaN	NaN	0.44	T	0.005	B	0.007	B	0.086	N	1.000	N	1.5	L	2.02	T	-0.993	T	0.197	T	0.045	1.307	10.28	3.44	1.222	0.774	7.005	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.214907	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	63	60	3	0
chr14	100848139	100848139	A	A	intronic	WDR25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	100903413	100903413	G	G	intronic	WDR25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	100995316	100995316	T	T	intronic	WDR25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	100995424	100995424	G	A	exonic	WDR25	NaN	nonsynonymous SNV	WDR25:NM_001161476:exon6:c.G1292A:p.S431N,WDR25:NM_024515:exon6:c.G1292A:p.S431N	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.991	D	0.000	U	1.000	D	1.78	L	1.28	T	-0.726	T	0.189	T	0.346	4.099	21.1	3.64	2.033	8.956	14.575	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.912621	nearby_gap_events	REJECT	75	68	7	0
chr14	100995684	100995684	A	A	intronic	WDR25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr14	101011170	101011170	T	T	intronic	BEGAIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr14	101011282	101011282	T	T	intronic	BEGAIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	148	116	0	0
chr14	101011283	101011283	C	C	intronic	BEGAIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	67	NaN	NA	NA	96	76	0	0
chr14	101052730	101052730	C	T	intergenic	BEGAIN,LINC00523	dist=16599;dist=70875	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	101176335	101176335	G	C	intergenic	LINC00523,DLK1	dist=37254;dist=16867	NaN	NaN	rs12881760	NaN	0.264177	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	101195419	101195419	T	A	intronic	DLK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1.638	11.43	-0.84	-0.111	-1.138	2.722	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	24.2786	27	NaN	NA	NA	18	12	6	14
chr14	101200646	101200646	G	C	exonic	DLK1	NaN	nonsynonymous SNV	DLK1:NM_003836:exon5:c.G565C:p.G189R	NaN	NaN	NaN	0.13	T	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	1.795	L	-3.06	D	0.778	D	0.834	D	0.725	2.658	14.85	4.58	2.086	7.594	16.373	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.081715	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	153	136	17	0
chr14	101255172	101255172	A	G	intergenic	DLK1,MIR2392	dist=53705;dist=25656	NaN	NaN	rs73347525	NaN	0.228435	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	101276803	101276803	A	A	intergenic	DLK1,MIR2392	dist=75336;dist=4025	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	101301833	101301833	C	A	ncRNA_intronic	MEG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr14	101344749	101344749	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	12	0	6,6	0
chr14	101347107	101347107	C	T	exonic	RTL1	NaN	nonsynonymous SNV	RTL1:NM_001134888:exon1:c.G4019A:p.R1340K	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.231	B	0.055	B	.	.	1.000	N	0.345	N	1.49	T	-1.039	T	0.039	T	0.149	1.844	12.13	2.22	0.886	-0.102	6.227	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.0584	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	145	131	14	0
chr14	101347108	101347108	T	C	exonic	RTL1	NaN	nonsynonymous SNV	RTL1:NM_001134888:exon1:c.A4018G:p.R1340G	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.001	B	0.001	B	.	.	1.000	N	0.345	N	1.37	T	-1.015	T	0.041	T	0.127	1.297	10.25	-6.22	-1.518	-1.214	5.835	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.368086	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	146	132	14	0
chr14	101347111	101347111	G	C	exonic	RTL1	NaN	nonsynonymous SNV	RTL1:NM_001134888:exon1:c.C4015G:p.P1339A	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.02	B	0.009	B	.	.	1.000	N	0.205	N	2.12	T	-1.000	T	0.025	T	0.119	0.052	4.282	0.825	0.208	-0.501	3.857	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.018994846051382134	NA	0	0	NaN	NA	NA	67	47	20	0
chr14	101348998	101348998	T	T	exonic	RTL1	NaN	synonymous SNV	RTL1:NM_001134888:exon1:c.A2128A:p.I710I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	31	24	0	0
chr14	101370810	101370810	G	T	ncRNA_intronic	MEG8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	101370811	101370811	A	G	ncRNA_intronic	MEG8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	101532578	101532578	C	A	upstream;downstream	MIR656;MIR369,MIR409,MIR410,MIR412	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	101660987	101660987	G	A	intergenic	MEG9,LINC00524	dist=121714;dist=211337	NaN	NaN	rs928666	NaN	0.51897	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr14	101666887	101666887	T	A	intergenic	MEG9,LINC00524	dist=127614;dist=205437	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr14	101690767	101690767	T	A	intergenic	MEG9,LINC00524	dist=151494;dist=181557	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	101717490	101717490	T	G	intergenic	MEG9,LINC00524	dist=178217;dist=154834	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	101908067	101908067	C	T	intergenic	LINC00524,DIO3OS	dist=33808;dist=110493	NaN	NaN	rs56036339	NaN	0.308906	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr14	102001546	102001546	G	C	intergenic	LINC00524,DIO3OS	dist=127287;dist=17014	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	23	16	7	0
chr14	102359304	102359304	A	G	intronic	PPP2R5C	NaN	NaN	NaN	rs2720220	NaN	0.133387	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	73.234138	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	11	27	12
chr14	102378995	102378995	A	A	intronic	PPP2R5C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr14	102446938	102446938	A	A	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	102449218	102449218	T	T	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr14	102457858	102457858	T	C	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr14	102473315	102473315	T	T	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr14	102481356	102481356	T	T	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr14	102482483	102482483	A	A	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	102483692	102483692	T	C	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.268343	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	561	551	10	0
chr14	102484628	102484628	C	T	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.530257	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	314	307	7	0
chr14	102498573	102498573	A	G	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr14	102498574	102498574	C	G	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr14	102498575	102498575	C	A	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr14	102499919	102499919	A	C	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	102499922	102499922	C	G	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	102499924	102499924	C	T	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	102509119	102509119	A	A	intronic	DYNC1H1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr14	102548389	102548389	T	C	intronic	HSP90AA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.717331	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	293	284	9	0
chr14	102549839	102549839	A	G	intronic	HSP90AA1	NaN	NaN	NaN	rs7155973	NaN	0.933906	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	166.730041	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	0	59	58
chr14	102549881	102549881	A	G	splicing	HSP90AA1	NM_005348:exon9:c.1486+2T>C,NM_001017963:exon10:c.1852+2T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.088	12.94	4.65	1.868	6.096	9.518	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.717896	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	58	55	3	0
chr14	102550803	102550803	G	A	exonic	HSP90AA1	NaN	synonymous SNV	HSP90AA1:NM_005348:exon6:c.C1080T:p.N360N,HSP90AA1:NM_001017963:exon7:c.C1446T:p.N482N	rs4947	NaN	0.684505	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1083.14	0	NaN	NA	NA	80	0	80	43
chr14	102551502	102551502	A	T	intronic	HSP90AA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	28	8	19	0
chr14	102568371	102568371	A	G	exonic	HSP90AA1	NaN	synonymous SNV	HSP90AA1:NM_001017963:exon2:c.T207C:p.H69H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.096479	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	267	260	7	0
chr14	102659911	102659911	A	A	intronic	WDR20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr14	102669840	102669840	T	T	intronic	WDR20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	102669841	102669841	T	T	intronic	WDR20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	102678780	102678780	G	A	intronic	WDR20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.0875	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	56	49	7	0
chr14	102678879	102678879	A	G	exonic	WDR20	NaN	nonsynonymous SNV	WDR20:NM_001242415:exon4:c.A548G:p.Q183R	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.0	B	0.001	B	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-1.035	T	0.115	T	0.113	2.696	14.97	1.92	0.088	1.141	4.035	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.647487	possible_contamination,strand_artifact	REJECT	192	184	8	0
chr14	102802190	102802190	T	C	intronic	ZNF839	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.706769	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	26	23	3	0
chr14	102808531	102808531	G	C	UTR3	ZNF839	NM_001267827:c.*15G>C,NM_001267828:c.*15G>C,NM_018335:c.*15G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	102830409	102830409	A	G	intronic	TECPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr14	102891646	102891646	A	G	intronic	TECPR2	NaN	NaN	NaN	rs4906197	NaN	0.305511	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	85	67	18	9
chr14	102897993	102897993	T	G	intronic	TECPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	102904636	102904636	C	T	intronic	TECPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr14	102904637	102904637	C	C	intronic	TECPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	102909957	102909957	T	T	intronic	TECPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	102915777	102915777	G	C	intronic	TECPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	102915778	102915778	T	A	intronic	TECPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	102915779	102915779	T	G	intronic	TECPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	102915780	102915780	T	C	intronic	TECPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	102915781	102915781	G	T	intronic	TECPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	102915782	102915782	A	G	intronic	TECPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	102918686	102918686	T	C	intronic	TECPR2	NaN	NaN	NaN	rs1190554	NaN	0.730232	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.963475	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	6	8	38
chr14	102964133	102964133	A	G	intronic	TECPR2	NaN	NaN	NaN	rs71417803	NaN	0.0103834	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.735019	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	13	11	4
chr14	103177267	103177267	T	C	intronic	RCOR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	103177280	103177280	A	G	exonic	RCOR1	NaN	nonsynonymous SNV	RCOR1:NM_015156:exon7:c.A788G:p.E263G	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.999	D	0.986	D	0.000	D	1.000	D	1.43	L	.	.	-0.536	T	0.314	T	0.731	3.933	20.1	5.58	2.124	8.440	15.743	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.814994	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	189	181	8	0
chr14	103199351	103199351	C	G	intergenic	RCOR1,TRAF3	dist=2438;dist=44465	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	103355870	103355870	A	G	intronic	TRAF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.492118	nearby_gap_events	REJECT	212	201	11	0
chr14	103390344	103390344	G	C	intronic	AMN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.221389	nearby_gap_events	REJECT	98	91	7	0
chr14	103390345	103390345	C	T	intronic	AMN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.31981	nearby_gap_events	REJECT	98	91	7	0
chr14	103397055	103397055	G	C	UTR3	AMN	NM_030943:c.*38G>C	NaN	NaN	rs1190233	NaN	0.671725	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.492502	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	0	33	46
chr14	103412672	103412672	T	G	intronic	CDC42BPB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	5	3	2	0
chr14	103416254	103416254	A	G	intronic	CDC42BPB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.303536	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	111	105	6	0
chr14	103434530	103434530	T	A	intronic	CDC42BPB	NaN	NaN	NaN	rs2093414	NaN	0.891174	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	17	7	10	5
chr14	103449538	103449538	C	T	intronic	CDC42BPB	NaN	NaN	NaN	rs114320872	NaN	0.0405351	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr14	103566786	103566786	G	A	exonic	EXOC3L4	NaN	nonsynonymous SNV	EXOC3L4:NM_001077594:exon1:c.G230A:p.R77Q	rs61730321	NaN	0.00199681	0.41	T	0.173	B	0.022	B	0.755	N	1.000	N	0.625	N	3.27	T	-0.940	T	0.010	T	0.197	2.579	14.58	2.16	0.854	0.291	6.277	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.962686		KEEP	74	69	5	0
chr14	103569311	103569311	A	T	intronic	EXOC3L4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	103576582	103576582	G	C	UTR3	EXOC3L4	NM_001077594:c.*22G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	42	34	8	0
chr14	103593950	103593950	C	G	exonic	TNFAIP2	NaN	nonsynonymous SNV	TNFAIP2:NM_006291:exon2:c.C844G:p.Q282E	rs1132339	ID=COSM1562733;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.522564	0.05	D	0.978	D	0.571	P	0.002	N	0.000	P	1.995	M	3.31	T	-1.075	T	0.000	T	0.163	2.285	13.60	3.5	0.794	1.263	10.765	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	106.870817	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	0	38	30
chr14	103597565	103597565	G	A	intronic	TNFAIP2	NaN	NaN	NaN	rs749206	NaN	0.743011	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	379.026	0	110.685427	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	3	44	40
chr14	103599249	103599249	T	G	intronic	TNFAIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.416519	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	9	5	4	0
chr14	103601759	103601759	A	A	UTR3	TNFAIP2	NM_006291:c.*62A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	103805034	103805034	T	T	intronic	EIF5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr14	103918343	103918343	T	G	intronic	MARK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.946399	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	168	155	13	0
chr14	103923414	103923414	A	G	intronic	MARK3	NaN	NaN	NaN	rs2273700	NaN	0.208067	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1333.41	0	NaN	NA	NA	172	19	153	25
chr14	103941187	103941187	T	T	intronic	MARK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	104005346	104005346	G	G	intergenic	TRMT61A,BAG5	dist=1936;dist=17535	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	104029378	104029378	C	G	exonic	APOPT1	NaN	nonsynonymous SNV	APOPT1:NM_001302652:exon1:c.C79G:p.P27A,APOPT1:NM_001302653:exon1:c.C79G:p.P27A,APOPT1:NM_001302654:exon1:c.C79G:p.P27A,APOPT1:NM_032374:exon1:c.C79G:p.P27A	rs2274268	NaN	0.234625	1	T	0.0	B	0.001	B	0.056	N	1.000	P	0.205	N	1.59	T	-0.989	T	0.000	T	0.323	1.572	11.21	-1.81	-1.209	-1.041	4.938	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.696145	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	1	8	12
chr14	104038166	104038166	A	A	intronic	APOPT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	104053791	104053791	T	T	intronic	APOPT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	83	54	0	0
chr14	104080626	104080626	G	A	intergenic	APOPT1,KLC1	dist=22116;dist=14899	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	104080627	104080627	T	G	intergenic	APOPT1,KLC1	dist=22117;dist=14898	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	104139570	104139570	G	T	intronic	KLC1	NaN	NaN	NaN	rs11160757	NaN	0.919529	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	161.522	0	NaN	NA	NA	203	0	203	36
chr14	104153612	104153612	A	C	intronic	KLC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	1	0
chr14	104167545	104167545	G	A	UTR3	KLC1	NM_182923:c.*9G>A,NM_001130107:c.*5G>A	NaN	NaN	rs709399	NaN	0.501997	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	194	0	NaN	NA	NA	13	0	13	31
chr14	104167564	104167564	A	G	UTR3	KLC1	NM_182923:c.*28A>G,NM_001130107:c.*24A>G	NaN	NaN	rs861536	NaN	0.215655	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	57.393851	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	0	25	31
chr14	104175106	104175106	A	A	intronic	XRCC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	17	15	0	0
chr14	104193228	104193228	C	A	intronic	ZFYVE21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	7	6	1	0
chr14	104251404	104251404	A	A	intronic	PPP1R13B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr14	104360455	104360455	G	T	intergenic	LINC00637,C14orf2	dist=36069;dist=18170	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	104361244	104361244	C	T	intergenic	LINC00637,C14orf2	dist=36858;dist=17381	NaN	NaN	rs77367887	NaN	0.0974441	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	104387164	104387164	T	C	intronic	C14orf2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr14	104387165	104387165	T	C	intronic	C14orf2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr14	104431814	104431814	A	A	exonic	TDRD9	NaN	synonymous SNV	TDRD9:NM_153046:exon4:c.A565A:p.K189K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	24	21	0	0
chr14	104432859	104432859	C	T	intronic	TDRD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.19782608695652215	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr14	104460525	104460525	T	T	intronic	TDRD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	104471561	104471561	A	G	intronic	TDRD9	NaN	NaN	NaN	rs371923118	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	104473597	104473597	C	A	intronic	TDRD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	104482468	104482468	G	G	intronic	TDRD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr14	104498472	104498472	G	A	intronic	TDRD9	NaN	NaN	NaN	rs4906405	NaN	0.946286	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	100.255	0	NaN	NA	NA	9	0	9	26
chr14	104518453	104518453	A	G	UTR3	TDRD9	NM_153046:c.*34A>G	NaN	NaN	rs7150461	NaN	0.490815	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	245.27	0	NaN	NA	NA	87	51	36	33
chr14	104561998	104561998	T	C	intronic	ASPG	NaN	NaN	NaN	rs1770983	NaN	0.814097	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.995077	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	0	12	38
chr14	104562097	104562097	G	T	intronic	ASPG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.773356	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	23	20	3	0
chr14	104563874	104563874	C	T	intronic	ASPG	NaN	NaN	NaN	rs7156718	NaN	0.479233	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	562.123	0	NaN	NA	NA	54	0	54	45
chr14	104615325	104615325	C	C	intronic	KIF26A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	104638188	104638188	C	G	exonic	KIF26A	NaN	synonymous SNV	KIF26A:NM_015656:exon6:c.C1242G:p.G414G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.923646	nearby_gap_events	REJECT	50	44	6	0
chr14	104638356	104638356	T	C	intronic	KIF26A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.833984	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	11	8	3	0
chr14	104641040	104641040	G	C	intronic	KIF26A	NaN	NaN	NaN	rs7148484	NaN	0.130791	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	104643167	104643167	C	G	exonic	KIF26A	NaN	nonsynonymous SNV	KIF26A:NM_015656:exon12:c.C4042G:p.P1348A	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.278	B	0.057	B	.	.	0.996	N	1.935	M	-1.16	T	-0.683	T	0.343	T	0.089	1.424	10.70	1.99	0.291	2.144	9.631	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.654453	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	50	45	5	0
chr14	104643169	104643169	C	T	exonic	KIF26A	NaN	synonymous SNV	KIF26A:NM_015656:exon12:c.C4044T:p.P1348P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.647763	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	36	30	6	0
chr14	104643721	104643721	C	A	exonic	KIF26A	NaN	synonymous SNV	KIF26A:NM_015656:exon12:c.C4596A:p.A1532A	rs2487301	NaN	0.458866	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	102.722791	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	63	24	39	28
chr14	104643859	104643859	A	G	exonic	KIF26A	NaN	synonymous SNV	KIF26A:NM_015656:exon12:c.A4734G:p.R1578R	rs2487300	NaN	0.494409	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	46.567279	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	6	17	32
chr14	104644412	104644412	G	C	intronic	KIF26A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	104654479	104654479	A	A	intergenic	KIF26A,C14orf180	dist=7244;dist=391542	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	104665680	104665680	A	A	intergenic	KIF26A,C14orf180	dist=18445;dist=380341	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	104668317	104668317	C	C	intergenic	KIF26A,C14orf180	dist=21082;dist=377704	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	104704368	104704368	C	A	intergenic	KIF26A,C14orf180	dist=57133;dist=341653	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr14	104751430	104751430	C	T	intergenic	KIF26A,C14orf180	dist=104195;dist=294591	NaN	NaN	rs7154167	NaN	0.527157	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr14	104751433	104751433	A	G	intergenic	KIF26A,C14orf180	dist=104198;dist=294588	NaN	NaN	rs72704061	NaN	0.174121	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr14	104757527	104757527	G	A	intergenic	KIF26A,C14orf180	dist=110292;dist=288494	NaN	NaN	rs11622285	NaN	0.0317492	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr14	104788069	104788069	C	T	intergenic	KIF26A,C14orf180	dist=140834;dist=257952	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	104862543	104862543	C	T	intergenic	KIF26A,C14orf180	dist=215308;dist=183478	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr14	105054766	105054766	A	G	intronic	C14orf180	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	15	7	8	0
chr14	105070765	105070765	C	G	intronic	TMEM179	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.503	0	NaN	NA	NA	8	6	2	1
chr14	105160987	105160987	C	T	intronic	INF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	12	3	9	0
chr14	105160989	105160989	A	C	intronic	INF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	12	2	9	0
chr14	105173455	105173455	G	G	intronic	INF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	36	30	0	0
chr14	105173807	105173807	G	T	exonic	INF2	NaN	nonsynonymous SNV	INF2:NM_001031714:exon8:c.G1203T:p.Q401H,INF2:NM_022489:exon8:c.G1203T:p.Q401H	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.994	D	0.808	P	.	.	1.000	N	1.245	L	-1.38	T	-0.623	T	0.425	T	0.246	2.211	13.35	1.39	0.645	-0.095	3.291	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.77879	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	10	7	3	0
chr14	105173808	105173808	A	C	exonic	INF2	NaN	nonsynonymous SNV	INF2:NM_001031714:exon8:c.A1204C:p.S402R,INF2:NM_022489:exon8:c.A1204C:p.S402R	NaN	NaN	NaN	0.55	T	0.021	B	0.006	B	.	.	1.000	N	1.445	L	-1.36	T	-0.911	T	0.286	T	0.12	1.791	11.95	-0.989	-0.435	0.351	3.691	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.178799	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	10	7	3	0
chr14	105174618	105174618	T	T	intronic	INF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	77	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr14	105174722	105174722	G	A	intronic	INF2	NaN	NaN	NaN	rs117034570	NaN	0.0463259	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	357.126	0	NaN	NA	NA	161	76	76	5
chr14	105174731	105174731	C	G	intronic	INF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.578638	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	158	142	16	0
chr14	105175085	105175085	A	G	intronic	INF2	NaN	NaN	NaN	rs11850821	NaN	0.205671	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	63.0052	0	25.759894	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	9	11	5
chr14	105175751	105175751	A	A	intronic	INF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	105176522	105176522	G	T	exonic	INF2	NaN	stopgain	INF2:NM_001031714:exon13:c.G2236T:p.E746X,INF2:NM_022489:exon13:c.G2236T:p.E746X	NaN	NaN	NaN	0.16	T	.	.	.	.	0.113	N	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.847	19.54	-2.97	-0.496	0.162	6.204	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	38.5456	44	NaN	NA	NA	7	1	5	0
chr14	105178089	105178089	T	C	intronic	INF2	NaN	NaN	NaN	rs4983531	NaN	0.695088	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	7	1	30
chr14	105178098	105178098	G	C	intronic	INF2	NaN	NaN	NaN	rs4983532	NaN	0.694489	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	8	7	1	31
chr14	105179673	105179673	G	A	intronic	INF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.097694	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	112	94	18	0
chr14	105209387	105209387	T	T	intronic	ADSSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr14	105219467	105219467	A	G	upstream	SIVA1	NaN	NaN	NaN	rs3809453	NaN	0.639976	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.03517837855265928	NA	0	0	25.095663	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	12	10	34
chr14	105222037	105222037	C	T	exonic	SIVA1	NaN	synonymous SNV	SIVA1:NM_006427:exon2:c.C189T:p.A63A	rs1132975	NaN	0.433307	.	.	.	.	.	.	.	.	0.999	P	.	.	.	.	-0.919	T	0.000	T	.	0.870	8.528	0.002	-0.046	-0.220	8.012	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.449796	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	2	4	34
chr14	105242278	105242278	A	A	intronic	AKT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr14	105243220	105243220	G	A	intronic	AKT1	NaN	NaN	NaN	rs2498796	NaN	0.436502	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	104	36	68	38
chr14	105243276	105243276	G	G	intronic	AKT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	45	44	0	0
chr14	105243277	105243277	C	C	intronic	AKT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	45	44	0	0
chr14	105248200	105248200	T	C	intronic	AKT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	105271780	105271780	G	T	downstream	ZBTB42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	105271781	105271781	C	G	downstream	ZBTB42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	105337803	105337803	C	T	intronic	CEP170B	NaN	NaN	NaN	rs28427389	NaN	0.490415	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	105339062	105339062	C	C	intronic	CEP170B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr14	105342503	105342503	T	T	intronic	CEP170B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	22	18	0	0
chr14	105344872	105344872	C	T	intronic	CEP170B	NaN	NaN	NaN	rs61995998	NaN	0.267173	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.96445	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	14	27	32
chr14	105347488	105347488	C	T	intronic	CEP170B	NaN	NaN	NaN	rs2582558	NaN	0.442692	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr14	105350178	105350178	C	T	exonic	CEP170B	NaN	synonymous SNV	CEP170B:NM_015005:exon8:c.C852T:p.H284H,CEP170B:NM_001112726:exon9:c.C1062T:p.H354H	rs45449696	NaN	0.219649	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	206.488424	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	171	83	88	43
chr14	105350356	105350356	C	G	exonic	CEP170B	NaN	nonsynonymous SNV	CEP170B:NM_015005:exon8:c.C1030G:p.P344A,CEP170B:NM_001112726:exon9:c.C1240G:p.P414A	NaN	NaN	NaN	0.06	T	1.0	D	0.994	D	0.009	N	0.993	D	1.555	L	1.95	T	-0.979	T	0.115	T	0.343	3.608	18.36	4.25	1.901	2.905	16.643	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.23314	0	NaN	NA	NA	30	27	3	0
chr14	105350544	105350544	G	T	exonic	CEP170B	NaN	synonymous SNV	CEP170B:NM_015005:exon8:c.G1218T:p.L406L,CEP170B:NM_001112726:exon9:c.G1428T:p.L476L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	105352493	105352493	A	G	intronic	CEP170B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.765607	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	26	21	5	1
chr14	105354293	105354293	A	G	exonic	CEP170B	NaN	synonymous SNV	CEP170B:NM_015005:exon11:c.A3507G:p.S1169S,CEP170B:NM_001112726:exon12:c.A3717G:p.S1239S	rs2582548	ID=COSM1128319,COSM1128321;OCCURENCE=1(prostate)	0.563698	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	55.784238	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	103	69	34	55
chr14	105354303	105354303	C	G	exonic	CEP170B	NaN	nonsynonymous SNV	CEP170B:NM_015005:exon11:c.C3517G:p.R1173G,CEP170B:NM_001112726:exon12:c.C3727G:p.R1243G	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.999	D	0.994	D	0.016	U	1.000	N	1.79	L	0.89	T	-0.918	T	0.184	T	0.476	1.259	10.11	1.27	0.429	2.703	10.619	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.892632	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	95	86	9	0
chr14	105360746	105360746	T	C	intronic	CEP170B	NaN	NaN	NaN	rs2841244	ID=COSN164799;OCCURENCE=1(NS)	0.605032	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.006449076083765459	NA	0	54	NaN	NA	NA	30	15	15	55
chr14	105361036	105361036	C	T	intronic	CEP170B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.050008	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	243	229	14	0
chr14	105361473	105361473	A	A	UTR3	CEP170B	NM_015005:c.*178A>A,NM_001112726:c.*178A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	105394217	105394217	T	T	intronic	PLD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	86	77	0	0
chr14	105395130	105395130	C	T	exonic	PLD4	NaN	nonsynonymous SNV	PLD4:NM_138790:exon4:c.C329T:p.A110V	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.001	B	0.005	B	0.592	N	1.000	N	0.955	L	1.93	T	-1.063	T	0.051	T	0.158	1.067	9.359	4.23	2.073	-0.804	13.964	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.826504	nearby_gap_events	REJECT	149	142	7	0
chr14	105405589	105405589	C	G	exonic	AHNAK2	NaN	nonsynonymous SNV	AHNAK2:NM_138420:exon7:c.G16199C:p.S5400T	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.991	D	0.736	P	0.471	U	1.000	N	1.04	L	5.99	T	-0.952	T	0.015	T	0.109	3.514	17.95	3.36	1.390	0.492	6.030	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.941249	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	238	222	16	0
chr14	105405590	105405590	T	C	exonic	AHNAK2	NaN	nonsynonymous SNV	AHNAK2:NM_138420:exon7:c.A16198G:p.S5400G	NaN	NaN	NaN	0.39	T	0.024	B	0.03	B	0.471	N	1.000	N	1.04	L	5.97	T	-0.929	T	0.008	T	0.146	1.608	11.33	-3.37	-0.785	0.025	5.735	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.405805	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	240	225	15	0
chr14	105405591	105405591	G	T	exonic	AHNAK2	NaN	synonymous SNV	AHNAK2:NM_138420:exon7:c.C16197A:p.P5399P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.356429	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	230	215	15	0
chr14	105408435	105408435	C	T	exonic	AHNAK2	NaN	synonymous SNV	AHNAK2:NM_138420:exon7:c.G13353A:p.L4451L	NaN	NaN	0.000798722	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.191221	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	369	362	7	0
chr14	105410293	105410293	T	A	exonic	AHNAK2	NaN	nonsynonymous SNV	AHNAK2:NM_138420:exon7:c.A11495T:p.K3832M	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.958	D	.	.	1.000	N	3.45	M	4.21	T	-1.108	T	0.041	T	0.262	2.491	14.29	0.726	-0.140	1.716	8.219	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	2.3894028908331955E-31	Somatic	183.487	47	289.872687	nearby_gap_events	REJECT	642	498	144	0
chr14	105410745	105410745	C	G	exonic	AHNAK2	NaN	synonymous SNV	AHNAK2:NM_138420:exon7:c.G11043C:p.L3681L	rs375945458	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.217538	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	206	189	17	9
chr14	105411948	105411948	G	A	exonic	AHNAK2	NaN	synonymous SNV	AHNAK2:NM_138420:exon7:c.C9840T:p.A3280A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.171	0	NaN	NA	NA	91	78	13	1
chr14	105415346	105415346	T	C	exonic	AHNAK2	NaN	nonsynonymous SNV	AHNAK2:NM_138420:exon7:c.A6442G:p.T2148A	rs141736470	NaN	0.123802	1	T	0.0	B	0.009	B	.	.	1.000	P	-0.475	N	5.61	T	-0.950	T	0.000	T	0.018	-1.099	0.144	-7.07	-2.608	0.000	3.509	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	28.0563	0	NaN	NA	NA	121	97	23	13
chr14	105417774	105417774	G	A	exonic	AHNAK2	NaN	synonymous SNV	AHNAK2:NM_138420:exon7:c.C4014T:p.F1338F	rs2013228	NaN	0.390575	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.3835	0	NaN	NA	NA	28	24	5	7
chr14	105417882	105417882	T	T	exonic	AHNAK2	NaN	synonymous SNV	AHNAK2:NM_138420:exon7:c.A3906A:p.G1302G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	15	14	0	0
chr14	105417894	105417894	C	G	exonic	AHNAK2	NaN	nonsynonymous SNV	AHNAK2:NM_138420:exon7:c.G3894C:p.M1298I	rs2819440	NaN	0.783546	0.33	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	-2.01	N	6.26	T	-1.008	T	0.000	T	0.069	-1.049	0.196	-0.191	-0.810	-0.516	3.772	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	68.184217	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	79	43	36	37
chr14	105418665	105418665	C	G	exonic	AHNAK2	NaN	synonymous SNV	AHNAK2:NM_138420:exon7:c.G3123C:p.L1041L	NaN	NaN	0.00139776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.421182	nearby_gap_events	REJECT	90	84	6	0
chr14	105419653	105419653	A	G	exonic	AHNAK2	NaN	nonsynonymous SNV	AHNAK2:NM_138420:exon7:c.T2135C:p.L712P	rs141485097	NaN	0.00938498	0.89	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	N	-3.395	N	7.12	T	-0.970	T	0.000	T	0.111	0.733	7.894	1.84	0.170	1.028	7.467	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.978107	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	66	59	7	0
chr14	105453020	105453020	T	T	exonic	C14orf79	NaN	synonymous SNV	C14orf79:NM_174891:exon1:c.T252T:p.F84F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	43	37	0	0
chr14	105474538	105474538	C	A	intergenic	C14orf79,CDCA4	dist=12683;dist=1372	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	105474539	105474539	C	G	intergenic	C14orf79,CDCA4	dist=12684;dist=1371	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	105474540	105474540	C	A	intergenic	C14orf79,CDCA4	dist=12685;dist=1370	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	105478102	105478102	G	A	exonic	CDCA4	NaN	synonymous SNV	CDCA4:NM_017955:exon2:c.C165T:p.N55N,CDCA4:NM_145701:exon2:c.C165T:p.N55N	rs3803294	NaN	0.41893	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	83.03621	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	81	44	37	46
chr14	105478337	105478337	A	G	intronic	CDCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	105517705	105517705	G	T	exonic	GPR132	NaN	nonsynonymous SNV	GPR132:NM_001278696:exon2:c.C205A:p.P69T,GPR132:NM_001278695:exon3:c.C742A:p.P248T,GPR132:NM_013345:exon4:c.C769A:p.P257T,GPR132:NM_001278694:exon5:c.C769A:p.P257T	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.545	H	-1.35	T	0.790	D	0.765	D	0.9	3.661	18.61	4.98	2.300	9.583	17.245	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.214438	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	260	251	9	0
chr14	105603636	105603636	C	G	intergenic	LOC102723354,JAG2	dist=37803;dist=3682	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	13	9	4	0
chr14	105612417	105612417	A	A	intronic	JAG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr14	105613875	105613875	A	A	intronic	JAG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	105615825	105615825	C	A	intronic	JAG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	92.5805	0	NaN	NA	NA	14	2	12	1
chr14	105621859	105621859	A	G	intronic	JAG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	52	50	2	0
chr14	105622386	105622386	A	G	intronic	JAG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	105646398	105646398	T	G	intronic	NUDT14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	105677669	105677669	A	G	intronic	BRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	12	1	11	0
chr14	105678575	105678575	A	A	intronic	BRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	105683997	105683997	G	G	exonic	BRF1	NaN	synonymous SNV	BRF1:NM_001242789:exon10:c.C942C:p.G314G,BRF1:NM_145685:exon11:c.C1044C:p.G348G,BRF1:NM_001242788:exon14:c.C1575C:p.G525G,BRF1:NM_001242786:exon15:c.C1377C:p.G459G,BRF1:NM_001242787:exon15:c.C1311C:p.G437G,BRF1:NM_001519:exon15:c.C1656C:p.G552G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	76	61	0	0
chr14	105685432	105685432	G	C	intronic	BRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr14	105688057	105688057	G	A	exonic	BRF1	NaN	nonsynonymous SNV	BRF1:NM_001242789:exon6:c.C529T:p.L177F,BRF1:NM_145685:exon7:c.C631T:p.L211F,BRF1:NM_001242788:exon10:c.C1162T:p.L388F,BRF1:NM_001242786:exon11:c.C898T:p.L300F,BRF1:NM_001242787:exon11:c.C898T:p.L300F,BRF1:NM_001519:exon11:c.C1243T:p.L415F	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.981	D	0.929	D	0.001	D	1.000	D	2.19	M	.	.	-0.701	T	0.282	T	0.332	2.350	13.82	1.77	0.142	1.896	6.406	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.897944	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	109	99	10	0
chr14	105707830	105707830	G	T	intronic	BRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.428126	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	35	29	6	0
chr14	105791848	105791848	G	C	intronic	PACS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr14	105849321	105849321	A	A	intronic	PACS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	105849722	105849722	C	A	exonic	PACS2	NaN	nonsynonymous SNV	PACS2:NM_001100913:exon16:c.C1652A:p.T551N,PACS2:NM_001243127:exon16:c.C1415A:p.T472N,PACS2:NM_015197:exon16:c.C1640A:p.T547N	NaN	NaN	NaN	0.58	T	0.0	B	0.006	B	0.009	N	0.951	N	-0.345	N	0.95	T	-1.022	T	0.037	T	0.041	0.572	7.089	1.85	0.853	1.441	6.087	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.02862846814893349	NA	0	0	NaN	NA	NA	31	20	11	0
chr14	105878194	105878194	GTCTT	G,GCCAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	301.66	0	NaN	NA	NA	179	85	64	0
chr14	105905126	105905126	C	T	intronic	MTA1	NaN	NaN	NaN	rs4983620	NaN	0.924121	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	247.25	0	71.682688	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	0	26	11
chr14	105930665	105930665	G	A	intronic	MTA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.825264	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr14	105930923	105930923	G	A	intronic	MTA1	NaN	NaN	NaN	rs11845995	NaN	0.700879	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	61.042327	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	0	23	57
chr14	105931585	105931585	A	G	intronic	MTA1	NaN	NaN	NaN	rs4983339	NaN	0.934305	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	125.250654	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	0	43	58
chr14	105944789	105944789	T	G	exonic	CRIP2	NaN	nonsynonymous SNV	CRIP2:NM_001270837:exon3:c.T363G:p.H121Q,CRIP2:NM_001312:exon3:c.T141G:p.H47Q	NaN	NaN	NaN	0	D	0.636	P	0.182	B	0.000	U	1.000	D	2.535	M	-3.16	D	-0.596	T	0.288	T	0.274	3.388	17.43	-3.41	-0.683	-5.220	7.358	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	40	14.207719	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	6	1	5	1
chr14	105945875	105945875	C	A	intronic	CRIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.75739	0	NaN	NA	NA	11	9	2	0
chr14	105945877	105945877	T	C	intronic	CRIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.76316	0	NaN	NA	NA	11	9	2	0
chr14	105945881	105945881	T	A	intronic	CRIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.75738	0	NaN	NA	NA	11	9	2	0
chr14	105945891	105945891	C	T	intronic	CRIP2	NaN	NaN	NaN	rs11849001	NaN	0.859026	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	47.174259	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	53
chr14	105964096	105964096	C	T	intronic	C14orf80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	4	2	4
chr14	105964098	105964098	T	T	intronic	C14orf80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	48	42	0	0
chr14	106114077	106114077	G	T	intergenic	MIR8071-2,ELK2AP	dist=7508;dist=21837	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	9	2	7	0
chr14	106212146	106212146	C	T	intergenic	ELK2AP,MIR4507	dist=73002;dist=112147	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr14	106212150	106212150	T	C	intergenic	ELK2AP,MIR4507	dist=73006;dist=112143	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	4	7	0
chr14	106284422	106284422	A	T	intergenic	ELK2AP,MIR4507	dist=145278;dist=39871	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	106364744	106364744	G	T	intergenic	MIR4539,KIAA0125	dist=38160;dist=19094	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	106364745	106364745	G	C	intergenic	MIR4539,KIAA0125	dist=38161;dist=19093	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	106376144	106376144	A	G	intergenic	MIR4539,KIAA0125	dist=49560;dist=7694	NaN	NaN	rs2516956	NaN	0.53135	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr14	106805381	106805381	T	G	intergenic	LINC00226,LINC00221	dist=60415;dist=133064	NaN	NaN	rs77489245	NaN	0.142572	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr14	107119927	107119927	C	T	intergenic	MIR7641-2,MIR5195	dist=27162;dist=139173	NaN	NaN	rs58047143	NaN	0.589856	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr14	107262636	107262636	T	A	intergenic	MIR5195,NONE	dist=3422;dist=NONE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	20181502	20181502	C	T	exonic	OR11H2	NaN	nonsynonymous SNV	OR11H2:NM_001197287:exon2:c.G574A:p.V192I	rs201024081	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	716	364	352	38
chr14	20502770	20502770	T	C	exonic	OR4K13	NaN	nonsynonymous SNV	OR4K13:NM_001004714:exon1:c.A148G:p.T50A	NaN	NaN	NaN	0.22	T	0.0	B	0.002	B	0.198	U	1.000	N	1.075	L	5.38	T	-0.917	T	0.003	T	0.057	0.049	4.270	0.057	-0.159	-1.150	4.181	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.541368	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	186	180	6	0
chr14	20528359	20528359	G	T	exonic	OR4L1	NaN	nonsynonymous SNV	OR4L1:NM_001004717:exon1:c.G156T:p.R52S	rs1959630	NaN	0.971246	0.28	T	0.0	B	0.0	B	0.713	N	1.000	P	-2.215	N	5.39	T	-0.989	T	0.000	T	0.067	-0.335	2.414	-4.33	-1.457	-1.783	5.877	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	335.885156	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	121	1	120	58
chr14	20691963	20691963	T	C	exonic	OR11H6	NaN	nonsynonymous SNV	OR11H6:NM_001004480:exon1:c.T95C:p.L32P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.982	D	0.000	D	1.000	D	4.5	H	6.57	T	-1.180	T	0.013	T	0.882	3.092	16.33	4.57	2.038	4.863	12.182	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.261458	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	113	109	4	0
chr14	20692718	20692718	A	A	exonic	OR11H6	NaN	synonymous SNV	OR11H6:NM_001004480:exon1:c.A850A:p.N284N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	63	NaN	NA	NA	100	84	0	0
chr14	20760117	20760117	T	T	intronic	TTC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	15	14	0	0
chr14	20763446	20763446	T	C	intronic	TTC5	NaN	NaN	NaN	rs1953551	NaN	0.93151	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1902.62	0	NaN	NA	NA	154	0	154	55
chr14	20763758	20763758	A	A	intronic	TTC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	20767110	20767110	A	G	intronic	TTC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	19	8	11	0
chr14	20770175	20770175	A	A	intronic	TTC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	20813701	20813701	A	A	intronic	PARP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr14	20824444	20824444	C	A	intronic	PARP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr14	20824445	20824445	T	A	intronic	PARP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr14	20824448	20824448	T	G	intronic	PARP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr14	20824862	20824862	A	A	intronic	PARP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr14	20825965	20825965	A	C	UTR3	PARP2	NM_005484:c.*9A>C,NM_001042618:c.*9A>C	NaN	NaN	rs2700	NaN	0.23722	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	70.5571	0	NaN	NA	NA	46	29	17	20
chr14	20837571	20837571	T	A	exonic	TEP1	NaN	nonsynonymous SNV	TEP1:NM_007110:exon53:c.A7588T:p.S2530C	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.002	B	0.005	B	0.216	N	1.000	N	0.55	N	0.7	T	-1.005	T	0.075	T	0.386	1.780	11.91	-4.73	-0.930	-1.764	4.455	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.876912	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	339	331	8	0
chr14	20839296	20839296	T	T	intronic	TEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	22	22	0	0
chr14	20857345	20857345	T	A	intronic	TEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr14	20857941	20857941	A	A	intronic	TEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr14	20863811	20863811	G	A	intronic	TEP1	NaN	NaN	NaN	rs1713417	NaN	0.205072	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	88.045811	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	34	38	9
chr14	20863936	20863936	G	C	intronic	TEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.466217	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	77	72	5	0
chr14	20864694	20864694	A	A	intronic	TEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr14	20864886	20864886	T	A	exonic	TEP1	NaN	nonsynonymous SNV	TEP1:NM_007110:exon10:c.A1553T:p.N518I	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.939	P	0.522	P	0.053	N	1.000	N	1.445	L	2.44	T	-1.047	T	0.041	T	0.403	3.338	17.23	-1.86	-0.380	-0.244	10.177	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.666342	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	210	193	17	0
chr14	20872163	20872163	A	A	intronic	TEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr14	20876306	20876306	A	C	exonic	TEP1	NaN	nonsynonymous SNV	TEP1:NM_007110:exon2:c.T293G:p.V98G	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.231	B	0.142	B	0.995	N	1.000	N	0.805	L	0.53	T	-0.968	T	0.108	T	0.345	-0.897	0.444	1.55	0.497	-0.331	6.189	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2142857142857145	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr14	20925041	20925041	A	G	intronic	APEX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.484741	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	64	57	7	0
chr14	20929034	20929034	A	C	intronic	TMEM55B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	1	1	0
chr14	20937523	20937523	T	C	upstream	PNP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr14	21025035	21025035	A	A	exonic	RNASE9	NaN	synonymous SNV	RNASE9:NM_001001673:exon2:c.T194T:p.V65V,RNASE9:NM_001110356:exon3:c.T194T:p.V65V,RNASE9:NM_001110357:exon3:c.T194T:p.V65V,RNASE9:NM_001110358:exon4:c.T209T:p.V70V,RNASE9:NM_001110360:exon4:c.T209T:p.V70V,RNASE9:NM_001289110:exon4:c.T194T:p.V65V,RNASE9:NM_001110359:exon5:c.T209T:p.V70V,RNASE9:NM_001110361:exon5:c.T209T:p.V70V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	132	112	0	0
chr14	21100335	21100335	A	G	intergenic	LOC254028,OR6S1	dist=24955;dist=8520	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr14	21109170	21109170	T	A	exonic	OR6S1	NaN	synonymous SNV	OR6S1:NM_001001968:exon1:c.A681T:p.A227A	rs11628297	NaN	0.984026	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3180.82	0	NaN	NA	NA	311	0	311	39
chr14	21161816	21161816	A	G	exonic	ANG	NaN	synonymous SNV	ANG:NM_001097577:exon2:c.A93G:p.T31T,ANG:NM_001145:exon2:c.A93G:p.T31T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.128914	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	225	215	10	0
chr14	21190287	21190287	A	C	intergenic	RNASE4,EDDM3A	dist=21526;dist=23812	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	21190306	21190306	A	T	intergenic	RNASE4,EDDM3A	dist=21545;dist=23793	NaN	NaN	rs2002078	ID=COSN164605;OCCURENCE=1(NS)	0.500399	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr14	21359808	21359808	C	A	intronic	RNASE3	NaN	NaN	NaN	rs2233859	NaN	0.304513	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	241.006393	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	80	0	80	36
chr14	21458320	21458320	CCCCG	C,CC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	393.253	0	NaN	NA	NA	38	0	33	2
chr14	21460186	21460186	T	T	intronic	METTL17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	21485791	21485791	C	G	exonic	NDRG2	NaN	synonymous SNV	NDRG2:NM_001282211:exon15:c.G1068C:p.S356S,NDRG2:NM_001282212:exon15:c.G990C:p.S330S,NDRG2:NM_001282216:exon15:c.G900C:p.S300S,NDRG2:NM_201536:exon15:c.G1038C:p.S346S,NDRG2:NM_201538:exon15:c.G1038C:p.S346S,NDRG2:NM_001282213:exon16:c.G1038C:p.S346S,NDRG2:NM_001282214:exon16:c.G1038C:p.S346S,NDRG2:NM_001282215:exon16:c.G1047C:p.S349S,NDRG2:NM_016250:exon16:c.G1038C:p.S346S,NDRG2:NM_201537:exon16:c.G1080C:p.S360S,NDRG2:NM_201539:exon16:c.G1080C:p.S360S,NDRG2:NM_201541:exon16:c.G1038C:p.S346S,NDRG2:NM_201535:exon17:c.G1080C:p.S360S,NDRG2:NM_201540:exon17:c.G1080C:p.S360S	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.982	T	0.110	T	.	1.252	10.08	-4.21	-0.840	-0.060	3.623	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0030291407807071747	NA	0	0	NaN	NA	NA	170	136	34	0
chr14	21485968	21485968	A	G	intronic	NDRG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.221039	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	164	152	12	0
chr14	21488795	21488795	C	T	intronic	NDRG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	83.324695	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	190	135	55	0
chr14	21490125	21490125	A	C	intronic	NDRG2	NaN	NaN	NaN	rs1243449	NaN	0.992013	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	180.602967	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	0	60	57
chr14	21490350	21490350	A	A	intronic	NDRG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	55	42	0	0
chr14	21491127	21491127	A	A	intronic	NDRG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	12	7	0	0
chr14	21498704	21498704	G	A	UTR5	TPPP2	NM_173846:c.-37G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr14	21498707	21498707	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	1	2,2	0
chr14	21499126	21499126	T	C	intronic	NDRG2,TPPP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	21499130	21499130	T	C	intronic	NDRG2,TPPP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	21499131	21499131	T	G	intronic	NDRG2,TPPP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	21499133	21499133	A	T	intronic	NDRG2,TPPP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	21499135	21499135	G	C	intronic	NDRG2,TPPP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	21525994	21525994	T	G	UTR5	RNASE8	NM_138331:c.-58T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	14	6	8	0
chr14	21541102	21541102	T	T	intronic	ARHGEF40	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	64	60	0	0
chr14	21542905	21542905	A	G	exonic	ARHGEF40	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGEF40:NM_018071:exon3:c.A1016G:p.E339G	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.031	B	0.039	B	0.062	N	0.997	N	0.695	N	4.28	T	-0.936	T	0.007	T	0.225	0.420	6.279	2.5	0.373	0.129	3.920	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.269586	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	65	62	3	0
chr14	21546276	21546276	A	A	intronic	ARHGEF40	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	21546277	21546277	G	G	intronic	ARHGEF40	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	21546279	21546279	G	G	intronic	ARHGEF40	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	21546284	21546284	A	A	intronic	ARHGEF40	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	21546285	21546285	G	G	intronic	ARHGEF40	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	21559592	21559592	T	C	exonic	ZNF219	NaN	synonymous SNV	ZNF219:NM_001101672:exon4:c.A1542G:p.K514K,ZNF219:NM_001102454:exon4:c.A1542G:p.K514K,ZNF219:NM_016423:exon4:c.A1542G:p.K514K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.914813	nearby_gap_events	REJECT	74	67	7	0
chr14	21559647	21559647	G	G	exonic	ZNF219	NaN	synonymous SNV	ZNF219:NM_001101672:exon4:c.C1487C:p.T496T,ZNF219:NM_001102454:exon4:c.C1487C:p.T496T,ZNF219:NM_016423:exon4:c.C1487C:p.T496T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	85	72	0	0
chr14	21559990	21559990	C	A	intronic	ZNF219	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	54.7639	0	NaN	NA	NA	25	17	8	17
chr14	21559993	21559993	C	T	intronic	ZNF219	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	54.7641	0	NaN	NA	NA	26	17	9	16
chr14	21571057	21571057	A	A	intronic	TMEM253,ZNF219	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	21624197	21624197	T	C	upstream	OR5AU1	NaN	NaN	NaN	rs10135366	NaN	0.561502	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	550.579351	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	187	1	186	54
chr14	21698595	21698595	A	G	intronic	HNRNPC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr14	21770616	21770616	C	T	intronic	RPGRIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.380575	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	159	154	5	0
chr14	21778588	21778588	G	A	intronic	RPGRIP1	NaN	NaN	NaN	rs1957413	NaN	0.573882	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	43.791	0	NaN	NA	NA	9	5	4	33
chr14	21778792	21778792	T	C	intronic	RPGRIP1	NaN	NaN	NaN	rs1957414	NaN	0.392971	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	42.2257	0	16.060586	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	3	6	11
chr14	21785818	21785818	T	T	intronic	RPGRIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	21819412	21819412	G	A	UTR3	RPGRIP1	NM_020366:c.*37G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr14	21819417	21819417	C	G	UTR3	RPGRIP1	NM_020366:c.*42C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	21825653	21825653	A	A	intronic	SUPT16H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	21826181	21826181	A	T	intronic	SUPT16H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	21841464	21841464	T	G	intronic	SUPT16H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	2	3	0
chr14	21853708	21853708	G	A	UTR3	CHD8	NM_001170629:c.*64C>T,NM_020920:c.*64C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	21860979	21860979	A	G	intronic	CHD8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	29	0	29	0
chr14	21871928	21871928	A	A	intronic	CHD8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr14	21874068	21874068	G	C	intronic	CHD8	NaN	NaN	NaN	rs7155123	NaN	0.794129	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	101.08	0	NaN	NA	NA	103	0	103	25
chr14	21881193	21881193	A	G	intronic	CHD8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	59	22	34	0
chr14	21899836	21899836	T	C	UTR5	CHD8	NM_001170629:c.-34A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.345274	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	288	281	7	0
chr14	21936472	21936472	T	T	intronic	RAB2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	28	24	0	0
chr14	21936977	21936977	A	A	intronic	RAB2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	21945144	21945144	C	T	upstream	RAB2B,TOX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.4476	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr14	21945583	21945583	T	T	intronic	TOX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	70	57	0	0
chr14	21957336	21957336	T	A	exonic	TOX4	NaN	nonsynonymous SNV	TOX4:NM_001303523:exon4:c.T515A:p.L172H,TOX4:NM_014828:exon5:c.T584A:p.L195H	NaN	NaN	NaN	0.5	T	0.758	P	0.264	B	0.414	N	0.986	N	0.345	N	2.73	T	-1.017	T	0.022	T	0.262	1.551	11.14	4.07	1.005	2.415	7.636	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.49450549450549636	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr14	21961227	21961227	A	C	exonic	TOX4	NaN	nonsynonymous SNV	TOX4:NM_001303523:exon6:c.A1383C:p.L461F,TOX4:NM_014828:exon7:c.A1452C:p.L484F	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.985	D	0.793	P	0.937	N	0.897	N	0	N	2.66	T	-1.026	T	0.031	T	0.329	3.340	17.24	2.55	1.054	0.123	4.590	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.306719	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	58	52	6	0
chr14	21968609	21968609	C	G	intronic	METTL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr14	21968610	21968610	C	T	intronic	METTL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr14	21969373	21969373	A	A	intronic	METTL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr14	21971239	21971239	T	C	intronic	METTL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	11	5	3	0
chr14	21979434	21979434	A	A	UTR5	METTL3	NM_019852:c.-69T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr14	21993314	21993314	A	A	exonic	SALL2	NaN	synonymous SNV	SALL2:NM_005407:exon2:c.T548T:p.L183L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	40	38	0	0
chr14	21993394	21993394	C	G	exonic	SALL2	NaN	synonymous SNV	SALL2:NM_005407:exon2:c.G468C:p.S156S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2941176470588277	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr14	22037905	22037905	G	A	downstream	OR10G3	NaN	NaN	NaN	rs8009501	NaN	0.72484	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	64.762866	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	56	28	28	47
chr14	22103071	22103071	A	T	UTR5	OR10G2	NM_001005466:c.-73T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	11	3	6	0
chr14	22103072	22103072	A	C	UTR5	OR10G2	NM_001005466:c.-74T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr14	22133648	22133648	G	A	exonic	OR4E2	NaN	nonsynonymous SNV	OR4E2:NM_001001912:exon1:c.G352A:p.V118M	rs2874103	NaN	0.720647	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-3.91	N	5.7	T	-0.984	T	0.000	T	0.092	-1.420	0.021	5.6	0.955	5.930	9.932	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	369.33311	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	123	0	123	56
chr14	22134250	22134250	A	T	downstream	OR4E2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	22670381	22670381	T	C	intergenic	OR4E2,DAD1	dist=536143;dist=363426	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	23025401	23025401	G	C	intergenic	OR4E2,DAD1	dist=891163;dist=8406	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	23070726	23070726	A	A	intronic	ABHD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	23079730	23079730	A	G	intronic	ABHD4	NaN	NaN	NaN	rs1242933	NaN	0.55631	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	50.1612	15	NaN	NA	NA	23	17	6	38
chr14	23236524	23236524	C	T	exonic	OXA1L	NaN	nonsynonymous SNV	OXA1L:NM_005015:exon2:c.C311T:p.A104V	rs8572	NaN	0.771765	0.04	D	0.001	B	0.001	B	0.342	N	1.000	P	.	.	1.51	T	-1.081	T	0.000	T	0.04	2.136	13.10	1.35	-0.041	-0.034	5.408	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	91.804273	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	0	31	55
chr14	23240328	23240328	T	A	exonic	OXA1L	NaN	synonymous SNV	OXA1L:NM_005015:exon8:c.T1221A:p.R407R	rs8786	NaN	0.203275	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2204.19	0	NaN	NA	NA	193	1	192	19
chr14	23242827	23242827	A	AC	exonic	SLC7A7	NaN	frameshift substitution	SLC7A7:NM_001126105:exon11:c.1528_1528delinsGT,SLC7A7:NM_001126106:exon11:c.1528_1528delinsGT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1519.31	0	NaN	NA	NA	176	0	21	3
chr14	23244963	23244963	T	C	intronic	SLC7A7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	17	7	9	0
chr14	23248172	23248172	A	T	intronic	SLC7A7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	23248174	23248174	G	C	intronic	SLC7A7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	23282584	23282584	T	C	exonic	SLC7A7	NaN	synonymous SNV	SLC7A7:NM_001126105:exon3:c.A24G:p.E8E,SLC7A7:NM_001126106:exon3:c.A24G:p.E8E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.54282	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	177	170	7	0
chr14	23299135	23299135	G	T	exonic	MRPL52	NaN	nonsynonymous SNV	MRPL52:NM_178336:exon1:c.G14T:p.G5V,MRPL52:NM_180982:exon1:c.G14T:p.G5V,MRPL52:NM_181307:exon1:c.G14T:p.G5V	rs1135641	NaN	0.514177	0.11	T	0.133	B	0.144	B	0.392	N	1.000	P	1.39	L	1.92	T	-0.937	T	0.000	T	0.567	2.637	14.78	-1.72	-0.184	-0.056	6.902	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	67.401326	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	0	21	46
chr14	23299286	23299286	T	C	exonic	MRPL52	NaN	nonsynonymous SNV	MRPL52:NM_178336:exon2:c.T56C:p.V19A,MRPL52:NM_180982:exon2:c.T53C:p.V18A,MRPL52:NM_181307:exon2:c.T56C:p.V19A	rs4982685	NaN	0.867612	0.94	T	0.0	B	0.0	B	0.933	N	1.000	P	-0.55	N	1.71	T	-1.003	T	0.000	T	0.454	-1.411	0.022	-0.46	-0.143	-0.341	4.686	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	475.798396	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	156	1	155	57
chr14	23312555	23312555	T	G	exonic	MMP14	NaN	nonsynonymous SNV	MMP14:NM_004995:exon5:c.T778G:p.F260V	NaN	NaN	NaN	0.14	T	0.981	D	0.907	P	0.000	D	1.000	D	1.325	L	2.11	T	-1.108	T	0.095	T	0.939	4.721	26.3	5.54	2.107	8.040	14.644	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.069651	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	320	303	17	0
chr14	23312918	23312918	G	A	splicing	MMP14	NM_004995:exon6:c.851-1G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.322	17.17	5.7	2.700	3.708	16.751	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.516423	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	206	194	12	0
chr14	23315331	23315331	T	C	UTR3	MMP14	NM_004995:c.*83T>C	NaN	NaN	rs743257	NaN	0.616214	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	18.8606	0	NaN	NA	NA	23	17	5	38
chr14	23352646	23352646	A	A	intronic	REM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	23355087	23355087	T	T	intronic	REM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr14	23371055	23371055	G	C	exonic	RBM23	NaN	nonsynonymous SNV	RBM23:NM_001077352:exon11:c.C1182G:p.F394L,RBM23:NM_018107:exon12:c.C1236G:p.F412L,RBM23:NM_001077351:exon13:c.C1284G:p.F428L	rs1127066	NaN	0.214856	0.55	T	0.09	B	0.047	B	0.027	N	0.001	P	1.095	L	0.84	T	-1.010	T	0.000	T	0.316	1.827	12.07	2.35	0.190	0.348	10.327	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	81.5132	0	33.819922	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	9	14	23
chr14	23380689	23380689	A	A	intronic	RBM23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	23391259	23391259	T	G	ncRNA_intronic	PRMT5-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr14	23393877	23393877	A	A	exonic	PRMT5	NaN	synonymous SNV	PRMT5:NM_001282956:exon5:c.T468T:p.F156F,PRMT5:NM_001282953:exon8:c.T798T:p.F266F,PRMT5:NM_001282954:exon8:c.T663T:p.F221F,PRMT5:NM_001282955:exon8:c.T849T:p.F283F,PRMT5:NM_001039619:exon9:c.T930T:p.F310F,PRMT5:NM_006109:exon9:c.T981T:p.F327F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	53	47	0	0
chr14	23394007	23394007	T	C	intronic	PRMT5	NaN	NaN	NaN	rs1956880	NaN	0.629393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	143.850384	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	49	1	48	51
chr14	23396680	23396680	T	C	intronic	PRMT5	NaN	NaN	NaN	rs12589539	NaN	0.523962	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	286.284919	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	108	1	107	45
chr14	23397649	23397649	T	T	intronic	PRMT5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	23397880	23397880	A	A	intronic	PRMT5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr14	23415960	23415960	C	C	ncRNA_intronic	LOC101926933	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr14	23420950	23420950	A	A	ncRNA_intronic	LOC101926933	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	33	30	0	0
chr14	23443215	23443215	T	A	intronic	AJUBA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	51.892382	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	75	42	33	0
chr14	23459352	23459352	G	G	intronic	C14orf93	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr14	23465094	23465094	C	A	intronic	C14orf93	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	63	NaN	NA	NA	656	399	254	0
chr14	23518737	23518737	A	T	intronic	CDH24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	23518739	23518739	G	T	intronic	CDH24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	23518857	23518857	A	G	exonic	CDH24	NaN	nonsynonymous SNV	CDH24:NM_144985:exon10:c.T1576C:p.F526L,CDH24:NM_022478:exon11:c.T1690C:p.F564L	NaN	NaN	NaN	0	D	0.059	B	0.022	B	0.000	D	1.000	D	2.04	M	2.3	T	-1.100	T	0.050	T	0.609	3.394	17.46	4.7	1.980	1.715	12.153	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.056861	nearby_gap_events	REJECT	153	146	7	0
chr14	23521345	23521345	A	G	intronic	CDH24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	23524090	23524090	A	A	intronic	CDH24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr14	23524098	23524098	A	C	intronic	CDH24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	23525055	23525055	A	A	UTR5	CDH24	NM_022478:c.-113T>T,NM_144985:c.-113T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	23528315	23528315	G	T	UTR3	ACIN1	NM_001164814:c.*42C>A,NM_001164815:c.*42C>A,NM_001164816:c.*42C>A,NM_001164817:c.*42C>A,NM_014977:c.*42C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.655994	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	178	168	10	0
chr14	23533706	23533706	A	A	intronic	ACIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	23559748	23559748	T	C	exonic	ACIN1	NaN	nonsynonymous SNV	ACIN1:NM_001164814:exon3:c.A473G:p.E158G,ACIN1:NM_001164815:exon3:c.A473G:p.E158G,ACIN1:NM_014977:exon3:c.A473G:p.E158G	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.999	D	0.973	D	0.001	N	1.000	D	1.59	L	2.15	T	-0.901	T	0.152	T	0.719	4.321	22.7	5.24	1.999	6.791	14.126	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.446247	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	72	68	4	0
chr14	23564412	23564412	C	G	exonic	ACIN1	NaN	synonymous SNV	ACIN1:NM_001164814:exon1:c.G84C:p.G28G,ACIN1:NM_001164815:exon1:c.G84C:p.G28G,ACIN1:NM_014977:exon1:c.G84C:p.G28G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	36	16	20	0
chr14	23587622	23587622	A	C	intronic	CEBPE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr14	23596740	23596740	A	G	intronic	SLC7A8	NaN	NaN	NaN	rs11625112	NaN	0.523363	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	23609917	23609917	C	T	intronic	SLC7A8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.4123	0	NaN	NA	NA	127	113	14	8
chr14	23792155	23792155	T	T	intronic	BCL2L2-PABPN1,PABPN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	23818668	23818668	A	G	intronic	SLC22A17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	23821150	23821150	G	A	intronic	SLC22A17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.7076	0	NaN	NA	NA	15	11	4	0
chr14	23821428	23821428	A	A	UTR5	SLC22A17	NM_001289050:c.-3676T>T,NM_020372:c.-5T>T,NM_016609:c.-5T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr14	23830042	23830042	T	C	exonic	EFS	NaN	nonsynonymous SNV	EFS:NM_005864:exon2:c.A19G:p.T7A	rs2231798	NaN	0.455671	0.64	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.000	P	0.675	N	0.5	T	-1.008	T	0.000	T	0.017	0.331	5.796	4.99	1.496	1.376	11.733	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.2851	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	17
chr14	23846603	23846603	A	A	intronic	CMTM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	23851410	23851410	A	A	intronic	MYH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr14	23855948	23855948	G	G	intronic	MYH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr14	23859714	23859714	C	T	intronic	MYH6	NaN	NaN	NaN	rs112405990	NaN	0.0992412	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	198.859	0	NaN	NA	NA	162	1	161	4
chr14	23861727	23861727	G	T	intronic	MYH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.23529411764705904	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr14	23861811	23861811	A	G	exonic	MYH6	NaN	nonsynonymous SNV	MYH6:NM_002471:exon25:c.T3302C:p.V1101A	rs365990	NaN	0.3748	1	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	-0.935	N	-0.95	T	-0.949	T	0.000	T	0.021	-0.194	3.060	4.69	1.118	2.250	9.475	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	79.5147	0	21.586912	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	18
chr14	23866489	23866489	A	A	intronic	MYH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	19	15	0	0
chr14	23866599	23866599	T	C	intronic	MYH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	23874117	23874117	T	C	intronic	MYH6	NaN	NaN	NaN	rs440466	NaN	0.324681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	190.120364	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	0	65	30
chr14	23874342	23874342	A	G	intronic	MYH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.607931	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	223	216	7	0
chr14	23876187	23876187	T	T	intronic	MYH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	24	19	0	0
chr14	23876586	23876586	A	A	intronic	MYH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	23876602	23876602	C	G	intronic	MYH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	23886667	23886667	C	G	ncRNA_intronic	MHRT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.148139	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	87	80	7	0
chr14	23887645	23887645	T	C	intronic	MYH7	NaN	NaN	NaN	rs7159367	NaN	0.351238	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	149.674	0	66.709519	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	18	27	35
chr14	23899888	23899888	T	T	intronic	MYH7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr14	23902578	23902578	T	T	intronic	MYH7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	23902905	23902905	C	G	exonic	MYH7	NaN	nonsynonymous SNV	MYH7:NM_000257:exon3:c.G37C:p.A13P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.915	P	0.915	D	.	.	1.000	D	2.965	M	-2.13	D	0.843	D	0.806	D	0.722	4.661	25.7	4.11	1.988	4.953	16.305	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	91	86	5	0
chr14	23946787	23946787	A	A	UTR3	NGDN	NM_015514:c.*10A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	23991012	23991012	T	T	UTR3	ZFHX2	NM_033400:c.*159A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr14	23993416	23993416	T	C	exonic	ZFHX2	NaN	nonsynonymous SNV	ZFHX2:NM_033400:exon9:c.A5735G:p.E1912G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.29	M	-4.08	D	1.048	D	0.923	D	0.796	3.545	18.09	4.67	1.962	7.814	13.233	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.41373	clustered_read_position	REJECT	77	69	8	0
chr14	23994204	23994204	T	G	exonic	ZFHX2	NaN	nonsynonymous SNV	ZFHX2:NM_033400:exon9:c.A4947C:p.K1649N	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	3.745	H	-4.65	D	1.084	D	0.961	D	0.474	1.893	12.29	2.1	0.258	-0.293	7.294	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	106.687	0	NaN	NA	NA	16	10	6	1
chr14	23994798	23994798	C	G	exonic	ZFHX2	NaN	synonymous SNV	ZFHX2:NM_033400:exon9:c.G4353C:p.L1451L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5005	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr14	23994800	23994800	G	GGGA	exonic	ZFHX2	NaN	nonframeshift substitution	ZFHX2:NM_033400:exon9:c.4351_4351delinsTCCC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5005	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr14	23994802	23994802	T	A	exonic	ZFHX2	NaN	nonsynonymous SNV	ZFHX2:NM_033400:exon9:c.A4349T:p.E1450V	NaN	NaN	NaN	0	D	0.993	D	0.902	P	0.001	N	1.000	D	2.14	M	-1.96	D	0.700	D	0.686	D	0.416	2.543	14.46	4.18	1.764	7.690	12.383	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.5824	0	NaN	NA	NA	8	5	2	0
chr14	23994804	23994804	A	C	exonic	ZFHX2	NaN	nonsynonymous SNV	ZFHX2:NM_033400:exon9:c.T4347G:p.F1449L	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.125	B	0.038	B	0.001	D	1.000	N	2.11	M	-2.44	D	-0.293	T	0.553	D	0.316	2.082	12.92	1.81	0.191	3.555	6.073	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.687418	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	101	85	16	10
chr14	23999026	23999026	T	C	intronic	ZFHX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.530926	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	165	157	8	0
chr14	23999306	23999306	G	A	intronic	ZFHX2	NaN	NaN	NaN	rs3742488	NaN	0.349441	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	69.2816	0	15.760441	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	1	7	14
chr14	24002649	24002649	G	C	exonic	ZFHX2	NaN	nonsynonymous SNV	ZFHX2:NM_033400:exon2:c.C1886G:p.P629R	NaN	NaN	NaN	0.26	T	.	.	.	.	.	.	0.750	N	1.1	L	-1.13	T	-0.527	T	0.378	T	0.575	1.533	11.08	4.57	2.367	5.930	14.399	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.205527	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	39	31	8	0
chr14	24029307	24029307	A	A	intronic	AP1G2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	9	6	0	0
chr14	24030486	24030486	T	C	ncRNA_exonic	LOC102724814	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr14	24030898	24030898	G	A	ncRNA_exonic	LOC102724814	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr14	24033878	24033878	A	A	ncRNA_intronic	LOC102724814	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	24035576	24035576	T	T	exonic	AP1G2	NaN	synonymous SNV	AP1G2:NM_003917:exon4:c.A382A:p.S128S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	89	73	0	0
chr14	24040942	24040942	T	T	intronic	JPH4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr14	24041182	24041182	T	A	intronic	JPH4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr14	24114292	24114292	C	A	intronic	DHRS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	24114293	24114293	C	A	intronic	DHRS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	24198369	24198369	C	T	intergenic	DHRS2,DHRS4-AS1	dist=83521;dist=209571	NaN	NaN	rs2332102	NaN	0.391374	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	24429239	24429239	C	G	intronic	DHRS4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.0365415	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.212164	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	82	76	6	0
chr14	24435040	24435040	G	A	exonic	DHRS4	NaN	nonsynonymous SNV	DHRS4:NM_001282988:exon3:c.G376A:p.G126R,DHRS4:NM_001282990:exon3:c.G376A:p.G126R,DHRS4:NM_021004:exon4:c.G478A:p.G160R	NaN	NaN	NaN	0.87	T	0.956	P	0.664	P	0.000	D	1.000	D	1.76	L	1.54	T	-1.039	T	0.083	T	0.524	3.084	16.30	3.0	1.687	4.394	11.856	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.15555555555555725	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr14	24511890	24511890	T	T	intronic	DHRS4L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr14	24523412	24523412	A	T	intronic	LRRC16B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.489304	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	55	52	3	0
chr14	24524030	24524030	A	C	intronic	LRRC16B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	13	4	9	0
chr14	24525782	24525782	A	G	intronic	LRRC16B	NaN	NaN	NaN	rs4982852	NaN	0.942093	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.090638	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	0	24	50
chr14	24529148	24529148	T	T	intronic	LRRC16B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	24530311	24530311	C	G	intronic	LRRC16B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	24530314	24530314	G	A	intronic	LRRC16B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	24532342	24532342	T	T	exonic	LRRC16B	NaN	synonymous SNV	LRRC16B:NM_138360:exon30:c.T2720T:p.I907I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	66	44	0	0
chr14	24534857	24534857	G	A	exonic	LRRC16B	NaN	synonymous SNV	LRRC16B:NM_138360:exon34:c.G3423A:p.E1141E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.761631	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	158	149	9	0
chr14	24551828	24551828	G	T	exonic	NRL	NaN	nonsynonymous SNV	NRL:NM_006177:exon2:c.C230A:p.T77N	NaN	ID=COSM1666177;OCCURENCE=1(eye)	NaN	0.61	T	0.003	B	0.005	B	0.011	N	1.000	N	0.235	N	-1.36	T	-0.948	T	0.241	T	0.111	1.853	12.15	5.08	2.636	0.554	10.963	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	261	105	153	0
chr14	24568599	24568599	A	G	intronic	PCK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr14	24571959	24571959	C	T	intronic	PCK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.498869	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	311	305	6	0
chr14	24572534	24572534	A	C	intronic	PCK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	24586073	24586073	T	C	intronic	DCAF11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr14	24586549	24586549	C	G	exonic	DCAF11	NaN	nonsynonymous SNV	DCAF11:NM_001163484:exon4:c.C358G:p.L120V,DCAF11:NM_025230:exon4:c.C358G:p.L120V,DCAF11:NM_181357:exon4:c.C280G:p.L94V	NaN	NaN	NaN	0.66	T	0.698	P	0.108	B	0.012	N	0.696	D	0.895	L	0.92	T	-0.929	T	0.103	T	0.257	2.837	15.45	4.95	1.483	1.812	12.708	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.57963	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	73	66	7	0
chr14	24586784	24586784	T	T	intronic	DCAF11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	24614560	24614560	T	C	intronic	PSME2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	20.5262	0	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr14	24619987	24619987	G	C	exonic	RNF31	NaN	nonsynonymous SNV	RNF31:NM_017999:exon8:c.G1378C:p.G460R	NaN	NaN	NaN	0.46	T	0.0	B	0.002	B	0.476	N	1.000	N	1.7	L	0.98	T	-1.002	T	0.107	T	0.326	-1.148	0.104	1.73	0.363	1.587	9.764	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.057023	nearby_gap_events	REJECT	117	102	15	0
chr14	24624342	24624342	C	T	intronic	RNF31	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.83439	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	43	35	8	0
chr14	24627011	24627011	T	C	intronic	RNF31	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	24629256	24629256	A	A	intronic	RNF31	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	24631573	24631573	A	T	intronic	IRF9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr14	24633803	24633803	T	T	intronic	IRF9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr14	24633828	24633828	T	C	exonic	IRF9	NaN	nonsynonymous SNV	IRF9:NM_006084:exon7:c.T655C:p.S219P	NaN	NaN	NaN	0.23	T	1.0	D	0.99	D	0.000	U	0.889	N	2.14	M	-3.39	D	0.516	D	0.856	D	0.683	3.830	19.45	5.32	2.234	2.649	11.584	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.806277	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	254	248	6	0
chr14	24641583	24641583	G	C	UTR5	REC8	NM_001048205:c.-179G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	24641584	24641584	T	G	UTR5	REC8	NM_001048205:c.-178T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	24642570	24642570	G	T	exonic	REC8	NaN	nonsynonymous SNV	REC8:NM_001048205:exon5:c.G412T:p.G138W,REC8:NM_005132:exon6:c.G412T:p.G138W	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.135	M	1.55	T	-0.767	T	0.196	T	0.796	4.549	24.6	5.53	2.584	6.773	16.364	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr14	24647284	24647284	C	T	intronic	REC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.441673	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	81	74	7	0
chr14	24648421	24648421	T	G	intronic	REC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.855851	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	186	171	15	0
chr14	24652479	24652479	C	C	exonic	IPO4	NaN	synonymous SNV	IPO4:NM_024658:exon22:c.G2204G:p.C735C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	189	139	0	0
chr14	24655300	24655300	A	A	intronic	IPO4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	18	15	0	0
chr14	24661938	24661938	T	C	exonic	TM9SF1	NaN	nonsynonymous SNV	TM9SF1:NM_001014842:exon3:c.A883G:p.T295A,TM9SF1:NM_001289006:exon3:c.A622G:p.T208A,TM9SF1:NM_006405:exon3:c.A883G:p.T295A	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.03	B	0.086	B	0.000	D	1.000	D	-0.47	N	1.0	T	-1.057	T	0.057	T	0.449	2.578	14.58	4.99	2.091	5.445	12.700	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.751498	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	293	286	7	0
chr14	24661988	24661988	C	T	exonic	TM9SF1	NaN	nonsynonymous SNV	TM9SF1:NM_001014842:exon3:c.G833A:p.G278D,TM9SF1:NM_001289006:exon3:c.G572A:p.G191D,TM9SF1:NM_006405:exon3:c.G833A:p.G278D	NaN	NaN	NaN	0.71	T	0.005	B	0.003	B	0.578	N	1.000	D	0	N	1.52	T	-1.091	T	0.057	T	0.433	0.777	8.102	4.86	2.528	1.583	13.369	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.860633	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	289	283	6	0
chr14	24676730	24676730	A	A	intronic	TSSK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	24679236	24679236	A	G	intronic	CHMP4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr14	24679453	24679453	T	A	intronic	CHMP4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr14	24679730	24679730	A	G	intronic	CHMP4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.980229	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	294	285	9	0
chr14	24708007	24708007	A	C	UTR3	GMPR2	NM_001283021:c.*23A>C,NM_001002001:c.*23A>C,NM_001002000:c.*23A>C,NM_016576:c.*23A>C,NM_001283023:c.*23A>C,NM_001283022:c.*23A>C,NM_001002002:c.*23A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	10	3	6	0
chr14	24724735	24724735	G	G	intronic	TGM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	86	NaN	NA	NA	133	107	0	0
chr14	24725404	24725404	G	C	intronic	TGM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr14	24729413	24729413	A	G	intronic	TGM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	50	12	38	0
chr14	24729615	24729615	T	T	intronic	TGM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	66	54	0	0
chr14	24735552	24735552	A	C	intronic	RABGGTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr14	24735553	24735553	C	G	intronic	RABGGTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr14	24737873	24737873	A	G	intronic	RABGGTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	32	20	12	0
chr14	24738468	24738468	A	A	intronic	RABGGTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	72	63	0	0
chr14	24738924	24738924	A	G	intronic	RABGGTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.146507	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	737	727	10	0
chr14	24740408	24740408	C	G	UTR5	RABGGTA	NM_004581:c.-87G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.484348	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	174	159	15	0
chr14	24769332	24769332	A	A	exonic	NOP9	NaN	synonymous SNV	NOP9:NM_001286367:exon1:c.A172A:p.S58S,NOP9:NM_174913:exon1:c.A172A:p.S58S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	24769487	24769487	T	T	intronic	NOP9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	20	20	0	0
chr14	24769491	24769491	G	A	intronic	NOP9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.3308823529411801	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr14	24770143	24770143	A	A	intronic	NOP9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	20	14	0	0
chr14	24787567	24787567	G	C	UTR3	ADCY4	NM_139247:c.*55C>G,NM_001198592:c.*55C>G,NM_001198568:c.*55C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	24787569	24787569	C	A	UTR3	ADCY4	NM_139247:c.*53G>T,NM_001198592:c.*53G>T,NM_001198568:c.*53G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	24795231	24795231	CCAC	CC,CCCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1660.25	0	NaN	NA	NA	195	0	159	7
chr14	24795237	24795237	T	C	intronic	ADCY4	NaN	NaN	NaN	rs55970272	NaN	0.927117	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1810.11	0	NaN	NA	NA	37	0	37	16
chr14	24795701	24795701	A	A	intronic	ADCY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	24798618	24798618	T	G	exonic	ADCY4	NaN	nonsynonymous SNV	ADCY4:NM_001198568:exon9:c.A1339C:p.I447L,ADCY4:NM_001198592:exon10:c.A1339C:p.I447L,ADCY4:NM_139247:exon10:c.A1339C:p.I447L	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.472	P	0.309	B	0.000	D	0.999	D	0	N	-0.95	T	-0.600	T	0.279	T	0.515	3.697	18.78	5.13	2.156	3.208	12.939	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.16149068322981244	NA	0	0	6.783036	clustered_read_position	REJECT	13	10	3	0
chr14	24800389	24800389	C	T	intronic	ADCY4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.835918	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	479	461	18	0
chr14	24803956	24803956	A	C	UTR5	ADCY4	NM_001198568:c.-98T>G	NaN	NaN	rs1124644	NaN	0.818291	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	49.612744	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	51
chr14	24837643	24837643	G	A	exonic	NFATC4	NaN	nonsynonymous SNV	NFATC4:NM_001198965:exon1:c.G97A:p.E33K,NFATC4:NM_004554:exon1:c.G97A:p.E33K,NFATC4:NM_001136022:exon2:c.G286A:p.E96K,NFATC4:NM_001198967:exon2:c.G286A:p.E96K	NaN	NaN	NaN	0.63	T	0.927	P	0.953	D	0.960	N	1.000	D	1.1	L	3.27	T	-0.959	T	0.106	T	0.387	1.782	11.92	2.33	1.602	3.650	7.221	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.2328	0	NaN	NA	NA	24	20	2	0
chr14	24839083	24839083	G	C	exonic	NFATC4	NaN	nonsynonymous SNV	NFATC4:NM_001198965:exon2:c.G479C:p.G160A,NFATC4:NM_001198966:exon2:c.G269C:p.G90A,NFATC4:NM_001288802:exon2:c.G443C:p.G148A,NFATC4:NM_004554:exon2:c.G479C:p.G160A,NFATC4:NM_001136022:exon3:c.G668C:p.G223A,NFATC4:NM_001198967:exon3:c.G668C:p.G223A	rs2229309	NaN	0.280351	1	T	0.969	D	0.588	P	0.684	N	0.000	P	0.69	N	2.49	T	-1.054	T	0.000	T	0.236	0.861	8.484	1.81	0.220	2.027	11.077	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2411.17	0	NaN	NA	NA	246	3	243	37
chr14	24841852	24841852	A	A	intronic	NFATC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr14	24843718	24843718	A	G	intronic	NFATC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr14	24845849	24845849	G	C	exonic	NFATC4	NaN	synonymous SNV	NFATC4:NM_001198966:exon9:c.G2196C:p.G732G,NFATC4:NM_001288802:exon9:c.G2370C:p.G790G,NFATC4:NM_004554:exon9:c.G2406C:p.G802G,NFATC4:NM_001136022:exon10:c.G2595C:p.G865G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr14	24868646	24868646	C	G	exonic	NYNRIN	NaN	nonsynonymous SNV	NYNRIN:NM_025081:exon2:c.C194G:p.A65G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.981	D	0.005	U	0.565	D	2.39	M	1.17	T	-0.387	T	0.220	T	0.389	4.591	25.0	4.13	2.129	2.676	13.912	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.537768	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	57	45	12	0
chr14	24870388	24870388	T	C	intronic	NYNRIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	24880395	24880395	A	G	exonic	NYNRIN	NaN	nonsynonymous SNV	NYNRIN:NM_025081:exon5:c.A2528G:p.K843R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.663	P	0.776	P	.	.	0.983	N	0.15	N	0.93	T	-0.921	T	0.123	T	0.155	3.377	17.39	5.02	2.104	3.799	12.744	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.303902	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	151	146	5	0
chr14	24885113	24885113	G	C	exonic	NYNRIN	NaN	nonsynonymous SNV	NYNRIN:NM_025081:exon9:c.G4158C:p.W1386C	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.997	D	0.85	P	.	.	1.000	D	0.55	N	2.85	T	-1.134	T	0.035	T	0.735	2.796	15.31	4.12	2.598	1.805	11.563	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.574758	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	92	87	5	0
chr14	24885731	24885731	A	A	exonic	NYNRIN	NaN	synonymous SNV	NYNRIN:NM_025081:exon9:c.A4776A:p.R1592R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	71	54	0	0
chr14	24897948	24897948	G	T	intronic	CBLN3	NaN	NaN	NaN	rs73593269	NaN	0.127196	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.001828143904014033	NA	0	0	17.878591	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	189	175	14	3
chr14	24897949	24897949	T	A	intronic	CBLN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.507068	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	190	176	14	0
chr14	24899953	24899953	C	C	exonic	KHNYN	NaN	synonymous SNV	KHNYN:NM_001290256:exon2:c.C140C:p.A47A,KHNYN:NM_001290257:exon2:c.C17C:p.A6A,KHNYN:NM_015299:exon2:c.C17C:p.A6A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	25	20	0	0
chr14	24900250	24900250	A	A	intronic	KHNYN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	24901276	24901276	G	T	exonic	KHNYN	NaN	nonsynonymous SNV	KHNYN:NM_001290256:exon3:c.G932T:p.W311L,KHNYN:NM_001290257:exon3:c.G809T:p.W270L,KHNYN:NM_015299:exon3:c.G809T:p.W270L	rs7151995	NaN	0.959465	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-0.695	N	2.1	T	-0.986	T	0.000	T	0.114	-1.093	0.149	-0.232	-0.289	0.092	6.650	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	20	3	17	42
chr14	24906612	24906612	A	G	UTR3	KHNYN	NM_001290256:c.*121A>G,NM_015299:c.*121A>G,NM_001290257:c.*121A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr14	24911838	24911838	T	T	intronic	SDR39U1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	24912008	24912008	T	C	intronic	SDR39U1	NaN	NaN	NaN	rs17184766	NaN	0.164137	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	228.429	0	NaN	NA	NA	108	56	52	15
chr14	24976747	24976747	A	A	intronic	CMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	25043998	25043998	C	A	exonic	CTSG	NaN	synonymous SNV	CTSG:NM_001911:exon3:c.G222T:p.L74L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.098748	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	272	256	16	0
chr14	25044102	25044102	A	G	intronic	CTSG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr14	25102160	25102160	C	T	exonic	GZMB	NaN	nonsynonymous SNV	GZMB:NM_004131:exon2:c.G164A:p.R55Q	rs8192917	NaN	0.680711	0.32	T	0.344	B	0.027	B	0.588	N	1.000	P	-0.02	N	1.57	T	-0.938	T	0.000	T	0.137	2.780	15.26	-1.15	-0.100	-1.293	8.534	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	134.067439	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	0	53	51
chr14	25103434	25103434	A	A	upstream	GZMB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr14	29236467	29236467	T	C	UTR5	FOXG1	NM_005249:c.-19T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.247643	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	1	3	0
chr14	30066976	30066976	A	T	ncRNA_intronic	MIR548AI	NaN	NaN	NaN	rs3783299	NaN	0.430711	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	839.121	0	NaN	NA	NA	381	193	188	31
chr14	30066979	30066979	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	2	2,2	0
chr14	30095794	30095794	T	T	ncRNA_intronic	MIR548AI	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr14	30105717	30105717	A	A	ncRNA_intronic	MIR548AI	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	13	10	0	0
chr14	30108232	30108232	TC	T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.81101	0	NaN	NA	NA	6	5	2	0
chr14	30135418	30135418	T	C	ncRNA_intronic	MIR548AI	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.679087	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	366	357	9	0
chr14	30492212	30492212	T	C	intergenic	PRKD1,G2E3	dist=95313;dist=536117	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	31066895	31066895	A	A	intronic	G2E3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr14	31091495	31091495	T	C	UTR5	SCFD1	NM_016106:c.-50T>C,NM_001283032:c.-5947T>C,NM_182835:c.-8257T>C,NM_001283031:c.-21059T>C,NM_001283033:c.-21059T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	15	8	5	0
chr14	31118846	31118846	A	A	intronic	SCFD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr14	31143249	31143249	T	A	intronic	SCFD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.679263	nearby_gap_events	REJECT	61	53	8	0
chr14	31354844	31354844	A	G	ncRNA_exonic	LOC100506071	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.62762	nearby_gap_events	REJECT	107	96	11	0
chr14	31376049	31376049	A	A	intronic	STRN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	165	127	0	0
chr14	31376050	31376050	C	C	intronic	STRN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	164	118	0	0
chr14	31496197	31496197	C	C	UTR5	AP4S1	NM_001254728:c.-39206C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	31496198	31496198	T	T	UTR5	AP4S1	NM_001254728:c.-39205T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	31496200	31496200	A	A	UTR5	AP4S1	NM_001254728:c.-39203A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	31538984	31538984	C	G	intronic	AP4S1	NaN	NaN	NaN	rs7155228	NaN	0.727037	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	150.133953	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	0	57	57
chr14	31554148	31554148	A	A	UTR3	AP4S1	NM_001254727:c.*212A>A,NM_001254726:c.*60A>A,NM_007077:c.*60A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	31569952	31569952	A	C	UTR3	HECTD1	NM_015382:c.*184T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr14	31589095	31589095	A	G	intronic	HECTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.257107	possible_contamination	REJECT	82	77	5	0
chr14	31590545	31590545	G	A	intronic	HECTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.351884	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	130	122	8	0
chr14	31611098	31611098	T	TTA	exonic	HECTD1	NaN	frameshift substitution	HECTD1:NM_015382:exon18:c.2839_2839delinsTAA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.3896	0	NaN	NA	NA	38	30	5	0
chr14	31613480	31613480	T	T	intronic	HECTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	82	75	0	0
chr14	31613483	31613483	A	A	intronic	HECTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	81	74	0	0
chr14	31614041	31614041	G	A	exonic	HECTD1	NaN	nonsynonymous SNV	HECTD1:NM_015382:exon16:c.C2603T:p.S868L	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.015	B	0.005	B	0.000	U	1.000	D	-0.345	N	1.51	T	-0.970	T	0.147	T	0.895	3.132	16.47	4.65	1.344	9.845	14.486	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.459637	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	702	692	10	0
chr14	31614288	31614288	A	C	intronic	HECTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	11	4	4	0
chr14	31617913	31617913	T	A	intronic	HECTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr14	31675186	31675186	A	G	intronic	HECTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	29	11	17	0
chr14	31771788	31771788	A	A	intronic	HEATR5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	31793053	31793053	GATATATATATATATATC	GATATATATATATAT,GATATATATATATATC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1470.43	0	NaN	NA	NA	161	1	23	10
chr14	31795496	31795496	G	A	exonic	HEATR5A	NaN	synonymous SNV	HEATR5A:NM_015473:exon23:c.C3420T:p.D1140D	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.882	T	0.196	T	.	-0.712	0.935	0.285	0.238	1.739	9.617	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.251208	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	126	120	6	0
chr14	31806669	31806669	T	T	intronic	HEATR5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr14	31806854	31806854	A	C	intronic	HEATR5A	NaN	NaN	NaN	rs372716140	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr14	31806857	31806857	T	C	intronic	HEATR5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr14	31849754	31849754	A	G	exonic	HEATR5A	NaN	nonsynonymous SNV	HEATR5A:NM_015473:exon11:c.T1627C:p.C543R	NaN	NaN	NaN	1	T	0.004	B	0.006	B	0.000	D	1.000	D	-0.73	N	3.28	T	-1.015	T	0.056	T	0.335	-0.615	1.264	5.67	2.152	2.725	11.027	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.351847	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	126	120	6	0
chr14	31849845	31849845	A	T	intronic	HEATR5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.519233	nearby_gap_events	REJECT	113	107	6	0
chr14	31917315	31917315	T	C	ncRNA_intronic	LOC101927124	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	31926436	31926436	A	G	intronic	DTD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	26	26	0	0
chr14	32257176	32257176	T	T	intronic	NUBPL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	292	209	0	0
chr14	32328251	32328251	T	T	intronic	NUBPL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr14	32615625	32615625	T	C	intronic	ARHGAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.959872	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	156	147	9	0
chr14	33014428	33014428	T	G	intronic	AKAP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr14	33070022	33070022	A	A	intronic	AKAP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	33290975	33290975	T	G	exonic	AKAP6	NaN	nonsynonymous SNV	AKAP6:NM_004274:exon13:c.T3956G:p.V1319G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.666	P	0.212	B	0.116	N	1.000	D	1.79	L	3.18	T	-1.079	T	0.023	T	0.691	1.445	10.77	3.48	1.031	1.338	7.948	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	367	252	114	0
chr14	34395148	34395148	GA	G,GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	511.97	0	NaN	NA	NA	225	109	104	19
chr14	34395149	34395149	A	G	intronic	EGLN3	NaN	NaN	NaN	rs77906272	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.890656	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	119	108	11	0
chr14	34419717	34419717	A	A	exonic	EGLN3	NaN	synonymous SNV	EGLN3:NM_022073:exon1:c.T242T:p.I81I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	38	30	0	0
chr14	34998406	34998406	T	T	intronic	EAPP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	34998658	34998658	T	C	exonic	EAPP	NaN	nonsynonymous SNV	EAPP:NM_018453:exon4:c.A376G:p.K126E	NaN	NaN	NaN	0.31	T	0.016	B	0.015	B	0.000	D	0.575	N	1.87	L	0.84	T	-0.898	T	0.120	T	0.341	2.275	13.56	4.22	2.183	4.094	11.925	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.658113	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	234	215	19	0
chr14	35005152	35005152	C	A	intronic	EAPP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	35062312	35062312	C	T	exonic	SNX6	NaN	synonymous SNV	SNX6:NM_021249:exon7:c.G309A:p.E103E,SNX6:NM_152233:exon8:c.G693A:p.E231E	rs12432539	NaN	0.773163	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	47.406743	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	46
chr14	35072538	35072538	T	T	intronic	SNX6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr14	35099099	35099099	A	G	intronic	SNX6	NaN	NaN	NaN	rs11847568	NaN	0.739217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	28.7144	0	NaN	NA	NA	10	6	4	16
chr14	35099153	35099153	A	T	exonic	SNX6	NaN	nonsynonymous SNV	SNX6:NM_152233:exon2:c.T50A:p.L17Q	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.093	B	0.07	B	0.002	N	1.000	D	0.345	N	1.92	T	-1.032	T	0.085	T	0.49	3.021	16.08	4.74	1.927	2.894	6.450	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	52	12.303654	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	0	4	0
chr14	35099154	35099154	G	C	exonic	SNX6	NaN	nonsynonymous SNV	SNX6:NM_152233:exon2:c.C49G:p.L17V	NaN	NaN	NaN	1	T	0.012	B	0.015	B	0.002	N	1.000	D	0	N	2.06	T	-1.051	T	0.049	T	0.179	2.918	15.72	3.84	1.150	4.134	6.958	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	45	9.328075	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr14	35099155	35099155	G	T	exonic	SNX6	NaN	synonymous SNV	SNX6:NM_152233:exon2:c.C48A:p.G16G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	45	9.528715	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr14	35182406	35182406	GATA	G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1666.12	0	NaN	NA	NA	187	0	129	25
chr14	35182417	35182417	T	C	intronic	CFL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	61.59559	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	186	150	36	0
chr14	35234509	35234509	A	A	intronic	BAZ1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr14	35240740	35240740	C	T	exonic	BAZ1A	NaN	nonsynonymous SNV	BAZ1A:NM_182648:exon20:c.G3182A:p.R1061Q,BAZ1A:NM_013448:exon21:c.G3278A:p.R1093Q	NaN	NaN	NaN	0.21	T	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	1.41	L	-0.68	T	-0.265	T	0.461	T	0.77	5.867	36	5.66	2.665	7.515	19.742	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.705279	nearby_gap_events	REJECT	91	86	5	2
chr14	35254926	35254926	T	T	intronic	BAZ1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr14	35468692	35468692	T	C	intronic	SRP54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	1	6	0
chr14	35477694	35477694	A	G	intronic	SRP54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.4481	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr14	35477705	35477705	T	TG	intronic	SRP54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.3677	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr14	35478055	35478055	A	T	intronic	SRP54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	35488283	35488283	A	C	intronic	SRP54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	9	3	3	0
chr14	35488284	35488284	A	T	intronic	SRP54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	8	3	3	0
chr14	35497418	35497418	A	T	intronic	SRP54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	35497419	35497419	T	C	intronic	SRP54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	35498233	35498233	T	T	intronic	SRP54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr14	35498442	35498442	G	A	UTR3	SRP54	NM_003136:c.*84G>A,NM_001146282:c.*84G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.60214	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	147	137	10	1
chr14	35515606	35515606	TGG	T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	793.817	0	NaN	NA	NA	86	0	75	27
chr14	35515789	35515789	C	T	exonic	FAM177A1	NaN	synonymous SNV	FAM177A1:NM_173607:exon1:c.C120T:p.A40A,FAM177A1:NM_001289022:exon2:c.C51T:p.A17A,FAM177A1:NM_001079519:exon3:c.C51T:p.A17A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.901601	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	156	148	8	0
chr14	35515790	35515790	T	C	exonic	FAM177A1	NaN	nonsynonymous SNV	FAM177A1:NM_173607:exon1:c.T121C:p.S41P,FAM177A1:NM_001289022:exon2:c.T52C:p.S18P,FAM177A1:NM_001079519:exon3:c.T52C:p.S18P	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.965	D	0.566	P	0.035	N	1.000	N	0.69	N	.	.	-1.086	T	0.054	T	0.467	2.707	15.01	2.71	1.737	0.363	5.298	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.177278	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	154	147	7	0
chr14	35515920	35515920	C	G	intronic	FAM177A1	NaN	NaN	NaN	rs2295103	NaN	0.177716	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.289947	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	12	6	22
chr14	35515957	35515957	C	A	intronic	FAM177A1	NaN	NaN	NaN	rs45530731	NaN	0.0435304	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.026689	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	6	12	9
chr14	35546372	35546372	GT	G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	378.118	0	NaN	NA	NA	228	143	73	5
chr14	35548325	35548325	A	A	intronic	FAM177A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	35550465	35550465	A	A	ncRNA_exonic	LOC101927178	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	27	25	0	0
chr14	35550466	35550466	A	A	ncRNA_exonic	LOC101927178	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	30	24	0	0
chr14	35550467	35550467	G	G	ncRNA_exonic	LOC101927178	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	39	35	0	0
chr14	35564183	35564183	T	T	ncRNA_intronic	LOC101927178	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	35591174	35591174	T	C	UTR5	PPP2R3C	NM_017917:c.-9A>G,NM_001305155:c.-12076A>G,NM_001305156:c.-12076A>G	NaN	NaN	rs1056879	NaN	0.40635	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.558755	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	12	9	21
chr14	35761723	35761723	C	T	exonic	PSMA6	NaN	nonsynonymous SNV	PSMA6:NM_002791:exon1:c.C41T:p.T14I	NaN	NaN	NaN	0	D	0.998	D	0.983	D	0.000	D	1.000	D	3.375	M	0.37	T	0.025	D	0.450	T	0.986	4.454	23.8	5.96	2.826	6.110	18.174	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.420607	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	24	18	6	0
chr14	35761726	35761726	T	A	exonic	PSMA6	NaN	nonsynonymous SNV	PSMA6:NM_002791:exon1:c.T44A:p.I15N	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.979	D	0.000	D	1.000	D	3.745	H	0.76	T	0.103	D	0.425	T	0.814	5.361	34	5.96	2.279	6.280	14.658	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2055335968379435	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr14	35778115	35778115	A	T	intronic	PSMA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.946286	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	108	100	8	0
chr14	35778375	35778375	T	C	intronic	PSMA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2631578947368443	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr14	35778423	35778423	G	G	intronic	PSMA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	35782167	35782167	A	T	exonic	PSMA6	NaN	stopgain	PSMA6:NM_001282233:exon4:c.A253T:p.K85X,PSMA6:NM_001282232:exon5:c.A253T:p.K85X,PSMA6:NM_001282234:exon5:c.A433T:p.K145X,PSMA6:NM_002791:exon5:c.A490T:p.K164X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	5.759	36	5.57	2.233	9.253	16.009	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.069834	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	140	128	12	0
chr14	35873770	35873770	G	A	exonic	NFKBIA	NaN	synonymous SNV	NFKBIA:NM_020529:exon1:c.C81T:p.D27D	rs1957106	NaN	0.244409	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	16.2344	0	8.428096	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	3	3	6
chr14	36003549	36003549	C	G	exonic	INSM2	NaN	nonsynonymous SNV	INSM2:NM_032594:exon1:c.C91G:p.P31A	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.068	B	0.019	B	0.007	U	0.544	D	0.805	L	0.14	T	-0.840	T	0.123	T	0.288	3.295	17.07	4.49	2.320	3.658	11.883	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.283614	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	79	61	18	0
chr14	36003558	36003558	G	C	exonic	INSM2	NaN	nonsynonymous SNV	INSM2:NM_032594:exon1:c.G100C:p.A34P	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.769	P	0.451	P	0.388	U	0.893	N	0.345	N	-0.01	T	-0.961	T	0.148	T	0.449	2.928	15.76	3.23	0.941	2.468	9.646	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.464088	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	181	168	13	0
chr14	36018509	36018509	A	G	ncRNA_intronic	RALGAPA1P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	18	1	17	0
chr14	36074737	36074737	A	G	ncRNA_intronic	RALGAPA1P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.872561	nearby_gap_events	REJECT	210	193	17	0
chr14	36096271	36096271	G	A	ncRNA_intronic	RALGAPA1P	NaN	NaN	NaN	rs201376057	NaN	0.00279553	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.4563	0	NaN	NA	NA	7	6	3	3
chr14	36097350	36097350	T	T	ncRNA_intronic	RALGAPA1P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	36159301	36159301	A	T	ncRNA_intronic	RALGAPA1P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	55.6826	0	8.018708	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	7	1	6	0
chr14	36191116	36191116	A	A	ncRNA_intronic	RALGAPA1P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr14	36303987	36303987	T	T	intronic	BRMS1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	36780714	36780714	T	T	intronic	MBIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	27	26	0	0
chr14	36781386	36781386	T	C	intronic	MBIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	36789775	36789775	A	T	exonic	MBIP	NaN	nonsynonymous SNV	MBIP:NM_001144891:exon1:c.T20A:p.L7H,MBIP:NM_016586:exon1:c.T20A:p.L7H	rs2899849	NaN	0.785942	0.6	T	0.003	B	0.004	B	0.726	N	1.000	P	0	N	0.29	T	-1.003	T	0.000	T	0.432	0.264	5.430	1.35	0.428	0.117	2.885	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.225852	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	0	18	54
chr14	36789795	36789795	G	A	UTR5	MBIP	NM_016586:c.-1C>T,NM_001144891:c.-1C>T	NaN	NaN	rs11558802	NaN	0.786342	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.737352	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	49
chr14	37051427	37051427	C	T	intronic	NKX2-8	NaN	NaN	NaN	rs11624339	NaN	0.227236	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.106565	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	25	20	32
chr14	37069761	37069761	A	A	intergenic	NKX2-8,PAX9	dist=17975;dist=57012	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	37132769	37132769	G	A	intronic	PAX9	NaN	NaN	NaN	rs2236007	NaN	0.166334	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	321.736	0	NaN	NA	NA	126	60	66	19
chr14	37150001	37150001	A	A	intronic	SLC25A21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	37154043	37154043	C	T	exonic	SLC25A21	NaN	nonsynonymous SNV	SLC25A21:NM_001171170:exon8:c.G691A:p.A231T,SLC25A21:NM_030631:exon8:c.G691A:p.A231T	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	2.125	M	-1.38	T	0.384	D	0.681	D	0.804	4.493	24.1	5.67	2.831	7.343	20.110	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	30.1623	0	12.575418	normal_lod	REJECT	10	5	5	0
chr14	37194768	37194768	T	T	intronic	SLC25A21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr14	37738047	37738047	A	A	intronic	MIPOL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr14	37754477	37754477	T	C	intronic	MIPOL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr14	37969259	37969259	A	G	exonic	MIPOL1	NaN	nonsynonymous SNV	MIPOL1:NM_138731:exon13:c.A1178G:p.Q393R,MIPOL1:NM_001195296:exon14:c.A1178G:p.Q393R,MIPOL1:NM_001195297:exon14:c.A1178G:p.Q393R	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.047	B	0.027	B	0.002	N	0.979	N	0.92	L	0.87	T	-1.031	T	0.086	T	0.224	2.047	12.80	2.8	0.386	2.008	9.387	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.432421	nearby_gap_events	REJECT	90	85	5	0
chr14	38060561	38060561	T	G	UTR3	FOXA1	NM_004496:c.*9A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	57	43	14	0
chr14	38061059	38061059	A	A	exonic	FOXA1	NaN	synonymous SNV	FOXA1:NM_004496:exon2:c.T930T:p.H310H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr14	38061264	38061264	G	T	exonic	FOXA1	NaN	nonsynonymous SNV	FOXA1:NM_004496:exon2:c.C725A:p.S242Y	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.965	M	-3.8	D	1.075	D	0.929	D	0.877	4.442	23.7	4.0	2.057	6.445	15.005	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr14	38061265	38061265	A	T	exonic	FOXA1	NaN	nonsynonymous SNV	FOXA1:NM_004496:exon2:c.T724A:p.S242T	NaN	NaN	NaN	0	D	0.989	D	0.993	D	0.000	D	1.000	D	2.85	M	-3.78	D	1.041	D	0.921	D	0.546	4.493	24.1	4.0	1.671	5.982	12.000	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr14	38061275	38061275	C	T	exonic	FOXA1	NaN	synonymous SNV	FOXA1:NM_004496:exon2:c.G714A:p.P238P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	38061951	38061951	G	A	intronic	FOXA1	NaN	NaN	NaN	rs35502972	NaN	0.00738818	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	466.092	0	NaN	NA	NA	117	71	46	2
chr14	38678523	38678523	G	C	UTR5	SSTR1	NM_001049:c.-72G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	23.6367	0	NaN	NA	NA	7	3	4	19
chr14	38678677	38678677	G	C	exonic	SSTR1	NaN	nonsynonymous SNV	SSTR1:NM_001049:exon3:c.G83C:p.R28T	NaN	NaN	NaN	0.59	T	0.001	B	0.0	B	0.779	N	0.663	N	-0.345	N	-0.45	T	-0.997	T	0.128	T	0.328	0.490	6.660	3.6	1.356	.	12.178	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.71877	0	NaN	NA	NA	16	14	3	0
chr14	38679804	38679804	A	G	UTR3	SSTR1	NM_001049:c.*34A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.526745	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	170	163	7	0
chr14	38679901	38679901	G	A	UTR3	SSTR1	NM_001049:c.*131G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	38679902	38679902	T	C	UTR3	SSTR1	NM_001049:c.*132T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	38679903	38679903	G	A	UTR3	SSTR1	NM_001049:c.*133G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	38679904	38679904	G	C	UTR3	SSTR1	NM_001049:c.*134G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	38746591	38746591	C	T	intergenic	CLEC14A,LINC00639	dist=21016;dist=471952	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr14	39517925	39517925	T	C	exonic	SEC23A	NaN	synonymous SNV	SEC23A:NM_006364:exon15:c.A1668G:p.K556K	rs11556216	NaN	0.247804	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	53.2136	0	NaN	NA	NA	50	19	31	15
chr14	39627433	39627433	G	A	intronic	TRAPPC6B	NaN	NaN	NaN	rs35270180	NaN	0.254393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.415925	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	7	5	22
chr14	39645863	39645863	G	A	intronic	PNN	NaN	NaN	NaN	rs2252040	NaN	0.903155	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	196.484	0	50.781812	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	0	17	43
chr14	39647188	39647188	T	A	intronic	PNN	NaN	NaN	NaN	rs68193573	NaN	0.246206	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	327.2	0	NaN	NA	NA	85	64	21	7
chr14	39777676	39777676	G	C	exonic	CTAGE5	NaN	nonsynonymous SNV	CTAGE5:NM_001247988:exon13:c.G991C:p.E331Q,CTAGE5:NM_001247989:exon13:c.G1093C:p.E365Q,CTAGE5:NM_001247990:exon13:c.G853C:p.E285Q,CTAGE5:NM_005930:exon13:c.G1078C:p.E360Q,CTAGE5:NM_203354:exon13:c.G1042C:p.E348Q,CTAGE5:NM_203355:exon13:c.G1078C:p.E360Q,CTAGE5:NM_203356:exon13:c.G991C:p.E331Q	rs1950952	NaN	0.535942	.	.	0.154	B	0.139	B	.	.	0.998	P	1.615	L	2.27	T	-0.900	T	0.000	T	0.074	2.150	13.15	4.5	1.266	2.215	8.212	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	64.542885	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	33
chr14	39784964	39784964	TG	T,TT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	102.479	0	NaN	NA	NA	10	0	4	2
chr14	39817887	39817887	T	A	intronic	CTAGE5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	39817888	39817888	T	C	intronic	CTAGE5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	39818230	39818230	A	G	intronic	CTAGE5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.983473	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	128	118	10	0
chr14	39868556	39868556	C	T	UTR3	FBXO33	NM_203301:c.*164G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	39868558	39868558	C	A	UTR3	FBXO33	NM_203301:c.*162G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr14	39868561	39868561	C	G	UTR3	FBXO33	NM_203301:c.*159G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	39869006	39869006	A	A	intronic	FBXO33	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	39869007	39869007	A	A	intronic	FBXO33	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	39871017	39871017	T	C	exonic	FBXO33	NaN	synonymous SNV	FBXO33:NM_203301:exon3:c.A759G:p.K253K	rs7156962	NaN	0.176717	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	130.245157	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	107	52	55	11
chr14	39871135	39871135	A	A	intronic	FBXO33	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	39871742	39871742	T	C	intronic	FBXO33	NaN	NaN	NaN	rs7158282	NaN	0.176518	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	30.1359	0	NaN	NA	NA	277	120	157	0
chr14	42355771	42355771	C	T	intronic	LRFN5	NaN	NaN	NaN	rs721222	NaN	0.703674	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	123.91	0	NaN	NA	NA	74	46	28	45
chr14	44974231	44974231	C	T	exonic	FSCB	NaN	nonsynonymous SNV	FSCB:NM_032135:exon1:c.G1960A:p.A654T	NaN	NaN	NaN	0.7	T	0.998	D	0.948	D	.	.	1.000	N	1.895	L	2.46	T	-1.026	T	0.088	T	0.137	1.569	11.20	4.35	2.432	-0.088	14.784	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.365291	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	28	24	4	0
chr14	44975052	44975052	A	G	exonic	FSCB	NaN	nonsynonymous SNV	FSCB:NM_032135:exon1:c.T1139C:p.L380P	rs3825630	ID=COSM147770;OCCURENCE=1(stomach)	0.271166	0.28	T	0.004	B	0.003	B	.	.	1.000	P	0.49	N	2.27	T	-0.903	T	0.000	T	0.022	0.163	4.879	-0.16	-0.139	-0.903	6.212	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	137.650728	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	118	62	56	11
chr14	44975510	44975510	C	T	exonic	FSCB	NaN	synonymous SNV	FSCB:NM_032135:exon1:c.G681A:p.P227P	rs3809430	NaN	0.324481	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	152	84	68	30
chr14	45370175	45370175	A	C	ncRNA_intronic	LOC101927418	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr14	45370177	45370177	C	G	ncRNA_intronic	LOC101927418	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	45431635	45431635	C	G	exonic	FAM179B	NaN	nonsynonymous SNV	FAM179B:NM_015091:exon1:c.C11G:p.A4G	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.534	P	0.382	B	0.008	N	1.000	N	0.695	N	2.32	T	-1.030	T	0.081	T	0.283	2.985	15.95	3.07	0.657	1.192	7.429	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	102	72	30	0
chr14	45431870	45431870	G	A	exonic	FAM179B	NaN	stopgain	FAM179B:NM_015091:exon1:c.G246A:p.W82X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.001	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.986	29.2	4.88	2.526	4.113	13.404	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.388446	nearby_gap_events	REJECT	87	80	7	0
chr14	45433155	45433155	C	G	exonic	FAM179B	NaN	nonsynonymous SNV	FAM179B:NM_015091:exon1:c.C1531G:p.L511V	rs3742591	NaN	0.0543131	0.17	T	0.998	D	0.996	D	0.002	N	0.000	P	1.8	L	-0.24	T	-0.853	T	0.015	T	0.482	1.580	11.24	-2.16	-0.598	0.802	5.377	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.556449	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	30	17	6
chr14	45495254	45495254	T	C	intronic	FAM179B	NaN	NaN	NaN	rs73348075	NaN	0.0720847	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.365726	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	19	19	3
chr14	45501384	45501384	A	G	intronic	FAM179B	NaN	NaN	NaN	rs73348095	NaN	0.140575	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5067	0	NaN	NA	NA	20	10	10	1
chr14	45577594	45577594	T	A	intronic	PRPF39	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.925733	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	67	60	7	0
chr14	45579952	45579952	C	A	exonic	PRPF39	NaN	nonsynonymous SNV	PRPF39:NM_017922:exon10:c.C1504A:p.L502I	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.998	D	0.941	D	0.000	D	1.000	D	2.275	M	1.3	T	-0.805	T	0.221	T	0.309	3.466	17.75	5.38	2.531	4.840	18.725	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.408946	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	117	109	8	0
chr14	45620772	45620772	T	C	intronic	FANCM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.050331	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	106	99	7	0
chr14	45628279	45628279	GTTTTTA	GTTTTA,GTTTT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	172.461	0	NaN	NA	NA	78	41	17	1
chr14	45633522	45633522	A	G	intronic	FANCM	NaN	NaN	NaN	rs78455731	NaN	0.10643	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.986553	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	10	9	9
chr14	45636412	45636412	A	G	intronic	FANCM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr14	45654597	45654597	T	A	intronic	FANCM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.338546	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	101	92	9	0
chr14	45696037	45696037	T	G	exonic	MIS18BP1	NaN	nonsynonymous SNV	MIS18BP1:NM_018353:exon10:c.A1749C:p.E583D	rs34101857	NaN	0.107029	0.33	T	0.009	B	0.008	B	0.002	N	1.000	P	1.5	L	2.07	T	-1.039	T	0.001	T	0.015	2.543	14.46	-1.47	-0.185	1.019	0.480	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	294.75	0	NaN	NA	NA	177	104	73	8
chr14	45716573	45716573	A	G	UTR5	MIS18BP1	NM_018353:c.-84T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr14	47314872	47314872	AAT	A,AA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	74.728	0	NaN	NA	NA	8	0	4	0
chr14	47613299	47613299	A	G	exonic	MDGA2	NaN	synonymous SNV	MDGA2:NM_001113498:exon4:c.T567C:p.Y189Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.355814	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	190	184	6	0
chr14	48143827	48143827	G	T	UTR5	MDGA2	NM_001113498:c.-35C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	-0.1	T	-0.592	T	0.298	T	0.061	2.081	12.92	4.55	2.530	1.434	13.036	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.975797	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	162	150	12	2
chr14	48143828	48143828	T	G	UTR5	MDGA2	NM_001113498:c.-36A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	-0.12	T	-0.898	T	0.213	T	0.11	1.133	9.616	0.901	-0.029	0.263	6.945	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.761349	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	150	135	15	0
chr14	48271290	48271290	C	A	intergenic	LINC00648,RPS29	dist=7073;dist=1772100	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	50065717	50065717	G	C	UTR5	LRR1	NM_152329:c.-22G>C,NM_203467:c.-22G>C	NaN	NaN	rs2281836	NaN	0.565895	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	208.113671	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	74	0	74	55
chr14	50069169	50069169	G	C	exonic	LRR1	NaN	nonsynonymous SNV	LRR1:NM_152329:exon2:c.G265C:p.D89H,LRR1:NM_203467:exon2:c.G265C:p.D89H	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.925	M	0.7	T	-0.207	T	0.392	T	0.908	4.810	27.2	5.99	2.864	9.170	20.135	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.167939	clustered_read_position	REJECT	5	2	3	0
chr14	50069170	50069170	A	G	exonic	LRR1	NaN	nonsynonymous SNV	LRR1:NM_152329:exon2:c.A266G:p.D89G,LRR1:NM_203467:exon2:c.A266G:p.D89G	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.925	M	0.71	T	-0.188	T	0.369	T	0.943	4.782	26.9	5.99	2.310	8.682	16.205	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.367534	clustered_read_position	REJECT	5	2	3	0
chr14	50088147	50088147	G	GC	exonic	MGAT2	NaN	frameshift substitution	MGAT2:NM_002408:exon1:c.161_161delinsGC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	42.1378	0	NaN	NA	NA	7	1	4	0
chr14	50110319	50110319	T	T	UTR3	POLE2	NM_001197330:c.*51A>A,NM_002692:c.*51A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	50122258	50122258	T	C	intronic	POLE2	NaN	NaN	NaN	rs9671528	NaN	0.143171	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	23.1146	0	NaN	NA	NA	48	20	28	2
chr14	50122281	50122281	T	A	intronic	POLE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.78728	0	NaN	NA	NA	23	19	4	3
chr14	50131251	50131251	T	T	intronic	POLE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr14	50131728	50131728	T	C	intronic	POLE2	NaN	NaN	NaN	rs35615446	NaN	0.147564	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.128164	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	17	8	16
chr14	50131846	50131846	G	T	exonic	POLE2	NaN	synonymous SNV	POLE2:NM_001197330:exon7:c.C534A:p.V178V,POLE2:NM_001197331:exon8:c.C612A:p.V204V,POLE2:NM_002692:exon8:c.C612A:p.V204V	rs3218791	NaN	0.207468	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.946209	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	19	12	18
chr14	50133008	50133008	T	G	intronic	POLE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr14	50133033	50133033	T	C	intronic	POLE2	NaN	NaN	NaN	rs3218797	NaN	0.14377	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.873493	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	23	13	16
chr14	50133057	50133057	C	T	exonic	POLE2	NaN	synonymous SNV	POLE2:NM_001197330:exon6:c.G489A:p.Q163Q,POLE2:NM_001197331:exon7:c.G567A:p.Q189Q,POLE2:NM_002692:exon7:c.G567A:p.Q189Q	rs3218798	NaN	0.00638978	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	46.913	0	28.068057	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	23	13	2
chr14	50140888	50140888	T	C	exonic	POLE2	NaN	nonsynonymous SNV	POLE2:NM_001197330:exon4:c.A292G:p.R98G,POLE2:NM_001197331:exon5:c.A370G:p.R124G,POLE2:NM_002692:exon5:c.A370G:p.R124G	NaN	NaN	NaN	0.31	T	0.698	P	0.108	B	0.000	D	1.000	D	1.445	L	1.93	T	-1.095	T	0.059	T	0.58	3.186	16.66	5.32	1.996	5.305	14.950	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.860437	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	142	136	6	0
chr14	50199375	50199375	A	C	intronic	KLHDC1	NaN	NaN	NaN	rs10146753	NaN	0.908147	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2153.54	0	NaN	NA	NA	179	1	178	35
chr14	50246553	50246553	A	A	intronic	KLHDC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr14	50246910	50246910	T	G	intronic	KLHDC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	3	2	0
chr14	50251369	50251369	A	G	exonic	NEMF	NaN	synonymous SNV	NEMF:NM_001301732:exon32:c.T3153C:p.N1051N,NEMF:NM_004713:exon33:c.T3216C:p.N1072N	rs10143621	NaN	0.958866	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	382.576	0	116.732437	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	0	39	36
chr14	50251888	50251888	C	T	intronic	NEMF	NaN	NaN	NaN	rs8009346	NaN	0.958067	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	356.094698	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	117	0	117	57
chr14	50266334	50266334	T	T	intronic	NEMF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	37	26	0	0
chr14	50267038	50267038	T	T	intronic	NEMF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	50298962	50298962	T	A	exonic	NEMF	NaN	nonsynonymous SNV	NEMF:NM_001301732:exon9:c.A769T:p.S257C,NEMF:NM_004713:exon9:c.A769T:p.S257C	rs3100906	NaN	0.927316	0.1	T	0.999	D	0.976	D	0.000	D	0.000	P	2.71	M	0.94	T	-1.076	T	0.000	T	0.784	4.242	22.1	5.33	2.017	4.464	14.460	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.002194	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	36
chr14	50300280	50300280	A	C	intronic	NEMF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr14	50301046	50301046	A	T	intronic	NEMF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.518671	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	154	140	14	0
chr14	50301047	50301047	T	G	intronic	NEMF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.048172	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	220	207	13	0
chr14	50307417	50307417	TA	AA,T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	86.2387	0	NaN	NA	NA	16	0	4	1
chr14	50319499	50319499	G	T	UTR5	NEMF	NM_004713:c.-28C>A,NM_001301732:c.-28C>A	NaN	NaN	rs3100887	NaN	0.959665	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	310.801	0	NaN	NA	NA	27	0	27	53
chr14	50360878	50360878	A	G	exonic	ARF6	NaN	nonsynonymous SNV	ARF6:NM_001663:exon2:c.A424G:p.T142A	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.0	B	0.0	B	0.000	D	1.000	D	0.78	N	0.0	T	-0.964	T	0.147	T	0.642	2.062	12.85	2.56	0.219	9.303	11.746	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.213148		KEEP	39	34	5	0
chr14	50550318	50550318	T	C	downstream	C14orf183	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	18	12	5	0
chr14	50606897	50606897	A	G	intronic	SOS2	NaN	NaN	NaN	rs2024808	NaN	0.884784	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	122	1	121	56
chr14	50619927	50619927	A	G	intronic	SOS2	NaN	NaN	NaN	rs11628935	NaN	0.247204	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.364569	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	17	12	37
chr14	50626749	50626749	T	G	exonic	SOS2	NaN	nonsynonymous SNV	SOS2:NM_006939:exon10:c.A1252C:p.K418Q	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.781	P	0.248	B	0.000	D	1.000	D	1.995	M	-2.33	D	0.089	D	0.559	D	0.46	2.920	15.73	5.55	2.109	4.891	15.710	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.462391	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	153	141	12	0
chr14	50626750	50626750	G	A	exonic	SOS2	NaN	synonymous SNV	SOS2:NM_006939:exon10:c.C1251T:p.I417I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.412124	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	177	165	12	0
chr14	50626751	50626751	A	T	exonic	SOS2	NaN	nonsynonymous SNV	SOS2:NM_006939:exon10:c.T1250A:p.I417N	NaN	NaN	NaN	0	D	0.951	P	0.594	P	0.000	N	1.000	D	2.095	M	-2.52	D	0.541	D	0.704	D	0.79	4.203	21.8	5.55	2.109	9.196	15.710	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.016318	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	178	166	12	0
chr14	50666547	50666547	G	A	exonic	SOS2	NaN	synonymous SNV	SOS2:NM_006939:exon4:c.C372T:p.Y124Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.612323	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	160	154	6	0
chr14	50745168	50745168	T	T	intronic	L2HGDH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr14	50750577	50750577	A	G	intronic	L2HGDH	NaN	NaN	NaN	rs12433038	NaN	0.504792	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	117.664	0	NaN	NA	NA	137	0	137	6
chr14	50769677	50769677	G	A	exonic	L2HGDH	NaN	nonsynonymous SNV	L2HGDH:NM_024884:exon2:c.C199T:p.L67F	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	3.48	M	-3.51	D	1.064	D	0.937	D	0.884	5.235	33	5.35	2.894	9.277	19.959	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.868412	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	140	136	4	0
chr14	50808793	50808793	T	A	intronic	CDKL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	50808795	50808795	G	C	intronic	CDKL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	50808797	50808797	A	G	intronic	CDKL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	50808798	50808798	T	C	intronic	CDKL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	50901113	50901113	T	C	exonic	MAP4K5	NaN	synonymous SNV	MAP4K5:NM_006575:exon27:c.A2163G:p.A721A,MAP4K5:NM_198794:exon27:c.A2163G:p.A721A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.719428	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	156	151	5	0
chr14	50901327	50901327	A	G	intronic	MAP4K5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.377175	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	33	30	3	0
chr14	50911942	50911942	A	G	intronic	MAP4K5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	3	2	0
chr14	50914082	50914082	T	C	intronic	MAP4K5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.417727	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	177	168	9	0
chr14	50915594	50915594	G	A	intronic	MAP4K5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.02805	0	NaN	NA	NA	21	18	3	0
chr14	50929578	50929578	A	C	intronic	MAP4K5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	50943063	50943063	A	C	intronic	MAP4K5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	3	2	0
chr14	50943065	50943065	A	T	intronic	MAP4K5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr14	50943069	50943069	T	T	intronic	MAP4K5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	50971691	50971691	A	A	intronic	MAP4K5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr14	50998689	50998689	C	A	exonic	MAP4K5	NaN	nonsynonymous SNV	MAP4K5:NM_006575:exon2:c.G79T:p.G27C,MAP4K5:NM_198794:exon2:c.G79T:p.G27C	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	4.5	H	0.08	T	0.991	D	0.838	D	0.947	4.298	22.5	4.25	2.081	6.693	15.577	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.578302	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	104	95	9	0
chr14	50998692	50998692	C	A	exonic	MAP4K5	NaN	nonsynonymous SNV	MAP4K5:NM_006575:exon2:c.G76T:p.V26F,MAP4K5:NM_198794:exon2:c.G76T:p.V26F	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	1.61	L	2.45	T	-0.562	T	0.248	T	0.876	4.442	23.7	4.25	2.081	3.984	15.577	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.302021	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	102	91	11	0
chr14	50998693	50998693	C	A	exonic	MAP4K5	NaN	nonsynonymous SNV	MAP4K5:NM_006575:exon2:c.G75T:p.R25S,MAP4K5:NM_198794:exon2:c.G75T:p.R25S	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.565	P	0.597	P	0.000	D	1.000	D	1.15	L	1.83	T	-0.702	T	0.229	T	0.785	3.541	18.07	3.34	0.881	1.402	8.176	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.800895	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	102	94	8	0
chr14	51079917	51079917	T	G	intronic	ATL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr14	51079919	51079919	T	T	intronic	ATL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr14	51081285	51081285	A	C	intronic	ATL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	51081292	51081292	C	G	intronic	ATL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	51107400	51107400	G	A	intronic	SAV1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr14	51111369	51111369	T	T	intronic	SAV1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr14	51132398	51132398	T	C	intronic	SAV1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr14	51192456	51192456	A	C	intronic	NIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	51192457	51192457	C	G	intronic	NIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr14	51192479	51192479	A	G	intronic	NIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	95.3743	0	NaN	NA	NA	111	68	24	2
chr14	51219202	51219202	T	C	intronic	NIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	14	5	8	0
chr14	51223106	51223106	G	T	intronic	NIN	NaN	NaN	NaN	rs2295846	NaN	0.381789	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	68.4036	0	NaN	NA	NA	72	36	36	24
chr14	51224374	51224374	T	G	exonic	NIN	NaN	nonsynonymous SNV	NIN:NM_020921:exon18:c.A3374C:p.Q1125P,NIN:NM_182944:exon18:c.A3374C:p.Q1125P,NIN:NM_182946:exon18:c.A3374C:p.Q1125P	rs12882191	NaN	0.784944	0.85	T	0.0	B	0.0	B	0.119	N	1.000	P	-2.125	N	3.58	T	-1.024	T	0.000	T	0.384	-3.043	0.001	4.07	0.851	0.518	3.893	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	54.384366	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	19	24	56
chr14	51226549	51226549	A	G	intronic	NIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	51226553	51226553	T	C	intronic	NIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	0	2	0
chr14	51228690	51228690	T	A	intronic	NIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	51228691	51228691	C	A	intronic	NIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	51228692	51228692	T	C	intronic	NIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	51239750	51239750	A	G	exonic	NIN	NaN	nonsynonymous SNV	NIN:NM_016350:exon8:c.T730C:p.Y244H,NIN:NM_020921:exon8:c.T730C:p.Y244H,NIN:NM_182944:exon8:c.T730C:p.Y244H,NIN:NM_182946:exon8:c.T730C:p.Y244H	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.963	D	0.715	P	0.000	D	0.706	D	0.805	L	1.94	T	-1.018	T	0.054	T	0.399	3.002	16.01	3.7	0.767	4.207	10.262	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	39.922996	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	599	559	40	0
chr14	51339133	51339133	G	G	intronic	ABHD12B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr14	51347353	51347353	A	G	intronic	ABHD12B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	16	9	4	0
chr14	51353493	51353493	T	C	intronic	ABHD12B	NaN	NaN	NaN	rs7158183	NaN	0.967851	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	5905.88	0	NaN	NA	NA	596	3	593	23
chr14	51371177	51371177	G	G	UTR3	ABHD12B	NM_181814:c.*93G>G,NM_001206673:c.*93G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr14	51387844	51387844	A	G	intronic	PYGL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	6	4	0
chr14	51390661	51390661	G	T	intronic	PYGL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	51390666	51390666	C	T	intronic	PYGL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	3	2	0
chr14	51411091	51411091	G	C	exonic	PYGL	NaN	nonsynonymous SNV	PYGL:NM_001163940:exon1:c.C31G:p.R11G,PYGL:NM_002863:exon1:c.C31G:p.R11G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.986	D	0.872	P	0.000	D	1.000	D	2.56	M	-3.27	D	0.885	D	0.876	D	0.874	4.064	20.9	3.34	0.981	0.710	11.236	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr14	51489750	51489750	A	C	intronic	TRIM9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	36	9	27	0
chr14	51491956	51491956	T	C	intronic	TRIM9	NaN	NaN	NaN	rs11848681	NaN	0.453275	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	66.8951	0	NaN	NA	NA	55	32	23	21
chr14	51492147	51492147	A	C	intronic	TRIM9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	51492150	51492150	A	G	intronic	TRIM9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	51492153	51492153	G	A	intronic	TRIM9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	51492155	51492155	A	T	intronic	TRIM9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	51710543	51710543	C	C	intronic	TMX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	200	149	0	0
chr14	51716172	51716172	T	C	intronic	TMX1	NaN	NaN	NaN	rs369308356	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.03764784274529443	NA	0	0	13.332813	nearby_gap_events	REJECT	72	62	10	0
chr14	52167659	52167659	A	T	intronic	FRMD6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	52179344	52179344	T	G	intronic	FRMD6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.364204	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	174	166	8	0
chr14	52192293	52192293	T	C	intronic	FRMD6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr14	52470798	52470798	A	G	intronic	C14orf166	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.121004	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	117	111	6	0
chr14	52470996	52470996	T	A	intronic	C14orf166	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.506497	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	200	182	18	0
chr14	52472633	52472633	A	A	intronic	NID2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	52473418	52473418	T	C	intronic	NID2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.05651	nearby_gap_events	REJECT	211	201	10	0
chr14	52481615	52481615	T	T	intronic	NID2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	52481916	52481916	C	CT	exonic	NID2	NaN	frameshift substitution	NID2:NM_007361:exon15:c.3106_3106delinsAG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3670.75	0	NaN	NA	NA	519	0	66	5
chr14	52481918	52481918	C	G	exonic	NID2	NaN	nonsynonymous SNV	NID2:NM_007361:exon15:c.G3104C:p.R1035P	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.994	D	0.841	P	0.052	N	0.999	N	0.515	N	-0.02	T	-0.850	T	0.224	T	0.745	1.702	11.65	4.79	1.396	1.560	11.192	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	13.7541	0	NaN	NA	NA	517	451	66	2
chr14	52486706	52486706	G	C	intronic	NID2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	52505772	52505772	T	G	intronic	NID2	NaN	NaN	NaN	rs2029977	NaN	0.989417	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	47	0	47	0
chr14	52509071	52509071	A	T	intronic	NID2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.344728	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	776	744	32	0
chr14	52509601	52509601	C	T	exonic	NID2	NaN	nonsynonymous SNV	NID2:NM_007361:exon6:c.G1478A:p.R493K	rs111989036	NaN	0.00259585	1	T	0.323	B	0.079	B	0.398	N	1.000	N	1.175	L	-1.53	D	-0.774	T	0.294	T	0.172	-0.749	0.820	1.77	0.108	1.727	6.318	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	87.917818	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	61	27	34	5
chr14	52509689	52509689	A	G	intronic	NID2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr14	52509690	52509690	T	A	intronic	NID2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	52509692	52509692	C	G	intronic	NID2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	52509696	52509696	T	G	intronic	NID2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	52732019	52732019	G	A	intergenic	NID2,PTGDR	dist=196073;dist=2412	NaN	NaN	rs809721	NaN	0.3748	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	52923779	52923779	C	T	intronic	TXNDC16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.094635	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	114	105	9	0
chr14	52923783	52923783	A	T	intronic	TXNDC16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.001845	nearby_gap_events	REJECT	86	74	12	0
chr14	53020188	53020188	G	T	exonic	GPR137C	NaN	nonsynonymous SNV	GPR137C:NM_001099652:exon1:c.G323T:p.G108V	NaN	NaN	NaN	0.64	T	0.95	P	0.698	P	0.050	N	1.000	D	0.145	N	1.04	T	-1.083	T	0.069	T	0.416	-0.683	1.028	3.55	0.869	5.591	6.377	100	11	3035	SNV	VtSM	3	Somatic	0.025116230540557918	NA	0	47	21.435293	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	27	18	9	0
chr14	53020196	53020196	C	T	exonic	GPR137C	NaN	nonsynonymous SNV	GPR137C:NM_001099652:exon1:c.C331T:p.P111S	NaN	NaN	NaN	0.25	T	1.0	D	0.996	D	0.000	D	0.730	D	0.69	N	1.02	T	-0.788	T	0.147	T	0.453	1.407	10.64	3.88	0.979	1.171	12.952	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	17	16.230999	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	27	18	9	0
chr14	53020197	53020197	C	T	exonic	GPR137C	NaN	nonsynonymous SNV	GPR137C:NM_001099652:exon1:c.C332T:p.P111L	NaN	NaN	NaN	0.55	T	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	0.69	N	0.97	T	-1.045	T	0.103	T	0.643	2.152	13.15	4.62	2.117	0.909	14.980	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	41	20.209179	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	26	17	9	0
chr14	53020393	53020393	G	G	intronic	GPR137C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	22	21	0	0
chr14	53101982	53101982	A	T	UTR3	GPR137C	NM_001099652:c.*149A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.767118	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	112	95	17	0
chr14	53101983	53101983	T	A	UTR3	GPR137C	NM_001099652:c.*150T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.831108	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	105	88	17	0
chr14	53178385	53178385	A	A	intronic	PSMC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr14	53197159	53197159	T	T	UTR5	STYX	NM_145251:c.-34T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr14	53197165	53197165	C	C	UTR5	STYX	NM_145251:c.-28C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr14	53224424	53224424	T	C	intronic	STYX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr14	53245197	53245197	A	T	intronic	GNPNAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	32	8	24	0
chr14	53247503	53247503	T	G	intronic	GNPNAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.55312	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	107	100	7	0
chr14	53250264	53250264	A	A	intronic	GNPNAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	17	12	0	0
chr14	53251054	53251054	T	G	intronic	GNPNAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr14	53251470	53251470	T	C	intronic	GNPNAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	53251471	53251471	A	G	intronic	GNPNAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	53326487	53326487	A	A	intronic	FERMT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	53326488	53326488	C	T	intronic	FERMT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr14	53326489	53326489	T	C	intronic	FERMT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr14	53342166	53342166	A	C	intronic	FERMT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	13	8	5	0
chr14	53345266	53345266	G	C	intronic	FERMT2	NaN	NaN	NaN	rs2357946	NaN	0.766973	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	93.563539	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	0	30	33
chr14	53513478	53513478	AAG	A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3217.14	0	NaN	NA	NA	357	9	343	19
chr14	53619463	53619463	G	A	exonic	DDHD1	NaN	synonymous SNV	DDHD1:NM_001160147:exon1:c.C354T:p.H118H,DDHD1:NM_001160148:exon1:c.C354T:p.H118H,DDHD1:NM_030637:exon1:c.C354T:p.H118H	rs2358188	NaN	0.752196	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.652604	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	22
chr14	54863703	54863703	G	C	UTR5	CDKN3	NM_001130851:c.-84G>C,NM_005192:c.-84G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.935308	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	77	70	7	0
chr14	54875514	54875514	A	G	intronic	CDKN3	NaN	NaN	NaN	rs2179896	ID=COSM147780;OCCURENCE=1(stomach)	0.686502	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	23.6361	0	8.513371	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	3	4	5
chr14	54903314	54903314	A	A	intronic	CNIH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	54948983	54948983	A	A	intronic	GMFB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	54996630	54996630	G	A	intronic	CGRRF1	NaN	NaN	NaN	rs17127622	NaN	0.114617	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	87.383489	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	24	36	1
chr14	54997589	54997589	T	C	intronic	CGRRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	54997590	54997590	A	G	intronic	CGRRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	54997591	54997591	G	A	intronic	CGRRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	55169403	55169403	A	T	intronic	SAMD4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr14	55203703	55203703	G	T	intronic	SAMD4A	NaN	NaN	NaN	rs10133272	NaN	0.258786	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	630.54	0	NaN	NA	NA	221	72	149	6
chr14	55244418	55244418	T	C	intronic	SAMD4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr14	55262608	55262608	T	G	intergenic	SAMD4A,GCH1	dist=2575;dist=46116	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr14	55262609	55262609	T	A	intergenic	SAMD4A,GCH1	dist=2576;dist=46115	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr14	55262653	55262653	G	A	intergenic	SAMD4A,GCH1	dist=2620;dist=46071	NaN	NaN	rs6572976	NaN	0.606629	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr14	55309833	55309833	T	A	UTR3	GCH1	NM_000161:c.*902A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.872237	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	170	152	18	0
chr14	55309835	55309835	A	T	UTR3	GCH1	NM_000161:c.*900T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	60	44	16	0
chr14	55309853	55309853	A	G	UTR3	GCH1	NM_000161:c.*882T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.419455	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	187	181	6	0
chr14	55424401	55424401	A	G	intronic	WDHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.653512	possible_contamination	REJECT	63	59	4	0
chr14	55424443	55424443	A	A	intronic	WDHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr14	55433829	55433829	T	T	intronic	WDHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr14	55455537	55455537	T	T	intronic	WDHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	55455541	55455541	T	T	intronic	WDHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr14	55528376	55528376	T	C	intronic	MAPK1IP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.10344827586207013	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr14	55528428	55528428	A	G	intronic	MAPK1IP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.06417112299465265	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr14	55604849	55604849	C	G	exonic	LGALS3	NaN	synonymous SNV	LGALS3:NM_001177388:exon3:c.C105G:p.G35G,LGALS3:NM_002306:exon3:c.C105G:p.G35G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.977605	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	57	50	7	0
chr14	55606929	55606929	A	C	intronic	LGALS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr14	55617589	55617589	T	C	intronic	DLGAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.129222	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	62	54	8	0
chr14	55618797	55618797	A	A	intronic	DLGAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr14	55642463	55642463	T	T	intronic	DLGAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr14	55648115	55648115	C	T	intronic	DLGAP5	NaN	NaN	NaN	rs58737648	NaN	0.239417	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	342.739	0	NaN	NA	NA	192	110	82	4
chr14	55650488	55650488	C	C	intronic	DLGAP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr14	56104478	56104478	T	T	intronic	KTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	56107824	56107824	T	A	intronic	KTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.89691	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	80	67	13	0
chr14	56122714	56122714	T	C	intronic	KTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.366339	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	199	178	21	0
chr14	56142515	56142515	C	T	intronic	KTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.247957	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	82	73	9	0
chr14	56763196	56763196	T	T	intronic	PELI2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	88	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr14	57046664	57046664	C	G	exonic	TMEM260	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM260:NM_017799:exon1:c.C32G:p.A11G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.0	B	0.001	B	0.857	N	0.999	N	0	N	1.41	T	-1.013	T	0.072	T	0.06	1.879	12.24	2.15	0.819	0.316	7.960	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.12422360248447085	NA	0	0	NaN	NA	NA	12	9	3	0
chr14	57046829	57046829	C	A	intronic	TMEM260	NaN	NaN	NaN	rs2275025	NaN	0.319489	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	57088604	57088604	T	C	intronic	TMEM260	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.369454	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	38	34	4	0
chr14	57088606	57088606	G	C	intronic	TMEM260	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.565173	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	38	34	4	0
chr14	57092038	57092038	A	G	intronic	TMEM260	NaN	NaN	NaN	rs2274706	NaN	0.396765	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	29.9581	0	NaN	NA	NA	173	86	87	4
chr14	57099859	57099859	G	A	exonic	TMEM260	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM260:NM_017799:exon13:c.G1694A:p.S565N	rs1041316	NaN	0.704073	1	T	0.0	B	0.0	B	0.003	N	1.000	P	-1.79	N	1.57	T	-0.975	T	0.000	T	0.033	-1.492	0.017	1.69	-0.202	1.028	4.075	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	62.2465	0	NaN	NA	NA	7	0	7	3
chr14	57113905	57113905	A	G	intronic	TMEM260	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.250743	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	32	25	7	0
chr14	57270951	57270951	T	C	exonic	OTX2	NaN	synonymous SNV	OTX2:NM_001270525:exon2:c.A228G:p.R76R,OTX2:NM_172337:exon2:c.A204G:p.R68R,OTX2:NM_001270524:exon3:c.A204G:p.R68R,OTX2:NM_001270523:exon4:c.A204G:p.R68R,OTX2:NM_021728:exon4:c.A228G:p.R76R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03306100432521493	NA	0	0	NaN	NA	NA	114	78	36	32
chr14	57277160	57277160	T	G	UTR5	OTX2	NM_001270523:c.-4986A>C,NM_021728:c.-4986A>C,NM_001270524:c.-4986A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr14	57676251	57676251	T	A	intronic	EXOC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	86	55	29	0
chr14	57686115	57686115	T	T	exonic	EXOC5	NaN	synonymous SNV	EXOC5:NM_006544:exon14:c.A1451A:p.D484D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	194	174	0	0
chr14	57704025	57704025	A	T	intronic	EXOC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	72	NaN	NA	NA	16	14	2	0
chr14	57706531	57706531	A	A	intronic	EXOC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	57740793	57740793	T	G	intronic	AP5M1	NaN	NaN	NaN	rs1189898	NaN	0.75619	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	889.339	0	NaN	NA	NA	96	5	91	36
chr14	57747157	57747157	A	T	intronic	AP5M1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	57748904	57748904	A	T	exonic	AP5M1	NaN	nonsynonymous SNV	AP5M1:NM_018229:exon4:c.A1046T:p.N349I	NaN	NaN	NaN	0.03	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.455	M	2.06	T	-0.872	T	0.157	T	0.833	4.707	26.1	6.06	2.315	5.993	16.615	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.188828	nearby_gap_events	REJECT	55	48	7	0
chr14	57749760	57749760	T	A	intronic	AP5M1	NaN	NaN	NaN	rs371177711	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.271157	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	392	369	23	0
chr14	57749769	57749769	T	C	intronic	AP5M1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.951817	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	610	588	22	0
chr14	57858519	57858519	A	A	intronic	NAA30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr14	57948380	57948380	T	C	splicing	C14orf105	NM_018168:exon5:c.394-2A>G	NaN	NaN	rs1152522	NaN	0.685104	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	0.088	4.474	2.75	0.805	0.278	5.919	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	42.5052	0	16.378407	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	12	8	52
chr14	57949952	57949952	A	A	intronic	C14orf105	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr14	58332289	58332289	G	T	intronic	SLC35F4	NaN	NaN	NaN	rs77375107	NaN	0.086262	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.326269	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	2	8	2
chr14	58332368	58332368	C	A	intronic	SLC35F4	NaN	NaN	NaN	rs72624732	NaN	0.0902556	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.219146	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	3	4	1
chr14	58410605	58410605	T	C	intergenic	SLC35F4,C14orf37	dist=78013;dist=60203	NaN	NaN	rs12433801	NaN	0.0678914	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr14	58669661	58669661	T	A	intronic	ACTR10	NaN	NaN	NaN	rs74757538	NaN	0.229233	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	53	50	3	1
chr14	58698902	58698902	C	A	exonic	ACTR10	NaN	nonsynonymous SNV	ACTR10:NM_018477:exon12:c.C989A:p.P330Q	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	2.75	M	-3.85	D	1.055	D	0.933	D	0.628	4.735	26.4	5.66	2.826	7.687	19.092	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.252617	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	74	65	9	0
chr14	58768236	58768236	A	C	intronic	ARID4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	58768237	58768237	C	A	intronic	ARID4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	58768238	58768238	T	A	intronic	ARID4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	58768465	58768465	A	A	intronic	ARID4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	58796233	58796233	T	T	intronic	ARID4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr14	58833537	58833537	A	G	intronic	ARID4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.217709	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	190	181	9	0
chr14	58838555	58838555	T	C	intronic	ARID4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	2	7	0
chr14	58863220	58863220	A	A	intronic	TOMM20L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	58878590	58878590	T	G	intronic	TIMM9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1538461538461531	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr14	58895022	58895022	A	G	exonic	KIAA0586	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA0586:NM_014749:exon1:c.A40G:p.I14V,KIAA0586:NM_001244189:exon2:c.A76G:p.I26V	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	N	.	.	1.24	T	-1.005	T	0.026	T	0.017	-2.229	0.005	-3.05	-0.747	0.104	2.156	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.682006	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	132	121	11	0
chr14	58917225	58917225	C	G	intronic	KIAA0586	NaN	NaN	NaN	rs1748970	NaN	0.997404	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	195.358	0	47.942316	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	0	20	53
chr14	58926527	58926527	C	T	intronic	KIAA0586	NaN	NaN	NaN	rs1748980	NaN	0.978035	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	239.941531	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	83	0	83	55
chr14	58943822	58943822	T	G	intronic	KIAA0586	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr14	58943824	58943824	C	C	intronic	KIAA0586	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	173	167	0	0
chr14	58954523	58954523	T	C	intronic	KIAA0586	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	13	4	7	0
chr14	58956846	58956846	T	C	intronic	KIAA0586	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.7101	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	113	103	10	0
chr14	58975092	58975092	T	G	intronic	KIAA0586	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr14	58975093	58975093	C	A	intronic	KIAA0586	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	58975095	58975095	C	G	intronic	KIAA0586	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	3	3	0
chr14	59112732	59112732	C	T	exonic	DACT1	NaN	nonsynonymous SNV	DACT1:NM_001079520:exon4:c.C1280T:p.A427V,DACT1:NM_016651:exon4:c.C1391T:p.A464V	rs17832998	NaN	0.269569	0.31	T	0.033	B	0.02	B	0.228	N	1.000	P	0.715	N	0.79	T	-0.969	T	0.000	T	0.061	0.606	7.265	2.42	0.206	0.062	8.585	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	404.781	0	NaN	NA	NA	145	67	78	17
chr14	59787324	59787324	TG	T,TC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	72.9939	0	NaN	NA	NA	13	3	5	0
chr14	59787325	59787325	G	C	intronic	DAAM1	NaN	NaN	NaN	rs45610932	NaN	0.0303514	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.134726	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	7	3	4	2
chr14	59787326	59787326	T	C	intronic	DAAM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.50481	0	NaN	NA	NA	14	13	2	0
chr14	59789983	59789983	A	A	intronic	DAAM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	59793564	59793564	T	T	intronic	DAAM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	15	12	0	0
chr14	59793815	59793815	A	T	intronic	DAAM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	0	7	0
chr14	59798709	59798709	C	T	intronic	DAAM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr14	59931203	59931203	C	C	exonic	GPR135	NaN	synonymous SNV	GPR135:NM_022571:exon1:c.G742G:p.G248G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr14	59931204	59931204	G	G	exonic	GPR135	NaN	synonymous SNV	GPR135:NM_022571:exon1:c.C741C:p.L247L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr14	59931205	59931205	A	A	exonic	GPR135	NaN	synonymous SNV	GPR135:NM_022571:exon1:c.T740T:p.L247L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr14	59931470	59931470	C	A	exonic	GPR135	NaN	nonsynonymous SNV	GPR135:NM_022571:exon1:c.G475T:p.A159S	NaN	NaN	NaN	0.14	T	0.992	D	0.794	P	0.000	U	1.000	D	1.46	L	-0.6	T	-0.476	T	0.332	T	0.233	3.858	19.60	4.39	1.978	1.760	8.060	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	59	22.635419	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	11	3	8	0
chr14	59931471	59931471	G	A	exonic	GPR135	NaN	synonymous SNV	GPR135:NM_022571:exon1:c.C474T:p.P158P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	55	19.842061	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	9	1	8	0
chr14	59951446	59951446	C	T	UTR5	JKAMP	NM_001284201:c.-343C>T	NaN	NaN	rs80087397	NaN	0.0678914	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	84.8559	0	27.67526	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	11	15	6
chr14	59951458	59951458	T	C	UTR5	JKAMP	NM_001284201:c.-331T>C	NaN	NaN	rs116224422	NaN	0.0211661	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.960847	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	9	14	8
chr14	59954344	59954344	G	A	intronic	JKAMP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.09523809523809613	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr14	59954385	59954385	A	G	intronic	JKAMP	NaN	NaN	NaN	rs76472382	NaN	0.0211661	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.905908	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	7	8	10
chr14	59961970	59961970	TTG	TTGT,T,TT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	480.228	0	NaN	NA	NA	180	69	29	0
chr14	59978372	59978372	G	A	intronic	CCDC175	NaN	NaN	NaN	rs45514195	NaN	0.0221645	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	19.3048	0	12.315319	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	12	5	10
chr14	59993782	59993782	A	T	intronic	CCDC175	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.976641	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	11	6	5	0
chr14	60011800	60011800	G	C	intronic	CCDC175	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr14	60011803	60011803	G	A	intronic	CCDC175	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr14	60027656	60027656	A	G	intronic	CCDC175	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	60027658	60027658	T	G	intronic	CCDC175	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	60027660	60027660	C	G	intronic	CCDC175	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	60027661	60027661	A	T	intronic	CCDC175	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	60027662	60027662	C	G	intronic	CCDC175	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	60027663	60027663	A	T	intronic	CCDC175	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	60027664	60027664	A	G	intronic	CCDC175	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	60027665	60027665	T	C	intronic	CCDC175	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	60032128	60032128	A	A	intronic	CCDC175	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr14	60043520	60043520	A	A	UTR5	CCDC175	NM_001164399:c.-27T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr14	60191805	60191805	A	A	intronic	RTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	60336922	60336922	G	A	intronic	RTN1	NaN	NaN	NaN	rs2145797	NaN	0.202676	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	190.104	0	NaN	NA	NA	25	9	16	18
chr14	60336951	60336951	C	G	intronic	RTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.685749	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	32	25	7	0
chr14	60581674	60581674	T	C	intronic	PCNXL4	NaN	NaN	NaN	rs74825538	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.0034394950579886945	NA	0	0	30.688771	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	56	35	21	0
chr14	60585132	60585132	A	G	exonic	PCNXL4	NaN	nonsynonymous SNV	PCNXL4:NM_022495:exon6:c.A962G:p.K321R	NaN	NaN	NaN	0.23	T	0.883	P	0.255	B	.	.	1.000	D	2.42	M	1.7	T	-0.992	T	0.096	T	0.278	3.190	16.68	6.07	2.330	5.582	16.628	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.344322	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	25	18	7	0
chr14	60588123	60588123	A	C	intronic	PCNXL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr14	60591887	60591887	G	A	exonic	PCNXL4	NaN	nonsynonymous SNV	PCNXL4:NM_022495:exon8:c.G2296A:p.G766S	rs167437	NaN	0.348842	0.82	T	0.004	B	0.002	B	0.021	N	0.000	P	-0.895	N	1.12	T	-0.930	T	0.000	T	0.039	-0.053	3.746	5.18	0.914	4.470	6.555	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	79.1199	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	27	32	19
chr14	60616943	60616943	T	T	intronic	DHRS7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	60752196	60752196	A	ATGCG	intronic	PPM1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.496605	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	28.9191	0	NaN	NA	NA	53	40	12	12
chr14	60759120	60759120	T	T	intronic	PPM1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	60933650	60933650	C	T	exonic	C14orf39	NaN	nonsynonymous SNV	C14orf39:NM_174978:exon10:c.G880A:p.E294K	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.996	D	0.99	D	0.048	N	0.881	N	2.015	M	1.71	T	-0.955	T	0.135	T	0.641	2.700	14.99	4.4	1.456	3.347	9.597	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.665901	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	56	53	3	0
chr14	60938142	60938142	A	T	exonic	C14orf39	NaN	nonsynonymous SNV	C14orf39:NM_174978:exon7:c.T547A:p.L183I	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.998	D	0.996	D	0.000	D	0.717	N	2.125	M	0.97	T	-0.753	T	0.206	T	0.496	3.643	18.52	3.0	0.895	1.665	7.305	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.56796	0	NaN	NA	NA	22	19	3	0
chr14	60944959	60944959	A	G	intronic	C14orf39	NaN	NaN	NaN	rs11845369	NaN	0.761581	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	112.050681	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	1	37	45
chr14	60976537	60976537	C	A	exonic	SIX6	NaN	nonsynonymous SNV	SIX6:NM_007374:exon1:c.C421A:p.H141N	rs33912345	NaN	0.341454	0.1	T	0.0	B	0.002	B	0.000	D	0.000	P	-1.37	N	-3.86	D	-0.959	T	0.000	T	0.091	0.917	8.731	5.38	2.804	3.798	14.842	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	83.456096	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	73	33	40	50
chr14	61180678	61180678	T	G	exonic	SIX4	NaN	nonsynonymous SNV	SIX4:NM_017420:exon3:c.A1793C:p.N598T	NaN	NaN	NaN	0.99	T	0.001	B	0.004	B	0.176	N	1.000	D	0.345	N	0.84	T	-0.709	T	0.358	T	0.115	1.678	11.57	-3.29	-0.456	0.293	6.311	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	86	77	9	0
chr14	61278651	61278651	G	C	intronic	MNAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	61285407	61285407	A	A	intronic	MNAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	117	91	0	0
chr14	61285408	61285408	C	C	intronic	MNAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	117	89	0	0
chr14	61304456	61304456	A	C	intronic	MNAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	61446235	61446235	A	G	exonic	TRMT5	NaN	synonymous SNV	TRMT5:NM_020810:exon2:c.T381C:p.I127I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.90398	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	152	143	9	0
chr14	61448162	61448162	A	C	intronic	SLC38A6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	61497078	61497078	G	A	intronic	SLC38A6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	61497081	61497081	C	G	intronic	SLC38A6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	61497082	61497082	A	C	intronic	SLC38A6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	61509924	61509924	T	C	exonic	SLC38A6	NaN	synonymous SNV	SLC38A6:NM_001172702:exon9:c.T684C:p.G228G,SLC38A6:NM_153811:exon9:c.T684C:p.G228G	rs2296921	NaN	0.842851	.	.	.	.	.	.	.	.	0.002	P	.	.	.	.	-1.023	T	0.000	T	.	-0.788	0.708	4.08	0.376	-0.298	10.026	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	86.011998	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	0	28	49
chr14	61747594	61747594	G	A	exonic	TMEM30B	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM30B:NM_001017970:exon1:c.C272T:p.P91L	rs137950125	NaN	0.0141773	0.23	T	0.001	B	0.004	B	0.007	N	1.000	N	2.94	M	.	.	-0.986	T	0.059	T	0.053	0.528	6.859	-4.24	-0.709	-2.075	6.770	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.033326	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	3	4	5
chr14	61747644	61747644	A	G	exonic	TMEM30B	NaN	synonymous SNV	TMEM30B:NM_001017970:exon1:c.T222C:p.G74G	rs3196765	NaN	0.779752	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.412798	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	0	10	45
chr14	61997331	61997331	A	A	intronic	PRKCH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	62162588	62162588	T	C	intronic	HIF1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.92845	clustered_read_position	REJECT	33	29	4	0
chr14	62213848	62213848	T	C	ncRNA_exonic	HIF1A-AS2	NaN	NaN	NaN	rs2057482	NaN	0.757588	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	397.894948	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	135	0	135	58
chr14	62249152	62249152	A	G	intronic	SNAPC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	2	0
chr14	62261603	62261603	G	T	intronic	SNAPC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.118857	nearby_gap_events	REJECT	81	72	9	0
chr14	62536181	62536181	A	T	intronic	SYT16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.721139	nearby_gap_events	REJECT	505	484	21	0
chr14	63744672	63744672	A	G	intronic	RHOJ	NaN	NaN	NaN	rs11849661	NaN	0.184505	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	64066754	64066754	A	T	intronic	WDR89	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.530001	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	26	16	10	0
chr14	64421661	64421661	A	C	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr14	64443323	64443323	C	C	exonic	SYNE2	NaN	synonymous SNV	SYNE2:NM_015180:exon12:c.C1171C:p.P391P,SYNE2:NM_182914:exon12:c.C1171C:p.P391P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	18	17	0	0
chr14	64458029	64458029	A	A	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	22	19	0	0
chr14	64474004	64474004	A	A	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr14	64483496	64483496	A	A	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	64494278	64494278	C	T	exonic	SYNE2	NaN	synonymous SNV	SYNE2:NM_015180:exon43:c.C6481T:p.L2161L,SYNE2:NM_182914:exon43:c.C6481T:p.L2161L	rs10151127	NaN	0.751997	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	138.305	0	NaN	NA	NA	43	0	43	38
chr14	64496749	64496749	C	T	exonic	SYNE2	NaN	nonsynonymous SNV	SYNE2:NM_015180:exon44:c.C6851T:p.A2284V,SYNE2:NM_182914:exon44:c.C6851T:p.A2284V	rs4027402	NaN	0.671925	0.68	T	0.055	B	0.02	B	0.325	N	1.000	P	0.895	L	1.29	T	-0.997	T	0.000	T	0.047	0.102	4.551	1.21	0.012	0.338	4.485	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	118.803854	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	0	39	58
chr14	64497930	64497930	G	A	exonic	SYNE2	NaN	nonsynonymous SNV	SYNE2:NM_015180:exon45:c.G7076A:p.S2359N,SYNE2:NM_182914:exon45:c.G7076A:p.S2359N	rs4027404	NaN	0.702476	0.52	T	0.004	B	0.012	B	0.051	N	0.000	P	0.895	L	0.72	T	-0.995	T	0.000	T	0.02	-0.180	3.123	3.1	1.208	0.982	5.694	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	372.881812	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	134	0	134	58
chr14	64522843	64522843	A	G	exonic	SYNE2	NaN	nonsynonymous SNV	SYNE2:NM_015180:exon49:c.A9926G:p.H3309R,SYNE2:NM_182914:exon49:c.A9926G:p.H3309R	rs8010699	NaN	0.682308	0.35	T	0.039	B	0.043	B	0.043	N	0.993	P	0	N	1.4	T	-1.049	T	0.000	T	0.052	-0.146	3.287	3.4	0.440	1.102	7.513	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	595.896707	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	195	1	194	57
chr14	64548118	64548118	T	T	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	25	20	0	0
chr14	64556471	64556471	A	A	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	119	107	0	0
chr14	64565403	64565403	T	T	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	64630097	64630097	T	G	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr14	64630098	64630098	G	A	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr14	64643875	64643875	C	A	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	64643876	64643876	T	C	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	64669622	64669622	C	T	exonic	SYNE2	NaN	nonsynonymous SNV	SYNE2:NM_015180:exon100:c.C18142T:p.P6048S,SYNE2:NM_182914:exon100:c.C18142T:p.P6048S	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.645	M	2.16	T	-0.323	T	0.363	T	0.789	4.544	24.5	5.93	2.814	7.818	20.341	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.436063	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	46	43	3	0
chr14	64678858	64678858	C	T	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	64682146	64682146	A	A	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	64686125	64686125	G	T	exonic	SYNE2	NaN	synonymous SNV	SYNE2:NM_182910:exon3:c.G381T:p.L127L,SYNE2:NM_182913:exon5:c.G759T:p.L253L,SYNE2:NM_015180:exon109:c.G19788T:p.L6596L,SYNE2:NM_182914:exon110:c.G19857T:p.L6619L	rs35648226	NaN	0.209665	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	171.617	0	NaN	NA	NA	62	33	29	22
chr14	64688438	64688438	A	T	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr14	64692260	64692260	A	A	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	64701494	64701494	T	T	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	64716208	64716208	T	C	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	64716209	64716209	T	G	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	64716210	64716210	G	A	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	64886469	64886469	T	T	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	64902441	64902441	A	A	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	64920377	64920377	T	C	ncRNA_intronic	MIR548AZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	15	10	5	0
chr14	64990412	64990412	A	A	ncRNA_intronic	LOC102723809	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr14	65008251	65008251	C	T	exonic	HSPA2	NaN	synonymous SNV	HSPA2:NM_021979:exon1:c.C684T:p.D228D	rs1063391	NaN	0.652556	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.235898	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	14	12	44
chr14	65016702	65016702	T	T	UTR5	PPP1R36	NM_172365:c.-14T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	65199481	65199481	T	C	intronic	PLEKHG3	NaN	NaN	NaN	rs73273534	NaN	0.0992412	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	61.613457	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	20	25	18
chr14	65205401	65205401	T	C	intronic	PLEKHG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	65208026	65208026	T	C	exonic	PLEKHG3	NaN	synonymous SNV	PLEKHG3:NM_015549:exon14:c.T1623C:p.S541S	rs229650	NaN	0.230431	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	49.359424	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	33	24	31
chr14	65215414	65215414	G	T	UTR3	SPTB	NM_001024858:c.*610C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	65234644	65234644	T	G	intronic	SPTB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr14	65239414	65239414	T	C	exonic	SPTB	NaN	nonsynonymous SNV	SPTB:NM_000347:exon25:c.A5437G:p.I1813V,SPTB:NM_001024858:exon25:c.A5437G:p.I1813V	rs142187216	NaN	NaN	0.28	T	0.994	D	0.946	D	0.000	D	1.000	D	1.62	L	1.06	T	-0.619	T	0.297	T	0.635	4.391	23.2	5.21	2.098	5.091	14.359	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	51	35	11	0
chr14	65245852	65245852	T	T	intronic	SPTB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	21	20	0	0
chr14	65246418	65246418	T	A	intronic	SPTB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr14	65250939	65250939	A	G	intronic	SPTB	NaN	NaN	NaN	rs229634	NaN	0.630791	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	219.833	0	NaN	NA	NA	72	31	41	36
chr14	65261154	65261154	G	A	intronic	SPTB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	65261171	65261171	A	G	intronic	SPTB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.439831	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	410	403	7	0
chr14	65261362	65261362	A	C	intronic	SPTB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	65267401	65267401	G	A	intronic	SPTB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	65267402	65267402	G	A	intronic	SPTB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	3	3	0
chr14	65268167	65268167	C	T	intronic	SPTB	NaN	NaN	NaN	rs230704	NaN	0.369609	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.748477	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	49	46	3	21
chr14	65271587	65271587	C	G	intronic	SPTB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.140808	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	185	172	13	0
chr14	65323141	65323141	G	G	intergenic	SPTB,CHURC1-FNTB	dist=33275;dist=57938	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	65381094	65381094	T	T	UTR5	CHURC1,CHURC1-FNTB	NM_145165:c.-39T>T,NM_001204063:c.-39T>T,NM_001204064:c.-39T>T;NM_001202559:c.-39T>T,NM_001202558:c.-9745T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr14	65398821	65398821	T	T	intronic	CHURC1,CHURC1-FNTB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	48	46	0	0
chr14	65406166	65406166	C	G	UTR3	GPX2	NM_002083:c.*40G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	12	3	9	0
chr14	65406167	65406167	T	G	UTR3	GPX2	NM_002083:c.*39A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	13	3	10	0
chr14	65433762	65433762	A	G	intronic	CHURC1-FNTB,RAB15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr14	65472891	65472891	T	A	UTR3	MAX	NM_001271069:c.*31A>T,NM_197957:c.*31A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	65473085	65473085	A	A	intronic	CHURC1-FNTB,FNTB,MAX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr14	65479187	65479187	T	C	intronic	CHURC1-FNTB,FNTB,MAX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr14	65479188	65479188	G	C	intronic	CHURC1-FNTB,FNTB,MAX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr14	65520083	65520083	C	G	intronic	CHURC1-FNTB,FNTB,MAX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.91487	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	99	89	10	0
chr14	65528072	65528072	A	C	UTR3	CHURC1-FNTB,FNTB	NM_001202559:c.*42A>C,NM_001202558:c.*42A>C;NM_002028:c.*42A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	77	NaN	NA	NA	28	9	19	0
chr14	65543400	65543400	A	G	intronic	MAX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	66191083	66191083	T	G	intronic	FUT8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	67346607	67346607	T	T	intronic	GPHN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	25	20	0	0
chr14	67490268	67490268	T	T	intronic	GPHN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr14	67490476	67490476	A	A	intronic	GPHN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr14	67670032	67670032	T	C	intronic	FAM71D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr14	67745738	67745738	T	C	UTR5	MPP5	NM_022474:c.-150T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	2	5	0
chr14	67770286	67770286	G	T	exonic	MPP5	NaN	nonsynonymous SNV	MPP5:NM_001256550:exon8:c.G909T:p.Q303H,MPP5:NM_022474:exon8:c.G1011T:p.Q337H	NaN	NaN	NaN	0.24	T	0.0	B	0.001	B	0.001	N	1.000	D	1.04	L	1.55	T	-1.086	T	0.039	T	0.249	1.834	12.09	-1.41	0.042	1.589	3.112	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.105776	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	125	98	27	0
chr14	67770287	67770287	A	G	exonic	MPP5	NaN	nonsynonymous SNV	MPP5:NM_001256550:exon8:c.A910G:p.I304V,MPP5:NM_022474:exon8:c.A1012G:p.I338V	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.001	B	0.007	B	0.031	N	1.000	D	0.805	L	3.12	T	-0.987	T	0.018	T	0.19	1.201	9.879	5.66	2.161	3.810	11.051	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	48.534604	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	120	93	27	0
chr14	67779323	67779323	A	C	exonic	MPP5	NaN	nonsynonymous SNV	MPP5:NM_001256550:exon9:c.A1019C:p.Q340P,MPP5:NM_022474:exon9:c.A1121C:p.Q374P	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.998	D	0.986	D	0.000	D	1.000	D	2.05	M	2.97	T	-1.123	T	0.083	T	0.957	4.734	26.4	5.67	2.287	6.972	16.192	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.831064	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	497	478	19	0
chr14	67849161	67849161	T	A	intronic	EIF2S1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	32	25	7	0
chr14	67849162	67849162	A	T	splicing	EIF2S1	NM_004094:exon7:c.679-2A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.752	15.16	5.54	2.116	9.235	15.692	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	54	47	7	0
chr14	67849899	67849899	T	C	intronic	EIF2S1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr14	67849951	67849951	A	G	intronic	EIF2S1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.384751	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	186	180	6	0
chr14	68026485	68026485	C	T	intronic	PLEKHH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.997701	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	38	33	5	1
chr14	68028635	68028635	T	T	intronic	PLEKHH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	22	20	0	0
chr14	68036059	68036059	A	A	intronic	PLEKHH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	68042235	68042235	A	G	intronic	PLEKHH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	49	18	28	0
chr14	68043957	68043957	T	T	intronic	PLEKHH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	68045840	68045840	C	T	intronic	PLEKHH1	NaN	NaN	NaN	rs74975461	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.316228	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	115	96	19	0
chr14	68045935	68045935	G	A	exonic	PLEKHH1	NaN	synonymous SNV	PLEKHH1:NM_020715:exon21:c.G2934A:p.S978S	rs6573781	NaN	0.646965	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	451.204686	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	151	0	151	58
chr14	68050937	68050937	A	A	intronic	PLEKHH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr14	68086851	68086851	T	T	intronic	ARG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	21	20	0	0
chr14	68086852	68086852	A	A	intronic	ARG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr14	68120080	68120080	T	T	intronic	VTI1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	68120246	68120246	C	A	intronic	VTI1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.458297	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	147	138	9	0
chr14	68141080	68141080	C	A	intronic	VTI1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.581986	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	68	58	10	0
chr14	68229188	68229188	A	T	intronic	ZFYVE26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	93	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr14	68241691	68241691	T	T	intronic	ZFYVE26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr14	68249467	68249467	T	G	intronic	ZFYVE26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	11	4	7	0
chr14	68257530	68257530	A	A	intronic	ZFYVE26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	15	15	0	0
chr14	68264867	68264867	A	G	exonic	ZFYVE26	NaN	synonymous SNV	ZFYVE26:NM_015346:exon11:c.T2112C:p.P704P	rs12891164	NaN	0.771166	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	954.328	0	NaN	NA	NA	54	0	54	40
chr14	68265516	68265516	A	C	intronic	ZFYVE26	NaN	NaN	NaN	rs7159622	NaN	0.782348	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	202.038	0	NaN	NA	NA	355	0	355	18
chr14	68268936	68268936	C	G	exonic	ZFYVE26	NaN	nonsynonymous SNV	ZFYVE26:NM_015346:exon10:c.G1499C:p.G500A	NaN	NaN	NaN	0.59	T	0.121	B	0.044	B	0.000	D	1.000	D	0.63	N	1.37	T	-1.078	T	0.060	T	0.106	1.907	12.33	4.93	1.450	4.581	15.342	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.118465	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	102	93	9	0
chr14	68280877	68280877	A	A	intronic	ZFYVE26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr14	68878320	68878320	A	C	intronic	RAD51B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	68944345	68944345	T	C	intronic	RAD51B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.0119808	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.960666	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	155	128	27	1
chr14	68963716	68963716	T	T	intronic	RAD51B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	69230404	69230404	C	A	intergenic	RAD51B,ZFP36L1	dist=167666;dist=23968	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr14	69237925	69237925	C	T	intergenic	RAD51B,ZFP36L1	dist=175187;dist=16447	NaN	NaN	rs72731537	NaN	0.0876597	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr14	69259662	69259662	C	A	exonic	ZFP36L1	NaN	synonymous SNV	ZFP36L1:NM_001244701:exon2:c.G201T:p.T67T	rs1051533	NaN	0.203474	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	131.357162	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	1	44	16
chr14	69311923	69311923	A	A	intergenic	ZFP36L1,ACTN1	dist=48963;dist=28917	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	69344050	69344050	A	A	intronic	ACTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	69352426	69352426	C	C	intronic	ACTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr14	69369336	69369336	C	G	intronic	ACTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.912712	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	241	226	15	0
chr14	69376658	69376658	A	C	intronic	ACTN1	NaN	NaN	NaN	rs743128	NaN	0.878395	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSm	3	Somatic	3.1399691466272304E-5	Somatic	400.816	28	NaN	NA	NA	69	44	25	38
chr14	69376770	69376770	G	A	intronic	ACTN1	NaN	NaN	NaN	rs200796181	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.599068	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	230	207	23	0
chr14	69585817	69585817	A	C	intronic	DCAF5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.836238	nearby_gap_events	REJECT	40	31	9	0
chr14	69586141	69586141	A	T	intronic	DCAF5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.022611	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	58	50	8	0
chr14	69619496	69619496	T	C	exonic	DCAF5	NaN	nonsynonymous SNV	DCAF5:NM_001284206:exon1:c.A200G:p.Q67R,DCAF5:NM_001284208:exon1:c.A200G:p.Q67R,DCAF5:NM_003861:exon1:c.A200G:p.Q67R	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.126	B	0.066	B	0.000	D	1.000	D	0.025	N	1.67	T	-1.079	T	0.042	T	0.221	2.356	13.84	4.23	1.692	6.904	13.287	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr14	69702693	69702693	T	T	intronic	EXD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	69792141	69792141	T	C	intronic	GALNT16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.036372	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	270	264	6	0
chr14	69806406	69806406	T	G	intronic	GALNT16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	69853816	69853816	A	G	intronic	ERH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.132762	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	227	221	6	0
chr14	69994131	69994131	C	A	intronic	PLEKHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr14	69994681	69994681	A	A	intronic	PLEKHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	70159973	70159973	C	T	intronic	SUSD6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	70237347	70237347	A	C	intronic	SRSF5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	12	7	4	0
chr14	70238198	70238198	G	G	UTR3	SRSF5	NM_001039465:c.*20G>G,NM_006925:c.*20G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	60	56	0	0
chr14	70252800	70252800	T	C	intronic	SLC10A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	3	2	0
chr14	70418881	70418881	G	A	exonic	SMOC1	NaN	synonymous SNV	SMOC1:NM_001034852:exon2:c.G126A:p.Q42Q,SMOC1:NM_022137:exon2:c.G126A:p.Q42Q	rs3742909	NaN	0.217053	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	42.2682	0	24.533411	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	22	11	20
chr14	70444775	70444775	A	T	intronic	SMOC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr14	70444780	70444780	A	C	intronic	SMOC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr14	70454272	70454272	G	A	intronic	SMOC1	NaN	NaN	NaN	rs227437	NaN	0.23123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	70460991	70460991	T	T	intronic	SMOC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr14	70477344	70477344	T	T	intronic	SMOC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	72	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr14	70478175	70478175	A	T	intronic	SMOC1	NaN	NaN	NaN	rs59684948	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	16	3	13	14
chr14	70478176	70478176	C	T	intronic	SMOC1	NaN	NaN	NaN	rs116375526	NaN	0.269768	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	53	35	18	0
chr14	70480007	70480007	A	C	intronic	SMOC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr14	70480008	70480008	G	A	intronic	SMOC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr14	70480215	70480215	T	A	intronic	SMOC1	NaN	NaN	NaN	rs1885482	NaN	0.159545	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	109.789048	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	88	36	52	18
chr14	70512615	70512615	T	C	UTR3	SLC8A3	NM_182932:c.*49A>G,NM_001130417:c.*49A>G,NM_058240:c.*49A>G,NM_182936:c.*49A>G,NM_033262:c.*49A>G,NM_183002:c.*49A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	70512616	70512616	C	G	UTR3	SLC8A3	NM_182932:c.*48G>C,NM_001130417:c.*48G>C,NM_058240:c.*48G>C,NM_182936:c.*48G>C,NM_033262:c.*48G>C,NM_183002:c.*48G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr14	70512617	70512617	T	A	UTR3	SLC8A3	NM_182932:c.*47A>T,NM_001130417:c.*47A>T,NM_058240:c.*47A>T,NM_182936:c.*47A>T,NM_033262:c.*47A>T,NM_183002:c.*47A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr14	70517662	70517662	T	C	intronic	SLC8A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	1	2	0
chr14	70530520	70530520	T	T	intronic	SLC8A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	70530706	70530706	C	G	intronic	SLC8A3	NaN	NaN	NaN	rs150956	NaN	0.682508	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	65.6054	0	NaN	NA	NA	254	201	53	33
chr14	70608763	70608763	C	G	intronic	SLC8A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	70633317	70633317	T	T	intronic	SLC8A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr14	70634801	70634801	T	C	exonic	SLC8A3	NaN	synonymous SNV	SLC8A3:NM_033262:exon2:c.A339G:p.T113T,SLC8A3:NM_058240:exon2:c.A339G:p.T113T,SLC8A3:NM_182932:exon2:c.A339G:p.T113T,SLC8A3:NM_183002:exon2:c.A339G:p.T113T	rs17765575	NaN	0.0732827	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.558015	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	27	18	16
chr14	70793185	70793185	T	A	intronic	COX16,SYNJ2BP-COX16	NaN	NaN	NaN	rs11621661	NaN	0.0591054	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.017152407481497503	NA	0	0	NaN	NA	NA	70	40	30	6
chr14	70842553	70842553	A	A	intronic	SYNJ2BP,SYNJ2BP-COX16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr14	70855144	70855144	T	T	intronic	SYNJ2BP,SYNJ2BP-COX16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	70883505	70883505	T	T	intronic	SYNJ2BP,SYNJ2BP-COX16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	70925257	70925257	A	G	exonic	ADAM21	NaN	synonymous SNV	ADAM21:NM_003813:exon2:c.A1041G:p.L347L	rs12436346	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	103.066	0	NaN	NA	NA	79	0	79	14
chr14	71051502	71051502	T	T	UTR3	MED6	NM_001284210:c.*107A>A,NM_001284209:c.*28A>A,NM_005466:c.*28A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	71051612	71051612	G	T	exonic	MED6	NaN	nonsynonymous SNV	MED6:NM_001284209:exon8:c.C680A:p.P227H,MED6:NM_001284211:exon8:c.C659A:p.P220H,MED6:NM_005466:exon8:c.C659A:p.P220H	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.102	B	0.039	B	0.296	N	1.000	D	0.895	L	.	.	-0.969	T	0.142	T	0.07	2.700	14.99	5.75	2.716	3.295	12.226	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.551414	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	199	179	20	1
chr14	71051614	71051614	T	G	exonic	MED6	NaN	nonsynonymous SNV	MED6:NM_001284210:exon7:c.A541C:p.T181P,MED6:NM_001284209:exon8:c.A678C:p.K226N,MED6:NM_001284211:exon8:c.A657C:p.K219N,MED6:NM_005466:exon8:c.A657C:p.K219N	NaN	NaN	NaN	0.47	T	0.981	D	0.95	D	0.000	D	1.000	N	1.89	L	.	.	-0.930	T	0.126	T	0.254	3.214	16.77	-0.832	-0.380	0.520	10.062	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.0525	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	192	176	16	0
chr14	71064314	71064314	C	T	intronic	MED6	NaN	NaN	NaN	rs1007402	NaN	0.442891	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.036218	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	8	13	11
chr14	71109153	71109153	C	G	exonic	TTC9	NaN	nonsynonymous SNV	TTC9:NM_015351:exon1:c.C307G:p.P103A	rs4902834	ID=COSM433314;OCCURENCE=1(breast)	0.841653	0.35	T	0.001	B	0.0	B	0.104	N	1.000	P	-0.205	N	2.2	T	-1.007	T	0.000	T	0.048	-1.207	0.069	-7.15	-2.181	0.182	0.715	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	47.39472	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	49
chr14	71197674	71197674	A	T	intronic	MAP3K9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr14	71202650	71202650	C	T	intronic	MAP3K9	NaN	NaN	NaN	rs4141095	NaN	0.860623	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	125.303888	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	0	43	55
chr14	71428898	71428898	T	T	intronic	PCNX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	71443582	71443582	A	C	intronic	PCNX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	71443583	71443583	A	T	intronic	PCNX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	71443589	71443589	T	C	intronic	PCNX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	71495412	71495412	T	C	intronic	PCNX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr14	71524457	71524457	A	A	intronic	PCNX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	11	8	0	0
chr14	71540532	71540532	A	A	intronic	PCNX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	72139418	72139418	A	A	intronic	SIPA1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	72139420	72139420	T	T	intronic	SIPA1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	72176164	72176164	T	C	exonic	SIPA1L1	NaN	nonsynonymous SNV	SIPA1L1:NM_001284245:exon14:c.T3991C:p.S1331P,SIPA1L1:NM_001284246:exon14:c.T3991C:p.S1331P,SIPA1L1:NM_001284247:exon14:c.T4054C:p.S1352P,SIPA1L1:NM_015556:exon15:c.T4054C:p.S1352P	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.232	B	0.136	B	0.349	N	0.994	D	0.805	L	0.91	T	-1.074	T	0.072	T	0.427	1.101	9.493	1.81	0.415	2.225	7.326	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.660439	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	220	213	7	0
chr14	72190293	72190293	C	C	intronic	SIPA1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	72197063	72197063	G	A	intronic	SIPA1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	72944943	72944943	T	G	intronic	RGS6	NaN	NaN	NaN	rs2239277	NaN	0.384585	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	162	4	158	9
chr14	72961829	72961829	T	T	intronic	RGS6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	72976806	72976806	A	A	intronic	RGS6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr14	72976807	72976807	C	C	intronic	RGS6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	73002822	73002822	A	G	intronic	RGS6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr14	73002823	73002823	A	C	intronic	RGS6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	73028325	73028325	A	G	intronic	RGS6	NaN	NaN	NaN	rs2239228	NaN	0.309105	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	73159730	73159730	C	A	intronic	DPF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	18	12	6	0
chr14	73220103	73220103	A	G	intronic	DPF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	32	19	13	0
chr14	73238671	73238671	A	A	intronic	DPF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr14	73360842	73360842	G	T	upstream	DPF3	NaN	NaN	NaN	rs78898062	NaN	0.0708866	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	67.896293	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	20	28	12
chr14	73404591	73404591	C	C	intronic	DCAF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	73406682	73406682	A	A	intronic	DCAF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr14	73412739	73412739	C	T	intronic	DCAF4	NaN	NaN	NaN	rs2246976	NaN	0.208466	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	95.7695	0	NaN	NA	NA	44	24	20	28
chr14	73418652	73418652	A	A	intronic	DCAF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	73441675	73441675	A	A	intronic	ZFYVE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr14	73653522	73653522	T	T	intronic	PSEN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr14	73685787	73685787	T	T	intronic	PSEN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	73725711	73725711	A	G	exonic	PAPLN	NaN	nonsynonymous SNV	PAPLN:NM_173462:exon14:c.A1571G:p.H524R	NaN	NaN	NaN	0.4	T	0.001	B	0.001	B	.	.	1.000	N	0.69	N	0.37	T	-1.026	T	0.103	T	0.055	0.072	4.390	2.09	0.239	0.374	6.698	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.016018	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	186	174	12	0
chr14	73725865	73725865	T	A	intronic	PAPLN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	73725866	73725866	G	T	intronic	PAPLN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	73725871	73725871	A	C	intronic	PAPLN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr14	73725872	73725872	A	T	intronic	PAPLN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr14	73727509	73727509	T	G	exonic	PAPLN	NaN	nonsynonymous SNV	PAPLN:NM_173462:exon16:c.T1997G:p.M666R	rs177389	NaN	0.65615	0.59	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	-1.995	N	0.36	T	-0.975	T	0.000	T	0.255	-0.872	0.498	3.65	0.630	1.696	9.762	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	54.653087	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	54	27	27	40
chr14	73728065	73728065	C	A	intronic	PAPLN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	73728962	73728962	G	G	intronic	PAPLN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr14	73733430	73733430	G	A	splicing	PAPLN	NM_173462:exon24:c.3311-1G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.282	22.4	5.07	2.653	8.877	18.637	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.702387	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	501	459	42	0
chr14	73733508	73733508	G	C	exonic	PAPLN	NaN	nonsynonymous SNV	PAPLN:NM_173462:exon24:c.G3388C:p.A1130P	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.99	D	0.83	P	.	.	1.000	D	1.71	L	-0.31	T	-0.613	T	0.294	T	0.255	3.528	18.01	0.887	0.679	0.461	4.938	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	17	10	7	0
chr14	73739208	73739208	A	C	exonic	PAPLN	NaN	nonsynonymous SNV	PAPLN:NM_173462:exon26:c.A3592C:p.T1198P	NaN	NaN	NaN	0.33	T	0.007	B	0.006	B	.	.	1.000	N	0	N	0.05	T	-1.031	T	0.097	T	0.12	2.516	14.37	1.41	0.083	0.588	5.845	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.920718	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	217	211	6	0
chr14	73782999	73782999	T	T	intronic	NUMB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr14	73822470	73822470	A	A	UTR5	NUMB	NM_003744:c.-11T>T,NM_001005744:c.-11T>T,NM_001005743:c.-11T>T,NM_001005745:c.-11T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	73962122	73962122	A	A	intronic	HEATR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	27	24	0	0
chr14	73975984	73975984	T	A	intronic	HEATR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	73980722	73980722	T	T	intronic	HEATR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr14	73988874	73988874	T	G	intronic	HEATR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr14	73989867	73989867	A	A	UTR5	HEATR4	NM_001220484:c.-11T>T,NM_203309:c.-11T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	74128624	74128624	T	T	intronic	DNAL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	74345634	74345634	G	C	intronic	PTGR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr14	74345642	74345642	T	A	intronic	PTGR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	14	7	6	0
chr14	74346824	74346824	C	T	exonic	PTGR2	NaN	nonsynonymous SNV	PTGR2:NM_001146154:exon7:c.C796T:p.P266S,PTGR2:NM_001146155:exon7:c.C796T:p.P266S,PTGR2:NM_152444:exon7:c.C796T:p.P266S	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.999	D	0.978	D	0.000	D	1.000	D	1.755	L	1.02	T	0.176	D	0.583	D	0.664	4.791	27.0	5.34	2.469	7.736	19.040	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	131	74	42	0
chr14	74362918	74362918	T	T	intronic	ZNF410	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr14	74363145	74363145	A	A	exonic	ZNF410	NaN	synonymous SNV	ZNF410:NM_001242926:exon4:c.A296A:p.E99E,ZNF410:NM_021188:exon4:c.A296A:p.E99E,ZNF410:NM_001242924:exon5:c.A347A:p.E116E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	66	60	0	0
chr14	74363256	74363256	T	G	intronic	ZNF410	NaN	NaN	NaN	rs183535973	NaN	0.00199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.11517	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	21	16	5	0
chr14	74370855	74370855	C	G	intronic	ZNF410	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr14	74370858	74370858	A	T	intronic	ZNF410	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	10	3	6	0
chr14	74370859	74370859	A	T	intronic	ZNF410	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr14	74370860	74370860	G	C	intronic	ZNF410	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr14	74370863	74370863	G	C	intronic	ZNF410	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr14	74376132	74376132	A	G	exonic	ZNF410	NaN	synonymous SNV	ZNF410:NM_001242927:exon7:c.A783G:p.S261S,ZNF410:NM_001242926:exon8:c.A1002G:p.S334S,ZNF410:NM_001242928:exon8:c.A414G:p.S138S,ZNF410:NM_021188:exon8:c.A1002G:p.S334S,ZNF410:NM_001242924:exon9:c.A1053G:p.S351S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.380391	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	93	89	4	0
chr14	74387820	74387820	G	T	intronic	ZNF410	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	155	69	84	0
chr14	74407583	74407583	T	T	intronic	FAM161B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr14	74413339	74413339	A	G	intronic	FAM161B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr14	74420084	74420084	T	T	intronic	COQ6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	74439724	74439724	T	C	exonic	ENTPD5	NaN	nonsynonymous SNV	ENTPD5:NM_001249:exon13:c.A890G:p.E297G	NaN	NaN	NaN	0.32	T	0.178	B	0.056	B	0.246	N	1.000	D	0.74	N	2.75	T	-1.071	T	0.024	T	0.316	2.544	14.47	2.99	0.461	2.062	8.764	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.309883	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	288	274	14	0
chr14	74439725	74439725	C	T	exonic	ENTPD5	NaN	nonsynonymous SNV	ENTPD5:NM_001249:exon13:c.G889A:p.E297K	NaN	NaN	NaN	0.84	T	0.001	B	0.003	B	0.246	N	1.000	D	1.355	L	2.84	T	-0.925	T	0.028	T	0.21	2.247	13.47	4.54	1.527	1.920	10.042	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.845688	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	195	181	14	0
chr14	74440759	74440759	T	T	intronic	ENTPD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	74443837	74443837	T	C	intronic	ENTPD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.23684210526315766	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr14	74507211	74507211	C	A	intronic	CCDC176	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	74507215	74507215	A	G	intronic	CCDC176	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	74512646	74512646	T	C	intronic	CCDC176	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	4	5	0
chr14	74534055	74534055	T	T	intronic	ALDH6A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr14	74538979	74538979	G	C	exonic	ALDH6A1	NaN	nonsynonymous SNV	ALDH6A1:NM_001278593:exon4:c.C275G:p.A92G,ALDH6A1:NM_005589:exon4:c.C275G:p.A92G	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.001	B	0.006	B	0.014	N	1.000	D	0.73	N	-1.05	T	-0.722	T	0.274	T	0.102	2.973	15.91	5.28	2.744	4.157	13.798	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.784555	clustered_read_position	REJECT	32	28	4	0
chr14	74541823	74541823	A	T	intronic	ALDH6A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	74550968	74550968	T	T	intronic	ALDH6A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	74557968	74557968	A	G	exonic	LIN52	NaN	nonsynonymous SNV	LIN52:NM_001024674:exon2:c.A65G:p.E22G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.991	D	0.000	D	1.000	D	2.305	M	.	.	-0.162	T	0.406	T	0.855	4.465	23.9	4.73	1.992	7.836	11.847	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.832383	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	73	62	11	0
chr14	74753586	74753586	A	A	intronic	ABCD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	74758925	74758925	T	T	intronic	ABCD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	74762975	74762975	T	G	intronic	ABCD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr14	74766836	74766836	T	T	intronic	ABCD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr14	74961118	74961118	A	A	intronic	ISCA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	20	15	0	0
chr14	74968098	74968098	T	T	intronic	LTBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	74973542	74973542	A	A	intronic	LTBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr14	74975482	74975482	C	T	intronic	LTBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.784322	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	156	147	9	0
chr14	74975802	74975802	A	G	intronic	LTBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	17	10	7	0
chr14	74976380	74976380	T	T	intronic	LTBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	74978121	74978121	A	A	intronic	LTBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr14	74994034	74994034	G	C	intronic	LTBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.281574	nearby_gap_events	REJECT	46	38	8	10
chr14	74994096	74994096	C	T	intronic	LTBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.4615384615384648	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr14	74994993	74994993	T	T	intronic	LTBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	74995395	74995395	A	G	exonic	LTBP2	NaN	nonsynonymous SNV	LTBP2:NM_000428:exon12:c.T2159C:p.F720S	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.86	M	-3.49	D	1.023	D	0.912	D	0.907	4.885	28.0	5.54	2.326	7.980	13.302	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.486142	nearby_gap_events	REJECT	34	29	5	0
chr14	75022209	75022209	A	G	exonic	LTBP2	NaN	nonsynonymous SNV	LTBP2:NM_000428:exon4:c.T1018C:p.W340R	NaN	NaN	NaN	0.54	T	0.56	P	0.132	B	0.003	U	0.914	N	0.92	L	-1.09	T	-0.821	T	0.230	T	0.804	1.091	9.451	5.12	2.145	3.711	9.699	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.534285	nearby_gap_events	REJECT	95	87	8	0
chr14	75095392	75095392	T	G	intergenic	LTBP2,AREL1	dist=16358;dist=32563	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	75245368	75245368	C	T	exonic	YLPM1	NaN	synonymous SNV	YLPM1:NM_019589:exon2:c.C1092T:p.L364L	rs57404741	NaN	0.190495	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.927513	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	21	12	16
chr14	75245488	75245488	T	A	intronic	YLPM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.057471264367815536	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	11	4	0
chr14	75248654	75248654	T	C	exonic	YLPM1	NaN	synonymous SNV	YLPM1:NM_019589:exon4:c.T1908C:p.P636P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.049951	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	244	233	11	0
chr14	75265267	75265267	T	T	exonic	YLPM1	NaN	synonymous SNV	YLPM1:NM_019589:exon5:c.T3267T:p.S1089S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	73	62	0	0
chr14	75276496	75276496	C	C	exonic	YLPM1	NaN	synonymous SNV	YLPM1:NM_019589:exon7:c.C4935C:p.G1645G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	39	30	0	0
chr14	75296092	75296092	A	A	intronic	YLPM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	75322036	75322036	A	C	intronic	PROX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-1.010	T	0.057	T	.	2.753	15.17	-0.718	-0.280	0.489	4.633	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	1	4	0
chr14	75348768	75348768	G	T	intronic	DLST	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	11	2	9	0
chr14	75366923	75366923	T	C	intronic	DLST	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	0	2	0
chr14	75374040	75374040	T	G	intronic	RPS6KL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	75376460	75376460	G	C	exonic	RPS6KL1	NaN	synonymous SNV	RPS6KL1:NM_031464:exon7:c.C1056G:p.A352A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	28	19	9	4
chr14	75376462	75376462	C	G	exonic	RPS6KL1	NaN	nonsynonymous SNV	RPS6KL1:NM_031464:exon7:c.G1054C:p.A352P	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.976	D	0.464	N	0.995	D	2.125	M	0.29	T	-0.390	T	0.364	T	0.721	1.266	10.13	4.74	2.467	1.348	11.943	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	29	18	11	0
chr14	75376465	75376465	C	G	exonic	RPS6KL1	NaN	nonsynonymous SNV	RPS6KL1:NM_031464:exon7:c.G1051C:p.G351R	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.995	D	0.003	N	0.955	D	2.295	M	0.37	T	-0.311	T	0.340	T	0.722	2.502	14.33	4.5	2.536	0.854	9.069	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.012958184989261774	NA	0	0	NaN	NA	NA	31	24	7	0
chr14	75385401	75385401	A	A	intronic	RPS6KL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	75386576	75386576	G	A	exonic	RPS6KL1	NaN	nonsynonymous SNV	RPS6KL1:NM_031464:exon3:c.C362T:p.P121L	rs2286913	ID=COSM1371117;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.297923	0.21	T	0.533	P	0.091	B	0.022	N	0.477	P	0.895	L	3.3	T	-0.974	T	0.000	T	0.087	0.663	7.553	4.07	1.297	3.053	13.300	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	109.42	0	NaN	NA	NA	83	49	34	32
chr14	75389074	75389074	G	A	UTR5	RPS6KL1	NM_031464:c.-830C>T	NaN	NaN	rs11159109	NaN	0.298323	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	75412908	75412908	A	G	intronic	PGF	NaN	NaN	NaN	rs8005277	NaN	0.999601	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	72.631917	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	0	25	56
chr14	75483948	75483948	A	A	intronic	MLH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	75504937	75504937	A	G	intronic	MLH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	75504939	75504939	T	C	intronic	MLH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	3	3	0
chr14	75537381	75537381	C	T	exonic	ZC2HC1C	NaN	synonymous SNV	ZC2HC1C:NM_001042430:exon2:c.C105T:p.Y35Y,ZC2HC1C:NM_024643:exon2:c.C105T:p.Y35Y	rs11546525	ID=COSM1371159;OCCURENCE=2(large_intestine)	0.349241	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	88.003806	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	84	44	40	38
chr14	75551254	75551254	C	T	UTR3	NEK9	NM_033116:c.*13G>A	NaN	NaN	rs175487	NaN	0.988219	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	221.363519	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	75	1	74	58
chr14	75555382	75555382	A	A	intronic	NEK9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr14	75570827	75570827	C	A	intronic	NEK9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr14	75570828	75570828	T	G	intronic	NEK9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr14	75580152	75580152	G	A	intronic	NEK9	NaN	NaN	NaN	rs175464	NaN	0.990415	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	171.967007	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	64	0	64	58
chr14	75585614	75585614	A	T	exonic	NEK9	NaN	nonsynonymous SNV	NEK9:NM_033116:exon5:c.T549A:p.F183L	NaN	NaN	NaN	0.49	T	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	-0.035	N	3.32	T	-1.048	T	0.101	T	0.914	4.434	23.6	4.31	2.254	4.476	8.934	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.853651	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	45	38	7	0
chr14	75590846	75590846	A	T	exonic	NEK9	NaN	synonymous SNV	NEK9:NM_033116:exon2:c.T300A:p.I100I	rs175449	NaN	0.427915	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.999997	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	42	18	41
chr14	75601543	75601543	T	C	UTR3	TMED10	NM_006827:c.*45A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	1	4	0
chr14	75601707	75601707	A	G	exonic	TMED10	NaN	nonsynonymous SNV	TMED10:NM_006827:exon5:c.T541C:p.S181P	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.998	D	0.984	D	0.000	D	1.000	D	3.8	H	1.77	T	-0.266	T	0.268	T	0.955	4.684	25.9	6.03	2.310	9.275	16.555	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.519673	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	439	431	8	0
chr14	75602404	75602404	G	C	intronic	TMED10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	75602635	75602635	A	A	intronic	TMED10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	75747916	75747916	T	G	exonic	FOS	NaN	nonsynonymous SNV	FOS:NM_005252:exon4:c.T932G:p.L311R	NaN	NaN	NaN	0.35	T	0.815	P	0.387	B	0.384	N	1.000	D	1.245	L	0.82	T	-0.899	T	0.179	T	0.835	0.343	5.858	5.51	2.101	2.691	8.613	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	28	24	4	0
chr14	75747917	75747917	G	T	exonic	FOS	NaN	synonymous SNV	FOS:NM_005252:exon4:c.G933T:p.L311L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	24	22	2	0
chr14	75904660	75904660	A	G	exonic	JDP2	NaN	nonsynonymous SNV	JDP2:NM_001135047:exon2:c.A37G:p.T13A,JDP2:NM_001135048:exon2:c.A37G:p.T13A,JDP2:NM_001135049:exon2:c.A70G:p.T24A,JDP2:NM_130469:exon2:c.A37G:p.T13A	rs3625	NaN	0.60643	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-0.975	N	0.7	T	-0.949	T	0.000	T	0.225	-0.466	1.845	4.72	0.749	7.140	10.718	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	121.29495	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	84	36	48	46
chr14	75956018	75956018	G	A	intergenic	JDP2,BATF	dist=16614;dist=32766	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr14	76045689	76045689	G	A	exonic	FLVCR2	NaN	stopgain	FLVCR2:NM_017791:exon1:c.G374A:p.W125X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	8.990	41	4.75	1.376	7.528	15.040	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.41437	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	163	155	8	0
chr14	76071846	76071846	C	A	UTR5	FLVCR2	NM_001195283:c.-68C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.074371	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	398	380	18	0
chr14	76071847	76071847	A	C	UTR5	FLVCR2	NM_001195283:c.-67A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.775344	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	399	382	17	0
chr14	76072063	76072063	A	A	intronic	FLVCR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr14	76090889	76090889	G	G	intronic	FLVCR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	76090890	76090890	T	T	intronic	FLVCR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	76148022	76148022	A	A	intronic	TTLL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	76173272	76173272	T	G	intronic	TTLL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	3	2	0
chr14	76173273	76173273	T	C	intronic	TTLL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	3	4	0
chr14	76349011	76349011	T	C	intronic	TTLL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.523371	nearby_gap_events	REJECT	77	65	12	0
chr14	76545419	76545419	T	C	intronic	IFT43	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	76549932	76549932	A	A	UTR3	IFT43	NM_001102564:c.*12A>A,NM_052873:c.*12A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	76632918	76632918	T	T	intronic	GPATCH2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr14	76842062	76842062	G	G	intronic	ESRRB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	76948900	76948900	T	G	intronic	ESRRB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	77244495	77244495	T	A	intronic	VASH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.590563	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	52	43	9	0
chr14	77272787	77272787	A	T	exonic	ANGEL1	NaN	nonsynonymous SNV	ANGEL1:NM_015305:exon5:c.T1352A:p.L451H	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	3.08	M	1.25	T	-0.328	T	0.297	T	0.872	4.682	25.9	5.96	2.285	9.339	16.448	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	20	10.566555	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	18	13	5	0
chr14	77272788	77272788	G	C	exonic	ANGEL1	NaN	nonsynonymous SNV	ANGEL1:NM_015305:exon5:c.C1351G:p.L451V	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.988	D	0.966	D	0.000	D	1.000	D	1.145	L	1.33	T	-1.001	T	0.136	T	0.546	3.879	19.71	5.07	1.522	6.676	10.866	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	18	10.467479	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	18	13	5	0
chr14	77276047	77276047	A	C	intronic	ANGEL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	4	8	0
chr14	77311071	77311071	C	A	intronic	LRRC74A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	18	13	5	0
chr14	77332237	77332237	T	T	intronic	LRRC74A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	77333963	77333963	C	T	intronic	LRRC74A	NaN	NaN	NaN	rs2242629	NaN	0.441094	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr14	77351061	77351061	G	A	intergenic	LRRC74A,IRF2BPL	dist=14416;dist=139825	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	1	6	0
chr14	77381304	77381304	G	C	intergenic	LRRC74A,IRF2BPL	dist=44659;dist=109582	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	77491716	77491716	T	T	UTR3	IRF2BPL	NM_024496:c.*29A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr14	77686303	77686303	A	C	intronic	TMEM63C	NaN	NaN	NaN	rs2287377	NaN	0.847244	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	88.397903	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	1	34	39
chr14	77691642	77691642	T	T	intronic	TMEM63C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	77697879	77697879	T	T	intronic	TMEM63C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr14	77704974	77704974	G	C	intronic	TMEM63C	NaN	NaN	NaN	rs8010477	NaN	0.949281	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	71.193219	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	0	24	56
chr14	77709476	77709476	GA	G,GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1164.53	0	NaN	NA	NA	117	2	30	3
chr14	77715303	77715303	G	A	intronic	TMEM63C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr14	77715387	77715387	A	C	intronic	TMEM63C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr14	77719586	77719586	T	T	intronic	TMEM63C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	77722859	77722859	T	T	intronic	TMEM63C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr14	77723088	77723088	A	G	UTR3	TMEM63C	NM_020431:c.*19A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	68	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr14	77751174	77751174	A	C	intronic	POMT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	77751176	77751176	G	C	intronic	POMT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	14	8	5	0
chr14	77751177	77751177	A	G	intronic	POMT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	20	12	6	0
chr14	77751178	77751178	A	C	intronic	POMT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	23	14	5	0
chr14	77751179	77751179	C	A	intronic	POMT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	26	18	5	0
chr14	77753231	77753231	A	T	intronic	POMT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	16	4	12	0
chr14	77762537	77762537	G	T	exonic	POMT2	NaN	stopgain	POMT2:NM_013382:exon9:c.C1086A:p.Y362X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.857	27.7	2.78	1.096	1.559	8.713	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.04676240349933726	NA	0	0	NaN	NA	NA	33	22	11	0
chr14	77787496	77787496	T	T	UTR5	GSTZ1	NM_145870:c.-16T>T,NM_145871:c.-16T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr14	77791365	77791365	C	T	intronic	GSTZ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	13	8	3	0
chr14	77793207	77793207	G	A	exonic	GSTZ1	NaN	nonsynonymous SNV	GSTZ1:NM_145870:exon3:c.G94A:p.E32K,GSTZ1:NM_145871:exon3:c.G94A:p.E32K	rs7975	NaN	0.311502	0.02	D	0.996	D	0.905	P	0.000	D	0.000	P	.	.	2.26	T	-0.898	T	0.000	T	0.254	3.547	18.09	5.57	2.614	7.442	16.458	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	87.545706	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	78	38	40	28
chr14	77795638	77795638	G	A	intronic	GSTZ1	NaN	NaN	NaN	rs2270423	NaN	0.298123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	103.644017	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	92	46	46	27
chr14	77812637	77812637	G	C	intronic	TMED8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	77812638	77812638	T	G	intronic	TMED8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	77812639	77812639	G	A	intronic	TMED8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	77843353	77843353	G	T	exonic	TMED8	NaN	nonsynonymous SNV	TMED8:NM_213601:exon1:c.C44A:p.P15H	rs10141317	NaN	0.249601	0	D	0.938	P	0.397	B	0.060	N	0.000	P	0.695	N	1.22	T	-0.936	T	0.000	T	0.27	4.271	22.3	3.25	2.136	3.685	10.123	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.405253	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	7	8	24
chr14	77843383	77843383	TG	CT,T,TT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	42.7522	0	NaN	NA	NA	12	5	2	0
chr14	77844924	77844924	A	G	exonic	SAMD15	NaN	nonsynonymous SNV	SAMD15:NM_001010860:exon1:c.A1163G:p.N388S	NaN	NaN	NaN	0.43	T	0.176	B	0.026	B	0.202	N	1.000	N	0.69	N	1.72	T	-1.026	T	0.031	T	0.012	1.012	9.133	3.1	0.890	0.101	4.277	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.566395	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	93	88	5	0
chr14	77873759	77873759	A	C	intronic	NOXRED1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr14	77880147	77880147	T	T	intronic	NOXRED1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	77894060	77894060	A	A	intronic	VIPAS39	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr14	77896183	77896183	A	A	intronic	VIPAS39	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	77914992	77914992	G	T	intronic	VIPAS39	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	77915704	77915704	A	G	intronic	VIPAS39	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.776197	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	43	34	9	0
chr14	77917715	77917715	A	A	intronic	VIPAS39	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	77928912	77928912	T	A	intronic	AHSA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	77931119	77931119	A	A	intronic	AHSA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr14	77951028	77951028	C	G	exonic	ISM2	NaN	nonsynonymous SNV	ISM2:NM_182509:exon2:c.G376C:p.D126H,ISM2:NM_199296:exon2:c.G376C:p.D126H	NaN	NaN	NaN	0.3	T	0.999	D	0.987	D	.	.	1.000	N	1.15	L	2.28	T	-1.032	T	0.091	T	0.149	2.346	13.80	-0.146	-0.048	0.565	2.476	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.404656	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	142	134	8	0
chr14	78018494	78018494	C	T	exonic	SPTLC2	NaN	synonymous SNV	SPTLC2:NM_004863:exon9:c.G1248A:p.V416V	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-1.018	T	0.123	T	.	0.966	8.943	1.89	0.193	0.379	1.553	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.698221	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	154	148	6	0
chr14	78043074	78043074	A	C	intronic	SPTLC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.138799	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	132	125	7	0
chr14	78045458	78045458	A	A	intronic	SPTLC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	78111633	78111633	G	G	intergenic	SPTLC2,ALKBH1	dist=28523;dist=27116	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	78170849	78170849	A	G	intronic	ALKBH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	17	4	12	0
chr14	78174296	78174296	G	G	exonic	ALKBH1	NaN	synonymous SNV	ALKBH1:NM_006020:exon1:c.C52C:p.P18P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	93	93	0	0
chr14	78184628	78184628	A	G	exonic	SNW1	NaN	nonsynonymous SNV	SNW1:NM_012245:exon14:c.T1414C:p.F472L	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.956	P	0.899	P	0.000	D	1.000	D	2.595	M	.	.	-0.044	T	0.441	T	0.819	4.781	26.9	5.37	2.173	8.635	15.669	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.493995	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	51	48	3	0
chr14	78184651	78184651	T	C	intronic	SNW1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	0.002	B	0.004	B	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-1.012	T	0.034	T	0.049	1.495	10.95	-5.85	-0.522	-1.030	1.300	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.064465	nearby_gap_events	REJECT	49	43	6	0
chr14	78205215	78205215	T	C	exonic	SNW1	NaN	nonsynonymous SNV	SNW1:NM_012245:exon5:c.A439G:p.T147A	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.36	M	.	.	0.374	D	0.585	D	0.91	4.677	25.8	5.81	2.226	7.655	16.165	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.781855	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	41	35	6	0
chr14	78217822	78217822	T	C	exonic	SNW1	NaN	nonsynonymous SNV	SNW1:NM_012245:exon3:c.A170G:p.D57G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.295	M	.	.	0.373	D	0.586	D	0.933	4.666	25.7	5.9	2.266	7.997	16.328	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.874904	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	73	62	11	0
chr14	78217824	78217824	C	A	splicing	SNW1	NM_012245:exon4:c.169-1G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.970	20.3	5.37	2.674	7.776	19.46	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	46.7165	0	14.467554	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	67	56	11	0
chr14	78285466	78285466	T	C	intronic	ADCK1	NaN	NaN	NaN	rs199753100	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.257544	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	326	276	50	0
chr14	78285469	78285469	C	T	intronic	ADCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.694576	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	336	289	47	0
chr14	78312918	78312918	T	C	intronic	ADCK1	NaN	NaN	NaN	rs2052444	NaN	0.829273	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	78325776	78325776	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	1	3,3	0
chr14	78325777	78325777	G	T	intronic	ADCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	78325778	78325778	A	C	intronic	ADCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	78325779	78325779	A	T	intronic	ADCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	78325781	78325781	G	T	intronic	ADCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	78325783	78325783	A	C	intronic	ADCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	78374094	78374094	T	T	intronic	ADCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	78390993	78390993	A	T	intronic	ADCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	78398107	78398107	G	A	intronic	ADCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.040191	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	587	546	41	0
chr14	79933539	79933539	T	C	intronic	NRXN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	2	3	0
chr14	80484373	80484373	T	A	intergenic	NRXN3,DIO2	dist=149740;dist=179495	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr14	80677728	80677728	A	G	exonic	DIO2	NaN	nonsynonymous SNV	DIO2:NM_001242503:exon1:c.T88C:p.S30P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	2.48	M	1.5	T	-0.630	T	0.218	T	0.873	4.028	20.7	5.7	2.162	8.956	15.969	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.845006	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	308	299	9	0
chr14	80963744	80963744	T	T	UTR3	CEP128	NM_152446:c.*78A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	81025489	81025489	T	T	intronic	CEP128	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr14	81046810	81046810	A	AACGAGTT	intronic	CEP128	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.346645	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	134.759	0	NaN	NA	NA	112	68	38	12
chr14	81258890	81258890	A	G	intronic	CEP128	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	69	40	29	0
chr14	81258959	81258959	T	A	intronic	CEP128	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.53566	0	NaN	NA	NA	8	7	2	0
chr14	81297291	81297291	G	T	intronic	CEP128	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.95791	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	125	108	17	0
chr14	81297699	81297699	A	A	intronic	CEP128	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr14	81302500	81302500	A	G	intronic	CEP128	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	81422234	81422234	A	C	intronic	TSHR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	81943447	81943447	C	T	exonic	SEL1L	NaN	nonsynonymous SNV	SEL1L:NM_005065:exon21:c.G2254A:p.A752T	NaN	NaN	NaN	0.62	T	0.004	B	0.014	B	0.000	D	1.000	D	0.415	N	1.58	T	-1.080	T	0.043	T	0.374	2.355	13.83	4.82	1.529	4.366	11.510	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.507354	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	217	211	6	0
chr14	81951969	81951969	T	T	intronic	SEL1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	81954105	81954105	T	T	intronic	SEL1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	81956848	81956848	C	T	intronic	SEL1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	81956851	81956851	T	C	intronic	SEL1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	81964717	81964717	A	T	intronic	SEL1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.752349	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	164	148	16	0
chr14	82000185	82000185	G	C	UTR5	SEL1L	NM_005065:c.-97C>G,NM_001244984:c.-97C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.340039	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	11	8	3	0
chr14	83917607	83917607	A	C	intergenic	LINC01467,LINC00911	dist=1828202;dist=1942616	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	87465559	87465559	A	A	intergenic	LOC283585,GALC	dist=76460;dist=933799	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	87465560	87465560	G	G	intergenic	LOC283585,GALC	dist=76461;dist=933798	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	87465561	87465561	T	T	intergenic	LOC283585,GALC	dist=76462;dist=933797	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	88237810	88237810	C	T	intergenic	LOC283585,GALC	dist=848711;dist=161548	NaN	NaN	rs61980217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr14	88454627	88454627	A	A	intronic	GALC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	88459882	88459882	A	A	UTR5	GALC	NM_001201402:c.-39T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr14	88693667	88693667	T	T	intronic	KCNK10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	88893918	88893918	T	T	intronic	SPATA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	88895718	88895718	CA	AC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	32.8334	0	NaN	NA	NA	12	6	3	3
chr14	88938652	88938652	A	G	exonic	PTPN21	NaN	nonsynonymous SNV	PTPN21:NM_007039:exon15:c.T2807C:p.V936A	rs2274736	NaN	0.395767	0.3	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-1.04	N	2.65	T	-0.940	T	0.000	T	0.075	1.298	10.25	5.86	1.502	3.948	15.262	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.34195	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	32	40	31
chr14	88939965	88939965	G	A	intronic	PTPN21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	88939966	88939966	T	C	intronic	PTPN21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	88939967	88939967	T	A	intronic	PTPN21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	88939970	88939970	T	A	intronic	PTPN21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	88946730	88946730	A	T	intronic	PTPN21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	34.6116	0	NaN	NA	NA	221	181	40	7
chr14	88952093	88952093	T	T	intronic	PTPN21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	33	31	0	0
chr14	88974425	88974425	A	G	intronic	PTPN21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr14	88974427	88974427	T	G	intronic	PTPN21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr14	89041229	89041229	A	A	intronic	ZC3H14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr14	89063167	89063167	A	G	intronic	ZC3H14	NaN	NaN	NaN	rs2297124	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	87.569479	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	0	29	45
chr14	89069436	89069436	G	C	intronic	ZC3H14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	89069439	89069439	A	C	intronic	ZC3H14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	89082289	89082289	A	G	intronic	EML5	NaN	NaN	NaN	rs12885870	NaN	0.251997	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	90.9282	0	45.346637	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	15	18	18
chr14	89089084	89089084	A	T	intronic	EML5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	89089090	89089090	T	A	intronic	EML5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	89091202	89091202	G	GGAA	intronic	EML5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.2502	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	107.07	0	NaN	NA	NA	66	36	27	12
chr14	89091490	89091490	G	G	intronic	EML5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	81	NaN	NA	NA	259	208	0	0
chr14	89123862	89123862	A	G	intronic	EML5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.704184	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	28	25	3	0
chr14	89124463	89124463	T	T	intronic	EML5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	89160606	89160606	T	T	intronic	EML5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr14	89163144	89163144	T	G	intronic	EML5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr14	89171982	89171982	C	A	intronic	EML5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.99602	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	193	178	15	0
chr14	89307472	89307472	A	G	exonic	TTC8	NaN	nonsynonymous SNV	TTC8:NM_001288781:exon5:c.A391G:p.T131A,TTC8:NM_198309:exon5:c.A391G:p.T131A,TTC8:NM_198310:exon5:c.A391G:p.T131A,TTC8:NM_144596:exon6:c.A421G:p.T141A	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.039	B	0.024	B	0.000	N	1.000	D	1.75	L	-1.13	T	-0.603	T	0.366	T	0.26	2.667	14.88	4.32	0.916	7.366	11.037	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.245782	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	415	407	8	0
chr14	89307562	89307562	A	A	intronic	TTC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	89310116	89310116	A	T	intronic	TTC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.37483	nearby_gap_events	REJECT	73	63	10	0
chr14	89327470	89327470	T	T	intronic	TTC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	89628715	89628715	A	G	UTR3	FOXN3	NM_001085471:c.*43T>C,NM_005197:c.*43T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr14	89628762	89628762	T	A	exonic	FOXN3	NaN	nonsynonymous SNV	FOXN3:NM_005197:exon6:c.A1403T:p.N468I,FOXN3:NM_001085471:exon7:c.A1469T:p.N490I	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	0.345	N	-3.59	D	0.937	D	0.841	D	0.759	3.657	18.59	5.74	2.193	5.173	15.711	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.943869	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	400	381	19	0
chr14	89628926	89628926	C	A	exonic	FOXN3	NaN	synonymous SNV	FOXN3:NM_005197:exon6:c.G1239T:p.L413L,FOXN3:NM_001085471:exon7:c.G1305T:p.L435L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.203823	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	74	67	7	0
chr14	89628927	89628927	A	G	exonic	FOXN3	NaN	nonsynonymous SNV	FOXN3:NM_005197:exon6:c.T1238C:p.L413P,FOXN3:NM_001085471:exon7:c.T1304C:p.L435P	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	1.905	M	0.0	T	-0.188	T	0.413	T	0.807	3.589	18.28	5.95	2.279	6.347	16.085	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.371681	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	70	63	7	0
chr14	89747216	89747216	T	G	intronic	FOXN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr14	89806065	89806065	G	T	intronic	FOXN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	89806067	89806067	A	T	intronic	FOXN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	90398021	90398021	A	A	intronic	EFCAB11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr14	90398832	90398832	T	A	intronic	EFCAB11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.559006	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	255	228	27	0
chr14	90455160	90455160	T	T	intronic	TDP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	64	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr14	90458297	90458297	A	G	exonic	TDP1	NaN	nonsynonymous SNV	TDP1:NM_001008744:exon12:c.A1403G:p.E468G,TDP1:NM_018319:exon13:c.A1403G:p.E468G	NaN	NaN	NaN	0.2	T	0.856	P	0.397	B	0.000	D	0.995	D	1.5	L	0.89	T	-0.721	T	0.248	T	0.556	3.228	16.82	5.94	2.272	7.808	15.377	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.495479	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	55	47	8	0
chr14	90734886	90734886	T	T	intronic	PSMC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	90736730	90736730	A	A	intronic	PSMC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	90988612	90988612	G	T	intergenic	LINC00642,TTC7B	dist=63363;dist=18320	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	91007618	91007618	T	C	UTR3	TTC7B	NM_001010854:c.*94A>G	NaN	NaN	rs1294572	NaN	0.982428	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.734121	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	58
chr14	91113221	91113221	T	T	ncRNA_exonic	LOC101928909	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	0	0
chr14	91121478	91121478	A	C	intronic	TTC7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.326552	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	82	74	8	3
chr14	91123453	91123453	A	A	intronic	TTC7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	53	40	0	0
chr14	91124813	91124813	A	T	intronic	TTC7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	91124814	91124814	C	G	intronic	TTC7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	91124815	91124815	A	C	intronic	TTC7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	91124816	91124816	C	A	intronic	TTC7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	91161862	91161862	C	T	exonic	TTC7B	NaN	synonymous SNV	TTC7B:NM_001010854:exon6:c.G759A:p.T253T	rs10146731	NaN	0.619409	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	197.815	0	NaN	NA	NA	110	0	110	40
chr14	91341508	91341508	A	C	intronic	RPS6KA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	91386447	91386447	T	G	intronic	RPS6KA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	2	5	0
chr14	91386449	91386449	T	C	intronic	RPS6KA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr14	91626740	91626740	A	G	exonic	C14orf159	NaN	synonymous SNV	C14orf159:NM_001102368:exon3:c.A102G:p.G34G,C14orf159:NM_001286471:exon3:c.A102G:p.G34G,C14orf159:NM_024952:exon3:c.A102G:p.G34G,C14orf159:NM_001102367:exon4:c.A102G:p.G34G,C14orf159:NM_001102366:exon5:c.A102G:p.G34G,C14orf159:NM_001102369:exon5:c.A102G:p.G34G,C14orf159:NM_001286472:exon5:c.A102G:p.G34G,C14orf159:NM_001286473:exon5:c.A102G:p.G34G,C14orf159:NM_001286470:exon6:c.A102G:p.G34G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	91666040	91666040	C	T	intronic	C14orf159	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	2	3	0
chr14	91666041	91666041	C	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	1	3,3	0
chr14	91666048	91666048	A	C	intronic	C14orf159	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	22	14	5	0
chr14	91739080	91739080	GA	G,GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	374.471	0	NaN	NA	NA	38	0	9	1
chr14	91739363	91739363	G	C	exonic	CCDC88C	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC88C:NM_001080414:exon30:c.C5693G:p.P1898R	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.893	P	0.565	P	0.191	U	1.000	N	2.095	M	2.29	T	-0.887	T	0.173	T	0.104	2.346	13.80	3.99	2.266	2.420	10.882	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	2.0928502602423273E-9	NA	0	0	NaN	NA	NA	104	20	84	0
chr14	91739365	91739365	G	A	exonic	CCDC88C	NaN	synonymous SNV	CCDC88C:NM_001080414:exon30:c.C5691T:p.A1897A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	2.726275543344162E-9	NA	0	0	NaN	NA	NA	107	23	84	0
chr14	91739366	91739366	G	A	exonic	CCDC88C	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC88C:NM_001080414:exon30:c.C5690T:p.A1897V	NaN	NaN	NaN	1	T	0.194	B	0.074	B	0.182	U	1.000	N	1.61	L	2.48	T	-0.985	T	0.073	T	0.101	1.620	11.38	3.99	2.266	0.599	7.504	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	1.288811454416304E-8	NA	0	0	NaN	NA	NA	107	24	83	0
chr14	91744233	91744233	G	C	intronic	CCDC88C	NaN	NaN	NaN	rs17796691	NaN	0.0461262	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.934148	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	6	7	14
chr14	91757492	91757492	A	G	intronic	CCDC88C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr14	91760436	91760436	T	T	intronic	CCDC88C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	91760677	91760677	A	A	intronic	CCDC88C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	91776359	91776359	A	C	intronic	CCDC88C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr14	91787399	91787399	T	T	intronic	CCDC88C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	91808649	91808649	T	G	intronic	CCDC88C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	1	2	0
chr14	91939352	91939352	T	T	intronic	SMEK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr14	91947879	91947879	T	A	intronic	SMEK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	91947881	91947881	C	A	intronic	SMEK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr14	91947883	91947883	T	C	intronic	SMEK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr14	91948643	91948643	G	A	intronic	SMEK1	NaN	NaN	NaN	rs6575195	NaN	0.912141	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	147.458	0	NaN	NA	NA	141	91	50	48
chr14	92074545	92074545	T	A	intronic	CATSPERB	NaN	NaN	NaN	rs1743159	NaN	0.61861	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	54.894506	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	20	22	54
chr14	92074856	92074856	C	A	intronic	CATSPERB	NaN	NaN	NaN	rs1743158	NaN	0.618211	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.002126	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	9	12	45
chr14	92091370	92091370	A	G	intronic	CATSPERB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr14	92140446	92140446	A	G	intronic	CATSPERB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.062673	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	108	101	7	0
chr14	92185731	92185731	G	A	intronic	CATSPERB	NaN	NaN	NaN	rs17783516	ID=COSN164767;OCCURENCE=1(breast)	0.377995	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.147695	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	6	13	28
chr14	92343945	92343945	T	C	exonic	FBLN5	NaN	synonymous SNV	FBLN5:NM_006329:exon10:c.A1071G:p.S357S	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.927	T	0.083	T	.	1.221	9.956	-12.3	-3.245	-4.100	2.679	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.332006	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	101	97	4	0
chr14	92454604	92454604	A	G	intronic	TRIP11	NaN	NaN	NaN	rs2273182	NaN	0.271765	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	108.039	0	NaN	NA	NA	44	35	9	15
chr14	92465805	92465805	A	T	intronic	TRIP11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	14	5	8	0
chr14	92473912	92473912	T	C	intronic	TRIP11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr14	92478198	92478198	A	G	intronic	TRIP11	NaN	NaN	NaN	rs7151632	NaN	0.130591	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	110.193144	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	95	49	46	9
chr14	92478223	92478223	A	A	intronic	TRIP11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr14	92480423	92480423	T	C	intronic	TRIP11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.087537	nearby_gap_events	REJECT	113	106	7	0
chr14	92488299	92488299	A	A	intronic	TRIP11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	92549586	92549586	G	A	exonic	ATXN3	NaN	synonymous SNV	ATXN3:NM_001164779:exon3:c.C129T:p.V43V,ATXN3:NM_001127697:exon5:c.C339T:p.V113V,ATXN3:NM_001164781:exon5:c.C282T:p.V94V,ATXN3:NM_001127696:exon6:c.C447T:p.V149V,ATXN3:NM_030660:exon6:c.C327T:p.V109V,ATXN3:NM_004993:exon7:c.C492T:p.V164V	rs16999141	ID=COSM147835;OCCURENCE=1(stomach)	0.566693	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.218843	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	0	18	34
chr14	92555065	92555065	G	A	intronic	ATXN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.867207	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	214	208	6	0
chr14	92555199	92555199	T	C	intronic	ATXN3	NaN	NaN	NaN	rs8003041	NaN	0.334465	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	255.67807	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	219	111	108	27
chr14	92555220	92555220	A	A	intronic	ATXN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	92559678	92559678	G	C	intronic	ATXN3	NaN	NaN	NaN	rs4904834	NaN	0.495008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	173.79	0	NaN	NA	NA	245	0	245	1
chr14	92559976	92559976	A	G	intronic	ATXN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	92563173	92563173	A	G	exonic	ATXN3	NaN	nonsynonymous SNV	ATXN3:NM_001127696:exon2:c.T34C:p.S12P,ATXN3:NM_001127697:exon2:c.T34C:p.S12P,ATXN3:NM_001164774:exon2:c.T34C:p.S12P,ATXN3:NM_001164776:exon2:c.T34C:p.S12P,ATXN3:NM_001164778:exon2:c.T34C:p.S12P,ATXN3:NM_004993:exon2:c.T34C:p.S12P	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.983	D	0.952	D	0.000	D	1.000	D	2.81	M	0.89	T	-0.416	T	0.293	T	0.949	4.336	22.8	5.51	2.120	8.841	14.865	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.495597	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	158	153	5	0
chr14	92582587	92582587	A	C	intronic	NDUFB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	2.5990436845131594E-4	NA	0	0	NaN	NA	NA	137	90	47	0
chr14	92588461	92588461	A	G	UTR5	CPSF2	NM_017437:c.-8868A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	8	0	7	0
chr14	92609334	92609334	T	C	intronic	CPSF2	NaN	NaN	NaN	rs35609412	NaN	0.24381	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	72	48	24	6
chr14	92623105	92623105	T	A	intronic	CPSF2	NaN	NaN	NaN	rs200968712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	44.4726	0	NaN	NA	NA	200	166	41	19
chr14	92879026	92879026	G	C	intronic	SLC24A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr14	92909212	92909212	A	G	intronic	SLC24A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr14	92911579	92911579	G	A	intronic	SLC24A4	NaN	NaN	NaN	rs78521571	NaN	0.0163738	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	63.89281	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	19	27	0
chr14	92911580	92911580	G	T	intronic	SLC24A4	NaN	NaN	NaN	rs79012680	NaN	0.0163738	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	61.212383	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	19	27	0
chr14	92922966	92922966	G	T	intronic	SLC24A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.748243	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	92	84	8	0
chr14	92942396	92942396	G	C	intronic	SLC24A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr14	92942397	92942397	A	C	intronic	SLC24A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	92952954	92952954	T	T	intronic	SLC24A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr14	93125498	93125498	A	A	intronic	RIN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	82	67	0	0
chr14	93125912	93125912	A	A	intronic	RIN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	16	14	0	0
chr14	93175841	93175841	T	T	intronic	LGMN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	93180130	93180130	C	A	intronic	LGMN	NaN	NaN	NaN	rs201188566	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	120	70	50	0
chr14	93180136	93180136	C	G	intronic	LGMN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	113	63	50	0
chr14	93185254	93185254	A	A	intronic	LGMN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	93290723	93290723	A	G	intronic	GOLGA5	NaN	NaN	NaN	rs3818256	NaN	0.859625	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	74.9754	0	NaN	NA	NA	79	0	79	6
chr14	93397971	93397971	C	G	exonic	CHGA	NaN	synonymous SNV	CHGA:NM_001275:exon6:c.C732G:p.V244V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.400932	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	18	14	4	0
chr14	93429144	93429144	C	T	exonic	ITPK1	NaN	nonsynonymous SNV	ITPK1:NM_001142593:exon6:c.G415A:p.D139N,ITPK1:NM_001142594:exon6:c.G415A:p.D139N,ITPK1:NM_014216:exon6:c.G415A:p.D139N	NaN	NaN	NaN	0.46	T	0.0	B	0.0	B	0.001	N	0.870	N	0.625	N	3.03	T	-1.034	T	0.017	T	0.035	3.297	17.08	4.62	1.315	4.539	14.087	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.710565	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	174	168	6	0
chr14	93435177	93435177	G	T	intronic	ITPK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	93435179	93435179	G	T	intronic	ITPK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	93649383	93649383	C	T	UTR3	MOAP1	NM_022151:c.*149G>A	NaN	NaN	rs15837	NaN	0.805112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	100.616	0	NaN	NA	NA	136	79	57	34
chr14	93673580	93673580	A	G	UTR5	UBR7	NM_175748:c.-57A>G	NaN	NaN	rs2255370	NaN	0.36222	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	35.1084	0	NaN	NA	NA	84	66	18	30
chr14	93685784	93685784	A	A	intronic	UBR7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	15	15	0	0
chr14	93709289	93709289	T	T	exonic	BTBD7	NaN	synonymous SNV	BTBD7:NM_001289133:exon9:c.A1676A:p.Q559Q,BTBD7:NM_001002860:exon11:c.A2729A:p.Q910Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	92	87	0	0
chr14	93730259	93730259	A	G	exonic	BTBD7	NaN	nonsynonymous SNV	BTBD7:NM_001289133:exon2:c.T190C:p.S64P,BTBD7:NM_001002860:exon4:c.T1243C:p.S415P	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	2.545	M	-0.37	T	0.088	D	0.496	T	0.961	4.712	26.2	4.99	1.904	9.339	14.728	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.99362	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	352	345	7	0
chr14	93762352	93762352	C	C	exonic	BTBD7	NaN	synonymous SNV	BTBD7:NM_001002860:exon2:c.G46G:p.V16V,BTBD7:NM_018167:exon2:c.G46G:p.V16V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	62	NaN	NA	NA	95	77	0	0
chr14	93931106	93931106	T	G	intronic	UNC79	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr14	93931107	93931107	C	A	intronic	UNC79	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr14	93963618	93963618	G	A	exonic	UNC79	NaN	nonsynonymous SNV	UNC79:NM_020818:exon7:c.G353A:p.G118E	NaN	NaN	NaN	0.11	T	1.0	D	0.982	D	0.000	D	1.000	D	1.445	L	2.31	T	-1.123	T	0.100	T	0.884	3.808	19.33	5.48	2.569	9.869	19.355	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.234465	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	126	120	6	0
chr14	93994870	93994870	A	G	intronic	UNC79	NaN	NaN	NaN	rs17094893	ID=COSN164773;OCCURENCE=1(breast)	0.457668	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	109.740004	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	1	40	47
chr14	93995658	93995658	T	C	exonic	UNC79	NaN	nonsynonymous SNV	UNC79:NM_020818:exon10:c.T548C:p.V183A	NaN	NaN	NaN	0	D	0.954	P	0.954	D	0.000	D	1.000	D	0.69	N	2.0	T	-1.052	T	0.085	T	0.875	4.092	21.1	5.65	2.139	7.160	15.879	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.76611	nearby_gap_events	REJECT	74	69	5	0
chr14	94007075	94007075	C	T	exonic	UNC79	NaN	synonymous SNV	UNC79:NM_020818:exon13:c.C891T:p.G297G	rs1951716	NaN	0.485224	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	98.044838	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	0	33	51
chr14	94079066	94079066	T	T	intronic	UNC79	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr14	94084437	94084437	A	C	intronic	UNC79	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.345264	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	33	28	5	0
chr14	94084438	94084438	T	A	intronic	UNC79	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.808964	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	32	27	5	0
chr14	94084439	94084439	C	T	intronic	UNC79	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.14945054945054978	NA	0	0	NaN	NA	NA	18	14	4	0
chr14	94187772	94187772	G	T	UTR3	PRIMA1	NM_178013:c.*18C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	0.012699796570764072	Somatic	27.4138	27	16.654745	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	26	18	8	1
chr14	94187832	94187832	C	T	exonic	PRIMA1	NaN	synonymous SNV	PRIMA1:NM_178013:exon5:c.G420A:p.S140S	rs1887197	NaN	0.498802	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.957135	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	0	15	48
chr14	94244399	94244399	T	A	intronic	PRIMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	94244400	94244400	T	G	intronic	PRIMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	94244401	94244401	T	A	intronic	PRIMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	94245649	94245649	A	G	exonic	PRIMA1	NaN	synonymous SNV	PRIMA1:NM_178013:exon3:c.T102C:p.H34H	rs4905087	NaN	0.585663	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.128768	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	10
chr14	94245652	94245652	C	C	exonic	PRIMA1	NaN	synonymous SNV	PRIMA1:NM_178013:exon3:c.G99G:p.T33T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr14	94247165	94247165	G	A	intronic	PRIMA1	NaN	NaN	NaN	rs10873438	NaN	0.616014	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	94254684	94254684	A	A	intronic	PRIMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	94391574	94391574	T	T	ncRNA_intronic	FAM181A-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr14	94417541	94417541	A	G	exonic	ASB2	NaN	synonymous SNV	ASB2:NM_016150:exon4:c.T540C:p.N180N,ASB2:NM_001202429:exon6:c.T684C:p.N228N	rs4277287	NaN	0.811901	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	61.3083	0	NaN	NA	NA	152	67	85	54
chr14	94423501	94423501	C	A	UTR5	ASB2	NM_016150:c.-223G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr14	94441258	94441258	C	C	intronic	ASB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	69	NaN	NA	NA	74	61	0	0
chr14	94505441	94505441	C	G	intronic	OTUB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.551605	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	72	58	14	0
chr14	94524216	94524216	T	C	exonic	DDX24	NaN	synonymous SNV	DDX24:NM_020414:exon6:c.A1941G:p.A647A	rs1056810	ID=COSM1162346;OCCURENCE=1(pancreas)	0.294329	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	81.2272	0	NaN	NA	NA	92	36	56	8
chr14	94526980	94526980	A	A	intronic	DDX24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr14	94545525	94545525	T	C	exonic	DDX24	NaN	synonymous SNV	DDX24:NM_020414:exon2:c.A564G:p.K188K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.907117	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	198	193	5	0
chr14	94578188	94578188	C	A	intronic	IFI27	NaN	NaN	NaN	rs1243080	NaN	0.43111	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	58.591174	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	9	25	30
chr14	94595511	94595511	C	G	intronic	IFI27L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	94595514	94595514	C	A	intronic	IFI27L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr14	94595585	94595585	T	T	intronic	IFI27L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	51	45	0	0
chr14	94640945	94640945	C	CG	intronic	PPP4R4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.83977	0	NaN	NA	NA	9	8	3	0
chr14	94700251	94700251	TA	T,TT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	135.16	0	NaN	NA	NA	146	94	41	2
chr14	94722734	94722734	T	G	intronic	PPP4R4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.253482	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	99	90	9	0
chr14	94745083	94745083	GTTTTTTTTT	GTTTTTTTTG,GTTTTTTTTTG,GTTTTTTTT,TTTTTTTTTG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	175.983	0	NaN	NA	NA	31	0	2	0
chr14	94908300	94908300	G	C	downstream	SERPINA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	94912982	94912982	A	A	intronic	SERPINA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr14	94935458	94935458	T	T	intronic	SERPINA9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr14	95056547	95056547	C	T	exonic	SERPINA5	NaN	synonymous SNV	SERPINA5:NM_000624:exon4:c.C789T:p.A263A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.757925	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	328	314	14	0
chr14	95056774	95056774	A	A	intronic	SERPINA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	95058462	95058462	A	C	exonic	SERPINA5	NaN	synonymous SNV	SERPINA5:NM_000624:exon6:c.A1107C:p.I369I	rs6116	NaN	0.279952	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2473.08	0	NaN	NA	NA	222	0	222	28
chr14	95085477	95085477	C	T	intronic	SERPINA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.944159	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	43	35	8	0
chr14	95234778	95234778	T	C	UTR3	GSC	NM_173849:c.*50A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.07214	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	243	233	10	0
chr14	95239227	95239227	A	G	intergenic	GSC,DICER1	dist=2728;dist=313338	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	95239228	95239228	C	A	intergenic	GSC,DICER1	dist=2729;dist=313337	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	95352412	95352412	G	G	intergenic	GSC,DICER1	dist=115913;dist=200153	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	95352413	95352413	C	C	intergenic	GSC,DICER1	dist=115914;dist=200152	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	95360240	95360240	G	A	intergenic	GSC,DICER1	dist=123741;dist=192325	NaN	NaN	rs60573630	NaN	0.318091	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	12	2	10	0
chr14	95396149	95396149	C	G	intergenic	GSC,DICER1	dist=159650;dist=156416	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr14	95579293	95579293	T	T	intronic	DICER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	95590884	95590884	C	T	exonic	DICER1	NaN	nonsynonymous SNV	DICER1:NM_001195573:exon7:c.G1025A:p.R342K,DICER1:NM_001271282:exon8:c.G1025A:p.R342K,DICER1:NM_001291628:exon8:c.G1025A:p.R342K,DICER1:NM_177438:exon8:c.G1025A:p.R342K,DICER1:NM_030621:exon10:c.G1025A:p.R342K	NaN	NaN	NaN	0.7	T	0.716	P	0.345	B	0.000	D	1.000	D	1.845	L	1.22	T	-1.041	T	0.104	T	0.596	4.412	23.4	5.54	2.607	7.267	19.489	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.155621	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	36	33	3	0
chr14	95662815	95662815	A	A	intronic	CLMN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	85	61	0	0
chr14	95670693	95670693	A	A	exonic	CLMN	NaN	synonymous SNV	CLMN:NM_024734:exon9:c.T993T:p.N331N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	49	43	0	0
chr14	95677308	95677308	G	G	intronic	CLMN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr14	95849630	95849630	C	T	intergenic	LOC101929080,LINC00341	dist=47789;dist=23974	NaN	NaN	rs34682171	NaN	0.118411	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	95849639	95849639	G	T	intergenic	LOC101929080,LINC00341	dist=47798;dist=23965	NaN	NaN	rs1187731	NaN	0.516374	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	95850530	95850530	A	C	intergenic	LOC101929080,LINC00341	dist=48689;dist=23074	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	95884323	95884323	G	A	exonic	SYNE3	NaN	nonsynonymous SNV	SYNE3:NM_152592:exon17:c.C2768T:p.A923V	rs12434757	ID=COSM1477880,COSM433554,COSM433553;OCCURENCE=2(breast)	0.55012	1	T	0.0	B	0.003	B	0.190	N	0.000	P	-1.32	N	2.14	T	-0.944	T	0.000	T	0.082	-0.086	3.580	2.34	-0.092	1.201	8.572	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	117.667	0	NaN	NA	NA	88	0	88	5
chr14	95906506	95906506	C	C	intronic	SYNE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	22	21	0	0
chr14	95906507	95906507	T	T	intronic	SYNE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	22	20	0	0
chr14	95918785	95918785	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	0	2,2	0
chr14	95918787	95918787	G	C	intronic	SYNE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr14	96077613	96077613	C	T	intergenic	GLRX5,TCL6	dist=66558;dist=39902	NaN	NaN	rs11628756	NaN	0.445887	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	9	2	7	0
chr14	96178173	96178173	G	A	intronic	TCL1A	NaN	NaN	NaN	rs2296311	NaN	0.217851	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	134.184	0	NaN	NA	NA	68	35	33	14
chr14	96180242	96180242	C	A	intronic	TCL1A	NaN	NaN	NaN	rs1122138	NaN	0.220847	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.7032	0	NaN	NA	NA	15	11	3	8
chr14	96572622	96572622	G	A	intergenic	C14orf132,BDKRB2	dist=12314;dist=98513	NaN	NaN	rs745378	NaN	0.178914	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr14	96703347	96703347	C	A	intronic	BDKRB2	NaN	NaN	NaN	rs2069577	NaN	0.373003	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	115.566488	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	99	50	49	37
chr14	96757361	96757361	T	A	intronic	ATG2B	NaN	NaN	NaN	rs10454690	NaN	0.796126	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1360.98	0	NaN	NA	NA	126	1	125	45
chr14	96761514	96761514	T	A	intronic	ATG2B	NaN	NaN	NaN	rs45468796	NaN	0.357029	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	478.439	0	NaN	NA	NA	182	94	88	22
chr14	96781896	96781896	G	A	exonic	ATG2B	NaN	nonsynonymous SNV	ATG2B:NM_018036:exon22:c.C3386T:p.P1129L	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.031	B	0.01	B	0.070	U	0.991	D	0.55	N	2.82	T	-1.057	T	0.021	T	0.199	2.339	13.78	4.3	1.190	1.190	13.469	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.479292	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	177	171	6	0
chr14	96783124	96783124	A	A	intronic	ATG2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	5	0	0
chr14	96784094	96784094	T	C	exonic	ATG2B	NaN	nonsynonymous SNV	ATG2B:NM_018036:exon19:c.A2978G:p.Q993R	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.993	D	0.968	D	0.000	U	1.000	D	1.87	L	1.0	T	-0.688	T	0.229	T	0.937	4.314	22.6	5.45	2.187	7.709	15.805	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.41852	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	58	55	3	0
chr14	96797724	96797724	G	A	exonic	ATG2B	NaN	synonymous SNV	ATG2B:NM_018036:exon11:c.C1719T:p.H573H	rs1822372	NaN	0.84405	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	198.100582	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	0	66	58
chr14	96800857	96800857	A	C	intronic	ATG2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.046063	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	168	146	22	0
chr14	96829290	96829290	G	A	exonic	ATG2B	NaN	synonymous SNV	ATG2B:NM_018036:exon1:c.C24T:p.S8S	rs12434329	NaN	0.479433	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.935407	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	3	12	50
chr14	96922647	96922647	G	A	intronic	AK7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr14	96924596	96924596	C	A	intronic	AK7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr14	96987303	96987303	A	T	intronic	PAPOLA	NaN	NaN	NaN	rs45604538	NaN	0.0477236	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	.	.	-0.980	T	0.009	T	0.127	1.809	12.01	-5.27	-0.479	-0.193	8.590	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.49127	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	61	31	30	7
chr14	96987437	96987437	A	G	intronic	PAPOLA	NaN	NaN	NaN	rs10139164	NaN	0.264776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	15	14.170063	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	15	7	22
chr14	97008706	97008706	A	G	intronic	PAPOLA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr14	97009011	97009011	T	T	intronic	PAPOLA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr14	97009389	97009389	A	A	intronic	PAPOLA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr14	97018766	97018766	A	G	intronic	PAPOLA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	97022352	97022352	A	G	intronic	PAPOLA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.156	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr14	97029130	97029130	C	T	intronic	PAPOLA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr14	97029133	97029133	T	C	intronic	PAPOLA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	17	9	8	0
chr14	97065497	97065497	A	C	intergenic	PAPOLA,VRK1	dist=32044;dist=198187	NaN	NaN	rs4905507	NaN	0.69369	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr14	97313536	97313536	A	T	intronic	VRK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	16	8	8	1
chr14	97319570	97319570	A	G	intronic	VRK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	1	5	0
chr14	97756201	97756201	A	G	intergenic	LINC00618,LOC101929241	dist=344470;dist=168952	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	98021846	98021846	G	T	ncRNA_intronic	LOC101929241	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	98148344	98148344	C	A	ncRNA_intronic	LOC100129345	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	99246710	99246710	T	A	intergenic	C14orf177,BCL11B	dist=62607;dist=388915	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr14	99283290	99283290	C	T	intergenic	C14orf177,BCL11B	dist=99187;dist=352335	NaN	NaN	rs737514	NaN	0.053115	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr14	99359465	99359465	C	C	intergenic	C14orf177,BCL11B	dist=175362;dist=276160	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr14	99889161	99889161	C	T	intronic	SETD3	NaN	NaN	NaN	rs56055510	NaN	0.452476	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr14	99924871	99924871	C	G	exonic	SETD3	NaN	synonymous SNV	SETD3:NM_032233:exon6:c.G420C:p.G140G,SETD3:NM_199123:exon6:c.G420C:p.G140G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.216737	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	229	212	17	0
chr14	99924885	99924885	A	A	intronic	SETD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr14	99976551	99976551	A	A	exonic	CCNK	NaN	synonymous SNV	CCNK:NM_001099402:exon11:c.A1175A:p.D392D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr14	99981544	99981544	C	A	UTR3	CCDC85C	NM_001144995:c.*39G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.379228	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	224	210	14	0
chr14	99988486	99988486	T	C	exonic	CCDC85C	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC85C:NM_001144995:exon3:c.A959G:p.Q320R	NaN	NaN	NaN	0.83	T	0.958	D	0.419	B	0.080	U	1.000	D	2.135	M	.	.	-0.588	T	0.308	T	0.593	3.850	19.56	3.71	0.694	5.102	10.802	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.1400000000000002	NA	0	0	5.491262	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	17	13	4	0
chr15	100015468	100015468	C	T	intergenic	LRRC28,MEF2A	dist=88954;dist=90665	NaN	NaN	rs8027441	NaN	0.21266	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	100035561	100035561	C	A	intergenic	LRRC28,MEF2A	dist=109047;dist=70572	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	100251025	100251025	A	A	intronic	MEF2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	100269735	100269735	G	T	exonic	LYSMD4	NaN	nonsynonymous SNV	LYSMD4:NM_001284420:exon2:c.C301A:p.Q101K,LYSMD4:NM_001284417:exon3:c.C484A:p.Q162K,LYSMD4:NM_001284418:exon3:c.C484A:p.Q162K,LYSMD4:NM_001284421:exon4:c.C106A:p.Q36K,LYSMD4:NM_001284419:exon5:c.C472A:p.Q158K,LYSMD4:NM_001284422:exon5:c.C106A:p.Q36K,LYSMD4:NM_152449:exon6:c.C487A:p.Q163K	NaN	NaN	NaN	0.88	T	0.159	B	0.026	B	0.099	N	1.000	N	0.665	N	2.28	T	-1.028	T	0.024	T	0.072	-1.860	0.009	-1.38	0.103	0.735	6.565	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.157069	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	50	42	8	0
chr15	100270400	100270400	C	T	intronic	LYSMD4	NaN	NaN	NaN	rs713613	NaN	0.640974	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	100271253	100271253	C	T	intronic	LYSMD4	NaN	NaN	NaN	rs12185079	NaN	0.237819	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	143.392	0	NaN	NA	NA	59	33	26	27
chr15	100509915	100509915	G	G	intergenic	DNM1P46,ADAMTS17	dist=162783;dist=1728	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	100509976	100509976	C	C	intergenic	DNM1P46,ADAMTS17	dist=162844;dist=1667	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	100516474	100516474	A	A	intronic	ADAMTS17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	20	17	0	0
chr15	100649528	100649528	A	G	intronic	ADAMTS17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr15	100653112	100653112	T	G	intronic	ADAMTS17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	100672237	100672237	T	G	exonic	ADAMTS17	NaN	synonymous SNV	ADAMTS17:NM_139057:exon12:c.A1696C:p.R566R	rs12907333	NaN	0.997604	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	74.61618	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	0	28	44
chr15	100692782	100692782	C	G	intronic	ADAMTS17	NaN	NaN	NaN	rs7162227	NaN	0.0994409	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	106.769	0	NaN	NA	NA	52	28	24	13
chr15	100695561	100695561	A	A	intronic	ADAMTS17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	100794363	100794363	C	T	exonic	ADAMTS17	NaN	synonymous SNV	ADAMTS17:NM_139057:exon7:c.G1053A:p.K351K	rs4369638	NaN	0.821486	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	131.27173	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	58	1	57	52
chr15	100855474	100855474	C	C	intronic	ADAMTS17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	100859569	100859569	G	A	intronic	ADAMTS17	NaN	NaN	NaN	rs7182422	NaN	0.137181	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	100875874	100875874	A	C	intronic	ADAMTS17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	100942962	100942962	T	C	exonic	CERS3	NaN	nonsynonymous SNV	CERS3:NM_001290342:exon13:c.A1108G:p.R370G,CERS3:NM_001290343:exon13:c.A1108G:p.R370G,CERS3:NM_178842:exon13:c.A1108G:p.R370G,CERS3:NM_001290341:exon14:c.A1141G:p.R381G	rs2439928	NaN	0.986022	0.59	T	0.0	B	0.0	B	0.236	N	1.000	P	0	N	3.29	T	-0.987	T	0.000	T	0.044	-1.136	0.112	3.36	0.626	1.473	7.933	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	239.062	0	NaN	NA	NA	84	0	84	39
chr15	101020129	101020129	T	A	intronic	CERS3	NaN	NaN	NaN	rs2587764	NaN	0.236621	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	96.40306	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	80	35	45	26
chr15	101024931	101024931	A	C	intronic	CERS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	101024932	101024932	G	C	intronic	CERS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	101114482	101114482	AAC	A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	583.038	0	NaN	NA	NA	255	128	113	13
chr15	101115448	101115448	C	A	intronic	LINS	NaN	NaN	NaN	rs4965678	NaN	0.750399	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	606.363	0	NaN	NA	NA	210	95	115	56
chr15	101196832	101196832	G	T	intergenic	ASB7,ALDH1A3	dist=4928;dist=223065	NaN	NaN	rs68106855	NaN	0.302117	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr15	101401287	101401287	C	A	intergenic	ASB7,ALDH1A3	dist=209383;dist=18610	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	101433300	101433300	A	T	intronic	ALDH1A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	8	0	7	0
chr15	101564970	101564970	T	T	intronic	LRRK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr15	101569031	101569031	G	A	intronic	LRRK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	101588512	101588512	T	A	intronic	LRRK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	1	2	0
chr15	101589019	101589019	C	T	intronic	LRRK1	NaN	NaN	NaN	rs11635234	NaN	0.317292	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	101589821	101589821	T	T	intronic	LRRK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr15	101593051	101593051	G	A	intronic	LRRK1	NaN	NaN	NaN	rs4965781	NaN	0.277556	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	23.1213	0	NaN	NA	NA	105	48	57	7
chr15	101593699	101593699	G	T	intronic	LRRK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	16.2371	0	NaN	NA	NA	6	3	3	2
chr15	101606814	101606814	T	G	intronic	LRRK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr15	101608938	101608938	A	C	exonic	LRRK1	NaN	nonsynonymous SNV	LRRK1:NM_024652:exon34:c.A5933C:p.N1978T	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.001	B	0.002	B	0.001	D	1.000	N	1.43	L	-0.78	T	-0.894	T	0.234	T	0.111	1.629	11.40	0.842	-0.096	2.176	5.994	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.362121	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	247	241	6	0
chr15	101651025	101651025	G	A	intergenic	LRRK1,CHSY1	dist=40708;dist=64903	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	101710386	101710386	G	C	intergenic	LRRK1,CHSY1	dist=100069;dist=5542	NaN	NaN	rs11630300	NaN	0.408147	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr15	101717680	101717680	G	T	exonic	CHSY1	NaN	synonymous SNV	CHSY1:NM_014918:exon3:c.C2322A:p.T774T	rs8024370	NaN	0.759784	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	88.2153	0	NaN	NA	NA	130	0	130	13
chr15	101719208	101719208	T	T	intronic	CHSY1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	15	14	0	0
chr15	101791262	101791262	C	A	intronic	CHSY1	NaN	NaN	NaN	rs7171436	NaN	0.288938	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	47.3012	28	18.847145	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	5	8	2
chr15	101791359	101791359	C	G	exonic	CHSY1	NaN	synonymous SNV	CHSY1:NM_014918:exon1:c.G303C:p.R101R	rs7176149	NaN	0.228035	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.6485	0	NaN	NA	NA	10	7	3	3
chr15	101832301	101832301	A	A	intronic	SNRPA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	101848334	101848334	C	T	ncRNA_exonic	LOC100507472	NaN	NaN	NaN	rs737033	NaN	0.130591	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	53	21	32	0
chr15	101858455	101858455	T	T	intronic	PCSK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr15	101910511	101910511	A	C	intronic	PCSK6	NaN	NaN	NaN	rs2073591	NaN	0.452875	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	179.793	0	NaN	NA	NA	36	16	20	26
chr15	101924653	101924653	A	A	intronic	PCSK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr15	101933401	101933401	T	G	intronic	PCSK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	101948340	101948340	C	C	intronic	PCSK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	101948365	101948365	C	C	intronic	PCSK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	102068963	102068963	C	C	intergenic	PCSK6,TM2D3	dist=38776;dist=113086	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	102076681	102076681	T	G	intergenic	PCSK6,TM2D3	dist=46494;dist=105368	NaN	NaN	rs8031371	NaN	0.421326	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	102079854	102079854	G	A	intergenic	PCSK6,TM2D3	dist=49667;dist=102195	NaN	NaN	rs62028865	NaN	0.0682907	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	102105641	102105641	G	A	intergenic	PCSK6,TM2D3	dist=75454;dist=76408	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr15	102153200	102153200	G	T	intergenic	PCSK6,TM2D3	dist=123013;dist=28849	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	102192418	102192418	C	T	intronic	TM2D3	NaN	NaN	NaN	rs3743188	NaN	0.332867	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.704673	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	12	5	21
chr15	102248919	102248919	T	T	intronic	TARSL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	102264476	102264476	C	A	exonic	TARSL2	NaN	nonsynonymous SNV	TARSL2:NM_152334:exon1:c.G115T:p.A39S	rs1143136	NaN	0.192292	0.12	T	0.187	B	0.033	B	0.447	N	1.000	P	1.39	L	.	.	-1.033	T	0.000	T	0.044	1.254	10.09	2.33	0.708	0.678	7.760	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.957924	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	6	8	10
chr15	102358534	102358534	G	A	exonic	OR4F15	NaN	nonsynonymous SNV	OR4F15:NM_001001674:exon1:c.G145A:p.V49I	NaN	NaN	NaN	.	.	0.25	B	0.106	B	0.001	N	1.000	N	-0.005	N	4.91	T	-0.867	T	0.003	T	0.07	0.174	4.937	2.75	0.482	0.621	9.186	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.761626	possible_contamination	REJECT	87	82	5	0
chr15	20462608	20462608	A	A	intergenic	NONE,CHEK2P2	dist=NONE;dist=25389	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	22	19	0	0
chr15	20495020	20495020	C	C	ncRNA_intronic	CHEK2P2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	20562703	20562703	C	T	intergenic	CHEK2P2,HERC2P3	dist=65892;dist=50947	NaN	NaN	rs28667213	NaN	0.447085	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr15	20867163	20867163	T	T	intergenic	GOLGA8CP,NBEAP1	dist=86137;dist=7634	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	13	10	0	0
chr15	21071192	21071192	C	T	intronic	POTEB,POTEB2,POTEB3	NaN	NaN	NaN	rs8039386	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	1293	830	463	46
chr15	22298230	22298230	A	A	ncRNA_intronic	LOC101927079,LOC727924	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	268	189	0	0
chr15	22511280	22511280	C	C	intergenic	OR4N3P,MIR1268A	dist=96885;dist=1949	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	22514329	22514329	T	C	intergenic	MIR1268A,REREP3	dist=1049;dist=32236	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr15	22514344	22514344	T	C	intergenic	MIR1268A,REREP3	dist=1064;dist=32221	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr15	22514352	22514352	G	A	intergenic	MIR1268A,REREP3	dist=1072;dist=32213	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr15	22514464	22514464	T	C	intergenic	MIR1268A,REREP3	dist=1184;dist=32101	NaN	NaN	rs376988032	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr15	22846793	22846793	T	T	intronic	TUBGCP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	22846794	22846794	A	A	intronic	TUBGCP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr15	22854894	22854894	T	A	intronic	TUBGCP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr15	22855219	22855219	A	G	exonic	TUBGCP5	NaN	nonsynonymous SNV	TUBGCP5:NM_001102610:exon13:c.A1680G:p.I560M,TUBGCP5:NM_052903:exon13:c.A1680G:p.I560M	NaN	NaN	NaN	0.04	D	1.0	D	0.995	D	0.000	D	0.998	D	1.845	L	3.09	T	-0.657	T	0.044	T	0.744	2.972	15.91	-9.76	-2.723	-0.260	17.087	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.002112	nearby_gap_events	REJECT	133	126	7	0
chr15	22867661	22867661	A	C	intronic	TUBGCP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	22930486	22930486	C	G	intronic	CYFIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	22940714	22940714	T	T	intronic	CYFIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	7	0	0
chr15	22969103	22969103	T	T	intronic	CYFIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	22969232	22969232	G	A	exonic	CYFIP1	NaN	nonsynonymous SNV	CYFIP1:NM_001033028:exon7:c.G1165A:p.G389S,CYFIP1:NM_014608:exon22:c.G2458A:p.G820S,CYFIP1:NM_001287810:exon23:c.G2458A:p.G820S	rs7170637	ID=COSM1372039,COSM1372038;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.265775	0.77	T	0.007	B	0.003	B	0.000	N	0.991	P	-1.845	N	2.08	T	-0.986	T	0.000	T	0.215	1.230	9.988	5.41	0.901	6.190	11.352	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1132.99	0	NaN	NA	NA	161	52	109	11
chr15	22993026	22993026	T	T	exonic	CYFIP1	NaN	synonymous SNV	CYFIP1:NM_001033028:exon11:c.T1620T:p.G540G,CYFIP1:NM_014608:exon26:c.T2913T:p.G971G,CYFIP1:NM_001287810:exon27:c.T2913T:p.G971G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	54	51	0	0
chr15	23006248	23006248	T	T	exonic	NIPA2	NaN	synonymous SNV	NIPA2:NM_001008894:exon5:c.A999A:p.R333R,NIPA2:NM_001008892:exon6:c.A1056A:p.R352R,NIPA2:NM_001184888:exon6:c.A999A:p.R333R,NIPA2:NM_001008860:exon7:c.A1056A:p.R352R,NIPA2:NM_030922:exon8:c.A1056A:p.R352R,NIPA2:NM_001184889:exon10:c.A1056A:p.R352R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	69	66	0	0
chr15	23006365	23006365	A	T	exonic	NIPA2	NaN	nonsynonymous SNV	NIPA2:NM_001008894:exon5:c.T882A:p.F294L,NIPA2:NM_001008892:exon6:c.T939A:p.F313L,NIPA2:NM_001184888:exon6:c.T882A:p.F294L,NIPA2:NM_001008860:exon7:c.T939A:p.F313L,NIPA2:NM_030922:exon8:c.T939A:p.F313L,NIPA2:NM_001184889:exon10:c.T939A:p.F313L	NaN	NaN	NaN	0.88	T	0.0	B	0.0	B	0.001	N	0.779	D	0	N	-2.42	D	-0.759	T	0.314	T	0.076	0.436	6.370	-1.25	-0.068	-0.136	1.51	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	65	33	11	0
chr15	23086243	23086243	T	A	exonic	NIPA1	NaN	stopgain	NIPA1:NM_144599:exon1:c.A169T:p.K57X	NaN	NaN	NaN	0.15	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	6.917	38	3.56	1.258	0.921	8.493	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	104.181	0	NaN	NA	NA	15	2	12	2
chr15	23086245	23086245	GCA	AAG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	123.749	0	NaN	NA	NA	16	0	13	2
chr15	23811038	23811038	C	A	exonic	MKRN3	NaN	nonsynonymous SNV	MKRN3:NM_005664:exon1:c.C109A:p.P37T	NaN	NaN	NaN	0.68	T	0.005	B	0.002	B	0.094	N	1.000	N	0	N	1.53	T	-1.021	T	0.023	T	0.06	0.783	8.130	-1.54	-0.292	0.160	1.82	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	26	17	9	0
chr15	23811099	23811099	C	A	exonic	MKRN3	NaN	nonsynonymous SNV	MKRN3:NM_005664:exon1:c.C170A:p.P57H	NaN	NaN	NaN	0	D	0.995	D	0.889	P	.	.	1.000	N	0	N	1.41	T	-1.023	T	0.068	T	0.149	1.222	9.957	0.207	0.055	0.442	8.006	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.989366	nearby_gap_events	REJECT	38	32	6	0
chr15	23889150	23889150	G	A	exonic	MAGEL2	NaN	nonsynonymous SNV	MAGEL2:NM_019066:exon1:c.C3740T:p.P1247L	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	0.917	N	1.245	L	.	.	-1.014	T	0.094	T	.	1.686	11.60	2.31	0.687	0.501	6.913	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.754289	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	259	245	14	0
chr15	23892335	23892335	C	G	exonic	MAGEL2	NaN	synonymous SNV	MAGEL2:NM_019066:exon1:c.G555C:p.P185P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.439094	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	106	88	18	0
chr15	23892949	23892949	A	A	UTR5	MAGEL2	NM_019066:c.-60T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr15	24122758	24122758	C	A	intergenic	NDN,PWRN4	dist=190308;dist=97536	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	24122759	24122759	A	G	intergenic	NDN,PWRN4	dist=190309;dist=97535	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	24921004	24921004	G	A	UTR5	NPAP1	NM_018958:c.-11G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.2333333333333349	Somatic	10.3993	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr15	24922230	24922230	C	G	exonic	NPAP1	NaN	nonsynonymous SNV	NPAP1:NM_018958:exon1:c.C1216G:p.Q406E	rs3742950	NaN	0.525759	0.66	T	0.0	B	0.0	B	0.035	N	1.000	P	-0.895	N	3.51	T	-1.014	T	0.000	T	0.019	-2.282	0.004	-0.437	-0.475	-0.565	9.397	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.444053	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	20	22	35
chr15	24923328	24923328	C	A	exonic	NPAP1	NaN	nonsynonymous SNV	NPAP1:NM_018958:exon1:c.C2314A:p.P772T	NaN	NaN	NaN	0.67	T	0.998	D	0.934	D	.	.	1.000	N	0.805	L	2.28	T	-1.049	T	0.037	T	0.231	0.223	5.203	-2.62	-0.695	-0.420	0.282	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.3181818181818176	NA	0	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr15	24923337	24923337	G	T	exonic	NPAP1	NaN	nonsynonymous SNV	NPAP1:NM_018958:exon1:c.G2323T:p.G775W	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.983	D	.	.	1.000	N	1.32	L	3.25	T	-1.039	T	0.035	T	0.283	1.691	11.61	-1.34	-0.395	-0.306	2.629	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.622629	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	20	15	5	0
chr15	25200393	25200393	A	A	intronic	SNRPN,SNURF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	25219605	25219605	T	A	splicing	SNRPN,SNURF	NM_022807:exon7:c.3+2T>A,NM_022806:exon6:c.3+2T>A,NM_022808:exon6:c.3+2T>A,NM_022805:exon6:c.3+2T>A,NM_003097:exon4:c.3+2T>A;NM_005678:exon4:c.407+2T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1.808	12.00	2.88	1.559	2.414	7.573	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.246703	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	242	218	24	0
chr15	25219606	25219606	A	T	intronic	SNRPN,SNURF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.421878	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	219	195	24	0
chr15	25298774	25298774	G	A	upstream	SNORD116-2	NaN	NaN	NaN	rs2732023	NaN	0.442692	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	25445488	25445488	A	G	upstream;downstream	SNORD115-17,SNORD115-18,SNORD115-19;SNORD115-16	NaN	NaN	NaN	rs12917218	NaN	0.316494	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	16	9	7	0
chr15	25454552	25454552	G	A	ncRNA_intronic	SNORD115-15,SNORD115-21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	25723129	25723129	T	C	intergenic	UBE3A,ATP10A	dist=38954;dist=200731	NaN	NaN	rs6576430	NaN	0.923922	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	25967085	25967085	T	C	intronic	ATP10A	NaN	NaN	NaN	rs1564828	NaN	0.983027	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	335.378206	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	114	0	114	58
chr15	25968873	25968873	T	G	intronic	ATP10A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr15	25981190	25981190	A	G	intronic	ATP10A	NaN	NaN	NaN	rs7173593	NaN	0.63778	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	256.059905	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	86	0	86	58
chr15	26026139	26026139	A	G	intronic	ATP10A	NaN	NaN	NaN	rs8038726	NaN	0.805112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	200.128975	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	0	65	53
chr15	26679112	26679112	T	C	intergenic	LINC00929,GABRB3	dist=300928;dist=109582	NaN	NaN	rs11161309	NaN	0.63099	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	26793309	26793309	A	A	intronic	GABRB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	15	14	0	0
chr15	26866265	26866265	G	GA	intronic	GABRB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.282947	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	627.515	0	NaN	NA	NA	343	181	157	18
chr15	27188281	27188281	T	T	intronic	GABRA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	27188684	27188684	A	G	intronic	GABRA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	15	5	10	0
chr15	27339361	27339361	A	C	intronic	GABRG3	NaN	NaN	NaN	rs4354903	NaN	0.184704	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr15	27573911	27573911	G	C	intronic	GABRG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	27745458	27745458	C	A	intronic	GABRG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr15	27765368	27765368	T	C	intronic	GABRG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr15	27772676	27772676	C	T	exonic	GABRG3	NaN	synonymous SNV	GABRG3:NM_033223:exon8:c.C963T:p.T321T	rs140679	NaN	0.516374	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-1.149	T	0.000	T	.	1.175	9.780	-8.26	-2.099	-1.707	18.838	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	302.801522	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	101	0	101	43
chr15	28090173	28090173	C	T	exonic	OCA2	NaN	synonymous SNV	OCA2:NM_001300984:exon22:c.G2292A:p.S764S,OCA2:NM_000275:exon23:c.G2364A:p.S788S	rs12592307	ID=COSM147867;OCCURENCE=1(stomach)	0.282748	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	106.060634	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	73	32	41	21
chr15	28096501	28096501	A	C	intronic	OCA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.409619	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	138	129	9	0
chr15	28107291	28107291	A	A	intronic	OCA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	28107356	28107356	A	A	intronic	OCA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	28116948	28116948	T	A	intronic	OCA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.309716	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	113	96	17	0
chr15	28180137	28180137	C	T	intronic	OCA2	NaN	NaN	NaN	rs2594931	NaN	0.630791	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	12	0	12	0
chr15	28196858	28196858	T	T	intronic	OCA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	28346313	28346313	T	T	intergenic	OCA2,HERC2	dist=1855;dist=9870	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	28370476	28370476	A	G	intronic	HERC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr15	28377115	28377115	T	T	intronic	HERC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr15	28377193	28377193	G	C	intronic	HERC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	7.69637	0	27.272596	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	157	136	21	20
chr15	28377196	28377196	C	CCT,CT,T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1136.67	0	NaN	NA	NA	135	0	85	45
chr15	28389508	28389508	C	T	intronic	HERC2	NaN	NaN	NaN	rs7403363	NaN	0.83726	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	88.2153	0	26.966464	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	5
chr15	28391541	28391541	A	A	intronic	HERC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	28414516	28414516	T	T	intronic	HERC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr15	28414563	28414563	A	G	intronic	HERC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.62667	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	178	169	9	0
chr15	28431909	28431909	A	G	intronic	HERC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.336057	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	57	53	4	0
chr15	28461072	28461072	G	A	intronic	HERC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.474466	poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	18	14	4	0
chr15	28520013	28520013	T	T	intronic	HERC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	28566536	28566536	T	TG	exonic	HERC2	NaN	frameshift substitution	HERC2:NM_004667:exon2:c.44_44delinsCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.3657	0	NaN	NA	NA	9	6	2	0
chr15	29345906	29345906	G	T	intronic	APBA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	29346027	29346027	T	T	intronic	APBA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr15	29385466	29385466	T	T	intronic	APBA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	194	138	0	0
chr15	29415560	29415560	G	A	exonic	FAM189A1	NaN	synonymous SNV	FAM189A1:NM_015307:exon11:c.C1602T:p.D534D	rs3751562	ID=COSM433678;OCCURENCE=1(breast)	0.603035	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	165.015447	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	0	57	58
chr15	29427210	29427210	T	T	intronic	FAM189A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	29427211	29427211	G	G	intronic	FAM189A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	29586566	29586566	G	G	intronic	FAM189A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	29637229	29637229	T	G	intronic	FAM189A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	30033642	30033642	T	C	splicing	TJP1	NM_001301026:exon12:c.1163-2A>G,NM_003257:exon11:c.1151-2A>G,NM_175610:exon11:c.1151-2A>G,NM_001301025:exon12:c.1352-2A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.761	19.09	5.65	2.154	8.036	15.876	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.507155	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	236	230	6	0
chr15	30663198	30663198	G	C	intronic	CHRFAM7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	7.177118070082031E-6	NA	0	0	NaN	NA	NA	165	100	65	0
chr15	30663199	30663199	C	A	intronic	CHRFAM7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	9.554910338146155E-8	NA	0	0	NaN	NA	NA	203	139	64	0
chr15	31200550	31200550	T	T	intronic	FAN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	171	140	0	0
chr15	31200551	31200551	C	C	intronic	FAN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	67	NaN	NA	NA	158	126	0	0
chr15	31234378	31234378	T	G	UTR3	FAN1	NM_014967:c.*613T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr15	31260294	31260294	A	A	intronic	MTMR10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	31266415	31266415	T	A	intronic	MTMR10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.468733	nearby_gap_events	REJECT	100	94	6	0
chr15	31266668	31266668	G	A	intronic	MTMR10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.493171	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	71	65	6	0
chr15	31338500	31338500	T	G	intronic	TRPM1	NaN	NaN	NaN	rs12907509	NaN	0.11881	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	72.795362	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	40	32	12
chr15	31338521	31338521	A	G	intronic	TRPM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	31341767	31341767	G	A	intronic	TRPM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.149037	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	280	257	23	0
chr15	31352713	31352713	A	G	intronic	TRPM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	31352716	31352716	A	C	intronic	TRPM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	31362436	31362436	A	C	intronic	TRPM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.620597	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	209	198	11	0
chr15	31362438	31362438	A	A	intronic	TRPM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	25	23	0	0
chr15	31373518	31373518	A	G	intronic	TRPM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.327763	nearby_gap_events	REJECT	45	38	7	0
chr15	31452638	31452638	T	C	intronic	TRPM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	31595751	31595751	A	G	intergenic	LOC283710,KLF13	dist=72701;dist=23307	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	31745636	31745636	C	G	intergenic	KLF13,OTUD7A	dist=17768;dist=29693	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	31779786	31779786	A	G	intronic	OTUD7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr15	31779790	31779790	C	G	intronic	OTUD7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	31779791	31779791	C	T	intronic	OTUD7A	NaN	NaN	NaN	rs200220584	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	31793930	31793930	A	G	exonic	OTUD7A	NaN	synonymous SNV	OTUD7A:NM_130901:exon8:c.T1113C:p.L371L	rs7164569	NaN	0.330871	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.683368	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	20	16	25
chr15	31795965	31795965	A	C	exonic	OTUD7A	NaN	nonsynonymous SNV	OTUD7A:NM_130901:exon7:c.T929G:p.V310G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	1.95	M	1.38	T	-0.708	T	0.202	T	0.948	4.270	22.3	4.67	1.853	8.430	14.434	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.583274	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	294	277	17	0
chr15	31819231	31819231	T	T	intronic	OTUD7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr15	31851229	31851229	T	C	exonic	OTUD7A	NaN	nonsynonymous SNV	OTUD7A:NM_130901:exon3:c.A493G:p.S165G	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.99	D	0.979	D	0.000	D	0.976	D	1.555	L	1.39	T	-0.822	T	0.186	T	0.63	3.064	16.23	5.62	2.122	5.528	15.825	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.474785	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	139	134	5	0
chr15	32066371	32066371	G	A	intergenic	OTUD7A,CHRNA7	dist=118829;dist=256315	NaN	NaN	rs10775163	NaN	0.695088	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	32403946	32403946	G	A	intronic	CHRNA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	32921777	32921777	T	G	intronic	ARHGAP11A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	19	9	10	0
chr15	32925118	32925118	T	T	intronic	ARHGAP11A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr15	32927960	32927960	T	C	intronic	ARHGAP11A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	73	56	17	0
chr15	32972142	32972142	A	A	intronic	SCG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr15	32976927	32976927	A	G	intronic	SCG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr15	33063150	33063150	C	T	UTR3	FMN1	NM_001103184:c.*3361G>A,NM_001277313:c.*3361G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	33063152	33063152	A	G	UTR3	FMN1	NM_001103184:c.*3359T>C,NM_001277313:c.*3359T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	33096560	33096560	A	T	intronic	FMN1	NaN	NaN	NaN	rs16959042	NaN	0.166134	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	163.736	0	NaN	NA	NA	16	1	15	0
chr15	33202750	33202750	A	C	intronic	FMN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03453026618232897	NA	0	0	NaN	NA	NA	83	65	18	0
chr15	33218488	33218488	A	T	intronic	FMN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.61564	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	155	137	18	0
chr15	33261232	33261232	G	A	exonic	FMN1	NaN	synonymous SNV	FMN1:NM_001103184:exon4:c.C2001T:p.P667P,FMN1:NM_001277313:exon8:c.C2670T:p.P890P	rs2930131	NaN	0.531949	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	288.239	0	NaN	NA	NA	108	47	61	43
chr15	33357101	33357101	T	A	intronic	FMN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr15	33591100	33591100	T	T	intergenic	TMCO5B,LOC101928134	dist=51344;dist=4758	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	33822645	33822645	A	C	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	33822647	33822647	C	A	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	33822747	33822747	A	G	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.871632	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	230	224	6	0
chr15	33833154	33833154	A	G	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr15	33858820	33858820	G	C	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr15	33878202	33878202	T	C	exonic	RYR3	NaN	nonsynonymous SNV	RYR3:NM_001036:exon16:c.T1673C:p.I558T,RYR3:NM_001243996:exon16:c.T1673C:p.I558T	NaN	NaN	NaN	0	D	0.979	D	0.76	P	0.000	D	1.000	D	2.725	M	-0.24	T	0.927	D	0.893	D	0.793	3.236	16.85	4.01	0.970	7.751	11.421	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.097081		KEEP	61	55	6	0
chr15	33920662	33920662	T	C	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	rs35706688	NaN	0.177117	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.659502	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	12	22	27
chr15	33923514	33923514	A	T	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03617989559310459	NA	0	0	NaN	NA	NA	67	48	19	0
chr15	33928628	33928628	G	A	exonic	RYR3	NaN	nonsynonymous SNV	RYR3:NM_001036:exon27:c.G3433A:p.G1145R,RYR3:NM_001243996:exon27:c.G3433A:p.G1145R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.82	H	-1.19	T	0.725	D	0.758	D	0.931	5.146	32	5.35	2.941	9.601	19.614	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.988037	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	134	109	25	0
chr15	33990250	33990250	G	A	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	rs1111611	NaN	0.99401	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	293.164246	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	111	0	111	58
chr15	33992094	33992094	A	G	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr15	33999098	33999098	A	G	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr15	33999284	33999284	A	A	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr15	34028349	34028349	T	G	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	34028353	34028353	C	T	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr15	34028354	34028354	T	A	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr15	34028355	34028355	T	G	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	8	3	3	0
chr15	34028585	34028585	T	T	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	34028586	34028586	A	A	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	34028587	34028587	T	T	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	34028589	34028589	T	T	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	34028596	34028596	T	T	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	34028599	34028599	A	A	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	34034571	34034571	T	C	exonic	RYR3	NaN	nonsynonymous SNV	RYR3:NM_001036:exon52:c.T7825C:p.S2609P,RYR3:NM_001243996:exon52:c.T7825C:p.S2609P	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.446	B	0.169	B	0.001	D	0.945	D	2.085	M	-2.96	D	-0.018	T	0.622	D	0.303	2.563	14.53	4.36	1.090	1.412	1.981	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0281454401839994	NA	0	0	NaN	NA	NA	60	38	22	0
chr15	34034573	34034573	C	T	exonic	RYR3	NaN	synonymous SNV	RYR3:NM_001036:exon52:c.C7827T:p.S2609S,RYR3:NM_001243996:exon52:c.C7827T:p.S2609S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.01973827555742663	NA	0	0	NaN	NA	NA	93	73	20	0
chr15	34064386	34064386	A	A	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	34103340	34103340	A	A	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	34113010	34113010	C	T	exonic	RYR3	NaN	synonymous SNV	RYR3:NM_001243996:exon77:c.C10797T:p.F3599F,RYR3:NM_001036:exon78:c.C10812T:p.F3604F	rs2288613	ID=COSM433726;OCCURENCE=1(breast)	0.3748	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03992580824332482	NA	0	0	NaN	NA	NA	42	26	16	45
chr15	34113054	34113054	G	A	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	rs3815965	NaN	0.742212	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	55.875206	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	44	20	24	46
chr15	34152745	34152745	T	T	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr15	34152777	34152777	T	A	intronic	RYR3	NaN	NaN	NaN	rs2303310	NaN	0.478634	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	270.33753	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	91	0	91	55
chr15	34439106	34439106	A	A	intronic	KATNBL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	34519850	34519850	T	T	intronic	EMC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr15	34527413	34527413	C	T	exonic	SLC12A6	NaN	synonymous SNV	SLC12A6:NM_001042497:exon23:c.G3285A:p.G1095G,SLC12A6:NM_005135:exon24:c.G3177A:p.G1059G,SLC12A6:NM_133647:exon24:c.G3330A:p.G1110G,SLC12A6:NM_001042494:exon25:c.G3153A:p.G1051G,SLC12A6:NM_001042495:exon25:c.G3153A:p.G1051G,SLC12A6:NM_001042496:exon25:c.G3303A:p.G1101G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.454511	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	76	65	11	0
chr15	34529806	34529806	A	G	intronic	SLC12A6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	34529807	34529807	T	A	intronic	SLC12A6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	34529809	34529809	T	G	intronic	SLC12A6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	34532834	34532834	T	T	intronic	SLC12A6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	34547608	34547608	A	A	intronic	SLC12A6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr15	34640218	34640218	C	T	exonic	NUTM1	NaN	nonsynonymous SNV	NUTM1:NM_001284293:exon2:c.C119T:p.P40L,NUTM1:NM_001284292:exon3:c.C149T:p.P50L,NUTM1:NM_175741:exon3:c.C65T:p.P22L	rs374230	NaN	0.877796	0.64	T	0.001	B	0.002	B	0.917	N	1.000	P	-1.905	N	2.95	T	-0.975	T	0.000	T	0.09	-0.886	0.468	-5.94	-1.024	-0.105	0.879	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	186.961	0	NaN	NA	NA	26	3	23	51
chr15	34640378	34640378	T	C	exonic	NUTM1	NaN	synonymous SNV	NUTM1:NM_001284293:exon2:c.T279C:p.D93D,NUTM1:NM_001284292:exon3:c.T309C:p.D103D,NUTM1:NM_175741:exon3:c.T225C:p.D75D	rs430083	NaN	0.939696	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3775.8	0	NaN	NA	NA	326	0	326	21
chr15	34640934	34640934	T	A	intronic	NUTM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr15	34645886	34645886	T	T	intronic	NUTM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr15	34646640	34646640	C	A	intronic	NUTM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	21.6463	0	NaN	NA	NA	280	238	42	9
chr15	34652474	34652474	T	C	intronic	LPCAT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	34652475	34652475	T	G	intronic	LPCAT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	34656284	34656284	A	G	intronic	LPCAT4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	33	3	30	12
chr15	34787943	34787943	A	T	intergenic	GOLGA8A,GOLGA8B	dist=105942;dist=29541	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr15	35044592	35044592	T	T	downstream	GJD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr15	35045057	35045057	G	A	exonic	GJD2	NaN	synonymous SNV	GJD2:NM_020660:exon2:c.C588T:p.S196S	rs3743123	NaN	0.308906	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.388798	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	13	20	29
chr15	35045250	35045250	C	A	exonic	GJD2	NaN	nonsynonymous SNV	GJD2:NM_020660:exon2:c.G395T:p.G132V	NaN	NaN	NaN	0.55	T	0.131	B	0.07	B	0.357	N	1.000	D	0	N	-4.65	D	0.049	D	0.744	D	0.36	1.319	10.33	2.44	0.357	0.760	10.896	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.19009	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	91	85	6	0
chr15	35085427	35085427	T	C	ncRNA_intronic	LOC101928174	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	10	2	6	0
chr15	35168136	35168136	C	T	exonic	AQR	NaN	synonymous SNV	AQR:NM_014691:exon28:c.G3237A:p.Q1079Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.138211	nearby_gap_events	REJECT	86	81	5	0
chr15	35178888	35178888	A	G	intronic	AQR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsM	3	Somatic	3.441312628437114E-5	Somatic	35.6188	0	42.811083	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	112	88	24	0
chr15	35182584	35182584	A	A	intronic	AQR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr15	35224436	35224436	C	G	intronic	AQR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	35224438	35224438	T	A	intronic	AQR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	35224441	35224441	T	C	intronic	AQR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	35230927	35230927	A	G	intronic	AQR	NaN	NaN	NaN	rs200068790	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	77.88319	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	775	707	68	0
chr15	35234152	35234152	T	A	intronic	AQR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	11	4	7	0
chr15	35261952	35261952	C	T	UTR5	AQR	NM_014691:c.-138G>A	NaN	NaN	rs7164070	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	74.9709	0	NaN	NA	NA	8	0	8	44
chr15	36828984	36828984	T	C	intergenic	MIR4510,C15orf41	dist=609860;dist=42820	NaN	NaN	rs1453948	NaN	0.746206	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	36946303	36946303	C	G	exonic	C15orf41	NaN	nonsynonymous SNV	C15orf41:NM_001130010:exon4:c.C217G:p.L73V,C15orf41:NM_001290233:exon4:c.C217G:p.L73V	rs3784678	NaN	0.497005	0.16	T	0.879	P	0.503	P	.	.	0.000	P	1.465	L	0.85	T	-0.913	T	0.000	T	0.33	2.814	15.37	5.5	2.854	3.645	12.854	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	211.352	0	NaN	NA	NA	94	47	47	36
chr15	36984409	36984409	T	C	intronic	C15orf41	NaN	NaN	NaN	rs3743338	ID=COSN164899;OCCURENCE=1(NS),1(lung)	0.560903	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	326.989	0	NaN	NA	NA	76	23	53	36
chr15	36989469	36989469	G	A	intronic	C15orf41	NaN	NaN	NaN	rs2381887	NaN	0.838059	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	974.53	0	NaN	NA	NA	110	0	110	41
chr15	37001393	37001393	T	T	intronic	C15orf41	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	187	140	0	0
chr15	37001396	37001396	A	A	intronic	C15orf41	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	162	107	0	0
chr15	37184677	37184677	A	G	intronic	MEIS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	16	6	9	0
chr15	37387596	37387596	G	T	intronic	MEIS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr15	38710548	38710548	A	A	intergenic	SPRED1,FAM98B	dist=61098;dist=35780	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	38756173	38756173	T	G	intronic	FAM98B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr15	38766556	38766556	G	C	intronic	FAM98B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr15	38766557	38766557	C	G	intronic	FAM98B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr15	38773369	38773369	T	C	intronic	FAM98B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr15	38818453	38818453	T	T	intronic	RASGRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	38990803	38990803	T	G	UTR3	C15orf53	NM_207444:c.*57T>G	NaN	NaN	rs12595568	NaN	0.534744	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	121.627105	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	96	46	50	54
chr15	39172762	39172762	A	A	intergenic	C15orf53,C15orf54	dist=180523;dist=370108	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	39172765	39172765	A	A	intergenic	C15orf53,C15orf54	dist=180526;dist=370105	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	39172767	39172767	C	C	intergenic	C15orf53,C15orf54	dist=180528;dist=370103	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	39172768	39172768	A	A	intergenic	C15orf53,C15orf54	dist=180529;dist=370102	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	39873993	39873993	G	C	intronic	THBS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	3	3	0
chr15	39873995	39873995	T	C	intronic	THBS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	16	8	7	0
chr15	39874221	39874221	A	A	intronic	THBS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr15	39876466	39876466	G	C	intronic	THBS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.783735	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	210	202	8	0
chr15	39882889	39882889	A	G	intronic	THBS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr15	39887654	39887654	A	A	UTR3	THBS1	NM_003246:c.*84A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr15	39910431	39910431	A	G	exonic	FSIP1	NaN	nonsynonymous SNV	FSIP1:NM_152597:exon11:c.T1204C:p.C402R	rs10152640	ID=COSM147877;OCCURENCE=1(breast),1(stomach)	0.411941	.	.	0.0	B	0.0	B	0.539	N	1.000	P	-0.55	N	2.85	T	-1.043	T	0.000	T	0.003	-1.858	0.009	-0.452	-0.082	-0.124	2.767	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	269.67119	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	89	0	89	31
chr15	39923363	39923363	T	C	intronic	FSIP1	NaN	NaN	NaN	rs60195210	NaN	0.235623	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	14	6	8	0
chr15	40062824	40062824	TCA	TAA,TA,TC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	801.973	0	NaN	NA	NA	232	31	48	1
chr15	40226495	40226495	T	C	exonic	EIF2AK4	NaN	synonymous SNV	EIF2AK4:NM_001013703:exon1:c.T99C:p.I33I	rs566792	NaN	0.960064	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	232.104272	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	84	2	82	58
chr15	40259519	40259519	C	T	intronic	EIF2AK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.164537	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.152013	nearby_gap_events	REJECT	79	70	9	0
chr15	40265799	40265799	A	G	exonic	EIF2AK4	NaN	nonsynonymous SNV	EIF2AK4:NM_001013703:exon11:c.A1667G:p.E556G	rs2307105	NaN	0.844449	0.64	T	0.0	B	0.0	B	0.003	N	0.000	P	-1.61	N	-0.45	T	-0.963	T	0.000	T	0.249	2.050	12.81	4.97	1.535	1.363	9.406	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	89.870724	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	0	33	57
chr15	40268426	40268426	G	G	intronic	EIF2AK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr15	40280166	40280166	T	G	intronic	EIF2AK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	40309339	40309339	G	A	exonic	EIF2AK4	NaN	nonsynonymous SNV	EIF2AK4:NM_001013703:exon29:c.G3961A:p.V1321M	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.801	P	0.435	B	0.000	D	1.000	D	0.755	N	0.98	T	-1.089	T	0.081	T	0.285	2.887	15.62	5.97	2.836	5.766	7.847	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.550264	clustered_read_position	REJECT	100	92	8	0
chr15	40309340	40309340	T	A	exonic	EIF2AK4	NaN	nonsynonymous SNV	EIF2AK4:NM_001013703:exon29:c.T3962A:p.V1321E	NaN	NaN	NaN	1	T	0.993	D	0.949	D	0.000	D	1.000	D	0.295	N	0.93	T	-1.019	T	0.120	T	0.771	4.474	23.9	5.97	2.288	8.015	16.461	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.702741	clustered_read_position	REJECT	98	91	7	0
chr15	40313069	40313069	T	C	intronic	EIF2AK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.751889	nearby_gap_events	REJECT	265	255	10	0
chr15	40324481	40324481	T	C	intronic	EIF2AK4	NaN	NaN	NaN	rs4432245	NaN	0.262181	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.917194	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	32	18	2
chr15	40327301	40327301	G	A	UTR3	EIF2AK4	NM_001013703:c.*16G>A	NaN	NaN	rs2898985	NaN	0.309704	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	79.847346	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	24	33	2
chr15	40462214	40462214	T	T	intronic	BUB1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	40489029	40489029	A	A	intronic	BUB1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	40493277	40493277	A	T	intronic	BUB1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	40493278	40493278	A	C	intronic	BUB1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	40494701	40494701	A	T	intronic	BUB1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.816835	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	132	122	10	0
chr15	40498423	40498423	C	T	exonic	BUB1B	NaN	synonymous SNV	BUB1B:NM_001211:exon15:c.C1773T:p.A591A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.674322	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	420	412	8	0
chr15	40500986	40500986	C	T	intronic	BUB1B	NaN	NaN	NaN	rs11630664	NaN	0.396965	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	100.932	0	NaN	NA	NA	104	0	104	24
chr15	40504724	40504724	G	A	exonic	BUB1B	NaN	nonsynonymous SNV	BUB1B:NM_001211:exon19:c.G2410A:p.D804N	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	1.59	L	2.1	T	-1.000	T	0.128	T	0.159	4.872	27.9	5.42	2.541	6.715	19.232	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.817558	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	88	80	8	0
chr15	40504725	40504725	A	C	exonic	BUB1B	NaN	nonsynonymous SNV	BUB1B:NM_001211:exon19:c.A2411C:p.D804A	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	0.999	D	1.59	L	2.13	T	-1.006	T	0.118	T	0.869	4.141	21.4	5.42	2.056	6.354	15.475	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.937087	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	89	81	8	0
chr15	40556891	40556891	A	G	intronic	PAK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.119767	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	103	95	8	0
chr15	40558744	40558744	G	A	intronic	PAK6	NaN	NaN	NaN	rs748556	NaN	0.506989	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	117.291296	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	0	41	54
chr15	40559276	40559276	C	T	intronic	PAK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr15	40564226	40564226	G	G	intronic	PAK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	40573781	40573781	A	G	exonic	ANKRD63	NaN	nonsynonymous SNV	ANKRD63:NM_001190479:exon1:c.T1007C:p.I336T	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	.	.	1.000	N	0	N	0.49	T	-0.796	T	0.106	T	0.551	3.174	16.62	3.88	1.623	0.052	11.689	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	102.485	0	NaN	NA	NA	17	4	13	13
chr15	40573798	40573798	G	C	exonic	ANKRD63	NaN	synonymous SNV	ANKRD63:NM_001190479:exon1:c.C990G:p.R330R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr15	40580977	40580977	G	T	exonic	PLCB2	NaN	nonsynonymous SNV	PLCB2:NM_001284298:exon31:c.C3452A:p.P1151Q,PLCB2:NM_001284297:exon32:c.C3485A:p.P1162Q,PLCB2:NM_004573:exon32:c.C3497A:p.P1166Q	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.012	B	0.014	B	0.001	N	1.000	N	0	N	2.12	T	-1.023	T	0.018	T	0.177	0.615	7.313	-10.8	-1.851	-2.908	1.291	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	52	37	15	0
chr15	40581579	40581579	A	T	intronic	PLCB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr15	40581582	40581582	G	T	intronic	PLCB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr15	40581583	40581583	A	T	intronic	PLCB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr15	40581584	40581584	A	C	intronic	PLCB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr15	40583876	40583876	T	G	intronic	PLCB2	NaN	NaN	NaN	rs9972418	NaN	0.96905	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	89.523274	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	0	35	58
chr15	40588905	40588905	A	A	intronic	PLCB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	40589633	40589633	T	T	intronic	PLCB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	40595627	40595627	G	A	intronic	PLCB2	NaN	NaN	NaN	rs1869901	NaN	0.635783	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1377.66	0	NaN	NA	NA	131	0	131	44
chr15	40627845	40627845	G	A	exonic	C15orf52	NaN	synonymous SNV	C15orf52:NM_207380:exon11:c.C1119T:p.S373S	rs55641696	NaN	0.146366	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.436851	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	17	18	26
chr15	40627990	40627990	G	C	exonic	C15orf52	NaN	nonsynonymous SNV	C15orf52:NM_207380:exon10:c.C1057G:p.Q353E	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.89	P	0.552	P	0.467	N	0.997	N	2.075	M	.	.	-0.991	T	0.151	T	0.163	0.880	8.571	3.97	1.031	4.746	11.102	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.97529	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	62	55	7	0
chr15	40628104	40628104	G	T	intronic	C15orf52	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.904543	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	63	55	8	0
chr15	40630654	40630654	G	T	intronic	C15orf52	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	40630658	40630658	C	T	intronic	C15orf52	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	40630660	40630660	T	T	intronic	C15orf52	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr15	40632274	40632274	A	A	intronic	C15orf52	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	52	44	0	0
chr15	40632302	40632302	G	C	intronic	C15orf52	NaN	NaN	NaN	rs12440659	NaN	0.785743	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	55.398572	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	26	24	44
chr15	40655845	40655845	C	G	exonic	DISP2	NaN	nonsynonymous SNV	DISP2:NM_033510:exon2:c.C139G:p.P47A	rs1898883	NaN	0.726038	1	T	0.0	B	0.0	B	0.176	N	1.000	P	-1.1	N	2.98	T	-1.003	T	0.000	T	0.036	-0.473	1.819	4.26	0.783	1.695	8.223	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	261.882666	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	101	1	100	52
chr15	40655873	40655873	G	C	exonic	DISP2	NaN	nonsynonymous SNV	DISP2:NM_033510:exon2:c.G167C:p.C56S	rs1898882	NaN	0.613618	0.6	T	0.0	B	0.005	B	0.310	N	0.088	P	1.39	L	2.79	T	-1.063	T	0.000	T	0.173	3.538	18.06	4.25	1.387	3.293	12.932	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	203.031	0	NaN	NA	NA	80	41	39	42
chr15	40656807	40656807	A	A	intronic	DISP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	40660102	40660102	G	T	exonic	DISP2	NaN	nonsynonymous SNV	DISP2:NM_033510:exon8:c.G1789T:p.G597C	NaN	NaN	NaN	0.14	T	0.566	P	0.272	B	0.000	D	1.000	D	0.49	N	-4.08	D	0.334	D	0.716	D	0.772	2.478	14.25	4.66	1.355	2.635	7.921	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	29	17	12	0
chr15	40660103	40660103	G	C	exonic	DISP2	NaN	nonsynonymous SNV	DISP2:NM_033510:exon8:c.G1790C:p.G597A	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.967	D	0.716	P	0.000	D	1.000	D	1.59	L	-3.35	D	0.706	D	0.815	D	0.531	3.280	17.01	5.58	2.625	7.946	19.563	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	27	16	11	0
chr15	40660515	40660515	G	A	exonic	DISP2	NaN	synonymous SNV	DISP2:NM_033510:exon8:c.G2202A:p.P734P	rs35565646	ID=COSM433776;OCCURENCE=1(breast)	0.16254	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	53.993518	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	7	23	17
chr15	40660517	40660517	C	A	exonic	DISP2	NaN	nonsynonymous SNV	DISP2:NM_033510:exon8:c.C2204A:p.P735H	NaN	NaN	NaN	0.13	T	0.755	P	0.35	B	0.016	N	1.000	N	1.65	L	2.72	T	-1.077	T	0.034	T	0.198	1.215	9.930	2.89	0.595	2.936	9.566	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.564261	clustered_read_position	REJECT	36	32	4	0
chr15	40660518	40660518	C	A	exonic	DISP2	NaN	synonymous SNV	DISP2:NM_033510:exon8:c.C2205A:p.P735P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.03299	clustered_read_position	REJECT	35	31	4	0
chr15	40660566	40660566	G	A	exonic	DISP2	NaN	synonymous SNV	DISP2:NM_033510:exon8:c.G2253A:p.A751A	rs72733420	ID=COSM433777;OCCURENCE=1(breast)	0.108427	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	41.090939	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	42	18	24
chr15	40661507	40661507	TG	GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.29802	0	NaN	NA	NA	58	49	8	3
chr15	40683839	40683839	A	A	intronic	KNSTRN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	40684232	40684232	G	A	intronic	KNSTRN	NaN	NaN	NaN	rs72733427	NaN	0.0822684	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	153.391388	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	144	81	63	20
chr15	40700006	40700006	G	GTT,T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	439.135	0	NaN	NA	NA	48	0	38	1
chr15	40708154	40708154	T	T	intronic	IVD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr15	40710283	40710283	T	G	intronic	IVD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.130015	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	209	186	23	0
chr15	40751645	40751645	C	G	exonic	BAHD1	NaN	nonsynonymous SNV	BAHD1:NM_001301132:exon2:c.C982G:p.P328A,BAHD1:NM_014952:exon2:c.C982G:p.P328A	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.952	P	0.6	P	0.000	D	0.539	N	0	N	0.43	T	-0.986	T	0.083	T	0.253	1.764	11.86	4.96	2.837	2.942	3.983	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.903501	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	94	83	11	0
chr15	40758337	40758337	A	C	UTR3	BAHD1	NM_001301132:c.*8A>C,NM_014952:c.*8A>C	NaN	NaN	rs3743145	NaN	0.124601	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	487.38	0	NaN	NA	NA	129	47	82	14
chr15	40842089	40842089	A	C	intronic	C15orf57	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr15	40842211	40842211	G	T	intronic	C15orf57	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr15	40846439	40846439	A	A	intronic	C15orf57	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	40854882	40854882	T	G	intronic	C15orf57	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr15	40861417	40861417	A	G	upstream	RPUSD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr15	40861420	40861420	T	C	upstream	RPUSD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	40898643	40898643	G	C	exonic	CASC5	NaN	nonsynonymous SNV	CASC5:NM_144508:exon4:c.G128C:p.R43T,CASC5:NM_170589:exon4:c.G128C:p.R43T	rs7177192	ID=COSM147880;OCCURENCE=1(stomach)	0.653754	1	T	0.0	B	0.0	B	0.066	N	1.000	P	-1.04	N	1.93	T	-0.968	T	0.000	T	0.032	-0.852	0.545	-4.84	-1.200	-0.480	2.286	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	291.111186	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	98	0	98	57
chr15	40907531	40907531	A	T	intronic	CASC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.369162	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	101	95	6	0
chr15	40915680	40915680	A	G	exonic	CASC5	NaN	nonsynonymous SNV	CASC5:NM_144508:exon10:c.A3218G:p.D1073G,CASC5:NM_170589:exon11:c.A3296G:p.D1099G	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.998	D	0.947	D	0.000	D	1.000	N	1.995	M	2.09	T	-0.996	T	0.118	T	0.594	3.778	19.18	5.04	1.910	2.117	14.444	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.682434	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	464	456	8	0
chr15	40916044	40916044	A	G	exonic	CASC5	NaN	synonymous SNV	CASC5:NM_144508:exon10:c.A3582G:p.G1194G,CASC5:NM_170589:exon11:c.A3660G:p.G1220G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.590305	nearby_gap_events	REJECT	143	132	11	0
chr15	40916737	40916737	T	C	exonic	CASC5	NaN	synonymous SNV	CASC5:NM_144508:exon10:c.T4275C:p.L1425L,CASC5:NM_170589:exon11:c.T4353C:p.L1451L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	995	644	351	0
chr15	40939280	40939280	A	T	intronic	CASC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.949362	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	116	106	10	0
chr15	40939281	40939281	T	A	intronic	CASC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.966362	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	112	99	13	0
chr15	40942575	40942575	A	G	exonic	CASC5	NaN	synonymous SNV	CASC5:NM_144508:exon18:c.A6171G:p.K2057K,CASC5:NM_170589:exon19:c.A6249G:p.K2083K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.14143404488231978	NA	0	0	NaN	NA	NA	19	15	4	0
chr15	40942819	40942819	A	A	intronic	CASC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr15	41029904	41029904	T	C	exonic	RMDN3	NaN	synonymous SNV	RMDN3:NM_001304802:exon10:c.A1146G:p.L382L,RMDN3:NM_018145:exon10:c.A1146G:p.L382L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.865405	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	130	119	11	0
chr15	41067671	41067671	C	A	intronic	DNAJC17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	1	5	0
chr15	41071855	41071855	G	A	intronic	DNAJC17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr15	41071856	41071856	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	1	2,2	0
chr15	41075021	41075021	T	C	intronic	DNAJC17	NaN	NaN	NaN	rs34814635	NaN	0.582069	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	19	9	10	0
chr15	41105188	41105188	C	T	intronic	ZFYVE19	NaN	NaN	NaN	rs604250	NaN	0.34345	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	59.86164	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	20	23	25
chr15	41105658	41105658	G	A	intronic	ZFYVE19	NaN	NaN	NaN	rs3736286	NaN	0.275559	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	93.7428	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	92	52	40	39
chr15	41105926	41105926	T	G	exonic	ZFYVE19	NaN	nonsynonymous SNV	ZFYVE19:NM_001258420:exon8:c.T922G:p.S308A,ZFYVE19:NM_001077268:exon9:c.T1126G:p.S376A,ZFYVE19:NM_001258421:exon9:c.T601G:p.S201A,ZFYVE19:NM_032850:exon10:c.T1096G:p.S366A	rs690347	NaN	0.807708	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-2.175	N	1.61	T	-0.958	T	0.000	T	0.307	1.144	9.661	5.27	1.472	5.701	14.498	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	159.539778	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	0	52	55
chr15	41148080	41148080	T	T	intronic	SPINT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr15	41148199	41148199	C	T	exonic	SPINT1	NaN	synonymous SNV	SPINT1:NM_001032367:exon8:c.C1227T:p.Y409Y,SPINT1:NM_003710:exon9:c.C1227T:p.Y409Y,SPINT1:NM_181642:exon9:c.C1275T:p.Y425Y	rs659232	NaN	0.853834	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	178.241713	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	61	0	61	57
chr15	41191880	41191880	G	G	exonic	VPS18	NaN	synonymous SNV	VPS18:NM_020857:exon4:c.G864G:p.M288M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	88	73	0	0
chr15	41193243	41193243	A	A	intronic	VPS18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	41221774	41221774	G	C	UTR5	DLL4	NM_019074:c.-93G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	21.618	0	NaN	NA	NA	13	8	5	1
chr15	41222803	41222803	C	T	intronic	DLL4	NaN	NaN	NaN	rs200269380	NaN	0.00119808	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	12	10	2	0
chr15	41228377	41228377	C	A	intronic	DLL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.242647058823529	NA	0	0	NaN	NA	NA	11	8	3	0
chr15	41229051	41229051	G	T	exonic	DLL4	NaN	synonymous SNV	DLL4:NM_019074:exon9:c.G1866T:p.L622L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.112321	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	109	91	18	0
chr15	41230324	41230324	A	A	UTR3	DLL4	NM_019074:c.*92A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr15	41247993	41247993	A	G	UTR3	CHAC1	NM_001142776:c.*21A>G,NM_024111:c.*21A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	13	3	10	0
chr15	41279978	41279978	T	C	intronic	INO80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr15	41313347	41313347	A	G	intronic	INO80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	41366463	41366463	A	A	intronic	INO80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	71	54	0	0
chr15	41371814	41371814	A	C	intronic	INO80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr15	41387928	41387928	T	T	intronic	INO80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	68	NaN	NA	NA	117	109	0	0
chr15	41388335	41388335	T	T	intronic	INO80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	41483808	41483808	A	A	intronic	EXD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr15	41487934	41487934	G	C	intronic	EXD1	NaN	NaN	NaN	rs28382348	NaN	0.144768	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.83857	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	15	14	24
chr15	41523667	41523667	G	T	intronic	CHP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.422728	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	22	12	10	0
chr15	41570909	41570909	T	G	intronic	CHP1	NaN	NaN	NaN	rs11630656	NaN	0.116813	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	63.416553	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	23	29	23
chr15	41643370	41643370	A	A	intronic	NUSAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	41650175	41650175	T	T	intronic	NUSAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	41663884	41663884	TAAAAAAAAAAAA	TAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	472.312	0	NaN	NA	NA	93	1	10	0
chr15	41672384	41672384	A	G	exonic	NUSAP1	NaN	synonymous SNV	NUSAP1:NM_001243144:exon9:c.A1137G:p.X379X,NUSAP1:NM_001243142:exon11:c.A1320G:p.X440X,NUSAP1:NM_001243143:exon11:c.A1281G:p.X427X,NUSAP1:NM_001301136:exon11:c.A1323G:p.X441X,NUSAP1:NM_016359:exon11:c.A1326G:p.X442X,NUSAP1:NM_018454:exon11:c.A1323G:p.X441X	rs7168431	NaN	0.115615	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	23.3987	0	NaN	NA	NA	23	16	7	6
chr15	41672422	41672422	A	T	UTR3	NUSAP1	NM_016359:c.*38A>T,NM_001243144:c.*38A>T,NM_001243143:c.*38A>T,NM_001243142:c.*38A>T,NM_018454:c.*38A>T,NM_001301136:c.*38A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.86754	nearby_gap_events	REJECT	37	32	5	2
chr15	41672424	41672424	C	A	UTR3	NUSAP1	NM_016359:c.*40C>A,NM_001243144:c.*40C>A,NM_001243143:c.*40C>A,NM_001243142:c.*40C>A,NM_018454:c.*40C>A,NM_001301136:c.*40C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.275656	nearby_gap_events	REJECT	35	30	5	0
chr15	41672425	41672425	T	C	UTR3	NUSAP1	NM_016359:c.*41T>C,NM_001243144:c.*41T>C,NM_001243143:c.*41T>C,NM_001243142:c.*41T>C,NM_018454:c.*41T>C,NM_001301136:c.*41T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.406218	nearby_gap_events	REJECT	21	16	5	0
chr15	41672433	41672433	T	C	UTR3	NUSAP1	NM_016359:c.*49T>C,NM_001243144:c.*49T>C,NM_001243143:c.*49T>C,NM_001243142:c.*49T>C,NM_018454:c.*49T>C,NM_001301136:c.*49T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.470016	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	30	24	6	0
chr15	41672444	41672444	T	A	UTR3	NUSAP1	NM_016359:c.*60T>A,NM_001243144:c.*60T>A,NM_001243143:c.*60T>A,NM_001243142:c.*60T>A,NM_018454:c.*60T>A,NM_001301136:c.*60T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.19230769230769257	NA	0	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr15	41689331	41689331	A	A	UTR5	NDUFAF1	NM_016013:c.-74T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	41749778	41749778	T	T	intronic	RTF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr15	41762640	41762640	A	G	intronic	RTF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	41768037	41768037	A	A	intronic	RTF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	41771230	41771230	T	T	intronic	RTF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	41794087	41794087	T	G	intronic	ITPKA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.10447214076246397	NA	0	0	NaN	NA	NA	20	16	4	0
chr15	41794088	41794088	A	T	intronic	ITPKA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.818001	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	29	21	8	0
chr15	41794089	41794089	G	A	intronic	ITPKA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.059881349647755586	NA	0	0	11.57648	nearby_gap_events	REJECT	26	18	8	0
chr15	41796472	41796472	G	C	intronic	LTK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.024496915764990888	NA	0	0	NaN	NA	NA	19	13	6	0
chr15	41796485	41796485	T	T	intronic	LTK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	50	44	0	0
chr15	41796498	41796498	T	A	intronic	LTK	NaN	NaN	NaN	rs316618	NaN	0.132188	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	41.371482	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	26	21	15
chr15	41814100	41814100	A	T	intronic	RPAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	41820368	41820368	T	T	intronic	RPAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	41821644	41821644	A	C	intronic	RPAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	33	23	10	0
chr15	41821752	41821752	T	C	exonic	RPAP1	NaN	synonymous SNV	RPAP1:NM_015540:exon9:c.A1074G:p.R358R	rs1200349	NaN	0.511382	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.02682	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	34
chr15	41827302	41827302	A	A	intronic	RPAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	41828478	41828478	A	A	intronic	RPAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr15	41828867	41828867	A	A	intronic	RPAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr15	41853898	41853898	A	G	intronic	TYRO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	41854990	41854990	A	A	intronic	TYRO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	41860371	41860371	T	T	intronic	TYRO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	41862233	41862233	G	A	exonic	TYRO3	NaN	nonsynonymous SNV	TYRO3:NM_006293:exon10:c.G1261A:p.G421S	NaN	NaN	NaN	1	T	0.872	P	0.271	B	0.001	D	0.561	N	-0.345	N	-0.67	T	-0.809	T	0.095	T	0.398	1.526	11.05	5.28	2.755	3.607	5.200	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.734846	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	200	194	6	0
chr15	41865525	41865525	G	T	exonic	TYRO3	NaN	nonsynonymous SNV	TYRO3:NM_006293:exon17:c.G2005T:p.V669L	rs62001448	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.996	D	0.198	N	1.000	D	1.25	L	-2.04	D	-0.825	T	0.009	T	0.852	4.902	28.2	5.55	2.612	9.869	19.508	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.681382	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	103	93	10	0
chr15	41999826	41999826	T	T	intronic	MGA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	42003471	42003471	T	G	exonic	MGA	NaN	nonsynonymous SNV	MGA:NM_001080541:exon8:c.T3008G:p.L1003R,MGA:NM_001164273:exon8:c.T3008G:p.L1003R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.996	D	0.004	N	0.962	D	0.895	L	2.23	T	-1.055	T	0.081	T	0.92	4.383	23.2	5.83	2.240	7.133	16.200	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.83383	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	212	196	16	0
chr15	42019299	42019299	T	A	intronic	MGA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr15	42021578	42021578	A	A	intronic	MGA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	42035380	42035380	A	A	intronic	MGA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr15	42067400	42067400	T	G	UTR5	MAPKBP1	NM_001265611:c.-74T>G,NM_014994:c.-74T>G,NM_001128608:c.-74T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	42103061	42103061	T	A	intronic	MAPKBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	6	4	0
chr15	42105378	42105378	A	G	intronic	MAPKBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.945643	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	190	176	14	0
chr15	42107299	42107299	T	T	intronic	MAPKBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	42111630	42111630	A	A	intronic	MAPKBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	42114414	42114414	C	T	intronic	MAPKBP1	NaN	NaN	NaN	rs2303517	NaN	0.6252	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	74.9743	0	21.881296	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	29
chr15	42128568	42128568	C	G	intronic	JMJD7,JMJD7-PLA2G4B	NaN	NaN	NaN	rs2303516	NaN	0.248403	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	370.308	0	NaN	NA	NA	33	0	33	22
chr15	42129373	42129373	C	G	UTR3	JMJD7	NM_001114632:c.*19C>G	NaN	NaN	rs11547012	NaN	0.479633	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	330.819167	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	108	0	108	46
chr15	42133246	42133246	T	C	intronic	JMJD7-PLA2G4B,PLA2G4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.462323	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	300	288	12	0
chr15	42133521	42133521	T	T	intronic	JMJD7-PLA2G4B,PLA2G4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	52	44	0	0
chr15	42134803	42134803	C	C	intronic	JMJD7-PLA2G4B,PLA2G4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	49	47	0	0
chr15	42135802	42135802	G	C	intronic	JMJD7-PLA2G4B,PLA2G4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr15	42136503	42136503	A	G	intronic	JMJD7-PLA2G4B,PLA2G4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.712034	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	256	250	6	0
chr15	42136978	42136978	G	A	intronic	JMJD7-PLA2G4B,PLA2G4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.75031	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	370	347	23	1
chr15	42137576	42137576	C	T	intronic	JMJD7-PLA2G4B,PLA2G4B	NaN	NaN	NaN	rs1648828	NaN	0.752796	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	563.714477	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	190	0	190	57
chr15	42138321	42138321	A	G	intronic	JMJD7-PLA2G4B,PLA2G4B	NaN	NaN	NaN	rs1197670	NaN	0.757388	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	89.837316	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	0	34	57
chr15	42140107	42140107	G	T	UTR3	JMJD7-PLA2G4B,PLA2G4B	NM_001198588:c.*219G>T,NM_005090:c.*49G>T;NM_001114633:c.*49G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	19	12	3	0
chr15	42140108	42140108	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	1	3,4	0
chr15	42143466	42143466	T	A	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	95	58	34	0
chr15	42144365	42144365	C	A	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.399631	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	70	52	18	0
chr15	42144366	42144366	A	C	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.023179	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	70	52	18	0
chr15	42146617	42146617	A	G	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	23	2	19	0
chr15	42146699	42146699	A	G	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	95	11	83	0
chr15	42147639	42147639	A	C	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	rs2305655	NaN	0.619409	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.756805	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	17	20	53
chr15	42154288	42154288	C	A	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.0353435	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	63	47	16	0
chr15	42162136	42162136	T	G	exonic	SPTBN5	NaN	nonsynonymous SNV	SPTBN5:NM_016642:exon32:c.A5756C:p.Q1919P	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.998	D	0.924	D	0.005	N	0.957	N	2.255	M	1.25	T	-0.921	T	0.171	T	0.416	3.522	17.98	2.45	0.201	0.403	7.591	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	23.6373	37	10.753615	clustered_read_position	REJECT	7	3	4	0
chr15	42166021	42166021	A	C	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000998403	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.543388	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	218	210	8	0
chr15	42166701	42166701	A	A	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	42167064	42167064	T	T	exonic	SPTBN5	NaN	synonymous SNV	SPTBN5:NM_016642:exon23:c.A4478A:p.E1493E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	27	23	0	0
chr15	42169027	42169027	G	T	exonic	SPTBN5	NaN	nonsynonymous SNV	SPTBN5:NM_016642:exon19:c.C3831A:p.S1277R	NaN	NaN	NaN	0.28	T	0.31	B	0.056	B	0.011	N	1.000	N	2.075	M	0.69	T	-1.054	T	0.095	T	0.239	2.104	12.99	1.65	1.135	0.078	3.638	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.1238390092879262	NA	0	0	6.409623	clustered_read_position	REJECT	12	9	3	0
chr15	42169219	42169219	G	A	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.117533	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	97	78	19	0
chr15	42171876	42171876	CA	C,CG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2290.56	0	NaN	NA	NA	237	0	58	9
chr15	42172155	42172155	T	T	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr15	42175104	42175104	G	C	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	rs1197691	NaN	0.678714	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	62.870618	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	1	24	45
chr15	42175456	42175456	T	T	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr15	42179667	42179667	A	A	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	42180325	42180325	T	G	intronic	SPTBN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.13701	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	75	70	5	0
chr15	42192885	42192885	G	A	exonic	EHD4	NaN	synonymous SNV	EHD4:NM_139265:exon6:c.C1584T:p.L528L	rs113393602	NaN	0.0409345	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	383.28	0	NaN	NA	NA	148	71	77	6
chr15	42280427	42280427	T	T	ncRNA_intronic	PLA2G4E-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	17	16	0	0
chr15	42293490	42293490	A	G	intronic	PLA2G4E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	13	5	8	0
chr15	42305852	42305852	A	AGAG	intronic	PLA2G4E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.724441	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	610.276	0	NaN	NA	NA	67	0	61	39
chr15	42342752	42342752	T	T	exonic	PLA2G4E	NaN	synonymous SNV	PLA2G4E:NM_001206670:exon1:c.A150A:p.P50P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	47	43	0	0
chr15	42371752	42371752	A	T	exonic	PLA2G4D	NaN	nonsynonymous SNV	PLA2G4D:NM_178034:exon13:c.T1300A:p.S434T	rs4924618	ID=COSM1162389;OCCURENCE=1(pancreas)	0.29992	0.37	T	0.173	B	0.033	B	0.594	N	0.984	P	1.01	L	3.61	T	-0.951	T	0.000	T	0.044	2.179	13.24	1.28	-0.029	0.628	3.727	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.036144	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	32
chr15	42373844	42373844	A	A	intronic	PLA2G4D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	42377492	42377492	A	G	intronic	PLA2G4D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	58	4	54	0
chr15	42377551	42377551	C	G	intronic	PLA2G4D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.071624	nearby_gap_events	REJECT	90	83	7	0
chr15	42379763	42379763	T	T	intronic	PLA2G4D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	42392937	42392937	T	T	intergenic	PLA2G4D,PLA2G4F	dist=6185;dist=40395	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	42434780	42434780	T	G	exonic	PLA2G4F	NaN	nonsynonymous SNV	PLA2G4F:NM_213600:exon19:c.A2275C:p.I759L	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.325	B	0.033	B	0.001	D	0.885	N	2.545	M	3.81	T	-1.104	T	0.021	T	0.476	1.370	10.51	3.75	0.445	4.375	12.877	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.525679	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	116	107	9	0
chr15	42436372	42436372	A	A	intronic	PLA2G4F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr15	42438319	42438319	AG	A,GA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	88.2395	0	NaN	NA	NA	16	2	3	0
chr15	42438328	42438328	CA	AC,C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	87.1638	0	NaN	NA	NA	15	2	5	1
chr15	42442451	42442451	A	C	intronic	PLA2G4F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	11	6	4	0
chr15	42442455	42442455	T	T	intronic	PLA2G4F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	11	8	0	0
chr15	42443082	42443082	A	A	intronic	PLA2G4F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	42444921	42444921	A	C	exonic	PLA2G4F	NaN	nonsynonymous SNV	PLA2G4F:NM_213600:exon7:c.T566G:p.L189R	NaN	NaN	NaN	0.2	T	0.966	D	0.641	P	0.025	N	1.000	N	1.175	L	4.88	T	-0.883	T	0.010	T	0.488	2.854	15.51	5.74	2.326	4.530	12.736	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	22	13	9	1
chr15	42445404	42445404	G	C	intronic	PLA2G4F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	42445406	42445406	C	T	intronic	PLA2G4F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	42445409	42445409	T	C	intronic	PLA2G4F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr15	42458512	42458512	A	A	intronic	VPS39	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	42476675	42476675	T	T	intronic	VPS39	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	42509980	42509980	G	A	intronic	TMEM87A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.117569	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	33	30	3	0
chr15	42553130	42553130	T	G	intronic	TMEM87A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr15	42564369	42564369	C	T	intronic	TMEM87A	NaN	NaN	NaN	rs4244587	NaN	0.64357	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	61.417674	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	0	20	0
chr15	42564370	42564370	A	G	intronic	TMEM87A	NaN	NaN	NaN	rs4244588	NaN	0.914337	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	61.717906	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	0	20	3
chr15	42565421	42565421	T	T	intronic	TMEM87A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	42566589	42566589	A	T	UTR5	GANC	NM_001301409:c.-91A>T,NM_198141:c.-91A>T,NM_001301410:c.-91A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.688603	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	54	49	5	0
chr15	42640459	42640459	A	A	intronic	GANC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	42676852	42676852	A	A	intronic	CAPN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	42682329	42682329	C	T	intronic	CAPN3	NaN	NaN	NaN	rs371015074	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr15	42682333	42682333	C	G	intronic	CAPN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr15	42682334	42682334	A	T	intronic	CAPN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr15	42700576	42700576	A	A	intronic	CAPN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	11	8	0	0
chr15	42702051	42702051	C	T	intronic	CAPN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.12906	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	156	142	14	0
chr15	42702052	42702052	T	G	intronic	CAPN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.407378	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	153	136	17	0
chr15	42717006	42717006	C	G	intronic	ZNF106	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	42717238	42717238	A	A	intronic	ZNF106	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	42731649	42731649	T	T	exonic	ZNF106	NaN	synonymous SNV	ZNF106:NM_001284306:exon7:c.A1612A:p.K538K,ZNF106:NM_022473:exon8:c.A4057A:p.K1353K,ZNF106:NM_001284307:exon9:c.A1741A:p.K581K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	105	83	0	0
chr15	42851724	42851724	A	G	intronic	HAUS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	0	3	0
chr15	42877750	42877750	C	T	exonic	STARD9	NaN	nonsynonymous SNV	STARD9:NM_020759:exon3:c.C149T:p.S50F	NaN	NaN	NaN	0.1	T	.	.	.	.	.	.	0.984	N	1.935	M	-0.96	T	-0.543	T	0.401	T	0.351	4.113	21.2	4.61	1.344	3.118	9.759	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.43198	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	59	53	6	0
chr15	42930891	42930891	A	T	intronic	STARD9	NaN	NaN	NaN	rs1197550	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	151.478	0	NaN	NA	NA	52	1	51	32
chr15	42954962	42954962	T	T	intronic	STARD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	63	NaN	NA	NA	26	25	0	0
chr15	42961566	42961566	A	C	intronic	STARD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	3	2	0
chr15	42966542	42966542	T	T	intronic	STARD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	42966780	42966780	A	C	intronic	STARD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	4	2	0
chr15	42976441	42976441	T	C	exonic	STARD9	NaN	nonsynonymous SNV	STARD9:NM_020759:exon23:c.T2665C:p.C889R	NaN	NaN	NaN	0.69	T	.	.	.	.	.	.	1.000	N	0	N	0.01	T	-1.028	T	0.074	T	0.112	1.158	9.715	-3.26	-0.623	-0.786	4.167	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.154941	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	71	68	3	0
chr15	42984522	42984522	G	C	exonic	STARD9	NaN	synonymous SNV	STARD9:NM_020759:exon23:c.G10746C:p.S3582S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.369188	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	139	126	13	0
chr15	43010387	43010387	G	A	intronic	STARD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.976546	nearby_gap_events	REJECT	71	62	9	0
chr15	43017888	43017888	A	A	intronic	CDAN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr15	43020295	43020295	G	C	intronic	CDAN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	136.092	0	NaN	NA	NA	64	34	30	0
chr15	43242393	43242393	A	C	intronic	UBR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	43322331	43322331	A	A	intronic	UBR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	43328305	43328305	A	G	intronic	UBR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	43330276	43330276	T	T	intronic	UBR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	43351240	43351240	T	T	intronic	UBR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	17	14	0	0
chr15	43351835	43351835	A	C	intronic	UBR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	43351839	43351839	T	C	intronic	UBR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	43398107	43398107	GA	G,GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	313.226	0	NaN	NA	NA	33	0	8	12
chr15	43478113	43478113	G	C	intronic	CCNDBP1	NaN	NaN	NaN	rs540587	NaN	0.751597	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	111.629311	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	0	36	56
chr15	43498495	43498495	C	C	intronic	EPB42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	19	17	0	0
chr15	43498496	43498496	G	G	intronic	EPB42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr15	43525367	43525367	G	A	UTR3	TGM5	NM_004245:c.*22C>T,NM_201631:c.*22C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.058825	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	311	305	6	0
chr15	43533221	43533221	G	T	intronic	TGM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr15	43533223	43533223	T	G	intronic	TGM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr15	43545979	43545979	A	A	intronic	TGM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr15	43552800	43552800	A	A	intronic	TGM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	43571780	43571780	T	C	intronic	TGM7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	43611202	43611202	G	C	intergenic	TGM7,LCMT2	dist=16749;dist=8772	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	43639359	43639359	A	T	intronic	ADAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr15	43639360	43639360	G	C	intronic	ADAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr15	43639363	43639363	A	C	intronic	ADAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	43643300	43643300	A	A	intronic	ADAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr15	43643832	43643832	T	G	intronic	ADAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr15	43668677	43668677	T	T	intronic	TUBGCP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr15	43669989	43669989	A	A	intronic	TUBGCP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr15	43672439	43672439	A	C	intronic	TUBGCP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr15	43675713	43675713	A	C	ncRNA_intronic	RNU6-28P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr15	43692274	43692274	T	C	exonic	TUBGCP4	NaN	nonsynonymous SNV	TUBGCP4:NM_001286414:exon14:c.T1454C:p.V485A,TUBGCP4:NM_014444:exon14:c.T1451C:p.V484A	NaN	NaN	NaN	0.47	T	0.205	B	0.219	B	0.000	D	1.000	D	1.59	L	.	.	-0.824	T	0.220	T	0.924	2.480	14.25	5.2	2.308	7.825	14.694	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.497719	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	65	60	5	0
chr15	43701216	43701216	C	G	exonic	TP53BP1	NaN	nonsynonymous SNV	TP53BP1:NM_001141979:exon26:c.G5473C:p.G1825R,TP53BP1:NM_001141980:exon26:c.G5479C:p.G1827R,TP53BP1:NM_005657:exon26:c.G5464C:p.G1822R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.69	M	-2.72	D	0.902	D	0.864	D	0.942	4.987	29.2	5.35	2.664	7.208	19.425	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.035962	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	291	271	20	0
chr15	43708087	43708087	A	A	ncRNA_intronic	RNU6-28P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	43713982	43713982	T	C	ncRNA_intronic	RNU6-28P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr15	43714317	43714317	T	C	exonic	TP53BP1	NaN	nonsynonymous SNV	TP53BP1:NM_001141979:exon19:c.A3836G:p.E1279G,TP53BP1:NM_001141980:exon19:c.A3836G:p.E1279G,TP53BP1:NM_005657:exon19:c.A3821G:p.E1274G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	0.975	L	2.17	T	-0.998	T	0.119	T	0.818	4.128	21.3	5.78	2.333	7.749	16.398	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.334423	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	352	345	7	0
chr15	43733667	43733667	T	T	ncRNA_intronic	RNU6-28P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr15	43733846	43733846	A	A	ncRNA_intronic	RNU6-28P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr15	43767017	43767017	A	A	ncRNA_intronic	RNU6-28P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	43773295	43773295	A	G	ncRNA_intronic	RNU6-28P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	43773298	43773298	C	G	ncRNA_intronic	RNU6-28P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	43785258	43785258	T	C	ncRNA_intronic	RNU6-28P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.2646	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr15	43813759	43813759	G	A	exonic	MAP1A	NaN	nonsynonymous SNV	MAP1A:NM_002373:exon4:c.G88A:p.G30R	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	1.0	D	.	.	1.000	D	2.48	M	0.67	T	-0.332	T	0.336	T	0.951	2.915	15.71	4.92	2.720	9.601	18.657	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	27	27	0	0
chr15	43815468	43815468	C	A	exonic	MAP1A	NaN	synonymous SNV	MAP1A:NM_002373:exon4:c.C1797A:p.V599V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.015825	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	345	331	14	0
chr15	43816560	43816560	T	G	exonic	MAP1A	NaN	nonsynonymous SNV	MAP1A:NM_002373:exon4:c.T2889G:p.F963L	NaN	NaN	NaN	0.28	T	0.058	B	0.022	B	.	.	0.997	N	2.455	M	4.79	T	-0.962	T	0.008	T	0.478	0.680	7.636	0.067	-0.147	0.124	5.843	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.365836	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	105	89	16	0
chr15	43816917	43816917	G	A	exonic	MAP1A	NaN	synonymous SNV	MAP1A:NM_002373:exon4:c.G3246A:p.G1082G	rs1060939	NaN	0.528754	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	57.7331	0	NaN	NA	NA	47	31	16	20
chr15	43817970	43817970	C	T	exonic	MAP1A	NaN	synonymous SNV	MAP1A:NM_002373:exon4:c.C4299T:p.D1433D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.08823529411764706	NA	0	0	NaN	NA	NA	13	6	7	0
chr15	43818079	43818079	G	A	exonic	MAP1A	NaN	nonsynonymous SNV	MAP1A:NM_002373:exon4:c.G4408A:p.A1470T	rs62020612	ID=COSM1373044;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.13778	0.48	T	0.0	B	0.001	B	.	.	1.000	P	1.405	L	4.28	T	-0.951	T	0.000	T	0.01	1.853	12.15	-0.403	-0.182	-0.485	9.215	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	86.054664	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	87	46	41	10
chr15	43820057	43820057	A	C	exonic	MAP1A	NaN	nonsynonymous SNV	MAP1A:NM_002373:exon4:c.A6386C:p.H2129P	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.001	B	0.003	B	0.003	N	0.963	N	1.04	L	4.92	T	-0.960	T	0.005	T	0.397	0.521	6.823	2.45	0.857	0.937	9.569	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.666775	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	83	74	9	0
chr15	43820058	43820058	C	A	exonic	MAP1A	NaN	nonsynonymous SNV	MAP1A:NM_002373:exon4:c.C6387A:p.H2129Q	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.002	B	0.008	B	0.003	N	0.978	N	1.04	L	5.04	T	-0.931	T	0.004	T	0.226	-0.409	2.087	0.945	0.023	-0.014	5.197	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.0280142571413913	NA	0	0	12.371684	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	53	43	10	0
chr15	43820245	43820245	G	C	exonic	MAP1A	NaN	nonsynonymous SNV	MAP1A:NM_002373:exon4:c.G6574C:p.G2192R	NaN	NaN	NaN	0.03	D	1.0	D	0.995	D	0.004	N	0.999	D	1.1	L	4.82	T	-0.953	T	0.016	T	0.515	2.194	13.29	4.7	2.428	2.815	15.579	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.530599	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	92	78	14	0
chr15	43820263	43820263	G	C	exonic	MAP1A	NaN	nonsynonymous SNV	MAP1A:NM_002373:exon4:c.G6592C:p.G2198R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.996	D	0.808	P	0.004	N	0.985	D	1.1	L	4.55	T	-0.981	T	0.013	T	0.564	1.745	11.79	4.7	2.428	2.792	7.208	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.818787	nearby_gap_events	REJECT	98	89	9	0
chr15	43821047	43821047	C	A	exonic	MAP1A	NaN	nonsynonymous SNV	MAP1A:NM_002373:exon4:c.C7376A:p.P2459Q	NaN	NaN	NaN	0.58	T	0.001	B	0.001	B	.	.	1.000	N	-0.205	N	4.97	T	-0.915	T	0.002	T	0.076	-0.886	0.468	-4.61	-0.864	-0.412	3.477	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	31	19	12	0
chr15	43821048	43821048	A	C	exonic	MAP1A	NaN	synonymous SNV	MAP1A:NM_002373:exon4:c.A7377C:p.P2459P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	57	45	12	0
chr15	43821123	43821123	G	C	exonic	MAP1A	NaN	synonymous SNV	MAP1A:NM_002373:exon4:c.G7452C:p.G2484G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	29	16	13	3
chr15	43821125	43821125	C	G	exonic	MAP1A	NaN	nonsynonymous SNV	MAP1A:NM_002373:exon4:c.C7454G:p.P2485R	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.015	B	0.009	B	.	.	1.000	N	1.04	L	4.6	T	-0.970	T	0.008	T	0.205	-0.412	2.075	4.9	2.544	0.905	11.177	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	86	67	18	44
chr15	43850952	43850952	T	G	ncRNA_intronic	RNU6-28P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr15	43895661	43895661	A	A	intronic	STRC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	43924531	43924531	T	C	exonic	CATSPER2	NaN	nonsynonymous SNV	CATSPER2:NM_001282310:exon12:c.A1439G:p.E480G,CATSPER2:NM_054020:exon12:c.A1421G:p.E474G,CATSPER2:NM_172095:exon12:c.A1427G:p.E476G,CATSPER2:NM_001282309:exon13:c.A1421G:p.E474G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.241	B	0.116	B	0.136	N	1.000	D	1.5	L	-4.05	D	0.614	D	0.795	D	0.18	2.748	15.15	4.19	1.886	2.964	9.859	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr15	43924532	43924532	C	G	exonic	CATSPER2	NaN	nonsynonymous SNV	CATSPER2:NM_001282310:exon12:c.G1438C:p.E480Q,CATSPER2:NM_054020:exon12:c.G1420C:p.E474Q,CATSPER2:NM_172095:exon12:c.G1426C:p.E476Q,CATSPER2:NM_001282309:exon13:c.G1420C:p.E474Q	NaN	NaN	NaN	0.67	T	0.004	B	0.006	B	0.136	N	1.000	N	-0.375	N	-3.95	D	-0.081	T	0.669	D	0.117	1.891	12.28	2.12	0.407	0.710	11.128	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	16	12	4	0
chr15	43924533	43924533	G	T	exonic	CATSPER2	NaN	nonsynonymous SNV	CATSPER2:NM_001282310:exon12:c.C1437A:p.H479Q,CATSPER2:NM_054020:exon12:c.C1419A:p.H473Q,CATSPER2:NM_172095:exon12:c.C1425A:p.H475Q,CATSPER2:NM_001282309:exon13:c.C1419A:p.H473Q	NaN	NaN	NaN	0.24	T	0.983	D	0.775	P	0.009	N	1.000	D	1.7	L	-3.85	D	0.399	D	0.811	D	0.308	2.429	14.08	-1.02	-0.312	0.242	7.502	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	21	12	9	0
chr15	43941456	43941456	C	C	upstream	CATSPER2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr15	44038899	44038899	C	T	exonic	PDIA3	NaN	synonymous SNV	PDIA3:NM_005313:exon1:c.C162T:p.A54A	rs2411284	ID=COSM433931;OCCURENCE=1(breast)	0.549121	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	34.8054	0	12.135318	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	6	6	49
chr15	44057633	44057633	T	C	intronic	PDIA3	NaN	NaN	NaN	rs77244112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.466009	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	30	19	11	0
chr15	44059057	44059057	T	C	exonic	PDIA3	NaN	nonsynonymous SNV	PDIA3:NM_005313:exon8:c.T977C:p.V326A	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.946	P	0.9	P	0.000	D	1.000	D	2	M	1.36	T	-0.789	T	0.196	T	0.789	4.810	27.2	5.74	2.168	6.260	16.040	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.469589	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	270	257	13	0
chr15	44066699	44066699	G	A	exonic	ELL3	NaN	nonsynonymous SNV	ELL3:NM_025165:exon8:c.C841T:p.P281S	NaN	NaN	NaN	0.39	T	1.0	D	0.994	D	0.006	N	0.998	D	1.545	L	1.42	T	-1.039	T	0.143	T	0.374	2.497	14.31	5.11	2.553	4.431	14.399	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.492686	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	300	294	6	0
chr15	44068514	44068514	G	G	intronic	ELL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	44084439	44084439	T	A	ncRNA_exonic	SERF2-C15ORF63	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	44084505	44084505	G	A	ncRNA_exonic	SERF2-C15ORF63	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.746925	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	46	33	13	0
chr15	44089000	44089000	A	C	ncRNA_intronic	SERF2-C15ORF63	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.306758	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	119	110	9	0
chr15	44097279	44097279	A	G	UTR3	MFAP1	NM_005926:c.*13T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.211271	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	77	73	4	0
chr15	44143090	44143090	A	G	intronic	WDR76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	21	13	8	0
chr15	44143462	44143462	A	A	intronic	WDR76	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	44177792	44177792	C	A	intronic	FRMD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	44884674	44884674	A	G	intronic	SPG11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.466877	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	149	139	10	0
chr15	44888940	44888940	T	C	intronic	SPG11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	44888944	44888944	A	T	intronic	SPG11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr15	44889173	44889173	A	G	intronic	SPG11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr15	44890803	44890803	A	G	intronic	SPG11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	13	6	7	0
chr15	44891044	44891044	A	G	intronic	SPG11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr15	44940972	44940972	T	T	intronic	SPG11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr15	44960736	44960736	A	A	intronic	PATL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	44967740	44967740	C	T	exonic	PATL2	NaN	nonsynonymous SNV	PATL2:NM_001145112:exon3:c.G166A:p.E56K	NaN	NaN	NaN	0.72	T	0.005	B	0.004	B	.	.	1.000	N	0.895	L	0.9	T	-1.016	T	0.062	T	0.369	3.278	17.00	2.66	1.056	0.698	6.866	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.274434	clustered_read_position	REJECT	5	2	3	0
chr15	45028799	45028799	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	2	3,2	0
chr15	45390082	45390082	G	C	intronic	DUOX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.98891	nearby_gap_events	REJECT	90	80	10	0
chr15	45390083	45390083	C	T	intronic	DUOX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.935235	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	115	105	10	0
chr15	45393963	45393963	T	C	intronic	DUOX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	45398251	45398251	T	A	intronic	DUOX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	3	5	0
chr15	45399243	45399243	A	A	intronic	DUOX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr15	45400988	45400988	T	G	exonic	DUOX2	NaN	nonsynonymous SNV	DUOX2:NM_014080:exon12:c.A1397C:p.Q466P	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.769	P	0.359	B	0.039	N	0.817	D	1.61	L	.	.	-0.628	T	0.159	T	0.448	1.920	12.38	5.27	1.985	6.199	12.580	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	29	2	27	0
chr15	45404066	45404066	G	A	exonic	DUOX2	NaN	nonsynonymous SNV	DUOX2:NM_014080:exon5:c.C413T:p.P138L	rs2001616	NaN	0.759984	0.06	T	0.031	B	0.049	B	0.000	D	0.000	P	2.035	M	.	.	-1.064	T	0.000	T	0.06	2.721	15.06	1.9	0.603	2.409	6.759	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	94.415267	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	1	34	55
chr15	45405645	45405645	G	T	intronic	DUOX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	49	23	26	0
chr15	45408699	45408699	C	T	intronic	DUOXA2	NaN	NaN	NaN	rs2252371	NaN	0.682907	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	184.648865	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	68	2	66	52
chr15	45408913	45408913	C	T	exonic	DUOXA2	NaN	synonymous SNV	DUOXA2:NM_207581:exon4:c.C540T:p.A180A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	75.158933	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	98	61	37	1
chr15	45408933	45408933	T	C	intronic	DUOXA2	NaN	NaN	NaN	rs2576092	NaN	0.764177	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	295.757468	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	99	1	98	57
chr15	45414964	45414964	T	T	intronic	DUOXA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr15	45424104	45424104	G	A	intronic	DUOX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.538028	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	118	113	5	0
chr15	45428712	45428712	C	T	intronic	DUOX1	NaN	NaN	NaN	rs72724253	NaN	0.0459265	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	20.4191	0	9.379939	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	7	4	5
chr15	45430076	45430076	T	A	intronic	DUOX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	1	6	0
chr15	45430310	45430310	A	G	intronic	DUOX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr15	45430313	45430313	G	C	intronic	DUOX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr15	45431530	45431530	C	G	intronic	DUOX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	45431531	45431531	A	C	intronic	DUOX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr15	45439751	45439751	C	T	exonic	DUOX1	NaN	nonsynonymous SNV	DUOX1:NM_175940:exon19:c.C2443T:p.P815S,DUOX1:NM_017434:exon20:c.C2443T:p.P815S	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.78	P	0.377	B	0.002	N	0.999	D	1.1	L	0.12	T	-0.912	T	0.152	T	0.465	3.636	18.49	4.24	1.389	2.027	11.561	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.799819	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	191	183	8	0
chr15	45443467	45443467	A	A	intronic	DUOX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	45490919	45490919	T	A	intronic	SHF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr15	45491305	45491305	A	A	UTR5	SHF	NM_138356:c.-33T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr15	45558475	45558475	A	A	ncRNA_intronic	LOC101928414	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	45560612	45560612	A	A	ncRNA_intronic	LOC101928414	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	45695513	45695513	G	A	exonic	SPATA5L1	NaN	nonsynonymous SNV	SPATA5L1:NM_024063:exon1:c.G886A:p.G296R	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.089	B	0.052	B	0.000	N	0.990	D	0.64	N	-3.54	D	-0.199	T	0.626	D	0.138	2.580	14.59	1.77	0.169	2.056	8.419	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	3	1
chr15	45724411	45724411	A	C	intronic	C15orf48	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	10	2	8	0
chr15	45725132	45725132	T	C	intronic	C15orf48	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.524346	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	215	202	13	0
chr15	45898758	45898758	A	A	UTR3	BLOC1S6	NM_012388:c.*46A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	45966019	45966019	A	G	intronic	SQRDL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	24	16	7	0
chr15	45980673	45980673	A	A	intronic	SQRDL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	46008282	46008282	A	T	intergenic	SQRDL,SEMA6D	dist=24790;dist=1468121	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	48053229	48053229	C	A	exonic	SEMA6D	NaN	synonymous SNV	SEMA6D:NM_020858:exon4:c.C276A:p.P92P,SEMA6D:NM_024966:exon4:c.C276A:p.P92P,SEMA6D:NM_153616:exon4:c.C276A:p.P92P,SEMA6D:NM_153617:exon4:c.C276A:p.P92P,SEMA6D:NM_153618:exon4:c.C276A:p.P92P,SEMA6D:NM_153619:exon4:c.C276A:p.P92P,SEMA6D:NM_001198999:exon7:c.C276A:p.P92P	rs501916	NaN	0.479832	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.143121	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	28	24	30
chr15	48056735	48056735	A	C	intronic	SEMA6D	NaN	NaN	NaN	rs565627	NaN	0.484625	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	90.809513	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	70	34	36	31
chr15	48062781	48062781	T	G	exonic	SEMA6D	NaN	nonsynonymous SNV	SEMA6D:NM_020858:exon17:c.T1835G:p.L612W,SEMA6D:NM_153616:exon17:c.T1796G:p.L599W,SEMA6D:NM_153617:exon18:c.T1853G:p.L618W,SEMA6D:NM_153618:exon19:c.T2021G:p.L674W,SEMA6D:NM_001198999:exon20:c.T1835G:p.L612W	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.994	D	0.001	D	1.000	D	1.65	L	-0.25	T	-0.149	T	0.425	T	0.64	3.644	18.53	5.81	2.215	5.983	16.159	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	65	NaN	NA	NA	403	262	141	0
chr15	48062785	48062785	G	T	exonic	SEMA6D	NaN	synonymous SNV	SEMA6D:NM_020858:exon17:c.G1839T:p.G613G,SEMA6D:NM_153616:exon17:c.G1800T:p.G600G,SEMA6D:NM_153617:exon18:c.G1857T:p.G619G,SEMA6D:NM_153618:exon19:c.G2025T:p.G675G,SEMA6D:NM_001198999:exon20:c.G1839T:p.G613G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	365	283	82	0
chr15	48413319	48413319	T	C	exonic	SLC24A5	NaN	synonymous SNV	SLC24A5:NM_205850:exon1:c.T78C:p.P26P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.64329	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	209	203	6	0
chr15	48427291	48427291	A	A	intronic	SLC24A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr15	48427294	48427294	C	A	intronic	SLC24A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr15	48451289	48451289	A	A	intronic	MYEF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr15	48543804	48543804	G	T	intronic	SLC12A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.661441	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	556	542	14	0
chr15	48561834	48561834	A	G	intronic	SLC12A1	NaN	NaN	NaN	rs1484551	NaN	0.979233	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1989.18	0	NaN	NA	NA	150	0	150	33
chr15	48561835	48561835	T	G	intronic	SLC12A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.2311	0	NaN	NA	NA	207	181	26	4
chr15	48604459	48604459	T	A	intergenic	SLC12A1,DUT	dist=8184;dist=19162	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr15	48626546	48626546	T	C	intronic	DUT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	48729185	48729185	A	G	exonic	FBN1	NaN	nonsynonymous SNV	FBN1:NM_000138:exon53:c.T6469C:p.Y2157H	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.136	B	0.033	B	0.000	D	1.000	D	2.67	M	-3.74	D	0.698	D	0.846	D	0.916	4.665	25.7	5.77	2.326	9.122	16.056	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.027289	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	73	70	3	0
chr15	48740937	48740937	A	G	intronic	FBN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.482856	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	120	109	11	0
chr15	48752348	48752348	T	A	intronic	FBN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.537102	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	112	102	10	0
chr15	48760772	48760772	A	A	intronic	FBN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	48780716	48780716	A	C	intronic	FBN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr15	48797463	48797463	A	T	intronic	FBN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	16	11	5	0
chr15	49054535	49054535	C	A	intronic	CEP152	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	2	6	0
chr15	49074317	49074317	T	T	intronic	CEP152	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	40	34	0	0
chr15	49088389	49088389	T	G	intronic	CEP152	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	18	13	5	0
chr15	49089998	49089998	A	A	intronic	CEP152	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	49109812	49109812	T	G	intergenic	CEP152,SHC4	dist=6469;dist=6122	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	49164235	49164235	T	T	intronic	SHC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	17	11	0	0
chr15	49170738	49170738	A	C	exonic	EID1	NaN	nonsynonymous SNV	EID1:NM_014335:exon1:c.A365C:p.Y122S	NaN	NaN	NaN	0.71	T	0.964	D	0.745	P	.	.	1.000	N	1.1	L	1.28	T	-1.070	T	0.087	T	0.591	3.547	18.09	3.07	0.952	3.528	6.441	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.014356726231238903	NA	0	0	NaN	NA	NA	29	19	10	0
chr15	49170931	49170931	A	G	exonic	EID1	NaN	synonymous SNV	EID1:NM_014335:exon1:c.A558G:p.R186R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.602282	nearby_gap_events	REJECT	136	129	7	0
chr15	49291983	49291983	T	G	intronic	SECISBP2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr15	49325316	49325316	A	C	intronic	SECISBP2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.07276	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	142	133	9	0
chr15	49325324	49325324	A	C	intronic	SECISBP2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.102534	nearby_gap_events	REJECT	166	158	8	0
chr15	49420816	49420816	A	G	intronic	COPS2	NaN	NaN	NaN	rs17394420	NaN	0.110024	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	104.623091	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	106	56	50	24
chr15	49426752	49426752	A	C	intronic	COPS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	49426753	49426753	G	C	intronic	COPS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	49426754	49426754	A	T	intronic	COPS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	49426756	49426756	A	T	intronic	COPS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	49426758	49426758	T	C	intronic	COPS2	NaN	NaN	NaN	rs369766419	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	49867122	49867122	A	G	intronic	FAM227B	NaN	NaN	NaN	rs12901416	NaN	0.733626	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.6351	0	NaN	NA	NA	39	15	24	0
chr15	49867148	49867148	T	C	intronic	FAM227B	NaN	NaN	NaN	rs12902794	NaN	0.734026	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.7819	0	NaN	NA	NA	58	33	25	0
chr15	49869802	49869802	T	A	intronic	FAM227B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	2	2	0
chr15	50152269	50152269	T	T	UTR3	ATP8B4	NM_024837:c.*122A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr15	50210995	50210995	C	G	intronic	ATP8B4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	50210997	50210997	C	A	intronic	ATP8B4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	50211000	50211000	T	C	intronic	ATP8B4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	50211001	50211001	T	A	intronic	ATP8B4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	50254360	50254360	A	G	intronic	ATP8B4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	50330883	50330883	T	A	intronic	ATP8B4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	14	8	6	0
chr15	50489677	50489677	A	T	intronic	SLC27A2	NaN	NaN	NaN	rs1863511	NaN	0.971446	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2352.01	0	NaN	NA	NA	155	1	154	36
chr15	50497576	50497576	T	G	intronic	SLC27A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.806794	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	157	145	12	0
chr15	50519333	50519333	A	G	exonic	SLC27A2	NaN	nonsynonymous SNV	SLC27A2:NM_001159629:exon6:c.A1256G:p.E419G,SLC27A2:NM_003645:exon7:c.A1415G:p.E472G	NaN	NaN	NaN	0.32	T	0.963	D	0.864	P	0.026	N	1.000	D	2.42	M	0.72	T	-0.669	T	0.261	T	0.361	3.776	19.17	5.78	2.205	6.039	14.072	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.314763	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	295	283	12	0
chr15	50519514	50519514	A	A	intronic	SLC27A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	50545020	50545020	A	A	intronic	HDC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	50545023	50545023	A	A	intronic	HDC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	50546273	50546273	C	G	intronic	HDC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	50546275	50546275	T	C	intronic	HDC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	50546276	50546276	C	A	intronic	HDC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	50571012	50571012	T	T	intronic	GABPB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	43	39	0	0
chr15	50731417	50731417	T	A	intronic	USP8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.181291	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	221	203	18	0
chr15	50733492	50733492	T	T	intronic	USP8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	39	28	0	0
chr15	50733779	50733779	A	C	intronic	USP8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr15	50769458	50769458	T	A	intronic	USP8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.915748	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	242	233	9	0
chr15	50769708	50769708	A	A	intronic	USP8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr15	50773755	50773755	G	A	exonic	USP8	NaN	synonymous SNV	USP8:NM_001283049:exon9:c.G1065A:p.Q355Q,USP8:NM_001128610:exon11:c.G1296A:p.Q432Q,USP8:NM_005154:exon11:c.G1296A:p.Q432Q	rs3131561	NaN	0.992212	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	48.637696	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	0	21	56
chr15	50784747	50784747	C	G	intronic	USP8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr15	50785132	50785132	T	G	intronic	USP8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	2.659222390410279E-4	NA	0	0	NaN	NA	NA	61	48	13	0
chr15	50838568	50838568	T	T	intronic	USP50	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	50873138	50873138	A	C	intronic	TRPM7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.639522	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	112	103	9	0
chr15	50888596	50888596	G	A	intronic	TRPM7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.658508	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	60	52	8	0
chr15	50912134	50912134	A	A	intronic	TRPM7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr15	50920471	50920471	A	A	intronic	TRPM7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	50923509	50923509	T	T	intronic	TRPM7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	50935766	50935766	A	A	intronic	TRPM7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr15	50941108	50941108	C	G	intronic	TRPM7	NaN	NaN	NaN	rs2063011	NaN	0.969249	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.199187	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	0
chr15	51018520	51018520	T	C	exonic	SPPL2A	NaN	nonsynonymous SNV	SPPL2A:NM_032802:exon11:c.A1144G:p.K382E	NaN	NaN	NaN	0.7	T	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.09	M	2.21	T	-1.038	T	0.102	T	0.89	3.493	17.86	5.83	2.229	5.881	16.192	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.370431	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	214	202	12	0
chr15	51204364	51204364	G	A	intronic	AP4E1	NaN	NaN	NaN	rs1147129	NaN	0.559105	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	248.208262	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	84	0	84	52
chr15	51242442	51242442	A	A	intronic	AP4E1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	51250617	51250617	T	T	intronic	AP4E1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	17	14	0	0
chr15	51289554	51289554	T	C	exonic	AP4E1	NaN	nonsynonymous SNV	AP4E1:NM_001252127:exon18:c.T2153C:p.F718S,AP4E1:NM_007347:exon18:c.T2378C:p.F793S	NaN	NaN	NaN	0.13	T	1.0	D	0.982	D	0.000	D	1.000	D	1.04	L	1.46	T	-1.001	T	0.125	T	0.797	3.479	17.80	5.19	1.959	5.458	14.260	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.88404	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	371	362	9	0
chr15	51294880	51294880	A	A	UTR3	AP4E1	NM_007347:c.*21A>A,NM_001252127:c.*21A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	51352114	51352114	G	T	intronic	TNFAIP8L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	51352115	51352115	A	C	intronic	TNFAIP8L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	51352116	51352116	G	C	intronic	TNFAIP8L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	51386583	51386583	G	T	intronic	TNFAIP8L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	16	7.309036	nearby_gap_events	REJECT	10	6	4	0
chr15	51502986	51502986	G	A	UTR3	CYP19A1	NM_031226:c.*19C>T,NM_000103:c.*19C>T	NaN	NaN	rs10046	NaN	0.362819	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.70345	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	80	39	41	45
chr15	51519945	51519945	A	AAAG	intronic	CYP19A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.675519	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	49.3141	0	NaN	NA	NA	7	0	3	5
chr15	51535155	51535155	A	T	intronic	CYP19A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr15	51743819	51743819	A	T	intronic	DMXL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	26	26	0	0
chr15	51755706	51755706	A	T	intronic	DMXL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.626078	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	132	122	10	0
chr15	51766803	51766803	T	C	intronic	DMXL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr15	51795172	51795172	G	A	exonic	DMXL2	NaN	synonymous SNV	DMXL2:NM_001174116:exon17:c.C2823T:p.N941N,DMXL2:NM_015263:exon17:c.C2823T:p.N941N	rs12592889	ID=COSM147909;OCCURENCE=1(stomach)	0.411342	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	112.503	0	NaN	NA	NA	234	113	121	29
chr15	51799537	51799537	A	A	intronic	DMXL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr15	51857220	51857220	C	T	intronic	DMXL2	NaN	NaN	NaN	rs11070857	NaN	0.329872	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	13.0632	0	NaN	NA	NA	179	109	70	13
chr15	51914662	51914662	G	A	exonic	DMXL2	NaN	synonymous SNV	DMXL2:NM_001174116:exon1:c.C81T:p.P27P,DMXL2:NM_001174117:exon1:c.C81T:p.P27P,DMXL2:NM_015263:exon1:c.C81T:p.P27P	rs2278990	NaN	0.411542	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	24	60.355137	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	64	28	36	41
chr15	51914716	51914716	T	C	exonic	DMXL2	NaN	synonymous SNV	DMXL2:NM_001174116:exon1:c.A27G:p.G9G,DMXL2:NM_001174117:exon1:c.A27G:p.G9G,DMXL2:NM_015263:exon1:c.A27G:p.G9G	rs2278989	NaN	0.412141	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	72.864646	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	58	29	29	44
chr15	51981291	51981291	C	T	intronic	SCG3	NaN	NaN	NaN	rs2305716	NaN	0.38738	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	46.320465	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	20	19	49
chr15	52090379	52090379	T	C	intronic	TMOD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.597061	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	109	102	7	0
chr15	52155257	52155257	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	1	2,2	0
chr15	52186180	52186180	A	A	intronic	TMOD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	52250920	52250920	A	G	intronic	LEO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.245517	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	123	111	12	0
chr15	52404862	52404862	A	C	exonic	BCL2L10	NaN	nonsynonymous SNV	BCL2L10:NM_020396:exon1:c.T62G:p.L21R	rs2231292	NaN	0.536542	1	T	0.0	B	0.0	B	0.477	N	1.000	P	-0.805	N	1.52	T	-0.997	T	0.000	T	0.036	-0.712	0.933	-5.24	-1.550	-3.406	4.903	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.821958	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	5	4	20
chr15	52413316	52413316	G	G	UTR3	GNB5	NM_006578:c.*1638C>C,NM_016194:c.*1638C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	52442220	52442220	A	T	intronic	GNB5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr15	52442221	52442221	G	C	intronic	GNB5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr15	52442222	52442222	T	G	intronic	GNB5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	4	0
chr15	52500672	52500672	G	A	intronic	MYO5C	NaN	NaN	NaN	rs62016466	NaN	0.0231629	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	127.149	0	NaN	NA	NA	73	41	32	2
chr15	52517683	52517683	T	C	exonic	MYO5C	NaN	nonsynonymous SNV	MYO5C:NM_018728:exon26:c.A3254G:p.K1085R	NaN	NaN	NaN	0.61	T	0.012	B	0.009	B	0.000	D	1.000	D	0.55	N	2.32	T	-1.046	T	0.030	T	0.501	2.172	13.22	5.83	2.236	5.753	16.213	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.187951	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	102	96	6	0
chr15	52534190	52534190	C	G	intronic	MYO5C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr15	52537468	52537468	A	C	intronic	MYO5C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr15	52537469	52537469	T	C	intronic	MYO5C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	52538328	52538328	A	G	intronic	MYO5C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	57	39	15	0
chr15	52561932	52561932	T	T	intronic	MYO5C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr15	52565036	52565036	A	A	intronic	MYO5C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	52571263	52571263	A	C	intronic	MYO5C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr15	52571685	52571685	T	C	intronic	MYO5C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	2	4	0
chr15	52574918	52574918	T	A	intronic	MYO5C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	0	2	0
chr15	52587880	52587880	C	T	UTR5	MYO5C	NM_018728:c.-47G>A	NaN	NaN	rs12907067	NaN	0.367412	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	24.3434	22	7.929429	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	2	4	28
chr15	52662310	52662310	T	G	intronic	MYO5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	1	4	0
chr15	52668426	52668426	T	T	intronic	MYO5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	22	20	0	0
chr15	52668822	52668822	G	A	intronic	MYO5A	NaN	NaN	NaN	rs1009157	NaN	0.309904	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.04016752514239526	NA	0	0	NaN	NA	NA	74	48	26	50
chr15	52681353	52681353	A	G	intronic	MYO5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.521918	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	128	113	15	0
chr15	52684163	52684163	T	C	exonic	MYO5A	NaN	synonymous SNV	MYO5A:NM_000259:exon12:c.A1506G:p.K502K,MYO5A:NM_001142495:exon12:c.A1506G:p.K502K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.808599	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	239	231	8	0
chr15	52697463	52697463	T	T	intronic	MYO5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	52725281	52725281	A	G	intronic	MYO5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	52844119	52844119	T	A	UTR3	ARPP19	NM_006628:c.*12A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr15	52844316	52844316	A	C	intronic	ARPP19	NaN	NaN	NaN	rs200974565	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.026388	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	139	123	16	0
chr15	52879232	52879232	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	11	1	5,5	0
chr15	52901283	52901283	T	C	exonic	FAM214A	NaN	nonsynonymous SNV	FAM214A:NM_001286495:exon5:c.A1849G:p.T617A,FAM214A:NM_019600:exon6:c.A1828G:p.T610A	rs61731670	NaN	0.430711	0.29	T	0.002	B	0.01	B	0.000	N	1.000	P	0	N	1.53	T	-1.028	T	0.000	T	0.096	-0.690	1.003	2.07	0.452	1.242	5.286	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	201.613	0	NaN	NA	NA	46	17	29	0
chr15	52901914	52901914	T	C	exonic	FAM214A	NaN	synonymous SNV	FAM214A:NM_001286495:exon5:c.A1218G:p.Q406Q,FAM214A:NM_019600:exon6:c.A1197G:p.Q399Q	rs3751613	NaN	0.0766773	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	58.267948	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	63	36	27	7
chr15	52901977	52901977	G	A	exonic	FAM214A	NaN	synonymous SNV	FAM214A:NM_001286495:exon5:c.C1155T:p.A385A,FAM214A:NM_019600:exon6:c.C1134T:p.A378A	rs2414166	ID=COSM147916;OCCURENCE=1(stomach)	0.417133	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.565506	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	68	28	40	56
chr15	52970312	52970312	T	T	UTR5	FAM214A	NM_019600:c.-94A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	76	52	0	0
chr15	53080789	53080789	A	G	intronic	ONECUT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	53147614	53147614	G	A	intergenic	ONECUT1,WDR72	dist=65405;dist=658324	NaN	NaN	rs62023513	NaN	0.110423	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	53958013	53958013	A	C	intronic	WDR72	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	20	13	7	0
chr15	54003154	54003154	C	T	intronic	WDR72	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.266797	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	106	101	5	0
chr15	54307592	54307592	G	A	exonic	UNC13C	NaN	nonsynonymous SNV	UNC13C:NM_001080534:exon1:c.G2492A:p.G831E	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.999	D	.	.	1.000	D	0.895	L	-2.42	D	0.595	D	0.735	D	0.977	3.789	19.24	5.69	2.681	7.644	18.794	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.925079	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	792	781	11	0
chr15	54341357	54341357	T	C	intronic	UNC13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr15	54435793	54435793	T	G	intronic	UNC13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.744431	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	195	183	12	0
chr15	54626114	54626114	T	A	intronic	UNC13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.5192	0	NaN	NA	NA	14	12	2	0
chr15	54685562	54685562	A	G	intronic	UNC13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	6	0	5	0
chr15	54707317	54707317	A	G	intronic	UNC13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr15	54707318	54707318	T	C	intronic	UNC13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	54707320	54707320	T	C	intronic	UNC13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	54707321	54707321	T	G	intronic	UNC13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	54707323	54707323	T	C	intronic	UNC13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	54817777	54817777	G	A	exonic	UNC13C	NaN	nonsynonymous SNV	UNC13C:NM_001080534:exon23:c.G5488A:p.E1830K	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.877	P	0.339	B	0.000	D	1.000	D	2.855	M	2.54	T	-1.043	T	0.067	T	0.828	5.061	31	5.89	2.788	8.202	19.241	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.944523	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	154	143	11	0
chr15	54825293	54825293	A	A	intronic	UNC13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	54847597	54847597	T	G	intronic	UNC13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	21	6	15	0
chr15	54859969	54859969	T	G	intronic	UNC13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr15	55631609	55631609	A	C	intronic	PIGB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr15	55664367	55664367	A	C	ncRNA_intronic	DYX1C1-CCPG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr15	55664368	55664368	A	T	ncRNA_intronic	DYX1C1-CCPG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr15	55710370	55710370	T	T	ncRNA_intronic	DYX1C1-CCPG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	72	NaN	NA	NA	311	258	0	0
chr15	55710810	55710810	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	2	3,2	0
chr15	55723090	55723090	A	A	ncRNA_intronic	DYX1C1-CCPG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr15	55731843	55731843	A	T	ncRNA_intronic	DYX1C1-CCPG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr15	55929213	55929213	T	T	intronic	PRTG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr15	55972642	55972642	C	T	intronic	PRTG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.227984	nearby_gap_events	REJECT	63	50	13	1
chr15	56125150	56125150	T	T	intronic	NEDD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	56161642	56161642	T	T	intronic	NEDD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	56164652	56164652	C	CG	exonic	NEDD4	NaN	frameshift substitution	NEDD4:NM_001284340:exon2:c.1571_1571delinsCG,NEDD4:NM_001284338:exon3:c.1622_1622delinsCG,NEDD4:NM_001284339:exon3:c.1622_1622delinsCG,NEDD4:NM_006154:exon7:c.365_365delinsCG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.23193	0	NaN	NA	NA	16	13	2	0
chr15	56387661	56387661	A	G	exonic	RFX7	NaN	synonymous SNV	RFX7:NM_022841:exon9:c.T2265C:p.D755D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.894092	nearby_gap_events	REJECT	290	280	10	0
chr15	56436738	56436738	A	A	intronic	RFX7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr15	56471659	56471659	A	A	intronic	RFX7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	56676263	56676263	A	A	intronic	TEX9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	56683433	56683433	T	A	intronic	TEX9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.85512	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	131	122	9	0
chr15	56683442	56683442	G	T	exonic	TEX9	NaN	nonsynonymous SNV	TEX9:NM_001286449:exon7:c.G172T:p.V58F,TEX9:NM_198524:exon7:c.G397T:p.V133F	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.631	P	0.313	B	0.581	N	1.000	N	1.59	L	.	.	-0.960	T	0.105	T	0.265	3.550	18.10	-0.846	-0.157	-0.026	6.662	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.988622	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	129	117	12	0
chr15	56927494	56927494	T	A	intronic	ZNF280D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.261349	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	179	168	11	0
chr15	56996497	56996497	T	A	intronic	ZNF280D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	72	65	7	0
chr15	57213454	57213454	A	G	intronic	TCF12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	13	4	9	0
chr15	57511711	57511711	A	C	UTR5	TCF12	NM_207040:c.-9A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.573479	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	449	425	24	0
chr15	57555531	57555531	A	A	intronic	TCF12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	7	0	0
chr15	57667310	57667310	A	G	intergenic	LINC01413,CGNL1	dist=50073;dist=1393	NaN	NaN	rs1706398	NaN	0.54992	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr15	57730173	57730173	T	C	intronic	CGNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	12	7	3	0
chr15	57734699	57734699	G	C	intronic	CGNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.085836	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	213	204	9	0
chr15	57753856	57753856	C	A	intronic	CGNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	57753862	57753862	T	C	intronic	CGNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	57836046	57836046	A	C	intronic	CGNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr15	57836690	57836690	G	T	exonic	CGNL1	NaN	nonsynonymous SNV	CGNL1:NM_032866:exon16:c.G3395T:p.R1132L,CGNL1:NM_001252335:exon17:c.G3395T:p.R1132L	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	3.21	M	-1.62	D	0.736	D	0.792	D	0.936	5.357	34	5.82	2.756	9.727	20.109	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.553738	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	366	360	6	0
chr15	57967219	57967219	T	C	exonic	GCOM1,MYZAP	NaN	synonymous SNV	MYZAP:NM_152451:exon11:c.T1173C:p.T391T,GCOM1:NM_001018090:exon12:c.T1257C:p.T419T,GCOM1:NM_001018091:exon12:c.T1257C:p.T419T,MYZAP:NM_001018100:exon12:c.T1257C:p.T419T,GCOM1:NM_001285900:exon12:c.T1257C:p.T419T	rs1991252	NaN	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	104.895871	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	0	42	58
chr15	57999304	57999304	G	C	intronic	GCOM1,POLR2M	NaN	NaN	NaN	rs11858659	NaN	0.0349441	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.452233	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	9	15	6
chr15	58254384	58254384	A	A	intronic	ALDH1A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	14	14	0	0
chr15	58255962	58255962	T	T	intronic	ALDH1A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	58256355	58256355	A	T	intronic	ALDH1A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	95	NaN	NA	NA	24	10	13	0
chr15	58430938	58430938	A	A	intronic	AQP9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	58467166	58467166	T	A	exonic	AQP9	NaN	nonsynonymous SNV	AQP9:NM_020980:exon4:c.T426A:p.N142K	NaN	NaN	NaN	0.57	T	0.132	B	0.145	B	0.000	D	1.000	D	0.27	N	-1.89	D	-0.919	T	0.294	T	0.155	1.693	11.62	-1.32	-0.398	-0.300	8.593	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.595851	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	66	58	8	0
chr15	58471368	58471368	C	T	exonic	AQP9	NaN	synonymous SNV	AQP9:NM_020980:exon5:c.C537T:p.I179I	rs2249783	NaN	0.836462	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	68.966963	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	54
chr15	58737296	58737296	A	A	ncRNA_intronic	LOC101928694	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	58828584	58828584	A	T	intronic	LIPC	NaN	NaN	NaN	rs11071387	NaN	0.314896	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	58834113	58834113	C	A	exonic	LIPC	NaN	nonsynonymous SNV	LIPC:NM_000236:exon3:c.C403A:p.R135S	NaN	NaN	NaN	0.32	T	0.877	P	0.487	P	0.003	N	1.000	D	1.12	L	-2.76	D	0.192	D	0.634	D	0.394	0.771	8.076	4.53	2.340	1.510	17.437	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.989942	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	44	41	3	0
chr15	58834917	58834917	T	G	intronic	LIPC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr15	58837909	58837909	CT	C,CC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2149.01	0	NaN	NA	NA	227	0	61	0
chr15	58840450	58840450	A	C	intronic	LIPC	NaN	NaN	NaN	rs1007543	NaN	0.95607	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	147.332367	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	54	0	54	58
chr15	58853079	58853079	C	A	exonic	LIPC	NaN	nonsynonymous SNV	LIPC:NM_000236:exon7:c.C1068A:p.F356L	rs3829462	NaN	0.936102	0.68	T	0.127	B	0.132	B	0.000	D	0.000	P	1.935	M	0.04	T	-0.968	T	0.000	T	0.291	2.038	12.77	3.91	0.789	3.447	12.058	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	103.076	0	NaN	NA	NA	150	1	149	7
chr15	58855602	58855602	C	A	intronic	LIPC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	58855606	58855606	A	T	intronic	LIPC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	58855607	58855607	G	C	intronic	LIPC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	58855608	58855608	T	C	intronic	LIPC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	58861091	58861091	A	G	downstream	LIPC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr15	58903370	58903370	A	G	intronic	ADAM10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.048798	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	133	129	4	0
chr15	58936276	58936276	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	0	2,3	0
chr15	58957211	58957211	T	T	intronic	ADAM10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	58971661	58971661	A	G	intronic	ADAM10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	59009939	59009939	A	C	intronic	ADAM10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.613251	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	273	261	12	0
chr15	59009941	59009941	C	C	intronic	ADAM10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	174	148	0	0
chr15	59064524	59064524	T	T	intronic	FAM63B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	59094492	59094492	T	C	intronic	FAM63B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	59344686	59344686	T	G	intronic	RNF111	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr15	59344687	59344687	A	C	intronic	RNF111	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	59344689	59344689	T	G	intronic	RNF111	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	59344690	59344690	T	A	intronic	RNF111	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr15	59344692	59344692	T	A	intronic	RNF111	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr15	59347929	59347929	C	A	exonic	RNF111	NaN	synonymous SNV	RNF111:NM_001270528:exon4:c.C1056A:p.S352S,RNF111:NM_001270529:exon4:c.C1056A:p.S352S,RNF111:NM_001270530:exon4:c.C1056A:p.S352S,RNF111:NM_017610:exon4:c.C1056A:p.S352S	rs1446239	ID=COSM1179762,COSM1179761;OCCURENCE=1(prostate),1(large_intestine)	0.441693	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	46.971237	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	21	21	37
chr15	59359001	59359001	A	G	exonic	RNF111	NaN	nonsynonymous SNV	RNF111:NM_001270528:exon6:c.A1405G:p.T469A,RNF111:NM_001270529:exon6:c.A1405G:p.T469A,RNF111:NM_001270530:exon6:c.A1405G:p.T469A,RNF111:NM_017610:exon6:c.A1405G:p.T469A	NaN	NaN	NaN	0.35	T	0.015	B	0.014	B	0.088	N	1.000	N	0.805	L	2.5	T	-0.988	T	0.018	T	0.055	2.665	14.87	-0.765	-0.379	0.489	5.297	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.292916	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	127	122	5	0
chr15	59453413	59453413	T	C	exonic	MYO1E	NaN	nonsynonymous SNV	MYO1E:NM_004998:exon24:c.A2644G:p.K882E	rs78750233	NaN	NaN	0.03	D	0.998	D	0.951	D	0.000	D	1.000	D	3.685	H	1.04	T	-0.068	T	0.354	T	0.894	4.662	25.7	5.04	2.127	7.868	14.939	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.393793	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	145	135	10	0
chr15	59487605	59487605	T	T	intronic	MYO1E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	16	11	0	0
chr15	59502633	59502633	T	T	intronic	MYO1E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	59510444	59510444	T	G	intronic	MYO1E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr15	59510445	59510445	A	T	intronic	MYO1E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	7	0	6	0
chr15	59515446	59515446	C	G	intronic	MYO1E	NaN	NaN	NaN	rs2306780	NaN	0.511182	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	485.053	0	NaN	NA	NA	168	80	88	10
chr15	59515456	59515456	A	G	intronic	MYO1E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr15	59524063	59524063	A	A	intronic	MYO1E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr15	59784676	59784676	A	A	intronic	FAM81A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr15	59931475	59931475	A	T	intronic	GTF2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	59964782	59964782	A	T	intronic	BNIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	59970061	59970061	A	G	intronic	BNIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.035346	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	117	103	14	0
chr15	60179039	60179039	A	A	intergenic	BNIP2,FOXB1	dist=197397;dist=117382	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	60297733	60297733	A	C	exonic	FOXB1	NaN	nonsynonymous SNV	FOXB1:NM_012182:exon2:c.A571C:p.M191L	NaN	NaN	NaN	1	T	0.057	B	0.007	B	0.000	U	0.524	N	1.5	L	-3.63	D	-0.159	T	0.645	D	0.307	1.464	10.84	2.91	1.498	3.468	9.168	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.62894	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr15	60643539	60643539	A	G	intronic	ANXA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr15	60690089	60690089	A	G	exonic	ANXA2	NaN	synonymous SNV	ANXA2:NM_001002858:exon1:c.T24C:p.C8C	rs12904657	ID=COSM1129161;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.794329	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	11	0	11	4
chr15	60715901	60715901	T	C	exonic	ICE2	NaN	nonsynonymous SNV	ICE2:NM_001018089:exon16:c.A2470G:p.S824G,ICE2:NM_024611:exon16:c.A2881G:p.S961G	NaN	NaN	NaN	0.72	T	0.0	B	0.001	B	0.001	D	1.000	N	0.255	N	.	.	-1.016	T	0.039	T	0.132	1.034	9.224	3.12	1.029	1.526	7.662	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.06179657879810119	NA	0	0	NaN	NA	NA	28	22	6	0
chr15	60740041	60740041	A	C	intronic	ICE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.720234	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	278	256	22	0
chr15	60803832	60803832	A	G	ncRNA_intronic	RORA-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	15	6	9	0
chr15	60803834	60803834	G	T	ncRNA_intronic	RORA-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	15	6	9	0
chr15	60803835	60803835	C	G	ncRNA_intronic	RORA-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	15	6	9	0
chr15	60803836	60803836	C	G	ncRNA_intronic	RORA-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	15	6	9	0
chr15	60803837	60803837	A	T	ncRNA_intronic	RORA-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	15	6	9	0
chr15	60803839	60803839	A	T	ncRNA_intronic	RORA-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	15	6	9	0
chr15	60803841	60803841	C	G	ncRNA_intronic	RORA-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	15	6	9	0
chr15	60803843	60803843	T	A	ncRNA_intronic	RORA-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	14	5	9	0
chr15	60849208	60849208	A	A	ncRNA_intronic	RORA-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr15	60970992	60970992	A	G	intronic	RORA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr15	61002339	61002339	C	G	intronic	RORA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	61078836	61078836	C	T	intronic	RORA	NaN	NaN	NaN	rs16943117	NaN	0.218251	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr15	61135322	61135322	G	G	intronic	RORA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	61365442	61365442	T	G	intronic	RORA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr15	61365447	61365447	C	A	intronic	RORA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr15	62123212	62123212	G	A	intergenic	RORA,VPS13C	dist=601710;dist=21378	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr15	62123218	62123218	C	G	intergenic	RORA,VPS13C	dist=601716;dist=21372	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr15	62161544	62161544	T	T	intronic	VPS13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	62167003	62167003	T	G	intronic	VPS13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	13.2144	0	NaN	NA	NA	31	25	6	26
chr15	62167017	62167017	G	A	intronic	VPS13C	NaN	NaN	NaN	rs6494299	NaN	0.559704	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	262.847	0	NaN	NA	NA	145	0	145	32
chr15	62167897	62167897	G	A	intronic	VPS13C	NaN	NaN	NaN	rs12708469	NaN	0.511382	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	89.598659	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	0	31	46
chr15	62168054	62168054	A	G	intronic	VPS13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.247798	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	44	38	6	0
chr15	62169323	62169323	A	G	intronic	VPS13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr15	62202482	62202482	C	T	exonic	VPS13C	NaN	nonsynonymous SNV	VPS13C:NM_017684:exon62:c.G8609A:p.S2870N,VPS13C:NM_018080:exon62:c.G8609A:p.S2870N,VPS13C:NM_001018088:exon64:c.G8738A:p.S2913N,VPS13C:NM_020821:exon64:c.G8738A:p.S2913N	rs10851704	NaN	0.516374	1	T	0.0	B	0.001	B	0.000	N	1.000	P	-0.775	N	1.65	T	-0.914	T	0.000	T	0.005	0.068	4.368	3.54	0.133	0.853	9.591	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.427649	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	27
chr15	62212379	62212379	T	T	exonic	VPS13C	NaN	synonymous SNV	VPS13C:NM_017684:exon55:c.A7235A:p.D2412D,VPS13C:NM_018080:exon55:c.A7235A:p.D2412D,VPS13C:NM_001018088:exon57:c.A7364A:p.D2455D,VPS13C:NM_020821:exon57:c.A7364A:p.D2455D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	107	91	0	0
chr15	62250985	62250985	A	T	intronic	VPS13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	14	2	11	0
chr15	62259665	62259665	A	G	intronic	VPS13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.00442194898232574	NA	0	0	8.755437	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	38	31	7	0
chr15	62259708	62259708	C	C	intronic	VPS13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	77	59	0	0
chr15	62266641	62266641	A	A	intronic	VPS13C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	62352374	62352374	A	G	intronic	VPS13C	NaN	NaN	NaN	rs11639147	NaN	0.515775	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	55.92012	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	45
chr15	62359832	62359832	T	C	exonic	C2CD4A	NaN	nonsynonymous SNV	C2CD4A:NM_207322:exon2:c.T20C:p.L7P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.989	D	0.002	N	0.839	N	2.51	M	1.17	T	-0.796	T	0.202	T	0.89	3.078	16.28	3.34	1.531	4.184	8.289	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.037644	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	53	50	3	0
chr15	62949767	62949767	A	T	intronic	TLN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr15	62949771	62949771	T	C	intronic	TLN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr15	62949972	62949972	A	G	exonic	TLN2	NaN	synonymous SNV	TLN2:NM_015059:exon6:c.A663G:p.A221A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.708245	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	310	303	7	0
chr15	62986493	62986493	T	C	intronic	TLN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	16	10	5	0
chr15	62995122	62995122	A	A	intronic	TLN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr15	63000768	63000768	A	G	exonic	TLN2	NaN	nonsynonymous SNV	TLN2:NM_015059:exon18:c.A2240G:p.D747G	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.248	B	0.146	B	0.000	D	1.000	D	1.1	L	-0.29	T	-0.675	T	0.224	T	0.858	2.801	15.33	4.96	1.997	3.361	14.931	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.394982	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	197	183	14	0
chr15	63017144	63017144	T	A	intronic	TLN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr15	63031521	63031521	T	T	intronic	TLN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	63033018	63033018	G	A	intronic	TLN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	63044637	63044637	A	G	intronic	TLN2	NaN	NaN	NaN	rs7176359	NaN	0.720847	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	171.066025	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	0	65	55
chr15	63102063	63102063	T	T	intronic	TLN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	63102083	63102083	T	C	intronic	TLN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.72164	nearby_gap_events	REJECT	85	79	6	0
chr15	63111888	63111888	C	C	intronic	TLN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	63111891	63111891	A	A	intronic	TLN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	63131217	63131217	A	G	intronic	TLN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr15	63351711	63351711	T	T	intronic	TPM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	63406274	63406274	T	C	intergenic	TPM1,LACTB	dist=42161;dist=7725	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	63413997	63413997	C	T	upstream	LACTB	NaN	NaN	NaN	rs8182083	NaN	0.999601	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.82926	normal_lod	REJECT	3	0	3	13
chr15	63433343	63433343	T	C	intronic	LACTB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	13	8	3	0
chr15	63449543	63449543	A	C	intronic	RPS27L	NaN	NaN	NaN	rs7170846	NaN	0.269968	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.777442	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	17	11	40
chr15	63449680	63449680	C	G	UTR5	RPS27L	NM_015920:c.-76G>C	NaN	NaN	rs2292038	NaN	0.283546	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	100.572	0	NaN	NA	NA	32	16	16	38
chr15	63555657	63555657	T	A	intronic	RAB8B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.050161	nearby_gap_events	REJECT	76	69	7	0
chr15	63620427	63620427	A	T	intronic	CA12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	63632436	63632436	T	T	intronic	CA12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	63880869	63880869	T	C	ncRNA_exonic	USP3-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	63881149	63881149	A	G	exonic	USP3	NaN	nonsynonymous SNV	USP3:NM_001256702:exon13:c.A1204G:p.N402D,USP3:NM_006537:exon14:c.A1336G:p.N446D	NaN	NaN	NaN	0.34	T	0.72	P	0.338	B	0.000	D	1.000	D	0.395	N	1.57	T	-1.098	T	0.055	T	0.301	4.124	21.3	5.37	2.174	9.245	15.675	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.766545	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	312	306	6	0
chr15	63893601	63893601	T	C	exonic	FBXL22	NaN	nonsynonymous SNV	FBXL22:NM_203373:exon2:c.T460C:p.S154P	NaN	NaN	NaN	0.14	T	0.0	B	0.001	B	0.003	U	1.000	N	1.1	L	0.62	T	-1.092	T	0.065	T	0.159	3.060	16.21	-4.28	-0.938	1.057	3.250	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	0.03652618135376723	Somatic	15.7203	20	9.633992		KEEP	15	11	4	0
chr15	63893723	63893723	A	G	exonic	FBXL22	NaN	synonymous SNV	FBXL22:NM_203373:exon2:c.A582G:p.G194G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.582432	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	10	7	3	0
chr15	63901646	63901646	G	A	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	rs4984252	NaN	0.635783	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	250.01	0	NaN	NA	NA	89	40	49	52
chr15	63941809	63941809	T	T	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr15	63946291	63946291	A	A	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	63946294	63946294	A	A	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	63946300	63946300	T	T	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	63946303	63946303	A	G	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr15	63956831	63956831	A	G	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr15	63964903	63964903	A	C	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	12.5012	0	12.780201	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	39	30	9	0
chr15	63966910	63966910	A	A	exonic	HERC1	NaN	synonymous SNV	HERC1:NM_003922:exon38:c.T7477T:p.S2493S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	85	67	0	0
chr15	63978502	63978502	T	G	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr15	63990880	63990880	T	G	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.681719	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	81	73	8	0
chr15	64040134	64040134	A	C	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	13	8	5	0
chr15	64042050	64042050	A	T	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr15	64047587	64047587	A	G	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	15	7	8	0
chr15	64049018	64049018	A	T	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr15	64050666	64050666	A	A	intronic	HERC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	64067831	64067831	A	T	UTR5	HERC1	NM_003922:c.-9T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	64275646	64275646	C	A	intronic	DAPK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.26852	0	NaN	NA	NA	88	83	12	9
chr15	64330592	64330592	G	T	intronic	DAPK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	64330594	64330594	T	G	intronic	DAPK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	64385851	64385851	T	C	exonic	FAM96A	NaN	synonymous SNV	FAM96A:NM_001014812:exon1:c.A117G:p.E39E,FAM96A:NM_001289108:exon1:c.A117G:p.E39E,FAM96A:NM_032231:exon1:c.A117G:p.E39E	rs332259	NaN	0.916933	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	147.982572	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	54	0	54	58
chr15	64404934	64404934	A	A	intronic	SNX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr15	64425420	64425420	T	C	intronic	SNX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	64425432	64425432	C	T	intronic	SNX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	64444389	64444389	G	T	intronic	SNX22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.554357	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	4	2	2	0
chr15	64445507	64445507	T	C	exonic	SNX22	NaN	nonsynonymous SNV	SNX22:NM_024798:exon4:c.T328C:p.F110L	NaN	NaN	NaN	0.51	T	0.025	B	0.01	B	0.002	N	0.778	D	0.77	N	1.65	T	-1.031	T	0.043	T	0.126	0.953	8.887	3.17	0.373	1.142	7.931	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.923598	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	82	73	9	0
chr15	64446041	64446041	T	T	intronic	SNX22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	19	18	0	0
chr15	64506395	64506395	A	A	intronic	CSNK1G1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	13	10	0	0
chr15	64716263	64716263	A	G	exonic	TRIP4	NaN	synonymous SNV	TRIP4:NM_016213:exon10:c.A1392G:p.R464R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.620176	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	43	40	3	0
chr15	64717545	64717545	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	10	1	5,3	0
chr15	64793617	64793617	A	G	intronic	ZNF609	NaN	NaN	NaN	rs576926	NaN	0.691893	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr15	64970244	64970244	T	T	intronic	ZNF609	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	65111212	65111212	T	T	intronic	PIF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr15	65114488	65114488	C	G	exonic	PIF1	NaN	nonsynonymous SNV	PIF1:NM_001286496:exon4:c.G794C:p.G265A,PIF1:NM_001286497:exon4:c.G794C:p.G265A,PIF1:NM_001286499:exon4:c.G635C:p.G212A,PIF1:NM_025049:exon4:c.G794C:p.G265A	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.999	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	2.08	M	-2.91	D	0.865	D	0.849	D	0.843	4.905	28.3	4.98	2.467	7.395	16.128	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	113	68	45	0
chr15	65114552	65114552	A	G	exonic	PIF1	NaN	nonsynonymous SNV	PIF1:NM_001286496:exon4:c.T730C:p.S244P,PIF1:NM_001286497:exon4:c.T730C:p.S244P,PIF1:NM_001286499:exon4:c.T571C:p.S191P,PIF1:NM_025049:exon4:c.T730C:p.S244P	NaN	NaN	NaN	0.22	T	0.999	D	0.98	D	0.001	D	0.998	D	2.28	M	0.52	T	-0.567	T	0.293	T	0.759	3.748	19.03	5.09	2.043	5.524	9.383	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.744597	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	232	227	5	0
chr15	65140988	65140988	A	C	intronic	PLEKHO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr15	65153650	65153650	G	C	intronic	PLEKHO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.860699	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	168	151	17	0
chr15	65153651	65153651	C	T	intronic	PLEKHO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.156428	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	167	150	17	0
chr15	65153652	65153652	T	C	intronic	PLEKHO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.226894	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	168	151	17	0
chr15	65176648	65176648	C	T	intergenic	PLEKHO2,ANKDD1A	dist=16447;dist=27453	NaN	NaN	rs1916138	NaN	0.365216	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr15	65207931	65207931	T	A	intronic	ANKDD1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr15	65209754	65209754	G	G	intronic	ANKDD1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	80	57	0	0
chr15	65219269	65219269	T	G	intronic	ANKDD1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr15	65219270	65219270	C	A	intronic	ANKDD1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr15	65219271	65219271	A	G	intronic	ANKDD1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr15	65219272	65219272	C	A	intronic	ANKDD1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr15	65251416	65251416	G	G	downstream	ANKDD1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	65266931	65266931	T	A	intronic	SPG21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.225783	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	162	149	13	0
chr15	65298579	65298579	A	A	intronic	MTFMT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	65312597	65312597	A	C	exonic	MTFMT	NaN	nonsynonymous SNV	MTFMT:NM_139242:exon5:c.T659G:p.L220W	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	0.990	D	3.515	H	-1.38	T	0.425	D	0.584	D	0.933	2.444	14.13	5.48	2.076	5.706	14.563	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.203789	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	229	213	16	0
chr15	65319040	65319040	T	A	intronic	MTFMT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.617243	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	153	144	9	0
chr15	65347330	65347330	G	A	exonic	RASL12	NaN	synonymous SNV	RASL12:NM_016563:exon5:c.C708T:p.A236A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.539532	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	255	245	10	0
chr15	65369395	65369395	C	T	exonic	KBTBD13	NaN	nonsynonymous SNV	KBTBD13:NM_001101362:exon1:c.C242T:p.A81V	rs2919358	NaN	0.521765	0.33	T	0.889	P	0.653	P	.	.	0.001	P	0.655	N	-0.29	T	-0.969	T	0.000	T	0.295	4.062	20.9	4.6	2.390	7.251	17.224	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.62579	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	10
chr15	65369531	65369531	G	T	exonic	KBTBD13	NaN	synonymous SNV	KBTBD13:NM_001101362:exon1:c.G378T:p.A126A	rs2946642	NaN	0.501597	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.998813	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	10
chr15	65369947	65369947	G	G	exonic	KBTBD13	NaN	synonymous SNV	KBTBD13:NM_001101362:exon1:c.G794G:p.G265G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	65410829	65410829	T	A	UTR3	PDCD7	NM_005707:c.*226A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	65443330	65443330	T	G	intronic	CLPX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	65443331	65443331	A	G	intronic	CLPX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	65444786	65444786	T	C	exonic	CLPX	NaN	nonsynonymous SNV	CLPX:NM_006660:exon13:c.A1793G:p.K598R	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.309	B	0.055	B	0.000	D	0.995	D	0.55	N	2.19	T	-1.083	T	0.033	T	0.064	2.884	15.61	4.59	0.996	5.991	11.493	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.233486	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	84	76	8	0
chr15	65489674	65489674	G	A	exonic	CILP	NaN	synonymous SNV	CILP:NM_003613:exon9:c.C2950T:p.L984L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	62.5963	0	104.971383	nearby_gap_events	REJECT	368	304	64	0
chr15	65494151	65494151	T	T	intronic	CILP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	65496548	65496548	T	C	intronic	CILP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	28	17	11	0
chr15	65499101	65499101	T	G	intronic	CILP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.17506	nearby_gap_events	REJECT	174	159	15	0
chr15	65517676	65517676	G	A	intergenic	CILP,PARP16	dist=13836;dist=32761	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	65553401	65553401	A	G	intronic	PARP16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr15	65559176	65559176	A	A	intronic	PARP16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	65621441	65621441	C	A	exonic	IGDCC3	NaN	nonsynonymous SNV	IGDCC3:NM_004884:exon14:c.G2251T:p.V751L	rs12907128	ID=COSM434160;OCCURENCE=1(breast)	0.614617	0.39	T	0.005	B	0.001	B	0.912	N	1.000	P	0	N	-0.11	T	-0.963	T	0.000	T	0.113	1.488	10.92	-5.23	-0.789	-0.442	0.439	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	36.7222	0	15.521969	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	15	10	44
chr15	65628287	65628287	C	T	exonic	IGDCC3	NaN	synonymous SNV	IGDCC3:NM_004884:exon3:c.G417A:p.S139S	rs117357415	NaN	0.0153754	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	47.775518	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	49	26	23	3
chr15	65648523	65648523	G	T	intronic	IGDCC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	1	6	0
chr15	65676852	65676852	A	A	intronic	IGDCC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	65684718	65684718	A	C	intronic	IGDCC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr15	65686807	65686807	G	T	exonic	IGDCC4	NaN	synonymous SNV	IGDCC4:NM_020962:exon9:c.C1656A:p.P552P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.19999999999999943	NA	0	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr15	65687395	65687395	T	A	intronic	IGDCC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	16	0	16	0
chr15	65758954	65758954	A	C	intronic	DPP8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	65772474	65772474	A	T	intronic	DPP8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.95168	nearby_gap_events	REJECT	116	105	11	0
chr15	65773965	65773965	G	A	intronic	DPP8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.270962	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	150	139	11	0
chr15	65872006	65872006	A	T	intronic	VWA9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	5	3	0
chr15	65872007	65872007	G	C	intronic	VWA9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr15	65872008	65872008	A	G	intronic	VWA9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr15	65930353	65930353	T	T	intronic	SLC24A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	17	15	0	0
chr15	65935195	65935195	C	G	intronic	SLC24A1	NaN	NaN	NaN	rs12101597	NaN	0.651558	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	17.7084	0	NaN	NA	NA	135	70	65	5
chr15	66010327	66010327	C	T	exonic	DENND4A	NaN	synonymous SNV	DENND4A:NM_001144823:exon13:c.G1596A:p.Q532Q,DENND4A:NM_005848:exon13:c.G1596A:p.Q532Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.489003	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	353	344	9	0
chr15	66162034	66162034	G	A	intronic	RAB11A	NaN	NaN	NaN	rs112864059	NaN	0.0509185	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	92.7901	0	NaN	NA	NA	53	32	21	8
chr15	66170421	66170421	A	G	intronic	RAB11A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	66205081	66205081	A	G	intronic	MEGF11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr15	66262920	66262920	G	A	exonic	MEGF11	NaN	synonymous SNV	MEGF11:NM_032445:exon8:c.C870T:p.C290C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.751189	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	100	92	8	0
chr15	66274387	66274387	C	T	intronic	MEGF11	NaN	NaN	NaN	rs113058811	NaN	0.0139776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	32.2607	19	15.17444	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	7	6	1
chr15	66274847	66274847	A	G	intronic	MEGF11	NaN	NaN	NaN	rs111245450	NaN	0.0191693	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.464245	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	21	18	7
chr15	66299344	66299344	T	C	intronic	MEGF11	NaN	NaN	NaN	rs2253733	NaN	0.682508	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr15	66420818	66420818	A	A	intronic	MEGF11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	66531931	66531931	A	G	intronic	MEGF11	NaN	NaN	NaN	rs12324491	NaN	0.302516	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	66587272	66587272	T	T	intronic	DIS3L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	66607344	66607344	T	G	intronic	DIS3L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr15	66607579	66607579	A	C	intronic	DIS3L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr15	66644521	66644521	C	G	exonic	TIPIN	NaN	nonsynonymous SNV	TIPIN:NM_017858:exon3:c.G158C:p.R53P	rs9806123	NaN	0.983227	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.000	P	-2.045	N	2.81	T	-0.955	T	0.000	T	0.4	-0.919	0.400	4.8	1.145	0.631	14.232	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	377.136444	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	135	0	135	58
chr15	66727637	66727637	A	G	intronic	MAP2K1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	10	1	8	0
chr15	66736877	66736877	A	C	intronic	MAP2K1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	16	9	7	0
chr15	66777323	66777323	T	C	intronic	MAP2K1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	18.5638	0	NaN	NA	NA	182	153	29	1
chr15	66777552	66777552	A	A	intronic	MAP2K1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	66786939	66786939	A	C	intronic	SNAPC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	66790177	66790177	A	A	upstream	MIR4512,SNAPC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	66813579	66813579	A	G	intronic	ZWILCH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	13	8	4	0
chr15	66819605	66819605	T	T	intronic	ZWILCH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	66821174	66821174	G	C	intronic	ZWILCH	NaN	NaN	NaN	rs6494580	NaN	0.927117	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	234.594007	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	80	1	79	57
chr15	66825309	66825309	T	G	intronic	ZWILCH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	13.8754	0	NaN	NA	NA	17	13	4	12
chr15	66832590	66832590	A	A	intronic	ZWILCH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	25	25	0	0
chr15	66840964	66840964	A	A	UTR3	ZWILCH	NM_017975:c.*302A>A,NM_001287823:c.*302A>A,NM_001287822:c.*302A>A,NM_001287821:c.*302A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	8	0	0
chr15	66844251	66844251	T	A	intronic	LCTL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.973166	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	279	264	15	0
chr15	66849715	66849715	T	A	intronic	LCTL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	66850385	66850385	A	G	intronic	LCTL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	32	2	29	0
chr15	66924640	66924640	A	C	ncRNA_intronic	LINC01169	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr15	66960020	66960020	C	C	ncRNA_intronic	LINC01169	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	67140296	67140296	C	T	intergenic	SMAD6,SMAD3	dist=65959;dist=217899	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr15	67140297	67140297	C	T	intergenic	SMAD6,SMAD3	dist=65960;dist=217898	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr15	67142701	67142701	G	T	intergenic	SMAD6,SMAD3	dist=68364;dist=215494	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	67457797	67457797	C	T	intronic	SMAD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr15	67473442	67473442	T	T	intronic	SMAD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr15	67473657	67473657	A	G	exonic	SMAD3	NaN	nonsynonymous SNV	SMAD3:NM_001145104:exon4:c.A152G:p.E51G,SMAD3:NM_001145102:exon6:c.A422G:p.E141G,SMAD3:NM_001145103:exon6:c.A605G:p.E202G,SMAD3:NM_005902:exon6:c.A737G:p.E246G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	3.675	H	-4.71	D	1.091	D	0.969	D	0.925	4.937	28.6	5.1	2.035	9.164	15.177	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.9096	0	NaN	NA	NA	7	4	3	10
chr15	67479868	67479868	A	A	intronic	SMAD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	67547301	67547301	C	A	intronic	AAGAB,IQCH	NaN	NaN	NaN	rs3743347	NaN	0.258187	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	13	6	7	29
chr15	67596522	67596522	G	A	intronic	IQCH	NaN	NaN	NaN	rs138305245	NaN	0.00599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.338711	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	56	25	31	2
chr15	67596813	67596813	A	A	intronic	IQCH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	58	48	0	0
chr15	67636587	67636587	A	A	intronic	IQCH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	67677415	67677415	T	G	intronic	IQCH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	67782446	67782446	T	A	ncRNA_intronic	IQCH-AS1	NaN	NaN	NaN	rs113465629	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.908301	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	8	1	7	0
chr15	67835643	67835643	T	A	UTR5	MAP2K5	NM_002757:c.-31T>A,NM_145160:c.-31T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr15	67957014	67957014	A	T	intronic	MAP2K5	NaN	NaN	NaN	rs62016202	NaN	0.0163738	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.952129	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	1	3	0
chr15	68061845	68061845	T	T	intronic	MAP2K5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	20	16	0	0
chr15	68119344	68119344	T	C	exonic	SKOR1	NaN	nonsynonymous SNV	SKOR1:NM_001258024:exon6:c.T1499C:p.F500S	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.361	B	0.099	B	0.003	N	0.542	D	1.495	L	2.59	T	-1.060	T	0.027	T	0.582	2.927	15.75	2.22	0.482	3.826	6.978	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.2266	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr15	68119771	68119771	C	A	intronic	SKOR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.452686	clustered_read_position	REJECT	2	0	2	0
chr15	68120200	68120200	C	T	exonic	SKOR1	NaN	synonymous SNV	SKOR1:NM_001258024:exon7:c.C1854T:p.T618T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.07399	0	NaN	NA	NA	12	10	2	1
chr15	68121483	68121483	A	C	intronic	SKOR1	NaN	NaN	NaN	rs7183168	NaN	0.764776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	26.4027	0	NaN	NA	NA	23	18	5	42
chr15	68434563	68434563	T	T	intronic	PIAS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	38	27	0	0
chr15	68475892	68475892	T	G	intronic	PIAS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.17397	0	NaN	NA	NA	23	20	3	15
chr15	68497520	68497520	A	G	intronic	CALML4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	78	NaN	NA	NA	64	27	35	0
chr15	68497851	68497851	A	T	UTR5	CALML4	NM_033429:c.-137T>A,NM_001286694:c.-5897T>A,NM_001286695:c.-7926T>A,NM_001031733:c.-137T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr15	68603853	68603853	A	A	intronic	ITGA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	68605993	68605993	T	T	intronic	ITGA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr15	68606094	68606094	G	C	intronic	ITGA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.646757	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	449	424	25	0
chr15	68609100	68609100	G	A	intronic	ITGA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	68618892	68618892	C	G	intronic	ITGA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	96	91	5	0
chr15	68618893	68618893	T	T	intronic	ITGA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	65	NaN	NA	NA	115	107	0	0
chr15	68618894	68618894	G	T	intronic	ITGA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	100	NaN	NA	NA	63	55	8	0
chr15	68623514	68623514	A	A	intronic	ITGA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	68641310	68641310	C	T	intronic	ITGA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	1	3	0
chr15	68649455	68649455	T	T	intronic	ITGA11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	68649587	68649587	G	A	exonic	ITGA11	NaN	synonymous SNV	ITGA11:NM_001004439:exon7:c.C651T:p.N217N	rs12907890	NaN	0.877796	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.103768	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	57
chr15	69007484	69007484	T	C	intronic	CORO2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	69011119	69011119	C	T	exonic	CORO2B	NaN	synonymous SNV	CORO2B:NM_001190456:exon9:c.C1035T:p.I345I,CORO2B:NM_001190457:exon9:c.C1035T:p.I345I,CORO2B:NM_006091:exon9:c.C1050T:p.I350I	rs33913544	NaN	0.125799	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	61.605603	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	10	26	23
chr15	69011140	69011140	G	C	exonic	CORO2B	NaN	synonymous SNV	CORO2B:NM_001190456:exon9:c.G1056C:p.V352V,CORO2B:NM_001190457:exon9:c.G1056C:p.V352V,CORO2B:NM_006091:exon9:c.G1071C:p.V357V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.012629242362287258	NA	0	0	NaN	NA	NA	29	21	8	0
chr15	69075474	69075474	G	A	intronic	ANP32A	NaN	NaN	NaN	rs2290428	NaN	0.132788	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	11.2634	27	NaN	NA	NA	14	11	3	1
chr15	69077032	69077032	C	G	intronic	ANP32A	NaN	NaN	NaN	rs12442034	NaN	0.16873	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	449.487	0	NaN	NA	NA	134	62	72	2
chr15	69238445	69238445	G	A	exonic	SPESP1	NaN	nonsynonymous SNV	SPESP1:NM_145658:exon2:c.G572A:p.G191E	rs3743093	NaN	0.534545	1	T	0.0	B	0.0	B	0.647	N	1.000	P	0	N	2.09	T	-0.925	T	0.000	T	0.012	-1.152	0.101	-0.354	-0.586	0.155	1.066	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	98.824367	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	0	32	45
chr15	69325581	69325581	C	T	exonic	NOX5	NaN	synonymous SNV	NOX5:NM_001184779:exon5:c.C735T:p.C245C,NOX5:NM_001184780:exon5:c.C714T:p.C238C,NOX5:NM_024505:exon5:c.C819T:p.C273C	rs311893	NaN	0.806709	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	95.623863	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	0	33	57
chr15	69340320	69340320	A	A	ncRNA_intronic	MIR548H4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	69393838	69393838	G	G	ncRNA_intronic	MIR548H4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	69553304	69553304	G	C	intronic	GLCE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	69594964	69594964	C	T	intronic	PAQR5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	69682200	69682200	A	G	intronic	PAQR5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	2	5	0
chr15	69713902	69713902	T	T	intronic	KIF23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	69714110	69714110	A	A	intronic	KIF23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr15	69714651	69714651	T	G	intronic	KIF23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.52637	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	155	136	19	0
chr15	69714653	69714653	C	C	intronic	KIF23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	240	213	0	0
chr15	69721592	69721592	A	A	intronic	KIF23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	69728424	69728424	T	T	intronic	KIF23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	69732736	69732736	C	T	exonic	KIF23	NaN	synonymous SNV	KIF23:NM_001281301:exon16:c.C1647T:p.T549T,KIF23:NM_004856:exon17:c.C1977T:p.T659T,KIF23:NM_138555:exon17:c.C1977T:p.T659T	rs937724	NaN	0.766773	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	95.354997	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	1	32	56
chr15	69737397	69737397	C	T	intronic	KIF23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.28066	0	NaN	NA	NA	10	9	2	0
chr15	69740141	69740141	C	G	exonic	KIF23	NaN	nonsynonymous SNV	KIF23:NM_001281301:exon21:c.C2296G:p.P766A,KIF23:NM_004856:exon22:c.C2566G:p.P856A,KIF23:NM_138555:exon23:c.C2878G:p.P960A	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.994	D	0.000	D	0.969	D	0	N	-1.14	T	0.083	D	0.437	T	0.466	3.821	19.40	4.73	2.604	4.026	13.388	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	296	143	153	0
chr15	69745931	69745931	T	C	intronic	RPLP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	69747712	69747712	T	A	intronic	RPLP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.57876	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	137	123	14	0
chr15	69813913	69813913	T	A	intergenic	RPLP1,DRAIC	dist=66029;dist=40146	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr15	70055385	70055385	T	A	intergenic	PCAT29,LINC00593	dist=67294;dist=72188	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	70055395	70055395	C	T	intergenic	PCAT29,LINC00593	dist=67304;dist=72178	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	70055398	70055398	A	T	intergenic	PCAT29,LINC00593	dist=67307;dist=72175	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	70055400	70055400	G	C	intergenic	PCAT29,LINC00593	dist=67309;dist=72173	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	70345748	70345748	G	T	intronic	TLE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.80821	0	NaN	NA	NA	10	9	2	0
chr15	70351172	70351172	G	A	intronic	TLE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.732775	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	146	140	6	0
chr15	70503064	70503064	C	C	intergenic	TLE3,SALRNA3	dist=112808;dist=404822	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	70704824	70704824	G	A	intergenic	TLE3,SALRNA3	dist=314568;dist=203062	NaN	NaN	rs11634522	NaN	0.351837	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr15	70756957	70756957	C	T	intergenic	TLE3,SALRNA3	dist=366701;dist=150929	NaN	NaN	rs4412933	NaN	0.395767	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr15	70787824	70787824	C	C	intergenic	TLE3,SALRNA3	dist=397568;dist=120062	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	70960538	70960538	C	T	exonic	UACA	NaN	nonsynonymous SNV	UACA:NM_001008224:exon16:c.G2446A:p.E816K,UACA:NM_018003:exon16:c.G2485A:p.E829K	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.999	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	2.075	M	-1.05	T	-0.057	T	0.605	D	0.529	3.933	20.1	5.65	2.824	3.588	20.096	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.030909	nearby_gap_events	REJECT	318	292	26	0
chr15	70961705	70961705	C	A	exonic	UACA	NaN	stopgain	UACA:NM_001008224:exon16:c.G1279T:p.E427X,UACA:NM_018003:exon16:c.G1318T:p.E440X	NaN	NaN	NaN	0.1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	6.793	38	5.61	2.641	3.877	12.917	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.917462	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	288	275	13	0
chr15	70961810	70961810	A	G	intronic	UACA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.254075	nearby_gap_events	REJECT	51	42	9	0
chr15	71055726	71055726	G	A	exonic	UACA	NaN	synonymous SNV	UACA:NM_018003:exon1:c.C21T:p.R7R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.269343	clustered_read_position	REJECT	22	17	5	0
chr15	71125093	71125093	G	A	exonic	LARP6	NaN	synonymous SNV	LARP6:NM_001286679:exon3:c.C222T:p.C74C,LARP6:NM_018357:exon3:c.C774T:p.C258C	rs3825970	ID=COSM1374353;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.501597	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	173.833	0	NaN	NA	NA	81	45	36	28
chr15	71125205	71125205	A	G	exonic	LARP6	NaN	nonsynonymous SNV	LARP6:NM_001286679:exon3:c.T110C:p.F37S,LARP6:NM_018357:exon3:c.T662C:p.F221S	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	2.56	M	-0.84	T	0.233	D	0.570	D	0.983	3.259	16.93	4.63	1.947	8.811	12.062	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.560118	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	96	82	14	0
chr15	71143929	71143929	A	C	UTR3	LARP6	NM_197958:c.*49T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	71184728	71184728	G	A	UTR5	THAP10	NM_020147:c.-117C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.674152	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	56	53	3	0
chr15	71433909	71433909	C	A	intronic	THSD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	215	122	83	5
chr15	71433912	71433912	T	A	intronic	THSD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	64	NaN	NA	NA	43	30	13	1
chr15	71433917	71433917	A	T	intronic	THSD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.006971727051137282	NA	0	78	NaN	NA	NA	29	16	13	0
chr15	71433918	71433918	A	T	intronic	THSD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.018116970426431424	NA	0	0	NaN	NA	NA	27	14	13	0
chr15	71486811	71486811	A	T	intronic	THSD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	71486812	71486812	T	C	intronic	THSD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	71486813	71486813	G	T	intronic	THSD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	71499719	71499719	G	A	intronic	THSD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	23	9	14	0
chr15	71535111	71535111	C	A	exonic	THSD4	NaN	synonymous SNV	THSD4:NM_024817:exon4:c.C588A:p.S196S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.903239	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	49	45	4	0
chr15	71535116	71535116	A	T	exonic	THSD4	NaN	nonsynonymous SNV	THSD4:NM_024817:exon4:c.A593T:p.H198L	NaN	NaN	NaN	0.38	T	0.009	B	0.01	B	0.694	N	1.000	N	0.345	N	0.12	T	-1.030	T	0.101	T	0.275	-0.898	0.442	-0.871	-0.308	0.462	8.138	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.081382	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	49	44	5	0
chr15	71651471	71651471	T	C	intronic	THSD4	NaN	NaN	NaN	rs16955492	NaN	0.250998	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr15	72106523	72106523	A	A	UTR3	NR2E3	NM_016346:c.*61A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr15	72142347	72142347	T	C	intronic	MYO9A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	33	13	18	0
chr15	72195524	72195524	T	C	intronic	MYO9A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.309035	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	77	73	4	0
chr15	72197167	72197167	T	G	intronic	MYO9A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr15	72197169	72197169	T	T	intronic	MYO9A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	72283409	72283409	T	G	intronic	MYO9A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr15	72461421	72461421	A	A	intronic	GRAMD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	72491992	72491992	C	G	exonic	PKM	NaN	stoploss	PKM:NM_001206797:exon10:c.G1373C:p.X458S,PKM:NM_001206798:exon11:c.G1550C:p.X517S,PKM:NM_001206799:exon11:c.G1610C:p.X537S,PKM:NM_002654:exon11:c.G1595C:p.X532S,PKM:NM_182470:exon11:c.G1595C:p.X532S,PKM:NM_182471:exon11:c.G1595C:p.X532S,PKM:NM_001206796:exon12:c.G1817C:p.X606S	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.254	16.92	4.6	2.768	3.430	9.997	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.53472	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr15	72493014	72493014	A	G	intronic	PKM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	72499194	72499194	G	C	exonic	PKM	NaN	nonsynonymous SNV	PKM:NM_001206797:exon7:c.C793G:p.R265G,PKM:NM_001206798:exon8:c.C970G:p.R324G,PKM:NM_001206799:exon8:c.C1030G:p.R344G,PKM:NM_002654:exon8:c.C1015G:p.R339G,PKM:NM_182470:exon8:c.C1015G:p.R339G,PKM:NM_182471:exon8:c.C1015G:p.R339G,PKM:NM_001206796:exon9:c.C1237G:p.R413G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.992	D	0.000	D	1.000	D	4.365	H	-6.03	D	0.960	D	0.991	D	0.966	4.140	21.4	5.23	2.596	5.251	19.159	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.850107	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	364	344	20	0
chr15	72533965	72533965	A	A	intronic	PARP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	72533967	72533967	C	C	intronic	PARP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	72533968	72533968	T	T	intronic	PARP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	72533971	72533971	A	A	intronic	PARP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	72543623	72543623	A	G	intronic	PARP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.056622	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	120	112	8	0
chr15	72545876	72545876	T	C	intronic	PARP6	NaN	NaN	NaN	rs1426166	NaN	0.999002	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	380.977124	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	140	3	137	58
chr15	72550550	72550550	T	T	intronic	PARP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	51	38	0	0
chr15	72553069	72553069	T	A	intronic	PARP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.724345	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	290	272	18	0
chr15	72582099	72582099	T	T	exonic	CELF6	NaN	synonymous SNV	CELF6:NM_001172685:exon5:c.A271A:p.S91S,CELF6:NM_001172684:exon6:c.A616A:p.S206S,CELF6:NM_052840:exon6:c.A616A:p.S206S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr15	72582650	72582650	A	A	intronic	CELF6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	72638818	72638818	T	C	intronic	HEXA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.934432	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	120	105	15	0
chr15	72646170	72646170	A	C	intronic	HEXA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	72874548	72874548	T	G	intronic	ARIH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.949861	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	138	117	21	0
chr15	73021905	73021905	T	T	intronic	BBS4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr15	73024081	73024081	A	A	intronic	BBS4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	7	0	0
chr15	73067234	73067234	T	C	exonic	ADPGK	NaN	synonymous SNV	ADPGK:NM_031284:exon2:c.A438G:p.A146A	rs11634630	NaN	0.960064	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2780.49	0	NaN	NA	NA	247	0	247	39
chr15	73428249	73428249	T	T	exonic	NEO1	NaN	synonymous SNV	NEO1:NM_001172623:exon5:c.T896T:p.L299L,NEO1:NM_001172624:exon5:c.T896T:p.L299L,NEO1:NM_002499:exon5:c.T896T:p.L299L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr15	73541513	73541513	A	G	exonic	NEO1	NaN	synonymous SNV	NEO1:NM_001172623:exon10:c.A1719G:p.K573K,NEO1:NM_001172624:exon10:c.A1719G:p.K573K,NEO1:NM_002499:exon10:c.A1719G:p.K573K	rs3736510	NaN	0.350439	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.309844	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	62	38	24	45
chr15	73545899	73545899	G	A	intronic	NEO1	NaN	NaN	NaN	rs77570871	NaN	0.0217652	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	5	2	2
chr15	73552820	73552820	G	C	intronic	NEO1	NaN	NaN	NaN	rs138542823	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	73552825	73552825	G	T	intronic	NEO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	73552829	73552829	G	C	intronic	NEO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	73552831	73552831	T	C	intronic	NEO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	73558646	73558646	T	C	intronic	NEO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.020430107526881215	NA	0	0	12.551267	nearby_gap_events	REJECT	29	21	8	0
chr15	73562532	73562532	C	T	exonic	NEO1	NaN	synonymous SNV	NEO1:NM_001172623:exon17:c.C2676T:p.T892T,NEO1:NM_001172624:exon17:c.C2676T:p.T892T,NEO1:NM_002499:exon17:c.C2676T:p.T892T	rs2680348	NaN	0.0764776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	39.714373	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	21	19	9
chr15	73566941	73566941	AG	AA,AT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1133.8	0	NaN	NA	NA	118	0	77	7
chr15	73566942	73566942	G	A	intronic	NEO1	NaN	NaN	NaN	rs497539	NaN	0.850639	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	60	0	60	16
chr15	73613307	73613307	C	G	UTR3	HCN4	NM_005477:c.*1515G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr15	73614997	73614997	G	T	exonic	HCN4	NaN	nonsynonymous SNV	HCN4:NM_005477:exon8:c.C3437A:p.P1146H	NaN	NaN	NaN	0	D	0.005	B	0.003	B	.	.	1.000	N	1.1	L	-6.04	D	0.881	D	0.920	D	0.226	0.604	7.253	1.39	0.125	5.638	7.744	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.260905	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	35	30	5	0
chr15	73624401	73624401	C	T	intronic	HCN4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	19	13	6	0
chr15	73832966	73832966	A	G	intronic	REC114	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr15	73889312	73889312	T	T	intronic	NPTN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr15	73889420	73889420	T	C	exonic	NPTN	NaN	nonsynonymous SNV	NPTN:NM_001161363:exon2:c.A382G:p.R128G,NPTN:NM_012428:exon2:c.A382G:p.R128G	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.425	B	0.252	B	0.000	D	1.000	D	1.625	L	0.11	T	-0.665	T	0.225	T	0.763	2.098	12.97	4.84	2.164	6.152	14.888	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.471275	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	213	206	7	0
chr15	74003462	74003462	T	C	intronic	CD276	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.799014	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	134	122	12	0
chr15	74003464	74003464	C	T	intronic	CD276	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.779369	nearby_gap_events	REJECT	141	131	10	0
chr15	74003465	74003465	T	C	intronic	CD276	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.652834	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	132	121	11	0
chr15	74033158	74033158	A	A	intronic	C15orf59	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	74043374	74043374	A	A	exonic	C15orf59	NaN	synonymous SNV	C15orf59:NM_001039614:exon1:c.T98T:p.I33I,C15orf59:NM_001303254:exon2:c.T14T:p.I5I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	53	49	0	0
chr15	74043461	74043461	C	G	exonic	C15orf59	NaN	nonsynonymous SNV	C15orf59:NM_001039614:exon1:c.G11C:p.R4P	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.852	P	0.457	P	0.001	N	0.763	D	0	N	.	.	-0.869	T	0.083	T	0.699	4.300	22.5	3.91	1.023	4.012	11.941	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.15415019762845888	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	11	4	0
chr15	74043523	74043523	A	G	UTR5	C15orf59	NM_001039614:c.-52T>C	NaN	NaN	rs7497362	NaN	0.745807	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	181.690125	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	0	60	38
chr15	74122061	74122061	G	A	intergenic	C15orf59-AS1,TBC1D21	dist=59918;dist=43866	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	74173689	74173689	A	C	intronic	TBC1D21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr15	74173690	74173690	A	G	intronic	TBC1D21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr15	74176419	74176419	G	C	intronic	TBC1D21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	74176421	74176421	T	A	intronic	TBC1D21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	74178545	74178545	C	T	intronic	TBC1D21	NaN	NaN	NaN	rs2278863	NaN	0.0267572	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	101.916	0	NaN	NA	NA	87	55	32	1
chr15	74178580	74178580	A	A	intronic	TBC1D21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	74180867	74180867	A	A	intronic	TBC1D21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr15	74186898	74186898	A	T	intergenic	TBC1D21,LOXL1-AS1	dist=5342;dist=22911	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	74241996	74241996	A	G	intronic	LOXL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	0	4	0
chr15	74244277	74244277	AC	A,AG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	260.044	0	NaN	NA	NA	29	0	10	3
chr15	74244344	74244344	C	T	UTR3	LOXL1	NM_005576:c.*166C>T	NaN	NaN	rs3522	NaN	0.560503	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.846794	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	14	17	37
chr15	74276367	74276367	G	A	exonic	STOML1	NaN	synonymous SNV	STOML1:NM_001256673:exon6:c.C958T:p.L320L,STOML1:NM_001256674:exon6:c.C955T:p.L319L,STOML1:NM_001256675:exon6:c.C895T:p.L299L,STOML1:NM_001256672:exon7:c.C1105T:p.L369L,STOML1:NM_001256676:exon7:c.C844T:p.L282L,STOML1:NM_004809:exon7:c.C1108T:p.L370L,STOML1:NM_001256677:exon8:c.C979T:p.L327L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.821992	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	304	261	43	0
chr15	74282862	74282862	G	A	intronic	STOML1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	74284406	74284406	C	G	intronic	STOML1	NaN	NaN	NaN	rs2304715	NaN	0.498602	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	60.423765	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	0	24	26
chr15	74290541	74290541	T	C	exonic	PML	NaN	nonsynonymous SNV	PML:NM_002675:exon2:c.T326C:p.F109S,PML:NM_033238:exon2:c.T326C:p.F109S,PML:NM_033239:exon2:c.T326C:p.F109S,PML:NM_033240:exon2:c.T326C:p.F109S,PML:NM_033244:exon2:c.T326C:p.F109S,PML:NM_033246:exon2:c.T326C:p.F109S,PML:NM_033247:exon2:c.T326C:p.F109S,PML:NM_033249:exon2:c.T326C:p.F109S,PML:NM_033250:exon2:c.T326C:p.F109S	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	0.971	D	1.635	L	0.78	T	-0.608	T	0.233	T	0.914	3.285	17.03	4.78	1.793	2.931	11.672	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.341605	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	45	37	8	0
chr15	74317131	74317131	T	T	intronic	PML	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	74328116	74328116	A	G	exonic	PML	NaN	nonsynonymous SNV	PML:NM_033250:exon7:c.A2170G:p.S724G,PML:NM_033239:exon8:c.A2314G:p.S772G	rs743580	NaN	0.551917	1	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	.	.	.	.	-0.930	T	0.000	T	0.015	-1.858	0.009	0.623	-0.085	0.137	2.442	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.360716	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	22	20	40
chr15	74336633	74336633	T	C	exonic	PML	NaN	nonsynonymous SNV	PML:NM_033238:exon9:c.T1933C:p.F645L	rs5742915	NaN	0.192292	1	T	0.001	B	0.001	B	0.079	U	0.943	P	0	N	1.01	T	-0.978	T	0.000	T	0.122	-0.095	3.535	-3.26	-0.543	-0.220	5.601	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	79.858293	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	16	30	37
chr15	74364655	74364655	A	G	intronic	GOLGA6A	NaN	NaN	NaN	rs2932678	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.04407413653017821	NA	0	0	16.326129	alt_allele_in_normal,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	29	19	10	0
chr15	74426229	74426229	A	A	exonic	ISLR2	NaN	synonymous SNV	ISLR2:NM_020851:exon3:c.A1134A:p.P378P,ISLR2:NM_001130136:exon4:c.A1134A:p.P378P,ISLR2:NM_001130137:exon4:c.A1134A:p.P378P,ISLR2:NM_001130138:exon4:c.A1134A:p.P378P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	71	NaN	NA	NA	90	81	0	0
chr15	74427270	74427270	G	T	exonic	ISLR2	NaN	synonymous SNV	ISLR2:NM_020851:exon3:c.G2175T:p.L725L,ISLR2:NM_001130136:exon4:c.G2175T:p.L725L,ISLR2:NM_001130137:exon4:c.G2175T:p.L725L,ISLR2:NM_001130138:exon4:c.G2175T:p.L725L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	15	15.741321	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	30	21	9	0
chr15	74467856	74467856	G	A	exonic	ISLR	NaN	synonymous SNV	ISLR:NM_005545:exon2:c.G657A:p.T219T,ISLR:NM_201526:exon2:c.G657A:p.T219T	rs1052622	ID=COSM1162175;OCCURENCE=1(pancreas)	0.585663	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	151.173539	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	49	0	49	55
chr15	74468406	74468406	G	A	exonic	ISLR	NaN	nonsynonymous SNV	ISLR:NM_005545:exon2:c.G1207A:p.G403R,ISLR:NM_201526:exon2:c.G1207A:p.G403R	NaN	NaN	NaN	0.98	T	0.802	P	0.481	P	.	.	1.000	N	0.695	N	-0.39	T	-0.957	T	0.175	T	0.294	2.596	14.64	3.16	2.047	0.726	12.830	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	62.6398	0	NaN	NA	NA	23	13	10	9
chr15	74474617	74474617	G	T	intronic	STRA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.732222	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	169	158	11	0
chr15	74476170	74476170	T	C	intronic	STRA6	NaN	NaN	NaN	rs74365804	NaN	0.00299521	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	103.909	0	40.352289	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	54	31	23	1
chr15	74481234	74481234	G	A	intronic	STRA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr15	74483043	74483043	T	T	intronic	STRA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	74500021	74500021	A	G	intronic	STRA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	61	36	25	1
chr15	74528985	74528985	T	G	UTR5	CCDC33	NM_025055:c.-76T>G	NaN	NaN	rs351175	NaN	0.564696	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	154.806615	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	1	52	53
chr15	74548811	74548811	G	C	intronic	CCDC33	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	74548813	74548813	T	G	intronic	CCDC33	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	74622457	74622457	A	C	intronic	CCDC33	NaN	NaN	NaN	rs2277602	NaN	0.506989	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	138.734166	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	1	51	52
chr15	74710072	74710072	A	A	intronic	SEMA7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	74710465	74710465	G	T	intronic	SEMA7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	74743054	74743054	T	G	intronic	UBL7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	74749077	74749077	A	A	intronic	UBL7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	74750978	74750978	C	A,CAAA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	309.445	61	NaN	NA	NA	160	80	19	0
chr15	74751300	74751300	A	A	intronic	UBL7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	74911718	74911718	A	G	intronic	CLK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	19	9	9	0
chr15	74912232	74912232	T	T	intronic	CLK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr15	74920297	74920297	A	C	intronic	CLK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.158163	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	180	170	10	0
chr15	74932751	74932751	G	A	intronic	EDC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	75047009	75047009	T	T	intronic	CYP1A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	75111197	75111197	A	A	intronic	LMAN1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	75112934	75112934	T	T	intronic	LMAN1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	75115800	75115800	A	A	intronic	LMAN1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr15	75116121	75116121	C	C	intronic	LMAN1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	75119212	75119212	A	G	intronic	CPLX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.666199		KEEP	79	73	6	0
chr15	75122604	75122604	T	C	exonic	CPLX3	NaN	nonsynonymous SNV	CPLX3:NM_001030005:exon3:c.T386C:p.L129P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.939	P	0.845	P	0.000	U	1.000	D	0.975	L	.	.	-0.576	T	0.249	T	0.734	4.503	24.2	5.38	2.045	7.665	14.571	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.190072	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	198	189	9	0
chr15	75130573	75130573	A	G	intronic	ULK3	NaN	NaN	NaN	rs2290572	NaN	0.461262	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	100.611	0	NaN	NA	NA	40	21	19	24
chr15	75130949	75130949	G	T	intronic	ULK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.38181818181818256	NA	0	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr15	75131838	75131838	A	G	intronic	ULK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.46137	0	NaN	NA	NA	13	11	2	0
chr15	75146944	75146944	G	A	exonic	SCAMP2	NaN	nonsynonymous SNV	SCAMP2:NM_005697:exon2:c.C104T:p.A35V	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.53	P	0.067	B	0.005	N	0.624	N	0.695	N	2.5	T	-1.083	T	0.022	T	0.252	3.804	19.31	4.85	2.756	5.666	11.881	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.062391	nearby_gap_events	REJECT	81	74	7	0
chr15	75165295	75165295	A	T	intronic	SCAMP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr15	75185187	75185187	A	A	intronic	MPI	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	75188674	75188674	A	A	intronic	MPI	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	75309000	75309000	C	T	exonic	SCAMP5	NaN	nonsynonymous SNV	SCAMP5:NM_138967:exon4:c.C203T:p.A68V,SCAMP5:NM_001178111:exon5:c.C203T:p.A68V,SCAMP5:NM_001178112:exon5:c.C203T:p.A68V	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.165	B	0.129	B	0.000	D	1.000	D	0.35	N	2.29	T	-1.056	T	0.033	T	0.715	4.408	23.4	4.84	2.391	4.830	17.294	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.848186		KEEP	57	49	8	0
chr15	75310923	75310923	A	C	intronic	SCAMP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	11	6	4	0
chr15	75320572	75320572	C	C	intronic	PPCDC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	75335419	75335419	G	C	intronic	PPCDC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	75335945	75335945	A	A	intronic	PPCDC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	75501197	75501197	A	A	intronic	C15orf39	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	75503147	75503147	G	A	exonic	C15orf39	NaN	nonsynonymous SNV	C15orf39:NM_015492:exon3:c.G2834A:p.G945D	rs3743211	NaN	0.946885	1	T	0.017	B	0.019	B	0.660	N	0.000	P	-0.805	N	2.44	T	-0.988	T	0.000	T	0.067	-1.826	0.009	3.07	0.247	0.204	3.451	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	130.69883	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	44	0	44	58
chr15	75507163	75507163	C	C	intergenic	C15orf39,GOLGA6C	dist=2653;dist=43736	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	75526750	75526750	C	A	intergenic	C15orf39,GOLGA6C	dist=22240;dist=24149	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	75632156	75632156	G	C	exonic	COMMD4	NaN	nonsynonymous SNV	COMMD4:NM_017828:exon7:c.G496C:p.G166R	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.001	B	0.004	B	0.367	N	1.000	D	0.97	L	2.89	T	-1.076	T	0.025	T	0.275	1.681	11.58	4.91	2.286	4.683	11.903	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.060207991242473675	NA	0	0	NaN	NA	NA	12	9	3	0
chr15	75646020	75646020	T	C	ncRNA_exonic	MIR631	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	69	NaN	NA	NA	10	0	10	0
chr15	75648427	75648427	C	G	intronic	MAN2C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.167718	nearby_gap_events	REJECT	36	30	6	0
chr15	75649299	75649299	A	A	intronic	MAN2C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	75650972	75650972	G	A	intronic	MAN2C1	NaN	NaN	NaN	rs3809549	NaN	0.396366	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	163.006716	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	55	0	55	44
chr15	75651020	75651020	TCC	TC,TCCCCACATGCTGCCCAGCCCATA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	213.086	0	NaN	NA	NA	42	6	6	2
chr15	75651727	75651727	G	A	exonic	MAN2C1	NaN	nonsynonymous SNV	MAN2C1:NM_001256496:exon15:c.C1691T:p.P564L,MAN2C1:NM_001256495:exon17:c.C1988T:p.P663L,MAN2C1:NM_006715:exon17:c.C1988T:p.P663L	NaN	NaN	NaN	0.38	T	0.279	B	0.051	B	0.001	N	1.000	D	0.805	L	-1.17	T	-0.704	T	0.245	T	.	1.996	12.63	4.56	2.235	4.378	12.334	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.65667	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	158	147	11	0
chr15	75651784	75651784	G	A	intronic	MAN2C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.841928	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	158	152	6	0
chr15	75651905	75651905	T	C	intronic	MAN2C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	16	6	6	0
chr15	75653378	75653378	T	C	intronic	MAN2C1	NaN	NaN	NaN	rs7174408	NaN	0.995008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	67.534199	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	0	30	57
chr15	75656552	75656552	A	A	intronic	MAN2C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	75658867	75658867	G	G	exonic	MAN2C1	NaN	synonymous SNV	MAN2C1:NM_001256494:exon4:c.C418C:p.R140R,MAN2C1:NM_001256495:exon4:c.C418C:p.R140R,MAN2C1:NM_001256496:exon4:c.C418C:p.R140R,MAN2C1:NM_006715:exon4:c.C418C:p.R140R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	150	146	0	0
chr15	75658989	75658989	A	A	intronic	MAN2C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	75672897	75672897	T	T	intronic	SIN3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr15	75684884	75684884	T	G	exonic	SIN3A	NaN	synonymous SNV	SIN3A:NM_001145357:exon15:c.A2550C:p.A850A,SIN3A:NM_001145358:exon15:c.A2550C:p.A850A,SIN3A:NM_015477:exon15:c.A2550C:p.A850A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	68	42	26	0
chr15	75705399	75705399	A	C	intronic	SIN3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.766746	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	400	387	13	0
chr15	75714934	75714934	G	C	intronic	SIN3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	75761099	75761099	T	T	UTR3	PTPN9	NM_002833:c.*11A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr15	75913400	75913400	A	A	intronic	SNUPN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr15	75982227	75982227	T	G	exonic	CSPG4	NaN	synonymous SNV	CSPG4:NM_001897:exon3:c.A1179C:p.G393G	rs78884605	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	93.063	0	NaN	NA	NA	69	45	24	13
chr15	75982428	75982428	C	T	exonic	CSPG4	NaN	synonymous SNV	CSPG4:NM_001897:exon3:c.G978A:p.G326G	rs7182906	ID=COSM434332;OCCURENCE=1(breast)	0.284145	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	211	86	125	32
chr15	76013727	76013727	G	G	intergenic	CSPG4,ODF3L1	dist=8538;dist=2592	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr15	76017367	76017367	T	T	intronic	ODF3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	76018287	76018287	C	C	intronic	ODF3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr15	76018288	76018288	C	C	intronic	ODF3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr15	76018289	76018289	C	G	intronic	ODF3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	4	2	0
chr15	76019266	76019266	T	G	intronic	ODF3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	76019267	76019267	T	C	intronic	ODF3L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr15	76130381	76130381	A	A	intergenic	MIR4313,UBE2Q2	dist=75725;dist=5246	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	76146964	76146964	T	G	intronic	UBE2Q2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.31779	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	105	98	7	0
chr15	76191802	76191802	G	A	UTR3	UBE2Q2	NM_173469:c.*3G>A,NM_001284382:c.*3G>A,NM_001145335:c.*3G>A	NaN	NaN	rs335689	NaN	0.980431	0	D	0.002	B	0.01	B	.	.	1.000	P	.	.	.	.	-1.016	T	0.000	T	0.217	1.181	9.801	-3.2	-0.481	-0.368	4.443	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	101.055	0	NaN	NA	NA	119	0	119	20
chr15	76196776	76196776	T	T	intronic	FBXO22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr15	76206659	76206659	A	A	intronic	FBXO22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	30	26	0	0
chr15	76518346	76518346	C	A,CCCTTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	980.764	0	NaN	NA	NA	111	0	7	22
chr15	76630055	76630055	T	T	intronic	ISL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	76630570	76630570	A	G	intronic	ISL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.582197	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	139	133	6	0
chr15	76764263	76764263	G	C	intronic	SCAPER	NaN	NaN	NaN	rs11857327	NaN	0.355631	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr15	76957958	76957958	A	G	intronic	SCAPER	NaN	NaN	NaN	rs280021	NaN	0.966853	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	113.867933	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	1	41	52
chr15	77025545	77025545	T	T	intronic	SCAPER	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr15	77059180	77059180	T	T	intronic	SCAPER	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr15	77064401	77064401	G	G	intronic	SCAPER	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	10	0	0
chr15	77176158	77176158	T	C	exonic	SCAPER	NaN	nonsynonymous SNV	SCAPER:NM_020843:exon1:c.A1G:p.M1V	rs3812908	NaN	0.417732	0.16	T	0.811	P	0.828	P	.	.	0.000	P	.	.	2.03	T	-0.862	T	0.000	T	0.533	1.116	9.550	3.87	1.990	2.645	9.374	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	71.6281	0	NaN	NA	NA	83	45	38	13
chr15	77239740	77239740	T	C	intronic	RCN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.038169	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	450	432	18	0
chr15	77310281	77310281	A	T	intronic	PSTPIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	77310636	77310636	G	C	intronic	PSTPIP1	NaN	NaN	NaN	rs3812911	NaN	0.60603	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3679.09	0	NaN	NA	NA	383	0	383	54
chr15	77314485	77314485	A	G	intronic	PSTPIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	77322977	77322977	A	A	intronic	PSTPIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	77348712	77348712	A	A	intronic	TSPAN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr15	77425506	77425506	T	C	exonic	PEAK1	NaN	synonymous SNV	PEAK1:NM_024776:exon7:c.A3918G:p.E1306E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.608917	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	94	89	5	0
chr15	77663894	77663894	C	C	intronic	PEAK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr15	77759295	77759295	G	A	intronic	HMG20A	NaN	NaN	NaN	rs2055901	NaN	0.524561	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.6781	0	NaN	NA	NA	93	46	47	11
chr15	77763399	77763399	A	C	intronic	HMG20A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.2667	0	NaN	NA	NA	14	11	3	1
chr15	77906677	77906677	C	C	exonic	LINGO1	NaN	synonymous SNV	LINGO1:NM_032808:exon2:c.G1572G:p.Q524Q,LINGO1:NM_001301198:exon3:c.G1554G:p.Q518Q,LINGO1:NM_001301194:exon4:c.G1554G:p.Q518Q,LINGO1:NM_001301195:exon4:c.G1554G:p.Q518Q,LINGO1:NM_001301197:exon4:c.G1554G:p.Q518Q,LINGO1:NM_001301199:exon4:c.G1554G:p.Q518Q,LINGO1:NM_001301200:exon4:c.G1554G:p.Q518Q,LINGO1:NM_001301192:exon5:c.G1554G:p.Q518Q,LINGO1:NM_001301186:exon6:c.G1554G:p.Q518Q,LINGO1:NM_001301187:exon6:c.G1554G:p.Q518Q,LINGO1:NM_001301189:exon6:c.G1554G:p.Q518Q,LINGO1:NM_001301191:exon6:c.G1554G:p.Q518Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	79	65	0	0
chr15	77907775	77907775	T	C	exonic	LINGO1	NaN	synonymous SNV	LINGO1:NM_032808:exon2:c.A474G:p.L158L,LINGO1:NM_001301198:exon3:c.A456G:p.L152L,LINGO1:NM_001301194:exon4:c.A456G:p.L152L,LINGO1:NM_001301195:exon4:c.A456G:p.L152L,LINGO1:NM_001301197:exon4:c.A456G:p.L152L,LINGO1:NM_001301199:exon4:c.A456G:p.L152L,LINGO1:NM_001301200:exon4:c.A456G:p.L152L,LINGO1:NM_001301192:exon5:c.A456G:p.L152L,LINGO1:NM_001301186:exon6:c.A456G:p.L152L,LINGO1:NM_001301187:exon6:c.A456G:p.L152L,LINGO1:NM_001301189:exon6:c.A456G:p.L152L,LINGO1:NM_001301191:exon6:c.A456G:p.L152L	rs2271397	NaN	0.724042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	473.734891	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	158	0	158	53
chr15	78102095	78102095	A	G	intronic	LINGO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	78191832	78191832	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	11	1	4,6	0
chr15	78280979	78280979	G	A	intergenic	LOC645752,LOC91450	dist=61791;dist=4596	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr15	78386619	78386619	A	A	intronic	SH2D7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	78390909	78390909	C	T	exonic	SH2D7	NaN	nonsynonymous SNV	SH2D7:NM_001101404:exon4:c.C616T:p.R206W	rs12593575	NaN	0.226038	0.21	T	0.0	B	0.0	B	0.014	N	1.000	P	-0.145	N	1.76	T	-1.042	T	0.000	T	0.083	1.300	10.26	-8.17	-2.516	-5.350	1.622	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	65.10132	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	54	25	29	15
chr15	78423433	78423433	G	A	intronic	CIB2	NaN	NaN	NaN	rs112308337	NaN	0.071885	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	78423479	78423479	T	C	intronic	CIB2	NaN	NaN	NaN	rs8040395	NaN	0.41254	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	78454756	78454756	A	A	intronic	IDH3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	78456306	78456306	A	A	intronic	IDH3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr15	78456307	78456307	T	C	intronic	IDH3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	78456308	78456308	T	A	intronic	IDH3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	78471110	78471110	G	A	exonic	ACSBG1	NaN	synonymous SNV	ACSBG1:NM_001199377:exon11:c.C1536T:p.G512G,ACSBG1:NM_015162:exon11:c.C1548T:p.G516G	rs17850484	NaN	0.0886581	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	103.967859	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	91	48	43	7
chr15	78474766	78474766	A	C	intronic	ACSBG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.526165	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	53	48	5	0
chr15	78475136	78475136	A	A	intronic	ACSBG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	11	8	0	0
chr15	78484648	78484648	C	A	intronic	ACSBG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	78485849	78485849	T	C	exonic	ACSBG1	NaN	nonsynonymous SNV	ACSBG1:NM_001199377:exon5:c.A650G:p.K217R,ACSBG1:NM_015162:exon5:c.A662G:p.K221R	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.902	P	0.716	P	0.002	N	1.000	D	0.735	N	0.93	T	-1.053	T	0.106	T	0.156	3.262	16.95	3.3	1.663	5.288	9.362	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0016978688488029424	NA	0	0	NaN	NA	NA	109	87	22	0
chr15	78537327	78537327	A	C	intergenic	ACSBG1,DNAJA4	dist=10278;dist=19160	NaN	NaN	rs11854210	NaN	0.141973	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	63	34	29	0
chr15	78556571	78556571	G	A	UTR5	DNAJA4	NM_018602:c.-85G>A	NaN	NaN	rs62007805	NaN	0.320887	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	51.8883	23	NaN	NA	NA	33	20	13	29
chr15	78556580	78556580	GGGGGCGGCCTC	G,GGGGGCGGCGTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	209.651	0	NaN	NA	NA	21	0	5	6
chr15	78565478	78565478	C	T	exonic	DNAJA4	NaN	synonymous SNV	DNAJA4:NM_001130182:exon3:c.C355T:p.L119L,DNAJA4:NM_001130183:exon3:c.C274T:p.L92L,DNAJA4:NM_018602:exon4:c.C442T:p.L148L	rs7163689	NaN	0.432708	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.278536	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	28	15	40
chr15	78567987	78567987	T	C	exonic	DNAJA4	NaN	nonsynonymous SNV	DNAJA4:NM_001130182:exon5:c.T794C:p.I265T,DNAJA4:NM_001130183:exon5:c.T713C:p.I238T,DNAJA4:NM_018602:exon6:c.T881C:p.I294T	NaN	NaN	NaN	0	D	0.996	D	0.978	D	0.000	D	1.000	D	3.545	H	0.14	T	0.233	D	0.498	T	0.864	4.490	24.1	5.63	2.145	7.874	15.051	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.598635	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	115	110	5	0
chr15	78577747	78577747	A	A	intronic	WDR61	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	17	16	0	0
chr15	78582252	78582252	T	T	intronic	WDR61	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr15	78584946	78584946	T	T	intronic	WDR61	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr15	78605511	78605511	G	C	intergenic	WDR61,CRABP1	dist=13443;dist=27155	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	78730591	78730591	C	T	UTR5	IREB2	NM_004136:c.-89C>T	NaN	NaN	rs954144	NaN	0.344249	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	109.072	0	35.094039	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	0	12	37
chr15	78764264	78764264	G	G	exonic	IREB2	NaN	synonymous SNV	IREB2:NM_004136:exon7:c.G881G:p.W294W	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	203	156	0	0
chr15	78789488	78789488	C	T	exonic	IREB2	NaN	synonymous SNV	IREB2:NM_004136:exon21:c.C2616T:p.A872A	rs13180	NaN	0.43111	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.437426	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	0	25	46
chr15	78826008	78826008	T	C	exonic	HYKK	NaN	nonsynonymous SNV	HYKK:NM_001013619:exon5:c.T1118C:p.M373T	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.067	B	0.011	B	0.486	N	1.000	D	1.1	L	.	.	-0.993	T	0.174	T	0.322	1.856	12.16	4.91	2.147	0.689	11.510	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.606018	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	79	72	7	0
chr15	78909517	78909517	A	G	intronic	CHRNA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	17	4	13	0
chr15	78917233	78917233	A	G	UTR3	CHRNB4	NM_000750:c.*242T>C,NM_001256567:c.*64T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.475352	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	60	57	3	0
chr15	79056240	79056240	T	C	intronic	ADAMTS7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.0807	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	88	78	10	0
chr15	79065380	79065380	T	C	intronic	ADAMTS7	NaN	NaN	NaN	rs7177201	NaN	0.471246	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	101.079	0	55.638682	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	0	21	51
chr15	79065384	79065384	G	A	intronic	ADAMTS7	NaN	NaN	NaN	rs28577997	NaN	0.276957	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	101.079	0	54.598404	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	1	19	22
chr15	79065394	79065394	T	C	intronic	ADAMTS7	NaN	NaN	NaN	rs3743061	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	101.079	0	57.612577	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	0	20	23
chr15	79088772	79088772	C	C	intronic	ADAMTS7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	27	24	0	0
chr15	79089139	79089139	A	A	intronic	ADAMTS7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	79178452	79178452	T	G	intronic	MORF4L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	90	75	15	0
chr15	79178453	79178453	G	T	intronic	MORF4L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	67	NaN	NA	NA	101	86	15	0
chr15	79179750	79179750	A	C	intronic	MORF4L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	13	9	4	0
chr15	79179751	79179751	T	A	intronic	MORF4L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr15	79179752	79179752	T	C	intronic	MORF4L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr15	79179753	79179753	G	A	intronic	MORF4L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr15	79179754	79179754	T	C	intronic	MORF4L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr15	79179757	79179757	G	T	intronic	MORF4L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr15	79183310	79183310	C	T	intronic	MORF4L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.968176	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	193	169	24	0
chr15	79214390	79214390	T	T	UTR3	CTSH	NM_004390:c.*82A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	79214507	79214507	C	A	exonic	CTSH	NaN	nonsynonymous SNV	CTSH:NM_004390:exon12:c.G973T:p.A325S	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.807	P	0.774	P	0.000	D	1.000	D	1.93	M	-2.29	D	0.457	D	0.692	D	0.573	4.072	20.9	4.57	2.376	6.111	12.720	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.02466	0	NaN	NA	NA	21	18	3	2
chr15	79215356	79215356	C	A	exonic	CTSH	NaN	nonsynonymous SNV	CTSH:NM_004390:exon11:c.G911T:p.G304V	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	4.23	H	0.42	T	0.291	D	0.499	T	0.981	4.005	20.5	4.75	2.479	6.265	13.104	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	28	20	8	0
chr15	79221928	79221928	A	C	intronic	CTSH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr15	79227271	79227271	T	T	intronic	CTSH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr15	79229817	79229817	A	A	intronic	CTSH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr15	79237293	79237293	C	T	exonic	CTSH	NaN	nonsynonymous SNV	CTSH:NM_004390:exon1:c.G31A:p.G11R	rs2289702	NaN	0.076877	0.31	T	0.999	D	0.934	D	0.000	U	0.998	P	0.55	N	-0.62	T	-0.801	T	0.013	T	0.329	0.611	7.291	3.12	2.040	0.281	9.956	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	382.559	0	NaN	NA	NA	61	15	46	8
chr15	79288573	79288573	C	C	intronic	RASGRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	36	33	0	0
chr15	79290623	79290623	A	A	intronic	RASGRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr15	79320022	79320022	T	C	intronic	RASGRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.451565	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	206	198	8	0
chr15	79324396	79324396	C	C	intronic	RASGRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	17	15	0	0
chr15	79324397	79324397	A	A	intronic	RASGRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	17	15	0	0
chr15	79324419	79324419	A	G	intronic	RASGRF1	NaN	NaN	NaN	rs2304991	NaN	0.682508	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	27	22.352654	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	9	10	49
chr15	79341631	79341631	T	C	intronic	RASGRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	10	3	5	0
chr15	79342047	79342047	A	C	intronic	RASGRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	20	5	15	0
chr15	79350840	79350840	A	G	intronic	RASGRF1	NaN	NaN	NaN	rs3816282	NaN	0.136781	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	115.972612	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	101	53	48	10
chr15	79484061	79484061	C	G	ncRNA_exonic	ANKRD34C-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	79587353	79587353	A	C	UTR3	ANKRD34C	NM_001146341:c.*119A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	79587354	79587354	T	C	UTR3	ANKRD34C	NM_001146341:c.*120T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	79587355	79587355	G	T	UTR3	ANKRD34C	NM_001146341:c.*121G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	79587358	79587358	G	C	UTR3	ANKRD34C	NM_001146341:c.*124G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	79750201	79750201	T	C	exonic	KIAA1024	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA1024:NM_015206:exon2:c.T1712C:p.V571A	NaN	NaN	NaN	.	.	0.0	B	0.0	B	0.098	N	1.000	N	0.69	N	1.57	T	-1.056	T	0.032	T	0.031	-1.171	0.088	-1.36	0.035	-0.034	1.038	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.426461	nearby_gap_events	REJECT	63	57	6	0
chr15	80061126	80061126	G	T	intergenic	KIAA1024,MTHFS	dist=296484;dist=74763	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	80137502	80137502	T	G	UTR3	MTHFS,ST20-MTHFS	NM_001199758:c.*50A>C,NM_006441:c.*50A>C;NM_001199760:c.*50A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr15	80141806	80141806	C	C	intronic	MTHFS,ST20-MTHFS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	80452886	80452886	T	G	intronic	FAH	NaN	NaN	NaN	rs733679	NaN	0.415935	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	53.540243	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	21	22	44
chr15	80494256	80494256	G	A	ncRNA_exonic	LINC01314	NaN	NaN	NaN	rs11637194	NaN	0.745208	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	80800534	80800534	A	G	exonic	ARNT2	NaN	synonymous SNV	ARNT2:NM_014862:exon6:c.A660G:p.K220K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.682594	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	176	170	6	0
chr15	80806400	80806400	A	G	intronic	ARNT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	16	9	7	0
chr15	80844955	80844955	T	T	intronic	ARNT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr15	80867480	80867480	G	C	intronic	ARNT2	NaN	NaN	NaN	rs72732083	NaN	0.136382	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	404.827	0	NaN	NA	NA	123	49	74	14
chr15	81132954	81132954	G	G	intronic	CEMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	81171254	81171254	A	C	intronic	CEMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr15	81197433	81197433	T	A	intronic	CEMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	81197435	81197435	G	A	intronic	CEMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	81234703	81234703	A	G	intronic	CEMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	81271942	81271942	A	G	intronic	MESDC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr15	81274246	81274246	C	C	intronic	MESDC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr15	81294774	81294774	G	C	exonic	MESDC1	NaN	synonymous SNV	MESDC1:NM_022566:exon1:c.G162C:p.S54S	rs11541231	NaN	0.0273562	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.037425	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	9	11	3
chr15	81361133	81361133	T	C	intergenic	MESDC1,C15orf26	dist=64788;dist=65511	NaN	NaN	rs7170899	NaN	0.114617	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr15	81611605	81611605	T	T	intronic	STARD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr15	81615146	81615146	T	T	intronic	STARD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	81625641	81625641	T	C	ncRNA_intronic	TMC3-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0026471052008197812	NA	0	0	NaN	NA	NA	178	141	37	0
chr15	81644005	81644005	T	T	ncRNA_intronic	TMC3-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	81644227	81644227	C	C	ncRNA_intronic	TMC3-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	81648973	81648973	A	AC	ncRNA_intronic	TMC3-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	49.7812	0	NaN	NA	NA	7	0	6	0
chr15	82054794	82054794	C	C	intergenic	TMC3-AS1,MEX3B	dist=319377;dist=279325	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	82313418	82313418	C	A	intergenic	TMC3-AS1,MEX3B	dist=578001;dist=20701	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr15	82313420	82313420	G	A	intergenic	TMC3-AS1,MEX3B	dist=578003;dist=20699	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr15	82313422	82313422	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	2	3,3	0
chr15	82313423	82313423	C	C	intergenic	TMC3-AS1,MEX3B	dist=578006;dist=20696	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr15	82336254	82336254	G	C	exonic	MEX3B	NaN	nonsynonymous SNV	MEX3B:NM_032246:exon2:c.C957G:p.S319R	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.994	D	0.854	P	0.000	D	1.000	D	2.125	M	1.52	T	-0.924	T	0.144	T	0.808	4.001	20.5	3.94	1.273	2.977	11.240	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr15	82336255	82336255	C	C	exonic	MEX3B	NaN	synonymous SNV	MEX3B:NM_032246:exon2:c.G956G:p.S319S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	48	43	0	0
chr15	83215181	83215181	T	T	intronic	CPEB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr15	83218198	83218198	T	T	intronic	CPEB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	83224799	83224799	A	A	exonic	CPEB1	NaN	synonymous SNV	CPEB1:NM_001079535:exon3:c.T455T:p.M152M,CPEB1:NM_001288820:exon3:c.T2T:p.M1M,CPEB1:NM_001079533:exon4:c.T455T:p.M152M,CPEB1:NM_001079534:exon4:c.T455T:p.M152M,CPEB1:NM_001288819:exon5:c.T455T:p.M152M,CPEB1:NM_030594:exon5:c.T680T:p.M227M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	161	128	0	0
chr15	83240062	83240062	T	T	intronic	CPEB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	83240064	83240064	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	13	2	5,5	0
chr15	83240065	83240065	C	A	intronic	CPEB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	16	11	5	0
chr15	83240066	83240066	C	G	intronic	CPEB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	16	11	5	0
chr15	83241228	83241228	C	G	intronic	CPEB1	NaN	NaN	NaN	rs17158403	NaN	0.110423	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	83350056	83350056	A	A	ncRNA_intronic	CPEB1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	83518518	83518518	G	A	exonic	HOMER2	NaN	synonymous SNV	HOMER2:NM_004839:exon9:c.C981T:p.D327D,HOMER2:NM_199330:exon9:c.C1014T:p.D338D	rs34287296	NaN	0.00778754	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.275652	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	20	14	2
chr15	83521036	83521036	C	T	intronic	HOMER2	NaN	NaN	NaN	rs1256429	NaN	0.826877	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	49.734608	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	0	19	49
chr15	83523367	83523367	TC	GG,TG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1711.11	0	NaN	NA	NA	179	0	7	0
chr15	83523664	83523664	C	A	intronic	HOMER2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.9337	0	NaN	NA	NA	28	23	5	12
chr15	83784532	83784532	T	T	intronic	TM6SF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	83826020	83826020	T	C	intronic	HDGFRP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr15	83826363	83826363	A	G	intronic	HDGFRP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.557989	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	752	713	39	0
chr15	83932764	83932764	C	G	exonic	BNC1	NaN	synonymous SNV	BNC1:NM_001301206:exon4:c.G1218C:p.L406L,BNC1:NM_001717:exon4:c.G1239C:p.L413L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.388866	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	301	292	9	0
chr15	83933576	83933576	A	A	intronic	BNC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr15	84059972	84059972	A	G	intergenic	BNC1,SH3GL3	dist=106504;dist=56008	NaN	NaN	rs1510472	NaN	0.396565	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	2	9	0
chr15	84116238	84116238	G	A	UTR5	SH3GL3	NM_001301109:c.-43348G>A,NM_001301108:c.-121063G>A,NM_003027:c.-48G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.452686	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	2	0	2	0
chr15	84116245	84116245	C	A	UTR5	SH3GL3	NM_001301109:c.-43341C>A,NM_001301108:c.-121056C>A,NM_003027:c.-41C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.653007	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	2	0	2	0
chr15	84237234	84237234	A	T	intronic	SH3GL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	84245441	84245441	A	G	exonic	SH3GL3	NaN	nonsynonymous SNV	SH3GL3:NM_001301108:exon6:c.A365G:p.E122G,SH3GL3:NM_003027:exon6:c.A572G:p.E191G,SH3GL3:NM_001301109:exon9:c.A596G:p.E199G	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.987	D	0.767	P	0.000	D	1.000	D	2.25	M	-0.68	T	-0.048	T	0.446	T	0.482	3.277	17.00	5.05	2.026	8.897	14.306	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.936274	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	295	276	19	0
chr15	84257372	84257372	T	T	intronic	SH3GL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	84287240	84287240	T	C	UTR3	SH3GL3	NM_001301109:c.*201T>C,NM_001301108:c.*201T>C,NM_003027:c.*201T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.0505	nearby_gap_events	REJECT	61	54	7	0
chr15	84488509	84488509	T	C	intronic	ADAMTSL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.787411	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	339	331	8	0
chr15	84488836	84488836	A	G	intronic	ADAMTSL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	14	9	5	0
chr15	84554034	84554034	A	G	intronic	ADAMTSL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	17	1	16	0
chr15	84559986	84559986	C	C	intronic	ADAMTSL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	84559987	84559987	T	T	intronic	ADAMTSL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	84559989	84559989	T	T	intronic	ADAMTSL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	84559993	84559993	T	T	intronic	ADAMTSL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr15	84559994	84559994	C	C	intronic	ADAMTSL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr15	84559995	84559995	T	T	intronic	ADAMTSL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr15	84559998	84559998	G	G	intronic	ADAMTSL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr15	84560000	84560000	A	A	intronic	ADAMTSL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr15	84560001	84560001	T	G	intronic	ADAMTSL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr15	85159710	85159710	A	A	UTR3	ZSCAN2	NM_001007072:c.*136A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	85188994	85188994	T	C	exonic	WDR73	NaN	synonymous SNV	WDR73:NM_032856:exon7:c.A591G:p.S197S	rs2271432	NaN	0.895367	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2503.62	0	NaN	NA	NA	197	0	197	50
chr15	85197312	85197312	C	T	intronic	WDR73	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.392482	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	76	67	9	0
chr15	85213976	85213976	T	G	exonic	SEC11A	NaN	nonsynonymous SNV	SEC11A:NM_001271919:exon4:c.A349C:p.N117H,SEC11A:NM_001271921:exon4:c.A319C:p.N107H,SEC11A:NM_014300:exon5:c.A469C:p.N157H,SEC11A:NM_001271918:exon6:c.A391C:p.N131H	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.218	B	0.167	B	0.000	D	1.000	D	2.81	M	.	.	-0.360	T	0.362	T	0.483	3.510	17.93	5.94	2.275	7.584	14.360	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr15	85290860	85290860	C	C	upstream	ZNF592	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	85327235	85327235	G	A	exonic	ZNF592	NaN	synonymous SNV	ZNF592:NM_014630:exon4:c.G1329A:p.Q443Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.871383	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	297	278	19	0
chr15	85402995	85402995	T	C	intronic	ALPK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	85403135	85403135	G	C	splicing	ALPK3	NM_020778:exon8:c.4699+1G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.893	28.1	5.16	2.417	5.659	16.137	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	514.566	0	NaN	NA	NA	34	9	25	5
chr15	85403149	85403149	C	C	intronic	ALPK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	78	57	0	0
chr15	85405929	85405929	G	T	exonic	ALPK3	NaN	nonsynonymous SNV	ALPK3:NM_020778:exon10:c.G4799T:p.W1600L	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	1.39	L	3.4	T	-1.195	T	0.045	T	0.62	4.794	27.0	4.97	2.578	9.074	15.773	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	29	29	0	0
chr15	85406703	85406703	T	C	intronic	ALPK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr15	85430904	85430904	T	T	intronic	SLC28A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	85438170	85438170	G	G	splicing	SLC28A1	NM_004213:exon6:c.278-1G>G,NM_001287762:exon5:c.278-1G>G,NM_201651:exon6:c.278-1G>G,NM_001287761:exon5:c.278-1G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	68	59	0	0
chr15	85476441	85476441	G	A	exonic	SLC28A1	NaN	synonymous SNV	SLC28A1:NM_001287762:exon12:c.G1149A:p.K383K,SLC28A1:NM_004213:exon13:c.G1149A:p.K383K	rs2305367	NaN	0.568291	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.663227	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	22	19	23
chr15	85619081	85619081	G	T	intronic	PDE8A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.92335	0	NaN	NA	NA	6	5	2	0
chr15	86124419	86124419	C	T	exonic	AKAP13	NaN	synonymous SNV	AKAP13:NM_006738:exon7:c.C3120T:p.S1040S,AKAP13:NM_007200:exon7:c.C3120T:p.S1040S	rs4843073	NaN	0.58147	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	412.675497	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	137	0	137	50
chr15	86124483	86124483	C	G	exonic	AKAP13	NaN	nonsynonymous SNV	AKAP13:NM_006738:exon7:c.C3184G:p.P1062A,AKAP13:NM_007200:exon7:c.C3184G:p.P1062A	rs4843074	NaN	0.581869	0.26	T	0.356	B	0.164	B	.	.	0.991	P	0.55	N	2.4	T	-0.995	T	0.000	T	0.191	1.546	11.12	-0.872	-0.005	-0.511	0.559	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	713.425994	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	255	0	255	50
chr15	86236788	86236788	A	A	intronic	AKAP13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	86253802	86253802	C	T	intronic	AKAP13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.314369	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	102	98	4	0
chr15	86258850	86258850	G	C	intronic	AKAP13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	86258851	86258851	G	A	intronic	AKAP13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr15	86258852	86258852	G	T	intronic	AKAP13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr15	86284817	86284817	T	C	intronic	AKAP13	NaN	NaN	NaN	rs13511	NaN	0.378195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	147.179	0	NaN	NA	NA	72	39	33	43
chr15	86401841	86401841	T	C	intergenic	KLHL25,LINC01584	dist=63652;dist=224735	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	12	3	9	0
chr15	86813334	86813334	A	A	intronic	AGBL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	86814997	86814997	A	A	intronic	AGBL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr15	87097580	87097580	T	G	intronic	AGBL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.875322	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	343	332	11	0
chr15	87097792	87097792	A	A	intronic	AGBL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr15	88187779	88187779	C	G	intergenic	LINC00052,NTRK3	dist=64862;dist=232209	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	88187780	88187780	C	A	intergenic	LINC00052,NTRK3	dist=64863;dist=232208	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	88575916	88575916	T	A	intronic	NTRK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	88660768	88660768	A	A	intronic	NTRK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	88669518	88669518	G	G	exonic	NTRK3	NaN	synonymous SNV	NTRK3:NM_001243101:exon12:c.C1356C:p.S452S,NTRK3:NM_001007156:exon13:c.C1380C:p.S460S,NTRK3:NM_001012338:exon13:c.C1380C:p.S460S,NTRK3:NM_002530:exon13:c.C1380C:p.S460S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	55	42	0	0
chr15	88669682	88669682	A	C	intronic	NTRK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr15	88670531	88670531	A	A	intronic	NTRK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	88679658	88679658	T	T	intronic	NTRK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	88769424	88769424	A	A	intronic	NTRK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	88799103	88799103	G	G	ncRNA_intronic	NTRK3-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	88799272	88799272	C	T	exonic	NTRK3	NaN	nonsynonymous SNV	NTRK3:NM_001007156:exon3:c.G113A:p.C38Y,NTRK3:NM_001012338:exon3:c.G113A:p.C38Y,NTRK3:NM_001243101:exon3:c.G113A:p.C38Y,NTRK3:NM_002530:exon3:c.G113A:p.C38Y	NaN	NaN	NaN	0	D	0.998	D	0.995	D	0.000	U	1.000	D	1.83	L	-6.75	D	1.006	D	0.985	D	0.724	3.772	19.15	3.85	1.853	6.442	14.707	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.410565	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	151	144	7	0
chr15	89009069	89009069	G	G	intronic	MRPL46	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	89172613	89172613	T	T	exonic	AEN	NaN	synonymous SNV	AEN:NM_022767:exon3:c.T697T:p.S233S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	83	65	0	0
chr15	89193584	89193584	G	C	UTR5	ISG20	NM_001303235:c.-1562G>C,NM_001303236:c.-1562G>C	NaN	NaN	rs8041679	NaN	0.754593	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr15	89386652	89386652	G	A	exonic	ACAN	NaN	nonsynonymous SNV	ACAN:NM_001135:exon6:c.G824A:p.R275Q,ACAN:NM_013227:exon6:c.G824A:p.R275Q	rs34949187	NaN	0.0820687	0.2	T	1.0	D	0.946	D	0.009	N	0.873	P	1.01	L	3.0	T	-1.045	T	0.000	T	0.25	3.790	19.24	5.56	2.626	5.756	18.526	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.111835	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	23
chr15	89392745	89392745	T	C	exonic	ACAN	NaN	synonymous SNV	ACAN:NM_001135:exon10:c.T1809C:p.A603A,ACAN:NM_013227:exon10:c.T1809C:p.A603A	rs1568116	NaN	0.995607	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	608.049	0	151.913571	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	63	0	63	56
chr15	89398045	89398045	T	G	intronic	ACAN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	1	0
chr15	89400722	89400722	G	T	exonic	ACAN	NaN	nonsynonymous SNV	ACAN:NM_001135:exon12:c.G4906T:p.V1636L,ACAN:NM_013227:exon12:c.G4906T:p.V1636L	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.969	D	0.695	P	0.173	N	1.000	N	2.36	M	4.63	T	-1.014	T	0.015	T	0.096	1.194	9.853	1.8	0.080	0.238	4.751	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.192374	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	78	68	10	0
chr15	89401751	89401751	T	C	exonic	ACAN	NaN	nonsynonymous SNV	ACAN:NM_001135:exon12:c.T5935C:p.S1979P,ACAN:NM_013227:exon12:c.T5935C:p.S1979P	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.999	D	0.942	D	0.120	N	1.000	N	2.275	M	4.28	T	-1.103	T	0.039	T	0.486	2.852	15.50	5.29	1.998	5.826	14.420	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.973846	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	117	108	9	0
chr15	89414295	89414295	G	G	intronic	ACAN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	89415401	89415401	A	A	intronic	ACAN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	18	15	0	0
chr15	89421327	89421327	A	G	exonic	HAPLN3	NaN	synonymous SNV	HAPLN3:NM_178232:exon5:c.T957C:p.G319G	rs2280463	NaN	0.437899	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	175.114329	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	58	0	58	35
chr15	89430506	89430506	C	T	exonic	HAPLN3	NaN	synonymous SNV	HAPLN3:NM_178232:exon2:c.G24A:p.P8P	rs3743395	NaN	0.203674	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	75.6792	0	39.92951	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	20	17	23
chr15	89442588	89442588	C	G	UTR3	MFGE8	NM_005928:c.*38G>C,NM_001114614:c.*38G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.42784	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	97	85	12	1
chr15	89442809	89442809	C	T	intronic	MFGE8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.367677	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	126	113	13	0
chr15	89449819	89449819	G	A	intronic	MFGE8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr15	89449821	89449821	A	C	intronic	MFGE8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	89453205	89453205	A	A	intronic	MFGE8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr15	89758127	89758127	A	A	intronic	RLBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	89758132	89758132	T	T	intronic	RLBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	89758134	89758134	T	T	intronic	RLBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	89758524	89758524	A	A	intronic	RLBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	89761949	89761949	A	T	intronic	RLBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	9	4	3	0
chr15	89761950	89761950	A	G	intronic	RLBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr15	89762091	89762091	T	T	intronic	RLBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	89811663	89811663	A	G	exonic	FANCI	NaN	synonymous SNV	FANCI:NM_001113378:exon10:c.A789G:p.E263E,FANCI:NM_018193:exon10:c.A789G:p.E263E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.519133	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	522	514	8	0
chr15	89817412	89817412	T	A	exonic	FANCI	NaN	stopgain	FANCI:NM_001113378:exon12:c.T989A:p.L330X,FANCI:NM_018193:exon12:c.T989A:p.L330X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.988	29.2	5.26	2.122	6.766	14.036	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.1415	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr15	89819777	89819777	G	T	intronic	FANCI	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.47366	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	538	530	8	0
chr15	89820162	89820162	A	A	intronic	FANCI	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr15	89820186	89820186	T	G	intronic	FANCI	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	89837054	89837054	T	G	intronic	FANCI	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.385771	nearby_gap_events	REJECT	143	134	9	0
chr15	89838346	89838346	A	A	intronic	FANCI	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	89850549	89850549	T	T	intronic	FANCI	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	89859560	89859560	C	T	UTR3	POLG	NM_001126131:c.*422G>A,NM_002693:c.*422G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.097931	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	118	111	7	0
chr15	89866190	89866190	A	G	intronic	POLG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	4	5	0
chr15	89869763	89869763	C	T	intronic	POLG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.528754	nearby_gap_events	REJECT	33	29	4	0
chr15	89870165	89870165	A	C	exonic	POLG	NaN	synonymous SNV	POLG:NM_001126131:exon8:c.T1563G:p.P521P,POLG:NM_002693:exon8:c.T1563G:p.P521P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.654336	nearby_gap_events	REJECT	47	37	10	0
chr15	89870166	89870166	G	A	exonic	POLG	NaN	nonsynonymous SNV	POLG:NM_001126131:exon8:c.C1562T:p.P521L,POLG:NM_002693:exon8:c.C1562T:p.P521L	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.029	B	0.006	B	0.737	N	1.000	N	0	N	-2.07	D	-0.762	T	0.337	T	0.169	1.275	10.16	3.24	1.132	3.160	8.717	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.599016	nearby_gap_events	REJECT	45	36	9	0
chr15	90022756	90022756	A	A	intronic	RHCG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr15	90119367	90119367	A	C	exonic	TICRR	NaN	nonsynonymous SNV	TICRR:NM_152259:exon1:c.A550C:p.T184P	NaN	NaN	NaN	0.26	T	0.0	B	0.002	B	0.046	N	1.000	N	0.55	N	3.02	T	-0.973	T	0.011	T	0.223	0.858	8.471	0.484	-0.090	.	1.618	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.589511	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	225	203	22	0
chr15	90119368	90119368	C	A	exonic	TICRR	NaN	nonsynonymous SNV	TICRR:NM_152259:exon1:c.C551A:p.T184N	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.005	B	0.005	B	0.046	N	1.000	N	1.245	L	3.05	T	-1.018	T	0.019	T	0.061	1.674	11.56	3.22	0.910	.	9.042	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.248544	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	197	179	18	0
chr15	90126210	90126210	A	T	intronic	TICRR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.26119	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	279	262	17	0
chr15	90126211	90126211	T	A	intronic	TICRR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.162036	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	263	244	19	0
chr15	90129188	90129188	T	C	intronic	TICRR	NaN	NaN	NaN	rs1540504	NaN	0.765775	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	80.702685	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	87	47	40	58
chr15	90135432	90135432	A	G	intronic	TICRR	NaN	NaN	NaN	rs34494298	NaN	0.766973	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.914487	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	29	18	57
chr15	90142543	90142543	T	A	intronic	TICRR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.561181	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	166	150	16	0
chr15	90144851	90144851	T	C	intronic	TICRR	NaN	NaN	NaN	rs4932233	ID=COSN165039;OCCURENCE=1(breast)	0.777556	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	113.067648	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	100	49	51	58
chr15	90150024	90150024	A	G	exonic	TICRR	NaN	nonsynonymous SNV	TICRR:NM_152259:exon14:c.A2690G:p.Q897R	NaN	NaN	NaN	0.19	T	1.0	D	0.998	D	0.061	N	0.972	D	1.845	L	2.42	T	-1.078	T	0.102	T	0.732	3.104	16.37	5.96	2.285	3.356	14.189	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.4476	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr15	90164948	90164948	A	G	intronic	TICRR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	89	NaN	NA	NA	36	17	19	0
chr15	90166969	90166969	C	A	exonic	TICRR	NaN	nonsynonymous SNV	TICRR:NM_152259:exon20:c.C3428A:p.A1143E	NaN	NaN	NaN	0.43	T	0.763	P	0.229	B	0.333	N	1.000	N	1.1	L	3.05	T	-0.987	T	0.018	T	0.215	1.829	12.08	3.39	0.586	0.241	4.025	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.434851	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	75	69	6	0
chr15	90166970	90166970	A	C	exonic	TICRR	NaN	synonymous SNV	TICRR:NM_152259:exon20:c.A3429C:p.A1143A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.456382	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	68	62	6	0
chr15	90167715	90167715	A	G	exonic	TICRR	NaN	nonsynonymous SNV	TICRR:NM_152259:exon20:c.A4174G:p.R1392G	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.029	B	0.01	B	0.005	N	1.000	N	0.69	N	3.1	T	-0.988	T	0.016	T	0.162	0.472	6.564	-0.497	-0.344	-0.102	4.338	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.942344	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	61	57	4	0
chr15	90168065	90168065	A	C	exonic	TICRR	NaN	synonymous SNV	TICRR:NM_152259:exon20:c.A4524C:p.P1508P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.957345	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	244	226	18	0
chr15	90171927	90171927	G	A	exonic	KIF7	NaN	nonsynonymous SNV	KIF7:NM_198525:exon19:c.C3755T:p.S1252F	NaN	NaN	0.000199681	0.01	D	0.432	B	0.075	B	0.342	N	1.000	N	0.55	N	-0.5	T	-0.988	T	0.139	T	0.075	1.044	9.264	-0.292	-0.483	0.162	3.743	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	36	26	10	0
chr15	90171928	90171928	A	A	exonic	KIF7	NaN	synonymous SNV	KIF7:NM_198525:exon19:c.T3754T:p.S1252S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	97	81	0	0
chr15	90173768	90173768	A	A	intronic	KIF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr15	90174824	90174824	C	T	exonic	KIF7	NaN	nonsynonymous SNV	KIF7:NM_198525:exon15:c.G3013A:p.G1005R	rs12900805	NaN	0.439297	0.42	T	0.004	B	0.004	B	0.060	N	1.000	P	0.69	N	0.94	T	-0.912	T	0.000	T	0.011	1.081	9.413	-0.473	-0.302	1.143	9.049	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	98.188939	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	77	35	42	48
chr15	90175078	90175078	A	G	intronic	KIF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	12	3	9	0
chr15	90176073	90176073	C	A	exonic	KIF7	NaN	nonsynonymous SNV	KIF7:NM_198525:exon14:c.G2873T:p.S958I	rs3803530	NaN	0.438299	0.22	T	0.611	P	0.242	B	0.000	N	0.041	P	1.445	L	0.88	T	-0.903	T	0.000	T	0.044	3.122	16.43	4.4	1.173	1.100	7.219	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.587812	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	13	13	42
chr15	90188740	90188740	C	A	intronic	KIF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	47	43	4	0
chr15	90188806	90188806	A	A	intronic	KIF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	90188977	90188977	A	G	intronic	KIF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr15	90189083	90189083	G	G	intronic	KIF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	90195977	90195977	G	T	exonic	KIF7	NaN	nonsynonymous SNV	KIF7:NM_198525:exon2:c.C185A:p.A62D	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.001	B	.	.	0.997	N	-0.985	N	-0.46	T	-1.004	T	0.077	T	0.109	-0.860	0.527	2.71	0.296	-0.091	7.663	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	2510.01	69	NaN	NA	NA	389	65	324	10
chr15	90210457	90210457	G	C	intronic	PLIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.957739	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	126	116	10	0
chr15	90210458	90210458	A	G	intronic	PLIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.788527	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	125	116	9	0
chr15	90210459	90210459	C	A	intronic	PLIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.767599	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	125	116	9	0
chr15	90212705	90212705	A	G	intronic	PLIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr15	90212707	90212707	T	C	intronic	PLIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr15	90214646	90214646	C	G	intronic	PLIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	29	11.287198	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	10	5	5	0
chr15	90220801	90220801	A	A	intronic	PLIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	90226947	90226947	C	A	exonic	PEX11A	NaN	synonymous SNV	PEX11A:NM_001271572:exon3:c.G312T:p.L104L,PEX11A:NM_003847:exon3:c.G405T:p.L135L	rs7169981	NaN	0.505192	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	340.395587	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	125	1	124	54
chr15	90244939	90244939	T	T	UTR5	WDR93	NM_020212:c.-39T>T,NM_001284395:c.-39T>T,NM_001284396:c.-39T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr15	90272378	90272378	C	A	intronic	WDR93	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.247199	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	202	163	39	0
chr15	90272410	90272410	A	C	intronic	WDR93	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr15	90293949	90293949	CGGGGC	CGGGCG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	51.1748	0	NaN	NA	NA	8	0	3	0
chr15	90293953	90293953	G	C	exonic	MESP1	NaN	nonsynonymous SNV	MESP1:NM_018670:exon1:c.C510G:p.C170W	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.875	P	0.237	B	.	.	0.997	D	0.895	L	-1.23	T	-0.736	T	0.229	T	0.239	1.893	12.29	1.81	1.464	1.739	8.735	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.757837	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	8	5	3	0
chr15	90293954	90293954	C	G	exonic	MESP1	NaN	nonsynonymous SNV	MESP1:NM_018670:exon1:c.G509C:p.C170S	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.118	B	0.011	B	.	.	0.970	N	0.895	L	-1.1	T	-0.945	T	0.233	T	0.116	-0.543	1.538	0.838	-0.004	-0.120	7.578	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.524037	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	8	5	3	0
chr15	90344282	90344282	T	A	intronic	ANPEP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	90348702	90348702	A	A	intronic	ANPEP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr15	90349914	90349914	A	A	UTR5	ANPEP	NM_001150:c.-100T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr15	90372465	90372465	C	T	intergenic	ANPEP,AP3S2	dist=14393;dist=1366	NaN	NaN	rs12910992	NaN	0.663538	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	90381016	90381016	A	G	intronic	AP3S2,C15orf38-AP3S2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	12	6	5	0
chr15	90447140	90447140	A	G	exonic	ARPIN,C15orf38-AP3S2	NaN	nonsynonymous SNV	C15orf38-AP3S2:NM_001199058:exon4:c.T377C:p.L126P,ARPIN:NM_001282380:exon4:c.T89C:p.L30P,ARPIN:NM_182616:exon4:c.T377C:p.L126P	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.996	D	0.948	D	.	.	1.000	D	1.845	L	0.77	T	-0.614	T	0.246	T	0.663	3.136	16.48	5.35	2.018	5.737	13.278	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.772366	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	60	57	3	0
chr15	90458001	90458001	T	T	intergenic	C15orf38-AP3S2,ZNF710	dist=1779;dist=86722	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	90458002	90458002	T	T	intergenic	C15orf38-AP3S2,ZNF710	dist=1780;dist=86721	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	90628409	90628409	G	T	intronic	IDH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.82875	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	101	91	10	0
chr15	90633948	90633948	A	G	intronic	IDH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.776115	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	219	209	10	0
chr15	90634941	90634941	A	G	intronic	IDH2	NaN	NaN	NaN	rs10852126	NaN	0.650759	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.448651	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	16	20	52
chr15	90645420	90645420	C	A	intronic	IDH2	NaN	NaN	NaN	rs12912761	NaN	0.0109824	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	33	9.127672	normal_lod	REJECT	3	0	3	0
chr15	90645544	90645544	T	C	exonic	IDH2	NaN	nonsynonymous SNV	IDH2:NM_002168:exon1:c.A79G:p.T27A	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.0	B	0.190	N	0.999	N	0.345	N	-0.95	T	-0.990	T	0.138	T	0.131	0.639	7.431	0.657	0.369	1.256	4.673	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	38	10.129627	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr15	90760990	90760990	A	AC	intronic	SEMA4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	4796.85	0	NaN	NA	NA	570	0	65	0
chr15	90760992	90760992	T	C	intronic	SEMA4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	7.04456	0	18.145432	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	567	503	64	0
chr15	90764485	90764485	T	C	intronic	SEMA4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	2	5	0
chr15	90766669	90766669	T	G	intronic	SEMA4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	90768959	90768959	A	C	exonic	SEMA4B	NaN	synonymous SNV	SEMA4B:NM_198925:exon12:c.A1588C:p.R530R,SEMA4B:NM_020210:exon13:c.A1588C:p.R530R	rs908044	NaN	0.358227	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.622875	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	54	29	25	32
chr15	90768967	90768967	T	G	exonic	SEMA4B	NaN	nonsynonymous SNV	SEMA4B:NM_198925:exon12:c.T1596G:p.C532W,SEMA4B:NM_020210:exon13:c.T1596G:p.C532W	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.725	H	0.11	T	0.056	D	0.440	T	0.989	3.970	20.3	-5.49	-0.732	-1.335	15.625	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.517803	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	56	50	6	0
chr15	90771704	90771704	G	A	exonic	SEMA4B	NaN	synonymous SNV	SEMA4B:NM_198925:exon14:c.G2343A:p.P781P,SEMA4B:NM_020210:exon15:c.G2343A:p.P781P	rs3751656	NaN	0.22524	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	241.528	0	NaN	NA	NA	59	21	38	19
chr15	90771750	90771750	T	G	exonic	SEMA4B	NaN	nonsynonymous SNV	SEMA4B:NM_198925:exon14:c.T2389G:p.S797A,SEMA4B:NM_020210:exon15:c.T2389G:p.S797A	rs3751655	NaN	0.792931	0.5	T	0.002	B	0.002	B	0.302	N	0.000	P	0.695	N	2.01	T	-1.044	T	0.000	T	0.012	0.369	6.001	2.86	0.324	0.929	4.051	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.01028027346182362	NA	0	0	NaN	NA	NA	162	125	37	41
chr15	90771928	90771928	A	A	UTR3	SEMA4B	NM_020210:c.*53A>A,NM_198925:c.*53A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	90784206	90784206	CA	C,CG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3235.07	0	NaN	NA	NA	329	0	40	30
chr15	90794013	90794013	G	T	ncRNA_exonic	TTLL13P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.969	D	0.518	P	0.067	U	1.000	N	1.5	L	3.62	T	-1.016	T	0.028	T	0.314	1.143	9.655	3.28	0.689	0.620	8.091	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.387929	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	209	200	9	0
chr15	90794927	90794927	G	T	ncRNA_intronic	TTLL13P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.747737	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	146	136	10	0
chr15	90800813	90800813	T	T	ncRNA_intronic	TTLL13P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	90801353	90801353	T	T	ncRNA_exonic	TTLL13P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	158	123	0	0
chr15	90809269	90809269	CT	C,CC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	66.6731	0	NaN	NA	NA	14	4	8	7
chr15	90814664	90814664	C	T	exonic	NGRN	NaN	nonsynonymous SNV	NGRN:NM_001033088:exon3:c.C520T:p.L174F	rs11073922	NaN	0.061901	0.01	D	0.992	D	0.93	D	0.052	U	0.893	P	2.16	M	0.5	T	-0.827	T	0.013	T	0.1	3.144	16.51	3.52	1.213	0.470	10.393	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	362.912	0	NaN	NA	NA	124	57	67	9
chr15	90814688	90814688	T	A	exonic	NGRN	NaN	nonsynonymous SNV	NGRN:NM_001033088:exon3:c.T544A:p.S182T	NaN	NaN	NaN	0.2	T	0.946	P	0.581	P	0.577	U	1.000	N	1.7	L	1.15	T	-1.031	T	0.090	T	0.084	2.742	15.13	-0.513	0.021	0.677	4.801	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.551667	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	137	116	21	0
chr15	90984725	90984725	T	G	intronic	IQGAP1	NaN	NaN	NaN	rs200510521	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.90673	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	20	15	5	0
chr15	91017232	91017232	G	A	intronic	IQGAP1	NaN	NaN	NaN	rs1145325	NaN	0.982827	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.875627	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	11	6	55
chr15	91030797	91030797	C	A	exonic	IQGAP1	NaN	nonsynonymous SNV	IQGAP1:NM_003870:exon33:c.C4231A:p.P1411T	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.115	B	0.082	B	0.007	N	0.680	D	1.32	L	0.64	T	-0.929	T	0.103	T	0.089	2.142	13.12	3.76	0.696	1.189	8.474	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.8808	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr15	91157582	91157582	A	A	intronic	CRTC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	128	112	0	0
chr15	91162941	91162941	G	A	intronic	CRTC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.049069	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	27	24	3	0
chr15	91168819	91168819	T	T	ncRNA_intronic	CRTC3-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	91293065	91293065	T	G	exonic	BLM	NaN	synonymous SNV	BLM:NM_000057:exon3:c.T567G:p.G189G,BLM:NM_001287247:exon3:c.T567G:p.G189G,BLM:NM_001287246:exon4:c.T567G:p.G189G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.413304	nearby_gap_events	REJECT	157	142	15	0
chr15	91295318	91295318	A	T	intronic	BLM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr15	91295319	91295319	A	C	intronic	BLM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr15	91295320	91295320	A	G	intronic	BLM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr15	91304147	91304147	A	T	exonic	BLM	NaN	nonsynonymous SNV	BLM:NM_000057:exon7:c.A1544T:p.N515I,BLM:NM_001287247:exon7:c.A1544T:p.N515I,BLM:NM_001287248:exon7:c.A419T:p.N140I,BLM:NM_001287246:exon8:c.A1544T:p.N515I	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.664	P	0.125	B	0.691	N	1.000	N	0.975	L	0.89	T	-1.031	T	0.057	T	0.122	2.003	12.66	0.718	-0.128	0.113	1.452	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.212707	nearby_gap_events	REJECT	140	131	9	0
chr15	91304148	91304148	T	G	exonic	BLM	NaN	nonsynonymous SNV	BLM:NM_000057:exon7:c.T1545G:p.N515K,BLM:NM_001287247:exon7:c.T1545G:p.N515K,BLM:NM_001287248:exon7:c.T420G:p.N140K,BLM:NM_001287246:exon8:c.T1545G:p.N515K	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.361	B	0.058	B	0.691	N	1.000	N	0.975	L	0.99	T	-1.059	T	0.053	T	0.062	1.881	12.25	-4.13	-1.104	-0.850	1.588	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.036966	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	218	209	9	0
chr15	91306052	91306052	T	T	intronic	BLM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	91359695	91359695	G	A	intergenic	BLM,FURIN	dist=1003;dist=52127	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	91359696	91359696	A	G	intergenic	BLM,FURIN	dist=1004;dist=52126	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	91419042	91419042	T	C	exonic	FURIN	NaN	synonymous SNV	FURIN:NM_001289823:exon2:c.T72C:p.A24A,FURIN:NM_001289824:exon2:c.T72C:p.A24A,FURIN:NM_002569:exon2:c.T72C:p.A24A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.445444	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	763	751	12	0
chr15	91421483	91421483	G	A	exonic	FURIN	NaN	synonymous SNV	FURIN:NM_001289823:exon8:c.G789A:p.V263V,FURIN:NM_001289824:exon8:c.G789A:p.V263V,FURIN:NM_002569:exon8:c.G789A:p.V263V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.11052631578947295	NA	0	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr15	91423543	91423543	G	T	intronic	FURIN	NaN	NaN	NaN	rs6224	NaN	0.470048	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.226614	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	3	12	40
chr15	91424585	91424585	A	C	exonic	FURIN	NaN	nonsynonymous SNV	FURIN:NM_001289823:exon16:c.A1862C:p.Q621P,FURIN:NM_001289824:exon16:c.A1862C:p.Q621P,FURIN:NM_002569:exon16:c.A1862C:p.Q621P	NaN	NaN	NaN	0.22	T	0.229	B	0.124	B	0.015	N	0.912	N	1.335	L	-0.44	T	-0.938	T	0.167	T	0.518	1.062	9.337	3.81	1.893	3.656	2.143	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.807742	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	28	23	5	0
chr15	91424955	91424955	TC	CG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	143.995	0	NaN	NA	NA	38	14	24	3
chr15	91428197	91428197	T	C	intronic	FES	NaN	NaN	NaN	rs2071382	NaN	0.640575	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr15	91428308	91428308	G	A	exonic	FES	NaN	synonymous SNV	FES:NM_001143783:exon1:c.G33A:p.Q11Q,FES:NM_001143784:exon1:c.G33A:p.Q11Q,FES:NM_001143785:exon2:c.G33A:p.Q11Q,FES:NM_002005:exon2:c.G33A:p.Q11Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.975851	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	137	127	10	0
chr15	91430666	91430666	A	A	intronic	FES	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr15	91435422	91435422	G	A	intronic	FES	NaN	NaN	NaN	rs12909124	NaN	0.457069	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.288442	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	10	9	29
chr15	91447461	91447461	A	G	exonic	MAN2A2	NaN	synonymous SNV	MAN2A2:NM_006122:exon1:c.A24G:p.T8T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.018218	nearby_gap_events	REJECT	60	54	6	0
chr15	91447527	91447527	A	G	exonic	MAN2A2	NaN	synonymous SNV	MAN2A2:NM_006122:exon1:c.A90G:p.Q30Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.371803	nearby_gap_events	REJECT	62	57	5	0
chr15	91449976	91449976	C	G	exonic	MAN2A2	NaN	nonsynonymous SNV	MAN2A2:NM_006122:exon6:c.C842G:p.T281S	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.109	B	0.219	B	0.000	D	1.000	D	2.175	M	1.98	T	-1.103	T	0.070	T	0.198	4.019	20.6	3.75	0.734	2.516	12.554	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	15	15	0	0
chr15	91452782	91452782	A	A	intronic	MAN2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	91453538	91453538	C	C	intronic	MAN2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	15	12	0	0
chr15	91453539	91453539	G	G	intronic	MAN2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	15	11	0	0
chr15	91454936	91454936	A	A	intronic	MAN2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	91454942	91454942	G	G	intronic	MAN2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	91455702	91455702	C	C	intronic	MAN2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr15	91455703	91455703	G	G	intronic	MAN2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr15	91455709	91455709	T	T	intronic	MAN2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr15	91457091	91457091	T	G	intronic	MAN2A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr15	91478975	91478975	C	T	intronic	UNC45A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.637424	nearby_gap_events	REJECT	46	41	5	0
chr15	91479483	91479483	T	T	intronic	UNC45A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr15	91486329	91486329	A	A	intronic	UNC45A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr15	91497417	91497417	G	T	upstream;downstream	RCCD1;UNC45A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	91503297	91503297	A	A	intronic	RCCD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	91503773	91503773	T	C	intronic	RCCD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr15	91503776	91503776	G	T	intronic	RCCD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr15	91517777	91517777	T	T	ncRNA_intronic	PRC1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	136	85	0	0
chr15	91519819	91519819	T	T	ncRNA_intronic	PRC1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	91527425	91527425	A	A	ncRNA_intronic	PRC1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr15	91543694	91543694	T	T	intronic	VPS33B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr15	91543877	91543877	A	A	intronic	VPS33B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	91547934	91547934	A	G	intronic	VPS33B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	91547935	91547935	A	C	intronic	VPS33B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	91547936	91547936	A	G	intronic	VPS33B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	91548290	91548290	G	A	exonic	VPS33B	NaN	nonsynonymous SNV	VPS33B:NM_001289148:exon14:c.C1084T:p.R362W,VPS33B:NM_001289149:exon14:c.C892T:p.R298W,VPS33B:NM_018668:exon15:c.C1165T:p.R389W	NaN	NaN	NaN	0.14	T	1.0	D	0.981	D	0.000	D	1.000	D	2.7	M	-1.08	T	0.293	D	0.666	D	0.882	4.051	20.8	6.04	2.873	3.709	18.352	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.710649	nearby_gap_events	REJECT	132	126	6	0
chr15	91548518	91548518	A	A	intronic	VPS33B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr15	91549170	91549170	A	G	intronic	VPS33B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.147468	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	248	239	9	0
chr15	91560337	91560337	A	A	intronic	VPS33B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	91676889	91676889	G	C	intronic	SV2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	92170314	92170314	A	G	intergenic	LOC101926928,SLCO3A1	dist=132234;dist=226624	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr15	92397199	92397199	G	A	exonic	SLCO3A1	NaN	nonsynonymous SNV	SLCO3A1:NM_001145044:exon1:c.G61A:p.D21N,SLCO3A1:NM_013272:exon1:c.G61A:p.D21N	NaN	NaN	NaN	0.5	T	0.911	P	0.485	P	0.165	N	1.000	D	0	N	1.19	T	-1.105	T	0.054	T	0.074	3.444	17.66	3.49	1.688	5.109	13.929	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	101.077	0	31.660921	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	10	0	10	2
chr15	92397201	92397201	C	G	exonic	SLCO3A1	NaN	nonsynonymous SNV	SLCO3A1:NM_001145044:exon1:c.C63G:p.D21E,SLCO3A1:NM_013272:exon1:c.C63G:p.D21E	NaN	NaN	NaN	1	T	0.785	P	0.209	B	0.165	N	1.000	D	0	N	1.25	T	-0.999	T	0.028	T	0.249	1.520	11.03	1.0	0.601	1.207	6.080	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	103.075	0	30.758502	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	10	0	10	4
chr15	92561183	92561183	A	G	intronic	SLCO3A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	1	8	0
chr15	92561188	92561188	T	G	intronic	SLCO3A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	1	8	0
chr15	92561189	92561189	C	A	intronic	SLCO3A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	9	1	8	0
chr15	92561194	92561194	G	A	intronic	SLCO3A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	9	1	8	0
chr15	92638193	92638193	G	A	exonic	SLCO3A1	NaN	synonymous SNV	SLCO3A1:NM_001145044:exon3:c.G729A:p.A243A,SLCO3A1:NM_013272:exon3:c.G729A:p.A243A	rs2286355	NaN	0.321086	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	160.978297	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	56	0	56	40
chr15	92653018	92653018	C	C	intronic	SLCO3A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr15	92664044	92664044	A	C	intronic	SLCO3A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr15	92706016	92706016	C	C	exonic	SLCO3A1	NaN	synonymous SNV	SLCO3A1:NM_001145044:exon10:c.C1784C:p.A595A,SLCO3A1:NM_013272:exon10:c.C1784C:p.A595A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	430	311	0	0
chr15	92714999	92714999	TCCCCCT	TCCCC,TCCCCT,TCTCCCC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	179.577	0	NaN	NA	NA	40	2	5	0
chr15	92919835	92919835	T	C	intergenic	SLCO3A1,ST8SIA2	dist=204170;dist=17305	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	92919837	92919837	C	A	intergenic	SLCO3A1,ST8SIA2	dist=204172;dist=17303	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	92937706	92937706	C	C	intronic	ST8SIA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr15	92988235	92988235	A	A	intronic	ST8SIA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	93007603	93007603	T	G	exonic	ST8SIA2	NaN	nonsynonymous SNV	ST8SIA2:NM_006011:exon6:c.T1116G:p.D372E	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.001	B	0.006	N	0.999	N	-0.23	N	2.61	T	-1.010	T	0.013	T	0.121	1.111	9.531	-8.86	-2.044	-3.173	6.633	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	186	138	48	0
chr15	93012620	93012620	A	G	downstream	LOC104613533,ST8SIA2	NaN	NaN	NaN	rs12592811	NaN	0.413538	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr15	93173615	93173615	A	A	intronic	FAM174B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr15	93198671	93198671	A	G	exonic	FAM174B	NaN	synonymous SNV	FAM174B:NM_207446:exon1:c.T219C:p.S73S	rs501381	NaN	0.967252	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.428537	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	36
chr15	93470602	93470602	A	G	intronic	CHD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr15	93515709	93515709	A	A	intronic	CHD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr15	93521651	93521651	T	G	intronic	CHD2	NaN	NaN	NaN	rs11074122	NaN	0.809704	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	36	25	11	9
chr15	93522311	93522311	T	A	intronic	CHD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	25.1381	0	NaN	NA	NA	191	160	32	15
chr15	93522321	93522321	G	T	intronic	CHD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.023826	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	167	137	30	0
chr15	93552661	93552661	A	A	intronic	CHD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr15	93567763	93567763	A	A	exonic	CHD2	NaN	synonymous SNV	CHD2:NM_001271:exon39:c.A5315A:p.E1772E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	106	80	0	0
chr15	93570906	93570906	C	T	UTR3	CHD2	NM_001271:c.*2971C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr15	93588264	93588264	G	C	exonic	RGMA	NaN	synonymous SNV	RGMA:NM_001166286:exon3:c.C1269G:p.L423L,RGMA:NM_001166283:exon4:c.C1341G:p.L447L,RGMA:NM_001166287:exon4:c.C1269G:p.L423L,RGMA:NM_001166288:exon4:c.C1269G:p.L423L,RGMA:NM_001166289:exon4:c.C1269G:p.L423L,RGMA:NM_020211:exon4:c.C1317G:p.L439L	rs4299103	NaN	0.47504	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.688165	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	11	13	41
chr15	93588335	93588335	T	C	exonic	RGMA	NaN	nonsynonymous SNV	RGMA:NM_001166286:exon3:c.A1198G:p.R400G,RGMA:NM_001166283:exon4:c.A1270G:p.R424G,RGMA:NM_001166287:exon4:c.A1198G:p.R400G,RGMA:NM_001166288:exon4:c.A1198G:p.R400G,RGMA:NM_001166289:exon4:c.A1198G:p.R400G,RGMA:NM_020211:exon4:c.A1246G:p.R416G	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.555	P	0.114	B	0.000	D	1.000	D	1.265	L	-2.47	D	0.088	D	0.558	D	0.287	2.351	13.82	4.71	1.748	2.584	13.842	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	267.958	0	6.299784	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	26	23	3	0
chr15	93588336	93588336	A	C	exonic	RGMA	NaN	nonsynonymous SNV	RGMA:NM_001166286:exon3:c.T1197G:p.D399E,RGMA:NM_001166283:exon4:c.T1269G:p.D423E,RGMA:NM_001166287:exon4:c.T1197G:p.D399E,RGMA:NM_001166288:exon4:c.T1197G:p.D399E,RGMA:NM_001166289:exon4:c.T1197G:p.D399E,RGMA:NM_020211:exon4:c.T1245G:p.D415E	rs4238485	NaN	1	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.000	P	-1.79	N	-2.22	D	-0.966	T	0.000	T	0.093	-0.661	1.101	-0.091	-0.150	0.136	5.063	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	77.421924	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	0	26	54
chr15	93588439	93588439	T	A	exonic	RGMA	NaN	nonsynonymous SNV	RGMA:NM_001166286:exon3:c.A1094T:p.D365V,RGMA:NM_001166283:exon4:c.A1166T:p.D389V,RGMA:NM_001166287:exon4:c.A1094T:p.D365V,RGMA:NM_001166288:exon4:c.A1094T:p.D365V,RGMA:NM_001166289:exon4:c.A1094T:p.D365V,RGMA:NM_020211:exon4:c.A1142T:p.D381V	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.83	M	-2.99	D	0.970	D	0.878	D	0.964	4.449	23.7	4.87	1.817	7.934	14.135	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.59775	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	94	88	6	0
chr15	93588442	93588442	A	C	exonic	RGMA	NaN	nonsynonymous SNV	RGMA:NM_001166286:exon3:c.T1091G:p.F364C,RGMA:NM_001166283:exon4:c.T1163G:p.F388C,RGMA:NM_001166287:exon4:c.T1091G:p.F364C,RGMA:NM_001166288:exon4:c.T1091G:p.F364C,RGMA:NM_001166289:exon4:c.T1091G:p.F364C,RGMA:NM_020211:exon4:c.T1139G:p.F380C	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.83	M	-2.58	D	0.867	D	0.832	D	0.965	4.359	23.0	4.87	1.817	9.212	14.135	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.61014	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	94	88	6	0
chr15	93595213	93595213	T	C	intronic	RGMA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	55	43.670375	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	41	22	19	3
chr15	93616286	93616286	A	G	UTR5	RGMA	NM_001166286:c.-60T>C	NaN	NaN	rs75748081	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	56.4959	0	NaN	NA	NA	18	8	10	41
chr15	93616975	93616975	A	G	exonic	RGMA	NaN	nonsynonymous SNV	RGMA:NM_001166283:exon1:c.T11C:p.L4P	rs4598860	NaN	0.608626	0.11	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	0	N	-2.8	D	-0.985	T	0.000	T	0.028	0.895	8.637	0.254	-0.196	-1.630	5.158	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.002554	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	21	24	38
chr15	93723925	93723925	G	T	intergenic	RGMA,LOC101927153	dist=91482;dist=675864	NaN	NaN	rs8035304	NaN	0.748203	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	93975902	93975902	A	A	intergenic	RGMA,LOC101927153	dist=343459;dist=423887	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr15	93975911	93975911	C	T	intergenic	RGMA,LOC101927153	dist=343468;dist=423878	NaN	NaN	rs7179578	NaN	0.354433	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr15	93975917	93975917	G	G	intergenic	RGMA,LOC101927153	dist=343474;dist=423872	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr15	94930231	94930231	G	G	intronic	MCTP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	94945774	94945774	C	T	exonic	MCTP2	NaN	synonymous SNV	MCTP2:NM_001159644:exon10:c.C909T:p.G303G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.196404	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	132	128	4	0
chr15	96723448	96723448	T	C	ncRNA_intronic	NR2F2-AS1	NaN	NaN	NaN	rs11638313	NaN	0.644968	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	96869427	96869427	C	G	ncRNA_intronic	NR2F2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	96875548	96875548	C	G	exonic	NR2F2	NaN	nonsynonymous SNV	NR2F2:NM_021005:exon1:c.C214G:p.Q72E	NaN	NaN	NaN	0.95	T	0.0	B	0.0	B	0.000	D	1.000	D	0.69	N	-3.13	D	-0.404	T	0.513	D	0.285	-0.393	2.158	3.75	0.954	3.792	11.473	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	34.8275	0	13.210474	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	6	1	5	3
chr15	96875550	96875550	G	A	exonic	NR2F2	NaN	synonymous SNV	NR2F2:NM_021005:exon1:c.G216A:p.Q72Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr15	96877222	96877222	GTC	TCG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5144	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr15	97328165	97328165	T	T	intronic	SPATA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr15	98522167	98522167	C	C	intergenic	ARRDC4,LINC01582	dist=5099;dist=104041	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	98950376	98950376	A	T	intergenic	LINC01582,FAM169B	dist=318394;dist=30015	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	98950377	98950377	C	T	intergenic	LINC01582,FAM169B	dist=318395;dist=30014	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr15	99029238	99029238	A	T	intronic	FAM169B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr15	99029240	99029240	A	G	intronic	FAM169B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr15	99029241	99029241	C	T	intronic	FAM169B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr15	99029242	99029242	A	G	intronic	FAM169B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr15	99282587	99282587	G	A	intronic	IGF1R	NaN	NaN	NaN	rs3743264	NaN	0.600639	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr15	99449683	99449683	T	T	intronic	IGF1R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr15	99454722	99454722	A	A	intronic	IGF1R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr15	99478225	99478225	G	A	exonic	IGF1R	NaN	synonymous SNV	IGF1R:NM_000875:exon16:c.G3129A:p.E1043E,IGF1R:NM_001291858:exon16:c.G3126A:p.E1042E	rs2229765	NaN	0.335663	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	139.224643	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	98	43	55	42
chr15	99482391	99482391	T	C	intronic	IGF1R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.481718	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	74	69	5	0
chr15	99500100	99500100	T	T	intronic	IGF1R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr15	99512889	99512889	A	T	intronic	PGPEP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr15	99512892	99512892	G	T	intronic	PGPEP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr15	99679460	99679460	T	C	intronic	TTC23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr15	99739968	99739968	T	T	intronic	TTC23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr15	99759307	99759307	A	T	intronic	TTC23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr15	99768950	99768950	T	A	intronic	TTC23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.626434	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	246	227	19	0
chr16	10052302	10052302	G	A	intronic	GRIN2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr16	10201334	10201334	G	G	intronic	GRIN2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	10201335	10201335	T	T	intronic	GRIN2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	10209375	10209375	C	T	intronic	GRIN2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	10209376	10209376	C	G	intronic	GRIN2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	1034834	1034834	T	C	exonic	SOX8	NaN	synonymous SNV	SOX8:NM_014587:exon3:c.T789C:p.N263N	rs237674	NaN	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	169.742838	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	0	57	57
chr16	103517	103517	A	C	exonic	POLR3K	NaN	nonsynonymous SNV	POLR3K:NM_016310:exon1:c.T70G:p.S24A	rs183360	NaN	1	0.82	T	0.0	B	0.001	B	0.000	N	0.000	P	-0.53	N	1.4	T	-0.951	T	0.000	T	0.213	0.817	8.287	5.06	1.270	4.538	14.082	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	167.653072	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	55	0	55	58
chr16	10524656	10524656	GGAC	G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3090.37	0	NaN	NA	NA	335	0	300	22
chr16	10532097	10532097	G	T	intronic	ATF7IP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.988425	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	220	211	9	0
chr16	10631985	10631985	T	C	intronic	EMP2	NaN	NaN	NaN	rs1504884	NaN	0.823482	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3053.17	0	NaN	NA	NA	277	0	277	37
chr16	10641352	10641352	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	0	2,2	0
chr16	10775855	10775855	G	A	exonic	TEKT5	NaN	synonymous SNV	TEKT5:NM_144674:exon4:c.C858T:p.D286D	rs12918646	NaN	0.294728	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	48.4649	0	NaN	NA	NA	90	71	19	12
chr16	10783089	10783089	A	T	intronic	TEKT5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.3308823529411801	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr16	10783957	10783957	A	A	intronic	TEKT5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	17	15	0	0
chr16	10788055	10788055	T	T	intronic	TEKT5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr16	10855739	10855739	G	A	intronic	NUBP1	NaN	NaN	NaN	rs1084544	NaN	0.214856	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.288175	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	0	28	21
chr16	10868775	10868775	T	T	intronic	TVP23A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	10	6	0	0
chr16	108877	108877	T	T	intronic	RHBDF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr16	10912148	10912148	A	A	intronic	TVP23A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	109657	109657	T	T	intronic	RHBDF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	10989428	10989428	T	G	intronic	CIITA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	78	NaN	NA	NA	13	7	6	0
chr16	11000322	11000322	T	T	intronic	CIITA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	11001680	11001680	G	T	exonic	CIITA	NaN	synonymous SNV	CIITA:NM_000246:exon11:c.G2331T:p.S777S,CIITA:NM_001286402:exon11:c.G2334T:p.S778S	rs34685848	NaN	0.0239617	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	70.677937	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	63	31	32	12
chr16	11001948	11001948	G	A	exonic	CIITA	NaN	nonsynonymous SNV	CIITA:NM_000246:exon11:c.G2599A:p.G867S,CIITA:NM_001286402:exon11:c.G2602A:p.G868S	NaN	NaN	NaN	0.63	T	1.0	D	0.999	D	0.056	N	1.000	N	1.06	L	0.68	T	-0.985	T	0.159	T	0.254	1.577	11.23	3.8	2.218	3.358	8.916	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	1.570868	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	8	7	1	0
chr16	11010335	11010335	C	T	intronic	CIITA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	11015861	11015861	T	T	intronic	CIITA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	11016375	11016375	A	A	intronic	CIITA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	1103758	1103758	A	C	intergenic	SOX8,SSTR5-AS1	dist=66779;dist=10324	NaN	NaN	rs9932436	NaN	0.452077	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr16	11056378	11056378	C	T	exonic	CLEC16A	NaN	synonymous SNV	CLEC16A:NM_001243403:exon3:c.C276T:p.Y92Y,CLEC16A:NM_015226:exon3:c.C276T:p.Y92Y	rs16957839	ID=COSM148020;OCCURENCE=1(stomach)	0.128994	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	46.848109	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	11	19	14
chr16	11058061	11058061	T	C	intronic	CLEC16A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	11062970	11062970	T	C	intronic	CLEC16A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr16	11141287	11141287	A	G	intronic	CLEC16A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr16	11154716	11154716	T	C	intronic	CLEC16A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	21	11	5	0
chr16	11154926	11154926	A	G	intronic	CLEC16A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	17	10	7	0
chr16	11167461	11167461	A	T	intronic	CLEC16A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	11214784	11214784	A	T	intronic	CLEC16A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.05011	0	NaN	NA	NA	19	16	3	5
chr16	11214786	11214786	A	A	intronic	CLEC16A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr16	11250413	11250413	C	A	intronic	CLEC16A	NaN	NaN	NaN	rs7189563	NaN	0.644569	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	112513	112513	T	C	intronic	RHBDF1	NaN	NaN	NaN	rs216604	NaN	0.866214	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	759.601	0	NaN	NA	NA	47	0	47	33
chr16	11260459	11260459	A	C	intronic	CLEC16A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	19	11	4	0
chr16	112746	112746	T	G	intronic	RHBDF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	68.674447	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	218	178	40	0
chr16	1129157	1129157	G	T	exonic	SSTR5	NaN	nonsynonymous SNV	SSTR5:NM_001053:exon1:c.G289T:p.A97S,SSTR5:NM_001172560:exon2:c.G289T:p.A97S	NaN	NaN	NaN	0.4	T	0.95	P	0.817	P	0.003	N	1.000	D	2.595	M	2.12	T	-0.958	T	0.128	T	0.746	5.313	34	4.87	2.260	6.418	16.982	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.012817916441806868	NA	0	0	NaN	NA	NA	90	66	24	4
chr16	1129225	1129225	C	T	exonic	SSTR5	NaN	synonymous SNV	SSTR5:NM_001053:exon1:c.C357T:p.D119D,SSTR5:NM_001172560:exon2:c.C357T:p.D119D	rs2076419	NaN	0.0155751	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	109.082179	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	69	27	42	2
chr16	1129835	1129835	A	G	exonic	SSTR5	NaN	nonsynonymous SNV	SSTR5:NM_001053:exon1:c.A967G:p.K323E,SSTR5:NM_001172560:exon2:c.A967G:p.K323E	NaN	NaN	NaN	0.98	T	0.012	B	0.018	B	0.451	U	1.000	N	2.125	M	1.04	T	-0.935	T	0.084	T	0.269	0.042	4.233	-1.06	-0.156	0.819	7.157	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.601742	clustered_read_position	REJECT	36	31	5	0
chr16	1129836	1129836	A	T	exonic	SSTR5	NaN	nonsynonymous SNV	SSTR5:NM_001053:exon1:c.A968T:p.K323M,SSTR5:NM_001172560:exon2:c.A968T:p.K323M	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.74	P	0.592	P	0.451	U	0.999	N	2.125	M	1.02	T	-0.980	T	0.151	T	0.365	1.334	10.38	2.19	0.597	1.029	6.205	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.901966	clustered_read_position	REJECT	36	31	5	0
chr16	1129872	1129872	C	T	exonic	SSTR5	NaN	nonsynonymous SNV	SSTR5:NM_001053:exon1:c.C1004T:p.P335L,SSTR5:NM_001172560:exon2:c.C1004T:p.P335L	rs169068	NaN	0.518171	0.37	T	0.055	B	0.011	B	0.234	N	1.000	P	2.015	M	-0.59	T	-0.970	T	0.000	T	0.06	-0.133	3.347	2.24	0.883	0.488	6.593	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.128783	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	17	11	38
chr16	1129912	1129912	A	G	exonic	SSTR5	NaN	synonymous SNV	SSTR5:NM_001053:exon1:c.A1044G:p.P348P,SSTR5:NM_001172560:exon2:c.A1044G:p.P348P	rs642249	NaN	0.9377	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.800449	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	0	12	51
chr16	113109	113109	T	T	exonic	RHBDF1	NaN	synonymous SNV	RHBDF1:NM_022450:exon5:c.A534A:p.P178P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	22	19	0	0
chr16	113327	113327	A	A	intronic	RHBDF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr16	113422	113422	T	T	intronic	RHBDF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	11349403	11349403	A	C	intronic	SOCS1	NaN	NaN	NaN	rs27829	NaN	0.978634	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.574981	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	0	10	28
chr16	11439639	11439639	T	C	intronic	RMI2	NaN	NaN	NaN	rs918737	NaN	0.510982	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	91.509865	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	0	31	22
chr16	11507419	11507419	G	C	intergenic	RMI2,LOC101927131	dist=61799;dist=51697	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	11511534	11511534	T	C	intergenic	RMI2,LOC101927131	dist=65914;dist=47582	NaN	NaN	rs73508946	NaN	0.139177	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	31	11	20	0
chr16	11511908	11511908	G	A	intergenic	RMI2,LOC101927131	dist=66288;dist=47208	NaN	NaN	rs77594401	NaN	0.139776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr16	1154572	1154572	G	G	intergenic	C1QTNF8,CACNA1H	dist=8328;dist=48669	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	1163138	1163138	G	T	intergenic	C1QTNF8,CACNA1H	dist=16894;dist=40103	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	1163139	1163139	G	C	intergenic	C1QTNF8,CACNA1H	dist=16895;dist=40102	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	11773433	11773433	C	T	exonic	TXNDC11	NaN	nonsynonymous SNV	TXNDC11:NM_015914:exon12:c.G2495A:p.R832H,TXNDC11:NM_001303447:exon13:c.G2576A:p.R859H	NaN	NaN	NaN	0.04	D	1.0	D	0.977	D	0.000	D	1.000	D	2.075	M	2.4	T	-0.976	T	0.142	T	0.491	4.688	25.9	5.63	2.652	2.691	18.698	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.196163	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	126	120	6	0
chr16	11785975	11785975	A	C	intronic	TXNDC11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr16	11862389	11862389	A	C	intronic	ZC3H7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	59.697382	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	104	72	32	0
chr16	11862390	11862390	A	C	intronic	ZC3H7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	72	36	36	0
chr16	11862391	11862391	C	C	intronic	ZC3H7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	31	26	0	0
chr16	11862392	11862392	A	C	intronic	ZC3H7A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr16	11935895	11935895	A	C	intronic	RSL1D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.84428	0	NaN	NA	NA	63	54	8	0
chr16	11935898	11935898	A	A	intronic	RSL1D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	11941805	11941805	A	A	intronic	RSL1D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr16	11944003	11944003	T	C	intronic	RSL1D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	9	4	4	0
chr16	11945231	11945231	T	C	intronic	RSL1D1	NaN	NaN	NaN	rs2075158	NaN	0.642772	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	119.838453	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	0	45	52
chr16	11969453	11969453	T	T	intronic	GSPT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	12093291	12093291	A	A	intronic	SNX29	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	12137032	12137032	A	G	intronic	SNX29	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	11	4	6	0
chr16	12163067	12163067	A	G	intronic	SNX29	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	1	6	0
chr16	1226389	1226389	T	C	intronic	CACNA1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	14	5	9	0
chr16	12450190	12450190	A	A	intronic	SNX29	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	1245612	1245612	C	A	intronic	CACNA1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.19480519480519692	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr16	1250651	1250651	C	C	intronic	CACNA1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	68	49	0	0
chr16	1257133	1257133	C	C	intronic	CACNA1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	36	34	0	0
chr16	1257471	1257471	G	C	intronic	CACNA1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr16	1257940	1257940	T	C	intronic	CACNA1H	NaN	NaN	NaN	rs2738896	NaN	0.172324	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.541161	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	10	13	25
chr16	1258040	1258040	C	A	exonic	CACNA1H	NaN	nonsynonymous SNV	CACNA1H:NM_001005407:exon16:c.C3182A:p.T1061N,CACNA1H:NM_021098:exon16:c.C3182A:p.T1061N	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.979	D	0.65	P	0.001	N	0.606	N	2.14	M	-4.09	D	0.974	D	0.884	D	0.313	2.833	15.43	4.01	2.096	5.446	15.362	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr16	1260767	1260767	G	A	intronic	CACNA1H	NaN	NaN	NaN	rs2738897	NaN	0.613618	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	48.028	0	10.329145	normal_lod	REJECT	11	4	7	24
chr16	1260993	1260993	C	G	intronic	CACNA1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.760489	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	389	362	27	0
chr16	1261119	1261119	G	A	intronic	CACNA1H	NaN	NaN	NaN	rs2738899	NaN	0.693291	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	109.412232	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	0	38	45
chr16	1261377	1261377	G	A	intronic	CACNA1H	NaN	NaN	NaN	rs2738900	NaN	0.708866	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	592.207	63	NaN	NA	NA	50	0	50	16
chr16	12630907	12630907	A	A	intronic	SNX29	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	1265600	1265600	G	G	intronic	CACNA1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	1265720	1265720	C	T	intronic	CACNA1H	NaN	NaN	NaN	rs3897150	NaN	0.907348	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.926452	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	25
chr16	12672591	12672591	T	T	intergenic	SNX29,CPPED1	dist=4445;dist=81065	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	1267808	1267808	T	T	intronic	CACNA1H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	1268304	1268304	C	G	exonic	CACNA1H	NaN	nonsynonymous SNV	CACNA1H:NM_001005407:exon32:c.C5522G:p.A1841G,CACNA1H:NM_021098:exon33:c.C5540G:p.A1847G	NaN	NaN	NaN	0.11	T	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	0.74	N	-4.68	D	1.009	D	0.912	D	0.511	4.786	27.0	4.23	2.357	7.308	16.111	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.755528	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	39	36	3	0
chr16	1269099	1269099	C	G	exonic	CACNA1H	NaN	nonsynonymous SNV	CACNA1H:NM_001005407:exon33:c.C5999G:p.S2000C,CACNA1H:NM_021098:exon34:c.C6017G:p.S2006C	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.976	D	0.083	U	1.000	N	1.625	L	-4.71	D	0.557	D	0.952	D	0.362	3.178	16.64	3.23	0.940	1.104	11.124	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.749685	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	1	3	1
chr16	1272080	1272080	G	C	exonic	TPSG1	NaN	nonsynonymous SNV	TPSG1:NM_012467:exon6:c.C674G:p.P225R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	.	.	0.671	D	4.69	H	-5.08	D	1.038	D	0.982	D	0.911	1.903	12.32	2.29	0.352	3.593	9.084	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	19	18	1	12
chr16	1272082	1272082	C	C	exonic	TPSG1	NaN	synonymous SNV	TPSG1:NM_012467:exon6:c.G672G:p.G224G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	25	22	0	0
chr16	12758986	12758986	A	A	intronic	CPPED1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr16	1279816	1279816	G	A	intronic	TPSB2	NaN	NaN	NaN	rs371907673	NaN	0.311102	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.07603609625668321	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr16	1279817	1279817	A	G	intronic	TPSB2	NaN	NaN	NaN	rs760213	NaN	0.535942	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.025943859189949774	NA	0	0	NaN	NA	NA	16	9	7	0
chr16	1306918	1306918	C	T	exonic	TPSD1	NaN	synonymous SNV	TPSD1:NM_012217:exon3:c.C375T:p.T125T	rs74470113	ID=COSM122114;OCCURENCE=1(upper_aerodigestive_tract)	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.2179	0	NaN	NA	NA	43	35	8	6
chr16	1306921	1306921	G	A	exonic	TPSD1	NaN	synonymous SNV	TPSD1:NM_012217:exon3:c.G378A:p.G126G	rs78324915	ID=COSM148002;OCCURENCE=1(stomach),1(haematopoietic_and_lymphoid_tissue)	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.2179	0	NaN	NA	NA	43	35	8	5
chr16	1306927	1306927	C	T	exonic	TPSD1	NaN	synonymous SNV	TPSD1:NM_012217:exon3:c.C384T:p.D128D	rs79472859	ID=COSM148003;OCCURENCE=1(stomach)	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.2182	0	NaN	NA	NA	43	35	8	6
chr16	1310223	1310223	C	T	intergenic	TPSD1,UBE2I	dist=1729;dist=48931	NaN	NaN	rs9924558	NaN	0.110623	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	17	2	14	0
chr16	1311508	1311508	G	A	intergenic	TPSD1,UBE2I	dist=3014;dist=47646	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr16	1339590	1339590	G	A	intergenic	TPSD1,UBE2I	dist=31096;dist=19564	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	136163	136163	A	G	UTR3	NPRL3	NM_001039476:c.*541T>C,NM_001243249:c.*541T>C,NM_001077350:c.*541T>C,NM_001243247:c.*541T>C,NM_001243248:c.*541T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	136164	136164	G	T	UTR3	NPRL3	NM_001039476:c.*540C>A,NM_001243249:c.*540C>A,NM_001077350:c.*540C>A,NM_001243247:c.*540C>A,NM_001243248:c.*540C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	136166	136166	A	G	UTR3	NPRL3	NM_001039476:c.*538T>C,NM_001243249:c.*538T>C,NM_001077350:c.*538T>C,NM_001243247:c.*538T>C,NM_001243248:c.*538T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	136888	136888	T	C	intronic	NPRL3	NaN	NaN	NaN	rs743725	NaN	0.726238	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.527969	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	15
chr16	1370303	1370303	T	C	intronic	UBE2I	NaN	NaN	NaN	rs909916	NaN	0.950479	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2372.85	0	NaN	NA	NA	220	0	220	35
chr16	1389393	1389393	T	T	intronic	BAIAP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	24	21	0	0
chr16	1394223	1394223	C	A	intronic	BAIAP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.862223	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	81	69	12	0
chr16	1395916	1395916	A	A	intronic	BAIAP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	60	50	0	0
chr16	1395936	1395936	A	A	intronic	BAIAP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	60	51	0	0
chr16	1398077	1398077	C	CCT	intronic	BAIAP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.939696	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	59.5518	0	NaN	NA	NA	7	0	6	25
chr16	140245	140245	G	C	intronic	NPRL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	14027980	14027980	T	T	intronic	ERCC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	24	19	0	0
chr16	1412941	1412941	C	T	intronic	GNPTG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.428167	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	410	403	7	0
chr16	1413247	1413247	A	A	UTR3	GNPTG,UNKL	NM_032520:c.*155A>A;NM_001193389:c.*2994T>T,NM_001193388:c.*2994T>T,NM_001276414:c.*2994T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr16	1420487	1420487	A	G	intronic	UNKL	NaN	NaN	NaN	rs12597285	NaN	0.95647	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	74.9771	0	NaN	NA	NA	8	0	8	13
chr16	14342974	14342974	A	A	intronic	MKL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr16	1436978	1436978	C	A	intronic	UNKL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr16	1440755	1440755	A	A	intronic	UNKL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr16	1442796	1442796	G	C	intronic	UNKL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	1451519	1451519	G	A	intronic	UNKL	NaN	NaN	NaN	rs761068	NaN	0.610823	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	62.2195	0	18.294965	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	25
chr16	14615286	14615286	C	G	intronic	PARN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	14649414	14649414	T	A	intronic	PARN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.775839	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	84	76	8	0
chr16	14649415	14649415	G	T	intronic	PARN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.286514	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	84	76	8	0
chr16	14649416	14649416	A	G	intronic	PARN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.635965	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	63	55	8	0
chr16	14704681	14704681	A	T	intronic	PARN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.658129	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	160	151	9	0
chr16	14742182	14742182	T	G	intronic	BFAR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.018523270178141673	NA	0	0	NaN	NA	NA	84	65	19	0
chr16	1479449	1479449	A	A	intergenic	C16orf91,CCDC154	dist=8648;dist=4940	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr16	1484284	1484284	T	T	downstream	CCDC154	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	1484337	1484337	CA	C,CG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1749.2	0	NaN	NA	NA	206	1	61	7
chr16	1484341	1484341	C	G	downstream	CCDC154	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.502334	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	200	162	38	0
chr16	1484681	1484681	T	A	exonic	CCDC154	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC154:NM_001143980:exon16:c.A1865T:p.Y622F	NaN	NaN	NaN	0	D	0.882	P	0.521	P	0.001	N	0.971	N	0.975	L	.	.	-1.031	T	0.077	T	0.517	2.384	13.93	4.35	1.832	1.247	6.450	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	31	8.971608	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	5	2	3	0
chr16	1486911	1486911	C	C	intronic	CCDC154	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	60	60	0	0
chr16	1488021	1488021	C	C	intronic	CCDC154	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	36	31	0	0
chr16	1488864	1488864	A	A	exonic	CCDC154	NaN	synonymous SNV	CCDC154:NM_001143980:exon8:c.T858T:p.L286L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	1492582	1492582	A	T	intronic	CCDC154	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	1493030	1493030	C	G	intronic	CCDC154	NaN	NaN	NaN	rs1883480	NaN	0.510982	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.979	0	NaN	NA	NA	7	4	3	18
chr16	14960574	14960574	A	T	intronic	NOMO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.39928	0	NaN	NA	NA	16	13	2	2
chr16	1497141	1497141	A	A	intronic	CLCN7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr16	1498872	1498872	T	A	intronic	CLCN7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	25	17	8	0
chr16	14989420	14989420	C	T	exonic	NOMO1	NaN	nonsynonymous SNV	NOMO1:NM_014287:exon31:c.C3587T:p.A1196V	rs3895684	NaN	NaN	0.01	D	0.382	B	0.026	B	0.002	N	0.074	P	1.32	L	0.74	T	-0.921	T	0.000	T	0.429	0.977	8.988	2.0	0.577	3.312	9.788	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.2746	0	NaN	NA	NA	1013	776	237	40
chr16	1501515	1501515	T	T	intronic	CLCN7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	1501530	1501530	G	A	intronic	CLCN7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.912485	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	100	89	11	0
chr16	1502815	1502815	T	C	exonic	CLCN7	NaN	nonsynonymous SNV	CLCN7:NM_001114331:exon14:c.A1222G:p.I408V,CLCN7:NM_001287:exon15:c.A1294G:p.I432V	NaN	NaN	NaN	0.61	T	0.998	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	0.94	L	-3.08	D	0.352	D	0.751	D	0.408	3.032	16.12	5.15	1.947	5.621	13.787	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.568669	nearby_gap_events	REJECT	38	34	4	0
chr16	1503751	1503751	T	A	intronic	CLCN7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr16	1503879	1503879	T	A	exonic	CLCN7	NaN	synonymous SNV	CLCN7:NM_001114331:exon13:c.A1098T:p.A366A,CLCN7:NM_001287:exon14:c.A1170T:p.A390A	rs2235579	NaN	0.555911	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	194.857301	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	149	69	80	46
chr16	1505369	1505369	C	G	intronic	CLCN7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.36476566911349606	NA	0	0	NaN	NA	NA	19	15	4	0
chr16	1505429	1505429	C	G	intronic	CLCN7	NaN	NaN	NaN	rs2072694	NaN	0.635184	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.06042	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	13	14	41
chr16	1507755	1507755	C	T	exonic	CLCN7	NaN	synonymous SNV	CLCN7:NM_001114331:exon7:c.G606A:p.T202T,CLCN7:NM_001287:exon8:c.G678A:p.T226T	rs201175959	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.504531	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	100	94	6	0
chr16	15091589	15091589	CTTTTTTTTTTTG	CTTTTTTTTTTTC,TCTTTTTTTTTTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	245.745	0	NaN	NA	NA	50	12	28	0
chr16	15111319	15111319	A	A	intronic	PDXDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr16	1511588	1511588	A	A	intronic	CLCN7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	33	28	0	0
chr16	15128246	15128246	C	G	intronic	PDXDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	18	9	9	0
chr16	15129459	15129459	A	G	intronic	PDXDC1	NaN	NaN	NaN	rs4985155	NaN	0.417732	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	604.057868	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	198	0	198	31
chr16	15131974	15131974	G	T	exonic	NTAN1	NaN	nonsynonymous SNV	NTAN1:NM_001270767:exon8:c.C532A:p.H178N,NTAN1:NM_001270766:exon9:c.C532A:p.H178N,NTAN1:NM_173474:exon10:c.C847A:p.H283N	rs1136001	NaN	0.343251	0.5	T	0.0	B	0.0	B	0.009	N	1.000	P	-0.805	N	1.65	T	-0.912	T	0.000	T	0.018	-0.522	1.619	1.84	-0.026	0.598	6.911	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	341.515179	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	118	0	118	30
chr16	15133889	15133889	T	G	exonic	NTAN1	NaN	synonymous SNV	NTAN1:NM_001270767:exon6:c.A261C:p.A87A,NTAN1:NM_001270766:exon7:c.A261C:p.A87A,NTAN1:NM_173474:exon8:c.A576C:p.A192A	rs14347	NaN	0.344649	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	200.120755	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	70	0	70	30
chr16	15166744	15166744	T	T	intronic	PDXDC1,RRN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	15177444	15177444	T	A	intronic	PDXDC1,RRN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.2573	0	NaN	NA	NA	26	22	4	3
chr16	1537455	1537455	T	C	exonic	PTX4	NaN	nonsynonymous SNV	PTX4:NM_001013658:exon2:c.A643G:p.R215G	rs2667673	NaN	0.535743	0.46	T	0.001	B	0.002	B	0.009	N	1.000	P	0.6	N	3.46	T	-0.984	T	0.000	T	0.057	0.600	7.233	-10.1	-3.768	-3.619	3.905	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	208.347	0	NaN	NA	NA	56	19	29	39
chr16	1538363	1538363	C	A	exonic	PTX4	NaN	nonsynonymous SNV	PTX4:NM_001013658:exon1:c.G106T:p.G36C	rs1040499	NaN	0.499601	0.14	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	.	.	3.13	T	-1.058	T	0.000	T	0.039	0.536	6.903	-0.196	-0.511	-0.524	2.442	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	86.1567	0	NaN	NA	NA	36	18	18	35
chr16	1545448	1545448	A	G	exonic	TELO2	NaN	nonsynonymous SNV	TELO2:NM_016111:exon3:c.A437G:p.Q146R	rs2235624	NaN	0.463658	0.48	T	0.346	B	0.052	B	0.549	N	1.000	P	0	N	-1.74	D	-1.003	T	0.000	T	0.032	0.009	4.060	-2.64	-0.281	0.588	7.452	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.89627	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	15	23	48
chr16	1547563	1547563	A	A	intronic	TELO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr16	15489683	15489683	G	A	UTR5	MPV17L	NM_173803:c.-72G>A,NM_001128423:c.-72G>A	NaN	NaN	rs2925566	NaN	0.276158	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	22.736	0	7.836065	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	5	4	10
chr16	15501787	15501787	C	A	intronic	MPV17L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.929087	clustered_read_position	REJECT	28	24	4	0
chr16	15501791	15501791	T	A	exonic	MPV17L	NaN	nonsynonymous SNV	MPV17L:NM_001128423:exon4:c.T413A:p.L138Q	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.854	P	0.65	P	0.634	N	1.000	D	.	.	-2.22	D	-0.050	T	0.705	D	0.732	4.037	20.7	5.2	1.974	5.011	12.449	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.660971	clustered_read_position	REJECT	29	25	4	0
chr16	1551826	1551826	C	G	intronic	TELO2	NaN	NaN	NaN	rs72779276	NaN	0.0880591	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	43	32	10	11
chr16	1552523	1552523	T	G	intronic	TELO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.945099	nearby_gap_events	REJECT	42	35	7	0
chr16	1552524	1552524	C	T	intronic	TELO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.968698	nearby_gap_events	REJECT	43	36	7	0
chr16	1557488	1557488	A	A	intronic	TELO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	1559790	1559790	T	T	intronic	TELO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	15609108	15609108	T	T	intronic	C16orf45	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	15	12	0	0
chr16	15680765	15680765	A	A	UTR3	C16orf45	NM_033201:c.*79A>A,NM_001142469:c.*79A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	1568289	1568289	G	A	exonic	IFT140	NaN	synonymous SNV	IFT140:NM_014714:exon30:c.C4110T:p.D1370D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.898243	nearby_gap_events	REJECT	113	104	9	0
chr16	15692588	15692588	C	T	intronic	KIAA0430	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.137017	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	468	459	9	0
chr16	1569846	1569846	T	T	intronic	IFT140	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr16	1570715	1570715	A	G	exonic	IFT140	NaN	nonsynonymous SNV	IFT140:NM_014714:exon27:c.T3548C:p.L1183P	NaN	NaN	NaN	0.22	T	0.998	D	0.942	D	0.001	D	0.533	N	2.36	M	1.28	T	-0.166	T	0.377	T	0.71	3.308	17.12	5.78	2.333	7.203	16.398	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.829713	possible_contamination	REJECT	101	95	6	0
chr16	15724286	15724286	T	A	exonic	KIAA0430	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA0430:NM_001184998:exon7:c.A1427T:p.N476I,KIAA0430:NM_001184999:exon7:c.A1418T:p.N473I,KIAA0430:NM_014647:exon7:c.A1427T:p.N476I	NaN	NaN	NaN	0.14	T	0.978	D	0.843	P	0.000	D	1.000	N	-0.14	N	.	.	-0.930	T	0.111	T	0.698	3.918	19.93	5.96	2.283	3.249	16.422	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.17786561264821815	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr16	1573810	1573810	A	G	intronic	IFT140	NaN	NaN	NaN	rs2745176	NaN	0.984425	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	36.1974	0	11.126496	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	7	6	43
chr16	1576607	1576607	G	C	intronic	IFT140	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.489947	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	9	3	6	0
chr16	15781413	15781413	A	A	intronic	NDE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	15784976	15784976	T	C	intronic	NDE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	14	8	6	0
chr16	15784978	15784978	C	G	intronic	NDE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr16	15788036	15788036	A	G	exonic	NDE1	NaN	nonsynonymous SNV	NDE1:NM_017668:exon7:c.A718G:p.T240A,NDE1:NM_001143979:exon8:c.A718G:p.T240A	rs140540712	NaN	NaN	0.61	T	0.0	B	0.001	B	0.274	N	1.000	N	0.69	N	.	.	-1.028	T	0.049	T	0.374	0.590	7.181	-0.652	0.043	0.087	4.257	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.026905	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	190	178	12	0
chr16	15788037	15788037	C	A	exonic	NDE1	NaN	nonsynonymous SNV	NDE1:NM_017668:exon7:c.C719A:p.T240N,NDE1:NM_001143979:exon8:c.C719A:p.T240N	NaN	NaN	NaN	0.37	T	0.0	B	0.001	B	0.274	N	1.000	N	0.345	N	.	.	-1.045	T	0.030	T	0.247	1.128	9.599	-5.83	-0.540	-0.486	0.391	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.259109	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	188	176	12	0
chr16	15788046	15788046	C	A	exonic	NDE1	NaN	nonsynonymous SNV	NDE1:NM_017668:exon7:c.C728A:p.T243N,NDE1:NM_001143979:exon8:c.C728A:p.T243N	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.995	D	0.919	D	0.000	D	1.000	D	1.905	M	.	.	-0.367	T	0.385	T	0.469	2.629	14.75	5.15	2.559	3.807	17.986	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	170	118	52	0
chr16	15810982	15810982	T	T	intronic	MYH11,NDE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr16	15820863	15820863	C	T	exonic	MYH11	NaN	nonsynonymous SNV	MYH11:NM_002474:exon28:c.G3700A:p.A1234T,MYH11:NM_022844:exon28:c.G3700A:p.A1234T,MYH11:NM_001040113:exon29:c.G3721A:p.A1241T,MYH11:NM_001040114:exon29:c.G3721A:p.A1241T	rs16967494	NaN	0.203874	0.01	D	0.053	B	0.025	B	0.000	D	0.021	P	0.28	N	-1.15	T	-1.088	T	0.000	T	0.065	1.365	10.49	4.68	2.311	0.783	12.121	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	1140.681956	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	366	0	366	31
chr16	15834148	15834148	A	A	intronic	MYH11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	15838940	15838940	G	C	intronic	MYH11	NaN	NaN	NaN	rs2384934	NaN	0.871805	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	211.685	0	NaN	NA	NA	23	2	21	23
chr16	15839034	15839034	G	A	exonic	MYH11	NaN	synonymous SNV	MYH11:NM_002474:exon20:c.C2472T:p.A824A,MYH11:NM_022844:exon20:c.C2472T:p.A824A,MYH11:NM_001040113:exon21:c.C2493T:p.A831A,MYH11:NM_001040114:exon21:c.C2493T:p.A831A	rs1050113	NaN	0.253594	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	91.399446	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	0	31	36
chr16	15843899	15843899	G	A	intronic	MYH11	NaN	NaN	NaN	rs6498570	NaN	0.95607	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	81.527005	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	1	28	58
chr16	15851511	15851511	T	T	intronic	MYH11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr16	15857814	15857814	A	G	intronic	MYH11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr16	15869868	15869868	T	T	intronic	MYH11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	15876162	15876162	T	A	intronic	MYH11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	15917308	15917308	A	T	intronic	MYH11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	15917310	15917310	G	C	intronic	MYH11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	15917311	15917311	G	T	intronic	MYH11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	1607914	1607914	T	T	intronic	IFT140	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr16	16083137	16083137	C	A	intronic	ABCC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	16146740	16146740	A	A	intronic	ABCC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr16	16162209	16162209	G	G	intronic	ABCC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	16162211	16162211	C	C	intronic	ABCC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	16180693	16180693	T	C	exonic	ABCC1	NaN	nonsynonymous SNV	ABCC1:NM_004996:exon18:c.T2305C:p.S769P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	4.385	H	-5.18	D	1.026	D	0.983	D	0.968	4.889	28.1	5.38	2.039	6.155	14.576	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.853687	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	160	150	10	0
chr16	16180866	16180866	G	T	intronic	ABCC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.746993	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	164	149	15	0
chr16	16193160	16193160	G	A	intronic	ABCC1	NaN	NaN	NaN	rs2239996	NaN	0.34365	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	22	5	17	0
chr16	16205141	16205141	A	G	intronic	ABCC1	NaN	NaN	NaN	rs4780592	NaN	0.645168	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	22	11	11	3
chr16	16205143	16205143	A	G	intronic	ABCC1	NaN	NaN	NaN	rs4780593	NaN	0.646965	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	22	11	11	3
chr16	16205161	16205161	G	A	intronic	ABCC1	NaN	NaN	NaN	rs4238623	NaN	0.538538	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	16	10	6	0
chr16	16225600	16225600	A	C	intronic	ABCC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	16228094	16228094	T	T	intronic	ABCC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	18	15	0	0
chr16	16244129	16244129	T	C	intronic	ABCC6	NaN	NaN	NaN	rs212097	NaN	0.281749	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.142437	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	3	6	30
chr16	16244174	16244174	T	C	intronic	ABCC6	NaN	NaN	NaN	rs212098	NaN	0.127396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.272225	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	7	4	8
chr16	16256907	16256907	T	G	exonic	ABCC6	NaN	nonsynonymous SNV	ABCC6:NM_001171:exon24:c.A3449C:p.N1150T	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.095	B	0.032	B	0.206	U	0.999	N	2.525	M	-2.5	D	-0.213	T	0.602	D	0.204	0.424	6.305	-3.19	-0.393	0.453	12.148	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.520391	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	67	55	12	0
chr16	16257059	16257059	A	C	intronic	ABCC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	1	2	0
chr16	16263361	16263361	G	A	intronic	ABCC6	NaN	NaN	NaN	rs7194043	NaN	0.973243	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1702.89	0	NaN	NA	NA	166	0	166	20
chr16	16263664	16263664	G	A	exonic	ABCC6	NaN	nonsynonymous SNV	ABCC6:NM_001171:exon22:c.C2834T:p.P945L	NaN	NaN	NaN	0.65	T	0.482	P	0.105	B	0.000	U	1.000	D	0.525	N	-2.54	D	-0.368	T	0.404	T	0.412	-0.164	3.200	5.0	2.328	3.528	11.043	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.366166	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	133	124	9	0
chr16	16267079	16267079	A	G	intronic	ABCC6	NaN	NaN	NaN	rs11866320	NaN	0.975639	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	201.250324	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	67	0	67	58
chr16	16278977	16278977	C	G	intronic	ABCC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.267394	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	81	69	12	0
chr16	16278983	16278983	C	A	intronic	ABCC6	NaN	NaN	NaN	rs377446088	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.09173387096774227	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr16	16280889	16280889	C	T	intronic	ABCC6	NaN	NaN	NaN	rs7192265	NaN	0.338059	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	24.3436	0	7.768983	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	2	3	25
chr16	16280895	16280895	A	G	intronic	ABCC6	NaN	NaN	NaN	rs7192961	NaN	0.332268	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	24.3435	18	8.607794	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	2	3	26
chr16	16280921	16280921	T	C	intronic	ABCC6	NaN	NaN	NaN	rs8056103	NaN	0.953874	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	74.9731	0	18.407503	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	19
chr16	16281007	16281007	A	G	exonic	ABCC6	NaN	nonsynonymous SNV	ABCC6:NM_001171:exon14:c.T1841C:p.V614A	rs12931472	NaN	0.339457	0.46	T	0.0	B	0.0	B	0.422	N	1.000	P	-0.305	N	-2.56	D	-0.965	T	0.000	T	0.303	0.166	4.895	3.85	0.432	1.037	3.582	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.246522	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	14	8	32
chr16	16282848	16282848	A	C	intronic	ABCC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	63	NaN	NA	NA	49	47	2	0
chr16	1633241	1633241	T	G	intronic	IFT140	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	16355483	16355483	G	GA	exonic	NOMO3	NaN	frameshift substitution	NOMO3:NM_001004067:exon12:c.1345_1345delinsGA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.57604	0	NaN	NA	NA	17	15	2	0
chr16	1636318	1636318	A	G	intronic	IFT140	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.972348	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	88	71	17	4
chr16	1638042	1638042	C	T	intronic	IFT140	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.740996	nearby_gap_events	REJECT	93	87	6	0
chr16	1642636	1642636	C	T	intronic	IFT140	NaN	NaN	NaN	rs199728113	NaN	0.00179712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.426303	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	163	147	16	0
chr16	1687728	1687728	T	T	intronic	CRAMP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	1706523	1706523	C	G	exonic	CRAMP1L	NaN	nonsynonymous SNV	CRAMP1L:NM_020825:exon9:c.C1765G:p.P589A	NaN	NaN	NaN	0.31	T	0.001	B	0.0	B	0.184	N	1.000	N	0.345	N	.	.	-1.052	T	0.046	T	0.086	-1.176	0.085	-3.17	-0.300	0.014	6.692	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.572321	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	266	248	18	0
chr16	1707887	1707887	T	T	intronic	CRAMP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	1717505	1717505	A	A	intronic	CRAMP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	10	7	0	0
chr16	1719190	1719190	A	A	intronic	CRAMP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	17202884	17202884	A	A	intronic	XYLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	17234894	17234894	G	A	intronic	XYLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.706532	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	193	188	5	0
chr16	1724085	1724085	A	A	UTR3	CRAMP1L	NM_020825:c.*39A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	17252801	17252801	A	G	intronic	XYLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr16	17252807	17252807	T	A	intronic	XYLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	17252809	17252809	G	A	intronic	XYLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	17292048	17292048	T	T	intronic	XYLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr16	17375063	17375063	G	G	intronic	XYLT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	1798393	1798393	A	A	intronic	MAPK8IP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	18015551	18015551	T	C	intergenic	XYLT1,NPIPA7	dist=450813;dist=396225	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	1813942	1813942	T	G	intronic	MAPK8IP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr16	1814450	1814450	A	A	exonic	MAPK8IP3	NaN	synonymous SNV	MAPK8IP3:NM_001040439:exon18:c.A2249A:p.E750E,MAPK8IP3:NM_015133:exon19:c.A2267A:p.E756E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	14	14	0	0
chr16	1818334	1818334	T	T	exonic	MAPK8IP3	NaN	synonymous SNV	MAPK8IP3:NM_001040439:exon29:c.T3676T:p.F1226F,MAPK8IP3:NM_015133:exon30:c.T3694T:p.F1232F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	25	22	0	0
chr16	1818994	1818994	A	G	UTR3	MAPK8IP3	NM_001040439:c.*169A>G,NM_015133:c.*169A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr16	1822123	1822123	C	G	UTR3	MRPS34	NM_023936:c.*99G>C,NM_001300900:c.*99G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	1822124	1822124	C	A	UTR3	MRPS34	NM_023936:c.*98G>T,NM_001300900:c.*98G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	1822947	1822947	C	G	exonic	MRPS34	NaN	synonymous SNV	MRPS34:NM_001300900:exon1:c.G174C:p.V58V,MRPS34:NM_023936:exon1:c.G174C:p.V58V	rs1076695	NaN	0.0501198	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.666606	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	5	6	5
chr16	1825768	1825768	A	C	intronic	EME2	NaN	NaN	NaN	rs2745169	NaN	0.333866	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.502794	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	0	12	41
chr16	1842209	1842209	A	G	exonic	IGFALS	NaN	synonymous SNV	IGFALS:NM_001146006:exon2:c.T324C:p.D108D,IGFALS:NM_004970:exon2:c.T210C:p.D70D	rs3751893	ID=COSM434736;OCCURENCE=1(breast)	0.784145	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	111.618296	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	0	38	55
chr16	1843672	1843672	T	C	UTR5	IGFALS	NM_001146006:c.-19A>G,NM_004970:c.-19A>G	NaN	NaN	rs3817902	NaN	0.66873	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.591736	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	0	35	41
chr16	1859032	1859032	C	T	downstream	HAGH	NaN	NaN	NaN	rs1625344	NaN	0.720647	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	1859240	1859240	T	T	UTR3	HAGH	NM_005326:c.*44A>A,NM_001286249:c.*151A>A,NM_001040427:c.*44A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	1859432	1859432	G	C	intronic	HAGH	NaN	NaN	NaN	rs1628812	NaN	0.736222	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	129.497703	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	0	48	55
chr16	1869792	1869792	T	C	intronic	HAGH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	76	NaN	NA	NA	15	6	9	0
chr16	1870037	1870037	TGGGCTGCCTGCTGAGCTGAGG	T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	752.577	0	NaN	NA	NA	235	66	136	10
chr16	1872276	1872276	C	C	intronic	HAGH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	68	59	0	0
chr16	1873087	1873087	C	A	intronic	HAGH	NaN	NaN	NaN	rs104843	NaN	0.550919	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	847.742	0	NaN	NA	NA	79	0	79	44
chr16	18806014	18806014	G	A	intronic	ARL6IP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.72735	0	NaN	NA	NA	8	7	2	0
chr16	18821049	18821049	A	T	intronic	SMG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr16	1884199	1884199	C	T	UTR3	MEIOB	NM_001163560:c.*58G>A,NM_152764:c.*58G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.899336	nearby_gap_events	REJECT	86	80	6	0
chr16	18852769	18852769	T	T	intronic	SMG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr16	18861167	18861167	T	T	intronic	SMG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	18865851	18865851	C	A	intronic	SMG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	14	8	5	0
chr16	18865852	18865852	A	G	intronic	SMG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr16	18865855	18865855	T	C	intronic	SMG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr16	1889474	1889474	G	C	UTR3	FAHD1	NM_001142398:c.*167G>C,NM_001018104:c.*220G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	19020746	19020746	A	A	intronic	TMC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	1903145	1903145	A	G	intronic	MEIOB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.785356	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	52	42	10	0
chr16	19056769	19056769	G	A	intronic	TMC7	NaN	NaN	NaN	rs12051270	NaN	0.466454	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	33.071	0	NaN	NA	NA	96	59	37	36
chr16	19068066	19068066	A	A	intronic	TMC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr16	19079095	19079095	T	G	intronic	COQ7	NaN	NaN	NaN	rs4531717	NaN	0.8752	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.804894	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	29
chr16	19083444	19083444	T	G	intronic	COQ7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	1918125	1918125	T	G	exonic	MEIOB	NaN	nonsynonymous SNV	MEIOB:NM_001163560:exon2:c.A52C:p.T18P,MEIOB:NM_152764:exon2:c.A52C:p.T18P	rs1742446	NaN	0.8125	1	T	0.0	B	0.0	B	0.882	N	0.000	P	-1.935	N	2.37	T	-0.958	T	0.000	T	0.2	-1.436	0.020	5.03	1.261	4.123	12.780	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	152.923	0	NaN	NA	NA	75	0	75	27
chr16	19191889	19191889	G	A	intronic	SYT17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.388417	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	144	138	6	0
chr16	19235948	19235948	T	T	intronic	SYT17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	19498672	19498672	A	T	intronic	TMC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	19505751	19505751	G	A	intronic	TMC5	NaN	NaN	NaN	rs2856608	NaN	0.567891	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	129.37	0	NaN	NA	NA	95	58	37	39
chr16	19514991	19514991	G	G	intronic	GDE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	19522130	19522130	A	T	intronic	GDE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	13.041	0	NaN	NA	NA	18	14	4	0
chr16	19548633	19548633	A	G	exonic	CCP110	NaN	nonsynonymous SNV	CCP110:NM_001199022:exon4:c.A1642G:p.K548E,CCP110:NM_014711:exon5:c.A1642G:p.K548E	NaN	NaN	NaN	1	T	0.008	B	0.01	B	0.005	N	0.697	N	0.9	L	2.69	T	-0.985	T	0.017	T	0.164	0.718	7.822	3.22	2.086	3.714	2.826	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.012913543228385655	NA	0	35	NaN	NA	NA	19	11	8	0
chr16	19553886	19553886	T	C	intronic	CCP110	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.805852		KEEP	49	45	4	0
chr16	19554149	19554149	G	C	intronic	CCP110	NaN	NaN	NaN	rs373651701	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	113.085523	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	89	42	47	1
chr16	19559788	19559788	A	C	intronic	CCP110	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	19559790	19559790	T	G	intronic	CCP110	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	0	2	0
chr16	1958702	1958702	T	C	intergenic	LINC00254,HS3ST6	dist=24470;dist=2763	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr16	19627381	19627381	A	T	intronic	C16orf62	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.005582	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	136	127	9	0
chr16	19651384	19651384	G	A	exonic	C16orf62	NaN	synonymous SNV	C16orf62:NM_001300743:exon19:c.G1812A:p.R604R,C16orf62:NM_020314:exon21:c.G2013A:p.R671R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.548911	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	148	142	6	0
chr16	19693552	19693552	T	C	exonic	C16orf62	NaN	synonymous SNV	C16orf62:NM_001300743:exon25:c.T2355C:p.H785H,C16orf62:NM_020314:exon28:c.T2634C:p.H878H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.24665	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	200	193	7	0
chr16	19711035	19711035	G	T	intronic	C16orf62	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr16	19722731	19722731	T	C	exonic	KNOP1	NaN	nonsynonymous SNV	KNOP1:NM_001012991:exon3:c.A950G:p.E317G	NaN	NaN	NaN	.	.	0.971	D	0.776	P	0.099	N	1.000	D	1.87	L	1.69	T	-1.095	T	0.093	T	0.272	1.720	11.71	3.3	0.786	2.040	7.886	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.001945482593797305	NA	0	0	NaN	NA	NA	23	11	12	0
chr16	19725410	19725410	G	A	intronic	KNOP1	NaN	NaN	NaN	rs79810083	NaN	0.0157748	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	80.5903	0	50.533661	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	56	34	22	3
chr16	19729732	19729732	C	T	exonic	IQCK	NaN	nonsynonymous SNV	IQCK:NM_001305122:exon2:c.C104T:p.A35V,IQCK:NM_153208:exon2:c.C104T:p.A35V	NaN	NaN	NaN	.	.	0.0	B	0.0	B	0.008	N	1.000	N	0	N	0.9	T	-1.054	T	0.040	T	0.169	2.059	12.84	-8.02	-1.928	-1.438	1.409	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.327521	normal_lod	REJECT	4	1	3	0
chr16	19741863	19741863	G	A	intronic	IQCK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.856805		KEEP	45	41	4	0
chr16	19783402	19783402	A	T	intronic	IQCK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	19800079	19800079	A	A	intronic	IQCK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr16	19800081	19800081	G	G	intronic	IQCK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr16	19800085	19800085	T	T	intronic	IQCK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr16	19800087	19800087	A	A	intronic	IQCK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr16	19838302	19838302	C	T	intronic	IQCK	NaN	NaN	NaN	rs75971389	NaN	0.155751	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.685395	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	25	20	4
chr16	1995724	1995724	A	A	intronic	RPL3L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	47	46	0	0
chr16	1996054	1996054	A	A	intronic	RPL3L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr16	20044005	20044005	A	A	intronic	GPR139	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr16	2004718	2004718	T	C	upstream	RPL3L	NaN	NaN	NaN	rs2815301	NaN	0.842652	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.710132	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	14	10	48
chr16	2009832	2009832	A	AC	intronic	NDUFB10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	42.8698	0	NaN	NA	NA	12	4	6	1
chr16	2011126	2011126	A	G	intronic	NDUFB10	NaN	NaN	NaN	rs758335	NaN	0.867612	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	92.224764	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	30	36	48
chr16	2018612	2018612	T	C	exonic	RNF151	NaN	nonsynonymous SNV	RNF151:NM_174903:exon4:c.T424C:p.C142R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.958	D	0.000	D	1.000	D	2.725	M	-1.08	T	0.369	D	0.625	D	0.952	2.484	14.27	5.25	1.989	5.555	11.561	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.013782465519296728	NA	0	0	NaN	NA	NA	29	21	8	0
chr16	2018614	2018614	C	G	exonic	RNF151	NaN	nonsynonymous SNV	RNF151:NM_174903:exon4:c.C426G:p.C142W	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.993	D	0.000	D	1.000	D	2.725	M	-1.09	T	0.059	D	0.585	D	0.888	1.550	11.14	0.53	0.132	1.125	8.459	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.030854098890043084	NA	0	0	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr16	2024163	2024163	T	T	intronic	TBL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	33	33	0	0
chr16	20348598	20348598	G	A	intronic	UMOD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.239553	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	105	89	16	0
chr16	20355517	20355517	AG	GA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.19462	0	NaN	NA	NA	8	6	2	32
chr16	20435232	20435232	T	G	intronic	ACSM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.830292	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	248	215	33	0
chr16	20435234	20435234	G	T	intronic	ACSM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.846997	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	256	219	37	0
chr16	20441197	20441197	C	T	intronic	ACSM5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	2048050	2048050	C	G	UTR3	ZNF598	NM_178167:c.*183G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	3.31359	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	21	17	4	0
chr16	2048052	2048052	G	A	UTR3	ZNF598	NM_178167:c.*181C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.17984189723320118	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr16	20497775	20497775	G	C	intronic	ACSM2A	NaN	NaN	NaN	rs4783532	NaN	0.472045	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1580.77	0	NaN	NA	NA	295	40	255	45
chr16	2049935	2049935	T	C	exonic	ZNF598	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF598:NM_178167:exon11:c.A1615G:p.S539G	NaN	NaN	NaN	0.62	T	0.0	B	0.0	B	0.677	N	1.000	N	-0.6	N	2.23	T	-0.977	T	0.013	T	0.161	0.107	4.577	-1.62	-0.418	0.414	1.489	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.906653	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	110	102	8	0
chr16	2050093	2050093	A	G	exonic	ZNF598	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF598:NM_178167:exon11:c.T1457C:p.F486S	NaN	NaN	NaN	0.04	D	1.0	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	2.215	M	1.18	T	-0.693	T	0.213	T	0.725	3.127	16.45	4.86	2.043	8.571	13.820	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	27	20	7	0
chr16	2050564	2050564	A	A	intronic	ZNF598	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	20557688	20557688	T	C	intronic	ACSM2B	NaN	NaN	NaN	rs12927522	ID=COSN165130;OCCURENCE=1(breast)	0.277356	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	77.9707	0	NaN	NA	NA	69	28	41	9
chr16	20635573	20635573	A	A	intronic	ACSM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr16	20693792	20693792	A	G	intronic	ACSM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr16	2070137	2070137	T	C	exonic	NPW	NaN	nonsynonymous SNV	NPW:NM_001099456:exon1:c.T235C:p.S79P	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.0	B	0.001	B	0.005	U	1.000	N	0.695	N	0.83	T	-1.082	T	0.074	T	0.189	1.486	10.92	-3.45	-0.844	-0.079	1.419	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	32.2239	22	NaN	NA	NA	8	3	5	27
chr16	2070568	2070568	A	C	exonic	NPW	NaN	nonsynonymous SNV	NPW:NM_001099456:exon2:c.A446C:p.D149A	rs2286472	ID=COSM434810;OCCURENCE=2(breast)	0.361422	0.72	T	0.0	B	0.0	B	0.727	N	1.000	P	0	N	0.59	T	-0.927	T	0.000	T	0.043	-1.887	0.008	-0.235	-0.424	-0.827	2.156	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	98.1052	0	14.088748	nearby_gap_events	REJECT	46	30	16	21
chr16	2072682	2072682	T	C	intergenic	NPW,SLC9A3R2	dist=1926;dist=4187	NaN	NaN	rs202020111	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	20749285	20749285	A	G	intronic	THUMPD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.986892	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	63	54	9	0
chr16	20749295	20749295	A	G	intronic	THUMPD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.933789	nearby_gap_events	REJECT	95	84	11	0
chr16	20792460	20792460	A	A	intronic	ACSM3,ERI2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr16	20803333	20803333	T	T	exonic	ACSM3	NaN	synonymous SNV	ACSM3:NM_005622:exon11:c.T1336T:p.S446S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	125	103	0	0
chr16	20809004	20809004	T	T	UTR3	ERI2	NM_001142725:c.*42A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	20844493	20844493	A	G	intronic	LOC81691	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	0	6	0
chr16	20851016	20851016	T	G	intronic	LOC81691	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	20851018	20851018	C	A	intronic	LOC81691	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr16	20855263	20855263	T	C	exonic	LOC81691	NaN	nonsynonymous SNV	LOC81691:NM_001199053:exon16:c.T1634C:p.L545P,LOC81691:NM_030941:exon16:c.T1634C:p.L545P	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.989	D	0.883	P	0.177	N	1.000	D	1.1	L	3.39	T	-1.125	T	0.031	T	0.647	3.528	18.01	4.09	1.948	3.105	9.483	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.724414	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	172	167	5	0
chr16	20856181	20856181	A	G	intronic	LOC81691	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	10	4	5	0
chr16	20856587	20856587	A	A	intronic	LOC81691	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	2086188	2086188	G	T	intronic	SLC9A3R2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	20871420	20871420	T	C	exonic	DCUN1D3	NaN	nonsynonymous SNV	DCUN1D3:NM_173475:exon3:c.A703G:p.I235V	NaN	NaN	NaN	0.49	T	0.017	B	0.016	B	0.000	N	1.000	D	0.095	N	.	.	-1.097	T	0.072	T	0.077	0.979	8.995	2.37	0.500	1.523	9.528	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03205412682854832	NA	0	0	NaN	NA	NA	382	262	120	0
chr16	2093860	2093860	C	G	intronic	NTHL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.900887	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	69	61	8	0
chr16	20947825	20947825	T	T	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	20959966	20959966	A	G	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.210317	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	198	191	7	0
chr16	20963683	20963683	T	T	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	20990488	20990488	C	G	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr16	20990489	20990489	A	G	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr16	20990490	20990490	C	A	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr16	2103242	2103242	C	A	intronic	TSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	2103246	2103246	G	A	intronic	TSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	2103247	2103247	T	C	intronic	TSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	21042337	21042337	T	T	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	21060735	21060735	A	C	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	21060739	21060739	T	C	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	2	8	0
chr16	21060741	21060741	C	T	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.840315	clustered_read_position	REJECT	151	143	8	0
chr16	21060842	21060842	C	G	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.773561	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	225	207	18	0
chr16	2107138	2107138	C	A	exonic	TSC2	NaN	synonymous SNV	TSC2:NM_000548:exon9:c.C807A:p.G269G,TSC2:NM_001077183:exon9:c.C807A:p.G269G,TSC2:NM_001114382:exon9:c.C807A:p.G269G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.011287653931134026	NA	0	0	NaN	NA	NA	30	22	8	1
chr16	21117789	21117789	T	C	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	6	3	0
chr16	21123196	21123196	C	T	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.479681	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	126	116	10	0
chr16	21136495	21136495	C	A	splicing	DNAH3	NM_017539:exon10:c.1404+1G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.732	15.10	5.63	2.665	6.060	18.465	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.24088	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	380	358	22	0
chr16	21145553	21145553	T	G	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	21145554	21145554	G	G	intronic	DNAH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	51	48	0	0
chr16	21170842	21170842	A	A	intronic	TMEM159	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	21181741	21181741	T	C	intronic	TMEM159	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr16	2120324	2120324	G	A	intronic	TSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr16	2120326	2120326	T	C	intronic	TSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr16	2120328	2120328	T	G	intronic	TSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr16	2120329	2120329	G	C	intronic	TSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr16	2120333	2120333	G	A	intronic	TSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr16	21211209	21211209	A	A	intronic	ZP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	21218363	21218363	A	A	intronic	ZP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr16	21220878	21220878	T	A	intronic	ZP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	21221355	21221355	T	T	intronic	ZP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	2123056	2123056	A	C	intronic	TSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	13	7	4	0
chr16	21262126	21262126	C	T	exonic	ANKS4B	NaN	synonymous SNV	ANKS4B:NM_145865:exon2:c.C1239T:p.V413V	rs74405183	NaN	0.0127796	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	80.98545	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	103	62	41	6
chr16	2131824	2131824	A	G	intronic	TSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.17786561264821815	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr16	2132486	2132486	C	T	exonic	TSC2	NaN	synonymous SNV	TSC2:NM_000548:exon32:c.C3864T:p.H1288H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.783751	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	157	151	6	0
chr16	2133854	2133854	G	C	intronic	TSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	30	17	13	0
chr16	2135085	2135085	G	T	intronic	TSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.21052631578947564	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr16	2140248	2140248	A	G	ncRNA_exonic	MIR1225	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.920878	nearby_gap_events	REJECT	32	27	5	0
chr16	2143926	2143926	A	AC	exonic	PKD1	NaN	frameshift substitution	PKD1:NM_000296:exon36:c.10704_10704delinsGT,PKD1:NM_001009944:exon36:c.10707_10707delinsGT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.9068	0	NaN	NA	NA	19	15	4	2
chr16	2147119	2147119	T	C	intronic	PKD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr16	21475040	21475040	T	A	ncRNA_exonic	SMG1P3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	2159349	2159349	A	G	exonic	PKD1	NaN	nonsynonymous SNV	PKD1:NM_000296:exon15:c.T5819C:p.F1940S,PKD1:NM_001009944:exon15:c.T5819C:p.F1940S	NaN	NaN	NaN	0.13	T	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.045	M	-0.74	T	-0.055	T	0.507	D	0.852	2.241	13.45	4.24	2.027	5.700	10.612	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	18	3	15	4
chr16	216086	216086	C	CG	exonic	HBM	NaN	frameshift substitution	HBM:NM_001003938:exon1:c.90_90delinsCG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	20.3053	0	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr16	2166480	2166480	C	G	intronic	PKD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	16.5421	0	NaN	NA	NA	20	15	5	4
chr16	21666697	21666697	A	G	exonic	METTL9	NaN	nonsynonymous SNV	METTL9:NM_001077180:exon5:c.A898G:p.M300V,METTL9:NM_001288659:exon5:c.A781G:p.M261V,METTL9:NM_001288660:exon5:c.A778G:p.M260V,METTL9:NM_016025:exon5:c.A901G:p.M301V	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.811	P	0.879	P	0.000	D	1.000	D	1.545	L	.	.	-0.418	T	0.355	T	0.856	2.777	15.25	6.08	2.333	8.933	14.596	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.345263	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	367	361	6	0
chr16	2169054	2169054	C	T	intronic	PKD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.06436781609195295	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr16	21703085	21703085	A	A	intronic	OTOA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	21721043	21721043	T	C	intronic	OTOA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	15	8	5	0
chr16	21721401	21721401	G	G	exonic	OTOA	NaN	synonymous SNV	OTOA:NM_170664:exon3:c.G325G:p.A109A,OTOA:NM_001161683:exon8:c.G1060G:p.A354A,OTOA:NM_144672:exon12:c.G1297G:p.A433A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	114	88	0	0
chr16	21968494	21968494	T	A	intronic	UQCRC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	21968905	21968905	C	A	intronic	UQCRC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	21983227	21983227	C	A	intronic	UQCRC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr16	21983229	21983229	T	G	intronic	UQCRC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr16	21983230	21983230	T	G	intronic	UQCRC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr16	2199896	2199896	A	C	intronic	RAB26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr16	2199898	2199898	C	A	intronic	RAB26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	22020678	22020678	A	G	intronic	C16orf52	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	22092007	22092007	T	T	intronic	C16orf52	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	22122167	22122167	T	C	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	9	3	5	0
chr16	22122368	22122368	A	A	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	22133001	22133001	C	A	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	22133002	22133002	C	T	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	22133003	22133003	T	G	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	22133006	22133006	A	G	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	rs145176306	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	22133007	22133007	T	G	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	22133008	22133008	A	G	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	22134329	22134329	T	A	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr16	22137464	22137464	T	T	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	22151416	22151416	T	T	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	22152799	22152799	T	T	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	22154171	22154171	A	C	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	84	NaN	NA	NA	61	15	46	0
chr16	2215811	2215811	T	T	intronic	TRAF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	22161286	22161286	A	C	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	rs10521117	NaN	0.135982	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	473.504	0	NaN	NA	NA	127	48	79	6
chr16	22162208	22162208	A	A	intronic	VWA3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	2221402	2221402	C	A	intronic	TRAF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	144	80	64	0
chr16	22229645	22229645	G	T	intronic	EEF2K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr16	22255944	22255944	T	C	intronic	EEF2K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.415553	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	137	131	6	0
chr16	22262514	22262514	C	A	exonic	EEF2K	NaN	synonymous SNV	EEF2K:NM_013302:exon6:c.C489A:p.G163G	rs2303186	NaN	0.521765	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	91.714595	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	71	33	38	28
chr16	2226440	2226440	T	G	intronic	TRAF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.953157	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	55	49	6	0
chr16	22268755	22268755	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	0	3,3	0
chr16	22268756	22268756	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	0	3,3	0
chr16	22269849	22269849	A	G	exonic	EEF2K	NaN	nonsynonymous SNV	EEF2K:NM_013302:exon10:c.A1064G:p.E355G	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.992	D	0.821	P	0.000	D	1.000	D	1.04	L	1.54	T	-1.010	T	0.114	T	0.87	5.240	33	5.8	2.227	7.869	16.161	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	12	7	5	3
chr16	2229577	2229577	C	G	intronic	CASKIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2631578947368443	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr16	22319549	22319549	G	C	intronic	POLR3E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.011847297039258192	NA	0	0	NaN	NA	NA	51	26	25	2
chr16	2232287	2232287	T	A	intronic	CASKIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	2232293	2232293	A	G	intronic	CASKIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	22324873	22324873	T	A	intronic	POLR3E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	22325116	22325116	A	A	intronic	POLR3E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr16	22325301	22325301	T	T	intronic	POLR3E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	22328163	22328163	A	C	intronic	POLR3E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	10	5	4	0
chr16	22334085	22334085	G	A	intronic	POLR3E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.109337	nearby_gap_events	REJECT	299	284	15	0
chr16	22336899	22336899	T	C	intronic	POLR3E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	14	7	7	0
chr16	22337572	22337572	C	T	exonic	POLR3E	NaN	synonymous SNV	POLR3E:NM_001258034:exon17:c.C1731T:p.A577A,POLR3E:NM_001258035:exon17:c.C1731T:p.A577A,POLR3E:NM_001258033:exon18:c.C1839T:p.A613A,POLR3E:NM_001258036:exon18:c.C1839T:p.A613A,POLR3E:NM_018119:exon18:c.C1839T:p.A613A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	3	1
chr16	22337573	22337573	G	C	exonic	POLR3E	NaN	nonsynonymous SNV	POLR3E:NM_001258034:exon17:c.G1732C:p.A578P,POLR3E:NM_001258035:exon17:c.G1732C:p.A578P,POLR3E:NM_001258033:exon18:c.G1840C:p.A614P,POLR3E:NM_001258036:exon18:c.G1840C:p.A614P,POLR3E:NM_018119:exon18:c.G1840C:p.A614P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.009	B	0.027	B	0.006	N	0.907	N	1.01	L	0.86	T	-1.004	T	0.085	T	0.519	2.299	13.64	3.58	1.335	1.708	4.745	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	22337574	22337574	C	T	exonic	POLR3E	NaN	nonsynonymous SNV	POLR3E:NM_001258034:exon17:c.C1733T:p.A578V,POLR3E:NM_001258035:exon17:c.C1733T:p.A578V,POLR3E:NM_001258033:exon18:c.C1841T:p.A614V,POLR3E:NM_001258036:exon18:c.C1841T:p.A614V,POLR3E:NM_018119:exon18:c.C1841T:p.A614V	NaN	NaN	NaN	0	D	0.199	B	0.106	B	0.006	N	0.943	N	1.7	L	1.06	T	-0.919	T	0.114	T	0.144	2.988	15.96	5.56	2.619	4.112	12.421	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	2259276	2259276	T	T	UTR3	BRICD5,MLST8	NM_182563:c.*87A>A;NM_001199173:c.*398T>T,NM_022372:c.*398T>T,NM_001199175:c.*398T>T,NM_001199174:c.*398T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	2282097	2282097	C	T	intronic	E4F1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.955513	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	173	158	15	0
chr16	2282256	2282256	G	A	exonic	E4F1	NaN	nonsynonymous SNV	E4F1:NM_001288776:exon4:c.G500A:p.R167H,E4F1:NM_001288778:exon4:c.G500A:p.R167H,E4F1:NM_004424:exon4:c.G500A:p.R167H	rs26839	NaN	0.995607	0.17	T	0.245	B	0.042	B	0.035	N	1.000	P	-0.69	N	3.3	T	-0.971	T	0.000	T	0.291	1.364	10.49	-6.01	-1.533	-0.663	8.465	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1142.51	0	NaN	NA	NA	40	1	39	25
chr16	2287026	2287026	C	C	intronic	DNASE1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	2287167	2287167	G	A	intronic	DNASE1L2	NaN	NaN	NaN	rs144134171	NaN	0.00579073	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.579946	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	3	7	1
chr16	2287350	2287350	G	G	intronic	DNASE1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	17	17	0	0
chr16	2287351	2287351	C	C	intronic	DNASE1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	16	16	0	0
chr16	2288256	2288256	T	C	intronic	DNASE1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.042962134447842804	NA	0	0	NaN	NA	NA	35	25	10	0
chr16	2293458	2293458	A	A	intronic	ECI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	2295400	2295400	A	G	intronic	ECI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr16	23096797	23096797	T	T	intronic	USP31	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr16	23117821	23117821	G	G	intronic	USP31	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	62	57	0	0
chr16	23117822	23117822	A	A	intronic	USP31	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	62	59	0	0
chr16	23197999	23197999	G	T	intronic	SCNN1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.235072	clustered_read_position	REJECT	28	24	4	0
chr16	23198000	23198000	G	C	intronic	SCNN1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.297438	clustered_read_position	REJECT	27	23	4	0
chr16	23200671	23200671	T	C	intronic	SCNN1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	7	3	0
chr16	23200672	23200672	T	G	intronic	SCNN1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	6	4	0
chr16	23200673	23200673	T	A	intronic	SCNN1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr16	23205657	23205657	G	C	intronic	SCNN1G	NaN	NaN	NaN	rs4247210	NaN	0.298722	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	443.25	0	NaN	NA	NA	57	3	54	17
chr16	2328488	2328488	A	G	intronic	ABCA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	23	4	19	0
chr16	2329261	2329261	C	T	intronic	ABCA3	NaN	NaN	NaN	rs2302035	NaN	0.340455	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	53.9594	22	NaN	NA	NA	23	12	11	26
chr16	2333315	2333315	C	G	exonic	ABCA3	NaN	nonsynonymous SNV	ABCA3:NM_001089:exon26:c.G3907C:p.V1303L	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.005	B	0.014	B	0.001	D	1.000	D	1.5	L	-2.22	D	-0.540	T	0.449	T	0.537	1.582	11.24	1.14	0.354	1.766	8.170	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.577833	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	68	60	8	0
chr16	2335443	2335443	C	A	exonic	ABCA3	NaN	synonymous SNV	ABCA3:NM_001089:exon23:c.G3483T:p.L1161L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.383396	clustered_read_position	REJECT	32	28	4	0
chr16	2335696	2335696	G	T	intronic	ABCA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.90755	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	45	40	5	0
chr16	2335743	2335743	C	A	intronic	ABCA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	2.0938240342682493E-15	NA	0	0	NaN	NA	NA	130	23	107	0
chr16	23360199	23360199	T	C	exonic	SCNN1B	NaN	synonymous SNV	SCNN1B:NM_000336:exon2:c.T279C:p.P93P	rs238547	NaN	0.788538	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.925198	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	25	23	50
chr16	23387047	23387047	T	C	intronic	SCNN1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.124773	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	84	78	6	0
chr16	23387048	23387048	A	T	intronic	SCNN1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.117738	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	70	64	6	0
chr16	23389975	23389975	T	T	intronic	SCNN1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	26	24	0	0
chr16	2339307	2339307	G	C	intronic	ABCA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	20	13	7	0
chr16	23428248	23428248	T	T	intronic	COG7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	2345692	2345692	T	C	exonic	ABCA3	NaN	synonymous SNV	ABCA3:NM_001089:exon18:c.A2313G:p.E771E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.733757	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	198	191	7	0
chr16	23457278	23457278	T	G	exonic	COG7	NaN	synonymous SNV	COG7:NM_153603:exon2:c.A174C:p.T58T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	23457279	23457279	G	A	exonic	COG7	NaN	nonsynonymous SNV	COG7:NM_153603:exon2:c.C173T:p.T58I	NaN	NaN	NaN	0.38	T	0.012	B	0.025	B	0.001	N	0.974	D	0.255	N	0.92	T	-1.054	T	0.062	T	0.16	1.914	12.36	5.64	2.633	3.868	12.062	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	23457280	23457280	T	G	exonic	COG7	NaN	nonsynonymous SNV	COG7:NM_153603:exon2:c.A172C:p.T58P	NaN	NaN	NaN	0.21	T	0.966	D	0.761	P	0.001	N	0.993	D	1.15	L	0.89	T	-0.984	T	0.132	T	0.696	4.336	22.8	5.64	2.127	6.101	11.032	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	2347879	2347879	T	G	exonic	ABCA3	NaN	nonsynonymous SNV	ABCA3:NM_001089:exon16:c.A1940C:p.Q647P	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.34	B	0.4	B	0.129	N	1.000	N	1.105	L	-3.34	D	0.052	D	0.704	D	0.537	2.208	13.34	0.287	-0.025	1.297	9.785	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.127274	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	190	182	8	0
chr16	2347985	2347985	G	A	intronic	ABCA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	29	21	8	17
chr16	23491245	23491245	A	A	intronic	GGA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr16	23497482	23497482	A	G	intronic	GGA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.517591	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	315	294	21	0
chr16	23504849	23504849	A	G	intronic	GGA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	23541289	23541289	A	T	intronic	EARS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr16	23568456	23568456	T	T	intronic	EARS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	23569241	23569241	GC	CA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.75418	0	NaN	NA	NA	11	9	2	0
chr16	23625462	23625462	TA	T,TT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2224.35	0	NaN	NA	NA	227	0	65	10
chr16	23647415	23647415	T	C	exonic	PALB2	NaN	nonsynonymous SNV	PALB2:NM_024675:exon4:c.A452G:p.Q151R	NaN	NaN	NaN	0.64	T	0.004	B	0.004	B	0.898	N	1.000	N	1.265	L	2.54	T	-0.940	T	0.024	T	0.076	0.188	5.012	0.851	0.505	0.094	5.392	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.939024	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	272	265	7	0
chr16	23647767	23647767	A	G	intronic	PALB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	2	4	0
chr16	2367106	2367106	T	T	intronic	ABCA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr16	2367543	2367543	A	C	intronic	ABCA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	23677066	23677066	A	A	intronic	DCTN5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	8	4	0	0
chr16	23695088	23695088	T	G	intronic	PLK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.863059	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	65	60	5	0
chr16	23695089	23695089	G	T	intronic	PLK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.49581	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	59	54	5	0
chr16	2369926	2369926	G	A	intronic	ABCA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.605119	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	147	136	11	0
chr16	23707105	23707105	T	T	intronic	ERN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr16	23711843	23711843	T	T	intronic	ERN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr16	23713395	23713395	C	T	intronic	ERN2	NaN	NaN	NaN	rs8058610	NaN	0.53734	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.894256	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	44
chr16	2371856	2371856	A	A	intronic	ABCA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	23724718	23724718	A	A	UTR5	ERN2	NM_033266:c.-66T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	2376490	2376490	A	A	UTR5	ABCA3	NM_001089:c.-23T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	23966622	23966622	G	A	intronic	PRKCB	NaN	NaN	NaN	rs189876	NaN	0.51238	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	24192303	24192303	A	A	intronic	PRKCB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	24226152	24226152	C	C	UTR3	PRKCB	NM_002738:c.*15C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	24226154	24226154	C	C	UTR3	PRKCB	NM_002738:c.*17C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	243069	243069	A	A	intronic	LUC7L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	24358210	24358210	A	T	intronic	CACNG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	24564879	24564879	GTATATATATATATAT	GTATATATATATATA,GTATATATATATAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	85.1055	0	NaN	NA	NA	9	0	2	3
chr16	2480979	2480979	A	G	intronic	CCNF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.051606	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	168	163	5	0
chr16	24816785	24816785	A	T	intronic	TNRC6A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	24818125	24818125	A	A	intronic	TNRC6A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr16	24828501	24828501	A	A	intronic	TNRC6A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	2482907	2482907	T	T	intronic	CCNF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	24833312	24833312	T	T	intronic	TNRC6A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	8	4	0	0
chr16	2486998	2486998	A	T	intronic	CCNF	NaN	NaN	NaN	rs12921396	NaN	0.80611	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	47.487009	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	21	24	49
chr16	24881148	24881148	T	T	intronic	SLC5A11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr16	24886888	24886888	GGGGGG	GGGGGT,TGGGGT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1130.29	0	NaN	NA	NA	119	0	23	2
chr16	24888762	24888762	T	G	intronic	SLC5A11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	24902194	24902194	T	C	exonic	SLC5A11	NaN	synonymous SNV	SLC5A11:NM_001258412:exon8:c.T459C:p.F153F,SLC5A11:NM_001258411:exon9:c.T564C:p.F188F,SLC5A11:NM_001258413:exon9:c.T477C:p.F159F,SLC5A11:NM_052944:exon9:c.T669C:p.F223F	rs274081	NaN	0.9998	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.825782	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	0	17	53
chr16	249034	249034	G	C	intronic	LUC7L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	249038	249038	T	G	intronic	LUC7L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	249039	249039	C	T	intronic	LUC7L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr16	249040	249040	T	G	intronic	LUC7L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	3	5	0
chr16	249408	249408	A	A	intronic	LUC7L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	24942187	24942187	T	G	exonic	ARHGAP17	NaN	synonymous SNV	ARHGAP17:NM_018054:exon18:c.A2199C:p.P733P,ARHGAP17:NM_001006634:exon19:c.A2433C:p.P811P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.644287	nearby_gap_events	REJECT	50	44	6	0
chr16	24958750	24958750	T	T	intronic	ARHGAP17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	24960889	24960889	A	C	intronic	ARHGAP17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr16	2496966	2496966	A	T	intronic	CCNF	NaN	NaN	NaN	rs12926965	NaN	0.803315	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	2498828	2498828	A	G	intronic	CCNF	NaN	NaN	NaN	rs28417759	NaN	0.803115	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.561831	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	5	13	44
chr16	2498849	2498849	G	A	intronic	CCNF	NaN	NaN	NaN	rs28670436	NaN	0.76258	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.27528	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	5	14	46
chr16	2498882	2498882	T	T	exonic	CCNF	NaN	synonymous SNV	CCNF:NM_001761:exon11:c.T1121T:p.I374I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	20	19	0	0
chr16	2499011	2499011	T	C	intronic	CCNF	NaN	NaN	NaN	rs8060813	NaN	0.803115	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.70817	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	7	8	50
chr16	2504217	2504217	G	G	intronic	CCNF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	25066576	25066576	T	G	intergenic	LOC554206,LCMT1-AS1	dist=22478;dist=45309	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr16	2506822	2506822	T	C	exonic	CCNF	NaN	nonsynonymous SNV	CCNF:NM_001761:exon17:c.T2162C:p.L721P	NaN	NaN	NaN	0.35	T	0.0	B	0.0	B	0.960	N	1.000	N	-1.245	N	1.96	T	-0.964	T	0.016	T	0.148	-0.244	2.826	-0.672	0.016	0.949	9.917	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	337	213	115	0
chr16	2510603	2510603	C	T	intronic	C16orf59	NaN	NaN	NaN	rs4786284	NaN	0.690695	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.748576	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	49
chr16	2511149	2511149	G	G	exonic	C16orf59	NaN	synonymous SNV	C16orf59:NM_025108:exon4:c.G529G:p.A177A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr16	2511671	2511671	T	T	intronic	C16orf59	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	25123449	25123449	A	A	intronic	LCMT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	25176102	25176102	A	A	intronic	LCMT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	2523175	2523175	C	A	intronic	NTN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.482595	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	78	65	13	0
chr16	2523366	2523366	A	G	intronic	NTN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.381778	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	84	78	6	0
chr16	2550236	2550236	G	A	intronic	TBC1D24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.02772	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	50	47	3	0
chr16	25704348	25704348	G	C	exonic	HS3ST4	NaN	nonsynonymous SNV	HS3ST4:NM_006040:exon1:c.G610C:p.G204R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	4.13	H	-1.43	T	0.871	D	0.784	D	0.98	4.775	26.8	3.76	1.916	8.987	14.729	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.757463	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	206	182	24	0
chr16	2578904	2578904	T	T	intronic	AMDHD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr16	2580812	2580812	G	A	exonic	CEMP1	NaN	nonsynonymous SNV	CEMP1:NM_001048212:exon1:c.C263T:p.P88L	NaN	NaN	NaN	0	D	0.001	B	0.0	B	.	.	1.000	N	0	N	0.41	T	-1.068	T	0.065	T	0.078	-0.362	2.293	-3.04	-1.758	-0.395	3.996	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.886597	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	275	261	14	0
chr16	2581079	2581079	A	G	UTR5	CEMP1	NM_001048212:c.-5T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.37353	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	76	71	5	0
chr16	26571885	26571885	G	C	intergenic	HS3ST4,C16orf82	dist=422876;dist=506334	NaN	NaN	rs2520142	NaN	0.581669	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	26885021	26885021	A	A	intergenic	HS3ST4,C16orf82	dist=736012;dist=193198	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	26967178	26967178	A	A	intergenic	HS3ST4,C16orf82	dist=818169;dist=111041	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	27225110	27225110	A	A	intronic	KDM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	27226366	27226366	A	C	intronic	KDM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	25	17	8	0
chr16	27226367	27226367	G	T	intronic	KDM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	25	17	7	0
chr16	27226368	27226368	G	T	intronic	KDM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	25	18	6	0
chr16	27226370	27226370	A	C	intronic	KDM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	23	16	6	0
chr16	27226371	27226371	G	A	intronic	KDM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	23	17	6	0
chr16	27226372	27226372	A	C	intronic	KDM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	23	16	7	0
chr16	27226373	27226373	G	T	intronic	KDM8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	22	16	6	0
chr16	27230261	27230261	T	C	intronic	KDM8	NaN	NaN	NaN	rs75521851	NaN	0.0752796	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	67.977081	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	76	46	30	13
chr16	27234731	27234731	T	G	intergenic	KDM8,NSMCE1	dist=1642;dist=1584	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	27244134	27244134	A	G	intronic	NSMCE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	18	9	9	0
chr16	27353726	27353726	A	A	intronic	IL4R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	27356359	27356359	C	T	intronic	IL4R	NaN	NaN	NaN	rs2074572	NaN	0.291733	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	244.135	0	NaN	NA	NA	21	0	21	20
chr16	27372015	27372015	C	T	intronic	IL4R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.613864	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	151	137	14	0
chr16	27372016	27372016	T	C	intronic	IL4R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.108661	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	151	137	14	0
chr16	2740969	2740969	G	A	intronic	KCTD5	NaN	NaN	NaN	rs79185719	NaN	0.112819	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr16	27441356	27441356	TCCA	TCA,TCAG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	276.757	0	NaN	NA	NA	38	0	6	0
chr16	27448907	27448907	A	G	exonic	IL21R	NaN	nonsynonymous SNV	IL21R:NM_021798:exon4:c.A251G:p.D84G,IL21R:NM_181078:exon4:c.A251G:p.D84G,IL21R:NM_181079:exon5:c.A317G:p.D106G	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.902	P	0.359	B	0.145	N	0.957	N	1.905	M	-3.63	D	0.026	D	0.721	D	0.298	0.531	6.875	2.25	0.223	1.917	5.797	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.127951	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	64	60	4	0
chr16	27456069	27456069	A	A	intronic	IL21R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr16	27475551	27475551	T	C/A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr16	2747857	2747857	C	T	intronic	KCTD5	NaN	NaN	NaN	rs3094475	NaN	0.305312	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	108.882	0	NaN	NA	NA	71	54	17	37
chr16	27495459	27495459	T	G	intronic	GTF3C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	27495461	27495461	C	A	intronic	GTF3C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	27497576	27497576	C	G	intronic	GTF3C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr16	27497577	27497577	T	A	intronic	GTF3C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr16	27497578	27497578	A	G	intronic	GTF3C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr16	27497581	27497581	G	T	intronic	GTF3C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr16	27497582	27497582	G	C	intronic	GTF3C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr16	27499508	27499508	A	G	intronic	GTF3C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr16	27506838	27506838	G	C	intronic	GTF3C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	27506845	27506845	A	G	intronic	GTF3C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	27510117	27510117	C	CA	intronic	GTF3C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.71246	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	791.412	0	NaN	NA	NA	133	0	81	8
chr16	27512699	27512699	A	A	intronic	GTF3C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	27514279	27514279	G	GC	exonic	GTF3C1	NaN	frameshift substitution	GTF3C1:NM_001286242:exon11:c.1808_1808delinsGC,GTF3C1:NM_001520:exon11:c.1808_1808delinsGC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.58515	0	NaN	NA	NA	13	10	3	1
chr16	27518151	27518151	C	A	intronic	GTF3C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.30188	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	140	131	9	0
chr16	27556971	27556971	A	A	intronic	GTF3C1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	2765833	2765833	G	G	exonic	PRSS27	NaN	synonymous SNV	PRSS27:NM_031948:exon3:c.C122C:p.T41T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	32	29	0	0
chr16	2765852	2765852	T	T	exonic	PRSS27	NaN	synonymous SNV	PRSS27:NM_031948:exon3:c.A103A:p.M35M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr16	2765856	2765856	G	G	exonic	PRSS27	NaN	synonymous SNV	PRSS27:NM_031948:exon3:c.C99C:p.N33N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr16	2765871	2765871	G	A	exonic	PRSS27	NaN	synonymous SNV	PRSS27:NM_031948:exon3:c.C84T:p.R28R	rs116457077	NaN	0.00579073	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	15	7.003015	clustered_read_position	REJECT	10	7	3	0
chr16	2766484	2766484	G	G	intronic	PRSS27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	5	0	0
chr16	2766638	2766638	G	C	intronic	PRSS27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	27765394	27765394	T	T	intronic	KIAA0556	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	27897114	27897114	T	C	intronic	GSG1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	2792506	2792506	G	G	ncRNA_intronic	SRRM2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr16	2806353	2806353	C	C	UTR5	SRRM2	NM_016333:c.-13C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	16	12	0	0
chr16	2810281	2810281	G	T	intronic	SRRM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	28117313	28117313	T	T	intronic	XPO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	2811770	2811770	A	A	exonic	SRRM2	NaN	synonymous SNV	SRRM2:NM_016333:exon11:c.A1241A:p.Q414Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	48	42	0	0
chr16	28119040	28119040	A	A	intronic	XPO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	28119875	28119875	A	T	intronic	XPO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	28119877	28119877	T	C	intronic	XPO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	28146702	28146702	A	G	intronic	XPO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	28146703	28146703	A	T	intronic	XPO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	28146707	28146707	C	T	intronic	XPO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	28163950	28163950	T	T	intronic	XPO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr16	28192250	28192250	T	C	intronic	XPO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.603758		KEEP	76	71	5	0
chr16	2821617	2821617	G	T	UTR3	TCEB2	NM_007108:c.*374C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.1334	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	260	246	14	0
chr16	2821989	2821989	C	T	UTR3	TCEB2	NM_007108:c.*2G>A	NaN	NaN	rs78292378	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.44647	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	284	256	28	0
chr16	28291213	28291213	A	G	intergenic	XPO6,SBK1	dist=67974;dist=12627	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	28331856	28331856	G	A	exonic	SBK1	NaN	nonsynonymous SNV	SBK1:NM_001024401:exon4:c.G889A:p.A297T	NaN	NaN	NaN	0.35	T	0.959	D	0.718	P	0.000	D	1.000	D	-0.135	N	-0.13	T	-0.876	T	0.160	T	0.291	2.270	13.55	3.98	1.762	4.314	13.592	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.684939	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	33	30	3	0
chr16	2849133	2849133	T	T	intronic	PRSS41	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr16	2849244	2849244	C	T	intronic	PRSS41	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.669499	nearby_gap_events	REJECT	63	58	5	0
chr16	28493527	28493527	T	T	intronic	CLN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr16	28499875	28499875	C	G	intronic	CLN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.649955	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	55	46	9	5
chr16	28518083	28518083	C	A	intronic	IL27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.91714	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	98	87	11	0
chr16	2855145	2855145	A	A	downstream	PRSS41	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	28597138	28597138	A	A	intronic	CCDC101	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr16	28603393	28603393	T	C	exonic	SULT1A2	NaN	nonsynonymous SNV	SULT1A2:NM_001054:exon8:c.A844G:p.K282E,SULT1A2:NM_177528:exon8:c.A844G:p.K282E	rs27742	NaN	0.986422	0.43	T	0.0	B	0.0	B	0.984	N	1.000	P	0.335	N	-1.41	T	-1.021	T	0.000	T	0.11	-0.271	2.699	-4.61	-1.084	-0.006	7.392	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	117.666	0	NaN	NA	NA	16	0	16	39
chr16	28603864	28603864	A	A	intronic	SULT1A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	28618237	28618237	T	C	intronic	SULT1A1	NaN	NaN	NaN	rs9282862	NaN	0.292532	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	460.185	0	16.079537		KEEP	48	39	9	0
chr16	28618238	28618238	A	G	intronic	SULT1A1	NaN	NaN	NaN	rs7499134	NaN	0.968251	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	135.60735	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	0	48	14
chr16	28631585	28631585	T	G	intronic	SULT1A1	NaN	NaN	NaN	rs1968752	NaN	0.675719	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	297.669	0	NaN	NA	NA	304	203	101	19
chr16	2867450	2867450	G	C	exonic	PRSS21	NaN	synonymous SNV	PRSS21:NM_001270452:exon2:c.G84C:p.P28P,PRSS21:NM_006799:exon2:c.G84C:p.P28P,PRSS21:NM_144956:exon2:c.G84C:p.P28P,PRSS21:NM_144957:exon2:c.G84C:p.P28P	rs71386691	NaN	0.470248	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.12434782608695666	Somatic	16.6481	0	NaN	NA	NA	13	10	3	26
chr16	2880571	2880571	A	A	intronic	ZG16B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	28844284	28844284	A	G	intronic	ATXN2L	NaN	NaN	NaN	rs62036626	ID=COSN165166;OCCURENCE=1(breast)	0.261382	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	138.252	0	NaN	NA	NA	60	31	29	43
chr16	28845584	28845584	C	T	intronic	ATXN2L	NaN	NaN	NaN	rs35725751	NaN	0.302716	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	155.408295	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	137	68	69	19
chr16	28845905	28845905	G	T	exonic	ATXN2L	NaN	nonsynonymous SNV	ATXN2L:NM_007245:exon18:c.G2324T:p.G775V,ATXN2L:NM_017492:exon18:c.G2324T:p.G775V,ATXN2L:NM_145714:exon18:c.G2324T:p.G775V,ATXN2L:NM_148414:exon18:c.G2324T:p.G775V,ATXN2L:NM_148415:exon18:c.G2324T:p.G775V,ATXN2L:NM_148416:exon18:c.G2324T:p.G775V	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.999	D	0.982	D	0.000	D	1.000	D	1.445	L	-0.05	T	-0.293	T	0.412	T	0.932	3.931	20.0	5.46	2.552	8.521	18.069	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	10.0437	0	11.110575	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	35	29	6	1
chr16	28846506	28846506	A	AC	exonic	ATXN2L	NaN	frameshift substitution	ATXN2L:NM_007245:exon19:c.2561_2561delinsAC,ATXN2L:NM_017492:exon19:c.2561_2561delinsAC,ATXN2L:NM_145714:exon19:c.2561_2561delinsAC,ATXN2L:NM_148414:exon19:c.2561_2561delinsAC,ATXN2L:NM_148415:exon19:c.2561_2561delinsAC,ATXN2L:NM_148416:exon19:c.2561_2561delinsAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	21.7551	0	NaN	NA	NA	95	75	55	2
chr16	28846840	28846840	T	G	intronic	ATXN2L	NaN	NaN	NaN	rs56404918	NaN	0.261382	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	78.8969	0	43.232814	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	22	18	47
chr16	28846866	28846866	G	A	intronic	ATXN2L	NaN	NaN	NaN	rs55719896	NaN	0.261382	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.860389	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	44	26	18	47
chr16	28847018	28847018	T	C	exonic	ATXN2L	NaN	nonsynonymous SNV	ATXN2L:NM_007245:exon21:c.T2834C:p.V945A,ATXN2L:NM_017492:exon21:c.T2834C:p.V945A,ATXN2L:NM_145714:exon21:c.T2834C:p.V945A,ATXN2L:NM_148414:exon21:c.T2834C:p.V945A,ATXN2L:NM_148415:exon21:c.T2834C:p.V945A,ATXN2L:NM_148416:exon21:c.T2834C:p.V945A	NaN	NaN	NaN	0.39	T	0.954	P	0.932	D	0.000	D	0.998	D	0.895	L	0.73	T	-0.913	T	0.182	T	0.74	3.007	16.03	5.58	2.131	2.520	14.732	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.719191		KEEP	35	31	4	0
chr16	28847027	28847027	T	C	exonic	ATXN2L	NaN	nonsynonymous SNV	ATXN2L:NM_007245:exon21:c.T2843C:p.I948T,ATXN2L:NM_017492:exon21:c.T2843C:p.I948T,ATXN2L:NM_145714:exon21:c.T2843C:p.I948T,ATXN2L:NM_148414:exon21:c.T2843C:p.I948T,ATXN2L:NM_148415:exon21:c.T2843C:p.I948T,ATXN2L:NM_148416:exon21:c.T2843C:p.I948T	NaN	NaN	NaN	0.44	T	0.99	D	0.878	P	0.000	D	1.000	D	1.04	L	-0.01	T	-0.709	T	0.274	T	0.852	3.256	16.92	5.82	2.222	3.419	15.160	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.017739	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	36	32	4	0
chr16	28847246	28847246	T	C	intronic	ATXN2L	NaN	NaN	NaN	rs12928404	NaN	0.45607	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	280.359	0	NaN	NA	NA	79	31	48	45
chr16	28847258	28847258	A	C	exonic	ATXN2L	NaN	nonsynonymous SNV	ATXN2L:NM_007245:exon22:c.A2900C:p.H967P,ATXN2L:NM_017492:exon22:c.A2900C:p.H967P,ATXN2L:NM_145714:exon22:c.A2900C:p.H967P,ATXN2L:NM_148414:exon22:c.A2900C:p.H967P,ATXN2L:NM_148415:exon22:c.A2900C:p.H967P,ATXN2L:NM_148416:exon22:c.A2900C:p.H967P	NaN	NaN	NaN	0.32	T	0.997	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	1.04	L	-0.82	T	-0.187	T	0.486	T	0.793	3.191	16.68	5.81	2.218	6.810	15.144	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	7.45675	26	NaN	NA	NA	13	11	2	3
chr16	28857681	28857681	A	A	UTR5	TUFM	NM_003321:c.-91T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	28877983	28877983	G	C	exonic	SH2B1	NaN	nonsynonymous SNV	SH2B1:NM_015503:exon1:c.G568C:p.G190R,SH2B1:NM_001145795:exon2:c.G568C:p.G190R,SH2B1:NM_001145796:exon2:c.G568C:p.G190R,SH2B1:NM_001145797:exon2:c.G568C:p.G190R,SH2B1:NM_001145812:exon2:c.G568C:p.G190R	NaN	NaN	NaN	0.34	T	0.739	P	0.21	B	0.026	N	1.000	N	0.55	N	0.75	T	-1.065	T	0.068	T	0.448	2.532	14.43	3.51	0.874	3.152	9.536	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	4.2604349548464396E-4	NA	0	0	NaN	NA	NA	68	52	16	0
chr16	28877985	28877985	C	G	exonic	SH2B1	NaN	synonymous SNV	SH2B1:NM_015503:exon1:c.C570G:p.G190G,SH2B1:NM_001145795:exon2:c.C570G:p.G190G,SH2B1:NM_001145796:exon2:c.C570G:p.G190G,SH2B1:NM_001145797:exon2:c.C570G:p.G190G,SH2B1:NM_001145812:exon2:c.C570G:p.G190G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.008426065927397749	NA	0	0	NaN	NA	NA	49	29	20	0
chr16	28878604	28878604	G	T	intronic	SH2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.036909	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	46	42	4	0
chr16	28878606	28878606	T	C	intronic	SH2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.017284		KEEP	46	42	4	0
chr16	28883270	28883270	C	T	exonic	SH2B1	NaN	synonymous SNV	SH2B1:NM_015503:exon5:c.C1479T:p.P493P,SH2B1:NM_001145795:exon6:c.C1479T:p.P493P,SH2B1:NM_001145796:exon6:c.C1479T:p.P493P,SH2B1:NM_001145797:exon6:c.C1479T:p.P493P,SH2B1:NM_001145812:exon6:c.C1479T:p.P493P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	7.11982	0	11.28258	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	64	56	8	3
chr16	28883271	28883271	TA	CT,TCAA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.40594	0	NaN	NA	NA	17	11	4	0
chr16	28883272	28883272	A	A	exonic	SH2B1	NaN	synonymous SNV	SH2B1:NM_015503:exon5:c.A1481A:p.Y494Y,SH2B1:NM_001145795:exon6:c.A1481A:p.Y494Y,SH2B1:NM_001145796:exon6:c.A1481A:p.Y494Y,SH2B1:NM_001145797:exon6:c.A1481A:p.Y494Y,SH2B1:NM_001145812:exon6:c.A1481A:p.Y494Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	17	13	0	0
chr16	28883274	28883274	C	T	exonic	SH2B1	NaN	nonsynonymous SNV	SH2B1:NM_015503:exon5:c.C1483T:p.P495S,SH2B1:NM_001145795:exon6:c.C1483T:p.P495S,SH2B1:NM_001145796:exon6:c.C1483T:p.P495S,SH2B1:NM_001145797:exon6:c.C1483T:p.P495S,SH2B1:NM_001145812:exon6:c.C1483T:p.P495S	NaN	NaN	NaN	0.61	T	0.999	D	0.961	D	0.007	N	0.997	D	0.345	N	1.48	T	-0.960	T	0.154	T	0.526	4.395	23.3	5.14	2.389	0.457	17.383	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.46135	0	NaN	NA	NA	13	11	2	0
chr16	28883658	28883658	T	C	exonic	SH2B1	NaN	nonsynonymous SNV	SH2B1:NM_015503:exon6:c.T1661C:p.V554A,SH2B1:NM_001145795:exon7:c.T1661C:p.V554A,SH2B1:NM_001145796:exon7:c.T1661C:p.V554A,SH2B1:NM_001145797:exon7:c.T1661C:p.V554A,SH2B1:NM_001145812:exon7:c.T1661C:p.V554A	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.991	D	0.009	N	1.000	D	3.53	H	-3.11	D	0.950	D	0.888	D	0.846	3.803	19.31	4.15	1.973	5.855	9.56	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.392299	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	5	3	2	0
chr16	28883769	28883769	T	T	intronic	SH2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	28883841	28883841	C	T	intronic	SH2B1	NaN	NaN	NaN	rs62037369	NaN	0.19369	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.435574	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	13	5	45
chr16	28884012	28884012	C	T	exonic	SH2B1	NaN	nonsynonymous SNV	SH2B1:NM_015503:exon7:c.C1883T:p.S628F,SH2B1:NM_001145795:exon8:c.C1883T:p.S628F,SH2B1:NM_001145796:exon8:c.C1883T:p.S628F,SH2B1:NM_001145797:exon8:c.C1883T:p.S628F,SH2B1:NM_001145812:exon8:c.C1883T:p.S628F	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.99	D	0.832	P	0.675	N	0.794	D	0.805	L	1.49	T	-0.766	T	0.171	T	0.428	3.140	16.50	5.1	2.363	2.972	12.409	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.731582	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	136	123	13	0
chr16	28884183	28884183	A	T	intronic	SH2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr16	28894010	28894010	A	A	intronic	ATP2A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	28898428	28898428	T	A	intronic	ATP2A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	28898931	28898931	G	C	exonic	ATP2A1	NaN	nonsynonymous SNV	ATP2A1:NM_001286075:exon6:c.G441C:p.W147C,ATP2A1:NM_004320:exon8:c.G816C:p.W272C,ATP2A1:NM_173201:exon8:c.G816C:p.W272C	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	1.96	M	-2.74	D	0.754	D	0.806	D	0.956	3.899	19.82	4.59	1.337	9.838	13.521	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.148288	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	66	60	6	0
chr16	28898932	28898932	C	G	exonic	ATP2A1	NaN	nonsynonymous SNV	ATP2A1:NM_001286075:exon6:c.C442G:p.L148V,ATP2A1:NM_004320:exon8:c.C817G:p.L273V,ATP2A1:NM_173201:exon8:c.C817G:p.L273V	NaN	NaN	NaN	0.75	T	0.0	B	0.003	B	0.004	N	0.954	D	-0.355	N	-2.38	D	-0.629	T	0.329	T	0.351	0.345	5.872	4.59	1.325	1.528	8.392	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.046643	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	66	60	6	0
chr16	28900428	28900428	A	A	intronic	ATP2A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	28912266	28912266	A	A	intronic	ATP2A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	28920250	28920250	A	G	intronic	RABEP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.536346	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	148	143	5	0
chr16	28943883	28943883	C	C	exonic	CD19	NaN	synonymous SNV	CD19:NM_001178098:exon2:c.C305C:p.P102P,CD19:NM_001770:exon2:c.C305C:p.P102P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	22	19	0	0
chr16	28970162	28970162	T	T	exonic	NFATC2IP	NaN	synonymous SNV	NFATC2IP:NM_032815:exon6:c.T971T:p.L324L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	20	14	0	0
chr16	28993624	28993624	G	A	intronic	SPNS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.275828	clustered_read_position	REJECT	42	35	7	1
chr16	28994585	28994585	G	A	exonic	SPNS1	NaN	nonsynonymous SNV	SPNS1:NM_001142449:exon8:c.G1072A:p.A358T,SPNS1:NM_001142451:exon9:c.G1138A:p.A380T,SPNS1:NM_032038:exon10:c.G1294A:p.A432T,SPNS1:NM_001142448:exon11:c.G1294A:p.A432T,SPNS1:NM_001142450:exon11:c.G1075A:p.A359T	NaN	NaN	NaN	0	D	0.927	P	0.742	P	0.000	D	1.000	D	2.86	M	0.34	T	-0.052	T	0.406	T	0.876	4.912	28.3	4.66	2.410	8.999	15.088	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.952048		KEEP	35	28	7	0
chr16	28997258	28997258	C	G	intronic	LAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.400191	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	321	301	20	0
chr16	2903047	2903047	G	C	UTR3	PRSS22	NM_022119:c.*47C>G	NaN	NaN	rs1054912	NaN	0.757788	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.525507	normal_lod	REJECT	3	0	3	31
chr16	2903081	2903081	G	A	UTR3	PRSS22	NM_022119:c.*13C>T	NaN	NaN	rs3743944	NaN	0.517971	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.221601	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	30
chr16	29035539	29035539	A	A	intergenic	LAT,RRN3P2	dist=33435;dist=50624	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr16	2903845	2903845	G	T	intronic	PRSS22	NaN	NaN	NaN	rs2074294	NaN	0.411941	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	102.906	0	NaN	NA	NA	6	1	5	28
chr16	2905897	2905897	A	A	intronic	PRSS22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	29323397	29323397	A	C	ncRNA_intronic	SNX29P2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	2944170	2944170	T	C	intronic	FLYWCH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	29676090	29676090	C	T	exonic	SPN	NaN	synonymous SNV	SPN:NM_001030288:exon2:c.C1041T:p.G347G,SPN:NM_003123:exon2:c.C1041T:p.G347G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.706379	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	63	60	3	0
chr16	29790670	29790670	T	G	intronic	ZG16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.818063	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	128	113	15	5
chr16	29810691	29810691	T	C	exonic	KIF22	NaN	nonsynonymous SNV	KIF22:NM_001256270:exon6:c.T662C:p.L221P,KIF22:NM_007317:exon6:c.T866C:p.L289P,KIF22:NM_001256269:exon7:c.T662C:p.L221P	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.909	P	0.828	P	.	.	1.000	D	0.845	L	-0.9	T	-0.291	T	0.386	T	0.68	3.869	19.66	5.82	2.219	5.216	14.113	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.315729	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	67	56	11	0
chr16	29814167	29814167	A	C	exonic	KIF22	NaN	nonsynonymous SNV	KIF22:NM_001256270:exon9:c.A1154C:p.Q385P,KIF22:NM_007317:exon9:c.A1358C:p.Q453P,KIF22:NM_001256269:exon10:c.A1154C:p.Q385P	NaN	NaN	NaN	0.15	T	0.337	B	0.123	B	.	.	1.000	D	0.695	N	-0.77	T	-0.816	T	0.210	T	0.527	2.386	13.94	3.4	0.988	1.939	8.955	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	33	30	3	0
chr16	29814168	29814168	G	A	exonic	KIF22	NaN	synonymous SNV	KIF22:NM_001256270:exon9:c.G1155A:p.Q385Q,KIF22:NM_007317:exon9:c.G1359A:p.Q453Q,KIF22:NM_001256269:exon10:c.G1155A:p.Q385Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	12	11	1	0
chr16	29814234	29814234	G	A	exonic	KIF22	NaN	synonymous SNV	KIF22:NM_001256270:exon9:c.G1221A:p.V407V,KIF22:NM_007317:exon9:c.G1425A:p.V475V,KIF22:NM_001256269:exon10:c.G1221A:p.V407V	rs2450399	NaN	0.903155	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	145.382783	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	0	52	57
chr16	29824678	29824678	C	G	exonic	PRRT2	NaN	synonymous SNV	PRRT2:NM_001256442:exon2:c.C303G:p.P101P,PRRT2:NM_001256443:exon2:c.C303G:p.P101P,PRRT2:NM_145239:exon2:c.C303G:p.P101P	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.112562	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	137	125	12	0
chr16	29824680	29824680	A	A	exonic	PRRT2	NaN	synonymous SNV	PRRT2:NM_001256442:exon2:c.A305A:p.E102E,PRRT2:NM_001256443:exon2:c.A305A:p.E102E,PRRT2:NM_145239:exon2:c.A305A:p.E102E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr16	29826367	29826367	C	T	UTR3	PRRT2	NM_145239:c.*408C>T,NM_001256442:c.*408C>T,NM_001256443:c.*1092C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr16	29830863	29830863	T	T	intronic	PAGR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr16	29842024	29842024	T	C	intronic	MVP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.584251	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	16	13	3	0
chr16	29888604	29888604	A	G	exonic	SEZ6L2	NaN	synonymous SNV	SEZ6L2:NM_001114100:exon9:c.T1555C:p.L519L,SEZ6L2:NM_001243333:exon10:c.T1765C:p.L589L,SEZ6L2:NM_001114099:exon11:c.T1687C:p.L563L,SEZ6L2:NM_001243332:exon11:c.T1897C:p.L633L,SEZ6L2:NM_012410:exon11:c.T1687C:p.L563L,SEZ6L2:NM_201575:exon11:c.T1897C:p.L633L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.007864	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	108	105	3	0
chr16	29888963	29888963	T	T	intronic	SEZ6L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	29897054	29897054	C	G	exonic	SEZ6L2	NaN	nonsynonymous SNV	SEZ6L2:NM_001114100:exon6:c.G883C:p.G295R,SEZ6L2:NM_001243333:exon7:c.G1093C:p.G365R,SEZ6L2:NM_001114099:exon8:c.G1015C:p.G339R,SEZ6L2:NM_001243332:exon8:c.G1225C:p.G409R,SEZ6L2:NM_012410:exon8:c.G1015C:p.G339R,SEZ6L2:NM_201575:exon8:c.G1225C:p.G409R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	2.505	M	0.11	T	-0.160	T	0.420	T	0.888	4.546	24.6	5.85	2.785	4.712	17.144	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	382.145	0	NaN	NA	NA	38	25	13	2
chr16	29900087	29900087	A	A	intronic	SEZ6L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	29908433	29908433	C	G	exonic	SEZ6L2	NaN	nonsynonymous SNV	SEZ6L2:NM_001243333:exon2:c.G89C:p.R30P,SEZ6L2:NM_001114100:exon3:c.G221C:p.R74P,SEZ6L2:NM_001243332:exon3:c.G221C:p.R74P,SEZ6L2:NM_201575:exon3:c.G221C:p.R74P	rs11649499	ID=COSM435083;OCCURENCE=1(breast)	0.750998	.	.	0.0	B	0.0	B	0.003	N	0.000	P	-0.345	N	0.9	T	-0.997	T	0.000	T	0.432	-1.806	0.009	2.85	0.600	0.504	7.503	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	101.063	0	29.853802	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	0	10	29
chr16	29922646	29922646	A	G	intronic	KCTD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	29922647	29922647	A	C	intronic	KCTD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	29922650	29922650	G	C	intronic	KCTD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	29922652	29922652	G	T	intronic	KCTD13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	29934532	29934532	C	A	exonic	KCTD13	NaN	nonsynonymous SNV	KCTD13:NM_178863:exon2:c.G393T:p.E131D	NaN	NaN	NaN	0.38	T	0.025	B	0.034	B	0.013	N	0.600	D	0.67	N	-1.12	T	-0.876	T	0.206	T	0.212	2.366	13.87	2.71	0.480	-0.333	2.934	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.023606	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	135	131	4	0
chr16	29979315	29979315	T	T	intronic	TMEM219	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr16	2998629	2998629	T	G	intronic	FLYWCH1	NaN	NaN	NaN	rs8050688	NaN	0.36861	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.23928	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	16	15	16
chr16	29992960	29992960	T	C	intronic	TAOK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	37	23	13	0
chr16	29996633	29996633	G	A	exonic	TAOK2	NaN	nonsynonymous SNV	TAOK2:NM_001252043:exon14:c.G1522A:p.A508T,TAOK2:NM_004783:exon14:c.G1522A:p.A508T,TAOK2:NM_016151:exon14:c.G1522A:p.A508T	NaN	NaN	NaN	.	.	0.801	P	0.264	B	0.000	D	1.000	D	1.56	L	1.66	T	-1.101	T	0.078	T	0.385	5.054	30	5.62	2.651	9.869	18.429	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.96253	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	89	81	8	0
chr16	30002074	30002074	A	A	intronic	TAOK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	176	129	0	0
chr16	30002777	30002777	G	C	exonic	TAOK2	NaN	nonsynonymous SNV	TAOK2:NM_004783:exon19:c.G3038C:p.G1013A	NaN	NaN	NaN	.	.	0.972	D	0.899	P	.	.	1.000	D	1.25	L	-0.93	T	-0.333	T	0.413	T	0.162	2.929	15.76	4.29	1.185	9.568	11.859	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	13	12	1	0
chr16	30002778	30002778	C	A	exonic	TAOK2	NaN	synonymous SNV	TAOK2:NM_004783:exon19:c.C3039A:p.G1013G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	45	43	2	0
chr16	30002779	30002779	A	A	exonic	TAOK2	NaN	synonymous SNV	TAOK2:NM_004783:exon19:c.A3040A:p.S1014S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	48	46	0	0
chr16	3000375	3000375	C	A	UTR3	FLYWCH1	NM_032296:c.*1647C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr16	30005331	30005331	G	G	exonic	HIRIP3	NaN	synonymous SNV	HIRIP3:NM_003609:exon4:c.C1135C:p.Q379Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	75	60	0	0
chr16	30080818	30080818	A	G	splicing	ALDOA	NM_000034:exon12:c.625-2A>G,NM_184043:exon7:c.625-2A>G,NM_001127617:exon7:c.625-2A>G,NM_184041:exon7:c.625-2A>G,NM_001243177:exon8:c.787-2A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.789	19.24	5.91	2.269	7.294	15.326	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.227623	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	79	74	5	0
chr16	30080819	30080819	G	T	splicing	ALDOA	NM_000034:exon12:c.625-1G>T,NM_184043:exon7:c.625-1G>T,NM_001127617:exon7:c.625-1G>T,NM_184041:exon7:c.625-1G>T,NM_001243177:exon8:c.787-1G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.534	18.04	5.91	2.813	6.225	19.068	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.331576	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	79	74	5	0
chr16	30087960	30087960	A	G	intronic	PPP4C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	39	22	17	0
chr16	30094017	30094017	G	A	intronic	PPP4C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.863271	clustered_read_position	REJECT	40	35	5	2
chr16	30096469	30096469	G	G	UTR3	PPP4C	NM_001303504:c.*86G>G,NM_002720:c.*86G>G,NM_001303503:c.*86G>G,NM_001303506:c.*86G>G,NM_001303507:c.*86G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	23	18	0	0
chr16	30097677	30097677	C	T	exonic	TBX6	NaN	nonsynonymous SNV	TBX6:NM_004608:exon9:c.G1180A:p.G394R	NaN	NaN	0.000199681	0.47	T	0.392	B	0.212	B	0.050	N	1.000	N	0.695	N	-2.13	D	-0.502	T	0.484	T	0.682	2.083	12.92	3.16	1.210	1.875	9.791	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	45	27	18	0
chr16	30100230	30100230	C	A	intronic	TBX6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	30100232	30100232	A	C	intronic	TBX6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	21	15	6	0
chr16	30119913	30119913	A	A	intronic	GDPD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	30122881	30122881	T	T	intronic	GDPD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr16	30128238	30128238	G	A	exonic	MAPK3	NaN	stopgain	MAPK3:NM_001109891:exon6:c.C862T:p.Q288X,MAPK3:NM_001040056:exon7:c.C994T:p.Q332X,MAPK3:NM_002746:exon7:c.C994T:p.Q332X	NaN	NaN	NaN	0.59	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.149	13.14	3.87	0.784	7.771	12.045	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	32	17	15	0
chr16	30128240	30128240	T	A	exonic	MAPK3	NaN	nonsynonymous SNV	MAPK3:NM_001109891:exon6:c.A860T:p.E287V,MAPK3:NM_001040056:exon7:c.A992T:p.E331V,MAPK3:NM_002746:exon7:c.A992T:p.E331V	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.748	P	0.349	B	0.000	D	1.000	D	2.84	M	2.78	T	-0.226	T	0.403	T	0.609	2.840	15.46	4.79	1.066	6.103	10.882	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	32	17	15	0
chr16	30128242	30128242	C	A	exonic	MAPK3	NaN	synonymous SNV	MAPK3:NM_001109891:exon6:c.G858T:p.L286L,MAPK3:NM_001040056:exon7:c.G990T:p.L330L,MAPK3:NM_002746:exon7:c.G990T:p.L330L	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.759	T	0.225	T	.	-1.115	0.130	4.92	1.469	4.815	9.372	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	32	17	15	0
chr16	30128243	30128243	A	T	exonic	MAPK3	NaN	nonsynonymous SNV	MAPK3:NM_001109891:exon6:c.T857A:p.L286Q,MAPK3:NM_001040056:exon7:c.T989A:p.L330Q,MAPK3:NM_002746:exon7:c.T989A:p.L330Q	NaN	NaN	NaN	0	D	0.992	D	0.822	P	0.000	D	1.000	D	3.595	H	2.19	T	0.209	D	0.543	D	0.834	2.738	15.12	4.8	1.064	9.120	10.926	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	65	NaN	NA	NA	33	16	15	0
chr16	30128244	30128244	G	T	exonic	MAPK3	NaN	nonsynonymous SNV	MAPK3:NM_001109891:exon6:c.C856A:p.L286M,MAPK3:NM_001040056:exon7:c.C988A:p.L330M,MAPK3:NM_002746:exon7:c.C988A:p.L330M	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.964	D	0.811	P	0.000	D	1.000	D	2.24	M	2.26	T	-0.866	T	0.164	T	0.361	2.437	14.11	-3.31	-0.363	1.814	3.356	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	33	18	15	0
chr16	30128245	30128245	G	T	exonic	MAPK3	NaN	stopgain	MAPK3:NM_001109891:exon6:c.C855A:p.Y285X,MAPK3:NM_001040056:exon7:c.C987A:p.Y329X,MAPK3:NM_002746:exon7:c.C987A:p.Y329X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.132	13.09	3.92	0.825	2.262	8.857	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	62	NaN	NA	NA	33	17	15	0
chr16	30128246	30128246	T	T	exonic	MAPK3	NaN	synonymous SNV	MAPK3:NM_001109891:exon6:c.A854A:p.Y285Y,MAPK3:NM_001040056:exon7:c.A986A:p.Y329Y,MAPK3:NM_002746:exon7:c.A986A:p.Y329Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	44	34	0	0
chr16	30133485	30133485	A	A	intronic	MAPK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr16	3016514	3016514	A	A	intronic	KREMEN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr16	30198728	30198728	C	A	exonic	CORO1A	NaN	nonsynonymous SNV	CORO1A:NM_007074:exon6:c.C662A:p.T221N,CORO1A:NM_001193333:exon7:c.C662A:p.T221N	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.404	B	0.052	B	0.000	D	0.632	D	1.08	L	0.16	T	-0.762	T	0.127	T	0.174	1.980	12.58	5.44	2.576	1.724	12.192	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.479621	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	297	279	18	0
chr16	3024602	3024602	C	T	exonic	PKMYT1	NaN	nonsynonymous SNV	PKMYT1:NM_001258450:exon5:c.G721A:p.E241K,PKMYT1:NM_001258451:exon5:c.G901A:p.E301K,PKMYT1:NM_004203:exon5:c.G928A:p.E310K,PKMYT1:NM_182687:exon5:c.G928A:p.E310K	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.414	B	0.261	B	0.000	N	1.000	D	1.71	L	1.85	T	-1.105	T	0.067	T	0.368	3.482	17.82	4.29	1.212	5.301	11.647	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.114332	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	184	172	12	0
chr16	3026501	3026501	T	C	intronic	PKMYT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr16	3029514	3029514	T	T	intronic	PKMYT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	30367976	30367976	G	T	downstream	TBC1D10B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	30369960	30369960	G	C	intronic	TBC1D10B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.214066	nearby_gap_events	REJECT	192	179	13	0
chr16	30386062	30386062	T	A	upstream	MYLPF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	30386064	30386064	G	A	upstream	MYLPF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	30386065	30386065	G	T	upstream	MYLPF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	30386066	30386066	T	C	upstream	MYLPF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	30386067	30386067	A	C	upstream	MYLPF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	30386068	30386068	T	C	upstream	MYLPF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	30388951	30388951	T	C	intronic	MYLPF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	30390314	30390314	T	C	intronic	SEPT1,ZNF48	NaN	NaN	NaN	rs12447833	NaN	0.819888	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.851296	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	14	13	52
chr16	30393624	30393624	C	T	exonic	SEPT1	NaN	synonymous SNV	SEPT1:NM_052838:exon3:c.G207A:p.K69K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.724254	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	150	142	8	0
chr16	30393771	30393771	G	A	intronic	SEPT1,ZNF48	NaN	NaN	NaN	rs4788409	NaN	0.772963	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	67	52	15	50
chr16	30407088	30407088	T	C	UTR5	ZNF48	NM_152652:c.-28T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	22	4	18	0
chr16	30410445	30410445	C	T	UTR3	ZNF48	NM_001214906:c.*17C>T,NM_001214907:c.*17C>T,NM_001214909:c.*17C>T,NM_152652:c.*17C>T	NaN	NaN	rs4788413	NaN	0.81869	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.078205	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	23	15	42
chr16	30505684	30505684	G	A	exonic	ITGAL	NaN	synonymous SNV	ITGAL:NM_001114380:exon10:c.G1116A:p.Q372Q,ITGAL:NM_002209:exon12:c.G1365A:p.Q455Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.894467	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	196	190	6	0
chr16	30516492	30516492	A	G	intronic	ITGAL	NaN	NaN	NaN	rs2073917	NaN	0.593251	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	321.895	0	NaN	NA	NA	22	0	22	49
chr16	30528338	30528338	G	G	exonic	ITGAL	NaN	synonymous SNV	ITGAL:NM_001114380:exon24:c.G2655G:p.L885L,ITGAL:NM_002209:exon26:c.G2907G:p.L969L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	84	67	0	0
chr16	30535890	30535890	T	T	exonic	ZNF768	NaN	synonymous SNV	ZNF768:NM_024671:exon2:c.A1571A:p.Q524Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	36	35	0	0
chr16	30537055	30537055	C	G	exonic	ZNF768	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF768:NM_024671:exon2:c.G406C:p.E136Q	NaN	NaN	NaN	0.38	T	0.872	P	0.659	P	0.000	D	0.968	N	0.695	N	3.23	T	-1.026	T	0.023	T	0.364	0.653	7.505	4.16	2.600	1.451	10.398	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.972435	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	81	73	8	0
chr16	30537473	30537473	A	T	intronic	ZNF768	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	30544473	30544473	C	T	splicing	ZNF747	NM_001305018:exon4:c.344-1G>A,NM_023931:exon3:c.484-1G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1.630	11.41	1.72	0.460	1.127	8.542	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.180857	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	269	260	9	0
chr16	30545862	30545862	A	A	exonic	ZNF747	NaN	synonymous SNV	ZNF747:NM_001305018:exon1:c.T139T:p.S47S,ZNF747:NM_001305019:exon1:c.T139T:p.S47S,ZNF747:NM_001305020:exon1:c.T139T:p.S47S,ZNF747:NM_023931:exon1:c.T139T:p.S47S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	28	22	0	0
chr16	30545867	30545867	T	A	exonic	ZNF747	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF747:NM_001305018:exon1:c.A134T:p.Y45F,ZNF747:NM_001305019:exon1:c.A134T:p.Y45F,ZNF747:NM_001305020:exon1:c.A134T:p.Y45F,ZNF747:NM_023931:exon1:c.A134T:p.Y45F	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.999	D	0.994	D	.	.	0.998	N	1.77	L	4.54	T	-1.028	T	0.019	T	0.392	3.061	16.22	2.5	1.393	1.641	6.892	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.395579	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	21	18	3	0
chr16	30621434	30621434	A	A	UTR5	ZNF689	NM_138447:c.-72T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr16	3064093	3064093	C	T	UTR3	CLDN9	NM_020982:c.*76C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	33	31	2	0
chr16	3064094	3064094	T	T	UTR3	CLDN9	NM_020982:c.*77T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	53	46	0	0
chr16	30661403	30661403	G	C	upstream	PRR14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr16	30663223	30663223	C	C	exonic	PRR14	NaN	synonymous SNV	PRR14:NM_024031:exon3:c.C130C:p.L44L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	109	93	0	0
chr16	30666332	30666332	G	T	exonic	PRR14	NaN	nonsynonymous SNV	PRR14:NM_024031:exon8:c.G1041T:p.W347C	NaN	NaN	NaN	0.17	T	1.0	D	0.961	D	0.053	N	1.000	D	2.075	M	0.72	T	-0.672	T	0.279	T	0.662	3.495	17.87	5.77	2.726	3.692	16.900	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	2.625111	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	40	38	2	0
chr16	30667040	30667040	A	G	intronic	PRR14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	13	4	9	0
chr16	30679961	30679961	T	A	exonic	FBRS	NaN	nonsynonymous SNV	FBRS:NM_001105079:exon10:c.T595A:p.F199I	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.05	B	0.031	B	0.001	D	0.514	D	0.49	N	1.54	T	-1.032	T	0.051	T	0.403	3.824	19.42	5.05	1.902	1.676	13.781	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	29	29	0	0
chr16	3071500	3071500	A	C	intronic	TNFRSF12A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	39	26	7	1
chr16	3071545	3071545	C	T	intronic	TNFRSF12A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.34210526315789824	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr16	3071574	3071574	C	G	exonic	TNFRSF12A	NaN	nonsynonymous SNV	TNFRSF12A:NM_016639:exon3:c.C218G:p.A73G	NaN	NaN	NaN	0.15	T	0.025	B	0.057	B	0.008	N	0.951	D	0.805	L	.	.	-0.920	T	0.135	T	0.123	2.473	14.23	4.58	2.375	1.411	12.770	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr16	30722407	30722407	A	C	exonic	SRCAP	NaN	nonsynonymous SNV	SRCAP:NM_006662:exon10:c.A1316C:p.E439A	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	1.995	M	-3.05	D	0.839	D	0.839	D	0.363	3.032	16.12	5.28	2.225	8.611	14.342	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.40983	0	NaN	NA	NA	16	13	2	0
chr16	30732116	30732116	G	C	exonic	SRCAP	NaN	nonsynonymous SNV	SRCAP:NM_006662:exon20:c.G3070C:p.V1024L	NaN	NaN	NaN	0.44	T	0.0	B	0.001	B	0.041	N	1.000	N	0	N	-2.67	D	-0.730	T	0.371	T	0.078	0.600	7.235	-0.273	-0.136	1.127	5.453	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.447911	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	18	12	6	0
chr16	3073280	3073280	A	G	exonic	HCFC1R1	NaN	nonsynonymous SNV	HCFC1R1:NM_001002017:exon2:c.T178C:p.Y60H,HCFC1R1:NM_001288667:exon2:c.T229C:p.Y77H,HCFC1R1:NM_001288666:exon3:c.T178C:p.Y60H,HCFC1R1:NM_001288668:exon3:c.T46C:p.Y16H,HCFC1R1:NM_017885:exon3:c.T235C:p.Y79H,HCFC1R1:NM_001002018:exon4:c.T235C:p.Y79H,HCFC1R1:NM_001288665:exon4:c.T235C:p.Y79H	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.988	D	0.009	N	0.765	D	0.695	N	0.35	T	-0.500	T	0.209	T	0.683	3.556	18.13	5.45	2.086	4.608	11.909	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.451256	nearby_gap_events	REJECT	40	34	6	0
chr16	30735014	30735014	T	C	exonic	SRCAP	NaN	synonymous SNV	SRCAP:NM_006662:exon25:c.T4269C:p.L1423L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.475	0	NaN	NA	NA	174	144	35	30
chr16	3074426	3074426	G	C	intronic	THOC6	NaN	NaN	NaN	rs56708449	NaN	0.167332	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	52.0986	0	24.794249	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	16	11	22
chr16	30744912	30744912	T	C	intronic	SRCAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.304134	nearby_gap_events	REJECT	194	175	19	0
chr16	30747778	30747778	T	C	intronic	SRCAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.83111	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	224	216	8	0
chr16	30750561	30750561	C	T	exonic	SRCAP	NaN	nonsynonymous SNV	SRCAP:NM_006662:exon34:c.C9200T:p.A3067V	NaN	NaN	NaN	0	D	0.001	B	0.004	B	0.005	N	0.924	N	0	N	-3.05	D	-0.333	T	0.508	D	0.28	1.414	10.66	4.17	1.387	2.485	10.995	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.443253	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	12	9	3	0
chr16	30767448	30767448	T	T	intronic	PHKG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr16	30773822	30773822	T	C	UTR5	RNF40	NM_001207034:c.-45T>C,NM_014771:c.-45T>C,NM_001207033:c.-45T>C,NM_001286572:c.-45T>C	NaN	NaN	rs1550477	NaN	0.967452	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	95.41701	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	0	32	57
chr16	30779777	30779777	T	T	exonic	RNF40	NaN	synonymous SNV	RNF40:NM_001207034:exon11:c.T1605T:p.D535D,RNF40:NM_001207033:exon13:c.T1905T:p.D635D,RNF40:NM_001286572:exon13:c.T1905T:p.D635D,RNF40:NM_014771:exon13:c.T1905T:p.D635D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	40	38	0	0
chr16	30780828	30780828	A	G	exonic	RNF40	NaN	synonymous SNV	RNF40:NM_001207034:exon15:c.A2193G:p.L731L,RNF40:NM_001207033:exon17:c.A2493G:p.L831L,RNF40:NM_001286572:exon17:c.A2493G:p.L831L,RNF40:NM_014771:exon17:c.A2493G:p.L831L	rs4889506	NaN	0.98143	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.516055	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	0	26	57
chr16	30785352	30785352	C	T	exonic	RNF40	NaN	nonsynonymous SNV	RNF40:NM_001207034:exon18:c.C2623T:p.R875C,RNF40:NM_001207033:exon20:c.C2920T:p.R974C,RNF40:NM_001286572:exon20:c.C2923T:p.R975C,RNF40:NM_014771:exon20:c.C2923T:p.R975C	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	1.425	L	-0.28	T	-0.167	T	0.413	T	0.823	5.176	32	4.82	2.514	7.286	16.830	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.551165	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	216	210	6	0
chr16	30792983	30792983	A	G	UTR3	ZNF629	NM_001080417:c.*56T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.642128	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	326	291	35	0
chr16	30793224	30793224	A	G	exonic	ZNF629	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF629:NM_001080417:exon3:c.T2425C:p.S809P	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.0	B	0.0	B	0.566	N	1.000	N	0	N	2.78	T	-0.975	T	0.013	T	0.067	1.260	10.11	-4.3	-0.748	0.529	8.571	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.94689	0	NaN	NA	NA	14	12	2	0
chr16	30795795	30795795	G	G	exonic	ZNF629	NaN	synonymous SNV	ZNF629:NM_001080417:exon2:c.C9C:p.P3P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr16	30899365	30899365	T	C	ncRNA_intronic	MIR762HG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.365898	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	95	92	3	0
chr16	30903931	30903931	G	C	exonic	BCL7C	NaN	nonsynonymous SNV	BCL7C:NM_001286526:exon4:c.C418G:p.P140A,BCL7C:NM_004765:exon4:c.C418G:p.P140A	NaN	NaN	NaN	0.13	T	0.738	P	0.392	B	0.000	D	0.980	D	2.16	M	0.79	T	-0.752	T	0.188	T	0.34	3.771	19.14	4.11	1.255	5.089	12.503	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	34	24	10	0
chr16	30903932	30903932	C	C	exonic	BCL7C	NaN	synonymous SNV	BCL7C:NM_001286526:exon4:c.G417G:p.Q139Q,BCL7C:NM_004765:exon4:c.G417G:p.Q139Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	63	51	0	0
chr16	30904624	30904624	G	G	ncRNA_intronic	MIR762HG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	115	94	0	0
chr16	30937357	30937357	A	A	intronic	FBXL19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr16	30938811	30938811	A	G	intronic	FBXL19	NaN	NaN	NaN	rs12930545	NaN	0.493211	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	53.421278	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	0	21	47
chr16	30964757	30964757	T	C	exonic	ORAI3	NaN	synonymous SNV	ORAI3:NM_152288:exon2:c.T480C:p.F160F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.850124	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	278	271	7	0
chr16	30964940	30964940	A	G	exonic	ORAI3	NaN	synonymous SNV	ORAI3:NM_152288:exon2:c.A663G:p.Q221Q	rs9926903	NaN	0.988219	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	160.385432	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	63	0	63	57
chr16	30972465	30972465	T	T	intronic	SETD1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	3097568	3097568	C	A	intronic	MMP25	NaN	NaN	NaN	rs3743937	NaN	0.151358	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	17	16.762504	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	8	7	18
chr16	30975740	30975740	A	A	intronic	SETD1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr16	30978803	30978803	T	C	intronic	SETD1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	0	8	0
chr16	30980765	30980765	G	T	exonic	SETD1A	NaN	nonsynonymous SNV	SETD1A:NM_014712:exon11:c.G2910T:p.Q970H	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.99	D	0.73	P	0.001	N	0.685	N	1.39	L	0.37	T	-0.753	T	0.166	T	0.348	1.572	11.21	3.48	1.582	0.413	6.059	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.97325		KEEP	50	46	4	0
chr16	30991099	30991099	C	A	exonic	SETD1A	NaN	nonsynonymous SNV	SETD1A:NM_014712:exon14:c.C3992A:p.P1331Q	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.989	D	0.648	P	0.000	D	0.899	D	0.805	L	-3.25	D	0.525	D	0.700	D	0.452	1.838	12.10	4.81	2.220	4.317	11.021	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.47818	0	NaN	NA	NA	13	9	4	0
chr16	30991453	30991453	G	A	exonic	SETD1A	NaN	nonsynonymous SNV	SETD1A:NM_014712:exon14:c.G4346A:p.R1449Q	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.014	B	0.005	B	0.000	N	0.981	D	1.32	L	-3.41	D	0.058	D	0.655	D	0.226	1.931	12.41	2.92	0.782	2.854	9.148	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.426341	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	264	258	6	0
chr16	30999142	30999142	A	G	exonic	HSD3B7	NaN	nonsynonymous SNV	HSD3B7:NM_025193:exon7:c.A748G:p.T250A	rs9938550	NaN	0.493411	0.64	T	0.0	B	0.001	B	0.796	N	1.000	P	.	.	-1.81	D	-0.972	T	0.000	T	0.008	-0.576	1.407	0.275	0.134	-0.060	1.683	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	18.2925	0	NaN	NA	NA	18	13	5	16
chr16	31008411	31008411	A	G	intronic	STX1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.310725	nearby_gap_events	REJECT	43	38	5	0
chr16	31008415	31008415	A	A	intronic	STX1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	44	40	0	0
chr16	31013069	31013069	A	A	intronic	STX1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr16	31049675	31049675	A	G	intronic	STX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	3109107	3109107	A	G	ncRNA_exonic	MMP25-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	31091504	31091504	G	T	exonic	ZNF646	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF646:NM_014699:exon2:c.G3859T:p.G1287W	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.176	B	0.054	B	.	.	1.000	N	0.99	L	2.93	T	-1.010	T	0.022	T	0.359	1.185	9.817	4.38	1.222	2.803	6.230	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.749421	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	279	256	23	0
chr16	31093099	31093099	A	A	intronic	ZNF646	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	13	10	0	0
chr16	31095643	31095643	GCCCCAG	GCCCAGC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	155.424	0	NaN	NA	NA	22	0	11	3
chr16	31095861	31095861	T	T	intronic	PRSS53	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	31098185	31098185	C	T	exonic	PRSS53	NaN	nonsynonymous SNV	PRSS53:NM_001039503:exon4:c.G277A:p.V93I	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.997	D	0.994	D	0.006	U	0.528	N	1.05	L	-2.4	D	0.383	D	0.712	D	0.36	2.599	14.65	5.75	2.720	2.426	16.858	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.456411	nearby_gap_events	REJECT	25	21	4	0
chr16	31105666	31105666	A	G	intronic	VKORC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	.	.	0.999	N	.	.	.	.	-0.980	T	0.113	T	0.122	0.843	8.407	2.14	1.243	0.134	6.288	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	31105675	31105675	C	A	intronic	VKORC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-0.977	T	0.066	T	0.116	0.253	5.369	-1.3	-0.269	-0.856	0.520	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	31123386	31123386	C	C	UTR3	BCKDK	NM_001271926:c.*34C>C,NM_001122957:c.*34C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	37	31	0	0
chr16	31142382	31142382	C	G	UTR3	KAT8	NM_182958:c.*69C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	39.078	0	NaN	NA	NA	77	58	19	16
chr16	31146711	31146711	C	A	intronic	PRSS8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.549991	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	71	41	30	0
chr16	31154146	31154146	G	A	exonic	PRSS36	NaN	synonymous SNV	PRSS36:NM_001258290:exon9:c.C1269T:p.S423S,PRSS36:NM_001258291:exon9:c.C1269T:p.S423S,PRSS36:NM_173502:exon9:c.C1269T:p.S423S	rs1549299	NaN	0.488618	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	50.1427	0	19.358022	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	16
chr16	31160763	31160763	G	C	intronic	PRSS36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	65	11	54	0
chr16	3118086	3118086	C	T	intronic	IL32	NaN	NaN	NaN	rs148340020	NaN	0.00399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	179.777	0	NaN	NA	NA	115	56	59	0
chr16	31191482	31191482	A	G	UTR5	FUS	NM_004960:c.-54A>G,NM_001170634:c.-54A>G,NM_001170937:c.-54A>G	NaN	NaN	rs929867	NaN	0.939097	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	125.144775	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	0	45	58
chr16	3119385	3119385	GT	TC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	26.4655	0	NaN	NA	NA	17	9	3	4
chr16	31195347	31195347	A	A	intronic	FUS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	31202214	31202214	T	T	intronic	FUS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	62	50	0	0
chr16	31228488	31228488	C	G	intronic	TRIM72	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	31230558	31230558	G	A	intronic	TRIM72	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.641742	nearby_gap_events	REJECT	131	124	7	0
chr16	31235574	31235574	T	TC	exonic	TRIM72	NaN	frameshift substitution	TRIM72:NM_001008274:exon7:c.932_932delinsTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.70144	0	NaN	NA	NA	14	12	2	0
chr16	31271391	31271391	T	TG	exonic	ITGAM	NaN	frameshift substitution	ITGAM:NM_000632:exon1:c.6_6delinsTG,ITGAM:NM_001145808:exon1:c.6_6delinsTG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5047	0	NaN	NA	NA	9	6	2	0
chr16	31276652	31276652	T	T	intronic	ITGAM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	31277591	31277591	A	A	intronic	ITGAM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	31287125	31287125	A	C	intronic	ITGAM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	10	0	10	0
chr16	31332786	31332786	T	G	exonic	ITGAM	NaN	nonsynonymous SNV	ITGAM:NM_000632:exon16:c.T1840G:p.S614A,ITGAM:NM_001145808:exon16:c.T1843G:p.S615A	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.071	B	0.168	B	.	.	0.982	N	0.935	L	0.61	T	-0.961	T	0.090	T	0.188	2.127	13.07	-0.182	0.341	1.005	5.344	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.517301	nearby_gap_events	REJECT	50	35	15	0
chr16	31336497	31336497	A	C	intronic	ITGAM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	31336755	31336755	A	G	intronic	ITGAM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	31336764	31336764	T	C	intronic	ITGAM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	13	4	9	0
chr16	31342366	31342366	T	T	intronic	ITGAM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	31366641	31366641	T	T	intronic	ITGAX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	83	65	0	0
chr16	31366642	31366642	G	C	intronic	ITGAX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.701315	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	79	70	9	0
chr16	31366661	31366661	A	A	intronic	ITGAX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	87	82	0	0
chr16	31367184	31367184	T	C	intronic	ITGAX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr16	31371807	31371807	A	A	intronic	ITGAX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	31373270	31373270	G	A	intronic	ITGAX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.292777	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	131	122	9	0
chr16	31384541	31384541	T	C	intronic	ITGAX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	13	7	5	0
chr16	3138989	3138989	A	G	UTR3	ZSCAN10	NM_001282415:c.*103T>C,NM_001282416:c.*103T>C,NM_032805:c.*103T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.980031	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	16	13	3	0
chr16	3140153	3140153	A	A	exonic	ZSCAN10	NaN	synonymous SNV	ZSCAN10:NM_001282415:exon5:c.T100T:p.S34S,ZSCAN10:NM_001282416:exon5:c.T871T:p.S291S,ZSCAN10:NM_032805:exon6:c.T1282T:p.S428S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	15	15	0	0
chr16	3140194	3140194	C	T	exonic	ZSCAN10	NaN	nonsynonymous SNV	ZSCAN10:NM_001282415:exon5:c.G59A:p.R20H,ZSCAN10:NM_001282416:exon5:c.G830A:p.R277H,ZSCAN10:NM_032805:exon6:c.G1241A:p.R414H	NaN	NaN	NaN	0.33	T	1.0	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	1.375	L	-1.14	T	-0.240	T	0.490	T	0.389	3.195	16.70	4.48	2.561	0.044	12.47	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.682318	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	53	46	7	0
chr16	31413235	31413235	T	C	intronic	ITGAD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	31413236	31413236	G	C	intronic	ITGAD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	31413239	31413239	T	G	intronic	ITGAD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	31419284	31419284	A	A	intronic	ITGAD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	31422864	31422864	A	T	intronic	ITGAD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr16	31424473	31424473	T	A	exonic	ITGAD	NaN	synonymous SNV	ITGAD:NM_005353:exon16:c.T1902A:p.A634A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.761107	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	68	63	5	0
chr16	31429373	31429373	T	T	intronic	ITGAD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr16	31446978	31446978	A	G	UTR3	ZNF843	NM_001136509:c.*146T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	31446980	31446980	T	C	UTR3	ZNF843	NM_001136509:c.*144A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr16	31446981	31446981	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	2	3,2	0
chr16	31483622	31483622	C	T	intronic	TGFB1I1	NaN	NaN	NaN	rs11646911	NaN	0.304313	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	50.1292	0	14.290032	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	2
chr16	31488315	31488315	A	A	exonic	TGFB1I1	NaN	synonymous SNV	TGFB1I1:NM_001042454:exon10:c.A1103A:p.D368D,TGFB1I1:NM_001164719:exon10:c.A1052A:p.D351D,TGFB1I1:NM_015927:exon10:c.A1052A:p.D351D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	31488916	31488916	C	G	UTR3	TGFB1I1	NM_001042454:c.*19C>G,NM_001164719:c.*19C>G,NM_015927:c.*19C>G	NaN	NaN	rs10596	NaN	0.305112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	19	0	19	32
chr16	31496448	31496448	A	A	intronic	SLC5A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	31502033	31502033	G	T	UTR3	C16orf58,SLC5A2	NM_022744:c.*123C>A;NM_003041:c.*177G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	31502034	31502034	G	C	UTR3	C16orf58,SLC5A2	NM_022744:c.*122C>G;NM_003041:c.*178G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	31502035	31502035	C	T	UTR3	C16orf58,SLC5A2	NM_022744:c.*121G>A;NM_003041:c.*179C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	31510768	31510768	C	C	intronic	C16orf58	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	41	35	0	0
chr16	31510769	31510769	T	C	intronic	C16orf58	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	13	9	4	0
chr16	31512161	31512161	A	A	intronic	C16orf58	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr16	31540030	31540030	T	C	UTR3	AHSP	NM_016633:c.*18T>C	NaN	NaN	rs10843	NaN	0.0946486	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	167.292	0	NaN	NA	NA	91	58	33	13
chr16	3170188	3170188	C	T	exonic	ZNF205	NaN	synonymous SNV	ZNF205:NM_001042428:exon7:c.C1527T:p.C509C,ZNF205:NM_001278158:exon7:c.C1527T:p.C509C,ZNF205:NM_003456:exon7:c.C1527T:p.C509C	rs12032	NaN	0.384185	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.165244	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	14	8	40
chr16	31724584	31724584	T	T	UTR5	ZNF720	NM_001130913:c.-170T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr16	3188493	3188493	G	T	exonic	ZNF213	NaN	synonymous SNV	ZNF213:NM_001134655:exon3:c.G474T:p.V158V,ZNF213:NM_004220:exon3:c.G474T:p.V158V	NaN	NaN	NaN	0.18	T	.	.	.	.	.	.	0.978	N	.	.	3.58	T	-1.005	T	0.015	T	.	-0.897	0.444	-10.9	-3.055	-1.432	13.873	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	22	21	1	0
chr16	31926619	31926619	G	A	exonic	ZNF267	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF267:NM_003414:exon4:c.G1049A:p.C350Y,ZNF267:NM_001265588:exon5:c.G953A:p.C318Y	rs3850114	NaN	0.855032	1	T	0.0	B	0.0	B	.	.	0.999	P	-2.515	N	2.83	T	-0.988	T	0.000	T	0.116	-0.643	1.164	0.458	-0.490	-0.878	1.412	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1148.52	0	NaN	NA	NA	95	0	95	54
chr16	31927484	31927484	C	A	exonic	ZNF267	NaN	synonymous SNV	ZNF267:NM_003414:exon4:c.C1914A:p.G638G,ZNF267:NM_001265588:exon5:c.C1818A:p.G606G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	3.645296216023127E-7	Somatic	124.394	0	NaN	NA	NA	135	88	47	5
chr16	3194686	3194686	G	A	intergenic	ZNF213,OR1F1	dist=1881;dist=59561	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	324052	324052	A	G	exonic	RGS11	NaN	synonymous SNV	RGS11:NM_001286485:exon5:c.T387C:p.D129D,RGS11:NM_003834:exon6:c.T357C:p.D119D,RGS11:NM_183337:exon6:c.T420C:p.D140D	rs2685126	ID=COSM435194;OCCURENCE=1(breast)	0.738419	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.358922	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	19	10	48
chr16	32487243	32487243	C	A	intergenic	LOC390705,TP53TG3	dist=185941;dist=197606	NaN	NaN	rs28479929	NaN	0.422724	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	22	3	19	0
chr16	3254151	3254151	T	G	upstream	OR1F1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	3254152	3254152	T	C	upstream	OR1F1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	3254155	3254155	A	T	upstream	OR1F1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	3254156	3254156	C	T	upstream	OR1F1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	3273854	3273854	T	C	UTR3	ZNF200	NM_001145448:c.*38A>G,NM_198088:c.*38A>G,NM_198087:c.*38A>G,NM_001145447:c.*38A>G,NM_001145446:c.*38A>G,NM_003454:c.*38A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	3274429	3274429	A	T	exonic	ZNF200	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF200:NM_001145446:exon5:c.T648A:p.N216K,ZNF200:NM_001145447:exon5:c.T648A:p.N216K,ZNF200:NM_001145448:exon5:c.T648A:p.N216K,ZNF200:NM_003454:exon5:c.T651A:p.N217K,ZNF200:NM_198087:exon5:c.T648A:p.N216K,ZNF200:NM_198088:exon5:c.T651A:p.N217K	NaN	NaN	NaN	0.54	T	0.873	P	0.466	P	0.050	N	0.754	N	0.805	L	3.4	T	-1.039	T	0.014	T	0.11	1.550	11.14	3.48	0.992	1.124	6.528	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.776404	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	179	166	13	0
chr16	3297175	3297175	T	C	exonic	MEFV	NaN	synonymous SNV	MEFV:NM_001198536:exon4:c.A795G:p.Q265Q,MEFV:NM_000243:exon5:c.A1428G:p.Q476Q	rs224207	NaN	0.650559	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.51072	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	9	20	41
chr16	3297181	3297181	C	T	exonic	MEFV	NaN	synonymous SNV	MEFV:NM_001198536:exon4:c.G789A:p.E263E,MEFV:NM_000243:exon5:c.G1422A:p.E474E	rs224208	NaN	0.638978	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.817634	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	9	20	41
chr16	3297291	3297291	T	C	intronic	MEFV	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.175689	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	19	15	4	0
chr16	3298837	3298837	T	T	intronic	MEFV	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	3299575	3299575	C	A	exonic	MEFV	NaN	synonymous SNV	MEFV:NM_001198536:exon2:c.G483T:p.L161L,MEFV:NM_000243:exon3:c.G1116T:p.L372L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.297654	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	354	325	29	0
chr16	3304463	3304463	C	T	exonic	MEFV	NaN	nonsynonymous SNV	MEFV:NM_000243:exon2:c.G605A:p.R202Q	rs224222	NaN	0.135982	1	T	0.002	B	0.001	B	0.004	N	1.000	P	0	N	0.03	T	-1.042	T	0.000	T	0.075	-0.601	1.316	-5.23	-1.150	-2.420	1.862	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.246945	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	6	7	13
chr16	3304654	3304654	T	C	exonic	MEFV	NaN	synonymous SNV	MEFV:NM_000243:exon2:c.A414G:p.G138G	rs224224	NaN	0.386581	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	382.75	0	NaN	NA	NA	31	0	31	37
chr16	3304762	3304762	A	G	exonic	MEFV	NaN	synonymous SNV	MEFV:NM_000243:exon2:c.T306C:p.D102D	rs224225	ID=COSM435205;OCCURENCE=1(breast)	0.389377	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	114.595136	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	0	39	42
chr16	3334880	3334880	T	T	intronic	ZNF263	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr16	3350723	3350723	A	A	UTR5	TIGD7	NM_033208:c.-109T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	33527741	33527741	T	C	ncRNA_intronic	RNU6-76P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr16	33527742	33527742	T	C	ncRNA_intronic	RNU6-76P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr16	335373	335373	C	T	exonic	PDIA2	NaN	nonsynonymous SNV	PDIA2:NM_006849:exon6:c.C857T:p.T286M	rs2685127	NaN	0.0810703	0.01	D	0.943	P	0.697	P	0.000	D	0.006	P	1.905	M	2.49	T	-1.072	T	0.000	T	0.136	1.743	11.79	3.87	2.013	2.599	14.729	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.255448	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	23	12	9
chr16	335716	335716	C	T	intronic	PDIA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr16	335717	335717	T	C	intronic	PDIA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	33627440	33627440	T	C	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=40698;dist=333612	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	336396	336396	G	A	exonic	PDIA2	NaN	nonsynonymous SNV	PDIA2:NM_006849:exon8:c.G1163A:p.R388Q	rs400037	NaN	0.16853	1	T	0.005	B	0.005	B	0.760	N	1.000	P	-0.97	N	3.97	T	-0.919	T	0.000	T	0.057	-1.424	0.021	-2.31	-0.251	-0.094	9.788	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.206444	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	14	19	20
chr16	33922647	33922647	T	C	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=335905;dist=38405	NaN	NaN	rs79461597	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	33935327	33935327	C	G	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=348585;dist=25725	NaN	NaN	rs111287395	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	33939375	33939375	C	T	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=352633;dist=21677	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	33939377	33939377	C	A	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=352635;dist=21675	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	33939380	33939380	C	T	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=352638;dist=21672	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	33939409	33939409	G	A	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=352667;dist=21643	NaN	NaN	rs79117630	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	17	9	8	0
chr16	33943673	33943673	C	T	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=356931;dist=17379	NaN	NaN	rs76337904	NaN	0.04373	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	69	NaN	NA	NA	901	370	530	0
chr16	33943774	33943774	A	G	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=357032;dist=17278	NaN	NaN	rs72485953	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr16	33943919	33943919	C	T	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=357177;dist=17133	NaN	NaN	rs76696743	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr16	33943948	33943948	A	C	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=357206;dist=17104	NaN	NaN	rs79205125	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr16	33943953	33943953	C	G	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=357211;dist=17099	NaN	NaN	rs79110264	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr16	33944275	33944275	A	A	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=357533;dist=16777	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr16	33948600	33948600	G	C	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=361858;dist=12452	NaN	NaN	rs111621397	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	1	6	0
chr16	33949264	33949264	G	A	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=362522;dist=11788	NaN	NaN	rs77356870	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	33949575	33949575	G	A	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=362833;dist=11477	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	12	4	8	0
chr16	33957158	33957158	G	C	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=370416;dist=3894	NaN	NaN	rs78624351	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	13	1	12	0
chr16	33957162	33957162	T	G	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=370420;dist=3890	NaN	NaN	rs79978971	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	11	0	11	0
chr16	33957164	33957164	A	G	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=370422;dist=3888	NaN	NaN	rs75473368	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	11	0	11	0
chr16	33957167	33957167	T	C	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=370425;dist=3885	NaN	NaN	rs375222679	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	11	0	11	0
chr16	33959552	33959552	T	C	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=372810;dist=1500	NaN	NaN	rs77946275	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	17	9	8	0
chr16	33959558	33959558	A	A	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=372816;dist=1494	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr16	33959561	33959561	T	T	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=372819;dist=1491	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr16	33959706	33959706	A	C	intergenic	ENPP7P13,LINC00273	dist=372964;dist=1346	NaN	NaN	rs76637885	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr16	33962298	33962298	T	G	ncRNA_exonic	LINC00273	NaN	NaN	NaN	rs72797474	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	.	.	-1.035	T	0.064	T	0.097	-1.707	0.011	-1.94	-2.670	0.224	2.835	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	339645	339645	A	A	intronic	AXIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	33964744	33964744	C	T	intergenic	LINC00273,UBE2MP1	dist=2241;dist=439058	NaN	NaN	rs72797494	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	33965926	33965926	G	G	intergenic	LINC00273,UBE2MP1	dist=3423;dist=437876	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	3433725	3433725	A	C	intronic	ZSCAN32	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.00139776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.579879	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	45	35	10	0
chr16	34341047	34341047	C	A	intergenic	LINC00273,UBE2MP1	dist=378544;dist=62755	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	28	0	20	0
chr16	343457	343457	A	C	intronic	AXIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.945189	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	86	71	15	0
chr16	343726	343726	A	G	intronic	AXIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	34480701	34480701	A	G	intergenic	UBE2MP1,LINC01566	dist=75939;dist=117086	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	3526408	3526408	G	G	intronic	NAA60	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	115	NaN	NA	NA	211	167	0	0
chr16	3534892	3534892	G	A	UTR3	NAA60	NM_001083601:c.*37G>A,NM_001083600:c.*37G>A,NM_024845:c.*37G>A	NaN	NaN	rs13740	NaN	0.563498	0.86	T	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	.	.	-0.962	T	0.000	T	0.128	2.517	14.38	-4.41	-0.537	-2.955	5.289	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	78.302109	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	0	25	53
chr16	3543660	3543660	G	A	UTR3	C16orf90	NM_001080524:c.*179C>T	NaN	NaN	rs116855661	NaN	0.0195687	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	17.9208	21	NaN	NA	NA	13	9	4	0
chr16	3543734	3543734	C	G	UTR3	C16orf90	NM_001080524:c.*105G>C	NaN	NaN	rs75072041	NaN	0.0848642	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	38.6381	0	15.887648	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	8	7	0
chr16	3543820	3543820	G	A	UTR3	C16orf90	NM_001080524:c.*19C>T	NaN	NaN	rs9923182	NaN	0.0309505	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.527066	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	11	7	2
chr16	3544851	3544851	G	A	exonic	C16orf90	NaN	nonsynonymous SNV	C16orf90:NM_001080524:exon2:c.C73T:p.P25S	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.573	P	0.23	B	0.460	U	1.000	N	0.975	L	.	.	-1.059	T	0.062	T	0.165	0.566	7.060	1.07	0.282	0.188	7.770	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.423537	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	119	114	5	0
chr16	3562360	3562360	T	T	intronic	CLUAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	3582934	3582934	A	A	intronic	CLUAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr16	3591964	3591964	A	A	intronic	NLRC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr16	3592165	3592165	T	C	intronic	NLRC3	NaN	NaN	NaN	rs79724354	NaN	0.0778754	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	110.247894	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	0	40	6
chr16	3593580	3593580	A	A	intronic	NLRC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	3594296	3594296	C	T	exonic	NLRC3	NaN	synonymous SNV	NLRC3:NM_178844:exon17:c.G2805A:p.A935A	rs35402060	NaN	0.0583067	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	238.83993	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	78	0	78	6
chr16	3602228	3602228	G	A	splicing	NLRC3	NM_178844:exon11:c.2319+1C>T,NM_178844:exon12:c.2320-1C>T	NaN	NaN	rs201180592	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1.096	9.471	3.81	1.013	0.608	9.103	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr16	3602403	3602403	G	T	intronic	NLRC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	14	7	6	0
chr16	3611638	3611638	T	T	intronic	NLRC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	3613150	3613150	A	G	exonic	NLRC3	NaN	synonymous SNV	NLRC3:NM_178844:exon5:c.T1788C:p.T596T	rs8044743	NaN	0.756989	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	120.897447	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	0	45	47
chr16	3613175	3613175	T	C	exonic	NLRC3	NaN	nonsynonymous SNV	NLRC3:NM_178844:exon5:c.A1763G:p.E588G	NaN	NaN	NaN	0.35	T	0.0	B	0.001	B	0.267	N	1.000	N	.	.	-1.85	D	-0.854	T	0.298	T	0.207	0.225	5.212	-4.9	-0.875	0.179	6.355	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.749436	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	43	39	4	0
chr16	3613904	3613904	C	G	exonic	NLRC3	NaN	nonsynonymous SNV	NLRC3:NM_178844:exon5:c.G1034C:p.S345T	rs117213971	NaN	0.0423323	0.58	T	0.0	B	0.002	B	0.430	N	1.000	N	.	.	-1.79	D	-1.010	T	0.028	T	0.109	-1.636	0.013	-4.9	-0.607	-0.419	9.072	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	49.212275	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	0	20	6
chr16	3632335	3632335	T	C	UTR3	SLX4	NM_032444:c.*8A>G	NaN	NaN	rs3751839	NaN	0.072484	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	72.8707	0	21.863881	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	3
chr16	3632774	3632774	A	G	intronic	SLX4	NaN	NaN	NaN	rs75990295	NaN	0.071885	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	153.661529	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	58	1	57	6
chr16	3634925	3634925	A	A	intronic	SLX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	3642896	3642896	A	A	intronic	SLX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	18	14	0	0
chr16	3645561	3645561	T	T	intronic	SLX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	365024	365024	C	A	intronic	AXIN1	NaN	NaN	NaN	rs7198225	NaN	0.530351	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	3658990	3658990	T	C	UTR5	SLX4	NM_032444:c.-25A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	3707978	3707978	A	A	UTR3	DNASE1	NM_005223:c.*24A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	3712174	3712174	A	A	intronic	TRAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	3721672	3721672	G	A	intronic	TRAP1	NaN	NaN	NaN	rs56373045	NaN	0.0485224	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	819.829	0	NaN	NA	NA	81	1	80	7
chr16	3779147	3779147	C	G	exonic	CREBBP	NaN	nonsynonymous SNV	CREBBP:NM_001079846:exon30:c.G5787C:p.Q1929H,CREBBP:NM_004380:exon31:c.G5901C:p.Q1967H	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.94	P	0.459	P	0.081	N	1.000	D	0.345	N	-1.75	D	-0.393	T	0.374	T	0.593	0.898	8.650	4.21	1.192	4.017	9.893	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.386774	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	14	11	3	0
chr16	3781679	3781679	C	T	intronic	CREBBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.74474	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	91	78	13	0
chr16	3807658	3807658	C	G	intronic	CREBBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	3807659	3807659	C	A	intronic	CREBBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	3819374	3819374	A	G	intronic	CREBBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr16	3819375	3819375	C	G	intronic	CREBBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	9	3	5	0
chr16	3820617	3820617	G	T	exonic	CREBBP	NaN	stopgain	CREBBP:NM_001079846:exon13:c.C2720A:p.S907X,CREBBP:NM_004380:exon14:c.C2834A:p.S945X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.002	N	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	12.893	46	5.87	2.941	6.639	20.583	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.29575	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	80	75	5	0
chr16	3824504	3824504	G	A	intronic	CREBBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	3824506	3824506	T	G	intronic	CREBBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr16	3824508	3824508	C	G	intronic	CREBBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr16	3824510	3824510	T	A	intronic	CREBBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr16	3828870	3828870	A	T	intronic	CREBBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	3831367	3831367	T	T	intronic	CREBBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	185	132	0	0
chr16	4004793	4004793	A	A	intergenic	LOC102724927,ADCY9	dist=4348;dist=7857	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	4027605	4027605	C	T	exonic	ADCY9	NaN	synonymous SNV	ADCY9:NM_001116:exon9:c.G2706A:p.A902A	rs2240735	NaN	0.46845	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	55.032862	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	8	20	51
chr16	4042101	4042101	C	T	intronic	ADCY9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	4042104	4042104	C	G	intronic	ADCY9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	4042414	4042414	G	C	intronic	ADCY9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.367673	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	55	50	5	0
chr16	4042449	4042449	C	T	intronic	ADCY9	NaN	NaN	NaN	rs2239307	NaN	0.558706	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	712.088	0	NaN	NA	NA	62	0	62	42
chr16	410020	410020	G	C	intergenic	AXIN1,MRPL28	dist=7344;dist=7364	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	419027	419027	T	T	intronic	MRPL28	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	422563	422563	T	C	intronic	TMEM8A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.637236	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	368	362	6	0
chr16	4308343	4308343	A	A	intronic	TFAP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	4384912	4384912	T	T	exonic	GLIS2	NaN	synonymous SNV	GLIS2:NM_032575:exon3:c.T456T:p.P152P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	34	30	0	0
chr16	4385323	4385323	A	G	exonic	GLIS2	NaN	nonsynonymous SNV	GLIS2:NM_032575:exon5:c.A704G:p.H235R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.96	D	0.000	D	1.000	D	2.02	M	2.06	T	-0.952	T	0.129	T	0.77	4.814	27.3	5.53	2.114	7.239	14.697	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.145641	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	151	145	6	0
chr16	4386814	4386814	T	C	exonic	GLIS2	NaN	synonymous SNV	GLIS2:NM_032575:exon6:c.T864C:p.Y288Y	rs669561	NaN	0.991214	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	159.611771	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	54	1	53	57
chr16	4393385	4393385	G	G	intronic	CORO7-PAM16,PAM16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	34	33	0	0
chr16	4393387	4393387	A	A	intronic	CORO7-PAM16,PAM16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	4407854	4407854	T	C	intronic	CORO7,CORO7-PAM16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr16	4411153	4411153	C	A	intronic	CORO7,CORO7-PAM16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.003936162949368126	NA	0	27	NaN	NA	NA	37	21	16	0
chr16	4414255	4414255	T	T	intronic	CORO7,CORO7-PAM16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr16	4432029	4432029	A	C	exonic	VASN	NaN	nonsynonymous SNV	VASN:NM_138440:exon2:c.A1151C:p.E384A	rs3810818	ID=COSM435258;OCCURENCE=4(breast)	0.686302	0.7	T	0.0	B	0.001	B	0.963	N	0.559	P	0.895	L	0.48	T	-0.955	T	0.000	T	0.073	-0.188	3.084	0.071	0.386	0.149	2.845	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	261.687599	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	85	0	85	55
chr16	4476089	4476089	T	C	exonic	DNAJA3	NaN	nonsynonymous SNV	DNAJA3:NM_001286516:exon1:c.T97C:p.Y33H	rs1139652	ID=COSM435261,COSM1478877;OCCURENCE=1(breast)	0.641973	0	D	0.298	B	0.062	B	.	.	0.000	P	.	.	0.79	T	-1.006	T	0.000	T	.	2.122	13.05	4.5	0.885	0.090	8.501	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	283.866	0	NaN	NA	NA	25	0	25	31
chr16	450310	450310	G	T	exonic	NME4	NaN	nonsynonymous SNV	NME4:NM_001286433:exon4:c.G430T:p.G144W,NME4:NM_001286436:exon5:c.G322T:p.G108W,NME4:NM_001286440:exon5:c.G322T:p.G108W,NME4:NM_005009:exon5:c.G532T:p.G178W,NME4:NM_001286438:exon6:c.G322T:p.G108W,NME4:NM_001286439:exon6:c.G322T:p.G108W	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.703	P	0.324	B	0.132	N	1.000	N	1.42	L	-0.08	T	-0.958	T	0.128	T	0.292	1.873	12.22	-3.58	-0.372	0.486	1.561	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.406281	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	121	113	8	9
chr16	4557670	4557670	T	T	intronic	HMOX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	456416	456416	T	G	intronic	DECR2	NaN	NaN	NaN	rs3743890	NaN	0.403155	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	50.1428	0	17.045681	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	14
chr16	456483	456483	T	C	intronic	DECR2	NaN	NaN	NaN	rs3785290	NaN	0.620407	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	50.1425	0	NaN	NA	NA	6	0	6	23
chr16	460847	460847	A	T	intronic	DECR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr16	461123	461123	G	C	intronic	DECR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.47189	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	506	474	32	0
chr16	461124	461124	C	G	intronic	DECR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.983638	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	506	475	31	0
chr16	461147	461147	A	A	intronic	DECR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr16	4621725	4621725	GA	G,GC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	411.414	0	NaN	NA	NA	57	0	43	16
chr16	4626094	4626094	A	G	exonic	C16orf96	NaN	nonsynonymous SNV	C16orf96:NM_001145011:exon5:c.A1613G:p.D538G	NaN	NaN	NaN	0.37	T	0.001	B	0.0	B	.	.	1.000	N	0	N	.	.	-1.037	T	0.034	T	0.069	-0.164	3.198	-2.43	-1.590	-0.646	3.166	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	33	22	9	0
chr16	4644248	4644248	A	G	intronic	C16orf96	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.88128	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	41	38	3	0
chr16	4650386	4650386	T	C	downstream	C16orf96	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.12798965740142235	Somatic	10.5732	0	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr16	4660717	4660717	A	A	intronic	UBALD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	4660718	4660718	A	A	intronic	UBALD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	46618086	46618086	A	A	intronic	SHCBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	4664833	4664833	T	G	UTR5	UBALD1	NM_145253:c.-35A>C	NaN	NaN	rs860889	NaN	0.996006	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.521207	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	42
chr16	46652297	46652297	A	G	intronic	SHCBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.547555	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	99	90	9	0
chr16	46654969	46654969	T	T	intronic	SHCBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr16	46655210	46655210	A	G	exonic	SHCBP1	NaN	nonsynonymous SNV	SHCBP1:NM_024745:exon1:c.T62C:p.M21T	rs6598679	NaN	0.983427	0.86	T	0.0	B	0.0	B	0.164	N	1.000	P	0	N	2.06	T	-1.005	T	0.000	T	0.041	-1.266	0.046	-0.124	-0.121	-0.334	3.327	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	96.889974	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	0	34	58
chr16	46695457	46695457	A	T	intronic	VPS35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	46695458	46695458	C	A	intronic	VPS35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	46708623	46708623	A	T	intronic	VPS35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	1	4	0
chr16	46727270	46727270	A	G	intronic	ORC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr16	46729683	46729683	T	A	intronic	ORC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	10	4	3	0
chr16	46743620	46743620	A	A	intronic	MYLK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	4674954	4674954	C	G	UTR5	MGRN1	NM_001142291:c.-8C>G,NM_001142290:c.-8C>G,NM_015246:c.-8C>G,NM_001142289:c.-8C>G	NaN	NaN	rs3747587	NaN	0.652556	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.75303	normal_lod	REJECT	2	0	2	1
chr16	46766066	46766066	T	C	intronic	MYLK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.244645	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	174	166	8	0
chr16	46843719	46843719	A	G	intronic	C16orf87	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr16	46919951	46919951	A	C	intronic	GPT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	46934957	46934957	G	C	intronic	GPT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	46962685	46962685	C	G	intronic	GPT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	46993132	46993132	T	G	intronic	DNAJA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.610144	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	57	44	13	0
chr16	46993145	46993145	A	C	intronic	DNAJA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	25	13	12	0
chr16	47001376	47001376	A	G	intronic	DNAJA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr16	4714689	4714689	T	T	intronic	MGRN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr16	47193008	47193008	A	A	ncRNA_intronic	ITFG1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	47193015	47193015	A	A	ncRNA_intronic	ITFG1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	47195469	47195469	T	T	ncRNA_exonic	ITFG1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr16	4723490	4723490	T	T	intronic	MGRN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr16	47292708	47292708	A	T	intronic	ITFG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.942168	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	126	119	7	0
chr16	4732774	4732774	T	A	intronic	MGRN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	4732775	4732775	T	C	intronic	MGRN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	4732776	4732776	C	A	intronic	MGRN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	4732778	4732778	T	G	intronic	MGRN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	4732779	4732779	T	C	intronic	MGRN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	47462851	47462851	A	G	intronic	ITFG1	NaN	NaN	NaN	rs17811434	NaN	0.447484	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	139.304688	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	49	2	47	32
chr16	4748825	4748825	C	T	exonic	ANKS3	NaN	synonymous SNV	ANKS3:NM_001242929:exon10:c.G1206A:p.Q402Q,ANKS3:NM_133450:exon13:c.G1527A:p.Q509Q	rs841214	ID=COSM435279;OCCURENCE=1(breast)	0.404952	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	70.4171	0	15.070858	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	2	9	30
chr16	47531297	47531297	T	A	intronic	PHKB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	31	22	9	0
chr16	47630519	47630519	T	G	intronic	PHKB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	476360	476360	A	T	exonic	RAB11FIP3	NaN	nonsynonymous SNV	RAB11FIP3:NM_014700:exon1:c.A354T:p.E118D	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.692	P	0.089	B	.	.	1.000	N	0.345	N	.	.	-1.018	T	0.027	T	0.099	1.800	11.98	-2.55	-0.927	-1.548	6.048	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr16	47684690	47684690	A	A	intronic	PHKB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr16	4786471	4786471	C	A	UTR5	C16orf71	NM_139170:c.-45C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	4786475	4786475	A	C	UTR5	C16orf71	NM_139170:c.-41A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	4786478	4786478	A	C	UTR5	C16orf71	NM_139170:c.-38A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	4790586	4790586	G	A	exonic	C16orf71	NaN	nonsynonymous SNV	C16orf71:NM_139170:exon4:c.G709A:p.A237T	NaN	NaN	NaN	0.21	T	0.938	P	0.119	B	0.654	N	1.000	N	1.175	L	2.41	T	-0.991	T	0.023	T	0.277	2.311	13.69	-0.048	0.042	0.305	4.003	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.900404	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	167	160	7	0
chr16	4794873	4794873	C	T	exonic	C16orf71	NaN	nonsynonymous SNV	C16orf71:NM_139170:exon6:c.C904T:p.R302C	rs2075469	ID=COSM435287;OCCURENCE=1(breast)	0.551518	0.09	T	0.894	P	0.311	B	0.801	N	1.000	P	1.245	L	2.56	T	-1.003	T	0.000	T	0.103	1.904	12.33	1.82	0.488	0.399	4.324	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	167.915125	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	1	65	51
chr16	4802295	4802295	T	G	UTR3	ZNF500	NM_021646:c.*82A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	4802296	4802296	T	A	UTR3	ZNF500	NM_021646:c.*81A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	4802297	4802297	T	G	UTR3	ZNF500	NM_021646:c.*80A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	4802298	4802298	C	A	UTR3	ZNF500	NM_021646:c.*79G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	4802386	4802386	G	T	exonic	ZNF500	NaN	synonymous SNV	ZNF500:NM_021646:exon6:c.C1434A:p.A478A	rs3747602	NaN	0.513978	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.757462	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	0	35	46
chr16	4802841	4802841	A	C	exonic	ZNF500	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF500:NM_001303450:exon6:c.T979G:p.C327G,ZNF500:NM_021646:exon6:c.T979G:p.C327G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	.	.	0.956	D	3.025	M	0.21	T	-0.038	T	0.415	T	0.906	2.371	13.89	4.07	1.481	8.216	10.981	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.354681	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	7	4	3	0
chr16	48119651	48119651	A	A	intronic	ABCC12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	48119654	48119654	A	A	intronic	ABCC12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr16	48119658	48119658	A	A	intronic	ABCC12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr16	48120580	48120580	T	T	intronic	ABCC12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr16	48121741	48121741	T	A	intronic	ABCC12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	4812438	4812438	A	A	intronic	ZNF500	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	4812848	4812848	C	A	intronic	ZNF500	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.06766917293233124	NA	0	0	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr16	48201101	48201101	A	C	UTR3	ABCC11	NM_145186:c.*84T>G,NM_033151:c.*84T>G,NM_032583:c.*84T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	48201103	48201103	G	A	UTR3	ABCC11	NM_145186:c.*82C>T,NM_033151:c.*82C>T,NM_032583:c.*82C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	48218342	48218342	C	A	intronic	ABCC11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.09253246753246724	NA	0	0	NaN	NA	NA	20	16	4	0
chr16	48249026	48249026	A	G	intronic	ABCC11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.566468	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	231	221	10	0
chr16	48290671	48290671	A	G	ncRNA_intronic	MIR548AE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	2	7	0
chr16	48303833	48303833	C	C	ncRNA_intronic	MIR548AE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	91	77	0	0
chr16	48333745	48333745	A	G	ncRNA_intronic	MIR548AE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr16	48337366	48337366	A	A	ncRNA_intronic	MIR548AE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	4833861	4833861	T	C	intronic	SEPT12	NaN	NaN	NaN	rs112713748	NaN	0.0896565	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	3.4872631237622053E-4	Somatic	613.223	0	NaN	NA	NA	187	119	68	13
chr16	4837452	4837452	T	T	intronic	SEPT12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr16	48395539	48395539	A	C	exonic	SIAH1	NaN	nonsynonymous SNV	SIAH1:NM_001006610:exon2:c.T894G:p.F298L,SIAH1:NM_003031:exon2:c.T801G:p.F267L	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	.	.	1.000	D	2.84	M	1.6	T	-0.616	T	0.220	T	0.859	3.412	17.53	4.74	1.009	2.425	12.048	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2055335968379435	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr16	4847317	4847317	C	T	UTR3	ROGDI	NM_024589:c.*144G>A	NaN	NaN	rs7546	NaN	0.397963	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr16	4850557	4850557	C	T	exonic	ROGDI	NaN	nonsynonymous SNV	ROGDI:NM_024589:exon5:c.G278A:p.R93Q	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.992	D	0.771	P	0.000	D	1.000	D	1.905	M	0.97	T	-0.729	T	0.188	T	0.345	3.638	18.50	4.33	1.954	5.779	15.588	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.220807	nearby_gap_events	REJECT	76	71	5	0
chr16	4850612	4850612	G	G	intronic	ROGDI	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	48	45	0	0
chr16	4850618	4850618	G	C	intronic	ROGDI	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.18181818181818182	NA	0	0	NaN	NA	NA	5	3	2	0
chr16	4851368	4851368	C	G	intronic	ROGDI	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.33362	0	NaN	NA	NA	55	48	7	1
chr16	4855279	4855279	A	G	exonic	GLYR1	NaN	synonymous SNV	GLYR1:NM_032569:exon16:c.T1620C:p.S540S	rs8064024	NaN	0.576677	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	63.239772	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	21	26	43
chr16	48574637	48574637	A	C	ncRNA_intronic	MIR5095	NaN	NaN	NaN	rs1039340	NaN	0.423123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	48585219	48585219	T	T	ncRNA_intronic	MIR5095	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr16	48596379	48596379	A	A	ncRNA_intronic	MIR5095	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	16	16	0	0
chr16	4863518	4863518	C	C	intronic	GLYR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	4872999	4872999	T	C	intronic	GLYR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.375293	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	48	45	3	0
chr16	4897153	4897153	A	G	intronic	GLYR1	NaN	NaN	NaN	rs2072595	NaN	0.588259	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.490483	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	8	8	29
chr16	4902862	4902862	T	C	intronic	UBN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	24	8	15	0
chr16	4910036	4910036	A	A	intronic	UBN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	4910038	4910038	T	G	intronic	UBN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr16	4911137	4911137	A	A	intronic	UBN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	49295607	49295607	T	C	intergenic	MIR5095,CBLN1	dist=637570;dist=16222	NaN	NaN	rs1510989	NaN	0.58766	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr16	4930248	4930248	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	0	2,2	0
chr16	4930252	4930252	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	0	2,2	0
chr16	4930254	4930254	T	G	UTR3	UBN1	NM_001079514:c.*121T>G,NM_001288656:c.*121T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	4930256	4930256	T	A	UTR3	UBN1	NM_001079514:c.*123T>A,NM_001288656:c.*123T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	4930257	4930257	C	T	UTR3	UBN1	NM_001079514:c.*124C>T,NM_001288656:c.*124C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	4930259	4930259	G	A	UTR3	UBN1	NM_001079514:c.*126G>A,NM_001288656:c.*126G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	4930262	4930262	G	A	UTR3	UBN1	NM_001079514:c.*129G>A,NM_001288656:c.*129G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	4930264	4930264	G	A	UTR3	UBN1	NM_001079514:c.*131G>A,NM_001288656:c.*131G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	4930265	4930265	C	A	UTR3	UBN1	NM_001079514:c.*132C>A,NM_001288656:c.*132C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	49315178	49315178	T	C	exonic	CBLN1	NaN	nonsynonymous SNV	CBLN1:NM_004352:exon1:c.A199G:p.I67V	NaN	NaN	NaN	0.38	T	0.0	B	0.006	B	0.000	D	0.970	D	-1.1	N	-0.86	T	-0.936	T	0.132	T	0.142	0.319	5.726	4.25	1.780	0.816	13.168	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	4934549	4934549	G	A	exonic	PPL	NaN	synonymous SNV	PPL:NM_002705:exon22:c.C4107T:p.S1369S	rs1049208	NaN	0.40635	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	59.5966	0	NaN	NA	NA	103	75	28	33
chr16	4934564	4934564	C	G	exonic	PPL	NaN	synonymous SNV	PPL:NM_002705:exon22:c.G4092C:p.L1364L	rs1049207	NaN	0.420727	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	59.5954	0	NaN	NA	NA	93	72	21	28
chr16	49411629	49411629	C	A	intronic	C16orf78	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	49411630	49411630	T	A	intronic	C16orf78	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	49430633	49430633	A	T	intronic	C16orf78	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	4943069	4943069	A	G	intronic	PPL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr16	4943071	4943071	C	A	intronic	PPL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr16	4943072	4943072	C	G	intronic	PPL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr16	4943073	4943073	T	G	intronic	PPL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr16	4943457	4943457	G	C	intronic	PPL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.573858	nearby_gap_events	REJECT	29	25	4	0
chr16	4944390	4944390	C	T	intronic	PPL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.969524	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	126	114	12	0
chr16	4945558	4945558	C	G	intronic	PPL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.959743	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	163	141	22	0
chr16	49531505	49531505	G	A	intronic	ZNF423	NaN	NaN	NaN	rs13335255	NaN	0.476837	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	49537339	49537339	T	C	intronic	ZNF423	NaN	NaN	NaN	rs7201926	NaN	0.459665	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	49559455	49559455	A	C	intronic	ZNF423	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	18	5	13	0
chr16	49668365	49668365	G	G	intronic	ZNF423	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	49674634	49674634	C	A	intronic	ZNF423	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	50068065	50068065	G	A	exonic	CNEP1R1	NaN	nonsynonymous SNV	CNEP1R1:NM_001281789:exon5:c.G334A:p.D112N,CNEP1R1:NM_153261:exon6:c.G385A:p.D129N	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.986	D	0.797	P	.	.	1.000	D	1.245	L	.	.	-0.709	T	0.271	T	0.105	4.296	22.5	5.75	2.878	9.286	20.305	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.193902	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	80	77	3	0
chr16	5009473	5009473	A	T	intronic	SEC14L5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	50106594	50106594	T	C	exonic	HEATR3	NaN	synonymous SNV	HEATR3:NM_182922:exon5:c.T591C:p.F197F	rs2287197	NaN	0.599441	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	177.34579	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	71	0	71	56
chr16	50257434	50257434	A	A	intronic	PAPD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	16	16	0	0
chr16	50282908	50282908	C	T	intergenic	PAPD5,ADCY7	dist=13689;dist=17543	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	50282910	50282910	A	G	intergenic	PAPD5,ADCY7	dist=13691;dist=17541	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	50282911	50282911	G	T	intergenic	PAPD5,ADCY7	dist=13692;dist=17540	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	50324745	50324745	G	A	intronic	ADCY7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr16	50324746	50324746	C	G	intronic	ADCY7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	5	4	0
chr16	50324747	50324747	A	G	intronic	ADCY7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	9	4	4	0
chr16	50325866	50325866	T	T	intronic	ADCY7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	39	34	0	0
chr16	50325868	50325868	G	T	intronic	ADCY7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	76.4643	0	NaN	NA	NA	77	53	25	2
chr16	50328489	50328489	T	C	intronic	ADCY7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.460163	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	80	73	7	4
chr16	50344481	50344481	G	A	intronic	ADCY7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	50344668	50344668	A	G	exonic	ADCY7	NaN	nonsynonymous SNV	ADCY7:NM_001114:exon18:c.A2231G:p.K744R	NaN	NaN	NaN	0.08	T	1.0	D	1.0	D	0.000	U	1.000	D	2.545	M	-2.35	D	0.761	D	0.817	D	0.794	4.573	24.8	5.45	2.293	9.016	15.349	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.302262	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	116	111	5	0
chr16	50367318	50367318	T	T	intronic	BRD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	50367319	50367319	T	T	intronic	BRD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	50367320	50367320	G	G	intronic	BRD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	50367430	50367430	G	T	intronic	BRD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.824153	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	338	328	10	0
chr16	50368543	50368543	T	A	intronic	BRD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	50388910	50388910	T	A	intronic	BRD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.035459	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	105	98	7	0
chr16	5041819	5041819	T	T	intronic	SEC14L5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	5042098	5042098	G	C	intronic	SEC14L5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.318244	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	135	123	12	0
chr16	5042101	5042101	C	T	intronic	SEC14L5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.416161	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	147	135	12	0
chr16	5042102	5042102	T	G	intronic	SEC14L5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.104223	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	147	135	12	0
chr16	50535964	50535964	T	C	intergenic	BRD7,NKD1	dist=133119;dist=46277	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	5061085	5061085	A	C	intronic	SEC14L5	NaN	NaN	NaN	rs2908669	NaN	0.937899	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	189.322376	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	0	66	58
chr16	50648093	50648093	T	C	intronic	NKD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	50659278	50659278	T	T	intronic	NKD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	50667018	50667018	T	T	intronic	NKD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr16	50667133	50667133	T	C	exonic	NKD1	NaN	nonsynonymous SNV	NKD1:NM_033119:exon10:c.T854C:p.L285P	NaN	NaN	NaN	0.33	T	0.058	B	0.022	B	0.054	N	1.000	D	0.315	N	-0.05	T	-1.006	T	0.107	T	0.206	2.419	14.05	4.72	1.990	3.783	5.425	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	29	28	1	0
chr16	50667134	50667134	G	G	exonic	NKD1	NaN	synonymous SNV	NKD1:NM_033119:exon10:c.G855G:p.L285L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	35	32	0	0
chr16	50709856	50709856	A	A	intronic	SNX20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	20	17	0	0
chr16	50745655	50745655	C	T	exonic	NOD2	NaN	synonymous SNV	NOD2:NM_001293557:exon3:c.C1752T:p.A584A,NOD2:NM_022162:exon4:c.C1833T:p.A611A	rs61736932	NaN	0.00259585	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.134835	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	16	10	4
chr16	50759576	50759576	A	G	intronic	NOD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	50759577	50759577	A	T	intronic	NOD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	50759580	50759580	C	T	intronic	NOD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	50759581	50759581	A	T	intronic	NOD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	5077417	5077417	G	A	intronic	NAGPA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.806329	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	112	102	10	0
chr16	50785793	50785793	A	T	exonic	CYLD	NaN	nonsynonymous SNV	CYLD:NM_001042355:exon4:c.A783T:p.L261F,CYLD:NM_001042412:exon4:c.A783T:p.L261F,CYLD:NM_015247:exon5:c.A783T:p.L261F	NaN	NaN	NaN	0.05	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	1.67	L	-3.3	D	0.665	D	0.824	D	0.682	2.535	14.44	4.66	1.011	2.162	6.685	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.845367	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	1	3	0
chr16	5078709	5078709	C	T	intronic	NAGPA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	2	0
chr16	5078714	5078714	T	A	intronic	NAGPA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	2	0
chr16	5078841	5078841	T	C	intronic	NAGPA	NaN	NaN	NaN	rs1995278	NaN	0.999201	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	62.2511	0	NaN	NA	NA	408	0	408	15
chr16	5083383	5083383	A	A	exonic	NAGPA	NaN	synonymous SNV	NAGPA:NM_016256:exon2:c.T433T:p.S145S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr16	50984949	50984949	G	G	intergenic	CYLD,LOC101927334	dist=149103;dist=66720	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	50984957	50984957	C	C	intergenic	CYLD,LOC101927334	dist=149111;dist=66712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	5105210	5105210	T	C	intronic	C16orf89	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.373626	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	53	38	15	0
chr16	5105238	5105238	G	C	intronic	C16orf89	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.788514	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	83	75	8	0
chr16	511372	511372	T	T	intronic	RAB11FIP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	5115817	5115817	A	C	exonic	C16orf89	NaN	nonsynonymous SNV	C16orf89:NM_001098514:exon1:c.T93G:p.S31R,C16orf89:NM_152459:exon1:c.T93G:p.S31R	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.846	P	0.387	B	0.411	N	1.000	N	0.895	L	1.34	T	-1.064	T	0.062	T	0.095	1.002	9.090	0.889	-0.054	0.695	7.402	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	9.848417617535824E-5	NA	0	19	NaN	NA	NA	140	80	60	36
chr16	51173559	51173559	G	A	exonic	SALL1	NaN	synonymous SNV	SALL1:NM_001127892:exon2:c.C2283T:p.L761L,SALL1:NM_002968:exon2:c.C2574T:p.L858L	rs1965024	ID=COSM1128938;OCCURENCE=1(prostate)	0.538738	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	4275.11	0	NaN	NA	NA	367	0	367	46
chr16	5122072	5122072	G	GGTCT	intronic	ALG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.583466	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	847.673	0	NaN	NA	NA	99	3	90	30
chr16	5127433	5127433	T	C	intronic	ALG1	NaN	NaN	NaN	rs201477967	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	132.299843	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	92	42	50	1
chr16	516555	516555	C	C	intronic	RAB11FIP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr16	5188040	5188040	T	C	intergenic	EEF2KMT,LINC01570	dist=40219;dist=463130	NaN	NaN	rs11076879	NaN	0.70627	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	5198609	5198609	C	C	intergenic	EEF2KMT,LINC01570	dist=50788;dist=452561	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	5198610	5198610	C	C	intergenic	EEF2KMT,LINC01570	dist=50789;dist=452560	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	52060205	52060205	C	G	downstream	C16orf97	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr16	52061174	52061174	A	T	intronic	C16orf97	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.435372	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	169	158	11	0
chr16	52061175	52061175	C	A	intronic	C16orf97	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.469654	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	155	144	11	0
chr16	52092114	52092114	G	C	intronic	C16orf97	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	52473263	52473263	A	G	exonic	TOX3	NaN	synonymous SNV	TOX3:NM_001080430:exon7:c.T1605C:p.P535P,TOX3:NM_001146188:exon8:c.T1590C:p.P530P	rs9925256	ID=COSM148075;OCCURENCE=1(stomach)	0.489617	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.026597492593985198	NA	0	0	NaN	NA	NA	70	52	18	43
chr16	52497938	52497938	A	C	exonic	TOX3	NaN	nonsynonymous SNV	TOX3:NM_001080430:exon3:c.T316G:p.F106V,TOX3:NM_001146188:exon4:c.T301G:p.F101V	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.991	D	0.000	D	1.000	D	2.25	M	0.91	T	-0.514	T	0.272	T	0.921	4.429	23.5	5.9	2.264	9.339	16.332	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.382622	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	127	113	14	0
chr16	52497939	52497939	C	G	exonic	TOX3	NaN	nonsynonymous SNV	TOX3:NM_001080430:exon3:c.G315C:p.Q105H,TOX3:NM_001146188:exon4:c.G300C:p.Q100H	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.675	P	0.157	B	0.000	D	1.000	D	2.175	M	0.54	T	-0.803	T	0.153	T	0.811	3.224	16.80	4.96	1.518	3.950	11.110	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.232588	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	125	111	14	0
chr16	53088521	53088521	G	C	upstream	CHD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	53263075	53263075	C	T	intronic	CHD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.574214	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	104	95	9	0
chr16	53279186	53279186	G	C	intronic	CHD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr16	53279188	53279188	C	T	intronic	CHD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr16	53279189	53279189	A	G	intronic	CHD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr16	53279194	53279194	T	G	intronic	CHD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	2	6	0
chr16	53279791	53279791	T	G	intronic	CHD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.005228114032979168	NA	0	0	NaN	NA	NA	29	23	6	0
chr16	53301037	53301037	T	T	intronic	CHD9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	53468755	53468755	C	T	intronic	RBL2	NaN	NaN	NaN	rs118012479	NaN	0.0307508	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	62.472097	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	19	26	3
chr16	53472864	53472864	T	TTA	intronic	RBL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.6049	0	NaN	NA	NA	14	10	2	0
chr16	53476804	53476804	G	A	intronic	RBL2	NaN	NaN	NaN	rs17800577	NaN	0.427316	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	78	58	20	23
chr16	53480915	53480915	TTC	T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.4539	0	NaN	NA	NA	29	23	6	0
chr16	53513033	53513033	C	T	intronic	RBL2	NaN	NaN	NaN	rs8043918	NaN	0.452676	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.56	0	NaN	NA	NA	115	69	46	2
chr16	53513055	53513055	T	C	intronic	RBL2	NaN	NaN	NaN	rs8049033	NaN	0.436901	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	43.9799	0	NaN	NA	NA	116	63	53	14
chr16	53528061	53528061	G	A	exonic	AKTIP	NaN	synonymous SNV	AKTIP:NM_001012398:exon8:c.C699T:p.P233P,AKTIP:NM_022476:exon8:c.C699T:p.P233P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.558704	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	305	291	14	0
chr16	53532586	53532586	T	C	intronic	AKTIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.437987	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	236	228	8	0
chr16	53553295	53553295	G	T	intergenic	AKTIP,RPGRIP1L	dist=16125;dist=80523	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	53644976	53644976	A	G	intronic	RPGRIP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.105944	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	50	38	12	0
chr16	53644996	53644996	A	G	intronic	RPGRIP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.719821	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	75	65	10	0
chr16	53645040	53645040	A	T	intronic	RPGRIP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr16	53705553	53705553	A	A	intronic	RPGRIP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	43	38	0	0
chr16	5371898	5371898	T	C	intergenic	EEF2KMT,LINC01570	dist=224077;dist=279272	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	53726294	53726294	A	A	intronic	RPGRIP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	173	132	0	0
chr16	53734704	53734704	A	A	intronic	RPGRIP1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	53828346	53828346	T	A	intronic	FTO	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	54145880	54145880	A	A	UTR3	FTO	NM_001080432:c.*53A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr16	54317576	54317576	T	G	UTR3	IRX3	NM_024336:c.*22A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.577059	nearby_gap_events	REJECT	98	91	7	0
chr16	54317582	54317582	T	G	UTR3	IRX3	NM_024336:c.*16A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.328946	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	105	97	8	0
chr16	54317583	54317583	G	T	UTR3	IRX3	NM_024336:c.*15C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.719743	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	120	111	9	0
chr16	54318024	54318024	T	T	intronic	IRX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr16	54318805	54318805	T	G	exonic	IRX3	NaN	nonsynonymous SNV	IRX3:NM_024336:exon2:c.A988C:p.S330R	NaN	NaN	NaN	0.53	T	0.005	B	0.004	B	0.000	D	1.000	N	0	N	0.59	T	-1.039	T	0.061	T	0.131	-0.896	0.446	1.48	0.173	0.655	7.128	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	34.8052	0	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr16	54404786	54404786	G	A	intergenic	IRX3,CRNDE	dist=84408;dist=547991	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	10	0	10	0
chr16	54471588	54471588	G	T	intergenic	IRX3,CRNDE	dist=151210;dist=481189	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	54471590	54471590	G	C	intergenic	IRX3,CRNDE	dist=151212;dist=481187	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	54542473	54542473	A	C	intergenic	IRX3,CRNDE	dist=222095;dist=410304	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	55167117	55167117	A	A	intergenic	IRX5,IRX6	dist=198722;dist=191354	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	55167118	55167118	C	C	intergenic	IRX5,IRX6	dist=198723;dist=191353	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	55169524	55169524	A	C	intergenic	IRX5,IRX6	dist=201129;dist=188947	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	55290662	55290662	T	C	intergenic	IRX5,IRX6	dist=322267;dist=67809	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	553150	553150	A	A	intronic	RAB11FIP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	55359126	55359126	A	T	intronic	IRX6	NaN	NaN	NaN	rs31078	NaN	0.815495	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	115.977239	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	102	45	57	53
chr16	55362757	55362757	GC	G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.27304	0	NaN	NA	NA	12	10	5	0
chr16	55363171	55363171	C	A	exonic	IRX6	NaN	stopgain	IRX6:NM_024335:exon5:c.C1281A:p.C427X	NaN	NaN	NaN	0.18	T	.	.	.	.	0.003	N	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	15.145	49	3.5	0.664	0.629	7.759	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.27982	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	71	65	6	0
chr16	55363175	55363175	C	A	exonic	IRX6	NaN	synonymous SNV	IRX6:NM_024335:exon5:c.C1285A:p.R429R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.61729	clustered_read_position	REJECT	74	65	9	12
chr16	55450733	55450733	G	A	intergenic	IRX6,MMP2	dist=86061;dist=62009	NaN	NaN	rs243860	NaN	0.478235	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	55518114	55518114	A	G	intronic	MMP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	15	10	4	0
chr16	55519754	55519754	T	G	intronic	MMP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	48.2855	0	19.644819	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	10	8	16
chr16	55522688	55522688	A	C	intronic	MMP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.334186	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	79	68	11	0
chr16	55527113	55527113	G	A	exonic	MMP2	NaN	synonymous SNV	MMP2:NM_001127891:exon9:c.G1230A:p.T410T,MMP2:NM_001302508:exon9:c.G1152A:p.T384T,MMP2:NM_001302509:exon9:c.G1152A:p.T384T,MMP2:NM_001302510:exon9:c.G1152A:p.T384T,MMP2:NM_004530:exon9:c.G1380A:p.T460T	rs2287074	NaN	0.32488	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	86.717689	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	61	26	35	41
chr16	55531120	55531120	A	A	intronic	MMP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	55579850	55579850	A	G	intronic	LPCAT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	31	8	22	0
chr16	55583150	55583150	A	T	intronic	LPCAT2	NaN	NaN	NaN	rs201352167	NaN	0.00379393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	32	17	15	1
chr16	55703443	55703443	C	G	intronic	SLC6A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.713927	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	67	57	10	0
chr16	55706121	55706121	A	A	intronic	SLC6A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	5	0	0
chr16	55730332	55730332	T	A	intronic	SLC6A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	55730333	55730333	T	C	intronic	SLC6A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	55735912	55735912	C	T	intronic	SLC6A2	NaN	NaN	NaN	rs2242447	NaN	0.477436	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	217.071	0	NaN	NA	NA	199	126	73	50
chr16	55843479	55843479	C	T	intronic	CES1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	55844617	55844617	G	A	intronic	CES1	NaN	NaN	NaN	rs2244614	NaN	0.364417	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.749512	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	71	53	18	46
chr16	55844924	55844924	TAAA	TAA,TA,TAACA,TAAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	101.239	0	NaN	NA	NA	28	0	6	0
chr16	55846749	55846749	T	T	intronic	CES1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	55862762	55862762	C	G	exonic	CES1	NaN	synonymous SNV	CES1:NM_001025194:exon2:c.G174C:p.P58P,CES1:NM_001025195:exon2:c.G177C:p.P59P,CES1:NM_001266:exon2:c.G174C:p.P58P	rs3826194	ID=COSM1378425;OCCURENCE=1(large_intestine)	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03674934271874966	NA	0	0	NaN	NA	NA	245	180	65	48
chr16	55862791	55862791	T	C	exonic	CES1	NaN	nonsynonymous SNV	CES1:NM_001025194:exon2:c.A145G:p.I49V,CES1:NM_001025195:exon2:c.A148G:p.I50V,CES1:NM_001266:exon2:c.A145G:p.I49V	rs3826193	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.001	B	0.016	N	1.000	N	-1.75	N	-0.1	T	-0.964	T	0.046	T	0.024	-2.119	0.005	2.48	0.358	0.503	8.559	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.04102954977111802	NA	0	0	NaN	NA	NA	256	192	64	48
chr16	55880169	55880169	T	A	UTR3	CES5A	NM_001143685:c.*194A>T,NM_001190158:c.*194A>T,NM_145024:c.*194A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	55880440	55880440	C	A	exonic	CES5A	NaN	nonsynonymous SNV	CES5A:NM_145024:exon12:c.G1501T:p.D501Y,CES5A:NM_001143685:exon13:c.G1651T:p.D551Y,CES5A:NM_001190158:exon14:c.G1738T:p.D580Y	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.163	B	0.066	B	0.020	N	1.000	N	0.345	N	-0.2	T	-0.997	T	0.137	T	0.203	2.308	13.67	-2.96	-0.706	-0.001	1.672	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.269813	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	104	90	14	3
chr16	55883769	55883769	A	A	intronic	CES5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr16	55903712	55903712	A	A	intronic	CES5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	56343642	56343642	C	T	intronic	GNAO1	NaN	NaN	NaN	rs11643455	NaN	0.23742	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	56366870	56366870	G	A	intronic	GNAO1	NaN	NaN	NaN	rs931072	NaN	0.778754	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	56370771	56370771	C	T	exonic	GNAO1	NaN	nonsynonymous SNV	GNAO1:NM_020988:exon6:c.C722T:p.T241M,GNAO1:NM_138736:exon6:c.C722T:p.T241M	NaN	NaN	NaN	1	T	1.0	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	0.785	N	-2.56	D	0.029	D	0.673	D	0.417	1.960	12.51	5.29	2.465	4.937	18.958	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.540384	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	78	67	11	0
chr16	56385313	56385313	T	TGA	exonic	GNAO1	NaN	frameshift substitution	GNAO1:NM_020988:exon7:c.741_741delinsTGA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.2403	0	NaN	NA	NA	21	15	4	0
chr16	56401294	56401294	T	C	intronic	AMFR	NaN	NaN	NaN	rs2241957	NaN	0.712061	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	59.36901	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	37	29	42
chr16	56481912	56481912	A	A	intronic	NUDT21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr16	56485481	56485481	T	A	UTR5	OGFOD1	NM_018233:c.-44T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	0	2	0
chr16	56540197	56540197	A	C	intronic	BBS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr16	56540199	56540199	G	T	intronic	BBS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr16	56548656	56548656	T	A	intronic	BBS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	47.9788	0	NaN	NA	NA	132	102	31	16
chr16	56548657	56548657	A	T	intronic	BBS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.391236	clustered_read_position	REJECT	123	113	10	7
chr16	56611219	56611219	C	T	intergenic	MT4,MT3	dist=8350;dist=12048	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	56611220	56611220	A	T	intergenic	MT4,MT3	dist=8351;dist=12047	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	56611221	56611221	A	T	intergenic	MT4,MT3	dist=8352;dist=12046	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	56667165	56667165	A	G	intronic	MT1M	NaN	NaN	NaN	rs1827209	NaN	0.871406	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.094875	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	0	12	56
chr16	56673325	56673325	A	C	intronic	MT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	56673665	56673665	T	T	intronic	MT1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	56685770	56685770	T	T	upstream	MT1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	13	10	0	0
chr16	56687032	56687032	T	C	UTR3	MT1B	NM_005947:c.*55T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1304347826086963	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr16	56691896	56691896	G	T	UTR5	MT1F	NM_005949:c.-75G>T,NM_001301272:c.-75G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	16	12.782691	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	17	9	8	0
chr16	56691897	56691897	T	G	UTR5	MT1F	NM_005949:c.-74T>G,NM_001301272:c.-74T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	19	13.292976	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	17	9	8	0
chr16	56692052	56692052	A	G	intronic	MT1F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsM	3	Somatic	0.18571428571428442	Somatic	11.2646	0	5.476725	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	14	11	3	0
chr16	56711396	56711396	T	C	ncRNA_intronic	MT1IP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	56711399	56711399	C	A	ncRNA_intronic	MT1IP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	56711409	56711409	C	G	ncRNA_intronic	MT1IP	NaN	NaN	NaN	rs4783949	NaN	0.458466	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	56716574	56716574	G	A	intronic	MT1X	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.593632	clustered_read_position	REJECT	231	220	11	0
chr16	56716954	56716954	T	T	intronic	MT1X	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	56716982	56716982	T	G	intronic	MT1X	NaN	NaN	NaN	rs2301234	NaN	0.658147	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	85.052269	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	30	35	50
chr16	56782351	56782351	A	G	intronic	NUP93	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	13	7	3	0
chr16	56782353	56782353	G	A	intronic	NUP93	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr16	56782357	56782357	A	T	intronic	NUP93	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr16	56855496	56855496	C	G	exonic	NUP93	NaN	synonymous SNV	NUP93:NM_001242795:exon5:c.C276G:p.L92L,NUP93:NM_001242796:exon5:c.C276G:p.L92L,NUP93:NM_014669:exon7:c.C645G:p.L215L	rs2118017	NaN	0.875799	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	71.6711	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	89	54	35	52
chr16	56864429	56864429	T	C	intronic	NUP93	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	56867332	56867332	A	A	intronic	NUP93	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr16	56868384	56868384	A	A	intronic	NUP93	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	56878578	56878578	G	T	UTR3	NUP93	NM_014669:c.*57G>T,NM_001242795:c.*57G>T,NM_001242796:c.*57G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr16	56902124	56902124	T	T	intronic	SLC12A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr16	56903609	56903609	T	T	intronic	SLC12A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr16	56903813	56903813	A	C	intronic	SLC12A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	569177	569177	C	G	intronic	RAB11FIP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	569178	569178	A	T	intronic	RAB11FIP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	5693022	5693022	T	A	intergenic	MIR8065,RBFOX1	dist=10455;dist=376110	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr16	56933599	56933599	C	T	intronic	SLC12A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	1.356939968523347E-4	NA	0	0	NaN	NA	NA	100	69	31	0
chr16	56938394	56938394	T	C	intronic	SLC12A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.307028	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	173	167	6	0
chr16	56969026	56969026	T	C	intronic	HERPUD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	38	8	29	0
chr16	56973116	56973116	T	C	intronic	HERPUD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr16	56973757	56973757	T	C	intronic	HERPUD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	56974187	56974187	A	T	intronic	HERPUD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	9	3	5	0
chr16	56996842	56996842	CA	AC,C,CAG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	84.3331	0	NaN	NA	NA	16	4	2	1
chr16	56996884	56996884	TGGG	TGG,TGGC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	442.635	0	NaN	NA	NA	53	0	19	3
chr16	56996889	56996889	C	C	intronic	CETP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	80	52	0	0
chr16	56996890	56996890	T	C	intronic	CETP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	49	40	9	0
chr16	57003221	57003221	T	T	intronic	CETP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr16	57003723	57003723	G	T	intronic	CETP	NaN	NaN	NaN	rs891141	NaN	0.950879	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	307.22192	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	120	2	118	58
chr16	57004021	57004021	A	A	intronic	CETP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	57005301	57005301	C	T	intronic	CETP	NaN	NaN	NaN	rs1532625	NaN	0.313099	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	209.564	0	NaN	NA	NA	105	57	48	39
chr16	57016252	57016252	A	A	intronic	CETP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	57060353	57060353	T	C	exonic	NLRC5	NaN	nonsynonymous SNV	NLRC5:NM_032206:exon5:c.T1498C:p.C500R	rs28438857	NaN	0.28115	0.56	T	0.0	B	0.0	B	0.643	N	1.000	P	1.1	L	2.59	T	-0.979	T	0.000	T	0.346	-2.356	0.004	-5.88	-1.205	0.556	8.074	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	92.993654	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	89	45	44	15
chr16	57060958	57060958	A	G	intronic	NLRC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.834669	nearby_gap_events	REJECT	42	36	6	0
chr16	57063866	57063866	T	A	intronic	NLRC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.517848	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	152	145	7	0
chr16	57065232	57065232	T	T	intronic	NLRC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr16	57065246	57065246	G	G	intronic	NLRC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	66	61	0	0
chr16	57068107	57068107	C	T	exonic	NLRC5	NaN	synonymous SNV	NLRC5:NM_032206:exon12:c.C2571T:p.H857H	rs3995817	NaN	0.294129	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	-0.037	3.826	-7.84	-1.729	-1.739	6.681	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	120.484	0	NaN	NA	NA	77	45	32	13
chr16	57071113	57071113	T	C	exonic	NLRC5	NaN	synonymous SNV	NLRC5:NM_032206:exon14:c.T2718C:p.S906S	rs1684579	ID=COSM148084;OCCURENCE=1(stomach)	0.576278	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	-0.547	1.520	-4.08	-1.299	-2.080	14.812	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	39.7915	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	1	15	0
chr16	57071114	57071114	A	G	exonic	NLRC5	NaN	nonsynonymous SNV	NLRC5:NM_032206:exon14:c.A2719G:p.N907D	rs1672867	NaN	0.994409	0.75	T	0.0	B	0.001	B	0.048	N	1.000	P	-1.245	N	0.62	T	-1.000	T	0.000	T	0.263	-1.996	0.007	1.81	0.216	-0.193	4.075	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.317685	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	1	15	2
chr16	57071209	57071209	T	C	intronic	NLRC5	NaN	NaN	NaN	rs9926871	NaN	0.10623	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.520177	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	8	8	9
chr16	57071232	57071232	C	G	intronic	NLRC5	NaN	NaN	NaN	rs1684580	NaN	0.489417	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	77.2039	0	NaN	NA	NA	6	1	5	36
chr16	57071236	57071236	C	T	intronic	NLRC5	NaN	NaN	NaN	rs55857123	NaN	0.105232	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.43239	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	8	5	0
chr16	57075992	57075992	A	A	intronic	NLRC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	57092802	57092802	T	T	intronic	NLRC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	57093485	57093485	A	G	intronic	NLRC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	18	12	6	0
chr16	57101457	57101457	A	T	intronic	NLRC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	57111343	57111343	A	A	intronic	NLRC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr16	57111347	57111347	G	C	intronic	NLRC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	57115186	57115186	A	A	intronic	NLRC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	57147493	57147493	T	C	intronic	CPNE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr16	57147494	57147494	G	A	intronic	CPNE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr16	57151089	57151089	G	T	intronic	CPNE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr16	57159704	57159704	T	T	intronic	CPNE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	57238527	57238527	T	G	UTR5	RSPRY1	NM_001305182:c.-44T>G,NM_001305163:c.-44T>G,NM_001305164:c.-44T>G,NM_133368:c.-44T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr16	57283826	57283826	G	A	intronic	ARL2BP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	57290715	57290715	C	G	UTR3	PLLP	NM_015993:c.*110G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	57290716	57290716	C	A	UTR3	PLLP	NM_015993:c.*109G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr16	57290951	57290951	A	A	intronic	PLLP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr16	57394189	57394189	T	T	intronic	CCL22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr16	57413514	57413514	T	T	intronic	CX3CL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	8	0	0
chr16	57413715	57413715	T	G	intronic	CX3CL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	57413718	57413718	T	G	intronic	CX3CL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	57415906	57415906	T	T	intronic	CX3CL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr16	57464131	57464131	G	T	intronic	CIAPIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.840855	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	297	285	12	0
chr16	57464333	57464333	A	T	intronic	CIAPIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	57493872	57493872	T	T	intronic	COQ9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	57496494	57496494	A	G	upstream	POLR2C	NaN	NaN	NaN	rs178601	NaN	0.758586	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	49.383048	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	0	18	51
chr16	57499841	57499841	A	G	intronic	POLR2C	NaN	NaN	NaN	rs223839	NaN	0.491414	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	101.079	0	NaN	NA	NA	299	0	299	8
chr16	57499902	57499902	T	C	exonic	POLR2C	NaN	synonymous SNV	POLR2C:NM_032940:exon3:c.T174C:p.V58V	rs4937	NaN	0.758387	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1146.18	0	NaN	NA	NA	379	0	379	52
chr16	57534731	57534731	C	C	intergenic	DOK4,CCDC102A	dist=14346;dist=11359	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	57549428	57549428	A	A	intronic	CCDC102A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	20	19	0	0
chr16	57552088	57552088	T	C	exonic	CCDC102A	NaN	synonymous SNV	CCDC102A:NM_033212:exon6:c.A1140G:p.A380A	rs28756858	NaN	0.215256	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	54.0067	0	NaN	NA	NA	20	11	9	22
chr16	57552233	57552233	C	C	intronic	CCDC102A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	70	62	0	0
chr16	57559909	57559909	C	T	exonic	CCDC102A	NaN	stopgain	CCDC102A:NM_033212:exon3:c.G716A:p.W239X	NaN	NaN	NaN	0.1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	8.066	40	5.15	2.573	7.041	17.995	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.286217	clustered_read_position	REJECT	22	18	4	0
chr16	57602139	57602139	A	A	intronic	ADGRG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr16	57687235	57687235	C	G	exonic	ADGRG1	NaN	nonsynonymous SNV	ADGRG1:NM_001145773:exon4:c.C623G:p.A208G,ADGRG1:NM_001290143:exon4:c.C83G:p.A28G,ADGRG1:NM_001290144:exon4:c.C83G:p.A28G,ADGRG1:NM_201525:exon4:c.C608G:p.A203G,ADGRG1:NM_001145770:exon5:c.C608G:p.A203G,ADGRG1:NM_001145771:exon5:c.C608G:p.A203G,ADGRG1:NM_001145772:exon5:c.C608G:p.A203G,ADGRG1:NM_001145774:exon5:c.C608G:p.A203G,ADGRG1:NM_005682:exon5:c.C608G:p.A203G,ADGRG1:NM_201524:exon5:c.C608G:p.A203G	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.004	B	0.008	B	0.878	N	1.000	N	0.895	L	1.79	T	-1.006	T	0.074	T	0.112	0.972	8.967	2.31	0.418	0.484	6.851	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.004887	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	74	68	6	0
chr16	57697568	57697568	C	A	UTR3	ADGRG1	NM_001290143:c.*74C>A,NM_001290142:c.*74C>A,NM_001145770:c.*74C>A,NM_005682:c.*74C>A,NM_001145771:c.*74C>A,NM_001145773:c.*74C>A,NM_201524:c.*74C>A,NM_001145772:c.*74C>A,NM_201525:c.*74C>A,NM_001145774:c.*74C>A,NM_001290144:c.*74C>A	NaN	NaN	rs10852555	NaN	0.573682	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	87.522521	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	74	35	39	37
chr16	57707409	57707409	A	A	intronic	ADGRG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr16	57713685	57713685	A	C	intronic	ADGRG3	NaN	NaN	NaN	rs9925879	NaN	0.258786	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	101	38	63	17
chr16	57719859	57719859	A	A	intronic	ADGRG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	21	19	0	0
chr16	57752196	57752196	T	T	intronic	DRC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr16	57758423	57758423	T	T	intronic	DRC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	57761185	57761185	A	G	intronic	DRC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	57761186	57761186	C	G	intronic	DRC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	57761188	57761188	C	T	intronic	DRC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	57762636	57762636	A	A	intronic	DRC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr16	57771268	57771268	A	A	intronic	KATNB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	67	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr16	57786517	57786517	C	T	intronic	KATNB1	NaN	NaN	NaN	rs2965797	NaN	0.410543	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	201.141693	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	70	0	70	46
chr16	57792930	57792930	C	T	intronic	KIFC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	57793175	57793175	A	C	intronic	KIFC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr16	57794376	57794376	A	C	intronic	KIFC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	15	4	11	0
chr16	57795124	57795124	T	T	intronic	KIFC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr16	57804002	57804002	G	C	intronic	KIFC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.083934	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	201	193	8	0
chr16	57805048	57805048	A	G	intronic	KIFC3	NaN	NaN	NaN	rs2967166	NaN	0.636382	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.658962	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	41
chr16	57805078	57805078	C	T	intronic	KIFC3	NaN	NaN	NaN	rs2965790	NaN	0.448882	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.832194	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	41
chr16	57806063	57806063	G	T	intronic	KIFC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.497969	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	159	147	12	0
chr16	57806064	57806064	C	G	intronic	KIFC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.053224	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	137	121	16	0
chr16	57832076	57832076	T	T	exonic	KIFC3	NaN	synonymous SNV	KIFC3:NM_001130100:exon2:c.A80A:p.E27E,KIFC3:NM_005550:exon2:c.A80A:p.E27E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	57862075	57862075	C	C	intergenic	LOC388282,CNGB1	dist=11244;dist=54169	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	57918004	57918004	G	A	UTR3	CNGB1	NM_001286130:c.*64C>T,NM_001297:c.*64C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	22	9	13	0
chr16	57918020	57918020	T	T	UTR3	CNGB1	NM_001286130:c.*48A>A,NM_001297:c.*48A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	37	32	0	0
chr16	57918021	57918021	G	T	UTR3	CNGB1	NM_001286130:c.*47C>A,NM_001297:c.*47C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	17	16	1	0
chr16	57921677	57921677	T	G	intronic	CNGB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr16	57974258	57974258	G	A	intronic	CNGB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.533943	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	199	190	9	0
chr16	57974260	57974260	A	G	intronic	CNGB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	13	1	10	0
chr16	57992168	57992168	T	T	intronic	CNGB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr16	58005096	58005096	G	G	upstream	CNGB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr16	58018490	58018490	A	T	intronic	TEPP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.407666	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	161	153	8	0
chr16	58018491	58018491	G	A	intronic	TEPP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.005831728684906784	NA	0	0	11.919539	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	61	53	8	0
chr16	58019099	58019099	T	C	intronic	TEPP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.386326	nearby_gap_events	REJECT	63	54	9	0
chr16	58019100	58019100	C	T	intronic	TEPP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.992399	nearby_gap_events	REJECT	64	55	9	0
chr16	58019101	58019101	T	G	intronic	TEPP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.391438	nearby_gap_events	REJECT	64	55	9	0
chr16	58019396	58019396	G	A	exonic	TEPP	NaN	nonsynonymous SNV	TEPP:NM_199046:exon6:c.G779A:p.S260N,TEPP:NM_199456:exon6:c.G698A:p.S233N	rs9934227	NaN	0.783546	1	T	0.0	B	0.0	B	0.001	N	1.000	P	-2.56	N	1.08	T	-0.982	T	0.000	T	0.013	0.171	4.918	1.54	0.085	0.593	7.896	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	173.95049	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	64	0	64	55
chr16	58021395	58021395	A	C	UTR3	TEPP	NM_199046:c.*65A>C,NM_199456:c.*65A>C	NaN	NaN	rs2241771	NaN	0.784744	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	223.478342	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	73	0	73	57
chr16	58030401	58030401	T	C	UTR3	ZNF319	NM_020807:c.*20A>G	NaN	NaN	rs3743555	NaN	0.672524	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	56.613934	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	0	19	37
chr16	58031335	58031335	C	T	exonic	ZNF319	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF319:NM_020807:exon2:c.G835A:p.A279T	rs375391098	NaN	NaN	0.11	T	0.763	P	0.2	B	0.000	U	1.000	D	-1.47	N	3.18	T	-0.744	T	0.008	T	0.388	4.207	21.8	5.0	2.330	6.083	17.279	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.92048	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	153	147	6	0
chr16	58036479	58036479	A	C	exonic	USB1	NaN	synonymous SNV	USB1:NM_001195302:exon2:c.A195C:p.T65T,USB1:NM_001204911:exon2:c.A195C:p.T65T,USB1:NM_024598:exon2:c.A195C:p.T65T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	38	21	17	0
chr16	58052799	58052799	T	A	intronic	USB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr16	58052803	58052803	T	C	intronic	USB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	6	3	0
chr16	58071569	58071569	A	A	intronic	MMP15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr16	58071584	58071584	A	G	intronic	MMP15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	58071585	58071585	A	T	intronic	MMP15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	58283908	58283908	T	C	UTR5	CCDC113	NM_014157:c.-11T>C,NM_001142302:c.-11T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.559029	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	7	4	3	0
chr16	58286616	58286616	T	T	intronic	CCDC113	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	58288089	58288089	G	A	intronic	CCDC113	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.269732	possible_contamination	REJECT	115	109	6	0
chr16	58296487	58296487	A	A	intronic	CCDC113	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	58324809	58324809	G	C	intronic	PRSS54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	36	33	3	0
chr16	58324810	58324810	C	G	intronic	PRSS54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	18	15	3	0
chr16	58484156	58484156	T	T	intergenic	GINS3,NDRG4	dist=44108;dist=13393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	58502011	58502011	G	A	intronic	NDRG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	58526171	58526171	T	C	intronic	NDRG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	58528812	58528812	G	A	intronic	NDRG4	NaN	NaN	NaN	rs34720527	NaN	0.145767	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.934932	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	10	7	20
chr16	58540531	58540531	A	G	intronic	NDRG4	NaN	NaN	NaN	rs2271948	NaN	0.424321	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.447588	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	1	4	19
chr16	58540931	58540931	A	A	intronic	NDRG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr16	58543373	58543373	A	C	intronic	NDRG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr16	58552228	58552228	G	A	intronic	SETD6	NaN	NaN	NaN	rs2280397	NaN	0.485024	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	267.717025	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	88	0	88	34
chr16	58562568	58562568	A	A	intronic	CNOT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	16	14	0	0
chr16	58564319	58564319	A	C	intronic	CNOT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	58568319	58568319	T	A	intronic	CNOT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.760082	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	489	469	20	0
chr16	58571775	58571775	T	C	intronic	CNOT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	9	1	7	0
chr16	58577516	58577516	G	A	exonic	CNOT1	NaN	nonsynonymous SNV	CNOT1:NM_001265612:exon31:c.C4414T:p.L1472F,CNOT1:NM_016284:exon31:c.C4429T:p.L1477F,CNOT1:NM_206999:exon31:c.C4429T:p.L1477F	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.32	B	0.247	B	0.000	D	1.000	D	2.625	M	0.56	T	-0.704	T	0.226	T	0.645	3.542	18.07	5.29	2.472	7.838	13.837	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.553629	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	56	45	11	0
chr16	58577518	58577518	G	T	exonic	CNOT1	NaN	nonsynonymous SNV	CNOT1:NM_001265612:exon31:c.C4412A:p.A1471D,CNOT1:NM_016284:exon31:c.C4427A:p.A1476D,CNOT1:NM_206999:exon31:c.C4427A:p.A1476D	NaN	NaN	NaN	0.64	T	0.998	D	0.934	D	0.000	D	1.000	D	1.575	L	0.86	T	-0.797	T	0.260	T	0.981	4.987	29.2	5.39	2.530	9.835	19.150	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.073035	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	60	42	18	0
chr16	58579086	58579086	T	T	intronic	CNOT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	58590728	58590728	T	C	intronic	CNOT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	58612905	58612905	A	G	intronic	CNOT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr16	58621091	58621091	A	G	intronic	CNOT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.349715	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	216	195	21	0
chr16	58701437	58701437	A	A	intronic	SLC38A7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	16	16	0	0
chr16	58705934	58705934	CAAAGG	C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2116.54	0	NaN	NA	NA	224	0	212	16
chr16	58705938	58705938	G	C	intronic	SLC38A7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.20569	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	3	0	3	0
chr16	5885940	5885940	C	C	intergenic	MIR8065,RBFOX1	dist=203373;dist=183192	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr16	597265	597265	C	C	exonic	CAPN15	NaN	synonymous SNV	CAPN15:NM_005632:exon4:c.C427C:p.P143P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr16	599737	599737	C	T	exonic	CAPN15	NaN	synonymous SNV	CAPN15:NM_005632:exon7:c.C1965T:p.P655P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.30769230769230677	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr16	602046	602046	T	C	intronic	CAPN15	NaN	NaN	NaN	rs7196821	NaN	0.975839	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	167.541949	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	67	0	67	58
chr16	602313	602313	C	A	exonic	CAPN15	NaN	synonymous SNV	CAPN15:NM_005632:exon11:c.C2520A:p.A840A	rs9930550	ID=COSM435473;OCCURENCE=2(breast)	0.635184	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.907009	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	16	16	32
chr16	614115	614115	T	T	exonic	PRR35	NaN	synonymous SNV	PRR35:NM_145270:exon2:c.T821T:p.L274L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	614405	614405	G	T	intronic	PRR35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.01951131958090639	NA	0	0	NaN	NA	NA	31	17	14	18
chr16	61761166	61761166	A	A	intronic	CDH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr16	61855047	61855047	A	T	intronic	CDH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	61855049	61855049	A	T	intronic	CDH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	624713	624713	C	T	exonic	PIGQ	NaN	synonymous SNV	PIGQ:NM_004204:exon2:c.C639T:p.C213C,PIGQ:NM_148920:exon2:c.C639T:p.C213C	rs4984669	ID=COSM435480;OCCURENCE=1(breast)	0.536542	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.00996	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	28	15	37
chr16	626377	626377	G	T	intronic	PIGQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	626378	626378	A	G	intronic	PIGQ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	642249	642249	T	C	intronic	RAB40C	NaN	NaN	NaN	rs35642938	NaN	0.544529	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr16	646551	646551	T	T	intronic	RAB40C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	646552	646552	C	C	intronic	RAB40C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	64981880	64981880	T	T	exonic	CDH11	NaN	synonymous SNV	CDH11:NM_001797:exon13:c.A2017A:p.T673T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	204	192	0	0
chr16	64981894	64981894	C	C	exonic	CDH11	NaN	synonymous SNV	CDH11:NM_001797:exon13:c.G2003G:p.G668G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	143	130	0	0
chr16	64985005	64985005	A	A	intronic	CDH11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	65006885	65006885	C	A	exonic	CDH11	NaN	nonsynonymous SNV	CDH11:NM_001797:exon9:c.G1312T:p.G438C	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	4.825	H	-1.11	T	0.974	D	0.814	D	0.995	4.512	24.3	5.14	2.573	7.426	17.959	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.822269	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	83	74	9	0
chr16	65022114	65022114	C	T	exonic	CDH11	NaN	synonymous SNV	CDH11:NM_001797:exon7:c.G945A:p.S315S	rs28216	NaN	0.223642	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	113.049365	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	94	48	46	37
chr16	65022273	65022273	A	A	intronic	CDH11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr16	66355924	66355924	C	G	intergenic	LINC00922,CDH5	dist=745721;dist=44601	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	28	15	13	0
chr16	66413303	66413303	A	G	exonic	CDH5	NaN	synonymous SNV	CDH5:NM_001795:exon2:c.A63G:p.A21A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	71.002215	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	75	42	33	1
chr16	66424284	66424284	T	G	intronic	CDH5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.227872	nearby_gap_events	REJECT	44	35	9	0
chr16	66426181	66426181	T	A	exonic	CDH5	NaN	nonsynonymous SNV	CDH5:NM_001795:exon7:c.T1112A:p.I371N	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.001	B	0.005	B	.	.	0.865	N	1.665	L	0.09	T	-0.921	T	0.143	T	0.158	0.784	8.135	1.07	-0.089	0.085	3.432	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.742316	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	247	232	15	0
chr16	66432303	66432303	GACCACCCCACCAC	GACCA,GACCAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	70.8395	0	NaN	NA	NA	18	6	5	0
chr16	66432423	66432423	T	C	exonic	CDH5	NaN	nonsynonymous SNV	CDH5:NM_001795:exon10:c.T1550C:p.I517T	rs1049970	ID=COSM1128913;OCCURENCE=1(prostate)	0.744409	0.1	T	0.0	B	0.001	B	.	.	0.000	P	-0.97	N	0.26	T	-0.995	T	0.000	T	0.015	0.804	8.228	3.99	0.699	1.933	7.395	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	357.805	0	104.090742	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	1	38	18
chr16	66432424	66432424	C	T	exonic	CDH5	NaN	synonymous SNV	CDH5:NM_001795:exon10:c.C1551T:p.I517I	rs3826229	ID=COSM1378765;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.415136	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.005307	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	18	22	0
chr16	66434942	66434942	A	G	intronic	CDH5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	38	10	28	0
chr16	66527250	66527250	G	C	exonic	BEAN1	NaN	nonsynonymous SNV	BEAN1:NM_001197225:exon5:c.G533C:p.G178A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.556198	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	231	214	17	0
chr16	66550961	66550961	T	G	intronic	TK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.104968	nearby_gap_events	REJECT	111	103	8	0
chr16	66551845	66551845	A	C	intronic	TK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	19	6	13	0
chr16	66575726	66575726	T	T	intronic	TK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	26	24	0	0
chr16	66584231	66584231	C	T	UTR5	TK2	NM_001172645:c.-267G>A,NM_001172644:c.-267G>A,NM_004614:c.-267G>A,NM_001271934:c.-2349G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr16	66584232	66584232	T	C	UTR5	TK2	NM_001172645:c.-268A>G,NM_001172644:c.-268A>G,NM_004614:c.-268A>G,NM_001271934:c.-2350A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr16	66601007	66601007	A	A	intronic	CKLF-CMTM1,CMTM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	66613842	66613842	G	C	intronic	CMTM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.133678	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	322	305	17	0
chr16	66620838	66620838	T	G	intronic	CMTM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	66620839	66620839	G	A	intronic	CMTM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	66643229	66643229	G	A	intronic	CMTM3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.613492	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	91	85	6	0
chr16	66655826	66655826	C	A	UTR3	CMTM4	NM_181521:c.*135G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	66657492	66657492	C	T	intronic	CMTM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.742292	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	80	76	4	0
chr16	66657495	66657495	G	A	intronic	CMTM4	NaN	NaN	NaN	rs12446021	NaN	0.0517173	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	56.65358	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	79	50	29	13
chr16	66670651	66670651	C	A	intronic	CMTM4	NaN	NaN	NaN	rs355971	NaN	0.166334	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	596.364	0	NaN	NA	NA	253	124	129	8
chr16	667338	667338	A	A	intronic	RAB40C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	66757787	66757787	T	A	intronic	DYNC1LI2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.406815	clustered_read_position	REJECT	21	16	5	2
chr16	66811145	66811145	T	A	exonic	CCDC79	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC79:NM_001136505:exon11:c.A946T:p.S316C	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.991	D	0.000	D	0.906	N	1.935	M	1.91	T	-0.934	T	0.133	T	0.792	1.755	11.83	5.33	2.025	3.037	9.509	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.479011	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	57	48	9	0
chr16	66824362	66824362	G	A	intronic	CCDC79	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	13	1	10	0
chr16	66842794	66842794	A	T	intronic	NAE1	NaN	NaN	NaN	rs363169	NaN	0.58107	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	15	6	9	0
chr16	66858810	66858810	A	G	intronic	NAE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.710419	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	166	149	17	0
chr16	66884622	66884622	A	A	intronic	CA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr16	66885652	66885652	A	G	intronic	CA7	NaN	NaN	NaN	rs151460	NaN	0.624601	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	89.806583	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	74	36	38	49
chr16	66919446	66919446	A	G	exonic	PDP2	NaN	nonsynonymous SNV	PDP2:NM_020786:exon2:c.A1259G:p.N420S	NaN	NaN	NaN	0.22	T	0.771	P	0.449	P	0.000	D	0.999	D	1.535	L	2.26	T	-1.140	T	0.048	T	0.16	2.982	15.94	4.7	1.031	4.933	11.684	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.454075	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	221	214	7	0
chr16	66944570	66944570	C	A	intronic	CDH16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	66946888	66946888	T	G	intronic	CDH16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.010810554494861553	NA	0	0	NaN	NA	NA	67	53	14	0
chr16	66951689	66951689	A	A	intronic	CDH16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	66958792	66958792	C	A	exonic	RRAD	NaN	synonymous SNV	RRAD:NM_001128850:exon2:c.G291T:p.L97L,RRAD:NM_004165:exon2:c.G291T:p.L97L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.383381	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	48	41	7	0
chr16	66958793	66958793	A	G	exonic	RRAD	NaN	nonsynonymous SNV	RRAD:NM_001128850:exon2:c.T290C:p.L97P,RRAD:NM_004165:exon2:c.T290C:p.L97P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.993	D	0.000	D	1.000	D	4.04	H	-1.45	T	0.812	D	0.772	D	0.992	4.801	27.1	4.24	1.773	6.916	13.522	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.930256	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	47	39	8	0
chr16	66959281	66959281	C	A	intronic	RRAD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	66966639	66966639	A	G	intronic	FAM96B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.537091	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	108	99	9	0
chr16	66966640	66966640	G	A	intronic	FAM96B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.453827	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	96	81	15	0
chr16	66969532	66969532	G	T	exonic	CES2	NaN	nonsynonymous SNV	CES2:NM_003869:exon1:c.G186T:p.E62D,CES2:NM_198061:exon1:c.G186T:p.E62D	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.244	B	0.073	B	.	.	1.000	N	0	N	-0.19	T	-1.014	T	0.096	T	0.078	3.058	16.21	1.01	0.254	-0.804	4.076	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.204987	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	8	6	2	0
chr16	66975370	66975370	G	G	intronic	CES2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	66976229	66976229	T	G	intronic	CES2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	9	4	4	0
chr16	66976489	66976489	T	T	intronic	CES2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	67003734	67003734	A	G	intronic	CES3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	67003735	67003735	C	A	intronic	CES3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	67003736	67003736	A	G	intronic	CES3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	67007947	67007947	C	T	UTR3	CES3	NM_024922:c.*995C>T,NM_001185177:c.*995C>T,NM_001185176:c.*995C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	67013796	67013796	A	T	intergenic	CES3,CES4A	dist=4744;dist=8696	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	67052180	67052180	C	A	intergenic	CES4A,CBFB	dist=8521;dist=10870	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	67070577	67070577	GTTTTT	GTTTCG,GTTTCT,GTTTT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	647.505	0	NaN	NA	NA	100	0	4	2
chr16	67070581	67070581	T	C	exonic	CBFB	NaN	nonsynonymous SNV	CBFB:NM_001755:exon3:c.T205C:p.F69L,CBFB:NM_022845:exon3:c.T205C:p.F69L	NaN	NaN	NaN	0.65	T	0.929	P	0.956	D	0.000	D	1.000	D	1.59	L	.	.	-0.707	T	0.283	T	0.677	2.624	14.74	5.05	2.022	7.462	13.909	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	23	14	9	0
chr16	67154172	67154172	A	A	intronic	C16orf70	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	67178869	67178869	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	0	2,2	0
chr16	67178870	67178870	T	A	intronic	C16orf70	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	67178872	67178872	T	A	intronic	C16orf70	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	67178874	67178874	T	A	intronic	C16orf70	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	67195655	67195655	T	T	UTR5	FBXL8	NM_018378:c.-34T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	67209131	67209131	A	A	UTR3	NOL3	NM_001276319:c.*174A>A,NM_001276312:c.*174A>A,NM_001276307:c.*174A>A,NM_001276309:c.*174A>A,NM_001185057:c.*131A>A,NM_003946:c.*174A>A,NM_001276311:c.*131A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	67210660	67210660	G	A	UTR3	KIAA0895L	NM_001040715:c.*54C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.150359	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	48	43	5	1
chr16	67229547	67229547	G	T	intronic	E2F4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	32.0875	0	NaN	NA	NA	203	167	36	13
chr16	67233266	67233266	A	C	exonic	ELMO3	NaN	nonsynonymous SNV	ELMO3:NM_024712:exon1:c.A196C:p.K66Q	rs12923138	NaN	0.596845	0.42	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.000	P	-1.555	N	2.55	T	-0.985	T	0.000	T	0.049	0.796	8.190	4.18	1.197	2.004	8.000	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.027222	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	6
chr16	67236008	67236008	T	T	intronic	ELMO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	50	40	0	0
chr16	67237195	67237195	G	A	intronic	ELMO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.488982	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	26	19	7	0
chr16	67237278	67237278	A	A	exonic	ELMO3	NaN	synonymous SNV	ELMO3:NM_024712:exon18:c.A1988A:p.H663H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr16	67242271	67242271	G	G	exonic	LRRC29	NaN	synonymous SNV	LRRC29:NM_001004055:exon4:c.C229C:p.L77L,LRRC29:NM_012163:exon4:c.C229C:p.L77L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	251	238	0	0
chr16	67261648	67261648	A	T	intronic	TMEM208	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	67261653	67261653	C	T	intronic	TMEM208	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	67261762	67261762	A	G	exonic	TMEM208	NaN	synonymous SNV	TMEM208:NM_014187:exon2:c.A30G:p.R10R	rs9941017	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.442788	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	369	361	8	0
chr16	67264732	67264732	A	A	intronic	FHOD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	17	17	0	0
chr16	67272409	67272409	T	G	intronic	FHOD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr16	67286843	67286843	A	G	intronic	SLC9A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr16	67288887	67288887	T	T	intronic	SLC9A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr16	67291547	67291547	A	G	intronic	SLC9A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.321938	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	160	153	7	0
chr16	67293649	67293649	C	T	intronic	SLC9A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.323388	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	349	342	7	0
chr16	67293686	67293686	C	G	intronic	SLC9A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.908482	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	92	82	10	0
chr16	67305037	67305037	A	A	exonic	SLC9A5	NaN	synonymous SNV	SLC9A5:NM_004594:exon16:c.A2615A:p.K872K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	16	15	0	0
chr16	67318385	67318385	A	A	intronic	PLEKHG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr16	67320027	67320027	T	C	intronic	PLEKHG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	67320784	67320784	A	A	exonic	PLEKHG4	NaN	synonymous SNV	PLEKHG4:NM_001129731:exon15:c.A2644A:p.T882T,PLEKHG4:NM_015432:exon16:c.A2887A:p.T963T,PLEKHG4:NM_001129728:exon17:c.A2887A:p.T963T,PLEKHG4:NM_001129729:exon17:c.A2887A:p.T963T,PLEKHG4:NM_001129727:exon18:c.A2887A:p.T963T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	30	28	0	0
chr16	67323442	67323442	G	T	UTR3	KCTD19	NM_001100915:c.*30C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.217327	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	27	18	9	0
chr16	67328926	67328926	T	C	exonic	KCTD19	NaN	synonymous SNV	KCTD19:NM_001100915:exon10:c.A1425G:p.E475E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.971529	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	48	45	3	0
chr16	67333251	67333251	T	G	intronic	KCTD19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr16	67400984	67400984	G	A	exonic	LRRC36	NaN	synonymous SNV	LRRC36:NM_001161575:exon5:c.G456A:p.G152G,LRRC36:NM_018296:exon8:c.G819A:p.G273G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.30724	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	136	130	6	0
chr16	67412465	67412465	A	C	intronic	LRRC36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	17	12	5	0
chr16	67418811	67418811	T	C	exonic	LRRC36	NaN	nonsynonymous SNV	LRRC36:NM_001161575:exon11:c.T1721C:p.L574P,LRRC36:NM_018296:exon14:c.T2084C:p.L695P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.16	M	1.5	T	-0.222	T	0.389	T	0.759	3.831	19.45	5.98	2.289	3.051	8.969	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.699239		KEEP	94	88	6	0
chr16	67424545	67424545	A	A	intronic	TPPP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	67432411	67432411	A	G	intronic	ZDHHC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.609948	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	131	126	5	0
chr16	67433165	67433165	T	T	intronic	ZDHHC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr16	67440060	67440060	C	T	intronic	ZDHHC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.890108	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	238	222	16	0
chr16	67466527	67466527	T	C	intronic	HSD11B2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	67466528	67466528	A	T	intronic	HSD11B2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	67466529	67466529	G	T	intronic	HSD11B2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	67466531	67466531	G	T	intronic	HSD11B2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	67472566	67472566	C	T	exonic	ATP6V0D1	NaN	synonymous SNV	ATP6V0D1:NM_004691:exon8:c.G921A:p.L307L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.227991	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	226	213	13	0
chr16	67477109	67477109	G	T	intronic	ATP6V0D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	25	9	16	0
chr16	67477151	67477151	A	A	intronic	ATP6V0D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	67478301	67478301	A	G	intronic	ATP6V0D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.620075	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	371	361	10	0
chr16	67514833	67514833	T	T	intronic	ATP6V0D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr16	67516503	67516503	T	G	UTR3	AGRP	NM_001138:c.*36A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	67516736	67516736	A	A	intronic	AGRP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	35	31	0	0
chr16	67573618	67573618	C	T	intronic	FAM65A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.409005	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	75	68	7	0
chr16	67573622	67573622	C	A	intronic	FAM65A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.043839	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	74	67	7	0
chr16	67574765	67574765	A	A	intronic	FAM65A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	67576604	67576604	A	G	exonic	FAM65A	NaN	nonsynonymous SNV	FAM65A:NM_001193522:exon13:c.A1927G:p.T643A,FAM65A:NM_001193523:exon13:c.A1975G:p.T659A,FAM65A:NM_001193524:exon13:c.A1957G:p.T653A,FAM65A:NM_024519:exon13:c.A1915G:p.T639A	NaN	NaN	NaN	0.54	T	0.013	B	0.005	B	0.142	N	1.000	N	0	N	2.38	T	-0.971	T	0.015	T	0.213	0.771	8.073	-0.087	0.303	-0.022	3.662	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.477645	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	5	2	3	0
chr16	67576690	67576690	CA	AC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	212.689	0	NaN	NA	NA	35	6	28	24
chr16	67579991	67579991	A	C	intronic	FAM65A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	21.2458	0	NaN	NA	NA	7	4	3	6
chr16	67679864	67679864	G	C	intronic	RLTPR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	67679867	67679867	T	A	intronic	RLTPR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	67679869	67679869	C	G	intronic	RLTPR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	67679870	67679870	C	T	intronic	RLTPR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	67679871	67679871	A	C	intronic	RLTPR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	67689917	67689917	T	T	intronic	RLTPR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	67693980	67693980	C	A	intronic	ACD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0931677018633539	NA	0	0	NaN	NA	NA	11	8	3	0
chr16	67694085	67694085	A	A	exonic	ACD	NaN	synonymous SNV	ACD:NM_001082486:exon1:c.T297T:p.I99I,ACD:NM_001082487:exon1:c.T297T:p.I99I,ACD:NM_022914:exon1:c.T297T:p.I99I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	67694261	67694261	G	A	exonic	ACD	NaN	stopgain	ACD:NM_001082486:exon1:c.C121T:p.Q41X,ACD:NM_001082487:exon1:c.C121T:p.Q41X,ACD:NM_022914:exon1:c.C121T:p.Q41X	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	0.038	N	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.893	28.1	2.32	1.059	0.952	7.110	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.070519		KEEP	40	36	4	0
chr16	67697847	67697847	T	T	exonic	ENKD1	NaN	synonymous SNV	ENKD1:NM_032140:exon4:c.A572A:p.E191E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	46	41	0	0
chr16	67701455	67701455	C	G	intronic	C16orf86	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.531064	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	44	37	7	0
chr16	67701471	67701471	G	G	intronic	C16orf86	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	32	30	0	0
chr16	67708166	67708166	C	A	downstream	GFOD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	67708167	67708167	A	C	downstream	GFOD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	67769120	67769120	A	A	intronic	RANBP10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	67778376	67778376	A	G	intronic	RANBP10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr16	67855141	67855141	G	C	intronic	TSNAXIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	67865760	67865760	G	T	exonic	CENPT	NaN	synonymous SNV	CENPT:NM_025082:exon8:c.C420A:p.P140P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	13	11	2	0
chr16	67865869	67865869	A	A	intronic	CENPT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	62	57	0	0
chr16	67876900	67876900	A	T	exonic	THAP11	NaN	nonsynonymous SNV	THAP11:NM_020457:exon1:c.A443T:p.N148I	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.838	P	0.202	B	0.270	N	1.000	N	0.345	N	0.44	T	-1.031	T	0.078	T	0.475	1.847	12.14	3.63	2.143	-0.176	9.782	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	13	8	5	0
chr16	67876902	67876902	C	G	exonic	THAP11	NaN	nonsynonymous SNV	THAP11:NM_020457:exon1:c.C445G:p.L149V	NaN	NaN	NaN	0.51	T	0.005	B	0.004	B	0.000	D	1.000	N	1.04	L	1.45	T	-1.063	T	0.054	T	0.106	1.433	10.73	5.33	2.653	0.000	12.635	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	13	8	4	0
chr16	67904866	67904866	A	A	UTR3	NUTF2	NM_005796:c.*50A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr16	67907428	67907428	A	A	intronic	EDC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	67910795	67910795	CCAAGTATGACTGG	C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	68.3759	0	NaN	NA	NA	162	126	40	0
chr16	67914513	67914513	G	T	exonic	EDC4	NaN	synonymous SNV	EDC4:NM_014329:exon18:c.G2151T:p.L717L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.824291	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	103	88	15	0
chr16	67915607	67915607	T	G	exonic	EDC4	NaN	nonsynonymous SNV	EDC4:NM_014329:exon22:c.T2863G:p.W955G	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.097	B	0.031	B	0.002	N	0.993	N	0	N	.	.	-1.078	T	0.035	T	0.555	1.366	10.49	4.4	2.109	1.212	2.750	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.989786	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	96	88	8	0
chr16	67963717	67963717	T	T	UTR3	CTRL	NM_001907:c.*120A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr16	67967878	67967878	A	C	downstream	PSMB10	NaN	NaN	NaN	rs7187289	NaN	0.319688	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr16	67968860	67968860	A	C	intronic	PSMB10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr16	67968861	67968861	T	A	intronic	PSMB10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr16	67968862	67968862	G	A	intronic	PSMB10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	2	0
chr16	67968863	67968863	G	A	intronic	PSMB10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr16	67968865	67968865	T	A	intronic	PSMB10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr16	67968866	67968866	G	T	intronic	PSMB10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr16	67974462	67974462	A	A	intronic	LCAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr16	67975642	67975642	T	A	intronic	LCAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	4	7	0
chr16	67975643	67975643	T	C	intronic	LCAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	4	7	0
chr16	67977434	67977434	G	T	UTR3	SLC12A4	NM_005072:c.*1309C>A,NM_001145961:c.*1309C>A,NM_001145963:c.*1309C>A,NM_001145962:c.*1309C>A,NM_001145964:c.*1309C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	67979217	67979217	C	A	intronic	SLC12A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.015566	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	214	199	15	0
chr16	67985271	67985271	C	C	intronic	SLC12A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	67985272	67985272	T	T	intronic	SLC12A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	67985275	67985275	C	C	intronic	SLC12A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	67985653	67985653	A	G	intronic	SLC12A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	9	5	3	0
chr16	67985654	67985654	G	A	intronic	SLC12A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr16	67986405	67986405	A	A	intronic	SLC12A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	67997525	67997525	A	A	intronic	SLC12A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	68010536	68010536	T	T	intronic	DPEP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	68014152	68014152	T	G	exonic	DPEP3	NaN	nonsynonymous SNV	DPEP3:NM_001129758:exon1:c.A207C:p.R69S,DPEP3:NM_022357:exon1:c.A207C:p.R69S	NaN	NaN	NaN	0.67	T	0.001	B	0.0	B	0.848	N	1.000	N	0.41	N	2.3	T	-0.962	T	0.017	T	0.059	-0.643	1.164	-3.16	-0.698	-3.179	0.219	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5371	0	NaN	NA	NA	6	4	2	3
chr16	68017611	68017611	C	A	intergenic	DPEP3,DPEP2	dist=3159;dist=3682	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	68025694	68025694	T	C	intronic	DPEP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.979352	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	331	322	9	0
chr16	68026050	68026050	A	G	exonic	DPEP2	NaN	nonsynonymous SNV	DPEP2:NM_022355:exon4:c.T437C:p.L146P	rs368802189	ID=COSM558609;OCCURENCE=1(lung)	NaN	0.01	D	0.087	B	0.117	B	0.193	N	1.000	D	1.51	L	1.85	T	-1.068	T	0.068	T	0.768	2.865	15.54	4.77	2.098	7.857	12.480	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.110309	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	62	57	5	0
chr16	68026196	68026196	A	A	intronic	DPEP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	68057096	68057096	T	C	exonic	DDX28	NaN	nonsynonymous SNV	DDX28:NM_018380:exon1:c.A10G:p.T4A	rs237831	NaN	0.972843	1	T	0.0	B	0.0	B	0.030	N	1.000	P	0	N	4.15	T	-0.949	T	0.000	T	0.042	-0.475	1.812	-5.55	-1.490	-1.874	0.221	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	139.894003	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	0	47	57
chr16	681280	681280	G	T	exonic	WFIKKN1	NaN	synonymous SNV	WFIKKN1:NM_053284:exon1:c.G27T:p.P9P	rs4984905	NaN	0.313299	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	23
chr16	68156691	68156691	G	A	exonic	NFATC3	NaN	nonsynonymous SNV	NFATC3:NM_004555:exon2:c.G905A:p.R302K,NFATC3:NM_173163:exon2:c.G905A:p.R302K,NFATC3:NM_173165:exon2:c.G905A:p.R302K	NaN	NaN	NaN	.	.	0.999	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	2.495	M	2.71	T	-1.021	T	0.120	T	0.675	4.753	26.6	5.39	2.683	9.420	19.518	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.91479	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	521	499	22	0
chr16	68157051	68157051	C	T	intronic	NFATC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr16	68157052	68157052	A	T	intronic	NFATC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	2	3	0
chr16	68160309	68160309	T	G	intronic	NFATC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	68160311	68160311	A	C	intronic	NFATC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	68160316	68160316	A	C	intronic	NFATC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	68200944	68200944	A	A	intronic	NFATC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	125	102	0	0
chr16	68215323	68215323	T	C	intronic	NFATC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	2	3	0
chr16	68224582	68224582	C	T	intronic	NFATC3	NaN	NaN	NaN	rs7199588	NaN	0.194089	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.177682	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	12	19	14
chr16	68225729	68225729	A	A	intronic	NFATC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	18	14	0	0
chr16	68264481	68264481	A	T	intronic	ESRP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	68264558	68264558	T	C	intronic	ESRP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	68265097	68265097	T	C	exonic	ESRP2	NaN	synonymous SNV	ESRP2:NM_024939:exon12:c.A1695G:p.P565P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.034688	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	132	122	10	0
chr16	68267384	68267384	A	A	ncRNA_exonic	MIR6773	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr16	68277349	68277349	C	G	intergenic	ESRP2,PLA2G15	dist=7213;dist=1898	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	68308932	68308932	G	G	exonic	SLC7A6	NaN	synonymous SNV	SLC7A6:NM_003983:exon3:c.G303G:p.L101L,SLC7A6:NM_001076785:exon4:c.G303G:p.L101L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	111	85	0	0
chr16	68349824	68349824	C	T	UTR5	PRMT7	NM_019023:c.-59C>T,NM_001184824:c.-59C>T,NM_001290018:c.-59C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.686327	nearby_gap_events	REJECT	291	281	10	0
chr16	68379765	68379765	A	A	intronic	PRMT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr16	68381439	68381439	T	T	intronic	PRMT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr16	68381667	68381667	A	A	intronic	PRMT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	69	NaN	NA	NA	38	36	0	0
chr16	68387373	68387373	C	T	intronic	PRMT7	NaN	NaN	NaN	rs1562479	NaN	0.555911	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	189	143	46	40
chr16	68387579	68387579	T	T	intronic	PRMT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	68389512	68389512	T	T	intronic	PRMT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr16	68395675	68395675	G	A	intronic	SMPD3	NaN	NaN	NaN	rs56899435	NaN	0.13738	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.869804	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	2	3	11
chr16	68397668	68397668	G	G	intronic	SMPD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	46	37	0	0
chr16	68397775	68397775	C	T	intronic	SMPD3	NaN	NaN	NaN	rs3743743	NaN	0.128794	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	123.497	0	47.255839	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	11	20	9
chr16	68404618	68404618	T	T	intronic	SMPD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	684225	684225	A	A	downstream	C16orf13,WFIKKN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	686337	686337	G	A	UTR5	C16orf13	NM_032366:c.-47C>T,NM_001040162:c.-47C>T,NM_001040161:c.-47C>T,NM_001040165:c.-47C>T,NM_001040160:c.-47C>T,NM_001288710:c.-47C>T	NaN	NaN	rs117667029	NaN	0.0642971	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	54.7382	0	17.953234	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	2	7	4
chr16	686376	686376	T	C	upstream	C16orf13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.009709	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	12	10	2	0
chr16	68721340	68721340	G	A	intronic	CDH3	NaN	NaN	NaN	rs2296406	NaN	0.597244	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	275.509	0	NaN	NA	NA	101	46	55	47
chr16	68721419	68721419	C	G	exonic	CDH3	NaN	nonsynonymous SNV	CDH3:NM_001793:exon12:c.C1575G:p.S525R	NaN	NaN	NaN	0.52	T	0.368	B	0.293	B	0.030	N	0.985	N	1.545	L	0.56	T	-0.990	T	0.125	T	0.278	-0.318	2.489	0.79	-0.065	-0.546	7.266	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.718029	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	46	38	8	0
chr16	68835819	68835819	A	G	intronic	CDH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	11	5	4	0
chr16	68857187	68857187	T	T	intronic	CDH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	68867432	68867432	A	A	UTR3	CDH1	NM_004360:c.*30A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	68952919	68952919	A	C	intronic	TANGO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	69056921	69056921	A	A	intronic	TANGO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr16	69117506	69117506	T	T	exonic	TANGO6	NaN	synonymous SNV	TANGO6:NM_024562:exon18:c.T3227T:p.M1076M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	30	25	0	0
chr16	69154918	69154918	T	T	intronic	CHTF8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	69304172	69304172	C	T	exonic	SNTB2	NaN	nonsynonymous SNV	SNTB2:NM_006750:exon4:c.C1132T:p.P378S	NaN	NaN	NaN	0.32	T	0.897	P	0.794	P	0.000	D	1.000	D	2.47	M	1.48	T	-0.938	T	0.186	T	0.781	5.093	31	5.99	2.840	4.810	20.073	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.354571	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	314	308	6	0
chr16	69304259	69304259	A	G	intronic	SNTB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	1	0
chr16	69350328	69350328	A	A	intronic	VPS4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	69356669	69356669	A	T	intronic	VPS4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	11	0	9	0
chr16	69383569	69383569	T	T	intronic	TMED6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	34	30	0	0
chr16	69383570	69383570	A	G/T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr16	69385415	69385415	C	C	intronic	TMED6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	169	139	0	0
chr16	69395212	69395212	G	A	intronic	TERF2	NaN	NaN	NaN	rs34295116	NaN	0.0397364	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	32	18	13	0
chr16	69395434	69395434	A	G	intronic	TERF2	NaN	NaN	NaN	rs251796	NaN	0.241613	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.992313	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	12	18	32
chr16	69397380	69397380	C	C	intronic	TERF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	69397382	69397382	C	C	intronic	TERF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	69404568	69404568	T	A	intronic	TERF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr16	69458575	69458575	T	T	UTR5	CYB5B	NM_030579:c.-12T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	69681556	69681556	A	A	intronic	NFAT5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	69711270	69711270	C	A	intronic	NFAT5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.575086	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	195	184	11	0
chr16	69718859	69718859	A	G	exonic	NFAT5	NaN	nonsynonymous SNV	NFAT5:NM_006599:exon10:c.A1706G:p.E569G,NFAT5:NM_001113178:exon11:c.A1757G:p.E586G,NFAT5:NM_138713:exon11:c.A1760G:p.E587G,NFAT5:NM_173214:exon11:c.A1478G:p.E493G,NFAT5:NM_173215:exon11:c.A1478G:p.E493G,NFAT5:NM_138714:exon12:c.A1478G:p.E493G	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.978	D	0.69	P	0.000	D	1.000	D	1.845	L	0.74	T	-0.809	T	0.194	T	0.676	4.632	25.4	5.32	2.014	7.534	15.286	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	75	39	36	0
chr16	69728016	69728016	A	G	exonic	NFAT5	NaN	nonsynonymous SNV	NFAT5:NM_006599:exon12:c.A4234G:p.T1412A,NFAT5:NM_001113178:exon13:c.A4285G:p.T1429A,NFAT5:NM_138713:exon13:c.A4288G:p.T1430A,NFAT5:NM_173214:exon13:c.A4006G:p.T1336A,NFAT5:NM_173215:exon13:c.A4006G:p.T1336A,NFAT5:NM_138714:exon14:c.A4006G:p.T1336A	NaN	NaN	NaN	0.23	T	0.001	B	0.001	B	0.000	D	0.854	N	0	N	0.7	T	-1.061	T	0.057	T	0.095	1.788	11.94	3.02	0.396	1.218	6.463	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.812018	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	77	73	4	0
chr16	69782855	69782855	C	T	exonic	NOB1	NaN	nonsynonymous SNV	NOB1:NM_014062:exon6:c.G692A:p.R231Q	rs3811348	NaN	0.34385	.	.	0.003	B	0.002	B	0.283	N	1.000	P	-1.37	N	1.69	T	-0.968	T	0.000	T	0.041	0.320	5.737	1.11	0.315	-0.419	4.622	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.844141	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	19	13	39
chr16	69788832	69788832	G	G	UTR5	NOB1	NM_014062:c.-19C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr16	69788833	69788833	A	A	UTR5	NOB1	NM_014062:c.-20T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr16	69788938	69788938	C	T	upstream	NOB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr16	698286	698286	C	T	UTR3	FAM195A	NM_138418:c.*96C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.636	T	0.254	T	.	-0.270	2.706	3.1	0.841	0.950	8.071	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.512318	clustered_read_position	REJECT	37	33	4	0
chr16	69833646	69833646	A	T	intronic	WWP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	69965397	69965397	T	C	intronic	WWP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.811749	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	33	28	5	0
chr16	69965824	69965824	G	T	intronic	WWP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	69965826	69965826	A	G	intronic	WWP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr16	69965827	69965827	C	G	intronic	WWP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	69967731	69967731	C	CA	intronic	WWP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1236.81	0	NaN	NA	NA	142	0	19	7
chr16	69967732	69967732	G	A	intronic	WWP2	NaN	NaN	NaN	rs8047818	NaN	0.818091	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1230.09	0	NaN	NA	NA	108	0	108	52
chr16	69968892	69968892	G	A	intronic	WWP2	NaN	NaN	NaN	rs12708902	NaN	0.714257	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	69972773	69972773	T	G	intronic	WWP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr16	70161159	70161159	G	T	intronic	PDPR	NaN	NaN	NaN	rs142629299	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	88.2153	0	NaN	NA	NA	9	0	9	3
chr16	70161203	70161203	A	G	exonic	PDPR	NaN	nonsynonymous SNV	PDPR:NM_017990:exon4:c.A268G:p.S90G	NaN	NaN	NaN	0.86	T	0.001	B	0.002	B	0.000	D	1.000	D	-0.91	N	-1.53	D	-0.815	T	0.172	T	0.428	0.664	7.558	4.7	1.873	9.119	13.651	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.20588235294117738	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr16	70190884	70190884	T	C	ncRNA_intronic	LOC400541	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	70211409	70211409	C	T	intronic	CLEC18C	NaN	NaN	NaN	rs77004202	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	8.194494523817612E-5	NA	0	0	NaN	NA	NA	298	238	60	0
chr16	70288007	70288007	C	T	intronic	AARS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1025641025641025	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr16	70310841	70310841	C	G	intronic	AARS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	70310843	70310843	T	A	intronic	AARS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	70310846	70310846	T	C	intronic	AARS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	703701	703701	G	G	intronic	WDR90	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	71	NaN	NA	NA	57	50	0	0
chr16	70422372	70422372	C	G	exonic	ST3GAL2	NaN	nonsynonymous SNV	ST3GAL2:NM_006927:exon4:c.G611C:p.S204T	NaN	NaN	NaN	0.62	T	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	1.245	L	1.38	T	-1.021	T	0.165	T	0.76	5.414	35	5.79	2.750	7.735	19.635	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	120	23	97	0
chr16	70432471	70432471	T	T	UTR5	ST3GAL2	NM_006927:c.-38A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	35	30	0	0
chr16	70462723	70462723	G	G	intronic	ST3GAL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	70462724	70462724	A	A	intronic	ST3GAL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	70462725	70462725	C	C	intronic	ST3GAL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	70502610	70502610	C	G	intronic	FUK	NaN	NaN	NaN	rs12446395	NaN	0.600439	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	160.098027	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	0	59	47
chr16	70509088	70509088	T	T	intronic	FUK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr16	70515255	70515255	C	A	intronic	COG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.677294	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	387	371	16	0
chr16	70516109	70516109	G	A	intronic	COG4	NaN	NaN	NaN	rs12447090	NaN	0.285743	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	65.842316	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	78	49	29	42
chr16	70531325	70531325	A	A	intronic	COG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr16	70531832	70531832	T	C	intronic	COG4	NaN	NaN	NaN	rs199544822	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.161371	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	335	326	9	0
chr16	70534978	70534978	G	A	exonic	COG4	NaN	synonymous SNV	COG4:NM_001195139:exon9:c.C1078T:p.L360L,COG4:NM_015386:exon9:c.C1078T:p.L360L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.43045	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	236	229	7	0
chr16	70542280	70542280	T	T	intronic	COG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	70564854	70564854	A	A	intronic	SF3B3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr16	70588535	70588535	T	C	intronic	SF3B3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	8	6	0
chr16	705920	705920	G	C	intronic	WDR90	NaN	NaN	NaN	rs9930754	NaN	0.394169	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.630562	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	13	17	32
chr16	70595511	70595511	T	G	intronic	SF3B3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	98	NaN	NA	NA	13	7	6	0
chr16	70595714	70595714	A	A	intronic	SF3B3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	70599362	70599362	G	C	exonic	SF3B3	NaN	nonsynonymous SNV	SF3B3:NM_012426:exon20:c.G2761C:p.A921P	NaN	NaN	NaN	0.22	T	0.026	B	0.167	B	0.005	N	0.999	D	0.345	N	0.93	T	-1.051	T	0.097	T	0.703	3.118	16.42	5.96	2.832	5.594	20.422	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	1.2882684741745345E-4	NA	0	0	NaN	NA	NA	86	65	21	0
chr16	706010	706010	C	CA	intronic	WDR90	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.692492	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	59.8423	0	NaN	NA	NA	21	10	10	7
chr16	70601254	70601254	G	A	intronic	SF3B3	NaN	NaN	NaN	rs7197262	NaN	0.471446	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	44.3335	0	NaN	NA	NA	20	12	9	28
chr16	70602221	70602221	C	T	exonic	SF3B3	NaN	synonymous SNV	SF3B3:NM_012426:exon22:c.C2988T:p.I996I	rs12909	ID=COSM148101;OCCURENCE=1(stomach)	0.506789	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	72.70082	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	14	29	36
chr16	70604082	70604082	A	A	intronic	SF3B3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr16	70680978	70680978	A	G	intronic	IL34	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	70680982	70680982	T	A	intronic	IL34	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	70688142	70688142	C	T	intronic	IL34	NaN	NaN	NaN	rs149557040	NaN	0.00838658	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	16	6	10	0
chr16	70693858	70693858	A	A	intronic	IL34	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr16	70698295	70698295	T	T	exonic	MTSS1L	NaN	synonymous SNV	MTSS1L:NM_138383:exon15:c.A1529A:p.E510E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	41	41	0	0
chr16	707057	707057	G	C	intronic	WDR90	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.207634	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	83	72	11	0
chr16	707058	707058	C	T	intronic	WDR90	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.63632	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	85	74	11	0
chr16	707059	707059	T	G	intronic	WDR90	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.092124	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	86	75	11	0
chr16	70711823	70711823	A	C	intronic	MTSS1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	7	3	0
chr16	70731244	70731244	A	A	intronic	VAC14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	707748	707748	C	T	intronic	WDR90	NaN	NaN	NaN	rs36022186	NaN	0.342452	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.577762	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	2	6	29
chr16	70796342	70796342	T	T	ncRNA_intronic	VAC14-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	70814852	70814852	C	T	intronic	VAC14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr16	70814853	70814853	T	C	intronic	VAC14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	9	4	4	0
chr16	70816881	70816881	T	T	intronic	VAC14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	70816893	70816893	C	T	intronic	VAC14	NaN	NaN	NaN	rs1875941	NaN	0.813498	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	112.933277	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	99	50	49	56
chr16	70819640	70819640	G	T	exonic	VAC14	NaN	nonsynonymous SNV	VAC14:NM_018052:exon3:c.C388A:p.P130T	NaN	NaN	NaN	0.45	T	0.767	P	0.479	P	0.000	D	1.000	D	1.42	L	-0.27	T	-0.722	T	0.271	T	0.964	0.352	5.908	5.29	2.489	9.845	18.968	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.825523	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	174	167	7	0
chr16	708275	708275	C	A	exonic	WDR90	NaN	nonsynonymous SNV	WDR90:NM_145294:exon22:c.C2697A:p.H899Q	rs45613635	NaN	0.340855	0.6	T	0.996	D	0.898	P	0.000	U	0.000	P	1.655	L	3.6	T	-0.941	T	0.000	T	0.466	2.893	15.64	3.07	1.194	0.623	5.150	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.951182	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	10	9	32
chr16	70896033	70896033	C	T	exonic	HYDIN	NaN	nonsynonymous SNV	HYDIN:NM_001270974:exon69:c.G11695A:p.V3899M	rs1626593	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.976	D	0.197	U	0.000	P	2.045	M	5.28	T	-1.053	T	0.012	T	0.476	2.763	15.20	3.84	1.541	1.842	4.922	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	468	346	122	21
chr16	70900026	70900026	T	G	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr16	70902683	70902683	G	A	exonic	HYDIN	NaN	synonymous SNV	HYDIN:NM_001270974:exon66:c.C11100T:p.H3700H	rs2502690	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	26.4913	0	71.952021	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	255	215	40	9
chr16	70906115	70906115	C	T	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	70906119	70906119	G	T	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	70916816	70916816	G	A	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	rs7190934	ID=COSN165249;OCCURENCE=1(breast)	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.00316878065919859	NA	0	139	NaN	NA	NA	531	386	145	50
chr16	70925798	70925798	A	A	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	28	26	0	0
chr16	709403	709403	G	G	intronic	WDR90	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	67	59	0	0
chr16	70941620	70941620	A	A	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	70951939	70951939	T	T	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	70955192	70955192	A	A	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	116	93	0	0
chr16	70956173	70956173	C	T	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	rs1774391	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	70975565	70975565	T	C	exonic	HYDIN	NaN	nonsynonymous SNV	HYDIN:NM_001270974:exon43:c.A6827G:p.Q2276R	rs1815707	NaN	NaN	1	T	0.001	B	0.002	B	0.129	U	1.000	D	0.255	N	5.8	T	-0.931	T	0.002	T	0.079	0.016	4.096	4.03	2.140	0.091	7.594	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	1183	885	295	34
chr16	70986364	70986364	G	C	exonic	HYDIN	NaN	stopgain	HYDIN:NM_001270974:exon41:c.C6491G:p.S2164X	NaN	NaN	NaN	0.2	T	.	.	.	.	0.006	U	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	12.339	46	3.91	2.178	4.659	15.172	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.583362	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	159	138	21	0
chr16	70986365	70986365	A	G	exonic	HYDIN	NaN	nonsynonymous SNV	HYDIN:NM_001270974:exon41:c.T6490C:p.S2164P	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.998	D	0.917	D	0.006	U	1.000	D	1.87	L	5.55	T	-0.739	T	0.009	T	0.282	2.199	13.31	3.91	1.768	4.409	8.640	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.137998	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	156	137	19	0
chr16	70986366	70986366	C	A	exonic	HYDIN	NaN	synonymous SNV	HYDIN:NM_001270974:exon41:c.G6489T:p.G2163G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.301894	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	139	120	19	0
chr16	70989476	70989476	A	T	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	rs372492439	NaN	0.00379393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	70996062	70996062	A	C	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	5	3	0
chr16	70998576	70998576	T	G	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	70998579	70998579	G	C	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr16	70998581	70998581	G	A	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	71004812	71004812	A	A	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr16	71007809	71007809	C	T	exonic	HYDIN	NaN	nonsynonymous SNV	HYDIN:NM_001270974:exon34:c.G5152A:p.V1718M	rs783762	NaN	NaN	0.02	D	0.383	B	0.082	B	0.183	U	0.000	P	2.215	M	1.03	T	-0.884	T	0.101	T	0.243	2.247	13.47	1.73	0.553	1.432	8.204	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	3.525572076475539E-8	NA	0	52	NaN	NA	NA	373	218	155	16
chr16	71007966	71007966	G	T	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.142622	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	207	193	14	0
chr16	71008169	71008169	T	C	exonic	HYDIN	NaN	synonymous SNV	HYDIN:NM_001270974:exon33:c.A4944G:p.L1648L	rs1774293	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.941947	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	337	325	12	0
chr16	71012855	71012855	T	C	exonic	HYDIN	NaN	nonsynonymous SNV	HYDIN:NM_001270974:exon30:c.A4600G:p.I1534V	rs1774303	NaN	0.0061901	0.31	T	0.001	B	0.001	B	0.524	N	1.000	N	0.205	N	5.69	T	-0.922	T	0.002	T	0.093	0.206	5.108	-0.967	-0.055	-0.505	4.049	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	58	49	9	46
chr16	71012906	71012906	T	C	exonic	HYDIN	NaN	nonsynonymous SNV	HYDIN:NM_001270974:exon30:c.A4549G:p.K1517E	NaN	NaN	NaN	1	T	0.002	B	0.003	B	0.069	U	1.000	D	0.895	L	5.69	T	-0.897	T	0.002	T	0.193	-1.400	0.023	1.25	-0.001	0.789	7.688	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.17647058823529446	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr16	7102036	7102036	CTTCA	CTCA,CTCAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	105.734	0	NaN	NA	NA	99	62	29	0
chr16	71022226	71022226	T	T	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	26	24	0	0
chr16	71025246	71025246	G	T	exonic	HYDIN	NaN	nonsynonymous SNV	HYDIN:NM_001270974:exon25:c.C3839A:p.T1280K	NaN	ID=COSM558930,COSM558929;OCCURENCE=1(lung)	NaN	0.92	T	0.156	B	0.031	B	0.010	U	1.000	N	-0.345	N	5.58	T	-0.947	T	0.002	T	0.261	-1.209	0.068	-1.77	-0.281	-1.546	3.485	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.707585	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	206	193	13	0
chr16	71025273	71025273	C	T	exonic	HYDIN	NaN	nonsynonymous SNV	HYDIN:NM_001270974:exon25:c.G3812A:p.R1271K	NaN	NaN	NaN	0.93	T	0.031	B	0.015	B	.	.	1.000	N	0	N	5.71	T	-0.938	T	0.001	T	0.117	-0.293	2.601	-0.634	-0.065	-1.029	2.973	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.719873	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	174	159	15	0
chr16	71025325	71025325	A	G	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	rs783748	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.0030630625082099855	NA	0	93	NaN	NA	NA	101	66	35	13
chr16	71026098	71026098	C	T	exonic	HYDIN	NaN	synonymous SNV	HYDIN:NM_001270974:exon24:c.G3660A:p.P1220P	rs704641	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	164	134	28	48
chr16	71054178	71054178	T	C	exonic	HYDIN	NaN	nonsynonymous SNV	HYDIN:NM_001270974:exon22:c.A3229G:p.I1077V	rs6416709	ID=COSM244981,COSM244980;OCCURENCE=1(prostate),1(lung),1(endometrium)	0.000399361	0.47	T	0.002	B	0.005	B	0.853	U	1.000	D	1.795	L	3.31	T	-0.988	T	0.016	T	0.183	0.515	6.789	0.358	0.228	0.089	1.430	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	27.2124	0	20.920508	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	54	42	12	31
chr16	71061293	71061293	T	T	UTR3	HYDIN	NM_017558:c.*200A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	71061332	71061332	C	A	UTR3	HYDIN	NM_017558:c.*161G>T	NaN	NaN	rs8047741	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	8.97031418085191E-4	NA	0	42	NaN	NA	NA	177	115	62	18
chr16	71061340	71061340	C	T	UTR3	HYDIN	NM_017558:c.*153G>A	NaN	NaN	rs8047747	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	4.258526242445424E-4	NA	0	0	NaN	NA	NA	184	113	71	18
chr16	71061805	71061805	A	G	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.08047	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	848	836	12	0
chr16	71065593	71065593	C	G	exonic	HYDIN	NaN	synonymous SNV	HYDIN:NM_001198542:exon19:c.G2838C:p.G946G,HYDIN:NM_001198543:exon19:c.G2808C:p.G936G,HYDIN:NM_001270974:exon19:c.G2757C:p.G919G,HYDIN:NM_017558:exon19:c.G2757C:p.G919G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.200402	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	114	104	10	0
chr16	710835	710835	G	T	intronic	WDR90	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	71094434	71094434	G	A	exonic	HYDIN	NaN	synonymous SNV	HYDIN:NM_001198542:exon18:c.C2583T:p.F861F,HYDIN:NM_001198543:exon18:c.C2553T:p.F851F,HYDIN:NM_001270974:exon18:c.C2502T:p.F834F,HYDIN:NM_017558:exon18:c.C2502T:p.F834F	rs2271453	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	104.933	0	NaN	NA	NA	132	94	38	17
chr16	71113780	71113780	C	T	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	rs1512612	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	370.531	0	NaN	NA	NA	107	56	51	38
chr16	711712	711712	C	T	exonic	WDR90	NaN	synonymous SNV	WDR90:NM_145294:exon31:c.C3789T:p.G1263G	rs3177415	NaN	0.698283	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	95.7601	0	NaN	NA	NA	76	51	25	40
chr16	71171328	71171328	A	C	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	27	8	19	0
chr16	71196643	71196643	A	A	intronic	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	712100	712100	A	A	intronic	WDR90	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	24	21	0	0
chr16	712154	712154	G	A	intronic	WDR90	NaN	NaN	NaN	rs11248943	NaN	0.342252	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.852035	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	10	10	33
chr16	71220721	71220721	G	T	exonic	HYDIN	NaN	nonsynonymous SNV	HYDIN:NM_001198542:exon2:c.C159A:p.S53R,HYDIN:NM_001198543:exon2:c.C129A:p.S43R,HYDIN:NM_001270974:exon2:c.C78A:p.S26R,HYDIN:NM_017558:exon2:c.C78A:p.S26R	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.986	D	0.867	P	0.054	U	0.855	D	2.045	M	5.4	T	-0.949	T	0.096	T	0.589	2.081	12.92	3.55	1.296	1.706	9.136	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.235108	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	46	43	3	0
chr16	71264730	71264730	A	G	upstream	HYDIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	71317668	71317668	T	T	exonic	CMTR2	NaN	synonymous SNV	CMTR2:NM_001099642:exon3:c.A2156A:p.Q719Q,CMTR2:NM_018348:exon3:c.A2156A:p.Q719Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	41	38	0	0
chr16	71319646	71319646	G	A	exonic	CMTR2	NaN	nonsynonymous SNV	CMTR2:NM_001099642:exon3:c.C178T:p.L60F,CMTR2:NM_018348:exon3:c.C178T:p.L60F	rs3096380	NaN	0.926318	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-1.005	N	2.43	T	-0.966	T	0.000	T	0.179	-1.361	0.027	4.6	0.438	1.944	7.978	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	224.342	0	60.780623	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	0	24	49
chr16	71411499	71411499	T	T	intronic	CALB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr16	71411502	71411502	G	A	intronic	CALB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.07913	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	101	92	9	0
chr16	71418003	71418003	A	A	intronic	CALB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr16	71571018	71571018	C	T	exonic	CHST4	NaN	synonymous SNV	CHST4:NM_001166395:exon2:c.C438T:p.I146I,CHST4:NM_005769:exon2:c.C438T:p.I146I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.572028	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	184	177	7	0
chr16	715930	715930	T	T	intronic	WDR90	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	71602225	71602225	A	A	ncRNA_intronic	TAT-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr16	71604133	71604133	T	T	ncRNA_intronic	TAT-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	71604525	71604525	T	A	ncRNA_intronic	TAT-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr16	71604528	71604528	T	C	ncRNA_intronic	TAT-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr16	71604531	71604531	T	C	ncRNA_intronic	TAT-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr16	716675	716675	T	A	exonic	WDR90	NaN	synonymous SNV	WDR90:NM_145294:exon39:c.T4887A:p.T1629T	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-1.041	T	0.036	T	.	-0.377	2.227	-8.95	-2.162	-1.696	1.716	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.389807	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	42	38	4	0
chr16	716676	716676	C	A	exonic	WDR90	NaN	nonsynonymous SNV	WDR90:NM_145294:exon39:c.C4888A:p.Q1630K	NaN	NaN	NaN	0.91	T	0.03	B	0.023	B	0.000	N	1.000	N	0	N	4.02	T	-1.004	T	0.035	T	0.215	-0.311	2.518	-3.94	-0.949	-1.385	6.109	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.479484	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	40	36	4	0
chr16	716798	716798	C	T	intronic	WDR90	NaN	NaN	NaN	rs12447392	NaN	0.0802716	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	164.731	0	84.271982	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	69	34	35	19
chr16	71682796	71682796	T	C	exonic	PHLPP2	NaN	synonymous SNV	PHLPP2:NM_001289003:exon18:c.A3768G:p.L1256L,PHLPP2:NM_015020:exon19:c.A3969G:p.L1323L	rs61733125	NaN	0.239417	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	126.413	0	NaN	NA	NA	100	63	37	23
chr16	71692272	71692272	A	G	intronic	PHLPP2	NaN	NaN	NaN	rs116036666	NaN	0.00439297	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1304347826086963	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr16	71703088	71703088	T	T	intronic	PHLPP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr16	717232	717232	T	T	intronic	WDR90	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	71792822	71792822	T	C	exonic	AP1G1	NaN	nonsynonymous SNV	AP1G1:NM_001128:exon11:c.A977G:p.Y326C,AP1G1:NM_001030007:exon12:c.A986G:p.Y329C	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.945	H	1.25	T	0.003	D	0.360	T	0.85	3.864	19.63	5.8	2.214	7.698	16.133	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.363272	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	215	208	7	0
chr16	71805159	71805159	TG	AT,T,TA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1081.2	0	NaN	NA	NA	114	0	6	13
chr16	71805229	71805229	A	C	intronic	AP1G1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr16	71883649	71883649	A	G	exonic	ATXN1L	NaN	synonymous SNV	ATXN1L:NM_001137675:exon3:c.A6G:p.K2K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.481873	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	310	303	7	0
chr16	71885450	71885450	C	T	exonic	ATXN1L	NaN	nonsynonymous SNV	ATXN1L:NM_001137675:exon3:c.C1807T:p.P603S	NaN	NaN	NaN	0.83	T	0.0	B	0.001	B	.	.	0.562	N	1.1	L	1.55	T	-0.991	T	0.041	T	0.087	-1.667	0.012	1.88	0.180	0.148	3.001	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.494414	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	307	285	22	0
chr16	71886661	71886661	A	A	UTR3	ATXN1L	NM_001137675:c.*948A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	71895842	71895842	T	C	exonic	ZNF821	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF821:NM_017530:exon5:c.A295G:p.T99A,ZNF821:NM_001201553:exon6:c.A421G:p.T141A,ZNF821:NM_001201554:exon6:c.A295G:p.T99A,ZNF821:NM_001201552:exon7:c.A421G:p.T141A	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.99	D	0.971	D	0.000	D	1.000	D	0.805	L	2.48	T	-1.133	T	0.065	T	0.708	5.069	31	6.17	2.371	7.698	16.822	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.394956	nearby_gap_events	REJECT	106	96	10	0
chr16	71901746	71901746	C	A	intronic	ZNF821	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	719270	719270	T	A	intronic	RHOT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	71950385	71950385	A	G	exonic	IST1	NaN	nonsynonymous SNV	IST1:NM_001270975:exon3:c.A109G:p.R37G,IST1:NM_001270977:exon3:c.A109G:p.R37G,IST1:NM_014761:exon3:c.A109G:p.R37G,IST1:NM_001270976:exon4:c.A148G:p.R50G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.66	H	.	.	0.301	D	0.582	D	0.992	3.215	16.77	4.39	0.895	2.409	11.848	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.411986	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	65	61	4	0
chr16	71950450	71950450	C	T	exonic	IST1	NaN	synonymous SNV	IST1:NM_001270975:exon3:c.C174T:p.H58H,IST1:NM_001270977:exon3:c.C174T:p.H58H,IST1:NM_014761:exon3:c.C174T:p.H58H,IST1:NM_001270976:exon4:c.C213T:p.H71H	rs1049794	NaN	0.203674	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	74.745819	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	39	33	17
chr16	71967695	71967695	T	A	intronic	PKD1L3	NaN	NaN	NaN	rs4788581	NaN	0.865815	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	214.475298	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	75	0	75	53
chr16	71985426	71985426	G	T	intronic	PKD1L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	719898	719898	T	A	intronic	RHOT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr16	719899	719899	T	G	intronic	RHOT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	1	0
chr16	719914	719914	T	G	intronic	RHOT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	34	21	13	0
chr16	72007399	72007399	C	T	exonic	PKD1L3	NaN	unknown	UNKNOWN	rs9925415	NaN	0.514377	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	181.631105	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	64	1	63	44
chr16	72012309	72012309	A	A	intronic	PKD1L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr16	720158	720158	G	A	exonic	RHOT2	NaN	synonymous SNV	RHOT2:NM_138769:exon6:c.G312A:p.G104G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.689122	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	137	127	10	0
chr16	720159	720159	A	G	exonic	RHOT2	NaN	nonsynonymous SNV	RHOT2:NM_138769:exon6:c.A313G:p.T105A	NaN	NaN	NaN	0.53	T	0.0	B	0.007	B	0.000	N	1.000	N	0.19	N	-0.92	T	-1.074	T	0.135	T	0.132	0.702	7.746	1.25	0.755	1.272	1.118	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.579447	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	139	130	9	0
chr16	72020443	72020443	A	A	intronic	PKD1L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	72024295	72024295	A	A	intronic	PKD1L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr16	72042682	72042682	A	C	exonic	DHODH	NaN	nonsynonymous SNV	DHODH:NM_001361:exon1:c.A19C:p.K7Q	rs3213422	ID=COSM1379664;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.564097	0.28	T	0.002	B	0.005	B	0.076	N	0.974	P	1.525	L	-1.93	D	-0.921	T	0.000	T	0.533	1.702	11.65	2.88	0.851	1.402	7.449	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	56.4957	0	26.401691	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	8	10	26
chr16	72042824	72042824	GT	G,GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	291.451	0	NaN	NA	NA	32	0	12	16
chr16	72045923	72045923	C	C	intronic	DHODH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	158	128	0	0
chr16	72050865	72050865	T	T	intronic	DHODH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	72050884	72050884	CG	C,CC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2237.85	0	NaN	NA	NA	232	0	81	7
chr16	72055052	72055052	A	G	exonic	DHODH	NaN	nonsynonymous SNV	DHODH:NM_001361:exon5:c.A547G:p.K183E	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	4.095	H	-2.18	D	1.021	D	0.873	D	0.847	4.922	28.5	5.55	2.234	9.178	15.996	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	49	32	16	0
chr16	72056991	72056991	T	A	intronic	DHODH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	72056992	72056992	C	T	intronic	DHODH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	72056995	72056995	C	G	intronic	DHODH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	72057964	72057964	T	T	intronic	DHODH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	72058181	72058181	A	C	UTR3	DHODH	NM_001361:c.*83A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	4	3	0
chr16	72058183	72058183	T	G	UTR3	DHODH	NM_001361:c.*85T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	72090178	72090178	T	C	intronic	HP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.246022	nearby_gap_events	REJECT	79	70	9	0
chr16	72130021	72130021	G	C	intronic	DHX38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr16	72130022	72130022	T	G	intronic	DHX38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr16	72130023	72130023	T	A	intronic	DHX38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr16	72135578	72135578	G	A	intronic	DHX38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.835291	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	51	47	4	0
chr16	72136931	72136931	T	T	intronic	DHX38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	72138304	72138304	T	C	intronic	DHX38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	95	NaN	NA	NA	28	12	16	0
chr16	72138306	72138306	G	C	intronic	DHX38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.683459	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	177	163	14	0
chr16	72139537	72139537	T	C	intronic	DHX38	NaN	NaN	NaN	rs42544	NaN	0.989816	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	122.566	0	NaN	NA	NA	9	0	9	39
chr16	72143458	72143458	G	T	intronic	DHX38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.174147	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	113	103	10	0
chr16	72154058	72154058	A	C	intronic	PMFBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr16	72154059	72154059	C	A	intronic	PMFBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr16	72154061	72154061	G	T	intronic	PMFBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr16	72154062	72154062	A	G	intronic	PMFBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr16	72154064	72154064	A	G	intronic	PMFBP1	NaN	NaN	NaN	rs374357441	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr16	72154065	72154065	A	C	intronic	PMFBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr16	72158926	72158926	A	A	intronic	PMFBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	72159830	72159830	T	T	intronic	PMFBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	722331	722331	C	T	exonic	RHOT2	NaN	nonsynonymous SNV	RHOT2:NM_138769:exon15:c.C1273T:p.R425C	rs3177338	NaN	0.66853	0	D	0.997	D	0.893	P	0.003	N	0.000	P	2.865	M	-0.23	T	-1.085	T	0.000	T	0.349	2.924	15.75	4.12	1.103	1.309	9.938	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	396.636	0	NaN	NA	NA	146	59	87	38
chr16	722418	722418	G	C	intronic	RHOT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	98	44	54	0
chr16	726349	726349	A	A	exonic	RHBDL1	NaN	synonymous SNV	RHBDL1:NM_001278720:exon2:c.A53A:p.E18E,RHBDL1:NM_001278721:exon2:c.A53A:p.E18E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr16	726421	726421	C	A	exonic	RHBDL1	NaN	nonsynonymous SNV	RHBDL1:NM_001278720:exon2:c.C125A:p.A42D,RHBDL1:NM_001278721:exon2:c.C125A:p.A42D	NaN	NaN	NaN	0.62	T	0.349	B	0.117	B	0.191	N	1.000	N	0.345	N	1.04	T	-1.038	T	0.052	T	0.253	0.793	8.177	3.49	0.826	1.442	8.26	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.23529411764705904	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr16	727317	727317	T	T	exonic	RHBDL1	NaN	synonymous SNV	RHBDL1:NM_001278721:exon4:c.T392T:p.I131I,RHBDL1:NM_001278720:exon5:c.T617T:p.I206I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	72827116	72827116	T	A	intronic	ZFHX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	14	9	4	0
chr16	72832135	72832135	T	A	exonic	ZFHX3	NaN	synonymous SNV	ZFHX3:NM_001164766:exon8:c.A1704T:p.A568A,ZFHX3:NM_006885:exon9:c.A4446T:p.A1482A	rs740178	NaN	0.886182	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	396.33168	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	126	0	126	55
chr16	72928463	72928463	C	C	intronic	ZFHX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	72941444	72941444	T	C	intronic	ZFHX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr16	732593	732593	A	C	UTR3	JMJD8,STUB1	NM_001005920:c.*201T>G;NM_001293197:c.*104A>C,NM_005861:c.*104A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr16	732602	732602	T	T	UTR3	JMJD8,STUB1	NM_001005920:c.*192A>A;NM_001293197:c.*113T>T,NM_005861:c.*113T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr16	733501	733501	C	A	intronic	JMJD8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.556839	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	73	62	11	0
chr16	73462486	73462486	G	A	intergenic	LINC01568,LOC101928035	dist=7191;dist=763805	NaN	NaN	rs1364064	NaN	0.639776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	734633	734633	T	C	UTR3	WDR24	NM_001303027:c.*101A>G,NM_032259:c.*101A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr16	735523	735523	G	T	exonic	WDR24	NaN	nonsynonymous SNV	WDR24:NM_001303027:exon7:c.C1753A:p.P585T,WDR24:NM_032259:exon7:c.C1753A:p.P585T	NaN	NaN	NaN	0.15	T	0.944	P	0.628	P	0.000	D	1.000	D	0.805	L	0.21	T	-0.518	T	0.325	T	0.32	2.572	14.56	3.72	1.176	4.352	9.421	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	2.715034044434072E-4	Somatic	68.2344	0	NaN	NA	NA	145	105	40	20
chr16	735921	735921	T	C	exonic	WDR24	NaN	synonymous SNV	WDR24:NM_001303027:exon5:c.A1521G:p.A507A,WDR24:NM_032259:exon5:c.A1521G:p.A507A	rs763053	NaN	0.502596	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	41.66847	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	23	18	21
chr16	737033	737033	A	A	exonic	WDR24	NaN	synonymous SNV	WDR24:NM_001303027:exon3:c.T1043T:p.F348F,WDR24:NM_032259:exon3:c.T1043T:p.F348F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr16	7383150	7383150	A	A	intronic	RBFOX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr16	739655	739655	T	A	UTR5	WDR24	NM_001303027:c.-15A>T,NM_032259:c.-15A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	74253383	74253383	T	G	intergenic	LOC101928035,PSMD7	dist=3963;dist=77290	NaN	NaN	rs7201517	NaN	0.447484	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	17	9	8	0
chr16	74330921	74330921	A	G	intronic	PSMD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.541261	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	7	5	2	0
chr16	74336259	74336259	A	A	intronic	PSMD7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	74452071	74452071	G	A	exonic	CLEC18B	NaN	synonymous SNV	CLEC18B:NM_001011880:exon3:c.C342T:p.P114P	rs62056016	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	464	118	346	28
chr16	74490797	74490797	A	G	intronic	GLG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	74502818	74502818	T	T	intronic	GLG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr16	74511476	74511476	A	C	intronic	GLG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	19	13	6	0
chr16	74511482	74511482	A	A	intronic	GLG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	14	14	0	0
chr16	74537525	74537525	G	T	exonic	GLG1	NaN	synonymous SNV	GLG1:NM_001145666:exon3:c.C645A:p.I215I,GLG1:NM_001145667:exon4:c.C678A:p.I226I,GLG1:NM_012201:exon4:c.C678A:p.I226I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.442276	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	181	174	7	0
chr16	74537526	74537526	A	G	exonic	GLG1	NaN	nonsynonymous SNV	GLG1:NM_001145666:exon3:c.T644C:p.I215T,GLG1:NM_001145667:exon4:c.T677C:p.I226T,GLG1:NM_012201:exon4:c.T677C:p.I226T	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.999	D	0.976	D	0.000	D	1.000	D	2.135	M	.	.	-0.215	T	0.413	T	0.948	4.452	23.7	5.38	2.036	9.223	15.393	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.961697	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	179	172	7	0
chr16	74657745	74657745	A	G	UTR3	RFWD3	NM_018124:c.*81T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr16	74657991	74657991	A	A	intronic	RFWD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr16	746884	746884	A	C	exonic	FBXL16	NaN	synonymous SNV	FBXL16:NM_153350:exon2:c.T522G:p.V174V	rs4984683	NaN	0.384185	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.9788	0	NaN	NA	NA	7	4	3	24
chr16	746914	746914	G	A	exonic	FBXL16	NaN	synonymous SNV	FBXL16:NM_153350:exon2:c.C492T:p.A164A	rs4984915	ID=COSM435773;OCCURENCE=1(breast)	0.383187	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5597	0	NaN	NA	NA	6	4	2	23
chr16	74729076	74729076	T	C	intronic	MLKL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	74729078	74729078	T	C	intronic	MLKL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	74729080	74729080	A	T	intronic	MLKL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	74729083	74729083	T	C	intronic	MLKL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr16	74729692	74729692	A	A	intronic	MLKL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	747453	747453	G	GC	intronic	FBXL16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	35.7307	0	NaN	NA	NA	11	3	2	9
chr16	747454	747454	T	C	intronic	FBXL16	NaN	NaN	NaN	rs12922098	NaN	0.384585	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	48.0216	40	12.179818	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	10	4	6	17
chr16	74750213	74750213	T	T	intronic	FA2H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	20	16	0	0
chr16	74760050	74760050	T	T	intronic	FA2H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	74760155	74760155	C	C	exonic	FA2H	NaN	synonymous SNV	FA2H:NM_024306:exon4:c.G581G:p.G194G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	17	15	0	0
chr16	74761331	74761331	A	A	intronic	FA2H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	74773971	74773971	T	C	exonic	FA2H	NaN	nonsynonymous SNV	FA2H:NM_024306:exon2:c.A313G:p.K105E	NaN	NaN	NaN	0.95	T	0.0	B	0.001	B	0.891	N	1.000	D	0.805	L	-2.03	D	-0.770	T	0.337	T	0.166	1.612	11.35	2.46	0.788	1.227	6.658	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.777443	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	97	92	5	0
chr16	74774122	74774122	G	T	intronic	FA2H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.53061	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	65	51	14	0
chr16	74920106	74920106	G	C	intronic	WDR59	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	74920107	74920107	G	A	intronic	WDR59	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	74920111	74920111	A	T	intronic	WDR59	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	74920112	74920112	A	G	intronic	WDR59	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	74920113	74920113	C	A	intronic	WDR59	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	74921511	74921511	T	T	intronic	WDR59	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr16	74926520	74926520	C	T	intronic	WDR59	NaN	NaN	NaN	rs11149776	NaN	0.276358	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	71.439906	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	17	29	26
chr16	74949933	74949933	A	G	intronic	WDR59	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.915292	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	960	927	33	0
chr16	74951777	74951777	CTTTTT	CTTTT,CTTTTG,CTTTTGTT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1395.09	0	NaN	NA	NA	172	3	60	0
chr16	74951782	74951782	T	G	intronic	WDR59	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	6.64227161649867E-5	NA	0	0	NaN	NA	NA	43	27	16	0
chr16	74976700	74976700	T	A	exonic	WDR59	NaN	nonsynonymous SNV	WDR59:NM_030581:exon7:c.A470T:p.N157I	NaN	NaN	NaN	0	D	0.914	P	0.654	P	0.000	D	1.000	D	2.905	M	-0.59	T	0.110	D	0.490	T	0.772	5.040	29.8	5.96	2.285	7.471	16.110	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.167478	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	320	301	19	0
chr16	75033679	75033679	A	T	exonic	ZNRF1	NaN	nonsynonymous SNV	ZNRF1:NM_032268:exon1:c.A110T:p.Y37F	rs149929766	NaN	0.0105831	0.62	T	0.079	B	0.051	B	0.008	N	1.000	D	0	N	.	.	-1.067	T	0.035	T	0.562	1.626	11.39	4.56	2.025	3.847	7.683	100	11	3035	SNV	VtSM	3	Somatic	0.027053140096617793	NA	0	15	10.859117		KEEP	16	10	6	0
chr16	75138619	75138619	T	G	intronic	ZNRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr16	75138621	75138621	C	G	intronic	ZNRF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.796725	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	157	147	10	0
chr16	75147369	75147369	T	T	intronic	LDHD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr16	75149567	75149567	A	A	intronic	LDHD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	75200480	75200480	T	T	intronic	ZFP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr16	75204310	75204310	G	A	UTR3	ZFP1	NM_153688:c.*78G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	75230230	75230230	C	G	intergenic	ZFP1,CTRB2	dist=24098;dist=7764	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr16	75271059	75271059	C	A	intronic	BCAR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.060944	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	60	47	13	0
chr16	75271836	75271836	G	G	intronic	BCAR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	75276530	75276530	A	G	exonic	BCAR1	NaN	synonymous SNV	BCAR1:NM_001170715:exon2:c.T525C:p.F175F,BCAR1:NM_001170716:exon2:c.T525C:p.F175F,BCAR1:NM_001170717:exon2:c.T471C:p.F157F,BCAR1:NM_001170718:exon2:c.T471C:p.F157F,BCAR1:NM_001170719:exon2:c.T465C:p.F155F,BCAR1:NM_014567:exon2:c.T471C:p.F157F,BCAR1:NM_001170714:exon3:c.T609C:p.F203F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.85153	0	NaN	NA	NA	15	13	3	0
chr16	75277883	75277883	G	T	intronic	BCAR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	14	9	5	0
chr16	75277885	75277885	A	G	intronic	BCAR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	7530707	7530707	C	G	intronic	RBFOX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	75338893	75338893	T	G	intronic	CFDP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	5	3	0
chr16	75446698	75446698	A	G	intronic	CFDP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	28	16	8	0
chr16	75448467	75448467	C	T	intronic	CFDP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.888585	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	55	52	3	0
chr16	75498355	75498355	G	A	intronic	TMEM170A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	75513447	75513447	C	A	exonic	CHST6	NaN	nonsynonymous SNV	CHST6:NM_021615:exon3:c.G280T:p.D94Y	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.175	M	-1.79	D	0.747	D	0.763	D	0.937	3.762	19.10	4.56	2.078	7.763	14.830	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.899822	clustered_read_position	REJECT	30	26	4	0
chr16	75513452	75513452	A	G	exonic	CHST6	NaN	nonsynonymous SNV	CHST6:NM_021615:exon3:c.T275C:p.V92A	NaN	NaN	NaN	0.62	T	0.88	P	0.708	P	0.000	D	1.000	D	1.595	L	-6.57	D	1.179	D	0.969	D	0.314	2.822	15.40	4.56	1.690	6.327	11.875	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.445285		KEEP	31	27	4	0
chr16	75528938	75528938	C	A	upstream	CHST6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	75528940	75528940	A	C	upstream	CHST6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	75563330	75563330	G	A	exonic	CHST5	NaN	nonsynonymous SNV	CHST5:NM_024533:exon3:c.C953T:p.T318M	rs3826107	ID=COSM435778;OCCURENCE=2(breast)	0.142971	0.1	T	0.999	D	0.986	D	0.000	D	0.000	P	2.61	M	1.79	T	-1.085	T	0.000	T	0.237	2.242	13.45	2.84	1.583	6.063	12.663	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	66.0103	0	NaN	NA	NA	20	10	10	21
chr16	75564287	75564287	T	C	UTR5	CHST5	NM_024533:c.-5A>G	NaN	NaN	rs3784932	NaN	0.147764	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	16.5299	0	NaN	NA	NA	19	15	4	24
chr16	75576750	75576750	C	C	intronic	TMEM231	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	75589839	75589839	G	A	exonic	TMEM231	NaN	stopgain	TMEM231:NM_001077416:exon1:c.C331T:p.Q111X,TMEM231:NM_001077418:exon2:c.C172T:p.Q58X	NaN	NaN	NaN	0.07	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	7.473	39	5.91	2.802	8.293	18.876	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.065032	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	82	79	3	0
chr16	75589866	75589866	A	C	exonic	TMEM231	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM231:NM_001077416:exon1:c.T304G:p.W102G,TMEM231:NM_001077418:exon2:c.T145G:p.W49G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	2.67	M	-0.39	T	0.001	D	0.489	T	0.948	4.116	21.2	4.82	1.065	6.117	11.631	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.758789	clustered_read_position	REJECT	25	21	4	0
chr16	75590113	75590113	C	G	exonic	TMEM231	NaN	synonymous SNV	TMEM231:NM_001077416:exon1:c.G57C:p.R19R	rs3743602	NaN	0.197085	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.451007	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	6	7	32
chr16	75600728	75600728	GC	CG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.3411	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr16	75606192	75606192	A	T	intronic	GABARAPL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	75642083	75642083	T	C	intronic	ADAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr16	75642084	75642084	T	G	intronic	ADAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr16	75654070	75654070	T	C	intronic	ADAT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	75664479	75664479	A	T	intronic	KARS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	17	10	3	0
chr16	75668243	75668243	A	G	intronic	KARS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	12	0	11	0
chr16	75689956	75689956	G	A	intronic	TERF2IP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	76482182	76482182	A	T	intronic	CNTNAP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	16	11	5	0
chr16	76482974	76482974	A	A	intronic	CNTNAP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	76483579	76483579	A	G	intronic	CNTNAP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.757618	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	128	123	5	0
chr16	76483823	76483823	A	A	intronic	CNTNAP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr16	76523550	76523550	T	G	intronic	CNTNAP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	13	6	5	0
chr16	76532420	76532420	T	T	intronic	CNTNAP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	76555017	76555017	T	C	intronic	CNTNAP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.494649	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	31	21	10	1
chr16	76556192	76556192	T	A	intronic	CNTNAP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr16	76587523	76587523	A	A	intronic	CNTNAP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	7714826	7714826	T	G	intronic	RBFOX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.879999	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	139	128	11	0
chr16	77227362	77227362	G	T	exonic	MON1B	NaN	nonsynonymous SNV	MON1B:NM_014940:exon3:c.G163T:p.D55Y	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.997	D	0.766	P	0.952	N	1.000	D	0.55	N	.	.	-0.808	T	0.179	T	0.462	3.791	19.25	3.61	2.287	1.575	13.540	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.6172	0	NaN	NA	NA	20	16	4	5
chr16	77227965	77227965	G	G	intronic	MON1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	77228629	77228629	A	G	exonic	MON1B	NaN	synonymous SNV	MON1B:NM_001286640:exon2:c.A435G:p.R145R,MON1B:NM_001286639:exon3:c.A546G:p.R182R,MON1B:NM_014940:exon4:c.A873G:p.R291R	rs2232503	NaN	0.98722	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	110.789771	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	0	42	58
chr16	77228782	77228782	C	A	exonic	MON1B	NaN	synonymous SNV	MON1B:NM_001286640:exon2:c.C588A:p.R196R,MON1B:NM_001286639:exon3:c.C699A:p.R233R,MON1B:NM_014940:exon4:c.C1026A:p.R342R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	48	25	8	0
chr16	77228783	77228783	C	T	exonic	MON1B	NaN	synonymous SNV	MON1B:NM_001286640:exon2:c.C589T:p.L197L,MON1B:NM_001286639:exon3:c.C700T:p.L234L,MON1B:NM_014940:exon4:c.C1027T:p.L343L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.124971	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	35	29	6	0
chr16	77228866	77228866	T	C	exonic	MON1B	NaN	synonymous SNV	MON1B:NM_001286640:exon2:c.T672C:p.V224V,MON1B:NM_001286639:exon3:c.T783C:p.V261V,MON1B:NM_014940:exon4:c.T1110C:p.V370V	rs2232504	NaN	0.778754	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.573962	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	9	9	42
chr16	77229398	77229398	T	T	intronic	MON1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr16	77229616	77229616	A	C	intronic	MON1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	14	7	7	0
chr16	77246218	77246218	G	A	exonic	SYCE1L	NaN	nonsynonymous SNV	SYCE1L:NM_001129979:exon9:c.G533A:p.R178Q	rs13331769	ID=COSM435799;OCCURENCE=1(breast)	0.36242	0.71	T	0.981	D	0.408	B	0.458	U	1.000	P	0.55	N	0.88	T	-0.947	T	0.000	T	0.182	-0.115	3.435	0.923	0.272	-0.261	3.897	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	53.2176	15	NaN	NA	NA	15	6	9	26
chr16	77246517	77246517	C	A	exonic	SYCE1L	NaN	nonsynonymous SNV	SYCE1L:NM_001129979:exon10:c.C628A:p.P210T	rs62049594	ID=COSM435800;OCCURENCE=2(breast),1(large_intestine)	0.204872	0.34	T	0.121	B	0.118	B	.	.	1.000	P	0.695	N	0.93	T	-0.911	T	0.000	T	0.074	1.685	11.59	-0.663	0.118	-0.852	1.316	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	61.629906	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	20	27	39
chr16	77246795	77246795	C	G	exonic	SYCE1L	NaN	synonymous SNV	SYCE1L:NM_001129979:exon11:c.C696G:p.P232P	rs2278049	NaN	0.510583	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.43712	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	7	10	50
chr16	77246847	77246847	T	G	UTR3	SYCE1L	NM_001129979:c.*19T>G	NaN	NaN	rs2278048	NaN	0.569688	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.148296	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	8	13	50
chr16	773172	773172	A	G	intronic	CCDC78	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.01	D	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.873	T	0.143	T	.	0.738	7.918	-2.3	-0.421	-1.251	1.336	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	1	10	0
chr16	77353674	77353674	T	T	intronic	ADAMTS18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	77359601	77359601	A	G	intronic	ADAMTS18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	77398081	77398081	T	C	intronic	ADAMTS18	NaN	NaN	NaN	rs1948719	NaN	0.293331	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	95.351872	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	101	54	47	38
chr16	774137	774137	A	G	exonic	CCDC78	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC78:NM_001031737:exon10:c.T1022C:p.L341P	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.994	D	0.9	P	0.875	N	1.000	N	1.15	L	1.08	T	-1.013	T	0.063	T	0.566	1.410	10.65	-0.094	-0.152	-0.269	3.927	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.263383	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	14	12	2	0
chr16	774767	774767	C	A	exonic	CCDC78	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC78:NM_001031737:exon8:c.G679T:p.A227S	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.965	D	0.786	P	0.102	N	0.998	N	1.795	L	1.47	T	-0.933	T	0.178	T	0.271	2.092	12.95	4.26	2.549	1.808	12.316	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.541161	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	23	14	9	0
chr16	7759206	7759206	G	T	intronic	RBFOX1	NaN	NaN	NaN	rs62011897	NaN	0.234425	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	731.917	0	NaN	NA	NA	267	101	166	17
chr16	777627	777627	C	T	intronic	HAGHL	NaN	NaN	NaN	rs7188886	NaN	0.159944	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	41.715093	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	49	23	21
chr16	77822869	77822869	G	G	intronic	VAT1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	30	24	0	0
chr16	778586	778586	T	T	exonic	HAGHL	NaN	synonymous SNV	HAGHL:NM_032304:exon5:c.T480T:p.G160G,HAGHL:NM_001290137:exon6:c.T480T:p.G160G,HAGHL:NM_001290139:exon6:c.T480T:p.G160G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	77913013	77913013	G	A	intronic	VAT1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.204644	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	125	120	5	0
chr16	78138182	78138182	T	C	intronic	WWOX	NaN	NaN	NaN	rs12918750	NaN	0.273962	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	27	9	18	0
chr16	78142306	78142306	TTG	T,TT,TTT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	148.896	0	NaN	NA	NA	73	39	8	6
chr16	78142448	78142448	G	A	intronic	WWOX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.706028	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	102	98	4	0
chr16	78149089	78149089	T	C	intronic	WWOX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	1	2	0
chr16	78185159	78185159	C	G	intronic	WWOX	NaN	NaN	NaN	rs34285084	NaN	0.048722	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	78187420	78187420	A	C	intronic	WWOX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	782397	782397	C	T	intronic	NARFL	NaN	NaN	NaN	rs12443803	NaN	0.133586	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	49.924596	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	18	20	24
chr16	78312517	78312517	T	G	exonic	WWOX	NaN	synonymous SNV	WWOX:NM_130791:exon6:c.T534G:p.P178P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.178695	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	285	276	9	0
chr16	784507	784507	C	T	intronic	NARFL	NaN	NaN	NaN	rs67935101	NaN	0.014976	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.164561	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	18	15	11
chr16	78459041	78459041	A	A	intronic	WWOX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	78466768	78466768	A	A	intronic	WWOX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	784920	784920	A	G	intronic	NARFL	NaN	NaN	NaN	rs9932304	NaN	0.704872	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.85653	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	17	10	43
chr16	78769573	78769573	C	A	intronic	WWOX	NaN	NaN	NaN	rs8045608	NaN	0.16234	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	2	8	0
chr16	78769622	78769622	A	G	intronic	WWOX	NaN	NaN	NaN	rs8046392	NaN	0.226238	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	14	3	11	0
chr16	7893364	7893364	G	C	intergenic	RBFOX1,TMEM114	dist=130024;dist=694207	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	79030933	79030933	G	G	intronic	WWOX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	79516495	79516495	C	C	intergenic	WWOX,MAF	dist=269931;dist=111250	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	80334160	80334160	A	A	ncRNA_intronic	LOC102724084	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	80423462	80423462	A	C	ncRNA_intronic	LOC102724084	NaN	NaN	NaN	rs7205126	NaN	0.239417	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr16	80584325	80584325	T	T	ncRNA_intronic	LOC102724084	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	6	0	0
chr16	80636302	80636302	T	A	intergenic	LINC01227,CDYL2	dist=29597;dist=1374	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	80636303	80636303	C	G	intergenic	LINC01227,CDYL2	dist=29598;dist=1373	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	80718578	80718578	T	T	exonic	CDYL2	NaN	synonymous SNV	CDYL2:NM_152342:exon2:c.A473A:p.N158N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	120	79	0	0
chr16	81058215	81058215	T	T	intronic	CENPN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr16	81062156	81062156	T	C	intronic	CENPN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	19.1875	33	NaN	NA	NA	89	81	5	22
chr16	81062158	81062158	T	C	intronic	CENPN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.153287	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	95	86	9	0
chr16	81095363	81095363	C	T	exonic	C16orf46	NaN	synonymous SNV	C16orf46:NM_001100873:exon3:c.G591A:p.L197L,C16orf46:NM_152337:exon4:c.G591A:p.L197L	rs804885	NaN	0.716054	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	79.925659	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	2	26	55
chr16	81116629	81116629	A	T	intronic	GCSH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	81116630	81116630	A	C	intronic	GCSH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	81116631	81116631	A	G	intronic	GCSH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	81129519	81129519	T	A	intronic	GCSH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	81129562	81129562	A	G	intronic	GCSH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	16	5	11	2
chr16	81145737	81145737	T	G	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	rs8059318	NaN	0.823482	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2863.75	0	NaN	NA	NA	205	0	205	56
chr16	81150865	81150865	T	C	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	rs6564823	NaN	0.985224	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	102.578	0	25.770413	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	18
chr16	81161608	81161608	T	C	exonic	PKD1L2	NaN	unknown	UNKNOWN	rs16954722	NaN	0.219449	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	244.583	0	NaN	NA	NA	229	153	76	6
chr16	81173030	81173030	A	G	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	rs4889243	NaN	0.926917	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	56.58196	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	0	20	57
chr16	81173136	81173136	T	C	exonic	PKD1L2	NaN	unknown	UNKNOWN	rs12918619	NaN	0.946286	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.457592	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	54
chr16	81183512	81183512	G	T	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	81194528	81194528	C	T	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	rs11647564	NaN	0.105631	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	305.80634	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	251	117	134	28
chr16	81198441	81198441	T	C	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	rs7191852	NaN	0.878195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	340.619	0	NaN	NA	NA	63	37	26	35
chr16	81199573	81199573	A	G	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.488069	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	119	103	16	0
chr16	81199613	81199613	A	G	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	rs376405547	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	81199614	81199614	C	G	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	81204696	81204696	A	A	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr16	81209207	81209207	T	C	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	rs2317114	NaN	0.551917	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	55.424074	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	55	27	28	40
chr16	81209402	81209402	A	C	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr16	81213378	81213378	A	G	exonic	PKD1L2	NaN	nonsynonymous SNV	PKD1L2:NM_001278423:exon2:c.T77C:p.L26P,PKD1L2:NM_001076780:exon13:c.T2132C:p.L711P	rs4889261	NaN	0.80012	1	T	0.0	B	0.0	B	0.004	N	0.001	P	.	.	2.73	T	-0.941	T	0.000	T	0.489	-1.631	0.013	5.02	1.137	3.419	10.907	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.748387	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	3	12	56
chr16	81213422	81213422	C	T	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	rs4889262	NaN	0.778355	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.535321	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	4	10	56
chr16	81214637	81214637	C	A	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	81214638	81214638	C	G	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	81214895	81214895	A	A	UTR5	PKD1L2	NM_001278425:c.-77T>T,NM_001278423:c.-77T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr16	81222699	81222699	G	C	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	81222701	81222701	C	T	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	81222704	81222704	C	T	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	81228717	81228717	G	C	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	81228718	81228718	C	G	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	81241069	81241069	T	T	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	81248814	81248814	A	C	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	81248815	81248815	G	A	intronic	PKD1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	81293229	81293229	T	T	intronic	BCO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	81303647	81303647	T	T	intronic	BCO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr16	813650	813650	G	A	exonic	MSLN	NaN	synonymous SNV	MSLN:NM_013404:exon4:c.G138A:p.A46A,MSLN:NM_001177355:exon5:c.G138A:p.A46A,MSLN:NM_005823:exon5:c.G138A:p.A46A	rs3765319	NaN	0.144569	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	31.5985	0	11.496081	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	4	5	14
chr16	81387937	81387937	C	A	intronic	GAN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	81391563	81391563	A	A	intronic	GAN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	81391567	81391567	A	C	intronic	GAN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	81479188	81479188	G	G	intronic	CMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr16	81509788	81509788	A	A	intronic	CMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	81509789	81509789	A	A	intronic	CMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	81577968	81577968	G	G	intronic	CMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	81599995	81599995	C	G	intronic	CMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	81654375	81654375	A	C	intronic	CMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	816777	816777	A	C	exonic	MSLN	NaN	nonsynonymous SNV	MSLN:NM_013404:exon13:c.A1364C:p.E455A,MSLN:NM_001177355:exon14:c.A1340C:p.E447A,MSLN:NM_005823:exon14:c.A1340C:p.E447A	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.393	B	0.321	B	0.847	N	1.000	N	1.385	L	2.65	T	-0.956	T	0.035	T	0.365	1.425	10.70	0.538	-0.038	0.552	3.945	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.967686	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	126	118	8	0
chr16	81694707	81694707	A	A	intronic	CMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	817016	817016	AGCCAGGGAGTCCCTG	A,AGCCAGGGAGTCCTG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	348.589	0	NaN	NA	NA	219	120	92	6
chr16	81705858	81705858	A	A	intronic	CMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	81711878	81711878	A	C	splicing	CMIP	NM_198390:exon10:c.1035-2A>C,NM_030629:exon10:c.753-2A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.372	17.37	5.01	1.898	8.407	14.721	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.012845367481557998	NA	0	0	14.009759	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	37	28	9	0
chr16	81711879	81711879	G	A	splicing	CMIP	NM_198390:exon10:c.1035-1G>A,NM_030629:exon10:c.753-1G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.406	17.50	5.01	2.342	7.085	15.437	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.011139	nearby_gap_events	REJECT	41	35	6	0
chr16	81711880	81711880	C	G	exonic	CMIP	NaN	nonsynonymous SNV	CMIP:NM_030629:exon10:c.C753G:p.S251R,CMIP:NM_198390:exon10:c.C1035G:p.S345R	NaN	NaN	NaN	.	.	0.994	D	0.975	D	0.000	D	1.000	D	0	N	2.97	T	-1.004	T	0.031	T	0.757	0.209	5.126	4.04	1.089	0.564	10.733	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.006428436377386979	NA	0	0	9.383292	nearby_gap_events	REJECT	28	21	7	0
chr16	81725309	81725309	T	T	intronic	CMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	81733425	81733425	T	C	intronic	CMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.851888	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	143	135	8	0
chr16	81733511	81733511	G	C	intronic	CMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.310245	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	122	114	8	0
chr16	81733513	81733513	A	G	intronic	CMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.483156	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	130	119	11	0
chr16	817339	817339	G	T	intronic	MSLN	NaN	NaN	NaN	rs3765325	NaN	0.222843	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.672508	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	8	13	20
chr16	81739057	81739057	T	T	intronic	CMIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr16	81740733	81740733	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	1	3,2	0
chr16	81743486	81743486	G	T	UTR3	CMIP	NM_198390:c.*82G>T,NM_030629:c.*82G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.925751	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	234	225	9	0
chr16	81891782	81891782	T	T	intronic	PLCG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	226	134	0	0
chr16	81902705	81902705	G	G	intronic	PLCG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	81902706	81902706	T	T	intronic	PLCG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	81904375	81904375	C	T	intronic	PLCG2	NaN	NaN	NaN	rs35039495	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	1344.29	18	NaN	NA	NA	11	0	11	1
chr16	81916771	81916771	T	T	intronic	PLCG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	81925051	81925051	T	T	intronic	PLCG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	81939150	81939150	G	C	intronic	PLCG2	NaN	NaN	NaN	rs4435248	NaN	0.795527	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	392.577	0	NaN	NA	NA	97	44	53	40
chr16	81941319	81941319	C	T	exonic	PLCG2	NaN	synonymous SNV	PLCG2:NM_002661:exon16:c.C1497T:p.A499A	rs1143689	NaN	0.77496	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	55.043506	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	35	24	57
chr16	81960842	81960842	A	A	intronic	PLCG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr16	819611	819611	C	G	upstream;downstream	MIR662;MSLN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.228486	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	82	76	6	0
chr16	819616	819616	G	A	upstream;downstream	MIR662;MSLN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.443002	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	73	65	8	0
chr16	81971589	81971589	A	A	intronic	PLCG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	82032705	82032705	T	G	UTR3	SDR42E1	NM_145168:c.*11A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr16	820944	820944	T	A	downstream	MIR662	NaN	NaN	NaN	rs12599363	ID=COSM1609708;OCCURENCE=1(liver)	0.253395	0.05	D	0.995	D	0.883	P	0.003	N	0.000	P	.	.	2.12	T	-0.948	T	0.000	T	0.83	3.215	16.77	4.84	1.930	2.506	12.076	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	57	15.880323	normal_lod	REJECT	5	0	5	2
chr16	822664	822664	T	G	intergenic	MIR662,RPUSD1	dist=2387;dist=12310	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.460622	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	56	49	7	0
chr16	824630	824630	C	G	intergenic	MIR662,RPUSD1	dist=4353;dist=10344	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.535893	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	72	65	7	0
chr16	824632	824632	A	A	intergenic	MIR662,RPUSD1	dist=4355;dist=10342	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr16	825124	825124	C	G	intergenic	MIR662,RPUSD1	dist=4847;dist=9850	NaN	NaN	rs34636186	NaN	0.147963	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.772612	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	4	3	7
chr16	82750687	82750687	A	G	intronic	CDH13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	83205259	83205259	A	G	intronic	CDH13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	22	5	15	0
chr16	8323496	8323496	G	A	intergenic	RBFOX1,TMEM114	dist=560156;dist=264075	NaN	NaN	rs79189411	NaN	0.0860623	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	836167	836167	T	T	exonic	RPUSD1	NaN	synonymous SNV	RPUSD1:NM_058192:exon6:c.A722A:p.H241H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	52	51	0	0
chr16	836992	836992	G	C	intronic	RPUSD1	NaN	NaN	NaN	rs2272896	NaN	0.355232	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.067199	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	15	7	22
chr16	83842419	83842419	A	G	intronic	HSBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr16	83927803	83927803	T	G	intergenic	HSBP1,MLYCD	dist=81196;dist=4927	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	83927804	83927804	G	C	intergenic	HSBP1,MLYCD	dist=81197;dist=4926	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	83933296	83933296	T	C	intronic	MLYCD	NaN	NaN	NaN	rs446036	NaN	0.957069	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.02685	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	34
chr16	83965761	83965761	C	C	intergenic	MLYCD,OSGIN1	dist=15974;dist=21066	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	83983100	83983100	T	G	intergenic	MLYCD,OSGIN1	dist=33313;dist=3727	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	D	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	N	-0.695	N	2.87	T	-0.934	T	0.008	T	0.179	-0.369	2.264	-7.41	-2.814	-1.836	1.329	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	83994126	83994126	C	A	intronic	OSGIN1	NaN	NaN	NaN	rs2665294	NaN	0.0565096	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	84.37832	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	26	33	9
chr16	83994548	83994548	G	A	intronic	OSGIN1	NaN	NaN	NaN	rs2741876	NaN	0.0443291	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.679485	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	14	10	7
chr16	83998662	83998662	A	G	intronic	OSGIN1	NaN	NaN	NaN	rs733728	NaN	0.207668	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.107537	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	14	19	13
chr16	83999000	83999000	C	G	exonic	OSGIN1	NaN	synonymous SNV	OSGIN1:NM_182981:exon6:c.C822G:p.A274A	rs3743627	NaN	0.129393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.25921	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	15	7	4
chr16	84028166	84028166	C	T	intronic	NECAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.030612244897958503	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr16	84034453	84034453	G	G	intronic	NECAB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr16	840527	840527	T	G	exonic	CHTF18	NaN	nonsynonymous SNV	CHTF18:NM_022092:exon7:c.T755G:p.L252R	NaN	NaN	NaN	0.53	T	0.242	B	0.166	B	.	.	1.000	D	1.43	L	2.74	T	-1.073	T	0.033	T	0.421	3.290	17.05	4.9	1.972	0.459	11.191	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.13888888888888942	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr16	84063239	84063239	A	G	intronic	SLC38A8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	84065397	84065397	T	T	intronic	SLC38A8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr16	840713	840713	A	A	intronic	CHTF18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	84088047	84088047	C	T	UTR3	MBTPS1	NM_003791:c.*7G>A	NaN	NaN	rs11607	NaN	0.36222	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.776241	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	15	38	33
chr16	84099482	84099482	A	T	intronic	MBTPS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	67	23	44	0
chr16	84099483	84099483	A	A	intronic	MBTPS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	27	24	0	0
chr16	84103509	84103509	G	A	exonic	MBTPS1	NaN	synonymous SNV	MBTPS1:NM_003791:exon14:c.C1917T:p.P639P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.975162	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	554	545	9	0
chr16	84103657	84103657	A	A	intronic	MBTPS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	21	16	0	0
chr16	84115672	84115672	A	G	intronic	MBTPS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr16	84115674	84115674	A	C	intronic	MBTPS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	84115677	84115677	C	T	intronic	MBTPS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	84115678	84115678	A	G	intronic	MBTPS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	84118567	84118567	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	5	0	2,2	0
chr16	84164788	84164788	G	T	exonic	HSDL1	NaN	nonsynonymous SNV	HSDL1:NM_001146051:exon3:c.C139A:p.L47M,HSDL1:NM_031463:exon3:c.C139A:p.L47M	NaN	NaN	NaN	0.23	T	0.668	P	0.271	B	0.000	D	0.845	D	0.55	N	-1.33	T	-0.467	T	0.318	T	0.333	2.267	13.54	4.36	2.765	0.584	3.309	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	37	14	11	0
chr16	84164792	84164792	G	A	exonic	HSDL1	NaN	synonymous SNV	HSDL1:NM_001146051:exon3:c.C135T:p.Y45Y,HSDL1:NM_031463:exon3:c.C135T:p.Y45Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0224309961125318	NA	0	0	NaN	NA	NA	34	23	11	0
chr16	84164793	84164793	T	G	exonic	HSDL1	NaN	nonsynonymous SNV	HSDL1:NM_001146051:exon3:c.A134C:p.Y45S,HSDL1:NM_031463:exon3:c.A134C:p.Y45S	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.882	P	0.451	P	0.000	D	1.000	D	0.895	L	-1.14	T	-0.154	T	0.432	T	0.766	3.956	20.2	5.84	2.232	5.746	16.211	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	68	34	33	0
chr16	841780	841780	T	G	intronic	CHTF18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	1	1	0
chr16	841877	841877	G	C	exonic	CHTF18	NaN	synonymous SNV	CHTF18:NM_022092:exon9:c.G1131C:p.G377G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0020657678628199874	NA	0	0	NaN	NA	NA	32	25	7	0
chr16	84188480	84188480	A	T	intronic	DNAAF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	28	11	17	0
chr16	84212790	84212790	G	A	exonic	TAF1C	NaN	synonymous SNV	TAF1C:NM_001243158:exon11:c.C1371T:p.P457P,TAF1C:NM_001243157:exon12:c.C1371T:p.P457P,TAF1C:NM_001243160:exon12:c.C936T:p.P312P,TAF1C:NM_001243159:exon14:c.C1140T:p.P380P,TAF1C:NM_005679:exon14:c.C2367T:p.P789P,TAF1C:NM_001243156:exon15:c.C2289T:p.P763P,TAF1C:NM_139353:exon15:c.C2085T:p.P695P	rs76848314	NaN	0.00139776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.46135	0	NaN	NA	NA	13	11	2	1
chr16	84213502	84213502	G	A	intronic	TAF1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.931654	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	435	416	19	0
chr16	84213540	84213540	C	A	intronic	TAF1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.510875	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	404	380	24	0
chr16	84213748	84213748	C	T	intronic	TAF1C	NaN	NaN	NaN	rs2278042	NaN	0.278954	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	65.6728	0	NaN	NA	NA	9	2	7	31
chr16	84215133	84215133	C	T	UTR5	TAF1C	NM_001243160:c.-1225G>A,NM_001243159:c.-185G>A	NaN	NaN	rs4150149	NaN	0.271366	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.372035	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	4	8	29
chr16	84215314	84215314	T	C	intronic	TAF1C	NaN	NaN	NaN	rs3815814	NaN	0.523962	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	16.0994	0	NaN	NA	NA	11	8	3	18
chr16	84215692	84215692	C	T	intronic	TAF1C	NaN	NaN	NaN	rs2303237	NaN	0.269369	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	367.396307	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	276	129	147	38
chr16	84225327	84225327	C	G	intronic	ADAD2	NaN	NaN	NaN	rs8049081	NaN	0.690695	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	25	13	12	38
chr16	84228406	84228406	C	T	intronic	ADAD2	NaN	NaN	NaN	rs11864953	NaN	0.649161	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	65.779908	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	15	28	42
chr16	84230643	84230643	A	A	UTR3	ADAD2	NM_139174:c.*63A>A,NM_001145400:c.*63A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	842546	842546	G	A	exonic	CHTF18	NaN	synonymous SNV	CHTF18:NM_022092:exon11:c.G1434A:p.E478E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	67	NaN	NA	NA	46	46	0	0
chr16	84285828	84285828	T	C	intergenic	KCNG4,WFDC1	dist=12472;dist=42484	NaN	NaN	rs390379	NaN	0.357428	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	84328553	84328553	T	T	UTR5	WFDC1	NM_001282467:c.-25T>T,NM_001282466:c.-25T>T,NM_021197:c.-25T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr16	84328664	84328664	C	G	exonic	WFDC1	NaN	synonymous SNV	WFDC1:NM_001282466:exon1:c.C87G:p.G29G,WFDC1:NM_001282467:exon1:c.C87G:p.G29G,WFDC1:NM_021197:exon1:c.C87G:p.G29G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.304828	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	136	127	9	0
chr16	84328756	84328756	G	C	intronic	WFDC1	NaN	NaN	NaN	rs401782	NaN	0.920527	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1423.36	0	NaN	NA	NA	111	0	111	39
chr16	84351827	84351827	C	CA	intronic	WFDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	850.87	0	NaN	NA	NA	142	4	15	0
chr16	84351828	84351828	G	A	intronic	WFDC1	NaN	NaN	NaN	rs187372	NaN	0.303514	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1056.7	0	NaN	NA	NA	88	0	88	21
chr16	84358121	84358121	A	C	intronic	WFDC1	NaN	NaN	NaN	rs244787	NaN	0.979034	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	34.8269	0	NaN	NA	NA	12	0	12	6
chr16	84421297	84421297	G	C	intronic	ATP2C2	NaN	NaN	NaN	rs7204511	NaN	0.45607	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	84456731	84456731	T	A	intronic	ATP2C2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.582793	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	77	69	8	0
chr16	84480081	84480081	C	G	intronic	ATP2C2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.580948	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	72	62	10	0
chr16	84485573	84485573	C	A	exonic	ATP2C2	NaN	synonymous SNV	ATP2C2:NM_001291454:exon15:c.C1254A:p.L418L,ATP2C2:NM_001286527:exon18:c.C1707A:p.L569L,ATP2C2:NM_014861:exon18:c.C1707A:p.L569L	rs247885	NaN	0.998203	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	285.752792	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	94	0	94	57
chr16	84488620	84488620	T	C	intronic	ATP2C2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	84492692	84492692	C	G	intronic	ATP2C2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr16	84492693	84492693	G	C	intronic	ATP2C2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr16	84492694	84492694	C	C	intronic	ATP2C2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	84495825	84495825	G	A	intronic	ATP2C2	NaN	NaN	NaN	rs12448746	NaN	0.150759	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.005865	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	16	17	30
chr16	84515992	84515992	A	A	intronic	TLDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr16	84515997	84515997	A	A	intronic	TLDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr16	845901	845901	T	C	intronic	CHTF18	NaN	NaN	NaN	rs2982244	NaN	0.999201	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	124.911356	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	1	44	58
chr16	84651065	84651065	T	T	intronic	COTL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	84690451	84690451	G	C	intronic	KLHL36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	84690455	84690455	C	G	intronic	KLHL36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	84690456	84690456	T	C	intronic	KLHL36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	84690457	84690457	A	C	intronic	KLHL36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	84690458	84690458	A	T	intronic	KLHL36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	84690459	84690459	T	G	intronic	KLHL36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	847597	847597	T	C	intronic	CHTF18	NaN	NaN	NaN	rs2294450	NaN	0.463059	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	20	14	6	0
chr16	84767029	84767029	A	T	intronic	USP10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.498679	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	189	168	21	0
chr16	84767130	84767130	A	A	intronic	USP10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	84793580	84793580	T	C	intronic	USP10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.030765	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	297	290	7	0
chr16	84808824	84808824	C	G	exonic	USP10	NaN	synonymous SNV	USP10:NM_005153:exon13:c.C2202G:p.L734L,USP10:NM_001272075:exon14:c.C2214G:p.L738L	rs774298	ID=COSM148135;OCCURENCE=1(stomach)	0.435104	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	147.034565	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	0	52	53
chr16	84902605	84902605	G	A	intronic	CRISPLD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.129804	nearby_gap_events	REJECT	114	103	11	0
chr16	85091019	85091019	T	G	intronic	KIAA0513	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	85110922	85110922	C	C	intronic	KIAA0513	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	85111987	85111987	C	T	intronic	KIAA0513	NaN	NaN	NaN	rs2291968	NaN	0.104233	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	105.774823	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	96	47	49	6
chr16	85112203	85112203	A	A	intronic	KIAA0513	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	85117324	85117324	A	A	intronic	KIAA0513	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	85120339	85120339	C	C	intronic	KIAA0513	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	39	37	0	0
chr16	85120350	85120350	A	G	intronic	KIAA0513	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	31	30	1	0
chr16	85121003	85121003	A	G	intronic	KIAA0513	NaN	NaN	NaN	rs3794684	NaN	0.747005	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	85122013	85122013	A	A	UTR3	KIAA0513	NM_001286566:c.*82A>A,NM_014732:c.*82A>A,NM_001286565:c.*82A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr16	85141672	85141672	G	A	exonic	FAM92B	NaN	synonymous SNV	FAM92B:NM_198491:exon3:c.C289T:p.L97L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.69288	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	136	118	18	0
chr16	85337058	85337058	T	C	intergenic	LINC00311,MIR5093	dist=15373;dist=2774	NaN	NaN	rs2966866	NaN	0.773363	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	18	5	13	0
chr16	85367803	85367803	G	T	intergenic	MIR5093,GSE1	dist=27872;dist=277226	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	85413207	85413207	C	A	intergenic	MIR5093,GSE1	dist=73276;dist=231822	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	85667696	85667696	G	A	exonic	GSE1	NaN	nonsynonymous SNV	GSE1:NM_014615:exon2:c.G184A:p.A62T	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.995	D	0.000	U	1.000	D	0.805	L	0.04	T	-0.363	T	0.306	T	0.748	4.696	26.0	4.36	1.975	9.514	16.488	100	11	3035	SNV	VTSm	3	Somatic	0.0021495355199470626	Somatic	53.2261	51	NaN	NA	NA	18	9	9	34
chr16	85675318	85675318	G	G	intronic	GSE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr16	85679082	85679082	C	C	intronic	GSE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	22	18	0	0
chr16	85679112	85679112	G	C	intronic	GSE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	23	14	9	0
chr16	85679113	85679113	C	G	intronic	GSE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	20	11	9	0
chr16	85699997	85699997	A	A	intronic	GSE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	85701586	85701586	C	T	intronic	GSE1	NaN	NaN	NaN	rs4843481	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	299.346	19	NaN	NA	NA	110	44	66	50
chr16	85702046	85702046	G	T	intronic	GSE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	85712105	85712105	C	T	intronic	GINS2	NaN	NaN	NaN	rs3815795	ID=COSN165285;OCCURENCE=1(breast)	0.183307	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	89.159754	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	19	34	29
chr16	85722560	85722560	C	G	UTR5	GINS2	NM_016095:c.-56G>C	NaN	NaN	rs58171120	NaN	0.329872	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.745898	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	2	4	22
chr16	85743732	85743732	C	G	intronic	C16orf74	NaN	NaN	NaN	rs2305357	NaN	0.754593	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.423411	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	4	5	41
chr16	85743813	85743813	G	T	exonic	C16orf74	NaN	synonymous SNV	C16orf74:NM_206967:exon3:c.C129A:p.P43P	rs112376688	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.543123	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	110	97	13	0
chr16	857673	857673	G	A	intronic	PRR25	NaN	NaN	NaN	rs58297819	NaN	0.138179	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	47.773999	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	11	22	21
chr16	85768606	85768606	A	G	intronic	C16orf74	NaN	NaN	NaN	rs409342	NaN	0.967652	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.108993	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	1	5	0
chr16	85768710	85768710	A	AC	intronic	C16orf74	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.2571	0	NaN	NA	NA	12	9	3	1
chr16	85834703	85834703	T	T	intronic	COX4I1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	85846203	85846203	A	C	intergenic	COX4I1,IRF8	dist=5596;dist=86571	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	85849937	85849937	T	C	intergenic	COX4I1,IRF8	dist=9330;dist=82837	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr16	85952543	85952543	A	T	intronic	IRF8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	85952544	85952544	A	G	intronic	IRF8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	85953591	85953591	T	T	intronic	IRF8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	86094479	86094479	A	G	intergenic	IRF8,LINC01082	dist=138268;dist=135308	NaN	NaN	rs56046769	NaN	0.361621	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	86098302	86098302	T	C	intergenic	IRF8,LINC01082	dist=142091;dist=131485	NaN	NaN	rs7185808	NaN	0.666334	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	86378215	86378215	G	A	ncRNA_intronic	LINC00917	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	86411940	86411940	T	C	intergenic	LINC00917,FENDRR	dist=32655;dist=96191	NaN	NaN	rs17264502	NaN	0.0714856	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr16	86476980	86476980	A	A	intergenic	LINC00917,FENDRR	dist=97695;dist=31151	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	86476981	86476981	C	C	intergenic	LINC00917,FENDRR	dist=97696;dist=31150	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	86477489	86477489	G	C	intergenic	LINC00917,FENDRR	dist=98204;dist=30642	NaN	NaN	rs9924566	NaN	0.315695	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr16	86544997	86544997	G	A	exonic	FOXF1	NaN	synonymous SNV	FOXF1:NM_001451:exon1:c.G822A:p.A274A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.19999999999999943	Somatic	10.4475	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr16	86556947	86556947	C	G	intergenic	FOXF1,MTHFSD	dist=8877;dist=6835	NaN	NaN	rs12925640	NaN	0.425719	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	86575647	86575647	C	A	intronic	MTHFSD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.790816	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	174	153	21	0
chr16	86601153	86601153	T	A	exonic	FOXC2	NaN	nonsynonymous SNV	FOXC2:NM_005251:exon1:c.T212A:p.V71E	NaN	NaN	NaN	0	D	0.391	B	0.235	B	0.005	U	1.000	D	1.975	M	-3.67	D	0.438	D	0.770	D	0.677	3.817	19.38	3.54	0.615	4.797	10.311	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.027415085027145958	NA	0	31	NaN	NA	NA	16	6	10	0
chr16	86602621	86602621	A	A	downstream	FOXC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	86752054	86752054	C	T	intergenic	FOXL1,LOC440390	dist=136750;dist=339336	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	86851994	86851994	C	A	intergenic	FOXL1,LOC440390	dist=236690;dist=239396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr16	86851995	86851995	A	G	intergenic	FOXL1,LOC440390	dist=236691;dist=239395	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr16	86916029	86916029	G	A	intergenic	FOXL1,LOC440390	dist=300725;dist=175361	NaN	NaN	rs7202673	NaN	0.457867	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr16	86996393	86996393	G	C	intergenic	FOXL1,LOC440390	dist=381089;dist=94997	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	87160705	87160705	C	A	intergenic	LOC440390,LOC101928708	dist=63108;dist=85016	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	87189932	87189932	C	A	intergenic	LOC440390,LOC101928708	dist=92335;dist=55789	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	87229841	87229841	C	C	intergenic	LOC440390,LOC101928708	dist=132244;dist=15880	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	8728817	8728817	G	C	intronic	METTL22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr16	8728842	8728842	T	C	intronic	METTL22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	56	33	23	0
chr16	87338667	87338667	T	T	intronic	C16orf95	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	87338668	87338668	T	T	intronic	C16orf95	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	87338887	87338887	G	A	intronic	C16orf95	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr16	87339236	87339236	T	C	intronic	C16orf95	NaN	NaN	NaN	rs76128303	NaN	0.205471	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.048372	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	5	8	24
chr16	87350661	87350661	T	T	intronic	C16orf95	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	76	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	8735120	8735120	T	C	intronic	METTL22	NaN	NaN	NaN	rs8062990	NaN	0.914537	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	540.733855	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	179	0	179	58
chr16	8736028	8736028	T	C	exonic	METTL22	NaN	synonymous SNV	METTL22:NM_024109:exon8:c.T871C:p.L291L	rs1614616	NaN	0.985823	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	119.201765	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	44	0	44	58
chr16	87368005	87368005	A	A	intronic	FBXO31	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr16	87369666	87369666	C	G	intronic	FBXO31	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	87369667	87369667	A	C	intronic	FBXO31	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	87376605	87376605	C	T	intronic	FBXO31	NaN	NaN	NaN	rs2303763	NaN	0.64976	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	64.459389	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	30	27	45
chr16	8738350	8738350	C	T	intronic	METTL22	NaN	NaN	NaN	rs11645418	NaN	0.849042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.880055	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	0	33	55
chr16	8738398	8738398	A	G	intronic	METTL22	NaN	NaN	NaN	rs1641065	NaN	0.985823	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	75.996107	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	0	32	58
chr16	8738499	8738499	G	A	exonic	METTL22	NaN	nonsynonymous SNV	METTL22:NM_024109:exon10:c.G1096A:p.A366T	rs1731000	NaN	0.986222	0.57	T	0.006	B	0.004	B	0.666	N	1.000	P	1.7	L	2.23	T	-0.986	T	0.000	T	0.223	-0.248	2.804	-4.67	-0.577	-0.065	3.329	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.988104	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	0	35	58
chr16	87394058	87394058	A	G	intronic	FBXO31	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	25	6	19	0
chr16	8739954	8739954	G	A	intronic	METTL22	NaN	NaN	NaN	rs1641070	NaN	0.985623	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3680.68	0	NaN	NA	NA	346	0	346	57
chr16	87432560	87432560	A	A	intronic	MAP1LC3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr16	87436764	87436764	A	G	UTR3	MAP1LC3B	NM_022818:c.*61A>G	NaN	NaN	rs1054528	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	742.473	0	NaN	NA	NA	72	11	61	57
chr16	87443800	87443800	T	T	UTR3	ZCCHC14	NM_015144:c.*86A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	87445053	87445053	T	T	intronic	ZCCHC14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	87454359	87454359	A	A	intronic	ZCCHC14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	87619184	87619184	G	G	intergenic	LOC101928737,JPH3	dist=69948;dist=17309	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr16	87678659	87678659	C	G	intronic	JPH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.507653	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	201	188	13	0
chr16	87686633	87686633	C	C	intronic	JPH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	87724156	87724156	G	A	intronic	JPH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.288655	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	265	260	5	0
chr16	87726782	87726782	A	C	intronic	JPH3	NaN	NaN	NaN	rs4843675	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	87744648	87744648	T	T	intronic	KLHDC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr16	87748364	87748364	C	A	intronic	KLHDC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.401224	clustered_read_position	REJECT	185	163	22	6
chr16	87764312	87764312	G	C	intronic	KLHDC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr16	87764318	87764318	A	C	intronic	KLHDC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	87764320	87764320	C	T	intronic	KLHDC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr16	87764322	87764322	A	T	intronic	KLHDC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	87818969	87818969	A	G	intergenic	LOC102724467,SLC7A5	dist=6215;dist=44660	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	87866758	87866758	A	A	intronic	SLC7A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	87873556	87873556	A	G	intronic	SLC7A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr16	879065	879065	T	C	intergenic	PRR25,LMF1	dist=15204;dist=24570	NaN	NaN	rs1124958	NaN	0.697684	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr16	87960180	87960180	A	C	intronic	CA5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr16	87988444	87988444	C	T	intronic	BANP	NaN	NaN	NaN	rs4843745	NaN	0.245407	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	88098707	88098707	T	T	intronic	BANP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr16	88098722	88098722	A	T	intronic	BANP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.30769230769230677	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr16	88105162	88105162	G	T	intronic	BANP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-0.989	T	0.091	T	.	-0.892	0.455	-1.66	-2.463	0.255	2.777	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	88133115	88133115	C	C	ncRNA_exonic	LOC400553	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr16	8829715	8829715	T	C	intronic	ABAT	NaN	NaN	NaN	rs1640998	NaN	0.343051	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.309934	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	15	11	31
chr16	88305164	88305164	C	T	intergenic	LOC101928880,ZNF469	dist=76341;dist=188715	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	88305166	88305166	A	T	intergenic	LOC101928880,ZNF469	dist=76343;dist=188713	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	883130	883130	T	T	intergenic	PRR25,LMF1	dist=19269;dist=20505	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	88335716	88335716	T	T	intergenic	LOC101928880,ZNF469	dist=106893;dist=158163	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	88442483	88442483	G	A	intergenic	LOC101928880,ZNF469	dist=213660;dist=51396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr16	88494947	88494947	T	C	exonic	ZNF469	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF469:NM_001127464:exon1:c.T1069C:p.S357P	rs11648572	NaN	0.989018	0.52	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	-0.205	N	3.3	T	-1.054	T	0.000	T	0.067	-0.816	0.634	-0.624	-0.226	-0.443	4.381	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	62.2506	0	13.769737	normal_lod	REJECT	7	0	7	34
chr16	88494976	88494976	A	C	exonic	ZNF469	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF469:NM_001127464:exon1:c.A1098C:p.R366S	rs11640794	NaN	0.855032	1	T	0.003	B	0.0	B	.	.	1.000	P	0	N	3.61	T	-0.994	T	0.000	T	0.04	-0.031	3.854	0.792	0.325	0.562	4.275	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	74.9707	0	16.368803	normal_lod	REJECT	8	0	8	40
chr16	88495426	88495426	C	A	exonic	ZNF469	NaN	synonymous SNV	ZNF469:NM_001127464:exon1:c.C1548A:p.G516G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.39912280701755176	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr16	88495427	88495427	A	G	exonic	ZNF469	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF469:NM_001127464:exon1:c.A1549G:p.S517G	NaN	NaN	NaN	0.5	T	0.027	B	0.015	B	.	.	1.000	N	0.205	N	2.06	T	-0.971	T	0.020	T	0.196	0.579	7.125	-0.63	-0.120	0.223	1.042	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.690243	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	16	13	3	0
chr16	88496823	88496823	G	T	exonic	ZNF469	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF469:NM_001127464:exon1:c.G2945T:p.R982M	NaN	NaN	NaN	0	D	0.948	P	0.404	B	.	.	1.000	N	0.345	N	3.19	T	-0.978	T	0.014	T	0.313	1.319	10.32	1.21	0.345	0.930	4.855	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	23.5838	0	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr16	88497446	88497446	A	G	exonic	ZNF469	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF469:NM_001127464:exon2:c.A3484G:p.K1162E	rs7197071	NaN	0.81889	1	T	0.023	B	0.012	B	.	.	1.000	P	0.345	N	3.12	T	-0.974	T	0.000	T	0.052	2.706	15.01	-2.95	-0.425	-0.304	7.373	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.268808	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	1	3	30
chr16	88498441	88498441	A	G	exonic	ZNF469	NaN	synonymous SNV	ZNF469:NM_001127464:exon2:c.A4479G:p.G1493G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.470928	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	183	173	10	0
chr16	88500361	88500361	C	G	exonic	ZNF469	NaN	synonymous SNV	ZNF469:NM_001127464:exon2:c.C6399G:p.G2133G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	70	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr16	88501971	88501971	T	A	exonic	ZNF469	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF469:NM_001127464:exon2:c.T8009A:p.L2670Q	rs3812956	NaN	0.294329	0.31	T	0.0	B	0.001	B	.	.	1.000	P	-0.345	N	3.45	T	-0.903	T	0.000	T	0.101	0.063	4.345	-6.47	-2.507	-1.057	0.608	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	164.222	0	NaN	NA	NA	62	41	21	36
chr16	88502505	88502505	A	G	exonic	ZNF469	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF469:NM_001127464:exon2:c.A8543G:p.H2848R	rs1983014	NaN	0.996206	1	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	-0.805	N	1.32	T	-0.946	T	0.000	T	0.059	0.292	5.583	4.05	0.527	4.799	10.770	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	143.308952	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	49	0	49	58
chr16	88504850	88504850	G	C	exonic	ZNF469	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF469:NM_001127464:exon2:c.G10888C:p.E3630Q	rs1105066	NaN	0.390974	0.09	T	0.465	P	0.117	B	.	.	1.000	P	0.695	N	2.93	T	-0.964	T	0.000	T	0.081	1.080	9.407	1.33	0.950	-0.519	6.119	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	65.827	0	NaN	NA	NA	46	29	17	16
chr16	8858580	8858580	T	A	intronic	ABAT	NaN	NaN	NaN	rs2302608	NaN	0.825879	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.3994	0	NaN	NA	NA	46	30	16	26
chr16	88594705	88594705	G	C	intronic	ZFPM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.563463	strand_artifact	REJECT	39	31	8	0
chr16	88594706	88594706	C	G	intronic	ZFPM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.251382	strand_artifact	REJECT	39	31	8	0
chr16	88615591	88615591	C	G	intergenic	ZFPM1,ZC3H18	dist=14017;dist=21198	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	88704919	88704919	G	C	upstream	IL17C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.609162	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	173	159	14	0
chr16	88706500	88706500	C	T	UTR3	IL17C	NM_013278:c.*20C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	9.16554	0	8.322534	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	39	33	6	0
chr16	88713646	88713646	A	A	intronic	CYBA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	88717386	88717386	T	C	exonic	CYBA	NaN	synonymous SNV	CYBA:NM_000101:exon1:c.A36G:p.E12E	rs8053867	NaN	0.995607	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	103.076	0	32.813853	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	16
chr16	88721065	88721065	T	T	intronic	MVD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	88721085	88721085	G	C	intronic	MVD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.438214	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	63	57	6	0
chr16	88723792	88723792	T	T	intronic	MVD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	88752693	88752693	T	G	ncRNA_intronic	SNAI3-AS1	NaN	NaN	NaN	rs11076698	NaN	0.863818	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	103.076	0	NaN	NA	NA	11	0	11	46
chr16	88764846	88764846	G	C	intronic	RNF166	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	46	28	18	0
chr16	88764849	88764849	C	A	intronic	RNF166	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.07711847185531231	NA	0	0	19.604007	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	45	29	16	2
chr16	88765504	88765504	G	C	intronic	RNF166	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	69	52	17	0
chr16	88778551	88778551	C	T	intronic	CTU2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	88779739	88779739	A	G	exonic	CTU2	NaN	nonsynonymous SNV	CTU2:NM_001012759:exon8:c.A757G:p.M253V,CTU2:NM_001012762:exon8:c.A757G:p.M253V	rs11549837	NaN	0.452676	0.71	T	0.0	B	0.0	B	0.119	N	0.999	P	-2.135	N	2.48	T	-1.008	T	0.000	T	0.032	-1.128	0.119	1.54	0.492	0.845	4.674	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.779761	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	0	19	25
chr16	88781125	88781125	T	C	exonic	CTU2	NaN	synonymous SNV	CTU2:NM_001012759:exon12:c.T1332C:p.C444C,CTU2:NM_001012762:exon12:c.T1332C:p.C444C	rs8043637	NaN	0.871805	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	68.016117	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	0	25	56
chr16	88781225	88781225	T	C	intronic	CTU2	NaN	NaN	NaN	rs2306047	NaN	0.328474	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	115.665266	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	1	39	17
chr16	88781384	88781384	C	CTGT,T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	212.318	0	NaN	NA	NA	24	0	11	9
chr16	88781418	88781418	CA	C,CG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	259.169	0	NaN	NA	NA	28	0	5	2
chr16	88785837	88785837	T	T	intronic	PIEZO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	16	15	0	0
chr16	88786280	88786280	A	G	exonic	PIEZO1	NaN	nonsynonymous SNV	PIEZO1:NM_001142864:exon43:c.T6253C:p.Y2085H	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.994	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	2.85	M	-1.75	D	0.663	D	0.747	D	0.812	4.717	26.2	5.65	2.148	9.010	15.542	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.086094	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	186	176	10	0
chr16	88786967	88786967	C	T	intronic	PIEZO1	NaN	NaN	NaN	rs4401037	NaN	0.900759	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.111	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	47
chr16	88788903	88788903	T	G	intronic	PIEZO1	NaN	NaN	NaN	rs4238687	NaN	0.896565	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	59.584571	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	0	31	53
chr16	88788934	88788934	A	G	intronic	PIEZO1	NaN	NaN	NaN	rs4238686	NaN	0.661941	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	113.054751	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	0	43	43
chr16	88788960	88788960	C	A	intronic	PIEZO1	NaN	NaN	NaN	rs3816618	NaN	0.339457	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	466.278	0	NaN	NA	NA	33	0	33	16
chr16	88791458	88791458	G	A	exonic	PIEZO1	NaN	nonsynonymous SNV	PIEZO1:NM_001142864:exon30:c.C4193T:p.P1398L	rs11645197	NaN	0.175319	0.2	T	0.255	B	0.071	B	0.216	N	1.000	P	1.7	L	-0.61	T	-1.083	T	0.000	T	0.333	2.160	13.18	4.33	2.406	.	11.357	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.951847	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	1	3	14
chr16	88792047	88792047	A	G	exonic	PIEZO1	NaN	synonymous SNV	PIEZO1:NM_001142864:exon28:c.T4014C:p.F1338F	rs4782430	NaN	0.872604	0.72	T	.	.	.	.	0.263	N	0.032	P	.	.	.	.	-1.030	T	0.000	T	.	-0.368	2.266	1.14	-0.130	0.317	8.458	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	257.404375	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	104	1	103	57
chr16	88792821	88792821	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	0	2,3	0
chr16	88792823	88792823	A	T	exonic	PIEZO1	NaN	synonymous SNV	PIEZO1:NM_001142864:exon27:c.T3837A:p.P1279P	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.953	T	0.081	T	.	0.383	6.079	-8.02	-1.431	-2.760	0.033	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	37	6.352508	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	2	0	2	0
chr16	88793102	88793102	GC	G,GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	120.928	0	NaN	NA	NA	15	0	7	7
chr16	88793110	88793110	G	G	intronic	PIEZO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	16	16	0	0
chr16	88793112	88793112	C	G	intronic	PIEZO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr16	88798624	88798624	C	A	ncRNA_intronic	LOC100289580	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.749228	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	112	104	8	0
chr16	88799288	88799288	G	A	ncRNA_intronic	LOC100289580	NaN	NaN	NaN	rs2340984	NaN	0.277356	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	90.839605	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	1	33	15
chr16	88799338	88799338	G	A	ncRNA_intronic	LOC100289580	NaN	NaN	NaN	rs6500492	NaN	0.656749	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	212.897	0	NaN	NA	NA	18	0	18	43
chr16	88799867	88799867	G	C	ncRNA_intronic	LOC100289580	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	48.7745	26	9.247256		KEEP	6	2	4	1
chr16	88801026	88801026	G	A	ncRNA_intronic	LOC100289580	NaN	NaN	NaN	rs3214056	NaN	0.257588	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	206.519757	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	71	0	71	14
chr16	88804734	88804734	A	G	exonic	PIEZO1	NaN	nonsynonymous SNV	PIEZO1:NM_001142864:exon7:c.T749C:p.V250A	rs7184427	NaN	0.820288	0.33	T	0.03	B	0.014	B	.	.	0.000	P	0.995	L	-0.81	T	-0.995	T	0.000	T	0.12	1.030	9.206	3.7	0.872	5.784	9.883	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	59.688634	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	0	23	52
chr16	88808630	88808630	G	A	intronic	PIEZO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.875374	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	273	257	16	0
chr16	88808862	88808862	C	T	intronic	PIEZO1	NaN	NaN	NaN	rs7201439	NaN	0.837061	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1187.39	0	NaN	NA	NA	124	1	123	56
chr16	88871742	88871742	T	T	intronic	CDT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	88872229	88872229	A	G	exonic	CDT1	NaN	nonsynonymous SNV	CDT1:NM_030928:exon5:c.A784G:p.T262A	rs480727	NaN	0.571286	0.52	T	0.003	B	0.007	B	0.705	N	1.000	P	0	N	1.84	T	-1.004	T	0.000	T	0.232	-1.252	0.050	-1.33	-0.900	-0.763	5.538	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1540.01	0	NaN	NA	NA	119	0	119	34
chr16	88872511	88872511	T	C	exonic	CDT1	NaN	synonymous SNV	CDT1:NM_030928:exon6:c.T915C:p.H305H	rs510862	NaN	0.870208	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	103.437083	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	0	36	54
chr16	88874632	88874632	C	G	exonic	CDT1	NaN	synonymous SNV	CDT1:NM_030928:exon10:c.C1587G:p.L529L	rs572275	NaN	0.552716	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.441908	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	10	8	28
chr16	88884466	88884466	C	T	exonic	GALNS	NaN	synonymous SNV	GALNS:NM_000512:exon13:c.G1431A:p.E477E	rs2303271	NaN	0.474241	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	189.591606	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	75	2	73	35
chr16	88889177	88889177	C	T	intronic	GALNS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.593875	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	3	9	1
chr16	88889183	88889183	T	TA	intronic	GALNS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.20265	0	NaN	NA	NA	13	12	2	0
chr16	88889187	88889187	C	CT	intronic	GALNS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.74016	0	NaN	NA	NA	16	13	2	0
chr16	88891291	88891291	G	G	intronic	GALNS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	151	110	0	0
chr16	88903354	88903354	A	C	intronic	GALNS	NaN	NaN	NaN	rs116779164	NaN	0.0453275	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	71	27	44	0
chr16	88904086	88904086	A	G	exonic	GALNS	NaN	synonymous SNV	GALNS:NM_000512:exon5:c.T510C:p.Y170Y	rs3743544	NaN	0.0455272	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	115.15	0	NaN	NA	NA	21	6	15	1
chr16	88906976	88906976	T	T	intronic	GALNS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	88907428	88907428	C	T	exonic	GALNS	NaN	nonsynonymous SNV	GALNS:NM_000512:exon4:c.G394A:p.G132S	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.986	D	0.000	D	1.000	D	3.895	H	-5.66	D	1.048	D	0.985	D	0.706	3.293	17.06	3.84	0.961	2.547	12.088	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.249872	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	32	28	4	0
chr16	88907561	88907561	A	A	intronic	GALNS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr16	88930705	88930705	G	C	exonic	PABPN1L	NaN	nonsynonymous SNV	PABPN1L:NM_001294328:exon5:c.C649G:p.H217D,PABPN1L:NM_001080487:exon6:c.C737G:p.A246G	NaN	NaN	NaN	0.59	T	0.0	B	0.001	B	0.120	N	1.000	N	-0.235	N	-0.56	T	-1.014	T	0.047	T	0.06	1.054	9.303	-3.09	-0.365	-0.526	8.989	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	35	24	11	0
chr16	88930706	88930706	C	G	exonic	PABPN1L	NaN	nonsynonymous SNV	PABPN1L:NM_001080487:exon6:c.G736C:p.A246P	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.697	P	0.201	B	0.120	N	1.000	N	1.67	L	-0.78	T	-1.006	T	0.092	T	0.261	2.607	14.68	1.59	0.711	-0.522	3.812	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.006932292367748096	NA	0	19	NaN	NA	NA	14	4	10	0
chr16	88931914	88931914	T	C	intronic	PABPN1L	NaN	NaN	NaN	rs889753	NaN	0.522564	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	25.5201	0	NaN	NA	NA	17	11	6	28
chr16	88932605	88932605	G	C	intronic	PABPN1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.647772	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	130	118	12	0
chr16	88942219	88942219	T	T	UTR3	CBFA2T3	NM_005187:c.*1165A>A,NM_175931:c.*1165A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	88958598	88958598	T	T	intronic	CBFA2T3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	88962224	88962224	A	G	intronic	CBFA2T3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	88963011	88963011	G	T	intronic	CBFA2T3	NaN	NaN	NaN	rs12448682	NaN	0.0790735	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr16	88976968	88976968	G	C	intronic	CBFA2T3	NaN	NaN	NaN	rs529900	NaN	0.371406	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	89005088	89005088	C	T	intronic	CBFA2T3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	89025610	89025610	G	G	intronic	CBFA2T3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr16	89025611	89025611	C	C	intronic	CBFA2T3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr16	89051089	89051089	T	A	intergenic	CBFA2T3,ACSF3	dist=7585;dist=109128	NaN	NaN	rs11076745	NaN	0.174321	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	89079773	89079773	C	C	intergenic	CBFA2T3,ACSF3	dist=36269;dist=80444	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr16	89152646	89152646	G	A	intergenic	CBFA2T3,ACSF3	dist=109142;dist=7571	NaN	NaN	rs11076757	NaN	0.411142	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr16	89165690	89165690	A	C	intronic	ACSF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	89167075	89167075	C	CCCCAGGAGGCTCCCGGGAG	UTR5	ACSF3	NM_001243279:c.-15C>CCCCAGGAGGCTCCCGGGAG,NM_001127214:c.-15C>CCCCAGGAGGCTCCCGGGAG,NM_174917:c.-15C>CCCCAGGAGGCTCCCGGGAG	NaN	NaN	NaN	NaN	0.555112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	149.151	0	NaN	NA	NA	41	0	9	26
chr16	89167094	89167094	T	C	exonic	ACSF3	NaN	nonsynonymous SNV	ACSF3:NM_001127214:exon2:c.T5C:p.L2P,ACSF3:NM_001243279:exon3:c.T5C:p.L2P,ACSF3:NM_174917:exon3:c.T5C:p.L2P	rs7188200	NaN	0.624401	0.28	T	0.0	B	0.001	B	0.006	N	1.000	P	1.04	L	0.82	T	-0.998	T	0.000	T	0.333	0.893	8.627	-8.23	-2.224	-1.587	6.063	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	83.704899	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	0	28	42
chr16	89169219	89169219	CCT	C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	946.991	0	NaN	NA	NA	100	0	89	10
chr16	89169221	89169221	T	T	intronic	ACSF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr16	89211648	89211648	C	T	intronic	ACSF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr16	89251677	89251677	A	A	exonic	CDH15	NaN	synonymous SNV	CDH15:NM_004933:exon5:c.A599A:p.E200E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	19	15	0	0
chr16	89254412	89254412	AGGGTGGGAGGGGAGGGT	A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	504.402	0	NaN	NA	NA	52	0	52	0
chr16	89258522	89258522	T	T	intronic	CDH15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	89259924	89259924	T	T	exonic	CDH15	NaN	synonymous SNV	CDH15:NM_004933:exon12:c.T1902T:p.S634S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr16	89259926	89259926	G	C	exonic	CDH15	NaN	nonsynonymous SNV	CDH15:NM_004933:exon12:c.G1904C:p.R635P	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.996	D	0.94	D	0.900	U	0.987	N	2.66	M	-1.09	T	-0.407	T	0.606	D	0.279	1.860	12.18	3.37	1.946	0.891	8.674	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.372066	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	52	47	5	3
chr16	89259974	89259974	T	C	exonic	CDH15	NaN	nonsynonymous SNV	CDH15:NM_004933:exon12:c.T1952C:p.V651A	NaN	NaN	NaN	0	D	0.374	B	0.399	B	0.337	U	0.865	D	2.425	M	-1.28	T	0.262	D	0.557	D	0.149	3.981	20.4	4.47	1.636	5.692	12.743	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.336644	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	46	43	3	0
chr16	89264808	89264808	C	A	intronic	SLC22A31	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.242847	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	329	313	16	0
chr16	89265513	89265513	C	A	exonic	SLC22A31	NaN	nonsynonymous SNV	SLC22A31:NM_001242757:exon3:c.G46T:p.G16C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.32412	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	24	20	4	0
chr16	89287613	89287613	CAG	C,CTG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1066.68	0	NaN	NA	NA	110	0	105	24
chr16	89344848	89344848	C	G	intronic	ANKRD11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	18	13	5	0
chr16	89344921	89344921	G	G	intronic	ANKRD11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	16	16	0	0
chr16	89345388	89345388	T	T	intronic	ANKRD11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr16	89347428	89347428	T	C	exonic	ANKRD11	NaN	nonsynonymous SNV	ANKRD11:NM_001256183:exon9:c.A5522G:p.E1841G,ANKRD11:NM_013275:exon9:c.A5522G:p.E1841G,ANKRD11:NM_001256182:exon10:c.A5522G:p.E1841G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.421	B	0.04	B	0.151	N	1.000	D	0.975	L	0.89	T	-1.024	T	0.079	T	0.152	2.370	13.88	4.59	1.710	4.220	13.656	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	76	44	32	0
chr16	89351662	89351662	C	T	exonic	ANKRD11	NaN	nonsynonymous SNV	ANKRD11:NM_001256183:exon9:c.G1288A:p.A430T,ANKRD11:NM_013275:exon9:c.G1288A:p.A430T,ANKRD11:NM_001256182:exon10:c.G1288A:p.A430T	NaN	NaN	NaN	0.61	T	0.533	P	0.206	B	0.000	D	1.000	D	0.77	N	1.08	T	-1.101	T	0.066	T	0.166	0.409	6.219	4.51	2.575	1.206	10.942	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.789	0	NaN	NA	NA	6	3	3	9
chr16	89352412	89352412	T	A	intronic	ANKRD11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	19	4	15	0
chr16	89383584	89383584	C	C	intronic	ANKRD11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	89389645	89389645	G	C	UTR5	LOC100287036	NM_001242885:c.-69G>C	NaN	NaN	rs3114900	NaN	0.984625	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	830.738	0	NaN	NA	NA	54	0	54	42
chr16	89393208	89393208	C	A	intronic	ANKRD11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	8943658	8943658	G	T	downstream	PMM2	NaN	NaN	NaN	rs78918345	NaN	0.171326	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr16	8953081	8953081	C	G	exonic	CARHSP1	NaN	synonymous SNV	CARHSP1:NM_001042476:exon2:c.G105C:p.R35R,CARHSP1:NM_001278263:exon2:c.G105C:p.R35R,CARHSP1:NM_001278264:exon2:c.G105C:p.R35R,CARHSP1:NM_001278265:exon2:c.G105C:p.R35R,CARHSP1:NM_001278266:exon2:c.G105C:p.R35R,CARHSP1:NM_014316:exon2:c.G105C:p.R35R,CARHSP1:NM_001278260:exon3:c.G105C:p.R35R,CARHSP1:NM_001278261:exon3:c.G105C:p.R35R,CARHSP1:NM_001278262:exon3:c.G105C:p.R35R	rs8097	NaN	0.569688	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.491757	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	8	4	46
chr16	89576881	89576881	T	G	intronic	SPG7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.586386	nearby_gap_events	REJECT	43	36	7	1
chr16	89592679	89592679	T	A	intronic	SPG7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	15	0	14	0
chr16	89596052	89596052	A	A	intronic	SPG7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr16	89598503	89598503	G	T	intronic	SPG7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	23	15	8	0
chr16	89611021	89611021	T	T	intronic	SPG7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr16	89620824	89620824	T	C	intronic	SPG7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	26	9	16	0
chr16	89628655	89628655	T	T	intronic	RPL13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	89636788	89636788	G	A	intergenic	RPL13,CPNE7	dist=3551;dist=5388	NaN	NaN	rs60724534	NaN	0.20008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr16	89649635	89649635	G	A	intronic	CPNE7	NaN	NaN	NaN	rs440729	NaN	0.6875	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	89649675	89649675	G	A	intronic	CPNE7	NaN	NaN	NaN	rs455868	NaN	0.681709	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	89651679	89651679	T	T	intronic	CPNE7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	19	18	0	0
chr16	89671781	89671781	C	C	intergenic	CPNE7,DPEP1	dist=8127;dist=7935	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr16	89703260	89703260	T	G	intronic	DPEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	51	10.421669	nearby_gap_events	REJECT	38	31	7	0
chr16	89711759	89711759	C	A	UTR3	CHMP1A	NM_002768:c.*715G>T,NM_001083314:c.*563G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	89718186	89718186	C	A	intronic	CHMP1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	8972370	8972370	G	T	intergenic	CARHSP1,USP7	dist=9501;dist=13581	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	89758377	89758377	G	C	intronic	CDK10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr16	89760492	89760492	C	G	intronic	CDK10	NaN	NaN	NaN	rs465507	NaN	0.151957	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr16	89761376	89761376	T	T	exonic	CDK10	NaN	synonymous SNV	CDK10:NM_001098533:exon11:c.T617T:p.L206L,CDK10:NM_001160367:exon11:c.T617T:p.L206L,CDK10:NM_052987:exon11:c.T617T:p.L206L,CDK10:NM_052988:exon11:c.T830T:p.L277L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr16	89764551	89764551	A	G	exonic	SPATA2L	NaN	nonsynonymous SNV	SPATA2L:NM_152339:exon3:c.T466C:p.F156L	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.996	D	0.971	D	0.000	D	1.000	D	1.5	L	.	.	-0.541	T	0.287	T	0.819	3.229	16.82	4.72	1.752	2.607	11.728	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.032741	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	236	229	7	0
chr16	89764754	89764754	A	A	intronic	SPATA2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr16	89775895	89775895	A	A	intronic	VPS9D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	89776433	89776433	T	C	intronic	VPS9D1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.123477	nearby_gap_events	REJECT	190	181	9	0
chr16	89778831	89778831	T	T	ncRNA_intronic	VPS9D1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr16	89778958	89778958	A	C	ncRNA_intronic	VPS9D1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.09886	nearby_gap_events	REJECT	31	24	7	0
chr16	89789956	89789956	C	C	exonic	ZNF276	NaN	synonymous SNV	ZNF276:NM_001113525:exon4:c.C845C:p.A282A,ZNF276:NM_152287:exon4:c.C620C:p.A207A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	43	40	0	0
chr16	89805177	89805177	G	A	UTR3	ZNF276	NM_152287:c.*523G>A,NM_001113525:c.*523G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.657004	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	398	380	18	0
chr16	89825172	89825172	A	C	intronic	FANCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	12	4	8	0
chr16	89828346	89828346	T	T	intronic	FANCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	27	26	0	0
chr16	89831178	89831178	G	A	intronic	FANCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.064036	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	77	66	11	0
chr16	89831179	89831179	A	G	intronic	FANCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.729628	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	74	64	10	0
chr16	89831203	89831203	A	G	intronic	FANCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.79323	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	65	58	7	0
chr16	89849168	89849168	T	T	intronic	FANCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	8987989	8987989	G	A	intronic	USP7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	89882372	89882372	T	C	exonic	FANCA	NaN	synonymous SNV	FANCA:NM_000135:exon2:c.A102G:p.K34K,FANCA:NM_001018112:exon2:c.A102G:p.K34K,FANCA:NM_001286167:exon2:c.A102G:p.K34K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.493668	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	82	67	15	0
chr16	89900158	89900158	G	T	intronic	SPIRE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr16	89915698	89915698	A	C	intronic	SPIRE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	16	3	13	0
chr16	89916698	89916698	C	G	intronic	SPIRE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.3333333333333329	NA	0	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr16	89924750	89924750	T	T	exonic	SPIRE2	NaN	synonymous SNV	SPIRE2:NM_032451:exon8:c.T1107T:p.F369F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	50	42	0	0
chr16	89925401	89925401	T	T	intronic	SPIRE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	89925809	89925809	A	A	intronic	SPIRE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	89930330	89930330	A	C	intronic	SPIRE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	19	4	15	0
chr16	89936399	89936399	G	A	intronic	SPIRE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.19999999999999943	Somatic	189.463	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr16	89936400	89936400	A	G	intronic	SPIRE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	26	7	19	0
chr16	89958474	89958474	C	A	intronic	TCF25	NaN	NaN	NaN	rs76683657	NaN	0.00878594	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	64	36	27	0
chr16	89958719	89958719	T	C	intronic	TCF25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	286.521	25	NaN	NA	NA	10	1	9	35
chr16	89961604	89961604	A	G	intronic	TCF25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	8	4	0
chr16	89971180	89971180	T	C	intronic	TCF25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	17	8.366594	nearby_gap_events	REJECT	18	13	5	0
chr16	89971267	89971267	C	A	intronic	TCF25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	17	13	4	0
chr16	89971268	89971268	A	A	intronic	TCF25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	24	19	0	0
chr16	89973761	89973761	A	C	intronic	TCF25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.52627	0	NaN	NA	NA	11	9	2	2
chr16	89973797	89973797	G	C	intronic	TCF25	NaN	NaN	NaN	rs28716697	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5546	0	NaN	NA	NA	6	4	2	10
chr16	89977442	89977442	T	T	intronic	TCF25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	89977491	89977491	G	A	exonic	TCF25	NaN	nonsynonymous SNV	TCF25:NM_014972:exon18:c.G1876A:p.E626K	NaN	NaN	NaN	0.15	T	0.944	P	0.587	P	0.001	N	0.965	N	1.04	L	.	.	-0.999	T	0.105	T	0.434	1.487	10.92	5.03	2.497	4.211	10.894	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.55807	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	121	112	9	0
chr16	89977492	89977492	A	G	exonic	TCF25	NaN	nonsynonymous SNV	TCF25:NM_014972:exon18:c.A1877G:p.E626G	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.057	B	0.025	B	0.001	N	1.000	D	1.04	L	.	.	-0.974	T	0.132	T	0.16	1.785	11.93	3.94	0.874	2.547	9.659	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.183923	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	122	113	9	0
chr16	89986144	89986144	C	T	exonic	MC1R	NaN	nonsynonymous SNV	MC1R:NM_002386:exon1:c.C478T:p.R160W	rs1805008	NaN	0.0145767	.	.	0.861	P	0.44	B	0.047	U	0.993	A	3.5	M	1.01	T	-0.622	T	0.016	T	0.877	2.337	13.77	0.042	0.077	0.818	13.982	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	104.225879	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	1	36	8
chr16	9000480	9000480	C	T	intronic	USP7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.206465	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	246	233	13	0
chr16	9000565	9000565	A	A	intronic	USP7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr16	90016157	90016157	A	A	intronic	DEF8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	90021600	90021600	G	T	exonic	DEF8	NaN	nonsynonymous SNV	DEF8:NM_001242819:exon3:c.G148T:p.G50W,DEF8:NM_001242821:exon3:c.G148T:p.G50W,DEF8:NM_001242816:exon4:c.G148T:p.G50W,DEF8:NM_001242818:exon4:c.G148T:p.G50W,DEF8:NM_001242822:exon4:c.G148T:p.G50W,DEF8:NM_017702:exon4:c.G148T:p.G50W,DEF8:NM_207514:exon4:c.G331T:p.G111W,DEF8:NM_001242820:exon5:c.G148T:p.G50W	NaN	NaN	NaN	0	D	0.13	B	0.036	B	0.387	N	0.684	N	1.935	M	0.84	T	-0.937	T	0.130	T	0.322	0.578	7.122	3.65	2.293	4.097	9.691	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.165694	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	67	57	10	0
chr16	90023901	90023901	C	T	intronic	DEF8	NaN	NaN	NaN	rs12596872	NaN	0.215855	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	254.868	0	NaN	NA	NA	60	12	48	19
chr16	90075426	90075426	A	A	intronic	DBNDD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr16	90075432	90075432	C	C	intronic	DBNDD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr16	90075638	90075638	T	T	intronic	DBNDD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	90094169	90094169	G	A	intronic	GAS8	NaN	NaN	NaN	rs3743828	NaN	0.235024	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	50	32	18	18
chr16	90095484	90095484	C	T	ncRNA_exonic	GAS8-AS1	NaN	NaN	NaN	rs3785184	NaN	0.234824	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	50.8632	0	NaN	NA	NA	125	59	66	11
chr16	90099060	90099060	GC	CG,GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	386.832	0	NaN	NA	NA	108	37	4	5
chr16	9010446	9010446	A	C	intronic	USP7	NaN	NaN	NaN	rs199666597	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.158095	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	422	395	27	0
chr16	90109817	90109817	A	T	ncRNA_exonic	URAHP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	9017035	9017035	A	T	intronic	USP7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	68	6	54	0
chr16	9017053	9017053	T	C	intronic	USP7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	73	16	57	0
chr16	9017055	9017055	A	T	intronic	USP7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	73	15	57	0
chr16	9017061	9017061	T	A,TACAACGATGTGGGGGTTTGTAGTTGCATCATTTAA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	76.7146	0	NaN	NA	NA	11	0	7	5
chr16	9017282	9017282	A	C	intronic	USP7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	104.853	23	48.743144	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	52	28	24	33
chr16	904889	904889	A	A	intronic	LMF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr16	9185945	9185945	A	G	exonic	C16orf72	NaN	nonsynonymous SNV	C16orf72:NM_014117:exon1:c.A44G:p.H15R	NaN	NaN	NaN	0.62	T	0.96	D	0.923	D	0.000	U	1.000	D	1.67	L	0.85	T	-0.896	T	0.179	T	0.399	3.559	18.15	1.91	0.183	5.635	8.985	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	16	12.810117	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	9	4	5	0
chr16	9185946	9185946	C	A	exonic	C16orf72	NaN	nonsynonymous SNV	C16orf72:NM_014117:exon1:c.C45A:p.H15Q	NaN	NaN	NaN	0.45	T	0.984	D	0.969	D	0.000	N	1.000	D	1.67	L	0.85	T	-0.813	T	0.218	T	0.361	3.748	19.03	3.06	1.384	3.530	14.010	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	12	4	5	0
chr16	9196866	9196866	T	T	exonic	C16orf72	NaN	synonymous SNV	C16orf72:NM_014117:exon3:c.T333T:p.S111S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	107	82	0	0
chr16	920167	920167	G	A	intronic	LMF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.545658	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	27	23	4	0
chr16	9206359	9206359	G	G	intronic	C16orf72	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	920739	920739	C	G	exonic	LMF1	NaN	nonsynonymous SNV	LMF1:NM_022773:exon8:c.G1222C:p.A408P	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.955	P	0.862	P	0.000	D	1.000	D	3.515	H	1.75	T	-0.512	T	0.205	T	0.966	3.354	17.30	4.31	1.238	4.616	12.864	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.557977	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	116	107	9	0
chr16	921396	921396	C	CG,CGCG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.56353	0	NaN	NA	NA	27	21	4	0
chr16	922084	922084	G	T	intronic	LMF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr16	922798	922798	C	T	intronic	LMF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	9228627	9228627	C	T	intergenic	C16orf72,MIR548X	dist=15072;dist=100147	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	929789	929789	GC	CG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	28.1602	16	NaN	NA	NA	11	6	5	4
chr16	929790	929790	C	G	intronic	LMF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr16	9325299	9325299	G	A	intergenic	C16orf72,MIR548X	dist=111744;dist=3475	NaN	NaN	rs2965883	NaN	0.451278	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	937758	937758	G	T	intronic	LMF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	19	6	13	0
chr16	937762	937762	G	C	intronic	LMF1	NaN	NaN	NaN	rs28503555	NaN	0.145966	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	12	6	4	0
chr16	943107	943107	A	G	intronic	LMF1	NaN	NaN	NaN	rs4984705	NaN	0.445288	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	62	NaN	NA	NA	64	51	12	23
chr16	9653331	9653331	G	C	intergenic	LINC01195,GRIN2A	dist=103969;dist=193931	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr16	9862556	9862556	G	T	intronic	GRIN2A	NaN	NaN	NaN	rs11866328	NaN	0.314097	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	153.515649	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	51	0	51	36
chr16	9923553	9923553	A	T	intronic	GRIN2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.1793	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	173	156	17	0
chr16	9923554	9923554	T	G	intronic	GRIN2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.724911	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	186	169	17	0
chr16	9923555	9923555	G	A	intronic	GRIN2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.722206	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	184	167	17	0
chr16	9943895	9943895	A	A	intronic	GRIN2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr16	9984768	9984768	A	A	intronic	GRIN2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	1004023	1004023	A	T	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr17	1004024	1004024	A	C	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr17	1004025	1004025	A	G	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	10209869	10209869	C	T	exonic	MYH13	NaN	synonymous SNV	MYH13:NM_003802:exon37:c.G5373A:p.E1791E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.001348023988942748	Somatic	88.5596	0	NaN	NA	NA	222	167	55	15
chr17	10215214	10215214	T	T	intronic	MYH13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr17	10219374	10219374	A	A	intronic	MYH13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	10231449	10231449	A	A	intronic	MYH13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	10233750	10233750	T	T	exonic	MYH13	NaN	synonymous SNV	MYH13:NM_003802:exon21:c.A2389A:p.R797R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	71	50	0	0
chr17	10254078	10254078	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	5	0	2,3	0
chr17	10254079	10254079	A	C	intronic	MYH13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	1027650	1027650	G	C	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	10297658	10297658	A	G	exonic	MYH8	NaN	nonsynonymous SNV	MYH8:NM_002472:exon35:c.T5074C:p.W1692R	rs8069834	NaN	0.485423	1	T	0.0	B	0.0	B	0.002	N	1.000	P	-3.88	N	-0.82	T	-0.892	T	0.000	T	0.076	-0.455	1.894	1.84	0.017	0.948	8.832	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	149	NaN	NA	NA	207	174	33	48
chr17	10316097	10316097	A	A	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	10317035	10317035	T	T	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr17	10317534	10317534	T	C	exonic	MYH8	NaN	nonsynonymous SNV	MYH8:NM_002472:exon11:c.A983G:p.D328G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.001	U	1.000	D	4.04	H	-3.32	D	1.091	D	0.931	D	0.955	4.214	21.9	5.01	2.116	7.825	14.885	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.382163	possible_contamination	REJECT	180	174	6	0
chr17	10317831	10317831	A	G	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	rs4791406	NaN	0.525759	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	114.053	0	NaN	NA	NA	402	86	316	16
chr17	10317842	10317842	A	G	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	rs4791407	NaN	0.525759	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	91.3936	0	NaN	NA	NA	424	95	329	12
chr17	10318324	10318324	A	C	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	10318325	10318325	G	T	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	10350388	10350388	T	C	exonic	MYH4	NaN	nonsynonymous SNV	MYH4:NM_017533:exon35:c.A5111G:p.K1704R	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.221	B	0.219	B	0.170	N	0.844	N	1.14	L	-1.28	T	-0.721	T	0.330	T	0.054	2.735	15.11	1.77	0.116	2.711	8.186	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	167	135	32	0
chr17	10351379	10351379	G	T	exonic	MYH4	NaN	nonsynonymous SNV	MYH4:NM_017533:exon34:c.C4721A:p.S1574Y	NaN	NaN	NaN	0	D	0.703	P	0.701	P	0.002	U	0.991	D	2.34	M	-1.31	T	0.282	D	0.608	D	0.482	3.393	17.45	5.52	2.747	3.026	15.300	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.963076	nearby_gap_events	REJECT	102	87	15	0
chr17	10351380	10351380	A	G	exonic	MYH4	NaN	nonsynonymous SNV	MYH4:NM_017533:exon34:c.T4720C:p.S1574P	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.539	P	0.529	P	0.002	U	0.975	D	2.69	M	-1.31	T	0.259	D	0.582	D	0.652	2.845	15.48	5.52	2.217	0.785	11.433	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.952101	nearby_gap_events	REJECT	104	92	12	0
chr17	10351381	10351381	T	A	exonic	MYH4	NaN	nonsynonymous SNV	MYH4:NM_017533:exon34:c.A4719T:p.K1573N	NaN	NaN	NaN	0	D	0.988	D	0.952	D	0.001	U	0.998	D	2.95	M	-1.45	T	0.154	D	0.633	D	0.271	3.658	18.60	1.72	0.483	0.066	6.321	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.38207	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	97	85	12	0
chr17	10351528	10351528	A	T	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	10354058	10354058	T	C	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.954667	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	153	148	5	0
chr17	10355162	10355162	A	G	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	10355763	10355763	T	C	exonic	MYH4	NaN	nonsynonymous SNV	MYH4:NM_017533:exon26:c.A3318G:p.I1106M	rs917361	NaN	0.533946	0.22	T	0.0	B	0.003	B	0.000	N	1.000	P	-0.425	N	-1.67	D	-0.964	T	0.000	T	0.037	0.572	7.093	4.63	0.854	-0.314	4.116	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	92.488083	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	6	32	44
chr17	10356844	10356844	A	G	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.9314	0	NaN	NA	NA	18	14	4	2
chr17	10359804	10359804	T	T	exonic	MYH4	NaN	synonymous SNV	MYH4:NM_017533:exon17:c.A1966A:p.R656R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	110	100	0	0
chr17	10362746	10362746	A	G	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	rs2058099	NaN	0.532947	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	73	NaN	NA	NA	167	27	140	48
chr17	10397635	10397635	T	G	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	30	19	11	0
chr17	10397636	10397636	C	A	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	30	18	11	0
chr17	10398375	10398375	C	T	exonic	MYH1	NaN	nonsynonymous SNV	MYH1:NM_005963:exon37:c.G5339A:p.S1780N	NaN	NaN	NaN	0.14	T	0.34	B	0.417	B	0.000	U	1.000	D	2.835	M	-1.16	T	0.106	D	0.584	D	0.226	5.032	29.7	5.26	2.616	7.772	19.228	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.530546	nearby_gap_events	REJECT	66	61	5	0
chr17	10399229	10399229	T	T	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	10399520	10399520	C	A	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	rs186198269	NaN	0.00259585	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	228	177	51	4
chr17	10404118	10404118	A	G	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	rs72816758	NaN	0.11901	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	102.245684	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	49	11	38	16
chr17	10406478	10406478	TC	CA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	16.2071	0	NaN	NA	NA	6	3	2	0
chr17	10417475	10417475	C	A	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	10417480	10417480	A	G	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	10426570	10426570	A	G	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.861897	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	45	42	3	0
chr17	10430278	10430278	T	C	exonic	MYH2	NaN	nonsynonymous SNV	MYH2:NM_001100112:exon29:c.A3967G:p.R1323G,MYH2:NM_017534:exon29:c.A3967G:p.R1323G	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.177	B	0.513	P	0.001	U	1.000	D	3.085	M	-1.61	D	0.377	D	0.692	D	0.791	3.000	16.00	4.93	2.052	3.386	11.973	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.303578	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	280	273	7	0
chr17	10431010	10431010	T	T	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	10450744	10450744	T	A	ncRNA_intronic	MYHAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	5	3	0
chr17	10532884	10532884	G	A	intronic	MYH3	NaN	NaN	NaN	rs12940161	NaN	0.514177	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	927.974	94	NaN	NA	NA	119	7	112	39
chr17	10541515	10541515	C	T	exonic	MYH3	NaN	nonsynonymous SNV	MYH3:NM_002470:exon27:c.G3574A:p.A1192T	rs2285477	NaN	0.586462	0.68	T	0.014	B	0.02	B	.	.	1.000	P	0.76	N	-1.1	T	-0.969	T	0.000	T	0.031	1.676	11.56	-2.15	-0.722	-0.429	7.826	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3448.74	0	NaN	NA	NA	305	2	303	45
chr17	10543150	10543150	A	A	intronic	MYH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	67	49	0	0
chr17	10545432	10545432	C	A,CAGTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1141.49	0	NaN	NA	NA	136	2	6	27
chr17	10546130	10546130	T	G	intronic	MYH3	NaN	NaN	NaN	rs2285468	NaN	0.525958	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	194	0	194	55
chr17	10549021	10549021	T	C	intronic	MYH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.152129	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	354	346	8	0
chr17	10550436	10550436	T	C	intronic	MYH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr17	10558084	10558084	T	T	intronic	MYH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	10628422	10628422	T	C	exonic	TMEM220	NaN	nonsynonymous SNV	TMEM220:NM_001004313:exon4:c.A193G:p.I65V	rs148509041	NaN	0.00299521	0.1	T	0.002	B	0.006	B	0.468	N	1.000	N	1.79	L	.	.	-0.993	T	0.065	T	0.117	0.018	4.105	-5.72	-0.629	0.211	4.604	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	321	251	70	4
chr17	10629429	10629429	C	A	intronic	TMEM220	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr17	10629431	10629431	G	T	intronic	TMEM220	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	9	3	3	0
chr17	10629432	10629432	T	A	intronic	TMEM220	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	9	3	4	0
chr17	10629436	10629436	A	C	intronic	TMEM220	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr17	10632430	10632430	C	T	intronic	TMEM220	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr17	10632432	10632432	T	C	intronic	TMEM220	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr17	1065963	1065963	C	A	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	1065965	1065965	C	A	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	11037654	11037654	G	G	intergenic	PIRT,SHISA6	dist=296236;dist=107086	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	11037656	11037656	A	A	intergenic	PIRT,SHISA6	dist=296238;dist=107084	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr17	11398109	11398109	C	C	intronic	SHISA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	11459150	11459150	C	A	exonic	SHISA6	NaN	nonsynonymous SNV	SHISA6:NM_001173461:exon3:c.C893A:p.P298Q,SHISA6:NM_001173462:exon4:c.C989A:p.P330Q,SHISA6:NM_207386:exon5:c.C1046A:p.P349Q	NaN	NaN	NaN	0.2	T	1.0	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	1.935	M	.	.	-0.338	T	0.396	T	0.827	4.660	25.6	4.88	2.256	7.487	16.605	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.298759	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	404	378	26	0
chr17	11459233	11459233	G	T	intronic	SHISA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.878086	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	261	247	14	0
chr17	11502215	11502215	G	C	exonic	DNAH9	NaN	nonsynonymous SNV	DNAH9:NM_001372:exon1:c.G400C:p.A134P	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.012	B	0.022	B	0.085	U	1.000	D	1.935	M	1.74	T	-1.090	T	0.068	T	0.703	1.232	9.994	4.75	2.184	2.746	11.758	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.892564	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	42	35	7	0
chr17	11515142	11515142	A	A	intronic	DNAH9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	11543520	11543520	T	C	intronic	DNAH9	NaN	NaN	NaN	rs11653848	NaN	0.32508	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	315.433	0	NaN	NA	NA	68	40	28	29
chr17	11622776	11622776	T	G	exonic	DNAH9	NaN	nonsynonymous SNV	DNAH9:NM_001372:exon27:c.T5678G:p.V1893G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.992	D	0.000	D	1.000	D	4.395	H	2.48	T	-0.314	T	0.197	T	0.957	4.575	24.8	5.19	1.970	7.845	15.047	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.316156	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	112	106	6	0
chr17	11671741	11671741	T	G	intronic	DNAH9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	11671742	11671742	T	G	intronic	DNAH9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	2	0
chr17	1167415	1167415	T	A	intergenic	ABR,BHLHA9	dist=76799;dist=6443	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	11809169	11809169	A	A	intronic	DNAH9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	11830	11830	A	G	intronic	DOC2B	NaN	NaN	NaN	rs62054999	NaN	0.823283	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	64	10	54	55
chr17	11840827	11840827	A	G	exonic	DNAH9	NaN	synonymous SNV	DNAH9:NM_004662:exon12:c.A1584G:p.T528T,DNAH9:NM_001372:exon66:c.A12648G:p.T4216T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.068125	nearby_gap_events	REJECT	239	226	13	0
chr17	11845592	11845592	T	T	intronic	DNAH9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	11865585	11865585	A	A	intronic	DNAH9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr17	11895783	11895783	C	T	exonic	ZNF18	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF18:NM_001303281:exon2:c.G364A:p.D122N,ZNF18:NM_001303282:exon2:c.G364A:p.D122N,ZNF18:NM_144680:exon4:c.G364A:p.D122N	rs148878294	NaN	0.000199681	0.04	D	0.982	D	0.864	P	0.030	N	0.953	N	2.215	M	3.66	T	-1.120	T	0.036	T	0.03	2.040	12.78	4.42	1.273	2.240	10.009	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.59003	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	96	85	11	0
chr17	12569407	12569407	T	T	UTR5	MYOCD	NM_153604:c.-99T>T,NM_001146312:c.-99T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr17	12659655	12659655	A	A	intronic	MYOCD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	12663884	12663884	T	C	ncRNA_exonic	LOC100128006	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	16	8	6	0
chr17	12812374	12812374	G	C	intronic	ARHGAP44	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	12832190	12832190	T	T	intronic	ARHGAP44	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	12852069	12852069	C	A	intronic	ARHGAP44	NaN	NaN	NaN	rs7501977	NaN	0.695687	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	12855514	12855514	A	C	intronic	ARHGAP44	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	12856413	12856413	G	G	intronic	ARHGAP44	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	12856414	12856414	A	A	intronic	ARHGAP44	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	12896098	12896098	G	C	UTR3	ELAC2	NM_018127:c.*37C>G,NM_173717:c.*37C>G,NM_001165962:c.*37C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	12905786	12905786	A	G	exonic	ELAC2	NaN	nonsynonymous SNV	ELAC2:NM_001165962:exon12:c.T1070C:p.F357S,ELAC2:NM_018127:exon13:c.T1190C:p.F397S,ELAC2:NM_173717:exon13:c.T1190C:p.F397S	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	3.045	M	-1.86	D	0.839	D	0.819	D	0.991	2.151	13.15	5.67	2.169	8.376	13.869	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.49254	0	NaN	NA	NA	141	124	17	0
chr17	12916412	12916412	T	A	intronic	ELAC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr17	131462	131462	C	G	intronic	RPH3AL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.745404	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	1	3	0
chr17	131515	131515	TC	TA,T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	128.537	0	NaN	NA	NA	18	0	12	1
chr17	131523	131523	A	C	intronic	RPH3AL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.705665	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	18	11	7	0
chr17	13504445	13504445	A	A	exonic	HS3ST3A1	NaN	synonymous SNV	HS3ST3A1:NM_006042:exon1:c.T2T:p.M1M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	1359363	1359363	T	G	exonic	CRK	NaN	synonymous SNV	CRK:NM_005206:exon1:c.A49C:p.R17R,CRK:NM_016823:exon1:c.A49C:p.R17R	rs2229075	NaN	0.727835	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	169.403	0	NaN	NA	NA	17	0	17	40
chr17	1370720	1370720	C	T	intronic	MYO1C	NaN	NaN	NaN	rs2302457	NaN	0.328674	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.319275	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	0	15	22
chr17	1371586	1371586	G	C	exonic	MYO1C	NaN	nonsynonymous SNV	MYO1C:NM_001080779:exon27:c.C2721G:p.S907R,MYO1C:NM_001080950:exon27:c.C2664G:p.S888R,MYO1C:NM_033375:exon27:c.C2616G:p.S872R	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.581	P	0.287	B	0.000	D	0.981	N	0.49	N	1.28	T	-1.063	T	0.052	T	0.617	1.094	9.464	1.41	0.308	1.034	8.222	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	329.437	0	NaN	NA	NA	43	22	21	0
chr17	1373586	1373586	G	C	exonic	MYO1C	NaN	synonymous SNV	MYO1C:NM_001080779:exon24:c.C2409G:p.P803P,MYO1C:NM_001080950:exon24:c.C2352G:p.P784P,MYO1C:NM_033375:exon24:c.C2304G:p.P768P	NaN	NaN	NaN	0.04	D	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.510	T	0.247	T	.	0.178	4.960	-6.87	-1.178	-2.247	10.111	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	16.3295	0	16.847194	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	53	43	10	11
chr17	1373612	1373612	C	T	exonic	MYO1C	NaN	nonsynonymous SNV	MYO1C:NM_001080779:exon24:c.G2383A:p.V795I,MYO1C:NM_001080950:exon24:c.G2326A:p.V776I,MYO1C:NM_033375:exon24:c.G2278A:p.V760I	rs8081370	NaN	0.820887	0.71	T	0.001	B	0.001	B	0.000	N	1.000	P	-2.625	N	-2.19	D	-0.938	T	0.000	T	0.08	-0.354	2.330	4.89	0.898	4.556	7.502	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	458.674	0	NaN	NA	NA	43	0	43	57
chr17	1382933	1382933	T	C	exonic	MYO1C	NaN	nonsynonymous SNV	MYO1C:NM_001080779:exon8:c.A973G:p.S325G,MYO1C:NM_001080950:exon8:c.A916G:p.S306G,MYO1C:NM_033375:exon8:c.A868G:p.S290G	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.002	B	0.000	D	0.636	D	-1.765	N	-0.5	T	-0.909	T	0.069	T	0.101	0.650	7.488	6.01	2.306	3.242	7.155	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.701164	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	14	9	5	0
chr17	1387472	1387472	C	T	exonic	MYO1C	NaN	synonymous SNV	MYO1C:NM_001080779:exon2:c.G201A:p.L67L,MYO1C:NM_001080950:exon2:c.G144A:p.L48L,MYO1C:NM_033375:exon2:c.G96A:p.L32L	rs11538156	NaN	0.0662939	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	107	NaN	NA	NA	175	145	30	20
chr17	1387628	1387628	G	A	intronic	MYO1C	NaN	NaN	NaN	rs72818298	NaN	0.00658946	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	74	NaN	NA	NA	242	193	49	5
chr17	1395682	1395682	C	T	intronic	MYO1C	NaN	NaN	NaN	rs12941864	NaN	0.493411	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	164	125	39	33
chr17	14063201	14063201	A	G	exonic	COX10	NaN	nonsynonymous SNV	COX10:NM_001303:exon5:c.A632G:p.E211G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	N	1.000	D	3.875	H	-3.04	D	1.072	D	0.915	D	0.978	1.894	12.29	4.97	2.170	7.309	15.029	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.060002	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	21	18	3	0
chr17	14095309	14095309	A	G	exonic	COX10	NaN	synonymous SNV	COX10:NM_001303:exon6:c.A699G:p.P233P	rs2230354	NaN	0.548323	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	5826.18	0	NaN	NA	NA	544	0	544	51
chr17	14109934	14109934	T	T	intronic	COX10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	1411569	1411569	A	G	intronic	INPP5K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	18	7	11	0
chr17	1419853	1419853	C	A	UTR5	INPP5K	NM_016532:c.-60G>T,NM_130766:c.-3074G>T,NM_001135642:c.-3074G>T	NaN	NaN	rs3815465	NaN	0.162141	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	74.9771	39	21.780215	normal_lod	REJECT	8	0	8	3
chr17	14204113	14204113	G	T	upstream	HS3ST3B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr17	14204115	14204115	T	C	upstream	HS3ST3B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr17	14205051	14205051	C	T	exonic	HS3ST3B1	NaN	synonymous SNV	HS3ST3B1:NM_006041:exon1:c.C216T:p.H72H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	32	11.118202	normal_lod	REJECT	5	1	4	0
chr17	14205508	14205508	A	A	intronic	HS3ST3B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	37	32	0	0
chr17	14205512	14205512	A	A	intronic	HS3ST3B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	35	25	0	0
chr17	14221383	14221383	G	A	intronic	HS3ST3B1	NaN	NaN	NaN	rs1005322	NaN	0.375399	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	14450882	14450882	A	A	intergenic	HS3ST3B1,CDRT7	dist=198161;dist=483410	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	14450883	14450883	C	C	intergenic	HS3ST3B1,CDRT7	dist=198162;dist=483409	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	1451515	1451515	T	T	intronic	PITPNA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	1479741	1479741	A	G	intronic	SLC43A2	NaN	NaN	NaN	rs6502794	NaN	0.46226	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	37	31	6	48
chr17	1479818	1479818	G	G	intronic	SLC43A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	19	19	0	0
chr17	1480088	1480088	G	A	intronic	SLC43A2	NaN	NaN	NaN	rs7222193	NaN	0.375599	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	129	21	108	32
chr17	14861237	14861237	A	G	intergenic	HS3ST3B1,CDRT7	dist=608516;dist=73055	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	1486813	1486813	A	A	intronic	SLC43A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr17	1493911	1493911	T	T	intronic	SLC43A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	1510361	1510361	T	T	intronic	SLC43A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	1510362	1510362	A	A	intronic	SLC43A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	1519662	1519662	G	A	intronic	SLC43A2	NaN	NaN	NaN	rs8065481	NaN	0.548522	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	145	117	28	54
chr17	15207364	15207364	T	G	exonic	TEKT3	NaN	synonymous SNV	TEKT3:NM_031898:exon9:c.A1362C:p.T454T	rs13961	NaN	0.786741	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	474.708986	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	149	0	149	52
chr17	15308318	15308318	T	G	intergenic	TEKT3,CDRT4	dist=63360;dist=31014	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	15308319	15308319	G	C	intergenic	TEKT3,CDRT4	dist=63361;dist=31013	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr17	1531132	1531132	A	G	exonic	SLC43A2	NaN	nonsynonymous SNV	SLC43A2:NM_001284498:exon2:c.T37C:p.W13R,SLC43A2:NM_152346:exon2:c.T37C:p.W13R	NaN	NaN	NaN	0.19	T	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.77	M	0.42	T	-0.312	T	0.367	T	0.966	4.971	29.0	4.95	2.073	9.006	14.748	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.19782608695652215	Somatic	8.02736	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr17	1538628	1538628	C	G	exonic	SCARF1	NaN	nonsynonymous SNV	SCARF1:NM_003693:exon11:c.G1917C:p.E639D	rs3744644	NaN	0.903754	0.56	T	0.925	P	0.616	P	0.001	D	1.000	P	1.725	L	1.13	T	-0.907	T	0.000	T	0.1	0.796	8.191	3.2	0.576	-0.283	7.906	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.231856	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	0	13	55
chr17	1538960	1538960	A	A	intronic	SCARF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr17	15406410	15406410	A	A	exonic	TVP23C	NaN	synonymous SNV	TVP23C:NM_145301:exon6:c.T599T:p.V200V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr17	15406411	15406411	C	T	exonic	TVP23C	NaN	nonsynonymous SNV	TVP23C:NM_145301:exon6:c.G598A:p.V200I	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.0	B	0.001	B	0.187	N	0.976	N	-0.11	N	1.92	T	-1.023	T	0.024	T	0.113	-0.158	3.230	-1.11	-0.186	-0.037	5.914	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr17	15406413	15406413	T	G	exonic	TVP23C	NaN	nonsynonymous SNV	TVP23C:NM_145301:exon6:c.A596C:p.Q199P	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.99	D	0.954	D	0.360	N	1.000	N	0.805	L	1.88	T	-1.079	T	0.078	T	0.677	1.116	9.552	1.81	0.513	0.298	6.065	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	15406418	15406418	A	C	exonic	TVP23C	NaN	nonsynonymous SNV	TVP23C:NM_145301:exon6:c.T591G:p.F197L	NaN	NaN	NaN	1	T	0.002	B	0.001	B	0.663	N	1.000	N	1.72	L	2.03	T	-0.943	T	0.032	T	0.159	1.531	11.07	-0.891	-0.287	-0.039	2.287	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	1542266	1542266	A	A	intronic	SCARF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	1543721	1543721	T	T	intronic	SCARF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	1548616	1548616	A	C	intronic	SCARF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	1549694	1549694	C	C	UTR3	RILP	NM_031430:c.*42G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	1549699	1549699	T	T	UTR3	RILP	NM_031430:c.*37A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	1549700	1549700	T	T	UTR3	RILP	NM_031430:c.*36A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	1550945	1550945	C	T	intronic	RILP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.23529411764705904	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr17	155198	155198	G	T	intronic	RPH3AL	NaN	NaN	NaN	rs6565709	NaN	0.973842	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr17	1554244	1554244	C	T	exonic	PRPF8	NaN	nonsynonymous SNV	PRPF8:NM_006445:exon43:c.G6860A:p.R2287Q	NaN	NaN	NaN	0.52	T	0.005	B	0.004	B	0.000	D	1.000	D	1.04	L	-3.35	D	0.008	D	0.639	D	0.819	1.225	9.968	4.91	1.517	7.568	14.193	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.432484	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	130	125	5	0
chr17	1557320	1557320	T	T	intronic	PRPF8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	15611627	15611627	A	A	intronic	ZNF286A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	15640809	15640809	T	C	exonic	TBC1D26	NaN	nonsynonymous SNV	TBC1D26:NM_178571:exon5:c.T170C:p.L57P	NaN	NaN	NaN	0.14	T	1.0	D	0.994	D	0.023	U	0.999	D	2.435	M	1.08	T	-0.852	T	0.192	T	0.464	1.891	12.28	0.888	0.632	1.367	3.996	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.003112712317834163	NA	0	0	NaN	NA	NA	157	125	32	0
chr17	1577983	1577983	A	G	intronic	PRPF8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	1585661	1585661	A	A	intronic	PRPF8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	15903602	15903602	C	A	UTR5	TTC19	NM_001271420:c.-1636C>A	NaN	NaN	rs758853	NaN	0.313698	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.426514	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	26
chr17	15928508	15928508	G	G	intronic	TTC19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	15928509	15928509	G	G	intronic	TTC19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	15928510	15928510	G	G	intronic	TTC19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr17	15929816	15929816	G	G	intronic	TTC19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	91	79	0	0
chr17	15930860	15930860	A	C	UTR3	TTC19	NM_017775:c.*24A>C,NM_001271420:c.*24A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	15968071	15968071	G	A	intronic	NCOR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.605783	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	147	136	11	0
chr17	15968673	15968673	G	A	intronic	NCOR1	NaN	NaN	NaN	rs2285582	NaN	0.510383	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	49.0421	0	NaN	NA	NA	76	1	75	12
chr17	15969016	15969016	A	A	intronic	NCOR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr17	15984093	15984093	C	C	intronic	NCOR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr17	15989801	15989801	A	A	intronic	NCOR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	16012270	16012270	A	G	intronic	NCOR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.998086	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	393	361	32	0
chr17	16046845	16046845	A	T	intronic	NCOR1	NaN	NaN	NaN	rs2285579	NaN	0.509984	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	217.741141	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	80	3	77	43
chr17	16047179	16047179	TTAA	T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	478.069	0	NaN	NA	NA	52	0	49	36
chr17	16090090	16090090	A	C	intronic	NCOR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr17	1611545	1611545	A	C	intronic	TLCD2	NaN	NaN	NaN	rs4790810	NaN	0.885783	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	112	NaN	NA	NA	142	0	142	58
chr17	16216960	16216960	G	G	intronic	PIGL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	56	42	0	0
chr17	16229232	16229232	A	G	UTR3	PIGL	NM_004278:c.*20A>G	NaN	NaN	rs15739	ID=COSN165346;OCCURENCE=1(breast)	0.267372	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	138.196726	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	0	48	42
chr17	16285102	16285102	A	T	intronic	UBB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	21	13	6	0
chr17	16285106	16285106	T	C	intronic	UBB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	27	17	6	0
chr17	16285893	16285893	C	T	exonic	UBB	NaN	synonymous SNV	UBB:NM_001281716:exon2:c.C672T:p.R224R,UBB:NM_001281717:exon2:c.C672T:p.R224R,UBB:NM_001281718:exon2:c.C672T:p.R224R,UBB:NM_001281719:exon2:c.C672T:p.R224R,UBB:NM_001281720:exon2:c.C672T:p.R224R,UBB:NM_018955:exon2:c.C672T:p.R224R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	20.5762	0	NaN	NA	NA	190	160	30	43
chr17	1630395	1630395	T	C	exonic	WDR81	NaN	synonymous SNV	WDR81:NM_001163809:exon1:c.T2142C:p.G714G	rs59643265	NaN	0.267173	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.0497	0	NaN	NA	NA	13	10	3	18
chr17	1630584	1630584	A	G	exonic	WDR81	NaN	synonymous SNV	WDR81:NM_001163809:exon1:c.A2331G:p.L777L	rs7221974	NaN	0.298522	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	186	147	39	22
chr17	1630992	1630992	G	A	exonic	WDR81	NaN	synonymous SNV	WDR81:NM_001163809:exon1:c.G2739A:p.L913L	rs9912287	NaN	0.246006	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	100	NaN	NA	NA	151	22	129	27
chr17	16330025	16330025	C	T	intronic	TRPV2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.98553	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	125	111	14	0
chr17	16335074	16335074	G	G	intronic	TRPV2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	72	NaN	NA	NA	100	71	0	0
chr17	16335195	16335195	C	T	intronic	TRPV2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.816427	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	157	140	17	0
chr17	16336992	16336992	C	G	exonic	TRPV2	NaN	synonymous SNV	TRPV2:NM_016113:exon13:c.C2094G:p.P698P	rs14039	ID=COSM148202;OCCURENCE=1(stomach)	0.288139	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	37.600696	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	75	52	23	41
chr17	16336994	16336994	A	A	exonic	TRPV2	NaN	synonymous SNV	TRPV2:NM_016113:exon13:c.A2096A:p.D699D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	33	30	0	0
chr17	16347544	16347544	A	A	ncRNA_intronic	LRRC75A-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	6	0	0
chr17	16354301	16354301	G	A	ncRNA_intronic	LRRC75A-AS1	NaN	NaN	NaN	rs12601710	NaN	0.324481	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	1635614	1635614	T	C	intronic	WDR81	NaN	NaN	NaN	rs62090048	NaN	0.245407	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.946914	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	73	52	21	25
chr17	1636934	1636934	A	G	exonic	WDR81	NaN	nonsynonymous SNV	WDR81:NM_001163673:exon7:c.A994G:p.M332V,WDR81:NM_001163809:exon7:c.A4603G:p.M1535V,WDR81:NM_001163811:exon7:c.A922G:p.M308V,WDR81:NM_152348:exon8:c.A1450G:p.M484V	rs3809870	NaN	0.278954	0.6	T	0.0	B	0.0	B	0.257	N	1.000	P	0.345	N	-1.07	T	-1.022	T	0.000	T	0.136	-3.187	0.001	-1.04	-0.539	-0.684	9.665	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	132	NaN	NA	NA	124	108	16	23
chr17	1637074	1637074	A	G	exonic	WDR81	NaN	synonymous SNV	WDR81:NM_001163673:exon7:c.A1134G:p.P378P,WDR81:NM_001163809:exon7:c.A4743G:p.P1581P,WDR81:NM_001163811:exon7:c.A1062G:p.P354P,WDR81:NM_152348:exon8:c.A1590G:p.P530P	rs3809871	ID=COSM1479285,COSM436111,COSM436112;OCCURENCE=1(breast)	0.539537	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	41	9.840628	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	34	6	36
chr17	1637302	1637302	A	G	exonic	WDR81	NaN	synonymous SNV	WDR81:NM_001163673:exon7:c.A1362G:p.L454L,WDR81:NM_001163809:exon7:c.A4971G:p.L1657L,WDR81:NM_001163811:exon7:c.A1290G:p.L430L,WDR81:NM_152348:exon8:c.A1818G:p.L606L	rs3809872	NaN	0.76238	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	76.846168	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	0	26	49
chr17	1639211	1639211	T	G	intronic	WDR81	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	0	8	0
chr17	1640640	1640640	C	G	intronic	WDR81	NaN	NaN	NaN	rs62090051	NaN	0.244808	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	108.198596	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	58	13	45	27
chr17	1640793	1640793	C	T	exonic	WDR81	NaN	synonymous SNV	WDR81:NM_001163673:exon10:c.C2031T:p.S677S,WDR81:NM_001163809:exon10:c.C5640T:p.S1880S,WDR81:NM_001163811:exon10:c.C1959T:p.S653S,WDR81:NM_152348:exon11:c.C2487T:p.S829S	rs8077638	ID=COSM436117,COSM1381116,COSM436118;OCCURENCE=1(breast),1(large_intestine)	0.241613	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	121	18	103	27
chr17	1648502	1648502	C	T	exonic	SERPINF2	NaN	nonsynonymous SNV	SERPINF2:NM_000934:exon3:c.C97T:p.R33W,SERPINF2:NM_001165920:exon3:c.C97T:p.R33W,SERPINF2:NM_001165921:exon3:c.C97T:p.R33W	rs2070863	NaN	0.239018	0.07	T	0.97	D	0.375	B	0.190	N	1.000	P	0.895	L	-1.72	D	-0.991	T	0.001	T	0.459	1.602	11.31	2.96	0.235	0.793	10.652	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	62	15	47	19
chr17	1650855	1650855	A	A	intronic	SERPINF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr17	16526171	16526171	A	G	exonic	ZNF624	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF624:NM_020787:exon6:c.T2029C:p.F677L	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.998	D	.	.	0.807	D	3.05	M	0.88	T	-0.232	T	0.288	T	0.737	3.488	17.84	3.16	1.683	6.582	10.043	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.320263	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	72	68	4	0
chr17	16537318	16537318	A	C	intronic	ZNF624	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	26	14	4	0
chr17	16537765	16537765	A	C	intronic	ZNF624	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	16537766	16537766	A	C	intronic	ZNF624	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	1654048	1654048	A	G	intronic	SERPINF2	NaN	NaN	NaN	rs4790821	NaN	0.252396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	16550507	16550507	A	G	intronic	ZNF624	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr17	16550508	16550508	T	C	intronic	ZNF624	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	2	0	1	0
chr17	1656215	1656215	G	A	intronic	SERPINF2	NaN	NaN	NaN	rs736060	NaN	0.234026	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	46	32	14	24
chr17	16638089	16638089	T	C	exonic	CCDC144A	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC144A:NM_014695:exon12:c.T2504C:p.I835T	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.975	D	0.92	D	.	.	1.000	N	1.665	L	2.05	T	-0.996	T	0.109	T	0.114	0.639	7.434	0.886	0.055	2.318	6.194	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	19.1505	0	NaN	NA	NA	12	8	4	1
chr17	16638125	16638125	A	G	exonic	CCDC144A	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC144A:NM_014695:exon12:c.A2540G:p.K847R	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.562	P	0.315	B	.	.	1.000	N	0.995	L	2.39	T	-1.032	T	0.063	T	0.141	0.819	8.299	2.08	0.952	0.414	3.858	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.4402	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr17	1680852	1680852	A	A	UTR3	SERPINF1	NM_002615:c.*112A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr17	16837758	16837758	G	A	intergenic	KRT16P2,TNFRSF13B	dist=101611;dist=4640	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	1690304	1690304	A	T	intronic	SMYD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	39	8.637152	nearby_gap_events	REJECT	23	17	6	0
chr17	16951654	16951654	G	G	intronic	MPRIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	17007749	17007749	T	C	intronic	MPRIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	9	1	8	0
chr17	1704325	1704325	A	C	intronic	SMYD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.488618	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	145	125	20	3
chr17	17045826	17045826	G	A	intronic	MPRIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.46134	0	NaN	NA	NA	13	11	2	0
chr17	17062415	17062415	T	C	intronic	MPRIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.366122	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	516	501	15	0
chr17	17078806	17078806	A	A	intronic	MPRIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	17083787	17083787	C	A	intronic	MPRIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	17087795	17087795	A	G	intronic	MPRIP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	17091475	17091475	T	G	UTR3	MPRIP	NM_201274:c.*3369T>G,NM_015134:c.*3267T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr17	17091476	17091476	C	A	UTR3	MPRIP	NM_201274:c.*3370C>A,NM_015134:c.*3268C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr17	17122327	17122327	G	A	intronic	FLCN	NaN	NaN	NaN	rs8065832	NaN	0.502995	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	132.382774	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	112	51	61	37
chr17	17129705	17129705	C	A	intronic	FLCN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.149908	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	277	261	16	0
chr17	17163574	17163574	G	A	intronic	COPS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.933952	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	178	167	11	0
chr17	17168222	17168222	T	C	exonic	COPS3	NaN	nonsynonymous SNV	COPS3:NM_001199125:exon6:c.A455G:p.E152G,COPS3:NM_003653:exon6:c.A515G:p.E172G	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.893	P	0.256	B	0.000	D	1.000	D	2.36	M	-0.07	T	-0.613	T	0.238	T	0.691	4.834	27.5	5.76	2.195	7.946	15.255	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.832031	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	155	150	5	0
chr17	17184399	17184399	A	C	intronic	COPS3	NaN	NaN	NaN	rs2012954	NaN	0.749201	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.555295	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	51	28	23	50
chr17	17210007	17210007	A	G	intronic	NT5M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	5	4	0
chr17	17210009	17210009	C	G	intronic	NT5M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	17210010	17210010	C	G	intronic	NT5M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	2	4	0
chr17	17210013	17210013	G	A	intronic	NT5M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	1733399	1733399	A	G	exonic	RPA1	NaN	synonymous SNV	RPA1:NM_002945:exon1:c.A12G:p.Q4Q	rs5030749	NaN	0.544129	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	66.8187	0	NaN	NA	NA	13	4	9	36
chr17	17394801	17394801	A	C	exonic	MED9	NaN	nonsynonymous SNV	MED9:NM_018019:exon2:c.A433C:p.K145Q	NaN	NaN	NaN	0	D	0.875	P	0.357	B	0.000	D	1.000	D	1.67	L	.	.	-0.900	T	0.141	T	0.459	4.295	22.5	3.64	0.855	8.825	9.153	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	25.6363	0	NaN	NA	NA	27	19	7	0
chr17	17399008	17399008	G	C	intronic	RASD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	22	15	7	0
chr17	17399009	17399009	C	G	intronic	RASD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.14403567447045695	NA	0	0	NaN	NA	NA	19	14	5	0
chr17	17409560	17409560	C	T	exonic	PEMT	NaN	nonsynonymous SNV	PEMT:NM_001267551:exon6:c.G568A:p.V190M,PEMT:NM_007169:exon6:c.G523A:p.V175M,PEMT:NM_148172:exon6:c.G634A:p.V212M,PEMT:NM_148173:exon6:c.G523A:p.V175M,PEMT:NM_001267552:exon7:c.G665A:p.S222N	rs7946	ID=COSM1128813;OCCURENCE=1(prostate)	0.424521	0.11	T	0.955	P	0.578	P	0.050	N	1.000	P	2.045	M	0.85	T	-0.971	T	0.000	T	0.195	-1.025	0.226	2.16	0.380	-0.047	5.481	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	74.497896	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	0	29	45
chr17	17416071	17416071	A	A	intronic	PEMT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	17425536	17425536	T	C	intronic	PEMT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	7	1	5	0
chr17	17425651	17425651	A	G	exonic	PEMT	NaN	nonsynonymous SNV	PEMT:NM_001267551:exon3:c.T197C:p.L66P,PEMT:NM_001267552:exon3:c.T263C:p.L88P,PEMT:NM_007169:exon3:c.T152C:p.L51P,PEMT:NM_148172:exon3:c.T263C:p.L88P,PEMT:NM_148173:exon3:c.T152C:p.L51P	NaN	NaN	NaN	0.2	T	0.988	D	0.735	P	0.415	N	0.997	D	2.25	M	2.45	T	-0.987	T	0.091	T	0.764	3.056	16.20	0.485	0.606	1.509	5.346	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	3.5470464567422376E-12	NA	0	0	106.998173	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	282	214	68	0
chr17	17425652	17425652	G	A	exonic	PEMT	NaN	synonymous SNV	PEMT:NM_001267551:exon3:c.C196T:p.L66L,PEMT:NM_001267552:exon3:c.C262T:p.L88L,PEMT:NM_007169:exon3:c.C151T:p.L51L,PEMT:NM_148172:exon3:c.C262T:p.L88L,PEMT:NM_148173:exon3:c.C151T:p.L51L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	2.813888248888794E-13	NA	0	0	99.396558	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	283	221	62	0
chr17	17431994	17431994	G	G	intronic	PEMT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr17	17431996	17431996	C	C	intronic	PEMT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr17	17480217	17480217	T	T	intronic	PEMT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	17495033	17495033	G	A	upstream	PEMT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.393347	normal_lod	REJECT	10	7	3	0
chr17	1756351	1756351	A	G	intronic	RPA1	NaN	NaN	NaN	rs2287321	NaN	0.45028	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	147	119	28	34
chr17	17566735	17566735	A	G	intergenic	PEMT,RAI1	dist=71718;dist=18052	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	17624349	17624349	G	C	intronic	RAI1	NaN	NaN	NaN	rs77904527	NaN	0.180511	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	17696531	17696531	G	C	exonic	RAI1	NaN	nonsynonymous SNV	RAI1:NM_030665:exon3:c.G269C:p.G90A	rs3803763	ID=COSM1381228;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.666933	0.26	T	0.0	B	0.0	B	0.444	N	1.000	P	-1.1	N	2.58	T	-1.029	T	0.000	T	0.201	-2.187	0.005	1.06	0.029	-0.280	3.332	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	13.771	0	NaN	NA	NA	11	8	3	30
chr17	17696672	17696672	G	A	exonic	RAI1	NaN	nonsynonymous SNV	RAI1:NM_030665:exon3:c.G410A:p.G137E	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.682	P	0.205	B	0.029	N	1.000	N	1.735	L	2.42	T	-0.894	T	0.189	T	0.703	0.694	7.706	0.982	-0.042	4.751	8.151	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.235583	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	94	89	5	0
chr17	17700727	17700727	G	A	exonic	RAI1	NaN	nonsynonymous SNV	RAI1:NM_030665:exon3:c.G4465A:p.E1489K	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.799	P	0.162	B	0.011	N	0.875	D	0.805	L	0.39	T	-0.794	T	0.153	T	0.387	3.004	16.02	5.55	2.621	4.165	15.032	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.406925	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	39	33	6	0
chr17	17707105	17707105	T	C	exonic	RAI1	NaN	synonymous SNV	RAI1:NM_030665:exon4:c.T5601C:p.I1867I	rs3818717	NaN	0.240615	0.17	T	.	.	.	.	0.011	N	0.000	P	.	.	.	.	-0.999	T	0.000	T	.	1.451	10.79	-6.98	-1.125	-1.200	6.628	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	215.035154	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	157	71	86	48
chr17	17716619	17716619	T	T	intronic	SREBF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr17	17717878	17717878	T	G	intronic	SREBF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	25	23	2	0
chr17	17718197	17718197	C	G	exonic	SREBF1	NaN	nonsynonymous SNV	SREBF1:NM_004176:exon14:c.G2554C:p.A852P,SREBF1:NM_001005291:exon15:c.G2644C:p.A882P	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.951	P	0.742	P	0.006	N	1.000	N	1.74	L	2.26	T	-1.012	T	0.114	T	0.441	-0.028	3.872	2.37	0.288	-0.748	7.565	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	15	11	4	0
chr17	17718616	17718616	A	C	exonic	SREBF1	NaN	nonsynonymous SNV	SREBF1:NM_004176:exon13:c.T2411G:p.L804R,SREBF1:NM_001005291:exon14:c.T2501G:p.L834R	NaN	NaN	NaN	0.37	T	0.999	D	0.966	D	0.003	N	1.000	D	1.87	L	2.17	T	-1.060	T	0.099	T	0.897	2.132	13.09	5.69	2.162	2.398	9.441	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.361698	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	113	100	13	0
chr17	17718655	17718655	A	C	intronic	SREBF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.21101	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	110	100	10	0
chr17	17721365	17721365	G	C	intronic	SREBF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	17722902	17722902	T	G	exonic	SREBF1	NaN	nonsynonymous SNV	SREBF1:NM_004176:exon3:c.A661C:p.T221P,SREBF1:NM_001005291:exon4:c.A751C:p.T251P	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.779	P	0.346	B	0.640	N	1.000	N	1.445	L	0.41	T	-0.750	T	0.353	T	0.256	1.304	10.27	0.46	-0.139	0.499	4.345	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.65581	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	88	80	8	0
chr17	17726810	17726810	G	T	intronic	SREBF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	30	10	20	22
chr17	17739890	17739890	T	T	intronic	SREBF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	17754287	17754287	G	A	intronic	TOM1L2	NaN	NaN	NaN	rs371214368	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	57.3356	0	31.377418	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	20	14	0
chr17	17762830	17762830	C	C	intronic	TOM1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	17786227	17786227	C	T	intronic	TOM1L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr17	17794444	17794444	T	C	intronic	TOM1L2	NaN	NaN	NaN	rs4925125	NaN	0.402157	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	1782425	1782425	G	A	intronic	RPA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.823905	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	201	171	30	0
chr17	1784030	1784030	T	G	intronic	RPA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	17881034	17881034	T	C	exonic	LRRC48	NaN	nonsynonymous SNV	LRRC48:NM_001130092:exon3:c.T122C:p.L41P,LRRC48:NM_031294:exon3:c.T122C:p.L41P,LRRC48:NM_001130090:exon4:c.T122C:p.L41P,LRRC48:NM_001130091:exon4:c.T122C:p.L41P	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.589	P	0.251	B	0.490	N	1.000	D	0.95	L	0.92	T	-1.050	T	0.079	T	0.56	2.487	14.28	2.96	2.018	2.661	4.033	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.507491	strand_artifact	REJECT	49	45	4	0
chr17	17891458	17891458	G	G	intronic	LRRC48	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	17898304	17898304	T	T	intronic	LRRC48	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	9	5	0	0
chr17	17898313	17898313	A	ACGT	exonic	LRRC48	NaN	nonframeshift substitution	LRRC48:NM_001130092:exon8:c.712_712delinsACGT,LRRC48:NM_031294:exon8:c.712_712delinsACGT,LRRC48:NM_001130090:exon9:c.712_712delinsACGT,LRRC48:NM_001130091:exon9:c.712_712delinsACGT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.90572	0	NaN	NA	NA	14	12	2	0
chr17	17898315	17898315	TG	GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.83679	0	NaN	NA	NA	14	12	2	0
chr17	17919848	17919848	T	G	intronic	LRRC48	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	1	0
chr17	17921820	17921820	G	C	UTR3	ATPAF2	NM_145691:c.*43C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	17921821	17921821	G	A	UTR3	ATPAF2	NM_145691:c.*42C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	17921822	17921822	C	A	UTR3	ATPAF2	NM_145691:c.*41G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	18001773	18001773	A	A	intronic	DRG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	37	31	0	0
chr17	18004034	18004034	A	A	intronic	DRG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	18008775	18008775	C	A	intronic	DRG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr17	18022723	18022723	G	T	exonic	MYO15A	NaN	synonymous SNV	MYO15A:NM_016239:exon2:c.G609T:p.L203L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.789904	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	228	204	24	0
chr17	18023897	18023897	G	A	exonic	MYO15A	NaN	nonsynonymous SNV	MYO15A:NM_016239:exon2:c.G1783A:p.A595T	rs2955365	NaN	0.553514	0.05	D	0.689	P	0.186	B	.	.	0.000	P	0.695	N	-2.47	D	-0.899	T	0.000	T	0.101	1.891	12.28	3.58	2.122	1.488	12.164	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.132372	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	2	5	20
chr17	18030508	18030508	A	A	intronic	MYO15A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	18044518	18044518	A	A	intronic	MYO15A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	15	12	0	0
chr17	18053695	18053695	T	T	intronic	MYO15A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	18054917	18054917	T	C	intronic	MYO15A	NaN	NaN	NaN	rs865923	NaN	0.424121	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	87.741706	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	99	62	37	44
chr17	18054919	18054919	G	A	intronic	MYO15A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.395825	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	100	97	3	0
chr17	18058521	18058521	C	T	exonic	MYO15A	NaN	synonymous SNV	MYO15A:NM_016239:exon45:c.C8322T:p.S2774S	rs712272	NaN	0.215256	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.471899	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	13	12	28
chr17	18063096	18063096	A	A	intronic	MYO15A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	18066475	18066475	T	T	intronic	MYO15A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	18075463	18075463	C	T	intronic	MYO15A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	5.363710461921217E-5	NA	0	0	32.087842	nearby_gap_events	REJECT	55	32	23	0
chr17	18075464	18075464	T	C	intronic	MYO15A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.911409	nearby_gap_events	REJECT	55	32	23	0
chr17	18098206	18098206	T	C	intronic	ALKBH5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	26	6	19	0
chr17	18136103	18136103	T	C	exonic	LLGL1	NaN	nonsynonymous SNV	LLGL1:NM_004140:exon4:c.T379C:p.F127L	NaN	NaN	NaN	0.75	T	0.009	B	0.009	B	0.000	D	0.998	D	0.895	L	3.58	T	-0.978	T	0.012	T	0.375	2.976	15.92	5.33	2.168	4.638	15.294	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	25	16	9	0
chr17	18139896	18139896	G	T	intronic	LLGL1	NaN	NaN	NaN	rs2746028	NaN	0.467452	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	27.5845	0	NaN	NA	NA	133	71	62	29
chr17	18140360	18140360	A	A	intronic	LLGL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	18144621	18144621	C	G	intronic	LLGL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.573079	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	83	61	22	0
chr17	18145598	18145598	G	A	intronic	LLGL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.471433	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	164	158	6	0
chr17	18145943	18145943	G	T	splicing	LLGL1	NM_004140:exon21:c.3116+1G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.439	23.6	4.66	2.584	8.592	16.829	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	37	33	4	0
chr17	18145944	18145944	T	G	splicing	LLGL1	NM_004140:exon21:c.3116+2T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.269	22.3	4.66	2.089	5.258	13.491	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	30	26	4	0
chr17	18149854	18149854	A	G	intronic	FLII	NaN	NaN	NaN	rs2856289	NaN	0.726038	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	10.5005	0	7.456445	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	4	3	33
chr17	18150287	18150287	C	T	exonic	FLII	NaN	nonsynonymous SNV	FLII:NM_001256265:exon21:c.G2591A:p.R864Q,FLII:NM_001256264:exon22:c.G2723A:p.R908Q,FLII:NM_002018:exon22:c.G2756A:p.R919Q	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.999	D	0.986	D	0.000	D	1.000	D	2.54	M	2.25	T	-0.958	T	0.141	T	0.787	3.330	17.21	5.54	2.598	7.148	19.466	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.418059	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	180	174	6	0
chr17	18150356	18150356	A	G	exonic	FLII	NaN	nonsynonymous SNV	FLII:NM_001256265:exon21:c.T2522C:p.L841P,FLII:NM_001256264:exon22:c.T2654C:p.L885P,FLII:NM_002018:exon22:c.T2687C:p.L896P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.98	D	0.000	D	1.000	D	2.565	M	0.92	T	-0.336	T	0.321	T	0.789	3.011	16.04	5.54	2.099	6.617	15.661	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.17500000000000135	NA	0	0	4.898469	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	6	4	2	0
chr17	18152214	18152214	A	C	intronic	FLII	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	18154841	18154841	C	T	intronic	FLII	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	150	139	11	0
chr17	18157910	18157910	G	A	exonic	FLII	NaN	nonsynonymous SNV	FLII:NM_001256264:exon6:c.C467T:p.P156L,FLII:NM_002018:exon6:c.C500T:p.P167L	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	N	1.000	D	3.215	M	1.33	T	-0.309	T	0.288	T	0.626	2.985	15.95	4.55	1.322	9.674	14.204	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.111443	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	95	90	5	0
chr17	18158056	18158056	G	T	intronic	FLII	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	33	28	5	0
chr17	18158057	18158057	C	G	intronic	FLII	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr17	18166852	18166852	A	C	intronic	MIEF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr17	18166856	18166856	C	A	intronic	MIEF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr17	18166857	18166857	G	A	intronic	MIEF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr17	18181126	18181126	C	G	exonic	TOP3A	NaN	nonsynonymous SNV	TOP3A:NM_004618:exon18:c.G2690C:p.C897S	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	4.115	H	-1.28	T	0.890	D	0.812	D	0.854	1.459	10.82	5.55	2.621	7.505	19.500	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.15775335775335766	NA	0	0	9.754889	nearby_gap_events	REJECT	45	38	7	0
chr17	18206154	18206154	A	A	intronic	TOP3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	18232201	18232201	T	C	exonic	SHMT1	NaN	nonsynonymous SNV	SHMT1:NM_001281786:exon11:c.A901G:p.T301A,SHMT1:NM_148918:exon11:c.A1198G:p.T400A,SHMT1:NM_004169:exon12:c.A1315G:p.T439A	NaN	NaN	NaN	0.88	T	0.0	B	0.002	B	0.648	N	1.000	N	-0.315	N	1.63	T	-1.028	T	0.023	T	0.047	-1.059	0.185	-10.7	-2.912	-1.469	10.234	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.841786	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	315	309	6	0
chr17	18239023	18239023	G	A	intronic	SHMT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.470277	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	109	99	10	0
chr17	18243345	18243345	T	C	intronic	SHMT1	NaN	NaN	NaN	rs200010833	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	65	NaN	NA	NA	28	10	18	0
chr17	18251580	18251580	T	C	intronic	SHMT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-0.886	T	0.100	T	.	-0.528	1.594	-5.36	-1.251	-0.410	7.473	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr17	18281280	18281280	C	G	UTR5	EVPLL	NM_001145127:c.-2972C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	18284983	18284983	G	A	exonic	EVPLL	NaN	nonsynonymous SNV	EVPLL:NM_001145127:exon4:c.G285A:p.M95I	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.003	B	0.001	B	.	.	1.000	N	0.345	N	2.34	T	-0.963	T	0.021	T	0.257	0.013	4.082	.	0.432	-0.253	6.516	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.876362	possible_contamination	REJECT	53	49	4	0
chr17	18541868	18541868	A	G	intronic	TBC1D28	NaN	NaN	NaN	rs55807264	NaN	0.709864	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	161.524	0	NaN	NA	NA	16	0	16	12
chr17	18542074	18542074	G	A	intronic	TBC1D28	NaN	NaN	NaN	rs9908833	NaN	0.709265	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	323.093	0	NaN	NA	NA	32	1	31	34
chr17	1859515	1859515	C	G	intronic	RTN4RL1	NaN	NaN	NaN	rs10438728	NaN	0.340655	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	18630995	18630995	G	A	exonic	TRIM16L	NaN	nonsynonymous SNV	TRIM16L:NM_001037330:exon2:c.G125A:p.R42K	rs8075739	NaN	0.326478	0.18	T	0.257	B	0.065	B	0.001	U	0.946	P	0.805	L	-0.24	T	-0.948	T	0.000	T	0.393	0.306	5.659	2.26	1.813	2.912	4.610	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	320	159	161	35
chr17	18673147	18673147	T	C	intronic	FBXW10	NaN	NaN	NaN	rs9674947	NaN	0.40615	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	259.368	0	NaN	NA	NA	27	0	27	24
chr17	18700843	18700843	C	A	intronic	TVP23B	NaN	NaN	NaN	rs9908423	NaN	0.294529	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	52.3517	0	NaN	NA	NA	262	121	141	21
chr17	18793267	18793267	T	C	intronic	PRPSAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	18793268	18793268	T	A	intronic	PRPSAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	18793269	18793269	T	C	intronic	PRPSAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	18793270	18793270	G	A	intronic	PRPSAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	18793271	18793271	A	G	intronic	PRPSAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	18793274	18793274	T	G	intronic	PRPSAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	18862149	18862149	T	A	intronic	SLC5A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	18862151	18862151	T	G	intronic	SLC5A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	18862990	18862990	T	G	intronic	SLC5A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03689421402504743	NA	0	0	NaN	NA	NA	357	257	100	0
chr17	18862991	18862991	G	T	intronic	SLC5A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	322	239	83	0
chr17	18863844	18863844	C	A	intronic	SLC5A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.011448699692773642	NA	0	0	NaN	NA	NA	59	44	15	0
chr17	18870123	18870123	A	C	intronic	SLC5A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr17	18871773	18871773	G	A	intronic	SLC5A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	18871783	18871783	G	C	intronic	SLC5A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	18871785	18871785	T	C	intronic	SLC5A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	18873062	18873062	A	C	intronic	SLC5A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	18873063	18873063	A	T	intronic	SLC5A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	18874689	18874689	C	C	exonic	FAM83G	NaN	synonymous SNV	FAM83G:NM_001039999:exon6:c.G2455G:p.D819D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	130	115	0	0
chr17	1887561	1887561	A	G	intronic	RTN4RL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr17	18881021	18881021	T	T	exonic	FAM83G	NaN	synonymous SNV	FAM83G:NM_001039999:exon5:c.A1958A:p.H653H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	74	NaN	NA	NA	162	131	0	0
chr17	18881859	18881859	G	A	exonic	FAM83G	NaN	synonymous SNV	FAM83G:NM_001039999:exon5:c.C1120T:p.L374L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.300625	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	132	122	10	0
chr17	18894723	18894723	C	A	intronic	FAM83G,SLC5A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	18906753	18906753	T	T	intronic	FAM83G,SLC5A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	18907390	18907390	G	C	UTR5	FAM83G	NM_001039999:c.-36C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	39	21	18	0
chr17	18918258	18918258	C	G	intronic	SLC5A10	NaN	NaN	NaN	rs28526726	NaN	0.410942	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	65.961911	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	0	26	53
chr17	19186880	19186880	A	C	exonic	EPN2	NaN	nonsynonymous SNV	EPN2:NM_014964:exon3:c.A448C:p.T150P,EPN2:NM_148921:exon3:c.A448C:p.T150P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.975	D	0.871	P	0.000	D	1.000	D	2.435	M	2.43	T	-0.732	T	0.194	T	0.937	3.968	20.3	3.92	0.812	9.225	12.075	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.06219165085388815	NA	0	0	NaN	NA	NA	23	17	6	0
chr17	19213335	19213335	C	G	intronic	EPN2	NaN	NaN	NaN	rs2296981	NaN	0.364018	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.208105	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	24	19	56
chr17	19232887	19232887	C	T	exonic	EPN2	NaN	synonymous SNV	EPN2:NM_001102664:exon6:c.C483T:p.L161L,EPN2:NM_148921:exon8:c.C1167T:p.L389L,EPN2:NM_014964:exon9:c.C1338T:p.L446L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.429169	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	432	426	6	0
chr17	19240915	19240915	T	T	UTR3	B9D1	NM_001243475:c.*102A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	19288085	19288085	A	A	intronic	MFAP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	19313555	19313555	C	A	upstream	RNF112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	19317015	19317015	T	C	intronic	RNF112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.508478	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	502	490	12	0
chr17	19319559	19319559	G	A	UTR3	RNF112	NM_007148:c.*71G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.887968	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	136	126	10	0
chr17	1939160	1939160	T	T	intronic	DPH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr17	1939587	1939587	A	A	intronic	DPH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	1943725	1943725	A	G	intronic	DPH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	18	9	9	0
chr17	1943888	1943888	T	C	exonic	DPH1	NaN	synonymous SNV	DPH1:NM_001383:exon9:c.T1011C:p.P337P	rs2236375	NaN	0.816693	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	189.214341	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	0	66	45
chr17	19451269	19451269	T	T	intronic	SLC47A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	19454924	19454924	A	C	intronic	SLC47A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	15	4	11	0
chr17	1945783	1945783	T	G	intronic	DPH1,OVCA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	19458680	19458680	A	A	intronic	SLC47A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr17	19458798	19458798	T	T	intronic	SLC47A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	1946503	1946503	C	G	UTR3	DPH1,OVCA2	NM_001383:c.*623C>G;NM_080822:c.*105C>G	NaN	NaN	rs1051322	NaN	0.105831	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	315	250	65	15
chr17	19480594	19480594	A	G	intronic	SLC47A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.331659	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	238	217	21	0
chr17	19552476	19552476	C	T	intronic	ALDH3A2	NaN	NaN	NaN	rs4646793	NaN	0.335264	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	680.276	0	NaN	NA	NA	266	123	143	18
chr17	19561011	19561011	GACTGAATT	G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	50.6256	0	NaN	NA	NA	61	46	18	16
chr17	19566639	19566639	T	C	intronic	ALDH3A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.087331	nearby_gap_events	REJECT	172	162	10	0
chr17	19575280	19575280	A	A	intronic	ALDH3A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr17	1958078	1958078	G	T	upstream	HIC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	19584697	19584697	T	C	exonic	SLC47A2	NaN	nonsynonymous SNV	SLC47A2:NM_001099646:exon15:c.A1375G:p.K459E,SLC47A2:NM_152908:exon15:c.A1483G:p.K495E,SLC47A2:NM_001256663:exon16:c.A1417G:p.K473E	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.254	B	0.139	B	0.006	N	0.590	N	0.64	N	1.59	T	-1.037	T	0.044	T	0.159	1.040	9.247	3.0	0.936	1.652	7.176	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.636673	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	86	72	14	0
chr17	1960211	1960211	G	A	exonic	HIC1	NaN	nonsynonymous SNV	HIC1:NM_001098202:exon2:c.G284A:p.R95H,HIC1:NM_006497:exon2:c.G227A:p.R76H	NaN	NaN	NaN	0.03	D	1.0	D	0.999	D	.	.	1.000	D	2.035	M	-0.33	T	-0.036	T	0.457	T	0.552	4.241	22.1	4.27	2.212	7.542	16.471	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.464402	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	118	110	8	0
chr17	19606067	19606067	C	C	intronic	SLC47A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	36	34	0	0
chr17	19611651	19611651	T	G	exonic	SLC47A2	NaN	nonsynonymous SNV	SLC47A2:NM_001099646:exon7:c.A593C:p.N198T,SLC47A2:NM_001256663:exon7:c.A593C:p.N198T,SLC47A2:NM_152908:exon7:c.A701C:p.N234T	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.998	D	0.969	D	0.000	D	1.000	D	1.36	L	1.42	T	-0.777	T	0.188	T	0.611	3.002	16.01	5.07	1.911	3.861	12.773	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.605262	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	44	40	4	0
chr17	19611652	19611652	T	A	exonic	SLC47A2	NaN	nonsynonymous SNV	SLC47A2:NM_001099646:exon7:c.A592T:p.N198Y,SLC47A2:NM_001256663:exon7:c.A592T:p.N198Y,SLC47A2:NM_152908:exon7:c.A700T:p.N234Y	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.988	D	0.000	D	1.000	D	2.165	M	1.37	T	-0.715	T	0.223	T	0.759	2.215	13.36	4.12	0.825	6.577	9.108	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.314576	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	44	40	4	0
chr17	1961423	1961423	G	A	exonic	HIC1	NaN	nonsynonymous SNV	HIC1:NM_001098202:exon2:c.G1496A:p.G499D,HIC1:NM_006497:exon2:c.G1439A:p.G480D	NaN	NaN	NaN	0.44	T	0.997	D	0.916	D	.	.	1.000	D	0	N	3.1	T	-0.917	T	0.025	T	0.374	2.459	14.18	3.84	2.156	1.954	13.621	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.424208	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	43	40	3	0
chr17	19642552	19642552	C	C	intronic	ALDH3A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	19646773	19646773	C	A	exonic	ALDH3A1	NaN	stopgain	ALDH3A1:NM_001135168:exon2:c.G166T:p.E56X,ALDH3A1:NM_000691:exon3:c.G166T:p.E56X,ALDH3A1:NM_001135167:exon3:c.G166T:p.E56X	NaN	NaN	NaN	0.88	T	.	.	.	.	.	.	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.516	14.37	3.84	2.232	0.539	12.544	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.421328		KEEP	116	108	8	0
chr17	19646895	19646895	G	G	intronic	ALDH3A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	99	81	0	0
chr17	19647261	19647261	G	T	intronic	ALDH3A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	19647266	19647266	A	G	intronic	ALDH3A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	19647267	19647267	G	A	intronic	ALDH3A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	19648364	19648364	T	T	exonic	ALDH3A1	NaN	synonymous SNV	ALDH3A1:NM_001135168:exon1:c.A79A:p.I27I,ALDH3A1:NM_000691:exon2:c.A79A:p.I27I,ALDH3A1:NM_001135167:exon2:c.A79A:p.I27I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	19677187	19677187	G	T	UTR3	ULK2	NM_014683:c.*2475C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	19698910	19698910	T	A	intronic	ULK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	34	1	33	0
chr17	19699358	19699358	T	C	intronic	ULK2	NaN	NaN	NaN	rs192511	NaN	0.752596	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	145.765329	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	1	49	57
chr17	19705267	19705267	T	C	intronic	ULK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.144839	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	527	519	8	0
chr17	19729495	19729495	T	C	exonic	ULK2	NaN	synonymous SNV	ULK2:NM_001142610:exon11:c.A792G:p.A264A,ULK2:NM_014683:exon11:c.A792G:p.A264A	rs157397	NaN	0.794129	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	54.504145	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	0	19	51
chr17	19744866	19744866	A	T	intronic	ULK2	NaN	NaN	NaN	rs79813170	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.470013	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	76	69	7	0
chr17	19744952	19744952	A	A	intronic	ULK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr17	19746553	19746553	T	A	intronic	ULK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.596369	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	344	326	18	0
chr17	19813338	19813338	A	A	intronic	AKAP10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	19843273	19843273	A	G	intronic	AKAP10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.275123	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	202	190	12	0
chr17	1985055	1985055	T	G	intronic	SMG6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr17	20059342	20059342	A	C	UTR5	SPECC1	NM_001033555:c.-168A>C,NM_001243438:c.-168A>C,NM_001033554:c.-168A>C	NaN	NaN	rs62066869	NaN	0.151158	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	16.2344	0	NaN	NA	NA	6	3	3	12
chr17	20217218	20217218	T	T	intronic	SPECC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	20217440	20217440	A	C	UTR3	SPECC1	NM_001243439:c.*62A>C,NM_001033553:c.*62A>C,NM_001033555:c.*62A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	20354836	20354836	A	G	exonic	LGALS9B	NaN	synonymous SNV	LGALS9B:NM_001042685:exon10:c.T879C:p.S293S	rs1725649	NaN	0.212061	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	48.0307	0	NaN	NA	NA	270	175	95	12
chr17	20768691	20768691	C	T	UTR3	CCDC144NL	NM_001004306:c.*37G>A	NaN	NaN	rs75640454	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.9344	0	NaN	NA	NA	168	95	73	0
chr17	20768730	20768730	A	G	exonic	CCDC144NL	NaN	stoploss	CCDC144NL:NM_001004306:exon4:c.T664C:p.X222Q	rs4605228	NaN	0.0101837	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	-0.766	0.770	.	-1.871	-1.896	.	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.1011	0	NaN	NA	NA	160	91	69	0
chr17	20768744	20768744	G	T	exonic	CCDC144NL	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC144NL:NM_001004306:exon4:c.C650A:p.S217Y	rs2318592	NaN	NaN	0	D	0.002	B	0.0	B	.	.	1.000	P	0	N	2.21	T	-0.990	T	0.016	T	0.217	-2.492	0.003	.	-1.915	-1.875	.	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.63485	0	NaN	NA	NA	182	107	75	0
chr17	20768757	20768757	T	C	exonic	CCDC144NL	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC144NL:NM_001004306:exon4:c.A637G:p.K213E	rs62066975	NaN	NaN	0	D	0.002	B	0.001	B	.	.	1.000	N	0	N	2.25	T	-0.993	T	0.016	T	0.147	-1.849	0.009	.	-1.874	0.077	.	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0378855329492397	NA	0	0	NaN	NA	NA	122	91	31	0
chr17	20768788	20768788	G	T	exonic	CCDC144NL	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC144NL:NM_001004306:exon4:c.C606A:p.H202Q	rs78365129	NaN	NaN	0	D	0.597	P	0.402	B	.	.	1.000	N	0	N	2.33	T	-1.002	T	0.025	T	0.112	-0.942	0.357	.	0.088	0.089	.	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.02467	0	NaN	NA	NA	176	108	68	0
chr17	20768803	20768803	C	T	exonic	CCDC144NL	NaN	synonymous SNV	CCDC144NL:NM_001004306:exon4:c.G591A:p.E197E	rs76135364	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.26548	0	NaN	NA	NA	184	108	76	2
chr17	20768816	20768816	C	T	exonic	CCDC144NL	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC144NL:NM_001004306:exon4:c.G578A:p.C193Y	rs73298040	NaN	NaN	0	D	0.782	P	0.588	P	.	.	1.000	N	0	N	2.21	T	-1.019	T	0.029	T	0.184	-1.390	0.024	.	0.088	0.076	.	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.87277	0	NaN	NA	NA	183	102	81	2
chr17	20906334	20906334	G	A	UTR3	USP22	NM_015276:c.*10C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.514658	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	215	210	5	0
chr17	20907484	20907484	T	T	intronic	USP22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	20908041	20908041	C	G	intronic	USP22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	20914723	20914723	C	T	intronic	USP22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	20914732	20914732	A	C	intronic	USP22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	20914733	20914733	C	G	intronic	USP22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	20914734	20914734	A	T	intronic	USP22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	20976214	20976214	C	A	intergenic	USP22,LINC01563	dist=29862;dist=2655	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	20976220	20976220	T	C	intergenic	USP22,LINC01563	dist=29868;dist=2649	NaN	NaN	rs10788715	NaN	0.804912	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	21094240	21094240	C	T	intronic	DHRS7B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.771753	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	171	160	11	0
chr17	21102169	21102169	G	C	intronic	TMEM11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	60	47	13	0
chr17	21102170	21102170	C	C	intronic	TMEM11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	62	NaN	NA	NA	166	129	0	0
chr17	21147404	21147404	A	G	intronic	NATD1	NaN	NaN	NaN	rs897926	NaN	0.662939	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.865488	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	0	17	52
chr17	21197487	21197487	G	C	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	rs67988204	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	21200503	21200503	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	27	5	14,8	0
chr17	21200622	21200622	T	C	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	rs5014455	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	17	11	6	0
chr17	21204134	21204134	T	T	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	21205396	21205396	C	A	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	rs75974715	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	227.068	0	NaN	NA	NA	230	66	164	49
chr17	21205568	21205568	G	C	exonic	MAP2K3	NaN	synonymous SNV	MAP2K3:NM_002756:exon6:c.G426C:p.V142V,MAP2K3:NM_145109:exon6:c.G513C:p.V171V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	4.215121372764414E-4	Somatic	51.413	78	63.560598	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	123	92	31	26
chr17	21205606	21205606	G	C	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	rs2305871	NaN	0.251597	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.02474524324380553	NA	0	0	NaN	NA	NA	42	30	12	16
chr17	21207834	21207834	C	C	exonic	MAP2K3	NaN	synonymous SNV	MAP2K3:NM_002756:exon8:c.C578C:p.T193T,MAP2K3:NM_145109:exon8:c.C665C:p.T222T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	22	19	0	0
chr17	21207844	21207844	C	T	exonic	MAP2K3	NaN	synonymous SNV	MAP2K3:NM_002756:exon8:c.C588T:p.A196A,MAP2K3:NM_145109:exon8:c.C675T:p.A225A	rs2230436	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.255247	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	14	5	37
chr17	21208180	21208180	G	A	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	rs28396250	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	100	66	34	0
chr17	21208203	21208203	C	A	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	rs28568964	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	113	78	35	38
chr17	21208221	21208221	G	A	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	rs7208462	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.87979	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	92	79	13	5
chr17	21209008	21209008	C	T	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	rs35360822	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	36	26	10	0
chr17	21209052	21209052	C	T	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	rs5012536	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	32	19	13	0
chr17	21209093	21209093	G	A	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	rs5012535	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	38	25	13	0
chr17	21209146	21209146	G	A	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	rs5012534	NaN	0.00319489	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	44	33	11	0
chr17	21214867	21214867	C	A	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	rs1898406	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	21215637	21215637	G	A	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	rs66486636	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	68.2056	0	NaN	NA	NA	1433	801	632	43
chr17	21215682	21215682	G	A	intronic	MAP2K3	NaN	NaN	NaN	rs73302038	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	30.8534	0	NaN	NA	NA	1500	779	721	37
chr17	21217513	21217513	G	A	exonic	MAP2K3	NaN	nonsynonymous SNV	MAP2K3:NM_002756:exon12:c.G928A:p.V310M,MAP2K3:NM_145109:exon12:c.G1015A:p.V339M	rs2363198	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.789	P	0.000	D	1.000	D	1.655	L	-0.77	T	-0.986	T	0.000	T	0.308	3.586	18.26	3.94	1.057	7.174	10.666	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	70	NaN	NA	NA	207	159	48	58
chr17	21217547	21217547	T	C	UTR3	MAP2K3	NM_145109:c.*5T>C,NM_002756:c.*5T>C	NaN	NaN	rs2363197	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	67	NaN	NA	NA	184	136	48	58
chr17	21217554	21217554	C	T	UTR3	MAP2K3	NM_145109:c.*12C>T,NM_002756:c.*12C>T	NaN	NaN	rs2363196	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	76	NaN	NA	NA	182	137	45	57
chr17	21217566	21217566	C	T	UTR3	MAP2K3	NM_145109:c.*24C>T,NM_002756:c.*24C>T	NaN	NaN	rs2363375	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	165	117	48	50
chr17	21217596	21217596	C	G	UTR3	MAP2K3	NM_145109:c.*54C>G,NM_002756:c.*54C>G	NaN	NaN	rs2363373	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	143	106	37	48
chr17	21222672	21222672	G	G	intergenic	MAP2K3,KCNJ12	dist=4121;dist=57027	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr17	21223241	21223241	G	C	intergenic	MAP2K3,KCNJ12	dist=4690;dist=56458	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	21225449	21225449	C	T	intergenic	MAP2K3,KCNJ12	dist=6898;dist=54250	NaN	NaN	rs4021560	NaN	0.000998403	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	21225450	21225450	G	C	intergenic	MAP2K3,KCNJ12	dist=6899;dist=54249	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr17	21240815	21240815	G	C	intergenic	MAP2K3,KCNJ12	dist=22264;dist=38884	NaN	NaN	rs73306042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr17	21241037	21241037	G	G	intergenic	MAP2K3,KCNJ12	dist=22486;dist=38662	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	18	16	0	0
chr17	21241046	21241046	C	C	intergenic	MAP2K3,KCNJ12	dist=22495;dist=38653	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	17	15	0	0
chr17	21247606	21247606	C	T	intergenic	MAP2K3,KCNJ12	dist=29055;dist=32093	NaN	NaN	rs72843849	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	21273223	21273223	G	T	intergenic	MAP2K3,KCNJ12	dist=54672;dist=6476	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr17	21273256	21273256	G	T	intergenic	MAP2K3,KCNJ12	dist=54705;dist=6443	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr17	21289037	21289037	C	C	intronic	KCNJ12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	21303190	21303190	G	A	intronic	KCNJ12	NaN	NaN	NaN	rs79750648	NaN	0.0439297	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr17	21303191	21303191	G	A	intronic	KCNJ12	NaN	NaN	NaN	rs75174590	NaN	0.0439297	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr17	21303222	21303222	C	T	intronic	KCNJ12	NaN	NaN	NaN	rs75050283	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr17	21303235	21303235	C	T	intronic	KCNJ12	NaN	NaN	NaN	rs79734730	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr17	21308454	21308454	C	A	UTR5	KCNJ18	NM_001194958:c.-10201C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	21312642	21312642	G	G	intronic	KCNJ12,KCNJ18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	21312643	21312643	G	G	intronic	KCNJ12,KCNJ18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	21312648	21312648	C	C	intronic	KCNJ12,KCNJ18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	21318629	21318629	C	T	UTR5	KCNJ12,KCNJ18	NM_021012:c.-26C>T;NM_001194958:c.-26C>T	NaN	NaN	rs58862472	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.02945100682205947	NA	0	0	NaN	NA	NA	160	56	104	5
chr17	21318826	21318826	G	A	exonic	KCNJ12,KCNJ18	NaN	nonsynonymous SNV	KCNJ18:NM_001194958:exon3:c.G172A:p.A58T,KCNJ12:NM_021012:exon3:c.G172A:p.A58T	rs142399667	ID=COSM1239196;OCCURENCE=1(oesophagus)	NaN	0.25	T	0.006	B	0.021	B	0.001	D	0.878	D	0.39	N	-3.3	D	-0.156	T	0.416	T	0.071	1.693	11.62	5.33	2.506	2.230	10.234	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.719914	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	760	750	10	2
chr17	21319369	21319369	G	A	exonic	KCNJ12,KCNJ18	NaN	nonsynonymous SNV	KCNJ18:NM_001194958:exon3:c.G715A:p.E239K,KCNJ12:NM_021012:exon3:c.G715A:p.E239K	rs77048459	NaN	NaN	1	T	0.606	P	0.207	B	0.000	D	1.000	D	0.375	N	-3.22	D	-0.010	T	0.551	D	0.558	1.365	10.49	4.34	1.219	4.708	15.944	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.14953	0	NaN	NA	NA	582	514	67	4
chr17	21319392	21319392	G	A	exonic	KCNJ12,KCNJ18	NaN	synonymous SNV	KCNJ18:NM_001194958:exon3:c.G738A:p.L246L,KCNJ12:NM_021012:exon3:c.G738A:p.L246L	rs73979899	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	31.7133	0	NaN	NA	NA	447	379	68	20
chr17	21319407	21319407	C	T	exonic	KCNJ12,KCNJ18	NaN	synonymous SNV	KCNJ18:NM_001194958:exon3:c.C753T:p.I251I,KCNJ12:NM_021012:exon3:c.C753T:p.I251I	rs16962951	ID=COSM1381528;OCCURENCE=1(large_intestine)	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	26.0561	0	NaN	NA	NA	442	381	65	7
chr17	21319436	21319436	G	A	exonic	KCNJ12,KCNJ18	NaN	nonsynonymous SNV	KCNJ18:NM_001194958:exon3:c.G782A:p.R261H,KCNJ12:NM_021012:exon3:c.G782A:p.R261H	rs77270326	ID=COSM312197;OCCURENCE=1(lung)	NaN	0.01	D	1.0	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	2.88	M	-3.45	D	1.047	D	0.924	D	0.915	4.974	29.1	5.43	2.554	9.690	19.233	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.4878	0	NaN	NA	NA	421	366	55	13
chr17	21319439	21319439	T	G	exonic	KCNJ12,KCNJ18	NaN	nonsynonymous SNV	KCNJ18:NM_001194958:exon3:c.T785G:p.I262S,KCNJ12:NM_021012:exon3:c.T785G:p.I262S	rs76684759	ID=COSM312198;OCCURENCE=1(lung)	NaN	0.01	D	0.999	D	0.99	D	0.000	D	1.000	D	2.925	M	-3.51	D	1.054	D	0.919	D	0.991	4.199	21.8	5.43	2.065	7.898	15.474	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	16.2988	0	NaN	NA	NA	418	363	56	15
chr17	21319452	21319452	G	A	exonic	KCNJ12,KCNJ18	NaN	synonymous SNV	KCNJ18:NM_001194958:exon3:c.G798A:p.S266S,KCNJ12:NM_021012:exon3:c.G798A:p.S266S	rs73313929	NaN	0.00319489	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.408	0	NaN	NA	NA	417	364	53	13
chr17	21319767	21319767	C	G/T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	814.355	0	NaN	NA	NA	291	131	160	0
chr17	21319785	21319785	C	T	exonic	KCNJ12,KCNJ18	NaN	synonymous SNV	KCNJ18:NM_001194958:exon3:c.C1131T:p.Y377Y,KCNJ12:NM_021012:exon3:c.C1131T:p.Y377Y	rs1657745	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	414	263	151	58
chr17	21319860	21319860	C	A/T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	929.576	0	NaN	NA	NA	364	171	193	0
chr17	21319943	21319943	A	G	exonic	KCNJ12,KCNJ18	NaN	nonsynonymous SNV	KCNJ18:NM_001194958:exon3:c.A1289G:p.E430G,KCNJ12:NM_021012:exon3:c.A1289G:p.E430G	rs5021699	NaN	NaN	0.04	D	1.0	D	0.999	D	0.023	N	1.000	D	2.175	M	-2.63	D	0.810	D	0.829	D	0.594	3.516	17.96	5.41	2.066	9.091	15.454	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	19.7842	0	NaN	NA	NA	120	100	19	20
chr17	21321250	21321250	G	A	UTR3	KCNJ12	NM_021012:c.*1294G>A	NaN	NaN	rs62049523	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	10	0	10	0
chr17	21321278	21321278	T	C	UTR3	KCNJ12	NM_021012:c.*1322T>C	NaN	NaN	rs77331608	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	21321283	21321283	A	T	UTR3	KCNJ12	NM_021012:c.*1327A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	21321285	21321285	G	A	UTR3	KCNJ12	NM_021012:c.*1329G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	21321289	21321289	A	C	UTR3	KCNJ12	NM_021012:c.*1333A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	21321295	21321295	A	G	UTR3	KCNJ12	NM_021012:c.*1339A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	21321297	21321297	T	A	UTR3	KCNJ12	NM_021012:c.*1341T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	21321298	21321298	C	G	UTR3	KCNJ12	NM_021012:c.*1342C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	21321299	21321299	A	G	UTR3	KCNJ12	NM_021012:c.*1343A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	21321301	21321301	A	G	UTR3	KCNJ12	NM_021012:c.*1345A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	21321306	21321306	A	T	UTR3	KCNJ12	NM_021012:c.*1350A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	21321307	21321307	A	G	UTR3	KCNJ12	NM_021012:c.*1351A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	21323413	21323413	C	T	downstream	KCNJ12	NaN	NaN	NaN	rs77078182	NaN	0.463658	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr17	21323414	21323414	A	C	downstream	KCNJ12	NaN	NaN	NaN	rs77685110	NaN	0.463658	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	0	7	0
chr17	21326244	21326244	C	G	intergenic	KCNJ12,C17orf51	dist=3065;dist=105327	NaN	NaN	rs75216822	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr17	21326499	21326499	C	T	intergenic	KCNJ12,C17orf51	dist=3320;dist=105072	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	21340216	21340216	C	T	intergenic	KCNJ12,C17orf51	dist=17037;dist=91355	NaN	NaN	rs80194918	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	10	1	9	0
chr17	2137129	2137129	A	T	intronic	SMG6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	2137130	2137130	A	G	intronic	SMG6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	21797400	21797400	A	C	intergenic	C17orf51,FAM27L	dist=342459;dist=27970	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	21988488	21988488	C	G	intergenic	FLJ36000,MTRNR2L1	dist=75418;dist=33949	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	21988489	21988489	A	G	intergenic	FLJ36000,MTRNR2L1	dist=75419;dist=33948	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	2200657	2200657	G	A	intronic	SMG6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.056626	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	118	109	9	0
chr17	2203025	2203025	T	G	exonic	SMG6	NaN	nonsynonymous SNV	SMG6:NM_017575:exon2:c.A1022C:p.N341T	rs1885987	NaN	0.229433	0.41	T	0.001	B	0.004	B	0.743	N	0.000	P	0	N	3.15	T	-0.939	T	0.000	T	0.095	0.920	8.744	2.3	0.252	3.302	10.136	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	70	NaN	NA	NA	81	46	35	5
chr17	2203175	2203175	C	G	exonic	SMG6	NaN	nonsynonymous SNV	SMG6:NM_017575:exon2:c.G872C:p.R291P	rs1885986	NaN	0.184704	0.06	T	0.998	D	0.921	D	0.004	N	0.000	P	0.895	L	2.89	T	-0.817	T	0.000	T	0.777	2.872	15.57	5.35	2.490	3.931	19.057	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.85424	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	113	90	23	28
chr17	2203348	2203348	T	C	exonic	SMG6	NaN	synonymous SNV	SMG6:NM_017575:exon2:c.A699G:p.P233P	rs216194	NaN	0.94369	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	229.692046	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	88	1	87	54
chr17	2203453	2203453	A	G	exonic	SMG6	NaN	synonymous SNV	SMG6:NM_017575:exon2:c.T594C:p.A198A	rs216193	NaN	0.544529	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	64	53	11	47
chr17	221106	221106	C	T	intergenic	RPH3AL,C17orf97	dist=18473;dist=39012	NaN	NaN	rs34681138	NaN	0.304712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr17	2219169	2219169	A	A	intronic	SRR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr17	2235408	2235408	G	A	intronic	TSR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.706459	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	66	60	6	0
chr17	2236404	2236404	T	C	exonic	TSR1	NaN	nonsynonymous SNV	TSR1:NM_018128:exon7:c.A1156G:p.S386G	rs2281726	NaN	0.173522	0.44	T	0.0	B	0.001	B	0.082	N	1.000	P	0.975	L	2.75	T	-0.944	T	0.000	T	0.016	1.490	10.93	-1.25	-0.441	0.599	6.619	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	94.3768	54	NaN	NA	NA	175	125	50	6
chr17	2239570	2239570	A	G	intronic	TSR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.539032	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	131	120	11	0
chr17	22402	22402	G	G	exonic	DOC2B	NaN	synonymous SNV	DOC2B:NM_003585:exon2:c.C379C:p.L127L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	157	122	0	0
chr17	22467	22467	C	T	intronic	DOC2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.187323	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	182	174	8	0
chr17	2265113	2265113	C	A	intronic	SGSM2	NaN	NaN	NaN	rs2429906	NaN	0.35623	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	124	93	31	35
chr17	2266709	2266709	T	T	intronic	SGSM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	57	50	0	0
chr17	2266799	2266799	G	A	exonic	SGSM2	NaN	nonsynonymous SNV	SGSM2:NM_001098509:exon7:c.G713A:p.R238K,SGSM2:NM_014853:exon7:c.G713A:p.R238K	rs745400	NaN	0.552117	0.35	T	0.006	B	0.01	B	0.000	D	0.018	P	0.97	L	2.67	T	-1.054	T	0.000	T	0.086	3.215	16.77	3.73	1.440	2.476	9.287	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	88	71	17	44
chr17	2266812	2266812	T	C	exonic	SGSM2	NaN	synonymous SNV	SGSM2:NM_001098509:exon7:c.T726C:p.C242C,SGSM2:NM_014853:exon7:c.T726C:p.C242C	rs2003968	ID=COSM1563374;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.566294	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	88	74	14	43
chr17	2268311	2268311	G	A	exonic	SGSM2	NaN	nonsynonymous SNV	SGSM2:NM_001098509:exon10:c.G1121A:p.R374Q,SGSM2:NM_014853:exon10:c.G1121A:p.R374Q	rs2248821	NaN	0.563898	0.06	T	0.041	B	0.028	B	0.000	N	0.000	P	1.59	L	1.59	T	-1.033	T	0.000	T	0.08	3.749	19.03	2.47	0.303	2.258	10.234	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	62	NaN	NA	NA	39	35	4	29
chr17	2268681	2268681	T	C	intronic	SGSM2	NaN	NaN	NaN	rs2429908	NaN	0.564497	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	73	NaN	NA	NA	259	209	50	40
chr17	2276396	2276396	TGGGGCTGA	TGGGCTGA,TGGGGC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	40.0442	0	NaN	NA	NA	192	155	21	8
chr17	2280431	2280431	A	A	intronic	SGSM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	2290674	2290674	C	T	exonic	MNT	NaN	nonsynonymous SNV	MNT:NM_020310:exon6:c.G1270A:p.V424M	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.447	B	0.071	B	0.158	N	0.992	D	1.7	L	-1.61	D	-0.550	T	0.511	D	0.335	2.138	13.11	4.68	2.150	1.814	16.562	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	2304155	2304155	G	A	UTR5	MNT	NM_020310:c.-149C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	30	10.531633	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	7	3	4	0
chr17	2304157	2304157	G	A	UTR5	MNT	NM_020310:c.-151C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	16	8.517395	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	7	3	4	0
chr17	2323517	2323517	C	T	exonic	METTL16	NaN	nonsynonymous SNV	METTL16:NM_024086:exon10:c.G1436A:p.S479N	rs17834783	NaN	0.0265575	0.35	T	0.029	B	0.019	B	0.664	N	1.000	N	1.1	L	0.89	T	-1.079	T	0.007	T	0.017	0.469	6.548	3.62	0.715	0.444	7.918	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	110	NaN	NA	NA	194	167	27	7
chr17	2323931	2323931	T	C	intronic	METTL16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.1679	0	NaN	NA	NA	8	5	2	0
chr17	2367688	2367688	A	A	intronic	METTL16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	25565191	25565191	A	A	intergenic	NONE,MIR4522	dist=NONE;dist=55745	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	25735492	25735492	A	C	intergenic	WSB1,TBC1D3P5	dist=94847;dist=9539	NaN	NaN	rs1551853	NaN	0.541933	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	25736138	25736138	C	G	intergenic	WSB1,TBC1D3P5	dist=95493;dist=8893	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr17	2583505	2583505	G	A	exonic	PAFAH1B1	NaN	synonymous SNV	PAFAH1B1:NM_000430:exon10:c.G1050A:p.G350G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.27897435897435907	NA	0	0	NaN	NA	NA	24	15	9	0
chr17	25896031	25896031	A	A	intronic	KSR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	25896032	25896032	C	C	intronic	KSR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	25909850	25909850	G	T	exonic	KSR1	NaN	synonymous SNV	KSR1:NM_014238:exon5:c.G288T:p.L96L	rs2293181	NaN	0.383187	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	187.581203	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	61	0	61	35
chr17	25930993	25930993	A	A	intronic	KSR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr17	2593953	2593953	C	G	exonic	CLUH	NaN	nonsynonymous SNV	CLUH:NM_015229:exon26:c.G3865C:p.A1289P	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.0	B	0.0	B	0.153	N	1.000	N	1.355	L	-1.5	D	-0.899	T	0.271	T	0.142	1.693	11.62	-1.31	-0.011	0.136	3.413	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	16	12	4	0
chr17	25948326	25948326	G	T	intronic	KSR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr17	2595464	2595464	C	G	intronic	CLUH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.521379	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	62	57	5	0
chr17	2595593	2595593	G	C	intronic	CLUH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.574295	nearby_gap_events	REJECT	32	26	6	0
chr17	25967768	25967768	T	C	exonic	LGALS9	NaN	nonsynonymous SNV	LGALS9:NM_002308:exon3:c.T302C:p.L101P,LGALS9:NM_009587:exon3:c.T302C:p.L101P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.997	D	0.024	N	0.828	D	3.74	H	2.87	T	-0.594	T	0.127	T	0.923	3.004	16.02	3.94	1.806	4.216	11.121	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.723982	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	84	81	3	0
chr17	25973605	25973605	C	A	exonic	LGALS9	NaN	nonsynonymous SNV	LGALS9:NM_002308:exon7:c.C564A:p.H188Q,LGALS9:NM_009587:exon8:c.C660A:p.H220Q	NaN	NaN	NaN	0.73	T	0.131	B	0.137	B	0.013	U	1.000	N	0.55	N	3.99	T	-0.995	T	0.025	T	0.338	0.524	6.837	1.05	0.528	-0.720	5.950	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.306419	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	24	17	7	0
chr17	25974258	25974258	T	C	intronic	LGALS9	NaN	NaN	NaN	rs4239242	NaN	0.309505	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	138.391	0	NaN	NA	NA	25	7	18	16
chr17	25984702	25984702	C	G	intergenic	LGALS9,NOS2	dist=8116;dist=99090	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	2598626	2598626	GT	G,GC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	420.403	0	NaN	NA	NA	44	0	14	1
chr17	25991435	25991435	C	T	intergenic	LGALS9,NOS2	dist=14849;dist=92357	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	2599460	2599460	G	A	exonic	CLUH	NaN	nonsynonymous SNV	CLUH:NM_015229:exon13:c.C2267T:p.P756L	NaN	NaN	NaN	0	D	0.998	D	0.959	D	0.000	D	1.000	D	2.83	M	-2.06	D	0.728	D	0.787	D	0.874	5.288	33	5.66	2.673	9.420	18.723	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	29	12.149342	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	18	10	8	0
chr17	2599669	2599669	C	C	intronic	CLUH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	48	45	0	0
chr17	25998365	25998365	A	T	intergenic	LGALS9,NOS2	dist=21779;dist=85427	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	22	5	17	0
chr17	26084532	26084532	C	G	intronic	NOS2	NaN	NaN	NaN	rs11653716	NaN	0.167532	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	85.2018	0	NaN	NA	NA	53	31	22	2
chr17	26092631	26092631	A	G	exonic	NOS2	NaN	synonymous SNV	NOS2:NM_000625:exon20:c.T2358C:p.G786G	rs1060822	NaN	0.730831	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	206.241915	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	0	72	47
chr17	26101237	26101237	G	A	intronic	NOS2	NaN	NaN	NaN	rs3729966	NaN	0.21266	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	73.014214	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	79	42	37	15
chr17	26105924	26105924	C	T	exonic	NOS2	NaN	nonsynonymous SNV	NOS2:NM_000625:exon10:c.G1163A:p.R388H	NaN	NaN	0.000199681	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	4.03	H	1.08	T	0.149	D	0.428	T	0.929	5.076	31	5.68	2.683	7.818	18.787	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.805438	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	150	145	5	0
chr17	26114866	26114866	G	A	intronic	NOS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.474743	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	89	84	5	0
chr17	26125662	26125662	T	T	intronic	NOS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	26206414	26206414	C	A	UTR3	LYRM9	NM_001076680:c.*85G>T	NaN	NaN	rs3751972	NaN	0.786142	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	136.293697	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	0	45	52
chr17	26207436	26207436	A	A	intronic	LYRM9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	20	20	0	0
chr17	26370061	26370061	T	T	exonic	NLK	NaN	synonymous SNV	NLK:NM_016231:exon1:c.T162T:p.H54H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	87	84	0	0
chr17	2652228	2652228	G	A	upstream	MIR1253	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	2660997	2660997	G	G	intergenic	MIR1253,RAP1GAP2	dist=9521;dist=38735	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	26646434	26646434	G	GC	intronic	TMEM97	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.9998	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	825.366	0	NaN	NA	NA	90	0	82	17
chr17	26671719	26671719	C	T	UTR3	TNFAIP1	NM_021137:c.*93C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	2	8	0
chr17	26681435	26681435	T	C	intronic	POLDIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr17	26681438	26681438	C	G	intronic	POLDIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr17	26681440	26681440	C	G	intronic	POLDIP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr17	26695445	26695445	T	A	intronic	VTN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	26695788	26695788	T	T	intronic	VTN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	45	39	0	0
chr17	26696763	26696763	C	C	exonic	VTN	NaN	synonymous SNV	VTN:NM_000638:exon3:c.G294G:p.L98L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	89	69	0	0
chr17	26696764	26696764	A	A	exonic	VTN	NaN	synonymous SNV	VTN:NM_000638:exon3:c.T293T:p.L98L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	85	64	0	0
chr17	26696766	26696766	G	G	exonic	VTN	NaN	synonymous SNV	VTN:NM_000638:exon3:c.C291C:p.S97S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	94	75	0	0
chr17	26699367	26699367	G	GC	exonic	SARM1	NaN	frameshift substitution	SARM1:NM_015077:exon2:c.313_313delinsGC	NaN	NaN	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	197.469	0	NaN	NA	NA	20	0	20	4
chr17	26708302	26708302	G	T	exonic	SARM1	NaN	nonsynonymous SNV	SARM1:NM_015077:exon3:c.G548T:p.G183V	rs71373646	NaN	0.999401	0.08	T	0.0	B	0.0	B	.	.	0.000	P	.	.	0.97	T	-1.045	T	0.000	T	0.085	2.162	13.19	3.71	0.761	2.860	7.066	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	240.828861	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	80	2	78	58
chr17	26708550	26708550	T	C	exonic	SARM1	NaN	nonsynonymous SNV	SARM1:NM_015077:exon3:c.T796C:p.S266P	rs11658194	NaN	0.966254	0.46	T	0.0	B	0.0	B	.	.	0.000	P	.	.	1.07	T	-1.047	T	0.000	T	0.129	3.397	17.47	3.19	0.192	3.698	9.148	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	34.7715	0	7.912438	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	1	5	0
chr17	26708551	26708551	C	G	exonic	SARM1	NaN	nonsynonymous SNV	SARM1:NM_015077:exon3:c.C797G:p.S266W	rs11652384	NaN	1	0.3	T	0.0	B	0.0	B	.	.	0.000	P	.	.	1.22	T	-1.072	T	0.000	T	0.109	2.869	15.56	4.09	1.236	4.471	9.827	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.983585	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	1	5	0
chr17	26712141	26712141	A	G	exonic	SARM1	NaN	nonsynonymous SNV	SARM1:NM_015077:exon6:c.A1474G:p.S492G	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.002	B	0.007	B	0.002	N	0.669	N	.	.	.	.	-1.017	T	0.082	T	0.175	2.440	14.12	4.42	2.069	2.090	6.695	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.568894	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	153	148	5	0
chr17	26732561	26732561	A	T	intronic	SLC46A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr17	26818065	26818065	T	A	intronic	SLC13A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.361486	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	24	16	8	19
chr17	26851370	26851370	G	T	intronic	FOXN1	NaN	NaN	NaN	rs144922383	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	1705.13	0	15.109258	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	187	171	16	0
chr17	26861877	26861877	C	T	exonic	FOXN1	NaN	nonsynonymous SNV	FOXN1:NM_003593:exon7:c.C1288T:p.P430S	rs61749867	NaN	0.0119808	0.34	T	0.0	B	0.0	B	0.005	N	1.000	N	0	N	-3.18	D	-0.787	T	0.107	T	0.064	0.548	6.967	2.31	0.457	-0.500	5.356	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	494.177	37	NaN	NA	NA	85	13	72	8
chr17	26864428	26864428	A	G	exonic	FOXN1	NaN	nonsynonymous SNV	FOXN1:NM_003593:exon8:c.A1921G:p.S641G	rs146028232	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.001	B	0.001	N	0.999	N	-1.35	N	-3.11	D	-0.663	T	0.286	T	0.146	-0.488	1.755	3.12	0.647	3.193	4.740	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.07335907335907532	NA	0	0	4.985763	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	21	17	4	0
chr17	26878340	26878340	T	C	intronic	UNC119	NaN	NaN	NaN	rs142577899	NaN	0.00159744	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	26881730	26881730	G	A	intronic	PIGS	NaN	NaN	NaN	rs2286519	NaN	0.213458	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	47.369364	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	20	20	28
chr17	26898023	26898023	T	G	intronic	PIGS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	39	25	14	0
chr17	26918638	26918638	T	G	intronic	SPAG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	25	6	19	0
chr17	26937288	26937288	T	C	ncRNA_intronic	SPAG5-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	26937401	26937401	T	A	ncRNA_intronic	SPAG5-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.352197	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	93	87	6	0
chr17	26942288	26942288	A	A	ncRNA_intronic	SPAG5-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	135	88	0	0
chr17	26942834	26942834	G	A	ncRNA_intronic	SPAG5-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.338724	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	99	92	7	0
chr17	26944359	26944359	A	A	ncRNA_exonic	SPAG5-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	26951433	26951433	A	A	intronic	KIAA0100	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	26955404	26955404	T	A	exonic	KIAA0100	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA0100:NM_014680:exon24:c.A4473T:p.L1491F	NaN	NaN	NaN	0.54	T	0.998	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	1.59	L	1.75	T	-0.970	T	0.090	T	0.836	2.123	13.06	3.46	0.996	0.789	3.589	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	106	69	35	0
chr17	26966874	26966874	T	G	intronic	KIAA0100	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	10	0	10	0
chr17	26967761	26967761	A	A	intronic	KIAA0100	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	7	0	0
chr17	27011931	27011931	T	A	exonic	SUPT6H	NaN	nonsynonymous SNV	SUPT6H:NM_003170:exon19:c.T2439A:p.H813Q	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.984	D	0.548	P	0.000	D	0.999	D	1.935	M	.	.	-0.882	T	0.163	T	0.462	3.905	19.86	1.56	0.453	1.022	7.796	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.956911	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	86	76	10	0
chr17	27013915	27013915	T	C	intronic	SUPT6H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	27013918	27013918	T	C	intronic	SUPT6H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	27013920	27013920	A	T	intronic	SUPT6H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	27016350	27016350	T	C	intronic	SUPT6H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	62	8	54	0
chr17	27020889	27020889	T	C	intronic	SUPT6H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	27020892	27020892	T	G	intronic	SUPT6H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	27020893	27020893	C	A	intronic	SUPT6H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	27020894	27020894	A	G	intronic	SUPT6H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	27020896	27020896	C	A	intronic	SUPT6H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	27025052	27025052	A	G	intronic	SUPT6H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.013835	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	67	63	4	0
chr17	27026667	27026667	G	G	intronic	SUPT6H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	27027342	27027342	C	T	intronic	SUPT6H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.09328	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	142	129	13	0
chr17	27031918	27031918	A	A	intronic	PROCA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	2703933	2703933	A	G	intronic	RAP1GAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr17	27041624	27041624	C	G	exonic	RAB34	NaN	nonsynonymous SNV	RAB34:NM_001142625:exon10:c.G773C:p.R258T	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.0	B	0.0	B	.	.	.	.	0.55	N	-0.31	T	-0.735	T	0.183	T	0.068	2.049	12.81	5.62	2.642	1.631	15.153	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.727118	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	132	117	15	0
chr17	27041627	27041627	G	A	exonic	RAB34	NaN	nonsynonymous SNV	RAB34:NM_001142625:exon10:c.C770T:p.P257L	NaN	NaN	0.000599042	.	.	0.0	B	0.001	B	.	.	.	.	0	N	-0.34	T	-0.944	T	0.118	T	0.078	2.673	14.90	3.32	0.730	1.101	8.713	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.099331	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	90	82	8	0
chr17	27044482	27044482	C	A	exonic	NARR	NaN	nonsynonymous SNV	NARR:NM_001256281:exon1:c.G245T:p.R82L	rs11545700	NaN	0.0449281	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	142.984	0	NaN	NA	NA	31	6	25	16
chr17	27044483	27044483	G	G	exonic	NARR	NaN	synonymous SNV	NARR:NM_001256281:exon1:c.C244C:p.R82R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	56	46	0	0
chr17	27045338	27045338	T	C	upstream	NARR,RAB34	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.467084	nearby_gap_events	REJECT	74	66	8	0
chr17	27052165	27052165	T	C	intronic	TLCD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	27052736	27052736	T	C	intronic	TLCD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	27061237	27061237	G	T	intronic	NEK8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr17	27061239	27061239	A	A	intronic	NEK8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	27068305	27068305	G	G	intronic	NEK8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	87	84	0	0
chr17	27074171	27074171	G	T	intronic	TRAF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.714511	nearby_gap_events	REJECT	66	58	8	0
chr17	27075143	27075143	C	G	exonic	TRAF4	NaN	nonsynonymous SNV	TRAF4:NM_004295:exon4:c.C409G:p.R137G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.76	M	1.32	T	-0.445	T	0.250	T	0.937	3.235	16.84	3.64	1.448	4.322	14.537	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.464543	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	74	68	6	0
chr17	27075380	27075380	G	C	exonic	TRAF4	NaN	nonsynonymous SNV	TRAF4:NM_004295:exon5:c.G563C:p.C188S	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	3.725	H	1.2	T	-0.120	T	0.350	T	0.959	4.097	21.1	5.67	2.668	7.257	18.318	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.649571	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	144	133	11	0
chr17	27075381	27075381	C	G	exonic	TRAF4	NaN	nonsynonymous SNV	TRAF4:NM_004295:exon5:c.C564G:p.C188W	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.725	H	1.21	T	-0.201	T	0.317	T	0.931	3.010	16.04	4.69	2.668	1.294	13.796	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.784319	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	138	127	11	0
chr17	27085461	27085461	T	C	exonic	FAM222B	NaN	nonsynonymous SNV	FAM222B:NM_001077498:exon3:c.A1516G:p.S506G,FAM222B:NM_001288634:exon3:c.A1516G:p.S506G,FAM222B:NM_001288640:exon3:c.A1132G:p.S378G,FAM222B:NM_001288631:exon4:c.A1522G:p.S508G,FAM222B:NM_001288633:exon4:c.A1516G:p.S506G,FAM222B:NM_001288635:exon4:c.A1516G:p.S506G,FAM222B:NM_001288639:exon4:c.A1132G:p.S378G,FAM222B:NM_018182:exon4:c.A1516G:p.S506G,FAM222B:NM_001288632:exon5:c.A1516G:p.S506G,FAM222B:NM_001288637:exon5:c.A1132G:p.S378G,FAM222B:NM_001288638:exon5:c.A1132G:p.S378G,FAM222B:NM_001288636:exon6:c.A1132G:p.S378G	NaN	NaN	NaN	0.54	T	0.002	B	0.003	B	0.009	N	1.000	D	1.04	L	1.36	T	-1.077	T	0.058	T	0.112	-0.243	2.831	3.64	1.988	2.217	9.682	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.024322	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	185	172	13	0
chr17	27085463	27085463	G	T	exonic	FAM222B	NaN	nonsynonymous SNV	FAM222B:NM_001077498:exon3:c.C1514A:p.A505E,FAM222B:NM_001288634:exon3:c.C1514A:p.A505E,FAM222B:NM_001288640:exon3:c.C1130A:p.A377E,FAM222B:NM_001288631:exon4:c.C1520A:p.A507E,FAM222B:NM_001288633:exon4:c.C1514A:p.A505E,FAM222B:NM_001288635:exon4:c.C1514A:p.A505E,FAM222B:NM_001288639:exon4:c.C1130A:p.A377E,FAM222B:NM_018182:exon4:c.C1514A:p.A505E,FAM222B:NM_001288632:exon5:c.C1514A:p.A505E,FAM222B:NM_001288637:exon5:c.C1130A:p.A377E,FAM222B:NM_001288638:exon5:c.C1130A:p.A377E,FAM222B:NM_001288636:exon6:c.C1130A:p.A377E	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.299	B	0.154	B	0.023	N	1.000	D	0.69	N	1.48	T	-1.058	T	0.062	T	0.592	1.961	12.51	4.76	2.456	5.823	16.925	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.201809	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	187	176	11	0
chr17	27086206	27086206	C	T	exonic	FAM222B	NaN	synonymous SNV	FAM222B:NM_001077498:exon3:c.G771A:p.L257L,FAM222B:NM_001288634:exon3:c.G771A:p.L257L,FAM222B:NM_001288640:exon3:c.G387A:p.L129L,FAM222B:NM_001288631:exon4:c.G777A:p.L259L,FAM222B:NM_001288633:exon4:c.G771A:p.L257L,FAM222B:NM_001288635:exon4:c.G771A:p.L257L,FAM222B:NM_001288639:exon4:c.G387A:p.L129L,FAM222B:NM_018182:exon4:c.G771A:p.L257L,FAM222B:NM_001288632:exon5:c.G771A:p.L257L,FAM222B:NM_001288637:exon5:c.G387A:p.L129L,FAM222B:NM_001288638:exon5:c.G387A:p.L129L,FAM222B:NM_001288636:exon6:c.G387A:p.L129L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.06148	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	151	148	3	0
chr17	27086216	27086216	G	A	exonic	FAM222B	NaN	nonsynonymous SNV	FAM222B:NM_001077498:exon3:c.C761T:p.A254V,FAM222B:NM_001288634:exon3:c.C761T:p.A254V,FAM222B:NM_001288640:exon3:c.C377T:p.A126V,FAM222B:NM_001288631:exon4:c.C767T:p.A256V,FAM222B:NM_001288633:exon4:c.C761T:p.A254V,FAM222B:NM_001288635:exon4:c.C761T:p.A254V,FAM222B:NM_001288639:exon4:c.C377T:p.A126V,FAM222B:NM_018182:exon4:c.C761T:p.A254V,FAM222B:NM_001288632:exon5:c.C761T:p.A254V,FAM222B:NM_001288637:exon5:c.C377T:p.A126V,FAM222B:NM_001288638:exon5:c.C377T:p.A126V,FAM222B:NM_001288636:exon6:c.C377T:p.A126V	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.93	P	0.249	B	0.000	D	1.000	D	1.67	L	1.03	T	-0.879	T	0.102	T	0.443	2.964	15.88	4.19	2.149	7.424	15.675	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.242769	nearby_gap_events	REJECT	154	143	11	0
chr17	27086474	27086474	G	A	exonic	FAM222B	NaN	nonsynonymous SNV	FAM222B:NM_001077498:exon3:c.C503T:p.P168L,FAM222B:NM_001288634:exon3:c.C503T:p.P168L,FAM222B:NM_001288640:exon3:c.C119T:p.P40L,FAM222B:NM_001288631:exon4:c.C509T:p.P170L,FAM222B:NM_001288633:exon4:c.C503T:p.P168L,FAM222B:NM_001288635:exon4:c.C503T:p.P168L,FAM222B:NM_001288639:exon4:c.C119T:p.P40L,FAM222B:NM_018182:exon4:c.C503T:p.P168L,FAM222B:NM_001288632:exon5:c.C503T:p.P168L,FAM222B:NM_001288637:exon5:c.C119T:p.P40L,FAM222B:NM_001288638:exon5:c.C119T:p.P40L,FAM222B:NM_001288636:exon6:c.C119T:p.P40L	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.008	B	0.014	B	0.000	D	1.000	D	0.69	N	1.48	T	-1.093	T	0.050	T	0.355	0.551	6.982	4.56	2.329	3.917	10.105	100	11	3035	SNV	VtSM	3	Somatic	0.02766798418972352	NA	0	18	8.297391		KEEP	8	4	4	0
chr17	27185827	27185827	C	T	exonic	ERAL1	NaN	synonymous SNV	ERAL1:NM_005702:exon7:c.C945T:p.D315D	rs2242345	NaN	0.771166	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	55.813477	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	0	19	57
chr17	27207963	27207963	A	A	intronic	FLOT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	27228405	27228405	C	G	intronic	DHRS13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.850859	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	129	121	8	0
chr17	27228406	27228406	A	C	intronic	DHRS13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	26	16	9	0
chr17	27234051	27234051	G	G	intronic	PHF12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	16	14	0	0
chr17	27234052	27234052	T	T	intronic	PHF12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr17	27240072	27240072	A	G	exonic	PHF12	NaN	nonsynonymous SNV	PHF12:NM_001033561:exon9:c.T1517C:p.L506P,PHF12:NM_001290131:exon9:c.T1517C:p.L506P,PHF12:NM_020889:exon9:c.T1517C:p.L506P	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.001	B	0.001	B	0.194	N	1.000	D	0.895	L	-3.46	D	0.105	D	0.662	D	0.289	1.495	10.95	4.61	2.168	2.727	7.492	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	58.905422	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	174	136	38	0
chr17	27286511	27286511	A	A	intronic	SEZ6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	27306662	27306662	C	A	intronic	SEZ6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.826703	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	133	121	12	0
chr17	27380155	27380155	A	G	intronic	PIPOX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.478589	possible_contamination	REJECT	139	134	5	0
chr17	27381989	27381989	T	G	intronic	PIPOX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	18	7	11	0
chr17	27417143	27417143	A	G	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	8	5	0
chr17	27417389	27417389	T	T	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	27419529	27419529	A	C	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	27420072	27420072	A	C	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	27420074	27420074	C	G	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	27420075	27420075	T	C	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	27420267	27420267	T	T	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	27422053	27422053	C	T	exonic	MYO18A	NaN	synonymous SNV	MYO18A:NM_078471:exon29:c.G4410A:p.A1470A,MYO18A:NM_203318:exon29:c.G4410A:p.A1470A	rs2320786	NaN	0.508187	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.930013	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	11	11	31
chr17	27424170	27424170	T	T	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	27424662	27424662	T	T	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	27426108	27426108	C	G	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.285896	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	124	110	14	4
chr17	27440957	27440957	A	G	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.069748	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	22	16	6	0
chr17	27442398	27442398	G	GT	exonic	MYO18A	NaN	frameshift substitution	MYO18A:NM_078471:exon13:c.2289_2289delinsAC,MYO18A:NM_203318:exon13:c.2289_2289delinsAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.45196	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr17	27443360	27443360	A	G	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.20660474716202534	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr17	27444987	27444987	T	T	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	4	0	0
chr17	27449765	27449765	A	A	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	27468619	27468619	C	A	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	27492869	27492869	A	G	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	rs6505113	NaN	0.72524	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	218.370192	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	190	100	90	45
chr17	27504861	27504861	T	T	intronic	MYO18A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	27524572	27524572	A	T	intergenic	MYO18A,CRYBA1	dist=17165;dist=49303	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	13	7	6	0
chr17	2771160	2771160	C	A	intronic	RAP1GAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	27805223	27805223	T	A	intronic	TAOK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.10365275142314892	NA	0	0	NaN	NA	NA	23	18	5	1
chr17	27822763	27822763	G	T	intronic	TAOK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.38919	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	251	243	8	0
chr17	27822764	27822764	A	G	intronic	TAOK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.232253	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	245	235	10	0
chr17	27838071	27838071	A	G	intronic	TAOK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr17	27861113	27861113	T	C	intronic	TAOK1	NaN	NaN	NaN	rs10451296	NaN	0.0163738	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.927402	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	149	126	23	9
chr17	27889523	27889523	C	G	UTR3	ABHD15	NM_198147:c.*56G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	27889525	27889525	C	T	UTR3	ABHD15	NM_198147:c.*54G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	27899172	27899172	G	C	exonic	TP53I13	NaN	nonsynonymous SNV	TP53I13:NM_138349:exon6:c.G526C:p.A176P	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.99	D	0.836	P	0.012	N	0.909	N	2.08	M	.	.	-0.914	T	0.171	T	0.688	1.341	10.40	2.96	0.995	3.706	7.535	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.647514	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	346	314	32	0
chr17	27899174	27899174	C	G	exonic	TP53I13	NaN	synonymous SNV	TP53I13:NM_138349:exon6:c.C528G:p.A176A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.010089	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	352	321	31	0
chr17	27903281	27903281	G	A	exonic	GIT1	NaN	nonsynonymous SNV	GIT1:NM_014030:exon14:c.C1568T:p.P523L,GIT1:NM_001085454:exon15:c.C1595T:p.P532L	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.066	B	0.025	B	0.020	N	1.000	D	1.1	L	-0.36	T	-0.864	T	0.202	T	0.4	1.177	9.788	4.67	2.588	5.616	16.872	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.861088	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	58	51	7	0
chr17	27904436	27904436	A	A	intronic	GIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	27904618	27904618	G	A	intronic	GIT1	NaN	NaN	NaN	rs369796708	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.985948	nearby_gap_events	REJECT	167	157	10	0
chr17	27910411	27910411	T	G	intronic	GIT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	19	0	19	0
chr17	27934716	27934716	C	A	intronic	ANKRD13B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.866328	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	46	39	7	0
chr17	27935269	27935269	T	A	intronic	ANKRD13B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	27940509	27940509	C	A	exonic	ANKRD13B	NaN	stopgain	ANKRD13B:NM_152345:exon15:c.C1790A:p.S597X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	7.376	39	3.94	2.443	4.588	12.972	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.956828	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	5	2	3	0
chr17	27943024	27943024	A	G	exonic	CORO6	NaN	nonsynonymous SNV	CORO6:NM_032854:exon9:c.T1232C:p.L411P	rs143699377	NaN	0.00738818	0	D	0.986	D	0.936	D	0.062	N	1.000	D	2.595	M	1.48	T	-0.294	T	0.223	T	0.466	2.234	13.43	5.16	1.941	7.093	14.678	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	16	7.81059	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	3	4	2
chr17	27946293	27946293	A	A	intronic	CORO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	27948222	27948222	T	C	intronic	CORO6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	27958760	27958760	A	G	exonic	SSH2	NaN	nonsynonymous SNV	SSH2:NM_033389:exon15:c.T3371C:p.L1124S,SSH2:NM_001282129:exon16:c.T3452C:p.L1151S	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.034	B	0.023	B	0.258	N	1.000	N	0.345	N	2.93	T	-0.963	T	0.019	T	0.216	-0.580	1.394	3.49	0.439	1.671	4.638	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.139117	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	759	750	9	0
chr17	27977614	27977614	C	G	intronic	SSH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.993611	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	64	59	5	0
chr17	28003765	28003765	T	C	intronic	SSH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	28256807	28256807	C	G	intronic	SSH2	NaN	NaN	NaN	rs7209622	NaN	0.59405	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.444568	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	0	18	41
chr17	28257228	28257228	C	G	UTR5	SSH2	NM_001282129:c.-210G>C,NM_001282130:c.-210G>C	NaN	NaN	rs8071113	NaN	0.997404	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.552865	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	2	0	2	25
chr17	28395718	28395718	A	A	intronic	EFCAB5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	75	33	0	0
chr17	28407070	28407070	T	T	intronic	EFCAB5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	28407627	28407627	T	G	intronic	EFCAB5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr17	28434826	28434826	ACTTTTCT	AC,ACT,ACTT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	474.428	0	NaN	NA	NA	51	0	15	8
chr17	28511749	28511749	A	G	exonic	NSRP1	NaN	nonsynonymous SNV	NSRP1:NM_001261467:exon6:c.A572G:p.D191G,NSRP1:NM_032141:exon7:c.A734G:p.D245G	NaN	NaN	NaN	0.09	T	1.0	D	0.996	D	0.001	D	1.000	D	2.125	M	0.66	T	-0.539	T	0.290	T	0.657	4.208	21.8	6.06	2.322	6.865	14.354	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.215052	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	36	31	5	0
chr17	28754293	28754293	T	C	intronic	CPD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	11	3	7	0
chr17	28778720	28778720	G	C	intronic	CPD	NaN	NaN	NaN	rs2253256	NaN	0.68131	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.851642	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	0	34	47
chr17	2883588	2883588	C	A	exonic	RAP1GAP2	NaN	nonsynonymous SNV	RAP1GAP2:NM_001100398:exon8:c.C559A:p.L187M,RAP1GAP2:NM_015085:exon9:c.C604A:p.L202M	rs17762452	NaN	0.297125	0.26	T	0.173	B	0.174	B	0.076	N	0.999	P	0	N	-3.36	D	-1.104	T	0.000	T	0.091	1.541	11.10	4.02	1.113	0.540	9.932	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	486	383	103	34
chr17	28857590	28857590	T	C	intergenic	GOSR1,TBC1D29	dist=3758;dist=28994	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	28878200	28878200	T	C	intergenic	GOSR1,TBC1D29	dist=24368;dist=8384	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	2888249	2888249	A	G	intronic	RAP1GAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.771906	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	369	350	19	0
chr17	2888250	2888250	T	A	intronic	RAP1GAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.467576	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	186	163	23	0
chr17	28895404	28895404	A	G	intergenic	TBC1D29,LRRC37BP1	dist=4895;dist=8079	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	16	10	6	0
chr17	2910884	2910884	A	A	intronic	RAP1GAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	2910886	2910886	G	G	intronic	RAP1GAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	29130911	29130911	T	C	intronic	CRLF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	51	4	47	0
chr17	29151667	29151667	C	T	exonic	CRLF3	NaN	nonsynonymous SNV	CRLF3:NM_015986:exon1:c.G3A:p.M1I	NaN	NaN	NaN	0	D	0.001	B	0.003	B	0.613	N	0.999	N	.	.	1.62	T	-1.011	T	0.052	T	0.394	2.688	14.95	1.47	0.062	0.218	5.356	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.810578	nearby_gap_events	REJECT	53	47	6	0
chr17	29162212	29162212	T	G	exonic	ATAD5	NaN	synonymous SNV	ATAD5:NM_024857:exon2:c.T1113G:p.V371V	rs78909753	NaN	0.0107827	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.611339	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	12	12	5
chr17	29184192	29184192	A	C	intronic	ATAD5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	40	4	36	0
chr17	2921306	2921306	T	T	intronic	RAP1GAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	2921438	2921438	C	T	exonic	RAP1GAP2	NaN	synonymous SNV	RAP1GAP2:NM_001100398:exon17:c.C1533T:p.S511S,RAP1GAP2:NM_015085:exon18:c.C1578T:p.S526S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	52	23	29	1
chr17	29221945	29221945	C	G	UTR3	ATAD5	NM_024857:c.*14C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	29221946	29221946	A	G	UTR3	ATAD5	NM_024857:c.*15A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	29226630	29226630	T	A	intronic	TEFM	NaN	NaN	NaN	rs28539246	NaN	0.479433	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	107.498	0	NaN	NA	NA	35	2	33	11
chr17	29226652	29226652	A	G	intronic	TEFM	NaN	NaN	NaN	rs9897628	NaN	0.479433	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	85.4523	0	NaN	NA	NA	58	1	57	5
chr17	29261367	29261367	A	G	intronic	ADAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	14	8	6	0
chr17	2929635	2929635	T	T	intronic	RAP1GAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	293050	293050	A	G	exonic	FAM101B	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	0.23	T	0.999	D	0.992	D	0.000	D	0.998	D	2.25	M	.	.	-0.227	T	0.418	T	0.846	4.794	27.0	5.54	2.244	8.948	15.171	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.559934	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	338	331	7	0
chr17	293094	293094	A	G	exonic	FAM101B	NaN	unknown	UNKNOWN	rs189011908	NaN	0.00179712	0	D	0.675	P	0.197	B	0.005	N	0.997	D	2.095	M	.	.	-0.491	T	0.149	T	0.612	4.320	22.7	5.54	2.244	8.948	15.171	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	334	85	249	1
chr17	2935577	2935577	T	G	intronic	RAP1GAP2	NaN	NaN	NaN	rs4239038	NaN	0.623602	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	132	111	21	47
chr17	29482988	29482988	C	C	intronic	NF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	83	75	0	0
chr17	29486152	29486152	G	A	intronic	NF1	NaN	NaN	NaN	rs2952976	NaN	0.509784	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	246.69687	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	95	0	95	51
chr17	29528335	29528335	T	A	intronic	NF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.506617	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	76	69	7	0
chr17	29563047	29563047	A	C	intronic	NF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	29579995	29579995	G	A	exonic	NF1	NaN	nonsynonymous SNV	NF1:NM_001042492:exon31:c.G4150A:p.E1384K	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.979	D	0.982	D	0.000	D	1.000	D	1.565	L	3.1	T	-1.213	T	0.062	T	0.813	3.976	20.4	5.92	2.809	9.434	20.321	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.309921	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	53	47	6	0
chr17	29631202	29631202	C	T	UTR3	EVI2B	NM_006495:c.*79G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.598583	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	157	145	12	0
chr17	29646032	29646032	G	A	exonic	EVI2A	NaN	synonymous SNV	EVI2A:NM_001003927:exon3:c.C69T:p.S23S	rs1129506	NaN	0.591853	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	198.108164	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	68	0	68	44
chr17	29661845	29661845	T	A	intronic	NF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.422473	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	190	177	13	0
chr17	29679245	29679245	TG	T,TA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	974.82	0	NaN	NA	NA	103	0	15	5
chr17	29683540	29683540	G	A	exonic	NF1	NaN	nonsynonymous SNV	NF1:NM_000267:exon51:c.G7615A:p.E2539K,NF1:NM_001042492:exon52:c.G7678A:p.E2560K	NaN	NaN	NaN	0.68	T	0.974	D	0.969	D	0.000	D	1.000	D	1.445	L	3.34	T	-0.904	T	0.233	T	0.835	4.117	21.2	5.66	2.832	8.998	20.125	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.966076	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	164	144	20	0
chr17	29685492	29685492	T	C	intronic	NF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.727052	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	415	391	24	0
chr17	29685774	29685774	A	T	intronic	NF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	5	9	0
chr17	29761215	29761215	A	A	intronic	RAB11FIP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	29850898	29850898	C	G	intronic	RAB11FIP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.074792	nearby_gap_events	REJECT	104	91	13	0
chr17	29852368	29852368	A	A	intronic	RAB11FIP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	29936896	29936896	C	A	intergenic	MIR365B,COPRS	dist=34356;dist=241988	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	30169511	30169511	A	C	intergenic	MIR365B,COPRS	dist=266971;dist=9373	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	30169512	30169512	T	A	intergenic	MIR365B,COPRS	dist=266972;dist=9372	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	30214205	30214205	A	C	intronic	UTP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.2513	0	NaN	NA	NA	43	37	7	6
chr17	30222002	30222002	T	C	exonic	UTP6	NaN	nonsynonymous SNV	UTP6:NM_018428:exon3:c.A206G:p.Q69R	rs3760454	NaN	0.355431	1	T	0.075	B	0.029	B	0.000	D	0.214	P	-1.135	N	1.65	T	-0.988	T	0.000	T	0.06	1.604	11.32	5.31	2.118	4.609	13.777	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	49.237446	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	16	20	35
chr17	30267447	30267447	T	A	exonic	SUZ12	NaN	nonsynonymous SNV	SUZ12:NM_015355:exon3:c.T328A:p.F110I	NaN	NaN	NaN	0	D	0.518	P	0.168	B	0.000	D	1.000	D	1.545	L	1.58	T	-1.032	T	0.076	T	0.81	2.649	14.82	4.81	1.929	5.875	14.681	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.33921	0	NaN	NA	NA	15	13	2	0
chr17	3029884	3029884	T	C	downstream	OR1G1	NaN	NaN	NaN	rs187540032	NaN	0.00179712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	236	179	57	1
chr17	30320860	30320860	C	G	intronic	SUZ12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.768139	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	208	191	17	0
chr17	30320861	30320861	T	C	intronic	SUZ12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSM	3	Somatic	0.03948134570091097	NA	0	22	36.436519	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	69	49	20	0
chr17	30320871	30320871	T	A	intronic	SUZ12	NaN	NaN	NaN	rs183542211	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.0014424262864421809	NA	0	0	31.315423	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	128	105	23	0
chr17	30502438	30502438	A	A	intronic	RHOT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr17	30502856	30502856	T	G	intronic	RHOT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.196313	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	57	52	5	0
chr17	30519332	30519332	A	C	intronic	RHOT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr17	30520122	30520122	T	T	intronic	RHOT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr17	30530822	30530822	A	A	intronic	RHOT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	30536564	30536564	A	A	intronic	RHOT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	30632304	30632304	G	G	intronic	RHBDL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr17	30662509	30662509	A	A	intronic	C17orf75	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	30669143	30669143	G	T	exonic	C17orf75	NaN	nonsynonymous SNV	C17orf75:NM_022344:exon1:c.C16A:p.Q6K	NaN	NaN	NaN	0.14	T	0.571	P	0.167	B	0.004	N	0.990	D	0.69	N	.	.	-0.967	T	0.108	T	0.238	2.168	13.21	4.99	2.584	5.986	16.224	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.130117	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	51	47	4	0
chr17	30669145	30669145	A	C	exonic	C17orf75	NaN	nonsynonymous SNV	C17orf75:NM_022344:exon1:c.T14G:p.L5W	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	0.793	D	1.355	L	.	.	-0.267	T	0.297	T	0.506	1.847	12.13	4.99	2.089	5.675	13.067	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.557325	clustered_read_position	REJECT	48	44	4	0
chr17	30677413	30677413	G	C	intronic	ZNF207	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.53604	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	173	154	19	0
chr17	30687522	30687522	G	C	intronic	ZNF207	NaN	NaN	NaN	rs6505295	NaN	0.515375	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	106.07686	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	0	36	46
chr17	30693818	30693818	A	A	intronic	ZNF207	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr17	30791503	30791503	C	T	intronic	PSMD11	NaN	NaN	NaN	rs2302276	ID=COSN165387;OCCURENCE=1(NS)	0.554113	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	778.096	0	NaN	NA	NA	21	1	20	8
chr17	30791509	30791509	C	G	intronic	PSMD11	NaN	NaN	NaN	rs2302277	ID=COSN165388;OCCURENCE=1(NS)	0.224641	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1057.94	0	NaN	NA	NA	75	0	75	9
chr17	30796001	30796001	T	C	intronic	PSMD11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	12	6	6	0
chr17	30807000	30807000	A	A	intronic	PSMD11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr17	30981683	30981683	T	C	intronic	MYO1D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	30981684	30981684	C	T	intronic	MYO1D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	3100802	3100802	C	A	upstream	OR1A2	NaN	NaN	NaN	rs2241094	NaN	0.112819	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	43	7	36	15
chr17	3100827	3100827	T	C	exonic	OR1A2	NaN	synonymous SNV	OR1A2:NM_012352:exon1:c.T15C:p.N5N	rs2241093	ID=COSM148147;OCCURENCE=1(stomach)	0.291534	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	41	35	6	32
chr17	31082478	31082478	T	T	intronic	MYO1D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	23	19	0	0
chr17	3119871	3119871	C	T	downstream	OR1A1	NaN	NaN	NaN	rs17174920	NaN	0.361022	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	548.192	0	NaN	NA	NA	103	26	77	17
chr17	31268125	31268125	A	A	UTR3	TMEM98	NM_015544:c.*114A>A,NM_001033504:c.*114A>A,NM_001301746:c.*114A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr17	31319069	31319069	A	C	intronic	SPACA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.146981	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	290	272	18	0
chr17	31324423	31324423	C	T	intronic	SPACA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	31324458	31324458	C	A	intronic	SPACA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.95128	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	71	65	6	0
chr17	31340747	31340747	T	C	UTR3	ASIC2	NM_001094:c.*236A>G,NM_183377:c.*236A>G	NaN	NaN	rs28932	NaN	0.0547125	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	31355208	31355208	T	T	intronic	ASIC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	31618164	31618164	C	T	intronic	ASIC2	NaN	NaN	NaN	rs731601	NaN	0.221645	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	3181384	3181384	C	T	exonic	OR3A2	NaN	synonymous SNV	OR3A2:NM_002551:exon1:c.G846A:p.G282G	rs769434	NaN	0.177915	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	113	NaN	NA	NA	234	189	45	14
chr17	32647722	32647722	T	A	intronic	CCL8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr17	32683677	32683677	A	A	intronic	CCL13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	7	0	0
chr17	32684643	32684643	C	T	intronic	CCL13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.819847	possible_contamination	REJECT	61	57	4	0
chr17	32904480	32904480	G	A	UTR3	C17orf102	NM_207454:c.*66C>T	NaN	NaN	rs887231	NaN	0.629593	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	20.4191	0	NaN	NA	NA	184	100	84	1
chr17	32905755	32905755	T	T	intronic	C17orf102	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	32908064	32908064	T	C	UTR5	TMEM132E	NM_207313:c.-32T>C,NM_001304438:c.-32T>C	NaN	NaN	rs4795938	NaN	0.865415	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	34.8074	0	14.049073	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	6	6	39
chr17	32908236	32908236	A	A	intronic	TMEM132E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	32927866	32927866	G	C	intronic	TMEM132E	NaN	NaN	NaN	rs11653925	NaN	0.561302	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	10	1	9	0
chr17	32930312	32930312	G	A	intronic	TMEM132E	NaN	NaN	NaN	rs4795012	NaN	0.557907	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	32943415	32943415	A	G	intronic	TMEM132E	NaN	NaN	NaN	rs9902302	NaN	0.73103	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr17	32949227	32949227	A	A	intronic	TMEM132E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	32957176	32957176	C	C	intronic	TMEM132E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	117	88	0	0
chr17	32957197	32957197	G	T	intronic	TMEM132E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	51	36	11	0
chr17	32962155	32962155	A	A	intronic	TMEM132E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	32990443	32990443	T	C	intergenic	TMEM132E,CCT6B	dist=24101;dist=264435	NaN	NaN	rs11080291	NaN	0.853435	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr17	33151767	33151767	T	C	intergenic	TMEM132E,CCT6B	dist=185425;dist=103111	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	33182709	33182709	A	A	intergenic	TMEM132E,CCT6B	dist=216367;dist=72169	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	33266453	33266453	A	C	intronic	CCT6B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	33286753	33286753	A	C	intronic	CCT6B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr17	33288252	33288252	T	T	intronic	CCT6B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	33289046	33289046	G	C	exonic	ZNF830	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF830:NM_052857:exon1:c.G461C:p.S154T	rs3744355	NaN	0.127196	0.61	T	0.002	B	0.002	B	0.003	N	0.000	P	0.49	N	2.42	T	-0.919	T	0.000	T	0.016	-0.371	2.252	4.67	1.604	4.666	12.440	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.979	0	NaN	NA	NA	61	30	31	0
chr17	33310486	33310486	A	G	exonic	LIG3	NaN	synonymous SNV	LIG3:NM_002311:exon2:c.A462G:p.T154T,LIG3:NM_013975:exon2:c.A462G:p.T154T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.012934797055191603	NA	0	0	NaN	NA	NA	25	13	12	0
chr17	3337057	3337057	A	G	exonic	OR1E2	NaN	nonsynonymous SNV	OR1E2:NM_001303278:exon1:c.T79C:p.C27R,OR1E2:NM_003554:exon1:c.T79C:p.C27R	rs769431	NaN	0.747005	0	D	0.008	B	0.009	B	0.131	N	1.000	P	0.695	N	4.1	T	-1.007	T	0.000	T	0.215	2.409	14.02	4.24	2.252	0.725	8.665	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	31.7576	0	NaN	NA	NA	24	15	8	33
chr17	33428407	33428407	G	A	ncRNA_intronic	RAD51L3-RFFL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	33428408	33428408	A	G	ncRNA_intronic	RAD51L3-RFFL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	33428412	33428412	A	C	ncRNA_intronic	RAD51L3-RFFL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	33428414	33428414	A	C	ncRNA_intronic	RAD51L3-RFFL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	33430667	33430667	A	C	ncRNA_intronic	RAD51L3-RFFL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	2	7	0
chr17	33434170	33434170	A	A	ncRNA_intronic	RAD51L3-RFFL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	19	14	0	0
chr17	3343642	3343642	A	C	intronic	SPATA22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.261151	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	75	66	9	0
chr17	33446242	33446242	A	A	ncRNA_intronic	RAD51L3-RFFL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr17	33456373	33456373	T	T	intronic	FNDC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	33456763	33456763	A	A	intronic	FNDC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr17	33462253	33462253	C	A	intronic	NLE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	34	8	26	0
chr17	33464864	33464864	C	T	exonic	NLE1	NaN	nonsynonymous SNV	NLE1:NM_018096:exon5:c.G506A:p.R169K	rs7215209	NaN	0.848842	1	T	0.0	B	0.001	B	0.000	N	0.000	P	-0.71	N	1.61	T	-0.961	T	0.000	T	0.037	0.456	6.477	3.95	0.414	2.347	6.497	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	57.332786	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	24	29	42
chr17	33469279	33469279	G	C	exonic	NLE1	NaN	nonsynonymous SNV	NLE1:NM_018096:exon1:c.C16G:p.P6A	rs1471615	NaN	0.993411	0.47	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	0.145	N	0.51	T	-0.984	T	0.000	T	0.021	2.088	12.94	3.37	1.193	0.511	5.541	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	50.1426	0	NaN	NA	NA	69	0	69	28
chr17	33476085	33476085	G	T	intronic	UNC45B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	3349969	3349969	A	G	intronic	SPATA22	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	3352294	3352294	A	G	exonic	SPATA22	NaN	nonsynonymous SNV	SPATA22:NM_001170696:exon5:c.T350C:p.I117T,SPATA22:NM_001170695:exon6:c.T479C:p.I160T,SPATA22:NM_001170697:exon6:c.T479C:p.I160T,SPATA22:NM_001170698:exon6:c.T479C:p.I160T,SPATA22:NM_001170699:exon6:c.T479C:p.I160T,SPATA22:NM_032598:exon6:c.T479C:p.I160T	rs1488689	NaN	0.266973	0.45	T	0.007	B	0.003	B	0.247	N	1.000	P	0.205	N	2.31	T	-0.931	T	0.000	T	0.192	-1.004	0.254	2.79	0.851	0.736	6.735	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.074065	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	21	5	12
chr17	3352331	3352331	C	T	exonic	SPATA22	NaN	nonsynonymous SNV	SPATA22:NM_001170696:exon5:c.G313A:p.V105M,SPATA22:NM_001170695:exon6:c.G442A:p.V148M,SPATA22:NM_001170697:exon6:c.G442A:p.V148M,SPATA22:NM_001170698:exon6:c.G442A:p.V148M,SPATA22:NM_001170699:exon6:c.G442A:p.V148M,SPATA22:NM_032598:exon6:c.G442A:p.V148M	rs1488690	NaN	0.266973	0.33	T	0.005	B	0.005	B	0.882	N	1.000	P	0.55	N	2.2	T	-0.973	T	0.000	T	0.236	0.114	4.615	-9.61	-1.929	-1.651	15.723	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.090754	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	23	5	12
chr17	33592046	33592046	CT	C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	275.27	0	NaN	NA	NA	76	27	46	0
chr17	33680840	33680840	T	C	exonic	SLFN11	NaN	synonymous SNV	SLFN11:NM_152270:exon4:c.A1437G:p.Q479Q,SLFN11:NM_001104589:exon5:c.A1437G:p.Q479Q,SLFN11:NM_001104587:exon6:c.A1437G:p.Q479Q,SLFN11:NM_001104588:exon6:c.A1437G:p.Q479Q,SLFN11:NM_001104590:exon6:c.A1437G:p.Q479Q	rs17854753	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.050461	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	0	36	58
chr17	33749493	33749493	A	C	exonic	SLFN12	NaN	nonsynonymous SNV	SLFN12:NM_001289009:exon2:c.T555G:p.F185L,SLFN12:NM_018042:exon2:c.T555G:p.F185L	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.999	D	0.986	D	.	.	1.000	N	2.715	M	3.27	T	-1.091	T	0.064	T	0.606	2.950	15.83	-1.74	-0.245	0.157	7.458	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.776299	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	147	139	8	0
chr17	33749919	33749919	A	C	exonic	SLFN12	NaN	nonsynonymous SNV	SLFN12:NM_001289009:exon2:c.T129G:p.S43R,SLFN12:NM_018042:exon2:c.T129G:p.S43R	rs1849733	ID=COSM1179770;OCCURENCE=1(prostate)	0.376198	0.73	T	0.035	B	0.003	B	.	.	1.000	P	0.125	N	3.93	T	-0.912	T	0.000	T	0.257	-0.406	2.100	-6.41	-0.829	-2.082	3.679	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	116.937351	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	102	56	46	48
chr17	33769034	33769034	G	A	exonic	SLFN13	NaN	synonymous SNV	SLFN13:NM_144682:exon5:c.C1470T:p.T490T	rs62078110	ID=COSM288119;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.45607	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	45.6009	0	NaN	NA	NA	228	185	44	18
chr17	33769038	33769038	C	A	exonic	SLFN13	NaN	nonsynonymous SNV	SLFN13:NM_144682:exon5:c.G1466T:p.R489L	rs62078111	NaN	0.218051	0.68	T	0.388	B	0.083	B	0.287	N	1.000	P	1.355	L	4.49	T	-0.948	T	0.008	T	0.197	0.401	6.177	-6.09	-1.430	-7.189	5.552	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	43.2884	0	NaN	NA	NA	234	190	44	6
chr17	33805263	33805263	A	C	intronic	SLFN12L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	33807250	33807250	T	A	intronic	SLFN12L	NaN	NaN	NaN	rs9905892	NaN	0.771765	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	224.925874	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	75	1	74	51
chr17	33814632	33814632	T	G	intronic	SLFN12L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	33814735	33814735	G	A	intronic	SLFN12L	NaN	NaN	NaN	rs4796088	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	51.912553	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	150	121	29	0
chr17	33825517	33825517	C	T	intergenic	SLFN12L,SLFN14	dist=10759;dist=49627	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	33880528	33880528	G	T	intronic	SLFN14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	62	47	15	0
chr17	3392772	3392772	A	T	intronic	ASPA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	3392773	3392773	T	C	intronic	ASPA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	33932910	33932910	C	A	intronic	AP2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	33932912	33932912	T	G	intronic	AP2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	33932913	33932913	C	G	intronic	AP2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	33932914	33932914	T	A	intronic	AP2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	33932916	33932916	T	C	intronic	AP2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	33935309	33935309	T	C	exonic	AP2B1	NaN	nonsynonymous SNV	AP2B1:NM_001030006:exon5:c.T428C:p.V143A,AP2B1:NM_001282:exon5:c.T428C:p.V143A	NaN	NaN	NaN	0	D	0.869	P	0.796	P	0.000	D	1.000	D	2.87	M	1.67	T	-0.637	T	0.200	T	0.824	4.128	21.3	5.41	2.060	7.956	14.672	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.22202	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	963	953	10	0
chr17	33935493	33935493	A	G	intronic	AP2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	4	5	0
chr17	33935495	33935495	A	G	intronic	AP2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	10	4	3	0
chr17	33935497	33935497	T	A	intronic	AP2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr17	33968871	33968871	A	T	intronic	AP2B1	NaN	NaN	NaN	rs225270	NaN	0.879193	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.388819	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	0	35	55
chr17	33998733	33998733	C	C	intronic	AP2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	33998734	33998734	T	T	intronic	AP2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	33998735	33998735	T	T	intronic	AP2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	34073362	34073362	T	C	exonic	GAS2L2	NaN	nonsynonymous SNV	GAS2L2:NM_139285:exon6:c.A1154G:p.Q385R	NaN	NaN	NaN	0.64	T	0.02	B	0.018	B	0.016	N	1.000	N	1.845	L	2.21	T	-0.966	T	0.034	T	0.086	1.104	9.506	1.33	0.024	0.121	7.598	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr17	34088075	34088075	A	A	intronic	C17orf50	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr17	34161511	34161511	T	G	intronic	TAF15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.273684210526315	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr17	34161658	34161658	T	G	intronic	TAF15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03343108504398752	NA	0	0	NaN	NA	NA	21	15	6	0
chr17	34182423	34182423	A	A	intronic	HEATR9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr17	3422011	3422011	G	A	exonic	TRPV3	NaN	synonymous SNV	TRPV3:NM_001258205:exon15:c.C1944T:p.S648S,TRPV3:NM_145068:exon15:c.C1944T:p.S648S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.673472	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	528	520	8	0
chr17	3424220	3424220	A	G	intronic	TRPV3	NaN	NaN	NaN	rs72634011	NaN	0.265775	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	67	NaN	NA	NA	110	15	95	13
chr17	34264746	34264746	G	T	intronic	LYZL6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.960825	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	69	56	13	0
chr17	3427566	3427566	G	A	exonic	TRPV3	NaN	synonymous SNV	TRPV3:NM_001258205:exon13:c.C1669T:p.L557L,TRPV3:NM_145068:exon13:c.C1669T:p.L557L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.19381	nearby_gap_events	REJECT	64	55	9	0
chr17	34277161	34277161	A	T	intergenic	LYZL6,CCL16	dist=6447;dist=26368	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	34277163	34277163	G	T	intergenic	LYZL6,CCL16	dist=6449;dist=26366	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	34304552	34304552	A	T	UTR3	CCL16	NM_004590:c.*50T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	34305162	34305162	T	T	intronic	CCL16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	33	28	0	0
chr17	34305371	34305371	A	C	intronic	CCL16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	34324926	34324926	A	G	ncRNA_intronic	CCL15-CCL14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.766204	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	31	28	3	0
chr17	3433521	3433521	A	A	intronic	TRPV3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	34340999	34340999	G	T	intronic	CCL23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr17	3458127	3458127	C	G	exonic	TRPV3	NaN	nonsynonymous SNV	TRPV3:NM_001258205:exon2:c.G18C:p.K6N,TRPV3:NM_145068:exon2:c.G18C:p.K6N	NaN	NaN	NaN	0.35	T	0.998	D	0.978	D	0.000	D	0.550	D	0.695	N	0.97	T	-0.870	T	0.128	T	0.383	3.612	18.38	3.82	1.167	0.370	9.165	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.626018	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	159	142	17	0
chr17	3458128	3458128	T	G	exonic	TRPV3	NaN	nonsynonymous SNV	TRPV3:NM_001258205:exon2:c.A17C:p.K6T,TRPV3:NM_145068:exon2:c.A17C:p.K6T	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.998	D	0.969	D	0.000	D	0.583	D	0.695	N	0.94	T	-0.780	T	0.140	T	0.721	3.536	18.05	4.79	1.943	1.302	11.022	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.966481	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	158	140	18	0
chr17	3458130	3458130	G	T	exonic	TRPV3	NaN	synonymous SNV	TRPV3:NM_001258205:exon2:c.C15A:p.P5P,TRPV3:NM_145068:exon2:c.C15A:p.P5P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.787762	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	153	136	17	0
chr17	3474660	3474660	G	A	intronic	TRPV1	NaN	NaN	NaN	rs3826503	NaN	0.227436	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1249.47	0	NaN	NA	NA	101	0	101	19
chr17	3475381	3475381	C	T	intronic	TRPV1	NaN	NaN	NaN	rs117452381	NaN	0.00798722	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	68	57	11	2
chr17	3475405	3475405	C	T	intronic	TRPV1	NaN	NaN	NaN	rs224549	NaN	0.867612	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	194.895873	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	73	2	71	45
chr17	34820996	34820996	A	G	intergenic	TBC1D3B,ZNHIT3	dist=12904;dist=21475	NaN	NaN	rs9911791	NaN	0.43131	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	34849771	34849771	T	C	exonic	ZNHIT3	NaN	synonymous SNV	ZNHIT3:NM_001281432:exon4:c.T207C:p.D69D,ZNHIT3:NM_004773:exon4:c.T207C:p.D69D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.951601	possible_contamination	REJECT	145	139	6	0
chr17	34863176	34863176	T	T	intronic	MYO19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	3486703	3486703	T	A	exonic	TRPV1	NaN	nonsynonymous SNV	TRPV1:NM_080706:exon8:c.A1405T:p.T469S,TRPV1:NM_018727:exon9:c.A1405T:p.T469S,TRPV1:NM_080705:exon9:c.A1405T:p.T469S,TRPV1:NM_080704:exon10:c.A1405T:p.T469S	NaN	NaN	NaN	0.35	T	0.102	B	0.043	B	0.117	N	1.000	N	0.46	N	-2.84	D	-0.568	T	0.492	T	0.364	0.612	7.297	4.02	0.875	1.261	11.743	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	70.1098	0	NaN	NA	NA	225	174	52	7
chr17	34871652	34871652	T	T	intronic	MYO19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr17	34883816	34883816	T	T	intronic	MYO19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	34892932	34892932	T	T	intronic	PIGW	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	3491616	3491616	T	C	exonic	TRPV1	NaN	nonsynonymous SNV	TRPV1:NM_080706:exon6:c.A1090G:p.R364G,TRPV1:NM_018727:exon7:c.A1090G:p.R364G,TRPV1:NM_080705:exon7:c.A1090G:p.R364G,TRPV1:NM_080704:exon8:c.A1090G:p.R364G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	2.61	M	-2.56	D	0.720	D	0.827	D	0.833	4.003	20.5	0.815	0.004	2.503	13.107	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.803439	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	264	258	6	0
chr17	3493533	3493533	A	G	intronic	TRPV1	NaN	NaN	NaN	rs161387	NaN	0.996605	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	68.23413	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	2	24	58
chr17	34943719	34943719	C	T	intronic	GGNBP2	NaN	NaN	NaN	rs3744593	NaN	0.352835	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	308.142	0	NaN	NA	NA	69	24	45	38
chr17	34950677	34950677	T	A	intronic	DHRS11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	34954512	34954512	C	T	intronic	DHRS11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.716093	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	456	432	24	0
chr17	34958155	34958155	T	T	UTR5	MRM1	NM_024864:c.-85T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	35002809	35002809	C	A	intergenic	MRM1,LHX1	dist=37402;dist=291963	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	31	23	8	0
chr17	35036386	35036386	G	T	intergenic	MRM1,LHX1	dist=70979;dist=258386	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	3513835	3513835	T	T	UTR3	SHPK	NM_013276:c.*19A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr17	3518428	3518428	T	T	intronic	SHPK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	35185861	35185861	G	A	intergenic	MRM1,LHX1	dist=220454;dist=108911	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	35307503	35307503	T	T	intronic	AATF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	35310174	35310174	T	G	intronic	AATF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	7	3	0
chr17	35414006	35414006	C	T	UTR3	AATF	NM_012138:c.*42C>T	NaN	NaN	rs11653434	NaN	0.0377396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	94.371782	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	121	76	45	8
chr17	35479368	35479368	T	A	intronic	ACACA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	4	3	0
chr17	35479369	35479369	T	G	intronic	ACACA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr17	35479370	35479370	T	C	intronic	ACACA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr17	35479374	35479374	A	C	intronic	ACACA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr17	35486460	35486460	A	C	intronic	ACACA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	2	1	0
chr17	35567339	35567339	T	T	intronic	ACACA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	3559767	3559767	T	C	intronic	CTNS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	3	5	0
chr17	35604894	35604894	T	T	intronic	ACACA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	35608875	35608875	T	T	intronic	ACACA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	35616476	35616476	C	T	intronic	ACACA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.583316		KEEP	32	28	4	0
chr17	35620816	35620816	A	G	intronic	ACACA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.180115	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	67	58	9	0
chr17	35631158	35631158	A	G	exonic	ACACA	NaN	nonsynonymous SNV	ACACA:NM_198837:exon7:c.T649C:p.S217P,ACACA:NM_198838:exon8:c.T589C:p.S197P,ACACA:NM_198834:exon9:c.T934C:p.S312P,ACACA:NM_198836:exon9:c.T823C:p.S275P,ACACA:NM_198839:exon13:c.T823C:p.S275P	NaN	NaN	NaN	0.34	T	0.059	B	0.071	B	0.100	N	1.000	D	0.895	L	-4.53	D	0.178	D	0.778	D	0.432	2.349	13.81	3.76	1.064	2.595	2.210	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.593515	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	275	254	21	0
chr17	3563124	3563124	C	T	intronic	CTNS	NaN	NaN	NaN	rs78671385	NaN	0.00339457	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	41	18.021394	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	23	10	1
chr17	35631286	35631286	A	A	intronic	ACACA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr17	3563339	3563339	C	T	intronic	CTNS	NaN	NaN	NaN	rs222753	NaN	0.265974	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	107.183	0	26.825893	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	3	14	36
chr17	3563963	3563963	C	G	exonic	CTNS	NaN	nonsynonymous SNV	CTNS:NM_001031681:exon13:c.C1138G:p.P380A	rs2873624	NaN	0.228634	0.63	T	0.006	B	0.004	B	0.629	N	1.000	P	0	N	-3.56	D	-1.009	T	0.000	T	0.055	-0.850	0.551	1.44	0.408	0.328	4.531	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	193	153	40	28
chr17	35696820	35696820	AAAAG	A,AAGAG,GAAAG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	495.19	0	NaN	NA	NA	55	0	42	6
chr17	35696822	35696822	A	G	intronic	ACACA	NaN	NaN	NaN	rs7502476	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	10	2	8	0
chr17	3577273	3577273	A	G	ncRNA_intronic	P2RX5-TAX1BP3	NaN	NaN	NaN	rs160587	NaN	0.56849	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	63	NaN	NA	NA	118	98	20	0
chr17	35827719	35827719	T	A	intronic	TADA2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.90058	0	NaN	NA	NA	119	105	21	9
chr17	3585094	3585094	C	A	ncRNA_intronic	P2RX5-TAX1BP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.579418	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	51	44	7	0
chr17	35870984	35870984	G	A	intronic	DUSP14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	3592097	3592097	A	A	ncRNA_intronic	P2RX5-TAX1BP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr17	35921186	35921186	C	G	intronic	SYNRG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	16	5	10	0
chr17	35932012	35932012	T	C	exonic	SYNRG	NaN	nonsynonymous SNV	SYNRG:NM_001163544:exon8:c.A742G:p.M248V,SYNRG:NM_001163545:exon8:c.A739G:p.M247V,SYNRG:NM_001163546:exon8:c.A742G:p.M248V,SYNRG:NM_001163547:exon8:c.A742G:p.M248V,SYNRG:NM_080550:exon8:c.A742G:p.M248V,SYNRG:NM_198882:exon8:c.A742G:p.M248V,SYNRG:NM_007247:exon9:c.A976G:p.M326V	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.968	D	0.959	D	0.000	D	1.000	D	1.905	M	1.02	T	-0.817	T	0.227	T	0.904	3.860	19.61	5.9	2.248	6.139	16.332	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.844314	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	644	635	9	0
chr17	3593554	3593554	A	A	ncRNA_intronic	P2RX5-TAX1BP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	35937382	35937382	T	T	intronic	SYNRG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	3594146	3594146	A	G	ncRNA_intronic	P2RX5-TAX1BP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	62	NaN	NA	NA	12	6	4	0
chr17	35960380	35960380	T	A	intronic	SYNRG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.769147	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	148	139	9	0
chr17	36047276	36047276	G	T	UTR3	HNF1B	NM_000458:c.*99C>A,NM_001165923:c.*99C>A,NM_001304286:c.*7C>A	NaN	NaN	rs2229295	NaN	0.268371	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.005507180317679895	NA	0	19	NaN	NA	NA	70	33	37	7
chr17	36059034	36059034	A	AG	intronic	HNF1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.157149	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7142.02	0	NaN	NA	NA	756	0	706	5
chr17	36064897	36064897	A	G	intronic	HNF1B	NaN	NaN	NaN	rs2107133	NaN	0.0467252	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1045.91	0	NaN	NA	NA	114	1	113	10
chr17	36091861	36091861	C	C	intronic	HNF1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	23	20	0	0
chr17	36093494	36093494	G	A	intronic	HNF1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.717541	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	161	144	17	0
chr17	36093863	36093863	G	C	intronic	HNF1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	20	11	9	0
chr17	3618298	3618298	C	T	intronic	ITGAE	NaN	NaN	NaN	rs1367950	NaN	0.352436	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	125	88	37	40
chr17	3627473	3627473	C	C	exonic	GSG2	NaN	synonymous SNV	GSG2:NM_031965:exon1:c.C244C:p.R82R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr17	3627840	3627840	G	A	exonic	GSG2	NaN	nonsynonymous SNV	GSG2:NM_031965:exon1:c.G611A:p.G204D	rs220462	NaN	0.257788	0	D	0.001	B	0.003	B	0.554	N	1.000	P	0.55	N	3.09	T	-0.904	T	0.000	T	0.009	2.158	13.17	-1.77	-0.416	-0.148	9.767	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	92	73	19	32
chr17	3628212	3628212	T	C	exonic	GSG2	NaN	nonsynonymous SNV	GSG2:NM_031965:exon1:c.T983C:p.I328T	rs220461	NaN	0.253594	0	D	0.001	B	0.0	B	0.857	N	1.000	P	0.345	N	3.24	T	-0.891	T	0.000	T	0.006	-0.663	1.096	-8.67	-2.050	-2.294	9.806	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	78	NaN	NA	NA	216	174	42	32
chr17	3628362	3628362	T	C	exonic	GSG2	NaN	nonsynonymous SNV	GSG2:NM_031965:exon1:c.T1133C:p.V378A	rs3809806	ID=COSM1128744;OCCURENCE=1(prostate)	0.53135	0	D	0.0	B	0.0	B	0.470	N	1.000	P	-0.55	N	3.47	T	-0.977	T	0.000	T	0.006	-0.610	1.283	0.989	-0.105	-0.223	4.249	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	87	NaN	NA	NA	354	287	67	44
chr17	3634306	3634306	T	T	intronic	ITGAE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	36486004	36486004	T	C	exonic	GPR179	NaN	nonsynonymous SNV	GPR179:NM_001004334:exon11:c.A3448G:p.K1150E	rs55727040	NaN	0.160743	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-0.975	N	1.22	T	-0.961	T	0.000	T	0.111	-1.109	0.135	5.09	1.380	0.195	11.095	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.888877	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	15	16	3
chr17	36486802	36486802	G	A	exonic	GPR179	NaN	nonsynonymous SNV	GPR179:NM_001004334:exon11:c.C2650T:p.R884W	rs72832277	NaN	0.0335463	0	D	0.071	B	0.007	B	0.261	N	0.994	N	0.975	L	0.57	T	-1.059	T	0.012	T	0.215	0.809	8.253	2.89	1.301	-0.459	11.843	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	138.295118	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	95	39	56	3
chr17	36489587	36489587	G	A	intronic	GPR179	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	36491166	36491166	A	A	intronic	GPR179	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	3649248	3649248	A	A	intronic	ITGAE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	36493119	36493119	A	G	intronic	GPR179	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.647775	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	146	139	7	0
chr17	3651149	3651149	C	C	intronic	ITGAE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	3651154	3651154	T	T	intronic	ITGAE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	36522122	36522122	T	G	intronic	SOCS7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr17	3654980	3654980	A	G	exonic	ITGAE	NaN	synonymous SNV	ITGAE:NM_002208:exon15:c.T1857C:p.N619N	rs11652878	NaN	0.141374	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	22	7.969749	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	2	3	8
chr17	36552269	36552269	C	C	intronic	SOCS7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	36571044	36571044	A	G	intergenic	SOCS7,ARHGAP23	dist=9198;dist=13676	NaN	NaN	rs72834033	NaN	0.0341454	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	3657175	3657175	T	C	exonic	ITGAE	NaN	nonsynonymous SNV	ITGAE:NM_002208:exon13:c.A1429G:p.I477V	rs220479	NaN	0.710264	1	T	0.001	B	0.002	B	.	.	1.000	P	-1.235	N	2.37	T	-1.005	T	0.000	T	0.037	-2.501	0.003	-3.83	-0.905	-0.538	6.700	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	219	43	176	49
chr17	3657298	3657298	T	G	intronic	ITGAE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	36617210	36617210	A	G	intronic	ARHGAP23	NaN	NaN	NaN	rs9898977	NaN	0.627396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	124.768803	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	49	0	49	50
chr17	36617251	36617251	A	A	intronic	ARHGAP23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr17	36619489	36619489	G	T	intronic	ARHGAP23	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.302698	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	99	89	10	0
chr17	36622757	36622757	C	A	exonic	ARHGAP23	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGAP23:NM_001199417:exon7:c.C833A:p.P278H	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.651	P	0.219	B	.	.	1.000	N	1.04	L	2.71	T	-1.036	T	0.029	T	0.387	1.904	12.33	1.03	0.032	-0.417	6.805	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.680844	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	20	17	3	0
chr17	36623134	36623134	C	A	exonic	ARHGAP23	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGAP23:NM_001199417:exon7:c.C1210A:p.P404T	NaN	NaN	NaN	0.24	T	0.069	B	0.082	B	.	.	1.000	N	0.345	N	2.78	T	-0.976	T	0.026	T	0.211	0.150	4.808	1.1	0.402	0.083	10.416	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	15	8	7	0
chr17	36623601	36623601	GA	G,GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	137.261	0	NaN	NA	NA	15	0	4	0
chr17	3663453	3663453	T	C	intronic	ITGAE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr17	36638947	36638947	GA	G,GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	137.146	0	NaN	NA	NA	14	0	2	5
chr17	36704615	36704615	C	A	intronic	SRCIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.131809	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	91	85	6	0
chr17	36704893	36704893	C	T	exonic	SRCIN1	NaN	nonsynonymous SNV	SRCIN1:NM_025248:exon17:c.G3170A:p.R1057Q	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.997	D	0.000	D	0.998	D	1.795	L	0.89	T	-0.680	T	0.219	T	0.368	5.022	29.6	4.02	2.351	5.539	13.859	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.47848	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	153	147	6	0
chr17	36705033	36705033	A	A	intronic	SRCIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr17	36707761	36707761	A	A	intronic	SRCIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	36715749	36715749	G	A	intronic	SRCIN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	15.7894	23	7.297777	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	8	5	3	3
chr17	36718610	36718610	T	A	intronic	SRCIN1	NaN	NaN	NaN	rs6503709	NaN	0.988219	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.328075	normal_lod	REJECT	3	0	3	8
chr17	36734706	36734706	CAGCCGG	C,CAGCCGC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1369.51	0	NaN	NA	NA	146	0	73	39
chr17	36830132	36830132	C	G	exonic	C17orf96	NaN	nonsynonymous SNV	C17orf96:NM_001130677:exon1:c.G617C:p.G206A	NaN	NaN	NaN	0.7	T	0.0	B	0.001	B	.	.	1.000	N	0	N	.	.	-0.998	T	0.028	T	0.042	0.591	7.186	-4.36	-0.648	-2.020	0.948	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	20	6.452686	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	2	0	2	0
chr17	36830236	36830236	G	A	exonic	C17orf96	NaN	synonymous SNV	C17orf96:NM_001130677:exon1:c.C513T:p.A171A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	36830836	36830836	A	T	UTR5	C17orf96	NM_001130677:c.-88T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.622441		KEEP	39	35	4	0
chr17	36871758	36871758	G	C	intronic	MLLT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.585496	nearby_gap_events	REJECT	74	58	16	0
chr17	36871759	36871759	C	G	intronic	MLLT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.494595	nearby_gap_events	REJECT	73	58	15	0
chr17	36881204	36881204	G	C	exonic	MLLT6	NaN	nonsynonymous SNV	MLLT6:NM_005937:exon19:c.G3215C:p.G1072A	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.0	B	0.023	N	0.962	N	0.2	N	2.71	T	-1.000	T	0.019	T	0.05	0.152	4.818	1.01	0.420	0.534	8.214	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0013208267299054896	NA	0	0	NaN	NA	NA	134	87	47	0
chr17	36881205	36881205	C	G	exonic	MLLT6	NaN	synonymous SNV	MLLT6:NM_005937:exon19:c.C3216G:p.G1072G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.001216143158734211	NA	0	0	NaN	NA	NA	145	94	51	0
chr17	36887535	36887535	T	C	intronic	CISD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.58442	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	147	143	4	0
chr17	36895973	36895973	A	T	intronic	PCGF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr17	36916896	36916896	A	A	intronic	PSMB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	36926181	36926181	T	T	intronic	PIP4K2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	36934107	36934107	A	A	intronic	PIP4K2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	36940403	36940403	A	A	intronic	PIP4K2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	36940404	36940404	A	G	intronic	PIP4K2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr17	36943044	36943044	CAA	C,CAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2241.39	0	NaN	NA	NA	262	0	31	13
chr17	36966832	36966832	T	C	exonic	CWC25	NaN	nonsynonymous SNV	CWC25:NM_017748:exon5:c.A515G:p.E172G	NaN	NaN	NaN	0.23	T	0.039	B	0.016	B	0.008	N	0.999	D	1.79	L	.	.	-0.889	T	0.190	T	0.384	2.153	13.16	3.91	0.840	2.136	9.514	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	132	125	7	0
chr17	36981327	36981327	G	C	intronic	CWC25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	21	13	8	2
chr17	37010014	37010014	A	A	UTR5	RPL23	NM_000978:c.-51T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr17	37042930	37042930	A	A	intronic	LASP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	3704568	3704568	A	A	upstream	ITGAE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	37054642	37054642	T	T	intronic	LASP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	4	0	0
chr17	37099899	37099899	G	T	exonic	FBXO47	NaN	nonsynonymous SNV	FBXO47:NM_001008777:exon8:c.C884A:p.A295D	NaN	NaN	NaN	0.55	T	0.02	B	0.01	B	0.003	N	1.000	N	0.69	N	0.23	T	-1.040	T	0.117	T	0.092	-0.039	3.815	4.94	1.503	4.298	13.673	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.740525	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	242	234	8	0
chr17	3719525	3719525	G	T	exonic	C17orf85	NaN	synonymous SNV	C17orf85:NM_001114118:exon11:c.C1350A:p.I450I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.852636	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	138	130	8	0
chr17	37235425	37235425	A	G	ncRNA_intronic	LOC100131347	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.496611	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	166	159	7	0
chr17	37239671	37239671	A	G	intronic	PLXDC1	NaN	NaN	NaN	rs9891236	NaN	0.853834	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.442656	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	19	18	50
chr17	37264315	37264315	T	T	intronic	PLXDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr17	37305681	37305681	T	T	intronic	PLXDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	37317500	37317500	T	T	intronic	ARL5C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	37353587	37353587	T	C	intronic	CACNB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	37356728	37356728	T	G	intronic	RPL19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.002459	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	12	7	5	0
chr17	37356731	37356731	G	T	intronic	RPL19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	24	11.048233	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	12	7	5	5
chr17	37356732	37356732	G	T	intronic	RPL19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	3	4	10
chr17	37369664	37369664	T	T	intronic	STAC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	37373071	37373071	G	T	exonic	STAC2	NaN	nonsynonymous SNV	STAC2:NM_198993:exon4:c.C578A:p.P193Q	NaN	NaN	NaN	0.61	T	0.988	D	0.771	P	0.000	D	0.956	D	1.32	L	-1.31	T	-0.287	T	0.456	T	0.433	3.885	19.75	4.5	1.310	3.635	12.987	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.050216	nearby_gap_events	REJECT	46	37	9	0
chr17	37373391	37373391	T	C	exonic	STAC2	NaN	nonsynonymous SNV	STAC2:NM_198993:exon3:c.A433G:p.K145E	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.996	D	0.000	D	0.999	D	2.39	M	-3.22	D	0.964	D	0.881	D	0.768	4.832	27.4	5.18	1.962	6.947	13.992	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.185668	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	467	459	8	0
chr17	37381693	37381693	C	C	exonic	STAC2	NaN	synonymous SNV	STAC2:NM_198993:exon1:c.G63G:p.G21G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	14	14	0	0
chr17	37420364	37420364	A	G	intronic	FBXL20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.412324	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	94	75	19	0
chr17	37420395	37420395	A	G	intronic	FBXL20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.241418	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	247	239	8	0
chr17	37441829	37441829	G	T	intronic	FBXL20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	145	65	50	0
chr17	3749286	3749286	A	C	intronic	C17orf85	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.95131	0	NaN	NA	NA	11	9	2	2
chr17	37566405	37566405	T	C	exonic	MED1	NaN	nonsynonymous SNV	MED1:NM_004774:exon17:c.A2069G:p.K690R	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.884	P	0.358	B	.	.	1.000	D	0.695	N	0.74	T	-0.985	T	0.102	T	0.199	2.660	14.86	5.59	2.124	8.008	15.767	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.823879	nearby_gap_events	REJECT	128	120	8	0
chr17	37566988	37566988	A	A	intronic	MED1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	20	16	0	0
chr17	37571445	37571445	A	G	intronic	MED1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	30	18	12	0
chr17	37649157	37649157	C	G	intronic	CDK12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr17	37649159	37649159	A	G	intronic	CDK12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	10	5	4	0
chr17	37649160	37649160	A	T	intronic	CDK12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr17	37649162	37649162	T	C	intronic	CDK12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr17	37649164	37649164	T	G	intronic	CDK12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr17	37657810	37657810	A	A	intronic	CDK12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	11	8	0	0
chr17	3769010	3769010	T	T	UTR3	CAMKK1	NM_172207:c.*188A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	3772871	3772871	A	A	exonic	CAMKK1	NaN	synonymous SNV	CAMKK1:NM_032294:exon14:c.T1251T:p.L417L,CAMKK1:NM_172206:exon14:c.T1251T:p.L417L,CAMKK1:NM_172207:exon15:c.T1365T:p.L455L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	32	24	0	0
chr17	3773326	3773326	A	A	intronic	CAMKK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr17	3775848	3775848	T	C	exonic	CAMKK1	NaN	nonsynonymous SNV	CAMKK1:NM_032294:exon12:c.A1124G:p.E375G,CAMKK1:NM_172206:exon12:c.A1124G:p.E375G,CAMKK1:NM_172207:exon13:c.A1238G:p.E413G	rs7214723	NaN	0.395367	.	.	0.011	B	0.088	B	0.078	N	0.000	P	0.88	L	0.78	T	-0.922	T	0.000	T	0.169	2.268	13.54	4.1	1.987	2.666	10.748	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.412159	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	15	5	35
chr17	3775993	3775993	C	T	intronic	CAMKK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	27	9.534468	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	7	2	5	0
chr17	37762139	37762139	G	A	exonic	NEUROD2	NaN	synonymous SNV	NEUROD2:NM_006160:exon2:c.C714T:p.P238P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.504791	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	190	180	10	0
chr17	37791753	37791753	T	G	intronic	PPP1R1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	71	NaN	NA	NA	18	2	16	0
chr17	37809956	37809956	A	G	exonic	STARD3	NaN	nonsynonymous SNV	STARD3:NM_001165937:exon2:c.A172G:p.T58A,STARD3:NM_001165938:exon2:c.A172G:p.T58A,STARD3:NM_006804:exon2:c.A172G:p.T58A	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.45	M	0.87	T	-0.500	T	0.263	T	0.787	2.029	12.74	4.48	1.798	8.900	14.080	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.157268	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	145	137	8	0
chr17	37814533	37814533	T	T	intronic	STARD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr17	37815438	37815438	G	T	intronic	STARD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.445821	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	7	3	4	0
chr17	37816461	37816461	T	C	intronic	STARD3	NaN	NaN	NaN	rs2952149	NaN	0.0303514	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	65.492688	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	10	28	6
chr17	37816658	37816658	C	T	intronic	STARD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.532566	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	62	59	3	0
chr17	37821822	37821822	G	T	intronic	TCAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.850137	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	58	51	7	0
chr17	37821842	37821842	A	C	intronic	TCAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	49	41	8	0
chr17	37829129	37829129	A	G	intronic	PGAP3	NaN	NaN	NaN	rs2247862	NaN	0.578874	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.04663174579885745	NA	0	59	NaN	NA	NA	85	60	25	50
chr17	37830852	37830852	A	G	intronic	PGAP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.629669	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	201	195	6	0
chr17	3783618	3783618	G	C	intronic	CAMKK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.40598	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	36	30	6	0
chr17	37841033	37841033	A	C	intronic	PGAP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	37842120	37842120	G	T	intronic	PGAP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.1014749621560745	NA	0	0	7.235006	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	81	75	6	0
chr17	3785518	3785518	T	T	intronic	CAMKK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	37856552	37856552	G	A	exonic	ERBB2	NaN	nonsynonymous SNV	ERBB2:NM_001289937:exon1:c.G61A:p.A21T,ERBB2:NM_004448:exon1:c.G61A:p.A21T	NaN	NaN	NaN	0.57	T	0.029	B	0.003	B	.	.	1.000	D	0.345	N	-0.94	T	-0.905	T	0.236	T	0.165	2.173	13.22	1.28	0.825	0.422	3.770	100	11	3035	SNV	VtSM	3	Somatic	7.402553777376152E-4	NA	0	21	21.602785	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	37	27	10	0
chr17	3785943	3785943	A	G	intronic	CAMKK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr17	37863454	37863454	A	A	intronic	ERBB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	37864546	37864546	T	C	intronic	ERBB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	37871503	37871503	T	T	intronic	ERBB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	37872454	37872454	C	A	intronic	ERBB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.530515	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	67	59	8	0
chr17	37875990	37875990	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	1	3,3	0
chr17	37876166	37876166	G	A	intronic	ERBB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.089916	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	360	317	43	0
chr17	37879588	37879588	A	G	exonic	ERBB2	NaN	nonsynonymous SNV	ERBB2:NM_001289937:exon17:c.A1963G:p.I655V,ERBB2:NM_004448:exon17:c.A1963G:p.I655V,ERBB2:NM_001005862:exon20:c.A1873G:p.I625V,ERBB2:NM_001289936:exon21:c.A1918G:p.I640V	rs1136201	NaN	0.121406	0.39	T	0.679	P	0.255	B	.	.	0.000	P	0.75	N	-0.99	T	-1.086	T	0.000	T	0.172	2.307	13.67	4.97	1.880	4.008	8.987	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	221.404759	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	76	0	76	20
chr17	37883536	37883536	T	T	intronic	ERBB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	37886031	37886031	A	A	intronic	MIEN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	27	21	0	0
chr17	37898909	37898909	A	C	exonic	GRB7	NaN	synonymous SNV	GRB7:NM_001030002:exon3:c.A246C:p.P82P,GRB7:NM_001242442:exon3:c.A315C:p.P105P,GRB7:NM_001242443:exon3:c.A246C:p.P82P,GRB7:NM_005310:exon3:c.A246C:p.P82P	rs36079893	NaN	0.121006	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	16.0944	15	NaN	NA	NA	9	5	3	2
chr17	37899739	37899739	A	A	intronic	GRB7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	37947870	37947870	A	A	intronic	IKZF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	37955194	37955194	A	G	intronic	IKZF3	NaN	NaN	NaN	rs34344462	NaN	0.0898562	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	37988293	37988293	C	T	intronic	IKZF3	NaN	NaN	NaN	rs8069893	NaN	0.0521166	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	250.669	0	NaN	NA	NA	82	36	46	5
chr17	37992550	37992550	A	T	intronic	IKZF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	11	4	6	0
chr17	3800995	3800995	T	C	UTR3	P2RX1	NM_002558:c.*113A>G	NaN	NaN	rs711173	NaN	0.191693	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	66	27.690019	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	99	77	22	28
chr17	3801201	3801201	A	G	intronic	P2RX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	30	11.970495	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	17	11	6	1
chr17	3801282	3801282	T	C	intronic	P2RX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.75721	0	NaN	NA	NA	11	9	2	0
chr17	3801692	3801692	T	T	intronic	P2RX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	38020419	38020419	T	C	UTR5	IKZF3	NM_183230:c.-40A>G,NM_183229:c.-40A>G,NM_183228:c.-40A>G,NM_001284515:c.-86431A>G,NM_012481:c.-40A>G,NM_183231:c.-40A>G,NM_183232:c.-40A>G,NM_001284514:c.-86431A>G,NM_001257408:c.-40A>G,NM_001257409:c.-40A>G,NM_001257414:c.-40A>G,NM_001257413:c.-40A>G,NM_001257412:c.-40A>G,NM_001257411:c.-40A>G,NM_001257410:c.-40A>G	NaN	NaN	rs1453559	NaN	0.457069	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	32	8.452664	normal_lod	REJECT	4	1	3	22
chr17	38028497	38028497	C	T	intronic	ZPBP2	NaN	NaN	NaN	rs111845187	NaN	0.0155751	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.391679	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	6	5	7
chr17	38028634	38028634	G	T	exonic	ZPBP2	NaN	nonsynonymous SNV	ZPBP2:NM_198844:exon4:c.G452T:p.S151I,ZPBP2:NM_199321:exon5:c.G518T:p.S173I	rs11557467	NaN	0.379593	0.02	D	0.295	B	0.266	B	0.005	N	0.973	P	0.345	N	0.57	T	-0.920	T	0.000	T	0.316	0.151	4.814	4.4	0.900	3.003	8.372	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.445697	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	6	6	35
chr17	38066202	38066202	A	G	intronic	GSDMB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	3	5	0
chr17	38069949	38069949	C	T	intronic	GSDMB	NaN	NaN	NaN	rs7216389	NaN	0.667931	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	38078873	38078873	A	G	exonic	ORMDL3	NaN	nonsynonymous SNV	ORMDL3:NM_139280:exon4:c.T392C:p.L131P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	3.03	M	.	.	0.256	D	0.546	D	0.99	4.542	24.5	5.39	2.046	9.339	15.414	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.012238	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	83	68	15	0
chr17	38078877	38078877	A	G	exonic	ORMDL3	NaN	nonsynonymous SNV	ORMDL3:NM_139280:exon4:c.T388C:p.S130P	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.912	P	0.813	P	0.000	D	1.000	D	2.815	M	.	.	-0.019	T	0.438	T	0.964	4.641	25.5	5.39	2.046	9.339	15.414	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.129788	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	83	72	11	0
chr17	38080189	38080189	A	G	intronic	ORMDL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	2.796864	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	21	19	2	0
chr17	3808520	3808520	T	T	exonic	P2RX1	NaN	synonymous SNV	P2RX1:NM_002558:exon2:c.A279A:p.P93P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	59	56	0	0
chr17	38100811	38100811	C	G	exonic	LRRC3C	NaN	nonsynonymous SNV	LRRC3C:NM_001195545:exon2:c.C652G:p.R218G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	.	.	.	.	0.152	N	0.997	N	1.67	L	0.15	T	-0.777	T	0.230	T	0.337	0.756	8.005	4.65	2.398	4.650	10.620	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	22	9	13	0
chr17	38122177	38122177	A	A	intronic	GSDMA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr17	38122501	38122501	T	T	intronic	GSDMA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	38126987	38126987	A	A	intronic	GSDMA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	38129996	38129996	A	T	intronic	GSDMA	NaN	NaN	NaN	rs60137005	NaN	0.381989	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	65	NaN	NA	NA	170	0	170	40
chr17	38130051	38130051	T	C	intronic	GSDMA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.461822	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	165	149	16	0
chr17	38130176	38130176	A	A	intronic	GSDMA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	38131306	38131306	A	A	intronic	GSDMA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	38143002	38143002	A	C	intronic	PSMD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	38144926	38144926	T	T	intronic	PSMD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	38146263	38146263	GA	G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3786.21	0	NaN	NA	NA	383	0	377	34
chr17	38146458	38146458	A	A	intronic	PSMD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr17	38151874	38151874	T	C	intronic	PSMD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr17	38151878	38151878	T	G	intronic	PSMD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr17	38160765	38160765	T	T	intergenic	PSMD3,CSF3	dist=6552;dist=10849	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	38171905	38171905	T	T	intronic	CSF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	38176693	38176693	A	A	intronic	MED24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	38178149	38178149	A	G	intronic	MED24	NaN	NaN	NaN	rs2302776	NaN	0.44988	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.163151	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	15	10	43
chr17	38188346	38188346	A	G	intronic	MED24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.117094	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	103	87	16	0
chr17	38188347	38188347	G	A	intronic	MED24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.027005314547027207	NA	0	0	NaN	NA	NA	26	15	11	0
chr17	3819212	3819212	T	T	intronic	P2RX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	38209493	38209493	T	T	intronic	MED24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr17	38244663	38244663	G	A	exonic	THRA	NaN	nonsynonymous SNV	THRA:NM_001190918:exon8:c.G892A:p.A298T,THRA:NM_001190919:exon8:c.G892A:p.A298T,THRA:NM_003250:exon8:c.G892A:p.A298T,THRA:NM_199334:exon8:c.G892A:p.A298T	NaN	NaN	NaN	0.22	T	1.0	D	0.992	D	0.000	D	1.000	D	1.82	L	-4.07	D	0.964	D	0.915	D	0.637	4.792	27.0	5.25	2.446	9.758	17.675	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.329666	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	149	144	5	0
chr17	38245791	38245791	C	A	UTR3	THRA	NM_199334:c.*82C>A	NaN	NaN	rs12939700	NaN	0.0654952	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	444.614	0	NaN	NA	NA	103	40	63	3
chr17	38298017	38298017	C	G	intronic	CASC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	38298019	38298019	T	G	intronic	CASC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	38298021	38298021	A	T	intronic	CASC3	NaN	NaN	NaN	rs184161651	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	38298023	38298023	A	T	intronic	CASC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	3831710	3831710	G	T	intronic	ATP2A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	3831712	3831712	G	C	intronic	ATP2A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	3832212	3832212	A	A	intronic	ATP2A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	78	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr17	38325658	38325658	A	C	exonic	CASC3	NaN	synonymous SNV	CASC3:NM_007359:exon12:c.A2047C:p.R683R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.195028	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	168	156	12	0
chr17	38340986	38340986	A	A	intronic	RAPGEFL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	38349620	38349620	A	G	exonic	RAPGEFL1	NaN	synonymous SNV	RAPGEFL1:NM_001303533:exon14:c.A1362G:p.S454S,RAPGEFL1:NM_001303534:exon14:c.A1344G:p.S448S,RAPGEFL1:NM_016339:exon14:c.A1197G:p.S399S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.129798	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	114	104	10	0
chr17	38349621	38349621	G	T	exonic	RAPGEFL1	NaN	nonsynonymous SNV	RAPGEFL1:NM_001303533:exon14:c.G1363T:p.V455L,RAPGEFL1:NM_001303534:exon14:c.G1345T:p.V449L,RAPGEFL1:NM_016339:exon14:c.G1198T:p.V400L	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.413	B	0.21	B	0.001	D	1.000	D	0.39	N	1.74	T	-1.079	T	0.042	T	0.315	3.240	16.86	4.68	1.390	2.085	9.927	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.229203	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	114	104	10	0
chr17	3840652	3840652	C	G	intronic	ATP2A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr17	38412835	38412835	A	A	intronic	WIPF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	38412837	38412837	A	A	intronic	WIPF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	38412838	38412838	T	T	intronic	WIPF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	38451506	38451506	A	G	intronic	CDC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	38451507	38451507	T	A	intronic	CDC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr17	3845823	3845823	T	T	intronic	ATP2A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr17	3846802	3846802	A	G	exonic	ATP2A3	NaN	synonymous SNV	ATP2A3:NM_005173:exon11:c.T1302C:p.Y434Y,ATP2A3:NM_174953:exon11:c.T1302C:p.Y434Y,ATP2A3:NM_174954:exon11:c.T1302C:p.Y434Y,ATP2A3:NM_174955:exon11:c.T1302C:p.Y434Y,ATP2A3:NM_174956:exon11:c.T1302C:p.Y434Y,ATP2A3:NM_174957:exon11:c.T1302C:p.Y434Y,ATP2A3:NM_174958:exon11:c.T1302C:p.Y434Y	rs758641	NaN	0.333267	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	105	NaN	NA	NA	199	40	159	42
chr17	3848013	3848013	A	C	exonic	ATP2A3	NaN	synonymous SNV	ATP2A3:NM_005173:exon10:c.T1272G:p.A424A,ATP2A3:NM_174953:exon10:c.T1272G:p.A424A,ATP2A3:NM_174954:exon10:c.T1272G:p.A424A,ATP2A3:NM_174955:exon10:c.T1272G:p.A424A,ATP2A3:NM_174956:exon10:c.T1272G:p.A424A,ATP2A3:NM_174957:exon10:c.T1272G:p.A424A,ATP2A3:NM_174958:exon10:c.T1272G:p.A424A	rs1800911	NaN	0.336262	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.761773	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	4	13	35
chr17	38498984	38498984	C	T	exonic	RARA	NaN	nonsynonymous SNV	RARA:NM_001024809:exon1:c.C28T:p.P10S	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.001	B	0.001	B	0.202	N	1.000	N	1.355	L	-2.87	D	-0.370	T	0.631	D	0.186	2.053	12.82	3.79	1.930	2.850	8.782	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	46	29	17	0
chr17	38503093	38503093	G	G	intronic	RARA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	38507974	38507974	T	T	intronic	RARA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	3854562	3854562	T	C	exonic	ATP2A3	NaN	nonsynonymous SNV	ATP2A3:NM_005173:exon5:c.A446G:p.D149G,ATP2A3:NM_174953:exon5:c.A446G:p.D149G,ATP2A3:NM_174954:exon5:c.A446G:p.D149G,ATP2A3:NM_174955:exon5:c.A446G:p.D149G,ATP2A3:NM_174956:exon5:c.A446G:p.D149G,ATP2A3:NM_174957:exon5:c.A446G:p.D149G,ATP2A3:NM_174958:exon5:c.A446G:p.D149G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.992	D	0.000	D	1.000	D	4.975	H	-4.43	D	1.025	D	0.973	D	0.957	2.654	14.84	3.56	1.847	7.512	12.315	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	76.1503	0	NaN	NA	NA	28	13	15	1
chr17	38548701	38548701	A	G	intronic	TOP2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	17	5	11	0
chr17	38552674	38552674	G	C	exonic	TOP2A	NaN	nonsynonymous SNV	TOP2A:NM_001067:exon28:c.C3581G:p.P1194R	rs202201081	NaN	0.000199681	0.45	T	0.084	B	0.078	B	0.069	N	1.000	N	1.01	L	2.01	T	-1.024	T	0.034	T	0.164	0.893	8.627	3.63	1.513	4.480	6.902	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	156	88	59	1
chr17	38564652	38564652	T	C	intronic	TOP2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.49514	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	311	305	6	0
chr17	38564835	38564835	A	G	exonic	TOP2A	NaN	synonymous SNV	TOP2A:NM_001067:exon11:c.T1251C:p.F417F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	92	65	19	0
chr17	38568148	38568148	A	A	intronic	TOP2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	40	36	0	0
chr17	38569755	38569755	T	C	exonic	TOP2A	NaN	nonsynonymous SNV	TOP2A:NM_001067:exon5:c.A455G:p.D152G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.745	P	0.6	P	0.000	D	1.000	D	2.735	M	0.45	T	-0.366	T	0.305	T	0.808	4.779	26.9	5.75	2.200	7.992	16.058	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.50515	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	197	192	5	0
chr17	38569908	38569908	A	A	intronic	TOP2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr17	38572366	38572366	G	A	intronic	TOP2A	NaN	NaN	NaN	rs2586112	NaN	0.813299	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	49.8279	0	NaN	NA	NA	29	17	12	37
chr17	38600092	38600092	G	A	exonic	IGFBP4	NaN	synonymous SNV	IGFBP4:NM_001552:exon1:c.G105A:p.L35L	rs598892	NaN	0.357827	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.772751	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	51	35	16	34
chr17	38609447	38609447	T	T	intronic	IGFBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	213	176	0	0
chr17	38610363	38610363	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	0	2,2	0
chr17	38610364	38610364	T	G	intronic	IGFBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	38612667	38612667	T	T	intronic	IGFBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	38633701	38633701	T	C	UTR3	TNS4	NM_032865:c.*139A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	38644842	38644842	C	T	exonic	TNS4	NaN	synonymous SNV	TNS4:NM_032865:exon3:c.G819A:p.V273V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.121745	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	76	72	4	0
chr17	38644973	38644973	T	T	exonic	TNS4	NaN	synonymous SNV	TNS4:NM_032865:exon3:c.A688A:p.S230S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	73	60	0	0
chr17	38652214	38652214	C	T	intronic	TNS4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.408192	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	373	351	22	0
chr17	38652215	38652215	T	C	intronic	TNS4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.61607	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	373	351	22	0
chr17	3868905	3868905	A	C	intergenic	ATP2A3,ZZEF1	dist=1147;dist=38834	NaN	NaN	rs9909779	NaN	0.305312	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	3868919	3868919	C	T	intergenic	ATP2A3,ZZEF1	dist=1161;dist=38820	NaN	NaN	rs9908942	NaN	0.305112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	38697637	38697637	A	C	intergenic	TNS4,CCR7	dist=39783;dist=12385	NaN	NaN	rs9902343	NaN	0.256989	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr17	38721752	38721752	A	A	upstream	CCR7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	38813824	38813824	G	A	intronic	KRT222	NaN	NaN	NaN	rs8068721	NaN	0.707867	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	68.8844	39	36.281323	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	51	31	20	24
chr17	38855977	38855977	T	A	intronic	KRT24	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	16	6	10	0
chr17	38857446	38857446	C	A	exonic	KRT24	NaN	nonsynonymous SNV	KRT24:NM_019016:exon3:c.G801T:p.M267I	rs874889	NaN	0.476837	0.37	T	0.0	B	0.002	B	.	.	0.993	P	0.615	N	-1.43	T	-0.903	T	0.000	T	0.119	0.504	6.732	2.79	0.395	0.613	8.290	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.353296	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	12	13	44
chr17	38911637	38911637	A	G	upstream	KRT25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	38911638	38911638	T	C	upstream	KRT25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	38922966	38922966	A	A	intronic	KRT26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	38924987	38924987	T	T	intronic	KRT26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	38926058	38926058	A	T	exonic	KRT26	NaN	stopgain	KRT26:NM_181539:exon5:c.T917A:p.L306X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.418	N	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.354	17.30	4.13	0.888	5.390	11.543	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.696135	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	72	62	10	0
chr17	38926669	38926669	A	G	intronic	KRT26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr17	38936674	38936674	C	G	exonic	KRT27	NaN	nonsynonymous SNV	KRT27:NM_181537:exon3:c.G562C:p.E188Q	NaN	NaN	NaN	0	D	0.884	P	0.962	D	0.244	N	0.836	D	3.41	M	-3.51	D	1.192	D	0.934	D	0.126	3.973	20.3	4.53	1.442	4.927	15.557	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.119812	clustered_read_position	REJECT	63	58	5	0
chr17	38938216	38938216	T	G	intronic	KRT27	NaN	NaN	NaN	rs17473777	NaN	0.324481	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.276311	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	7	12	32
chr17	38938222	38938222	T	C	intronic	KRT27	NaN	NaN	NaN	rs72824004	NaN	0.16274	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.506675	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	12	7	15
chr17	38948648	38948648	T	T	UTR3	KRT28	NM_181535:c.*31A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	38949957	38949957	A	G	intronic	KRT28	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.855575	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	64	60	4	0
chr17	38954687	38954687	C	G,T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	116.302	0	NaN	NA	NA	13	0	3	0
chr17	38955274	38955274	A	C	intronic	KRT28	NaN	NaN	NaN	rs7224150	NaN	0.131989	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	191.894	0	NaN	NA	NA	89	0	89	6
chr17	38975076	38975076	A	A	exonic	KRT10	NaN	synonymous SNV	KRT10:NM_000421:exon7:c.T1711T:p.S571S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr17	38977217	38977217	T	T	intronic	KRT10,TMEM99	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr17	39022740	39022740	T	T	intronic	KRT12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	39022841	39022841	A	T	intronic	KRT12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.347861	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	127	113	14	0
chr17	39033685	39033685	A	T	intronic	KRT20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	33	32	1	0
chr17	39036523	39036523	T	C	intronic	KRT20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	39041455	39041455	A	G	UTR5	KRT20	NM_019010:c.-18T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	39080749	39080749	C	T	exonic	KRT23	NaN	synonymous SNV	KRT23:NM_001282433:exon7:c.G738A:p.R246R,KRT23:NM_015515:exon8:c.G1149A:p.R383R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	1.1941187426799961E-8	Somatic	121.799	110	105.29837	nearby_gap_events	REJECT	167	116	51	0
chr17	39092868	39092868	G	A	UTR5	KRT23	NM_015515:c.-13C>T	NaN	NaN	rs2269858	NaN	0.322484	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.980723	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	12	6	18
chr17	39120077	39120077	A	G	intronic	KRT39	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	3912313	3912313	A	G	intronic	ZZEF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.582307	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	47	41	6	0
chr17	39186031	39186031	C	C	exonic	KRTAP1-4	NaN	synonymous SNV	KRTAP1-4:NM_001257305:exon1:c.G300G:p.P100P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	20	14	0	0
chr17	3919723	3919723	A	C	exonic	ZZEF1	NaN	nonsynonymous SNV	ZZEF1:NM_015113:exon49:c.T8039G:p.M2680R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.998	D	0.981	D	0.000	D	1.000	D	0.975	L	1.91	T	-0.995	T	0.115	T	0.95	4.614	25.2	5.64	2.160	8.962	15.856	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.633321	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	69	63	6	0
chr17	39197418	39197418	T	G	exonic	KRTAP1-1	NaN	nonsynonymous SNV	KRTAP1-1:NM_030967:exon1:c.A232C:p.T78P	NaN	NaN	NaN	0.65	T	0.005	B	0.007	B	.	.	1.000	N	0.695	N	1.32	T	-0.996	T	0.039	T	0.167	1.996	12.63	-3.23	-0.638	-0.741	2.047	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.336973	normal_lod,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	4	1	3	0
chr17	39197617	39197617	A	G	exonic	KRTAP1-1	NaN	synonymous SNV	KRTAP1-1:NM_030967:exon1:c.T33C:p.F11F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.545456	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	115	102	13	0
chr17	3922918	3922918	A	G	intronic	ZZEF1	NaN	NaN	NaN	rs711178	NaN	0.517372	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	332	55	277	39
chr17	39254396	39254396	A	C	upstream	KRTAP4-8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	3926110	3926110	C	G	exonic	ZZEF1	NaN	nonsynonymous SNV	ZZEF1:NM_015113:exon44:c.G7105C:p.E2369Q	rs711177	NaN	0.143371	0.14	T	0.18	B	0.044	B	0.000	N	0.000	P	0.55	N	1.71	T	-0.969	T	0.000	T	0.176	3.872	19.67	4.97	1.472	3.495	11.065	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	522.373	0	NaN	NA	NA	79	15	64	10
chr17	39274069	39274069	G	C	exonic	KRTAP4-11	NaN	nonsynonymous SNV	KRTAP4-11:NM_033059:exon1:c.C499G:p.R167G	rs349771	NaN	0.463259	0.08	T	0.253	B	0.088	B	.	.	0.998	P	1.1	L	6.16	T	-1.192	T	0.000	T	0.191	1.938	12.44	2.95	0.934	2.143	11.146	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	544	225	319	0
chr17	39274311	39274311	T	C	exonic	KRTAP4-11	NaN	nonsynonymous SNV	KRTAP4-11:NM_033059:exon1:c.A257G:p.K86R	rs425755	ID=COSM979057;OCCURENCE=1(cervix),3(large_intestine),1(endometrium)	NaN	0.7	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	-1.01	N	6.35	T	-0.952	T	0.001	T	0.105	-1.168	0.090	-7.14	-1.427	-0.427	1.491	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.61116	0	NaN	NA	NA	18	15	3	8
chr17	39274319	39274319	G	C	exonic	KRTAP4-11	NaN	nonsynonymous SNV	KRTAP4-11:NM_033059:exon1:c.C249G:p.S83R	rs199712484	ID=COSM979058;OCCURENCE=1(large_intestine),1(endometrium)	NaN	0.02	D	0.055	B	0.007	B	0.013	U	1.000	N	2.77	M	5.85	T	-0.880	T	0.006	T	0.452	1.770	11.88	0.987	0.075	0.102	3.778	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.52106	0	NaN	NA	NA	19	17	3	8
chr17	39296016	39296016	A	C	UTR3	KRTAP4-6	NM_030976:c.*106T>G	NaN	NaN	rs937403	ID=COSN165424;OCCURENCE=1(breast)	0.661142	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	402.016573	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	132	0	132	54
chr17	39340794	39340794	G	A	exonic	KRTAP4-1	NaN	nonsynonymous SNV	KRTAP4-1:NM_033060:exon2:c.C256T:p.P86S	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.147	B	0.035	B	.	.	1.000	N	.	.	5.73	T	-0.884	T	0.003	T	0.124	1.079	9.404	3.95	2.284	0.621	11.851	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.048872180451127886	NA	0	0	NaN	NA	NA	13	8	5	0
chr17	39340795	39340795	A	C	exonic	KRTAP4-1	NaN	synonymous SNV	KRTAP4-1:NM_033060:exon2:c.T255G:p.R85R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.12092820999367146	NA	0	0	NaN	NA	NA	23	18	5	0
chr17	39346139	39346139	A	G	exonic	KRTAP9-1	NaN	nonsynonymous SNV	KRTAP9-1:NM_001190460:exon1:c.A1G:p.M1V	rs61743546	NaN	0.14357	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	6.2	T	-0.726	T	0.000	T	0.74	3.300	17.09	3.82	1.679	2.519	9.555	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.17667	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	6
chr17	39346541	39346541	CA	TG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.4128	0	NaN	NA	NA	16	13	2	0
chr17	3935370	3935370	G	C	intronic	ZZEF1	NaN	NaN	NaN	rs968114	NaN	0.164337	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	57	9	48	22
chr17	3947644	3947644	T	C	exonic	ZZEF1	NaN	nonsynonymous SNV	ZZEF1:NM_015113:exon38:c.A6040G:p.I2014V	rs781831	NaN	0.520168	0.57	T	0.0	B	0.0	B	0.384	N	1.000	P	-0.55	N	2.17	T	-1.038	T	0.000	T	0.057	0.606	7.263	-2.65	-0.777	-1.644	10.601	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	206	42	164	40
chr17	39502245	39502245	C	G	downstream	KRT33A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	39502246	39502246	T	A	downstream	KRT33A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	39502247	39502247	G	G	downstream	KRT33A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	39522695	39522695	T	T	intronic	KRT33B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	45	40	0	0
chr17	39535180	39535180	T	C	intronic	KRT34	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr17	39537494	39537494	A	T	intronic	KRT34	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	39580074	39580074	T	G	exonic	KRT37	NaN	nonsynonymous SNV	KRT37:NM_003770:exon2:c.A515C:p.N172T	NaN	NaN	NaN	0	D	0.955	P	0.763	P	0.013	N	0.569	D	3.63	H	-2.54	D	0.870	D	0.805	D	0.32	3.691	18.75	3.78	1.827	2.330	7.839	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	8.406238477414369E-4	NA	0	0	NaN	NA	NA	118	77	41	5
chr17	39580563	39580563	T	G	exonic	KRT37	NaN	synonymous SNV	KRT37:NM_003770:exon1:c.A213C:p.P71P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.804599	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	125	115	10	0
chr17	39594621	39594621	T	T	intronic	KRT38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	39594942	39594942	C	A	intronic	KRT38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.01648706080785758	NA	0	0	NaN	NA	NA	33	25	8	0
chr17	39595116	39595116	G	T	intronic	KRT38	NaN	NaN	NaN	rs9894668	NaN	0.21905	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	307.915219	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	102	1	101	31
chr17	39595216	39595216	A	A	intronic	KRT38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	39597266	39597266	C	T	UTR5	KRT38	NM_006771:c.-93G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.019682	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	190	182	8	0
chr17	3961489	3961489	C	T	intronic	ZZEF1	NaN	NaN	NaN	rs781839	NaN	0.464657	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	132	22	110	40
chr17	39616375	39616375	T	G	exonic	KRT32	NaN	nonsynonymous SNV	KRT32:NM_002278:exon7:c.A1334C:p.Q445P	NaN	NaN	NaN	0.3	T	0.0	B	0.001	B	0.357	N	1.000	N	0.51	N	-2.1	D	-0.700	T	0.417	T	0.203	0.208	5.124	-7.35	-1.675	-0.650	15.761	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.037414	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	63	58	5	0
chr17	39616430	39616430	G	T	exonic	KRT32	NaN	nonsynonymous SNV	KRT32:NM_002278:exon7:c.C1279A:p.P427T	rs2604953	NaN	0.819489	0.22	T	0.295	B	0.055	B	0.494	N	1.000	P	2.125	M	-2.21	D	-0.986	T	0.000	T	0.11	0.904	8.676	0.565	0.050	-0.026	3.116	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	718.645	0	NaN	NA	NA	68	0	68	42
chr17	39620564	39620564	G	A	exonic	KRT32	NaN	synonymous SNV	KRT32:NM_002278:exon4:c.C840T:p.R280R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.308797	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	215	209	6	0
chr17	39636186	39636186	A	A	intronic	KRT35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	39642457	39642457	T	A	UTR3	KRT36	NM_003771:c.*171A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	39644689	39644689	A	G	intronic	KRT36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	12	4	7	0
chr17	39646021	39646021	A	G	exonic	KRT36	NaN	synonymous SNV	KRT36:NM_003771:exon1:c.T96C:p.R32R	rs1003842	NaN	0.767572	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	202.559231	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	70	0	70	50
chr17	39658039	39658039	A	G	intronic	KRT13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.528873	nearby_gap_events	REJECT	39	35	4	0
chr17	39658082	39658082	A	C	intronic	KRT13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	39659814	39659814	C	A	intronic	KRT13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	39659815	39659815	A	G	intronic	KRT13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	39659816	39659816	G	C	intronic	KRT13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	39659819	39659819	T	C	intronic	KRT13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	39659820	39659820	C	A	intronic	KRT13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	39659913	39659913	G	A	exonic	KRT13	NaN	nonsynonymous SNV	KRT13:NM_002274:exon2:c.C560T:p.A187V,KRT13:NM_153490:exon2:c.C560T:p.A187V	rs9891361	NaN	0.705272	0.02	D	0.99	D	0.811	P	0.000	D	0.000	P	1.845	L	-2.36	D	-0.915	T	0.000	T	0.381	5.384	34	4.89	2.539	6.585	18.250	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	62.2577	0	NaN	NA	NA	86	0	86	29
chr17	39670912	39670912	G	C	exonic	KRT15	NaN	nonsynonymous SNV	KRT15:NM_002275:exon7:c.C1262G:p.A421G	rs897420	NaN	0.972843	0.17	T	0.001	B	0.001	B	0.384	N	1.000	P	0	N	-1.35	T	-0.971	T	0.000	T	0.13	-0.328	2.445	3.22	0.690	0.541	10.635	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	149.188	0	36.031282	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	0	15	12
chr17	39681262	39681262	A	G	intronic	KRT19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr17	39681475	39681475	A	G	exonic	KRT19	NaN	synonymous SNV	KRT19:NM_002276:exon2:c.T471C:p.N157N	rs4601	NaN	0.731829	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	140.449416	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	1	52	44
chr17	3970396	3970396	T	T	intronic	ZZEF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	39723990	39723990	T	A	exonic	KRT9	NaN	synonymous SNV	KRT9:NM_000226:exon7:c.A1407T:p.G469G	rs3890472	ID=COSM1179685;OCCURENCE=1(prostate)	0.647364	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	22.6855	0	NaN	NA	NA	139	55	84	31
chr17	39724304	39724304	T	T	intronic	KRT9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr17	39728050	39728050	G	A	exonic	KRT9	NaN	synonymous SNV	KRT9:NM_000226:exon1:c.C195T:p.G65G	rs8070680	NaN	0.78095	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.7256	0	NaN	NA	NA	21	16	5	31
chr17	39731823	39731823	C	A	intergenic	KRT9,KRT14	dist=3513;dist=6708	NaN	NaN	rs117531465	NaN	0.00439297	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	39742898	39742898	G	A	exonic	KRT14	NaN	synonymous SNV	KRT14:NM_000526:exon1:c.C189T:p.C63C	rs11551758	ID=COSM329475;OCCURENCE=1(haematopoietic_and_lymphoid_tissue),3(prostate)	0.680711	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	306.262	0	NaN	NA	NA	147	78	69	0
chr17	39766499	39766499	GAAAAAG	GAAAAG,GAAAAGA,GAAAAGG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	656.028	0	NaN	NA	NA	175	31	50	0
chr17	39766504	39766504	A	G	intronic	KRT16	NaN	NaN	NaN	rs7406899	NaN	0.98742	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	64	13	51	52
chr17	39779160	39779160	G	C	intronic	KRT17	NaN	NaN	NaN	rs9916519	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	60	44	16	33
chr17	39820454	39820454	T	G	intergenic	KRT42P,EIF1	dist=24003;dist=24673	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	39846591	39846591	A	A	intronic	EIF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	3984848	3984848	A	G	intronic	ZZEF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.080453	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	119	112	7	0
chr17	39881289	39881289	G	C	exonic	HAP1	NaN	nonsynonymous SNV	HAP1:NM_001079870:exon10:c.C1473G:p.F491L,HAP1:NM_001079871:exon10:c.C1449G:p.F483L,HAP1:NM_177977:exon11:c.C1524G:p.F508L	rs8075017	NaN	0.896565	1	T	0.0	B	0.0	B	0.715	N	1.000	P	-0.805	N	3.91	T	-0.960	T	0.000	T	0.043	-1.171	0.088	-1.63	-0.568	-0.471	0.225	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	73.922018	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	0	26	48
chr17	39883672	39883672	G	A	intronic	HAP1	NaN	NaN	NaN	rs11867808	NaN	0.249002	0	D	0.005	B	0.003	B	.	.	0.000	P	.	.	2.19	T	-0.942	T	0.000	T	0.262	0.804	8.230	1.24	0.015	0.626	5.629	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	39884651	39884651	A	A	intronic	HAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	39888614	39888614	A	A	exonic	HAP1	NaN	synonymous SNV	HAP1:NM_001079870:exon3:c.T606T:p.Y202Y,HAP1:NM_001079871:exon3:c.T582T:p.Y194Y,HAP1:NM_177977:exon3:c.T582T:p.Y194Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	30	27	0	0
chr17	39889108	39889108	A	G	intronic	HAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	39889109	39889109	T	C	intronic	HAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	1	2	0
chr17	39889110	39889110	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	0	2,2	0
chr17	39889113	39889113	A	T	intronic	HAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	3989968	3989968	C	C	intronic	ZZEF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	81	64	0	0
chr17	39912145	39912145	T	A	exonic	JUP	NaN	nonsynonymous SNV	JUP:NM_002230:exon14:c.A2089T:p.M697L,JUP:NM_021991:exon14:c.A2089T:p.M697L	rs1126821	NaN	0.58726	0.73	T	0.0	B	0.0	B	0.081	N	0.000	P	0.69	N	0.31	T	-0.959	T	0.000	T	0.106	0.033	4.187	1.12	0.317	0.962	12.111	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	337.446	0	NaN	NA	NA	125	64	61	52
chr17	39913735	39913735	A	T	exonic	JUP	NaN	nonsynonymous SNV	JUP:NM_002230:exon12:c.T1978A:p.Y660N,JUP:NM_021991:exon12:c.T1978A:p.Y660N	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	2.38	M	-0.12	T	-0.086	T	0.428	T	0.784	4.716	26.2	4.74	2.006	8.871	13.226	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.04369747899159513	NA	0	0	NaN	NA	NA	13	10	3	0
chr17	3991428	3991428	G	T	intronic	ZZEF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	39919408	39919408	T	C	exonic	JUP	NaN	nonsynonymous SNV	JUP:NM_002230:exon8:c.A1324G:p.I442V,JUP:NM_021991:exon8:c.A1324G:p.I442V	NaN	NaN	NaN	0.48	T	0.04	B	0.076	B	0.000	D	1.000	D	0.52	N	-0.17	T	-0.960	T	0.146	T	0.173	0.605	7.260	5.08	2.128	1.566	14.165	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.438876	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	186	181	5	0
chr17	39921390	39921390	A	G	intronic	JUP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	7	1	6	0
chr17	39969438	39969438	T	C	exonic	FKBP10	NaN	nonsynonymous SNV	FKBP10:NM_021939:exon1:c.T152C:p.I51T	NaN	NaN	NaN	0.4	T	0.865	P	0.616	P	0.001	D	1.000	D	1.355	L	0.62	T	-0.970	T	0.158	T	0.541	3.555	18.13	5.54	2.104	6.039	15.351	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	52	36	14	2
chr17	39975893	39975893	C	T	exonic	FKBP10	NaN	synonymous SNV	FKBP10:NM_021939:exon6:c.C1029T:p.I343I	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.835	T	0.209	T	.	1.600	11.31	-0.388	0.037	-0.209	10.888	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	22	4	18	0
chr17	39977957	39977957	C	G	exonic	FKBP10	NaN	nonsynonymous SNV	FKBP10:NM_021939:exon9:c.C1451G:p.S484C	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.997	D	0.848	P	0.005	N	0.764	D	2.95	M	0.37	T	0.007	D	0.343	T	0.468	3.348	17.27	5.42	2.550	0.949	12.841	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.782462	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	152	145	7	1
chr17	39978120	39978120	A	A	intronic	FKBP10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	39986991	39986991	T	C	intronic	NT5C3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1544117647058832	NA	0	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr17	3998963	3998963	T	A	intronic	ZZEF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr17	39998141	39998141	C	T	exonic	KLHL10	NaN	synonymous SNV	KLHL10:NM_152467:exon2:c.C261T:p.P87P	rs1529933	NaN	0.778155	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	298.496	0	138.523452	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	90	36	54	56
chr17	39998462	39998462	G	A	exonic	KLHL10	NaN	synonymous SNV	KLHL10:NM_152467:exon2:c.G582A:p.E194E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.355498	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	147	142	5	0
chr17	40010591	40010591	T	A	exonic	KLHL11	NaN	nonsynonymous SNV	KLHL11:NM_018143:exon2:c.A1528T:p.T510S	NaN	NaN	NaN	0.66	T	0.179	B	0.039	B	0.000	D	1.000	D	0.975	L	-0.2	T	-0.933	T	0.152	T	0.676	1.797	11.97	5.26	2.106	7.559	15.457	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	29	22	7	0
chr17	40011598	40011598	A	G	intronic	KLHL11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	40024917	40024917	T	T	intronic	ACLY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	21	18	0	0
chr17	40028074	40028074	A	C	exonic	ACLY	NaN	nonsynonymous SNV	ACLY:NM_001303275:exon24:c.T2937G:p.F979L,ACLY:NM_198830:exon24:c.T2775G:p.F925L,ACLY:NM_001096:exon25:c.T2805G:p.F935L,ACLY:NM_001303274:exon25:c.T2967G:p.F989L	NaN	NaN	NaN	0	D	0.936	P	0.839	P	0.000	D	1.000	D	3.245	M	-1.83	D	0.523	D	0.806	D	0.727	4.523	24.4	1.21	0.189	2.056	5.583	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.486518	nearby_gap_events	REJECT	67	58	9	0
chr17	40030258	40030258	A	G	intronic	ACLY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr17	40030259	40030259	C	A	intronic	ACLY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr17	40030261	40030261	A	C	intronic	ACLY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr17	40030262	40030262	C	T	intronic	ACLY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr17	40030264	40030264	A	T	intronic	ACLY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr17	40039315	40039315	T	T	intronic	ACLY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	40048496	40048496	T	C	intronic	ACLY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.474134	nearby_gap_events	REJECT	35	27	8	0
chr17	40048497	40048497	C	T	intronic	ACLY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.014757481940144507	NA	0	0	11.197269	nearby_gap_events	REJECT	36	28	8	0
chr17	40092992	40092992	T	T	intronic	TTC25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	40101364	40101364	T	T	intronic	TTC25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	40107175	40107175	A	G	intronic	TTC25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.951143	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	42	39	3	0
chr17	40120020	40120020	T	T	intronic	CNP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	38	30	0	0
chr17	40120022	40120022	G	A	intronic	CNP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.453649	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	193	184	9	0
chr17	40127537	40127537	T	T	UTR3	CNP	NM_033133:c.*1595T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	40140828	40140828	T	G	exonic	DNAJC7	NaN	synonymous SNV	DNAJC7:NM_001144766:exon8:c.A672C:p.T224T,DNAJC7:NM_003315:exon8:c.A840C:p.T280T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.83227	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	50	43	7	0
chr17	4015833	4015833	C	T	intronic	ZZEF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.964418	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	51	45	6	0
chr17	4017569	4017569	A	C	intronic	ZZEF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.33845	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	152	143	9	0
chr17	4017774	4017774	A	G	intronic	ZZEF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	1	8	0
chr17	40179712	40179712	G	T	exonic	ZNF385C	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF385C:NM_001242704:exon7:c.C962A:p.A321D	NaN	NaN	NaN	0.12	T	1.0	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	2.25	M	0.87	T	-0.610	T	0.275	T	0.731	4.878	28.0	5.14	2.666	5.823	18.795	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	20.5514	20	NaN	NA	NA	11	7	4	4
chr17	40179848	40179848	T	T	intronic	ZNF385C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	40180028	40180028	C	T	intronic	ZNF385C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.627039	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	104	95	9	0
chr17	40256749	40256749	A	C	intronic	DHX58	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.707909	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	147	138	9	0
chr17	40257736	40257736	T	G	intronic	DHX58	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	9	5	3	0
chr17	40257737	40257737	T	A	intronic	DHX58	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr17	40257738	40257738	T	T	intronic	DHX58	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr17	40257894	40257894	T	C	exonic	DHX58	NaN	nonsynonymous SNV	DHX58:NM_024119:exon9:c.A1111G:p.I371V	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	2.34	M	3.21	T	-1.126	T	0.071	T	0.452	3.795	19.27	5.17	1.962	5.393	14.185	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.194003	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	53	47	6	0
chr17	40257895	40257895	A	T	exonic	DHX58	NaN	synonymous SNV	DHX58:NM_024119:exon9:c.T1110A:p.G370G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.245167	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	54	48	6	0
chr17	40262644	40262644	T	T	intronic	DHX58	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	40262664	40262664	T	G	intronic	DHX58	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.273404	nearby_gap_events	REJECT	18	13	5	0
chr17	40263535	40263535	T	T	intronic	DHX58	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	40266710	40266710	C	A	intronic	KAT2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.180633	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	100	86	14	0
chr17	40269385	40269385	G	A	intronic	KAT2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	72.007867	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	286	237	49	0
chr17	40269667	40269667	C	G	intronic	KAT2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	23	18	5	0
chr17	40269668	40269668	C	G	intronic	KAT2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.044480578261007986	NA	0	0	NaN	NA	NA	32	22	10	6
chr17	40270062	40270062	TG	GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	55.2849	0	NaN	NA	NA	36	19	14	3
chr17	40270096	40270096	T	TGA	intronic	KAT2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.75555	0	NaN	NA	NA	11	6	2	0
chr17	40275276	40275276	C	A	exonic	HSPB9	NaN	synonymous SNV	HSPB9:NM_033194:exon1:c.C408A:p.L136L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.6324	0	NaN	NA	NA	117	101	17	4
chr17	40324155	40324155	T	A	intronic	KCNH4	NaN	NaN	NaN	rs188601592	NaN	0.00239617	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	40330584	40330584	T	G	intronic	KCNH4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	40330587	40330587	G	A	intronic	KCNH4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	40330592	40330592	T	C	intronic	KCNH4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	40337280	40337280	T	T	intronic	HCRT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	40343166	40343166	C	G	exonic	GHDC	NaN	nonsynonymous SNV	GHDC:NM_001142623:exon6:c.G952C:p.A318P,GHDC:NM_032484:exon6:c.G952C:p.A318P	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.002	B	0.005	B	0.612	N	1.000	N	1.01	L	.	.	-1.021	T	0.062	T	0.294	-0.253	2.783	-6.52	-0.894	-0.473	9.642	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.511284	nearby_gap_events	REJECT	91	83	8	0
chr17	40354405	40354405	G	A	exonic	STAT5B	NaN	synonymous SNV	STAT5B:NM_012448:exon18:c.C2190T:p.P730P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.269284	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	188	178	10	0
chr17	40368186	40368186	T	C	intronic	STAT5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.4944	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	90	83	7	0
chr17	40368197	40368197	T	C	intronic	STAT5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.29071	nearby_gap_events	REJECT	113	97	16	0
chr17	40384169	40384169	A	A	intronic	STAT5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	4040529	4040529	T	C	intronic	ZZEF1	NaN	NaN	NaN	rs7218401	NaN	0.132188	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	40444113	40444113	A	A	intronic	STAT5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	40459737	40459737	C	T	exonic	STAT5A	NaN	synonymous SNV	STAT5A:NM_001288719:exon14:c.C1812T:p.D604D,STAT5A:NM_001288720:exon14:c.C1809T:p.D603D,STAT5A:NM_001288718:exon15:c.C1902T:p.D634D,STAT5A:NM_003152:exon16:c.C1902T:p.D634D	rs1135669	NaN	0.241014	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	120.104606	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	84	33	51	26
chr17	40469328	40469328	A	A	intronic	STAT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	40469329	40469329	C	T	intronic	STAT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	40469330	40469330	T	C	intronic	STAT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	40497541	40497541	T	C	intronic	STAT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	4	7	0
chr17	40500586	40500586	C	T	intronic	STAT3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	40639396	40639396	A	A	intronic	ATP6V0A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	71	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr17	40646296	40646296	T	T	intronic	ATP6V0A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	40665851	40665851	T	T	intronic	ATP6V0A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	40672718	40672718	G	T	intronic	ATP6V0A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	40690543	40690543	G	C	intronic	NAGLU	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	40690549	40690549	C	T	intronic	NAGLU	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	40690550	40690550	A	T	intronic	NAGLU	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	40693258	40693258	A	C	intronic	NAGLU	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	22	0	22	0
chr17	40705100	40705100	C	T	intronic	HSD17B1	NaN	NaN	NaN	rs597255	NaN	0.573482	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	427.924	0	NaN	NA	NA	144	73	71	35
chr17	40705254	40705254	A	G	exonic	HSD17B1	NaN	synonymous SNV	HSD17B1:NM_000413:exon2:c.A210G:p.S70S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	93	75	18	3
chr17	40706273	40706273	C	C	intronic	HSD17B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	40706627	40706627	T	T	intronic	HSD17B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	33	28	0	0
chr17	4071326	4071326	C	G	intronic	ANKFY1	NaN	NaN	NaN	rs4790178	NaN	0.514177	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.957361	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	20	5	47
chr17	40718083	40718083	A	A	UTR3	COASY	NM_025233:c.*97A>A,NM_001042532:c.*97A>A,NM_001042529:c.*97A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	40722162	40722162	G	A	exonic	MLX	NaN	synonymous SNV	MLX:NM_198205:exon6:c.G549A:p.A183A,MLX:NM_170607:exon7:c.G801A:p.A267A,MLX:NM_198204:exon7:c.G639A:p.A213A	rs1474040	NaN	0.0966454	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	136.077321	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	114	58	56	24
chr17	4072582	4072582	T	C	exonic	ANKFY1	NaN	nonsynonymous SNV	ANKFY1:NM_001257999:exon24:c.A3413G:p.D1138G,ANKFY1:NM_016376:exon24:c.A3290G:p.D1097G	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	2.245	M	.	.	-0.106	T	0.433	T	0.935	4.991	29.3	5.55	2.110	8.040	14.877	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.086398	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	105	97	8	0
chr17	4072627	4072627	G	A	intronic	ANKFY1	NaN	NaN	NaN	rs74995106	NaN	0.00838658	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	101	14	87	2
chr17	40733957	40733957	T	C	exonic	FAM134C	NaN	synonymous SNV	FAM134C:NM_178126:exon9:c.A1275G:p.R425R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.358091	nearby_gap_events	REJECT	147	140	7	0
chr17	40734442	40734442	G	G	intronic	FAM134C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	40734445	40734445	C	C	intronic	FAM134C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	40735685	40735685	A	G	intronic	FAM134C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	20	15	5	0
chr17	40735688	40735688	C	G	intronic	FAM134C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	20	14	5	0
chr17	40737992	40737992	T	A	intronic	FAM134C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	0	1	0
chr17	40761048	40761048	T	T	intronic	FAM134C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	40764009	40764009	T	T	intronic	TUBG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	40764359	40764359	T	T	intronic	TUBG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr17	40765567	40765567	A	T	intronic	TUBG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	40765570	40765570	A	T	intronic	TUBG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	40765571	40765571	A	G	intronic	TUBG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	40811781	40811781	C	T	intronic	TUBG2	NaN	NaN	NaN	rs2292750	NaN	0.609425	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	4.658337430367558E-4	NA	0	18	NaN	NA	NA	44	18	26	41
chr17	40811919	40811919	A	G	exonic	TUBG2	NaN	synonymous SNV	TUBG2:NM_016437:exon2:c.A117G:p.E39E	rs525911	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.18424	0	NaN	NA	NA	66	56	9	29
chr17	40817990	40817990	G	A	intronic	TUBG2	NaN	NaN	NaN	rs7225374	NaN	0.976438	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	101.08	0	28.045623	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	0	10	42
chr17	4082243	4082243	T	G	exonic	ANKFY1	NaN	nonsynonymous SNV	ANKFY1:NM_001257999:exon18:c.A2633C:p.Q878P,ANKFY1:NM_016376:exon18:c.A2510C:p.Q837P	NaN	NaN	NaN	0.13	T	0.998	D	0.991	D	0.000	D	1.000	D	2.01	M	.	.	-0.296	T	0.394	T	0.852	4.078	21.0	4.96	2.208	7.534	14.258	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.277714	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	111	103	8	0
chr17	40826531	40826531	G	T	intronic	PLEKHH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	16	5	11	3
chr17	40826532	40826532	A	C	intronic	PLEKHH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	16	5	11	0
chr17	4083220	4083220	G	A	intronic	ANKFY1	NaN	NaN	NaN	rs17764053	NaN	0.0896565	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	168	NaN	NA	NA	228	31	197	13
chr17	40837022	40837022	A	C	exonic	CNTNAP1	NaN	nonsynonymous SNV	CNTNAP1:NM_003632:exon4:c.A377C:p.N126T	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.275	M	-4.95	D	1.092	D	0.970	D	0.623	3.888	19.76	4.93	1.843	7.164	14.574	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.138956	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	62	59	3	0
chr17	40838994	40838994	A	G	exonic	CNTNAP1	NaN	nonsynonymous SNV	CNTNAP1:NM_003632:exon7:c.A974G:p.E325G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.993	D	0.000	D	1.000	D	1.915	M	-1.17	T	0.239	D	0.585	D	0.733	5.138	32	5.53	2.092	8.878	14.830	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.12452107279693456	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr17	40841143	40841143	A	C	intronic	CNTNAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr17	40843687	40843687	A	A	intronic	CNTNAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	40854534	40854534	G	GT	UTR3	EZH1	NM_001991:c.*16C>AC	NaN	NaN	NaN	NaN	0.482228	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3712.77	0	NaN	NA	NA	391	0	327	11
chr17	40854536	40854536	G	T	UTR3	EZH1	NM_001991:c.*14C>A	NaN	NaN	rs200701491	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.280311	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	392	351	41	0
chr17	40860794	40860794	T	T	intronic	EZH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	40865191	40865191	T	C	intronic	EZH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	5	3	0
chr17	40865378	40865378	G	A	exonic	EZH1	NaN	synonymous SNV	EZH1:NM_001991:exon11:c.C1053T:p.H351H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.330825	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	408	401	7	0
chr17	40925591	40925591	C	T	intronic	VPS25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.85472	nearby_gap_events	REJECT	42	36	6	0
chr17	40925919	40925919	A	A	intronic	VPS25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	40926595	40926595	T	T	intronic	VPS25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	40927574	40927574	A	C	intronic	VPS25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	40933020	40933020	T	A	exonic	WNK4	NaN	nonsynonymous SNV	WNK4:NM_032387:exon1:c.T304A:p.S102T	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.181	B	0.1	B	0.311	N	0.993	N	0.895	L	-0.54	T	-0.985	T	0.170	T	0.073	2.046	12.80	0.651	0.037	1.401	5.198	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr17	40936517	40936517	T	C	exonic	WNK4	NaN	nonsynonymous SNV	WNK4:NM_032387:exon4:c.T1090C:p.C364R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.805	M	1.84	T	-0.660	T	0.188	T	0.922	4.753	26.6	4.61	1.927	7.868	14.175	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.490012	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	69	65	4	0
chr17	40939221	40939221	T	T	intronic	WNK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	40939767	40939767	T	C	intronic	WNK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.624399	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	153	112	41	0
chr17	40950016	40950016	T	G	UTR3	COA3	NM_001040431:c.*63A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	40950922	40950922	T	G	UTR5	CNTD1	NM_173478:c.-164T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	13	5	3	0
chr17	40966515	40966515	T	C	intronic	BECN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	22	4	17	0
chr17	40986212	40986212	T	T	exonic	PSME3	NaN	synonymous SNV	PSME3:NM_001267045:exon3:c.T14T:p.I5I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	40986439	40986439	A	C	intronic	PSME3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.7803	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr17	40990077	40990077	T	T	intronic	PSME3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr17	40990283	40990283	A	C	intronic	PSME3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	60.588087	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	305	263	42	2
chr17	41001071	41001071	T	T	intronic	AOC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	41102799	41102799	A	C	intronic	AARSD1,PTGES3L-AARSD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.499613	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	128	120	8	0
chr17	41102801	41102801	C	C	intronic	AARSD1,PTGES3L-AARSD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	71	59	0	0
chr17	41102803	41102803	A	A	intronic	AARSD1,PTGES3L-AARSD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	4111192	4111192	T	G	intronic	ANKFY1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	1	1	0
chr17	41116134	41116134	C	T	exonic	AARSD1,PTGES3L-AARSD1	NaN	nonsynonymous SNV	AARSD1:NM_001261434:exon2:c.G160A:p.G54S,PTGES3L-AARSD1:NM_001136042:exon7:c.G682A:p.G228S,PTGES3L-AARSD1:NM_025267:exon7:c.G499A:p.G167S	NaN	NaN	NaN	0.97	T	1.0	D	0.997	D	0.000	D	.	.	1.515	L	-1.03	T	-0.309	T	0.499	T	0.685	6.080	37	5.07	2.497	7.065	17.594	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.645223	nearby_gap_events	REJECT	41	33	8	0
chr17	41121208	41121208	GGGC	G,GG,GGG,GGGG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	752.146	0	NaN	NA	NA	75	0	29	8
chr17	41121219	41121219	A	A	intronic	PTGES3L,PTGES3L-AARSD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	85	73	0	0
chr17	41122443	41122443	T	C	intronic	PTGES3L,PTGES3L-AARSD1	NaN	NaN	NaN	rs2670866	NaN	0.977236	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	120.920253	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	1	42	58
chr17	4113203	4113203	G	A	exonic	ANKFY1	NaN	synonymous SNV	ANKFY1:NM_001257999:exon5:c.C624T:p.N208N,ANKFY1:NM_016376:exon5:c.C498T:p.N166N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.688192	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	151	146	5	0
chr17	41132266	41132266	A	A	UTR5	PTGES3L,PTGES3L-AARSD1	NM_001142654:c.-67T>T,NM_001142653:c.-67T>T,NM_001261430:c.-67T>T;NM_001136042:c.-67T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	41132504	41132504	C	G	UTR5	PTGES3L,PTGES3L-AARSD1	NM_001142654:c.-305G>C,NM_001142653:c.-305G>C,NM_001261430:c.-305G>C;NM_001136042:c.-305G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.70969	0	NaN	NA	NA	14	12	2	0
chr17	41141578	41141578	A	A	intronic	RUNDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	41150984	41150984	T	T	intronic	RPL27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	71	NaN	NA	NA	78	65	0	0
chr17	41166071	41166071	C	A	intronic	IFI35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.005270666560989157	NA	0	0	10.549055	nearby_gap_events	REJECT	59	52	7	0
chr17	41166072	41166072	A	G	intronic	IFI35	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.254442	nearby_gap_events	REJECT	59	52	7	0
chr17	41177925	41177925	T	T	intronic	RND2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	41201047	41201047	T	T	intronic	BRCA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	41209058	41209058	G	A	intronic	BRCA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.831976	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	110	96	14	0
chr17	41222898	41222898	T	T	intronic	BRCA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	41222964	41222964	C	G	exonic	BRCA1	NaN	nonsynonymous SNV	BRCA1:NM_007297:exon14:c.G4826C:p.G1609A,BRCA1:NM_007298:exon14:c.G1655C:p.G552A,BRCA1:NM_007294:exon15:c.G4967C:p.G1656A,BRCA1:NM_007299:exon15:c.G1655C:p.G552A,BRCA1:NM_007300:exon16:c.G5030C:p.G1677A	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	1.59	L	-2.35	D	0.598	D	0.752	D	0.874	3.702	18.80	4.82	2.668	4.124	13.591	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	29.9613	0	NaN	NA	NA	163	135	30	17
chr17	41223096	41223096	T	A	exonic	BRCA1	NaN	nonsynonymous SNV	BRCA1:NM_007297:exon14:c.A4694T:p.Q1565L,BRCA1:NM_007298:exon14:c.A1523T:p.Q508L,BRCA1:NM_007294:exon15:c.A4835T:p.Q1612L,BRCA1:NM_007299:exon15:c.A1523T:p.Q508L,BRCA1:NM_007300:exon16:c.A4898T:p.Q1633L	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.192	B	0.07	B	0.397	N	1.000	N	0	N	-2.02	D	-0.745	T	0.308	T	0.564	1.310	10.29	-3.12	-0.694	0.103	5.865	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	29.0588	0	NaN	NA	NA	302	253	48	3
chr17	41247993	41247993	A	T	intronic	BRCA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	41247995	41247995	T	G	intronic	BRCA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	41267812	41267812	G	A	intronic	BRCA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5597	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr17	41332804	41332804	T	C	intronic	NBR1	NaN	NaN	NaN	rs9904555	NaN	0.961661	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	56	8	48	0
chr17	41338473	41338473	A	A	intronic	NBR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr17	41345682	41345682	C	T	intronic	NBR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	41345684	41345684	A	T	intronic	NBR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	41345686	41345686	T	G	intronic	NBR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	41368461	41368461	T	C	intronic	TMEM106A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr17	4145774	4145774	G	A	intronic	ANKFY1	NaN	NaN	NaN	rs12944876	NaN	0.323083	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.303334	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	4	7	33
chr17	4145818	4145818	T	C	intronic	ANKFY1	NaN	NaN	NaN	rs12709336	NaN	0.324281	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.873114	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	3	6	34
chr17	41466728	41466728	A	T	upstream	LINC00910	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr17	41466730	41466730	G	G	upstream	LINC00910	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	41470322	41470322	G	T	intergenic	LINC00910,ARL4D	dist=4056;dist=6031	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	41477521	41477521	G	C	exonic	ARL4D	NaN	nonsynonymous SNV	ARL4D:NM_001661:exon2:c.G421C:p.G141R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.05	B	0.14	B	0.002	N	0.995	N	2.79	M	-1.62	D	-0.217	T	0.537	D	0.266	2.680	14.92	3.84	1.239	2.395	7.280	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	81	45	36	0
chr17	41561590	41561590	A	A	intronic	DHX8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	41568515	41568515	G	A	intronic	DHX8	NaN	NaN	NaN	rs191193994	NaN	0.000998403	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	30.1621	0	NaN	NA	NA	154	69	85	0
chr17	41584589	41584589	G	T	intronic	DHX8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	41584590	41584590	A	G	intronic	DHX8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	41585657	41585657	G	A	intronic	DHX8	NaN	NaN	NaN	rs2293014	NaN	0.667133	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.580173	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	17	12	30
chr17	41598056	41598056	C	G	intronic	DHX8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	41598059	41598059	T	G	intronic	DHX8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	41599718	41599718	T	G	intronic	DHX8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	53	34	19	0
chr17	41599719	41599719	T	G	intronic	DHX8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	45	9	28	0
chr17	41599720	41599720	C	G	intronic	DHX8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	27	13	10	0
chr17	41610028	41610028	C	A	intronic	ETV4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.406637	nearby_gap_events	REJECT	87	77	10	0
chr17	41610090	41610090	C	G	exonic	ETV4	NaN	nonsynonymous SNV	ETV4:NM_001261437:exon7:c.G646C:p.A216P,ETV4:NM_001261438:exon7:c.G646C:p.A216P,ETV4:NM_001079675:exon8:c.G763C:p.A255P,ETV4:NM_001986:exon8:c.G763C:p.A255P	NaN	NaN	NaN	0.32	T	0.012	B	0.016	B	0.110	N	1.000	D	0.35	N	1.85	T	-1.059	T	0.029	T	0.288	1.518	11.03	2.45	0.758	0.733	3.957	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	70	43	27	0
chr17	41640279	41640279	C	C	intergenic	ETV4,MEOX1	dist=16479;dist=77479	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	41800301	41800301	G	G	intergenic	MEOX1,SOST	dist=61039;dist=30798	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr17	41800302	41800302	C	C	intergenic	MEOX1,SOST	dist=61040;dist=30797	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr17	41847190	41847190	A	A	intronic	DUSP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr17	41860518	41860518	T	C	intronic	C17orf105	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.2315	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	78	75	3	0
chr17	41905023	41905023	T	T	intronic	MPP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	41909113	41909113	A	A	intronic	MPP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	41926217	41926217	G	C	exonic	CD300LG	NaN	nonsynonymous SNV	CD300LG:NM_001168322:exon2:c.G335C:p.R112P,CD300LG:NM_001168323:exon2:c.G335C:p.R112P,CD300LG:NM_001168324:exon2:c.G335C:p.R112P,CD300LG:NM_145273:exon2:c.G335C:p.R112P	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.979	D	0.701	P	0.736	N	1.000	N	-0.225	N	-0.11	T	-0.985	T	0.144	T	0.205	1.117	9.554	2.46	0.813	0.472	8.861	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.185198	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	179	169	10	0
chr17	41934402	41934402	T	T	intronic	CD300LG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr17	41955378	41955378	A	T	intronic	MPP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	41957507	41957507	C	G	intronic	MPP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	41958320	41958320	AG	GA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.46887	0	NaN	NA	NA	66	56	9	4
chr17	42018423	42018423	A	C	intronic	PPY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr17	42019109	42019109	A	T	intronic	PPY	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr17	420548	420548	A	G	UTR3	VPS53	NM_001128159:c.*1820T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	42083841	42083841	AG	A,CA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	178.857	0	NaN	NA	NA	25	0	8	2
chr17	42085150	42085150	T	C	intronic	NAGS	NaN	NaN	NaN	rs228773	NaN	0.960264	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	298.461653	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	101	0	101	58
chr17	42085890	42085890	G	A	exonic	NAGS	NaN	nonsynonymous SNV	NAGS:NM_153006:exon7:c.G1526A:p.R509Q	NaN	NaN	NaN	0.54	T	1.0	D	0.998	D	0.000	D	0.999	D	0.895	L	-3.29	D	0.497	D	0.799	D	0.53	4.251	22.1	5.33	2.479	8.210	16.505	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.217602	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	63	60	3	0
chr17	42085972	42085972	C	T	UTR3	NAGS	NM_153006:c.*3C>T	NaN	NaN	rs186636	NaN	0.475639	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	194.140098	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	70	0	70	47
chr17	42107121	42107121	A	C	intergenic	TMEM101,LSM12	dist=6602;dist=4882	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	42153512	42153512	G	C	UTR3	G6PC3	NM_138387:c.*101G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.845853	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	135	123	12	0
chr17	42153514	42153514	C	G	UTR3	G6PC3	NM_138387:c.*103C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.882234	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	136	124	12	0
chr17	42156258	42156258	A	G	intronic	HDAC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	29	0	26	0
chr17	42157650	42157650	A	C	intronic	HDAC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr17	42157660	42157660	T	T	intronic	HDAC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr17	42161884	42161884	A	T	intronic	HDAC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr17	42161885	42161885	C	T	intronic	HDAC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	42162540	42162540	T	C	intronic	HDAC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.1004	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	65	61	4	0
chr17	42165129	42165129	A	A	intronic	HDAC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	17	15	0	0
chr17	42168712	42168712	G	A	exonic	HDAC5	NaN	nonsynonymous SNV	HDAC5:NM_001015053:exon11:c.C1316T:p.P439L,HDAC5:NM_005474:exon11:c.C1313T:p.P438L	NaN	NaN	NaN	0.34	T	0.18	B	0.077	B	.	.	1.000	D	0	N	0.92	T	-1.064	T	0.059	T	0.397	2.643	14.80	5.17	2.418	1.137	13.133	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.682123	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	123	117	6	0
chr17	42168873	42168873	G	G	intronic	HDAC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	42169471	42169471	C	G	intronic	HDAC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr17	42169713	42169713	A	T	intronic	HDAC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	7	2	3	0
chr17	42188045	42188045	G	A	intronic	HDAC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	42222494	42222494	T	T	intronic	C17orf53	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	42248346	42248346	A	T	exonic	ASB16	NaN	nonsynonymous SNV	ASB16:NM_080863:exon1:c.A189T:p.Q63H	rs7218599	ID=COSM436689;OCCURENCE=1(breast)	0.926518	0.55	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	0.69	N	0.63	T	-0.992	T	0.000	T	0.066	2.353	13.83	3.06	0.128	-0.067	4.073	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	139.975804	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	0	48	57
chr17	42249268	42249268	T	A	intronic	ASB16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	42254905	42254905	T	T	ncRNA_exonic	ASB16-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	42266382	42266382	T	T	UTR5	TMUB2	NM_177441:c.-33T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr17	42272613	42272613	A	A	intronic	ATXN7L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr17	42285410	42285410	A	A	intronic	UBTF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	42287802	42287802	A	A	exonic	UBTF	NaN	synonymous SNV	UBTF:NM_001076683:exon13:c.T1288T:p.S430S,UBTF:NM_001076684:exon13:c.T1288T:p.S430S,UBTF:NM_014233:exon14:c.T1399T:p.S467S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	17	13	0	0
chr17	42287883	42287883	G	G	intronic	UBTF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr17	42288483	42288483	T	C	exonic	UBTF	NaN	nonsynonymous SNV	UBTF:NM_001076683:exon11:c.A1016G:p.E339G,UBTF:NM_001076684:exon11:c.A1016G:p.E339G,UBTF:NM_014233:exon12:c.A1127G:p.E376G	NaN	NaN	NaN	0.16	T	1.0	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	1.1	L	0.93	T	-0.874	T	0.176	T	0.693	4.847	27.6	4.5	1.880	5.631	13.627	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	20	2	17	4
chr17	42291862	42291862	G	A	intronic	UBTF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	42295451	42295451	T	G	intronic	UBTF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	42305706	42305706	A	G	intergenic	UBTF,SLC4A1	dist=7456;dist=20052	NaN	NaN	rs9906669	NaN	0.53095	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr17	42330374	42330374	G	GT	intronic	SLC4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.1265	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr17	42330542	42330542	T	T	exonic	SLC4A1	NaN	synonymous SNV	SLC4A1:NM_000342:exon17:c.A2255A:p.Q752Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	42337024	42337024	A	A	intronic	SLC4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	42390691	42390691	C	C	intronic	RUNDC3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	72	NaN	NA	NA	221	199	0	0
chr17	42390927	42390927	A	A	intronic	RUNDC3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	42392041	42392041	CTG	C,CGG,CT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	97.7103	0	NaN	NA	NA	28	5	5	0
chr17	42393941	42393941	A	G	intronic	RUNDC3A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	52.9197	0	NaN	NA	NA	49	35	15	2
chr17	42398407	42398407	C	T	intronic	SLC25A39	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.384008	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	74	55	19	0
chr17	42398408	42398408	T	C	intronic	SLC25A39	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.2003	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	74	55	19	0
chr17	42431524	42431524	C	T	exonic	FAM171A2	NaN	synonymous SNV	FAM171A2:NM_198475:exon8:c.G2058A:p.L686L	rs140882895	NaN	0.0519169	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.618344	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	24	18	6	0
chr17	42432521	42432521	A	G	exonic	FAM171A2	NaN	nonsynonymous SNV	FAM171A2:NM_198475:exon8:c.T1061C:p.L354P	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.068	B	0.082	B	0.018	U	1.000	D	1.3	L	0.81	T	-0.973	T	0.122	T	0.174	2.624	14.73	5.25	1.990	7.141	14.146	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.22480237154149807	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr17	42437509	42437509	A	A	intronic	FAM171A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	42449641	42449641	T	T	UTR3	ITGA2B	NM_000419:c.*91A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	42452539	42452539	C	C	intronic	ITGA2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	18	17	0	0
chr17	42453065	42453065	A	C	exonic	ITGA2B	NaN	nonsynonymous SNV	ITGA2B:NM_000419:exon26:c.T2621G:p.I874S	rs5911	ID=COSM436699;OCCURENCE=1(breast)	0.400359	0.66	T	0.001	B	0.0	B	0.081	U	0.000	P	-0.69	N	1.14	T	-0.918	T	0.000	T	0.144	1.717	11.70	3.42	1.033	1.255	6.970	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.609272	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	1	10	27
chr17	42461520	42461520	G	A	intronic	ITGA2B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.055688	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	36	14	0
chr17	42476832	42476832	T	C	exonic	GPATCH8	NaN	synonymous SNV	GPATCH8:NM_001304943:exon5:c.A2379G:p.S793S,GPATCH8:NM_001304939:exon7:c.A2538G:p.S846S,GPATCH8:NM_001304942:exon7:c.A2379G:p.S793S,GPATCH8:NM_001002909:exon8:c.A2613G:p.S871S,GPATCH8:NM_001304941:exon9:c.A2379G:p.S793S,GPATCH8:NM_001304940:exon10:c.A2379G:p.S793S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.408993	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	384	377	7	0
chr17	42569217	42569217	G	C	intronic	GPATCH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	42569218	42569218	G	T	intronic	GPATCH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	42569220	42569220	A	C	intronic	GPATCH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	42569221	42569221	G	T	intronic	GPATCH8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	42636880	42636880	A	T	UTR3	FZD2	NM_001466:c.*126A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	23	7	16	0
chr17	42663045	42663045	A	T	intergenic	FZD2,LINC01180	dist=24415;dist=60687	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	42663046	42663046	A	C	intergenic	FZD2,LINC01180	dist=24416;dist=60686	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	42734677	42734677	A	C	intronic	C17orf104	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	1	2	0
chr17	42739924	42739924	A	A	intronic	C17orf104	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	42786821	42786821	A	A	intronic	DBF4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	42818665	42818665	T	T	intronic	DBF4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	42824711	42824711	C	C	intronic	DBF4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	107	NaN	NA	NA	131	116	0	0
chr17	42829264	42829264	C	T	UTR3	DBF4B	NM_145663:c.*643C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	16	14	2	0
chr17	42829265	42829265	T	C	UTR3	DBF4B	NM_145663:c.*644T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	23	21	2	0
chr17	42837108	42837108	C	A	exonic	ADAM11	NaN	nonsynonymous SNV	ADAM11:NM_002390:exon2:c.C80A:p.P27H	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.999	D	0.907	P	0.010	N	0.994	N	0	N	4.36	T	-0.920	T	0.009	T	0.378	-0.463	1.861	3.29	1.931	1.534	9.321	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.715915		KEEP	39	35	4	0
chr17	42838497	42838497	G	T	intronic	ADAM11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	42839836	42839836	G	A	intronic	ADAM11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	42839843	42839843	T	G	intronic	ADAM11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	42847237	42847237	G	T	intronic	ADAM11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-0.963	T	0.067	T	.	0.148	4.795	-3.47	-0.451	0.010	1.869	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	21	7.625675	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	6	3	3	0
chr17	42852546	42852546	A	G	intronic	ADAM11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.403882	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	65	59	6	0
chr17	42852748	42852748	T	T	intronic	ADAM11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	42853407	42853407	A	A	intronic	ADAM11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr17	42854375	42854375	A	G	intronic	ADAM11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.894984	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	224	217	7	0
chr17	42855050	42855050	G	T	intronic	ADAM11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.595119	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	49	40	9	0
chr17	42855554	42855554	T	C	exonic	ADAM11	NaN	synonymous SNV	ADAM11:NM_002390:exon25:c.T2220C:p.I740I	rs2070605	NaN	0.645367	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	767.542	0	NaN	NA	NA	76	0	76	30
chr17	42926538	42926538	C	A	intronic	HIGD1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	42928806	42928806	A	G	intronic	EFTUD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	25	11	13	0
chr17	42930583	42930583	T	T	intronic	EFTUD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	42991252	42991252	A	A	intronic	GFAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	20	17	0	0
chr17	42992344	42992344	G	A	intronic	GFAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.210041	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	82	73	9	0
chr17	42992345	42992345	A	G	intronic	GFAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.909494	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	82	73	9	0
chr17	43004483	43004483	G	G	intronic	KIF18B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr17	43107390	43107390	A	C	intronic	DCAKD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr17	43159181	43159181	G	C	intronic	NMT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	43174495	43174495	G	G	splicing	NMT1	NM_021079:exon6:c.597-1G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	27	25	0	0
chr17	43176974	43176974	A	G	intronic	NMT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr17	43185566	43185566	C	A	UTR3	NMT1	NM_021079:c.*2559C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	43192548	43192548	GT	GTC,TC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	666.131	0	NaN	NA	NA	69	0	53	2
chr17	43193670	43193670	T	C	intronic	PLCD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr17	43194227	43194227	C	T	intronic	PLCD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	43194230	43194230	T	G	intronic	PLCD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	43194232	43194232	A	C	intronic	PLCD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	43195902	43195902	C	G	intronic	PLCD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	43195904	43195904	C	T	intronic	PLCD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	43247306	43247306	A	A	UTR3	HEXIM2	NM_001303436:c.*130A>A,NM_001303437:c.*130A>A,NM_001303438:c.*130A>A,NM_001303439:c.*130A>A,NM_144608:c.*130A>A,NM_001303440:c.*130A>A,NM_001303441:c.*130A>A,NM_001303442:c.*130A>A,NM_001303443:c.*130A>A,NM_001303444:c.*130A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr17	43300581	43300581	A	G	intronic	FMNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr17	43308098	43308098	A	C	intronic	FMNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.467424	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	197	187	10	0
chr17	43310476	43310476	A	C	intronic	FMNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	43	24	13	1
chr17	43311269	43311269	G	A	intronic	FMNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.19961	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	115	103	12	0
chr17	43316007	43316007	T	C	splicing	FMNL1	NM_005892:exon10:c.969+2T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.738	18.98	4.04	1.820	7.840	12.616	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.329305	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	67	64	3	0
chr17	43316472	43316472	A	T	intronic	FMNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	43322582	43322582	C	T	intronic	FMNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.6796	0	NaN	NA	NA	10	7	3	1
chr17	43332396	43332396	T	T	ncRNA_intronic	MAP3K14-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	43342530	43342530	C	T	exonic	MAP3K14	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	60.832747	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	640	570	70	0
chr17	43342531	43342531	T	C	exonic	MAP3K14	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	0	D	0.917	P	0.541	P	0.000	D	0.999	D	1.845	L	.	.	-0.404	T	0.242	T	0.252	5.369	34	5.94	2.279	7.698	15.579	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	66.863862	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	635	565	70	0
chr17	4337626	4337626	A	G	intronic	SPNS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	47	10	36	0
chr17	43454149	43454149	A	G	intergenic	MAP3K14,ARHGAP27	dist=59719;dist=17119	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	43454150	43454150	C	A	intergenic	MAP3K14,ARHGAP27	dist=59720;dist=17118	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	43473307	43473307	C	G	intronic	ARHGAP27	NaN	NaN	NaN	rs62064597	NaN	0.0710863	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.298676	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	13	17	20
chr17	43474525	43474525	A	T	intronic	ARHGAP27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	43474526	43474526	A	A	intronic	ARHGAP27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	43481836	43481836	G	C	exonic	ARHGAP27	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGAP27:NM_001282290:exon5:c.C1388G:p.A463G,ARHGAP27:NM_199282:exon5:c.C365G:p.A122G	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.998	D	0.915	D	0.000	N	1.000	D	1.845	L	3.13	T	-0.892	T	0.297	T	0.182	3.132	16.47	5.83	2.757	3.880	15.614	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.20485	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	570	550	20	0
chr17	43481837	43481837	C	T	exonic	ARHGAP27	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGAP27:NM_001282290:exon5:c.G1387A:p.A463T,ARHGAP27:NM_199282:exon5:c.G364A:p.A122T	NaN	NaN	NaN	0.59	T	0.998	D	0.937	D	0.000	N	1.000	D	0.945	L	3.24	T	-0.763	T	0.180	T	0.121	1.336	10.39	1.92	0.618	-0.051	7.836	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.618538	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	570	550	20	0
chr17	43482077	43482077	A	T	intronic	ARHGAP27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	6	1	3	0
chr17	43482078	43482078	G	C	intronic	ARHGAP27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	43482081	43482081	C	T	intronic	ARHGAP27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	43482082	43482082	A	G	intronic	ARHGAP27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	43482083	43482083	G	T	intronic	ARHGAP27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	4348551	4348551	A	G	intronic	SPNS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	15	4	10	0
chr17	43487968	43487968	A	G	intronic	ARHGAP27	NaN	NaN	NaN	rs1230106	NaN	0.561102	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	43507524	43507524	C	T	exonic	ARHGAP27	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGAP27:NM_001282290:exon1:c.G122A:p.S41N,ARHGAP27:NM_174919:exon4:c.G122A:p.S41N	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.996	D	0.944	D	.	.	1.000	N	2.125	M	1.54	T	-0.953	T	0.165	T	0.057	4.314	22.6	3.05	1.591	4.067	11.726	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.617024		KEEP	39	35	4	0
chr17	43508223	43508223	G	T	intronic	ARHGAP27	NaN	NaN	NaN	rs12939187	NaN	0.0790735	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	4351396	4351396	C	T	intronic	SPNS3	NaN	NaN	NaN	rs6502786	NaN	0.694489	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.250998	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	38
chr17	4351615	4351615	C	A	intronic	SPNS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	67	60	7	0
chr17	4351639	4351639	CG	CA,CT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1122.51	0	NaN	NA	NA	118	0	88	0
chr17	43517054	43517054	G	A	intronic	PLEKHM1	NaN	NaN	NaN	rs62064657	NaN	0.072484	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	65	35	30	14
chr17	4352539	4352539	C	T	exonic	SPNS3	NaN	synonymous SNV	SPNS3:NM_182538:exon7:c.C780T:p.F260F	rs7224464	NaN	0.483227	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.007676806757911327	NA	0	118	NaN	NA	NA	15	6	9	49
chr17	436253	436253	A	T	intronic	VPS53	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr17	4377493	4377493	A	A	intronic	SPNS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	43825478	43825478	G	A	intronic	MGC57346-CRHR1	NaN	NaN	NaN	rs75715199	NaN	0.0954473	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	44	23	21	0
chr17	43849419	43849419	A	A	intronic	MGC57346-CRHR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	43893913	43893913	C	G	exonic	CRHR1	NaN	nonsynonymous SNV	CRHR1:NM_001145146:exon3:c.C206G:p.P69R,CRHR1:NM_001145148:exon3:c.C206G:p.P69R,CRHR1:NM_004382:exon3:c.C206G:p.P69R	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.993	D	0.000	D	1.000	D	3.93	H	-1.1	T	0.684	D	0.732	D	0.929	2.391	13.95	5.04	2.630	5.936	13.771	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.341778	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	85	74	11	0
chr17	4389644	4389644	G	T	intronic	SPNS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	22.3077	17	NaN	NA	NA	83	67	16	4
chr17	43898690	43898690	C	G	intronic	CRHR1,MGC57346-CRHR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.3192982456140372	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr17	43898879	43898879	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	0	2,2	0
chr17	43906587	43906587	A	G	exonic	CRHR1,MGC57346-CRHR1	NaN	nonsynonymous SNV	CRHR1:NM_001145147:exon4:c.A214G:p.S72G,CRHR1:NM_001303020:exon4:c.A31G:p.S11G,CRHR1:NM_001145146:exon5:c.A334G:p.S112G,CRHR1:NM_001145148:exon5:c.A334G:p.S112G,CRHR1:NM_004382:exon5:c.A334G:p.S112G,MGC57346-CRHR1:NM_001303016:exon6:c.A31G:p.S11G	NaN	NaN	NaN	0.33	T	0.005	B	0.009	B	0.000	D	1.000	D	0.345	N	1.08	T	-0.940	T	0.154	T	0.076	1.919	12.37	5.43	2.072	3.325	13.448	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0013028291529255318	NA	0	0	NaN	NA	NA	64	51	13	0
chr17	43907896	43907896	T	C	exonic	CRHR1,MGC57346-CRHR1	NaN	synonymous SNV	CRHR1:NM_001303018:exon5:c.T144C:p.T48T,CRHR1:NM_001145147:exon6:c.T549C:p.T183T,CRHR1:NM_001303020:exon6:c.T366C:p.T122T,CRHR1:NM_001145148:exon7:c.T669C:p.T223T,CRHR1:NM_004382:exon7:c.T669C:p.T223T,CRHR1:NM_001145146:exon8:c.T756C:p.T252T,MGC57346-CRHR1:NM_001303016:exon8:c.T366C:p.T122T,MGC57346-CRHR1:NM_001256299:exon9:c.T144C:p.T48T	rs16940665	NaN	0.0860623	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.887638	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	15	21	18
chr17	43910619	43910619	G	A	intronic	CRHR1,MGC57346-CRHR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	46.106524	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	351	313	38	0
chr17	43911036	43911036	G	A	intronic	CRHR1,MGC57346-CRHR1	NaN	NaN	NaN	rs16940676	NaN	0.0860623	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.634924	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	6	12	23
chr17	43911443	43911443	T	C	intronic	CRHR1,MGC57346-CRHR1	NaN	NaN	NaN	rs1876829	NaN	0.0860623	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	503.714	0	NaN	NA	NA	125	62	63	12
chr17	43911525	43911525	C	T	intronic	CRHR1,MGC57346-CRHR1	NaN	NaN	NaN	rs1876828	NaN	0.086262	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	43912830	43912830	T	T	UTR3	CRHR1,MGC57346-CRHR1	NM_004382:c.*700T>T,NM_001145148:c.*700T>T,NM_001145147:c.*700T>T,NM_001145146:c.*700T>T,NM_001303018:c.*700T>T,NM_001303020:c.*700T>T;NM_001256299:c.*700T>T,NM_001303016:c.*651T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	43921210	43921210	G	T	ncRNA_exonic	MAPT-AS1	NaN	NaN	NaN	rs17763596	NaN	0.0860623	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr17	43923266	43923266	G	G	exonic	SPPL2C	NaN	synonymous SNV	SPPL2C:NM_175882:exon1:c.G994G:p.A332A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	43923898	43923898	A	G	exonic	SPPL2C	NaN	synonymous SNV	SPPL2C:NM_175882:exon1:c.A1626G:p.S542S	rs171443	NaN	0.885383	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	213.831	0	62.584736	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	0	23	28
chr17	43923934	43923934	T	C	exonic	SPPL2C	NaN	synonymous SNV	SPPL2C:NM_175882:exon1:c.T1662C:p.D554D	rs11079725	NaN	0.0860623	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	41.524513	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	46	19	22
chr17	44032956	44032956	G	G	intronic	MAPT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	44060559	44060559	A	G	exonic	MAPT	NaN	nonsynonymous SNV	MAPT:NM_001123066:exon6:c.A389G:p.K130R,MAPT:NM_016835:exon6:c.A389G:p.K130R	NaN	NaN	NaN	0.31	T	0.634	P	0.234	B	0.538	N	1.000	N	1.59	L	2.7	T	-0.990	T	0.036	T	0.058	1.891	12.28	2.83	0.235	0.520	7.702	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.651191	nearby_gap_events	REJECT	140	134	6	0
chr17	44061023	44061023	G	A	exonic	MAPT	NaN	nonsynonymous SNV	MAPT:NM_001123066:exon6:c.G853A:p.D285N,MAPT:NM_016835:exon6:c.G853A:p.D285N	rs62063786	NaN	0.0876597	0.3	T	0.147	B	0.035	B	0.037	N	1.000	P	1.245	L	2.72	T	-0.969	T	0.000	T	0.023	2.231	13.42	-3.22	-0.440	0.030	6.158	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	240.479	0	NaN	NA	NA	60	22	38	15
chr17	44061036	44061036	T	C	exonic	MAPT	NaN	nonsynonymous SNV	MAPT:NM_001123066:exon6:c.T866C:p.V289A,MAPT:NM_016835:exon6:c.T866C:p.V289A	rs62063787	NaN	0.0876597	0.96	T	0.0	B	0.0	B	0.573	N	1.000	P	-1.39	N	2.95	T	-0.938	T	0.000	T	0.026	-0.857	0.533	-1.36	-0.068	0.211	0.216	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	259.717	0	NaN	NA	NA	67	23	44	22
chr17	44071415	44071415	A	C	intronic	MAPT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	44071416	44071416	G	C	intronic	MAPT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	44071420	44071420	C	A	intronic	MAPT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	44071421	44071421	G	A	intronic	MAPT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	44071423	44071423	G	C	intronic	MAPT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	44073739	44073739	G	A	intronic	MAPT	NaN	NaN	NaN	rs62063850	NaN	0.0878594	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	27	10.400936	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	8	4	4	18
chr17	44073818	44073818	G	A	exonic	MAPT	NaN	nonsynonymous SNV	MAPT:NM_016834:exon6:c.G436A:p.G146S,MAPT:NM_016841:exon6:c.G436A:p.G146S,MAPT:NM_001123067:exon7:c.G523A:p.G175S,MAPT:NM_001203251:exon7:c.G523A:p.G175S,MAPT:NM_001203252:exon8:c.G610A:p.G204S,MAPT:NM_005910:exon8:c.G610A:p.G204S,MAPT:NM_016835:exon10:c.G1561A:p.G521S,MAPT:NM_001123066:exon11:c.G1615A:p.G539S	NaN	NaN	0.000199681	0.3	T	1.0	D	1.0	D	0.001	D	1.000	D	2.005	M	2.83	T	-1.058	T	0.131	T	0.548	4.021	20.6	5.09	2.651	4.629	17.232	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.379391	nearby_gap_events	REJECT	26	18	8	0
chr17	44077054	44077054	A	A	UTR3	STH	NM_001007532:c.*22A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	44110685	44110685	T	C	intronic	KANSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	44111494	44111494	T	T	intronic	KANSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	16	14	0	0
chr17	44116090	44116090	A	A	intronic	KANSL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	44144993	44144993	C	G	exonic	KANSL1	NaN	nonsynonymous SNV	KANSL1:NM_001193466:exon5:c.G1574C:p.R525P,KANSL1:NM_015443:exon5:c.G1574C:p.R525P,KANSL1:NM_001193465:exon6:c.G1574C:p.R525P	rs144838667	NaN	0.999401	0.51	T	0.001	B	0.0	B	.	.	1.000	P	0	N	0.92	T	-0.982	T	0.000	T	0.109	0.440	6.390	4.24	0.575	2.836	8.757	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	77.497888	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	0	37	57
chr17	4433859	4433859	T	A	intronic	SPNS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	44352873	44352873	A	A	intergenic	KANSL1,LRRC37A	dist=50133;dist=19624	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr17	4436116	4436116	T	G	intronic	SPNS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr17	4436187	4436187	G	C	intronic	SPNS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	116	86	30	0
chr17	4436201	4436201	C	A	intronic	SPNS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	128	NaN	NA	NA	87	72	15	0
chr17	4436440	4436440	G	T	intronic	SPNS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.19230769230769257	NA	0	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr17	4439501	4439501	C	G	intronic	SPNS2	NaN	NaN	NaN	rs1076071	NaN	0.961861	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	103.076	0	29.167234	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	34
chr17	4439532	4439532	T	C	intronic	SPNS2	NaN	NaN	NaN	rs1076072	NaN	0.732628	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	88.1983	0	23.470373	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	0	9	31
chr17	4443688	4443688	C	T	exonic	MYBBP1A	NaN	nonsynonymous SNV	MYBBP1A:NM_001105538:exon25:c.G3389A:p.R1130H,MYBBP1A:NM_014520:exon25:c.G3389A:p.R1130H	rs76606292	NaN	0.00319489	0.05	D	1.0	D	0.938	D	0.002	N	0.684	N	0.975	L	1.93	T	-1.088	T	0.047	T	0.304	3.750	19.04	3.69	2.615	0.783	10.332	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.173041	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	22	5	1
chr17	4443695	4443695	A	G	exonic	MYBBP1A	NaN	nonsynonymous SNV	MYBBP1A:NM_001105538:exon25:c.T3382C:p.S1128P,MYBBP1A:NM_014520:exon25:c.T3382C:p.S1128P	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.981	D	0.026	N	1.000	N	1.04	L	2.02	T	-1.081	T	0.062	T	0.341	3.971	20.3	0.033	0.068	0.137	3.143	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.009254	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	12	10	2	0
chr17	4444979	4444979	A	A	intronic	MYBBP1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	71	62	0	0
chr17	4448339	4448339	C	G	exonic	MYBBP1A	NaN	synonymous SNV	MYBBP1A:NM_001105538:exon17:c.G2292C:p.L764L,MYBBP1A:NM_014520:exon17:c.G2292C:p.L764L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	15	5	10	0
chr17	4448756	4448756	C	T	intronic	MYBBP1A	NaN	NaN	NaN	rs2306266	NaN	0.409145	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	88.287822	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	9	32	17
chr17	4449323	4449323	G	T	intronic	MYBBP1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	6	1	4	0
chr17	4449324	4449324	T	C	intronic	MYBBP1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	4453168	4453168	T	T	intronic	MYBBP1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	4455166	4455166	A	G	intronic	MYBBP1A	NaN	NaN	NaN	rs3816686	NaN	0.291933	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	188.719972	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	63	0	63	19
chr17	4457116	4457116	T	C	exonic	MYBBP1A	NaN	nonsynonymous SNV	MYBBP1A:NM_001105538:exon5:c.A550G:p.I184V,MYBBP1A:NM_014520:exon5:c.A550G:p.I184V	rs78557985	NaN	0.0189696	0.35	T	0.012	B	0.057	B	0.000	N	0.782	N	1.995	M	-0.28	T	-0.945	T	0.052	T	0.149	0.686	7.665	3.52	0.164	3.370	10.069	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	48	203.900469	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	95	18	77	2
chr17	4457428	4457428	A	G	intronic	MYBBP1A	NaN	NaN	NaN	rs75613207	NaN	0.0181709	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	68	13	55	2
chr17	4457430	4457430	C	T	intronic	MYBBP1A	NaN	NaN	NaN	rs74605518	NaN	0.0181709	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	57	15	42	2
chr17	4457580	4457580	G	A	intronic	MYBBP1A	NaN	NaN	NaN	rs2306270	ID=COSM148158;OCCURENCE=1(stomach)	0.20028	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	78	NaN	NA	NA	213	172	41	13
chr17	4457611	4457611	G	T	intronic	MYBBP1A	NaN	NaN	NaN	rs79329446	NaN	0.0153754	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	219	46	173	2
chr17	4457617	4457617	G	A	intronic	MYBBP1A	NaN	NaN	NaN	rs75997571	ID=COSN165306;OCCURENCE=1(breast)	0.0954473	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	219	175	44	6
chr17	4457689	4457689	A	A	intronic	MYBBP1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	4462160	4462160	T	C	exonic	GGT6	NaN	nonsynonymous SNV	GGT6:NM_153338:exon3:c.A536G:p.E179G,GGT6:NM_001122890:exon4:c.A632G:p.E211G,GGT6:NM_001288702:exon4:c.A650G:p.E217G	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.77	P	0.561	P	0.357	N	0.999	N	1.215	L	3.05	T	-1.041	T	0.026	T	0.106	3.270	16.98	2.75	0.864	1.519	6.030	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.444048	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	100	90	10	0
chr17	4462521	4462521	A	A	intronic	GGT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr17	4462626	4462626	G	A	intronic	GGT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.005786443246485552	NA	0	0	8.471825	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	39	32	7	0
chr17	44851221	44851221	G	A	exonic	WNT3	NaN	synonymous SNV	WNT3:NM_030753:exon2:c.C135T:p.C45C	rs143605657	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	35	24	11	1
chr17	4488414	4488414	C	C	intronic	SMTNL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	24	21	0	0
chr17	44949974	44949974	C	A	exonic	WNT9B	NaN	nonsynonymous SNV	WNT9B:NM_003396:exon2:c.C169A:p.L57M	NaN	NaN	NaN	.	.	0.995	D	0.925	D	0.001	N	0.997	D	1.61	L	-1.08	T	-0.084	T	0.525	D	0.218	3.124	16.44	3.48	1.198	1.015	9.424	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.363376	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	120	114	6	0
chr17	44951584	44951584	G	T	intronic	WNT9B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	9	2	7	0
chr17	44952582	44952582	G	C	exonic	WNT9B	NaN	synonymous SNV	WNT9B:NM_003396:exon3:c.G450C:p.G150G	NaN	ID=COSM1383866;OCCURENCE=1(large_intestine)	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.82562	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	108	99	9	0
chr17	4497052	4497052	G	A	intronic	SMTNL2	NaN	NaN	NaN	rs148075120	NaN	0.00459265	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	110	28	82	3
chr17	4498743	4498743	A	T	intronic	SMTNL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	45000547	45000547	G	C	UTR5	GOSR2	NM_004287:c.-12G>C,NM_054022:c.-12G>C,NM_001012511:c.-12G>C	NaN	NaN	rs183199	NaN	0.953674	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	124.440889	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	0	48	56
chr17	45017814	45017814	T	T	UTR3	GOSR2	NM_004287:c.*1688T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr17	45017859	45017859	A	G	UTR3	GOSR2	NM_004287:c.*1733A>G	NaN	NaN	rs758392	NaN	0.411342	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	564.457	0	NaN	NA	NA	250	141	109	24
chr17	4510455	4510455	T	T	intronic	SMTNL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr17	45198343	45198343	C	T	exonic	CDC27	NaN	synonymous SNV	CDC27:NM_001293091:exon18:c.G2250A:p.A750A,CDC27:NM_001114091:exon19:c.G2451A:p.A817A,CDC27:NM_001256:exon19:c.G2433A:p.A811A,CDC27:NM_001293089:exon19:c.G2430A:p.A810A	rs731790	NaN	0.0567093	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	113.318781	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	81	34	47	7
chr17	45214631	45214631	G	A	exonic	CDC27	NaN	synonymous SNV	CDC27:NM_001293091:exon13:c.C1617T:p.Y539Y,CDC27:NM_001114091:exon14:c.C1818T:p.Y606Y,CDC27:NM_001256:exon14:c.C1800T:p.Y600Y,CDC27:NM_001293089:exon14:c.C1797T:p.Y599Y	rs11570544	NaN	0.0141773	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.016876205555449546	NA	0	0	NaN	NA	NA	20	15	5	7
chr17	45214682	45214682	A	G	exonic	CDC27	NaN	synonymous SNV	CDC27:NM_001293091:exon13:c.T1566C:p.H522H,CDC27:NM_001114091:exon14:c.T1767C:p.H589H,CDC27:NM_001256:exon14:c.T1749C:p.H583H,CDC27:NM_001293089:exon14:c.T1746C:p.H582H	rs62075622	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.004441965112403416	NA	0	0	NaN	NA	NA	23	16	7	8
chr17	45214685	45214685	T	C	exonic	CDC27	NaN	synonymous SNV	CDC27:NM_001293091:exon13:c.A1563G:p.E521E,CDC27:NM_001114091:exon14:c.A1764G:p.E588E,CDC27:NM_001256:exon14:c.A1746G:p.E582E,CDC27:NM_001293089:exon14:c.A1743G:p.E581E	rs11570543	NaN	0.0583067	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.945719	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	12	7	6
chr17	45216162	45216162	A	C	exonic	CDC27	NaN	nonsynonymous SNV	CDC27:NM_001293091:exon12:c.T1464G:p.D488E,CDC27:NM_001114091:exon13:c.T1665G:p.D555E,CDC27:NM_001256:exon13:c.T1647G:p.D549E,CDC27:NM_001293089:exon13:c.T1644G:p.D548E	rs111227623	ID=COSM41553,COSM292298;OCCURENCE=1(ovary),1(lung),2(large_intestine)	NaN	1	T	0.171	B	0.082	B	0.000	D	1.000	D	-0.845	N	0.15	T	-0.976	T	0.061	T	0.851	0.551	6.981	-0.476	-0.146	1.462	9.464	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.61897	0	NaN	NA	NA	173	149	21	16
chr17	45216362	45216362	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	1	2,2	0
chr17	45216363	45216363	A	C	intronic	CDC27	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	45266432	45266432	C	G	intronic	CDC27	NaN	NaN	NaN	rs11079761	NaN	0.058107	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.455659	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	17	10	6
chr17	45266535	45266535	T	C	exonic	CDC27	NaN	nonsynonymous SNV	CDC27:NM_001114091:exon1:c.A4G:p.T2A,CDC27:NM_001256:exon1:c.A4G:p.T2A,CDC27:NM_001293089:exon1:c.A4G:p.T2A	rs62077280	NaN	NaN	0.4	T	0.99	D	0.971	D	0.001	N	1.000	D	0.27	N	0.51	T	-0.721	T	0.272	T	0.339	4.066	20.9	3.71	0.861	4.258	8.709	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	13.174	0	6.367754	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	29	25	4	3
chr17	45266571	45266571	T	A	UTR5	CDC27	NM_001293091:c.-7576A>T,NM_001256:c.-33A>T,NM_001114091:c.-33A>T,NM_001293089:c.-33A>T	NaN	NaN	rs62077281	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.3777	0	NaN	NA	NA	29	23	5	6
chr17	45266610	45266610	T	G	UTR5	CDC27	NM_001293091:c.-7615A>C,NM_001256:c.-72A>C,NM_001114091:c.-72A>C,NM_001293089:c.-72A>C	NaN	NaN	rs73319515	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.03167	0	NaN	NA	NA	21	18	3	6
chr17	45266632	45266632	A	G	UTR5	CDC27	NM_001293091:c.-7637T>C,NM_001256:c.-94T>C,NM_001114091:c.-94T>C,NM_001293089:c.-94T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	4534834	4534834	A	G	UTR3	ALOX15	NM_001140:c.*61T>C	NaN	NaN	rs916055	NaN	0.3125	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.970283	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	28
chr17	4535126	4535126	A	A	intronic	ALOX15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	21	17	0	0
chr17	45360730	45360730	T	C	exonic	ITGB3	NaN	nonsynonymous SNV	ITGB3:NM_000212:exon3:c.T176C:p.L59P	rs5918	NaN	0.0888578	0.43	T	0.003	B	0.005	B	0.880	N	1.000	P	1.355	L	-3.04	D	-0.903	T	0.007	T	0.087	0.492	6.670	-11.8	-3.995	-1.382	9.907	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	132.553704	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	123	61	62	13
chr17	45367476	45367476	T	T	intronic	ITGB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	45377706	45377706	C	C	intronic	ITGB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	45419475	45419475	A	A	intronic	EFCAB13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	4542794	4542794	C	G	exonic	ALOX15	NaN	nonsynonymous SNV	ALOX15:NM_001140:exon2:c.G268C:p.D90H	rs11568142	NaN	0.00439297	0.04	D	0.587	P	0.537	P	0.035	U	1.000	N	1.7	L	-0.09	T	-0.940	T	0.200	T	0.307	2.131	13.08	0.222	-0.184	0.743	1.576	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.153853	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	4	20	3
chr17	45451894	45451894	G	A	exonic	EFCAB13	NaN	nonsynonymous SNV	EFCAB13:NM_001195192:exon10:c.G646A:p.V216I,EFCAB13:NM_152347:exon12:c.G934A:p.V312I	rs4968318	NaN	0.621805	1	T	0.0	B	0.001	B	0.009	N	1.000	P	0.55	N	0.26	T	-0.988	T	0.000	T	0.037	-1.272	0.044	-8.04	-3.238	-3.603	1.613	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.340265	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	18	18	44
chr17	45455140	45455140	T	C	exonic	EFCAB13	NaN	nonsynonymous SNV	EFCAB13:NM_001195192:exon11:c.T1093C:p.C365R,EFCAB13:NM_152347:exon13:c.T1381C:p.C461R	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.246	B	0.069	B	0.099	N	1.000	N	1.1	L	0.31	T	-1.047	T	0.128	T	0.556	-0.385	2.193	-4.23	-0.597	-1.019	0.076	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.52545	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	201	195	6	0
chr17	45481423	45481423	T	G	intronic	EFCAB13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.94913	clustered_read_position	REJECT	62	54	8	0
chr17	45486990	45486990	A	G	intronic	EFCAB13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.138972	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	57	54	3	0
chr17	456563	456563	C	T	intronic	VPS53	NaN	NaN	NaN	rs142478715	NaN	0.0139776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	125	101	24	4
chr17	456603	456603	G	C	intronic	VPS53	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.922331	nearby_gap_events	REJECT	162	146	16	0
chr17	456736	456736	A	T	intronic	VPS53	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	45673944	45673944	G	A	intronic	NPEPPS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.442286		KEEP	50	45	5	0
chr17	45679084	45679084	A	G	exonic	NPEPPS	NaN	nonsynonymous SNV	NPEPPS:NM_006310:exon15:c.A1711G:p.K571E	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.001	B	0.000	D	0.648	D	-0.65	N	5.1	T	-0.971	T	0.002	T	0.184	0.350	5.898	2.93	0.789	4.383	5.926	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.71467	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	167	157	10	0
chr17	45681465	45681465	T	A	intronic	NPEPPS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr17	45681466	45681466	T	C	intronic	NPEPPS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	45681468	45681468	T	A	intronic	NPEPPS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	45681469	45681469	G	C	intronic	NPEPPS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	45695863	45695863	A	A	intronic	NPEPPS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	45735860	45735860	T	C	intronic	KPNB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	17	7	6	0
chr17	4574423	4574423	T	A	downstream	PELP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr17	45754338	45754338	A	A	intronic	KPNB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr17	45754551	45754551	A	A	intronic	KPNB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	4576347	4576347	T	T	exonic	PELP1	NaN	synonymous SNV	PELP1:NM_014389:exon16:c.A2089A:p.T697T,PELP1:NM_001278241:exon17:c.A1498A:p.T500T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	20	19	0	0
chr17	45774255	45774255	A	A	intronic	TBKBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	4578226	4578226	T	C	exonic	PELP1	NaN	nonsynonymous SNV	PELP1:NM_014389:exon12:c.A1450G:p.I484V,PELP1:NM_001278241:exon13:c.A859G:p.I287V	NaN	NaN	NaN	0.98	T	0.0	B	0.0	B	0.076	N	1.000	N	-0.695	N	1.64	T	-0.981	T	0.030	T	0.105	-0.810	0.650	-0.387	-0.152	0.964	8.622	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.571157	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	219	213	6	0
chr17	45788043	45788043	A	C	UTR3	TBKBP1	NM_014726:c.*51A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	29	9	20	0
chr17	4579638	4579638	G	A	intronic	PELP1	NaN	NaN	NaN	rs8071990	NaN	0.745407	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	3644.94	0	NaN	NA	NA	357	2	355	46
chr17	45820180	45820180	C	G	intronic	TBX21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.323529411764705	NA	0	0	NaN	NA	NA	12	9	3	0
chr17	4585959	4585959	A	T	intronic	PELP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	45892733	45892733	A	C	intronic	OSBPL7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	45894734	45894734	A	G	intronic	OSBPL7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.950792	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	68	60	8	0
chr17	45896478	45896478	T	C	intronic	OSBPL7	NaN	NaN	NaN	rs878171	NaN	0.734026	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1622.62	0	NaN	NA	NA	140	0	140	54
chr17	45897593	45897593	A	G	exonic	OSBPL7	NaN	nonsynonymous SNV	OSBPL7:NM_145798:exon2:c.T52C:p.S18P	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.023	B	0.026	B	0.553	N	0.829	D	0.345	N	1.99	T	-1.020	T	0.026	T	0.256	1.782	11.92	2.26	0.308	0.438	4.483	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.284574	nearby_gap_events	REJECT	69	62	7	0
chr17	45912696	45912696	C	T	intronic	LRRC46	NaN	NaN	NaN	rs17701113	NaN	0.158546	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.058904	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	24	22	42
chr17	45915657	45915657	C	C	exonic	SCRN2	NaN	synonymous SNV	SCRN2:NM_001145023:exon7:c.G1098G:p.L366L,SCRN2:NM_138355:exon7:c.G1098G:p.L366L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	276	187	0	0
chr17	45915658	45915658	A	T	exonic	SCRN2	NaN	nonsynonymous SNV	SCRN2:NM_001145023:exon7:c.T1097A:p.L366Q,SCRN2:NM_138355:exon7:c.T1097A:p.L366Q	NaN	NaN	NaN	0.56	T	1.0	D	0.95	D	0.002	N	1.000	D	2.36	M	3.11	T	-1.056	T	0.076	T	0.742	3.803	19.31	5.66	2.160	6.250	14.869	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.42093	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	271	234	37	0
chr17	45915659	45915659	G	A	exonic	SCRN2	NaN	synonymous SNV	SCRN2:NM_001145023:exon7:c.C1096T:p.L366L,SCRN2:NM_138355:exon7:c.C1096T:p.L366L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.165669	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	277	238	39	0
chr17	45916779	45916779	T	T	intronic	SCRN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr17	45924709	45924709	T	G	exonic	SP6	NaN	nonsynonymous SNV	SP6:NM_001258248:exon2:c.A1087C:p.K363Q,SP6:NM_199262:exon2:c.A1087C:p.K363Q	NaN	NaN	NaN	0.49	T	0.588	P	0.073	B	0.000	D	0.976	N	0	N	3.07	T	-0.946	T	0.009	T	0.446	0.961	8.920	4.4	1.839	1.552	7.619	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.456288	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	31	26	5	0
chr17	45956694	45956694	A	G	intergenic	SP6,SP2	dist=23454;dist=16822	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr17	45994132	45994132	T	C	exonic	SP2	NaN	nonsynonymous SNV	SP2:NM_003110:exon3:c.T695C:p.L232P	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.979	D	0.642	P	0.001	D	1.000	D	1.59	L	2.89	T	-1.165	T	0.043	T	0.591	3.234	16.84	5.39	2.267	3.736	14.530	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.873041	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	89	78	11	0
chr17	45994150	45994150	C	A	exonic	SP2	NaN	nonsynonymous SNV	SP2:NM_003110:exon3:c.C713A:p.T238N	NaN	NaN	NaN	0.35	T	0.149	B	0.095	B	0.492	N	1.000	N	1.355	L	2.89	T	-0.983	T	0.025	T	0.113	1.125	9.586	3.42	0.850	2.455	7.966	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.046082	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	73	64	9	0
chr17	45994154	45994154	G	A	exonic	SP2	NaN	synonymous SNV	SP2:NM_003110:exon3:c.G717A:p.P239P	rs2229358	NaN	0.49381	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.006079744036415665	NA	0	49	NaN	NA	NA	71	40	31	21
chr17	46023526	46023526	A	C	intronic	PNPO	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	46023528	46023528	T	C	intronic	PNPO	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr17	46030384	46030384	A	G	exonic	PRR15L	NaN	nonsynonymous SNV	PRR15L:NM_024320:exon2:c.T217C:p.S73P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	2.63	M	.	.	0.018	D	0.466	T	0.93	4.024	20.6	5.58	2.247	8.459	15.006	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.392423	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	80	77	3	0
chr17	46030611	46030611	A	A	UTR5	PRR15L	NM_024320:c.-11T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr17	46051913	46051913	A	A	UTR5	CDK5RAP3	NM_001278217:c.-539A>A,NM_001278198:c.-1344A>A,NM_001278216:c.-1344A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	15	13	0	0
chr17	46052794	46052794	C	C	intronic	CDK5RAP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	137	132	0	0
chr17	46053070	46053070	A	C	UTR5	CDK5RAP3	NM_001278198:c.-187A>C,NM_001278216:c.-187A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	46055128	46055128	T	T	intronic	CDK5RAP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	46056112	46056112	T	C	intronic	CDK5RAP3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	46058868	46058868	A	G	exonic	CDK5RAP3	NaN	stoploss	CDK5RAP3:NM_001278216:exon12:c.A846G:p.X282W,CDK5RAP3:NM_001278217:exon13:c.A1260G:p.X420W,CDK5RAP3:NM_001278197:exon14:c.A1596G:p.X532W,CDK5RAP3:NM_176096:exon14:c.A1521G:p.X507W	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.523	14.40	5.5	2.104	5.107	14.645	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.859232	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	29	26	3	0
chr17	46060841	46060841	C	T	intergenic	CDK5RAP3,COPZ2	dist=1689;dist=42692	NaN	NaN	rs2597178	NaN	0.280351	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	16	10	6	0
chr17	46103671	46103671	T	T	UTR3	COPZ2	NM_016429:c.*123A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	46103760	46103760	A	G	UTR3	COPZ2	NM_016429:c.*34T>C	NaN	NaN	rs12051	NaN	0.275759	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	124	75	49	39
chr17	46105926	46105926	T	G	intronic	COPZ2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.438199	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	63	55	8	0
chr17	46106634	46106634	G	T	intronic	COPZ2	NaN	NaN	NaN	rs9898218	NaN	0.280351	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	143	86	57	11
chr17	46109676	46109676	A	A	intronic	COPZ2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr17	46134026	46134026	A	A	intronic	NFE2L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	46137032	46137032	A	A	UTR3	NFE2L1	NM_003204:c.*29A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	46148995	46148995	A	A	intronic	CBX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	46198572	46198572	T	A	intronic	SNX11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	2	2	0
chr17	4620497	4620497	C	T	intronic	ARRB2	NaN	NaN	NaN	rs7208257	NaN	0.91873	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	324.42236	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	142	3	139	58
chr17	4621468	4621468	CA	AG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.9231	0	NaN	NA	NA	12	9	3	1
chr17	4621799	4621799	A	A	intronic	ARRB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr17	4623762	4623762	A	A	exonic	ARRB2	NaN	synonymous SNV	ARRB2:NM_001257331:exon12:c.A1031A:p.Q344Q,ARRB2:NM_199004:exon12:c.A1031A:p.Q344Q,ARRB2:NM_001257328:exon13:c.A1139A:p.Q380Q,ARRB2:NM_001257329:exon13:c.A945A:p.P315P,ARRB2:NM_001257330:exon13:c.A1076A:p.Q359Q,ARRB2:NM_004313:exon13:c.A1076A:p.Q359Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	46262262	46262262	A	A	intronic	SKAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr17	4641755	4641755	C	T	exonic	CXCL16	NaN	synonymous SNV	CXCL16:NM_001100812:exon3:c.G306A:p.G102G,CXCL16:NM_022059:exon3:c.G306A:p.G102G	rs1050997	ID=COSM148161;OCCURENCE=1(stomach)	0.624002	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	382.616045	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	122	0	122	56
chr17	4644149	4644149	C	T	exonic	ZMYND15	NaN	synonymous SNV	ZMYND15:NM_001136046:exon2:c.C306T:p.P102P,ZMYND15:NM_001267822:exon2:c.C306T:p.P102P,ZMYND15:NM_032265:exon2:c.C306T:p.P102P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.883375	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	49	43	6	0
chr17	4644860	4644860	T	G	intronic	ZMYND15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr17	4646571	4646571	T	T	intronic	ZMYND15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr17	4646962	4646962	G	GCT,GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	20.4226	0	NaN	NA	NA	44	34	9	0
chr17	4647002	4647002	A	G	intronic	ZMYND15	NaN	NaN	NaN	rs8082690	NaN	0.688898	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	660.081	0	163.860482	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	68	0	68	43
chr17	46511249	46511249	T	T	intergenic	SKAP1,LOC101927166	dist=3655;dist=10946	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	46629422	46629422	T	C	exonic	HOXB3	NaN	nonsynonymous SNV	HOXB3:NM_002146:exon3:c.A415G:p.T139A	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.009	B	0.005	B	0.028	U	1.000	D	0.345	N	1.58	T	-0.159	T	0.511	D	0.162	2.739	15.12	4.35	1.967	5.667	13.999	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.102067		KEEP	33	28	5	0
chr17	46669430	46669430	C	T	ncRNA_intronic	HOXB-AS3	NaN	NaN	NaN	rs9299	NaN	0.485623	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	94.296305	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	0	32	49
chr17	46670422	46670422	G	C	ncRNA_intronic	HOXB-AS3	NaN	NaN	NaN	rs2288276	NaN	0.798522	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	109.07	0	NaN	NA	NA	11	0	11	10
chr17	46670800	46670800	T	G	exonic	HOXB5	NaN	nonsynonymous SNV	HOXB5:NM_002147:exon1:c.A245C:p.E82A	NaN	NaN	NaN	0.27	T	0.734	P	0.239	B	0.000	D	1.000	D	2.41	M	-3.02	D	0.431	D	0.720	D	0.425	2.945	15.82	5.44	2.062	7.686	15.170	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.694894	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	21	16	5	0
chr17	46691587	46691587	A	AGGCCCCCTGCCC	intronic	HOXB8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.404153	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	43.675	0	NaN	NA	NA	10	3	5	5
chr17	4675746	4675746	G	T	intronic	TM4SF5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	4684178	4684178	T	C	intronic	TM4SF5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	4684179	4684179	A	G	intronic	TM4SF5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	46867238	46867238	T	T	intronic	TTLL6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	26	23	0	0
chr17	46869043	46869043	A	T	intronic	TTLL6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	46869044	46869044	A	C	intronic	TTLL6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr17	46869045	46869045	C	G	intronic	TTLL6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr17	46878822	46878822	T	A	intronic	TTLL6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.973124	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	284	268	16	0
chr17	46878823	46878823	A	T	intronic	TTLL6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.852086	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	234	219	15	0
chr17	4688996	4688996	A	C	intronic	VMO1	NaN	NaN	NaN	rs2279962	NaN	0.446086	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	78	69	9	37
chr17	4692627	4692627	A	A	intronic	GLTPD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	4693170	4693170	T	C	exonic	GLTPD2	NaN	nonsynonymous SNV	GLTPD2:NM_001014985:exon4:c.T455C:p.V152A	rs34850425	NaN	0.989018	0.74	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	-0.69	N	.	.	-1.024	T	0.000	T	0.021	-1.173	0.088	-1.06	-0.620	-0.183	5.055	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	88.2152	0	23.024755	normal_lod	REJECT	9	0	9	10
chr17	4693384	4693384	T	C	exonic	GLTPD2	NaN	synonymous SNV	GLTPD2:NM_001014985:exon4:c.T669C:p.G223G	rs150754782	ID=COSM166585;OCCURENCE=1(haematopoietic_and_lymphoid_tissue),1(endometrium)	0.0179712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.7862	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr17	4693508	4693508	G	C	exonic	GLTPD2	NaN	nonsynonymous SNV	GLTPD2:NM_001014985:exon4:c.G793C:p.V265L	rs34421346	NaN	0.979233	0.31	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	0	N	.	.	-1.034	T	0.000	T	0.066	1.120	9.567	1.12	0.496	-0.070	3.444	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	74.9768	0	22.889326	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	0	8	39
chr17	46939766	46939766	A	A	intronic	CALCOCO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	46940013	46940013	T	T	intronic	CALCOCO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr17	46970674	46970674	A	C	intronic	ATP5G1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	22	19.410254	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	23	13	10	0
chr17	46998477	46998477	T	C	intronic	UBE2Z	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.879275	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	111	104	7	0
chr17	4700718	4700718	T	T	intronic	PSMB6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	47076551	47076551	G	T	intronic	IGF2BP1	NaN	NaN	NaN	rs2411760	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	53.64	0	NaN	NA	NA	8	2	6	22
chr17	47117476	47117476	A	A	intronic	IGF2BP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	15	12	0	0
chr17	47120747	47120747	T	G	intronic	IGF2BP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	4720065	4720065	C	G	intronic	PLD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.145936	nearby_gap_events	REJECT	54	46	8	0
chr17	4720131	4720131	C	G	intronic	PLD2	NaN	NaN	NaN	rs2302325	NaN	0.517772	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	100	NaN	NA	NA	54	47	7	28
chr17	47210429	47210429	A	G	exonic	B4GALNT2	NaN	synonymous SNV	B4GALNT2:NM_153446:exon1:c.A42G:p.E14E	rs7207842	NaN	0.742212	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	103.128927	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	0	37	55
chr17	47210506	47210506	C	A	exonic	B4GALNT2	NaN	nonsynonymous SNV	B4GALNT2:NM_153446:exon1:c.C119A:p.A40D	rs7207403	NaN	0.43111	0.61	T	0.0	B	0.0	B	0.042	N	1.000	P	0	N	2.05	T	-0.919	T	0.000	T	0.05	1.401	10.62	-1.38	-0.291	0.254	0.870	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.843684	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	18	13	49
chr17	47219554	47219554	C	G	intronic	B4GALNT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.581482	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	158	144	14	0
chr17	47219559	47219559	G	T	intronic	B4GALNT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.091317	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	122	109	13	0
chr17	4722194	4722194	G	T	intronic	PLD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.860188	nearby_gap_events	REJECT	79	69	10	0
chr17	47241604	47241604	T	C	exonic	B4GALNT2	NaN	synonymous SNV	B4GALNT2:NM_001159387:exon8:c.T921C:p.N307N,B4GALNT2:NM_001159388:exon8:c.T843C:p.N281N,B4GALNT2:NM_153446:exon8:c.T1101C:p.N367N	rs8074457	NaN	0.996206	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	120.73027	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	0	46	58
chr17	4725920	4725920	T	C	intronic	PLD2	NaN	NaN	NaN	rs2875840	NaN	0.298123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	113	NaN	NA	NA	393	333	60	23
chr17	47301563	47301563	C	C	UTR3	PHOSPHO1	NM_001143804:c.*45G>G,NM_178500:c.*45G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	59	53	0	0
chr17	47301813	47301813	T	G	exonic	PHOSPHO1	NaN	nonsynonymous SNV	PHOSPHO1:NM_001143804:exon3:c.A674C:p.Y225S,PHOSPHO1:NM_178500:exon3:c.A599C:p.Y200S	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.997	D	0.955	D	0.000	D	1.000	D	3.215	M	-0.19	T	0.184	D	0.498	T	0.966	4.917	28.4	5.21	1.965	7.557	14.747	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.10879541914024732	NA	0	0	NaN	NA	NA	20	15	5	0
chr17	4736954	4736954	A	C	intronic	MINK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	68	NaN	NA	NA	66	61	5	0
chr17	47482615	47482615	G	C	intronic	PHB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	10	2	8	0
chr17	47482616	47482616	T	G	intronic	PHB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	10	2	8	0
chr17	47529144	47529144	C	G	intergenic	PHB,LOC101927207	dist=36877;dist=6079	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	47648147	47648147	C	T	ncRNA_intronic	LOC100288866	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	47653488	47653488	T	T	UTR5	NXPH3	NM_007225:c.-94T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	47655832	47655832	T	T	intronic	NXPH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	47778741	47778741	T	T	UTR3	SLC35B1	NM_005827:c.*79A>A,NM_001278784:c.*79A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	47778928	47778928	T	G	intronic	SLC35B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	18.2868	0	9.77373	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	23	7	0
chr17	47778929	47778929	G	T	intronic	SLC35B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.78878	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	22	7	0
chr17	47797839	47797839	A	G	intronic	FAM117A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr17	47886624	47886624	A	A	intronic	KAT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	17	14	0	0
chr17	47903994	47903994	T	T	intronic	KAT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	47916	47916	C	G	intergenic	LOC100506371,RPH3AL	dist=10874;dist=14264	NaN	NaN	rs11656530	NaN	0.798722	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	47928934	47928934	A	A	intergenic	FLJ45513,DLX4	dist=2735;dist=117628	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	47928935	47928935	T	T	intergenic	FLJ45513,DLX4	dist=2736;dist=117627	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	47928936	47928936	G	G	intergenic	FLJ45513,DLX4	dist=2737;dist=117626	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	4794767	4794767	G	C	exonic	MINK1	NaN	nonsynonymous SNV	MINK1:NM_015716:exon16:c.G1757C:p.R586P,MINK1:NM_153827:exon16:c.G1757C:p.R586P,MINK1:NM_170663:exon16:c.G1757C:p.R586P	NaN	NaN	NaN	0.32	T	0.898	P	0.39	B	0.000	D	1.000	D	1.1	L	-0.78	T	-0.710	T	0.253	T	0.494	3.570	18.19	4.78	2.499	5.186	10.406	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr17	4795619	4795619	T	G	intronic	MINK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	49.080459	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	149	114	35	0
chr17	4795620	4795620	G	T	intronic	MINK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	49	11	38	0
chr17	47964897	47964897	C	T	intergenic	FLJ45513,DLX4	dist=38698;dist=81665	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	47976847	47976847	G	G	intergenic	FLJ45513,DLX4	dist=50648;dist=69715	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	4800502	4800502	T	G	exonic	MINK1	NaN	nonsynonymous SNV	MINK1:NM_015716:exon31:c.T3808G:p.F1270V,MINK1:NM_001024937:exon32:c.T3859G:p.F1287V,MINK1:NM_153827:exon32:c.T3919G:p.F1307V,MINK1:NM_170663:exon32:c.T3832G:p.F1278V	NaN	NaN	NaN	0	D	0.981	D	0.943	D	0.000	D	1.000	D	2.515	M	-1.85	D	0.548	D	0.717	D	0.856	3.594	18.30	4.14	1.733	7.824	11.141	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.721745	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	20	14	6	0
chr17	4800523	4800523	G	C	exonic	MINK1	NaN	nonsynonymous SNV	MINK1:NM_015716:exon31:c.G3829C:p.G1277R,MINK1:NM_001024937:exon32:c.G3880C:p.G1294R,MINK1:NM_153827:exon32:c.G3940C:p.G1314R,MINK1:NM_170663:exon32:c.G3853C:p.G1285R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.976	D	0.000	D	1.000	D	2.075	M	-1.55	D	0.444	D	0.664	D	0.787	4.148	21.4	4.14	2.134	9.601	13.927	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2270381836945303	NA	0	0	NaN	NA	NA	12	9	3	0
chr17	4802329	4802329	G	A	exonic	CHRNE	NaN	synonymous SNV	CHRNE:NM_000080:exon11:c.C1293T:p.A431A	rs33978919	NaN	0.191294	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	22	13.940974	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	57	48	9	17
chr17	4803711	4803711	G	A	exonic	C17orf107	NaN	stopgain	C17orf107:NM_001145536:exon3:c.G456A:p.W152X	rs35400274	NaN	0.221645	1	T	.	.	.	.	0.671	N	0.000	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.908	19.87	4.62	2.411	1.993	12.827	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	19	16	3	16
chr17	4804064	4804064	C	C	UTR3	C17orf107	NM_001145536:c.*236C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	16	11	0	0
chr17	4804073	4804073	G	G	UTR3	C17orf107	NM_001145536:c.*245G>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	26	22	0	0
chr17	48046775	48046775	G	A	UTR5	DLX4	NM_138281:c.-58G>A	NaN	NaN	rs58769681	NaN	0.194688	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	162.24581	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	114	50	64	18
chr17	48145725	48145725	A	T	intronic	ITGA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	20	7	13	0
chr17	48148336	48148336	G	A	intronic	ITGA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.470571	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	510	489	21	0
chr17	48148710	48148710	C	A	exonic	ITGA3	NaN	nonsynonymous SNV	ITGA3:NM_002204:exon6:c.C787A:p.P263T,ITGA3:NM_005501:exon6:c.C787A:p.P263T	NaN	NaN	NaN	0.39	T	0.664	P	0.215	B	0.005	N	1.000	N	1.765	L	0.74	T	-0.877	T	0.219	T	0.491	1.586	11.26	4.62	1.369	0.543	7.022	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.027771	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	244	238	6	0
chr17	48152699	48152699	C	A	intronic	ITGA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.08888888888888813	NA	0	0	NaN	NA	NA	16	12	4	0
chr17	48166331	48166331	T	C	intronic	ITGA3	NaN	NaN	NaN	rs16948664	NaN	0.0585064	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr17	48166679	48166679	A	C	UTR3	ITGA3	NM_002204:c.*237A>C,NM_005501:c.*50A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	15	6	5	0
chr17	48183459	48183459	A	G	exonic	PDK2	NaN	synonymous SNV	PDK2:NM_001199900:exon4:c.A543G:p.G181G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	48183471	48183471	G	G	exonic	PDK2	NaN	synonymous SNV	PDK2:NM_001199900:exon4:c.G555G:p.G185G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	48184190	48184190	C	A	exonic	PDK2	NaN	nonsynonymous SNV	PDK2:NM_001199899:exon5:c.C358A:p.H120N,PDK2:NM_002611:exon5:c.C550A:p.H184N,PDK2:NM_001199898:exon6:c.C358A:p.H120N	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.001	B	0.011	B	0.000	D	1.000	D	1.92	M	1.55	T	-1.059	T	0.089	T	0.545	2.913	15.71	4.77	2.475	7.609	16.711	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.575823	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	232	218	14	0
chr17	48184191	48184191	A	C	exonic	PDK2	NaN	nonsynonymous SNV	PDK2:NM_001199899:exon5:c.A359C:p.H120P,PDK2:NM_002611:exon5:c.A551C:p.H184P,PDK2:NM_001199898:exon6:c.A359C:p.H120P	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.598	P	0.706	P	0.000	D	1.000	D	1.965	M	1.51	T	-0.888	T	0.146	T	0.875	4.476	23.9	4.77	2.003	9.087	13.399	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.555796	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	234	218	16	0
chr17	48184286	48184286	CCG	C,CCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	406.318	0	NaN	NA	NA	80	16	21	9
chr17	48184612	48184612	A	G	intronic	PDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	22	12	7	0
chr17	48186586	48186586	T	T	intronic	PDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	48212636	48212636	AG	GA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.07468	0	NaN	NA	NA	12	10	2	0
chr17	48216854	48216854	G	C	exonic	PPP1R9B	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.025783702254290348	NA	0	0	14.118685	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	28	21	7	0
chr17	48216862	48216862	C	T	exonic	PPP1R9B	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	27	20	7	0
chr17	48226811	48226811	C	T	exonic	PPP1R9B	NaN	unknown	UNKNOWN	rs74676292	NaN	0.169529	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	79.172571	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	67	34	33	15
chr17	48227293	48227293	G	A	exonic	PPP1R9B	NaN	unknown	UNKNOWN	rs111354487	NaN	0.01877	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.60355	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	4	4	4
chr17	48243504	48243504	C	T	intronic	SGCA	NaN	NaN	NaN	rs9911548	NaN	0.988618	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.516819	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	49
chr17	48245180	48245180	C	T	intronic	SGCA	NaN	NaN	NaN	rs2696297	NaN	0.867013	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	177.456562	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	74	0	74	58
chr17	48245950	48245950	A	A	intronic	SGCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	48262930	48262930	G	C	exonic	COL1A1	NaN	nonsynonymous SNV	COL1A1:NM_000088:exon51:c.C4328G:p.A1443G	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.997	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	3.185	M	-0.93	T	0.488	D	0.648	D	0.689	3.160	16.57	4.49	2.333	9.595	16.098	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	27	9.607776	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	14	9	5	1
chr17	48262932	48262932	C	A	exonic	COL1A1	NaN	synonymous SNV	COL1A1:NM_000088:exon51:c.G4326T:p.V1442V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	22	8.73964	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	12	7	5	0
chr17	48262933	48262933	A	G	exonic	COL1A1	NaN	nonsynonymous SNV	COL1A1:NM_000088:exon51:c.T4325C:p.V1442A	NaN	NaN	NaN	0	D	0.58	P	0.324	B	0.000	D	0.999	D	2.395	M	-0.92	T	-0.134	T	0.400	T	0.72	2.940	15.80	4.49	1.890	9.081	12.896	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	31	10.352375	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	12	7	5	0
chr17	48264195	48264195	T	C	exonic	COL1A1	NaN	nonsynonymous SNV	COL1A1:NM_000088:exon48:c.A3620G:p.E1207G	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.361	B	0.179	B	0.000	D	1.000	D	2.01	M	-2.59	D	-0.263	T	0.567	D	0.59	0.387	6.103	2.79	0.536	5.990	8.379	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.104275	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	489	478	11	0
chr17	48265495	48265495	T	C	exonic	COL1A1	NaN	nonsynonymous SNV	COL1A1:NM_000088:exon44:c.A3223G:p.T1075A	rs1800215	NaN	0.978834	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-0.31	N	-3.21	D	-0.936	T	0.000	T	0.2	-1.115	0.130	5.13	1.179	0.571	11.680	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	270.478996	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	92	0	92	58
chr17	48267585	48267585	A	C	intronic	COL1A1	NaN	NaN	NaN	rs2075558	NaN	0.432308	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	82	69	13	28
chr17	48269804	48269804	T	T	intronic	COL1A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	48272055	48272055	C	T	intronic	COL1A1	NaN	NaN	NaN	rs2253369	NaN	0.697284	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	130.735	0	NaN	NA	NA	15	0	14	28
chr17	48275137	48275137	C	A	exonic	COL1A1	NaN	nonsynonymous SNV	COL1A1:NM_000088:exon9:c.G652T:p.G218C	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	4.78	H	-6.01	D	0.924	D	0.992	D	0.982	3.736	18.97	4.8	2.357	7.734	17.017	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	25	9	10	0
chr17	48275428	48275428	A	G	intronic	COL1A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.197248	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	53	49	4	0
chr17	48282015	48282015	A	C	intergenic	COL1A1,LOC101927230	dist=3015;dist=10040	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	48355968	48355968	C	T	exonic	TMEM92	NaN	synonymous SNV	TMEM92:NM_153229:exon3:c.C147T:p.N49N,TMEM92:NM_001168215:exon4:c.C147T:p.N49N	rs55649994	NaN	0.0367412	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.089515	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	28	9	6
chr17	48409915	48409915	C	A	intergenic	TMEM92-AS1,XYLT2	dist=44699;dist=13478	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr17	48426529	48426529	T	C	intronic	XYLT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	48431461	48431461	GCC	GC,GCTC,GCT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	191.072	0	NaN	NA	NA	24	0	5	3
chr17	48431825	48431825	G	T	exonic	XYLT2	NaN	nonsynonymous SNV	XYLT2:NM_022167:exon3:c.G685T:p.G229C	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.836	P	0.353	B	0.001	D	0.878	D	0	N	3.61	T	-0.917	T	0.011	T	0.346	2.166	13.20	2.31	1.095	2.296	4.392	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	115	108	7	0
chr17	48431827	48431827	C	G	exonic	XYLT2	NaN	synonymous SNV	XYLT2:NM_022167:exon3:c.C687G:p.G229G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	87	80	7	3
chr17	48435365	48435365	T	A	intronic	XYLT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr17	4844116	4844116	T	T	UTR5	RNF167	NM_015528:c.-89T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	48452481	48452481	T	C	intronic	EME1	NaN	NaN	NaN	rs17714829	NaN	0.0317492	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	108.014802	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	105	57	48	5
chr17	4845768	4845768	G	A	intronic	RNF167	NaN	NaN	NaN	rs238247	NaN	0.322085	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	586.202	0	NaN	NA	NA	83	21	62	48
chr17	48469724	48469724	T	C	intronic	LRRC59	NaN	NaN	NaN	rs757509	NaN	0.483626	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	257.830861	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	88	0	88	48
chr17	48470074	48470074	T	T	intronic	LRRC59	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	48472217	48472217	C	A	intronic	LRRC59	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	41	32	9	2
chr17	4850133	4850133	C	C	intronic	PFN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	48539765	48539765	T	A	intronic	ACSF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.736155	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	119	112	7	0
chr17	48545596	48545596	G	A	exonic	CHAD	NaN	synonymous SNV	CHAD:NM_001267:exon1:c.C579T:p.D193D	rs34864120	NaN	0.188698	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	151.957234	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	0	52	25
chr17	48548332	48548332	A	C	intronic	ACSF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.065887	clustered_read_position	REJECT	26	22	4	0
chr17	48548420	48548420	T	G	exonic	ACSF2	NaN	nonsynonymous SNV	ACSF2:NM_001288971:exon9:c.T767G:p.V256G,ACSF2:NM_001288970:exon10:c.T1118G:p.V373G,ACSF2:NM_001288969:exon11:c.T1208G:p.V403G,ACSF2:NM_001288972:exon11:c.T767G:p.V256G,ACSF2:NM_025149:exon11:c.T1247G:p.V416G,ACSF2:NM_001288968:exon12:c.T1322G:p.V441G	NaN	NaN	NaN	0.13	T	0.751	P	0.599	P	0.000	D	1.000	D	1.9	L	0.94	T	-0.961	T	0.150	T	0.699	1.331	10.37	3.57	0.614	3.330	10.110	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.014162	clustered_read_position	REJECT	39	34	5	0
chr17	48556939	48556939	T	T	intronic	RSAD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	4856076	4856076	T	C	intronic	ENO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr17	48560997	48560997	A	A	intronic	RSAD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	19	17	0	0
chr17	4856580	4856580	T	C	exonic	ENO3	NaN	nonsynonymous SNV	ENO3:NM_001976:exon5:c.T254C:p.V85A,ENO3:NM_053013:exon5:c.T254C:p.V85A	rs238239	NaN	0.303914	0.04	D	0.0	B	0.019	B	.	.	0.000	P	.	.	1.57	T	-0.951	T	0.000	T	0.231	3.121	16.43	4.42	0.998	5.019	11.268	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	332	64	268	50
chr17	4858331	4858331	T	G	intronic	ENO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	4858952	4858952	A	A	intronic	ENO3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr17	48606191	48606191	T	T	exonic	MYCBPAP	NaN	synonymous SNV	MYCBPAP:NM_032133:exon17:c.T2672T:p.L891L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	29	27	0	0
chr17	48613695	48613695	C	G	intronic	EPN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	48614483	48614483	A	G	intronic	EPN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.935364	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	303	297	6	0
chr17	48631891	48631891	G	T	intronic	SPATA20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.968904	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	50	40	10	0
chr17	48633176	48633176	A	A	UTR3	SPATA20	NM_001258373:c.*153A>A,NM_001258372:c.*153A>A,NM_022827:c.*153A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr17	4863410	4863410	A	G	intronic	SPAG7	NaN	NaN	NaN	rs238224	NaN	0.702875	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	50	5	45	57
chr17	48646427	48646427	T	G	intronic	CACNA1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.293489	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	10	4	6	0
chr17	48653616	48653616	C	A	exonic	CACNA1G	NaN	nonsynonymous SNV	CACNA1G:NM_001256324:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_001256325:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_001256326:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_001256327:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_001256328:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_001256329:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_001256330:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_001256331:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_001256332:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_001256333:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_001256334:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_001256359:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_001256360:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_001256361:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_018896:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_198376:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_198377:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_198378:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_198379:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_198380:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_198382:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_198383:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_198384:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_198385:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_198386:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_198387:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_198388:exon8:c.C1853A:p.T618N,CACNA1G:NM_198396:exon8:c.C1853A:p.T618N	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.999	D	0.989	D	0.012	N	0.912	D	0.805	L	-4.0	D	0.885	D	0.860	D	0.182	2.718	15.05	4.58	1.350	2.978	9.197	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.676984	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	171	149	22	0
chr17	48663291	48663291	A	C	intronic	CACNA1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	48667837	48667837	G	C	exonic	CACNA1G	NaN	nonsynonymous SNV	CACNA1G:NM_001256324:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_001256325:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_001256326:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_001256327:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_001256328:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_001256329:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_001256330:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_001256331:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_001256332:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_001256333:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_001256334:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_001256359:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_001256360:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_001256361:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_018896:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_198376:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_198377:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_198378:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_198379:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_198380:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_198382:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_198383:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_198384:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_198385:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_198386:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_198387:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_198388:exon10:c.G2307C:p.E769D,CACNA1G:NM_198396:exon10:c.G2307C:p.E769D	NaN	NaN	NaN	0.39	T	0.17	B	0.146	B	0.000	D	0.999	D	0.28	N	-4.38	D	0.061	D	0.734	D	0.538	1.759	11.84	2.05	0.457	0.154	9.298	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.124037	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	223	209	14	0
chr17	48668962	48668962	C	A	exonic	CACNA1G	NaN	nonsynonymous SNV	CACNA1G:NM_001256324:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_001256325:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_001256326:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_001256327:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_001256328:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_001256329:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_001256330:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_001256331:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_001256332:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_001256333:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_001256334:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_001256359:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_001256360:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_001256361:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_018896:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_198376:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_198377:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_198378:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_198379:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_198380:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_198382:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_198383:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_198384:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_198385:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_198386:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_198387:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_198388:exon11:c.C2620A:p.L874I,CACNA1G:NM_198396:exon11:c.C2620A:p.L874I	NaN	NaN	NaN	0.57	T	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	1.44	L	-5.05	D	1.045	D	0.952	D	0.703	5.012	29.5	5.55	2.623	6.085	19.505	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.340539	clustered_read_position,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	19	16	3	0
chr17	48669487	48669487	A	A	intronic	CACNA1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr17	48674039	48674039	C	C	intronic	CACNA1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	69	NaN	NA	NA	86	73	0	0
chr17	48681505	48681505	C	T	intronic	CACNA1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.322246	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	68	57	11	0
chr17	48684175	48684175	T	C	intronic	CACNA1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr17	48684185	48684185	A	C	intronic	CACNA1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	16	11	4	0
chr17	48684186	48684186	C	T	intronic	CACNA1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	16	12	4	0
chr17	48692881	48692881	C	T	intronic	CACNA1G	NaN	NaN	NaN	rs8066527	NaN	0.20008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	46.673341	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	9	19	26
chr17	48693760	48693760	G	C	intronic	CACNA1G	NaN	NaN	NaN	rs4794171	NaN	0.211462	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	7.778126570134686E-5	Somatic	247.024	70	121.446755	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	114	58	56	18
chr17	48698861	48698861	T	G	intronic	CACNA1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	41	22	19	0
chr17	48701693	48701693	C	A	intronic	CACNA1G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.158797	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	74	64	10	0
chr17	4872077	4872077	G	A	exonic	CAMTA2	NaN	nonsynonymous SNV	CAMTA2:NM_001171166:exon21:c.C3568T:p.L1190F,CAMTA2:NM_001171168:exon22:c.C3580T:p.L1194F,CAMTA2:NM_001171167:exon23:c.C3650T:p.A1217V,CAMTA2:NM_015099:exon23:c.C3583T:p.L1195F	rs144756230	NaN	NaN	0.09	T	0.997	D	0.991	D	0.033	N	0.968	N	0.69	N	1.57	T	-1.034	T	0.118	T	0.325	3.514	17.95	4.7	2.151	1.335	8.884	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.391864	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	648	629	19	0
chr17	4872078	4872078	C	G	exonic	CAMTA2	NaN	nonsynonymous SNV	CAMTA2:NM_001171167:exon23:c.G3649C:p.A1217P	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.001	B	0.001	B	.	.	1.000	D	.	.	2.59	T	-1.033	T	0.022	T	0.134	2.671	14.89	1.21	0.912	-0.015	3.393	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.492356	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	362	341	21	0
chr17	48738365	48738365	GCCC	CAGG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.46137	0	NaN	NA	NA	13	11	2	0
chr17	48738370	48738370	C	G	exonic	ABCC3	NaN	nonsynonymous SNV	ABCC3:NM_001144070:exon8:c.C893G:p.S298C,ABCC3:NM_003786:exon8:c.C893G:p.S298C	NaN	NaN	NaN	0.09	T	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.89	M	-2.98	D	0.938	D	0.886	D	0.564	2.883	15.61	5.18	2.406	2.638	17.685	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.90568	0	NaN	NA	NA	14	12	2	0
chr17	48740965	48740965	T	T	intronic	ABCC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	48752659	48752659	A	G	intronic	ABCC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.506186	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	194	188	6	0
chr17	48753215	48753215	T	T	intronic	ABCC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	38	31	0	0
chr17	48761022	48761022	G	C	exonic	ABCC3	NaN	nonsynonymous SNV	ABCC3:NM_003786:exon27:c.G3859C:p.G1287R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.035	M	-2.84	D	0.945	D	0.866	D	0.975	4.861	27.8	4.98	1.531	9.711	15.107	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	33.116	0	NaN	NA	NA	8	3	3	2
chr17	48761105	48761105	C	T	exonic	ABCC3	NaN	synonymous SNV	ABCC3:NM_003786:exon27:c.C3942T:p.H1314H	rs2277624	NaN	0.286941	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	102.601566	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	29	43	26
chr17	48773320	48773320	C	G	UTR3	ANKRD40	NM_052855:c.*38G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	48773323	48773323	T	A	UTR3	ANKRD40	NM_052855:c.*35A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	48818428	48818428	T	T	intronic	LUC7L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	48818964	48818964	C	T	intronic	LUC7L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr17	48821042	48821042	T	G	intronic	LUC7L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr17	48821044	48821044	T	G	intronic	LUC7L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.619811	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	47	39	8	1
chr17	4882952	4882952	G	A	intronic	CAMTA2	NaN	NaN	NaN	rs1859434	NaN	0.71845	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	64	NaN	NA	NA	47	5	42	49
chr17	4889568	4889568	A	G	exonic	CAMTA2	NaN	nonsynonymous SNV	CAMTA2:NM_001171167:exon2:c.T19C:p.S7P,CAMTA2:NM_001171168:exon2:c.T19C:p.S7P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.986	D	.	.	1.000	D	0	N	2.57	T	-0.939	T	0.099	T	0.364	2.588	14.61	4.6	1.924	1.082	10.303	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.510501	nearby_gap_events	REJECT	93	84	9	0
chr17	48913390	48913390	G	A	exonic	WFIKKN2	NaN	nonsynonymous SNV	WFIKKN2:NM_175575:exon1:c.G92A:p.R31Q	rs55700534	NaN	0.00299521	0.67	T	0.0	B	0.0	B	0.114	N	1.000	N	0	N	-1.4	T	-0.976	T	0.115	T	0.062	-0.042	3.802	-3.06	-0.258	0.139	1.988	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	44	25	19	0
chr17	4891532	4891532	T	G	UTR3	INCA1	NM_213726:c.*168A>C,NM_001167985:c.*168A>C,NM_001167986:c.*168A>C,NM_001167987:c.*168A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.627494	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	65	56	9	0
chr17	4891533	4891533	G	T	UTR3	INCA1	NM_213726:c.*167C>A,NM_001167985:c.*167C>A,NM_001167986:c.*167C>A,NM_001167987:c.*167C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.320159	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	64	55	9	0
chr17	4892020	4892020	A	A	intronic	INCA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	4892938	4892938	A	G	intronic	INCA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	24	14	9	0
chr17	4893242	4893242	G	A	intronic	INCA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.381823	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	135	129	6	0
chr17	4904732	4904732	A	A	intronic	KIF1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	4905963	4905963	G	C	intronic	KIF1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.599245	nearby_gap_events	REJECT	253	238	15	0
chr17	4905964	4905964	C	A	intronic	KIF1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.418578	nearby_gap_events	REJECT	253	238	15	0
chr17	4905966	4905966	A	G	intronic	KIF1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.28443	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	248	234	14	0
chr17	4906070	4906070	A	A	exonic	KIF1C	NaN	synonymous SNV	KIF1C:NM_006612:exon8:c.A653A:p.H218H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	35	30	0	0
chr17	49063042	49063042	T	T	intronic	SPAG9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr17	49063270	49063270	C	G	intronic	SPAG9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	1	3	0
chr17	49067054	49067054	G	A	exonic	SPAG9	NaN	nonsynonymous SNV	SPAG9:NM_001251971:exon17:c.C2326T:p.P776S,SPAG9:NM_003971:exon20:c.C2755T:p.P919S,SPAG9:NM_001130527:exon21:c.C2767T:p.P923S,SPAG9:NM_001130528:exon21:c.C2797T:p.P933S	NaN	NaN	NaN	0.42	T	0.494	P	0.102	B	0.001	D	0.996	D	0.865	L	1.99	T	-1.072	T	0.036	T	0.43	2.650	14.82	5.77	2.728	4.618	14.783	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.942532	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	438	429	9	0
chr17	49068096	49068096	A	A	intronic	SPAG9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	15	14	0	0
chr17	49072743	49072743	T	G	intronic	SPAG9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.456708	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	179	167	12	0
chr17	49072957	49072957	A	A	intronic	SPAG9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	24	20	0	0
chr17	4908399	4908399	A	T	intronic	KIF1C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr17	49233095	49233095	G	T	exonic	NME1,NME1-NME2	NaN	nonsynonymous SNV	NME1:NM_000269:exon2:c.G80T:p.R27L,NME1-NME2:NM_001018136:exon2:c.G80T:p.R27L,NME1:NM_198175:exon3:c.G155T:p.R52L	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	.	.	1.000	D	3.88	H	0.35	T	0.351	D	0.503	D	0.907	5.401	34	4.93	2.255	9.676	18.180	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.878315	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	243	231	12	0
chr17	49233096	49233096	T	G	exonic	NME1,NME1-NME2	NaN	synonymous SNV	NME1:NM_000269:exon2:c.T81G:p.R27R,NME1-NME2:NM_001018136:exon2:c.T81G:p.R27R,NME1:NM_198175:exon3:c.T156G:p.R52R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.71061	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	221	212	9	0
chr17	49238658	49238658	T	C	intronic	NME1,NME1-NME2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.712899	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	129	118	11	0
chr17	4926882	4926882	A	G	exonic	KIF1C	NaN	synonymous SNV	KIF1C:NM_006612:exon23:c.A2748G:p.P916P	rs346828	ID=COSM1162595;OCCURENCE=1(pancreas)	0.67512	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	57.062942	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	0	22	47
chr17	49269967	49269967	T	T	intronic	MBTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	49280309	49280309	C	A	intronic	MBTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	111.463833	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	449	380	69	0
chr17	49280310	49280310	A	C	intronic	MBTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	72.676998	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	346	298	48	0
chr17	49280492	49280492	G	G	intronic	MBTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	56	54	0	0
chr17	49297544	49297544	T	T	intronic	MBTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	13	10	0	0
chr17	49338014	49338014	C	G	exonic	UTP18	NaN	synonymous SNV	UTP18:NM_016001:exon1:c.C69G:p.P23P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.890228	clustered_read_position	REJECT	31	25	6	0
chr17	49338257	49338257	C	T	exonic	UTP18	NaN	synonymous SNV	UTP18:NM_016001:exon1:c.C312T:p.D104D	rs14180	NaN	0.058107	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.552822	normal_lod	REJECT	4	1	3	0
chr17	49353474	49353474	A	A	intronic	UTP18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	4	0	0
chr17	49354461	49354461	T	T	intronic	UTP18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	28	21	0	0
chr17	4936336	4936336	A	T	exonic	SLC52A1	NaN	synonymous SNV	SLC52A1:NM_001104577:exon5:c.T1263A:p.L421L,SLC52A1:NM_017986:exon5:c.T1263A:p.L421L	rs72822610	NaN	0.10004	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	119	17	102	20
chr17	49632018	49632018	G	G	intergenic	LOC440446,CA10	dist=212086;dist=75656	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	49708986	49708986	A	G	intronic	CA10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.516146	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	43	35	8	0
chr17	49716279	49716279	G	A	intronic	CA10	NaN	NaN	NaN	rs1468119	NaN	0.0611022	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr17	50149588	50149588	T	A	intronic	CA10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	2	0
chr17	50235196	50235196	G	G	UTR5	CA10	NM_020178:c.-50C>C,NM_001082534:c.-50C>C,NM_001082533:c.-50C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	86	73	0	0
chr17	5036849	5036849	T	C	intronic	USP6	NaN	NaN	NaN	rs3867174	NaN	0.590855	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	62.2578	0	NaN	NA	NA	31	0	31	36
chr17	5042705	5042705	T	C	exonic	USP6	NaN	nonsynonymous SNV	USP6:NM_004505:exon14:c.T1234C:p.S412P,USP6:NM_001304284:exon22:c.T1234C:p.S412P	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.782	P	0.504	P	0.000	D	1.000	N	0.55	N	2.68	T	-1.064	T	0.042	T	0.229	0.949	8.869	0.046	0.115	-0.123	.	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.06583284182770588	NA	0	0	NaN	NA	NA	27	21	6	1
chr17	5044652	5044652	A	A	intronic	USP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	5044653	5044653	C	C	intronic	USP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	505129	505129	A	C	exonic	VPS53	NaN	nonsynonymous SNV	VPS53:NM_018289:exon11:c.T1037G:p.L346R,VPS53:NM_001128159:exon12:c.T1124G:p.L375R	rs61644407	NaN	0.122204	0.51	T	0.344	B	0.089	B	0.004	N	0.132	P	0.805	L	1.44	T	-0.978	T	0.000	T	0.441	0.004	4.034	5.81	2.226	3.026	8.182	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	72	NaN	NA	NA	202	159	43	10
chr17	505139	505139	G	A	intronic	VPS53	NaN	NaN	NaN	rs56807006	NaN	0.0692891	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	202	43	159	15
chr17	505199	505199	A	A	intronic	VPS53	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr17	5073936	5073936	C	T	exonic	USP6	NaN	nonsynonymous SNV	USP6:NM_004505:exon28:c.C3680T:p.A1227V,USP6:NM_001304284:exon36:c.C3680T:p.A1227V	NaN	ID=COSM264630;OCCURENCE=1(large_intestine)	NaN	0.03	D	0.574	P	0.388	B	0.010	N	1.000	N	0.895	L	2.86	T	-1.068	T	0.034	T	0.149	1.349	10.43	2.35	1.313	0.593	6.370	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.930624	nearby_gap_events,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	94	89	5	0
chr17	5085075	5085075	T	A	UTR3	ZNF594	NM_032530:c.*53A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.01	D	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-0.951	T	0.102	T	.	0.141	4.759	-2.45	-1.267	0.227	6.423	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	13	6	7	0
chr17	51064760	51064760	A	G	UTR3	C17orf112	NM_001243552:c.*79A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	29	20	7	0
chr17	51900680	51900680	T	C	exonic	KIF2B	NaN	nonsynonymous SNV	KIF2B:NM_032559:exon1:c.T286C:p.S96P	NaN	NaN	NaN	0.37	T	0.001	B	0.003	B	0.095	N	1.000	N	-0.805	N	-0.82	T	-1.013	T	0.107	T	0.117	-0.776	0.742	-6.77	-0.724	-1.384	1.708	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	48.3637	0	NaN	NA	NA	107	79	25	1
chr17	51900814	51900814	T	C	exonic	KIF2B	NaN	synonymous SNV	KIF2B:NM_032559:exon1:c.T420C:p.C140C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.604865	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	303	292	11	0
chr17	51900987	51900987	T	A	exonic	KIF2B	NaN	nonsynonymous SNV	KIF2B:NM_032559:exon1:c.T593A:p.L198Q	NaN	NaN	NaN	0	D	0.998	D	0.957	D	0.038	N	0.974	D	2.08	M	2.18	T	-0.958	T	0.116	T	0.551	2.717	15.05	5.37	2.147	2.606	10.023	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.71202	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	39	34	5	0
chr17	52925878	52925878	T	G	intergenic	KIF2B,TOM1L1	dist=1023305;dist=52174	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	52981198	52981198	A	G	intronic	TOM1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.749466	clustered_read_position	REJECT	65	60	5	0
chr17	53014411	53014411	T	T	intronic	TOM1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr17	53027538	53027538	A	A	intronic	TOM1L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr17	53078115	53078115	T	A	intronic	STXBP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	28	18	6	0
chr17	5308308	5308308	G	A	intronic	NUP88	NaN	NaN	NaN	rs8067757	NaN	0.0321486	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	111	22	89	6
chr17	5323644	5323644	A	A	intronic	RPAIN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr17	53342796	53342796	G	GTTTC	UTR5	HLF	NM_002126:c.-50G>GTTTC	NaN	NaN	NaN	NaN	0.755391	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	129.677	0	NaN	NA	NA	36	13	19	10
chr17	53398298	53398298	A	A	UTR3	HLF	NM_002126:c.*58A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr17	5347704	5347704	G	A	exonic	DHX33	NaN	nonsynonymous SNV	DHX33:NM_001199699:exon11:c.C1426T:p.P476S,DHX33:NM_020162:exon12:c.C1945T:p.P649S	NaN	NaN	NaN	0.22	T	0.339	B	0.148	B	0.000	D	1.000	D	1.445	L	4.08	T	-1.071	T	0.025	T	0.5	2.130	13.08	4.45	2.467	2.164	8.362	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.309014	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	677	669	8	0
chr17	53498990	53498990	T	C	intronic	MMD	NaN	NaN	NaN	rs78612327	NaN	0.178115	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	134.226	0	NaN	NA	NA	39	15	24	27
chr17	5408132	5408132	T	T	intronic	NLRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	5418915	5418915	A	A	intronic	NLRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	93	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr17	5421030	5421030	C	G	intronic	NLRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr17	5421033	5421033	C	G	intronic	NLRP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr17	54230976	54230976	A	A	intronic	ANKFN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	5424376	5424376	G	A	intronic	NLRP1	NaN	NaN	NaN	rs12944976	NaN	0.202875	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	199	47	152	43
chr17	5425077	5425077	T	C	exonic	NLRP1	NaN	nonsynonymous SNV	NLRP1:NM_033006:exon12:c.A3460G:p.M1154V,NLRP1:NM_033007:exon12:c.A3460G:p.M1154V,NLRP1:NM_001033053:exon13:c.A3562G:p.M1188V,NLRP1:NM_014922:exon13:c.A3550G:p.M1184V,NLRP1:NM_033004:exon13:c.A3550G:p.M1184V	rs11651270	NaN	0.417931	1	T	0.0	B	0.0	B	0.058	N	1.000	P	-2.485	N	2.82	T	-0.940	T	0.000	T	0.061	-1.251	0.051	2.26	0.565	0.439	6.051	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	242	48	194	46
chr17	5436263	5436263	C	T	exonic	NLRP1	NaN	nonsynonymous SNV	NLRP1:NM_033006:exon10:c.G3085A:p.V1029M,NLRP1:NM_033007:exon10:c.G3085A:p.V1029M,NLRP1:NM_001033053:exon11:c.G3187A:p.V1063M,NLRP1:NM_014922:exon11:c.G3175A:p.V1059M,NLRP1:NM_033004:exon11:c.G3175A:p.V1059M	rs2301582	NaN	0.184305	0.09	T	0.769	P	0.055	B	0.758	N	1.000	P	0	N	-0.48	T	-1.036	T	0.000	T	0.097	0.972	8.966	0.836	0.255	-0.977	6.211	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	63	8	55	42
chr17	54449968	54449968	CAGAA	C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	305.311	0	NaN	NA	NA	145	72	59	0
chr17	5456713	5456713	T	C	exonic	NLRP1	NaN	nonsynonymous SNV	NLRP1:NM_001033053:exon5:c.A2521G:p.T841A,NLRP1:NM_014922:exon5:c.A2521G:p.T841A,NLRP1:NM_033004:exon5:c.A2521G:p.T841A,NLRP1:NM_033006:exon5:c.A2521G:p.T841A,NLRP1:NM_033007:exon5:c.A2521G:p.T841A	NaN	NaN	NaN	0.14	T	0.994	D	0.904	P	0.037	N	1.000	N	2.38	M	1.04	T	-0.854	T	0.217	T	0.221	3.202	16.72	4.48	2.032	1.531	10.367	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.615731	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	452	414	38	0
chr17	54671538	54671538	T	T	UTR5	NOG	NM_005450:c.-47T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	54834	54834	T	T	intergenic	LOC100506371,RPH3AL	dist=17792;dist=7346	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	5485367	5485367	A	T	exonic	NLRP1	NaN	nonsynonymous SNV	NLRP1:NM_001033053:exon3:c.T464A:p.L155H,NLRP1:NM_014922:exon3:c.T464A:p.L155H,NLRP1:NM_033004:exon3:c.T464A:p.L155H,NLRP1:NM_033006:exon3:c.T464A:p.L155H,NLRP1:NM_033007:exon3:c.T464A:p.L155H	rs12150220	ID=COSM1130227;OCCURENCE=1(prostate)	0.192093	0.15	T	0.997	D	0.823	P	.	.	1.000	P	0.345	N	0.99	T	-0.972	T	0.000	T	0.252	1.746	11.80	-1.07	-0.277	-1.072	0.444	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.805367	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	2	7	29
chr17	54925498	54925498	G	G	intronic	DGKE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	94	76	0	0
chr17	54926539	54926539	T	A	intronic	DGKE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.007120024016308182	NA	0	0	NaN	NA	NA	13	7	6	0
chr17	54991194	54991194	C	A	exonic	TRIM25	NaN	nonsynonymous SNV	TRIM25:NM_005082:exon1:c.G156T:p.Q52H	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.524	P	0.452	P	0.002	N	0.995	D	1.9	L	2.27	T	-1.079	T	0.042	T	0.347	1.604	11.32	-3.07	-0.376	-0.034	2.927	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	28	17	11	0
chr17	54991195	54991195	T	G	exonic	TRIM25	NaN	nonsynonymous SNV	TRIM25:NM_005082:exon1:c.A155C:p.Q52P	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.999	D	0.989	D	0.002	N	1.000	D	2.795	M	2.27	T	-0.858	T	0.139	T	0.868	3.810	19.35	5.2	2.185	6.021	14.886	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	28	17	9	0
chr17	54991196	54991196	G	A	exonic	TRIM25	NaN	stopgain	TRIM25:NM_005082:exon1:c.C154T:p.Q52X	NaN	NaN	NaN	0.08	T	.	.	.	.	0.002	N	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.940	28.7	5.2	2.706	7.653	18.514	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	46	13.484596	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	25	19	6	0
chr17	55055603	55055603	T	C	intronic	SCPEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.953644	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	4	1	3	0
chr17	55182711	55182711	T	T	intronic	AKAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	35	34	0	0
chr17	55193669	55193669	A	A	intronic	AKAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	55334971	55334971	A	G	intronic	MSI2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	55479442	55479442	G	A	intronic	MSI2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	55479901	55479901	C	C	intronic	MSI2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	55607238	55607238	C	A	intronic	MSI2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	55674120	55674120	C	A	intronic	MSI2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	55674121	55674121	A	G	intronic	MSI2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	55904563	55904563	G	A	intergenic	CCDC182,MRPS23	dist=81873;dist=11724	NaN	NaN	rs11871764	NaN	0.129593	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr17	55912128	55912128	A	G	intergenic	CCDC182,MRPS23	dist=89438;dist=4159	NaN	NaN	rs10515150	NaN	0.158347	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	8	6	0
chr17	55946562	55946562	G	T	intronic	CUEDC1	NaN	NaN	NaN	rs79637497	NaN	0.0259585	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	112.99556	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	108	61	47	16
chr17	55946626	55946626	A	A	intronic	CUEDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	55949993	55949993	C	A	intronic	CUEDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	55951143	55951143	A	A	intronic	CUEDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr17	55973111	55973111	C	C	intronic	CUEDC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	56232690	56232690	T	C	exonic	OR4D1	NaN	nonsynonymous SNV	OR4D1:NM_012374:exon1:c.T176C:p.M59T	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.992	D	0.000	N	0.995	D	3.31	M	2.94	T	-0.955	T	0.107	T	0.44	3.380	17.40	4.56	0.974	5.021	9.709	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.758303	nearby_gap_events	REJECT	157	149	8	0
chr17	56274649	56274649	A	A	intronic	EPX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	13	7	0	0
chr17	56276361	56276361	T	T	intronic	EPX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	16	14	0	0
chr17	56277213	56277213	A	A	intronic	EPX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	56281718	56281718	C	A	exonic	EPX	NaN	stopgain	EPX:NM_000502:exon12:c.C2082A:p.Y694X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.074	N	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	5.561	35	-0.2	-0.381	-1.179	10.806	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.054052	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	203	183	20	0
chr17	56281727	56281727	C	T	exonic	EPX	NaN	synonymous SNV	EPX:NM_000502:exon12:c.C2091T:p.G697G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.650667	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	228	209	19	0
chr17	56283927	56283927	A	A	intronic	MKS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr17	56285529	56285529	C	T	exonic	MKS1	NaN	nonsynonymous SNV	MKS1:NM_001165927:exon13:c.G1072A:p.V358M,MKS1:NM_017777:exon13:c.G1102A:p.V368M	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.978	D	0.926	D	0.000	D	1.000	D	2.67	M	-0.53	T	0.180	D	0.551	D	0.814	4.896	28.2	5.58	2.617	5.160	17.071	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.470824	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	186	171	15	1
chr17	56285543	56285543	A	G	intronic	MKS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.351246	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	167	155	12	0
chr17	56288482	56288482	G	G	intronic	MKS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	56291059	56291059	T	T	intronic	MKS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	56295914	56295914	A	C	intronic	MKS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	56295916	56295916	T	A	intronic	MKS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	56320228	56320228	T	T	intronic	LPO	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr17	56328040	56328040	A	G	intronic	LPO	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	22	14	6	0
chr17	56342375	56342375	A	G	intronic	LPO	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	56342379	56342379	C	T	intronic	LPO	NaN	NaN	NaN	rs8178399	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	56345399	56345399	A	A	UTR3	LPO	NM_006151:c.*44A>A,NM_001160102:c.*44A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	56356897	56356897	T	T	exonic	MPO	NaN	synonymous SNV	MPO:NM_000250:exon4:c.A535A:p.M179M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	42	39	0	0
chr17	56385252	56385252	G	A	exonic	BZRAP1	NaN	synonymous SNV	BZRAP1:NM_024418:exon22:c.C4602T:p.G1534G,BZRAP1:NM_001261835:exon23:c.C4782T:p.G1594G,BZRAP1:NM_004758:exon23:c.C4782T:p.G1594G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.734026	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	242	226	16	0
chr17	56386118	56386118	A	G	exonic	BZRAP1	NaN	synonymous SNV	BZRAP1:NM_024418:exon21:c.T4335C:p.D1445D,BZRAP1:NM_001261835:exon22:c.T4515C:p.D1505D,BZRAP1:NM_004758:exon22:c.T4515C:p.D1505D	rs2680689	ID=COSM436987,COSM436986;OCCURENCE=2(breast)	0.283946	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	16.2344	30	7.925701	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	6	3	3	13
chr17	56387139	56387139	T	C	intronic	BZRAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr17	56389446	56389446	G	C	exonic	BZRAP1	NaN	synonymous SNV	BZRAP1:NM_024418:exon16:c.C2556G:p.A852A,BZRAP1:NM_001261835:exon17:c.C2736G:p.A912A,BZRAP1:NM_004758:exon17:c.C2736G:p.A912A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	35	32	3	0
chr17	56393568	56393568	A	A	intronic	BZRAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	56395739	56395739	C	A	exonic	BZRAP1	NaN	nonsynonymous SNV	BZRAP1:NM_024418:exon13:c.G1594T:p.G532W,BZRAP1:NM_001261835:exon14:c.G1774T:p.G592W,BZRAP1:NM_004758:exon14:c.G1774T:p.G592W	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.998	D	0.114	N	0.843	N	1.1	L	-2.32	D	0.137	D	0.682	D	0.705	3.481	17.81	4.89	2.538	0.977	13.433	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.764547	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	128	110	18	0
chr17	56395740	56395740	A	C	exonic	BZRAP1	NaN	synonymous SNV	BZRAP1:NM_024418:exon13:c.T1593G:p.T531T,BZRAP1:NM_001261835:exon14:c.T1773G:p.T591T,BZRAP1:NM_004758:exon14:c.T1773G:p.T591T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.550683	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	128	110	18	0
chr17	56400455	56400455	C	T	intronic	BZRAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.997375	nearby_gap_events	REJECT	144	137	7	0
chr17	56402179	56402179	G	T	exonic	BZRAP1	NaN	nonsynonymous SNV	BZRAP1:NM_024418:exon4:c.C755A:p.P252Q,BZRAP1:NM_001261835:exon5:c.C935A:p.P312Q,BZRAP1:NM_004758:exon5:c.C935A:p.P312Q	NaN	NaN	NaN	0.41	T	1.0	D	0.982	D	0.045	N	0.980	N	1.955	M	3.12	T	-1.095	T	0.052	T	0.496	4.215	21.9	4.26	2.488	2.344	11.776	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	21	6.552828	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	2	0	2	0
chr17	56403957	56403957	T	T	ncRNA_intronic	BZRAP1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	56423757	56423757	A	T	ncRNA_intronic	BZRAP1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	27	5	22	0
chr17	56438301	56438301	G	A	exonic	RNF43	NaN	nonsynonymous SNV	RNF43:NM_017763:exon7:c.C692T:p.P231L	rs2680701	NaN	0.0824681	0.68	T	0.959	D	0.305	B	0.711	N	0.000	P	0.895	L	3.18	T	-0.953	T	0.000	T	0.171	3.184	16.66	3.65	0.939	7.333	12.140	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	61.219081	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	8	26	18
chr17	56448311	56448311	A	G	exonic	RNF43	NaN	synonymous SNV	RNF43:NM_017763:exon3:c.T336C:p.P112P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.65525	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	156	146	10	0
chr17	56492800	56492800	T	C	exonic	RNF43	NaN	nonsynonymous SNV	RNF43:NM_017763:exon2:c.A139G:p.I47V	rs3744093	NaN	0.373802	0.49	T	0.002	B	0.003	B	0.069	N	0.000	P	0.345	N	3.24	T	-0.954	T	0.000	T	0.057	0.992	9.051	3.19	0.973	1.086	6.236	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	17.9188	29	8.723524	normal_lod	REJECT	13	9	4	21
chr17	5650959	5650959	C	A	intergenic	NLRP1,LOC339166	dist=163127;dist=24595	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	12	5	6	0
chr17	56565584	56565584	G	A	exonic	HSF5	NaN	synonymous SNV	HSF5:NM_001080439:exon1:c.C52T:p.L18L	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.535	T	0.269	T	.	-0.841	0.572	4.05	2.265	3.045	9.232	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.04150197628458451	NA	0	0	7.332834	clustered_read_position	REJECT	8	5	3	0
chr17	56581764	56581764	T	C	exonic	MTMR4	NaN	nonsynonymous SNV	MTMR4:NM_004687:exon13:c.A1385G:p.D462G	NaN	NaN	0.000199681	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	1.79	L	-2.67	D	0.784	D	0.811	D	0.871	4.521	24.3	5.63	2.141	7.655	15.019	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.338071	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	213	208	5	0
chr17	56582973	56582973	A	A	intronic	MTMR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr17	56584623	56584623	C	T	exonic	MTMR4	NaN	stopgain	MTMR4:NM_004687:exon9:c.G723A:p.W241X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	6.035	37	5.39	2.713	5.959	18.554	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.796554	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	332	326	6	0
chr17	56590143	56590143	T	T	intronic	MTMR4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	56599015	56599015	A	G	ncRNA_intronic	SEPT4-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.731043	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	127	121	6	0
chr17	56599457	56599457	T	C	exonic	SEPT4	NaN	nonsynonymous SNV	SEPT4:NM_001198713:exon6:c.A644G:p.K215R,SEPT4:NM_001256822:exon6:c.A227G:p.K76R,SEPT4:NM_004574:exon6:c.A668G:p.K223R,SEPT4:NM_080415:exon6:c.A611G:p.K204R,SEPT4:NM_080416:exon6:c.A611G:p.K204R,SEPT4:NM_001256782:exon7:c.A713G:p.K238R	NaN	NaN	NaN	0.57	T	0.002	B	0.007	B	0.001	N	0.995	D	0.915	L	0.68	T	-1.077	T	0.077	T	0.164	1.541	11.10	2.61	0.157	2.249	8.714	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.239924	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	239	232	7	0
chr17	56606611	56606611	A	G	ncRNA_intronic	SEPT4-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	11	5	4	0
chr17	56620532	56620532	G	T	exonic	C17orf47	NaN	nonsynonymous SNV	C17orf47:NM_001038704:exon1:c.C1016A:p.P339Q	NaN	NaN	NaN	0	D	0.996	D	0.964	D	0.184	N	1.000	N	0.895	L	1.3	T	-0.954	T	0.147	T	0.2	3.342	17.25	5.32	2.487	1.240	14.487	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.486873	nearby_gap_events	REJECT	98	90	8	0
chr17	56621288	56621288	C	T	exonic	C17orf47	NaN	nonsynonymous SNV	C17orf47:NM_001038704:exon1:c.G260A:p.G87E	NaN	NaN	NaN	0.88	T	0.982	D	0.866	P	0.000	D	1.000	N	0.975	L	0.85	T	-0.940	T	0.152	T	0.68	1.695	11.63	4.18	0.681	1.483	14.149	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	215	114	101	28
chr17	56636970	56636970	A	T	intronic	TEX14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	56650489	56650489	T	T	intronic	TEX14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	56665455	56665455	A	A	intronic	TEX14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	15	15	0	0
chr17	57057228	57057228	T	T	intronic	PPM1E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr17	5705980	5705980	G	T	ncRNA_intronic	LOC339166	NaN	NaN	NaN	rs2309407	NaN	0.805312	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	57092915	57092915	T	T	intronic	TRIM37	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	15	11	0	0
chr17	57125202	57125202	A	A	intronic	TRIM37	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr17	57126787	57126787	A	A	intronic	TRIM37	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr17	57141776	57141776	A	G	intronic	TRIM37	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.620535	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	179	160	19	0
chr17	57196971	57196971	A	A	intronic	SKA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	13	12	0	0
chr17	57247170	57247170	CAAAAAAA	CAAAAAA,CAAAAA,CAAAAAAG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	254.118	0	NaN	NA	NA	71	1	24	1
chr17	57262550	57262550	G	A	exonic	PRR11	NaN	synonymous SNV	PRR11:NM_018304:exon3:c.G264A:p.Q88Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.795986	possible_contamination	REJECT	128	122	6	0
chr17	57270	57270	T	A	intergenic	LOC100506371,RPH3AL	dist=20228;dist=4910	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	57272079	57272079	G	A	intronic	PRR11	NaN	NaN	NaN	rs2291193	NaN	0.454473	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	104.252611	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	97	53	44	26
chr17	57275189	57275189	A	C	intronic	PRR11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	1	1	0
chr17	57278802	57278802	T	T	intronic	PRR11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	57278982	57278982	A	G	exonic	PRR11	NaN	nonsynonymous SNV	PRR11:NM_018304:exon10:c.A1073G:p.E358G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.998	D	0.961	D	0.000	D	0.997	D	1.87	L	.	.	-0.249	T	0.381	T	0.646	4.461	23.8	5.58	2.122	4.456	14.938	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.210808	nearby_gap_events	REJECT	161	150	11	0
chr17	57326029	57326029	T	C	intronic	GDPD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.439308	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	148	143	5	0
chr17	57474613	57474613	A	A	UTR3	YPEL2	NM_001005404:c.*62A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr17	57721514	57721514	A	G	intronic	CLTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.3981	0	NaN	NA	NA	15	13	2	0
chr17	57733413	57733413	A	A	intronic	CLTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	57739015	57739015	T	G	intronic	CLTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.018855	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	409	399	10	0
chr17	57742114	57742114	T	G	intronic	CLTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	4	2	0
chr17	57743613	57743613	A	A	intronic	CLTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	57750982	57750982	T	C	intronic	CLTC	NaN	NaN	NaN	rs8065248	NaN	0.919728	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	93	46	24	46
chr17	57754304	57754304	T	C	intronic	CLTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.189535	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	135	127	8	0
chr17	57943942	57943942	A	G	intronic	TUBD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.356451	nearby_gap_events	REJECT	186	178	8	0
chr17	57958387	57958387	A	C	exonic	TUBD1	NaN	synonymous SNV	TUBD1:NM_001193609:exon4:c.T405G:p.G135G,TUBD1:NM_001193610:exon4:c.T405G:p.G135G,TUBD1:NM_001193611:exon4:c.T405G:p.G135G,TUBD1:NM_016261:exon4:c.T405G:p.G135G,TUBD1:NM_001193612:exon5:c.T48G:p.G16G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.8782	0	NaN	NA	NA	431	396	48	2
chr17	57963497	57963497	A	G	exonic	TUBD1	NaN	synonymous SNV	TUBD1:NM_001193609:exon3:c.T267C:p.G89G,TUBD1:NM_001193610:exon3:c.T267C:p.G89G,TUBD1:NM_001193611:exon3:c.T267C:p.G89G,TUBD1:NM_016261:exon3:c.T267C:p.G89G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.696858	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	127	120	7	0
chr17	57963638	57963638	A	A	intronic	TUBD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr17	57963643	57963643	G	C	intronic	TUBD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr17	57992087	57992087	A	A	intronic	RPS6KB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr17	58013518	58013518	A	G	intronic	RPS6KB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.684561	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	46	35	11	0
chr17	58031385	58031385	T	A	intronic	RNFT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.3181818181818176	NA	0	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr17	58031412	58031412	A	G	exonic	RNFT1	NaN	synonymous SNV	RNFT1:NM_016125:exon8:c.T1167C:p.I389I	rs11368	NaN	0.579273	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	24	8	16	34
chr17	58121288	58121288	T	T	exonic	HEATR6	NaN	synonymous SNV	HEATR6:NM_022070:exon20:c.A3182A:p.E1061E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	133	117	0	0
chr17	58128389	58128389	C	G	intronic	HEATR6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr17	58143797	58143797	T	T	intronic	HEATR6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	118	80	0	0
chr17	58148223	58148223	G	C	intronic	HEATR6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	58150443	58150443	T	G	intronic	HEATR6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	1	0
chr17	58150444	58150444	C	C	intronic	HEATR6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	58242903	58242903	A	C	intergenic	CA4,USP32	dist=5997;dist=11788	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	58260483	58260483	A	T	intronic	USP32	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	58348680	58348680	G	A	intronic	USP32	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.570923	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	93	88	5	0
chr17	58378939	58378939	T	G	intronic	USP32	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.25087719298245376	NA	0	0	NaN	NA	NA	13	10	3	0
chr17	58503461	58503461	G	C	intronic	C17orf64	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.853255	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	91	82	9	0
chr17	58503462	58503462	A	C	intronic	C17orf64	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.550993	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	87	78	9	0
chr17	58700785	58700785	T	T	intronic	PPM1D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr17	58752447	58752447	C	A	intergenic	PPM1D,BCAS3	dist=8807;dist=2725	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr17	58786727	58786727	A	A	intronic	BCAS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr17	59067478	59067478	C	T	exonic	BCAS3	NaN	synonymous SNV	BCAS3:NM_001099432:exon15:c.C1368T:p.S456S,BCAS3:NM_017679:exon15:c.C1368T:p.S456S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	0.838759	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	54	53	1	0
chr17	59447369	59447369	T	C	intronic	BCAS3	NaN	NaN	NaN	rs11653176	NaN	0.574481	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr17	59468461	59468461	C	G	intronic	BCAS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr17	59468942	59468942	G	A	intronic	BCAS3	NaN	NaN	NaN	rs3785837	NaN	0.46885	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	59480656	59480656	C	G	intronic	TBX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	71	60	11	0
chr17	59481929	59481929	G	G	intronic	TBX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	32	26	0	0
chr17	59482884	59482884	C	T	exonic	TBX2	NaN	nonsynonymous SNV	TBX2:NM_005994:exon6:c.C1373T:p.S458F	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.991	D	0.73	P	0.001	N	1.000	D	1.67	L	-2.25	D	0.382	D	0.660	D	0.576	3.904	19.85	4.55	2.352	5.569	16.035	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	23	22	1	0
chr17	59482925	59482925	A	G	exonic	TBX2	NaN	nonsynonymous SNV	TBX2:NM_005994:exon6:c.A1414G:p.S472G	NaN	NaN	NaN	0.39	T	0.0	B	0.0	B	0.006	N	0.578	D	-1.87	N	-2.11	D	-0.797	T	0.192	T	0.035	1.106	9.512	4.07	0.952	6.217	5.818	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.336896	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	57	53	4	0
chr17	59485393	59485393	C	T	intronic	TBX2	NaN	NaN	NaN	rs2240736	NaN	0.56849	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	50.1428	0	NaN	NA	NA	22	0	22	23
chr17	59489329	59489329	T	T	UTR5	C17orf82	NM_203425:c.-8T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	59543380	59543380	A	G	intronic	TBX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr17	59556190	59556190	G	C	intronic	TBX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	59556191	59556191	T	C	intronic	TBX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	59560129	59560129	G	A	intronic	TBX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.032986	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	15	8	5
chr17	59560132	59560132	G	C	intronic	TBX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	12	4	8	3
chr17	59560327	59560327	A	C	exonic	TBX4	NaN	nonsynonymous SNV	TBX4:NM_018488:exon8:c.A1088C:p.E363A	NaN	NaN	NaN	.	.	0.229	B	0.057	B	0.465	N	1.000	D	1.28	L	0.61	T	-1.043	T	0.114	T	0.442	3.451	17.69	5.51	2.094	8.901	14.812	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.174644	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	103	89	14	0
chr17	5984147	5984147	G	A	exonic	WSCD1	NaN	nonsynonymous SNV	WSCD1:NM_015253:exon2:c.G169A:p.V57M	rs200180772	NaN	0.000998403	0.03	D	0.718	P	0.293	B	0.038	N	1.000	N	0.895	L	1.48	T	-1.051	T	0.043	T	0.248	3.121	16.43	4.45	2.203	2.730	13.021	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.397035	clustered_read_position	REJECT	21	18	3	0
chr17	59857613	59857613	A	C	intronic	BRIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.447404	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	129	119	10	0
chr17	59876421	59876421	T	C	intronic	BRIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	59876422	59876422	A	A	intronic	BRIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr17	59876423	59876423	A	A	intronic	BRIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr17	59885726	59885726	T	T	intronic	BRIP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	5993953	5993953	A	A	intronic	WSCD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	59962084	59962084	G	A	intronic	INTS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	42	16	24	0
chr17	60002226	60002226	T	T	intronic	INTS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr17	60002583	60002583	A	G	intronic	INTS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	2	1	0
chr17	60024315	60024315	G	T	exonic	MED13	NaN	nonsynonymous SNV	MED13:NM_005121:exon29:c.C6355A:p.H2119N	NaN	NaN	NaN	0	D	0.991	D	0.988	D	0.000	D	1.000	D	2.815	M	-1.66	D	0.691	D	0.761	D	0.591	5.170	32	5.29	2.464	9.400	18.930	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.323326	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	97	84	13	0
chr17	60043858	60043858	A	G	exonic	MED13	NaN	nonsynonymous SNV	MED13:NM_005121:exon19:c.T4346C:p.L1449P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	2.305	M	-0.86	T	0.252	D	0.578	D	0.996	4.297	22.5	5.48	2.089	8.962	15.581	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.128058	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	223	216	7	0
chr17	60061472	60061472	T	G	intronic	MED13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	60072761	60072761	C	C	intronic	MED13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	20	20	0	0
chr17	60072763	60072763	T	T	intronic	MED13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	20	20	0	0
chr17	60072764	60072764	A	A	intronic	MED13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	20	20	0	0
chr17	60072768	60072768	A	A	intronic	MED13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	20	20	0	0
chr17	60088672	60088672	A	C	intronic	MED13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	9	3	5	0
chr17	60088675	60088675	C	T	intronic	MED13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	60088676	60088676	T	A	intronic	MED13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	60112992	60112992	A	T	intronic	MED13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr17	6014068	6014068	C	G	intronic	WSCD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	6014069	6014069	G	A	intronic	WSCD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	60214681	60214681	G	A	intergenic	MED13,TBC1D3P2	dist=72038;dist=127386	NaN	NaN	rs12937135	NaN	0.043131	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	6021541	6021541	C	T	intronic	WSCD1	NaN	NaN	NaN	rs2302838	NaN	0.586262	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	679.239767	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	242	2	240	31
chr17	60455467	60455467	A	C	intronic	EFCAB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	2	2	0
chr17	60483827	60483827	T	C	intronic	EFCAB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.379962	nearby_gap_events	REJECT	21	17	4	0
chr17	60744143	60744143	C	T	exonic	MRC2	NaN	synonymous SNV	MRC2:NM_006039:exon5:c.C885T:p.T295T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.128557	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	78	75	3	0
chr17	60757532	60757532	T	C	exonic	MRC2	NaN	nonsynonymous SNV	MRC2:NM_006039:exon15:c.T2300C:p.F767S	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.849	P	0.479	P	0.007	N	1.000	D	0.92	L	3.16	T	-1.064	T	0.019	T	0.607	3.301	17.09	3.06	2.054	1.792	6.132	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.411207	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	197	192	5	0
chr17	60757983	60757983	G	C	intronic	MRC2	NaN	NaN	NaN	rs2109080	NaN	0.609625	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.35232	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	2	0	2	4
chr17	60758273	60758273	G	C	exonic	MRC2	NaN	synonymous SNV	MRC2:NM_006039:exon17:c.G2586C:p.S862S	rs2245463	NaN	0.847444	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	50.1426	0	16.647294	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	40
chr17	60767047	60767047	T	T	exonic	MRC2	NaN	synonymous SNV	MRC2:NM_006039:exon24:c.T3499T:p.Y1167Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	124	108	0	0
chr17	60789641	60789641	C	C	intronic	MARCH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	60796125	60796125	A	G	intronic	MARCH10	NaN	NaN	NaN	rs34672337	NaN	0.0315495	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	60814742	60814742	A	T	ncRNA_intronic	MIR548W	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr17	61490878	61490878	C	A	intronic	TANC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.519744	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	200	188	12	0
chr17	61495576	61495576	T	A	intronic	TANC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	1	0
chr17	61516155	61516155	C	T	intronic	CYB561	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	61523004	61523004	C	G	intronic	CYB561	NaN	NaN	NaN	rs2058203	NaN	0.447085	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	61537179	61537179	A	T	intergenic	CYB561,ACE	dist=13457;dist=17243	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	15	8	7	0
chr17	61555553	61555553	C	G	intronic	ACE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.204096	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	87	78	9	0
chr17	61557951	61557951	G	T	intronic	ACE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.335992	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	64	56	8	0
chr17	61558599	61558599	A	G	intronic	ACE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.58631	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	11	7	4	0
chr17	61558854	61558854	T	T	intronic	ACE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	61559072	61559072	G	A	exonic	ACE	NaN	stopgain	ACE:NM_000789:exon7:c.G1091A:p.W364X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	5.134	32	4.19	2.153	7.813	16.720	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	2.4093977437708282E-4	NA	0	0	18.208648	nearby_gap_events	REJECT	61	51	10	0
chr17	61564509	61564509	G	T	intronic	ACE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr17	61574223	61574223	C	T	exonic	ACE	NaN	nonsynonymous SNV	ACE:NM_001178057:exon12:c.C1723T:p.P575S,ACE:NM_152830:exon13:c.C1846T:p.P616S,ACE:NM_000789:exon24:c.C3568T:p.P1190S	NaN	NaN	NaN	0.67	T	0.067	B	0.028	B	0.138	N	1.000	D	0.805	L	1.52	T	-1.070	T	0.044	T	0.255	1.860	12.18	0.696	0.170	0.404	4.708	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	41.358041	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	35	18	1
chr17	61611844	61611844	G	A	intronic	KCNH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	7	3	0
chr17	61611845	61611845	A	C	intronic	KCNH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	10	6	3	0
chr17	61613610	61613610	A	A	intronic	KCNH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	17	15	0	0
chr17	61615371	61615371	T	G	intronic	KCNH6	NaN	NaN	NaN	rs4465659	NaN	0.54373	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	24.3285	0	NaN	NA	NA	6	2	4	27
chr17	61616164	61616164	A	A	intronic	KCNH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	24	19	0	0
chr17	61621085	61621085	A	A	intronic	KCNH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr17	61621510	61621510	T	C	intronic	KCNH6	NaN	NaN	NaN	rs374418299	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	72	40	31	0
chr17	61621530	61621530	T	G	intronic	KCNH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.515409	nearby_gap_events	REJECT	280	268	12	0
chr17	61621531	61621531	G	T	intronic	KCNH6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.119977	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	287	272	15	0
chr17	61623052	61623052	C	T	exonic	KCNH6	NaN	nonsynonymous SNV	KCNH6:NM_001278919:exon13:c.C2666T:p.T889M,KCNH6:NM_001278920:exon13:c.C2297T:p.T766M,KCNH6:NM_030779:exon14:c.C2774T:p.T925M,KCNH6:NM_173092:exon14:c.C2507T:p.T836M	rs35819807	NaN	0.139976	0.28	T	0.009	B	0.004	B	0.426	N	1.000	P	0.41	N	-5.58	D	-0.394	T	0.001	T	0.032	1.057	9.316	-7.62	-1.025	0.188	6.958	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	39.667207	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	15	17	29
chr17	61657355	61657355	G	A	intronic	DCAF7	NaN	NaN	NaN	rs113553586	NaN	0.0253594	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.864709	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	65	60	5	0
chr17	61657357	61657357	A	C	intronic	DCAF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.645612	clustered_read_position	REJECT	65	60	5	0
chr17	61661098	61661098	T	G	intronic	DCAF7	NaN	NaN	NaN	rs114430751	NaN	0.014377	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	61	9.686618	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	10	5	5	0
chr17	61661099	61661099	G	C	intronic	DCAF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSM	3	Somatic	0.0013175230566535294	NA	0	57	10.174698	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	10	5	5	1
chr17	61661100	61661100	G	T	intronic	DCAF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSM	3	Somatic	5.508549268464849E-5	NA	0	48	10.47142	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	12	7	5	0
chr17	61661101	61661101	GC	G,GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	95.6953	0	NaN	NA	NA	14	1	2	0
chr17	61661102	61661102	C	G	intronic	DCAF7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	14	5	9	0
chr17	61673016	61673016	G	A	intergenic	DCAF7,TACO1	dist=1374;dist=5215	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	61673017	61673017	G	A	intergenic	DCAF7,TACO1	dist=1375;dist=5214	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	61673018	61673018	C	A	intergenic	DCAF7,TACO1	dist=1376;dist=5213	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	61729882	61729882	A	G	intronic	MAP3K3	NaN	NaN	NaN	rs8080211	ID=COSN165495;OCCURENCE=1(breast)	0.15595	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.890398	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	12	18	19
chr17	61776538	61776538	G	G	intronic	LIMD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	29	25	0	0
chr17	61781045	61781045	C	A	exonic	STRADA	NaN	stopgain	STRADA:NM_001003786:exon11:c.G1099T:p.E367X,STRADA:NM_001003788:exon12:c.G1036T:p.E346X,STRADA:NM_001003787:exon13:c.G1210T:p.E404X	NaN	NaN	NaN	0.53	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	5.021	29.6	4.03	1.336	4.429	13.383	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.03604	nearby_gap_events	REJECT	54	42	12	0
chr17	61781046	61781046	A	C	exonic	STRADA	NaN	nonsynonymous SNV	STRADA:NM_001003786:exon11:c.T1098G:p.F366L,STRADA:NM_001003788:exon12:c.T1035G:p.F345L,STRADA:NM_001003787:exon13:c.T1209G:p.F403L	NaN	NaN	NaN	0.31	T	0.001	B	0.002	B	0.000	D	1.000	D	0.345	N	0.65	T	-1.110	T	0.056	T	0.146	2.413	14.03	-2.1	-0.476	0.137	7.512	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.627259	nearby_gap_events	REJECT	20	8	12	0
chr17	61781419	61781419	G	A	UTR3	STRADA	NM_153335:c.*224C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.642167	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	41	32	9	0
chr17	61787774	61787774	T	C	intronic	STRADA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	13	6	5	0
chr17	617948	617948	A	G	exonic	VPS53	NaN	nonsynonymous SNV	VPS53:NM_001128159:exon1:c.T2C:p.M1T,VPS53:NM_018289:exon1:c.T2C:p.M1T	NaN	NaN	NaN	0	D	0.814	P	0.774	P	0.000	D	1.000	D	.	.	1.54	T	-0.748	T	0.213	T	0.86	2.701	14.99	3.68	0.813	2.483	7.465	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.390599	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	32	28	4	0
chr17	618039	618039	G	A	UTR5	VPS53	NM_001128159:c.-90C>T,NM_018289:c.-90C>T	NaN	NaN	rs2474694	NaN	0.512979	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.681446	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	9
chr17	61805799	61805799	A	A	intronic	STRADA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	61838519	61838519	T	T	intronic	CCDC47	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	61864422	61864422	A	G	exonic	DDX42	NaN	nonsynonymous SNV	DDX42:NM_203499:exon2:c.A13G:p.K5E,DDX42:NM_007372:exon3:c.A13G:p.K5E	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.993	D	0.956	D	0.196	N	1.000	D	1.78	L	1.85	T	-0.945	T	0.146	T	0.881	5.058	30	5.57	2.107	9.252	14.905	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.370471	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	283	272	11	0
chr17	61870036	61870036	T	G	intronic	DDX42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.470255	clustered_read_position	REJECT	26	22	4	0
chr17	61870037	61870037	T	A	intronic	DDX42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.367135	clustered_read_position	REJECT	19	15	4	0
chr17	61898164	61898164	C	A	intronic	FTSJ3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.894362	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	78	71	7	3
chr17	61898520	61898520	A	A	intronic	FTSJ3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	61901880	61901880	G	C	intronic	FTSJ3	NaN	NaN	NaN	rs752621	ID=COSN165498;OCCURENCE=1(breast)	0.183107	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	55.642938	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	49	23	26	19
chr17	61903445	61903445	G	C	exonic	FTSJ3	NaN	nonsynonymous SNV	FTSJ3:NM_017647:exon5:c.C271G:p.Q91E	rs2584625	NaN	0.732827	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-1.78	N	1.61	T	-0.955	T	0.000	T	0.184	2.818	15.39	4.74	1.367	5.111	13.178	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	335.490862	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	122	0	122	47
chr17	61903587	61903587	A	A	intronic	FTSJ3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	335	307	0	0
chr17	61905424	61905424	T	C	intronic	PSMC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	30	14	15	0
chr17	61906846	61906846	T	C	intronic	PSMC5	NaN	NaN	NaN	rs2665833	NaN	0.726837	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	326.592016	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	128	0	128	48
chr17	61908150	61908150	T	C	intronic	PSMC5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	0	2	0
chr17	61914605	61914605	G	A	intronic	SMARCD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr17	61914607	61914607	A	C	intronic	SMARCD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr17	61914608	61914608	C	G	intronic	SMARCD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	61914609	61914609	A	C	intronic	SMARCD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	8	3	4	0
chr17	61995080	61995080	G	T	intronic	GH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.701511	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	313	294	19	0
chr17	61995583	61995583	T	T	intronic	GH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	62006962	62006962	G	C	intronic	CD79B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	62006968	62006968	T	C	intronic	CD79B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	62020126	62020126	T	T	intronic	SCN4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	67	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	62020506	62020506	A	A	intronic	SCN4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	19	16	0	0
chr17	62024549	62024549	A	G	intronic	SCN4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr17	62025245	62025245	C	G	intronic	SCN4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.028263401923018936	NA	0	0	NaN	NA	NA	46	33	13	0
chr17	62026134	62026134	G	T	intronic	SCN4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	467.381	0	NaN	NA	NA	27	12	15	0
chr17	62038562	62038562	CA	AC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.1606	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr17	62041808	62041808	T	T	intronic	SCN4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr17	62045375	62045375	A	A	intronic	SCN4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	60	45	0	0
chr17	62048467	62048467	A	G	intronic	SCN4A	NaN	NaN	NaN	rs2302236	NaN	0.816094	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	141.013999	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	0	47	49
chr17	62075876	62075876	G	G	ncRNA_exonic	LOC400612	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	87	60	0	0
chr17	62078685	62078685	G	A	intronic	PRR29	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.403	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	15	13	2	0
chr17	62078783	62078783	C	A	intronic	PRR29	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.00824175824175818	NA	0	0	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	62080059	62080059	A	C	UTR3	ICAM2,PRR29	NM_001099786:c.*48T>G,NM_000873:c.*48T>G,NM_001099789:c.*48T>G,NM_001099788:c.*48T>G,NM_001099787:c.*48T>G;NM_001191030:c.*938A>C,NM_001191029:c.*724A>C,NM_001191031:c.*984A>C,NM_001164257:c.*938A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	62080064	62080064	G	C	UTR3	ICAM2,PRR29	NM_001099786:c.*43C>G,NM_000873:c.*43C>G,NM_001099789:c.*43C>G,NM_001099788:c.*43C>G,NM_001099787:c.*43C>G;NM_001191030:c.*943G>C,NM_001191029:c.*729G>C,NM_001191031:c.*989G>C,NM_001164257:c.*943G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr17	62081328	62081328	C	C	UTR3	PRR29	NM_001191030:c.*2207C>C,NM_001191029:c.*1993C>C,NM_001191031:c.*2253C>C,NM_001164257:c.*2207C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	34	31	0	0
chr17	62083929	62083929	A	G	intronic	ICAM2	NaN	NaN	NaN	rs6504194	NaN	0.894968	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	250.634617	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	93	0	93	57
chr17	62121613	62121613	A	A	intronic	ERN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr17	62463591	62463591	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	8	0	2,5	0
chr17	62463592	62463592	C	A	intronic	MILR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr17	62476255	62476255	T	T	intronic	POLG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	62527922	62527922	T	T	intronic	CEP95	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	19	15	0	0
chr17	62529367	62529367	A	A	intronic	CEP95	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	62553644	62553644	A	C	intronic	SMURF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	15	9	3	0
chr17	6256665	6256665	A	T	intergenic	WSCD1,AIPL1	dist=228918;dist=70392	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	63186444	63186444	C	T	intronic	RGS9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	63186445	63186445	A	C	intronic	RGS9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	63221148	63221148	A	A	exonic	RGS9	NaN	synonymous SNV	RGS9:NM_001081955:exon18:c.A1427A:p.H476H,RGS9:NM_003835:exon18:c.A1436A:p.H479H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	95	64	0	0
chr17	6328709	6328709	T	T	UTR3	AIPL1	NM_001285399:c.*71A>A,NM_001033055:c.*71A>A,NM_001285402:c.*71A>A,NM_001285401:c.*71A>A,NM_001285400:c.*71A>A,NM_001033054:c.*71A>A,NM_014336:c.*71A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	6330152	6330152	GCCCC	GCCC,GTCCC,GTCCT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	199.199	0	NaN	NA	NA	30	0	18	0
chr17	6337207	6337207	T	T	intronic	AIPL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	6338284	6338284	A	A	UTR5	AIPL1	NM_001285402:c.-887T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	46	41	0	0
chr17	6338293	6338293	G	G	UTR5	AIPL1	NM_001285402:c.-896C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	47	43	0	0
chr17	6347133	6347133	G	T	upstream	FAM64A	NaN	NaN	NaN	rs4796498	NaN	0.304313	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	6351103	6351103	G	C	intronic	FAM64A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.388893	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	23	18	5	0
chr17	63530227	63530227	A	A	intronic	AXIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	63551368	63551368	C	A	intronic	AXIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr17	63554591	63554591	G	A	exonic	AXIN2	NaN	nonsynonymous SNV	AXIN2:NM_004655:exon2:c.C148T:p.P50S	rs2240308	NaN	0.33766	0.96	T	0.0	B	0.0	B	0.209	N	0.001	P	.	.	-0.04	T	-0.975	T	0.000	T	0.044	-0.675	1.053	2.75	0.980	0.923	7.627	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	191.014544	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	73	1	72	43
chr17	6367699	6367699	G	A	intronic	PITPNM3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.09130434782608779	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	11	4	0
chr17	63746703	63746703	A	G	intronic	CEP112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	6387082	6387082	A	G	intronic	PITPNM3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	6387686	6387686	G	C	intronic	PITPNM3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.492071	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	94	82	12	0
chr17	64025435	64025435	T	TTAATCA,TTTAATCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1964.07	0	NaN	NA	NA	227	7	171	1
chr17	6406883	6406883	C	T	exonic	PITPNM3	NaN	nonsynonymous SNV	PITPNM3:NM_001165966:exon3:c.G130A:p.A44T,PITPNM3:NM_031220:exon4:c.G238A:p.A80T	rs3809835	NaN	0.273562	0.75	T	0.002	B	0.003	B	0.974	N	1.000	P	0.55	N	2.1	T	-0.943	T	0.000	T	0.025	1.081	9.413	-1.55	-0.243	-1.150	7.236	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	112	NaN	NA	NA	92	87	5	30
chr17	64092918	64092918	C	C	intronic	CEP112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	64128917	64128917	G	T	intronic	CEP112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	64128921	64128921	T	C	intronic	CEP112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	64128926	64128926	G	C	intronic	CEP112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	64210819	64210819	C	A	intronic	APOH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.770804	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	56	52	4	0
chr17	64216708	64216708	T	C	exonic	APOH	NaN	nonsynonymous SNV	APOH:NM_000042:exon5:c.A568G:p.T190A	NaN	NaN	NaN	1	T	0.0	B	0.0	B	0.204	N	1.000	N	-1.805	N	-0.06	T	-0.973	T	0.036	T	0.297	-0.442	1.946	-0.309	-0.126	0.481	2.687	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.92468	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	92	87	5	0
chr17	64225371	64225371	T	T	intronic	APOH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	644856	644856	A	T	UTR3	FAM57A	NM_024792:c.*46A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	64684364	64684364	T	G	intronic	PRKCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr17	6478673	6478673	G	A	intergenic	PITPNM3,KIAA0753	dist=18796;dist=2972	NaN	NaN	rs12942925	NaN	0.288538	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	648498	648498	C	T	exonic	GEMIN4	NaN	nonsynonymous SNV	GEMIN4:NM_015721:exon2:c.G2785A:p.D929N	rs2740349	NaN	0.892173	1	T	0.0	B	0.0	B	0.027	N	1.000	P	-1.24	N	3.33	T	-0.991	T	0.000	T	0.018	-1.535	0.016	4.69	1.046	1.204	4.629	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	107	NaN	NA	NA	175	135	40	56
chr17	649547	649547	G	C	exonic	GEMIN4	NaN	nonsynonymous SNV	GEMIN4:NM_015721:exon2:c.C1736G:p.A579G	rs910925	NaN	0.710064	0.03	D	1.0	D	0.997	D	0.000	D	0.000	P	2.095	M	2.35	T	-1.080	T	0.000	T	0.581	4.442	23.7	5.84	2.779	9.633	19.135	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	118	NaN	NA	NA	195	168	27	48
chr17	64954748	64954748	T	G	intergenic	CACNG5,CACNG4	dist=73353;dist=6232	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr17	64954818	64954818	G	A	intergenic	CACNG5,CACNG4	dist=73423;dist=6162	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr17	649935	649935	G	C	exonic	GEMIN4	NaN	nonsynonymous SNV	GEMIN4:NM_015721:exon2:c.C1348G:p.Q450E	rs2740348	NaN	0.893371	1	T	0.0	B	0.0	B	0.060	N	1.000	P	-1.445	N	2.76	T	-0.971	T	0.000	T	0.047	-2.123	0.005	6.08	1.603	2.121	10.115	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	133	NaN	NA	NA	351	299	52	57
chr17	65002039	65002039	C	A	intronic	CACNG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	56	NaN	NA	NA	16	0	16	0
chr17	65029874	65029874	T	G	downstream	CACNG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	650496	650496	T	C	exonic	GEMIN4	NaN	nonsynonymous SNV	GEMIN4:NM_015721:exon2:c.A787G:p.T263A	NaN	NaN	NaN	0.75	T	0.002	B	0.013	B	0.030	N	1.000	N	1.445	L	2.43	T	-0.969	T	0.027	T	0.171	0.047	4.258	1.94	0.339	-0.143	4.574	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.220945	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	396	384	12	0
chr17	65052216	65052216	T	C	exonic	CACNG1	NaN	synonymous SNV	CACNG1:NM_000727:exon4:c.T498C:p.I166I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.336615	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	130	125	5	0
chr17	65104887	65104887	A	C	intronic	HELZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.143021	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	61	54	7	0
chr17	65105848	65105848	T	C	intronic	HELZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.464181	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	366	356	10	0
chr17	65124994	65124994	C	A	intronic	HELZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	65124999	65124999	T	G	intronic	HELZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	65125000	65125000	A	G	intronic	HELZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr17	65131956	65131956	T	G	intronic	HELZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	1	4	0
chr17	6513329	6513329	G	A	exonic	KIAA0753	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA0753:NM_014804:exon9:c.C1697T:p.P566L	rs2304977	NaN	0.271765	0.31	T	0.979	D	0.747	P	0.000	D	0.000	P	2.43	M	-2.02	D	-1.136	T	0.000	T	0.315	3.689	18.74	4.15	1.275	2.037	11.292	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	126	23	103	32
chr17	6513346	6513346	T	G	exonic	KIAA0753	NaN	synonymous SNV	KIAA0753:NM_014804:exon9:c.A1680C:p.P560P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.368579	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	129	122	7	0
chr17	65134033	65134033	C	T	intronic	HELZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.369164	nearby_gap_events	REJECT	107	100	7	0
chr17	6513526	6513526	A	G	intronic	KIAA0753	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr17	65145971	65145971	G	T	intronic	HELZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.575858	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	203	197	6	0
chr17	6515454	6515454	C	T	exonic	KIAA0753	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA0753:NM_014804:exon8:c.G1330A:p.D444N	rs2289643	ID=COSM1130191;OCCURENCE=1(prostate)	0.536342	0.41	T	0.025	B	0.005	B	0.200	N	1.000	P	1.61	L	3.04	T	-0.948	T	0.000	T	0.025	0.774	8.089	3.36	1.434	1.423	8.274	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	225	41	184	44
chr17	65156920	65156920	A	C	intronic	HELZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.447992	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	373	355	18	0
chr17	65199384	65199384	T	T	intronic	HELZ	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr17	6524298	6524298	T	A	exonic	KIAA0753	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA0753:NM_014804:exon7:c.A1125T:p.E375D	rs9889363	NaN	0.307907	0.03	D	0.999	D	0.994	D	0.017	N	0.000	P	2.34	M	-2.19	D	-1.146	T	0.000	T	0.163	4.484	24.0	3.84	0.991	0.810	7.626	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	115	13	102	36
chr17	6527923	6527923	C	A	intronic	KIAA0753	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	13	9	4	0
chr17	65336886	65336886	A	C	UTR3	PSMD12	NM_002816:c.*73T>G,NM_174871:c.*73T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.405644	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	430	406	24	0
chr17	65342006	65342006	A	G	intronic	PSMD12	NaN	NaN	NaN	rs116732194	NaN	0.00958466	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	14	6	8	0
chr17	65353393	65353393	T	T	intronic	PSMD12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	65528888	65528888	G	C	intronic	PITPNC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	6555534	6555534	A	G	exonic	C17orf100	NaN	nonsynonymous SNV	C17orf100:NM_001105520:exon1:c.A301G:p.S101G	rs200915782	NaN	0.000399361	0.42	T	0.994	D	0.828	P	.	.	0.999	N	0.55	N	.	.	-1.063	T	0.095	T	0.27	1.203	9.885	4.34	1.906	3.383	10.477	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	60.9238	0	NaN	NA	NA	52	38	14	0
chr17	6560578	6560578	A	C	upstream	ALOX15P1	NaN	NaN	NaN	rs3894313	NaN	0.601238	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	14	1	12	0
chr17	6560595	6560595	C	T	upstream	ALOX15P1	NaN	NaN	NaN	rs12103597	NaN	0.601038	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	14	1	13	0
chr17	6560596	6560596	A	T	upstream	ALOX15P1	NaN	NaN	NaN	rs12103854	NaN	0.601038	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	14	1	13	0
chr17	65628195	65628195	T	A	intronic	PITPNC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	65632	65632	C	T	intronic	RPH3AL	NaN	NaN	NaN	rs7207457	NaN	0.51877	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	144	22	122	33
chr17	65716236	65716236	A	G	intronic	NOL11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	65716239	65716239	T	A	intronic	NOL11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	65716241	65716241	T	G	intronic	NOL11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	65716242	65716242	C	A	intronic	NOL11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	65718685	65718685	T	C	intronic	NOL11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.531321	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	147	138	9	0
chr17	65720080	65720080	T	G	intronic	NOL11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	19	11	7	0
chr17	65733942	65733942	A	T	intronic	NOL11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	2.6096879677424476E-5	NA	0	0	NaN	NA	NA	312	229	83	0
chr17	65733943	65733943	T	A	intronic	NOL11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	7.017906942871192E-5	NA	0	0	NaN	NA	NA	312	237	75	0
chr17	65734482	65734482	A	T	intronic	NOL11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr17	65882210	65882210	T	T	intronic	BPTF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr17	65906996	65906996	T	G	exonic	BPTF	NaN	nonsynonymous SNV	BPTF:NM_182641:exon11:c.T2996G:p.V999G,BPTF:NM_004459:exon13:c.T3374G:p.V1125G	NaN	NaN	NaN	0.39	T	0.472	P	0.142	B	.	.	1.000	N	0.55	N	0.0	T	-1.042	T	0.110	T	0.376	0.068	4.371	1.62	0.468	1.130	6.210	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	65909384	65909384	A	T	intronic	BPTF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	41	35	6	1
chr17	65944549	65944549	G	C	intronic	BPTF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr17	65955909	65955909	A	A	exonic	BPTF	NaN	synonymous SNV	BPTF:NM_182641:exon24:c.A8179A:p.K2727K,BPTF:NM_004459:exon26:c.A8128A:p.K2710K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	163	153	0	0
chr17	65960563	65960563	A	A	intronic	BPTF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	65962802	65962802	T	C	intronic	BPTF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.041521	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	109	100	9	0
chr17	6597348	6597348	T	T	intronic	SLC13A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr17	65976846	65976846	A	T	intronic	BPTF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	65976848	65976848	A	C	intronic	BPTF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	65978496	65978496	A	C	UTR3	BPTF	NM_004459:c.*92A>C,NM_182641:c.*92A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	6606609	6606609	A	G	intronic	SLC13A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	2	7	0
chr17	6614077	6614077	C	T	intronic	SLC13A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	66148414	66148414	T	T	intergenic	LINC00674,LOC440461	dist=16344;dist=46387	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	10	7	0	0
chr17	6616508	6616508	A	AC	intronic	SLC13A5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.58838	0	NaN	NA	NA	15	13	2	0
chr17	66191777	66191777	G	A	intergenic	LINC00674,LOC440461	dist=59707;dist=3024	NaN	NaN	rs8082280	NaN	0.58726	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	66250522	66250522	C	A	intronic	AMZ2	NaN	NaN	NaN	rs35309522	NaN	0.0533147	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	344.864	0	NaN	NA	NA	179	99	80	12
chr17	66303777	66303777	G	T	exonic	ARSG	NaN	nonsynonymous SNV	ARSG:NM_001267727:exon2:c.G143T:p.W48L,ARSG:NM_014960:exon2:c.G143T:p.W48L	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.969	D	0.813	P	0.000	D	1.000	D	2.64	M	.	.	-0.153	T	0.418	T	0.832	4.675	25.8	5.59	2.622	6.344	17.106	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.817372	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	128	111	17	0
chr17	66339736	66339736	T	T	intronic	ARSG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr17	66339871	66339871	G	T	exonic	ARSG	NaN	synonymous SNV	ARSG:NM_001267727:exon3:c.G345T:p.P115P,ARSG:NM_014960:exon3:c.G345T:p.P115P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.876512	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	149	143	6	0
chr17	66347879	66347879	A	A	intronic	ARSG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr17	66366522	66366522	T	T	intronic	ARSG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	66425157	66425157	A	A	intronic	PRKAR1A,WIPI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	66440630	66440630	T	C	intronic	PRKAR1A,WIPI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.502551	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	26	23	3	0
chr17	66449122	66449122	G	A	exonic	WIPI1	NaN	nonsynonymous SNV	WIPI1:NM_017983:exon2:c.C92T:p.T31I	rs883541	NaN	0.736222	0.24	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.000	P	-1.73	N	0.37	T	-0.977	T	0.000	T	0.114	1.468	10.85	5.02	0.536	6.391	8.224	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	94.629409	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	0	37	57
chr17	66453344	66453344	C	T	intronic	PRKAR1A,WIPI1	NaN	NaN	NaN	rs76441646	NaN	0.234225	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	279.65951	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	101	1	100	23
chr17	66519856	66519856	T	C	intronic	PRKAR1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	75	11	64	0
chr17	66519857	66519857	C	C	intronic	PRKAR1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	226	154	0	0
chr17	66538097	66538097	T	T	intronic	FAM20A,PRKAR1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	21	19	0	0
chr17	66538994	66538994	A	A	intronic	FAM20A,PRKAR1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr17	66547931	66547931	T	A	intronic	FAM20A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr17	66550887	66550887	G	A	intronic	FAM20A	NaN	NaN	NaN	rs35495396	NaN	0.144768	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	84.5188	0	NaN	NA	NA	38	30	8	3
chr17	6674417	6674417	T	C	intronic	XAF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.869075	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	449	442	7	0
chr17	6683215	6683215	C	T	exonic	FBXO39	NaN	nonsynonymous SNV	FBXO39:NM_153230:exon2:c.C28T:p.P10S	rs4796555	NaN	0.324681	0.67	T	0.022	B	0.01	B	0.130	N	0.995	P	0.805	L	0.58	T	-0.934	T	0.000	T	0.045	2.013	12.69	2.26	0.813	0.928	4.791	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	105	NaN	NA	NA	211	165	46	18
chr17	66871295	66871295	A	C	intronic	ABCA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	66872974	66872974	A	A	intronic	ABCA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	66872979	66872979	G	A	intronic	ABCA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	66880351	66880351	T	T	intronic	ABCA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr17	66880547	66880547	A	G	intronic	ABCA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	17	9	7	0
chr17	66881273	66881273	T	T	intronic	ABCA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	6690061	6690061	T	A	intronic	FBXO39	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	66918453	66918453	A	G	intronic	ABCA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.751881	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	332	312	20	0
chr17	66918582	66918582	A	A	intronic	ABCA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	66932956	66932956	T	A	intronic	ABCA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.04089113992519443	NA	0	0	NaN	NA	NA	37	28	9	0
chr17	66938232	66938232	A	G	intronic	ABCA8	NaN	NaN	NaN	rs4147958	NaN	0.635982	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	49.313779	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	1	17	31
chr17	66980414	66980414	A	A	intronic	ABCA9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr17	66980417	66980417	G	G	intronic	ABCA9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	66980419	66980419	A	G	intronic	ABCA9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	5	3	2	0
chr17	67014744	67014744	A	G	intronic	ABCA9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.954687	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	106	98	8	0
chr17	67016457	67016457	T	C	intronic	ABCA9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.664176	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	332	314	18	0
chr17	67017767	67017767	T	T	intronic	ABCA9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	6703635	6703635	A	C	intronic	TEKT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	67040586	67040586	T	A	intronic	ABCA9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	6704071	6704071	G	A	exonic	TEKT1	NaN	synonymous SNV	TEKT1:NM_053285:exon7:c.C1044T:p.V348V	rs17804647	NaN	0.0537141	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	318	248	70	15
chr17	67041254	67041254	C	C	intronic	ABCA9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	145	102	0	0
chr17	67079351	67079351	A	A	splicing	ABCA6	NM_080284:exon36:c.4475+2T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	24	24	0	0
chr17	67094251	67094251	A	G	intronic	ABCA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	15	4	11	0
chr17	67103805	67103805	T	T	intronic	ABCA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	67125653	67125653	T	T	intronic	ABCA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	48	47	0	0
chr17	67160306	67160306	A	C	intronic	ABCA10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.573001	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	92	61	31	1
chr17	67160307	67160307	C	A	intronic	ABCA10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.937976	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	103	97	6	0
chr17	67160310	67160310	A	C	intronic	ABCA10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr17	67171672	67171672	A	C	intronic	ABCA10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	12	5	6	0
chr17	67178316	67178316	A	G	exonic	ABCA10	NaN	nonsynonymous SNV	ABCA10:NM_080282:exon23:c.T2747C:p.M916T	rs4968849	NaN	0.711262	0.96	T	0.001	B	0.0	B	0.502	N	1.000	P	-1.405	N	-1.59	D	-0.971	T	0.000	T	0.05	-2.296	0.004	0.662	-0.189	0.007	7.444	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	716.406	0	NaN	NA	NA	71	0	71	48
chr17	67178954	67178954	C	T	intronic	ABCA10	NaN	NaN	NaN	rs4968851	NaN	0.685703	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	297.438	0	NaN	NA	NA	152	0	152	27
chr17	6718429	6718429	A	G	intronic	TEKT1	NaN	NaN	NaN	rs55935995	NaN	0.0459265	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	132	NaN	NA	NA	300	252	48	15
chr17	67189428	67189428	A	G	intronic	ABCA10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	67215712	67215712	C	T	exonic	ABCA10	NaN	synonymous SNV	ABCA10:NM_080282:exon7:c.G504A:p.V168V	rs12941264	NaN	0.598442	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	109.122506	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	2	43	52
chr17	6722309	6722309	T	T	intronic	TEKT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	6722719	6722719	A	A	intronic	TEKT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	67250059	67250059	C	T	intronic	ABCA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	21	14	7	0
chr17	67252225	67252225	T	C	intronic	ABCA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0023331581749964875	NA	0	0	NaN	NA	NA	115	78	37	0
chr17	67252226	67252226	C	A	intronic	ABCA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	2.4096127499131107E-4	NA	0	0	NaN	NA	NA	156	121	35	0
chr17	67252227	67252227	A	T	intronic	ABCA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	3.3604552791883743E-4	NA	0	0	NaN	NA	NA	138	102	36	0
chr17	67257540	67257540	A	A	intronic	ABCA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	15	11	0	0
chr17	67270254	67270254	T	A	exonic	ABCA5	NaN	nonsynonymous SNV	ABCA5:NM_018672:exon19:c.A2610T:p.L870F,ABCA5:NM_172232:exon20:c.A2610T:p.L870F	NaN	NaN	NaN	.	.	0.987	D	0.886	P	0.005	N	0.999	D	2.14	M	-2.27	D	0.099	D	0.658	D	0.223	3.398	17.47	3.15	0.389	0.610	2.171	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.979516	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	264	247	17	0
chr17	67280176	67280176	A	G	exonic	ABCA5	NaN	synonymous SNV	ABCA5:NM_018672:exon17:c.T2310C:p.G770G,ABCA5:NM_172232:exon18:c.T2310C:p.G770G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.97751	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	124	116	8	0
chr17	67300977	67300977	A	A	intronic	ABCA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	67302898	67302898	T	T	exonic	ABCA5	NaN	synonymous SNV	ABCA5:NM_018672:exon5:c.A756A:p.L252L,ABCA5:NM_172232:exon6:c.A756A:p.L252L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	72	NaN	NA	NA	87	77	0	0
chr17	67303190	67303190	A	G	intronic	ABCA5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.268914	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	637	628	9	0
chr17	67425205	67425205	A	G	intronic	MAP2K6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	67515395	67515395	T	T	intronic	MAP2K6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	67517326	67517326	A	A	intronic	MAP2K6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr17	67519597	67519597	A	G	intronic	MAP2K6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr17	67522649	67522649	T	T	intronic	MAP2K6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	67532218	67532218	G	T	intronic	MAP2K6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.936036	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	73	65	8	0
chr17	67532220	67532220	C	G	intronic	MAP2K6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.357981	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	73	66	7	0
chr17	6797322	6797322	C	T	ncRNA_intronic	ALOX12P2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	68043735	68043735	C	T	intergenic	LINC01497,LINC01028	dist=64050;dist=3677	NaN	NaN	rs111795841	NaN	0.0203674	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr17	6899559	6899559	C	C	exonic	ALOX12	NaN	synonymous SNV	ALOX12:NM_000697:exon1:c.C123C:p.P41P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	6900383	6900383	T	C	ncRNA_intronic	ALOX12-AS1	NaN	NaN	NaN	rs312468	NaN	0.950479	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	149.852955	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	47	0	47	58
chr17	6903606	6903606	G	T	ncRNA_intronic	ALOX12-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.120002	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	61	55	6	0
chr17	6915920	6915920	G	C	exonic	RNASEK	NaN	nonsynonymous SNV	RNASEK:NM_001004333:exon1:c.G35C:p.C12S	NaN	NaN	NaN	0.84	T	.	.	.	.	.	.	1.000	N	0	N	.	.	-1.008	T	0.034	T	0.093	1.705	11.66	1.56	0.759	0.236	6.656	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	83.4241	0	NaN	NA	NA	78	63	15	0
chr17	6915921	6915921	C	G	exonic	RNASEK	NaN	nonsynonymous SNV	RNASEK:NM_001004333:exon1:c.C36G:p.C12W	NaN	NaN	NaN	0.01	D	.	.	.	.	.	.	1.000	N	0	N	.	.	-1.010	T	0.029	T	0.326	1.820	12.04	-3.92	-0.353	-0.416	0.520	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	65	52	13	0
chr17	6918083	6918083	C	C	ncRNA_exonic	RNASEK-C17orf49	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	6919093	6919093	T	C	exonic	C17orf49	NaN	synonymous SNV	C17orf49:NM_001142798:exon3:c.T117C:p.G39G,C17orf49:NM_174893:exon3:c.T117C:p.G39G	rs14309	NaN	0.757388	.	.	.	.	.	.	.	.	0.711	P	.	.	.	.	-1.043	T	0.000	T	.	3.023	16.08	3.62	0.790	1.113	5.279	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.421816	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	2	8	49
chr17	6919804	6919804	T	T	ncRNA_intronic	MIR497HG,RNASEK-C17orf49	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	129	114	0	0
chr17	6920352	6920352	C	T	ncRNA_intronic	MIR497HG,RNASEK-C17orf49	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.072156	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	183	174	9	0
chr17	6927898	6927898	T	T	exonic	BCL6B	NaN	synonymous SNV	BCL6B:NM_181844:exon4:c.T580T:p.W194W	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	55	47	0	0
chr17	6928502	6928502	G	C	exonic	BCL6B	NaN	nonsynonymous SNV	BCL6B:NM_181844:exon5:c.G872C:p.R291P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.453	P	0.061	B	0.012	N	1.000	N	0	N	3.18	T	-1.007	T	0.011	T	0.492	0.191	5.030	-10.7	-2.276	-3.585	13.542	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.788561	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	19	13	6	0
chr17	6930369	6930369	G	C	exonic	BCL6B	NaN	nonsynonymous SNV	BCL6B:NM_181844:exon8:c.G1286C:p.S429T	NaN	NaN	NaN	0.48	T	0.743	P	0.655	P	0.000	D	0.837	D	-0.675	N	3.17	T	-0.959	T	0.026	T	0.285	2.949	15.83	3.65	1.139	7.677	11.793	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.211046	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	248	237	11	0
chr17	6940210	6940210	A	A	intronic	SLC16A13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	6942111	6942111	G	T	exonic	SLC16A13	NaN	synonymous SNV	SLC16A13:NM_201566:exon3:c.G984T:p.V328V	rs33979567	ID=COSM1385695;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.196885	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	119	100	19	23
chr17	6943266	6943266	G	A	exonic	SLC16A13	NaN	synonymous SNV	SLC16A13:NM_201566:exon4:c.G1266A:p.G422G	rs4796576	NaN	0.559704	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	104	11	93	51
chr17	6945555	6945555	C	G	exonic	SLC16A11	NaN	nonsynonymous SNV	SLC16A11:NM_153357:exon3:c.G946C:p.G316R	NaN	NaN	NaN	0.59	T	0.218	B	0.098	B	0.038	N	1.000	N	0.345	N	0.3	T	-1.036	T	0.090	T	0.831	2.036	12.77	4.12	1.365	0.548	7.643	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.19016	clustered_read_position	REJECT	115	105	10	2
chr17	6945557	6945557	A	G	exonic	SLC16A11	NaN	nonsynonymous SNV	SLC16A11:NM_153357:exon3:c.T944C:p.F315S	NaN	NaN	NaN	0.14	T	0.473	P	0.136	B	0.005	N	1.000	N	0.065	N	0.44	T	-1.064	T	0.067	T	0.613	2.059	12.84	2.77	0.926	1.463	5.676	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	15	10	4	1
chr17	6946559	6946559	G	A	intronic	SLC16A11	NaN	NaN	NaN	rs35634464	NaN	0.0642971	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	358.99	0	116.19732	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	70	18	52	23
chr17	6946626	6946626	C	T	intronic	SLC16A11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.06527725148414806	NA	0	0	NaN	NA	NA	20	14	6	0
chr17	6978821	6978821	A	A	intronic	CLEC10A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr17	6979484	6979484	A	A	intronic	CLEC10A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	16	12	0	0
chr17	6979944	6979944	T	G	intronic	CLEC10A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	5	0	4	0
chr17	6980319	6980319	A	A	intronic	CLEC10A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	69867617	69867617	A	C	intergenic	CASC17,LOC102723505	dist=669297;dist=150375	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	69867618	69867618	G	A	intergenic	CASC17,LOC102723505	dist=669298;dist=150374	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	69867619	69867619	T	A	intergenic	CASC17,LOC102723505	dist=669299;dist=150373	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	69918852	69918852	C	A	intergenic	CASC17,LOC102723505	dist=720532;dist=99140	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7005645	7005645	C	G	intronic	ASGR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7006205	7006205	C	A	intronic	ASGR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	70119626	70119626	T	T	intronic	SOX9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	70120602	70120602	A	T	UTR3	SOX9	NM_000346:c.*74A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	11	6	3	0
chr17	70120607	70120607	C	G	UTR3	SOX9	NM_000346:c.*79C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr17	7012278	7012278	A	T	intronic	ASGR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	70133274	70133274	A	A	intergenic	SOX9,LINC00673	dist=10714;dist=266189	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	70133275	70133275	G	C	intergenic	SOX9,LINC00673	dist=10715;dist=266188	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr17	70569249	70569249	C	G	ncRNA_intronic	LINC00673	NaN	NaN	NaN	rs4793458	NaN	0.834864	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	70598901	70598901	A	G	ncRNA_intronic	LINC00511	NaN	NaN	NaN	rs8075353	NaN	0.416933	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	706386	706386	T	A	intronic	NXN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	70643648	70643648	A	T	UTR3	SLC39A11	NM_001159770:c.*75T>A,NM_139177:c.*75T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	70643650	70643650	C	T	UTR3	SLC39A11	NM_001159770:c.*73G>A,NM_139177:c.*73G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	70643654	70643654	T	A	UTR3	SLC39A11	NM_001159770:c.*69A>T,NM_139177:c.*69A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	7077642	7077642	G	A	intronic	ASGR1	NaN	NaN	NaN	rs117542665	NaN	0.00878594	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	88.316747	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	7	34	2
chr17	7077781	7077781	T	G	splicing	ASGR1	NM_001197216:exon6:c.239-2A>C,NM_001671:exon7:c.356-2A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.954	15.85	4.65	2.096	3.882	10.678	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.754344	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	238	219	19	0
chr17	708531	708531	T	C	intronic	NXN	NaN	NaN	NaN	rs2295478	NaN	0.302516	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	75	NaN	NA	NA	39	34	5	24
chr17	70944046	70944046	A	A	intronic	SLC39A11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	7111631	7111631	C	A	intronic	DLG4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.579674	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	70	65	5	0
chr17	71186445	71186445	A	T	intergenic	SSTR2,COG1	dist=18383;dist=2728	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	71186448	71186448	A	C	intergenic	SSTR2,COG1	dist=18386;dist=2725	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	71201675	71201675	T	C	intronic	COG1	NaN	NaN	NaN	rs3829571	NaN	0.863618	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1841.6	0	NaN	NA	NA	180	0	180	45
chr17	7120464	7120464	C	CG	exonic	DLG4	NaN	frameshift substitution	DLG4:NM_001128827:exon1:c.3_3delinsCG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	61.7206	0	NaN	NA	NA	7	0	7	2
chr17	71238363	71238363	A	G	intronic	C17orf80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.605753		KEEP	42	36	6	0
chr17	71238433	71238433	G	A	exonic	C17orf80	NaN	nonsynonymous SNV	C17orf80:NM_001100622:exon4:c.G1564A:p.A522T,C17orf80:NM_017941:exon4:c.G1564A:p.A522T	rs1566286	NaN	0.515974	1	T	0.0	B	0.001	B	0.933	N	1.000	P	-1.24	N	2.7	T	-0.924	T	0.000	T	0.031	-1.224	0.061	-11.3	-2.805	-0.879	13.613	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	77.611755	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	12	30	43
chr17	71241234	71241234	T	G	intronic	C17orf80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	13	6	4	0
chr17	71248937	71248937	A	A	intronic	CPSF4L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	9	6	0	0
chr17	71252507	71252507	G	G	intronic	CPSF4L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	71254051	71254051	A	C	intronic	CPSF4L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	7125965	7125965	T	T	intronic	ACADVL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr17	7126201	7126201	A	A	intronic	ACADVL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr17	7126606	7126606	A	A	intronic	ACADVL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	7127718	7127718	T	C	intronic	ACADVL	NaN	NaN	NaN	rs17671352	NaN	0.519768	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.828329	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	6	10	41
chr17	71281700	71281700	T	G	exonic	CDC42EP4	NaN	nonsynonymous SNV	CDC42EP4:NM_012121:exon2:c.A940C:p.T314P	NaN	NaN	NaN	0.28	T	0.001	B	0.0	B	0.030	N	0.566	N	1.1	L	1.39	T	-1.047	T	0.056	T	0.135	1.320	10.33	1.3	0.219	0.625	6.290	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.698579	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	26	23	3	0
chr17	71281804	71281804	T	T	exonic	CDC42EP4	NaN	synonymous SNV	CDC42EP4:NM_012121:exon2:c.A836A:p.H279H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	17	16	0	0
chr17	71285062	71285062	G	G	intronic	CDC42EP4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	7129840	7129840	T	C	exonic	DVL2	NaN	synonymous SNV	DVL2:NM_004422:exon14:c.A1662G:p.Q554Q	rs35594616	NaN	0.519569	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSm	3	Somatic	0.004845778967793046	Somatic	212.829	43	NaN	NA	NA	57	25	32	21
chr17	7129898	7129898	G	A	exonic	DVL2	NaN	nonsynonymous SNV	DVL2:NM_004422:exon14:c.C1604T:p.T535I	rs72839768	NaN	0.0071885	0.01	D	0.984	D	0.916	D	0.000	D	1.000	D	2.83	M	2.46	T	-0.974	T	0.053	T	0.832	3.709	18.84	4.91	2.553	9.263	15.630	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	549.9	0	NaN	NA	NA	120	36	84	1
chr17	7132556	7132556	C	T	exonic	DVL2	NaN	synonymous SNV	DVL2:NM_004422:exon8:c.G855A:p.Q285Q	rs222837	NaN	0.655152	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	1077.46	112	NaN	NA	NA	166	28	138	32
chr17	7133100	7133100	G	T	intronic	DVL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.565005	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	25	20	5	0
chr17	7133101	7133101	C	T	intronic	DVL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.756502	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	25	20	5	0
chr17	71344889	71344889	C	T	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	rs9905883	NaN	0.858626	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1633.87	0	NaN	NA	NA	146	0	146	52
chr17	71346296	71346296	T	A	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	15	2	9	0
chr17	71346297	71346297	G	C	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	15	0	11	0
chr17	71346321	71346321	T	C	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr17	71346353	71346353	A	C	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	rs28397959	NaN	0.859026	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	515.3	0	NaN	NA	NA	25	1	24	23
chr17	71357810	71357810	G	A	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	rs2279732	NaN	0.311701	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	48.3564	0	17.411244	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	11	8	30
chr17	71390269	71390269	G	A	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	71390270	71390270	A	G	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7139238	7139238	G	A	intronic	PHF23	NaN	NaN	NaN	rs222851	NaN	0.513978	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	51	46	5	36
chr17	7139427	7139427	A	G	exonic	PHF23	NaN	synonymous SNV	PHF23:NM_001284517:exon4:c.T618C:p.P206P,PHF23:NM_001284518:exon4:c.T807C:p.P269P,PHF23:NM_024297:exon4:c.T819C:p.P273P	NaN	NaN	NaN	0.07	T	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.836	T	0.212	T	.	-0.544	1.531	1.97	0.185	-0.092	5.851	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.739507	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	106	89	17	0
chr17	7139449	7139449	A	A	exonic	PHF23	NaN	synonymous SNV	PHF23:NM_001284517:exon4:c.T596T:p.V199V,PHF23:NM_001284518:exon4:c.T785T:p.V262V,PHF23:NM_024297:exon4:c.T797T:p.V266V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	47	38	0	0
chr17	7139557	7139557	TC	CC,TCC,T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	153.085	0	NaN	NA	NA	39	0	9	0
chr17	71397914	71397914	A	C	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.225486	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	90	68	22	0
chr17	71410868	71410868	G	T	exonic	SDK2	NaN	nonsynonymous SNV	SDK2:NM_001144952:exon18:c.C2399A:p.A800E	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.893	P	0.789	P	0.000	D	0.991	D	3.29	M	0.18	T	-0.265	T	0.380	T	0.584	3.668	18.64	2.34	0.272	3.580	10.208	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.122434	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	39	35	4	0
chr17	71410870	71410870	G	C	exonic	SDK2	NaN	nonsynonymous SNV	SDK2:NM_001144952:exon18:c.C2397G:p.H799Q	NaN	NaN	NaN	0.85	T	0.0	B	0.0	B	0.000	D	0.804	N	-0.79	N	0.47	T	-0.968	T	0.030	T	0.031	-0.274	2.687	-9.18	-1.250	-1.162	5.134	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.46976	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	38	34	4	0
chr17	71419673	71419673	A	G	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.673157	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	133	126	7	0
chr17	71419700	71419700	C	T	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.138052	nearby_gap_events	REJECT	135	128	7	0
chr17	71419971	71419971	A	G	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	19	5	14	0
chr17	71426606	71426606	G	T	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	rs143153761	NaN	0.00279553	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	275.073	0	NaN	NA	NA	105	50	55	1
chr17	7142709	7142709	T	C	UTR5	PHF23	NM_001284517:c.-111A>G,NM_024297:c.-111A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.038307		KEEP	31	27	4	0
chr17	71430014	71430014	A	T	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr17	71434072	71434072	G	G	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	38	33	0	0
chr17	71452344	71452344	A	A	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	7145492	7145492	C	CA	intronic	GABARAP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.842053	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	157.913	0	NaN	NA	NA	21	2	18	39
chr17	71468179	71468179	A	G	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.161478	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	112	104	8	0
chr17	71468412	71468412	A	A	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	7147964	7147964	G	T	intronic	CTDNEP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.606633	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	56	51	5	0
chr17	7154534	7154534	G	A	exonic	CTDNEP1	NaN	synonymous SNV	CTDNEP1:NM_001143775:exon1:c.C82T:p.L28L,CTDNEP1:NM_015343:exon2:c.C82T:p.L28L	rs414206	ID=COSM437281;OCCURENCE=1(breast)	0.701078	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	178	32	146	48
chr17	7155810	7155810	G	A	UTR5	ELP5	NM_203415:c.-12G>A,NM_015362:c.-12G>A,NM_203413:c.-12G>A,NM_203414:c.-12G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.67592	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	133	128	5	0
chr17	7160387	7160387	A	C	intronic	ELP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr17	7160393	7160393	G	A	intronic	ELP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7162257	7162257	A	A	UTR3	ELP5	NM_203413:c.*150A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	7163060	7163060	A	A	UTR3	ELP5	NM_203415:c.*56A>A,NM_015362:c.*56A>A,NM_203413:c.*953A>A,NM_203414:c.*56A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	71638060	71638060	T	G	intronic	SDK2	NaN	NaN	NaN	rs4789238	NaN	0.29992	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	7165400	7165400	A	T	UTR5	CLDN7	NM_001185023:c.-38T>A,NM_001185022:c.-38T>A,NM_001307:c.-38T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr17	71680998	71680998	G	G	intergenic	SDK2,LOC100134391	dist=40771;dist=52995	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	71690767	71690767	G	G	intergenic	SDK2,LOC100134391	dist=50540;dist=43226	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	71695296	71695296	G	C	intergenic	SDK2,LOC100134391	dist=55069;dist=38697	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	71708091	71708091	C	C	intergenic	SDK2,LOC100134391	dist=67864;dist=25902	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	7186640	7186640	AGT	A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.45727	0	NaN	NA	NA	12	10	2	0
chr17	7186647	7186647	GT	TG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.61941	0	NaN	NA	NA	12	10	2	0
chr17	7186737	7186737	G	C	intronic	SLC2A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.322227	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	153	141	12	0
chr17	71881968	71881968	G	G	intergenic	LINC00469,RPL38	dist=57292;dist=317827	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	7189241	7189241	C	G	intronic	SLC2A4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	0.027	B	0.023	B	.	.	1.000	N	.	.	-1.52	D	-0.924	T	0.231	T	0.107	1.108	9.519	-8.29	-1.714	-1.234	8.487	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.603864	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	613	572	41	0
chr17	7193255	7193255	G	A	intronic	YBX2	NaN	NaN	NaN	rs3744405	NaN	0.363219	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	98.4387	0	NaN	NA	NA	98	64	34	27
chr17	71989140	71989140	A	T	intergenic	LINC00469,RPL38	dist=164464;dist=210655	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr17	71989141	71989141	G	T	intergenic	LINC00469,RPL38	dist=164465;dist=210654	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr17	72001291	72001291	G	A	intergenic	LINC00469,RPL38	dist=176615;dist=198504	NaN	NaN	rs1673855	NaN	0.485024	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	72095301	72095301	G	A	intergenic	LINC00469,RPL38	dist=270625;dist=104494	NaN	NaN	rs4239006	NaN	0.417532	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	13	9	4	0
chr17	72104217	72104217	T	C	intergenic	LINC00469,RPL38	dist=279541;dist=95578	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	7216869	7216869	A	A	intronic	GPS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	46	36	0	0
chr17	72177417	72177417	C	T	intergenic	LINC00469,RPL38	dist=352741;dist=22378	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7218365	7218365	C	G	exonic	GPS2	NaN	nonsynonymous SNV	GPS2:NM_004489:exon2:c.G7C:p.A3P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.911	P	0.725	P	0.000	U	1.000	D	2.085	M	0.15	T	-0.510	T	0.272	T	0.802	4.795	27.0	3.62	1.148	6.519	11.649	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.16176470588235334	NA	0	0	9.122211	nearby_gap_events	REJECT	19	13	6	0
chr17	72216807	72216807	A	G	intronic	TTYH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	13	2	10	0
chr17	7221861	7221861	G	C	exonic	NEURL4	NaN	nonsynonymous SNV	NEURL4:NM_001005408:exon23:c.C3811G:p.P1271A,NEURL4:NM_032442:exon23:c.C3817G:p.P1273A	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.229	B	0.056	B	0.000	D	0.998	D	2.66	M	1.4	T	-0.929	T	0.119	T	0.507	3.529	18.01	4.26	1.190	6.777	12.763	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0010601885977199789	NA	0	0	NaN	NA	NA	242	179	63	0
chr17	7222020	7222020	A	C	intronic	NEURL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr17	72233552	72233552	G	A	exonic	TTYH2	NaN	synonymous SNV	TTYH2:NM_032646:exon4:c.G534A:p.A178A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.011303	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	171	161	10	0
chr17	72240168	72240168	G	A	exonic	TTYH2	NaN	nonsynonymous SNV	TTYH2:NM_032646:exon6:c.G784A:p.A262T	rs35682745	NaN	0.108826	0.11	T	0.023	B	0.013	B	0.002	N	0.000	P	2.4	M	2.7	T	-1.097	T	0.000	T	0.424	2.717	15.05	3.16	0.536	4.109	8.859	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.4476	0	NaN	NA	NA	8	6	2	12
chr17	72240177	72240177	T	G	exonic	TTYH2	NaN	nonsynonymous SNV	TTYH2:NM_032646:exon6:c.T793G:p.S265A	rs35999669	ID=COSM437296;OCCURENCE=1(breast)	0.381989	1	T	0.0	B	0.001	B	0.000	N	0.000	P	-1.665	N	3.16	T	-0.964	T	0.000	T	0.329	0.113	4.610	4.04	0.539	2.541	6.888	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.4476	0	NaN	NA	NA	8	6	2	26
chr17	7224490	7224490	T	G	exonic	NEURL4	NaN	nonsynonymous SNV	NEURL4:NM_001005408:exon20:c.A3295C:p.S1099R,NEURL4:NM_032442:exon20:c.A3301C:p.S1101R	NaN	NaN	NaN	0.79	T	0.828	P	0.221	B	0.000	D	0.621	N	1.39	L	1.52	T	-1.046	T	0.046	T	0.445	1.526	11.05	3.62	0.801	2.020	9.722	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.719007	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	170	160	10	0
chr17	72245410	72245410	T	A	intronic	TTYH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	72245663	72245663	A	A	intronic	TTYH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	72246014	72246014	C	C	intronic	TTYH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	72246015	72246015	T	T	intronic	TTYH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	72246386	72246386	G	T	intronic	TTYH2	NaN	NaN	NaN	rs73996939	NaN	0.103035	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.936918	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	349	327	22	0
chr17	72246558	72246558	A	A	intronic	TTYH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	72248651	72248651	A	A	intronic	TTYH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	72305534	72305534	C	T	intronic	DNAI2	NaN	NaN	NaN	rs2290955	NaN	0.355431	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.644605	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	27	0	27	49
chr17	72306356	72306356	A	A	intronic	DNAI2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	7230850	7230850	G	C	exonic	NEURL4	NaN	nonsynonymous SNV	NEURL4:NM_001005408:exon2:c.C636G:p.S212R,NEURL4:NM_032442:exon2:c.C636G:p.S212R	NaN	NaN	NaN	0.54	T	0.0	B	0.001	B	0.009	N	0.620	D	1.1	L	1.45	T	-1.018	T	0.045	T	0.321	1.279	10.18	1.11	0.328	1.326	7.726	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.2631578947368443	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr17	7231274	7231274	A	A	intronic	NEURL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	7231279	7231279	T	C	intronic	NEURL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	72338323	72338323	C	C	intronic	KIF19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	72339603	72339603	A	T	intronic	KIF19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	72347935	72347935	T	G	intronic	KIF19	NaN	NaN	NaN	rs3874788	NaN	0.852636	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.022969	normal_lod	REJECT	3	0	3	1
chr17	72348348	72348348	T	C	intronic	KIF19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.813414	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	59	53	6	0
chr17	72350277	72350277	T	G	intronic	KIF19	NaN	NaN	NaN	rs2382642	NaN	0.527556	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	20.2652	0	NaN	NA	NA	37	28	9	50
chr17	72351050	72351050	A	A	exonic	KIF19	NaN	synonymous SNV	KIF19:NM_153209:exon19:c.A2836A:p.K946K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	88	69	0	0
chr17	72351133	72351133	A	A	intronic	KIF19	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	10	7	0	0
chr17	72351406	72351406	C	T	exonic	KIF19	NaN	synonymous SNV	KIF19:NM_153209:exon20:c.C2952T:p.H984H	rs2271536	NaN	0.350839	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	128.368	0	NaN	NA	NA	59	32	27	19
chr17	72356458	72356458	A	G	intronic	BTBD17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	1	6	0
chr17	72363909	72363909	A	G	intronic	GPR142	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	72366599	72366599	T	C	intronic	GPR142	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	2	2	0
chr17	72366601	72366601	C	A	intronic	GPR142	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	5	0	3	0
chr17	72367843	72367843	C	T	intronic	GPR142	NaN	NaN	NaN	rs11652774	NaN	0.29972	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	233.407	0	NaN	NA	NA	88	40	48	27
chr17	72368550	72368550	T	C	exonic	GPR142	NaN	synonymous SNV	GPR142:NM_181790:exon4:c.T1200C:p.N400N	rs11658891	NaN	0.595647	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	78.233	0	35.178991	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	10	14	34
chr17	72429834	72429834	T	G	intronic	GPRC5C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.10395	nearby_gap_events	REJECT	232	219	13	0
chr17	72443192	72443192	G	T	UTR3	GPRC5C	NM_022036:c.*25G>T,NM_018653:c.*25G>T	NaN	NaN	rs2706527	NaN	0.83127	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	884.287	0	NaN	NA	NA	98	0	98	51
chr17	7245563	7245563	T	A	intronic	ACAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr17	7245565	7245565	G	A	intronic	ACAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	9	5	3	0
chr17	7245566	7245566	T	G	intronic	ACAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	9	4	4	0
chr17	7246940	7246940	T	G	intronic	ACAP1	NaN	NaN	NaN	rs3809829	NaN	0.597644	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	159	8	151	41
chr17	72470656	72470656	T	G	intronic	CD300A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	13	6	7	0
chr17	7251134	7251134	C	T	intronic	ACAP1	NaN	NaN	NaN	rs113180181	NaN	0.00878594	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	49	5	44	4
chr17	72537915	72537915	G	A	intronic	CD300C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.759105	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	382	345	37	0
chr17	7254602	7254602	T	G	intronic	ACAP1	NaN	NaN	NaN	rs66687178	NaN	0.142572	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	96.82243	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	0	32	22
chr17	7259073	7259073	C	T	intronic	TMEM95	NaN	NaN	NaN	rs6503016	NaN	0.500998	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	94.870832	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	0	32	36
chr17	72609030	72609030	A	A	intronic	CD300E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr17	72610004	72610004	A	C	intronic	CD300E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.231897	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	82	75	7	0
chr17	72694461	72694461	C	A	intronic	CD300LF,RAB37	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.729876	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	329	307	22	0
chr17	72701007	72701007	A	C	intronic	CD300LF,RAB37	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	72758023	72758023	T	T	intronic	SLC9A3R1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	72764161	72764161	G	T	intronic	SLC9A3R1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	72768064	72768064	G	A	intronic	NAT9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.237338	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	97	82	15	0
chr17	72784923	72784923	C	T	intronic	TMEM104	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.5575980392156883	NA	0	0	NaN	NA	NA	15	12	3	0
chr17	72840719	72840719	C	A	intronic	GRIN2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.851589	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	159	145	14	0
chr17	72840720	72840720	A	C	intronic	GRIN2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.946216	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	152	137	15	0
chr17	72842439	72842439	G	A	intronic	GRIN2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.702995	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	351	329	22	0
chr17	72843378	72843378	C	T	intronic	GRIN2C	NaN	NaN	NaN	rs3826314	NaN	0.305911	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.891026	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	11
chr17	72843425	72843425	C	A	intronic	GRIN2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	1.3230663385462133E-5	Somatic	74.9771	88	24.505529	clustered_read_position	REJECT	8	0	8	0
chr17	72843581	72843581	T	G	exonic	GRIN2C	NaN	nonsynonymous SNV	GRIN2C:NM_000835:exon9:c.A1867C:p.T623P,GRIN2C:NM_001278553:exon9:c.A1867C:p.T623P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	1.67	L	0.58	T	-0.480	T	0.284	T	0.867	2.473	14.23	4.29	1.910	7.815	13.550	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr17	72846527	72846527	A	G	intronic	GRIN2C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.957441	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	122	117	5	0
chr17	72860522	72860522	C	T	intronic	FDXR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.305376	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	50	39	11	0
chr17	72860523	72860523	T	C	intronic	FDXR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.963981	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	50	39	11	0
chr17	72860842	72860842	A	A	intronic	FDXR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	7286326	7286326	T	A	exonic	TNK1	NaN	synonymous SNV	TNK1:NM_001251902:exon2:c.T81A:p.L27L,TNK1:NM_003985:exon2:c.T81A:p.L27L	rs1554948	NaN	0.384585	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	123	NaN	NA	NA	311	260	51	41
chr17	7290614	7290614	C	T	intronic	TNK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03846153846153868	NA	0	0	NaN	NA	NA	12	4	8	0
chr17	7290899	7290899	A	C	intronic	TNK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	72921823	72921823	G	T	intronic	OTOP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	10	5	3	0
chr17	72921825	72921825	T	G	intronic	OTOP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	10	5	3	0
chr17	72921830	72921830	C	G	intronic	OTOP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	72926327	72926327	T	T	intronic	OTOP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	6	0	0
chr17	72927123	72927123	G	T	exonic	OTOP2	NaN	nonsynonymous SNV	OTOP2:NM_178160:exon6:c.G1393T:p.G465W	rs6501741	NaN	0.544728	0.03	D	0.993	D	0.663	P	0.661	N	1.000	P	0.55	N	2.79	T	-0.966	T	0.000	T	0.167	0.369	6.004	-2.23	-0.515	-0.038	7.211	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1322.26	0	NaN	NA	NA	115	0	115	40
chr17	7293715	7293715	C	T	exonic	PLSCR3	NaN	nonsynonymous SNV	PLSCR3:NM_001201576:exon8:c.G877A:p.V293I,PLSCR3:NM_020360:exon8:c.G877A:p.V293I	rs3744549	NaN	0.525359	0.62	T	0.0	B	0.0	B	0.546	N	1.000	P	0	N	2.32	T	-1.044	T	0.000	T	0.064	-0.448	1.922	-1.82	-0.780	-1.714	8.401	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	106	83	23	53
chr17	72939446	72939446	C	T	intronic	OTOP3	NaN	NaN	NaN	rs4789110	NaN	0.541334	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.620997	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	24	10	47
chr17	72954917	72954917	A	C	intronic	HID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	26	7.230054	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	13	9	4	0
chr17	72955227	72955227	C	G	intronic	HID1	NaN	NaN	NaN	rs902727	NaN	0.681709	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	21	0	21	42
chr17	72955228	72955228	C	G	intronic	HID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.796827	nearby_gap_events	REJECT	83	72	11	0
chr17	72956124	72956124	G	A	exonic	HID1	NaN	synonymous SNV	HID1:NM_030630:exon7:c.C948T:p.A316A	rs3744198	NaN	0.244209	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.790305	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	21	20	42
chr17	72956399	72956399	C	A	intronic	HID1	NaN	NaN	NaN	rs3744199	NaN	0.339657	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	177.936	0	NaN	NA	NA	68	32	36	14
chr17	72956422	72956422	A	A	intronic	HID1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	7296899	7296899	C	T	ncRNA_intronic	TMEM256-PLSCR3	NaN	NaN	NaN	rs72842811	NaN	0.0117812	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	111	84	27	11
chr17	7297452	7297452	A	G	ncRNA_exonic	TMEM256-PLSCR3	NaN	NaN	NaN	rs4613118	NaN	0.545128	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	13	13	0	0
chr17	72985403	72985403	G	A	intronic	CDR2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	72997390	72997390	C	G	intronic	CDR2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	349	190	159	0
chr17	72998151	72998151	G	C	intronic	CDR2L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.221932	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	453	435	18	0
chr17	72999955	72999955	A	A	exonic	CDR2L	NaN	synonymous SNV	CDR2L:NM_014603:exon5:c.A1184A:p.D395D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	18	18	0	0
chr17	73000061	73000061	A	G	exonic	CDR2L	NaN	synonymous SNV	CDR2L:NM_014603:exon5:c.A1290G:p.E430E	rs3744203	ID=COSM437358;OCCURENCE=1(breast)	0.466454	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.543214	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	15	18	34
chr17	73016419	73016419	G	A	exonic	ICT1	NaN	nonsynonymous SNV	ICT1:NM_001303265:exon4:c.G295A:p.A99T,ICT1:NM_001545:exon4:c.G295A:p.A99T	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	2.78	M	2.27	T	-0.880	T	0.153	T	0.84	5.365	34	5.91	2.793	8.032	18.479	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	9.421142214738571E-8	Somatic	89.6941	23	81.035721	nearby_gap_events	REJECT	179	132	47	0
chr17	73038454	73038454	T	G	intronic	ATP5H	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	7307287	7307287	T	C	ncRNA_intronic	TMEM256-PLSCR3	NaN	NaN	NaN	rs9900153	NaN	0.572484	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.9069	0	NaN	NA	NA	21	17	4	48
chr17	73096565	73096565	C	T	exonic	SLC16A5	NaN	synonymous SNV	SLC16A5:NM_001271765:exon5:c.C807T:p.D269D,SLC16A5:NM_004695:exon5:c.C807T:p.D269D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.02361	clustered_read_position	REJECT	60	55	5	0
chr17	7311866	7311866	A	C	exonic	NLGN2	NaN	nonsynonymous SNV	NLGN2:NM_020795:exon1:c.A292C:p.N98H	NaN	NaN	NaN	0	D	0.9	P	0.67	P	0.003	N	1.000	D	2.765	M	0.18	T	-0.352	T	0.302	T	0.408	4.432	23.6	3.42	1.819	7.238	10.530	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	1
chr17	7314386	7314386	G	T	intronic	NLGN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	7318396	7318396	C	T	exonic	NLGN2	NaN	synonymous SNV	NLGN2:NM_020795:exon5:c.C966T:p.S322S	rs2241233	NaN	0.76897	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	148.501809	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	0	50	55
chr17	7318717	7318717	T	T	intronic	NLGN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	73201992	73201992	G	C	intronic	NUP85	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	154.145654	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	381	275	106	0
chr17	73201994	73201994	C	T	intronic	NUP85	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.669482	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	353	312	41	0
chr17	7320505	7320505	G	T	exonic	NLGN2	NaN	nonsynonymous SNV	NLGN2:NM_020795:exon7:c.G1895T:p.R632L	NaN	NaN	NaN	0.51	T	0.0	B	0.003	B	0.018	N	0.999	D	0.345	N	-0.29	T	-0.971	T	0.141	T	0.424	1.389	10.58	4.44	2.467	0.488	12.759	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.843596	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	9	6	3	0
chr17	7320509	7320509	C	G	exonic	NLGN2	NaN	synonymous SNV	NLGN2:NM_020795:exon7:c.C1899G:p.P633P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.864708	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	5	2	3	0
chr17	7323904	7323904	G	A	intronic	SPEM1	NaN	NaN	NaN	rs73977668	NaN	0.0858626	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	383	301	82	13
chr17	73239105	73239105	T	C	intronic	GGA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.857129	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	171	165	6	0
chr17	7324238	7324238	C	T	exonic	SPEM1	NaN	nonsynonymous SNV	SPEM1:NM_199339:exon3:c.C244T:p.P82S	rs377239691	NaN	NaN	0.08	T	0.851	P	0.415	B	0.064	N	1.000	N	1.04	L	0.95	T	-1.063	T	0.076	T	0.128	1.929	12.41	2.3	1.334	0.004	6.234	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.17142857142857418	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr17	73242776	73242776	A	A	intronic	GGA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	80	NaN	NA	NA	190	162	0	0
chr17	73263055	73263055	G	A	intronic	MIF4GD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.329493	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	181	175	6	0
chr17	73263058	73263058	A	A	intronic	MIF4GD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	73264028	73264028	T	C	intronic	MIF4GD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	38	30	8	0
chr17	73268742	73268742	A	G	ncRNA_exonic	LOC100287042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	10	1	8	0
chr17	73279624	73279624	A	G	exonic	SLC25A19	NaN	synonymous SNV	SLC25A19:NM_001126122:exon4:c.T339C:p.Y113Y,SLC25A19:NM_001126121:exon5:c.T339C:p.Y113Y,SLC25A19:NM_021734:exon5:c.T339C:p.Y113Y	rs7213318	NaN	0.889577	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	54.6393	0	17.940917	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	22
chr17	7329073	7329073	T	G	exonic	C17orf74	NaN	nonsynonymous SNV	C17orf74:NM_175734:exon1:c.T66G:p.D22E	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.043	B	0.011	B	0.015	N	1.000	N	1.79	L	0.77	T	-1.028	T	0.091	T	0.138	0.606	7.266	-2.74	-0.785	-2.202	4.579	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	12	3	6	6
chr17	7330168	7330168	G	G	exonic	C17orf74	NaN	synonymous SNV	C17orf74:NM_175734:exon3:c.G858G:p.L286L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	12	9	0	0
chr17	7330175	7330175	A	A	exonic	C17orf74	NaN	synonymous SNV	C17orf74:NM_175734:exon3:c.A865A:p.N289N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr17	7330290	7330290	C	T	exonic	C17orf74	NaN	nonsynonymous SNV	C17orf74:NM_175734:exon3:c.C980T:p.S327L	rs78371599	NaN	0.0229633	1	T	0.0	B	0.0	B	0.838	N	1.000	N	-0.895	N	1.54	T	-0.996	T	0.003	T	0.015	-2.258	0.004	0.992	0.246	-0.504	3.852	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	151	122	29	2
chr17	73316679	73316679	G	C	intronic	GRB2	NaN	NaN	NaN	rs8079197	NaN	0.558107	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.413478	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	9	5	55
chr17	73389545	73389545	C	G	intronic	GRB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr17	73389548	73389548	C	A	intronic	GRB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	73389549	73389549	T	G	intronic	GRB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	5	0	5	0
chr17	73389550	73389550	T	C	intronic	GRB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	8	1	7	0
chr17	73464390	73464390	T	C	intronic	KIAA0195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	73482282	73482282	T	T	intronic	KIAA0195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	73485033	73485033	T	C	intronic	KIAA0195	NaN	NaN	NaN	rs11867527	NaN	0.781749	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	84.5765	0	NaN	NA	NA	63	39	24	54
chr17	7348625	7348625	A	G	exonic	CHRNB1	NaN	nonsynonymous SNV	CHRNB1:NM_000747:exon2:c.A95G:p.E32G	rs17856697	ID=COSM437379;OCCURENCE=2(breast)	0.120607	0.08	T	0.772	P	0.243	B	0.028	N	0.000	P	1.005	L	-1.16	T	-1.022	T	0.000	T	0.229	3.436	17.62	5.43	2.279	6.902	8.739	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.609859	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	1	5	20
chr17	7348677	7348677	A	A	exonic	CHRNB1	NaN	synonymous SNV	CHRNB1:NM_000747:exon2:c.A147A:p.G49G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	73489220	73489220	T	C	intronic	KIAA0195	NaN	NaN	NaN	rs7215753	NaN	0.9998	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	146.10536	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	0	50	56
chr17	73490031	73490031	TGGGGC	TGGGC,TGGGGT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	74.6703	0	NaN	NA	NA	21	4	6	0
chr17	73491740	73491740	A	A	intronic	KIAA0195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	73491741	73491741	T	T	intronic	KIAA0195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	73492734	73492734	G	C	intronic	KIAA0195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	73492736	73492736	C	A	intronic	KIAA0195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	73495041	73495041	A	G	exonic	KIAA0195	NaN	synonymous SNV	KIAA0195:NM_014738:exon31:c.A3876G:p.T1292T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.739856	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	353	345	8	0
chr17	73497129	73497129	T	T	UTR3	CASKIN2	NM_001142643:c.*32A>A,NM_020753:c.*32A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	38	28	0	0
chr17	73497794	73497794	T	C	intronic	CASKIN2	NaN	NaN	NaN	rs9892311	NaN	0.815296	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.133072	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	8	7	55
chr17	73498737	73498737	G	T	exonic	CASKIN2	NaN	synonymous SNV	CASKIN2:NM_001142643:exon17:c.C2172A:p.P724P,CASKIN2:NM_020753:exon18:c.C2418A:p.P806P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.054065	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	99	88	11	0
chr17	73499316	73499316	C	T	exonic	CASKIN2	NaN	nonsynonymous SNV	CASKIN2:NM_001142643:exon17:c.G1593A:p.M531I,CASKIN2:NM_020753:exon18:c.G1839A:p.M613I	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.859	P	0.513	P	0.000	D	1.000	D	1.565	L	0.76	T	-0.810	T	0.172	T	0.796	4.055	20.8	5.21	2.423	4.838	18.756	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.27042	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	101	97	4	0
chr17	73500224	73500224	G	C	intronic	CASKIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	65.3064	21	14.62964	normal_lod	REJECT	9	2	7	0
chr17	73500270	73500270	C	A	intronic	CASKIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.42424242424242303	NA	0	0	5.106609	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	14	9	5	0
chr17	73500921	73500921	A	A	exonic	CASKIN2	NaN	synonymous SNV	CASKIN2:NM_001142643:exon10:c.T918T:p.P306P,CASKIN2:NM_020753:exon11:c.T1164T:p.P388P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	18	18	0	0
chr17	73501095	73501095	G	C	exonic	CASKIN2	NaN	synonymous SNV	CASKIN2:NM_001142643:exon10:c.C744G:p.G248G,CASKIN2:NM_020753:exon11:c.C990G:p.G330G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.52871	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	170	159	11	0
chr17	73501747	73501747	T	G	intronic	CASKIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.632519	nearby_gap_events	REJECT	43	33	10	0
chr17	73501748	73501748	G	T	intronic	CASKIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.903018	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	37	30	7	0
chr17	73501749	73501749	G	T	intronic	CASKIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1881422924901176	NA	0	0	NaN	NA	NA	17	13	4	0
chr17	73501752	73501752	G	A	intronic	CASKIN2	NaN	NaN	NaN	rs8069700	NaN	0.515775	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.848368	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	25	18	7	28
chr17	73501753	73501753	A	G	intronic	CASKIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.270959	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	22	15	7	0
chr17	73501840	73501840	C	G	intronic	CASKIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	73501841	73501841	A	G	intronic	CASKIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	7350267	7350267	A	G	intronic	CHRNB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	23	13.731193	clustered_read_position	REJECT	10	4	6	0
chr17	73503810	73503810	C	A	intronic	CASKIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.107764	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	297	278	19	0
chr17	73503830	73503830	A	A	intronic	CASKIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	73508082	73508082	C	G	intronic	CASKIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	7350975	7350975	T	C	intronic	CHRNB1	NaN	NaN	NaN	rs2302765	NaN	0.1873	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	83	NaN	NA	NA	157	119	38	22
chr17	7350993	7350993	C	G	intronic	CHRNB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	73510303	73510303	G	A	intronic	CASKIN2	NaN	NaN	NaN	rs9890605	NaN	0.814497	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr17	73513232	73513232	C	G	intronic	TSEN54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.039266	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	42	30	12	0
chr17	73519915	73519915	A	T	intronic	TSEN54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	73519917	73519917	C	G	intronic	TSEN54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	73520306	73520306	T	A	intronic	TSEN54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	73555285	73555285	T	T	intronic	LLGL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	95	17	0	0
chr17	73559225	73559225	G	C	exonic	LLGL2	NaN	nonsynonymous SNV	LLGL2:NM_001015002:exon7:c.G659C:p.G220A,LLGL2:NM_001031803:exon7:c.G659C:p.G220A,LLGL2:NM_004524:exon7:c.G659C:p.G220A	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.001	B	0.004	B	0.196	N	1.000	N	0.205	N	1.63	T	-1.046	T	0.085	T	0.15	1.634	11.42	-4.69	-0.581	-0.191	7.171	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.028142276781521605	NA	0	0	NaN	NA	NA	44	26	18	0
chr17	73562200	73562200	A	A	intronic	LLGL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	73567079	73567079	G	A	exonic	LLGL2	NaN	nonsynonymous SNV	LLGL2:NM_001031803:exon17:c.G2074A:p.E692K,LLGL2:NM_004524:exon17:c.G2074A:p.E692K	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	2.545	M	0.78	T	-0.294	T	0.330	T	0.709	3.279	17.01	4.82	2.234	9.625	17.891	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1473684210526336	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr17	73567215	73567215	G	T	intronic	LLGL2	NaN	NaN	NaN	rs115113002	NaN	0.00279553	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	73570169	73570169	A	A	intronic	LLGL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	73570718	73570718	C	G	exonic	LLGL2	NaN	nonsynonymous SNV	LLGL2:NM_004524:exon24:c.C2981G:p.P994R	rs1126939	NaN	0.315296	0	D	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	.	.	3.53	T	-1.042	T	0.000	T	.	0.903	8.672	0.022	-0.271	-0.116	4.422	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	162	130	32	34
chr17	73587702	73587702	A	C	ncRNA_exonic	MYO15B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	7358812	7358812	G	C	intronic	CHRNB1	NaN	NaN	NaN	rs377089087	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7358814	7358814	A	C	intronic	CHRNB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	73588736	73588736	C	A	ncRNA_intronic	MYO15B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	7359277	7359277	T	C	intronic	CHRNB1	NaN	NaN	NaN	rs2302763	NaN	0.182907	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	78.576759	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	4	28	24
chr17	73624827	73624827	T	TG	exonic	RECQL5	NaN	frameshift substitution	RECQL5:NM_004259:exon17:c.2505_2505delinsCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.93534	0	NaN	NA	NA	131	109	34	1
chr17	73625478	73625478	T	C	exonic	RECQL5	NaN	synonymous SNV	RECQL5:NM_004259:exon16:c.A2025G:p.T675T	rs820191	NaN	0.989217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	131.680199	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	44	0	44	58
chr17	73627565	73627565	A	G	exonic	RECQL5	NaN	synonymous SNV	RECQL5:NM_004259:exon9:c.T1413C:p.Y471Y	rs820197	NaN	0.988618	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	368.303459	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	123	0	123	58
chr17	73629648	73629648	T	C	UTR5	SMIM5	NM_001162995:c.-6634T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	73638426	73638426	T	G	intronic	RECQL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr17	73646690	73646690	A	C	UTR3	RECQL5	NM_001003715:c.*30T>G,NM_001003716:c.*572T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	73646691	73646691	C	G	UTR3	RECQL5	NM_001003715:c.*29G>C,NM_001003716:c.*571G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	73646692	73646692	T	A	UTR3	RECQL5	NM_001003715:c.*28A>T,NM_001003716:c.*570A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr17	73646693	73646693	C	G	UTR3	RECQL5	NM_001003715:c.*27G>C,NM_001003716:c.*569G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	73646694	73646694	C	A	UTR3	RECQL5	NM_001003715:c.*26G>T,NM_001003716:c.*568G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	73646695	73646695	T	C	UTR3	RECQL5	NM_001003715:c.*25A>G,NM_001003716:c.*567A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr17	73646887	73646887	A	A	UTR3	RECQL5	NM_001003716:c.*375T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr17	73656963	73656963	T	T	intronic	RECQL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	7366219	7366219	C	T	exonic	ZBTB4	NaN	synonymous SNV	ZBTB4:NM_001128833:exon4:c.G2082A:p.R694R,ZBTB4:NM_020899:exon4:c.G2082A:p.R694R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.162928	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	31	28	3	0
chr17	7366557	7366557	C	G/A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	73	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr17	7366651	7366651	C	G	exonic	ZBTB4	NaN	nonsynonymous SNV	ZBTB4:NM_001128833:exon4:c.G1650C:p.M550I,ZBTB4:NM_020899:exon4:c.G1650C:p.M550I	rs871990	NaN	0.1873	0.11	T	0.0	B	0.0	B	0.972	U	1.000	P	0	N	3.9	T	-0.895	T	0.000	T	0.049	0.088	4.476	-9.81	-2.294	-3.455	4.054	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	61.688	0	NaN	NA	NA	66	42	24	19
chr17	73667806	73667806	T	T	intronic	SAP30BP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr17	73684037	73684037	A	T	intronic	SAP30BP	NaN	NaN	NaN	rs1661652	NaN	0.699081	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	73689572	73689572	G	T	intronic	SAP30BP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.16666666666666674	NA	0	0	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	73723569	73723569	A	G	exonic	ITGB4	NaN	nonsynonymous SNV	ITGB4:NM_001005619:exon3:c.A247G:p.S83G,ITGB4:NM_000213:exon4:c.A247G:p.S83G,ITGB4:NM_001005731:exon4:c.A247G:p.S83G	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.987	D	0.885	P	0.000	D	0.981	D	2.01	M	-3.15	D	0.788	D	0.829	D	0.471	1.556	11.16	5.46	2.072	2.820	7.654	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.493489	possible_contamination	REJECT	96	91	5	0
chr17	73726944	73726944	T	C	intronic	ITGB4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.423279	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	215	199	16	0
chr17	73726992	73726992	G	T	exonic	ITGB4	NaN	nonsynonymous SNV	ITGB4:NM_001005619:exon8:c.G1039T:p.V347L,ITGB4:NM_000213:exon9:c.G1039T:p.V347L,ITGB4:NM_001005731:exon9:c.G1039T:p.V347L	NaN	NaN	NaN	0.33	T	0.004	B	0.007	B	0.110	N	1.000	N	0.64	N	-4.36	D	-0.050	T	0.732	D	0.089	1.917	12.37	1.79	0.599	1.446	7.136	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.454862	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	177	162	15	0
chr17	73726993	73726993	T	G	exonic	ITGB4	NaN	nonsynonymous SNV	ITGB4:NM_001005619:exon8:c.T1040G:p.V347G,ITGB4:NM_000213:exon9:c.T1040G:p.V347G,ITGB4:NM_001005731:exon9:c.T1040G:p.V347G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.85	P	0.483	P	0.110	N	0.996	D	2.49	M	-4.56	D	0.933	D	0.899	D	0.398	1.419	10.68	4.28	2.057	0.826	6.625	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.865817	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	189	174	15	0
chr17	73728364	73728364	C	T	intronic	ITGB4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	93	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr17	73728365	73728365	T	C	intronic	ITGB4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	40	37	3	0
chr17	73732522	73732522	T	G	intronic	ITGB4	NaN	NaN	NaN	rs820176	NaN	0.689896	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	48.344591	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	0	15	42
chr17	73732810	73732810	A	C	intronic	ITGB4	NaN	NaN	NaN	rs820177	NaN	0.69349	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.447977	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	0	34	48
chr17	73735859	73735859	G	A	intronic	ITGB4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.446257	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	317	307	10	0
chr17	73736550	73736550	C	A	intronic	ITGB4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.720498	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	97	84	13	0
chr17	73736569	73736569	C	A	intronic	ITGB4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.005320550436502809	Somatic	48.5172	0	NaN	NA	NA	116	87	29	2
chr17	73748431	73748431	A	A	exonic	ITGB4	NaN	synonymous SNV	ITGB4:NM_001005619:exon30:c.A3970A:p.M1324M,ITGB4:NM_000213:exon31:c.A3970A:p.M1324M,ITGB4:NM_001005731:exon31:c.A3970A:p.M1324M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	28	26	0	0
chr17	73750601	73750601	C	G	intronic	ITGB4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.630694	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	12	7	5	2
chr17	73750859	73750859	C	G	exonic	ITGB4	NaN	synonymous SNV	ITGB4:NM_001005619:exon32:c.C4311G:p.P1437P,ITGB4:NM_001005731:exon33:c.C4311G:p.P1437P,ITGB4:NM_000213:exon34:c.C4521G:p.P1507P	rs8669	NaN	0.377196	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	71.6239	21	22.910428	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	2	9	35
chr17	73753728	73753728	G	T	UTR3	ITGB4	NM_000213:c.*92G>T,NM_001005731:c.*92G>T,NM_001005619:c.*92G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.480714	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	99	93	6	0
chr17	73759039	73759039	C	T	intronic	GALK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.480724	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	5	2	3	0
chr17	73808761	73808761	C	T	intronic	UNK	NaN	NaN	NaN	rs139675007	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	73814814	73814814	C	A	exonic	UNK	NaN	nonsynonymous SNV	UNK:NM_001080419:exon11:c.C1463A:p.P488Q	NaN	NaN	NaN	0.54	T	1.0	D	0.996	D	0.000	D	1.000	D	1.59	L	.	.	-0.585	T	0.368	T	0.803	4.985	29.2	5.55	2.613	7.666	19.518	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	41.197683	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	454	412	42	0
chr17	73816270	73816270	C	T	intronic	UNK	NaN	NaN	NaN	rs150214359	NaN	0.00279553	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	6	0	5	0
chr17	73826018	73826018	C	G	intronic	UNC13D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	8	6	0
chr17	73826058	73826058	C	G	intronic	UNC13D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.01535037519852666	NA	0	0	18.769357	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	68	53	15	0
chr17	73829177	73829177	C	A	intronic	UNC13D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.485567	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	49	43	6	0
chr17	73829190	73829190	C	T	intronic	UNC13D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.374841	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	26	20	6	0
chr17	73830302	73830302	A	C	intronic	UNC13D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	73838642	73838642	T	G	exonic	UNC13D	NaN	synonymous SNV	UNC13D:NM_199242:exon6:c.A441C:p.P147P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.486576	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	101	92	9	0
chr17	73843708	73843708	A	T	intronic	WBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	17	9	8	0
chr17	73845630	73845630	T	C	intronic	WBP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr17	7386090	7386090	G	A	exonic	SLC35G6	NaN	nonsynonymous SNV	SLC35G6:NM_001102614:exon2:c.G787A:p.A263T	rs7209977	NaN	0.120607	0.36	T	0.031	B	0.011	B	.	.	0.000	P	1.61	L	-0.25	T	-1.065	T	0.000	T	0.372	1.222	9.957	4.06	1.996	2.058	10.773	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	122.763	0	NaN	NA	NA	213	48	165	14
chr17	73871645	73871645	A	A	intronic	TRIM47	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	73873119	73873119	T	G	intronic	TRIM47	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	73873123	73873123	T	G	intronic	TRIM47	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	73887734	73887734	T	G	intronic	TRIM65	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	0	2	0
chr17	73887735	73887735	G	A	intronic	TRIM65	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	73888395	73888395	T	C,TC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.80229	0	NaN	NA	NA	131	112	6	0
chr17	73888742	73888742	C	G	intronic	TRIM65	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	44	36	8	0
chr17	73888743	73888743	G	C	intronic	TRIM65	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	50	38	12	0
chr17	73895152	73895152	C	T	intronic	MRPL38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	16	5	10	2
chr17	73895154	73895154	T	C	intronic	MRPL38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	17	5	11	0
chr17	73895159	73895159	C	T	intronic	MRPL38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	15	4	11	0
chr17	73898036	73898036	T	G	intronic	MRPL38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.759994	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	101	92	9	0
chr17	73905787	73905787	A	G	downstream	FBF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	73929240	73929240	A	A	intronic	FBF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	73949739	73949739	A	T	intronic	ACOX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr17	73959466	73959466	C	T	intronic	ACOX1	NaN	NaN	NaN	rs7226127	NaN	0.119808	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	73997431	73997431	T	T	ncRNA_exonic	TEN1-CDK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	73999109	73999109	T	T	ncRNA_intronic	TEN1-CDK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr17	73999512	73999512	A	G	ncRNA_intronic	TEN1-CDK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	74001563	74001563	A	A	ncRNA_exonic	TEN1-CDK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr17	74005497	74005497	G	C	exonic	EVPL	NaN	nonsynonymous SNV	EVPL:NM_001988:exon22:c.C3789G:p.S1263R	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.99	D	0.851	P	0.000	D	0.895	D	2.095	M	0.52	T	-0.558	T	0.248	T	0.324	3.212	16.76	3.25	0.620	3.876	10.055	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	28	11	17	0
chr17	74005498	74005498	C	G	exonic	EVPL	NaN	nonsynonymous SNV	EVPL:NM_001988:exon22:c.G3788C:p.S1263T	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.967	D	0.619	P	0.000	D	0.946	N	2.095	M	0.54	T	-0.853	T	0.179	T	0.145	3.132	16.47	-0.092	-0.240	0.538	9.403	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	42	22	20	0
chr17	74008180	74008180	A	A	intronic	EVPL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	7401335	7401335	G	GCTCTGGGGT	intronic	POLR2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	743.349	0	NaN	NA	NA	273	99	126	16
chr17	74015102	74015102	C	A	exonic	EVPL	NaN	nonsynonymous SNV	EVPL:NM_001988:exon11:c.G1177T:p.G393W	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.911	P	0.205	B	0.383	N	1.000	N	0.69	N	-0.22	T	-0.955	T	0.107	T	0.246	2.131	13.08	-2.39	-0.032	-0.253	3.150	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	4.2530916704834783E-4	NA	0	0	13.761342	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	24	16	8	0
chr17	74015103	74015103	A	C	exonic	EVPL	NaN	synonymous SNV	EVPL:NM_001988:exon11:c.T1176G:p.T392T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.973092	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	24	16	8	0
chr17	74042369	74042369	AG	GA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.17024	0	NaN	NA	NA	105	91	15	4
chr17	7405074	7405074	C	T	intronic	POLR2A	NaN	NaN	NaN	rs8075218	NaN	0.74361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1862.49	0	NaN	NA	NA	157	0	157	54
chr17	7405695	7405695	T	C	intronic	POLR2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	7405697	7405697	T	G	intronic	POLR2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	7406049	7406049	C	T	intronic	POLR2A	NaN	NaN	NaN	rs9910214	NaN	0.0311502	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	78	NaN	NA	NA	150	125	25	10
chr17	74070974	74070974	T	T	exonic	GALR2	NaN	synonymous SNV	GALR2:NM_003857:exon1:c.T10T:p.S4S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	74079652	74079652	C	A	UTR3	EXOC7	NM_001145298:c.*77G>T,NM_001145297:c.*77G>T,NM_001145299:c.*77G>T,NM_001013839:c.*77G>T,NM_015219:c.*77G>T,NM_001282313:c.*77G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	74079653	74079653	C	A	UTR3	EXOC7	NM_001145298:c.*76G>T,NM_001145297:c.*76G>T,NM_001145299:c.*76G>T,NM_001013839:c.*76G>T,NM_015219:c.*76G>T,NM_001282313:c.*76G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	74081619	74081619	G	T	intronic	EXOC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.946141	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	266	245	21	0
chr17	74087124	74087124	G	G	intronic	EXOC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	74087128	74087128	T	A	intronic	EXOC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	74097966	74097966	A	A	intronic	EXOC7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	74099777	74099777	T	C	UTR5	EXOC7	NM_001145298:c.-4A>G,NM_001145297:c.-4A>G,NM_001145299:c.-4A>G,NM_001013839:c.-4A>G,NM_015219:c.-4A>G,NM_001282314:c.-4A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.363291	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	45	42	3	0
chr17	74121019	74121019	A	G	intergenic	EXOC7,FOXJ1	dist=21151;dist=11396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	74141268	74141268	T	T	ncRNA_intronic	RNF157-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	74148354	74148354	A	G	ncRNA_intronic	RNF157-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	74151574	74151574	T	T	intronic	RNF157	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	74157907	74157907	G	T	intronic	RNF157	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.639278	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	760	731	29	0
chr17	74157908	74157908	C	G	intronic	RNF157	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.017064	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	647	617	30	0
chr17	74160670	74160670	T	C	intronic	RNF157	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5005	0	NaN	NA	NA	7	5	2	1
chr17	7416113	7416113	G	G	exonic	POLR2A	NaN	synonymous SNV	POLR2A:NM_000937:exon28:c.G4627G:p.A1543A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	50	41	0	0
chr17	7416114	7416114	C	C	exonic	POLR2A	NaN	synonymous SNV	POLR2A:NM_000937:exon28:c.C4628C:p.A1543A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	50	43	0	0
chr17	7416115	7416115	A	A	exonic	POLR2A	NaN	synonymous SNV	POLR2A:NM_000937:exon28:c.A4629A:p.A1543A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	49	42	0	0
chr17	74162460	74162460	T	T	intronic	RNF157	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	7416456	7416456	A	A	exonic	POLR2A	NaN	synonymous SNV	POLR2A:NM_000937:exon29:c.A4873A:p.T1625T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	27	22	0	0
chr17	7417422	7417422	T	T	exonic	POLR2A	NaN	synonymous SNV	POLR2A:NM_000937:exon29:c.T5839T:p.Y1947Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	74272681	74272681	T	A	intronic	QRICH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	74286252	74286252	A	A	intronic	QRICH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	14	12	0	0
chr17	74288514	74288514	C	G	exonic	QRICH2	NaN	nonsynonymous SNV	QRICH2:NM_032134:exon4:c.G1796C:p.G599A	NaN	NaN	NaN	0.03	D	1.0	D	0.999	D	.	.	1.000	N	2.605	M	2.19	T	-1.030	T	0.134	T	0.283	1.580	11.24	2.5	0.427	0.892	7.503	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.918	0	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr17	74288516	74288516	A	T	exonic	QRICH2	NaN	synonymous SNV	QRICH2:NM_032134:exon4:c.T1794A:p.P598P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.039	0	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr17	74288520	74288520	T	A	exonic	QRICH2	NaN	nonsynonymous SNV	QRICH2:NM_032134:exon4:c.A1790T:p.Q597L	NaN	NaN	NaN	0.2	T	0.804	P	0.23	B	.	.	1.000	N	2.1	M	1.99	T	-1.040	T	0.040	T	0.417	0.582	7.144	-0.773	0.116	0.223	2.815	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.4874	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr17	74288560	74288560	C	T	exonic	QRICH2	NaN	nonsynonymous SNV	QRICH2:NM_032134:exon4:c.G1750A:p.G584S	NaN	NaN	NaN	0.08	T	1.0	D	0.999	D	.	.	1.000	N	2.365	M	2.72	T	-1.094	T	0.096	T	0.662	1.548	11.13	3.6	2.077	-0.064	10.901	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5597	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr17	74288562	74288562	C	T	exonic	QRICH2	NaN	nonsynonymous SNV	QRICH2:NM_032134:exon4:c.G1748A:p.R583H	NaN	NaN	NaN	0.55	T	0.013	B	0.004	B	.	.	1.000	N	1.245	L	3.09	T	-0.957	T	0.013	T	0.077	1.238	10.03	-8.52	-1.818	-4.590	5.248	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5597	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr17	74300654	74300654	A	A	intronic	QRICH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	74303591	74303591	A	A	UTR5	QRICH2	NM_032134:c.-10T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr17	74324960	74324960	A	G	intronic	PRPSAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	5	4	0
chr17	74328324	74328324	G	A	intronic	PRPSAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.829637	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	88	75	13	0
chr17	74340881	74340881	A	G	intronic	PRPSAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	14	6	7	0
chr17	74381165	74381165	T	G	UTR5	SPHK1	NM_182965:c.-22T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	74381566	74381566	T	TA	exonic	SPHK1	NaN	frameshift substitution	SPHK1:NM_182965:exon2:c.99_99delinsTA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	350.683	0	NaN	NA	NA	67	0	7	1
chr17	74382529	74382529	T	G	exonic	SPHK1	NaN	nonsynonymous SNV	SPHK1:NM_001142602:exon4:c.T314G:p.L105R,SPHK1:NM_001142601:exon5:c.T314G:p.L105R,SPHK1:NM_021972:exon5:c.T356G:p.L119R,SPHK1:NM_182965:exon5:c.T572G:p.L191R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.986	D	0.000	D	1.000	D	3.28	M	1.94	T	-0.535	T	0.199	T	0.995	3.966	20.3	5.39	2.037	5.938	15.415	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.010169	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	142	132	10	0
chr17	74382530	74382530	G	C	exonic	SPHK1	NaN	synonymous SNV	SPHK1:NM_001142602:exon4:c.G315C:p.L105L,SPHK1:NM_001142601:exon5:c.G315C:p.L105L,SPHK1:NM_021972:exon5:c.G357C:p.L119L,SPHK1:NM_182965:exon5:c.G573C:p.L191L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.983821	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	142	132	10	0
chr17	74386996	74386996	G	C	UTR3	UBE2O	NM_022066:c.*28C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr17	74386998	74386998	G	C	UTR3	UBE2O	NM_022066:c.*26C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	11	6	4	0
chr17	74387000	74387000	T	C	UTR3	UBE2O	NM_022066:c.*24A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr17	74387001	74387001	G	T	UTR3	UBE2O	NM_022066:c.*23C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr17	74388107	74388107	A	A	exonic	UBE2O	NaN	synonymous SNV	UBE2O:NM_022066:exon16:c.T3034T:p.Y1012Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	15	14	0	0
chr17	74391621	74391621	T	T	intronic	UBE2O	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	74395812	74395812	C	A	exonic	UBE2O	NaN	nonsynonymous SNV	UBE2O:NM_022066:exon9:c.G1346T:p.G449V	NaN	NaN	NaN	0.45	T	0.089	B	0.017	B	0.070	N	0.995	D	0.895	L	-0.61	T	-0.894	T	0.185	T	0.205	0.656	7.516	4.68	2.311	2.704	9.485	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	86	79	7	0
chr17	74396128	74396128	G	C	intronic	UBE2O	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.019018241838941678	NA	0	0	NaN	NA	NA	155	119	36	0
chr17	74396129	74396129	C	G	intronic	UBE2O	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.04375810133475407	NA	0	0	NaN	NA	NA	126	91	35	0
chr17	74396707	74396707	A	A	intronic	UBE2O	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr17	74464733	74464733	T	T	intronic	AANAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr17	74468575	74468575	T	T	intronic	RHBDF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	74469953	74469953	G	T	exonic	RHBDF2	NaN	nonsynonymous SNV	RHBDF2:NM_001005498:exon13:c.C1606A:p.H536N,RHBDF2:NM_024599:exon14:c.C1693A:p.H565N	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.998	D	0.965	D	0.000	D	1.000	D	2.52	M	0.47	T	-0.316	T	0.370	T	0.658	4.931	28.6	5.39	2.537	7.896	19.152	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.440097	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	345	316	29	0
chr17	74470408	74470408	T	T	intronic	RHBDF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	74473930	74473930	A	A	intronic	RHBDF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr17	74473931	74473931	A	A	intronic	RHBDF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	74473933	74473933	A	A	intronic	RHBDF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	74475024	74475024	G	A	exonic	RHBDF2	NaN	nonsynonymous SNV	RHBDF2:NM_001005498:exon5:c.C536T:p.P179L,RHBDF2:NM_024599:exon6:c.C623T:p.P208L	rs3744045	ID=COSM437441;OCCURENCE=1(breast)	0.765176	0.11	T	0.375	B	0.141	B	0.000	N	0.000	P	1.935	M	-0.18	T	-1.042	T	0.000	T	0.099	2.064	12.86	4.57	1.328	6.857	14.248	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.823352	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	0	15	49
chr17	74494492	74494492	A	G	intronic	RHBDF2	NaN	NaN	NaN	rs62086562	NaN	0.341054	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	74524748	74524748	C	G	intronic	CYGB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.425816	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	14	6	8	0
chr17	7453682	7453682	A	A	intronic	TNFSF12,TNFSF12-TNFSF13	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr17	74574979	74574979	A	A	intronic	ST6GALNAC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	7462326	7462326	A	G	UTR5	TNFSF13	NM_003808:c.-31A>G,NM_001198623:c.-31A>G,NM_001198622:c.-31A>G,NM_172088:c.-31A>G,NM_172087:c.-31A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.535554	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	93	83	10	0
chr17	7466605	7466605	A	A	exonic	SENP3	NaN	synonymous SNV	SENP3:NM_015670:exon2:c.A212A:p.D71D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	52	36	0	0
chr17	7468216	7468216	T	C	ncRNA_intronic	SENP3-EIF4A1	NaN	NaN	NaN	rs4968212	NaN	0.586661	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	94	NaN	NA	NA	274	222	52	56
chr17	74697734	74697734	A	C	intronic	MXRA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	74720113	74720113	G	A	exonic	JMJD6	NaN	synonymous SNV	JMJD6:NM_001081461:exon3:c.C546T:p.S182S,JMJD6:NM_015167:exon3:c.C546T:p.S182S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.660993	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	207	196	11	0
chr17	74729778	74729778	A	G	UTR3	METTL23	NM_001080510:c.*10A>G,NM_001206984:c.*10A>G,NM_001206983:c.*10A>G,NM_001206985:c.*10A>G,NM_001206986:c.*10A>G,NM_001206987:c.*10A>G,NM_001302703:c.*10A>G,NM_001302704:c.*10A>G,NM_001302705:c.*10A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	3	2	0
chr17	74732507	74732507	A	G	exonic	SRSF2	NaN	synonymous SNV	SRSF2:NM_001195427:exon2:c.T402C:p.S134S,SRSF2:NM_003016:exon2:c.T402C:p.S134S	rs237058	NaN	0.990615	0.56	T	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	-0.962	T	0.000	T	.	1.816	12.03	-0.491	-0.179	2.679	11.120	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.526406	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	0	17	54
chr17	74732953	74732953	T	T	exonic	SRSF2	NaN	synonymous SNV	SRSF2:NM_001195427:exon1:c.A290A:p.D97D,SRSF2:NM_003016:exon1:c.A290A:p.D97D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	74733403	74733403	G	A	UTR5	SRSF2	NM_003016:c.-161C>T,NM_001195427:c.-161C>T	NaN	NaN	rs3744061	NaN	0.359026	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.123789	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	9	15	40
chr17	7474281	7474281	G	T	ncRNA_intronic	SENP3-EIF4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7474283	7474283	T	G	ncRNA_intronic	SENP3-EIF4A1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7477477	7477477	A	G	ncRNA_intronic	SENP3-EIF4A1	NaN	NaN	NaN	rs4968214	NaN	0.578075	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	132	107	25	55
chr17	7481833	7481833	AGGG	ACGG,AGCT,AGG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	483.754	0	NaN	NA	NA	54	0	3	10
chr17	7489151	7489151	G	T	intronic	MPDU1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.888322	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	143	130	13	0
chr17	74900249	74900249	G	A	intronic	MGAT5B	NaN	NaN	NaN	rs628830	NaN	0.141174	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.61074	0	NaN	NA	NA	18	15	3	9
chr17	74900300	74900300	C	T	intronic	MGAT5B	NaN	NaN	NaN	rs537905	NaN	0.146565	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	459.655	0	NaN	NA	NA	155	68	87	9
chr17	74900492	74900492	C	T	exonic	MGAT5B	NaN	synonymous SNV	MGAT5B:NM_198955:exon5:c.C711T:p.L237L,MGAT5B:NM_001199172:exon6:c.C678T:p.L226L,MGAT5B:NM_144677:exon6:c.C678T:p.L226L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.397593	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	64	57	7	0
chr17	7490255	7490255	G	C	exonic	MPDU1	NaN	nonsynonymous SNV	MPDU1:NM_004870:exon5:c.G427C:p.V143L	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.002	B	0.002	B	0.223	N	1.000	N	0.845	L	-0.74	T	-1.025	T	0.149	T	0.365	0.257	5.390	-3.51	-0.309	-0.510	0.788	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	21	15	6	0
chr17	7490257	7490257	G	C	exonic	MPDU1	NaN	synonymous SNV	MPDU1:NM_004870:exon5:c.G429C:p.V143V	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.0	B	0.0	B	.	.	0.992	N	.	.	-2.71	D	-0.691	T	0.426	T	.	1.607	11.33	-7.03	-1.052	-0.735	3.241	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	21	14	6	0
chr17	7490258	7490258	C	G	exonic	MPDU1	NaN	nonsynonymous SNV	MPDU1:NM_004870:exon5:c.C430G:p.L144V	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.979	D	0.628	P	0.000	D	1.000	N	2.595	M	-1.11	T	-0.309	T	0.490	T	0.546	1.754	11.82	4.52	2.873	0.765	10.369	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	21	15	6	0
chr17	7490367	7490367	T	T	intronic	MPDU1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	30	25	0	0
chr17	74905818	74905818	T	T	intronic	MGAT5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	7490810	7490810	G	A	exonic	MPDU1	NaN	nonsynonymous SNV	MPDU1:NM_004870:exon7:c.G685A:p.A229T	rs10852891	NaN	0.15615	0.2	T	0.602	P	0.043	B	.	.	0.000	P	1.975	M	-0.91	T	-1.090	T	0.000	T	0.067	2.885	15.61	2.12	0.827	0.870	5.550	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	79	NaN	NA	NA	97	80	17	18
chr17	7492547	7492547	G	C	exonic	SOX15	NaN	nonsynonymous SNV	SOX15:NM_006942:exon1:c.C448G:p.P150A	NaN	NaN	NaN	0.43	T	0.003	B	0.005	B	0.020	N	1.000	N	0.895	L	-3.78	D	-0.402	T	0.600	D	0.167	2.803	15.33	-2.57	0.005	1.149	1.946	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.124087	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	235	220	15	0
chr17	74928931	74928931	C	T	intronic	MGAT5B	NaN	NaN	NaN	rs8078608	NaN	0.466853	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	266.475402	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	95	2	93	43
chr17	7496358	7496358	C	T	exonic	FXR2	NaN	nonsynonymous SNV	FXR2:NM_004860:exon13:c.G1472A:p.G491E	NaN	NaN	NaN	0.4	T	1.0	D	0.999	D	0.003	N	1.000	D	1.975	M	0.96	T	-0.859	T	0.222	T	0.812	1.762	11.85	4.86	2.688	4.939	15.867	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.390114	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	48	42	6	0
chr17	7496973	7496973	A	G	intronic	FXR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	74989576	74989576	C	T	intergenic	MGAT5B,SEC14L1	dist=43105;dist=95149	NaN	NaN	rs11655206	NaN	0.245008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	74989614	74989614	C	T	intergenic	MGAT5B,SEC14L1	dist=43143;dist=95111	NaN	NaN	rs11655214	NaN	0.884784	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	7504858	7504858	G	A	intronic	FXR2	NaN	NaN	NaN	rs17643401	NaN	0.150359	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	152	NaN	NA	NA	247	212	35	24
chr17	7506179	7506179	A	G	intronic	FXR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.619342	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	578	552	26	0
chr17	7506994	7506994	T	T	intronic	FXR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	75160319	75160319	C	A	intronic	SEC14L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	75189439	75189439	G	A	intronic	SEC14L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	75190687	75190687	A	G	intronic	SEC14L1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.996989	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	159	147	12	0
chr17	75212740	75212740	A	T	UTR3	SEC14L1	NM_001204408:c.*94A>T,NM_001204410:c.*2635A>T,NM_001143999:c.*2635A>T,NM_001143998:c.*2635A>T,NM_003003:c.*2635A>T,NM_001039573:c.*94A>T,NM_001144001:c.*2635A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	5	0	3	0
chr17	75212742	75212742	G	C	UTR3	SEC14L1	NM_001204408:c.*96G>C,NM_001204410:c.*2637G>C,NM_001143999:c.*2637G>C,NM_001143998:c.*2637G>C,NM_003003:c.*2637G>C,NM_001039573:c.*96G>C,NM_001144001:c.*2637G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	75267149	75267149	G	T	intergenic	SEC14L1,SEPT9	dist=53968;dist=10343	NaN	NaN	rs12451573	NaN	0.0802716	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	7529902	7529902	G	A	exonic	SAT2	NaN	nonsynonymous SNV	SAT2:NM_133491:exon6:c.C376T:p.R126C	rs13894	NaN	0.076278	0	D	1.0	D	0.984	D	0.000	D	0.000	P	1.57	L	0.91	T	-0.891	T	0.015	T	0.418	4.134	21.3	4.23	1.419	1.850	9.666	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	71	NaN	NA	NA	192	151	41	15
chr17	7529974	7529974	G	A	intronic	SAT2,SHBG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.923878	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	168	157	11	0
chr17	7530824	7530824	C	T	intronic	SAT2,SHBG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.897351	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	20	16	4	0
chr17	7533901	7533901	C	T	intronic	SHBG	NaN	NaN	NaN	rs9913778	NaN	0.113618	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	80	NaN	NA	NA	372	325	47	15
chr17	75422581	75422581	C	T	intronic	SEPT9	NaN	NaN	NaN	rs312891	NaN	0.229433	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr17	75440368	75440368	T	A	intronic	SEPT9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	75483717	75483717	A	G	intronic	SEPT9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.3956043956043974	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr17	75483730	75483730	A	G	intronic	SEPT9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	445.427	0	NaN	NA	NA	29	2	27	0
chr17	75485875	75485875	G	A	intronic	SEPT9	NaN	NaN	NaN	rs406147	NaN	0.280551	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	75493370	75493370	T	T	intronic	SEPT9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	75493518	75493518	A	A	intronic	SEPT9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	38	33	0	0
chr17	75494705	75494705	A	G	exonic	SEPT9	NaN	nonsynonymous SNV	SEPT9:NM_001113495:exon10:c.A1390G:p.M464V,SEPT9:NM_001113496:exon10:c.A973G:p.M325V,SEPT9:NM_001293696:exon10:c.A1054G:p.M352V,SEPT9:NM_001293697:exon10:c.A973G:p.M325V,SEPT9:NM_001293698:exon10:c.A973G:p.M325V,SEPT9:NM_001113493:exon11:c.A1705G:p.M569V,SEPT9:NM_001113494:exon11:c.A1234G:p.M412V,SEPT9:NM_001293695:exon11:c.A1669G:p.M557V,SEPT9:NM_006640:exon11:c.A1672G:p.M558V,SEPT9:NM_001113491:exon12:c.A1726G:p.M576V,SEPT9:NM_001113492:exon12:c.A1234G:p.M412V	rs2627223	NaN	0.90655	1	T	0.001	B	0.0	B	0.337	N	1.000	P	-1.78	N	1.55	T	-0.966	T	0.000	T	0.02	-1.537	0.016	2.77	0.113	0.038	6.896	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	58.277153	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	0	20	53
chr17	75504519	75504519	G	T	intergenic	SEPT9,LOC100507351	dist=7841;dist=38504	NaN	NaN	rs112758424	NaN	0.00858626	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	75504521	75504521	G	T	intergenic	SEPT9,LOC100507351	dist=7843;dist=38502	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	75504524	75504524	G	A	intergenic	SEPT9,LOC100507351	dist=7846;dist=38499	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7557419	7557419	A	G	exonic	ATP1B2	NaN	synonymous SNV	ATP1B2:NM_001303263:exon3:c.A150G:p.G50G,ATP1B2:NM_001678:exon4:c.A396G:p.G132G	rs1642763	NaN	0.789936	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	148	NaN	NA	NA	284	240	44	56
chr17	7559037	7559037	C	T	intronic	ATP1B2	NaN	NaN	NaN	rs55831773	NaN	0.169329	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	171	NaN	NA	NA	109	100	9	19
chr17	75722678	75722678	C	G	ncRNA_intronic	LOC100132174	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	13	8	5	0
chr17	75722679	75722679	A	C	ncRNA_intronic	LOC100132174	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr17	7577120	7577120	C	T	exonic	TP53	NaN	nonsynonymous SNV	TP53:NM_001126115:exon4:c.G422A:p.R141H,TP53:NM_001126116:exon4:c.G422A:p.R141H,TP53:NM_001126117:exon4:c.G422A:p.R141H,TP53:NM_001276697:exon4:c.G341A:p.R114H,TP53:NM_001276698:exon4:c.G341A:p.R114H,TP53:NM_001276699:exon4:c.G341A:p.R114H,TP53:NM_001126118:exon7:c.G701A:p.R234H,TP53:NM_000546:exon8:c.G818A:p.R273H,TP53:NM_001126112:exon8:c.G818A:p.R273H,TP53:NM_001126113:exon8:c.G818A:p.R273H,TP53:NM_001126114:exon8:c.G818A:p.R273H,TP53:NM_001276695:exon8:c.G701A:p.R234H,TP53:NM_001276696:exon8:c.G701A:p.R234H,TP53:NM_001276760:exon8:c.G701A:p.R234H,TP53:NM_001276761:exon8:c.G701A:p.R234H	rs28934576	ID=COSM1645335,COSM10660,COSM99729;OCCURENCE=1(vulva),49(ovary),4(bone),61(breast),1(NS),4(penis),22(stomach),25(haematopoietic_and_lymphoid_tissue),1(soft_tissue),19(urinary_tract),16(pancreas),4(liver),2(genital_tract),28(oesophagus),8(skin),40(lung),1(cervix),43(upper_aerodigestive_tract),1(thymus),133(large_intestine),38(central_nervous_system),5(biliary_tract),1(fallopian_tube),8(endometrium)	0.000199681	0.01	D	1.0	D	0.989	D	0.000	D	1.000	A	2.455	M	-7.32	D	0.939	D	0.992	D	0.97	3.533	18.03	4.92	2.556	7.587	15.662	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	5.431219874000753E-17	Somatic	421.052	168	169.926183		KEEP	94	30	64	0
chr17	7577407	7577407	A	C	intronic	TP53	NaN	NaN	NaN	rs12951053	NaN	0.178315	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.779205	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	25	9	10
chr17	7579801	7579801	G	C	UTR5	TP53	NM_001126118:c.-232C>G	NaN	NaN	rs1642785	NaN	0.584864	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.249004	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	2	4	40
chr17	75843737	75843737	T	C	intergenic	LOC100132174,FLJ45079	dist=119096;dist=31346	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	75843738	75843738	C	A	intergenic	LOC100132174,FLJ45079	dist=119097;dist=31345	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7592560	7592560	C	T	exonic	WRAP53	NaN	synonymous SNV	WRAP53:NM_018081:exon2:c.C450T:p.F150F,WRAP53:NM_001143990:exon3:c.C450T:p.F150F,WRAP53:NM_001143991:exon3:c.C450T:p.F150F,WRAP53:NM_001143992:exon3:c.C450T:p.F150F	rs2287498	ID=COSM148182;OCCURENCE=1(stomach)	0.222244	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	112	NaN	NA	NA	139	125	14	10
chr17	7592780	7592780	G	A	intronic	WRAP53	NaN	NaN	NaN	rs2287497	NaN	0.335264	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.390113	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	69	55	14	12
chr17	76009139	76009139	T	A	intronic	TNRC6C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	76009141	76009141	A	T	intronic	TNRC6C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7605015	7605015	A	A	exonic	WRAP53	NaN	synonymous SNV	WRAP53:NM_018081:exon6:c.A863A:p.D288D,WRAP53:NM_001143990:exon7:c.A863A:p.D288D,WRAP53:NM_001143991:exon7:c.A863A:p.D288D,WRAP53:NM_001143992:exon7:c.A863A:p.D288D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	73	61	0	0
chr17	7605941	7605941	TA	AC,AG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	163.877	0	NaN	NA	NA	49	18	2	2
chr17	7606722	7606722	C	G	exonic	WRAP53	NaN	nonsynonymous SNV	WRAP53:NM_018081:exon10:c.C1565G:p.A522G,WRAP53:NM_001143990:exon11:c.C1565G:p.A522G,WRAP53:NM_001143991:exon11:c.C1565G:p.A522G,WRAP53:NM_001143992:exon11:c.C1565G:p.A522G	rs7640	ID=COSM148183;OCCURENCE=1(stomach)	0.511182	1	T	0.0	B	0.0	B	0.886	N	1.000	P	-0.885	N	0.76	T	-0.993	T	0.000	T	0.093	-1.279	0.042	-6.63	-1.379	-1.904	8.558	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	63	NaN	NA	NA	152	120	16	20
chr17	76087497	76087497	T	T	intronic	TNRC6C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	24	21	0	0
chr17	76089888	76089888	A	G	intronic	TNRC6C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	11	5	5	0
chr17	76114963	76114963	C	G	intronic	TMC6	NaN	NaN	NaN	rs2748430	NaN	0.607628	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.044029	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	2	7	19
chr17	76114975	76114975	G	T	intronic	TMC6	NaN	NaN	NaN	rs2748429	NaN	0.60603	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	57.075	0	16.70651	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	1	7	15
chr17	76115353	76115353	T	C	intronic	TMC6	NaN	NaN	NaN	rs2748428	NaN	0.758786	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	98.116447	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	116	71	45	46
chr17	76116811	76116811	G	T	exonic	TMC6	NaN	synonymous SNV	TMC6:NM_001127198:exon13:c.C1638A:p.G546G,TMC6:NM_007267:exon13:c.C1638A:p.G546G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.308559	clustered_read_position,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	58	53	5	0
chr17	7611978	7611978	A	A	exonic	EFNB3	NaN	synonymous SNV	EFNB3:NM_001406:exon4:c.A534A:p.R178R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	139	107	0	0
chr17	76121254	76121254	T	C	exonic	TMC6	NaN	nonsynonymous SNV	TMC6:NM_001127198:exon6:c.A521G:p.E174G,TMC6:NM_007267:exon6:c.A521G:p.E174G	NaN	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.998	D	0.049	N	1.000	D	1.735	L	-0.07	T	-0.707	T	0.414	T	0.516	4.312	22.6	3.27	1.246	4.485	10.106	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.01224	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	173	167	6	0
chr17	76122064	76122064	A	A	intronic	TMC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	76122774	76122774	T	G	intronic	TMC6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.21503759398496136	Somatic	9.2463	0	NaN	NA	NA	13	10	3	0
chr17	76134380	76134380	G	T	intronic	TMC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.448913	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	315	291	24	0
chr17	76134685	76134685	C	A	exonic	TMC8	NaN	nonsynonymous SNV	TMC8:NM_152468:exon14:c.C1695A:p.F565L	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.985	D	0.000	D	0.749	D	2.79	M	-2.75	D	0.697	D	0.811	D	0.783	2.046	12.80	1.54	0.140	0.228	7.124	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.718137	nearby_gap_events	REJECT	55	48	7	0
chr17	76134686	76134686	A	G	exonic	TMC8	NaN	nonsynonymous SNV	TMC8:NM_152468:exon14:c.A1696G:p.T566A	NaN	NaN	NaN	0.17	T	0.002	B	0.001	B	0.948	N	1.000	N	0.22	N	-0.84	T	-0.993	T	0.138	T	0.076	-0.306	2.540	-9.34	-2.488	-2.396	3.561	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.503349	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	55	49	6	0
chr17	76136966	76136966	G	T	exonic	TMC8	NaN	stopgain	TMC8:NM_152468:exon16:c.G1954T:p.E652X	NaN	NaN	NaN	0.94	T	.	.	.	.	0.603	N	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	8.342	40	2.27	0.252	2.284	6.986	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.018457	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	81	67	14	0
chr17	76136967	76136967	A	C	exonic	TMC8	NaN	nonsynonymous SNV	TMC8:NM_152468:exon16:c.A1955C:p.E652A	NaN	NaN	NaN	0.73	T	0.028	B	0.004	B	0.603	N	1.000	N	0.865	L	-1.01	T	-0.964	T	0.214	T	0.164	2.494	14.30	1.7	0.358	0.845	3.906	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.198325	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	80	66	14	0
chr17	76143064	76143064	G	A	intronic	C17orf99	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.280642	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	84	74	10	0
chr17	76161271	76161271	T	T	intronic	C17orf99	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	76162031	76162031	G	GGC	exonic	C17orf99	NaN	frameshift substitution	C17orf99:NM_001163075:exon5:c.702_702delinsGGC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.08867	0	NaN	NA	NA	14	11	2	0
chr17	76198754	76198754	T	C	intronic	AFMID	NaN	NaN	NaN	rs35822441	NaN	0.754992	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.478287	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	8	9	47
chr17	76221462	76221462	C	C	UTR3	BIRC5	NM_001168:c.*1827C>C,NM_001012271:c.*1827C>C,NM_001012270:c.*1724C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	76230631	76230631	C	T	intronic	TMEM235	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.872191	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	99	92	7	0
chr17	76235756	76235756	T	T	intronic	TMEM235	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	76235991	76235991	A	A	UTR3	TMEM235	NM_001204212:c.*118A>A,NM_001204211:c.*118A>A,NM_001204210:c.*118A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	76259919	76259919	G	A	ncRNA_exonic	LOC100996291	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr17	7630505	7630505	T	C	exonic	DNAH2	NaN	synonymous SNV	DNAH2:NM_001303270:exon4:c.T294C:p.H98H,DNAH2:NM_020877:exon4:c.T294C:p.H98H	rs11867551	NaN	0.086262	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	84	12	72	15
chr17	76319206	76319206	G	G	intergenic	LOC100996291,SOCS3	dist=44633;dist=33652	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	76319213	76319213	C	C	intergenic	LOC100996291,SOCS3	dist=44640;dist=33645	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	76395421	76395421	G	A	intronic	PGS1	NaN	NaN	NaN	rs2292643	NaN	0.581669	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	348.72096	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	124	0	124	48
chr17	76395753	76395753	G	A	intronic	PGS1	NaN	NaN	NaN	rs12450528	NaN	0.582069	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	533.783955	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	172	0	172	48
chr17	76396610	76396610	G	A	intronic	PGS1	NaN	NaN	NaN	rs2292640	NaN	0.584465	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	97.298665	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	0	32	39
chr17	76396897	76396897	A	G	exonic	PGS1	NaN	nonsynonymous SNV	PGS1:NM_024419:exon6:c.A841G:p.T281A	NaN	NaN	NaN	0.26	T	0.001	B	0.003	B	0.000	D	1.000	D	1.355	L	.	.	-0.883	T	0.190	T	0.237	2.980	15.94	5.34	2.151	2.904	15.631	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.802582	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	55	49	6	0
chr17	76400268	76400268	C	G	intronic	PGS1	NaN	NaN	NaN	rs3826323	NaN	0.573882	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	390.695649	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	131	0	131	46
chr17	76424575	76424575	T	T	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	14	11	0	0
chr17	76425116	76425116	T	A	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	76425524	76425524	A	A	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	76441608	76441608	A	G	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.750408	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	102	97	5	0
chr17	76446609	76446609	A	G	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.822096	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	37	34	3	0
chr17	76456017	76456017	C	G	exonic	DNAH17	NaN	nonsynonymous SNV	DNAH17:NM_173628:exon60:c.G9502C:p.V3168L	rs34438166	NaN	0.0309505	0	D	0.986	D	0.955	D	0.040	N	0.999	D	3.135	M	-1.27	T	-0.400	T	0.090	T	0.393	3.709	18.84	4.89	2.243	7.275	17.662	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	85	NaN	NA	NA	469	319	150	14
chr17	76456144	76456144	C	G	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.449921	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	651	630	21	0
chr17	76456146	76456146	A	G	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	25	6	18	1
chr17	76471926	76471926	A	G	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.505871	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	447	418	29	0
chr17	76472921	76472921	A	G	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	31	7	23	0
chr17	76475508	76475508	T	G	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	76487371	76487371	T	T	ncRNA_intronic	DNAH17-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr17	76491212	76491212	C	A	ncRNA_intronic	DNAH17-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.565781	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	409	367	42	0
chr17	76496311	76496311	C	A	ncRNA_exonic	DNAH17-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr17	76496312	76496312	T	G	ncRNA_exonic	DNAH17-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	8	0	8	0
chr17	76496313	76496313	C	A	ncRNA_exonic	DNAH17-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	8	0	8	0
chr17	76497741	76497741	G	T	ncRNA_exonic	DNAH17-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr17	76497742	76497742	G	T	ncRNA_exonic	DNAH17-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	2	3	0
chr17	76498844	76498844	A	G	ncRNA_exonic	DNAH17-AS1	NaN	NaN	NaN	rs7218164	NaN	0.256989	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	60.341856	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	0	21	19
chr17	76503920	76503920	G	G	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	76503921	76503921	C	A	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr17	76506405	76506405	T	T	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	76521358	76521358	A	A	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	76557587	76557587	G	A	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	0	8	0
chr17	76565341	76565341	G	A	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	rs72920970	NaN	0.285942	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	451.099	0	NaN	NA	NA	180	91	89	35
chr17	76566057	76566057	A	T	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	76567015	76567015	C	G	intronic	DNAH17	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7662218	7662218	A	G	exonic	DNAH2	NaN	nonsynonymous SNV	DNAH2:NM_020877:exon15:c.A2224G:p.N742D	NaN	NaN	NaN	0.78	T	0.0	B	0.001	B	0.020	N	1.000	D	-0.77	N	1.91	T	-1.016	T	0.021	T	0.102	-0.005	3.990	5.69	2.168	2.966	9.443	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.441875		KEEP	41	37	4	0
chr17	7668901	7668901	T	C	intronic	DNAH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.048331	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	279	273	6	0
chr17	7668915	7668915	A	C	intronic	DNAH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	767145	767145	T	C	intronic	NXN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr17	767147	767147	A	C	intronic	NXN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr17	767150	767150	T	C	intronic	NXN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr17	7671650	7671650	C	T	intronic	DNAH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.233454	clustered_read_position	REJECT	116	110	6	0
chr17	76745003	76745003	A	T	intronic	CYTH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	76745004	76745004	G	C	intronic	CYTH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	76745005	76745005	C	T	intronic	CYTH1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7674850	7674850	C	T	intronic	DNAH2	NaN	NaN	NaN	rs7212989	NaN	0.468051	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	188	152	36	52
chr17	76798548	76798548	TTTTTTCTTTTTCT	TTTCTTTTTTTTCT,TTTTTTC,TTTTTTCT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	303.721	0	NaN	NA	NA	108	43	4	0
chr17	76808883	76808883	G	A	intronic	USP36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr17	76810677	76810677	A	G	intronic	USP36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	13	7	5	0
chr17	7681354	7681354	T	G	intronic	DNAH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	76818217	76818217	A	A	intronic	USP36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	76821986	76821986	G	C	intronic	USP36	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7682823	7682823	C	T	intronic	DNAH2	NaN	NaN	NaN	rs140710110	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.215489	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	568	558	10	0
chr17	76851638	76851638	T	T	UTR3	TIMP2	NM_003255:c.*111A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	76866924	76866924	T	T	intronic	TIMP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	0	0
chr17	76887032	76887032	T	A	exonic	KIAA1731NL	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA1731NL:NM_001243540:exon3:c.A1554T:p.E518D,KIAA1731NL:NM_001243541:exon3:c.A1380T:p.E460D	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.089	B	0.035	B	0.833	N	1.000	N	.	.	1.75	T	-1.023	T	0.036	T	0.18	1.431	10.72	-8.06	-3.111	-4.941	12.412	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.435311	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	311	284	27	0
chr17	76888051	76888051	T	C	exonic	KIAA1731NL	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA1731NL:NM_001243540:exon3:c.A535G:p.S179G,KIAA1731NL:NM_001243541:exon3:c.A361G:p.S121G	NaN	NaN	NaN	1	T	0.035	B	0.035	B	0.859	N	1.000	N	.	.	1.88	T	-0.986	T	0.022	T	0.031	0.147	4.790	-2.63	-0.619	-0.820	5.683	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.416212	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	150	145	5	0
chr17	76893864	76893864	A	G	intronic	KIAA1731NL,TIMP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	76893865	76893865	C	G	intronic	KIAA1731NL,TIMP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	76895300	76895300	T	G	intronic	KIAA1731NL,TIMP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	76993511	76993511	G	C	exonic	CANT1	NaN	nonsynonymous SNV	CANT1:NM_138793:exon2:c.C194G:p.A65G,CANT1:NM_001159773:exon3:c.C194G:p.A65G,CANT1:NM_001159772:exon4:c.C194G:p.A65G	NaN	NaN	NaN	0.47	T	0.0	B	0.0	B	0.504	N	1.000	N	-0.69	N	-2.1	D	-0.853	T	0.356	T	0.129	-0.045	3.786	1.74	0.116	3.730	15.940	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5638	0	NaN	NA	NA	6	4	2	0
chr17	76993546	76993546	A	G	exonic	CANT1	NaN	synonymous SNV	CANT1:NM_138793:exon2:c.T159C:p.A53A,CANT1:NM_001159773:exon3:c.T159C:p.A53A,CANT1:NM_001159772:exon4:c.T159C:p.A53A	rs8077024	NaN	0.44349	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	21.6008	0	9.284066	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	6	4	14
chr17	7700478	7700478	T	C	intronic	DNAH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	7702357	7702357	C	T	intronic	DNAH2	NaN	NaN	NaN	rs12949280	NaN	0.729433	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	153.496	0	NaN	NA	NA	51	0	51	16
chr17	77075639	77075639	T	C	exonic	ENGASE	NaN	nonsynonymous SNV	ENGASE:NM_001042573:exon4:c.T485C:p.V162A	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.994	D	0.947	D	0.000	D	1.000	D	2.915	M	.	.	-0.025	T	0.458	T	0.839	4.072	20.9	5.22	2.091	5.620	13.955	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.39619	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	334	328	6	0
chr17	77080076	77080076	A	A	intronic	ENGASE	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	77096683	77096683	A	C	intronic	RBFOX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	77102776	77102776	A	G	exonic	RBFOX3	NaN	nonsynonymous SNV	RBFOX3:NM_001082575:exon6:c.T317C:p.I106T	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	3.35	M	-1.08	T	0.578	D	0.686	D	0.968	2.407	14.01	4.13	1.861	8.560	13.261	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.621796	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	107	99	8	0
chr17	7710500	7710500	T	C	exonic	DNAH2	NaN	nonsynonymous SNV	DNAH2:NM_020877:exon62:c.T9475C:p.F3159L	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.99	D	0.941	D	0.000	D	1.000	D	2.585	M	-1.14	T	0.343	D	0.623	D	0.703	4.934	28.6	5.18	2.099	6.926	14.342	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.819174	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	155	149	6	0
chr17	7710736	7710736	G	T	intronic	DNAH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.37935	0	NaN	NA	NA	20	17	3	0
chr17	77111698	77111698	A	A	exonic	RBFOX3	NaN	synonymous SNV	RBFOX3:NM_001082575:exon5:c.T100T:p.S34S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr17	77111732	77111732	G	A	exonic	RBFOX3	NaN	synonymous SNV	RBFOX3:NM_001082575:exon5:c.C66T:p.Y22Y	rs80198744	NaN	0.188498	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	55.2344	0	17.920278	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	2	7	9
chr17	77139999	77139999	A	A	intronic	RBFOX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	77146012	77146012	A	T	intronic	RBFOX3	NaN	NaN	NaN	rs12946325	NaN	0.63758	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	5	9	0
chr17	77148580	77148580	G	G	intronic	RBFOX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	77171485	77171485	C	C	intronic	RBFOX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	15	13	0	0
chr17	7735063	7735063	T	G	exonic	DNAH2	NaN	nonsynonymous SNV	DNAH2:NM_020877:exon82:c.T12696G:p.F4232L	rs57985356	NaN	0.150759	.	.	0.003	B	0.01	B	0.000	D	0.000	P	0.855	L	3.15	T	-0.913	T	0.000	T	0.249	1.225	9.971	4.27	1.038	2.018	9.719	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	303	235	68	10
chr17	77361953	77361953	C	C	intronic	RBFOX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	77381431	77381431	C	A	intronic	RBFOX3	NaN	NaN	NaN	rs8070973	NaN	0.65016	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	7750474	7750474	A	AT	exonic	KDM6B	NaN	frameshift substitution	KDM6B:NM_001080424:exon10:c.961_961delinsAT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.15144	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr17	7751625	7751625	T	C	exonic	KDM6B	NaN	synonymous SNV	KDM6B:NM_001080424:exon11:c.T2019C:p.F673F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	19	11	8	0
chr17	7751851	7751851	G	C	exonic	KDM6B	NaN	nonsynonymous SNV	KDM6B:NM_001080424:exon11:c.G2245C:p.V749L	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.002	B	0.006	B	0.530	N	1.000	N	0	N	3.25	T	-0.932	T	0.013	T	0.064	-1.553	0.015	-4.27	-0.861	-0.033	10.987	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.6218	0	NaN	NA	NA	8	5	2	0
chr17	7751854	7751854	G	T	exonic	KDM6B	NaN	nonsynonymous SNV	KDM6B:NM_001080424:exon11:c.G2248T:p.A750S	NaN	NaN	NaN	0.86	T	0.021	B	0.027	B	0.649	U	1.000	N	0	N	3.13	T	-0.916	T	0.010	T	0.158	-1.511	0.017	-3.81	-0.832	-0.727	10.498	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr17	7751855	7751855	C	T	exonic	KDM6B	NaN	nonsynonymous SNV	KDM6B:NM_001080424:exon11:c.C2249T:p.A750V	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.002	B	0.002	B	0.649	U	1.000	N	0	N	3.07	T	-1.012	T	0.013	T	0.23	-1.079	0.164	3.01	1.999	1.221	7.966	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr17	7753503	7753503	T	G	intronic	KDM6B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.540583	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	241	225	16	0
chr17	7756070	7756070	A	A	intronic	KDM6B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	7760704	7760704	A	G	exonic	NAA38	NaN	nonsynonymous SNV	NAA38:NM_032356:exon1:c.T38C:p.L13P	rs8522	NaN	0.436302	0.64	T	0.0	B	0.0	B	0.030	N	0.000	P	.	.	0.46	T	-0.992	T	0.000	T	0.024	-0.741	0.844	-5.02	-0.670	-0.339	3.836	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	19	15	4	18
chr17	77653775	77653775	A	C	intergenic	RBFOX3,MIR4739	dist=141545;dist=27210	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	77753245	77753245	C	CTG	intronic	CBX2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.263179	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	20.5696	0	NaN	NA	NA	17	11	5	9
chr17	77768750	77768750	A	C	exonic	CBX8	NaN	nonsynonymous SNV	CBX8:NM_020649:exon5:c.T854G:p.I285R	NaN	NaN	NaN	0.57	T	0.037	B	0.003	B	0.755	N	0.995	D	0.69	N	0.9	T	-1.035	T	0.061	T	0.266	1.712	11.68	4.34	1.967	1.752	4.923	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.822454	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	5	1	4	0
chr17	77768755	77768755	C	T	exonic	CBX8	NaN	synonymous SNV	CBX8:NM_020649:exon5:c.G849A:p.R283R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.353905	clustered_read_position,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	4	1	3	0
chr17	77768811	77768811	T	C	exonic	CBX8	NaN	nonsynonymous SNV	CBX8:NM_020649:exon5:c.A793G:p.S265G	NaN	NaN	NaN	0.51	T	0.0	B	0.001	B	0.124	N	0.952	N	-0.115	N	0.96	T	-1.032	T	0.044	T	0.071	0.270	5.460	3.23	0.790	1.769	6.956	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	33	9.027222	clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr17	77768813	77768813	G	A	exonic	CBX8	NaN	nonsynonymous SNV	CBX8:NM_020649:exon5:c.C791T:p.T264I	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.055	B	0.009	B	0.202	N	0.838	N	0.69	N	0.89	T	-1.043	T	0.068	T	0.045	1.174	9.776	3.34	1.152	2.894	9.735	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	32	8.926997	clustered_read_position	REJECT	3	0	3	0
chr17	77769301	77769301	G	T	exonic	CBX8	NaN	synonymous SNV	CBX8:NM_020649:exon5:c.C303A:p.G101G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.382432	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	55	48	7	0
chr17	77770639	77770639	A	G	intronic	CBX8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	77773874	77773874	C	A	intergenic	CBX8,CBX4	dist=2959;dist=33081	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	77808020	77808020	T	C	exonic	CBX4	NaN	nonsynonymous SNV	CBX4:NM_003655:exon5:c.A1421G:p.D474G	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.048	B	0.023	B	0.093	U	1.000	D	1.795	L	.	.	-0.898	T	0.257	T	0.586	2.952	15.84	3.83	1.378	4.957	11.184	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	18	12	6	0
chr17	77809285	77809285	C	A	intronic	CBX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.553021	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	42	39	3	0
chr17	77809382	77809382	G	A	intronic	CBX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.745121	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	54	45	9	0
chr17	77811524	77811524	G	A	intronic	CBX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr17	77811528	77811528	G	T	intronic	CBX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.774926	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	210	191	19	0
chr17	77889231	77889231	A	G	ncRNA_intronic	LOC101928766	NaN	NaN	NaN	rs1663190	NaN	0.75619	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	77914561	77914561	C	T	UTR3	TBC1D16	NM_019020:c.*97G>A,NM_001271844:c.*97G>A,NM_001271845:c.*97G>A	NaN	NaN	rs2241950	NaN	0.254193	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.50137	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	22
chr17	77922972	77922972	C	T	intronic	TBC1D16	NaN	NaN	NaN	rs66505868	NaN	0.259185	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	24	12	12	16
chr17	77924218	77924218	G	A	exonic	TBC1D16	NaN	synonymous SNV	TBC1D16:NM_001271844:exon2:c.C166T:p.L56L,TBC1D16:NM_001271845:exon2:c.C163T:p.L55L,TBC1D16:NM_001271846:exon2:c.C163T:p.L55L,TBC1D16:NM_019020:exon6:c.C1249T:p.L417L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr17	77924219	77924219	C	A	exonic	TBC1D16	NaN	nonsynonymous SNV	TBC1D16:NM_001271844:exon2:c.G165T:p.K55N,TBC1D16:NM_001271845:exon2:c.G162T:p.K54N,TBC1D16:NM_001271846:exon2:c.G162T:p.K54N,TBC1D16:NM_019020:exon6:c.G1248T:p.K416N	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.027	B	0.03	B	0.000	D	1.000	D	2.3	M	3.63	T	-1.037	T	0.018	T	0.183	1.605	11.32	2.59	0.320	1.328	8.851	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr17	77924220	77924220	T	A	exonic	TBC1D16	NaN	nonsynonymous SNV	TBC1D16:NM_001271844:exon2:c.A164T:p.K55M,TBC1D16:NM_001271845:exon2:c.A161T:p.K54M,TBC1D16:NM_001271846:exon2:c.A161T:p.K54M,TBC1D16:NM_019020:exon6:c.A1247T:p.K416M	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.731	P	0.438	B	0.000	D	1.000	D	2.85	M	3.55	T	-1.130	T	0.029	T	0.539	3.675	18.68	2.14	0.399	2.729	9.934	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr17	77924223	77924223	T	C	exonic	TBC1D16	NaN	nonsynonymous SNV	TBC1D16:NM_001271844:exon2:c.A161G:p.Y54C,TBC1D16:NM_001271845:exon2:c.A158G:p.Y53C,TBC1D16:NM_001271846:exon2:c.A158G:p.Y53C,TBC1D16:NM_019020:exon6:c.A1244G:p.Y415C	NaN	ID=COSM985417;OCCURENCE=1(endometrium)	NaN	0.17	T	0.997	D	0.912	D	0.000	D	1.000	D	1.61	L	3.64	T	-1.149	T	0.036	T	0.776	4.027	20.7	5.67	2.141	6.205	15.91	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr17	77924225	77924225	C	G	exonic	TBC1D16	NaN	nonsynonymous SNV	TBC1D16:NM_001271844:exon2:c.G159C:p.E53D,TBC1D16:NM_001271845:exon2:c.G156C:p.E52D,TBC1D16:NM_001271846:exon2:c.G156C:p.E52D,TBC1D16:NM_019020:exon6:c.G1242C:p.E414D	NaN	NaN	NaN	0.95	T	0.001	B	0.01	B	0.000	D	0.998	D	1.42	L	3.75	T	-0.956	T	0.010	T	0.362	1.263	10.12	1.04	0.239	0.415	6.478	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr17	77924228	77924228	C	T	exonic	TBC1D16	NaN	synonymous SNV	TBC1D16:NM_001271844:exon2:c.G156A:p.E52E,TBC1D16:NM_001271845:exon2:c.G153A:p.E51E,TBC1D16:NM_001271846:exon2:c.G153A:p.E51E,TBC1D16:NM_019020:exon6:c.G1239A:p.E413E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr17	77924229	77924229	T	C	exonic	TBC1D16	NaN	nonsynonymous SNV	TBC1D16:NM_001271844:exon2:c.A155G:p.E52G,TBC1D16:NM_001271845:exon2:c.A152G:p.E51G,TBC1D16:NM_001271846:exon2:c.A152G:p.E51G,TBC1D16:NM_019020:exon6:c.A1238G:p.E413G	NaN	NaN	NaN	0	D	0.014	B	0.013	B	0.000	D	1.000	D	1.075	L	3.68	T	-0.992	T	0.013	T	0.473	3.148	16.53	3.1	0.955	4.199	10.964	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr17	77925476	77925476	G	A	intronic	TBC1D16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	7794202	7794202	C	G	intronic	CHD3	NaN	NaN	NaN	rs12450454	NaN	0.720248	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	343	275	68	36
chr17	7798362	7798362	G	T	exonic	CHD3	NaN	nonsynonymous SNV	CHD3:NM_001005271:exon9:c.G1574T:p.G525V,CHD3:NM_001005273:exon9:c.G1397T:p.G466V,CHD3:NM_005852:exon9:c.G1397T:p.G466V	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.99	D	0.000	D	1.000	D	3.745	H	0.37	T	0.253	D	0.490	T	0.922	3.083	16.29	5.11	2.657	9.657	18.311	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	16.5281	0	16.817829	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	32	24	8	0
chr17	78014099	78014099	A	T	intronic	CCDC40	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	7801776	7801776	C	T	intronic	CHD3	NaN	NaN	NaN	rs58909711	NaN	0.192692	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	89	74	15	14
chr17	78087211	78087211	A	G	intronic	GAA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.142066	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	37	29	8	0
chr17	78092624	78092624	C	C	intronic	GAA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	166	146	0	0
chr17	7810585	7810585	C	T	intronic	CHD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.009593993325917809	NA	0	0	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr17	7811957	7811957	T	A	intronic	CHD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr17	78163498	78163498	T	T	intronic	CARD14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	78176023	78176023	T	G	exonic	CARD14	NaN	nonsynonymous SNV	CARD14:NM_001257970:exon15:c.T2023G:p.S675A,CARD14:NM_024110:exon15:c.T2023G:p.S675A	NaN	NaN	NaN	0.61	T	0.994	D	0.97	D	0.000	D	1.000	D	2.65	M	3.4	T	-1.032	T	0.056	T	0.705	3.498	17.88	4.88	1.831	5.222	13.464	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.51898	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	41	35	6	0
chr17	78176024	78176024	C	T	exonic	CARD14	NaN	nonsynonymous SNV	CARD14:NM_001257970:exon15:c.C2024T:p.S675L,CARD14:NM_024110:exon15:c.C2024T:p.S675L	NaN	NaN	NaN	0.52	T	1.0	D	0.992	D	0.000	D	1.000	D	1.61	L	3.43	T	-1.062	T	0.044	T	0.883	2.778	15.25	4.88	2.259	6.775	16.799	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.622473	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	41	35	6	0
chr17	78176025	78176025	G	C	exonic	CARD14	NaN	synonymous SNV	CARD14:NM_001257970:exon15:c.G2025C:p.S675S,CARD14:NM_024110:exon15:c.G2025C:p.S675S	NaN	NaN	NaN	0.07	T	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	2.21	T	-0.986	T	0.033	T	.	0.809	8.253	-9.77	-2.390	-0.949	7.297	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.03343108504398752	NA	0	0	8.135382	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	41	34	7	0
chr17	78180896	78180896	C	G	intronic	CARD14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.736274	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	98	88	10	0
chr17	78180897	78180897	T	C	intronic	CARD14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.672604	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	100	90	10	0
chr17	78180898	78180898	G	T	intronic	CARD14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.876953	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	93	83	10	0
chr17	78184942	78184942	A	A	intronic	SGSH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr17	78186090	78186090	A	A	intronic	SGSH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr17	78188256	78188256	C	T	intronic	SGSH	NaN	NaN	NaN	rs6565648	NaN	0.352636	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	100.689	0	NaN	NA	NA	53	31	22	17
chr17	78188971	78188971	C	G	intronic	SGSH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	30	19	11	0
chr17	78195748	78195748	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	10	0	4,5	0
chr17	78195749	78195749	C	T	intronic	SLC26A11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr17	78195750	78195750	C	T	intronic	SLC26A11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr17	78201554	78201554	T	C	intronic	SLC26A11	NaN	NaN	NaN	rs6565652	NaN	0.727835	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	158.866252	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	54	0	54	43
chr17	78215708	78215708	A	T	intronic	SLC26A11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	78215709	78215709	G	C	intronic	SLC26A11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	78215710	78215710	A	G	intronic	SLC26A11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr17	78265743	78265743	T	C	intronic	RNF213	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.687793	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	179	173	6	0
chr17	78268566	78268566	C	T	exonic	RNF213	NaN	nonsynonymous SNV	RNF213:NM_001256071:exon9:c.C1519T:p.L507F,RNF213:NM_020954:exon9:c.C1519T:p.L507F	NaN	NaN	NaN	0.41	T	0.009	B	0.003	B	0.011	N	0.997	N	0.665	N	.	.	-0.988	T	0.043	T	0.106	-1.017	0.236	-10.1	-6.851	-8.594	1.337	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.085421	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	148	144	4	0
chr17	78269246	78269246	T	T	intronic	RNF213	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr17	78280910	78280910	T	C	intronic	RNF213	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.417457	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	135	124	11	0
chr17	78282781	78282781	T	T	intronic	RNF213	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	78292903	78292903	T	A	intronic	RNF213	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	16	5	11	0
chr17	7829332	7829332	T	A	intronic	KCNAB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.111286	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	151	140	11	0
chr17	78301816	78301816	A	A	intronic	RNF213	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	7830610	7830610	G	A	intronic	KCNAB3	NaN	NaN	NaN	rs9908139	NaN	0.547923	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	58.148649	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	138	109	29	39
chr17	7831177	7831177	A	G	intronic	KCNAB3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr17	78312967	78312967	T	C	intronic	RNF213	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.270552	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	286	278	8	0
chr17	78313495	78313495	C	G	exonic	RNF213	NaN	nonsynonymous SNV	RNF213:NM_001256071:exon26:c.C5328G:p.D1776E	NaN	NaN	NaN	0.83	T	.	.	.	.	.	.	1.000	N	0.345	N	.	.	-1.024	T	0.044	T	0.085	1.482	10.90	1.73	0.672	-0.018	9.925	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.139391	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	176	163	13	1
chr17	78322103	78322103	A	C	intronic	RNF213	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr17	78323757	78323757	T	C	intronic	RNF213	NaN	NaN	NaN	rs7223115	ID=COSN165547;OCCURENCE=1(NS)	0.644169	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	120.547142	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	1	41	51
chr17	7832811	7832811	A	G	upstream;downstream	KCNAB3;TRAPPC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.99927	normal_lod	REJECT	8	4	4	0
chr17	78343439	78343439	T	C	exonic	RNF213	NaN	nonsynonymous SNV	RNF213:NM_001256071:exon45:c.T12293C:p.V4098A	NaN	NaN	NaN	0.15	T	0.99	D	0.896	P	0.000	D	1.000	N	2.015	M	1.86	T	-1.012	T	0.123	T	0.293	3.331	17.21	4.15	0.940	2.204	10.950	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	34	19	15	2
chr17	78350086	78350086	T	G	ncRNA_intronic	LOC100294362	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.02036	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	399	357	42	0
chr17	78353580	78353580	A	A	ncRNA_intronic	LOC100294362	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	78360378	78360378	T	T	ncRNA_intronic	LOC100294362	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	18	15	0	0
chr17	78360468	78360468	G	A	ncRNA_intronic	LOC100294362	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.822521	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	400	389	11	0
chr17	7837616	7837616	A	T	intronic	CNTROB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7837617	7837617	G	A	intronic	CNTROB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7837622	7837622	G	T	intronic	CNTROB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	78389597	78389597	G	T	exonic	ENDOV	NaN	synonymous SNV	ENDOV:NM_001164637:exon2:c.G204T:p.V68V,ENDOV:NM_001164638:exon2:c.G204T:p.V68V,ENDOV:NM_173627:exon2:c.G204T:p.V68V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	79.2721	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	105	64	41	1
chr17	78395877	78395877	A	A	intronic	ENDOV	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	78396091	78396091	C	G	intronic	ENDOV	NaN	NaN	NaN	rs9907097	NaN	0.458666	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	71.567	22	NaN	NA	NA	30	16	9	10
chr17	7843053	7843053	C	T	exonic	CNTROB	NaN	synonymous SNV	CNTROB:NM_001037144:exon8:c.C1150T:p.L384L,CNTROB:NM_053051:exon8:c.C1150T:p.L384L	rs11078719	NaN	0.594848	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	89	NaN	NA	NA	611	522	89	40
chr17	7843134	7843134	A	G	intronic	CNTROB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	15	5	10	0
chr17	78445168	78445168	G	C	intronic	NPTX1	NaN	NaN	NaN	rs11871688	NaN	0.41274	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	78445731	78445731	A	G	intronic	NPTX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.374163	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	166	162	4	0
chr17	78449106	78449106	A	C	intronic	NPTX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr17	78449108	78449108	G	A	intronic	NPTX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	11	5	6	0
chr17	78449211	78449211	G	A	intronic	NPTX1	NaN	NaN	NaN	rs74003912	NaN	0.115615	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	269.454	18	NaN	NA	NA	125	60	39	13
chr17	78449869	78449869	G	A	exonic	NPTX1	NaN	synonymous SNV	NPTX1:NM_002522:exon1:c.C378T:p.A126A	rs376150195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	8	3	0
chr17	78485712	78485712	T	G	intergenic	NPTX1,RPTOR	dist=35308;dist=32913	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	78485713	78485713	G	C	intergenic	NPTX1,RPTOR	dist=35309;dist=32912	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	7849087	7849087	C	G	exonic	CNTROB	NaN	synonymous SNV	CNTROB:NM_001037144:exon13:c.C1776G:p.P592P,CNTROB:NM_053051:exon13:c.C1776G:p.P592P	rs4462665	ID=COSM1387480;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.63099	0.32	T	.	.	.	.	0.213	N	0.285	P	.	.	0.87	T	-1.049	T	0.000	T	.	-1.016	0.238	-5.31	-1.742	-1.603	7.964	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	293	224	69	41
chr17	7852095	7852095	A	C	intronic	CNTROB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr17	7852528	7852528	C	T	intronic	CNTROB	NaN	NaN	NaN	rs7211792	NaN	0.630391	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	269	208	61	41
chr17	7852830	7852830	C	T	UTR3	CNTROB	NM_001037144:c.*2C>T,NM_053051:c.*2C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.39766081871345127	NA	0	0	NaN	NA	NA	17	13	4	0
chr17	78671351	78671351	G	A	intronic	RPTOR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr17	78794619	78794619	T	G	intronic	RPTOR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	78794620	78794620	C	A	intronic	RPTOR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	78850952	78850952	G	A	intronic	RPTOR	NaN	NaN	NaN	rs8068506	NaN	0.222045	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	1	6	0
chr17	78857242	78857242	T	C	exonic	RPTOR	NaN	synonymous SNV	RPTOR:NM_020761:exon15:c.T1608C:p.A536A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.238022	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	113	100	13	0
chr17	78858680	78858680	T	T	intronic	RPTOR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr17	78859004	78859004	C	T	intronic	RPTOR	NaN	NaN	NaN	rs2016817	NaN	0.25	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.77745	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	12	14	25
chr17	78866160	78866160	A	G	intronic	RPTOR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	38	10	28	0
chr17	78866703	78866703	A	A	intronic	RPTOR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	78868665	78868665	C	C	intronic	RPTOR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	78898600	78898600	C	G	intronic	RPTOR	NaN	NaN	NaN	rs908236	NaN	0.647165	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	78914270	78914270	T	T	intronic	RPTOR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	78922239	78922239	G	G	intronic	RPTOR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	78970352	78970352	T	C	intronic	CHMP6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr17	79059694	79059694	T	C	intronic	BAIAP2	NaN	NaN	NaN	rs56202200	NaN	0.267572	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	17	7	8	0
chr17	79060773	79060773	G	T	intronic	BAIAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	79060774	79060774	A	C	intronic	BAIAP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	79077957	79077957	T	C	intronic	BAIAP2	NaN	NaN	NaN	rs34057293	NaN	0.800319	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	76	NaN	NA	NA	164	42	122	52
chr17	79077980	79077980	A	C	intronic	BAIAP2	NaN	NaN	NaN	rs57792378	NaN	0.806709	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	132	33	99	52
chr17	79080706	79080706	A	C	exonic	BAIAP2	NaN	nonsynonymous SNV	BAIAP2:NM_001144888:exon12:c.A1499C:p.Q500P,BAIAP2:NM_006340:exon12:c.A1499C:p.Q500P,BAIAP2:NM_017450:exon12:c.A1499C:p.Q500P,BAIAP2:NM_017451:exon12:c.A1499C:p.Q500P	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.951	P	0.686	P	0.035	N	1.000	D	1.625	L	1.88	T	-0.973	T	0.129	T	0.863	1.367	10.50	4.78	1.811	8.326	13.354	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.719534	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	20	15	5	0
chr17	79093427	79093427	C	C	intronic	AATK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	37	33	0	0
chr17	79093475	79093475	CAT	GCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	120.824	0	NaN	NA	NA	22	5	17	8
chr17	79093478	79093478	GT	G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	120.258	0	NaN	NA	NA	22	5	17	5
chr17	79093488	79093488	C	A	intronic	AATK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	120.824	0	NaN	NA	NA	22	5	15	8
chr17	79093500	79093500	C	T	intronic	AATK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	120.821	0	NaN	NA	NA	19	3	16	8
chr17	79093503	79093503	A	G	intronic	AATK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	120.824	0	NaN	NA	NA	21	5	16	8
chr17	79093822	79093822	A	G	exonic	AATK	NaN	nonsynonymous SNV	AATK:NM_004920:exon11:c.T3488C:p.F1163S,AATK:NM_001080395:exon12:c.T3797C:p.F1266S	rs36000545	NaN	0.359824	0.55	T	0.001	B	0.001	B	0.512	N	1.000	P	1.1	L	2.95	T	-0.920	T	0.000	T	0.046	0.054	4.293	1.32	0.108	0.846	2.543	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	34.8085	21	10.356341	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	1	5	9
chr17	79094337	79094337	C	G	exonic	AATK	NaN	nonsynonymous SNV	AATK:NM_004920:exon10:c.G3090C:p.M1030I,AATK:NM_001080395:exon11:c.G3399C:p.M1133I	NaN	NaN	NaN	0.13	T	0.004	B	0.002	B	0.794	N	1.000	N	0.55	N	3.0	T	-1.019	T	0.040	T	0.057	1.068	9.360	-4.41	-1.142	-2.785	1.918	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	30	23	7	0
chr17	79094586	79094586	A	C	exonic	AATK	NaN	synonymous SNV	AATK:NM_004920:exon10:c.T2841G:p.S947S,AATK:NM_001080395:exon11:c.T3150G:p.S1050S	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-1.016	T	0.053	T	.	1.057	9.318	-0.009	0.007	-1.652	3.125	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.771597	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	18	14	4	0
chr17	79096641	79096641	G	C	intronic	AATK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.3956043956043974	NA	0	25	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr17	79096706	79096706	A	T	intronic	AATK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr17	79101275	79101275	T	T	intronic	AATK	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr17	7910510	7910510	G	A	intronic	GUCY2D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.983491	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	203	196	7	0
chr17	79110069	79110069	C	T	intronic	AATK	NaN	NaN	NaN	rs72855509	NaN	0.116214	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr17	79123134	79123134	C	T	intronic	AATK	NaN	NaN	NaN	rs4969406	NaN	0.411342	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	79123135	79123135	C	T	intronic	AATK	NaN	NaN	NaN	rs4969407	NaN	0.412141	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	7912979	7912979	A	A	intronic	GUCY2D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	79168602	79168602	T	C	intronic	CEP131	NaN	NaN	NaN	rs111490885	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.065273	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	468	461	7	0
chr17	79169768	79169768	A	A	intronic	CEP131	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	79170576	79170576	C	T	exonic	CEP131	NaN	synonymous SNV	CEP131:NM_001009811:exon15:c.G1824A:p.A608A,CEP131:NM_014984:exon15:c.G1824A:p.A608A	rs1542961	ID=COSM1480155,COSM437764;OCCURENCE=1(breast)	0.221246	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	96.252518	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	94	53	41	35
chr17	79172159	79172159	T	T	intronic	CEP131	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	79174103	79174103	G	A	intronic	CEP131	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.473337		KEEP	62	55	7	0
chr17	79181069	79181069	A	G	intronic	CEP131	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	79226579	79226579	A	A	intronic	SLC38A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr17	79287569	79287569	T	T	exonic	TMEM105	NaN	synonymous SNV	TMEM105:NM_178520:exon3:c.A272A:p.Q91Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	43	35	0	0
chr17	79297127	79297127	A	C	intronic	TMEM105	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	9	2	4	0
chr17	79321661	79321661	C	T	intergenic	TMEM105,LOC100130370	dist=17187;dist=28038	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	79409309	79409309	A	G	exonic	BAHCC1	NaN	unknown	UNKNOWN	rs12938890	NaN	1	0.8	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	P	0.205	N	2.77	T	-1.007	T	0.000	T	0.252	-1.279	0.043	-0.684	-0.596	-0.082	5.140	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.099285	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	45
chr17	79409434	79409434	A	G	exonic	BAHCC1	NaN	unknown	UNKNOWN	rs12939225	NaN	0.494609	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.398013	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	7	8	33
chr17	79410012	79410012	A	G	exonic	BAHCC1	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.999	D	0.997	D	.	.	0.999	D	1.1	L	2.29	T	-1.111	T	0.076	T	0.358	2.674	14.90	4.28	1.801	1.745	12.549	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.23018	clustered_read_position	REJECT	60	55	5	0
chr17	79410722	79410722	A	G	intronic	BAHCC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr17	79414788	79414788	A	C	exonic	BAHCC1	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	0.39	T	0.0	B	0.0	B	0.346	N	1.000	N	1.245	L	1.88	T	-1.024	T	0.046	T	0.345	0.717	7.817	-2.92	-0.894	-0.715	6.314	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.9557	0	NaN	NA	NA	28	25	3	0
chr17	79419182	79419182	C	G	intronic	BAHCC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	33	7.558223	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	4	1	3	0
chr17	79419749	79419749	G	C	exonic	BAHCC1	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	.	.	0.952	P	0.457	P	0.000	D	0.931	D	2.33	M	1.59	T	-0.950	T	0.093	T	0.354	2.509	14.35	3.6	1.140	2.056	9.767	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	39	35	4	0
chr17	79425558	79425558	C	A,CCTCCCCCGCA,CCTCCCCGCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	96.9678	0	NaN	NA	NA	13	1	5	3
chr17	79425815	79425815	A	C	intronic	BAHCC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr17	79426305	79426305	G	A	exonic	BAHCC1	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	0	D	0.996	D	0.987	D	0.002	N	0.972	D	2.51	M	0.91	T	-0.368	T	0.277	T	0.361	4.851	27.7	4.35	2.146	4.940	15.998	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	18	18	0	0
chr17	79426416	79426416	A	G	intronic	BAHCC1	NaN	NaN	NaN	rs4969272	NaN	0.310304	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.376641	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	3	0	3	26
chr17	79426481	79426481	A	G	intronic	BAHCC1	NaN	NaN	NaN	rs4969273	NaN	0.655351	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.015301	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	50
chr17	79427740	79427740	A	A	intronic	BAHCC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	60	54	0	0
chr17	79428338	79428338	T	T	exonic	BAHCC1	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	16	14	0	0
chr17	79429872	79429872	G	A	exonic	BAHCC1	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	0	D	0.557	P	0.294	B	.	.	1.000	D	2.325	M	-1.98	D	0.310	D	0.595	D	0.439	4.484	24.0	4.9	2.266	9.286	16.846	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	79478916	79478916	G	T	intronic	ACTG1	NaN	NaN	NaN	rs9910792	NaN	0.558906	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	38.67885	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	0	13	30
chr17	79479395	79479395	A	A	intronic	ACTG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	7948175	7948175	C	T	exonic	ALOX15B	NaN	synonymous SNV	ALOX15B:NM_001039130:exon6:c.C705T:p.D235D,ALOX15B:NM_001039131:exon6:c.C705T:p.D235D,ALOX15B:NM_001141:exon6:c.C705T:p.D235D	rs6503070	ID=COSM148184;OCCURENCE=1(stomach)	0.597244	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	57.0299	0	20.221267	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	8	1	7	23
chr17	79496133	79496133	C	T	exonic	FSCN2	NaN	synonymous SNV	FSCN2:NM_001077182:exon1:c.C576T:p.R192R,FSCN2:NM_012418:exon1:c.C576T:p.R192R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.81729	nearby_gap_events	REJECT	93	87	6	0
chr17	79508024	79508024	A	A	intronic	C17orf70	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	79508506	79508506	G	T	intronic	C17orf70	NaN	NaN	NaN	rs2228698	NaN	0.764776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	184.707674	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	63	0	63	47
chr17	79510920	79510920	T	G	intronic	C17orf70	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr17	7951275	7951275	A	T	intronic	ALOX15B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	28	2	26	0
chr17	79514408	79514408	A	A	exonic	C17orf70	NaN	synonymous SNV	C17orf70:NM_025161:exon5:c.T1700T:p.I567I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	53	46	0	0
chr17	79516181	79516181	T	C	intronic	C17orf70	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr17	7951905	7951905	A	A	UTR3	ALOX15B	NM_001141:c.*22A>A,NM_001039130:c.*22A>A,NM_001039131:c.*22A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	57	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	79575730	79575730	A	G	intronic	NPLOC4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.408793	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	93	89	4	0
chr17	79589242	79589242	G	A	exonic	NPLOC4	NaN	synonymous SNV	NPLOC4:NM_017921:exon3:c.C159T:p.T53T	rs6565604	NaN	0.642772	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	119.040571	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	0	39	38
chr17	79611977	79611977	T	T	intronic	TSPAN10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	79612299	79612299	G	T	exonic	TSPAN10	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	3.3815060772261966E-5	NA	0	0	NaN	NA	NA	94	57	37	0
chr17	79612300	79612300	T	C	exonic	TSPAN10	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	0.21	T	0.121	B	0.069	B	0.002	N	1.000	N	1.665	L	-1.21	T	-0.787	T	0.307	T	0.399	1.703	11.65	1.98	0.214	2.632	7.854	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.010668546581845356	NA	0	0	NaN	NA	NA	200	158	42	0
chr17	79612444	79612444	G	C	exonic	TSPAN10	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	0.35	T	1.0	D	0.99	D	0.009	N	1.000	N	2.585	M	-1.29	T	-0.267	T	0.618	D	0.641	1.236	10.02	3.13	0.903	2.756	8.892	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.52918	0	NaN	NA	NA	130	114	19	5
chr17	79612642	79612642	T	A	exonic	TSPAN10	NaN	unknown	UNKNOWN	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.515	H	-1.54	D	0.906	D	0.742	D	0.988	4.071	20.9	4.15	1.747	6.880	13.304	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.18216	0	NaN	NA	NA	15	13	2	0
chr17	79614932	79614932	TTAAC	T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	461.307	0	NaN	NA	NA	49	0	45	39
chr17	79618059	79618059	C	T	UTR3	PDE6G	NM_002602:c.*45G>A	NaN	NaN	rs8477	NaN	0.585064	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	89.105474	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	0	31	25
chr17	79618252	79618252	G	A	intronic	PDE6G	NaN	NaN	NaN	rs7217415	NaN	0.583067	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	99.7823	0	29.052781	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	10	0	10	18
chr17	79618834	79618834	G	C	intronic	PDE6G	NaN	NaN	NaN	rs12603868	NaN	0.570088	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	85.650734	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	1	33	32
chr17	79619226	79619226	C	C	intronic	PDE6G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	79637367	79637367	C	G	exonic	CCDC137	NaN	nonsynonymous SNV	CCDC137:NM_199287:exon3:c.C381G:p.H127Q	rs7226091	ID=COSM437790;OCCURENCE=1(breast)	0.239217	0.56	T	0.0	B	0.0	B	0.024	N	1.000	P	-0.895	N	2.38	T	-0.925	T	0.000	T	0.192	-1.649	0.012	0.343	0.022	-0.066	2.980	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	127.337472	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	127	73	54	22
chr17	79639045	79639045	C	G	intronic	CCDC137	NaN	NaN	NaN	rs12940151	NaN	0.131589	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	197.788	0	NaN	NA	NA	106	59	47	7
chr17	79650210	79650210	A	A	intronic	ARL16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr17	79650647	79650647	A	A	intronic	ARL16	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	79650771	79650771	G	A	exonic	ARL16	NaN	synonymous SNV	ARL16:NM_001040025:exon1:c.C85T:p.L29L	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5005	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr17	79650828	79650828	T	G	exonic	ARL16	NaN	nonsynonymous SNV	ARL16:NM_001040025:exon1:c.A28C:p.S10R	rs8066889	NaN	0.248203	0.01	D	0.0	B	0.0	B	0.834	U	1.000	P	1.04	L	-0.51	T	-1.011	T	0.000	T	0.075	1.432	10.73	0.805	0.263	0.878	8.446	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	39.4871	16	12.404018	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	6	7	15
chr17	79655889	79655889	A	A	intronic	HGS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	79670642	79670642	G	A	intronic	MRPL12	NaN	NaN	NaN	rs34724580	NaN	0.104233	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	24.3428	0	7.804624	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	2	4	2
chr17	79674126	79674126	C	A	intronic	MRPL12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.503248	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	423	402	21	0
chr17	79674205	79674205	A	G	exonic	MRPL12	NaN	nonsynonymous SNV	MRPL12:NM_002949:exon5:c.A532G:p.K178E	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	3.225	M	-0.06	T	0.263	D	0.528	D	0.848	4.836	27.5	4.61	1.944	6.948	14.190	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.084393	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	477	467	10	0
chr17	79682943	79682943	G	A	intronic	SLC25A10	NaN	NaN	NaN	rs56713834	NaN	0.0934505	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	19.454	0	9.814068	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	12	5	9
chr17	79682993	79682993	TGC	CTG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.4739	0	NaN	NA	NA	17	13	2	0
chr17	79684391	79684391	T	T	intronic	SLC25A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr17	79684743	79684743	G	C	intronic	SLC25A10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.24603	clustered_read_position	REJECT	43	37	6	1
chr17	79687211	79687211	G	T	exonic	SLC25A10	NaN	nonsynonymous SNV	SLC25A10:NM_001270953:exon11:c.G885T:p.W295C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.007655658916015277	NA	0	0	NaN	NA	NA	77	59	18	2
chr17	7976048	7976048	T	T	UTR3	ALOX12B	NM_001139:c.*41A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr17	79766889	79766889	A	G	UTR5	GCGR	NM_000160:c.-6A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.064502	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	30	22	8	0
chr17	79769169	79769169	C	G	exonic	GCGR	NaN	synonymous SNV	GCGR:NM_000160:exon6:c.C465G:p.A155A	rs5386	NaN	0.0345447	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	37	31	6	14
chr17	79769466	79769466	T	C	intronic	GCGR	NaN	NaN	NaN	rs28454947	NaN	0.16234	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.906774	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	4	5	21
chr17	79769858	79769858	C	CT,T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	65.2604	0	NaN	NA	NA	23	5	7	2
chr17	7977105	7977105	A	G	intronic	ALOX12B	NaN	NaN	NaN	rs12937410	NaN	0.850839	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	381.713363	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	130	0	130	53
chr17	79780421	79780421	C	A	UTR3	FAM195B	NM_001093767:c.*401G>T,NM_207368:c.*702G>T,NM_001288799:c.*702G>T,NM_001288798:c.*401G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	79780422	79780422	C	G	UTR3	FAM195B	NM_001093767:c.*400G>C,NM_207368:c.*701G>C,NM_001288799:c.*701G>C,NM_001288798:c.*400G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	79791682	79791682	C	T	exonic	PPP1R27	NaN	nonsynonymous SNV	PPP1R27:NM_001007533:exon3:c.G388A:p.G130S	NaN	NaN	NaN	0	D	0.916	P	0.467	P	0.000	D	1.000	D	2.955	M	0.63	T	-0.472	T	0.213	T	0.633	6.077	37	4.08	2.095	6.615	13.284	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.893058	normal_lod	REJECT	17	13	4	0
chr17	7980189	7980189	TCCCCAGATGCC	T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	55.7452	0	NaN	NA	NA	236	190	44	17
chr17	79801973	79801973	GA	AG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.8573	0	NaN	NA	NA	69	57	13	0
chr17	7980304	7980304	A	G	intronic	ALOX12B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.323819	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	235	229	6	0
chr17	79804513	79804513	A	G	intronic	P4HB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr17	79804762	79804762	T	T	intronic	P4HB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr17	79813071	79813071	C	T	exonic	P4HB	NaN	nonsynonymous SNV	P4HB:NM_000918:exon4:c.G571A:p.D191N	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.021	B	0.031	B	0.008	N	1.000	N	1.525	L	1.44	T	-1.028	T	0.069	T	0.126	3.003	16.02	3.61	0.932	4.701	12.352	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.695379	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	115	110	5	0
chr17	79827526	79827526	C	G	intronic	ARHGDIA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03354973923177499	NA	0	0	NaN	NA	NA	75	58	17	0
chr17	7983298	7983298	C	G	intronic	ALOX12B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.663136	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	242	221	21	0
chr17	7984610	7984610	C	C	intronic	ALOX12B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	235	216	0	0
chr17	79860599	79860599	G	C	exonic	NPB	NaN	nonsynonymous SNV	NPB:NM_148896:exon2:c.G353C:p.R118P	NaN	NaN	NaN	0.23	T	0.742	P	0.287	B	0.236	U	0.550	N	0.69	N	.	.	-1.030	T	0.047	T	0.414	3.084	16.30	1.33	0.473	0.407	3.322	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.933	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	11	8	3	0
chr17	79863067	79863067	C	A	intronic	PCYT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr17	79863070	79863070	C	A	intronic	PCYT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	79863071	79863071	T	A	intronic	PCYT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	79863076	79863076	T	C	intronic	PCYT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr17	79864818	79864818	A	ACG	intronic	PCYT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	22.6451	0	NaN	NA	NA	9	5	3	0
chr17	79872129	79872129	A	G	intronic	SIRT7	NaN	NaN	NaN	rs1879568	NaN	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	94.888039	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	0	39	58
chr17	79872710	79872710	A	A	intronic	SIRT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr17	79875481	79875481	C	T	intronic	SIRT7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	77.785339	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	72	36	36	1
chr17	79880994	79880994	C	C	intronic	MAFG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	72	54	0	0
chr17	79891147	79891147	T	C	exonic	PYCR1	NaN	synonymous SNV	PYCR1:NM_001282279:exon7:c.A810G:p.S270S,PYCR1:NM_006907:exon7:c.A903G:p.S301S,PYCR1:NM_001282280:exon8:c.A903G:p.S301S,PYCR1:NM_001282281:exon8:c.A984G:p.S328S	rs61747618	NaN	0.986022	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	133.732627	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	0	48	57
chr17	79892451	79892451	C	T	intronic	PYCR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	19	14	5	0
chr17	79893462	79893462	A	A	intronic	PYCR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	16	15	0	0
chr17	79898644	79898644	G	A	UTR3	MYADML2	NM_001145113:c.*50C>T	NaN	NaN	rs2293098	NaN	0.427716	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	43.060694	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	44	24	20	43
chr17	7990686	7990686	G	A	exonic	ALOX12B	NaN	synonymous SNV	ALOX12B:NM_001139:exon1:c.C75T:p.T25T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.160441	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	176	167	9	0
chr17	79911153	79911153	A	G	intronic	NOTUM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.154939	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	62	55	7	0
chr17	79911165	79911165	G	A	intronic	NOTUM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	92	54	37	0
chr17	79915509	79915509	T	C	intronic	NOTUM	NaN	NaN	NaN	rs34996156	NaN	0.373802	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	79915863	79915863	A	G	intronic	NOTUM	NaN	NaN	NaN	rs34107062	NaN	0.373602	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	19	9	10	0
chr17	79954545	79954545	G	A	exonic	ASPSCR1	NaN	synonymous SNV	ASPSCR1:NM_001251888:exon7:c.G756A:p.L252L,ASPSCR1:NM_024083:exon7:c.G756A:p.L252L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.10000000000000024	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	5	3	3
chr17	79970044	79970044	T	T	intronic	ASPSCR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr17	79973294	79973294	G	A	intronic	ASPSCR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.806355	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	40	31	9	0
chr17	79974417	79974417	G	T	intronic	ASPSCR1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.271935	nearby_gap_events	REJECT	58	47	11	0
chr17	79976891	79976891	T	T	UTR3	STRA13	NM_144998:c.*190A>A,NM_001271007:c.*190A>A,NM_001271006:c.*190A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr17	79977713	79977713	CG	GC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.07448	0	NaN	NA	NA	8	7	2	0
chr17	79981524	79981524	A	T	exonic	LRRC45	NaN	nonsynonymous SNV	LRRC45:NM_144999:exon1:c.A5T:p.E2V	NaN	NaN	NaN	.	.	0.779	P	0.296	B	0.000	D	1.000	D	2.31	M	2.21	T	-1.094	T	0.057	T	0.369	4.767	26.7	4.97	1.989	5.321	14.907	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.985237	clustered_read_position	REJECT	26	22	4	0
chr17	79981777	79981777	A	T	intronic	LRRC45	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr17	79986707	79986707	C	C	intronic	LRRC45	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	79986919	79986919	T	T	intronic	LRRC45	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	29	25	0	0
chr17	79987140	79987140	T	C	intronic	LRRC45	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.785397	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	47	43	4	0
chr17	79987141	79987141	C	A	intronic	LRRC45	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.181297	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	47	43	4	0
chr17	79987914	79987914	G	G	intronic	LRRC45	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	22	20	0	0
chr17	79990942	79990942	A	A	intronic	RAC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	79991538	79991538	C	A	intronic	RAC3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.355179	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	62	54	8	0
chr17	79994026	79994026	G	A	intronic	DCXR	NaN	NaN	NaN	rs6502047	NaN	0.215655	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	71	43	28	17
chr17	79995490	79995490	C	CTT	intronic	DCXR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.185104	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	94.4404	0	NaN	NA	NA	31	13	16	9
chr17	79995616	79995616	A	G	upstream	DCXR	NaN	NaN	NaN	rs57552134	NaN	0.311102	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.967572	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	4	8	23
chr17	80006504	80006504	T	C	UTR3	RFNG	NM_002917:c.*98A>G	NaN	NaN	rs1128009	NaN	0.574281	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	199.635224	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	0	66	50
chr17	80007517	80007517	C	G	intronic	RFNG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.304331	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	44	40	4	0
chr17	80007897	80007897	G	T	intronic	RFNG	NaN	NaN	NaN	rs9915742	NaN	0.552117	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	180.984574	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	0	65	54
chr17	80012068	80012068	A	A	intronic	GPS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	80038952	80038952	T	G	intronic	FASN	NaN	NaN	NaN	rs4246444	NaN	0.663738	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	53.045709	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	20	0	20	50
chr17	80039028	80039028	A	G	intronic	FASN	NaN	NaN	NaN	rs4246445	NaN	0.664337	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	57.895715	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	0	21	53
chr17	80040350	80040350	T	G	intronic	FASN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	52	45	7	0
chr17	80040351	80040351	C	T	intronic	FASN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr17	80040606	80040606	CT	C,CC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	108.806	0	NaN	NA	NA	13	0	2	2
chr17	80040607	80040607	T	C	intronic	FASN	NaN	NaN	NaN	rs4969465	NaN	0.622804	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.854517	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	52
chr17	80040639	80040639	G	A	intronic	FASN	NaN	NaN	NaN	rs17848942	NaN	0.310703	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.427352	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	1	14	46
chr17	80041366	80041366	C	A	intronic	FASN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.053455	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	69	59	10	0
chr17	80041869	80041869	G	C	exonic	FASN	NaN	nonsynonymous SNV	FASN:NM_004104:exon29:c.C5080G:p.R1694G	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.677	P	0.452	P	0.003	N	0.997	D	2.865	M	3.48	T	-1.099	T	0.045	T	0.429	2.926	15.75	4.57	2.073	2.675	17.321	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.685945	clustered_read_position	REJECT	10	7	3	0
chr17	80041870	80041870	G	A	exonic	FASN	NaN	synonymous SNV	FASN:NM_004104:exon29:c.C5079T:p.C1693C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.378469	clustered_read_position	REJECT	10	7	3	0
chr17	80042869	80042869	G	A	intronic	FASN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.386338	nearby_gap_events	REJECT	62	54	8	0
chr17	80043349	80043349	C	T	intronic	FASN	NaN	NaN	NaN	rs17848939	NaN	0.422125	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	134.040913	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	0	50	47
chr17	80043920	80043920	C	T	intronic	FASN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	52.4647	0	NaN	NA	NA	35	22	13	2
chr17	80044969	80044969	C	T	exonic	FASN	NaN	synonymous SNV	FASN:NM_004104:exon21:c.G3384A:p.L1128L	rs146626315	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.642204	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	109	104	5	0
chr17	80047345	80047345	A	C	intronic	FASN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr17	80049677	80049677	A	A	intronic	FASN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	80050584	80050584	T	T	exonic	FASN	NaN	synonymous SNV	FASN:NM_004104:exon7:c.A883A:p.T295T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	22	18	0	0
chr17	80053370	80053370	A	A	intronic	FASN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr17	8005907	8005907	T	C	intronic	ALOXE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	80059758	80059758	G	A	intronic	CCDC57	NaN	NaN	NaN	rs7225637	NaN	0.395767	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	53	1	52	49
chr17	80086485	80086485	A	A	intronic	CCDC57	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	8011741	8011741	C	A	intronic	ALOXE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	8011742	8011742	T	A	intronic	ALOXE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	8011747	8011747	C	T	intronic	ALOXE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	8011748	8011748	A	C	intronic	ALOXE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	80136324	80136324	T	T	intronic	CCDC57	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	8014476	8014476	T	T	intronic	ALOXE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	80151764	80151764	T	C	intronic	CCDC57	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.569309	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	300	294	6	0
chr17	8015353	8015353	A	C	intronic	ALOXE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	8015354	8015354	G	A	intronic	ALOXE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	8015579	8015579	G	C	intronic	ALOXE3	NaN	NaN	NaN	rs894505	NaN	0.504992	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	93	72	21	46
chr17	80175100	80175100	G	C	intergenic	CCDC57,SLC16A3	dist=4411;dist=11182	NaN	NaN	rs8082212	NaN	0.823882	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	80194276	80194276	G	C	intronic	SLC16A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	2.968187	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	43	39	4	0
chr17	80194278	80194278	C	G	intronic	SLC16A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.486001	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	40	36	4	0
chr17	80194665	80194665	G	T	exonic	SLC16A3	NaN	nonsynonymous SNV	SLC16A3:NM_001042422:exon3:c.G284T:p.G95V,SLC16A3:NM_001042423:exon3:c.G284T:p.G95V,SLC16A3:NM_001206950:exon3:c.G284T:p.G95V,SLC16A3:NM_001206951:exon3:c.G284T:p.G95V,SLC16A3:NM_001206952:exon3:c.G284T:p.G95V,SLC16A3:NM_004207:exon3:c.G284T:p.G95V	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.62	H	0.68	T	0.110	D	0.442	T	0.984	3.374	17.37	5.62	2.645	9.751	18.649	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.375245	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	41	35	6	0
chr17	80194666	80194666	T	C	exonic	SLC16A3	NaN	synonymous SNV	SLC16A3:NM_001042422:exon3:c.T285C:p.G95G,SLC16A3:NM_001042423:exon3:c.T285C:p.G95G,SLC16A3:NM_001206950:exon3:c.T285C:p.G95G,SLC16A3:NM_001206951:exon3:c.T285C:p.G95G,SLC16A3:NM_001206952:exon3:c.T285C:p.G95G,SLC16A3:NM_004207:exon3:c.T285C:p.G95G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.340624	nearby_gap_events	REJECT	41	36	5	0
chr17	80194667	80194667	C	G	exonic	SLC16A3	NaN	nonsynonymous SNV	SLC16A3:NM_001042422:exon3:c.C286G:p.L96V,SLC16A3:NM_001042423:exon3:c.C286G:p.L96V,SLC16A3:NM_001206950:exon3:c.C286G:p.L96V,SLC16A3:NM_001206951:exon3:c.C286G:p.L96V,SLC16A3:NM_001206952:exon3:c.C286G:p.L96V,SLC16A3:NM_004207:exon3:c.C286G:p.L96V	NaN	NaN	NaN	0.62	T	0.763	P	0.576	P	0.000	N	1.000	D	1.155	L	0.28	T	-0.978	T	0.167	T	0.291	2.581	14.59	3.6	0.708	4.872	10.456	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.403247	nearby_gap_events	REJECT	41	36	5	0
chr17	80202571	80202571	C	T	UTR3	CSNK1D	NM_001893:c.*86G>A,NM_139062:c.*168G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.564713	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	624	614	10	0
chr17	80209081	80209081	T	A	intronic	CSNK1D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	80209082	80209082	T	A	intronic	CSNK1D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	80209083	80209083	C	A	intronic	CSNK1D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	80211229	80211229	A	A	intronic	CSNK1D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr17	8026272	8026272	G	C	intronic	HES7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	8026273	8026273	T	G	intronic	HES7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	8026274	8026274	G	A	intronic	HES7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	8026275	8026275	T	C	intronic	HES7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr17	80274141	80274141	GCAGGGAGGGCAGAGGCTGCTGGCGGGT	G,GCAGGGAGGGCAGAGGCTGCGTGGCGGGT,GCAGGGAGGGCAGAGGCTGTCTGCGGGT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	138.074	0	NaN	NA	NA	40	15	19	1
chr17	80351433	80351433	G	T	intronic	OGFOD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	80362094	80362094	A	A	intronic	OGFOD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	80364205	80364205	T	T	intronic	OGFOD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	80367222	80367222	G	C	intronic	OGFOD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.429427	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	437	407	30	0
chr17	80369446	80369446	C	T	intronic	OGFOD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.493245	nearby_gap_events	REJECT	134	128	6	0
chr17	80400399	80400399	C	C	exonic	HEXDC	NaN	synonymous SNV	HEXDC:NM_173620:exon12:c.C1689C:p.G563G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	70	66	0	0
chr17	80436902	80436902	A	A	intronic	NARF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr17	8044248	8044248	T	G	UTR3	PER1	NM_002616:c.*138A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	15	7	8	0
chr17	8046772	8046772	C	G	exonic	PER1	NaN	nonsynonymous SNV	PER1:NM_002616:exon19:c.G2884C:p.A962P	rs2585405	NaN	0.771765	0.52	T	0.0	B	0.0	B	0.082	N	1.000	P	-0.205	N	2.59	T	-1.042	T	0.000	T	0.084	-1.546	0.015	3.22	0.658	1.592	12.935	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	393.52	0	NaN	NA	NA	55	14	41	47
chr17	8048006	8048006	C	A	intronic	PER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.28	T	0.002	B	0.001	B	.	.	1.000	N	.	.	1.23	T	-1.041	T	0.037	T	0.123	-1.626	0.013	-7.99	-2.727	-1.144	0.370	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.019592	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	35	28	7	0
chr17	8051374	8051374	G	C	exonic	PER1	NaN	nonsynonymous SNV	PER1:NM_002616:exon10:c.C1175G:p.P392R	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.625	M	2.33	T	-0.862	T	0.131	T	0.819	3.864	19.63	4.2	1.426	7.749	13.716	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.006710480765859476	NA	0	0	NaN	NA	NA	48	35	13	0
chr17	8051704	8051704	A	A	intronic	PER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	35	33	0	0
chr17	8051720	8051720	A	G	intronic	PER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	80	NaN	NA	NA	9	0	6	0
chr17	8051899	8051899	T	A	intronic	PER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	8051901	8051901	T	C	intronic	PER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	8052542	8052542	G	G	intronic	PER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	8053978	8053978	G	G	exonic	PER1	NaN	synonymous SNV	PER1:NM_002616:exon2:c.C47C:p.P16P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	196	137	0	0
chr17	8054034	8054034	A	A	UTR5	PER1	NM_002616:c.-10T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	80540890	80540890	A	G	intronic	FOXK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	14	4	9	0
chr17	80545194	80545194	A	G	intronic	FOXK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.88979	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	433	425	8	0
chr17	80597572	80597572	T	T	intronic	WDR45B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr17	80615794	80615794	C	C	exonic	RAB40B	NaN	synonymous SNV	RAB40B:NM_006822:exon6:c.G782G:p.R261R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	26	18	0	0
chr17	80615795	80615795	G	C	exonic	RAB40B	NaN	nonsynonymous SNV	RAB40B:NM_006822:exon6:c.C781G:p.R261G	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.176	B	0.166	B	0.011	N	1.000	D	1.995	M	.	.	-0.626	T	0.242	T	0.456	3.445	17.66	3.82	1.332	2.986	13.397	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.080848	nearby_gap_events	REJECT	22	17	5	0
chr17	80637652	80637652	G	C	intronic	RAB40B	NaN	NaN	NaN	rs28535905	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	4	1	2	0
chr17	80644906	80644906	A	G	intronic	RAB40B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	59	NaN	NA	NA	12	1	11	0
chr17	80644926	80644926	G	G	intronic	RAB40B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	80674643	80674643	C	G	exonic	FN3KRP	NaN	synonymous SNV	FN3KRP:NM_024619:exon1:c.C12G:p.L4L	rs2250000	NaN	0.99381	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.214741	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	55
chr17	80676946	80676946	A	ACCACCCC	intronic	FN3KRP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	78.3336	0	NaN	NA	NA	11	1	8	11
chr17	80684675	80684675	T	T	intronic	FN3KRP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr17	80699351	80699351	A	A	intronic	FN3K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	80714163	80714163	G	T	intronic	TBCD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	870.108	0	NaN	NA	NA	96	4	92	15
chr17	80739437	80739437	C	A	intronic	TBCD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr17	80767747	80767747	A	C	intronic	TBCD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr17	80788244	80788244	A	A	exonic	ZNF750	NaN	synonymous SNV	ZNF750:NM_024702:exon3:c.T1946T:p.I649I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	24	20	0	0
chr17	80789163	80789163	C	C	exonic	ZNF750	NaN	synonymous SNV	ZNF750:NM_024702:exon2:c.G1168G:p.A390A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	113	83	0	0
chr17	80789744	80789744	G	A	exonic	ZNF750	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF750:NM_024702:exon2:c.C587T:p.T196I	NaN	NaN	NaN	.	.	0.225	B	0.047	B	0.461	N	1.000	N	1.24	L	1.93	T	-1.051	T	0.047	T	0.168	0.412	6.238	3.55	1.343	2.021	9.085	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.632843	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	85	81	4	0
chr17	8079046	8079046	T	T	intronic	TMEM107	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	80825768	80825768	C	T	intronic	TBCD	NaN	NaN	NaN	rs56079240	NaN	0.00998403	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	19	10	9	0
chr17	80854803	80854803	G	G	intronic	TBCD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr17	80858669	80858669	G	A	intronic	TBCD	NaN	NaN	NaN	rs9891862	NaN	0.508586	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	259.37	0	NaN	NA	NA	114	0	114	28
chr17	80878389	80878389	A	G	intronic	TBCD	NaN	NaN	NaN	rs1471197	NaN	0.994808	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1833.41	0	NaN	NA	NA	162	0	162	57
chr17	80878391	80878391	A	G	intronic	TBCD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.932144	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	197	179	18	0
chr17	80880852	80880852	A	A	intronic	TBCD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	80886167	80886167	A	T	intronic	TBCD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	80888583	80888583	A	C	intronic	TBCD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr17	80895933	80895933	A	G	exonic	TBCD	NaN	nonsynonymous SNV	TBCD:NM_005993:exon36:c.A3290G:p.E1097G	rs3785522	ID=COSM437857;OCCURENCE=1(breast)	0.930911	.	.	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.000	P	-2.215	N	2.34	T	-0.977	T	0.000	T	0.135	-1.682	0.012	2.91	-0.002	2.702	11.693	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	116.261	0	NaN	NA	NA	40	23	17	51
chr17	80900209	80900209	T	G	intronic	TBCD	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.770617	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	118	92	26	0
chr17	8093324	8093324	C	G	exonic	C17orf59	NaN	nonsynonymous SNV	C17orf59:NM_017622:exon1:c.G135C:p.E45D	rs150061068	NaN	0.00319489	0.23	T	0.001	B	0.002	B	0.979	N	0.993	N	0.345	N	.	.	-1.051	T	0.052	T	0.078	2.199	13.31	3.99	1.449	2.072	11.501	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.84794	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr17	80982464	80982464	A	A	intronic	B3GNTL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	80982465	80982465	A	A	intronic	B3GNTL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	81006629	81006629	C	T	exonic	B3GNTL1	NaN	synonymous SNV	B3GNTL1:NM_001009905:exon2:c.G93A:p.P31P	rs7406119	NaN	0.193291	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	83.562872	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	28	32	20
chr17	81043039	81043039	A	A	exonic	METRNL	NaN	synonymous SNV	METRNL:NM_001004431:exon2:c.A396A:p.P132P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr17	81043175	81043175	G	T	exonic	METRNL	NaN	nonsynonymous SNV	METRNL:NM_001004431:exon2:c.G532T:p.A178S	rs72854240	ID=COSM437859;OCCURENCE=1(breast)	0.0299521	.	.	0.137	B	0.058	B	0.691	N	1.000	N	0.425	N	.	.	-1.031	T	0.001	T	0.059	0.946	8.856	2.1	0.516	2.535	4.495	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	135.861	0	NaN	NA	NA	66	35	31	8
chr17	81050982	81050982	G	C	intronic	METRNL	NaN	NaN	NaN	rs7501742	NaN	0.565495	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	207.517607	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	166	66	100	48
chr17	81059986	81059986	T	G	intergenic	METRNL,FLJ43681	dist=7115;dist=114680	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	81060040	81060040	G	A	intergenic	METRNL,FLJ43681	dist=7169;dist=114626	NaN	NaN	rs114541204	NaN	0.522364	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	8110253	8110253	C	A	intronic	AURKB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.24612	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	189	174	15	0
chr17	8110272	8110272	C	G	intronic	AURKB	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.081723	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	206	188	18	0
chr17	8110764	8110764	C	A	intronic	AURKB	NaN	NaN	NaN	rs2289590	NaN	0.453275	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	75	NaN	NA	NA	97	32	65	47
chr17	8131395	8131395	T	T	UTR3	CTC1	NM_025099:c.*103A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr17	8132775	8132775	A	A	intronic	CTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	22	19	0	0
chr17	8133216	8133216	T	G	exonic	CTC1	NaN	nonsynonymous SNV	CTC1:NM_025099:exon18:c.A3004C:p.T1002P	NaN	NaN	NaN	0.26	T	0.004	B	0.007	B	0.823	N	1.000	N	0.92	L	-1.71	D	-0.801	T	0.332	T	0.123	0.511	6.768	3.26	2.123	0.610	4.811	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.887237	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	157	140	17	0
chr17	8139719	8139719	A	A	intronic	CTC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr17	8141707	8141707	T	C	intronic	CTC1	NaN	NaN	NaN	rs6503093	NaN	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	209.579203	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	67	0	67	58
chr17	8158273	8158273	A	G	intronic	PFAS	NaN	NaN	NaN	rs6503094	NaN	0.642173	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	173	29	144	54
chr17	8159232	8159232	A	G	intronic	PFAS	NaN	NaN	NaN	rs7221716	NaN	0.784345	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	72	NaN	NA	NA	229	42	187	57
chr17	8166378	8166378	T	C	intronic	PFAS	NaN	NaN	NaN	rs7206953	NaN	0.583466	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1093.96	0	NaN	NA	NA	103	15	88	51
chr17	8167118	8167118	T	T	exonic	PFAS	NaN	synonymous SNV	PFAS:NM_012393:exon15:c.T1655T:p.L552L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	17	15	0	0
chr17	8167599	8167599	CTG	CCG,CGC,GCC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	125.184	0	NaN	NA	NA	35	13	7	2
chr17	8167600	8167600	T	C	exonic	PFAS	NaN	nonsynonymous SNV	PFAS:NM_012393:exon16:c.T1862C:p.L621P	rs11078738	NaN	0.525759	1	T	0.0	B	0.0	B	0.006	N	1.000	P	0	N	2.08	T	-0.946	T	0.000	T	0.118	0.276	5.493	1.53	-0.109	0.220	5.668	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.043939753320683395	NA	0	0	NaN	NA	NA	13	8	5	3
chr17	8167990	8167990	A	A	intronic	PFAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr17	8168224	8168224	T	C	exonic	PFAS	NaN	synonymous SNV	PFAS:NM_012393:exon18:c.T2061C:p.S687S	rs9902252	ID=COSM437866;OCCURENCE=1(breast)	0.529353	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	125	NaN	NA	NA	205	50	155	56
chr17	8172363	8172363	C	T	exonic	PFAS	NaN	synonymous SNV	PFAS:NM_012393:exon28:c.C3798T:p.P1266P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.321922	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	182	177	5	0
chr17	8198155	8198155	A	A	UTR5	SLC25A35	NM_201520:c.-30T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	8215586	8215586	C	G	exonic	ARHGEF15	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGEF15:NM_025014:exon2:c.C229G:p.P77A,ARHGEF15:NM_173728:exon2:c.C229G:p.P77A	NaN	NaN	NaN	0.13	T	0.62	P	0.22	B	0.018	N	0.998	N	0.805	L	-0.61	T	-0.889	T	0.177	T	0.175	0.311	5.686	3.97	2.625	2.069	7.546	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.751876	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	33	28	5	0
chr17	8219254	8219254	T	G	intronic	ARHGEF15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.970811	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	74	66	8	0
chr17	8219478	8219478	A	G	intronic	ARHGEF15	NaN	NaN	NaN	rs2270445	NaN	0.629792	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	27.540387	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	81	62	19	44
chr17	8222162	8222162	G	C	exonic	ARHGEF15	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGEF15:NM_025014:exon12:c.G1967C:p.R656P,ARHGEF15:NM_173728:exon12:c.G1967C:p.R656P	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.968	D	0.000	D	0.969	D	2.19	M	-0.68	T	-0.144	T	0.443	T	0.467	3.447	17.67	3.87	1.271	3.011	6.609	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.552835	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	119	109	10	0
chr17	8222163	8222163	C	G	exonic	ARHGEF15	NaN	synonymous SNV	ARHGEF15:NM_025014:exon12:c.C1968G:p.R656R,ARHGEF15:NM_173728:exon12:c.C1968G:p.R656R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.053367	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	108	98	10	0
chr17	8224133	8224133	T	C	intronic	ARHGEF15	NaN	NaN	NaN	rs3744646	NaN	0.453275	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	27	23	4	39
chr17	8224276	8224276	T	C	exonic	ARHGEF15	NaN	nonsynonymous SNV	ARHGEF15:NM_025014:exon16:c.T2491C:p.S831P,ARHGEF15:NM_173728:exon16:c.T2491C:p.S831P	rs3744647	NaN	0.577875	0.36	T	0.0	B	0.0	B	0.341	N	1.000	P	-0.55	N	-0.4	T	-0.939	T	0.000	T	0.101	-2.193	0.005	0.487	-0.060	-1.059	6.930	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	164	NaN	NA	NA	229	197	32	51
chr17	8243299	8243299	T	T	UTR5	ODF4	NM_153007:c.-71T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	8243469	8243469	T	C	exonic	ODF4	NaN	nonsynonymous SNV	ODF4:NM_153007:exon1:c.T100C:p.W34R	rs12943505	NaN	0.179113	0.84	T	0.01	B	0.017	B	0.108	N	1.000	P	0.895	L	1.66	T	-0.976	T	0.000	T	0.088	0.029	4.163	-2.74	-0.593	-1.952	5.487	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	49.9248	0	NaN	NA	NA	113	94	21	26
chr17	8243661	8243661	G	A	exonic	ODF4	NaN	nonsynonymous SNV	ODF4:NM_153007:exon1:c.G292A:p.V98M	rs12601097	ID=COSM148189;OCCURENCE=1(stomach)	0.538938	1	T	0.0	B	0.0	B	0.007	N	0.000	P	-1.65	N	2.02	T	-0.943	T	0.000	T	0.041	-1.573	0.014	4.89	0.887	1.035	7.368	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	133	NaN	NA	NA	258	214	44	51
chr17	8248815	8248815	T	G	intronic	ODF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.822263	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	175	164	11	0
chr17	8273345	8273345	T	C	exonic	KRBA2	NaN	nonsynonymous SNV	KRBA2:NM_001304947:exon2:c.A340G:p.I114V,KRBA2:NM_213597:exon2:c.A586G:p.I196V	NaN	NaN	NaN	0.37	T	0.226	B	0.104	B	.	.	1.000	N	1.5	L	1.81	T	-1.014	T	0.046	T	0.151	1.335	10.38	1.53	0.422	0.990	4.745	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.524442	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	46	43	3	0
chr17	8296002	8296002	G	C	UTR3	RNF222	NM_001146684:c.*115C>G	NaN	NaN	rs7222871	NaN	0.195487	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	135	20	115	21
chr17	8387438	8387438	G	GATGA	intronic	MYH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.971246	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	308.301	0	NaN	NA	NA	41	4	37	20
chr17	8393635	8393635	G	A	intronic	MYH10	NaN	NaN	NaN	rs190961207	NaN	0.00119808	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	359	283	76	1
chr17	8409950	8409950	A	A	intronic	MYH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	8415624	8415624	T	C	intronic	MYH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	8415625	8415625	C	G	intronic	MYH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	8416833	8416833	A	G	intronic	MYH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	25	18	6	0
chr17	8416834	8416834	G	C	intronic	MYH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	25	18	7	0
chr17	8416876	8416876	T	C	exonic	MYH10	NaN	nonsynonymous SNV	MYH10:NM_005964:exon21:c.A2632G:p.M878V,MYH10:NM_001256095:exon22:c.A2659G:p.M887V,MYH10:NM_001256012:exon23:c.A2725G:p.M909V	NaN	NaN	NaN	0	D	0.001	B	0.006	B	0.000	D	0.999	D	1.465	L	2.37	T	-1.118	T	0.045	T	0.669	2.537	14.44	5.12	2.140	4.732	15.092	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.215283	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	132	126	6	0
chr17	8424610	8424610	A	A	intronic	MYH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr17	8492531	8492531	A	C	intronic	MYH10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	18	11	6	0
chr17	8570293	8570293	C	T	intergenic	MYH10,CCDC42	dist=36214;dist=62953	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	8638324	8638324	C	A	intronic	CCDC42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr17	8638325	8638325	T	A	intronic	CCDC42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr17	8638327	8638327	T	A	intronic	CCDC42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr17	8638328	8638328	G	T	intronic	CCDC42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr17	8638329	8638329	T	A	intronic	CCDC42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr17	8638900	8638900	G	A	exonic	CCDC42	NaN	synonymous SNV	CCDC42:NM_144681:exon5:c.C522T:p.R174R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.944542	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	129	120	9	0
chr17	8644712	8644712	T	T	intronic	CCDC42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	65	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr17	8644776	8644776	T	T	intronic	CCDC42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	217	166	0	0
chr17	8648103	8648103	G	A	UTR5	CCDC42	NM_001158261:c.-176C>T,NM_144681:c.-176C>T	NaN	NaN	rs4309437	NaN	0.569888	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	8.158318179116453E-5	NA	0	120	NaN	NA	NA	98	59	39	33
chr17	8648469	8648469	A	G	upstream	CCDC42	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr17	8656520	8656520	A	G	intronic	SPDYE4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.685866	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	92	71	21	1
chr17	8656615	8656615	A	C	intronic	SPDYE4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	22	14	7	0
chr17	8656621	8656621	T	C	intronic	SPDYE4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	13.5245	0	NaN	NA	NA	40	18	4	0
chr17	8656833	8656833	T	T	intronic	SPDYE4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr17	8656834	8656834	C	G	intronic	SPDYE4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr17	8656835	8656835	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	8	0	2,5	0
chr17	8660948	8660948	T	C,TTTCTCC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	49.5447	0	NaN	NA	NA	21	9	2	1
chr17	8701799	8701799	G	T	exonic	MFSD6L	NaN	nonsynonymous SNV	MFSD6L:NM_152599:exon1:c.C640A:p.P214T	rs17854013	NaN	0.26857	0.66	T	0.922	P	0.598	P	0.107	N	1.000	P	1.39	L	0.94	T	-0.963	T	0.000	T	0.035	0.969	8.956	3.89	1.257	1.414	12.075	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	247	193	54	16
chr17	8730387	8730387	C	A	intronic	PIK3R6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.980655	nearby_gap_events	REJECT	48	40	8	0
chr17	8731745	8731745	T	C	intronic	PIK3R6	NaN	NaN	NaN	rs12949852	NaN	0.335663	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	17	71.778467	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	3	27	34
chr17	8736394	8736394	T	C	intronic	PIK3R6	NaN	NaN	NaN	rs12945801	NaN	0.47504	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	49.791321	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	11	19	30
chr17	8738575	8738575	A	G	intronic	PIK3R6	NaN	NaN	NaN	rs1005898	NaN	0.483027	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.419927	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	3	8	31
chr17	8739821	8739821	G	C	intronic	PIK3R6	NaN	NaN	NaN	rs12948724	NaN	0.475839	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	709.49	0	NaN	NA	NA	102	17	85	34
chr17	8741054	8741054	G	A	intronic	PIK3R6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.661775	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	295	287	8	0
chr17	8743033	8743033	G	T	intronic	PIK3R6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	189	102	85	0
chr17	8743087	8743087	A	T	intronic	PIK3R6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr17	8753082	8753082	C	T	intronic	PIK3R6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.087161	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	148	136	12	0
chr17	8784361	8784361	A	G	intronic	PIK3R5	NaN	NaN	NaN	rs4791765	NaN	0.222244	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1272.04	0	NaN	NA	NA	108	0	108	27
chr17	8790553	8790553	A	A	intronic	PIK3R5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	10	10	0	0
chr17	8792171	8792171	T	C	exonic	PIK3R5	NaN	synonymous SNV	PIK3R5:NM_001142633:exon10:c.A933G:p.L311L,PIK3R5:NM_014308:exon10:c.A933G:p.L311L	rs11650737	ID=COSM1130104;OCCURENCE=1(prostate)	0.203075	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	45.4619	0	NaN	NA	NA	71	1	70	7
chr17	8796821	8796821	T	G	intronic	PIK3R5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	24	2	22	0
chr17	8809025	8809025	G	A	exonic	PIK3R5	NaN	synonymous SNV	PIK3R5:NM_001142633:exon4:c.C234T:p.L78L,PIK3R5:NM_014308:exon4:c.C234T:p.L78L	rs61753147	NaN	0.0229633	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	61	NaN	NA	NA	68	8	60	8
chr17	8814815	8814815	G	G	UTR5	PIK3R5	NM_001142633:c.-4C>C,NM_014308:c.-4C>C,NM_001251855:c.-22870C>C,NM_001251853:c.-22870C>C,NM_001251851:c.-22870C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	145	114	0	0
chr17	8816097	8816097	G	C	intronic	PIK3R5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr17	8816098	8816098	G	A	intronic	PIK3R5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr17	8848381	8848381	G	G	intronic	PIK3R5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr17	8868318	8868318	C	G	intronic	PIK3R5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr17	8926761	8926761	C	G	intronic	NTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	9049689	9049689	T	T	intronic	NTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr17	9055748	9055748	C	A	intronic	NTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	9066001	9066001	C	T	intronic	NTN1	NaN	NaN	NaN	rs2072321	NaN	0.338259	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	172.283	0	67.034502	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	8	25	30
chr17	9086228	9086228	C	A	intronic	NTN1	NaN	NaN	NaN	rs2302196	NaN	0.322284	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	322.205	0	NaN	NA	NA	22	0	22	22
chr17	9086293	9086293	G	C	intronic	NTN1	NaN	NaN	NaN	rs2302197	NaN	0.320887	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	87.7007	0	26.752321	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	2	13	18
chr17	909451	909451	A	T	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	rs2586306	NaN	0.41254	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	124	NaN	NA	NA	154	133	21	39
chr17	9124644	9124644	C	G	intronic	NTN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.374322	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	97	92	5	1
chr17	914114	914114	G	T	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	48.545094	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	202	164	38	0
chr17	914285	914285	A	G	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	14	5	8	0
chr17	914623	914623	C	C	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr17	9153861	9153861	G	G	UTR3	STX8	NM_004853:c.*34C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	18	16	0	0
chr17	916446	916446	G	A	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	rs9894835	NaN	0.229633	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	72	58	14	27
chr17	916466	916466	C	T	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	rs4968074	NaN	0.348243	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	64	52	12	32
chr17	916527	916527	A	G	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr17	9471711	9471711	T	G	exonic	STX8	NaN	synonymous SNV	STX8:NM_004853:exon2:c.A94C:p.R32R	rs1133295	NaN	0.680112	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	18	117.935979	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	48	6	42	55
chr17	9479048	9479048	T	C	intronic	STX8	NaN	NaN	NaN	rs7210038	NaN	0.751398	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	85	NaN	NA	NA	116	14	102	53
chr17	9479098	9479098	C	A	intronic	STX8	NaN	NaN	NaN	rs7224817	NaN	0.667332	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	129	20	109	53
chr17	9501704	9501704	T	C	intronic	CFAP52	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.671121	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	54	49	5	0
chr17	9501706	9501706	C	A	intronic	CFAP52	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.26665	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	54	49	5	0
chr17	9501707	9501707	T	G	intronic	CFAP52	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.16716	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	54	49	5	0
chr17	9545117	9545117	T	C	exonic	CFAP52	NaN	nonsynonymous SNV	CFAP52:NM_001080556:exon12:c.T1448C:p.M483T,CFAP52:NM_145054:exon13:c.T1652C:p.M551T	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.973	D	0.000	D	1.000	D	2.475	M	0.18	T	-0.155	T	0.398	T	0.879	3.813	19.36	5.59	2.140	7.352	14.769	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	81	NaN	NA	NA	397	332	65	1
chr17	9583529	9583529	A	C	intronic	USP43	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	9583718	9583718	A	A	intronic	USP43	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	9586165	9586165	C	T	exonic	USP43	NaN	synonymous SNV	USP43:NM_001267576:exon7:c.C1131T:p.S377S,USP43:NM_153210:exon7:c.C1131T:p.S377S	rs12453943	NaN	0.45008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	160	NaN	NA	NA	238	198	40	23
chr17	9590319	9590319	T	G	intronic	USP43	NaN	NaN	NaN	rs7220651	NaN	0.450679	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	94	NaN	NA	NA	92	80	12	0
chr17	960446	960446	A	C	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	rs184526754	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	22	13	8	0
chr17	9604572	9604572	T	G	intronic	USP43	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.009068	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	282	270	12	0
chr17	9604623	9604623	G	T	intronic	USP43	NaN	NaN	NaN	rs73257749	NaN	0.0407348	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	186	92	94	9
chr17	961304	961304	C	A	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	rs2260448	NaN	0.854034	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	38.6823	0	NaN	NA	NA	261	201	60	50
chr17	9613231	9613231	T	G	intronic	USP43	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr17	9615435	9615435	G	A	exonic	USP43	NaN	nonsynonymous SNV	USP43:NM_001267576:exon14:c.G2306A:p.C769Y,USP43:NM_153210:exon14:c.G2321A:p.C774Y	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.224	B	0.236	B	0.592	U	1.000	N	0.69	N	3.07	T	-0.922	T	0.018	T	0.066	0.878	8.561	-0.771	-0.069	0.051	2.775	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.728492		KEEP	80	74	6	0
chr17	9671230	9671230	T	C	intergenic	USP43,DHRS7C	dist=38227;dist=3521	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	9674854	9674854	A	G	exonic	DHRS7C	NaN	nonsynonymous SNV	DHRS7C:NM_001105571:exon6:c.T887C:p.V296A,DHRS7C:NM_001220493:exon6:c.T890C:p.V297A	NaN	NaN	NaN	0	D	0.962	D	0.534	P	0.000	D	1.000	D	1.32	L	-2.23	D	0.254	D	0.578	D	0.85	2.888	15.62	5.5	2.302	8.435	14.736	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.702247		KEEP	121	113	8	0
chr17	9680451	9680451	T	C	intronic	DHRS7C	NaN	NaN	NaN	rs2272033	NaN	0.258387	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	308	65	243	36
chr17	970293	970293	G	T	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr17	970297	970297	A	T	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr17	970298	970298	G	T	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr17	970300	970300	T	G	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	2	5	0
chr17	975830	975830	G	A	intronic	ABR	NaN	NaN	NaN	rs77792616	NaN	0.0698882	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	65	6	59	15
chr17	9763181	9763181	T	T	intronic	GLP2R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr17	9774060	9774060	C	A	intronic	GLP2R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.811365	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	496	485	11	0
chr17	9783855	9783855	A	G	intronic	GLP2R	NaN	NaN	NaN	rs2277690	ID=COSN165328;OCCURENCE=1(breast)	0.46226	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	126	100	26	35
chr17	9783876	9783876	A	C	intronic	GLP2R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.549187	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	137	126	11	0
chr17	9792768	9792768	G	A	exonic	GLP2R	NaN	nonsynonymous SNV	GLP2R:NM_004246:exon13:c.G1408A:p.D470N	rs17681684	NaN	0.100639	0.65	T	0.0	B	0.0	B	0.075	N	1.000	P	-0.43	N	0.61	T	-0.958	T	0.000	T	0.008	0.853	8.451	1.83	-0.146	0.930	5.428	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	86	74	12	29
chr17	9801384	9801384	T	T	UTR3	RCVRN	NM_002903:c.*28A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr17	9820739	9820739	A	G	intronic	GAS7	NaN	NaN	NaN	rs11078821	NaN	0.418331	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	29	1	28	35
chr17	9821299	9821299	C	G	intronic	GAS7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0224538080610048	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr17	9830254	9830254	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	15	1	7,6	0
chr17	9830256	9830256	C	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	7	1	2,4	0
chr17	9830257	9830257	A	A	intronic	GAS7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr17	9835434	9835434	A	G	intronic	GAS7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr17	995074	995074	T	C	exonic	ABR	NaN	nonsynonymous SNV	ABR:NM_001092:exon3:c.A251G:p.K84R,ABR:NM_001159746:exon4:c.A224G:p.K75R,ABR:NM_021962:exon4:c.A362G:p.K121R	NaN	NaN	NaN	0.32	T	0.573	P	0.33	B	0.000	D	1.000	D	0.935	L	-0.0	T	-0.860	T	0.186	T	0.289	4.059	20.9	6.04	2.317	5.128	15.412	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.417812	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	18	11	7	0
chr18	10045865	10045865	A	C	intergenic	VAPA,LINC01254	dist=85847;dist=359265	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	10194649	10194649	A	G	intergenic	VAPA,LINC01254	dist=234631;dist=210481	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	10338355	10338355	T	C	intergenic	VAPA,LINC01254	dist=378337;dist=66775	NaN	NaN	rs6505546	NaN	0.134185	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	10455034	10455034	A	T	exonic	APCDD1	NaN	nonsynonymous SNV	APCDD1:NM_153000:exon1:c.A56T:p.H19L	NaN	NaN	NaN	0.77	T	0.065	B	0.04	B	0.125	U	0.588	N	1.04	L	1.38	T	-0.994	T	0.068	T	0.537	2.231	13.42	2.32	0.455	2.906	7.112	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.877653	clustered_read_position	REJECT	15	12	3	0
chr18	10455036	10455036	G	T	exonic	APCDD1	NaN	nonsynonymous SNV	APCDD1:NM_153000:exon1:c.G58T:p.G20W	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.001	N	1.000	D	1.445	L	1.17	T	-0.802	T	0.168	T	0.579	7.681	39	3.49	1.816	4.627	13.441	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.478065	clustered_read_position	REJECT	15	12	3	0
chr18	10455076	10455076	GA	G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	49.2945	0	NaN	NA	NA	6	0	5	0
chr18	10471972	10471972	C	T	exonic	APCDD1	NaN	nonsynonymous SNV	APCDD1:NM_153000:exon3:c.C688T:p.L230F	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.715	M	1.05	T	-0.403	T	0.287	T	0.942	3.677	18.69	4.42	2.477	4.588	14.193	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.75662	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	427	420	7	0
chr18	10472233	10472233	G	G	intronic	APCDD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	10488115	10488115	A	A	UTR3	APCDD1	NM_153000:c.*80A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr18	10549106	10549106	A	A	intronic	NAPG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr18	10680132	10680132	C	T	intronic	PIEZO2	NaN	NaN	NaN	rs688237	NaN	0.665935	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	75	1	74	28
chr18	10696401	10696401	A	C	exonic	PIEZO2	NaN	nonsynonymous SNV	PIEZO2:NM_022068:exon42:c.T6625G:p.W2209G	NaN	NaN	NaN	0.32	T	0.018	B	0.015	B	0.000	D	1.000	D	2.42	M	-1.92	D	-0.179	T	0.532	D	0.661	2.369	13.88	5.16	1.955	5.888	11.650	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.239674	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	16	11	5	0
chr18	10696534	10696534	C	T	exonic	PIEZO2	NaN	synonymous SNV	PIEZO2:NM_022068:exon42:c.G6492A:p.T2164T	rs117799245	NaN	0.0157748	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.55073	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	107	60	47	2
chr18	10762900	10762900	C	C	intronic	PIEZO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr18	10787200	10787200	A	G	intronic	PIEZO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.052941176470588346	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	5	4	0
chr18	10800271	10800271	A	C	intronic	PIEZO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr18	10800276	10800276	A	G	intronic	PIEZO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	13	6	7	0
chr18	10856858	10856858	C	T	intronic	PIEZO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.663001	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	169	163	6	0
chr18	10871423	10871423	A	G	intronic	PIEZO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr18	10907742	10907742	T	C	intronic	PIEZO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	3	5	0
chr18	11047726	11047726	A	A	intronic	PIEZO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	11047727	11047727	C	C	intronic	PIEZO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	11047728	11047728	A	A	intronic	PIEZO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	11072848	11072848	G	A	intronic	PIEZO2	NaN	NaN	NaN	rs4797498	NaN	0.639377	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	11378338	11378338	A	C	intergenic	PIEZO2,LINC01255	dist=229577;dist=110231	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr18	11753965	11753965	T	G	intronic	GNAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	11753967	11753967	T	A	intronic	GNAL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	11881158	11881158	G	T	UTR3	GNAL	NM_182978:c.*24G>T,NM_001142339:c.*24G>T,NM_001261443:c.*24G>T,NM_001261444:c.*24G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.67312	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	180	171	9	0
chr18	11888594	11888594	G	C	intronic	MPPE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	11888595	11888595	T	G	intronic	MPPE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	12012337	12012337	A	A	intronic	IMPA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr18	12014412	12014412	A	G	intronic	IMPA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.272327	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	387	368	19	0
chr18	12030206	12030206	T	C	intronic	IMPA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr18	12030612	12030612	T	C	UTR3	IMPA2	NM_014214:c.*155T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr18	12092364	12092364	C	A	intergenic	IMPA2,ANKRD62	dist=61479;dist=1484	NaN	NaN	rs13381564	NaN	0.505591	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	12263038	12263038	G	C	intronic	CIDEA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	12308273	12308273	G	T	UTR5	TUBB6	NM_001303524:c.-19G>T,NM_001303530:c.-16954G>T,NM_001303525:c.-19G>T,NM_001303528:c.-12389G>T,NM_001303529:c.-16954G>T,NM_032525:c.-19G>T,NM_001303526:c.-19G>T,NM_001303527:c.-2719G>T	NaN	NaN	rs11548177	NaN	0.128994	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	12308793	12308793	G	C	exonic	TUBB6	NaN	synonymous SNV	TUBB6:NM_001303525:exon2:c.G165C:p.S55S,TUBB6:NM_001303526:exon2:c.G165C:p.S55S,TUBB6:NM_032525:exon2:c.G165C:p.S55S,TUBB6:NM_001303524:exon3:c.G165C:p.S55S	rs11267036	NaN	0.129393	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	45.398159	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	16	21	11
chr18	12351236	12351236	A	G	intronic	AFG3L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.912023	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	212	201	11	0
chr18	12353178	12353178	A	T	intronic	AFG3L2	NaN	NaN	NaN	rs9966470	NaN	0.123003	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	225.498	0	NaN	NA	NA	112	69	43	6
chr18	12358984	12358984	A	G	intronic	AFG3L2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr18	12359882	12359882	G	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	1	3,2	0
chr18	12397568	12397568	A	G	intergenic	AFG3L2,SLMO1	dist=20293;dist=10327	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	12449459	12449459	T	C	UTR3	SPIRE1	NM_001128626:c.*178A>G,NM_020148:c.*178A>G,NM_001128627:c.*178A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr18	12452452	12452452	A	G	intronic	SPIRE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.014997	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	272	266	6	0
chr18	12479666	12479666	T	T	intronic	SPIRE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr18	12495940	12495940	T	A	intronic	SPIRE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	16	8	4	0
chr18	12686456	12686456	A	A	intronic	CEP76,PSMG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr18	12702610	12702610	G	A	UTR5	CEP76	NM_024899:c.-63C>T,NM_001271989:c.-63C>T	NaN	NaN	rs4797701	NaN	0.176318	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	149.789	0	NaN	NA	NA	36	14	22	11
chr18	12718542	12718542	A	C	exonic	PSMG2	NaN	nonsynonymous SNV	PSMG2:NM_020232:exon4:c.A315C:p.K105N,PSMG2:NM_147163:exon4:c.A222C:p.K74N	NaN	NaN	NaN	0.44	T	0.833	P	0.582	P	0.028	N	0.827	N	0.93	L	.	.	-0.977	T	0.060	T	0.12	3.117	16.42	-3.78	-0.209	-1.010	6.717	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.045126100517617174	NA	0	0	NaN	NA	NA	205	149	56	0
chr18	12718543	12718543	C	A	exonic	PSMG2	NaN	nonsynonymous SNV	PSMG2:NM_020232:exon4:c.C316A:p.L106M,PSMG2:NM_147163:exon4:c.C223A:p.L75M	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.999	D	0.966	D	0.000	D	1.000	D	2.125	M	.	.	-0.288	T	0.402	T	0.364	3.498	17.88	5.44	2.557	0.286	14.573	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.028877187982489082	NA	0	0	NaN	NA	NA	238	182	56	0
chr18	12751823	12751823	A	G	intergenic	LOC100996324,PTPN2	dist=2402;dist=33654	NaN	NaN	rs11080598	NaN	0.405551	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	12802161	12802161	A	G	intronic	PTPN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	12826016	12826016	A	G	intronic	PTPN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.372439	nearby_gap_events	REJECT	99	93	6	0
chr18	12985358	12985358	A	A	UTR3	SEH1L	NM_031216:c.*107A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr18	13038248	13038248	T	G	intronic	CEP192	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.731283	nearby_gap_events	REJECT	61	51	10	0
chr18	13087289	13087289	G	T	intronic	CEP192	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.867036	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	150	138	12	0
chr18	13087408	13087408	A	G	intronic	CEP192	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	13116432	13116432	G	T	exonic	CEP192	NaN	nonsynonymous SNV	CEP192:NM_032142:exon43:c.G7346T:p.R2449L	rs1786263	NaN	0.775559	1	T	0.001	B	0.0	B	0.000	N	1.000	P	-2.045	N	3.54	T	-1.000	T	0.000	T	0.142	-0.277	2.675	4.76	0.785	0.755	4.897	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	213.395985	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	73	2	71	49
chr18	13116533	13116533	A	A	intronic	CEP192	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr18	13162202	13162202	A	C	intergenic	CEP192,LDLRAD4	dist=37151;dist=56527	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr18	13367549	13367549	C	G	intronic	LDLRAD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	21	5	16	0
chr18	13682209	13682209	C	A	intronic	FAM210A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr18	14105047	14105047	T	A	exonic	ZNF519	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF519:NM_145287:exon3:c.A1492T:p.T498S	NaN	NaN	NaN	1	T	0.012	B	0.021	B	.	.	1.000	N	-0.55	N	.	.	-0.976	T	0.027	T	0.055	-1.608	0.013	0.646	0.552	-0.489	5.628	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03606106950401307	NA	0	0	NaN	NA	NA	51	32	19	0
chr18	14522516	14522516	T	A	intronic	POTEC	NaN	NaN	NaN	rs111259201	NaN	0.0425319	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	126.026	0	NaN	NA	NA	51	22	29	4
chr18	14542909	14542909	G	A	exonic	POTEC	NaN	synonymous SNV	POTEC:NM_001137671:exon1:c.C237T:p.N79N	rs8040519	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	79.2353	0	NaN	NA	NA	37	14	23	11
chr18	14752957	14752957	G	A	exonic	ANKRD30B	NaN	synonymous SNV	ANKRD30B:NM_001145029:exon3:c.G456A:p.L152L	rs12457503	NaN	0.519968	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	142.230803	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	113	55	58	44
chr18	14753086	14753086	A	A	intronic	ANKRD30B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr18	14797771	14797771	A	T	intronic	ANKRD30B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.921829	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	46	42	4	0
chr18	14797773	14797773	C	G	intronic	ANKRD30B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.821472	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	46	42	4	0
chr18	14998781	14998781	T	T	intergenic	LINC01443,LOC644669	dist=25026;dist=314774	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	18562886	18562886	G	T	intronic	ROCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.342966	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	201	185	16	0
chr18	18564243	18564243	A	C	intronic	ROCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr18	18564244	18564244	T	G	intronic	ROCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr18	18564245	18564245	G	A	intronic	ROCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr18	18586835	18586835	A	A	intronic	ROCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr18	18603666	18603666	G	A	intronic	ROCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.103581	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	152	142	10	0
chr18	18622252	18622252	G	T	intronic	ROCK1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr18	19057341	19057341	A	C	intronic	GREB1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr18	19057344	19057344	C	G	intronic	GREB1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	19057345	19057345	A	G	intronic	GREB1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	19057347	19057347	T	A	intronic	GREB1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	19057349	19057349	T	G	intronic	GREB1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	19085321	19085321	T	T	intronic	GREB1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr18	19085720	19085720	T	T	intronic	GREB1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr18	19085756	19085756	C	G	intronic	GREB1L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.022498	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	123	112	11	0
chr18	19100758	19100758	A	ATCT	exonic	GREB1L	NaN	nonframeshift substitution	GREB1L:NM_001142966:exon32:c.5582_5582delinsATCT	NaN	NaN	0.995407	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	150.789	0	NaN	NA	NA	50	17	26	15
chr18	19128102	19128102	T	C	intronic	ESCO1	NaN	NaN	NaN	rs8090799	NaN	0.422125	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	192763	192763	T	C	intronic	USP14	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	5	4	0
chr18	19282497	19282497	G	T	intronic	ABHD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.479333	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	185	166	19	0
chr18	19282498	19282498	T	G	intronic	ABHD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.673372	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	145	125	20	0
chr18	19282499	19282499	T	G	intronic	ABHD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.573882	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	212	185	27	0
chr18	19282502	19282502	A	T	intronic	ABHD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	69.088409	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	186	141	45	0
chr18	19282515	19282515	A	ATTTTG	intronic	ABHD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.591653	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	610.221	0	NaN	NA	NA	233	102	115	29
chr18	19282516	19282516	T	TTTTG	intronic	ABHD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.58556	0	NaN	NA	NA	270	126	57	2
chr18	19353731	19353731	A	G	intronic	MIB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	13	10	3	0
chr18	19371619	19371619	A	A	intronic	MIB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr18	19395813	19395813	A	T	intronic	MIB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	14	8	4	0
chr18	19399662	19399662	A	A	intronic	MIB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	8	0	0
chr18	19418605	19418605	A	C	intronic	MIB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr18	19427165	19427165	A	C	intronic	MIB1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr18	19756772	19756772	G	C	intronic	GATA6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.653007	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	2	0	2	0
chr18	19927153	19927153	A	A	intergenic	GATA6,CTAGE1	dist=144662;dist=66411	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	19927155	19927155	G	G	intergenic	GATA6,CTAGE1	dist=144664;dist=66409	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	19927158	19927158	A	A	intergenic	GATA6,CTAGE1	dist=144667;dist=66406	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	19995753	19995753	T	C	exonic	CTAGE1	NaN	synonymous SNV	CTAGE1:NM_172241:exon1:c.A2022G:p.P674P	rs9946145	NaN	0.685503	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	207.745687	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	77	0	77	56
chr18	204816	204816	T	A	intronic	USP14	NaN	NaN	NaN	rs77098792	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	924.977	0	9.151564	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	104	86	18	0
chr18	20529506	20529506	A	C	intronic	RBBP8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	20562033	20562033	T	C	intronic	RBBP8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.488165	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	79	75	4	0
chr18	20577456	20577456	T	A	intronic	RBBP8	NaN	NaN	NaN	rs2305886	NaN	0.429912	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	257.357	0	NaN	NA	NA	148	0	148	23
chr18	20606176	20606176	T	C	exonic	RBBP8	NaN	nonsynonymous SNV	RBBP8:NM_203292:exon18:c.T2570C:p.L857P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.027	B	0.018	B	.	.	1.000	D	.	.	1.44	T	-1.079	T	0.058	T	.	1.071	9.371	3.34	0.437	0.366	5.469	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	94	59	35	1
chr18	20716316	20716316	T	T	exonic	CABLES1	NaN	synonymous SNV	CABLES1:NM_001100619:exon1:c.T590T:p.L197L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr18	20716670	20716670	T	A	intronic	CABLES1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	17	16	1	0
chr18	20757920	20757920	T	C	intronic	CABLES1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	20877628	20877628	G	A	UTR3	TMEM241	NM_032933:c.*343C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr18	20953586	20953586	T	T	intronic	TMEM241	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	54	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr18	20964885	20964885	T	T	intronic	TMEM241	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr18	21017751	21017751	C	A	exonic	TMEM241	NaN	synonymous SNV	TMEM241:NM_032933:exon1:c.G66T:p.T22T	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.948	T	0.179	T	.	6.179	37	2.51	0.341	0.608	5.308	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.07812	0	NaN	NA	NA	12	10	2	0
chr18	21017941	21017941	A	T	upstream	TMEM241	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr18	21047324	21047324	T	T	intronic	RIOK3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	21055092	21055092	A	C	intronic	RIOK3	NaN	NaN	NaN	rs7235571	NaN	0.919928	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	259.37	0	73.722666	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	24	0	24	35
chr18	21083738	21083738	C	T	intronic	C18orf8	NaN	NaN	NaN	rs303760	NaN	0.170527	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.377157	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	15
chr18	21107906	21107906	C	A	intronic	C18orf8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.359062	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	165	146	19	0
chr18	21152088	21152088	C	A	exonic	NPC1	NaN	nonsynonymous SNV	NPC1:NM_000271:exon3:c.G237T:p.Q79H	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	3.285	M	-3.9	D	1.034	D	0.933	D	0.928	4.381	23.1	5.19	2.890	1.631	11.499	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	60	41	19	0
chr18	21294127	21294127	A	C	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	rs199550712	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.20588235294117738	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr18	21294177	21294177	A	A	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	21338551	21338551	A	A	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	21390286	21390286	T	T	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr18	21395602	21395602	A	A	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr18	21413760	21413760	A	T	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr18	21425135	21425135	A	A	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	17	12	0	0
chr18	21426244	21426244	T	T	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	21441717	21441717	C	T	exonic	LAMA3	NaN	synonymous SNV	LAMA3:NM_001127717:exon35:c.C4530T:p.P1510P,LAMA3:NM_198129:exon35:c.C4530T:p.P1510P	rs12965685	NaN	0.340655	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	140.76108	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	51	1	50	47
chr18	214612	214612	A	G	UTR3	THOC1	NM_005131:c.*14T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.556912	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	52	46	6	0
chr18	21474190	21474190	A	A	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	76	57	0	0
chr18	21474812	21474812	T	C	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.637532	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	246	231	15	0
chr18	21479106	21479106	A	A	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	5	2	0	0
chr18	21480936	21480936	A	G	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr18	21480939	21480939	T	C	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr18	21480940	21480940	C	A	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	12	6	5	0
chr18	21480941	21480941	T	C	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	13	8	5	0
chr18	21480942	21480942	G	A	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	14	7	6	0
chr18	21480943	21480943	T	A	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	14	8	5	0
chr18	21494726	21494726	G	T	exonic	LAMA3	NaN	stopgain	LAMA3:NM_001127718:exon20:c.G2551T:p.G851X,LAMA3:NM_000227:exon21:c.G2719T:p.G907X,LAMA3:NM_001127717:exon57:c.G7378T:p.G2460X,LAMA3:NM_198129:exon58:c.G7546T:p.G2516X	NaN	NaN	NaN	0.56	T	.	.	.	.	.	.	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	11.099	44	0.682	0.219	0.286	7.360	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.810281	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	24	18	6	0
chr18	21494727	21494727	G	A	exonic	LAMA3	NaN	nonsynonymous SNV	LAMA3:NM_001127718:exon20:c.G2552A:p.G851E,LAMA3:NM_000227:exon21:c.G2720A:p.G907E,LAMA3:NM_001127717:exon57:c.G7379A:p.G2460E,LAMA3:NM_198129:exon58:c.G7547A:p.G2516E	NaN	NaN	NaN	1	T	0.004	B	0.01	B	.	.	1.000	N	0.69	N	3.74	T	-0.946	T	0.021	T	0.056	-1.946	0.007	1.2	0.049	0.566	5.607	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.631171	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	24	18	6	0
chr18	21512302	21512302	A	A	intronic	LAMA3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr18	21705526	21705526	A	T	intronic	TTC39C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.190035	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	177	163	14	0
chr18	21710321	21710321	C	T	exonic	TTC39C	NaN	synonymous SNV	TTC39C:NM_001292030:exon7:c.C642T:p.N214N,TTC39C:NM_001135993:exon12:c.C1563T:p.N521N,TTC39C:NM_153211:exon12:c.C1380T:p.N460N	rs12970083	NaN	0.991613	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	103.047	0	NaN	NA	NA	94	0	94	38
chr18	21735833	21735833	C	T	exonic	CABYR	NaN	nonsynonymous SNV	CABYR:NM_138643:exon2:c.C74T:p.P25L,CABYR:NM_153768:exon3:c.C314T:p.P105L,CABYR:NM_012189:exon4:c.C368T:p.P123L,CABYR:NM_138644:exon4:c.C368T:p.P123L,CABYR:NM_153769:exon4:c.C368T:p.P123L,CABYR:NM_153770:exon4:c.C368T:p.P123L	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	1.7	L	0.71	T	-0.378	T	0.352	T	0.664	3.083	16.29	5.82	2.753	4.445	16.997	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.710556	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	137	132	5	0
chr18	21744961	21744961	T	C	intronic	OSBPL1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	1	4	0
chr18	21745012	21745012	C	T	intronic	OSBPL1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.04156417157755862	NA	0	0	NaN	NA	NA	83	61	22	0
chr18	219029	219029	G	A	intronic	THOC1	NaN	NaN	NaN	rs1784834	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	23.1213	0	8.157559	normal_lod,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	8	4	4	9
chr18	219072	219072	A	G	intronic	THOC1	NaN	NaN	NaN	rs1784833	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	23.1213	0	8.375754	poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	8	4	4	8
chr18	21912873	21912873	A	C	intronic	OSBPL1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	21912874	21912874	T	A	intronic	OSBPL1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	21948407	21948407	A	G	intronic	OSBPL1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr18	22008813	22008813	T	G	intronic	IMPACT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.304328	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	318	291	27	0
chr18	22017752	22017752	C	A	intronic	IMPACT	NaN	NaN	NaN	rs1941814	NaN	0.789537	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	88.2144	0	8.735998	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	5
chr18	22020543	22020543	C	G	exonic	IMPACT	NaN	nonsynonymous SNV	IMPACT:NM_018439:exon6:c.C451G:p.L151V	rs677688	NaN	0.871206	0.38	T	0.0	B	0.0	B	0.453	N	1.000	P	-1.795	N	1.55	T	-1.026	T	0.000	T	0.151	-0.962	0.320	2.38	0.203	0.781	4.381	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	58.799421	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	0	21	58
chr18	22040952	22040952	A	T	intronic	HRH4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr18	22057455	22057455	G	A	exonic	HRH4	NaN	nonsynonymous SNV	HRH4:NM_001143828:exon2:c.G838A:p.A280T,HRH4:NM_021624:exon3:c.G1102A:p.A368T	NaN	NaN	NaN	0.09	T	1.0	D	0.998	D	0.000	N	1.000	D	2.43	M	0.98	T	-0.686	T	0.242	T	0.313	4.859	27.7	4.21	0.837	6.680	10.256	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.238403	nearby_gap_events	REJECT	112	105	7	0
chr18	224184	224184	C	G	intronic	THOC1	NaN	NaN	NaN	rs631343	NaN	0.701078	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	88.2151	0	18.712227	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	7
chr18	22669589	22669589	A	A	intronic	ZNF521	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	12	8	0	0
chr18	23598446	23598446	G	A	intronic	SS18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr18	23637732	23637732	A	A	intronic	SS18	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr18	23737942	23737942	T	T	intronic	PSMA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr18	23738314	23738314	A	A	intronic	PSMA8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr18	23772322	23772322	A	T	exonic	PSMA8	NaN	nonsynonymous SNV	PSMA8:NM_001025096:exon7:c.A700T:p.I234L,PSMA8:NM_001025097:exon7:c.A586T:p.I196L,PSMA8:NM_144662:exon7:c.A718T:p.I240L	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.016	B	0.005	B	0.000	D	0.999	D	0.55	N	0.99	T	-1.078	T	0.067	T	0.44	2.861	15.53	4.49	2.037	1.486	10.403	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.095554	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	155	144	11	0
chr18	23807177	23807177	G	A	exonic	TAF4B	NaN	nonsynonymous SNV	TAF4B:NM_001293725:exon1:c.G280A:p.V94I,TAF4B:NM_005640:exon1:c.G280A:p.V94I	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.984	D	0.952	D	0.017	N	0.991	N	1.155	L	1.9	T	-1.057	T	0.100	T	0.19	2.237	13.44	4.7	2.140	2.249	13.118	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.706077		KEEP	30	26	4	0
chr18	23866482	23866482	C	T	intronic	TAF4B	NaN	NaN	NaN	rs8089000	NaN	0.333666	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.071844	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	14	4	23
chr18	24035648	24035648	T	C	UTR3	KCTD1	NM_001136205:c.*59A>G,NM_001258221:c.*59A>G,NM_001142730:c.*59A>G,NM_198991:c.*59A>G,NM_001258222:c.*59A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.346658	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	242	200	42	4
chr18	24044933	24044933	A	T	intronic	KCTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	24044934	24044934	A	G	intronic	KCTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	24081318	24081318	A	A	intronic	KCTD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	24	22	0	0
chr18	24445514	24445514	T	A	ncRNA_intronic	AQP4-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	246345	246345	T	G	exonic	THOC1	NaN	synonymous SNV	THOC1:NM_005131:exon11:c.A897C:p.A299A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.015929	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	84	76	8	0
chr18	25033749	25033749	G	C	intergenic	CHST9,CDH2	dist=268447;dist=497181	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	25033750	25033750	C	A	intergenic	CHST9,CDH2	dist=268448;dist=497180	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	252619	252619	T	G	intronic	THOC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.201827	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	190	179	11	0
chr18	254368	254368	C	A	intronic	THOC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.697048	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	147	133	14	0
chr18	25565548	25565548	T	C	exonic	CDH2	NaN	nonsynonymous SNV	CDH2:NM_001792:exon12:c.A1919G:p.D640G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.603	P	0.471	P	0.000	D	1.000	D	0.255	N	0.7	T	-0.901	T	0.117	T	0.595	3.818	19.39	5.96	2.283	7.649	16.422	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	31	11	19	0
chr18	2563877	2563877	A	A	intronic	METTL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	22	19	0	0
chr18	25714329	25714329	T	C	intronic	CDH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	25727786	25727786	A	G	intronic	CDH2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	8	1	4	0
chr18	25727792	25727792	A	G	intronic	CDH2	NaN	NaN	NaN	rs200241515	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	2575214	2575214	A	T	intronic	NDC80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	2579049	2579049	A	G	intronic	NDC80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	16	4	12	0
chr18	2585243	2585243	A	A	intronic	NDC80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr18	2587771	2587771	T	T	intronic	NDC80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr18	2589175	2589175	T	A	intronic	NDC80	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	4	2	2	0
chr18	2599090	2599090	T	T	exonic	NDC80	NaN	synonymous SNV	NDC80:NM_006101:exon12:c.T1294T:p.S432S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	61	54	0	0
chr18	2636637	2636637	G	T	intergenic	NDC80,CBX3P2	dist=20003;dist=15532	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	2656248	2656248	G	C	exonic	SMCHD1	NaN	synonymous SNV	SMCHD1:NM_015295:exon1:c.G174C:p.A58A	rs2430853	NaN	0.630591	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	297.722	0	NaN	NA	NA	96	44	52	36
chr18	2688798	2688798	G	A	intronic	SMCHD1	NaN	NaN	NaN	rs637651	NaN	0.814696	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	149.610652	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	49	0	49	58
chr18	2706517	2706517	A	G	intronic	SMCHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	16	9	7	0
chr18	2707396	2707396	T	T	intronic	SMCHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr18	2718406	2718406	C	T	exonic	SMCHD1	NaN	nonsynonymous SNV	SMCHD1:NM_015295:exon19:c.C2432T:p.S811F	NaN	NaN	NaN	0	D	0.978	D	0.758	P	0.001	D	0.568	D	0.805	L	1.68	T	-0.905	T	0.079	T	0.509	1.323	10.34	4.48	1.235	1.311	14.491	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.760647	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	36	33	3	0
chr18	2724930	2724930	A	T	exonic	SMCHD1	NaN	nonsynonymous SNV	SMCHD1:NM_015295:exon21:c.A2637T:p.K879N	rs633422	NaN	0.20627	0.28	T	0.0	B	0.0	B	0.001	D	0.284	P	0.805	L	1.8	T	-0.904	T	0.000	T	0.078	1.977	12.57	3.1	0.363	1.045	5.757	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	207.307638	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	77	2	75	41
chr18	2760782	2760782	T	C	intronic	SMCHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.759216	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	41	35	6	0
chr18	2763632	2763632	A	T	intronic	SMCHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	77	62	15	0
chr18	2763839	2763839	A	T	intronic	SMCHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr18	28587982	28587982	C	T	exonic	DSC3	NaN	nonsynonymous SNV	DSC3:NM_001941:exon11:c.G1663A:p.D555N,DSC3:NM_024423:exon11:c.G1663A:p.D555N	NaN	NaN	NaN	.	.	0.037	B	0.06	B	0.286	N	0.746	N	1.345	L	0.14	T	-0.956	T	0.141	T	0.064	1.643	11.45	5.08	2.793	2.705	6.739	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.725639	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	88	81	7	0
chr18	28604338	28604338	T	T	exonic	DSC3	NaN	synonymous SNV	DSC3:NM_001941:exon6:c.A752A:p.E251E,DSC3:NM_024423:exon6:c.A752A:p.E251E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	165	128	0	0
chr18	28611139	28611139	A	C	splicing	DSC3	NM_024423:exon4:c.155-1T>G,NM_001941:exon4:c.155-1T>G	NaN	NaN	rs276936	NaN	1	.	.	.	.	.	.	.	.	0.000	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	0.698	7.726	4.33	0.777	2.381	13.497	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	109.072	0	NaN	NA	NA	101	0	101	22
chr18	28648847	28648847	T	T	intronic	DSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr18	28662312	28662312	A	C	exonic	DSC2	NaN	nonsynonymous SNV	DSC2:NM_004949:exon9:c.T1155G:p.N385K,DSC2:NM_024422:exon9:c.T1155G:p.N385K	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.835	P	0.728	P	0.073	N	0.970	D	2.12	M	0.72	T	-0.743	T	0.184	T	0.154	3.841	19.51	-2.62	-0.375	-0.521	9.680	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.810191	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	173	167	6	0
chr18	28666371	28666371	T	G	intronic	DSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr18	28666526	28666526	T	A	intronic	DSC2	NaN	NaN	NaN	rs111347888	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.645294	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	143	128	15	0
chr18	28671101	28671101	T	C	exonic	DSC2	NaN	nonsynonymous SNV	DSC2:NM_004949:exon4:c.A364G:p.K122E,DSC2:NM_024422:exon4:c.A364G:p.K122E	NaN	NaN	NaN	0.13	T	0.02	B	0.03	B	0.287	N	1.000	N	2.195	M	0.21	T	-0.926	T	0.162	T	0.22	2.188	13.27	-2.92	-0.778	0.396	8.732	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.973735	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	34	29	5	0
chr18	28671102	28671102	C	T	exonic	DSC2	NaN	synonymous SNV	DSC2:NM_004949:exon4:c.G363A:p.K121K,DSC2:NM_024422:exon4:c.G363A:p.K121K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.940817	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	34	29	5	0
chr18	28672005	28672005	T	T	intronic	DSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	45	36	0	0
chr18	28672342	28672342	A	A	intronic	DSC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr18	28723596	28723596	G	C	ncRNA_intronic	DSCAS	NaN	NaN	NaN	rs2577072	NaN	0.346645	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	54.957855	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	17	22	19
chr18	28734749	28734749	A	G	exonic	DSC1	NaN	synonymous SNV	DSC1:NM_004948:exon5:c.T615C:p.Y205Y,DSC1:NM_024421:exon5:c.T615C:p.Y205Y	rs2249810	NaN	0.478634	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	106.148946	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	35	0	35	44
chr18	28739508	28739508	A	G	ncRNA_intronic	DSCAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.903477	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	121	104	17	0
chr18	28739509	28739509	G	A	ncRNA_intronic	DSCAS	NaN	NaN	NaN	rs201678469	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.36408	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	121	110	11	3
chr18	28739515	28739515	A	T	ncRNA_intronic	DSCAS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.112865	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	160	147	13	0
chr18	2884918	2884918	T	A	intronic	EMILIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	2884919	2884919	A	C	intronic	EMILIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	2884931	2884931	T	T	intronic	EMILIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr18	28906460	28906460	T	T	intronic	DSG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	28906461	28906461	G	G	intronic	DSG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	28913600	28913600	G	T	exonic	DSG1	NaN	nonsynonymous SNV	DSG1:NM_001942:exon7:c.G733T:p.G245W	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.999	D	0.989	D	0.000	D	1.000	D	0.55	N	0.13	T	-0.514	T	0.275	T	0.329	3.629	18.46	5.82	2.739	7.188	20.088	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.394	0	NaN	NA	NA	367	356	48	24
chr18	28916230	28916230	GT	GATT,GATTT,G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	385.311	0	NaN	NA	NA	148	65	37	1
chr18	28918140	28918140	A	G	intronic	DSG1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.901643	nearby_gap_events	REJECT	103	92	11	0
chr18	28968393	28968393	C	T	exonic	DSG4	NaN	stopgain	DSG4:NM_001134453:exon4:c.C280T:p.R94X,DSG4:NM_177986:exon4:c.C280T:p.R94X	NaN	ID=COSM1686268,COSM1686269;OCCURENCE=2(skin)	NaN	0.6	T	.	.	.	.	0.010	N	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3.933	20.1	3.98	1.476	0.418	13.385	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	7.382877389928898E-33	Somatic	508.542	193	406.615309	nearby_gap_events	REJECT	651	443	208	0
chr18	28980742	28980742	T	A	ncRNA_intronic	DSG1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	14	7	7	0
chr18	28986365	28986365	A	A	ncRNA_intronic	DSG1-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr18	29045523	29045523	A	A	intronic	DSG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	29046727	29046727	A	A	intronic	DSG3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr18	29101081	29101081	A	G	exonic	DSG2	NaN	nonsynonymous SNV	DSG2:NM_001943:exon5:c.A398G:p.D133G	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.927	P	0.855	P	0.001	U	0.999	D	2.395	M	-0.75	T	0.177	D	0.553	D	0.911	0.845	8.414	5.72	2.180	6.075	15.996	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.607568	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	21	15	6	1
chr18	29104771	29104771	T	G	exonic	DSG2	NaN	nonsynonymous SNV	DSG2:NM_001943:exon8:c.T934G:p.F312V	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.955	P	0.577	P	0.000	D	1.000	D	1.555	L	0.74	T	-0.936	T	0.145	T	0.648	2.564	14.53	4.27	1.051	2.275	9.759	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.48443	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	123	118	5	0
chr18	2913031	2913031	C	G	intronic	EMILIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr18	2913035	2913035	T	A	intronic	EMILIN2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr18	2913172	2913172	G	T	exonic	EMILIN2	NaN	nonsynonymous SNV	EMILIN2:NM_032048:exon8:c.G2932T:p.A978S	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.998	D	0.983	D	0.000	D	0.997	D	1.715	L	3.9	T	-1.208	T	0.038	T	0.452	4.518	24.3	5.61	2.808	6.881	20.009	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.005883407736920422	NA	0	0	NaN	NA	NA	338	263	75	41
chr18	29178491	29178491	G	C	intronic	TTR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.17	T	.	.	.	.	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-1.004	T	0.048	T	.	-0.773	0.752	-8.2	-1.446	-0.106	1.813	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.219877	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	601	574	27	0
chr18	29205747	29205747	A	C	intronic	B4GALT6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.671209	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	166	156	10	0
chr18	2922071	2922071	G	T	exonic	LPIN2	NaN	synonymous SNV	LPIN2:NM_014646:exon17:c.C2301A:p.P767P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	72	53	19	0
chr18	29340660	29340660	A	A	UTR5	SLC25A52	NM_001034172:c.-6T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr18	29429477	29429477	A	C	intronic	TRAPPC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	2	2	0
chr18	29429481	29429481	T	A	intronic	TRAPPC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr18	29429637	29429637	T	G	exonic	TRAPPC8	NaN	nonsynonymous SNV	TRAPPC8:NM_014939:exon25:c.A3627C:p.K1209N	NaN	NaN	NaN	0.5	T	0.061	B	0.073	B	0.000	D	1.000	D	1.78	L	2.26	T	-1.093	T	0.041	T	0.109	1.335	10.38	3.48	0.486	1.342	9.941	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.17343	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	698	667	31	0
chr18	29437400	29437400	A	G	intronic	TRAPPC8	NaN	NaN	NaN	rs3810001	NaN	0.346645	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	77.957441	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	59	26	33	29
chr18	29438035	29438035	T	A	intronic	TRAPPC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	2.247389	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	25	23	2	0
chr18	29481051	29481051	A	A	intronic	TRAPPC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	29488503	29488503	A	G	intronic	TRAPPC8	NaN	NaN	NaN	rs186545028	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	22	12	7	0
chr18	29488617	29488617	T	A	intronic	TRAPPC8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.409098	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	15	8	7	1
chr18	29547078	29547078	G	A	intergenic	TRAPPC8,RNF125	dist=23987;dist=51367	NaN	NaN	rs61740662	NaN	0.349641	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	29691544	29691544	C	G	intronic	RNF138	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	29771721	29771721	G	A	intronic	MEP1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr18	29771724	29771724	T	G	intronic	MEP1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr18	29775270	29775270	T	T	intronic	MEP1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr18	29787878	29787878	G	C	intronic	MEP1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr18	29787884	29787884	T	G	intronic	MEP1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr18	29788278	29788278	C	T	intronic	MEP1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	29788279	29788279	A	C	intronic	MEP1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	29796948	29796948	T	C	intronic	MEP1B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	14	9	4	0
chr18	3025464	3025464	A	G	intergenic	LPIN2,MYOM1	dist=13519;dist=41341	NaN	NaN	rs7229727	NaN	0.533946	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	30672801	30672801	A	A	exonic	CCDC178	NaN	synonymous SNV	CCDC178:NM_001105528:exon20:c.T2312T:p.L771L,CCDC178:NM_198995:exon20:c.T2198T:p.L733L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	41	29	0	0
chr18	3067475	3067475	A	G	exonic	MYOM1	NaN	nonsynonymous SNV	MYOM1:NM_019856:exon37:c.T4555C:p.S1519P,MYOM1:NM_003803:exon38:c.T4843C:p.S1615P	rs375289350	NaN	NaN	0.36	T	0.001	B	0.006	B	0.299	N	1.000	N	1.405	L	-0.37	T	-1.016	T	0.146	T	0.096	0.356	5.932	-1.21	-0.444	1.737	1.815	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.018721	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	476	468	8	0
chr18	3071724	3071724	T	G	intronic	MYOM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	1	2	0
chr18	3071725	3071725	G	A	intronic	MYOM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr18	3071727	3071727	A	T	intronic	MYOM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr18	3089521	3089521	C	CT	intronic	MYOM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	154.372	0	NaN	NA	NA	19	0	2	2
chr18	30913047	30913047	A	C	intronic	CCDC178	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1400000000000002	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr18	31320304	31320304	G	A	exonic	ASXL3	NaN	nonsynonymous SNV	ASXL3:NM_030632:exon11:c.G2936A:p.R979K	NaN	NaN	NaN	0.58	T	0.908	P	0.277	B	0.220	N	0.852	D	0.9	L	0.25	T	-0.936	T	0.153	T	0.509	3.352	17.29	4.79	1.389	8.540	14.584	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.003204	nearby_gap_events	REJECT	51	45	6	0
chr18	31599249	31599249	T	C	intronic	NOL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	11	3	8	0
chr18	31684946	31684946	A	T	intronic	NOL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	31.457171	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	233	202	31	0
chr18	31709822	31709822	T	C	intronic	NOL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.312605	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	138	116	22	0
chr18	32395867	32395867	A	A	intronic	DTNA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	112	96	0	0
chr18	32453817	32453817	A	C	intronic	DTNA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	32453819	32453819	C	A	intronic	DTNA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	32455398	32455398	A	A	intronic	DTNA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr18	32459779	32459779	A	A	intronic	DTNA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr18	3272874	3272874	T	A	intronic	MYL12B	NaN	NaN	NaN	rs7407072	NaN	0.928914	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	118	NaN	NA	NA	44	3	41	0
chr18	3277162	3277162	A	T	intronic	MYL12B	NaN	NaN	NaN	rs1954839	NaN	0.929313	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	64.391297	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	4	35	26
chr18	3277436	3277436	A	A	intronic	MYL12B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr18	32843659	32843659	A	A	intronic	ZSCAN30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr18	32843660	32843660	T	T	intronic	ZSCAN30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr18	32843661	32843661	A	A	intronic	ZSCAN30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr18	32843663	32843663	A	A	intronic	ZSCAN30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr18	32843757	32843757	C	G	intronic	ZSCAN30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr18	32843758	32843758	C	A	intronic	ZSCAN30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr18	32920652	32920652	A	A	UTR5	ZNF24	NM_006965:c.-38T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	32953702	32953702	T	T	intronic	ZNF396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	55	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr18	32953733	32953733	C	T	intronic	ZNF396	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.929523	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	154	147	7	0
chr18	33077660	33077660	A	G	intronic	INO80C	NaN	NaN	NaN	rs189576	NaN	0.376398	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.706406	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	19	12	7	33
chr18	33077706	33077706	C	G	exonic	INO80C	NaN	nonsynonymous SNV	INO80C:NM_001098817:exon1:c.G133C:p.A45P,INO80C:NM_194281:exon1:c.G133C:p.A45P	NaN	NaN	NaN	0.44	T	0.531	P	0.189	B	0.379	N	1.000	N	0	N	.	.	-1.045	T	0.028	T	0.214	1.175	9.780	1.29	0.135	0.339	2.146	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.527922	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	146	135	11	0
chr18	33077707	33077707	T	C	exonic	INO80C	NaN	synonymous SNV	INO80C:NM_001098817:exon1:c.A132G:p.K44K,INO80C:NM_194281:exon1:c.A132G:p.K44K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.452305	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	124	113	11	0
chr18	33234731	33234731	T	T	exonic	GALNT1	NaN	synonymous SNV	GALNT1:NM_020474:exon1:c.T105T:p.D35D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	84	69	0	0
chr18	33331908	33331908	G	T	intergenic	GALNT1,MIR187	dist=40110;dist=152873	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr18	33331910	33331910	T	G	intergenic	GALNT1,MIR187	dist=40112;dist=152871	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr18	334759	334759	G	C	exonic	COLEC12	NaN	nonsynonymous SNV	COLEC12:NM_130386:exon6:c.C1799G:p.P600R	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.92	P	0.523	P	0.501	N	1.000	N	0.69	N	2.26	T	-1.060	T	0.041	T	0.134	1.438	10.75	5.39	2.509	3.114	11.586	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.846239	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	229	211	18	0
chr18	334994	334994	A	G	exonic	COLEC12	NaN	nonsynonymous SNV	COLEC12:NM_130386:exon6:c.T1564C:p.S522P	rs2305025	ID=COSM438093;OCCURENCE=1(breast)	0.6252	0.48	T	0.0	B	0.0	B	0.004	N	1.000	P	-2.235	N	-2.09	D	-0.905	T	0.000	T	0.12	-1.404	0.023	2.81	0.041	0.108	7.425	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.503425	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	25	13	12	48
chr18	33552963	33552963	T	A	intronic	C18orf21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr18	33552964	33552964	T	G	intronic	C18orf21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr18	33552965	33552965	C	A	intronic	C18orf21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr18	33552966	33552966	C	G	intronic	C18orf21	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr18	33691313	33691313	T	G	intronic	SLC39A6	NaN	NaN	NaN	rs1540043	NaN	0.500599	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	106.368	0	NaN	NA	NA	100	60	40	25
chr18	33701884	33701884	C	G	intronic	SLC39A6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr18	33701885	33701885	T	A	intronic	SLC39A6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr18	33704706	33704706	A	C	intronic	SLC39A6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	14	3	11	0
chr18	33718201	33718201	T	C	intronic	ELP2	NaN	NaN	NaN	rs74956437	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.477126	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	115	102	13	0
chr18	33722984	33722984	G	A	intronic	ELP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.307824	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	196	189	7	0
chr18	33722985	33722985	A	T	intronic	ELP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.0494	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	198	189	9	0
chr18	33725874	33725874	T	G	intronic	ELP2	NaN	NaN	NaN	rs1789546	NaN	0.245208	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.964014	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	25	6	29
chr18	33725931	33725931	G	A	exonic	ELP2	NaN	nonsynonymous SNV	ELP2:NM_001242879:exon7:c.G703A:p.V235M,ELP2:NM_001242877:exon9:c.G835A:p.V279M,ELP2:NM_001242878:exon9:c.G835A:p.V279M,ELP2:NM_001242876:exon10:c.G1030A:p.V344M,ELP2:NM_018255:exon10:c.G913A:p.V305M,ELP2:NM_001242875:exon11:c.G1108A:p.V370M	rs1785928	ID=COSM1388588;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.321685	0.14	T	0.0	B	0.004	B	0.000	N	1.000	P	-0.625	N	0.24	T	-0.918	T	0.000	T	0.146	-0.141	3.309	-1.7	-0.180	0.248	7.043	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.978568	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	27	6	30
chr18	33734770	33734770	T	C	intronic	ELP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	19	7	11	0
chr18	33785304	33785304	T	C	intronic	MOCOS	NaN	NaN	NaN	rs667195	NaN	0.997005	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	192.058965	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	62	0	62	58
chr18	33795364	33795364	A	C	intronic	MOCOS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	33795366	33795366	T	A	intronic	MOCOS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr18	33795425	33795425	G	A	intronic	MOCOS	NaN	NaN	NaN	rs631108	NaN	0.835463	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	50.1099	0	NaN	NA	NA	306	0	306	1
chr18	33795508	33795508	C	A	exonic	MOCOS	NaN	nonsynonymous SNV	MOCOS:NM_017947:exon8:c.C1365A:p.D455E	NaN	NaN	NaN	0.07	T	0.995	D	0.992	D	0.000	D	0.929	D	2.4	M	2.27	T	-1.004	T	0.097	T	0.803	2.591	14.62	2.66	1.300	0.484	6.769	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.876909	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	66	50	16	0
chr18	33800205	33800205	A	G	intronic	MOCOS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr18	33848663	33848663	A	ATACAT	UTR3	MOCOS	NM_017947:c.*15A>ATACAT	NaN	NaN	NaN	NaN	0.818091	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1703.36	0	NaN	NA	NA	187	2	164	15
chr18	33878083	33878083	C	T	intronic	FHOD3	NaN	NaN	NaN	rs4438379	NaN	0.177915	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.552828	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	2	0	2	1
chr18	33935443	33935443	T	T	intronic	FHOD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr18	34111967	34111967	T	C	intronic	FHOD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr18	34191864	34191864	T	T	intronic	FHOD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr18	34205385	34205385	A	G	intronic	FHOD3	NaN	NaN	NaN	rs2644253	NaN	0.842053	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	16	4	12	0
chr18	34215505	34215505	G	C	intronic	FHOD3	NaN	NaN	NaN	rs76682740	NaN	0.0543131	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	34298773	34298773	A	T	intronic	FHOD3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	1	4	0
chr18	34340673	34340673	A	T	exonic	FHOD3	NaN	stopgain	FHOD3:NM_001281739:exon22:c.A3952T:p.K1318X,FHOD3:NM_025135:exon23:c.A4003T:p.K1335X,FHOD3:NM_001281740:exon27:c.A4552T:p.K1518X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.001	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	9.475	42	3.87	0.772	4.546	9.867	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	36	11.954653	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	12	7	5	0
chr18	34340674	34340674	A	G	exonic	FHOD3	NaN	nonsynonymous SNV	FHOD3:NM_001281739:exon22:c.A3953G:p.K1318R,FHOD3:NM_025135:exon23:c.A4004G:p.K1335R,FHOD3:NM_001281740:exon27:c.A4553G:p.K1518R	NaN	NaN	NaN	0.37	T	0.06	B	0.067	B	0.001	D	0.986	N	1.845	L	1.48	T	-1.040	T	0.077	T	0.028	2.059	12.84	5.04	1.900	3.584	12.149	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	32	11.536752	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	13	8	5	0
chr18	34377093	34377093	A	A	intronic	TPGS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr18	34378719	34378719	A	A	intronic	TPGS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr18	34409313	34409313	T	T	intronic	KIAA1328	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	7	0	0
chr18	34414278	34414278	C	T	intronic	KIAA1328	NaN	NaN	NaN	rs75167429	NaN	0.0139776	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	64.245701	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	23	27	4
chr18	34465494	34465494	T	A	intronic	KIAA1328	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.63321	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	137	120	17	0
chr18	34465499	34465499	G	T	intronic	KIAA1328	NaN	NaN	NaN	rs367863122	NaN	0.000399361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.489595	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	134	120	14	0
chr18	3457603	3457603	T	T	exonic	TGIF1	NaN	synonymous SNV	TGIF1:NM_001278682:exon3:c.T493T:p.S165S,TGIF1:NM_003244:exon3:c.T484T:p.S162S,TGIF1:NM_170695:exon3:c.T871T:p.S291S,TGIF1:NM_173207:exon3:c.T526T:p.S176S,TGIF1:NM_173209:exon3:c.T424T:p.S142S,TGIF1:NM_173210:exon3:c.T424T:p.S142S,TGIF1:NM_173211:exon3:c.T424T:p.S142S,TGIF1:NM_001278684:exon4:c.T484T:p.S162S,TGIF1:NM_001278686:exon4:c.T424T:p.S142S,TGIF1:NM_173208:exon4:c.T484T:p.S162S,TGIF1:NM_174886:exon4:c.T424T:p.S142S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	112	102	0	0
chr18	346821	346821	C	T	exonic	COLEC12	NaN	synonymous SNV	COLEC12:NM_130386:exon5:c.G801A:p.T267T	rs3826628	ID=COSM1388632;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.233227	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	214.287145	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	146	63	83	24
chr18	34752759	34752759	T	G	intronic	KIAA1328	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr18	34853230	34853230	A	A	intronic	CELF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	34887882	34887882	A	G	intronic	CELF4	NaN	NaN	NaN	rs580548	NaN	0.597244	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr18	34893042	34893042	T	G	intronic	CELF4	NaN	NaN	NaN	rs6507198	NaN	0.401957	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr18	34901815	34901815	C	T	exonic	CELF4	NaN	synonymous SNV	CELF4:NM_001025087:exon3:c.G399A:p.A133A,CELF4:NM_001025088:exon3:c.G399A:p.A133A,CELF4:NM_001025089:exon3:c.G399A:p.A133A,CELF4:NM_020180:exon3:c.G399A:p.A133A	rs41482751	NaN	0.00179712	0.01	D	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	-0.649	T	0.202	T	.	1.640	11.44	3.4	1.183	0.663	8.947	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	123.618	0	NaN	NA	NA	144	64	80	0
chr18	34902125	34902125	T	G	intronic	CELF4	NaN	NaN	NaN	rs12607920	NaN	0.239417	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	34927761	34927761	C	A	intronic	CELF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	34927764	34927764	T	A	intronic	CELF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	34947085	34947085	C	G	intronic	CELF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	17	10	7	0
chr18	34947086	34947086	A	C	intronic	CELF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr18	35065704	35065704	G	T	intronic	CELF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.865396	clustered_read_position	REJECT	7	4	3	0
chr18	35065705	35065705	T	A	intronic	CELF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.363845	clustered_read_position	REJECT	7	4	3	0
chr18	35065706	35065706	G	T	intronic	CELF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.659467	clustered_read_position	REJECT	7	4	3	0
chr18	35120062	35120062	G	C	intronic	CELF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr18	35145627	35145627	A	T	UTR5	CELF4	NM_001025089:c.-23T>A,NM_020180:c.-23T>A,NM_001025088:c.-23T>A,NM_001025087:c.-23T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	31	8	23	0
chr18	3582369	3582369	A	C	intronic	DLGAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	12	5	7	0
chr18	36315014	36315014	G	T	intergenic	MIR4318,LINC00669	dist=1077836;dist=471874	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	39248144	39248144	C	T	intergenic	KC6,PIK3C3	dist=147583;dist=287055	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	39542624	39542624	A	T	intronic	PIK3C3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	46	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr18	39618865	39618865	C	C	intronic	PIK3C3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	134	102	0	0
chr18	39623823	39623823	A	G	intronic	PIK3C3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	22	14	7	0
chr18	40503461	40503461	T	T	intronic	RIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr18	40613715	40613715	T	T	intronic	RIT2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	42281289	42281289	T	T	UTR5	SETBP1	NM_001130110:c.-23T>T,NM_015559:c.-23T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	42329108	42329108	C	C	intronic	SETBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	42329110	42329110	C	C	intronic	SETBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	42618431	42618431	T	T	intronic	SETBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr18	43120213	43120213	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	0	2,3	0
chr18	43128748	43128748	C	G	intronic	SLC14A2	NaN	NaN	NaN	rs2542975	NaN	0.199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	16	8	8	0
chr18	43128888	43128888	T	C	intronic	SLC14A2	NaN	NaN	NaN	rs67098829	NaN	0.164936	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	13	7	6	0
chr18	43212495	43212495	T	G	intronic	SLC14A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	5	1	2	0
chr18	43248218	43248218	T	A	intronic	SLC14A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr18	43248220	43248220	G	A	intronic	SLC14A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	43248221	43248221	T	A	intronic	SLC14A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr18	43249251	43249251	T	G	intronic	SLC14A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	43249253	43249253	T	C	intronic	SLC14A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	43262532	43262532	C	A	UTR3	SLC14A2	NM_001242692:c.*48C>A,NM_007163:c.*48C>A	NaN	NaN	rs3745007	NaN	0.450679	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	293.636	0	NaN	NA	NA	119	59	60	28
chr18	43319060	43319060	T	C	intronic	SLC14A1	NaN	NaN	NaN	rs473429	NaN	0.489617	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	506.892	0	NaN	NA	NA	164	65	99	36
chr18	43405615	43405615	C	T	UTR5	SIGLEC15	NM_213602:c.-79C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1637426900584798	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr18	43420231	43420231	C	T	intronic	SIGLEC15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	17	10	7	0
chr18	43432413	43432413	T	T	UTR3	EPG5	NM_020964:c.*19A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr18	43438081	43438081	A	A	intronic	EPG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr18	43479507	43479507	C	T	exonic	EPG5	NaN	synonymous SNV	EPG5:NM_020964:exon27:c.G4671A:p.Q1557Q	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.411239	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	529	522	7	0
chr18	43481106	43481106	G	A	exonic	EPG5	NaN	nonsynonymous SNV	EPG5:NM_020964:exon26:c.C4501T:p.R1501W	rs370776793	NaN	0.000199681	0.01	D	0.987	D	0.401	B	.	.	0.990	D	1.245	L	2.79	T	-1.056	T	0.024	T	0.187	3.426	17.59	2.29	0.618	2.656	8.509	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.923668	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	399	391	8	0
chr18	43487927	43487927	T	G	exonic	EPG5	NaN	nonsynonymous SNV	EPG5:NM_020964:exon24:c.A4325C:p.Q1442P	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.999	D	0.931	D	.	.	1.000	D	1.735	L	2.8	T	-1.180	T	0.069	T	0.875	4.270	22.3	5.91	2.261	7.097	16.345	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr18	43495639	43495639	A	A	intronic	EPG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr18	43495640	43495640	A	A	intronic	EPG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr18	43496413	43496413	C	T	exonic	EPG5	NaN	nonsynonymous SNV	EPG5:NM_020964:exon18:c.G3374A:p.S1125N	NaN	NaN	NaN	0.94	T	0.082	B	0.096	B	0.113	N	1.000	D	0.75	N	2.82	T	-1.082	T	0.019	T	0.078	1.580	11.24	4.89	1.451	5.856	10.874	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.316049	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	82	76	6	0
chr18	43497821	43497821	A	T	intronic	EPG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr18	43502574	43502574	A	A	intronic	EPG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	19	16	0	0
chr18	43515094	43515094	C	G	intronic	EPG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr18	43515095	43515095	A	G	intronic	EPG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr18	43515096	43515096	A	T	intronic	EPG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr18	43515097	43515097	A	G	intronic	EPG5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr18	43534747	43534747	A	G	exonic	EPG5	NaN	synonymous SNV	EPG5:NM_020964:exon2:c.T621C:p.F207F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.165	0	NaN	NA	NA	221	196	30	0
chr18	43591268	43591268	TAAAAA	TAAAA,TAAAAAG,TAAAAG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	380.174	0	NaN	NA	NA	66	1	8	0
chr18	43669980	43669980	T	C	intronic	ATP5A1	NaN	NaN	NaN	rs2298787	NaN	0.315895	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	96.1608	0	NaN	NA	NA	162	116	46	11
chr18	43678024	43678024	G	A	UTR5	ATP5A1	NM_001257335:c.-6218C>T	NaN	NaN	rs56181324	NaN	0.238818	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.130619	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	9	5	27
chr18	43678035	43678035	T	C	UTR5	ATP5A1	NM_001257335:c.-6229A>G	NaN	NaN	rs3753069	NaN	0.550519	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	41.673929	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	0	15	30
chr18	43684300	43684300	C	A	UTR5	HAUS1	NM_138443:c.-78C>A	NaN	NaN	rs41274316	NaN	0.0517173	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	81.063579	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	21	32	9
chr18	43698319	43698319	T	C	intronic	HAUS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr18	43914950	43914950	G	C	intronic	RNF165	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	44027705	44027705	G	C	intronic	RNF165	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr18	44027707	44027707	C	T	intronic	RNF165	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr18	44027708	44027708	T	A	intronic	RNF165	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr18	44027709	44027709	G	T	intronic	RNF165	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr18	44057231	44057231	A	C	UTR3	LOXHD1	NM_001145473:c.*204T>G,NM_144612:c.*204T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr18	44063750	44063750	A	A	intronic	LOXHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr18	44065264	44065264	A	A	intronic	LOXHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	44098101	44098101	T	C	exonic	LOXHD1	NaN	nonsynonymous SNV	LOXHD1:NM_001145473:exon2:c.A107G:p.K36R,LOXHD1:NM_001173129:exon2:c.A107G:p.K36R,LOXHD1:NM_001145472:exon16:c.A2057G:p.K686R,LOXHD1:NM_144612:exon33:c.A5204G:p.K1735R	rs368286192	NaN	NaN	0.3	T	0.949	P	0.406	B	0.000	D	0.589	N	0.955	L	-0.12	T	-0.752	T	0.152	T	0.187	2.367	13.87	5.3	2.013	5.785	9.723	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.590046	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	130	120	10	0
chr18	44104365	44104365	A	G	intronic	LOXHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr18	44109297	44109297	G	C	intronic	LOXHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	63.337385	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	606	538	68	0
chr18	44126819	44126819	G	A	intronic	LOXHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.476806	nearby_gap_events	REJECT	137	126	11	0
chr18	44139379	44139379	C	A	intronic	LOXHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.007055684900905327	NA	0	0	NaN	NA	NA	45	36	9	0
chr18	44146190	44146190	T	T	intronic	LOXHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr18	44146420	44146420	A	A	intronic	LOXHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr18	44159552	44159552	T	G	intronic	LOXHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	8	5	3	0
chr18	44181127	44181127	T	T	intronic	LOXHD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr18	44400852	44400852	A	T	intronic	PIAS2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.425849	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	197	182	15	0
chr18	44424666	44424666	T	A	intronic	PIAS2	NaN	NaN	NaN	rs79873463	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.01166	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	192	173	19	0
chr18	44561516	44561516	C	G	exonic	TCEB3B	NaN	synonymous SNV	TCEB3B:NM_016427:exon1:c.G120C:p.T40T	rs2571027	NaN	0.535144	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	69.1605	0	NaN	NA	NA	314	174	140	27
chr18	44585955	44585955	G	A	exonic	KATNAL2	NaN	nonsynonymous SNV	KATNAL2:NM_031303:exon5:c.G263A:p.S88N	rs7233515	NaN	0.435304	0.38	T	0.001	B	0.003	B	0.976	N	1.000	P	0.4	N	-3.34	D	-1.049	T	0.000	T	0.038	1.493	10.94	-4.83	-0.685	-0.937	6.742	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	57.422021	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	13	28	37
chr18	44601809	44601809	A	G	intronic	KATNAL2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	6	0	4	0
chr18	44634990	44634990	T	G	UTR3	HDHD2	NM_032124:c.*63A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	1	0
chr18	44641397	44641397	C	T	intronic	HDHD2	NaN	NaN	NaN	rs2576058	NaN	0.476438	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	115.115972	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	80	34	46	48
chr18	44660734	44660734	A	C	intronic	HDHD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.679112	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	167	156	11	0
chr18	44661115	44661115	A	A	intronic	HDHD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	34	34	0	0
chr18	44752125	44752125	G	A	intronic	SKOR2	NaN	NaN	NaN	rs2137289	NaN	0.596845	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	45098760	45098760	T	T	intergenic	MIR4527,SMAD2	dist=191824;dist=260706	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	45298570	45298570	G	T	intergenic	MIR4527,SMAD2	dist=391634;dist=60896	NaN	NaN	rs2852951	NaN	0.975439	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	45372211	45372211	A	A	intronic	SMAD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	16	14	0	0
chr18	45377441	45377441	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	16	0	8,6	0
chr18	45377472	45377472	G	A	intronic	SMAD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.461584	clustered_read_position	REJECT	89	84	5	0
chr18	45377474	45377474	T	A	intronic	SMAD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.589793	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	57	47	10	0
chr18	45396797	45396797	C	A	intronic	SMAD2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	200	86	114	0
chr18	45529639	45529639	C	C	intergenic	SMAD2,ZBTB7C	dist=72122;dist=24000	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	45555518	45555518	C	T	UTR3	ZBTB7C	NM_001039360:c.*113G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	4	2	7
chr18	45555556	45555556	C	T	UTR3	ZBTB7C	NM_001039360:c.*75G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.19999999999999943	NA	0	0	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr18	45555829	45555829	T	C	exonic	ZBTB7C	NaN	synonymous SNV	ZBTB7C:NM_001039360:exon3:c.A1662G:p.T554T	rs7231151	NaN	0.411542	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	103.076	0	33.332111	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	7
chr18	45566358	45566358	A	A	exonic	ZBTB7C	NaN	synonymous SNV	ZBTB7C:NM_001039360:exon2:c.T1121T:p.M374M	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	57	49	0	0
chr18	45873865	45873865	G	A	intergenic	ZBTB7C,CTIF	dist=210185;dist=191562	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	46002330	46002330	T	C	intergenic	ZBTB7C,CTIF	dist=338650;dist=63097	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	46174615	46174615	A	T	intronic	CTIF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	46190630	46190630	T	T	intronic	CTIF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	1	0	0
chr18	46287676	46287676	G	G	intronic	CTIF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr18	46287677	46287677	T	T	intronic	CTIF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr18	46343793	46343793	A	T	intronic	CTIF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr18	46343794	46343794	G	G	intronic	CTIF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	46384099	46384099	A	A	intronic	CTIF	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr18	46394300	46394300	T	C	intergenic	CTIF,SMAD7	dist=4714;dist=51923	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	49	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	46889622	46889622	A	G	intronic	DYM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.902171	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	127	119	8	0
chr18	47008796	47008796	A	A	intronic	C18orf32,RPL17-C18orf32	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr18	47088826	47088826	C	T	intronic	LIPG	NaN	NaN	NaN	rs35978968	NaN	0.251997	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	567.517761	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	201	1	200	36
chr18	47091845	47091845	T	C	exonic	LIPG	NaN	nonsynonymous SNV	LIPG:NM_006033:exon2:c.T256C:p.F86L	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.37	B	0.247	B	0.000	D	1.000	D	1.1	L	-2.45	D	-0.059	T	0.551	D	0.321	3.020	16.08	3.94	0.798	5.135	10.611	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.079006	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	690	615	75	0
chr18	47093735	47093735	T	A	intronic	LIPG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr18	47093738	47093738	T	C	intronic	LIPG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr18	47093740	47093740	T	C	intronic	LIPG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr18	47102002	47102002	T	C	intronic	LIPG	NaN	NaN	NaN	rs2276269	NaN	0.616414	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2317.38	0	NaN	NA	NA	193	1	192	20
chr18	47271643	47271643	G	A	intergenic	LIPG,ACAA2	dist=152365;dist=38231	NaN	NaN	rs36033557	NaN	0.175919	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	11	4	7	0
chr18	47288899	47288899	A	T	intergenic	LIPG,ACAA2	dist=169621;dist=20975	NaN	NaN	rs7238327	NaN	0.101038	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr18	47313853	47313853	A	C	intronic	ACAA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	14	8	6	0
chr18	47318374	47318374	T	T	intronic	ACAA2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	4	0	0
chr18	47323922	47323922	G	A	exonic	ACAA2	NaN	nonsynonymous SNV	ACAA2:NM_006111:exon3:c.C226T:p.R76C	rs145076043	NaN	NaN	0.02	D	1.0	D	0.983	D	0.000	D	1.000	D	2.27	M	-2.7	D	0.830	D	0.833	D	0.687	2.907	15.69	4.89	1.392	3.975	16.02	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.039691	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	46	43	3	0
chr18	47339798	47339798	G	A	intronic	ACAA2	NaN	NaN	NaN	rs2945506	NaN	0.433906	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	56.669741	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	21	1	20	36
chr18	47383332	47383332	A	T	intronic	MYO5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	47383333	47383333	A	C	intronic	MYO5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	47390487	47390487	C	A	intronic	MYO5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.852789	nearby_gap_events	REJECT	97	91	6	0
chr18	47404303	47404303	A	T	intronic	MYO5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	0	2	0
chr18	47405304	47405304	A	G	intronic	MYO5B	NaN	NaN	NaN	rs2276176	NaN	0.289736	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	465.069	0	NaN	NA	NA	117	53	64	12
chr18	47406711	47406711	C	A	intronic	MYO5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.157548	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	99	92	7	4
chr18	47406714	47406714	A	C	intronic	MYO5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.928576	nearby_gap_events	REJECT	99	92	7	0
chr18	47438628	47438628	A	A	intronic	MYO5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	18	17	0	0
chr18	47463587	47463587	A	G	intronic	MYO5B	NaN	NaN	NaN	rs1790797	NaN	0.660743	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	8.457890590903396E-4	Somatic	300.075	79	80.894985	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	138	89	49	22
chr18	47471271	47471271	C	C	intronic	MYO5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr18	47471322	47471322	T	T	intronic	MYO5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr18	47489494	47489494	A	G	intronic	MYO5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	19	6	12	0
chr18	47518852	47518852	A	A	intronic	MYO5B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr18	47566477	47566477	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	2	5,3	0
chr18	47765121	47765121	G	C	intronic	CFAP53	NaN	NaN	NaN	rs35839946	NaN	0.19988	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	78.123252	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	67	33	34	35
chr18	47788626	47788626	A	A	intronic	CFAP53	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr18	47797779	47797779	T	T	UTR3	MBD1	NM_001204137:c.*92A>A,NM_001204138:c.*92A>A,NM_001204140:c.*92A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr18	47800331	47800331	A	A	intronic	MBD1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr18	47807939	47807939	A	C	UTR5	MBD1	NM_001204139:c.-1577T>G,NM_001204141:c.-1577T>G,NM_001204136:c.-1577T>G,NM_015847:c.-1577T>G,NM_001204142:c.-1577T>G,NM_015846:c.-1577T>G,NM_015845:c.-1577T>G,NM_015844:c.-1577T>G,NM_002384:c.-1577T>G,NM_001204137:c.-1577T>G,NM_001204138:c.-1577T>G,NM_001204140:c.-1577T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	47809871	47809871	G	T	intronic	CXXC1	NaN	NaN	NaN	rs12458654	NaN	0.252796	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	64.377	0	NaN	NA	NA	49	31	18	28
chr18	47811870	47811870	G	GT	intronic	CXXC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	107.786	0	NaN	NA	NA	111	71	37	0
chr18	47811954	47811954	A	G	intronic	CXXC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	47813899	47813899	C	A	intronic	CXXC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.351025	nearby_gap_events	REJECT	41	35	6	0
chr18	47813900	47813900	A	C	intronic	CXXC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.395614	nearby_gap_events	REJECT	41	35	6	0
chr18	47908650	47908650	A	C	intronic	SKA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	4	3	0
chr18	48190588	48190588	A	C	exonic	MAPK4	NaN	nonsynonymous SNV	MAPK4:NM_001292040:exon2:c.A260C:p.K87T,MAPK4:NM_002747:exon2:c.A260C:p.K87T	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.053	B	0.102	B	0.207	N	1.000	N	0.295	N	0.95	T	-1.012	T	0.069	T	0.205	1.603	11.32	4.72	1.059	1.517	8.161	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.250897	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	98	93	5	0
chr18	48190927	48190927	A	A	intronic	MAPK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr18	48248654	48248654	A	G	intronic	MAPK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	48255511	48255511	T	T	intronic	MAPK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	48255772	48255772	C	T	exonic	MAPK4	NaN	synonymous SNV	MAPK4:NM_001292039:exon5:c.C679T:p.L227L,MAPK4:NM_002747:exon6:c.C1312T:p.L438L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	9.59393	0	9.593412		KEEP	38	32	6	0
chr18	48256095	48256095	C	A	exonic	MAPK4	NaN	synonymous SNV	MAPK4:NM_001292039:exon5:c.C1002A:p.R334R,MAPK4:NM_002747:exon6:c.C1635A:p.R545R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	21	6.552865	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	2	0	2	0
chr18	48331524	48331524	G	A	exonic	MRO	NaN	synonymous SNV	MRO:NM_001127174:exon4:c.C429T:p.D143D,MRO:NM_001127175:exon4:c.C471T:p.D157D,MRO:NM_001127176:exon4:c.C471T:p.D157D,MRO:NM_031939:exon5:c.C429T:p.D143D	rs2586776	ID=COSM1389008,COSM1389007;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.452875	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	137.791415	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	99	44	55	40
chr18	48446950	48446950	C	T	intronic	ME2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.178857	nearby_gap_events	REJECT	237	219	18	0
chr18	48450392	48450392	C	T	intronic	ME2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.523086	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	163	158	5	0
chr18	48510956	48510956	T	G	intronic	ELAC1	NaN	NaN	NaN	rs1704770	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.074422	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	62	54	8	0
chr18	49149202	49149202	A	C	intergenic	LOC100287225,DCC	dist=60363;dist=717340	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	16	11	5	0
chr18	49636805	49636805	T	T	intergenic	LOC100287225,DCC	dist=547966;dist=229737	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	50278401	50278401	T	A	intronic	DCC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	50741799	50741799	C	A	intronic	DCC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	50831975	50831975	C	T	exonic	DCC	NaN	nonsynonymous SNV	DCC:NM_005215:exon13:c.C1939T:p.P647S	NaN	ID=COSM563735;OCCURENCE=1(lung)	NaN	0.11	T	0.776	P	0.623	P	0.000	D	1.000	D	1.68	L	0.44	T	-0.219	T	0.441	T	0.637	2.895	15.65	5.45	2.706	7.354	18.418	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	58	42	16	0
chr18	50831976	50831976	C	T	exonic	DCC	NaN	nonsynonymous SNV	DCC:NM_005215:exon13:c.C1940T:p.P647L	NaN	ID=COSM1711358;OCCURENCE=1(skin)	NaN	0.06	T	0.907	P	0.787	P	0.000	D	1.000	D	1.505	L	0.4	T	-0.137	T	0.461	T	0.741	2.982	15.94	5.45	2.706	7.354	18.418	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	58	42	16	0
chr18	50831977	50831977	A	G	exonic	DCC	NaN	synonymous SNV	DCC:NM_005215:exon13:c.A1941G:p.P647P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	55	37	16	0
chr18	50848601	50848601	A	G	intronic	DCC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	13.4059	0	16.309586	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	135	117	18	16
chr18	50929326	50929326	A	A	intronic	DCC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	35	32	0	0
chr18	50961440	50961440	T	T	intronic	DCC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	22	20	0	0
chr18	51750450	51750450	C	G	exonic	MBD2	NaN	nonsynonymous SNV	MBD2:NM_003927:exon1:c.G480C:p.K160N,MBD2:NM_015832:exon1:c.G480C:p.K160N	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.993	D	0.893	P	0.000	D	1.000	D	3.04	M	-5.95	D	1.044	D	0.983	D	0.417	2.653	14.83	4.52	2.065	2.788	16.062	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	24	8.051664	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	1	3	2
chr18	51750452	51750452	T	G	exonic	MBD2	NaN	nonsynonymous SNV	MBD2:NM_003927:exon1:c.A478C:p.K160Q,MBD2:NM_015832:exon1:c.A478C:p.K160Q	NaN	NaN	NaN	0.16	T	0.745	P	0.536	P	0.000	D	1.000	D	1.38	L	-5.71	D	1.044	D	0.941	D	0.5	2.512	14.36	4.53	1.682	5.582	12.878	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	28	8.654516	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	1	3	0
chr18	51750453	51750453	C	T	exonic	MBD2	NaN	stopgain	MBD2:NM_003927:exon1:c.G477A:p.W159X,MBD2:NM_015832:exon1:c.G477A:p.W159X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.002	N	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	6.453	37	4.25	1.925	7.174	15.492	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	26	8.653201	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	4	1	3	0
chr18	51795960	51795960	A	G	exonic	POLI	NaN	nonsynonymous SNV	POLI:NM_007195:exon1:c.A44G:p.D15G	rs78943519	ID=COSM1389157;OCCURENCE=2(large_intestine)	NaN	0.41	T	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	N	0.55	N	0.6	T	-1.038	T	0.075	T	0.249	0.790	8.165	-0.887	-0.303	-0.072	4.424	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	21	15	6	0
chr18	51809279	51809279	C	A	exonic	POLI	NaN	stopgain	POLI:NM_007195:exon6:c.C869A:p.S290X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	4.106	21.1	5.96	2.832	6.551	19.194	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.857885	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	58	50	8	0
chr18	51809280	51809280	A	T	exonic	POLI	NaN	synonymous SNV	POLI:NM_007195:exon6:c.A870T:p.S290S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.705186	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	58	50	8	0
chr18	51818417	51818417	ACTC	AC,ACT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	195.996	0	NaN	NA	NA	77	36	28	1
chr18	51880774	51880774	T	A	intronic	STARD6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.2248	0	NaN	NA	NA	16	16	0	6
chr18	51900435	51900435	A	G	intronic	C18orf54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.56092	0	NaN	NA	NA	18	15	3	0
chr18	51900472	51900472	G	A	intronic	C18orf54	NaN	NaN	NaN	rs4940327	NaN	0.94988	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	48.3938	0	NaN	NA	NA	15	7	8	0
chr18	51900803	51900803	A	A	intronic	C18orf54	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr18	5196888	5196888	C	G	intronic	C18orf42	NaN	NaN	NaN	rs7240473	NaN	0.167133	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.304588	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	20	13	26
chr18	52555166	52555166	A	G	intronic	RAB27B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.528896	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	170	165	5	0
chr18	52575183	52575183	A	C	intronic	CCDC68	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	52595986	52595986	A	G	intronic	CCDC68	NaN	NaN	NaN	rs375523292	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.022909622864342876	NA	0	49	NaN	NA	NA	133	91	42	42
chr18	52608328	52608328	AC	A,AA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	597.861	0	NaN	NA	NA	63	0	13	1
chr18	52895625	52895625	A	A	intronic	TCF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr18	52969795	52969795	A	T	UTR5	TCF4	NM_001243236:c.-80T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	3	2	0
chr18	53018280	53018280	A	T	intronic	TCF4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	21	6	15	0
chr18	5395538	5395538	G	A	intronic	EPB41L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr18	5398206	5398206	A	T	intronic	EPB41L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	5398207	5398207	T	G	intronic	EPB41L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	5410574	5410574	A	G	exonic	EPB41L3	NaN	synonymous SNV	EPB41L3:NM_001281533:exon13:c.T1605C:p.T535T,EPB41L3:NM_001281534:exon13:c.T1605C:p.T535T,EPB41L3:NM_012307:exon14:c.T2112C:p.T704T,EPB41L3:NM_001281535:exon15:c.T1278C:p.T426T	rs3817466	NaN	0.711661	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	377.117623	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	137	0	137	57
chr18	5424155	5424155	T	T	intronic	EPB41L3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr18	54349810	54349810	T	T	intronic	WDR7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	54354213	54354213	A	G	intronic	WDR7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.590362	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	73	66	7	0
chr18	54361751	54361751	T	T	intronic	WDR7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr18	54363436	54363436	T	C	intronic	WDR7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.739866	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	148	143	5	0
chr18	54605932	54605932	A	A	intronic	WDR7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr18	55217881	55217881	T	C	UTR3	FECH	NM_000140:c.*63A>G,NM_001012515:c.*63A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr18	55221479	55221479	T	T	intronic	FECH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr18	55238852	55238852	A	G	intronic	FECH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.076048	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	81	75	6	0
chr18	55253710	55253710	G	A	intronic	FECH	NaN	NaN	NaN	rs317815	NaN	0.792931	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.700716	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	11
chr18	55273058	55273058	C	G	intronic	NARS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr18	55273060	55273060	T	C	intronic	NARS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr18	55315899	55315899	G	A	exonic	ATP8B1	NaN	stopgain	ATP8B1:NM_005603:exon28:c.C3577T:p.R1193X	NaN	NaN	NaN	0.64	T	.	.	.	.	0.000	D	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	8.241	40	5.27	2.456	2.379	13.467	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.272263	strand_artifact	REJECT	27	22	5	0
chr18	55338656	55338656	G	A	intronic	ATP8B1	NaN	NaN	NaN	rs317838	NaN	0.476438	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.223427	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	13	9	31
chr18	55364721	55364721	T	T	intronic	ATP8B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr18	55373836	55373836	G	C	intronic	ATP8B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr18	55373837	55373837	A	T	intronic	ATP8B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr18	55373838	55373838	A	G	intronic	ATP8B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr18	55373840	55373840	A	T	intronic	ATP8B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr18	55373842	55373842	T	C	intronic	ATP8B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr18	55583616	55583616	G	T	intergenic	ATP8B1,NEDD4L	dist=113289;dist=127994	NaN	NaN	rs58403675	NaN	0.26877	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	55912559	55912559	C	A	intronic	NEDD4L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr18	55983304	55983304	G	C	intronic	NEDD4L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	401	190	211	0
chr18	55996407	55996407	A	A	intronic	NEDD4L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr18	56001197	56001197	A	T	intronic	NEDD4L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	0	6	0
chr18	56018365	56018365	A	A	intronic	NEDD4L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	47	35	0	0
chr18	56037244	56037244	G	A	intronic	NEDD4L	NaN	NaN	NaN	rs4149613	NaN	0.00798722	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr18	56042296	56042296	G	C	intronic	NEDD4L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	56052670	56052670	T	T	intronic	NEDD4L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr18	56058869	56058869	T	C	intronic	NEDD4L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr18	56165432	56165432	T	T	intronic	ALPK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	48	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr18	56182378	56182378	A	T	intronic	ALPK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr18	56182379	56182379	A	T	intronic	ALPK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr18	56184092	56184092	G	A	intronic	ALPK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.601879	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	35	32	3	0
chr18	56202768	56202768	C	A	exonic	ALPK2	NaN	nonsynonymous SNV	ALPK2:NM_052947:exon5:c.G4651T:p.A1551S	rs3809983	NaN	0.33147	0.53	T	0.612	P	0.115	B	0.011	N	1.000	P	1.24	L	0.86	T	-0.921	T	0.000	T	0.08	2.114	13.02	-0.092	0.043	-0.557	0.463	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	106.549222	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	93	49	44	47
chr18	56202982	56202982	A	T	exonic	ALPK2	NaN	synonymous SNV	ALPK2:NM_052947:exon5:c.T4437A:p.A1479A	rs3826594	NaN	0.672923	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	289.669457	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	95	0	95	54
chr18	56247814	56247814	A	A	intronic	ALPK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr18	56279418	56279418	A	C	intronic	ALPK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	11	4	7	0
chr18	56412784	56412784	C	T	intronic	MALT1	NaN	NaN	NaN	rs58993112	NaN	0.169728	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.458192	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	19	10	26
chr18	56585462	56585462	A	G	intronic	ZNF532	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	12	8	4	0
chr18	56585464	56585464	A	G	intronic	ZNF532	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	14	9	4	0
chr18	56585465	56585465	C	G	intronic	ZNF532	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	41	NaN	NA	NA	14	8	6	0
chr18	56585473	56585473	T	G	intronic	ZNF532	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	14	9	5	0
chr18	56648892	56648892	A	C	intronic	ZNF532	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr18	56717475	56717475	T	A	ncRNA_intronic	OACYLP	NaN	NaN	NaN	rs78002491	NaN	0.154353	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr18	56807308	56807308	C	G	intronic	SEC11C	NaN	NaN	NaN	rs3744890	NaN	0.585264	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	127.559	0	35.19075	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	33
chr18	56807339	56807339	T	G	intronic	SEC11C	NaN	NaN	NaN	rs3744891	NaN	0.584864	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	36.042431	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	0	15	32
chr18	56816932	56816932	A	T	intronic	SEC11C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	56887507	56887507	C	A	exonic	GRP	NaN	nonsynonymous SNV	GRP:NM_001012512:exon1:c.C10A:p.R4S,GRP:NM_001012513:exon1:c.C10A:p.R4S,GRP:NM_002091:exon1:c.C10A:p.R4S	rs1062557	NaN	0.708866	0.77	T	0.067	B	0.016	B	0.659	N	1.000	P	0.895	L	1.62	T	-0.987	T	0.000	T	0.077	-0.846	0.560	-0.431	0.010	0.151	7.535	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	62.2575	0	19.786556	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	23
chr18	56964226	56964226	A	T	intronic	CPLX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	36	15	21	0
chr18	56968628	56968628	G	A	intronic	CPLX4	NaN	NaN	NaN	rs668992	NaN	0.551318	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	56985361	56985361	T	T	intronic	CPLX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr18	57000529	57000529	T	C	intronic	LMAN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	62	40	22	0
chr18	57000530	57000530	C	C	intronic	LMAN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	27	26	0	0
chr18	57000531	57000531	A	A	intronic	LMAN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr18	57006274	57006274	G	T	intronic	LMAN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	13	8	5	0
chr18	57006276	57006276	A	G	intronic	LMAN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	12	7	5	0
chr18	57013303	57013303	A	G	intronic	LMAN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.429225	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	41	36	5	0
chr18	57014713	57014713	G	T	intronic	LMAN1	NaN	NaN	NaN	rs7234168	NaN	0.101637	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.95697	0	NaN	NA	NA	80	46	34	0
chr18	57014889	57014889	T	C	intronic	LMAN1	NaN	NaN	NaN	rs8095245	NaN	0.164537	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	83.9558	0	NaN	NA	NA	66	18	48	12
chr18	57016308	57016308	T	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	0	2,2	0
chr18	57021733	57021733	TAAAAAAC	TAAAAA,TAAAAAC,TAAAA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	176.135	0	NaN	NA	NA	76	36	25	2
chr18	57022430	57022430	T	G	intronic	LMAN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	10	6	4	0
chr18	57103468	57103468	T	G	intronic	CCBE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	57105381	57105381	A	T	intronic	CCBE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.283926	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	59	53	6	0
chr18	57115162	57115162	T	T	intronic	CCBE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr18	57122747	57122747	G	C	intronic	CCBE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	57134210	57134210	A	A	intronic	CCBE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	57273067	57273067	G	T	intronic	CCBE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	57323149	57323149	C	A	intronic	CCBE1	NaN	NaN	NaN	rs12970058	NaN	0.658746	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr18	57364075	57364075	A	C	intronic	CCBE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.229073	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	43	32	11	0
chr18	57364086	57364086	CGGGGC	CGGCGC,CGGGCG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	97.5017	0	NaN	NA	NA	52	28	21	0
chr18	58038861	58038861	A	T	exonic	MC4R	NaN	nonsynonymous SNV	MC4R:NM_005912:exon1:c.T722A:p.M241K	NaN	NaN	NaN	0	D	0.993	D	0.955	D	0.000	D	1.000	D	1.64	L	-0.34	T	-0.206	T	0.401	T	0.888	3.704	18.81	5.85	2.238	9.339	14.188	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.860053	clustered_read_position	REJECT	69	64	5	0
chr18	58039175	58039175	G	A	exonic	MC4R	NaN	synonymous SNV	MC4R:NM_005912:exon1:c.C408T:p.S136S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.904612	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	618	610	8	0
chr18	58330814	58330814	A	G	intergenic	MC4R,CDH20	dist=290813;dist=826961	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr18	58330816	58330816	A	T	intergenic	MC4R,CDH20	dist=290815;dist=826959	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	58799127	58799127	C	C	intergenic	MC4R,CDH20	dist=759126;dist=358648	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr18	59174817	59174817	C	A	intronic	CDH20	NaN	NaN	NaN	rs1547956	NaN	0.71865	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	463.718	0	NaN	NA	NA	199	99	98	34
chr18	59420254	59420254	T	G	ncRNA_exonic	LINC01544	NaN	NaN	NaN	rs12962384	NaN	0.470048	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	59774366	59774366	T	C	intronic	PIGN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.941151	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	136	130	6	0
chr18	59828176	59828176	T	T	intronic	PIGN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	59854681	59854681	T	T	UTR5	KIAA1468	NM_020854:c.-58T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr18	59854980	59854980	C	G	exonic	KIAA1468	NaN	nonsynonymous SNV	KIAA1468:NM_020854:exon1:c.C242G:p.A81G	NaN	NaN	NaN	.	.	0.096	B	0.049	B	0.140	U	0.929	N	0	N	0.93	T	-1.059	T	0.058	T	0.118	2.863	15.54	4.39	1.403	2.248	13.850	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	50	34	16	0
chr18	59925919	59925919	T	C	intronic	KIAA1468	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.24641	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	341	331	10	0
chr18	59947862	59947862	TG	T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.75742	0	NaN	NA	NA	11	9	2	3
chr18	59947865	59947865	T	G	intronic	KIAA1468	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.46722	0	NaN	NA	NA	13	11	2	7
chr18	59972638	59972638	C	T	intronic	KIAA1468	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.81284	0	NaN	NA	NA	8	7	2	0
chr18	60036782	60036782	G	G	intronic	TNFRSF11A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	79	65	0	0
chr18	60051941	60051941	C	T	intronic	TNFRSF11A	NaN	NaN	NaN	rs56231704	NaN	0.0940495	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	55.807555	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	50	26	24	20
chr18	60052127	60052127	C	T	exonic	TNFRSF11A	NaN	stopgain	TNFRSF11A:NM_001270951:exon7:c.C760T:p.Q254X,TNFRSF11A:NM_001270950:exon8:c.C874T:p.Q292X,TNFRSF11A:NM_001278268:exon10:c.C1669T:p.Q557X,TNFRSF11A:NM_003839:exon10:c.C1711T:p.Q571X	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	0.000	U	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	6.705	38	4.6	2.111	6.522	15.667	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.887914	nearby_gap_events	REJECT	49	44	5	0
chr18	60052148	60052148	C	G	exonic	TNFRSF11A	NaN	nonsynonymous SNV	TNFRSF11A:NM_001270951:exon7:c.C781G:p.R261G,TNFRSF11A:NM_001270950:exon8:c.C895G:p.R299G,TNFRSF11A:NM_001278268:exon10:c.C1690G:p.R564G,TNFRSF11A:NM_003839:exon10:c.C1732G:p.R578G	NaN	NaN	NaN	.	.	0.407	B	0.118	B	0.000	U	1.000	N	0.895	L	.	.	-1.085	T	0.060	T	0.34	-0.122	3.400	-1.04	-0.512	0.267	4.089	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	180.34	48	NaN	NA	NA	47	17	29	3
chr18	60191166	60191166	G	C	exonic	ZCCHC2	NaN	nonsynonymous SNV	ZCCHC2:NM_017742:exon1:c.G509C:p.R170P	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.998	D	0.959	D	.	.	1.000	D	1.845	L	3.74	T	-1.137	T	0.040	T	0.721	3.956	20.2	3.46	1.495	4.426	14.995	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.270803	clustered_read_position,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	10	5	5	0
chr18	60191167	60191167	C	T	exonic	ZCCHC2	NaN	synonymous SNV	ZCCHC2:NM_017742:exon1:c.C510T:p.R170R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.36641	clustered_read_position,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	10	5	5	0
chr18	60191170	60191170	G	C	exonic	ZCCHC2	NaN	synonymous SNV	ZCCHC2:NM_017742:exon1:c.G513C:p.S171S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.011919504643962934	NA	0	0	8.028605	clustered_read_position,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	10	5	5	0
chr18	60191171	60191171	C	A	exonic	ZCCHC2	NaN	nonsynonymous SNV	ZCCHC2:NM_017742:exon1:c.C514A:p.R172S	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.841	P	0.206	B	.	.	1.000	D	1.04	L	3.73	T	-0.856	T	0.010	T	0.521	2.655	14.84	2.58	0.455	1.691	5.770	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.10294117647058923	NA	0	0	7.536705	clustered_read_position,poor_mapping_region_alternate_allele_mapq	REJECT	10	5	5	0
chr18	60191428	60191428	G	A	exonic	ZCCHC2	NaN	synonymous SNV	ZCCHC2:NM_017742:exon1:c.G771A:p.E257E	rs7229802	NaN	0.707668	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.611763	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	1	4	9
chr18	60630559	60630559	T	T	intronic	PHLPP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr18	60639894	60639894	A	C	exonic	PHLPP1	NaN	synonymous SNV	PHLPP1:NM_194449:exon15:c.A3708C:p.T1236T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.935558	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	201	183	18	0
chr18	60766933	60766933	A	G	intergenic	PHLPP1,BCL2	dist=119257;dist=23646	NaN	NaN	rs879839	NaN	0.623802	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr18	60766955	60766955	G	C	intergenic	PHLPP1,BCL2	dist=119279;dist=23624	NaN	NaN	rs4941181	NaN	0.623802	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr18	60766963	60766963	C	T	intergenic	PHLPP1,BCL2	dist=119287;dist=23616	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	9	4	5	0
chr18	6080799	6080799	T	T	intronic	L3MBTL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr18	6093321	6093321	C	T	intronic	L3MBTL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr18	6093324	6093324	T	C	intronic	L3MBTL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr18	6093328	6093328	G	A	intronic	L3MBTL4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr18	61022791	61022791	C	T	exonic	KDSR	NaN	synonymous SNV	KDSR:NM_002035:exon4:c.G261A:p.V87V	rs2003149	ID=COSM148435;OCCURENCE=1(stomach)	0.556909	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	68.889722	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	29	31	47
chr18	61077872	61077872	A	T	intronic	VPS4B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	61223355	61223355	T	C	upstream	SERPINB12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	14	8	6	0
chr18	61232902	61232902	A	A	intronic	SERPINB12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr18	61234323	61234323	A	A	downstream	SERPINB12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	42	39	0	0
chr18	61256828	61256828	C	G	intronic	SERPINB13	NaN	NaN	NaN	rs117688723	NaN	0.00339457	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	116.594386	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	114	63	51	4
chr18	61304898	61304898	T	T	UTR3	SERPINB4	NM_002974:c.*55A>A,NM_175041:c.*55A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr18	61310524	61310524	T	C	intronic	SERPINB4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.00902687730903902	NA	0	0	NaN	NA	NA	180	132	48	4
chr18	61326628	61326628	A	AT,T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	120.928	0	NaN	NA	NA	14	0	3	7
chr18	61449762	61449762	T	C,TC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1087.53	0	NaN	NA	NA	115	0	10	3
chr18	61466080	61466080	A	C	intronic	SERPINB7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr18	61558657	61558657	T	G	intronic	SERPINB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.117015	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	121	102	19	0
chr18	61564915	61564915	T	G	intronic	SERPINB2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.254971	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	194	181	13	0
chr18	61584817	61584817	T	C	intronic	SERPINB10	NaN	NaN	NaN	rs17072114	NaN	0.171326	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.706311	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	11	12	1
chr18	61600284	61600284	T	G	exonic	SERPINB10	NaN	synonymous SNV	SERPINB10:NM_005024:exon6:c.T636G:p.T212T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.480075	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	5	0	5	0
chr18	61602500	61602500	A	A	downstream	SERPINB10	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	11	9	0	0
chr18	61620679	61620679	T	A	UTR5	HMSD	NM_001123366:c.-11T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.188923	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	167	155	12	0
chr18	61646997	61646997	T	T	intronic	SERPINB8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr18	61648907	61648907	T	T	intronic	SERPINB8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr18	63476312	63476312	A	G	intronic	CDH7	NaN	NaN	NaN	rs11659738	NaN	0.638179	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr18	63481891	63481891	T	T	intronic	CDH7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	11	11	0	0
chr18	63481892	63481892	A	T	intronic	CDH7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr18	63489335	63489335	T	T	exonic	CDH7	NaN	synonymous SNV	CDH7:NM_004361:exon5:c.T644T:p.L215L,CDH7:NM_033646:exon5:c.T644T:p.L215L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	84	62	0	0
chr18	63527083	63527083	C	T	intronic	CDH7	NaN	NaN	NaN	rs8091515	ID=COSN165674;OCCURENCE=1(breast)	0.125599	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	115.316839	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	118	68	50	31
chr18	63527102	63527102	A	C	intronic	CDH7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	63527103	63527103	G	C	intronic	CDH7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	63530016	63530016	A	G	exonic	CDH7	NaN	nonsynonymous SNV	CDH7:NM_004361:exon11:c.A1727G:p.N576S,CDH7:NM_033646:exon11:c.A1727G:p.N576S	rs2291343	NaN	0.629593	1	T	0.022	B	0.027	B	0.000	D	0.000	P	0.11	N	0.77	T	-0.952	T	0.000	T	0.058	1.639	11.44	5.37	2.044	3.177	15.355	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.270771	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	60	27	33	52
chr18	63547744	63547744	G	G	exonic	CDH7	NaN	synonymous SNV	CDH7:NM_004361:exon12:c.G1972G:p.G658G,CDH7:NM_033646:exon12:c.G1972G:p.G658G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	126	120	0	0
chr18	641644	641644	A	G	intronic	CLUL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	66358514	66358514	TAA	T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	119.105	0	NaN	NA	NA	42	19	23	4
chr18	66365129	66365129	T	G	intronic	TMX3	NaN	NaN	NaN	rs433550	NaN	0.270966	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	94.050047	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	84	44	40	14
chr18	66365285	66365285	C	A	intronic	TMX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.882882	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	164	156	8	0
chr18	66367818	66367818	TAAA	TAAAATATAT,TAA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	33.958	0	NaN	NA	NA	16	8	5	0
chr18	66377556	66377556	A	A	intronic	TMX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr18	66504674	66504674	A	G	intronic	CCDC102B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	12	3	9	0
chr18	66513662	66513662	T	C	intronic	CCDC102B	NaN	NaN	NaN	rs1977942	NaN	0.55611	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6359.37	0	NaN	NA	NA	579	0	579	48
chr18	66513663	66513663	G	G	intronic	CCDC102B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	733	657	0	0
chr18	668960	668960	T	T	intronic	TYMS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	668964	668964	T	T	intronic	TYMS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	67266565	67266565	T	G	intronic	DOK6	NaN	NaN	NaN	rs142714232	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	67266567	67266567	C	T	intronic	DOK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	67266568	67266568	A	G	intronic	DOK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	67266569	67266569	A	T	intronic	DOK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	67266571	67266571	A	G	intronic	DOK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	673051	673051	A	C	UTR3	ENOSF1,TYMS	NM_017512:c.*1254T>G,NM_001126123:c.*170T>G,NM_202758:c.*1254T>G;NM_001071:c.*54A>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	5	0	3	0
chr18	673053	673053	G	T	UTR3	ENOSF1,TYMS	NM_017512:c.*1252C>A,NM_001126123:c.*168C>A,NM_202758:c.*1252C>A;NM_001071:c.*56G>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	67614105	67614105	T	T	exonic	CD226	NaN	synonymous SNV	CD226:NM_001303618:exon2:c.A247A:p.N83N,CD226:NM_006566:exon3:c.A247A:p.N83N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	91	74	0	0
chr18	67742563	67742563	A	T	intronic	RTTN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.533183	nearby_gap_events	REJECT	252	236	16	0
chr18	67795061	67795061	A	A	intronic	RTTN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr18	67802625	67802625	A	A	intronic	RTTN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr18	67807461	67807461	T	A	intronic	RTTN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.18479221927497763	NA	0	0	NaN	NA	NA	22	17	5	0
chr18	67809647	67809647	A	C	intronic	RTTN	NaN	NaN	NaN	rs11665653	NaN	0.811302	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	585.584	0	NaN	NA	NA	84	11	22	6
chr18	67818046	67818046	C	T	intronic	RTTN	NaN	NaN	NaN	rs12604751	NaN	0.991613	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	50.1047	0	NaN	NA	NA	36	0	36	3
chr18	67843915	67843915	T	C	exonic	RTTN	NaN	nonsynonymous SNV	RTTN:NM_173630:exon11:c.A1472G:p.E491G	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	2.215	M	0.01	T	0.002	D	0.471	T	0.8	2.395	13.97	5.31	2.003	6.512	15.278	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.72414	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	161	148	13	0
chr18	67843916	67843916	C	A	exonic	RTTN	NaN	stopgain	RTTN:NM_173630:exon11:c.G1471T:p.E491X	NaN	NaN	NaN	0.01	D	.	.	.	.	0.000	D	1.000	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	7.479	39	4.42	1.185	6.334	15.083	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.534397	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	161	148	13	0
chr18	67843918	67843918	A	T	exonic	RTTN	NaN	nonsynonymous SNV	RTTN:NM_173630:exon11:c.T1469A:p.V490D	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.992	D	0.898	P	0.006	N	1.000	D	1.845	L	0.38	T	-0.420	T	0.335	T	0.705	1.705	11.66	4.16	0.858	5.817	11.057	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.153625	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	161	149	12	0
chr18	67858032	67858032	C	G	intronic	RTTN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	17	2	14	0
chr18	68051511	68051511	G	G	ncRNA_intronic	LOC101060542	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	6837449	6837449	T	TG	intronic	ARHGAP28	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.02892	0	NaN	NA	NA	12	9	3	2
chr18	6859757	6859757	T	C	intronic	ARHGAP28	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.387246	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	203	196	7	0
chr18	6942262	6942262	A	G	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr18	6942263	6942263	A	G	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	9	3	6	0
chr18	6943069	6943069	G	C	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr18	6948366	6948366	T	C	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	15	5	8	0
chr18	6948367	6948367	C	C	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	254	246	0	0
chr18	6973241	6973241	A	A	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr18	7009229	7009229	T	T	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	12	11	0	0
chr18	7015685	7015685	T	T	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	7015686	7015686	C	C	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr18	70208898	70208898	G	T	intronic	CBLN2	NaN	NaN	NaN	rs1223504	NaN	0.583666	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	84.103177	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	0	28	57
chr18	7024406	7024406	G	A	exonic	LAMA1	NaN	nonsynonymous SNV	LAMA1:NM_005559:exon18:c.C2462T:p.P821L	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.355	B	0.104	B	0.077	N	1.000	N	2.09	M	0.01	T	-0.967	T	0.153	T	0.299	1.274	10.16	-1.89	-0.753	0.585	3.085	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.588911	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	87	79	8	0
chr18	7025928	7025928	G	T	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.561314	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	154	149	5	0
chr18	7038919	7038919	A	G	exonic	LAMA1	NaN	nonsynonymous SNV	LAMA1:NM_005559:exon11:c.T1453C:p.C485R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.998	D	0.978	D	0.000	D	1.000	D	4.285	H	-3.4	D	1.095	D	0.935	D	0.989	3.661	18.61	4.88	2.176	9.051	14.958	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.639932	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	53	50	3	0
chr18	7038985	7038985	A	G	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	7038987	7038987	T	A	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	7038990	7038990	G	A	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	7038991	7038991	T	C	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	7038992	7038992	C	A	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	7038993	7038993	T	C	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	7040035	7040035	T	C	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	10	4	6	0
chr18	7040255	7040255	A	C	intronic	LAMA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	11	3	6	0
chr18	70417867	70417867	A	A	intronic	NETO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	70532199	70532199	A	G	intronic	NETO1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.497297	possible_contamination,alt_allele_in_normal	REJECT	89	83	6	0
chr18	706442	706442	T	T	intronic	ENOSF1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	71606905	71606905	G	A	intergenic	LOC100505817,FBXO15	dist=589781;dist=133683	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	14	6	8	0
chr18	71749365	71749365	A	A	intronic	FBXO15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr18	71796541	71796541	T	A	intronic	FBXO15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	21.079982	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	112	95	17	0
chr18	71797928	71797928	A	A	intronic	FBXO15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	71797930	71797930	A	A	intronic	FBXO15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	71807584	71807584	A	A	intronic	FBXO15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr18	71929183	71929183	G	C	intronic	CYB5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	71929184	71929184	G	A	intronic	CYB5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	71929186	71929186	C	A	intronic	CYB5A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	71930734	71930734	T	C	intronic	CYB5A	NaN	NaN	NaN	rs2032262	NaN	0.922125	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	4447.68	0	NaN	NA	NA	435	11	424	16
chr18	71936464	71936464	G	A	intronic	CYB5A	NaN	NaN	NaN	rs7239151	NaN	0.550519	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	71985341	71985341	T	C	intronic	C18orf63	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.952411	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	77	69	8	0
chr18	71985362	71985362	A	G	intronic	C18orf63	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	8	1	5	0
chr18	71990033	71990033	G	T	intronic	C18orf63	NaN	NaN	NaN	rs10163785	NaN	0.489217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	204.532	0	NaN	NA	NA	124	0	124	26
chr18	72020346	72020346	T	T	intronic	C18orf63	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	72020348	72020348	T	G	intronic	C18orf63	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.864791	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	20	12	8	10
chr18	72103999	72103999	T	C	intronic	FAM69C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.438109	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	104	99	5	0
chr18	72114030	72114030	G	A	exonic	FAM69C	NaN	synonymous SNV	FAM69C:NM_001044369:exon2:c.C687T:p.S229S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.628317	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	155	146	9	0
chr18	72114454	72114454	TC	T,TT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	869.331	0	NaN	NA	NA	88	0	30	6
chr18	72179371	72179371	G	C	intronic	CNDP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	72179373	72179373	G	A	intronic	CNDP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	72179378	72179378	A	C	intronic	CNDP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	72186059	72186059	G	A	intronic	CNDP2	NaN	NaN	NaN	rs733062	NaN	0.972244	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	137.45005	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	46	0	46	57
chr18	72187133	72187133	A	G	intronic	CNDP2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	6	2	3	0
chr18	72223743	72223743	A	A	intronic	CNDP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr18	72228269	72228269	G	A	intronic	CNDP1	NaN	NaN	NaN	rs4329999	NaN	0.270567	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	80.5792	0	NaN	NA	NA	49	31	18	26
chr18	72245532	72245532	T	C	exonic	CNDP1	NaN	synonymous SNV	CNDP1:NM_032649:exon9:c.T1137C:p.P379P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.062379	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	318	310	8	0
chr18	72247278	72247278	C	T	intronic	CNDP1	NaN	NaN	NaN	rs4892247	NaN	0.722244	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	499.709283	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	177	1	176	49
chr18	72250762	72250762	T	C	intronic	CNDP1	NaN	NaN	NaN	rs11659237	NaN	0.619209	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	191.344454	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	69	1	68	48
chr18	7231104	7231104	T	T	upstream	LRRC30	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	72343008	72343008	T	C	exonic	ZNF407	NaN	synonymous SNV	ZNF407:NM_001146189:exon1:c.T33C:p.D11D,ZNF407:NM_001146190:exon1:c.T33C:p.D11D,ZNF407:NM_017757:exon1:c.T33C:p.D11D	rs7243081	NaN	0.99361	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	127.032797	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	0	45	55
chr18	72593118	72593118	C	T	intronic	ZNF407	NaN	NaN	NaN	rs2628126	NaN	0.930511	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	115.26324	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	42	0	42	52
chr18	72632282	72632282	T	G	intronic	ZNF407	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	72851720	72851720	C	T	intergenic	ZNF407,ZADH2	dist=74092;dist=57558	NaN	NaN	rs9966221	NaN	0.291733	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	72872514	72872514	T	G	intergenic	ZNF407,ZADH2	dist=94886;dist=36764	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	72872520	72872520	G	T	intergenic	ZNF407,ZADH2	dist=94892;dist=36758	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr18	72914280	72914280	G	A	exonic	ZADH2	NaN	synonymous SNV	ZADH2:NM_175907:exon2:c.C225T:p.N75N	rs7230037	NaN	0.297524	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	159.364829	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	0	53	38
chr18	72928894	72928894	A	A	intronic	TSHZ1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	72999469	72999469	A	C	exonic	TSHZ1	NaN	nonsynonymous SNV	TSHZ1:NM_005786:exon2:c.A1972C:p.K658Q	NaN	NaN	NaN	0.08	T	0.627	P	0.105	B	0.190	N	0.994	N	2.175	M	1.0	T	-1.012	T	0.094	T	0.267	0.159	4.853	3.44	0.281	3.290	7.410	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.42857142857142977	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	1
chr18	73351870	73351870	G	A	intergenic	SMIM21,LOC339298	dist=212212;dist=483083	NaN	NaN	rs76281893	NaN	0.0081869	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	73352348	73352348	T	C	intergenic	SMIM21,LOC339298	dist=212690;dist=482605	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	73839999	73839999	G	C	ncRNA_intronic	LOC339298	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	739888	739888	A	A	intronic	YES1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr18	74073898	74073898	T	T	UTR3	ZNF516	NM_014643:c.*555A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr18	74088928	74088928	C	A	intronic	ZNF516	NaN	NaN	NaN	rs1787447	NaN	0.788738	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	74091718	74091718	G	A	exonic	ZNF516	NaN	synonymous SNV	ZNF516:NM_014643:exon4:c.C2352T:p.R784R	rs17059302	NaN	0.173123	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	65.712232	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	56	30	26	11
chr18	74153970	74153970	C	T	exonic	ZNF516	NaN	synonymous SNV	ZNF516:NM_014643:exon3:c.G1041A:p.L347L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.155818	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	53	50	3	0
chr18	74478276	74478276	G	A	intergenic	LOC400661,LOC100131655	dist=72684;dist=28412	NaN	NaN	rs4606813	NaN	0.451677	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	74563987	74563987	T	G	intronic	ZNF236	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.449018	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	81	73	8	1
chr18	74607924	74607924	C	T	intronic	ZNF236	NaN	NaN	NaN	rs472676	NaN	0.351637	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	74620171	74620171	A	T	intronic	ZNF236	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.451649	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	60	48	12	0
chr18	74620561	74620561	A	C	intronic	ZNF236	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	74638861	74638861	T	T	intronic	ZNF236	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr18	74649086	74649086	A	C	intronic	ZNF236	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	9	5	3	0
chr18	74672850	74672850	G	T	intronic	ZNF236	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.49224	0	NaN	NA	NA	143	124	19	6
chr18	74696815	74696815	T	C	exonic	MBP	NaN	synonymous SNV	MBP:NM_001025092:exon4:c.A354G:p.G118G,MBP:NM_001025090:exon5:c.A387G:p.G129G,MBP:NM_002385:exon5:c.A432G:p.G144G,MBP:NM_001025081:exon6:c.A465G:p.G155G,MBP:NM_001025101:exon8:c.A786G:p.G262G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.146408	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	295	288	7	0
chr18	74721942	74721942	A	A	intronic	MBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr18	74729329	74729329	A	A	intronic	MBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	73	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr18	74831297	74831297	A	T	intronic	MBP	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	74980808	74980808	AGT	AAT,ATA,AT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	686.89	0	NaN	NA	NA	72	0	43	1
chr18	751822	751822	G	G	intronic	YES1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	9	0	0
chr18	75339367	75339367	G	C	intergenic	GALR1,LINC01029	dist=357271;dist=343886	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	8	2	4	0
chr18	75339368	75339368	A	A	intergenic	GALR1,LINC01029	dist=357272;dist=343885	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr18	75339369	75339369	G	G	intergenic	GALR1,LINC01029	dist=357273;dist=343884	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	26	23	0	0
chr18	75811103	75811103	G	C	intergenic	LINC01029,SALL3	dist=105420;dist=929172	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr18	76279097	76279097	C	T	intergenic	LINC01029,SALL3	dist=573414;dist=461178	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	7	3	3	0
chr18	76541487	76541487	A	C	intergenic	LINC01029,SALL3	dist=835804;dist=198788	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	76622299	76622299	C	C	intergenic	LINC01029,SALL3	dist=916616;dist=117976	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr18	76661677	76661677	C	T	intergenic	LINC01029,SALL3	dist=955994;dist=78598	NaN	NaN	rs4799256	NaN	0.284944	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	76662006	76662006	C	G	intergenic	LINC01029,SALL3	dist=956323;dist=78269	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	76662007	76662007	T	G	intergenic	LINC01029,SALL3	dist=956324;dist=78268	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	76662008	76662008	T	A	intergenic	LINC01029,SALL3	dist=956325;dist=78267	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	76664243	76664243	G	C	intergenic	LINC01029,SALL3	dist=958560;dist=76032	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	76753280	76753280	G	T	exonic	SALL3	NaN	nonsynonymous SNV	SALL3:NM_171999:exon2:c.G1289T:p.G430V	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	2.765	M	3.19	T	-0.991	T	0.089	T	0.921	2.198	13.31	4.54	2.352	9.575	17.489	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	47	43	4	1
chr18	76753768	76753768	C	G	exonic	SALL3	NaN	nonsynonymous SNV	SALL3:NM_171999:exon2:c.C1777G:p.L593V	rs2447437	ID=COSM1130040;OCCURENCE=1(prostate)	0.793331	0.56	T	0.013	B	0.022	B	0.156	N	1.000	P	1.05	L	3.03	T	-0.976	T	0.000	T	0.073	-1.198	0.073	5.2	2.584	0.292	10.231	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	40.3083	33	14.552418	normal_lod	REJECT	10	4	6	10
chr18	76754549	76754549	T	C	exonic	SALL3	NaN	nonsynonymous SNV	SALL3:NM_171999:exon2:c.T2558C:p.V853A	rs35578880	NaN	0.0253594	0.78	T	0.067	B	0.01	B	0.003	N	0.936	D	0.75	N	3.13	T	-0.939	T	0.002	T	0.088	1.240	10.03	1.85	0.085	2.298	9.048	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.696057	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	97	50	47	7
chr18	76754757	76754757	G	C	exonic	SALL3	NaN	synonymous SNV	SALL3:NM_171999:exon2:c.G2766C:p.L922L	rs61747126	NaN	0.0253594	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	77.3232	0	NaN	NA	NA	25	10	11	2
chr18	76806473	76806473	A	T	intergenic	SALL3,ATP9B	dist=47504;dist=22924	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	76807781	76807781	G	T	intergenic	SALL3,ATP9B	dist=48812;dist=21616	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr18	76807782	76807782	A	C	intergenic	SALL3,ATP9B	dist=48813;dist=21615	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr18	76856368	76856368	T	C	intronic	ATP9B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.425354	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	87	80	7	0
chr18	76966931	76966931	G	T	intronic	ATP9B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.653455	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	125	116	9	0
chr18	76966932	76966932	C	G	intronic	ATP9B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.672114	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	119	110	9	0
chr18	76974010	76974010	T	C	exonic	ATP9B	NaN	nonsynonymous SNV	ATP9B:NM_198531:exon11:c.T1079C:p.V360A	NaN	NaN	NaN	0.5	T	0.99	D	0.92	D	0.000	D	1.000	D	1.225	L	-2.39	D	0.264	D	0.706	D	0.895	2.880	15.59	6.07	2.330	6.744	16.308	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.000104	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	109	105	4	0
chr18	77013276	77013276	A	T	intronic	ATP9B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.4848	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	118	100	18	0
chr18	77013279	77013279	T	A	intronic	ATP9B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	25.403183	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	110	91	19	0
chr18	77060484	77060484	A	G	intronic	ATP9B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	10	3	7	0
chr18	77067124	77067124	A	G	exonic	ATP9B	NaN	nonsynonymous SNV	ATP9B:NM_198531:exon15:c.A1663G:p.T555A	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.995	D	0.000	D	1.000	D	3.22	M	0.01	T	0.208	D	0.510	D	0.865	3.972	20.3	5.01	1.876	8.999	14.712	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.032597	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	129	120	9	0
chr18	77089958	77089958	T	G	intronic	ATP9B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	9	5	3	0
chr18	77096136	77096136	C	T	intronic	ATP9B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	11	3	5	0
chr18	77097187	77097187	CT	C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	109.116	0	NaN	NA	NA	230	137	33	2
chr18	77097189	77097189	C	G	intronic	ATP9B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	19.386936	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	181	167	14	0
chr18	77107934	77107934	C	T	intronic	ATP9B	NaN	NaN	NaN	rs9965202	NaN	0.905551	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	95.887054	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	0	30	54
chr18	77135340	77135340	C	T	intronic	ATP9B	NaN	NaN	NaN	rs8097299	NaN	0.246206	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	40.3868	29	15.917698	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	26	16	10	13
chr18	77135472	77135472	A	G	intronic	ATP9B	NaN	NaN	NaN	rs2280058	NaN	0.28115	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	134.891	0	49.533458	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	8	20	18
chr18	77137202	77137202	A	G	intronic	ATP9B	NaN	NaN	NaN	rs1110784	NaN	0.932308	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	77170169	77170169	G	C	intronic	NFATC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr18	77170938	77170938	T	C	exonic	NFATC1	NaN	synonymous SNV	NFATC1:NM_001278669:exon2:c.T663C:p.F221F,NFATC1:NM_001278670:exon2:c.T663C:p.F221F,NFATC1:NM_001278672:exon2:c.T624C:p.F208F,NFATC1:NM_001278675:exon2:c.T624C:p.F208F,NFATC1:NM_006162:exon2:c.T663C:p.F221F,NFATC1:NM_172387:exon2:c.T624C:p.F208F,NFATC1:NM_172389:exon2:c.T624C:p.F208F,NFATC1:NM_172390:exon2:c.T663C:p.F221F	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.935846	nearby_gap_events	REJECT	14	10	4	0
chr18	77171142	77171142	C	G	exonic	NFATC1	NaN	synonymous SNV	NFATC1:NM_001278669:exon2:c.C867G:p.G289G,NFATC1:NM_001278670:exon2:c.C867G:p.G289G,NFATC1:NM_001278672:exon2:c.C828G:p.G276G,NFATC1:NM_001278675:exon2:c.C828G:p.G276G,NFATC1:NM_006162:exon2:c.C867G:p.G289G,NFATC1:NM_172387:exon2:c.C828G:p.G276G,NFATC1:NM_172389:exon2:c.C828G:p.G276G,NFATC1:NM_172390:exon2:c.C867G:p.G289G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	39	38	1	0
chr18	77182583	77182583	G	G	intronic	NFATC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr18	77205356	77205356	C	C	intronic	NFATC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr18	77210902	77210902	C	T	intronic	NFATC1	NaN	NaN	NaN	rs680802	NaN	0.996006	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	2805.77	0	NaN	NA	NA	247	1	246	26
chr18	77219523	77219523	T	C	intronic	NFATC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	14	10	4	0
chr18	77219634	77219634	C	C	intronic	NFATC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	21	21	0	0
chr18	77246340	77246340	T	TC	exonic	NFATC1	NaN	frameshift substitution	NFATC1:NM_001278673:exon8:c.769_769delinsTC,NFATC1:NM_172388:exon8:c.769_769delinsTC,NFATC1:NM_001278669:exon9:c.2185_2185delinsTC,NFATC1:NM_006162:exon9:c.2185_2185delinsTC,NFATC1:NM_172387:exon9:c.2146_2146delinsTC,NFATC1:NM_172389:exon9:c.2146_2146delinsTC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	11.9202	0	NaN	NA	NA	21	16	3	0
chr18	77246406	77246406	T	G	exonic	NFATC1	NaN	nonsynonymous SNV	NFATC1:NM_001278673:exon8:c.T835G:p.C279G,NFATC1:NM_172388:exon8:c.T835G:p.C279G,NFATC1:NM_001278669:exon9:c.T2251G:p.C751G,NFATC1:NM_006162:exon9:c.T2251G:p.C751G,NFATC1:NM_172387:exon9:c.T2212G:p.C738G,NFATC1:NM_172389:exon9:c.T2212G:p.C738G	rs754093	ID=COSM438403;OCCURENCE=1(breast)	0.338858	0	D	0.872	P	0.325	B	0.001	N	0.000	P	1.73	L	2.03	T	-0.908	T	0.000	T	0.448	1.124	9.583	3.49	0.745	4.802	9.691	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.617496	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	26	12	44
chr18	77246737	77246737	T	C	exonic	NFATC1	NaN	nonsynonymous SNV	NFATC1:NM_001278673:exon8:c.T1166C:p.L389P,NFATC1:NM_001278669:exon9:c.T2582C:p.L861P,NFATC1:NM_172387:exon9:c.T2543C:p.L848P	NaN	NaN	NaN	.	.	0.989	D	0.726	P	0.846	N	1.000	D	0.895	L	2.66	T	-1.131	T	0.087	T	0.646	1.176	9.783	3.27	0.675	1.755	9.82	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.90556	0	NaN	NA	NA	14	12	2	0
chr18	77247079	77247079	A	A	intronic	NFATC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr18	77343468	77343468	C	A	intergenic	NFATC1,CTDP1	dist=54145;dist=96333	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	77456172	77456172	A	G	intronic	CTDP1	NaN	NaN	NaN	rs655609	NaN	0.744808	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	246.605667	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	83	0	83	55
chr18	77457427	77457427	A	A	intronic	CTDP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	77475411	77475411	A	A	exonic	CTDP1	NaN	synonymous SNV	CTDP1:NM_001202504:exon8:c.A1594A:p.I532I,CTDP1:NM_004715:exon8:c.A1951A:p.I651I,CTDP1:NM_048368:exon8:c.A1951A:p.I651I	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	80	65	0	0
chr18	77478139	77478139	C	G	intronic	CTDP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	77489210	77489210	A	T	intronic	CTDP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	3	1	1	0
chr18	77505057	77505057	T	G	intronic	CTDP1	NaN	NaN	NaN	rs72976190	NaN	0.0527157	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	77513446	77513446	C	T	intronic	CTDP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.399497	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	357	341	16	0
chr18	77515080	77515080	G	G	downstream	CTDP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	77554886	77554886	G	C	intergenic	CTDP1,KCNG2	dist=40376;dist=68782	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	77554887	77554887	A	C	intergenic	CTDP1,KCNG2	dist=40377;dist=68781	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	77555024	77555024	G	A	intergenic	CTDP1,KCNG2	dist=40514;dist=68644	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	77555027	77555027	G	A	intergenic	CTDP1,KCNG2	dist=40517;dist=68641	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	77589655	77589655	G	A	intergenic	CTDP1,KCNG2	dist=75145;dist=34013	NaN	NaN	rs498541	NaN	0.355232	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	18	4	14	0
chr18	77589689	77589689	G	A	intergenic	CTDP1,KCNG2	dist=75179;dist=33979	NaN	NaN	rs499260	NaN	0.355232	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	17	4	13	0
chr18	77592660	77592660	C	G	intergenic	CTDP1,KCNG2	dist=78150;dist=31008	NaN	NaN	rs537962	NaN	0.356829	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	77626564	77626564	A	G	intronic	KCNG2	NaN	NaN	NaN	rs62103183	NaN	0.361422	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr18	77659017	77659017	C	A	intronic	KCNG2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.574819	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	5	1	4	0
chr18	77663940	77663940	G	A	UTR3	PQLC1	NM_025078:c.*36C>T,NM_001146345:c.*36C>T,NM_001146343:c.*182C>T	NaN	NaN	rs3744881	NaN	0.278155	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.861933	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	17	9	8	36
chr18	77664296	77664296	G	C	intronic	PQLC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.30769230769230677	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr18	77747020	77747020	A	A	intronic	TXNL4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr18	77797321	77797321	C	T	intronic	RBFA	NaN	NaN	NaN	rs748337	NaN	0.783147	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	139.632	0	NaN	NA	NA	123	79	44	47
chr18	77805948	77805948	GA	AG,GC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	279.621	0	NaN	NA	NA	79	27	3	10
chr18	77805950	77805950	A	A	exonic	RBFA	NaN	synonymous SNV	RBFA:NM_024805:exon7:c.A827A:p.K276K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	82	77	0	0
chr18	77894578	77894578	G	T	exonic	ADNP2	NaN	nonsynonymous SNV	ADNP2:NM_014913:exon4:c.G1282T:p.G428W	NaN	NaN	NaN	.	.	0.073	B	0.064	B	0.001	D	0.950	D	0.55	N	.	.	-1.065	T	0.078	T	0.512	2.065	12.86	3.01	1.287	1.415	4.65	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.356517	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	414	396	18	0
chr18	77896572	77896572	A	G	exonic	ADNP2	NaN	synonymous SNV	ADNP2:NM_014913:exon4:c.A3276G:p.G1092G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.619649	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	141	126	15	0
chr18	77896743	77896743	T	C	UTR3	ADNP2	NM_014913:c.*51T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.495001	alt_allele_in_normal,clustered_read_position	REJECT	92	84	8	0
chr18	77938602	77938602	A	G	intronic	PARD6G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	77938604	77938604	C	A	intronic	PARD6G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	4	0	4	0
chr18	77960599	77960599	T	C	exonic	PARD6G	NaN	nonsynonymous SNV	PARD6G:NM_032510:exon2:c.A289G:p.K97E	NaN	NaN	NaN	.	.	0.801	P	0.61	P	0.000	D	0.977	D	1.75	L	2.02	T	-1.115	T	0.073	T	0.293	3.821	19.41	5.41	2.271	2.404	11.027	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.1223	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	40	37	3	0
chr18	77960844	77960844	G	G	intronic	PARD6G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	47	37	0	0
chr18	78003909	78003909	T	C	intronic	PARD6G	NaN	NaN	NaN	rs6506820	NaN	0.173323	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	10	4	5	0
chr18	8070044	8070044	A	A	intronic	PTPRM	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr18	8542727	8542727	A	A	intergenic	PTPRM,RAB12	dist=135868;dist=66716	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr18	8658980	8658980	A	T	intergenic	RAB12,GACAT2	dist=19600;dist=36874	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	8747018	8747018	G	T	intronic	MTCL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr18	8748283	8748283	A	G	intronic	MTCL1	NaN	NaN	NaN	rs657716	NaN	0.516973	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	15	9	5	0
chr18	8786031	8786031	G	A	exonic	MTCL1	NaN	nonsynonymous SNV	MTCL1:NM_015210:exon7:c.G1829A:p.R610H	rs202096044	NaN	0.00738818	0.1	T	0.05	B	0.015	B	0.326	N	1.000	D	1.445	L	0.71	T	-1.074	T	0.060	T	0.258	1.642	11.45	2.74	0.277	4.366	11.209	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	69.2718	0	20.796841	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	1	8	0
chr18	8798374	8798374	G	A	intronic	MTCL1	NaN	NaN	NaN	rs606431	NaN	0.662141	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	278.253592	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	97	0	97	53
chr18	8826377	8826377	A	A	intronic	MTCL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	13	11	0	0
chr18	905512	905512	C	T	intronic	ADCYAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.566304	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	197	190	7	0
chr18	9122733	9122733	G	C	ncRNA_intronic	NDUFV2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	36	26	10	0
chr18	9122735	9122735	T	C	ncRNA_intronic	NDUFV2-AS1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	36	26	10	0
chr18	9258795	9258795	A	G	exonic	ANKRD12	NaN	nonsynonymous SNV	ANKRD12:NM_001083625:exon8:c.A5461G:p.K1821E,ANKRD12:NM_001204056:exon8:c.A5461G:p.K1821E,ANKRD12:NM_015208:exon9:c.A5530G:p.K1844E	NaN	NaN	NaN	0	D	0.952	P	0.54	P	0.000	D	0.999	D	2.16	M	-0.66	T	-0.161	T	0.383	T	0.513	4.049	20.8	5.44	2.186	6.043	15.789	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.812388	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	277	258	19	0
chr18	9264044	9264044	A	T	intronic	ANKRD12	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	14	7	7	0
chr18	9513279	9513279	A	A	exonic	RALBP1	NaN	synonymous SNV	RALBP1:NM_006788:exon2:c.A236A:p.E79E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	6	0	0
chr18	9533512	9533512	A	T	intronic	RALBP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	15	3	12	0
chr18	9561924	9561924	T	A	intronic	PPP4R1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr18	9577002	9577002	T	T	intronic	PPP4R1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	66	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr18	9859157	9859157	T	T	intronic	RAB31	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr18	9887073	9887073	A	G	exonic	TXNDC2	NaN	synonymous SNV	TXNDC2:NM_001098529:exon2:c.A597G:p.E199E,TXNDC2:NM_032243:exon2:c.A396G:p.E132E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	12.8868	0	NaN	NA	NA	12	9	3	1
chr18	9887429	9887429	C	T	exonic	TXNDC2	NaN	nonsynonymous SNV	TXNDC2:NM_001098529:exon2:c.C953T:p.P318L,TXNDC2:NM_032243:exon2:c.C752T:p.P251L	rs2240908	NaN	0.247604	.	.	0.003	B	0.012	B	0.235	N	1.000	P	0.97	L	2.33	T	-0.979	T	0.000	T	0.031	1.227	9.978	1.67	0.245	-0.321	8.377	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	64	NaN	NA	NA	55	42	13	30
chr18	9887546	9887546	G	A	exonic	TXNDC2	NaN	nonsynonymous SNV	TXNDC2:NM_001098529:exon2:c.G1070A:p.G357D,TXNDC2:NM_032243:exon2:c.G869A:p.G290D	rs2240906	ID=COSM1389977,COSM1389978;OCCURENCE=1(large_intestine)	0.481629	.	.	0.023	B	0.051	B	.	.	1.000	P	0.75	N	1.43	T	-1.039	T	0.000	T	0.052	-0.176	3.140	0.852	-0.049	-1.783	6.363	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	19.2891	0	NaN	NA	NA	23	17	6	18
chr18	9887666	9887666	T	C	exonic	TXNDC2	NaN	nonsynonymous SNV	TXNDC2:NM_001098529:exon2:c.T1190C:p.I397T,TXNDC2:NM_032243:exon2:c.T989C:p.I330T	NaN	NaN	NaN	.	.	0.851	P	0.408	B	0.009	N	1.000	N	0.74	N	3.43	T	-1.011	T	0.015	T	0.051	1.133	9.618	-4.79	-1.013	-1.118	5.504	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.733701	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	231	211	20	0
chr19	1004511	1004511	T	C	intronic	GRIN3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.206465	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	127	115	12	0
chr19	1004512	1004512	G	T	intronic	GRIN3B	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.891015	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	127	115	12	0
chr19	1004710	1004710	C	T	exonic	GRIN3B	NaN	nonsynonymous SNV	GRIN3B:NM_138690:exon3:c.C1210T:p.R404W	rs4807399	NaN	0.361621	0.18	T	0.033	B	0.003	B	0.003	N	1.000	P	1.095	L	2.72	T	-0.902	T	0.000	T	0.073	-0.656	1.117	-3.29	-0.291	-1.671	1.740	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.279582	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	43	25	18	36
chr19	1004740	1004740	T	C	exonic	GRIN3B	NaN	nonsynonymous SNV	GRIN3B:NM_138690:exon3:c.T1240C:p.W414R	rs2240157	NaN	0.68151	0.55	T	0.0	B	0.0	B	0.024	N	1.000	P	-2.175	N	0.88	T	-0.988	T	0.000	T	0.044	-1.149	0.103	3.35	0.880	0.585	9.816	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.521499	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	24	16	50
chr19	1005531	1005531	G	C	exonic	GRIN3B	NaN	synonymous SNV	GRIN3B:NM_138690:exon3:c.G2031C:p.L677L	rs12973948	NaN	0.234625	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	20.31026	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	14	9	25
chr19	10071635	10071635	G	G	intronic	COL5A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	111	89	0	0
chr19	10077150	10077150	G	C,GCC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	31.0095	0	NaN	NA	NA	14	7	2	0
chr19	10080140	10080140	C	G	intronic	COL5A3	NaN	NaN	NaN	rs2277966	NaN	0.467053	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	125.605	0	NaN	NA	NA	23	5	18	20
chr19	10080604	10080604	A	A	intronic	COL5A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	4	0	0
chr19	1008879	1008879	G	C	exonic	GRIN3B	NaN	synonymous SNV	GRIN3B:NM_138690:exon8:c.G2655C:p.T885T	rs2285907	NaN	0.109425	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	22.598437	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	17	12	12
chr19	1008924	1008924	C	A	exonic	GRIN3B	NaN	synonymous SNV	GRIN3B:NM_138690:exon8:c.C2700A:p.P900P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.841688	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	58	52	6	0
chr19	10089270	10089270	G	T	exonic	COL5A3	NaN	nonsynonymous SNV	COL5A3:NM_015719:exon41:c.C2998A:p.P1000T	NaN	NaN	NaN	0.23	T	0.016	B	0.008	B	0.023	N	0.979	D	1.635	L	-3.34	D	0.230	D	0.695	D	0.207	1.751	11.82	4.74	2.203	3.140	13.251	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.801205	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	93	86	7	0
chr19	10091897	10091897	A	A	intronic	COL5A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	7	0	0
chr19	1009585	1009585	C	G	exonic	GRIN3B	NaN	nonsynonymous SNV	GRIN3B:NM_138690:exon9:c.C3116G:p.P1039R	rs10401454	NaN	0.255391	0.85	T	0.011	B	0.001	B	0.002	U	1.000	P	0	N	2.81	T	-0.949	T	0.000	T	0.032	-0.072	3.647	-3.57	-0.787	-2.539	2.269	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	39.403695	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	32	12	20	24
chr19	10096482	10096482	C	T	intronic	COL5A3	NaN	NaN	NaN	rs11670705	NaN	0.197085	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1073.14	0	NaN	NA	NA	310	116	194	9
chr19	10096915	10096915	T	A	intronic	COL5A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr19	10097442	10097442	A	T	intronic	COL5A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.810577	nearby_gap_events	REJECT	43	36	7	0
chr19	10099748	10099748	T	C	intronic	COL5A3	NaN	NaN	NaN	rs11883111	NaN	0.44349	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	105.281161	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	21	45	26
chr19	10103811	10103811	G	C	intronic	COL5A3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.937992	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	92	83	9	0
chr19	1010691	1010691	A	A	exonic	TMEM259	NaN	synonymous SNV	TMEM259:NM_001033026:exon11:c.T1521T:p.P507P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr19	1010773	1010773	T	T	exonic	TMEM259	NaN	synonymous SNV	TMEM259:NM_001033026:exon11:c.A1439A:p.D480D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr19	10108091	10108091	C	G	exonic	COL5A3	NaN	nonsynonymous SNV	COL5A3:NM_015719:exon11:c.G1219C:p.G407R	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	1.0	D	0.000	U	1.000	D	4.67	H	-5.77	D	0.980	D	0.989	D	0.822	3.682	18.71	4.14	2.014	5.341	12.283	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.411875	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	211	187	24	15
chr19	10116375	10116375	G	T	exonic	COL5A3	NaN	synonymous SNV	COL5A3:NM_015719:exon4:c.C453A:p.A151A	rs2303099	NaN	0.508586	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	160.980807	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	1	52	38
chr19	1011823	1011823	A	G	intronic	TMEM259	NaN	NaN	NaN	rs2240161	NaN	0.674321	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.545497	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	15	14	48
chr19	1011846	1011846	T	C	intronic	TMEM259	NaN	NaN	NaN	rs10420656	NaN	0.392971	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	30.205443	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	17	14	31
chr19	1011864	1011864	C	C	intronic	TMEM259	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr19	1011999	1011999	A	G	intronic	TMEM259	NaN	NaN	NaN	rs116854930	NaN	0.124002	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.497544	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	24	9	7
chr19	1012002	1012002	A	G	intronic	TMEM259	NaN	NaN	NaN	rs117246624	NaN	0.125	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.610964	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	24	9	7
chr19	1014398	1014398	A	G	exonic	TMEM259	NaN	synonymous SNV	TMEM259:NM_001033026:exon2:c.T300C:p.H100H,TMEM259:NM_033420:exon2:c.T300C:p.H100H	rs7146	NaN	0.67512	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	52.613117	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	19	21	43
chr19	1016780	1016780	T	C	intronic	TMEM259	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	1016786	1016786	A	C	intronic	TMEM259	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	10200252	10200252	G	A	intronic	C19orf66	NaN	NaN	NaN	rs371707704	NaN	0.000199681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	234.493	0	NaN	NA	NA	95	46	49	0
chr19	10204175	10204175	G	A	exonic	ANGPTL6	NaN	nonsynonymous SNV	ANGPTL6:NM_031917:exon5:c.C1072T:p.R358C	rs147149731	NaN	0.00419329	0	D	0.173	B	0.022	B	0.004	N	0.998	N	-0.895	N	-1.47	T	-0.896	T	0.119	T	0.094	1.302	10.26	2.3	0.533	2.939	6.417	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	182.518	0	NaN	NA	NA	61	27	34	2
chr19	1020736	1020736	T	G	intronic	TMEM259	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.071867	nearby_gap_events	REJECT	65	58	7	0
chr19	10218568	10218568	G	T	intronic	PPAN,PPAN-P2RY11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.382989	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	191	174	17	0
chr19	10224815	10224815	G	C	exonic	P2RY11,PPAN-P2RY11	NaN	nonsynonymous SNV	P2RY11:NM_002566:exon2:c.G526C:p.G176R,PPAN-P2RY11:NM_001040664:exon13:c.G1786C:p.G596R	NaN	NaN	NaN	0.47	T	0.065	B	0.037	B	.	.	1.000	N	1.125	L	1.18	T	-1.008	T	0.047	T	0.083	2.235	13.43	-7.58	-1.011	-0.182	4.617	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.32118	nearby_gap_events	REJECT	16	10	6	1
chr19	10224819	10224819	C	G	exonic	P2RY11,PPAN-P2RY11	NaN	nonsynonymous SNV	P2RY11:NM_002566:exon2:c.C530G:p.A177G,PPAN-P2RY11:NM_001040664:exon13:c.C1790G:p.A597G	NaN	NaN	NaN	0.36	T	0.001	B	0.005	B	.	.	1.000	N	-0.205	N	1.28	T	-1.019	T	0.032	T	0.123	0.784	8.134	-5.42	-1.710	-0.057	5.400	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.374441	nearby_gap_events	REJECT	16	11	5	0
chr19	10225888	10225888	G	C	UTR3	P2RY11,PPAN-P2RY11	NM_002566:c.*474G>C;NM_001198690:c.*1358G>C,NM_001040664:c.*474G>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.544482	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	84	76	8	0
chr19	10226685	10226685	C	G	exonic	EIF3G	NaN	nonsynonymous SNV	EIF3G:NM_003755:exon8:c.G661C:p.G221R	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.983	D	0.579	P	0.000	D	1.000	D	1.6	L	1.25	T	-1.021	T	0.105	T	0.739	3.390	17.44	3.15	0.938	4.304	12.012	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.91899	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	51	44	7	0
chr19	10227723	10227723	C	A	intronic	EIF3G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.229577	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	68	54	14	0
chr19	10229533	10229533	C	A	intronic	EIF3G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	31.589	0	NaN	NA	NA	31	21	5	10
chr19	10230054	10230054	A	G	intronic	EIF3G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	10246914	10246914	G	G	exonic	DNMT1	NaN	synonymous SNV	DNMT1:NM_001379:exon37:c.C4491C:p.P1497P,DNMT1:NM_001130823:exon38:c.C4539C:p.P1513P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	22	19	0	0
chr19	10250361	10250361	G	A	exonic	DNMT1	NaN	synonymous SNV	DNMT1:NM_001379:exon33:c.C3891T:p.G1297G,DNMT1:NM_001130823:exon34:c.C3939T:p.G1313G	rs142903301	NaN	0.00239617	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	103.959679	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	66	23	43	4
chr19	10251606	10251606	G	A	intronic	DNMT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.15584415584415545	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr19	10259514	10259514	T	T	intronic	DNMT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	17	13	0	0
chr19	10267049	10267049	T	T	intronic	DNMT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr19	10283931	10283931	T	C	intronic	DNMT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.51139	clustered_read_position	REJECT	139	123	16	0
chr19	10305555	10305555	T	T	exonic	DNMT1	NaN	synonymous SNV	DNMT1:NM_001130823:exon1:c.A21A:p.P7P,DNMT1:NM_001379:exon1:c.A21A:p.P7P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	23	23	0	0
chr19	10334620	10334620	G	T	exonic	S1PR2	NaN	nonsynonymous SNV	S1PR2:NM_004230:exon2:c.C962A:p.P321Q	NaN	NaN	NaN	0.06	T	0.995	D	0.88	P	0.629	N	1.000	D	0.975	L	.	.	-0.729	T	0.314	T	0.277	4.067	20.9	5.49	2.586	6.127	18.144	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	32.4867	0	NaN	NA	NA	15	10	7	11
chr19	10335695	10335695	A	T	intronic	S1PR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	1	0	1	0
chr19	10368954	10368954	A	G	exonic	MRPL4	NaN	nonsynonymous SNV	MRPL4:NM_015956:exon6:c.A502G:p.K168E,MRPL4:NM_146388:exon6:c.A502G:p.K168E,MRPL4:NM_146387:exon7:c.A502G:p.K168E	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.879	P	0.896	P	0.000	D	1.000	D	3.385	M	.	.	0.270	D	0.554	D	0.953	3.754	19.06	5.32	1.999	8.411	13.213	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.03571428571428577	NA	0	0	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr19	10368956	10368956	G	A	exonic	MRPL4	NaN	synonymous SNV	MRPL4:NM_015956:exon6:c.G504A:p.K168K,MRPL4:NM_146388:exon6:c.G504A:p.K168K,MRPL4:NM_146387:exon7:c.G504A:p.K168K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.09523809523809613	NA	0	0	NaN	NA	NA	5	3	2	0
chr19	10370359	10370359	T	A	exonic	MRPL4	NaN	nonsynonymous SNV	MRPL4:NM_015956:exon9:c.T806A:p.L269Q,MRPL4:NM_146387:exon10:c.T806A:p.L269Q	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	3.415	M	.	.	0.339	D	0.569	D	0.985	4.581	24.9	5.1	1.917	7.207	12.838	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	24.3436	0	10.615368	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	5	1	4	0
chr19	10370360	10370360	G	C	exonic	MRPL4	NaN	synonymous SNV	MRPL4:NM_015956:exon9:c.G807C:p.L269L,MRPL4:NM_146387:exon10:c.G807C:p.L269L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.944572	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	6	2	4	0
chr19	10395172	10395172	T	C	exonic	ICAM1	NaN	nonsynonymous SNV	ICAM1:NM_000201:exon5:c.T1019C:p.V340A	NaN	NaN	NaN	0	D	0.959	D	0.853	P	0.002	N	1.000	N	2.47	M	2.78	T	-1.085	T	0.062	T	0.292	2.876	15.58	3.08	0.739	0.021	6.140	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.37994	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	156	144	12	0
chr19	10400728	10400728	G	C	exonic	ICAM5	NaN	synonymous SNV	ICAM5:NM_003259:exon1:c.G9C:p.G3G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	18	18	0	0
chr19	1042467	1042467	C	A	intronic	ABCA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	47.305124	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	225	191	34	0
chr19	10426422	10426422	A	C	exonic	FDX1L	NaN	synonymous SNV	FDX1L:NM_001031734:exon2:c.T168G:p.A56A	rs378395	ID=COSM438464;OCCURENCE=1(breast)	0.492812	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.532442	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	7	0	7	40
chr19	10426524	10426524	G	A	intronic	FDX1L	NaN	NaN	NaN	rs79442975	NaN	0.0211661	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	45.5227	34	12.602064	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	6	1	5	2
chr19	10426569	10426569	T	C	exonic	FDX1L	NaN	nonsynonymous SNV	FDX1L:NM_001031734:exon1:c.A113G:p.E38G	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.0	B	0.0	B	0.680	N	1.000	N	0.345	N	.	.	-1.022	T	0.059	T	0.347	1.429	10.72	2.02	0.369	0.330	5.229	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	10	5	5	0
chr19	10431761	10431761	A	C	exonic	RAVER1	NaN	nonsynonymous SNV	RAVER1:NM_133452:exon8:c.T1487G:p.L496R	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.995	D	0.979	D	0.325	U	0.931	N	1.39	L	2.79	T	-1.079	T	0.046	T	0.573	2.794	15.30	1.99	0.501	1.792	4.297	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.053046	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	78	73	5	0
chr19	10431762	10431762	G	T	exonic	RAVER1	NaN	nonsynonymous SNV	RAVER1:NM_133452:exon8:c.C1486A:p.L496I	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.956	P	0.899	P	0.325	U	0.996	N	1.04	L	2.85	T	-1.095	T	0.041	T	0.213	3.120	16.43	3.03	1.964	3.608	8.090	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.38723	clustered_read_position	REJECT	80	75	5	0
chr19	10432334	10432334	T	G	intronic	RAVER1	NaN	NaN	NaN	rs12983649	NaN	0.171925	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	33.267995	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	13	15	12
chr19	10433360	10433360	C	T	exonic	RAVER1	NaN	synonymous SNV	RAVER1:NM_133452:exon6:c.G1185A:p.T395T	rs117798643	NaN	0.00798722	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	41.142013	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	31	15	16	5
chr19	10433397	10433397	G	G	exonic	RAVER1	NaN	synonymous SNV	RAVER1:NM_133452:exon6:c.C1148C:p.P383P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	19	17	0	0
chr19	10441073	10441073	C	T	intronic	RAVER1	NaN	NaN	NaN	rs78630786	NaN	0.0211661	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	86.078592	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	65	29	36	7
chr19	10441118	10441118	C	G	intronic	RAVER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.331876	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	57	51	6	0
chr19	10445865	10445865	C	T	exonic	ICAM3	NaN	nonsynonymous SNV	ICAM3:NM_002162:exon4:c.G814A:p.D272N	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.743	P	0.721	P	0.020	N	0.971	N	2.31	M	3.79	T	-1.161	T	0.040	T	0.077	4.979	29.1	5.15	2.543	0.988	14.462	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	24	24	0	0
chr19	10463222	10463222	G	C	exonic	TYK2	NaN	nonsynonymous SNV	TYK2:NM_003331:exon23:c.C3206G:p.A1069G	NaN	ID=COSM48834;OCCURENCE=1(lung)	NaN	.	.	0.977	D	0.849	P	0.087	N	1.000	D	3.395	M	-3.71	D	1.088	D	0.934	D	0.815	5.121	32	5.35	2.529	7.378	16.613	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	7	5	2	0
chr19	10467172	10467172	G	C	intronic	TYK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr19	10467175	10467175	A	T	intronic	TYK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr19	10467176	10467176	T	G	intronic	TYK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	4	0	3	0
chr19	10472466	10472466	T	T	exonic	TYK2	NaN	synonymous SNV	TYK2:NM_003331:exon13:c.A1939A:p.S647S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	55	54	0	0
chr19	10479028	10479028	G	T	exonic	TYK2	NaN	nonsynonymous SNV	TYK2:NM_003331:exon4:c.C260A:p.P87Q	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.003	N	1.000	D	2.685	M	-1.52	D	0.497	D	0.683	D	0.604	4.591	25.0	5.17	2.408	8.234	14.193	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0567175252669469	NA	0	0	NaN	NA	NA	24	19	5	0
chr19	1053790	1053790	T	C	exonic	ABCA7	NaN	nonsynonymous SNV	ABCA7:NM_019112:exon25:c.T3427C:p.F1143L	NaN	NaN	NaN	0	D	0.998	D	0.927	D	.	.	0.883	N	3.175	M	-2.72	D	0.248	D	0.823	D	0.549	3.553	18.12	2.97	1.588	5.216	3.044	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.4592	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	29	26	3	0
chr19	10557159	10557159	G	T	intronic	PDE4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.705454	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	186	179	7	0
chr19	10557160	10557160	T	C	intronic	PDE4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.368205	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	184	176	8	0
chr19	1055874	1055874	T	G	intronic	ABCA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr19	1055875	1055875	C	A	intronic	ABCA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr19	1055876	1055876	T	G	intronic	ABCA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr19	1055880	1055880	T	A	intronic	ABCA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr19	1055882	1055882	T	G	intronic	ABCA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr19	1056002	1056002	C	T	intronic	ABCA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.02455	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	136	130	6	0
chr19	1056019	1056019	C	C	intronic	ABCA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	34	29	0	0
chr19	1056539	1056539	A	A	intronic	ABCA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	15	13	0	0
chr19	1056787	1056787	C	T	intronic	ABCA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	11	6	5	0
chr19	10571846	10571846	A	C	intronic	PDE4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr19	10572168	10572168	T	T	intronic	PDE4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	5	3	0	0
chr19	10572339	10572339	A	G	exonic	PDE4A	NaN	nonsynonymous SNV	PDE4A:NM_006202:exon7:c.A886G:p.K296E,PDE4A:NM_001111307:exon12:c.A1603G:p.K535E,PDE4A:NM_001111308:exon12:c.A1525G:p.K509E,PDE4A:NM_001111309:exon12:c.A1420G:p.K474E,PDE4A:NM_001243121:exon14:c.A1537G:p.K513E	NaN	NaN	NaN	0	D	0.983	D	0.817	P	0.000	D	1.000	D	1.775	L	-0.52	T	-0.215	T	0.394	T	0.666	3.946	20.2	3.92	1.652	9.022	10.736	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.249991	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	57	53	4	0
chr19	10574665	10574665	G	G	intronic	PDE4A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	101	75	0	0
chr19	1059004	1059004	A	G	intronic	ABCA7	NaN	NaN	NaN	rs2279796	NaN	0.574681	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1387.39	0	NaN	NA	NA	94	0	94	40
chr19	1059150	1059150	A	A	intronic	ABCA7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr19	10600041	10600041	A	G	exonic	KEAP1	NaN	nonsynonymous SNV	KEAP1:NM_012289:exon5:c.T1535C:p.V512A,KEAP1:NM_203500:exon5:c.T1535C:p.V512A	NaN	NaN	NaN	0.1	T	0.202	B	0.21	B	0.000	D	0.995	D	0.535	N	-1.13	T	-0.667	T	0.255	T	0.387	1.342	10.41	4.47	2.136	6.326	5.559	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.173055	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	348	340	8	0
chr19	10600564	10600564	A	T	intronic	KEAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr19	10600567	10600567	A	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	5	1	2,2	0
chr19	1064185	1064185	T	C	exonic	ABCA7	NaN	nonsynonymous SNV	ABCA7:NM_019112:exon45:c.T5977C:p.S1993P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.086	B	0.112	B	.	.	0.908	N	1.805	L	-4.0	D	0.393	D	0.812	D	0.346	2.039	12.77	2.21	0.331	5.821	6.79	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.783715	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	101	96	5	0
chr19	1065018	1065018	G	T	exonic	ABCA7	NaN	nonsynonymous SNV	ABCA7:NM_019112:exon46:c.G6133T:p.A2045S	rs4147934	NaN	0.605032	0.97	T	0.057	B	0.052	B	.	.	1.000	P	1.15	L	-1.69	D	-0.933	T	0.000	T	0.125	-0.977	0.295	1.15	0.253	1.745	5.61	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	131.851964	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	45	0	45	38
chr19	10659737	10659737	C	T	intronic	ATG4D	NaN	NaN	NaN	rs12979378	ID=COSN165722;OCCURENCE=1(NS)	0.128794	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	86.843673	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	98	55	43	21
chr19	1066256	1066256	G	A	intronic	HMHA1	NaN	NaN	NaN	rs4147938	NaN	0.598842	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	6	0	6	0
chr19	10672493	10672493	C	T	exonic	KRI1	NaN	nonsynonymous SNV	KRI1:NM_023008:exon5:c.G430A:p.G144R	rs12984043	ID=COSM148508;OCCURENCE=1(stomach)	0.261581	0.41	T	0.05	B	0.005	B	0.051	N	0.988	P	1.845	L	1.47	T	-0.932	T	0.000	T	0.258	0.518	6.809	1.67	0.888	3.193	8.125	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	123.548	0	NaN	NA	NA	59	31	28	30
chr19	10675588	10675588	C	T	intronic	KRI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr19	10675589	10675589	A	C	intronic	KRI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr19	10675590	10675590	G	T	intronic	KRI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr19	10675593	10675593	G	T	intronic	KRI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr19	10676256	10676256	T	T	intronic	KRI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr19	10676344	10676344	G	T	intronic	KRI1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	44	NaN	NA	NA	102	73	27	2
chr19	10677693	10677693	T	A	UTR3	CDKN2D	NM_079421:c.*41A>T,NM_001800:c.*41A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr19	10679240	10679240	C	G	exonic	CDKN2D	NaN	synonymous SNV	CDKN2D:NM_001800:exon1:c.G90C:p.R30R,CDKN2D:NM_079421:exon2:c.G90C:p.R30R	rs1968445	NaN	0.972444	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	40.088579	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	33
chr19	1068734	1068734	T	C	exonic	HMHA1	NaN	synonymous SNV	HMHA1:NM_001258328:exon2:c.T460C:p.L154L,HMHA1:NM_012292:exon2:c.T412C:p.L138L	rs3764653	NaN	0.404752	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.78081	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	26
chr19	1068738	1068738	G	A	exonic	HMHA1	NaN	nonsynonymous SNV	HMHA1:NM_001258328:exon2:c.G464A:p.R155H,HMHA1:NM_012292:exon2:c.G416A:p.R139H	rs1801284	NaN	0.404752	0.15	T	0.008	B	0.002	B	0.854	N	1.000	P	0.895	L	2.01	T	-0.946	T	0.000	T	0.051	-0.171	3.168	-8.44	-4.781	-1.052	16.357	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.680058	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	27
chr19	10690572	10690572	A	A	intronic	AP1M2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr19	10738748	10738748	T	C	intronic	SLC44A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr19	1074000	1074000	A	T	exonic	HMHA1	NaN	nonsynonymous SNV	HMHA1:NM_001282335:exon5:c.A426T:p.E142D,HMHA1:NM_001258328:exon6:c.A825T:p.E275D,HMHA1:NM_012292:exon6:c.A777T:p.E259D	rs2074442	NaN	0.776558	0.74	T	0.004	B	0.003	B	0.733	N	0.962	P	1.78	L	2.06	T	-0.946	T	0.000	T	0.07	0.061	4.331	-1.37	-0.361	-0.697	2.021	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	29.815607	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	12	1	11	45
chr19	1074063	1074063	GC	G,GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	101.52	0	NaN	NA	NA	12	0	2	0
chr19	10741907	10741907	A	G	intronic	SLC44A2	NaN	NaN	NaN	rs12972963	NaN	0.786342	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	82.983214	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	0	33	46
chr19	1074466	1074466	A	A	intronic	HMHA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	12	10	0	0
chr19	10748820	10748820	T	C	intronic	SLC44A2	NaN	NaN	NaN	rs3859514	NaN	0.677716	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	83.156815	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	83	44	39	52
chr19	10752988	10752988	G	T	intronic	SLC44A2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.645692	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	91	79	12	0
chr19	10792748	10792748	G	A	exonic	ILF3	NaN	synonymous SNV	ILF3:NM_001137673:exon12:c.G1260A:p.L420L,ILF3:NM_004516:exon12:c.G1260A:p.L420L,ILF3:NM_012218:exon12:c.G1260A:p.L420L,ILF3:NM_017620:exon12:c.G1260A:p.L420L,ILF3:NM_153464:exon12:c.G1260A:p.L420L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.114271	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	68	65	3	0
chr19	10794333	10794333	A	C	exonic	ILF3	NaN	nonsynonymous SNV	ILF3:NM_001137673:exon16:c.A1885C:p.M629L,ILF3:NM_004516:exon16:c.A1873C:p.M625L,ILF3:NM_012218:exon16:c.A1873C:p.M625L,ILF3:NM_017620:exon16:c.A1885C:p.M629L,ILF3:NM_153464:exon16:c.A1873C:p.M625L	NaN	NaN	NaN	0.11	T	0.218	B	0.114	B	0.000	D	0.999	D	0	N	2.59	T	-1.007	T	0.020	T	0.486	3.604	18.35	4.81	1.009	4.798	11.516	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.47845	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	32	28	4	0
chr19	10794375	10794375	CT	C,GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	232.377	0	NaN	NA	NA	31	1	22	0
chr19	10794539	10794539	G	C	intronic	ILF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.23529411764705904	NA	0	0	NaN	NA	NA	9	7	2	0
chr19	10794986	10794986	T	A	intronic	ILF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	58	1	51	0
chr19	10795016	10795016	T	A	intronic	ILF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.0013931074168021208	NA	0	0	NaN	NA	NA	57	43	14	0
chr19	10795017	10795017	T	C	intronic	ILF3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.004453291476283721	NA	0	0	NaN	NA	NA	40	29	11	0
chr19	1080311	1080311	G	C	exonic	HMHA1	NaN	synonymous SNV	HMHA1:NM_001282334:exon4:c.G666C:p.P222P,HMHA1:NM_001282335:exon13:c.G1410C:p.P470P,HMHA1:NM_001258328:exon14:c.G1809C:p.P603P,HMHA1:NM_012292:exon14:c.G1761C:p.P587P	rs2074454	ID=COSM438504;OCCURENCE=3(breast)	0.742212	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	97.2762	0	NaN	NA	NA	10	0	7	28
chr19	1080936	1080936	G	A	exonic	HMHA1	NaN	nonsynonymous SNV	HMHA1:NM_001282334:exon7:c.G968A:p.S323N,HMHA1:NM_001282335:exon16:c.G1712A:p.S571N,HMHA1:NM_001258328:exon17:c.G2111A:p.S704N,HMHA1:NM_012292:exon17:c.G2063A:p.S688N	NaN	NaN	NaN	0.29	T	0.9	P	0.466	P	0.000	D	1.000	N	1.67	L	2.07	T	-1.024	T	0.053	T	0.055	2.519	14.38	3.09	1.871	4.961	10.101	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.984014	nearby_gap_events	REJECT	32	28	4	0
chr19	1081120	1081120	A	G	intronic	HMHA1	NaN	NaN	NaN	rs8113708	NaN	0.751198	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	53.278062	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	1	21	37
chr19	10812457	10812457	A	A	intronic	QTRT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr19	1081410	1081410	C	A	intronic	HMHA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	14	2	8	0
chr19	1081413	1081413	G	A	intronic	HMHA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	17	7	8	0
chr19	10818148	10818148	G	T	intronic	QTRT1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.600175	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	362	340	22	0
chr19	1085966	1085966	A	G	exonic	HMHA1	NaN	synonymous SNV	HMHA1:NM_001282334:exon13:c.A2277G:p.T759T,HMHA1:NM_001282335:exon22:c.A3021G:p.T1007T,HMHA1:NM_001258328:exon23:c.A3420G:p.T1140T,HMHA1:NM_012292:exon23:c.A3372G:p.T1124T	rs3761028	ID=COSM438507;OCCURENCE=1(breast)	0.53095	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	47.910106	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	46
chr19	1089797	1089797	G	A	intronic	POLR2E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.785603	nearby_gap_events	REJECT	78	68	10	0
chr19	10904389	10904389	C	A	intronic	DNM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.53869	nearby_gap_events	REJECT	109	101	8	0
chr19	10905963	10905963	T	T	intronic	DNM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr19	10916745	10916745	C	A	intronic	DNM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0.000599042	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.08111	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	220	197	23	0
chr19	10929306	10929306	T	A	intronic	DNM2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	1094004	1094004	G	A	exonic	POLR2E	NaN	nonsynonymous SNV	POLR2E:NM_002695:exon2:c.C131T:p.S44F	rs12459404	NaN	1	1	T	0.0	B	0.0	B	0.000	N	0.999	P	-2.92	N	1.25	T	-0.975	T	0.000	T	0.211	-0.044	3.791	3.64	0.491	5.267	8.170	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	103.77165	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	0	34	56
chr19	1094232	1094232	C	G	intronic	POLR2E	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.926163	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	125	116	9	0
chr19	10943981	10943981	A	A	intronic	TMED1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr19	1095151	1095151	A	G	intronic	POLR2E	NaN	NaN	NaN	rs10416031	NaN	0.777756	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	127.565	0	41.739324	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	0	14	30
chr19	10959097	10959097	T	T	upstream	C19orf38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	34	32	0	0
chr19	10966880	10966880	T	T	intronic	C19orf38	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	8	0	0
chr19	10970558	10970558	A	G	intronic	C19orf38	NaN	NaN	NaN	rs8100581	NaN	0.94988	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	50.433761	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	0	18	55
chr19	10980005	10980005	G	T	exonic	C19orf38	NaN	stopgain	C19orf38:NM_001136482:exon7:c.G655T:p.E219X	NaN	NaN	NaN	0	D	.	.	.	.	0.006	U	0.999	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1.680	11.58	4.43	2.296	4.226	12.424	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	54	29	24	4
chr19	11031438	11031438	C	T	intronic	CARM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	29	29	0	0
chr19	11031464	11031464	C	G	intronic	CARM1	NaN	NaN	NaN	rs2288842	NaN	0.265176	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	399.873	0	NaN	NA	NA	30	1	29	10
chr19	11034474	11034474	C	A	intronic	YIPF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.48368	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	67	62	5	0
chr19	11034968	11034968	A	A	intronic	YIPF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr19	11038698	11038698	A	A	intronic	YIPF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	52	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr19	11038995	11038995	G	C	intronic	YIPF2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr19	11040291	11040291	G	T	exonic	C19orf52	NaN	nonsynonymous SNV	C19orf52:NM_138358:exon2:c.G696T:p.W232C	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.962	D	0.002	N	1.000	D	0.695	N	.	.	-0.609	T	0.241	T	0.631	4.221	21.9	4.98	2.744	0.923	13.942	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.406189	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	87	82	5	0
chr19	11040393	11040393	C	G	UTR3	C19orf52	NM_138358:c.*15C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.991285	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	57	52	5	0
chr19	1104078	1104078	G	A	exonic	GPX4	NaN	unknown	UNKNOWN	rs4807542	NaN	0.144968	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	27	11.283552	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	4	0	4	2
chr19	1105623	1105623	C	G	intronic	GPX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.2477	0	NaN	NA	NA	24	23	4	7
chr19	1105844	1105844	T	G	intronic	GPX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	63.038623	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	89	55	34	0
chr19	1105850	1105850	TG	GG,GT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	65.6976	0	NaN	NA	NA	88	62	5	1
chr19	1105851	1105851	G	T	intronic	GPX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	69	48	21	0
chr19	1106187	1106187	T	G	intronic	GPX4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	26	17	9	0
chr19	1108194	1108194	G	T	UTR3	SBNO2	NM_014963:c.*25C>A,NM_001100122:c.*25C>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	22.511	20	11.352534	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	6	2	4	0
chr19	1108197	1108197	G	C	UTR3	SBNO2	NM_014963:c.*22C>G,NM_001100122:c.*22C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	24.3436	20	11.149051	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	6	2	4	0
chr19	1108198	1108198	C	T	UTR3	SBNO2	NM_014963:c.*21G>A,NM_001100122:c.*21G>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSM	2	NA	NaN	NA	0	20	11.148681	normal_lod,clustered_read_position	REJECT	6	2	4	0
chr19	11097243	11097243	C	T	exonic	SMARCA4	NaN	nonsynonymous SNV	SMARCA4:NM_001128845:exon3:c.C734T:p.A245V,SMARCA4:NM_001128846:exon3:c.C734T:p.A245V,SMARCA4:NM_001128847:exon3:c.C734T:p.A245V,SMARCA4:NM_001128848:exon3:c.C734T:p.A245V,SMARCA4:NM_001128849:exon4:c.C734T:p.A245V,SMARCA4:NM_003072:exon4:c.C734T:p.A245V,SMARCA4:NM_001128844:exon5:c.C734T:p.A245V	NaN	NaN	NaN	0.21	T	0.759	P	0.225	B	0.095	N	0.894	N	0	N	-2.11	D	-0.523	T	0.344	T	0.176	1.845	12.13	4.95	2.303	1.739	10.627	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.1473684210526336	NA	0	0	NaN	NA	NA	8	6	2	0
chr19	11097493	11097493	T	C	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr19	11098682	11098682	A	C	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	9	2	7	0
chr19	11102094	11102094	A	T	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr19	11102095	11102095	A	C	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr19	11105711	11105711	A	G	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	4	0	2	0
chr19	11118551	11118551	A	C	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr19	11118552	11118552	G	T	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr19	11118553	11118553	G	C	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr19	11118556	11118556	A	G	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	2	4	0
chr19	11118558	11118558	A	T	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	7	2	4	0
chr19	11118559	11118559	T	T	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	9	7	0	0
chr19	11123260	11123260	C	C	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr19	1112943	1112943	G	C	exonic	SBNO2	NaN	synonymous SNV	SBNO2:NM_001100122:exon17:c.C2082G:p.T694T,SBNO2:NM_014963:exon20:c.C2253G:p.T751T	rs7249065	NaN	0.0782748	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.864517	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	14	8	6	4
chr19	11129568	11129568	T	T	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr19	11130461	11130461	A	A	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr19	11132614	11132614	A	A	exonic	SMARCA4	NaN	synonymous SNV	SMARCA4:NM_001128845:exon18:c.A2830A:p.N944N,SMARCA4:NM_001128846:exon18:c.A2830A:p.N944N,SMARCA4:NM_001128847:exon18:c.A2830A:p.N944N,SMARCA4:NM_001128848:exon18:c.A2830A:p.N944N,SMARCA4:NM_001128849:exon19:c.A2830A:p.N944N,SMARCA4:NM_003072:exon19:c.A2830A:p.N944N,SMARCA4:NM_001128844:exon20:c.A2830A:p.N944N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	29	28	0	0
chr19	11136215	11136215	C	G	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	rs2075021	NaN	0.450879	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	89.53228	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	30	0	30	24
chr19	11145016	11145016	A	G	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	53	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr19	11163601	11163601	G	G	intronic	SMARCA4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr19	1119699	1119699	A	G	intronic	SBNO2	NaN	NaN	NaN	rs7249751	NaN	0.535343	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	291.15	0	83.850319	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	0	29	33
chr19	1119963	1119963	A	G	exonic	SBNO2	NaN	synonymous SNV	SBNO2:NM_001100122:exon9:c.T1038C:p.A346A,SBNO2:NM_014963:exon12:c.T1209C:p.A403A	rs2074921	NaN	0.440296	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	17.9198	0	7.625739	normal_lod	REJECT	13	9	4	31
chr19	11213532	11213532	G	T	intronic	LDLR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	11213540	11213540	G	T	intronic	LDLR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	11215836	11215836	T	T	intronic	LDLR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr19	11218242	11218242	A	A	intronic	LDLR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr19	11226945	11226945	G	T	intronic	LDLR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	204	109	92	0
chr19	1124053	1124053	A	G	intronic	SBNO2	NaN	NaN	NaN	rs2024093	NaN	0.497204	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	P	.	.	.	.	-1.036	T	0.000	T	.	-0.453	1.903	-4.21	-2.514	-0.544	9.332	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	331.672	0	NaN	NA	NA	140	67	73	33
chr19	11242103	11242103	A	A	UTR3	LDLR	NM_001195798:c.*111A>A,NM_001195803:c.*111A>A,NM_001195800:c.*111A>A,NM_000527:c.*111A>A,NM_001195799:c.*111A>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr19	11291230	11291230	T	C	intronic	KANK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr19	11322333	11322333	T	T	intronic	DOCK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	30	28	0	0
chr19	11326224	11326224	A	A	intronic	DOCK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr19	11326315	11326315	T	G	intronic	DOCK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr19	11347047	11347047	C	G	exonic	DOCK6	NaN	nonsynonymous SNV	DOCK6:NM_020812:exon20:c.G2367C:p.R789S	NaN	NaN	NaN	0.09	T	0.749	P	0.434	B	0.009	N	0.889	D	2.045	M	1.64	T	-1.015	T	0.070	T	0.336	0.940	8.829	1.5	1.155	-0.296	1.397	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.049976	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	103	88	15	0
chr19	11348821	11348821	G	C	intronic	DOCK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.884109	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	41	33	8	0
chr19	11348960	11348960	G	A	exonic	DOCK6	NaN	nonsynonymous SNV	DOCK6:NM_020812:exon15:c.C1664T:p.P555L	rs12609039	NaN	0.0391374	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.7	H	2.84	T	-0.914	T	0.015	T	0.502	4.656	25.6	4.8	2.211	9.129	16.638	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	42.033208	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	51	31	20	6
chr19	11350522	11350522	A	G	exonic	C19orf80	NaN	nonsynonymous SNV	C19orf80:NM_018687:exon1:c.A209G:p.Y70C	NaN	NaN	NaN	0	D	0.999	D	0.943	D	0.010	N	1.000	N	1.65	L	0.6	T	-0.809	T	0.227	T	0.651	1.982	12.59	2.29	0.032	0.351	8.081	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.215637	clustered_read_position	REJECT	46	42	4	0
chr19	11353718	11353718	T	T	intronic	DOCK6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	6	3	0	0
chr19	11353811	11353811	A	C	exonic	DOCK6	NaN	nonsynonymous SNV	DOCK6:NM_020812:exon13:c.T1404G:p.S468R	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.768	P	0.474	P	0.000	D	1.000	D	2.035	M	1.06	T	-1.044	T	0.116	T	0.727	0.901	8.662	-0.302	-0.551	-0.652	9.181	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.164563	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	110	98	12	0
chr19	11358700	11358700	T	C	intronic	DOCK6	NaN	NaN	NaN	rs4804579	NaN	0.232428	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	419.373	0	NaN	NA	NA	156	71	85	20
chr19	11358799	11358799	G	A	exonic	DOCK6	NaN	nonsynonymous SNV	DOCK6:NM_020812:exon7:c.C749T:p.P250L	rs12978266	NaN	0.519569	0.01	D	0.982	D	0.839	P	0.000	D	0.000	P	2.175	M	2.35	T	-1.052	T	0.000	T	0.324	3.479	17.80	5.05	2.343	7.197	15.901	100	11	3035	SNV	VTSm	3	Somatic	0.0327317212855372	Somatic	292.2	40	NaN	NA	NA	81	53	28	8
chr19	11363473	11363473	C	G	exonic	DOCK6	NaN	synonymous SNV	DOCK6:NM_020812:exon3:c.G294C:p.G98G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.582204	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	140	130	10	0
chr19	11409061	11409061	C	T	intronic	TSPAN16	NaN	NaN	NaN	rs377665	NaN	0.416334	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1483.69	0	NaN	NA	NA	149	0	149	8
chr19	11448096	11448096	A	A	UTR5	RAB3D	NM_004283:c.-21T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	4	0	0
chr19	11460465	11460465	A	A	intronic	CCDC159	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	9	6	0	0
chr19	11460466	11460466	T	A	intronic	CCDC159	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	42	NaN	NA	NA	8	2	5	0
chr19	11460467	11460467	T	G	intronic	CCDC159	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr19	11472174	11472174	G	C	intronic	LPPR2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.441899	nearby_gap_events	REJECT	53	44	9	0
chr19	1147255	1147255	G	C	intronic	SBNO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.12035	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	68	58	10	0
chr19	11475080	11475080	C	A	exonic	LPPR2	NaN	nonsynonymous SNV	LPPR2:NM_001170635:exon10:c.C998A:p.A333D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	13.3528	0	NaN	NA	NA	169	144	22	11
chr19	11494741	11494741	T	T	intronic	EPOR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr19	11513192	11513192	T	T	exonic	RGL3	NaN	synonymous SNV	RGL3:NM_001035223:exon11:c.A1268A:p.Y423Y,RGL3:NM_001161616:exon11:c.A1268A:p.Y423Y	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	47	46	0	0
chr19	11515677	11515677	C	N	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	7	0	4,3	0
chr19	11526553	11526553	T	G	intronic	RGL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr19	11526764	11526764	G	GT	exonic	RGL3	NaN	frameshift substitution	RGL3:NM_001035223:exon5:c.486_486delinsAC,RGL3:NM_001161616:exon5:c.486_486delinsAC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1927.36	0	NaN	NA	NA	213	0	27	1
chr19	11527549	11527549	C	G	exonic	RGL3	NaN	nonsynonymous SNV	RGL3:NM_001035223:exon3:c.G332C:p.G111A,RGL3:NM_001161616:exon3:c.G332C:p.G111A	NaN	NaN	NaN	0.19	T	0.897	P	0.6	P	0.000	D	0.626	N	1.91	M	1.59	T	-0.975	T	0.087	T	0.252	2.495	14.30	2.35	0.879	0.003	5.827	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.320642	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	29	25	4	0
chr19	11536870	11536870	T	T	intronic	CCDC151	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr19	11537906	11537906	C	A	intronic	CCDC151	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.237854	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	110	102	8	0
chr19	11537909	11537909	A	A	intronic	CCDC151	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	60	NaN	NA	NA	61	55	0	0
chr19	11547138	11547138	T	G	intronic	PRKCSH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	50	NaN	NA	NA	7	0	7	0
chr19	11547139	11547139	G	A	intronic	PRKCSH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	9	2	7	0
chr19	1154855	1154855	G	A	intronic	SBNO2	NaN	NaN	NaN	rs80059539	NaN	0.0842652	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	11559023	11559023	A	C	intronic	PRKCSH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.330309	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	96	83	13	0
chr19	11596649	11596649	A	G	intronic	ZNF653	NaN	NaN	NaN	rs62131158	NaN	0.0209665	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	128.809	0	NaN	NA	NA	28	13	15	3
chr19	11606727	11606727	T	T	intronic	ZNF653	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr19	11618588	11618588	A	A	exonic	ECSIT	NaN	synonymous SNV	ECSIT:NM_001142465:exon4:c.T232T:p.S78S,ECSIT:NM_016581:exon6:c.T874T:p.S292S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	39	NaN	NA	NA	31	27	0	0
chr19	11624136	11624136	G	A	intronic	ECSIT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.624589	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	258	234	24	0
chr19	11653737	11653737	G	T	intronic	CNN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	11653738	11653738	A	G	intronic	CNN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	11658796	11658796	A	G	intronic	CNN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr19	11660716	11660716	C	C	UTR3	CNN1	NM_001299:c.*106C>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	15	14	0	0
chr19	11687730	11687730	A	A	intronic	ACP5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	28	21	0	0
chr19	11688024	11688024	C	A	exonic	ACP5	NaN	nonsynonymous SNV	ACP5:NM_001611:exon2:c.G109T:p.V37F,ACP5:NM_001111034:exon3:c.G109T:p.V37F,ACP5:NM_001111036:exon3:c.G109T:p.V37F,ACP5:NM_001111035:exon4:c.G109T:p.V37F	NaN	NaN	NaN	0.72	T	0.882	P	0.566	P	0.004	N	1.000	D	0.95	L	-1.9	D	-0.373	T	0.447	T	0.673	2.459	14.18	3.97	1.081	0.031	12.900	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.338314	nearby_gap_events	REJECT	51	42	9	0
chr19	11708361	11708361	C	T	UTR5	ZNF627	NM_145295:c.-82C>T,NM_001290083:c.-17074C>T,NM_001290084:c.-19288C>T,NM_001290085:c.-19288C>T	NaN	NaN	rs11551815	NaN	0.284345	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.694121	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	12	16	29
chr19	11832942	11832942	C	T	exonic	ZNF823	NaN	synonymous SNV	ZNF823:NM_001297610:exon3:c.G861A:p.K287K,ZNF823:NM_017507:exon3:c.G1275A:p.K425K,ZNF823:NM_001080493:exon4:c.G1407A:p.K469K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	0.359974	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	91	90	1	0
chr19	11833104	11833104	G	T	exonic	ZNF823	NaN	synonymous SNV	ZNF823:NM_001297610:exon3:c.C699A:p.P233P,ZNF823:NM_017507:exon3:c.C1113A:p.P371P,ZNF823:NM_001080493:exon4:c.C1245A:p.P415P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.355319	alt_allele_in_normal,strand_artifact	REJECT	80	72	8	2
chr19	11833108	11833108	T	C	exonic	ZNF823	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF823:NM_001297610:exon3:c.A695G:p.K232R,ZNF823:NM_017507:exon3:c.A1109G:p.K370R,ZNF823:NM_001080493:exon4:c.A1241G:p.K414R	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.999	D	0.995	D	.	.	1.000	N	1.635	L	1.83	T	-1.049	T	0.102	T	0.181	3.354	17.30	0.379	0.369	-0.140	5.083	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.202135	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	83	78	5	0
chr19	11888591	11888591	A	A	intronic	ZNF441	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	17	15	0	0
chr19	11889244	11889244	A	A	intronic	ZNF441	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	2	0	0
chr19	11890850	11890850	A	G	exonic	ZNF441	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF441:NM_152355:exon4:c.A211G:p.R71G	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.968	D	0.482	P	.	.	1.000	N	0.31	N	3.31	T	-0.983	T	0.015	T	0.281	1.002	9.091	1.2	0.795	1.109	4.580	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.02828282828282839	NA	0	0	4.301677	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	8	6	2	0
chr19	11925203	11925203	T	C	UTR5	ZNF440	NM_152357:c.-60T>C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.560809	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	141	137	4	0
chr19	11949877	11949877	C	C	intergenic	ZNF440,ZNF439	dist=3861;dist=26967	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr19	12036125	12036125	G	A	intronic	ZNF700	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.748102	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	17	10	7	0
chr19	12061349	12061349	A	G	UTR3	ZNF700	NM_001271848:c.*281A>G,NM_144566:c.*281A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	18	7	11	0
chr19	12076055	12076055	A	A	intronic	ZNF763	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	19	17	0	0
chr19	12076056	12076056	C	C	intronic	ZNF763	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	43	NaN	NA	NA	19	17	0	0
chr19	12126000	12126000	G	A	exonic	ZNF433	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF433:NM_001080411:exon4:c.C1682T:p.P561L	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.964	D	0.703	P	.	.	0.984	D	2.16	M	2.3	T	-1.055	T	0.067	T	0.231	3.822	19.41	0.223	0.129	2.803	8.816	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.5067	0	NaN	NA	NA	182	159	23	6
chr19	12154802	12154802	T	C	exonic	ZNF878	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF878:NM_001080404:exon4:c.A1414G:p.T472A	NaN	NaN	0.000399361	0.03	D	0.268	B	0.239	B	.	.	1.000	N	2.31	M	5.29	T	-0.967	T	0.007	T	0.175	3.099	16.35	1.3	0.567	-0.020	3.995	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.062421	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	48	43	5	0
chr19	12155697	12155697	A	A	exonic	ZNF878	NaN	synonymous SNV	ZNF878:NM_001080404:exon4:c.T519T:p.C173C	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	77	NaN	NA	NA	99	87	0	0
chr19	12155778	12155778	C	A	exonic	ZNF878	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF878:NM_001080404:exon4:c.G438T:p.K146N	NaN	NaN	NaN	0.47	T	1.0	D	0.995	D	.	.	1.000	N	0.56	N	2.13	T	-1.018	T	0.049	T	0.054	2.411	14.02	-2.1	-0.122	-3.623	2.778	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.033312	clustered_read_position	REJECT	55	50	5	0
chr19	12155790	12155790	A	G	exonic	ZNF878	NaN	synonymous SNV	ZNF878:NM_001080404:exon4:c.T426C:p.P142P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.036713	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	54	50	4	0
chr19	12157596	12157596	A	A	intronic	ZNF878	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	14	10	0	0
chr19	12175585	12175585	T	G	UTR5	ZNF844	NM_001136501:c.-104T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.005542	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	303	281	22	0
chr19	12175721	12175721	A	G	intronic	ZNF844	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	14	3	11	0
chr19	1220320	1220320	C	G	intronic	STK11	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	106	83	23	0
chr19	1222012	1222012	G	C	intronic	STK11	NaN	NaN	NaN	rs2075607	NaN	0.170527	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	23.277259	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	5	11	19
chr19	12243689	12243689	A	G	exonic	ZNF20	NaN	synonymous SNV	ZNF20:NM_001203250:exon4:c.T1303C:p.L435L,ZNF20:NM_021143:exon4:c.T1312C:p.L438L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.564524	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	270	263	7	0
chr19	12243710	12243710	C	T	exonic	ZNF20	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF20:NM_001203250:exon4:c.G1282A:p.A428T,ZNF20:NM_021143:exon4:c.G1291A:p.A431T	NaN	NaN	NaN	0.18	T	0.991	D	0.898	P	.	.	0.999	N	0.49	N	2.56	T	-1.037	T	0.033	T	0.142	2.490	14.29	-0.173	-0.041	-2.269	3.108	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.929081	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	233	211	22	0
chr19	12246781	12246781	A	A	ncRNA_intronic	ZNF625-ZNF20	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr19	1231142	1231142	T	C	exonic	C19orf26	NaN	nonsynonymous SNV	C19orf26:NM_152769:exon9:c.A1112G:p.H371R	rs8110590	NaN	0.651358	0.69	T	0.0	B	0.001	B	0.057	N	1.000	P	0	N	.	.	-0.986	T	0.000	T	0.027	-2.131	0.005	-0.095	-0.106	0.268	8.464	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.13128	0	NaN	NA	NA	13	10	2	17
chr19	1233597	1233597	G	A	exonic	C19orf26	NaN	synonymous SNV	C19orf26:NM_152769:exon8:c.C807T:p.P269P	rs3746102	NaN	0.10603	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	91.30076	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	41	7	34	17
chr19	1233648	1233648	A	G	intronic	C19orf26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.680435	possible_contamination	REJECT	62	58	4	0
chr19	1233833	1233833	C	T	intronic	C19orf26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr19	1233834	1233834	T	G	intronic	C19orf26	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr19	1235024	1235024	C	T	exonic	C19orf26	NaN	nonsynonymous SNV	C19orf26:NM_152769:exon5:c.G431A:p.R144H	rs370902462	NaN	NaN	0.01	D	0.015	B	0.007	B	0.147	N	0.745	D	0.695	N	.	.	-0.990	T	0.091	T	0.135	2.472	14.23	1.47	0.334	2.145	7.233	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.49192	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	44	41	3	0
chr19	1244144	1244144	T	C	exonic	ATP5D	NaN	nonsynonymous SNV	ATP5D:NM_001001975:exon3:c.T344C:p.L115S,ATP5D:NM_001687:exon3:c.T344C:p.L115S	NaN	NaN	NaN	0.07	T	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	3.555	H	.	.	0.226	D	0.557	D	0.944	3.481	17.81	4.64	2.183	5.610	10.742	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.08774	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	171	160	11	0
chr19	12461737	12461737	G	A	exonic	ZNF442	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF442:NM_030824:exon6:c.C662T:p.P221L	NaN	NaN	NaN	0.65	T	1.0	D	0.962	D	.	.	1.000	N	0.39	N	4.07	T	-1.051	T	0.032	T	0.187	0.893	8.628	-1.66	-0.946	-5.658	4.122	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.165496	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	377	363	14	0
chr19	12461739	12461739	C	G	exonic	ZNF442	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF442:NM_030824:exon6:c.G660C:p.W220C	NaN	NaN	NaN	0.19	T	1.0	D	0.969	D	.	.	1.000	N	-0.75	N	4.07	T	-1.049	T	0.023	T	0.311	0.453	6.459	-1.66	-0.569	-0.488	2.130	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.038952	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	380	366	14	0
chr19	12462021	12462021	A	G	exonic	ZNF442	NaN	synonymous SNV	ZNF442:NM_030824:exon6:c.T378C:p.G126G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.440355	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	90	87	3	0
chr19	12501451	12501451	C	T	exonic	ZNF799	NaN	synonymous SNV	ZNF799:NM_001080821:exon4:c.G1761A:p.P587P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	25.8941	0	NaN	NA	NA	155	126	27	8
chr19	1251781	1251781	A	G	intronic	MIDN	NaN	NaN	NaN	rs2285811	NaN	0.590256	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.853406	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	6	0	6	20
chr19	1251899	1251899	A	G	exonic	MIDN	NaN	nonsynonymous SNV	MIDN:NM_177401:exon4:c.A383G:p.Q128R	NaN	NaN	NaN	0	D	0.981	D	0.932	D	0.000	U	1.000	D	1.665	L	.	.	-0.523	T	0.283	T	0.436	3.609	18.37	3.11	1.283	7.777	10.278	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.75738	0	NaN	NA	NA	11	9	2	0
chr19	1251920	1251920	T	C	intronic	MIDN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.24634	0	NaN	NA	NA	11	9	2	0
chr19	1254122	1254122	G	A	intronic	MIDN	NaN	NaN	NaN	rs2301761	NaN	0.382588	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	99.815315	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	34	0	34	34
chr19	1254324	1254324	C	C	exonic	MIDN	NaN	synonymous SNV	MIDN:NM_177401:exon5:c.C543C:p.D181D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	20	19	0	0
chr19	1254978	1254978	T	C	exonic	MIDN	NaN	synonymous SNV	MIDN:NM_177401:exon6:c.T774C:p.P258P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.013884258029810064	NA	0	0	13.757017	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	63	52	11	0
chr19	1254979	1254979	G	T	exonic	MIDN	NaN	nonsynonymous SNV	MIDN:NM_177401:exon6:c.G775T:p.A259S	NaN	NaN	NaN	0.71	T	0.0	B	0.0	B	0.175	N	1.000	N	0.49	N	.	.	-1.000	T	0.045	T	0.049	-0.468	1.838	-2.89	-0.573	-0.380	7.557	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.446172	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	62	49	13	0
chr19	1254980	1254980	C	G	exonic	MIDN	NaN	nonsynonymous SNV	MIDN:NM_177401:exon6:c.C776G:p.A259G	NaN	NaN	NaN	0.25	T	0.004	B	0.007	B	0.175	N	1.000	N	1.04	L	.	.	-1.026	T	0.092	T	0.023	1.061	9.331	2.56	0.719	2.506	11.041	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	9.987740799753861E-4	NA	0	0	16.837102	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	47	35	12	0
chr19	1254989	1254989	C	A	exonic	MIDN	NaN	nonsynonymous SNV	MIDN:NM_177401:exon6:c.C785A:p.S262Y	NaN	NaN	NaN	0.01	D	0.984	D	0.754	P	0.000	D	1.000	D	1.15	L	.	.	-0.620	T	0.219	T	0.279	4.371	23.1	3.62	1.864	3.276	14.013	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.008035437685435794	NA	0	0	NaN	NA	NA	38	29	9	0
chr19	1254993	1254993	A	G	exonic	MIDN	NaN	synonymous SNV	MIDN:NM_177401:exon6:c.A789G:p.R263R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.02908893010991685	NA	0	0	NaN	NA	NA	27	18	9	0
chr19	12575020	12575020	A	G	exonic	ZNF709	NaN	synonymous SNV	ZNF709:NM_152601:exon4:c.T1716C:p.S572S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.199518	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	70	65	5	0
chr19	12576573	12576573	G	A	intronic	ZNF709	NaN	NaN	NaN	rs10404972	NaN	0.228035	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	59.6581	0	NaN	NA	NA	59	32	27	4
chr19	12577158	12577158	T	A	intronic	ZNF709	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	35	NaN	NA	NA	55	49	6	1
chr19	12637842	12637842	A	T	exonic	ZNF564	NaN	synonymous SNV	ZNF564:NM_144976:exon4:c.T1080A:p.T360T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.649856	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	77	68	9	0
chr19	12692053	12692053	T	A	exonic	ZNF490	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF490:NM_020714:exon5:c.A836T:p.K279I	NaN	NaN	NaN	0	D	0.004	B	0.047	B	.	.	1.000	N	2.13	M	2.04	T	-0.984	T	0.055	T	0.226	2.083	12.92	0.996	0.702	-0.385	5.000	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	34.347433	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	182	161	21	2
chr19	1271432	1271432	T	T	exonic	CIRBP	NaN	synonymous SNV	CIRBP:NM_001280:exon4:c.T315T:p.R105R,CIRBP:NM_001300815:exon4:c.T315T:p.R105R,CIRBP:NM_001300829:exon4:c.T315T:p.R105R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	94	89	0	0
chr19	1271433	1271433	G	T	exonic	CIRBP	NaN	nonsynonymous SNV	CIRBP:NM_001280:exon4:c.G316T:p.G106W,CIRBP:NM_001300815:exon4:c.G316T:p.G106W,CIRBP:NM_001300829:exon4:c.G316T:p.G106W	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.998	D	0.000	D	1.000	D	2.33	M	-1.11	T	0.367	D	0.618	D	0.74	2.649	14.82	4.55	2.085	5.942	15.889	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	63	61	2	0
chr19	12721546	12721546	A	A	UTR5	ZNF490	NM_020714:c.-52T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	64	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr19	12758342	12758342	A	C	exonic	MAN2B1	NaN	nonsynonymous SNV	MAN2B1:NM_000528:exon22:c.T2735G:p.M912R,MAN2B1:NM_001173498:exon22:c.T2732G:p.M911R	NaN	NaN	NaN	0.39	T	0.001	B	0.0	B	0.589	N	1.000	N	-0.75	N	-1.21	T	-0.981	T	0.110	T	0.14	0.358	5.942	-10.1	-2.200	-0.085	0.515	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.738945	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	82	74	8	0
chr19	12759142	12759142	C	A	exonic	MAN2B1	NaN	nonsynonymous SNV	MAN2B1:NM_000528:exon21:c.G2511T:p.W837C,MAN2B1:NM_001173498:exon21:c.G2508T:p.W836C	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.99	D	0.837	P	0.670	N	1.000	D	0.895	L	-1.16	T	-0.488	T	0.484	T	0.444	2.562	14.53	4.55	1.300	1.911	13.401	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	6.9557	0	8.361772	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	29	25	4	1
chr19	12760815	12760815	T	T	exonic	MAN2B1	NaN	synonymous SNV	MAN2B1:NM_000528:exon18:c.A2179A:p.K727K,MAN2B1:NM_001173498:exon18:c.A2176A:p.K726K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	91	73	0	0
chr19	12766713	12766713	A	G	intronic	MAN2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr19	12767657	12767657	T	C	intronic	MAN2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	12767877	12767877	A	G	intronic	MAN2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	3	4	0
chr19	12769194	12769194	C	A	intronic	MAN2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.04064039408866968	NA	0	0	NaN	NA	NA	11	8	3	0
chr19	12776480	12776480	T	T	intronic	MAN2B1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr19	1278611	1278611	ACAGGGCC	A,ACAGGAGG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	172.289	0	NaN	NA	NA	20	0	17	0
chr19	12786522	12786522	A	G	UTR3	WDR83	NM_001099737:c.*36A>G,NM_032332:c.*36A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.498101	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	55	51	4	0
chr19	12787022	12787022	A	A	intronic	DHPS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr19	12790881	12790881	A	G	intronic	DHPS	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	8	0	6	0
chr19	12800332	12800332	T	G	intronic	FBXW9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.755752	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	492	479	13	0
chr19	12800966	12800966	C	C	intronic	FBXW9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	51	49	0	0
chr19	12800974	12800974	C	C	intronic	FBXW9	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	35	33	0	0
chr19	12813075	12813075	A	A	intronic	TNPO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr19	12821549	12821549	C	T	exonic	TNPO2	NaN	nonsynonymous SNV	TNPO2:NM_001136196:exon12:c.G1156A:p.V386I,TNPO2:NM_013433:exon12:c.G1156A:p.V386I,TNPO2:NM_001136195:exon13:c.G1156A:p.V386I	NaN	NaN	NaN	0.24	T	0.005	B	0.007	B	0.000	D	1.000	D	1.765	L	-0.22	T	-0.748	T	0.253	T	0.384	3.395	17.46	5.18	2.406	7.487	17.459	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.926836		KEEP	24	20	4	0
chr19	12822020	12822020	T	T	intronic	TNPO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr19	12826653	12826653	A	A	intronic	TNPO2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	8	5	0	0
chr19	12849498	12849498	A	A	intronic	ASNA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	14	13	0	0
chr19	12856640	12856640	A	A	intronic	ASNA1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr19	12863429	12863429	G	A	exonic	BEST2	NaN	nonsynonymous SNV	BEST2:NM_017682:exon1:c.G23A:p.R8Q	rs79300835	NaN	0.0291534	0.32	T	0.422	B	0.183	B	0.000	U	0.995	D	0.55	N	-4.97	D	-0.152	T	0.237	T	0.449	3.170	16.60	3.55	1.944	2.748	14.759	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	26.805843	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	10	13	6
chr19	12863979	12863979	T	A	intronic	BEST2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	6	3	2	0
chr19	12866209	12866209	G	C	exonic	BEST2	NaN	nonsynonymous SNV	BEST2:NM_017682:exon5:c.G653C:p.R218P	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	4.08	H	-5.21	D	1.030	D	0.981	D	0.966	4.401	23.3	4.13	2.283	9.404	15.663	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	15.999517	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	365	346	19	0
chr19	12883598	12883598	C	C	exonic	HOOK2	NaN	synonymous SNV	HOOK2:NM_001100176:exon5:c.G384G:p.K128K,HOOK2:NM_013312:exon5:c.G384G:p.K128K	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	8	6	0	0
chr19	12883865	12883865	A	G	intronic	HOOK2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	8	4	4	0
chr19	12902918	12902918	C	A	exonic	JUNB	NaN	stopgain	JUNB:NM_002229:exon1:c.C333A:p.Y111X	NaN	NaN	NaN	1	T	.	.	.	.	0.000	U	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	6.604	37	4.68	2.147	3.908	12.310	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.195943	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	69	60	9	0
chr19	12911011	12911011	T	T	exonic	PRDX2	NaN	synonymous SNV	PRDX2:NM_005809:exon4:c.A360A:p.T120T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	29	26	0	0
chr19	12918226	12918226	A	A	intronic	RNASEH2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	24	24	0	0
chr19	12923882	12923882	C	T	intronic	RNASEH2A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.297599	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	162	155	7	0
chr19	12936505	12936505	A	C	UTR3	RTBDN	NM_001270440:c.*916T>G,NM_001270444:c.*15T>G,NM_001270445:c.*15T>G,NM_031429:c.*15T>G,NM_001270441:c.*15T>G,NM_001270442:c.*15T>G,NM_001270443:c.*15T>G,NM_001080997:c.*15T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.863266	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	6	5	0
chr19	12936506	12936506	G	A	UTR3	RTBDN	NM_001270440:c.*915C>T,NM_001270444:c.*14C>T,NM_001270445:c.*14C>T,NM_031429:c.*14C>T,NM_001270441:c.*14C>T,NM_001270442:c.*14C>T,NM_001270443:c.*14C>T,NM_001080997:c.*14C>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.115824	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	9	4	5	0
chr19	12943902	12943902	T	C	intronic	RTBDN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	12943904	12943904	A	C	intronic	RTBDN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	12958072	12958072	G	C	intronic	MAST1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.419614	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	40	32	8	0
chr19	12958492	12958492	G	A	exonic	MAST1	NaN	synonymous SNV	MAST1:NM_014975:exon6:c.G555A:p.R185R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTSM	3	NA	NaN	Somatic	15.635	16	7.346646	normal_lod	REJECT	9	6	3	0
chr19	12963085	12963085	G	A	ncRNA_exonic	MIR6794	NaN	NaN	NaN	rs375129841	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	176.788	0	NaN	NA	NA	72	44	28	0
chr19	12963086	12963086	A	C	ncRNA_exonic	MIR6794	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.011865960843234397	NA	0	0	NaN	NA	NA	78	51	27	0
chr19	12963087	12963087	C	G	ncRNA_exonic	MIR6794	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.013004169449864152	NA	0	0	NaN	NA	NA	74	48	26	0
chr19	12976070	12976070	C	C	intronic	MAST1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	112	102	0	0
chr19	12989304	12989304	C	T	exonic	DNASE2	NaN	nonsynonymous SNV	DNASE2:NM_001375:exon5:c.G601A:p.V201I	NaN	NaN	NaN	0.51	T	0.001	B	0.004	B	0.985	N	1.000	N	0.255	N	2.48	T	-0.930	T	0.015	T	0.051	0.057	4.312	-5.38	-0.680	-0.392	7.094	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.914258	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	295	289	6	0
chr19	13002400	13002400	G	C	intronic	GCDH	NaN	NaN	NaN	rs1799918	NaN	0.253195	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	170.475926	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	107	42	65	32
chr19	13002649	13002649	G	A	exonic	GCDH	NaN	synonymous SNV	GCDH:NM_000159:exon4:c.G132A:p.S44S,GCDH:NM_013976:exon4:c.G132A:p.S44S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.668127		KEEP	42	37	5	0
chr19	13008281	13008281	T	T	intronic	GCDH	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	73	68	0	0
chr19	13010996	13010996	T	A	intronic	SYCE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	13010999	13010999	T	A	intronic	SYCE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	13011006	13011006	G	C	intronic	SYCE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	13011010	13011010	C	T	intronic	SYCE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	13011011	13011011	A	C	intronic	SYCE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	13039078	13039078	T	T	intronic	FARSA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	38	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr19	13047604	13047604	T	C	intergenic	FARSA,CALR	dist=3046;dist=1810	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr19	13049903	13049903	G	A	intronic	CALR	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.020906309009922602	NA	0	0	NaN	NA	NA	126	93	33	0
chr19	13063888	13063888	C	G	UTR3	RAD23A	NM_001270363:c.*25C>G,NM_001270362:c.*25C>G,NM_005053:c.*25C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	27	25	2	0
chr19	13117254	13117254	C	T	intronic	NFIX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	21	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	13135928	13135928	T	G	exonic	NFIX	NaN	nonsynonymous SNV	NFIX:NM_001271043:exon2:c.T145G:p.F49V,NFIX:NM_001271044:exon2:c.T97G:p.F33V,NFIX:NM_002501:exon2:c.T121G:p.F41V	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.994	D	0.000	D	1.000	D	1.67	L	0.81	T	-0.580	T	0.252	T	0.832	4.152	21.5	5.16	1.946	7.994	13.957	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.044614	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	11	8	3	0
chr19	13179813	13179813	C	T	intronic	NFIX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr19	13179814	13179814	A	C	intronic	NFIX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr19	13179815	13179815	C	G	intronic	NFIX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr19	13183930	13183930	G	C	intronic	NFIX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	78	NaN	NA	NA	78	67	11	0
chr19	13183931	13183931	C	G	intronic	NFIX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	58	NaN	NA	NA	21	10	11	0
chr19	13184386	13184386	A	G	intronic	NFIX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	1	4	0
chr19	13184387	13184387	A	T	intronic	NFIX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr19	13184646	13184646	G	A	intronic	NFIX	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.256231	nearby_gap_events	REJECT	85	80	5	0
chr19	13212004	13212004	A	A	UTR5	LYL1	NM_005583:c.-19T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr19	13237502	13237502	G	A	intronic	NACC1	NaN	NaN	NaN	rs7259253	NaN	0.358427	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr19	13246759	13246759	G	A	exonic	NACC1	NaN	synonymous SNV	NACC1:NM_052876:exon2:c.G738A:p.V246V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.371232	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	26	22	4	0
chr19	13261005	13261005	CA	AG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5046	0	NaN	NA	NA	7	5	2	2
chr19	13321314	13321314	T	T	intronic	CACNA1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr19	13322884	13322884	G	T	intronic	CACNA1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.021913012214373938	NA	0	0	NaN	NA	NA	83	63	20	0
chr19	13323123	13323123	GT	G,GG	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	832.948	0	NaN	NA	NA	404	190	76	0
chr19	13325536	13325536	A	A	intronic	CACNA1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr19	13339458	13339458	A	C	intronic	CACNA1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	13355900	13355900	T	G	intronic	CACNA1A	NaN	NaN	NaN	rs16039	NaN	0.987819	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	80.832069	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	29	0	29	57
chr19	13355904	13355904	G	A	intronic	CACNA1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.955398	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	29	26	3	0
chr19	13373737	13373737	A	A	intronic	CACNA1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr19	13388024	13388024	G	A	intronic	CACNA1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.381986	possible_contamination,clustered_read_position	REJECT	133	128	5	0
chr19	13445144	13445144	C	T	intronic	CACNA1A	NaN	NaN	NaN	rs2306348	NaN	0.645567	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	281.109243	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	180	72	108	53
chr19	13482588	13482588	A	C	exonic	CACNA1A	NaN	nonsynonymous SNV	CACNA1A:NM_001127221:exon4:c.T545G:p.L182W,CACNA1A:NM_001127222:exon4:c.T545G:p.L182W	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.997	D	0.000	U	1.000	D	3.335	M	-5.19	D	1.083	D	0.974	D	0.775	4.245	22.1	4.89	1.846	8.889	13.499	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.703344	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	5	1	4	1
chr19	1357166	1357166	A	A	intronic	MUM1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr19	1370675	1370675	C	G	exonic	MUM1	NaN	synonymous SNV	MUM1:NM_032853:exon12:c.C1587G:p.V529V	rs12608765	ID=COSM438690;OCCURENCE=2(breast)	0.328275	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	76.298466	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	0	28	45
chr19	13866929	13866929	T	C	intronic	CCDC130	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	11	4	6	0
chr19	13867156	13867156	G	T	intronic	CCDC130	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	11	7	3	0
chr19	13867157	13867157	T	C	intronic	CCDC130	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	10	6	3	0
chr19	13869875	13869875	T	A	intronic	CCDC130	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	0.0	B	0.0	B	.	.	1.000	N	.	.	.	.	-1.042	T	0.033	T	.	-2.826	0	-9.03	-3.033	-0.981	0.557	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	24	NaN	NA	NA	64	44	15	0
chr19	13879622	13879622	T	C	intronic	MRI1	NaN	NaN	NaN	rs346152	NaN	0.631989	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.125157	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	38	18	20	35
chr19	13885301	13885301	G	T	exonic	C19orf53	NaN	nonsynonymous SNV	C19orf53:NM_014047:exon1:c.G10T:p.G4W	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	1.0	D	0.000	D	1.000	D	.	.	0.61	T	-0.437	T	0.301	T	0.693	3.813	19.36	5.04	2.642	4.946	13.816	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.926865	nearby_gap_events	REJECT	75	70	5	0
chr19	13885596	13885596	G	A	intronic	C19orf53	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.027472527472527458	NA	0	0	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr19	13888845	13888845	T	C	intronic	C19orf53	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.08233685576566538	NA	0	0	9.873452	nearby_gap_events	REJECT	30	24	6	0
chr19	13888846	13888846	G	T	intronic	C19orf53	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.10879541914024732	NA	0	0	7.54384	nearby_gap_events	REJECT	30	25	5	0
chr19	13888847	13888847	C	G	intronic	C19orf53	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.23636363636363514	NA	0	0	NaN	NA	NA	14	11	3	0
chr19	13889003	13889003	A	G	exonic	C19orf53	NaN	synonymous SNV	C19orf53:NM_014047:exon3:c.A291G:p.T97T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.940001		KEEP	48	44	4	0
chr19	1388968	1388968	A	A	intronic	NDUFS7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr19	13930074	13930074	C	C	intronic	ZSWIM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr19	1393231	1393231	T	C	intronic	NDUFS7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.058307	nearby_gap_events	REJECT	132	120	12	0
chr19	13934320	13934320	G	T	intronic	ZSWIM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	7.1877	0	NaN	NA	NA	146	128	18	0
chr19	13939376	13939376	T	T	intronic	ZSWIM4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	3	0	0
chr19	1396516	1396516	G	A	downstream	GAMT,NDUFS7	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr19	13988680	13988680	A	A	intronic	NANOS3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	47	NaN	NA	NA	4	4	0	0
chr19	1399320	1399320	A	A	intronic	GAMT	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	33	NaN	NA	NA	6	5	0	0
chr19	14001084	14001084	T	C	exonic	C19orf57	NaN	synonymous SNV	C19orf57:NM_024323:exon6:c.A585G:p.P195P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	35.644502	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	59	38	21	0
chr19	14003528	14003528	T	T	intronic	C19orf57	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	2	1	0	0
chr19	14017269	14017269	A	C	exonic	CC2D1A	NaN	nonsynonymous SNV	CC2D1A:NM_017721:exon1:c.A15C:p.K5N	NaN	NaN	NaN	0.12	T	0.008	B	0.011	B	0.006	N	0.993	N	1.425	L	1.88	T	-1.049	T	0.041	T	0.095	1.262	10.12	0.208	0.013	1.204	2.792	100	11	3035	SNV	VtSm	2	Somatic	0.024498586620002843	NA	0	24	NaN	NA	NA	15	6	9	1
chr19	14024159	14024159	C	G	intronic	CC2D1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.14999999999999866	NA	0	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr19	14030066	14030066	C	CT	intronic	CC2D1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	49.4091	0	NaN	NA	NA	6	0	2	5
chr19	14030067	14030067	C	T	intronic	CC2D1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	23.8917	0	NaN	NA	NA	7	3	4	13
chr19	14034465	14034465	A	G	intronic	CC2D1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	18.877781	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	205	188	17	0
chr19	14037511	14037511	T	T	exonic	CC2D1A	NaN	synonymous SNV	CC2D1A:NM_017721:exon19:c.T2046T:p.V682V	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	18	14	0	0
chr19	14038010	14038010	G	T	exonic	CC2D1A	NaN	nonsynonymous SNV	CC2D1A:NM_017721:exon22:c.G2248T:p.V750L	NaN	NaN	NaN	0.84	T	0.118	B	0.136	B	0.001	D	0.808	D	-0.635	N	2.52	T	-0.991	T	0.013	T	0.288	1.093	9.462	4.13	2.404	2.218	8.894	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.874694	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	63	52	11	0
chr19	14038011	14038011	T	G	exonic	CC2D1A	NaN	nonsynonymous SNV	CC2D1A:NM_017721:exon22:c.T2249G:p.V750G	NaN	NaN	NaN	0.03	D	0.993	D	0.932	D	0.001	D	1.000	D	1.39	L	1.95	T	-1.095	T	0.086	T	0.623	4.131	21.3	4.15	1.945	2.522	10.360	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.327501	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	62	51	11	0
chr19	14038909	14038909	C	T	intronic	CC2D1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	6.58395	0	NaN	NA	NA	22	19	3	0
chr19	14040860	14040860	A	C	intronic	CC2D1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.673291	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	27	21	6	0
chr19	14040862	14040862	G	A	intronic	CC2D1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.811149	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	28	23	5	0
chr19	14040863	14040863	C	G	intronic	CC2D1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.780034	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	26	21	5	0
chr19	14041045	14041045	T	T	intronic	CC2D1A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	35	28	0	0
chr19	14046780	14046780	G	C	intronic	PODNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.553675	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	21	15	6	0
chr19	14046781	14046781	C	G	intronic	PODNL1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.264534	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	20	14	6	0
chr19	14065319	14065319	G	C	intronic	DCAF15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.812506	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	200	180	20	0
chr19	14065354	14065354	T	C	exonic	DCAF15	NaN	nonsynonymous SNV	DCAF15:NM_138353:exon3:c.T247C:p.F83L	NaN	NaN	NaN	0.43	T	0.998	D	0.994	D	0.000	U	1.000	D	1.08	L	.	.	-0.740	T	0.260	T	0.778	3.828	19.44	4.91	1.837	7.280	13.535	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.760415	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	148	133	15	0
chr19	14073628	14073628	T	T	exonic	RFX1	NaN	synonymous SNV	RFX1:NM_002918:exon21:c.A2819A:p.D940D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	5	0	0
chr19	14074853	14074853	A	T	intronic	RFX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	2	1	1	0
chr19	14083761	14083761	T	T	exonic	RFX1	NaN	synonymous SNV	RFX1:NM_002918:exon9:c.A1108A:p.T370T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	9	8	0	0
chr19	14094444	14094444	T	C	intronic	RFX1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.978505	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	179	170	9	0
chr19	14139004	14139004	A	G	upstream	RLN3	NaN	NaN	NaN	rs1982632	NaN	0.878994	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	171.692837	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	61	0	61	54
chr19	14139219	14139219	A	G	intronic	RLN3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	8	2	6	0
chr19	14142616	14142616	C	G	UTR5	IL27RA	NM_004843:c.-69C>G	NaN	NaN	rs6511905	NaN	0.490815	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	49.104561	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	28	9	19	26
chr19	14143150	14143150	G	GC	intronic	IL27RA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	98.7268	0	NaN	NA	NA	24	7	3	0
chr19	14163117	14163117	T	T	UTR3	IL27RA	NM_004843:c.*15T>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	141	114	0	0
chr19	14164789	14164789	G	T	exonic	PALM3	NaN	synonymous SNV	PALM3:NM_001145028:exon6:c.C1650A:p.S550S	NaN	ID=COSM991806;OCCURENCE=1(endometrium)	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	11.14262	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	107	100	7	0
chr19	14164791	14164791	A	C	exonic	PALM3	NaN	nonsynonymous SNV	PALM3:NM_001145028:exon6:c.T1648G:p.S550A	NaN	NaN	NaN	1	T	0.005	B	0.003	B	.	.	1.000	N	0.69	N	1.54	T	-0.964	T	0.031	T	0.108	-0.730	0.878	-6.95	-1.881	-2.391	6.812	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.364818	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	104	97	7	0
chr19	14164794	14164794	C	G	exonic	PALM3	NaN	nonsynonymous SNV	PALM3:NM_001145028:exon6:c.G1645C:p.E549Q	NaN	NaN	NaN	0.05	D	0.1	B	0.056	B	.	.	1.000	N	0.895	L	1.02	T	-1.011	T	0.076	T	0.075	1.968	12.54	1.84	0.428	0.509	7.819	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	9.059159	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	103	97	6	0
chr19	14165278	14165278	G	A	exonic	PALM3	NaN	synonymous SNV	PALM3:NM_001145028:exon6:c.C1161T:p.G387G	rs56202530	NaN	0.086262	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	32.145924	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	37	16	17
chr19	1417430	1417430	T	T	intronic	DAZAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	4	3	0	0
chr19	1418710	1418710	A	G	exonic	DAZAP1	NaN	nonsynonymous SNV	DAZAP1:NM_018959:exon4:c.A283G:p.T95A,DAZAP1:NM_170711:exon4:c.A283G:p.T95A	NaN	NaN	NaN	0.39	T	0.284	B	0.066	B	0.000	D	1.000	D	1.1	L	-1.05	T	-0.655	T	0.284	T	0.261	2.886	15.61	4.85	1.817	6.587	13.592	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.023708206686929138	NA	0	0	10.573638	nearby_gap_events	REJECT	46	40	6	0
chr19	14211766	14211766	A	A	intronic	PRKACA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr19	14213728	14213728	T	A	splicing	PRKACA	NM_002730:exon5:c.238-2A>T,NM_001304349:exon5:c.466-2A>T,NM_207518:exon5:c.214-2A>T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1.871	12.22	5.5	2.090	7.984	13.568	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.778455	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	116	111	5	0
chr19	14262866	14262866	T	T	ncRNA_intronic	LOC100507373	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr19	14263238	14263238	T	C	exonic	ADGRL1	NaN	nonsynonymous SNV	ADGRL1:NM_014921:exon21:c.A3532G:p.N1178D,ADGRL1:NM_001008701:exon22:c.A3547G:p.N1183D	NaN	NaN	NaN	0.04	D	0.996	D	0.966	D	0.000	D	1.000	D	2.05	M	-0.76	T	0.074	D	0.523	D	0.1	5.011	29.5	4.99	1.881	7.651	12.663	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	55.7745	0	NaN	NA	NA	93	67	25	0
chr19	14269861	14269861	G	T	ncRNA_intronic	LOC100507373	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	23	14	9	0
chr19	14273299	14273299	T	G	ncRNA_intronic	LOC100507373	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	1	2	0
chr19	14278462	14278462	C	G	ncRNA_intronic	LOC100507373	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	1432819	1432819	A	A	intronic	DAZAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	112	81	0	0
chr19	1434728	1434728	T	C	intronic	DAZAP1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	5	1	4	0
chr19	1440570	1440570	A	C	downstream	RPS15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	1440571	1440571	G	T	downstream	RPS15	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	14492242	14492242	T	A	UTR5	ADGRE5	NM_001784:c.-94T>A,NM_078481:c.-94T>A,NM_001025160:c.-94T>A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	0	1	0
chr19	14495013	14495013	G	T	intronic	ADGRE5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	14499357	14499357	T	A	intronic	ADGRE5	NaN	NaN	NaN	rs2302094	NaN	0.916334	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	49.3703	0	NaN	NA	NA	10	2	6	36
chr19	14519663	14519663	T	C	UTR3	DDX39A	NM_005804:c.*85A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	6	3	3	0
chr19	14520061	14520061	CTGGGGC	CTGGC,CTGGGCA,GGCTGGC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	1833.97	0	NaN	NA	NA	195	0	97	2
chr19	14520065	14520065	G	C	intronic	DDX39A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.016117216117216032	NA	0	0	NaN	NA	NA	11	7	4	0
chr19	14551855	14551855	T	T	intronic	PKN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	29	NaN	NA	NA	6	6	0	0
chr19	1455259	1455259	G	C	intronic	APC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr19	1455716	1455716	G	T	intronic	APC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	9	6	3	0
chr19	14561722	14561722	A	G	exonic	PKN1	NaN	synonymous SNV	PKN1:NM_002741:exon6:c.A771G:p.L257L,PKN1:NM_213560:exon6:c.A789G:p.L263L	rs8107892	NaN	0.996406	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.75776	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	11	0	11	57
chr19	14561997	14561997	C	G	intronic	PKN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.465988	clustered_read_position	REJECT	46	41	5	0
chr19	14562222	14562222	A	T	intronic	PKN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr19	14562225	14562225	C	T	intronic	PKN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr19	14562226	14562226	C	T	intronic	PKN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	6	1	5	0
chr19	14562572	14562572	C	T	intronic	PKN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	24.008744	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	719	686	33	0
chr19	1456730	1456730	G	T	intronic	APC2	NaN	NaN	NaN	rs3896893	NaN	0.47524	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	17.217664	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	18	11	7	36
chr19	14574985	14574985	T	C	intronic	PKN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.698294	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	8	4	4	0
chr19	1457968	1457968	G	G	exonic	APC2	NaN	synonymous SNV	APC2:NM_005883:exon10:c.G1212G:p.P404P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	29	26	0	0
chr19	14580367	14580367	A	A	intronic	PKN1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	27	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr19	14585162	14585162	G	A	intronic	PTGER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.373882	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	22	17	5	0
chr19	14585163	14585163	A	G	intronic	PTGER1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.972187	clustered_read_position,strand_artifact	REJECT	22	17	5	0
chr19	14589160	14589160	T	A	UTR3	GIPC1	NM_202470:c.*68A>T,NM_202494:c.*68A>T,NM_005716:c.*68A>T,NM_202469:c.*68A>T,NM_202468:c.*68A>T	NaN	NaN	rs117718148	NaN	0.0371406	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	97.615	0	54.535013	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	53	30	23	2
chr19	14589222	14589222	G	C	UTR3	GIPC1	NM_202470:c.*6C>G,NM_202494:c.*6C>G,NM_005716:c.*6C>G,NM_202469:c.*6C>G,NM_202468:c.*6C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	166.161	0	NaN	NA	NA	24	15	9	0
chr19	14591308	14591308	G	C	intronic	GIPC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.307792	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	131	120	11	0
chr19	14593097	14593097	T	C	intronic	GIPC1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	32	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr19	1460339	1460339	G	T	intronic	APC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.001415	nearby_gap_events,possible_contamination	REJECT	147	134	13	0
chr19	1461939	1461939	C	G	intronic	APC2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.499675	nearby_gap_events	REJECT	27	21	6	0
chr19	14675050	14675050	T	C	exonic	TECR	NaN	nonsynonymous SNV	TECR:NM_138501:exon7:c.T440C:p.F147S	NaN	NaN	NaN	0	D	0.983	D	0.735	P	0.000	D	1.000	D	3.665	H	1.05	T	-0.302	T	0.271	T	0.963	4.567	24.8	3.99	1.580	4.642	11.154	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.052345	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	25	22	3	0
chr19	14675064	14675064	T	C	exonic	TECR	NaN	nonsynonymous SNV	TECR:NM_138501:exon7:c.T454C:p.S152P	NaN	NaN	NaN	0	D	0.997	D	0.921	D	0.000	D	1.000	D	3.68	H	0.98	T	-0.221	T	0.318	T	0.875	4.079	21.0	3.87	1.529	5.720	10.930	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.553051	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	25	22	3	0
chr19	14675084	14675084	G	A	exonic	TECR	NaN	synonymous SNV	TECR:NM_138501:exon7:c.G474A:p.L158L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	5.510651	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	24	21	3	0
chr19	1467684	1467684	A	A	exonic	APC2	NaN	synonymous SNV	APC2:NM_005883:exon15:c.A4384A:p.R1462R	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr19	14705416	14705416	C	T	intronic	CLEC17A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	4.68178	fstar_tumor_lod,possible_contamination	REJECT	48	45	3	0
chr19	14765615	14765615	C	T	intronic	ADGRE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.388325	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	35	29	6	0
chr19	14765710	14765710	T	C	intronic	ADGRE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.007088486117472455	NA	0	0	8.355744	nearby_gap_events	REJECT	45	38	7	0
chr19	14769407	14769407	A	C	intronic	ADGRE3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.024116165762928354	NA	0	0	NaN	NA	NA	104	54	50	0
chr19	1482252	1482252	A	A	intronic	PCSK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr19	1482344	1482344	G	G	intronic	PCSK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	24	22	0	0
chr19	1482639	1482639	A	A	intronic	PCSK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	4	0	0
chr19	1482653	1482653	A	T	intronic	PCSK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	14828625	14828625	A	G	intronic	ZNF333	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	22	NaN	NA	NA	5	1	3	0
chr19	14828627	14828627	G	A	intronic	ZNF333	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	4	1	3	0
chr19	14829876	14829876	A	C	exonic	ZNF333	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF333:NM_032433:exon12:c.A1737C:p.K579N	NaN	NaN	NaN	0.48	T	0.985	D	0.939	D	.	.	1.000	N	1.195	L	2.06	T	-1.063	T	0.069	T	0.096	1.049	9.283	-4.94	-1.655	-2.922	11.559	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.001956052319124109	NA	0	0	NaN	NA	NA	75	46	29	0
chr19	14829877	14829877	C	A	exonic	ZNF333	NaN	nonsynonymous SNV	ZNF333:NM_032433:exon12:c.C1738A:p.H580N	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.999	D	.	.	1.000	D	4.13	H	-2.18	D	1.041	D	0.856	D	0.605	2.713	15.03	3.14	1.784	6.710	12.156	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.039927945012652	NA	0	0	NaN	NA	NA	116	91	25	0
chr19	14866956	14866956	T	C	intronic	ADGRE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	8	4	3	0
chr19	1487083	1487083	C	T	intronic	PCSK4	NaN	NaN	NaN	rs4807119	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.049436	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	22	14	8	20
chr19	14875223	14875223	T	G	intronic	ADGRE2	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	5	2	3	0
chr19	1488364	1488364	C	C	intronic	PCSK4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	51	NaN	NA	NA	63	54	0	0
chr19	1489770	1489770	T	G	intronic	PCSK4	NaN	NaN	NaN	rs791468	NaN	0.489018	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	16.659214	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	33	20	13	29
chr19	14910654	14910654	T	C	exonic	OR7C1	NaN	nonsynonymous SNV	OR7C1:NM_198944:exon1:c.A295G:p.S99G	rs17230134	NaN	0.198882	0	D	0.215	B	0.071	B	0.840	U	1.000	P	1.905	M	4.08	T	-0.936	T	0.000	T	0.061	0.903	8.672	-0.988	-0.149	-5.089	8.155	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	10.5597	0	NaN	NA	NA	6	4	2	7
chr19	1495277	1495277	C	T	intronic	REEP6	NaN	NaN	NaN	rs12459408	NaN	0.328275	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.757826	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	40	25	15	27
chr19	15053105	15053105	A	C	exonic	OR7C2	NaN	nonsynonymous SNV	OR7C2:NM_012377:exon1:c.A805C:p.T269P	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.637	P	0.633	P	0.370	U	1.000	N	1.395	L	8.69	T	-0.955	T	0.001	T	0.245	0.750	7.974	0.481	-0.074	2.568	6.712	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.203739	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	149	136	13	0
chr19	15053106	15053106	C	A	exonic	OR7C2	NaN	nonsynonymous SNV	OR7C2:NM_012377:exon1:c.C806A:p.T269K	NaN	NaN	NaN	0.81	T	0.0	B	0.006	B	0.370	N	1.000	N	-1.28	N	8.73	T	-1.004	T	0.000	T	0.098	-2.342	0.004	-7.53	-1.652	-3.550	1.671	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.000104	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	151	137	14	0
chr19	15053107	15053107	A	C	exonic	OR7C2	NaN	synonymous SNV	OR7C2:NM_012377:exon1:c.A807C:p.T269T	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.971245	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	147	133	14	0
chr19	15063757	15063757	A	G	exonic	SLC1A6	NaN	synonymous SNV	SLC1A6:NM_005071:exon8:c.T1482C:p.I494I	rs2229896	NaN	0.252596	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsM	2	NA	NaN	Somatic	49.5444	0	19.738876	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	13	5	8	15
chr19	1506580	1506580	G	A	intronic	ADAMTSL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.968391	nearby_gap_events	REJECT	38	34	4	0
chr19	15067161	15067161	C	T	intronic	SLC1A6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.33265	nearby_gap_events	REJECT	80	75	5	0
chr19	15072728	15072728	T	C	UTR3	SLC1A6	NM_001272088:c.*82A>G,NM_001272087:c.*82A>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	34	NaN	NA	NA	14	3	11	0
chr19	15082536	15082536	T	C	intronic	SLC1A6	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.040306	nearby_gap_events,strand_artifact	REJECT	141	133	8	0
chr19	15083485	15083485	T	C	intronic	SLC1A6	NaN	NaN	NaN	rs3746294	NaN	0.324281	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	15.788	0	NaN	NA	NA	8	5	3	29
chr19	15083693	15083693	C	A	exonic	SLC1A6	NaN	synonymous SNV	SLC1A6:NM_005071:exon1:c.G30T:p.L10L,SLC1A6:NM_001272088:exon2:c.G30T:p.L10L,SLC1A6:NM_001272087:exon4:c.G30T:p.L10L	rs3746295	ID=COSM438761;OCCURENCE=1(breast)	0.552117	0	D	0.018	B	0.011	B	.	.	0.000	P	.	.	-0.8	T	-0.904	T	0.000	T	.	2.330	13.75	4.41	2.278	1.323	12.362	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	655.133	0	NaN	NA	NA	17	0	17	41
chr19	1510661	1510661	A	G	exonic	ADAMTSL5	NaN	synonymous SNV	ADAMTSL5:NM_213604:exon3:c.T168C:p.S56S	rs265291	NaN	0.935703	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.676232	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	5	0	5	8
chr19	1510841	1510841	T	A	intronic	ADAMTSL5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	26	NaN	NA	NA	33	25	8	0
chr19	1510842	1510842	A	C	splicing	ADAMTSL5	NM_213604:exon3:c.99+2T>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	.	.	.	.	.	.	.	.	1.000	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2.230	13.41	2.32	1.439	2.948	7.51	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	26	18	8	0
chr19	15124419	15124419	T	T	intronic	CCDC105	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr19	15131668	15131668	G	A	intronic	CCDC105	NaN	NaN	NaN	rs7249373	NaN	0.178315	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	193.204	0	NaN	NA	NA	81	39	42	21
chr19	15131678	15131678	T	A	intronic	CCDC105	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	15131679	15131679	T	C	intronic	CCDC105	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	15132552	15132552	G	T	intronic	CCDC105	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	19	NaN	NA	NA	96	60	36	0
chr19	15220417	15220417	A	A	intronic	SYDE1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr19	15220850	15220850	G	A	exonic	SYDE1	NaN	nonsynonymous SNV	SYDE1:NM_001300910:exon3:c.G565A:p.A189T,SYDE1:NM_033025:exon3:c.G766A:p.A256T	rs2240297	NaN	0.23722	0.69	T	0.001	B	0.001	B	0.453	N	1.000	P	0	N	3.0	T	-0.917	T	0.000	T	0.053	-0.759	0.790	-6.12	-1.180	0.014	1.374	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	6	4	2	6
chr19	15222428	15222428	A	G	intronic	SYDE1	NaN	NaN	NaN	rs2040858	NaN	0.277157	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.088643	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	37	27	10	21
chr19	15222529	15222529	G	A	exonic	SYDE1	NaN	nonsynonymous SNV	SYDE1:NM_001300910:exon6:c.G1303A:p.D435N,SYDE1:NM_033025:exon6:c.G1504A:p.D502N	NaN	NaN	NaN	0.56	T	0.082	B	0.044	B	0.000	D	0.999	N	0.255	N	2.16	T	-0.993	T	0.025	T	0.04	-1.398	0.023	4.4	1.301	0.878	8.522	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	12.391843	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	51	41	10	0
chr19	15229932	15229932	G	G	intronic	ILVBL	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	95	72	0	0
chr19	1526931	1526931	A	C	UTR5	PLK5	NM_001243079:c.-65A>C	NaN	NaN	rs2656858	NaN	0.689097	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	44.473056	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	16	0	16	39
chr19	15271752	15271752	G	G	exonic	NOTCH3	NaN	synonymous SNV	NOTCH3:NM_000435:exon33:c.C6687C:p.S2229S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	18	18	0	0
chr19	15271753	15271753	C	T	exonic	NOTCH3	NaN	nonsynonymous SNV	NOTCH3:NM_000435:exon33:c.G6686A:p.S2229N	NaN	NaN	NaN	0.56	T	0.901	P	0.534	P	.	.	0.552	N	0.55	N	-0.97	T	-0.706	T	0.238	T	0.128	0.984	9.018	3.6	2.031	2.227	10.516	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	37	NaN	NA	NA	12	12	0	0
chr19	15271754	15271754	T	T	exonic	NOTCH3	NaN	synonymous SNV	NOTCH3:NM_000435:exon33:c.A6685A:p.S2229S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	40	NaN	NA	NA	16	14	0	0
chr19	15271771	15271771	G	A	exonic	NOTCH3	NaN	nonsynonymous SNV	NOTCH3:NM_000435:exon33:c.C6668T:p.A2223V	rs1044009	NaN	0.629393	0.32	T	0.001	B	0.003	B	.	.	1.000	P	0	N	-1.47	T	-0.953	T	0.000	T	0.092	0.586	7.163	0.427	0.078	1.122	8.067	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	39.482029	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	15	0	15	55
chr19	15273266	15273266	T	T	intronic	NOTCH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	1	1	0	0
chr19	15273412	15273412	T	T	intronic	NOTCH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	31	NaN	NA	NA	107	105	0	0
chr19	15276143	15276143	C	T	intronic	NOTCH3	NaN	NaN	NaN	rs2074618	NaN	0.866613	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	343.948436	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	118	2	116	58
chr19	15276365	15276365	A	C	intronic	NOTCH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	18	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr19	15278057	15278057	A	G	intronic	NOTCH3	NaN	NaN	NaN	rs1548555	NaN	0.870008	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	151.667026	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	52	0	52	58
chr19	15281386	15281386	C	A	intronic	NOTCH3	NaN	NaN	NaN	rs2074620	NaN	0.539537	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.312164	normal_lod,strand_artifact	REJECT	3	0	3	11
chr19	15285052	15285052	T	C	exonic	NOTCH3	NaN	synonymous SNV	NOTCH3:NM_000435:exon25:c.A4563G:p.P1521P	rs1044006	ID=COSM438775,COSM1480700;OCCURENCE=1(breast)	0.871805	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	155.836357	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	62	0	62	57
chr19	15289613	15289613	A	T	intronic	NOTCH3	NaN	NaN	NaN	rs11670823	NaN	0.517173	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	114.038544	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	39	0	39	49
chr19	15289794	15289794	T	G	intronic	NOTCH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.33722	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	79	71	8	0
chr19	15290125	15290125	G	A	ncRNA_exonic	MIR6795	NaN	NaN	NaN	rs56061231	NaN	0.516174	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	519.327	0	NaN	NA	NA	46	1	45	17
chr19	15292366	15292366	C	T	intronic	NOTCH3	NaN	NaN	NaN	rs11669982	NaN	0.739217	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	140.40852	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	56	1	55	57
chr19	15298160	15298160	A	A	intronic	NOTCH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	11	10	0	0
chr19	15299769	15299769	A	A	intronic	NOTCH3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	19	16	0	0
chr19	15302844	15302844	T	C	exonic	NOTCH3	NaN	synonymous SNV	NOTCH3:NM_000435:exon4:c.A606G:p.A202A	rs1043994	NaN	0.855831	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	100.128685	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	36	0	36	57
chr19	15338344	15338344	G	A	exonic	EPHX3	NaN	synonymous SNV	EPHX3:NM_024794:exon7:c.C987T:p.A329A,EPHX3:NM_001142886:exon8:c.C987T:p.A329A	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.857619	nearby_gap_events	REJECT	37	32	5	0
chr19	1534056	1534056	A	G	intronic	PLK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTsm	2	Somatic	0.002428475463052019	Somatic	30.6552	0	NaN	NA	NA	45	34	11	2
chr19	1534065	1534065	G	C	intronic	PLK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.003576450828663995	NA	0	0	NaN	NA	NA	35	22	13	0
chr19	1534066	1534066	C	A	intronic	PLK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	7.449997	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	75	68	7	0
chr19	1534067	1534067	A	G	intronic	PLK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	Vtsm	1	Somatic	0.008649797141912975	NA	0	0	NaN	NA	NA	64	36	28	0
chr19	1534084	1534084	T	G	intronic	PLK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	14.88484	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	98	85	13	0
chr19	1534085	1534085	G	T	intronic	PLK5	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VtsM	2	Somatic	0.02015929517842736	NA	0	0	14.488883	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	69	56	13	0
chr19	15341719	15341719	T	T	intronic	EPHX3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	20	NaN	NA	NA	7	5	0	0
chr19	15343120	15343120	T	TGC	UTR5	EPHX3	NM_024794:c.-98A>GCA	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	8.05718	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr19	15343122	15343122	G	C	UTR5	EPHX3	NM_024794:c.-100C>G	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	9.51986	0	NaN	NA	NA	10	8	2	0
chr19	15353743	15353743	G	T	exonic	BRD4	NaN	nonsynonymous SNV	BRD4:NM_058243:exon14:c.C3137A:p.P1046H	NaN	NaN	NaN	0	D	1.0	D	0.996	D	0.078	N	1.000	D	1.355	L	-0.09	T	-0.301	T	0.350	T	0.709	1.693	11.62	4.21	1.887	6.207	15.339	100	11	3035	SNV	vTSm	2	NA	NaN	Somatic	103.518	34	NaN	NA	NA	18	4	14	17
chr19	15364909	15364909	C	C	intronic	BRD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	25	NaN	NA	NA	2	2	0	0
chr19	15365976	15365976	T	C	intronic	BRD4	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	23	NaN	NA	NA	3	0	2	0
chr19	15366010	15366010	A	G	intronic	BRD4	NaN	NaN	NaN	rs116468025	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	28.04539	nearby_gap_events,normal_lod	REJECT	15	3	12	0
chr19	15383786	15383786	C	C	exonic	BRD4	NaN	synonymous SNV	BRD4:NM_014299:exon2:c.G125G:p.S42S,BRD4:NM_058243:exon2:c.G125G:p.S42S	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	36	NaN	NA	NA	73	69	0	0
chr19	15482603	15482603	T	T	intronic	AKAP8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	3	2	0	0
chr19	15483906	15483906	C	T	exonic	AKAP8	NaN	nonsynonymous SNV	AKAP8:NM_005858:exon5:c.G617A:p.R206H	rs111389458	ID=COSM1235567;OCCURENCE=2(haematopoietic_and_lymphoid_tissue)	0.00179712	0.01	D	1.0	D	0.997	D	0.000	D	1.000	D	2.175	M	0.3	T	-0.333	T	0.301	T	0.494	4.267	22.3	5.06	2.508	4.661	15.702	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	10.134069	normal_lod,alt_allele_in_normal	REJECT	23	17	6	4
chr19	15487701	15487701	T	C	intronic	AKAP8	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	28	NaN	NA	NA	3	0	3	0
chr19	15512492	15512492	A	C	intronic	AKAP8L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	16	4	12	0
chr19	15514267	15514267	T	T	intronic	AKAP8L	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	30	NaN	NA	NA	10	9	0	0
chr19	15535046	15535046	G	T	exonic	WIZ	NaN	nonsynonymous SNV	WIZ:NM_021241:exon7:c.C2173A:p.P725T	NaN	NaN	NaN	0.01	D	1.0	D	0.999	D	0.000	D	1.000	D	0.895	L	2.32	T	-1.091	T	0.083	T	0.537	4.108	21.2	5.41	2.551	8.886	17.972	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	6.885099	nearby_gap_events,clustered_read_position	REJECT	13	10	3	0
chr19	15559024	15559024	C	A	exonic	WIZ	NaN	nonsynonymous SNV	WIZ:NM_021241:exon2:c.G95T:p.G32V	NaN	NaN	NaN	0.02	D	0.343	B	0.161	B	.	.	1.000	D	.	.	3.86	T	-0.917	T	0.010	T	0.355	3.375	17.38	1.54	0.874	0.760	5.163	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	13.198946	nearby_gap_events,alt_allele_in_normal	REJECT	235	217	18	0
chr19	1556140	1556140	G	GGAAGTC	exonic	MEX3D	NaN	nonframeshift substitution	MEX3D:NM_001174118:exon2:c.1378_1378delinsGACTTCC,MEX3D:NM_203304:exon2:c.1378_1378delinsGACTTCC	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vTsm	1	NA	NaN	Somatic	14.6794	0	NaN	NA	NA	10	7	3	0
chr19	15564367	15564367	G	G	intronic	RASAL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	16	NaN	NA	NA	27	25	0	0
chr19	15565446	15565446	C	A	intronic	RASAL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtsM	1	NA	NaN	NA	0	0	8.403003	nearby_gap_events	REJECT	61	53	8	0
chr19	15566859	15566859	T	C	intronic	RASAL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	15	NaN	NA	NA	7	2	5	0
chr19	15569049	15569049	T	G	intronic	RASAL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	17	NaN	NA	NA	2	0	2	0
chr19	1556960	1556960	G	C	intronic	MEX3D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	75	NaN	NA	NA	49	42	7	0
chr19	1556961	1556961	C	G	intronic	MEX3D	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	62	NaN	NA	NA	40	33	7	0
chr19	15571958	15571958	T	G	intronic	RASAL3	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	vtSm	1	NA	NaN	NA	0	45	NaN	NA	NA	31	17	14	0
chr19	15572357	15572357	G	T	exonic	RASAL3	NaN	synonymous SNV	RASAL3:NM_022904:exon3:c.C390A:p.P130P	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	100	11	3035	SNV	VTSM	4	Somatic	1.0143726564971079E-7	Somatic	119.163	59	54.249332	nearby_gap_even